# HG changeset patch # User richjp # Date 1413201221 14400 # Node ID c3956b7cb71f394b2a355c58ea34b89c7c9d261d # Parent f6ea3e1cdfb96f0efe37ae99d176660a5484dd6c Deleted selected files diff -r f6ea3e1cdfb9 -r c3956b7cb71f cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py --- a/cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py Fri Oct 10 12:36:10 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,742 +0,0 @@ -# cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.py - a self annotated version of rgToolFactory.py generated by running rgToolFactory.py -# to make a new Galaxy tool called cloudmap_zf_hom_mapping -# User r.poole@ucl.ac.uk at 10/10/2014 17:34:44 -# rgToolFactory.py -# see https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home -# -# copyright ross lazarus (ross stop lazarus at gmail stop com) May 2012 -# -# all rights reserved -# Licensed under the LGPL -# suggestions for improvement and bug fixes welcome at https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory/wiki/Home -# -# August 2014 -# merged John Chilton's citation addition and ideas from Marius van den Beek to enable arbitrary -# data types for input and output - thanks! -# -# march 2014 -# had to remove dependencies because cross toolshed dependencies are not possible - can't pre-specify a toolshed url for graphicsmagick and ghostscript -# grrrrr - night before a demo -# added dependencies to a tool_dependencies.xml if html page generated so generated tool is properly portable -# -# added ghostscript and graphicsmagick as dependencies -# fixed a wierd problem where gs was trying to use the new_files_path from universe (database/tmp) as ./database/tmp -# errors ensued -# -# august 2013 -# found a problem with GS if $TMP or $TEMP missing - now inject /tmp and warn -# -# july 2013 -# added ability to combine images and individual log files into html output -# just make sure there's a log file foo.log and it will be output -# together with all images named like "foo_*.pdf -# otherwise old format for html -# -# January 2013 -# problem pointed out by Carlos Borroto -# added escaping for <>$ - thought I did that ages ago... -# -# August 11 2012 -# changed to use shell=False and cl as a sequence - -# This is a Galaxy tool factory for simple scripts in python, R or whatever ails ye. -# It also serves as the wrapper for the new tool. -# -# you paste and run your script -# Only works for simple scripts that read one input from the history. -# Optionally can write one new history dataset, -# and optionally collect any number of outputs into links on an autogenerated HTML page. - -# DO NOT install on a public or important site - please. - -# installed generated tools are fine if the script is safe. -# They just run normally and their user cannot do anything unusually insecure -# but please, practice safe toolshed. -# Read the fucking code before you install any tool -# especially this one - -# After you get the script working on some test data, you can -# optionally generate a toolshed compatible gzip file -# containing your script safely wrapped as an ordinary Galaxy script in your local toolshed for -# safe and largely automated installation in a production Galaxy. - -# If you opt for an HTML output, you get all the script outputs arranged -# as a single Html history item - all output files are linked, thumbnails for all the pdfs. -# Ugly but really inexpensive. -# -# Patches appreciated please. -# -# -# long route to June 2012 product -# Behold the awesome power of Galaxy and the toolshed with the tool factory to bind them -# derived from an integrated script model -# called rgBaseScriptWrapper.py -# Note to the unwary: -# This tool allows arbitrary scripting on your Galaxy as the Galaxy user -# There is nothing stopping a malicious user doing whatever they choose -# Extremely dangerous!! -# Totally insecure. So, trusted users only -# -# preferred model is a developer using their throw away workstation instance - ie a private site. -# no real risk. The universe_wsgi.ini admin_users string is checked - only admin users are permitted to run this tool. -# - -import sys -import shutil -import subprocess -import os -import time -import tempfile -import optparse -import tarfile -import re -import shutil -import math - -progname = os.path.split(sys.argv[0])[1] -myversion = 'V001.1 March 2014' -verbose = False -debug = False -toolFactoryURL = 'https://bitbucket.org/fubar/galaxytoolfactory' - -# if we do html we need these dependencies specified in a tool_dependencies.xml file and referred to in the generated -# tool xml -toolhtmldepskel = """ - - - - - - - - - %s - - -""" - -protorequirements = """ - ghostscript - graphicsmagick - """ - -def timenow(): - """return current time as a string - """ - return time.strftime('%d/%m/%Y %H:%M:%S', time.localtime(time.time())) - -html_escape_table = { - "&": "&", - ">": ">", - "<": "<", - "$": "\$" - } - -def html_escape(text): - """Produce entities within text.""" - return "".join(html_escape_table.get(c,c) for c in text) - -def cmd_exists(cmd): - return subprocess.call("type " + cmd, shell=True, - stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) == 0 - - -def parse_citations(citations_text): - """ - """ - citations = [c for c in citations_text.split("**ENTRY**") if c.strip()] - citation_tuples = [] - for citation in citations: - if citation.startswith("doi"): - citation_tuples.append( ("doi", citation[len("doi"):].strip() ) ) - else: - citation_tuples.append( ("bibtex", citation[len("bibtex"):].strip() ) ) - return citation_tuples - - -class ScriptRunner: - """class is a wrapper for an arbitrary script - """ - - def __init__(self,opts=None,treatbashSpecial=True): - """ - cleanup inputs, setup some outputs - - """ - self.useGM = cmd_exists('gm') - self.useIM = cmd_exists('convert') - self.useGS = cmd_exists('gs') - self.temp_warned = False # we want only one warning if $TMP not set - self.treatbashSpecial = treatbashSpecial - if opts.output_dir: # simplify for the tool tarball - os.chdir(opts.output_dir) - self.thumbformat = 'png' - self.opts = opts - self.toolname = re.sub('[^a-zA-Z0-9_]+', '', opts.tool_name) # a sanitizer now does this but.. - self.toolid = self.toolname - self.myname = sys.argv[0] # get our name because we write ourselves out as a tool later - self.pyfile = self.myname # crude but efficient - the cruft won't hurt much - self.xmlfile = '%s.xml' % self.toolname - s = open(self.opts.script_path,'r').readlines() - s = [x.rstrip() for x in s] # remove pesky dos line endings if needed - self.script = '\n'.join(s) - fhandle,self.sfile = tempfile.mkstemp(prefix=self.toolname,suffix=".%s" % (opts.interpreter)) - tscript = open(self.sfile,'w') # use self.sfile as script source for Popen - tscript.write(self.script) - tscript.close() - self.indentedScript = '\n'.join([' %s' % html_escape(x) for x in s]) # for restructured text in help - self.escapedScript = '\n'.join([html_escape(x) for x in s]) - self.elog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_error.log" % self.toolname) - if opts.output_dir: # may not want these complexities - self.tlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"%s_runner.log" % self.toolname) - art = '%s.%s' % (self.toolname,opts.interpreter) - artpath = os.path.join(self.opts.output_dir,art) # need full path - artifact = open(artpath,'w') # use self.sfile as script source for Popen - artifact.write(self.script) - artifact.close() - self.cl = [] - self.html = [] - a = self.cl.append - a(opts.interpreter) - if self.treatbashSpecial and opts.interpreter in ['bash','sh']: - a(self.sfile) - else: - a('-') # stdin - a(opts.input_tab) - a(opts.output_tab) - self.outputFormat = self.opts.output_format - self.inputFormats = self.opts.input_formats - self.test1Input = '%s_test1_input.xls' % self.toolname - self.test1Output = '%s_test1_output.xls' % self.toolname - self.test1HTML = '%s_test1_output.html' % self.toolname - - def makeXML(self): - """ - Create a Galaxy xml tool wrapper for the new script as a string to write out - fixme - use templating or something less fugly than this example of what we produce - - - a tabular file - - reverse.py --script_path "$runMe" --interpreter "python" - --tool_name "reverse" --input_tab "$input1" --output_tab "$tab_file" - - - - - - - - - - - -**What it Does** - -Reverse the columns in a tabular file - - - - - -# reverse order of columns in a tabular file -import sys -inp = sys.argv[1] -outp = sys.argv[2] -i = open(inp,'r') -o = open(outp,'w') -for row in i: - rs = row.rstrip().split('\t') - rs.reverse() - o.write('\t'.join(rs)) - o.write('\n') -i.close() -o.close() - - - - - - - """ - newXML=""" -%(tooldesc)s -%(requirements)s - -%(command)s - - -%(inputs)s - - -%(outputs)s - - - -%(script)s - - - -%(tooltests)s - - - -%(help)s - - - - %(citations)s - 10.1093/bioinformatics/bts573 - -""" # needs a dict with toolname, toolid, interpreter, scriptname, command, inputs as a multi line string ready to write, outputs ditto, help ditto - - newCommand=""" - %(toolname)s.py --script_path "$runMe" --interpreter "%(interpreter)s" - --tool_name "%(toolname)s" %(command_inputs)s %(command_outputs)s """ - # may NOT be an input or htmlout - appended later - tooltestsTabOnly = """ - - - - - - - - - """ - tooltestsHTMLOnly = """ - - - - - - - - - """ - tooltestsBoth = """ - - - - - - - - - """ - xdict = {} - xdict['outputFormat'] = self.outputFormat - xdict['inputFormats'] = self.inputFormats - xdict['requirements'] = '' - if self.opts.make_HTML: - if self.opts.include_dependencies == "yes": - xdict['requirements'] = protorequirements - xdict['tool_version'] = self.opts.tool_version - xdict['test1Input'] = self.test1Input - xdict['test1HTML'] = self.test1HTML - xdict['test1Output'] = self.test1Output - if self.opts.make_HTML and self.opts.output_tab <> 'None': - xdict['tooltests'] = tooltestsBoth % xdict - elif self.opts.make_HTML: - xdict['tooltests'] = tooltestsHTMLOnly % xdict - else: - xdict['tooltests'] = tooltestsTabOnly % xdict - xdict['script'] = self.escapedScript - # configfile is least painful way to embed script to avoid external dependencies - # but requires escaping of <, > and $ to avoid Mako parsing - if self.opts.help_text: - helptext = open(self.opts.help_text,'r').readlines() - helptext = [html_escape(x) for x in helptext] # must html escape here too - thanks to Marius van den Beek - xdict['help'] = ''.join([x for x in helptext]) - else: - xdict['help'] = 'Please ask the tool author (%s) for help as none was supplied at tool generation\n' % (self.opts.user_email) - if self.opts.citations: - citationstext = open(self.opts.citations,'r').read() - citation_tuples = parse_citations(citationstext) - citations_xml = "" - for citation_type, citation_content in citation_tuples: - citation_xml = """%s""" % (citation_type, html_escape(citation_content)) - citations_xml += citation_xml - xdict['citations'] = citations_xml - else: - xdict['citations'] = "" - coda = ['**Script**','Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history::'] - coda.append('\n') - coda.append(self.indentedScript) - coda.append('\n**Attribution**\nThis Galaxy tool was created by %s at %s\nusing the Galaxy Tool Factory.\n' % (self.opts.user_email,timenow())) - coda.append('See %s for details of that project' % (toolFactoryURL)) - coda.append('Please cite: Creating re-usable tools from scripts: The Galaxy Tool Factory. Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. ') - coda.append('Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573\n') - xdict['help'] = '%s\n%s' % (xdict['help'],'\n'.join(coda)) - if self.opts.tool_desc: - xdict['tooldesc'] = '%s' % self.opts.tool_desc - else: - xdict['tooldesc'] = '' - xdict['command_outputs'] = '' - xdict['outputs'] = '' - if self.opts.input_tab <> 'None': - xdict['command_inputs'] = '--input_tab "$input1" ' # the space may matter a lot if we append something - xdict['inputs'] = ' \n' % self.inputFormats - else: - xdict['command_inputs'] = '' # assume no input - eg a random data generator - xdict['inputs'] = '' - xdict['inputs'] += ' \n' % self.toolname - xdict['toolname'] = self.toolname - xdict['toolid'] = self.toolid - xdict['interpreter'] = self.opts.interpreter - xdict['scriptname'] = self.sfile - if self.opts.make_HTML: - xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes"' - xdict['outputs'] += ' \n' - else: - xdict['command_outputs'] += ' --output_dir "./"' - if self.opts.output_tab <> 'None': - xdict['command_outputs'] += ' --output_tab "$tab_file"' - xdict['outputs'] += ' \n' % self.outputFormat - xdict['command'] = newCommand % xdict - xmls = newXML % xdict - xf = open(self.xmlfile,'w') - xf.write(xmls) - xf.write('\n') - xf.close() - # ready for the tarball - - - def makeTooltar(self): - """ - a tool is a gz tarball with eg - /toolname/tool.xml /toolname/tool.py /toolname/test-data/test1_in.foo ... - """ - retval = self.run() - if retval: - print >> sys.stderr,'## Run failed. Cannot build yet. Please fix and retry' - sys.exit(1) - tdir = self.toolname - os.mkdir(tdir) - self.makeXML() - if self.opts.make_HTML: - if self.opts.help_text: - hlp = open(self.opts.help_text,'r').read() - else: - hlp = 'Please ask the tool author for help as none was supplied at tool generation\n' - if self.opts.include_dependencies: - tooldepcontent = toolhtmldepskel % hlp - depf = open(os.path.join(tdir,'tool_dependencies.xml'),'w') - depf.write(tooldepcontent) - depf.write('\n') - depf.close() - if self.opts.input_tab <> 'None': # no reproducible test otherwise? TODO: maybe.. - testdir = os.path.join(tdir,'test-data') - os.mkdir(testdir) # make tests directory - shutil.copyfile(self.opts.input_tab,os.path.join(testdir,self.test1Input)) - if self.opts.output_tab <> 'None': - shutil.copyfile(self.opts.output_tab,os.path.join(testdir,self.test1Output)) - if self.opts.make_HTML: - shutil.copyfile(self.opts.output_html,os.path.join(testdir,self.test1HTML)) - if self.opts.output_dir: - shutil.copyfile(self.tlog,os.path.join(testdir,'test1_out.log')) - outpif = '%s.py' % self.toolname # new name - outpiname = os.path.join(tdir,outpif) # path for the tool tarball - pyin = os.path.basename(self.pyfile) # our name - we rewrite ourselves (TM) - notes = ['# %s - a self annotated version of %s generated by running %s\n' % (outpiname,pyin,pyin),] - notes.append('# to make a new Galaxy tool called %s\n' % self.toolname) - notes.append('# User %s at %s\n' % (self.opts.user_email,timenow())) - pi = open(self.pyfile,'r').readlines() # our code becomes new tool wrapper (!) - first Galaxy worm - notes += pi - outpi = open(outpiname,'w') - outpi.write(''.join(notes)) - outpi.write('\n') - outpi.close() - stname = os.path.join(tdir,self.sfile) - if not os.path.exists(stname): - shutil.copyfile(self.sfile, stname) - xtname = os.path.join(tdir,self.xmlfile) - if not os.path.exists(xtname): - shutil.copyfile(self.xmlfile,xtname) - tarpath = "%s.gz" % self.toolname - tar = tarfile.open(tarpath, "w:gz") - tar.add(tdir,arcname=self.toolname) - tar.close() - shutil.copyfile(tarpath,self.opts.new_tool) - shutil.rmtree(tdir) - ## TODO: replace with optional direct upload to local toolshed? - return retval - - - def compressPDF(self,inpdf=None,thumbformat='png'): - """need absolute path to pdf - note that GS gets confoozled if no $TMP or $TEMP - so we set it - """ - assert os.path.isfile(inpdf), "## Input %s supplied to %s compressPDF not found" % (inpdf,self.myName) - hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"compress_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) - sto = open(hlog,'a') - our_env = os.environ.copy() - our_tmp = our_env.get('TMP',None) - if not our_tmp: - our_tmp = our_env.get('TEMP',None) - if not (our_tmp and os.path.exists(our_tmp)): - newtmp = os.path.join(self.opts.output_dir,'tmp') - try: - os.mkdir(newtmp) - except: - sto.write('## WARNING - cannot make %s - it may exist or permissions need fixing\n' % newtmp) - our_env['TEMP'] = newtmp - if not self.temp_warned: - sto.write('## WARNING - no $TMP or $TEMP!!! Please fix - using %s temporarily\n' % newtmp) - self.temp_warned = True - outpdf = '%s_compressed' % inpdf - cl = ["gs", "-sDEVICE=pdfwrite", "-dNOPAUSE", "-dUseCIEColor", "-dBATCH","-dPDFSETTINGS=/printer", "-sOutputFile=%s" % outpdf,inpdf] - x = subprocess.Popen(cl,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) - retval1 = x.wait() - sto.close() - if retval1 == 0: - os.unlink(inpdf) - shutil.move(outpdf,inpdf) - os.unlink(hlog) - hlog = os.path.join(self.opts.output_dir,"thumbnail_%s.txt" % os.path.basename(inpdf)) - sto = open(hlog,'w') - outpng = '%s.%s' % (os.path.splitext(inpdf)[0],thumbformat) - if self.useGM: - cl2 = ['gm', 'convert', inpdf, outpng] - else: # assume imagemagick - cl2 = ['convert', inpdf, outpng] - x = subprocess.Popen(cl2,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir,env=our_env) - retval2 = x.wait() - sto.close() - if retval2 == 0: - os.unlink(hlog) - retval = retval1 or retval2 - return retval - - - def getfSize(self,fpath,outpath): - """ - format a nice file size string - """ - size = '' - fp = os.path.join(outpath,fpath) - if os.path.isfile(fp): - size = '0 B' - n = float(os.path.getsize(fp)) - if n > 2**20: - size = '%1.1f MB' % (n/2**20) - elif n > 2**10: - size = '%1.1f KB' % (n/2**10) - elif n > 0: - size = '%d B' % (int(n)) - return size - - def makeHtml(self): - """ Create an HTML file content to list all the artifacts found in the output_dir - """ - - galhtmlprefix = """ - - - - - - - -
- """ - galhtmlattr = """
This tool (%s) was generated by the Galaxy Tool Factory

""" - galhtmlpostfix = """
\n""" - - flist = os.listdir(self.opts.output_dir) - flist = [x for x in flist if x <> 'Rplots.pdf'] - flist.sort() - html = [] - html.append(galhtmlprefix % progname) - html.append('
Galaxy Tool "%s" run at %s

' % (self.toolname,timenow())) - fhtml = [] - if len(flist) > 0: - logfiles = [x for x in flist if x.lower().endswith('.log')] # log file names determine sections - logfiles.sort() - logfiles = [x for x in logfiles if os.path.abspath(x) <> os.path.abspath(self.tlog)] - logfiles.append(os.path.abspath(self.tlog)) # make it the last one - pdflist = [] - npdf = len([x for x in flist if os.path.splitext(x)[-1].lower() == '.pdf']) - for rownum,fname in enumerate(flist): - dname,e = os.path.splitext(fname) - sfsize = self.getfSize(fname,self.opts.output_dir) - if e.lower() == '.pdf' : # compress and make a thumbnail - thumb = '%s.%s' % (dname,self.thumbformat) - pdff = os.path.join(self.opts.output_dir,fname) - retval = self.compressPDF(inpdf=pdff,thumbformat=self.thumbformat) - if retval == 0: - pdflist.append((fname,thumb)) - else: - pdflist.append((fname,fname)) - if (rownum+1) % 2 == 0: - fhtml.append('%s%s' % (fname,fname,sfsize)) - else: - fhtml.append('%s%s' % (fname,fname,sfsize)) - for logfname in logfiles: # expect at least tlog - if more - if os.path.abspath(logfname) == os.path.abspath(self.tlog): # handled later - sectionname = 'All tool run' - if (len(logfiles) > 1): - sectionname = 'Other' - ourpdfs = pdflist - else: - realname = os.path.basename(logfname) - sectionname = os.path.splitext(realname)[0].split('_')[0] # break in case _ added to log - ourpdfs = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] == sectionname] - pdflist = [x for x in pdflist if os.path.basename(x[0]).split('_')[0] <> sectionname] # remove - nacross = 1 - npdf = len(ourpdfs) - - if npdf > 0: - nacross = math.sqrt(npdf) ## int(round(math.log(npdf,2))) - if int(nacross)**2 != npdf: - nacross += 1 - nacross = int(nacross) - width = min(400,int(1200/nacross)) - html.append('
%s images and outputs
' % sectionname) - html.append('(Click on a thumbnail image to download the corresponding original PDF image)
') - ntogo = nacross # counter for table row padding with empty cells - html.append('
\n') - for i,paths in enumerate(ourpdfs): - fname,thumb = paths - s= """\n""" % (fname,thumb,fname,width,fname) - if ((i+1) % nacross == 0): - s += '\n' - ntogo = 0 - if i < (npdf - 1): # more to come - s += '' - ntogo = nacross - else: - ntogo -= 1 - html.append(s) - if html[-1].strip().endswith(''): - html.append('
Image called %s
\n') - else: - if ntogo > 0: # pad - html.append(' '*ntogo) - html.append('\n') - logt = open(logfname,'r').readlines() - logtext = [x for x in logt if x.strip() > ''] - html.append('
%s log output
' % sectionname) - if len(logtext) > 1: - html.append('\n
\n')
-                    html += logtext
-                    html.append('\n
\n') - else: - html.append('%s is empty
' % logfname) - if len(fhtml) > 0: - fhtml.insert(0,'
\n') - fhtml.append('
Output File Name (click to view)Size

') - html.append('
All output files available for downloading
\n') - html += fhtml # add all non-pdf files to the end of the display - else: - html.append('
### Error - %s returned no files - please confirm that parameters are sane
' % self.opts.interpreter) - html.append(galhtmlpostfix) - htmlf = file(self.opts.output_html,'w') - htmlf.write('\n'.join(html)) - htmlf.write('\n') - htmlf.close() - self.html = html - - - def run(self): - """ - scripts must be small enough not to fill the pipe! - """ - if self.treatbashSpecial and self.opts.interpreter in ['bash','sh']: - retval = self.runBash() - else: - if self.opts.output_dir: - ste = open(self.elog,'w') - sto = open(self.tlog,'w') - sto.write('## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl)) - sto.flush() - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=ste,stdin=subprocess.PIPE,cwd=self.opts.output_dir) - else: - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdin=subprocess.PIPE) - p.stdin.write(self.script) - p.stdin.close() - retval = p.wait() - if self.opts.output_dir: - sto.close() - ste.close() - err = open(self.elog,'r').readlines() - if retval <> 0 and err: # problem - print >> sys.stderr,err - if self.opts.make_HTML: - self.makeHtml() - return retval - - def runBash(self): - """ - cannot use - for bash so use self.sfile - """ - if self.opts.output_dir: - s = '## Toolfactory generated command line = %s\n' % ' '.join(self.cl) - sto = open(self.tlog,'w') - sto.write(s) - sto.flush() - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False,stdout=sto,stderr=sto,cwd=self.opts.output_dir) - else: - p = subprocess.Popen(self.cl,shell=False) - retval = p.wait() - if self.opts.output_dir: - sto.close() - if self.opts.make_HTML: - self.makeHtml() - return retval - - -def main(): - u = """ - This is a Galaxy wrapper. It expects to be called by a special purpose tool.xml as: - rgBaseScriptWrapper.py --script_path "$scriptPath" --tool_name "foo" --interpreter "Rscript" - - """ - op = optparse.OptionParser() - a = op.add_option - a('--script_path',default=None) - a('--tool_name',default=None) - a('--interpreter',default=None) - a('--output_dir',default='./') - a('--output_html',default=None) - a('--input_tab',default="None") - a('--input_formats',default="tabular,text") - a('--output_tab',default="None") - a('--output_format',default="tabular") - a('--user_email',default='Unknown') - a('--bad_user',default=None) - a('--make_Tool',default=None) - a('--make_HTML',default=None) - a('--help_text',default=None) - a('--citations',default=None) - a('--tool_desc',default=None) - a('--new_tool',default=None) - a('--tool_version',default=None) - a('--include_dependencies',default=None) - opts, args = op.parse_args() - assert not opts.bad_user,'UNAUTHORISED: %s is NOT authorized to use this tool until Galaxy admin adds %s to admin_users in universe_wsgi.ini' % (opts.bad_user,opts.bad_user) - assert opts.tool_name,'## Tool Factory expects a tool name - eg --tool_name=DESeq' - assert opts.interpreter,'## Tool Factory wrapper expects an interpreter - eg --interpreter=Rscript' - assert os.path.isfile(opts.script_path),'## Tool Factory wrapper expects a script path - eg --script_path=foo.R' - if opts.output_dir: - try: - os.makedirs(opts.output_dir) - except: - pass - r = ScriptRunner(opts) - if opts.make_Tool: - retcode = r.makeTooltar() - else: - retcode = r.run() - os.unlink(r.sfile) - if retcode: - sys.exit(retcode) # indicate failure to job runner - - -if __name__ == "__main__": - main() - - - diff -r f6ea3e1cdfb9 -r c3956b7cb71f cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.xml --- a/cloudmap_zf_hom_mapping/cloudmap_zf_hom_mapping.xml Fri Oct 10 12:36:10 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,1298 +0,0 @@ - -This tool plots adjusted homozygosity ratios for zebrafish bulk sergeant analysis - - - - cloudmap_zf_hom_mapping.py --script_path "$runMe" --interpreter "Rscript" - --tool_name "cloudmap_zf_hom_mapping" --input_tab "$input1" --output_dir "$html_file.files_path" --output_html "$html_file" --make_HTML "yes" - - - - - - - - - - - - -ourargs = commandArgs(TRUE) -#Homozygosity-mapping script -#input file: Q200 variants no wildtype - -inf = ourargs[1] -outf = ourargs[2] -Q200var = read.table(inf) - -het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] -hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] - -get_hom1 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom2 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom3 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom4 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom5 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom6 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom7 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom8 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom9 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom10 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom11 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom12 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom13 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom14 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom15 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom16 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom17 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom18 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom19 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom20 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom21 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom22 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom23 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom24 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -get_hom25 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) -} - -h1 <- get_hom1(hom,het) -h2 <- get_hom2(hom,het) -h3 <- get_hom3(hom,het) -h4 <- get_hom4(hom,het) -h5 <- get_hom5(hom,het) -h6 <- get_hom6(hom,het) -h7 <- get_hom7(hom,het) -h8 <- get_hom8(hom,het) -h9 <- get_hom9(hom,het) -h10 <- get_hom10(hom,het) -h11 <- get_hom11(hom,het) -h12 <- get_hom12(hom,het) -h13 <- get_hom13(hom,het) -h14 <- get_hom14(hom,het) -h15 <- get_hom15(hom,het) -h16 <- get_hom16(hom,het) -h17 <- get_hom17(hom,het) -h18 <- get_hom18(hom,het) -h19 <- get_hom19(hom,het) -h20 <- get_hom20(hom,het) -h21 <- get_hom21(hom,het) -h22 <- get_hom22(hom,het) -h23 <- get_hom23(hom,het) -h24 <- get_hom24(hom,het) -h25 <- get_hom25(hom,het) - - - -#Extracting maxima (VDM-mapping) - -zero_crossings_maxima <- function(x,y){ - - dy <- diff(y) - xn <- x[2:length(x)] - - n <- length(dy) - t1 <- dy[1:n-1]; - t2 <- dy[2:n]; - tt <- t1*t2 - ind <- which(tt < 0) - - # print out the maxima - d2y <- diff(dy) - vind <- c() - vy <- c() - vxn <- c() - - xnn <- x[3:length(x)] - for(i in 1:length(ind)){ - ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') - if( d2y[ind[i]] < 0 ){ - ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) - vind <- c(vind, ind[i]) - vy <- c(vy, y[ind[i]]) - vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) - } - } - - maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) - maxima <- maxima[order(maxima\$y),] - - #print( maxima ) - - results <- list() - results\$dy <- dy - results\$xn <- xn - results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] - - return(results) -} - -res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) -res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) -res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) -res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) -res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) -res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) -res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) -res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) -res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) -res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) -res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) -res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) -res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) -res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) -res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) -res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) -res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) -res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) -res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) -res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) -res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) -res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) -res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) -res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) -res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) - - -#plotting (including maxima and adjusting to max ratio) -# all on one plot -pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) -library(Hmisc) -ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) -par(mfrow=c(5,5)) -plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") -points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") -points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") -points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") -points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") -points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") -points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") -points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") -points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") -points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") -points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") -points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") -points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") -points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") -points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") -points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") -points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") -points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") -points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") -points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") -points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") -points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") -points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") -points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") -points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") -points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(10) -dev.off() - -# seperate plots -pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) -plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") -points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) -plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") -points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr3.pdf",height=5, width=10) -plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") -points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr4.pdf",height=5, width=10) -plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") -points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr5.pdf",height=5, width=10) -plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") -points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr6.pdf",height=5, width=10) -plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") -points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr7.pdf",height=5, width=10) -plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") -points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr8.pdf",height=5, width=10) -plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") -points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr9.pdf",height=5, width=10) -plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") -points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) -plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") -points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) -plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") -points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr12.pdf",height=5, width=10) -plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") -points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr13.pdf",height=5, width=10) -plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") -points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr14.pdf",height=5, width=10) -plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") -points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr15.pdf",height=5, width=10) -plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") -points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr16.pdf",height=5, width=10) -plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") -points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr17.pdf",height=5, width=10) -plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") -points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr18.pdf",height=5, width=10) -plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") -points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr19.pdf",height=5, width=10) -plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") -points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr20.pdf",height=5, width=10) -plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") -points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr21.pdf",height=5, width=10) -plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") -points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr22.pdf",height=5, width=10) -plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") -points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr23.pdf",height=5, width=10) -plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") -points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr24.pdf",height=5, width=10) -plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") -points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(nx=10) -dev.off() -pdf("chr25.pdf",height=5, width=10) -plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") -points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) -abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) -legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) -minor.tick(10) -dev.off() - - - - - - - - - - - - - - - - - -**What it Does** - -This tool takes as input a VCF list of SNPs from pooled bulk-segregant zebrafish WGS or RNASeq data. This VCF should be quality filtered (usually Q200) and have had wild type SNPs/indels subtracted. This file is generated when running the zebrafish WGS or RNA-seq CloudMap workflows. It plots adjusted homozygosity ratios as in ores to determine the likely position of a causative mutation. This tool was created by Richard J. Poole (UCL) using TooolFactory and is described in: - -IN PRESS - -**Script** -Pressing execute will run the following code over your input file and generate some outputs in your history:: - - - ourargs = commandArgs(TRUE) - #Homozygosity-mapping script - #input file: Q200 variants no wildtype - - inf = ourargs[1] - outf = ourargs[2] - Q200var = read.table(inf) - - het <- Q200var[grep("AF=0.5",Q200var\$V8), ] - hom <- Q200var[grep("AF=1.0",Q200var\$V8), ] - - get_hom1 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr1") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr1") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom2 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr2") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr2") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom3 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr3") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr3") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom4 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr4") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr4") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom5 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr5") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr5") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom6 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr6") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr6") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom7 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr7") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr7") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom8 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr8") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr8") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom9 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr9") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr9") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom10 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr10") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr10") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom11 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr11") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr11") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom12 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr12") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr12") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom13 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr13") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr13") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom14 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr14") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr14") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom15 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr15") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr15") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom16 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr16") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr16") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom17 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr17") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr17") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom18 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr18") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr18") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom19 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr19") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr19") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom20 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr20") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr20") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom21 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr21") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr21") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom22 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr22") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr22") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom23 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr23") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr23") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom24 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr24") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr24") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - get_hom25 <- function(x1,x2){ - hom <- subset(x1,x1\$V1=="chr25") - het <- subset(x2,x2\$V1=="chr25") - d1 <- density(hom\$V2) - d2 <- density(het\$V2) - return(list( x=d1\$x, ratio=(d1\$y/d2\$y)*(nrow(hom)/nrow(het)))) - } - - h1 <- get_hom1(hom,het) - h2 <- get_hom2(hom,het) - h3 <- get_hom3(hom,het) - h4 <- get_hom4(hom,het) - h5 <- get_hom5(hom,het) - h6 <- get_hom6(hom,het) - h7 <- get_hom7(hom,het) - h8 <- get_hom8(hom,het) - h9 <- get_hom9(hom,het) - h10 <- get_hom10(hom,het) - h11 <- get_hom11(hom,het) - h12 <- get_hom12(hom,het) - h13 <- get_hom13(hom,het) - h14 <- get_hom14(hom,het) - h15 <- get_hom15(hom,het) - h16 <- get_hom16(hom,het) - h17 <- get_hom17(hom,het) - h18 <- get_hom18(hom,het) - h19 <- get_hom19(hom,het) - h20 <- get_hom20(hom,het) - h21 <- get_hom21(hom,het) - h22 <- get_hom22(hom,het) - h23 <- get_hom23(hom,het) - h24 <- get_hom24(hom,het) - h25 <- get_hom25(hom,het) - - - - #Extracting maxima (VDM-mapping) - - zero_crossings_maxima <- function(x,y){ - - dy <- diff(y) - xn <- x[2:length(x)] - - n <- length(dy) - t1 <- dy[1:n-1]; - t2 <- dy[2:n]; - tt <- t1*t2 - ind <- which(tt < 0) - - # print out the maxima - d2y <- diff(dy) - vind <- c() - vy <- c() - vxn <- c() - - xnn <- x[3:length(x)] - for(i in 1:length(ind)){ - ### cat( ind[i], d2y[ind[i]], '\n') - if( d2y[ind[i]] < 0 ){ - ### cat(ind[i], y[ind[i]], xn[ind[i]], "\n" ) - vind <- c(vind, ind[i]) - vy <- c(vy, y[ind[i]]) - vxn <- c(vxn, xn[ind[i]]) - } - } - - maxima <- data.frame(ind=vind, y=vy, x=vxn) - maxima <- maxima[order(maxima\$y),] - - #print( maxima ) - - results <- list() - results\$dy <- dy - results\$xn <- xn - results\$maxima <- maxima[ order(maxima\$y, decreasing=T), ] - - return(results) - } - - res1 <- zero_crossings_maxima(h1\$x,h1\$ratio) - res2 <- zero_crossings_maxima(h2\$x,h2\$ratio) - res3 <- zero_crossings_maxima(h3\$x,h3\$ratio) - res4 <- zero_crossings_maxima(h4\$x,h4\$ratio) - res5 <- zero_crossings_maxima(h5\$x,h5\$ratio) - res6 <- zero_crossings_maxima(h6\$x,h6\$ratio) - res7 <- zero_crossings_maxima(h7\$x,h7\$ratio) - res8 <- zero_crossings_maxima(h8\$x,h8\$ratio) - res9 <- zero_crossings_maxima(h9\$x,h9\$ratio) - res10 <- zero_crossings_maxima(h10\$x,h10\$ratio) - res11 <- zero_crossings_maxima(h11\$x,h11\$ratio) - res12 <- zero_crossings_maxima(h12\$x,h12\$ratio) - res13 <- zero_crossings_maxima(h13\$x,h13\$ratio) - res14 <- zero_crossings_maxima(h14\$x,h14\$ratio) - res15 <- zero_crossings_maxima(h15\$x,h15\$ratio) - res16 <- zero_crossings_maxima(h16\$x,h16\$ratio) - res17 <- zero_crossings_maxima(h17\$x,h17\$ratio) - res18 <- zero_crossings_maxima(h18\$x,h18\$ratio) - res19 <- zero_crossings_maxima(h19\$x,h19\$ratio) - res20 <- zero_crossings_maxima(h20\$x,h20\$ratio) - res21 <- zero_crossings_maxima(h21\$x,h21\$ratio) - res22 <- zero_crossings_maxima(h22\$x,h22\$ratio) - res23 <- zero_crossings_maxima(h23\$x,h23\$ratio) - res24 <- zero_crossings_maxima(h24\$x,h24\$ratio) - res25 <- zero_crossings_maxima(h25\$x,h25\$ratio) - - - #plotting (including maxima and adjusting to max ratio) - # all on one plot - pdf("allchrs.pdf",height=10, width=20) - library(Hmisc) - ymax <- 1.05*max( c(h1\$ratio,h2\$ratio,h3\$ratio,h4\$ratio,h5\$ratio,h6\$ratio,h7\$ratio,h8\$ratio,h9\$ratio,h10\$ratio,h11\$ratio,h12\$ratio,h13\$ratio,h14\$ratio,h15\$ratio,h16\$ratio,h17\$ratio,h18\$ratio,h19\$ratio,h20\$ratio,h21\$ratio,h22\$ratio,h23\$ratio,h24\$ratio,h25\$ratio)) - par(mfrow=c(5,5)) - plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") - points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") - points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") - points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") - points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") - points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") - points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") - points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") - points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") - points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") - points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") - points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") - points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res12\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h13\$x, h13\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,55000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 13") - points( res13\$maxima\$x[1], res13\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res13\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res13\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h14\$x, h14\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 14") - points( res14\$maxima\$x[1], res14\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res14\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res14\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") - points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") - points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") - points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") - points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") - points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") - points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") - points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h22\$x, h22\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,43000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 22") - points( res22\$maxima\$x[1], res22\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res22\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res22\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h23\$x, h23\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 23") - points( res23\$maxima\$x[1], res23\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res23\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res23\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h24\$x, h24\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,44000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 24") - points( res24\$maxima\$x[1], res24\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res24\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res24\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - plot(h25\$x, h25\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,39000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 25") - points( res25\$maxima\$x[1], res25\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res25\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", paste(format(round(res25\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(10) - dev.off() - - # seperate plots - pdf("chr1.pdf",height=5, width=10) - plot(h1\$x, h1\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 1") - points( res1\$maxima\$x[1], res1\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res1\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res1\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr2.pdf",height=5, width=10) - plot(h2\$x, h2\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,61000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 2") - points( res2\$maxima\$x[1], res2\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res2\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res2\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr3.pdf",height=5, width=10) - plot(h3\$x, h3\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,64000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 3") - points( res3\$maxima\$x[1], res3\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res3\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res3\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr4.pdf",height=5, width=10) - plot(h4\$x, h4\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,64000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 4") - points( res4\$maxima\$x[1], res4\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res4\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res4\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr5.pdf",height=5, width=10) - plot(h5\$x, h5\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,76000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 5") - points( res5\$maxima\$x[1], res5\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res5\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res5\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr6.pdf",height=5, width=10) - plot(h6\$x, h6\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,60000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 6") - points( res6\$maxima\$x[1], res6\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res6\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res6\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr7.pdf",height=5, width=10) - plot(h7\$x, h7\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,78000000),ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 7") - points( res7\$maxima\$x[1], res7\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res7\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res7\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr8.pdf",height=5, width=10) - plot(h8\$x, h8\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,57000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 8") - points( res8\$maxima\$x[1], res8\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res8\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res8\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr9.pdf",height=5, width=10) - plot(h9\$x, h9\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio" , main="Chromosome 9") - points( res9\$maxima\$x[1], res9\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res9\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res9\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr10.pdf",height=5, width=10) - plot(h10\$x, h10\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 10") - points( res10\$maxima\$x[1], res10\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res10\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res10\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr11.pdf",height=5, width=10) - plot(h11\$x, h11\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,47000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 11") - points( res11\$maxima\$x[1], res11\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res11\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res11\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr12.pdf",height=5, width=10) - plot(h12\$x, h12\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 12") - points( res12\$maxima\$x[1], res12\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res12\$maxima\$x[1], lwd=1) - 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dev.off() - pdf("chr15.pdf",height=5, width=10) - plot(h15\$x, h15\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,48000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 15") - points( res15\$maxima\$x[1], res15\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res15\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res15\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr16.pdf",height=5, width=10) - plot(h16\$x, h16\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,59000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 16") - points( res16\$maxima\$x[1], res16\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res16\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res16\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr17.pdf",height=5, width=10) - plot(h17\$x, h17\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,54000000),, ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 17") - points( res17\$maxima\$x[1], res17\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res17\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res17\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr18.pdf",height=5, width=10) - plot(h18\$x, h18\$ratio,type="l", lwd=3, col="red", xlim=c(0,50000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 18") - points( res18\$maxima\$x[1], res18\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res18\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res18\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr19.pdf",height=5, width=10) - plot(h19\$x, h19\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,51000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", , main="Chromosome 19") - points( res19\$maxima\$x[1], res19\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res19\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res19\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr20.pdf",height=5, width=10) - plot(h20\$x, h20\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,56000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 20") - points( res20\$maxima\$x[1], res20\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res20\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res20\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - dev.off() - pdf("chr21.pdf",height=5, width=10) - plot(h21\$x, h21\$ratio,type="l", lwd=3, col="red",, xlim=c(0,45000000), ylim=c(0,ymax), xlab="Location (Mb)", ylab="Adjusted homozygosity ratio", main="Chromosome 21") - points( res21\$maxima\$x[1], res21\$maxima\$y[1], col="red", pch=19 ) - abline(v=res21\$maxima\$x[1], lwd=1) - legend("topleft", bty="n", legend=paste(format(round(res21\$maxima\$x[1] ,0),nsmall=0) ) ) - minor.tick(nx=10) - 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Ross Lazarus; Antony Kaspi; Mark Ziemann; The Galaxy Team. -Bioinformatics 2012; doi: 10.1093/bioinformatics/bts573 - - - - - - 10.1093/bioinformatics/bts573 - - diff -r f6ea3e1cdfb9 -r c3956b7cb71f cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_input.xls --- a/cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/cloudmap_zf_hom_mapping_test1_input.xls Fri Oct 10 12:36:10 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,31522 +0,0 @@ -##fileformat=VCFv4.1 -##FILTER= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##FORMAT= -##GATKCommandLine= -##GATKCommandLine= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##INFO= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= -##contig= 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T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,671 -Zv9_scaffold3454 21770 . A C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,671 -Zv9_scaffold3454 22804 . C G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.759;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,438 -Zv9_scaffold3454 22806 . C A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=1.256;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:444,0,438 -Zv9_scaffold3455 137636 . G C 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.335;DP=91;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:1072,0,1490 -Zv9_scaffold3455 152119 . T G 2385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-0.290;DP=106;FS=2.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,79:106:99:2414,0,450 -Zv9_scaffold3455 157578 . C T 2063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.287;DP=80;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,68:80:39:2092,0,39 -Zv9_scaffold3455 167332 . T C 2140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.493;DP=83;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=25.79;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,64:83:99:2169,0,326 -Zv9_scaffold3455 315213 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-2.167;DP=59;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=7.23;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:455,0,1420 -Zv9_scaffold3455 315231 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.535;DP=67;FS=11.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:251,0,2965 -Zv9_scaffold3455 338319 . C A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=1.588;DP=35;FS=5.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:308,0,1635 -Zv9_scaffold3455 338336 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=1.706;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:318,0,1635 -Zv9_scaffold3455 338616 . G T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-1.130;DP=43;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:496,0,778 -Zv9_scaffold3455 339404 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.053;DP=55;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:306,0,1442 -Zv9_scaffold3455 340752 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.789;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:296,0,1437 -Zv9_scaffold3455 348721 . A AT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.703;DP=46;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:244,0,534 -Zv9_scaffold3455 371724 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.303;DP=71;FS=6.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:245,0,1713 -Zv9_scaffold3455 371760 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.801;ClippingRankSum=0.190;DP=74;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:328,0,1734 -Zv9_scaffold3459 279014 . C CT 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.709;DP=99;FS=29.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:277,0,1809 -Zv9_scaffold3460 60553 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=2.175;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:231,0,625 -Zv9_scaffold3460 60582 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.442;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:231,0,728 -Zv9_scaffold3465 18080 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,161 -Zv9_scaffold3465 18081 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,161 -Zv9_scaffold3465 18784 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=1.246;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=24.10;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:48:438,0,48 -Zv9_scaffold3465 22767 . A T 629.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=1.281;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:658,66,0 -Zv9_scaffold3465 50984 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.610;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:295,0,142 -Zv9_scaffold3465 51565 . A G 1132.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=-2.269;DP=24;FS=10.887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=28.97;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:22:1161,22,0 -Zv9_scaffold3465 51647 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,223 -Zv9_scaffold3465 51973 . A G 568.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.286;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:13:597,0,13 -Zv9_scaffold3465 53241 . G A 254.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:283,0,19 -Zv9_scaffold3465 78032 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=25.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:62:304,0,62 -Zv9_scaffold3465 78440 . G A 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 -Zv9_scaffold3465 78445 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:264,0,231 -Zv9_scaffold3465 91909 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:347,0,210 -Zv9_scaffold3465 92011 . T A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:49:366,0,49 -Zv9_scaffold3465 93647 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.182;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:50:384,0,50 -Zv9_scaffold3465 128487 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.979;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:96:277,0,96 -Zv9_scaffold3465 128976 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:285,0,80 -Zv9_scaffold3465 140771 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.568;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,228 -Zv9_scaffold3465 143798 . G C 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=2.699;DP=28;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:62:786,0,62 -Zv9_scaffold3465 144284 . A G 258.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=25.82;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:286,0,10 -Zv9_scaffold3465 144518 . A C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=26.17;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:72:447,0,72 -Zv9_scaffold3465 158575 . G A 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -Zv9_scaffold3465 203416 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DP=40;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:269,0,961 -Zv9_scaffold3465 203468 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-0.312;DP=30;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:392,0,422 -Zv9_scaffold3465 207020 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.179;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:268,0,414 -Zv9_scaffold3465 207221 . C G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.927;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=20.27;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:758,0,266 -Zv9_scaffold3465 207347 . A C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.282;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:499,0,163 -Zv9_scaffold3465 313030 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,107 -Zv9_scaffold3465 393399 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:308,0,54 -Zv9_scaffold3465 458119 . A G 349.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:376,0,2 -Zv9_scaffold3465 458261 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=-1.917;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:295,0,140 -Zv9_scaffold3469 57647 . T C 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:307,27,0 -Zv9_scaffold3470 55462 . G A 208.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:237,24,0 -Zv9_scaffold3470 265535 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -Zv9_scaffold3470 387644 . C T 277.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:306,24,0 -Zv9_scaffold3471 42665 . T C 1496.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.198;DP=56;FS=4.273;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,48:53:27:1525,27,0 -Zv9_scaffold3471 43215 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=1.315;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:886,0,684 -Zv9_scaffold3474 47071 . A G 207.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:236,0,21 -Zv9_scaffold3476 76577 . T G 353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:382,39,0 -Zv9_scaffold3476 130507 . T A 1093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1122,75,0 -Zv9_scaffold3476 130515 . C T 777.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.433;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:33:806,33,0 -Zv9_scaffold3476 130591 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=30.77;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:53:459,0,53 -Zv9_scaffold3476 130592 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.738;DP=14;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=30.77;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:53:459,0,53 -Zv9_scaffold3476 137161 . T A 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:48:694,48,0 -Zv9_scaffold3476 137166 . A G 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:694,48,0 -Zv9_scaffold3476 137266 . T C 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:39:455,39,0 -Zv9_scaffold3476 137567 . T G 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:446,30,0 -Zv9_scaffold3480 145124 . T C 374.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:403,0,13 -Zv9_scaffold3480 146568 . G T 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:356,24,0 -Zv9_scaffold3480 241275 . T C 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:415,36,0 -Zv9_scaffold3482 156157 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:261,0,262 -Zv9_scaffold3482 156172 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:322,0,290 -Zv9_scaffold3484 96372 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=4.104;DP=41;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=7.48;ReadPosRankSum=-3.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:335,0,787 -Zv9_scaffold3484 100373 . T A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=1.945;DP=57;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=6.47;ReadPosRankSum=-2.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:397,0,1353 -Zv9_scaffold3484 103934 . TGA T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.481;DP=41;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=5.94;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:281,0,1101 -Zv9_scaffold3485 66847 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.306;DP=112;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:265,0,3414 -Zv9_scaffold3485 75561 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-3.871;DP=37;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:273,0,803 -Zv9_scaffold3485 75702 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-3.355;DP=52;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.185;QD=10.05;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:551,0,2185 -Zv9_scaffold3485 75705 . G T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-2.064;DP=54;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=9.85;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:560,0,2185 -Zv9_scaffold3485 78012 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=1.871;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:397,0,1048 -Zv9_scaffold3485 78016 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.347;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:237,0,2893 -Zv9_scaffold3485 78022 . A T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.285;DP=40;FS=11.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:566,0,1010 -Zv9_scaffold3485 89322 . G T 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.830;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1269,0,1158 -Zv9_scaffold3485 170500 . A C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -Zv9_scaffold3485 232737 . T A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.328;DP=58;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:858,0,936 -Zv9_scaffold3485 232922 . C T 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-0.744;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=18.21;ReadPosRankSum=-1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,42:69:99:1285,0,928 -Zv9_scaffold3485 237912 . G A 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.938;DP=80;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1284,0,839 -Zv9_scaffold3485 253469 . G A 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.006;DP=71;FS=6.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1277,0,789 -Zv9_scaffold3485 253644 . AAGGTAGTGAAGTCTTTAAGTGTCAGACTGACTTGAGTTTTGGATGTCATGTTGCAGTCCCCTTAGATCCCATTGCTGTGTTTCTCCAAC A 1857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=1.213;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=22.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1895,167,0 -Zv9_scaffold3485 255940 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=-1.397;DP=49;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,32:49:99:875,0,547 -Zv9_scaffold3485 256561 . T G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:347,0,576 -Zv9_scaffold3485 256563 . CT C 609.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=-1.449;DP=17;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=33.73;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:1:644,0,1 -Zv9_scaffold3486 73810 . G C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:526,39,0 -Zv9_scaffold3486 73949 . G A 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 -Zv9_scaffold3487 79050 . T A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:57:318,0,57 -Zv9_scaffold3487 79097 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:80:250,0,80 -Zv9_scaffold3487 79192 . AAT A 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=30.92;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:88:532,0,88 -Zv9_scaffold3487 175064 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:253,0,164 -Zv9_scaffold3487 177505 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -Zv9_scaffold3487 178024 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=1.206;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:404,0,448 -Zv9_scaffold3487 181528 . A C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.667;DP=59;FS=8.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:387,0,1118 -Zv9_scaffold3487 196553 . C T 845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:874,66,0 -Zv9_scaffold3487 196694 . C A 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-2.481;DP=78;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1239,0,843 -Zv9_scaffold3487 204980 . C A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=-0.080;DP=57;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:370,0,1196 -Zv9_scaffold3487 205023 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-1.341;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=10.74;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,34:71:99:791,0,771 -Zv9_scaffold3487 205089 . T A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.052;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:316,0,453 -Zv9_scaffold3488 10615 . T C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:321,27,0 -Zv9_scaffold3488 12028 . G A 254.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.19;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:282,0,9 -Zv9_scaffold3488 12963 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.609;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:396,0,175 -Zv9_scaffold3488 13146 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.818;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:292,0,543 -Zv9_scaffold3488 99836 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.934;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=31.12;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:46:495,0,46 -Zv9_scaffold3488 166870 . A T 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:304,27,0 -Zv9_scaffold3489 6704 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.131;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:290,0,577 -Zv9_scaffold3489 6833 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=1.140;DP=67;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:301,0,1391 -Zv9_scaffold3489 81017 . C T 354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:383,42,0 -Zv9_scaffold3489 81029 . C T 337.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:366,36,0 -Zv9_scaffold3489 94537 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=1.095;DP=98;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:440,0,1247 -Zv9_scaffold3489 94811 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=-1.431;DP=175;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=4.29;ReadPosRankSum=2.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,42:141:99:779,0,3279 -Zv9_scaffold3489 100281 . T G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=1.456;DP=137;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,28:136:99:283,0,3045 -Zv9_scaffold3490 126513 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-1.003;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=15.41;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:98:244,0,98 -Zv9_scaffold3493 147462 . G A 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:311,27,0 -Zv9_scaffold3493 156598 . T G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -Zv9_scaffold3493 157106 . A C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -Zv9_scaffold3493 157112 . T G 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:295,21,0 -Zv9_scaffold3493 157793 . A C 900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:929,96,0 -Zv9_scaffold3493 157896 . A G 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:19:240,0,19 -Zv9_scaffold3494 12519 . C T 273.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:302,24,0 -Zv9_scaffold3494 13481 . T C 677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.972;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:53:706,53,0 -Zv9_scaffold3494 13520 . C T 606.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.593;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,20:23:17:635,17,0 -Zv9_scaffold3494 18891 . G A 518.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=1.187;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:547,17,0 -Zv9_scaffold3494 18966 . A T 501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:530,45,0 -Zv9_scaffold3494 19359 . A G 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -Zv9_scaffold3494 208591 . G A 251.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:280,0,13 -Zv9_scaffold3494 208673 . G A 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 -Zv9_scaffold3497 48262 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.734;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:265,0,395 -Zv9_scaffold3497 53682 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=-1.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:278,0,398 -Zv9_scaffold3497 53733 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-1.822;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:382,0,332 -Zv9_scaffold3497 54166 . A C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:344,0,357 -Zv9_scaffold3497 77975 . C T 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:234,0,22 -Zv9_scaffold3497 83406 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.212;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:237,0,106 -Zv9_scaffold3499 16407 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:63:277,0,63 -Zv9_scaffold3503 13162 . A C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -Zv9_scaffold3503 13296 . G A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -Zv9_scaffold3503 23293 . A C 209.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:238,24,0 -Zv9_scaffold3503 25674 . A G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=3.183;DP=43;FS=13.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:649,0,920 -Zv9_scaffold3503 25689 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=1.527;DP=52;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:527,0,592 -Zv9_scaffold3503 25791 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=1.156;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=16.17;ReadPosRankSum=-1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:384,0,167 -Zv9_scaffold3503 26296 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.357;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=22.21;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:650,0,460 -Zv9_scaffold3503 26298 . G T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.832;DP=30;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:650,0,460 -Zv9_scaffold3503 26997 . T G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-1.225;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:241,0,593 -Zv9_scaffold3503 363930 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.093;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:374,0,728 -Zv9_scaffold3503 365388 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=3.083;DP=29;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=9.20;ReadPosRankSum=-3.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:295,0,399 -Zv9_scaffold3503 911849 . C T 204.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:233,24,0 -Zv9_scaffold3504 65227 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-0.755;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:230,0,3684 -Zv9_scaffold3504 65307 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.380;DP=64;FS=5.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:337,0,2778 -Zv9_scaffold3504 65726 . G C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.996;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:809,0,5910 -Zv9_scaffold3504 65829 . A C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.651;DP=79;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:745,0,1367 -Zv9_scaffold3506 22068 . T G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -Zv9_scaffold3509 10370 . A T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=-0.802;DP=66;FS=7.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:823,0,962 -Zv9_scaffold3509 10491 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=-0.903;DP=55;FS=17.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:241,0,1203 -Zv9_scaffold3510 271317 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:270,0,100 -Zv9_scaffold3511 27727 . TA T 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=3.230;DP=105;FS=17.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=2.62;ReadPosRankSum=-2.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,10:92:99:312,0,3497 -Zv9_scaffold3511 28019 . C T 3266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-2.567;DP=255;FS=9.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,86:255:99:3295,0,11537 -Zv9_scaffold3511 28022 . G A 3266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-2.896;DP=261;FS=7.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,92:261:99:3295,0,11527 -Zv9_scaffold3511 31732 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.790;DP=573;FS=0.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=0.59;ReadPosRankSum=2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:487,86:573:99:369,0,16083 -Zv9_scaffold3512 16921 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.888;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:234,0,547 -Zv9_scaffold3512 47151 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.930;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.688;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:451,0,379 -Zv9_scaffold3512 64942 . A G 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-0.635;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:515,0,174 -Zv9_scaffold3514 203934 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-1.240;DP=47;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:450,0,400 -Zv9_scaffold3514 203971 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.258;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:320,0,410 -Zv9_scaffold3514 204808 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:244,0,407 -Zv9_scaffold3514 204821 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.585;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:307,0,350 -Zv9_scaffold3516 3240 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=2.337;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=9.72;ReadPosRankSum=-2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:242,0,419 -Zv9_scaffold3516 5637 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.057;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.311;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:359,0,540 -Zv9_scaffold3516 9700 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.225;DP=36;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:340,0,602 -Zv9_scaffold3516 9852 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.019;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:348,0,721 -Zv9_scaffold3518 195526 . C G 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:321,27,0 -Zv9_scaffold3518 419607 . T C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.265;DP=29;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:77:705,0,77 -Zv9_scaffold3518 419954 . C T 600.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.659;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:23:629,23,0 -Zv9_scaffold3518 419972 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.066;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:74:519,0,74 -Zv9_scaffold3519 149326 . G A 1205.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=1.985;DP=50;FS=1.758;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.433;QD=24.11;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,44:50:9:1233,9,0 -Zv9_scaffold3519 149428 . A G 1788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-1.917;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.354;QD=26.23;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:1817,147,0 -Zv9_scaffold3519 171917 . G T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -Zv9_scaffold3519 187130 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.391;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:325,0,253 -Zv9_scaffold3521 64441 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,178 -Zv9_scaffold3521 64523 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:321,0,141 -Zv9_scaffold3522 16797 . T G 744.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.075;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:773,66,0 -Zv9_scaffold3522 19525 . TA T 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:74:253,0,74 -Zv9_scaffold3522 19994 . A G 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -Zv9_scaffold3522 20048 . T TG 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:33:406,0,33 -Zv9_scaffold3522 20861 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:263,0,103 -Zv9_scaffold3522 20933 . A C 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 -Zv9_scaffold3522 20944 . C T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -Zv9_scaffold3522 65629 . C G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=1.257;DP=47;FS=5.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.933;QD=8.25;ReadPosRankSum=2.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:99:416,0,2585 -Zv9_scaffold3522 65638 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=1.584;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:417,0,2585 -Zv9_scaffold3524 37958 . C T 483.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.178;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,22:26:1:509,1,0 -Zv9_scaffold3524 53286 . G C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.972;DP=98;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:486,0,2011 -Zv9_scaffold3524 76152 . T A 501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:530,48,0 -Zv9_scaffold3524 104795 . T C 6386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-1.147;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:6415,523,0 -Zv9_scaffold3524 104856 . G T 1153.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=1.134;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=30.36;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:42:1182,42,0 -Zv9_scaffold3524 104964 . CA C 2250.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2288,185,0 -Zv9_scaffold3524 104979 . T A 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-1.636;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:899,0,1432 -Zv9_scaffold3524 105053 . C G 2694.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-1.083;DP=83;FS=6.243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:2723,231,0 -Zv9_scaffold3525 62193 . AGTGAGTGTCTGATCACCTGATCTACAGTTTGACGTCTGATAATGTGTCTGTAATCTGACTGGACTGTAATGAATTTTTCTCCTGTCTTTCACAG A 6083.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.201;DP=138;FS=3.443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.03;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:6121,486,0 -Zv9_scaffold3527 5934 . A G 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.657;DP=57;FS=7.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:673,0,923 -Zv9_scaffold3530 74761 . G T 221.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:250,0,19 -Zv9_scaffold3530 74784 . G A 264.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.639;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:7:292,0,7 -Zv9_scaffold3530 77384 . C T 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.932;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:80:1040,80,0 -Zv9_scaffold3530 79899 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:287,0,171 -Zv9_scaffold3530 79935 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:246,0,266 -Zv9_scaffold3530 134013 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.741;DP=11;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.43;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:308,0,140 -Zv9_scaffold3530 595015 . A T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -Zv9_scaffold3530 595051 . G T 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=4.919;DP=89;FS=9.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=10.31;ReadPosRankSum=-4.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:946,0,1414 -Zv9_scaffold3530 595162 . G A 1031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:94:1060,94,0 -Zv9_scaffold3530 1454599 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-2.313;DP=30;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:397,0,254 -Zv9_scaffold3530 1454614 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-2.948;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:391,0,460 -Zv9_scaffold3530 1509652 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -Zv9_scaffold3530 1509660 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:250,18,0 -Zv9_scaffold3530 1529740 . AG A 245.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-1.739;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:281,2,0 -Zv9_scaffold3530 1529768 . A G 651.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:680,57,0 -Zv9_scaffold3530 1529865 . C T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:316,27,0 -Zv9_scaffold3535 13319 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.059;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,30:159:99:389,0,4199 -Zv9_scaffold3535 17111 . G C 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-1.906;DP=355;FS=0.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=3.60;ReadPosRankSum=3.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,81:355:99:1305,0,8543 -Zv9_scaffold3535 22218 . G T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.003;DP=283;FS=8.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=2.43;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,55:281:99:717,0,7615 -Zv9_scaffold3535 173118 . A C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.538;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:74:464,0,74 -Zv9_scaffold3535 174576 . A G 289.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:318,0,13 -Zv9_scaffold3535 174998 . G C 210.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:239,0,19 -Zv9_scaffold3535 184276 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:301,0,164 -Zv9_scaffold3535 186023 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:40:329,0,40 -Zv9_scaffold3536 290037 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,256 -Zv9_scaffold3537 3162 . A AGT 1062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.153;DP=126;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1100,0,2324 -Zv9_scaffold3537 21023 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.181;DP=151;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,42:148:99:614,0,3912 -Zv9_scaffold3537 25153 . C G 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=1.771;DP=164;FS=4.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,59:164:99:1719,0,3072 -Zv9_scaffold3537 25507 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.526;DP=112;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:323,0,3846 -Zv9_scaffold3539 1397 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.210;DP=58;FS=5.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,28:58:99:743,0,764 -Zv9_scaffold3539 3105 . C T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.094;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:632,0,558 -Zv9_scaffold3539 5281 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:318,0,491 -Zv9_scaffold3539 10917 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-0.231;DP=36;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:383,0,636 -Zv9_scaffold3539 18526 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=1.327;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:232,0,933 -Zv9_scaffold3539 18565 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:241,0,784 -Zv9_scaffold3539 20830 . C A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-1.081;DP=48;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:568,0,885 -Zv9_scaffold3539 22424 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:351,0,510 -Zv9_scaffold3539 22710 . A C 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.754;DP=59;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1001,0,640 -Zv9_scaffold3539 23606 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.933;DP=31;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:365,0,490 -Zv9_scaffold3539 29287 . T C 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-0.124;DP=61;FS=9.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:869,0,898 -Zv9_scaffold3539 32572 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=-0.438;DP=47;FS=4.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:505,0,850 -Zv9_scaffold3539 34818 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=2.101;DP=42;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:423,0,744 -Zv9_scaffold3539 39246 . G C 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-1.862;DP=67;FS=4.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:778,0,1125 -Zv9_scaffold3539 39902 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.569;DP=48;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:931,0,657 -Zv9_scaffold3539 40722 . G A 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.386;DP=63;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=10.82;ReadPosRankSum=2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:710,0,957 -Zv9_scaffold3539 43938 . A T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-2.302;DP=145;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=3.70;ReadPosRankSum=2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,37:145:99:565,0,3714 -Zv9_scaffold3539 43950 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.901;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,32:143:99:482,0,4422 -Zv9_scaffold3539 46061 . T C 3261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.107;DP=292;FS=6.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.010;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,117:292:99:3290,0,4807 -Zv9_scaffold3539 166267 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.063;DP=17;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:39:408,0,39 -Zv9_scaffold3540 25121 . T A 295.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:7:323,0,7 -Zv9_scaffold3540 25340 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:269,0,86 -Zv9_scaffold3540 26028 . C T 260.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:13:289,0,13 -Zv9_scaffold3540 79139 . C T 204.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:19:233,0,19 -Zv9_scaffold3540 172069 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.013;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:301,0,815 -Zv9_scaffold3540 174177 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.961;DP=51;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:331,0,1085 -Zv9_scaffold3540 221469 . A AAG 624.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-2.402;DP=71;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=8.80;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:662,0,1098 -Zv9_scaffold3540 221616 . G GT 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=-1.291;DP=66;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:468,0,880 -Zv9_scaffold3540 222452 . T C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=1.735;DP=45;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:428,0,794 -Zv9_scaffold3540 222486 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.418;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:332,0,1489 -Zv9_scaffold3540 242480 . G A 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.247;DP=189;FS=6.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.544;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,60:189:99:1281,0,3923 -Zv9_scaffold3540 265785 . C G 504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:533,51,0 -Zv9_scaffold3540 266138 . G A 381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:410,30,0 -Zv9_scaffold3541 93682 . T G 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:234,21,0 -Zv9_scaffold3544 24608 . A T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.913;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:405,0,1181 -Zv9_scaffold3544 24609 . A T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.962;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=13.95;ReadPosRankSum=2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:405,0,1223 -Zv9_scaffold3544 24776 . A T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=-1.000;DP=27;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:430,0,437 -Zv9_scaffold3544 24815 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=-2.236;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:229,0,512 -Zv9_scaffold3544 28672 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=-3.040;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=12.02;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:425,0,570 -Zv9_scaffold3544 28935 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=-1.172;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:354,0,287 -Zv9_scaffold3544 29094 . C G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=2.357;DP=36;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=12.88;ReadPosRankSum=2.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:492,0,629 -Zv9_scaffold3545 107767 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.163;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:285,0,874 -Zv9_scaffold3545 107809 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.734;DP=54;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:292,0,960 -Zv9_scaffold3545 110981 . C G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:271,0,265 -Zv9_scaffold3545 141251 . G T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=-0.698;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:745,0,203 -Zv9_scaffold3545 141507 . T G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=1.584;DP=23;FS=16.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=16.56;ReadPosRankSum=-2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:409,0,679 -Zv9_scaffold3545 141510 . C A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=1.379;DP=24;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:409,0,679 -Zv9_scaffold3545 141710 . T A 225.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:253,0,12 -Zv9_scaffold3546 146823 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:279,0,54 -Zv9_scaffold3548 3677 . C T 2269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2298,192,0 -Zv9_scaffold3548 15128 . G A 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.205;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=33.77;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:70:1379,70,0 -Zv9_scaffold3548 16326 . G A 863.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=-0.098;DP=28;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:1:889,0,1 -Zv9_scaffold3548 16344 . C T 855.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=-0.462;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=32.92;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:20:884,0,20 -Zv9_scaffold3548 139202 . C A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.339;DP=53;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:483,0,880 -Zv9_scaffold3548 154661 . A T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.394;DP=49;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:644,0,721 -Zv9_scaffold3548 176591 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.657;DP=42;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:474,0,647 -Zv9_scaffold3548 300152 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,407 -Zv9_scaffold3549 73734 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:348,0,217 -Zv9_scaffold3549 74997 . A T 239.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:268,24,0 -Zv9_scaffold3549 75532 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=-1.175;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:442,0,278 -Zv9_scaffold3549 77072 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:321,0,365 -Zv9_scaffold3553 102761 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.155;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:317,0,354 -Zv9_scaffold3553 103098 . G GT 730.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.277;DP=32;FS=5.539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:24:768,24,0 -Zv9_scaffold3553 103269 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=1.827;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=23.76;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:43:456,0,43 -Zv9_scaffold3553 104741 . T A 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:321,27,0 -Zv9_scaffold3556 4413 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=-1.331;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,484 -Zv9_scaffold3556 4414 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,484 -Zv9_scaffold3556 38652 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:266,0,207 -Zv9_scaffold3556 51471 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.008;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:890,0,712 -Zv9_scaffold3556 52584 . T C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=1.233;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=28.66;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:974,0,522 -Zv9_scaffold3556 52656 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=19.57;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:498,0,362 -Zv9_scaffold3556 52780 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.012;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,33:47:99:844,0,240 -Zv9_scaffold3556 52791 . T G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.546;DP=52;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1032,0,292 -Zv9_scaffold3556 53508 . A G 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.237;DP=35;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=22.19;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:805,0,236 -Zv9_scaffold3556 54367 . T G 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=1.056;DP=46;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=23.60;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1114,0,311 -Zv9_scaffold3556 57407 . A G 262.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.158;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:290,0,12 -Zv9_scaffold3556 57453 . T C 319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:348,33,0 -Zv9_scaffold3556 63556 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.155;DP=23;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:296,0,409 -Zv9_scaffold3556 63574 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.305;DP=25;FS=13.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:255,0,433 -Zv9_scaffold3559 31046 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=1.125;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:302,0,1023 -Zv9_scaffold3561 90202 . C A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.119;DP=92;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:556,0,563 -Zv9_scaffold3561 148257 . A T 2492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.624;DP=202;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,105:202:99:2521,0,2655 -Zv9_scaffold3561 150309 . T C 1911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-0.443;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=9.37;ReadPosRankSum=-1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,79:176:99:1940,0,2586 -Zv9_scaffold3561 150330 . C A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=-1.645;DP=132;FS=20.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,39:115:99:1313,0,2307 -Zv9_scaffold3562 11589 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:362,0,340 -Zv9_scaffold3562 17452 . A T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=1.541;DP=103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:520,0,2973 -Zv9_scaffold3562 45312 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=-1.076;DP=155;FS=3.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,29:155:99:401,0,3899 -Zv9_scaffold3562 50851 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=-0.228;DP=153;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:581,0,3846 -Zv9_scaffold3563 39032 . AG A 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=10;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=25.07;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,139 -Zv9_scaffold3563 39039 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.86;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,139 -Zv9_scaffold3563 47334 . G GT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-3.478;DP=807;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=0.36;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:484,57:541:99:324,0,13237 -Zv9_scaffold3563 50440 . A T 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:63:825,63,0 -Zv9_scaffold3563 61277 . G T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.798;DP=32;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:697,0,400 -Zv9_scaffold3563 61744 . T G 1928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=3.282;DP=105;FS=8.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=18.37;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:1957,165,0 -Zv9_scaffold3563 61871 . G C 2307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2336,213,0 -Zv9_scaffold3563 62068 . C A 274.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=1.271;DP=23;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:19:303,0,19 -Zv9_scaffold3563 196778 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=1.223;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:437,0,1048 -Zv9_scaffold3563 252255 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.751;DP=138;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=1.85;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,27:138:99:284,0,3614 -Zv9_scaffold3563 252863 . G C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.086;DP=113;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=2.47;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,25:113:99:307,0,2937 -Zv9_scaffold3563 283663 . A G 264.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:293,27,0 -Zv9_NA654 4400 . G T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.060;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:916,0,2021 -Zv9_NA654 4409 . G A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.264;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:916,0,2051 -Zv9_NA654 5001 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.457;DP=62;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:385,0,1425 -Zv9_NA654 34843 . G A 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.443;DP=61;FS=5.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,27:61:99:736,0,852 -Zv9_NA654 96741 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=3.556;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=10.80;ReadPosRankSum=-2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:255,0,335 -Zv9_NA654 105559 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-0.666;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:575,0,493 -Zv9_NA772 1232 . A G 352.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:379,0,4 -Zv9_NA237 24782 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=-0.419;DP=408;FS=4.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,51:392:99:237,0,12682 -Zv9_NA237 27305 . G A 4657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.834;DP=330;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,137:327:99:4686,0,6233 -Zv9_NA237 31232 . G A 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=-0.837;DP=380;FS=17.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,98:379:99:1878,0,8450 -Zv9_NA834 9322 . A C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:347,0,139 -Zv9_NA834 10607 . C G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:339,0,265 -Zv9_NA834 14737 . C G 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -Zv9_NA834 15289 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,143 -Zv9_NA834 19640 . A T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -Zv9_NA540 5641 . C T 3627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-1.026;DP=238;FS=7.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,103:238:99:3656,0,7279 -Zv9_NA540 5656 . G A 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=-1.725;DP=242;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,80:242:99:1782,0,10284 -Zv9_NA540 5742 . TCTGCGAGACCACACACACATTCACACACAGTCAGTTTGATAAACACTATGAATATGCCAGAAAGCTGTTGTTGACAGAAAGTGTGTGTAC T 11419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.942;DP=321;FS=2.068;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,293:296:99:11457,859,0 -Zv9_NA426 12865 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=1.756;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:413,0,1319 -Zv9_NA240 27877 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,402 -Zv9_NA289 13234 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=1.309;DP=21;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,180 -Zv9_NA289 13953 . A T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -Zv9_NA289 14018 . C A 337.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.348;DP=11;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.64;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:365,0,12 -Zv9_NA289 14096 . T C 238.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:16:267,0,16 -Zv9_NA289 14506 . C T 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -Zv9_NA530 1529 . C T 2650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.240;DP=175;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:2679,0,2771 -Zv9_NA530 4263 . C T 13309.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=2.220;DP=159;FS=1.526;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=32.54;ReadPosRankSum=-2.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,93:140:99:13338,268,0 -Zv9_NA530 4288 . GT G 4005.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.184;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=31.38;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:4043,0,5229 -Zv9_NA530 4354 . A T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=1.022;DP=109;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=6.06;ReadPosRankSum=3.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,40:109:99:689,0,8391 -Zv9_NA530 4394 . G A 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-1.083;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,52:141:99:1402,0,4952 -Zv9_NA530 4438 . T G 6428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.406;DP=180;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,161:178:99:6457,0,1193 -Zv9_NA530 5148 . TA T 2387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.778;DP=204;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,80:194:99:2425,0,3031 -Zv9_NA530 5152 . A C 2396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.323;DP=211;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,87:205:99:2425,0,3033 -Zv9_NA530 5385 . C A 3551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.401;DP=205;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,103:205:99:3580,0,3648 -Zv9_NA530 5506 . ATT A,AT 1413.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-1.148;DP=26;FS=12.041;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=32.03;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,6,13:22:99:1744,374,381,1152,0,1162 -Zv9_NA530 5902 . T G 3458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=-1.746;DP=237;FS=16.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,98:237:99:3487,0,4677 -Zv9_NA530 5983 . C T 3200.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-3.416;DP=175;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,95:174:99:3228,0,2841 -Zv9_NA530 6601 . C T 4251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.165;DP=220;FS=2.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,95:219:99:4280,0,4423 -Zv9_NA530 6640 . A T 2957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-3.304;DP=206;FS=5.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,86:202:99:2986,0,4055 -Zv9_NA530 7185 . A C 2960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.001;DP=187;FS=0.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,84:187:99:2989,0,4409 -Zv9_NA530 7309 . A G 8014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-0.600;DP=233;FS=0.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=34.40;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,206:233:99:8043,0,308 -Zv9_NA530 8835 . T C 3029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.820;DP=177;FS=0.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,87:176:99:3058,0,3218 -Zv9_NA530 8982 . CT C 12464.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-1.394;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=26.01;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,42:61:99:12502,755,0 -Zv9_NA530 9008 . A G 2044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.014;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=30.33;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,8:46:99:2073,0,1901 -Zv9_NA530 9090 . C T 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=-0.345;DP=178;FS=0.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,51:177:99:1063,0,8125 -Zv9_NA530 9245 . GA G,GAA 3812.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=1.050;DP=221;FS=1.499;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:8,66,95:169:99:3704,2189,3220,1735,0,2593 -Zv9_NA530 9282 . G A 3022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.821;DP=185;FS=3.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,85:183:99:3051,0,3233 -Zv9_NA530 9503 . A G 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:383,27,0 -Zv9_NA530 10283 . C T 4424.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-1.732;DP=106;FS=5.939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=34.98;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:4453,310,0 -Zv9_NA530 10581 . TCTGCTTTTTTTCTGATTTGTTCAAATTCCAGAGCGCCTGAAACCAAATAAAAACAAAGAACAAGAATATGTTTGTGTGTGTTACTTTCTGATTCGACGTCTAGTAACAAAGCTGATTTAAAATA T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.474;ClippingRankSum=7.268;DP=101;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=2.02;ReadPosRankSum=-7.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,25:100:99:241,0,20268 -Zv9_NA216 2700 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -Zv9_NA235 4671 . C A 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.019;DP=69;FS=2.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=24.11;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,46:69:99:1692,0,593 -Zv9_NA235 8746 . C T 1611.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.717;DP=49;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=32.89;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:27:1640,0,27 -Zv9_NA235 9112 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.151;DP=53;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:866,0,977 -Zv9_NA958 176 . A G 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.376;DP=72;FS=4.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,26:71:99:897,0,1584 -Zv9_NA357 23 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:336,0,169 -Zv9_NA357 29517 . TA T 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.029;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=12.31;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:345,0,247 -Zv9_NA282 10271 . C T 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:492,36,0 -Zv9_NA587 1195 . G A 737.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-1.324;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:19:766,0,19 -Zv9_NA462 920 . G T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.735;DP=42;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:524,0,953 -Zv9_NA427 26600 . T A 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -Zv9_NA427 27131 . T G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=31.55;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:470,0,46 -Zv9_NA427 27615 . G A 227.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:256,0,22 -Zv9_NA427 27905 . C T 721.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-1.197;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=30.30;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:24:750,24,0 -Zv9_NA427 28594 . G T 969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:998,69,0 -Zv9_NA427 29659 . G T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -Zv9_NA427 30045 . G A 319.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.00;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:348,0,13 -Zv9_NA427 30719 . A G 620.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:19:649,0,19 -Zv9_NA427 31057 . A T 832.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:900,63,0 -Zv9_NA427 31217 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA427 31218 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA427 31427 . C T 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:666,45,0 -Zv9_NA427 31436 . G A 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:666,45,0 -Zv9_NA887 8756 . A AG 592.73 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.174;DP=232;FS=7.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=8.49;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,73:227:99:1998,0,5920 -Zv9_NA454 11869 . G A 3142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.976;DP=471;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,129:458:99:3171,0,12344 -Zv9_NA433 7601 . C T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -Zv9_NA805 6034 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-1.648;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:287,0,3629 -Zv9_NA805 6676 . A T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-0.918;DP=69;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:258,0,1929 -Zv9_NA805 6986 . T C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.198;DP=62;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:451,0,2905 -Zv9_NA805 7616 . A G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.051;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:746,0,908 -Zv9_NA805 7676 . C G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.332;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.02;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:458,0,847 -Zv9_NA805 7772 . T A 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.098;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:423,0,555 -Zv9_NA805 7778 . C CT 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=1.186;DP=27;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=13.92;ReadPosRankSum=-2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:413,0,183 -Zv9_NA805 8093 . T C 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-2.541;DP=88;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=12.90;ReadPosRankSum=2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:1163,0,1810 -Zv9_NA805 8845 . G C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.676;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,25:96:99:601,0,2663 -Zv9_NA805 24384 . A G 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.441;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:905,0,944 -Zv9_NA941 1117 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:255,18,0 -Zv9_NA217 7419 . G A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 -Zv9_NA928 31426 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=14.84;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,241 -Zv9_NA928 31894 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-1.545;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=31.52;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:438,0,361 -Zv9_NA928 32332 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.887;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=19.39;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:416,0,334 -Zv9_NA928 32631 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,516 -Zv9_NA747 1202 . A C 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -Zv9_NA747 2821 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,103 -Zv9_NA695 34146 . G C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -Zv9_NA695 35852 . T A 848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:877,63,0 -Zv9_NA695 35894 . G C 949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:978,69,0 -Zv9_NA407 40865 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.867;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:310,0,990 -Zv9_NA985 810 . C T 12452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.031;DP=427;FS=0.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,336:423:99:12481,0,1496 -Zv9_NA327 1051 . CCCTACACACACACACACACACACACAGGGGTCAGCAGAGGTCAGCGCAGGGGTCAGAGGTCAGACTGAGGTCACAGTA C 277.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:30:315,30,0 -Zv9_NA327 1446 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:231,0,323 -Zv9_NA327 2029 . G C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,172 -Zv9_NA327 7442 . C T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.716;DP=73;FS=10.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1002,0,1493 -Zv9_NA51 19581 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.066;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:366,0,747 -Zv9_NA51 19869 . C A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.531;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=14.94;ReadPosRankSum=-3.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,335 -Zv9_NA51 19966 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=21.45;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:350,0,575 -Zv9_NA51 19976 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-2.454;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=18.93;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:350,0,575 -Zv9_NA51 20566 . G C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -Zv9_NA661 4522 . T A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-1.051;DP=43;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1177,0,325 -Zv9_NA661 4558 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.182;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:825,0,618 -Zv9_NA661 12048 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-1.727;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:671,0,423 -Zv9_NA661 12180 . G T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.578;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:794,0,770 -Zv9_NA839 3014 . A T 239.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:268,0,21 -Zv9_NA11 79326 . GC G 286.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -Zv9_NA631 10809 . G T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-0.564;DP=150;FS=2.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,39:149:99:888,0,4195 -Zv9_NA631 20430 . T C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.859;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=26.23;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:684,0,127 -Zv9_NA683 4528 . GGGTACATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTAATGATGATCTTGATTTTGTGTGTGCA G 2228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.380;DP=54;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=31.05;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,50:54:99:2266,0,447 -Zv9_NA683 4711 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.202;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:265,0,1364 -Zv9_NA683 4744 . G A 1302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.442;DP=48;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:1331,0,222 -Zv9_NA683 5051 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.513;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=5.23;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:269,0,2410 -Zv9_NA683 5499 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.130;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:363,0,1561 -Zv9_NA683 5927 . G A 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=2.282;DP=36;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:941,0,231 -Zv9_NA683 8330 . T C 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -Zv9_NA683 13094 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:269,0,241 -Zv9_NA683 20420 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.870;DP=45;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:372,0,1174 -Zv9_NA683 26533 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.306;DP=83;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:257,0,2464 -Zv9_NA683 27074 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.315;DP=73;FS=3.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=6.24;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:484,0,2047 -Zv9_NA683 79880 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -Zv9_NA953 668 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.061;DP=19;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,153 -Zv9_NA953 994 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-1.333;DP=31;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:407,0,429 -Zv9_NA918 211 . TTG T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.294;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=16.87;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:324,0,119 -Zv9_NA918 46712 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.63;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:430,0,201 -Zv9_NA906 60506 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:277,0,381 -Zv9_NA164 7248 . A T 1536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=1.646;DP=41;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=35.72;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1565,114,0 -Zv9_NA164 7310 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 -Zv9_NA164 7315 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -Zv9_NA544 6911 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,101 -Zv9_NA899 40993 . C G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=1.755;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:295,0,365 -Zv9_NA899 41115 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:247,0,374 -Zv9_NA899 41359 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,476 -Zv9_NA899 41446 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.986;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,440 -Zv9_NA899 42657 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,293 -Zv9_NA689 8192 . C T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -Zv9_NA807 23622 . C A 4817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-1.012;DP=422;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,146:420:99:4846,0,10217 -Zv9_NA787 55347 . T G 469.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=33.52;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:496,0,4 -Zv9_NA787 55349 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:630,42,0 -Zv9_NA787 70765 . A C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=19;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:313,0,138 -Zv9_NA787 70780 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.991;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,164 -Zv9_NA787 71249 . G T 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -Zv9_NA883 29172 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -Zv9_NA883 35598 . CACCTGCAATACACAACAATTAGCCATTGATTAAAAAGTGTTGAATTATGGTAACATCAGCAACATCAAATGTTGCACCT C 14859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.211;DP=337;FS=13.200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,334:337:99:14897,1239,0 -Zv9_NA732 78069 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=3.064;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=8.57;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:294,0,730 -Zv9_NA732 79679 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:372,0,500 -Zv9_NA732 84446 . TTA T 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=3.002;DP=24;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:277,0,571 -Zv9_NA732 84870 . A G 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.315;DP=34;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:1017,0,545 -Zv9_NA732 84872 . A G 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.788;DP=34;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:1017,0,546 -Zv9_NA732 84982 . G GT 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.691;DP=47;FS=1.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:572,0,638 -Zv9_NA732 85116 . A T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.552;DP=45;FS=15.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=25.37;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1170,0,385 -Zv9_NA732 87417 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=1.062;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.280;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:915,0,649 -Zv9_NA732 90576 . G A 1419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.556;DP=67;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,43:67:99:1448,0,762 -Zv9_NA732 96339 . A T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.395;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:657,0,609 -Zv9_NA732 102521 . G A 1493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=-0.568;DP=61;FS=5.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,42:61:99:1522,0,494 -Zv9_NA732 102636 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:585,0,335 -Zv9_NA732 107900 . C T 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.423;ClippingRankSum=-7.174;DP=287;FS=4.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,63:266:99:1409,0,15496 -Zv9_NA732 108234 . T A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=27.43;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:330,0,54 -Zv9_NA732 108245 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=24.86;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:252,0,64 -Zv9_NA732 124845 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:262,0,60 -Zv9_NA732 125341 . G A 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=1.622;DP=75;FS=11.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=27.40;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,54:75:99:2083,0,546 -Zv9_NA994 21685 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.710;DP=42;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:289,0,1079 -Zv9_NA994 23797 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.883;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:322,0,1006 -Zv9_NA994 23898 . G T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.410;DP=63;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:407,0,1628 -Zv9_NA994 23930 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=-1.926;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:318,0,1648 -Zv9_NA994 41060 . G GAC 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.261;DP=57;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:316,0,701 -Zv9_NA994 41139 . T TTA 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-2.073;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:399,0,40 -Zv9_NA437 27525 . C G 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:485,36,0 -Zv9_NA437 28306 . T A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -Zv9_NA437 28437 . A G 785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:814,57,0 -Zv9_NA437 28550 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-2.143;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=32.61;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:28:550,0,28 -Zv9_NA437 29089 . C A 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -Zv9_NA437 29094 . G A 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:433,30,0 -Zv9_NA224 2901 . C A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=1.025;DP=39;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:506,0,855 -Zv9_NA224 4761 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.692;DP=32;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:477,0,650 -Zv9_NA947 4189 . CG C 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.787;DP=42;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=10.71;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:487,0,1079 -Zv9_NA947 23434 . T A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.065;DP=55;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:437,0,1484 -Zv9_NA947 61439 . T C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:558,0,112 -Zv9_NA947 67591 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-1.877;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:322,0,1046 -Zv9_NA947 80085 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=1.679;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:236,0,538 -Zv9_NA735 119911 . TC T 741.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.245;DP=79;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,29:75:99:779,0,1315 -Zv9_NA735 120199 . T C 262.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:291,0,22 -Zv9_NA735 120675 . C T 1802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.817;DP=110;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,52:110:99:1831,0,1857 -Zv9_NA735 120954 . C T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-0.333;DP=56;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:750,0,1111 -Zv9_NA735 122593 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.617;DP=37;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:496,0,674 -Zv9_NA735 134539 . G A 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=-0.285;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:718,0,1213 -Zv9_NA735 158661 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=1.970;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:693,0,1103 -Zv9_NA900 4417 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.882;DP=39;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:253,0,1127 -Zv9_NA900 9267 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=1.973;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,289 -Zv9_NA900 18028 . C T 2205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-1.318;DP=160;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,64:160:99:2234,0,3283 -Zv9_NA900 20016 . T TC 226.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:264,15,0 -Zv9_NA900 20017 . G T 235.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:264,15,0 -Zv9_NA900 22764 . A T 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.880;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,44:135:99:1195,0,3341 -Zv9_NA232 15752 . A T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.348;DP=25;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=15.83;ReadPosRankSum=1.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:424,0,404 -Zv9_NA232 15767 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.528;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:488,0,463 -Zv9_NA232 16013 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,761 -Zv9_NA232 16014 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.732;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,761 -Zv9_NA232 16412 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:404,0,784 -Zv9_NA232 20199 . A T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.445;DP=24;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:696,0,382 -Zv9_NA232 20202 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.175;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=29.03;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:696,0,399 -Zv9_NA232 20335 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.708;DP=27;FS=8.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=14.73;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:426,0,511 -Zv9_NA232 20511 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.823;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,414 -Zv9_NA232 20612 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.825;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:444,0,688 -Zv9_NA232 22042 . A C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=-0.736;DP=39;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.324;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:471,0,948 -Zv9_NA232 26465 . C T 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.802;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,57:174:99:1512,0,4305 -Zv9_NA232 27006 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.147;DP=135;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,32:119:99:848,0,3113 -Zv9_NA232 27013 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-0.114;DP=120;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=4.40;ReadPosRankSum=2.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,27:105:99:556,0,6262 -Zv9_NA232 34480 . G C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-3.622;DP=105;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:902,0,2529 -Zv9_NA232 34572 . A G 1413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.437;DP=99;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:1442,0,2067 -Zv9_NA930 11700 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:354,0,447 -Zv9_NA930 13373 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:262,0,385 -Zv9_NA930 14119 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:302,0,374 -Zv9_NA930 17902 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.315;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:507,0,525 -Zv9_NA930 18163 . C G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.455;DP=35;FS=3.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:583,0,1629 -Zv9_NA930 18168 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.563;DP=39;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:583,0,1689 -Zv9_NA930 19604 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.053;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:264,0,303 -Zv9_NA694 37685 . C T 895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:924,63,0 -Zv9_NA694 37836 . A C 11264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.494;DP=304;FS=2.578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=31.15;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,269:271:99:11293,800,0 -Zv9_NA694 37942 . G A 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=4.156;DP=72;FS=41.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=29.41;ReadPosRankSum=-4.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,57:69:99:2146,0,195 -Zv9_NA694 37962 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -Zv9_NA694 38453 . A G 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1387,96,0 -Zv9_NA694 39254 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.060;DP=61;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:912,0,267 -Zv9_NA694 39972 . T C 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -Zv9_NA694 40175 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.696;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,182 -Zv9_NA694 40181 . G A 756.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:785,54,0 -Zv9_NA694 40268 . G A 682.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.456;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:710,11,0 -Zv9_NA992 1792 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.759;DP=89;FS=5.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.906;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,20:84:99:444,0,2441 -Zv9_NA265 11797 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.304;DP=45;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:264,0,1417 -Zv9_NA265 12006 . A C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-0.727;DP=49;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:398,0,1343 -Zv9_NA265 14345 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.213;DP=46;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:291,0,1301 -Zv9_NA265 14541 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-0.156;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:249,0,2069 -Zv9_NA265 14543 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.507;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:249,0,2069 -Zv9_NA265 14726 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-2.167;DP=23;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:392,0,813 -Zv9_NA265 14812 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.506;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:573,0,212 -Zv9_NA265 14898 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.140;DP=31;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:470,0,644 -Zv9_NA276 68207 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=-0.659;DP=39;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=6.58;ReadPosRankSum=2.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:285,0,1061 -Zv9_NA276 68647 . T A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.472;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:371,0,1414 -Zv9_NA276 69235 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=1.611;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:361,0,994 -Zv9_NA276 69247 . G C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.903;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1109 -Zv9_NA276 69737 . G T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.811;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:568,0,481 -Zv9_NA276 70098 . T G 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.351;DP=39;FS=6.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:695,0,758 -Zv9_NA276 74456 . G C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=1.145;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:494,0,586 -Zv9_NA276 75730 . T C 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-0.139;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.846;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:791,0,851 -Zv9_NA276 75747 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=-0.467;DP=50;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:788,0,979 -Zv9_NA276 77630 . C CA 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.151;DP=55;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:735,0,189 -Zv9_NA276 79874 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.464;DP=48;FS=13.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:334,0,1303 -Zv9_NA276 80220 . C G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.655;DP=51;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:575,0,1161 -Zv9_NA276 80358 . C T 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.549;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:850,0,1103 -Zv9_NA276 80595 . A G 1924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.904;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,52:68:99:1953,0,310 -Zv9_NA276 80967 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.259;DP=75;FS=4.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:890,0,1579 -Zv9_NA276 81123 . T A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.347;DP=53;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:981,0,879 -Zv9_NA276 81748 . A G 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.613;DP=63;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:690,0,1319 -Zv9_NA561 36062 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.882;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:348,0,565 -Zv9_NA561 49379 . T G 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.438;DP=36;FS=5.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:753,0,477 -Zv9_NA561 49550 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.846;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:552,0,183 -Zv9_NA561 81424 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=2.267;DP=39;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:351,0,983 -Zv9_NA561 81445 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.667;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=15.80;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:676,0,1091 -Zv9_NA561 81448 . A C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.167;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:309,0,1741 -Zv9_NA561 81640 . C A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.454;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:95:559,0,95 -Zv9_NA561 109238 . A G 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.249;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:775,0,181 -Zv9_NA917 7659 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.574;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:305,0,2468 -Zv9_NA917 19707 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.735;DP=22;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.81;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:442,0,272 -Zv9_NA917 19790 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.354;DP=29;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:238,0,799 -Zv9_NA401 28956 . G GT 1001.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-0.219;DP=231;FS=17.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=4.34;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,61:201:99:1039,0,3135 -Zv9_NA401 32884 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.708;DP=39;FS=1.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:321,0,1041 -Zv9_NA401 32885 . T C 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-0.190;DP=39;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:667,0,713 -Zv9_NA15 6541 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.548;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:363,0,381 -Zv9_NA15 15861 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=-1.259;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:395,0,736 -Zv9_NA981 726 . G A 1029.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:72:1058,72,0 -Zv9_NA981 1431 . T G 625.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:654,48,0 -Zv9_NA157 1490 . C A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=1.654;DP=101;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,30:101:99:779,0,2746 -Zv9_NA250 18864 . ACAGGTATTTGTTTTAGTGTGATGCAATTTAACACCAGACCGTGTAAATGTGTTCAGTTGTCACCTGTCTCAATCAGGTTGTCCGTCACGAAAGTTAAACACCTGCCGTCTTGCTGTTCCTTCCTGTTTTCCTTTC A 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:382,0,4771 -Zv9_NA250 26253 . A G 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-1.686;DP=36;FS=7.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:720,0,143 -Zv9_NA250 26264 . G T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.208;DP=35;FS=13.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:722,0,100 -Zv9_NA851 22506 . G C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=2.440;DP=16;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=22.49;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:388,0,213 -Zv9_NA851 23262 . TA T 686.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=-0.397;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=22.15;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:6:723,0,6 -Zv9_NA851 23391 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=-1.961;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=12.02;ReadPosRankSum=2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:401,0,1481 -Zv9_NA851 23394 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=-2.787;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:401,0,1481 -Zv9_NA851 23977 . C G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.81;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:302,0,129 -Zv9_NA851 24967 . C T 792.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.135;DP=24;FS=2.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=33.03;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:18:821,0,18 -Zv9_NA851 36854 . T C 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:412,30,0 -Zv9_NA851 37291 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:492,0,474 -Zv9_NA851 37292 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:492,0,474 -Zv9_NA851 38021 . C T 695.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-0.819;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=34.75;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:723,12,0 -Zv9_NA851 43596 . G A 435.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=33.52;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:463,0,6 -Zv9_NA203 47002 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.573;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:326,0,1485 -Zv9_NA470 53417 . A C 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=1.816;DP=45;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:872,0,706 -Zv9_NA470 53441 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.346;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:250,0,943 -Zv9_NA470 53813 . G GA 1671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-0.150;DP=73;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,57:67:50:1709,0,50 -Zv9_NA470 54298 . C T 3775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-0.981;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,96:136:99:3804,0,1005 -Zv9_NA470 56416 . C CAG 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -Zv9_NA470 57082 . C T 4295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.099;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=26.19;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,116:164:99:4324,0,1511 -Zv9_NA470 58925 . TCACCTGTGAACAAACACCCTTTCAGGTCACACACACTCTCTTCACAGTGCACACACTAGACTATAGTAAATCTGAAAAACACA T 3681.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-1.243;DP=110;FS=4.696;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,95:106:59:3719,59,0 -Zv9_NA470 77408 . T G 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=1.175;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,61:76:99:2216,0,276 -Zv9_NA470 81098 . C A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -Zv9_NA470 81247 . A T 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:310,21,0 -Zv9_NA470 81331 . A G 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:358,24,0 -Zv9_NA470 81915 . A G 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.620;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=34.29;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,108:121:99:4177,0,135 -Zv9_NA470 84725 . A T 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.591;DP=58;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=29.53;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1741,0,357 -Zv9_NA470 84740 . C T 1607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.203;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=33.50;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1636,0,133 -Zv9_NA474 63411 . C G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -Zv9_NA466 5833 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=-0.573;DP=506;FS=3.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=0.57;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:434,71:505:99:319,0,15849 -Zv9_NA466 32502 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:308,0,263 -Zv9_NA466 61347 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.833;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:272,0,432 -Zv9_NA466 143510 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.706;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:325,0,309 -Zv9_NA466 143540 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,189 -Zv9_NA466 143942 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:239,0,351 -Zv9_NA908 64705 . C A 228.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:257,0,17 -Zv9_NA908 74021 . A G 209.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:238,0,21 -Zv9_NA908 75518 . A C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -Zv9_NA908 75519 . A C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -Zv9_NA908 84862 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:488,0,732 -Zv9_NA908 85310 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.721;DP=37;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:363,0,897 -Zv9_NA908 90052 . A C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.581;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:346,0,411 -Zv9_NA908 90426 . AAGGTGAGCGTTTCTACTTGCCTTAGAGTTTGTTGATGTTTAACGCAAGGATGGTGTTTAATCTAAGGTTCCTCATGATGCCTAC A 1444.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-1.300;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1482,133,0 -Zv9_NA908 91687 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,820 -Zv9_NA908 91695 . T A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.718;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:327,0,826 -Zv9_NA908 91716 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=14.99;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:343,0,339 -Zv9_NA908 92101 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=-0.714;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:314,0,1023 -Zv9_NA908 92530 . A C 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.679;DP=35;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=18.14;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:663,0,567 -Zv9_NA908 92547 . A C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.528;DP=39;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:551,0,927 -Zv9_NA908 92617 . C A 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.775;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:930,0,150 -Zv9_NA908 92657 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.764;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:327,0,912 -Zv9_NA908 92793 . T TA 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.399;DP=33;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:451,0,614 -Zv9_NA908 93093 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.441;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,1009 -Zv9_NA908 93338 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.915;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:261,0,805 -Zv9_NA908 103855 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-1.057;DP=156;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,34:155:99:664,0,4405 -Zv9_NA908 104662 . C T 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.050;DP=261;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,79:260:99:1938,0,6688 -Zv9_NA908 104721 . G A 2748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.650;DP=191;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=14.39;ReadPosRankSum=3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,78:189:99:2777,0,3743 -Zv9_NA908 105257 . C T 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=-0.052;DP=126;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1075,0,1302 -Zv9_NA908 105689 . G A 319.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.02;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:347,0,10 -Zv9_NA908 105799 . T C 2378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=1.360;DP=122;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,57:81:99:2407,0,605 -Zv9_NA908 105807 . G T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=1.747;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=4.45;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:620,0,3343 -Zv9_NA908 105994 . T G 2449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=-2.595;DP=125;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,72:122:99:2478,0,1680 -Zv9_NA908 106283 . G A 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=-0.832;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=7.29;ReadPosRankSum=2.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,48:137:99:1034,0,6919 -Zv9_NA908 106370 . A T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=-0.099;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:634,0,4485 -Zv9_NA908 106683 . G T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.850;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:525,0,105 -Zv9_NA908 106920 . G A 1000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.486;DP=64;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1029,0,1270 -Zv9_NA908 128256 . G C 4117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.451;DP=280;FS=11.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,127:279:99:4146,0,4717 -Zv9_NA908 129311 . G T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -Zv9_NA908 129314 . A G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:279,21,0 -Zv9_NA362 5327 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=21.12;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:345,0,486 -Zv9_NA362 5747 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.689;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,185 -Zv9_NA820 11209 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.700;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:353,0,1697 -Zv9_NA820 13598 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.392;DP=31;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:368,0,703 -Zv9_NA972 18961 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.087;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.518;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:300,0,3121 -Zv9_NA972 23776 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=-2.344;DP=69;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:540,0,3920 -Zv9_NA229 14356 . A T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -Zv9_NA129 3545 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-1.839;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,9:42:99:387,0,2885 -Zv9_NA129 3550 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.255;DP=55;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:387,0,2885 -Zv9_NA129 4410 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.014;DP=197;FS=6.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,42:196:99:780,0,5907 -Zv9_NA129 6074 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-2.386;DP=183;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=1.29;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,29:183:99:264,0,5772 -Zv9_NA948 2096 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.949;DP=20;FS=13.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.79;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:484,0,159 -Zv9_NA973 7401 . A T 205.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:234,0,18 -Zv9_NA973 7614 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -Zv9_NA681 80891 . T A 217.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:246,0,21 -Zv9_NA681 82552 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.404;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,28:177:99:353,0,5995 -Zv9_NA681 82763 . T G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=31.06;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:401,0,51 -Zv9_NA866 11258 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-0.231;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:487,0,158 -Zv9_NA35 6716 . A G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -Zv9_NA48 8699 . C T 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -Zv9_NA925 5763 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=3.945;DP=57;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.80;ReadPosRankSum=-3.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:302,0,3467 -Zv9_NA925 5845 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.489;DP=86;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:334,0,2473 -Zv9_NA925 5974 . G GGT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=-1.845;DP=101;FS=20.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:332,0,1002 -Zv9_NA925 6152 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.539;DP=170;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,56:170:99:1520,0,4356 -Zv9_NA5 6155 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.044;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:349,0,274 -Zv9_NA5 6506 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=2.608;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:312,0,437 -Zv9_NA5 6512 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=2.424;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.91;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:312,0,437 -Zv9_NA964 2165 . G C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-1.889;DP=28;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:445,0,477 -Zv9_NA964 11981 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:409,0,253 -Zv9_NA888 4647 . A ATG 448.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.211;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:16:486,0,16 -Zv9_NA974 440 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.919;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:350,0,170 -Zv9_NA974 4938 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=25.80;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:88:312,0,88 -Zv9_NA701 1499 . A C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.769;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:460,0,472 -Zv9_NA701 11136 . A G 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.895;DP=37;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=20.94;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:803,0,485 -Zv9_NA279 2083 . T C 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=1.156;DP=120;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,57:120:99:1955,0,2036 -Zv9_NA279 2122 . T G 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=-0.090;DP=114;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1249,0,2732 -Zv9_NA89 31353 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.273;DP=32;FS=7.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:577,0,488 -Zv9_NA89 32155 . G A 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-0.451;DP=75;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=16.40;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1258,0,1287 -Zv9_NA89 32239 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-1.126;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:561,0,1201 -Zv9_NA89 32329 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=27.08;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:76:299,0,76 -Zv9_NA89 33745 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.283;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=32.21;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:51:447,0,51 -Zv9_NA89 33863 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=1.613;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:274,0,667 -Zv9_NA89 34564 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.165;DP=38;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:514,0,822 -Zv9_NA503 37317 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,340 -Zv9_NA165 152 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=24.42;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:419,0,124 -Zv9_NA684 2983 . G A 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.898;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=19.07;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:1516,0,1000 -Zv9_NA989 859 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=2.507;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=15.59;ReadPosRankSum=-1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:340,0,317 -Zv9_NA989 1102 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-2.177;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=18.43;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:360,0,418 -Zv9_NA90 2001 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.132;DP=74;FS=4.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:375,0,1855 -Zv9_NA90 3173 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.079;DP=98;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,24:97:99:576,0,2804 -Zv9_NA90 9774 . C G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.48;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:315,0,783 -Zv9_NA163 17111 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=2.192;DP=79;FS=7.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:358,0,2318 -Zv9_NA163 17868 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=1.416;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:432,0,554 -Zv9_NA163 17942 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-2.202;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:358,0,410 -Zv9_NA163 18062 . G T 3694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-2.333;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=26.02;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,97:142:99:3723,0,1168 -Zv9_NA163 19282 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.908;DP=139;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,28:133:99:547,0,3998 -Zv9_NA163 24177 . GCCTGCAGAAAGAAAAGACGTTACACCTCGCACACAGACCGCCATTATTCAAGTTAGCTCCGACTAAAAACACGCTTAATAGTCAAACTTA G 4217.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.553;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=26.11;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,93:97:99:4255,335,0 -Zv9_NA17 56238 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:237,0,56 -Zv9_NA915 57887 . T A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.307;DP=42;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:568,0,844 -Zv9_NA915 67662 . A C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-0.826;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:420,0,1129 -Zv9_NA915 75395 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,182 -Zv9_NA915 76223 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.764;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:308,0,555 -Zv9_NA915 77119 . G A 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -Zv9_NA915 77959 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.861;DP=31;FS=8.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:455,0,583 -Zv9_NA915 78148 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-0.206;DP=38;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:705,0,583 -Zv9_NA915 78382 . G T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=1.183;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:693,0,1576 -Zv9_NA915 78384 . A T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.880;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.563;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:693,0,1569 -Zv9_NA915 89666 . G C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.636;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=24.20;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:730,0,267 -Zv9_NA915 103001 . T C 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -Zv9_NA915 105773 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:261,0,90 -Zv9_NA915 105790 . T A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:24:336,24,0 -Zv9_NA915 107129 . A ATT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.489;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:301,0,380 -Zv9_NA907 20522 . C G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.143;DP=41;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:637,0,689 -Zv9_NA907 23061 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-1.647;DP=36;FS=14.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:767,0,434 -Zv9_NA97 11140 . A AC 581.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:66:621,66,0 -Zv9_NA97 11141 . A C 622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1035,69,0 -Zv9_NA698 37374 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:265,0,242 -Zv9_NA698 37470 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=27.56;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:359,0,55 -Zv9_NA698 37816 . C T 208.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:237,0,23 -Zv9_NA698 38482 . A AT 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.058;DP=23;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:623,0,132 -Zv9_NA698 38551 . G C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,276 -Zv9_NA698 38952 . T C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=1.198;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:809,0,153 -Zv9_NA698 43206 . A C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=-1.022;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,327 -Zv9_NA698 45243 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.204;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:274,0,754 -Zv9_NA698 55188 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=2.817;DP=80;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:373,0,2437 -Zv9_NA698 55754 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=-0.116;DP=137;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,28:136:99:309,0,5002 -Zv9_NA698 56935 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=-0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=21.52;ReadPosRankSum=-2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:308,0,136 -Zv9_NA698 57087 . T C 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-0.554;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:645,0,2986 -Zv9_NA698 57907 . CTG C 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.540;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:604,0,1872 -Zv9_NA698 60609 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.041;DP=44;FS=10.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:287,0,1344 -Zv9_NA698 61176 . A C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=3.742;DP=33;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=14.78;ReadPosRankSum=-1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:516,0,1476 -Zv9_NA698 62898 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:290,0,383 -Zv9_NA698 63065 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.279;DP=61;FS=2.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:675,0,1376 -Zv9_NA698 63417 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.523;DP=61;FS=4.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:265,0,1915 -Zv9_NA698 63636 . CAACGACTTTTCCTGCATGTTACAACAAAAATGGCACAATTT C 1115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.86;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1153,112,0 -Zv9_NA698 64496 . C A 2113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.075;DP=124;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:2142,0,2266 -Zv9_NA698 83825 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.413;DP=85;FS=5.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:414,0,4865 -Zv9_NA698 83948 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-0.221;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:989,0,1517 -Zv9_NA708 10693 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.938;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:91:467,0,91 -Zv9_NA708 18155 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=24.80;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:301,0,56 -Zv9_NA493 3819 . A C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -Zv9_NA493 6190 . G GT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.992;DP=82;FS=6.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:259,0,503 -Zv9_NA493 7227 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.295;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:245,0,703 -Zv9_NA493 8431 . G T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.296;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:440,0,48 -Zv9_NA415 2346 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-2.524;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:249,0,615 -Zv9_NA415 2365 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,615 -Zv9_NA946 1284 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=8.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:320,0,200 -Zv9_NA463 28998 . G A 370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:399,30,0 -Zv9_NA995 5186 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.712;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.88;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:384,0,788 -Zv9_NA995 21779 . G C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-1.416;DP=41;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:597,0,789 -Zv9_NA995 21905 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.087;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:424,0,749 -Zv9_NA995 28299 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.031;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:344,0,647 -Zv9_NA110 25428 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.091;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:417,0,237 -Zv9_NA331 10588 . C A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -Zv9_NA331 39288 . C T 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=2.158;DP=37;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=24.80;ReadPosRankSum=4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,8:37:99:946,0,909 -Zv9_NA331 44262 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.376;DP=156;FS=10.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:308,0,5211 -Zv9_NA383 10501 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.531;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:304,0,352 -Zv9_NA383 10534 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,333 -Zv9_NA913 8798 . C A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.097;DP=97;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:545,0,2657 -Zv9_NA913 11531 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.692;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:279,0,1261 -Zv9_NA913 11953 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.187;DP=59;FS=6.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:283,0,2151 -Zv9_NA913 13211 . A C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-1.679;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:398,0,1245 -Zv9_NA913 13788 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.826;DP=39;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:329,0,1089 -Zv9_NA913 14986 . G A 241.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:9:269,0,9 -Zv9_NA913 15233 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.775;DP=19;FS=22.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:424,0,470 -Zv9_NA913 15256 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=36.05;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:99:424,0,470 -Zv9_NA913 16366 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-0.173;DP=119;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,27:118:99:604,0,3935 -Zv9_NA913 16754 . TGA T 377.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:32:415,32,0 -Zv9_NA933 1013 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-2.431;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=23.72;ReadPosRankSum=2.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:384,0,321 -Zv9_NA933 2086 . A C 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-2.623;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:883,0,465 -Zv9_NA337 67542 . C T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.371;DP=283;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,53:283:99:697,0,8457 -Zv9_NA337 67661 . CACACACACACACACACACACAT C 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-1.625;DP=55;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:257,0,3017 -Zv9_NA337 69090 . C G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.132;DP=213;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,53:213:99:693,0,9531 -Zv9_NA337 69261 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=1.363;DP=311;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=0.87;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,44:311:99:298,0,10293 -Zv9_NA754 2221 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -Zv9_NA754 3007 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -Zv9_NA135 12702 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:282,0,61 -Zv9_NA905 49204 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,338 -Zv9_NA905 49380 . T G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=23.65;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,179 -Zv9_NA905 49414 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:459,0,235 -Zv9_NA905 53013 . G A 537.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-0.224;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:15:566,0,15 -Zv9_NA905 53563 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,187 -Zv9_NA894 3545 . T G 244.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=18.79;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:4:271,0,4 -Zv9_NA894 3683 . A C 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:922,66,0 -Zv9_NA758 7728 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.291;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=20.57;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:563,0,323 -Zv9_NA81 62492 . G C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -Zv9_NA81 62586 . C A 372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 -Zv9_NA81 62759 . T A 632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:661,45,0 -Zv9_NA81 62779 . T C 786.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:815,57,0 -Zv9_NA81 62837 . T A 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -Zv9_NA880 20967 . C T 2549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.157;DP=602;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:469,131:600:99:2578,0,18520 -Zv9_NA399 82751 . C T 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:235,0,22 -Zv9_NA675 159231 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -Zv9_NA675 159472 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-0.263;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,278 -Zv9_NA865 9211 . A T 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 -Zv9_NA478 119 . TAC T 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.634;DP=43;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:256,0,136 -Zv9_NA478 823 . T C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.391;DP=59;FS=7.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:831,0,1112 -Zv9_NA566 4958 . C T 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-0.554;DP=235;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,51:234:99:1013,0,6965 -Zv9_NA566 5364 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=-0.612;DP=242;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,53:240:99:928,0,7178 -Zv9_NA566 6392 . TCA T 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=1.572;DP=140;FS=7.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:542,0,2433 -Zv9_NA566 6706 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.744;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:388,0,2853 -Zv9_NA398 30780 . G C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.328;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:398,0,343 -Zv9_NA398 30965 . C A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.884;DP=16;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,218 -Zv9_NA429 11512 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:384,0,251 -Zv9_NA429 11929 . T C 376.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:404,0,9 -Zv9_NA429 15307 . T A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:350,0,310 -Zv9_NA429 15764 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=2.534;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=19.45;ReadPosRankSum=-2.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:320,0,243 -Zv9_NA429 16162 . T A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-1.327;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:545,0,640 -Zv9_NA429 16184 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:653,0,539 -Zv9_NA429 18431 . A T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=20.65;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,205 -Zv9_NA429 19549 . G A 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 -Zv9_NA429 19606 . T TTC 234.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -Zv9_NA429 57796 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:304,0,346 -Zv9_NA429 63297 . GGGTCAGGAAACACTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGCTTACCTCCAGTGTTTATGACTATAATGTGTGTGTGTGTGTTCTCTGACA G 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,328 -Zv9_NA550 3735 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,403 -Zv9_NA637 5863 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,134 -Zv9_NA41 38671 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,384 -Zv9_NA234 5735 . CGTAAGTTCAGATCAGTTTGCATGTGTTTGTGTGTTTATTTGGGTACTGTTTATTTGAGTGCTGCGGAAGGATGGAATGATGTTCATGCTTGTTTTTTTCTTTAACAG C 11741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.497;DP=305;FS=7.956;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,288:302:99:11779,836,0 -Zv9_NA234 6094 . G T 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.321;DP=248;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,39:248:99:557,0,7943 -Zv9_NA813 6170 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:291,0,67 -Zv9_NA813 6172 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:67:291,0,67 -Zv9_NA824 44089 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=32.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:70:318,0,70 -Zv9_NA824 44403 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=19.89;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:247,0,221 -Zv9_NA501 72474 . T C 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:601,42,0 -Zv9_NA831 195 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:577,40,0 -Zv9_NA831 384 . AAAACAAACACATTTTACACAAATAACAGCTCAAACAAACACATTTTACACAAATAACAGCTC A 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.441;DP=35;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:74:589,0,74 -Zv9_NA831 1059 . C G 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:482,33,0 -Zv9_NA831 1062 . A C 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:482,33,0 -Zv9_NA831 1275 . C G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=2.083;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:427,0,1170 -Zv9_NA831 1631 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:231,0,63 -Zv9_NA831 2398 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.068;DP=25;FS=6.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:401,0,481 -Zv9_NA831 3665 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,175 -Zv9_NA831 3695 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,306 -Zv9_NA831 4385 . T C 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:314,24,0 -Zv9_NA831 4492 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:467,0,281 -Zv9_NA831 4628 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.589;DP=32;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:488,0,597 -Zv9_NA178 42635 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.65;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42:408,0,42 -Zv9_NA178 42644 . C G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:42:408,0,42 -Zv9_NA403 30381 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.178;DP=36;FS=7.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:456,0,769 -Zv9_NA403 40143 . T TG 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.268;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:390,0,229 -Zv9_NA911 7124 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.906;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:421,0,168 -Zv9_NA911 8890 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=1.123;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:535,0,734 -Zv9_NA911 12424 . C T 5901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.229;DP=190;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,152:190:99:5930,0,649 -Zv9_NA192 18252 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-2.028;DP=164;FS=4.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,36:162:99:718,0,4802 -Zv9_NA192 22245 . A T 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=1.133;DP=73;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.54;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1017,0,1552 -Zv9_NA192 22533 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:356,0,108 -Zv9_NA166 1488 . C T 1321.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1350,90,0 -Zv9_NA166 1489 . C T 1321.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1350,90,0 -Zv9_NA166 2575 . CA C 344.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.66;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:382,37,0 -Zv9_NA166 4357 . T G 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 -Zv9_NA166 7510 . T C 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:778,57,0 -Zv9_NA166 7556 . C T 1468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1497,108,0 -Zv9_NA141 1916 . G GA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.537;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:274,0,109 -Zv9_NA141 4299 . C A 1829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.310;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=30.00;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1858,126,0 -Zv9_NA141 4415 . A G 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-2.747;DP=86;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1238,0,594 -Zv9_NA141 4440 . G T 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=-1.115;DP=96;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,42:57:99:1645,0,383 -Zv9_NA408 8147 . A C 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:646,48,0 -Zv9_NA408 10517 . A G 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:687,48,0 -Zv9_NA233 34337 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:351,0,333 -Zv9_NA95 31646 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=2.213;DP=50;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:280,0,1068 -Zv9_NA95 40206 . AG A 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:270,0,350 -Zv9_NA926 8679 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.400;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:400,0,403 -Zv9_NA926 8707 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.684;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,363 -Zv9_NA926 8815 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.234;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=23.82;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:457,0,206 -Zv9_NA926 9038 . T C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.369;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,37:51:99:1394,0,346 -Zv9_NA926 9211 . T C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.317;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:784,0,223 -Zv9_NA926 9429 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-1.333;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:831,0,709 -Zv9_NA926 9512 . T G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.020;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:633,0,408 -Zv9_NA926 9992 . T C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.528;DP=31;FS=9.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.838;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:766,0,259 -Zv9_NA926 10071 . A C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=1.160;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:516,0,395 -Zv9_NA926 10159 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.154;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:487,0,948 -Zv9_NA926 10160 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.077;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:487,0,948 -Zv9_NA926 10973 . C CA 319 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.873;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:12:356,0,12 -Zv9_NA926 11164 . T C 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.797;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:653,0,312 -Zv9_NA926 11319 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.190;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:711,0,614 -Zv9_NA926 11415 . CT C 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=1.206;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:348,0,396 -Zv9_NA926 11535 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.286;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=17.03;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:505,0,442 -Zv9_NA926 11762 . T G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=1.087;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:718,0,473 -Zv9_NA926 12021 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-1.067;DP=16;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,179 -Zv9_NA926 12133 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:397,0,263 -Zv9_NA926 12151 . C G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:466,0,285 -Zv9_NA926 12417 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.671;DP=32;FS=6.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:817,0,293 -Zv9_NA926 12439 . T C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-1.796;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:781,0,263 -Zv9_NA926 12695 . T A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-1.622;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:429,0,422 -Zv9_NA395 5335 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.902;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,20:122:99:231,0,3973 -Zv9_NA662 3236 . T G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.788;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,168 -Zv9_NA662 4397 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=2.526;DP=41;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:603,0,1818 -Zv9_NA662 4398 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=2.552;DP=41;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:603,0,1822 -Zv9_NA662 4875 . A AT 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=-0.615;DP=32;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:407,0,346 -Zv9_NA662 6648 . T G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:277,0,133 -Zv9_NA662 9090 . TA T 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:49:293,0,49 -Zv9_NA662 11316 . C G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:375,0,203 -Zv9_NA662 11575 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=28.52;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:82:456,0,82 -Zv9_NA662 11731 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.228;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:318,0,286 -Zv9_NA662 11743 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:318,0,286 -Zv9_NA563 6604 . A T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.377;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:581,0,460 -Zv9_NA563 6619 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-1.811;DP=29;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:507,0,462 -Zv9_NA563 6721 . G GA 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.047;DP=25;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:291,0,130 -Zv9_NA563 6974 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.036;DP=22;FS=7.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:378,0,290 -Zv9_NA563 7857 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.022;DP=19;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:280,0,382 -Zv9_NA706 2677 . C T 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-1.726;DP=357;FS=0.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=4.82;ReadPosRankSum=2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,83:356:99:1749,0,10556 -Zv9_NA706 3167 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.430;DP=188;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,31:188:99:377,0,6088 -Zv9_NA706 13803 . C T 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=1.055;DP=504;FS=4.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:397,105:502:99:1774,0,14229 -Zv9_NA119 1316 . A G 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.562;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:739,0,2648 -Zv9_NA119 1679 . C A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-3.052;DP=125;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,36:124:99:593,0,4876 -Zv9_NA39 4091 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -Zv9_NA988 386 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.178;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:460,0,675 -Zv9_NA988 479 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.403;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:340,0,399 -Zv9_NA160 353 . T G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.923;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:336,0,1106 -Zv9_NA160 578 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.623;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:314,0,1417 -Zv9_NA160 879 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.369;DP=106;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:666,0,3044 -Zv9_NA160 1030 . C G 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.165;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=25.32;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,37:53:99:1421,0,445 -Zv9_NA160 1469 . T C 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.415;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:954,0,3098 -Zv9_NA160 1471 . G A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.118;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:954,0,3157 -Zv9_NA160 1951 . T A 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.544;DP=65;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,32:64:99:1186,0,2073 -Zv9_NA160 3505 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=-1.915;DP=58;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:763,0,1598 -Zv9_NA160 4208 . T C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=2.000;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:512,0,1307 -Zv9_NA160 4423 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.334;DP=54;FS=19.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:774,0,1180 -Zv9_NA160 4767 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.330;DP=88;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:1551,0,1549 -Zv9_NA600 8570 . G C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.953;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=28.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:660,0,28 -Zv9_NA600 20861 . A T 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -Zv9_NA600 20863 . G C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:240,18,0 -Zv9_NA378 7811 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.344;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:248,0,1092 -Zv9_NA378 7931 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.489;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:494,0,454 -Zv9_NA378 10272 . T C 291.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:320,0,15 -Zv9_NA53 1759 . GGGTAAGTCTGTTTATTCAGCACATTACATGAAATATGCACTGTAAGAGGGTTTGTCTCGTTTCTTATTGTTGTGTTGATTTTGTAACTTAAAATTCTTAAATCAAGAAGCATTTCTGAACAAGAACATAACTCTGTCTTGTTTTCA G 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:249,0,934 -Zv9_NA96 8135 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -Zv9_NA668 7300 . T C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -Zv9_NA668 7322 . C T 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:411,30,0 -Zv9_NA668 14083 . A G 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -Zv9_NA668 15702 . T A 726.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:755,54,0 -Zv9_NA668 16597 . G A 4288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=1.286;DP=103;FS=5.730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=33.26;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:4317,303,0 -Zv9_NA668 17213 . GA G 4935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.06;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,153:153:99:4973,468,0 -Zv9_NA668 17461 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:282,0,50 -Zv9_NA668 18149 . C G 355.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=29.59;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:12:383,0,12 -Zv9_NA668 18852 . G A 1300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1329,96,0 -Zv9_NA668 20015 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -Zv9_NA963 11307 . A T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;ClippingRankSum=0.995;DP=283;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,77:283:99:1204,0,14574 -Zv9_NA963 14151 . G A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.311;ClippingRankSum=-0.933;DP=178;FS=8.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,51:178:99:1145,0,4715 -Zv9_NA963 16654 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:288,0,934 -Zv9_NA963 17861 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.938;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:237,0,1313 -Zv9_NA963 17890 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-2.151;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:252,0,1105 -Zv9_NA963 33490 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:287,0,340 -Zv9_NA154 31488 . A C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,212 -Zv9_NA42 48580 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -Zv9_NA28 95330 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:271,0,98 -Zv9_NA417 5626 . C T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -Zv9_NA261 5272 . C G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.599;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=15.31;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:610,0,656 -Zv9_NA261 10207 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.260;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:429,0,442 -chr1 18230 . GGCAGGTACAGCAGAGGAGCACAGAACACACACACACGATTACAGCCACTCAGCGGGATACAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT G 1689.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.016;DP=53;FS=7.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=31.88;ReadPosRankSum=2.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:99:1727,0,1297 -chr1 20361 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.344;DP=43;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:467,0,928 -chr1 24969 . CGGTACCACACACACACACACTCCATATCTAAAACCATCACTTCTCCATATCTAACAGCATCACCACATCTTAATCACTGCCGCTTTCTCTGCTTGTGTCTTGCA C 1146.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=3.153;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=27.19;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:99:1184,0,1110 -chr1 26980 . T G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.190;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.19;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:433,0,413 -chr1 27301 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.722;DP=24;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:410,0,396 -chr1 27939 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:90:290,0,90 -chr1 37616 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr1 48148 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,306 -chr1 48786 . TACCTGCAGAGGAAGAAGATGTGATCTGCATGATCTGGGTGAACCACACACACACACACACACACACACACACAACACTC T 7742.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.712;DP=178;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=30.35;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,169:173:99:7780,665,0 -chr1 53917 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.399;DP=57;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:301,0,1511 -chr1 93242 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=2.266;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=22.18;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:361,0,192 -chr1 96090 . AGTGAGTGAAGCTACACACACACACACACACACACTCACACACTCACTCTGTGTTCCTCTGCAG A 917.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=2.239;DP=26;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=31.62;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:955,0,1229 -chr1 96385 . A G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.769;DP=44;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=21.06;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:955,0,535 -chr1 98791 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:771,0,380 -chr1 116292 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=-0.563;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:245,0,2257 -chr1 152315 . C T 4097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=3.163;DP=160;FS=13.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,115:159:99:4126,0,928 -chr1 153011 . G C 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=-0.873;DP=74;FS=15.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1186,0,1239 -chr1 164215 . C T 1687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.102;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,46:226:99:1716,0,6815 -chr1 168688 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.675;DP=269;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,46:269:99:506,0,9143 -chr1 204800 . C T 1640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=1.015;DP=101;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1669,0,1818 -chr1 351806 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=-1.834;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:469,0,420 -chr1 354683 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-1.359;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:327,0,868 -chr1 371457 . A G 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.403;DP=71;FS=3.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:737,0,1541 -chr1 376743 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.717;DP=81;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:506,0,2171 -chr1 376776 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=1.594;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:389,0,2081 -chr1 379164 . AT A 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-0.643;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:304,0,337 -chr1 379289 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=1.431;DP=51;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=7.66;ReadPosRankSum=-2.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:419,0,1480 -chr1 379301 . TA T 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.119;DP=47;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:488,0,714 -chr1 379539 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:472,0,240 -chr1 392405 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.418;DP=38;FS=5.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:312,0,1497 -chr1 399506 . G A 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.750;DP=281;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,68:281:99:1403,0,13680 -chr1 402018 . T A 1883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.645;DP=345;FS=0.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.888;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,86:327:99:1912,0,8904 -chr1 403345 . G A 2152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-1.407;DP=301;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,88:300:99:2181,0,7888 -chr1 419063 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=1.253;DP=89;FS=5.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:441,0,2708 -chr1 424766 . T A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.728;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:751,0,800 -chr1 456987 . G A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.150;DP=130;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:651,0,3509 -chr1 457089 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-2.341;DP=93;FS=15.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:274,0,2626 -chr1 461897 . G T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.546;DP=166;FS=2.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,32:166:99:533,0,5210 -chr1 476570 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=1.601;DP=45;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:640,0,2234 -chr1 476579 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.120;DP=48;FS=4.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:640,0,2286 -chr1 477831 . GTGCTGGGTAACACTCGTCGTCATCCGTCATGCAGAGTAACGGTGTTGTGCGCCTGTGTTTGACCTGT G 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=1.370;DP=51;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:636,0,2951 -chr1 477836 . GGGTAACACTCGTCGTCATCCGTCATGCAGAGTAACGGTGTTGTGCGCCTGTGTTTGACCTGTTTCTGCTGTA G 1066.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.456;DP=50;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:1104,0,1997 -chr1 485990 . C A 12883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.011;DP=451;FS=5.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=28.57;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,322:451:99:12912,0,3002 -chr1 485999 . A C 6137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.405;ClippingRankSum=0.396;DP=450;FS=0.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,182:450:99:6166,0,12969 -chr1 487784 . G A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-1.009;DP=441;FS=7.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:355,85:440:99:1155,0,17862 -chr1 489265 . C G 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-1.422;DP=256;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,51:254:99:945,0,7923 -chr1 494208 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-2.198;DP=37;FS=13.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=7.97;ReadPosRankSum=-2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,3:37:99:323,0,1295 -chr1 494969 . A G 1611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-3.006;DP=304;FS=0.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,76:302:99:1640,0,8414 -chr1 495724 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.446;DP=149;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=1.97;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,25:147:99:322,0,4822 -chr1 496033 . G A 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.442;DP=182;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=13.27;ReadPosRankSum=4.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,76:179:99:2444,0,3864 -chr1 500423 . G A 3781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-0.514;DP=230;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,112:229:99:3810,0,3934 -chr1 500489 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=-1.164;DP=153;FS=3.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,32:152:99:547,0,5157 -chr1 505012 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=3.877;DP=85;FS=6.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:660,0,2185 -chr1 505027 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=3.920;DP=89;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1055,0,1944 -chr1 546238 . G A 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.545;DP=60;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:892,0,631 -chr1 548510 . G A 2811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=-1.282;DP=160;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,91:160:99:2840,0,2355 -chr1 568504 . C T 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.178;DP=58;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1293,0,687 -chr1 570486 . A T 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-0.251;DP=45;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:276,0,1138 -chr1 571487 . G T 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.289;DP=83;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,46:83:99:1491,0,1327 -chr1 572567 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=2.785;DP=67;FS=10.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=14.91;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1027,0,1085 -chr1 572661 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=3.569;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:358,0,1500 -chr1 573805 . GAGGTGTGTGTGTGTGATGCGTGTTTCTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCATGTGTGATGAGTGTCTCTCCTCTGTGTTC G 6510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.136;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:122:99:6548,566,0 -chr1 573969 . C T 2627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=-2.957;DP=156;FS=4.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,85:156:99:2656,0,2446 -chr1 574509 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.585;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:316,0,2337 -chr1 592258 . C CCA 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-1.323;DP=33;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:353,0,437 -chr1 606321 . A G 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=1.163;DP=346;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,68:342:99:1118,0,10228 -chr1 621828 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.568;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:295,0,898 -chr1 624970 . C T 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.188;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=19.99;ReadPosRankSum=2.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:888,0,544 -chr1 630307 . C T 213.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:242,0,23 -chr1 638526 . C T 749.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:778,57,0 -chr1 638559 . T A 1822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1851,135,0 -chr1 655201 . GAGGTCAGTGTGTGTTTGGGTGGGCAGCAGTTTGAAGCTGTGCTGCGTGTTTGTGGGTAATGATGTGGACACACACAGCTCTGACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTC G 3273.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=1.590;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=31.72;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,75:80:99:3311,318,0 -chr1 679087 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.629;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.994;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:424,0,659 -chr1 679101 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.564;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:266,0,996 -chr1 683967 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=-0.534;DP=64;FS=6.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:243,0,1927 -chr1 684880 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.662;DP=53;FS=3.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:913,0,805 -chr1 695204 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-0.814;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:354,0,564 -chr1 703392 . C A 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.575;DP=57;FS=4.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:359,0,1598 -chr1 704363 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.647;DP=53;FS=4.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:273,0,1544 -chr1 705824 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-2.501;DP=74;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:516,0,1851 -chr1 706184 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.624;DP=58;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:255,0,1788 -chr1 706913 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.175;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:363,0,1530 -chr1 711917 . T A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-0.882;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:454,0,1321 -chr1 766124 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.676;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:534,0,772 -chr1 779691 . TATATGTGTAGTGTGTGTGTATGTGTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGC T 623.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:57:661,57,0 -chr1 986873 . G GA 906.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=1.030;DP=67;FS=8.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:944,0,831 -chr1 989512 . G GT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.551;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:243,0,1719 -chr1 996988 . G A 3600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.287;DP=264;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=13.64;ReadPosRankSum=2.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,105:263:99:3629,0,5198 -chr1 997045 . C A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-2.191;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,54:203:99:991,0,7634 -chr1 997815 . A C 2725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.855;ClippingRankSum=1.748;DP=250;FS=5.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.90;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,85:248:99:2754,0,4985 -chr1 999469 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=-0.972;DP=265;FS=4.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,54:265:99:903,0,8021 -chr1 1001796 . C T 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.104;DP=178;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,42:178:99:953,0,4966 -chr1 1013803 . C T 2593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.943;DP=238;FS=8.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.757;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,81:238:99:2622,0,5283 -chr1 1021349 . T C 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.943;DP=74;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.42;ReadPosRankSum=-2.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:873,0,1616 -chr1 1029207 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,177 -chr1 1456989 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.900;DP=201;FS=5.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,38:201:99:616,0,6489 -chr1 1474892 . CAGGTACTTATTGATATTATATTGCATAGATTGTTTTATAAGTGTTATATTTTCCTGACTCTGACGAATGTGAATTCCCACTTTGTCTTAT C 13001.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-1.917;DP=365;FS=6.042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.143;QD=32.41;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,361:364:99:13039,1233,0 -chr1 1475878 . G T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-1.332;DP=334;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,70:334:99:1170,0,20438 -chr1 1478713 . AAGGTATGATTTAAAAACTGCTCATCTTAAAGAAACAGAAATGCATTGGCTACAAATTAAAAATCTCTTTTCT A 1639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.234;DP=373;FS=3.017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,339:341:99:1677,664,0 -chr1 1478841 . G T 2127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.318;ClippingRankSum=1.160;DP=421;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,114:420:99:2156,0,11532 -chr1 1479426 . G A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=-1.637;DP=415;FS=7.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,96:415:99:1965,0,12246 -chr1 1480293 . TGGTAAGCACTGCATTTGATTGGTTCTATTTAATAGCTGGTTGGTGAGGTTAATAAATGATATTGTCCTGTTATCGTCAA T 5986.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-2.408;DP=394;FS=10.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=15.19;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,185:387:99:6024,0,11568 -chr1 1481206 . AGTAAGTGGATGGGTAATAATTCAGTATGTTTCTGAGCGTCTTGTATCAGAGGTCTTACGTGTTTGCTGTTGTCTTGCAG A 9814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=-0.092;DP=328;FS=2.117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,315:318:99:10269,941,0 -chr1 1489002 . G GTC 687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-0.605;DP=87;FS=8.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:725,0,2233 -chr1 1489389 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.757;DP=29;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:295,0,759 -chr1 1491996 . T C 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=1.104;DP=68;FS=6.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:868,0,1500 -chr1 1492139 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.534;DP=79;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:587,0,2204 -chr1 1492176 . C G 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.310;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,29:83:99:981,0,1905 -chr1 1492274 . G C 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-2.134;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=14.26;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:898,0,1326 -chr1 1492408 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=2.175;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:320,0,3856 -chr1 1549093 . ACAGGTAAAGAAAAATGTGTCCTTTAATGTCCGAATGTAACTTGGTACGTGGTACTGCAGTAGTCATTGTTCTGTTCATT A 11679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=4.987;DP=301;FS=1.224;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=26.80;ReadPosRankSum=-3.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,282:292:99:11717,906,0 -chr1 1549641 . C CA 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.258;DP=257;FS=11.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,53:240:99:532,0,5218 -chr1 1549995 . C T 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.390;DP=232;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,54:232:99:1171,0,8339 -chr1 1550424 . T TAGAGAGACAG 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:389,0,780 -chr1 1551848 . C T 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=1.619;DP=236;FS=2.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,78:235:99:2076,0,7464 -chr1 1563567 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.778;DP=124;FS=3.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,20:124:99:233,0,4197 -chr1 1568574 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=1.804;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:497,0,1076 -chr1 1568962 . C T 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=3.888;DP=108;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1717,0,1876 -chr1 1569810 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-1.067;DP=160;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,25:160:99:265,0,5228 -chr1 1569852 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=-2.406;DP=124;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,34:124:99:860,0,3397 -chr1 1602587 . T C 564.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=28.20;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:11:592,11,0 -chr1 1602746 . G T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.712;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:335,0,957 -chr1 1603090 . AAGGTATGTCATATTTTGGGAACTTCCTTGACTGAATAATTCTGAAGACTCACATCTCAAACATATCTTCCACTTC A 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.304;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:319,0,681 -chr1 1607640 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=18.98;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,180 -chr1 1608081 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.747;DP=50;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:763,0,1009 -chr1 1608679 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.984;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,287 -chr1 1608839 . G A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.776;DP=45;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=23.93;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:1105,0,1432 -chr1 1608844 . A T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.536;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:1100,0,1432 -chr1 1609029 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=1.297;DP=26;FS=12.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:411,0,510 -chr1 1610612 . G T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.554;DP=44;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=18.63;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:848,0,577 -chr1 1612582 . GA G 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.164;DP=53;FS=8.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:476,0,754 -chr1 1631288 . A C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=2.068;DP=21;FS=3.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:99:265,0,935 -chr1 1631310 . A T 1398.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=1.380;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=28.45;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:15:1427,0,15 -chr1 1631527 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.369;DP=36;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:565,0,752 -chr1 1758188 . A G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr1 1761726 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=1.550;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:363,0,368 -chr1 1970068 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr1 1971665 . C CA 619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=-1.379;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.657;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:657,0,427 -chr1 1973879 . C CA 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-1.088;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:427,0,269 -chr1 1974194 . TTA T 807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=1.826;DP=67;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=12.06;ReadPosRankSum=-2.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:845,0,814 -chr1 2035862 . C CCGGACTG 1435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=338;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:41:1473,41,0 -chr1 2042111 . C G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=1.452;DP=363;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,58:361:99:656,0,11582 -chr1 2703981 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,437 -chr1 3469201 . C G 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:229,0,25 -chr1 4171156 . T C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-2.580;DP=58;FS=7.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=6.62;ReadPosRankSum=-2.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:412,0,1986 -chr1 4244594 . A ATG 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=10.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:25:306,25,0 -chr1 4244688 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.832;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=14.59;ReadPosRankSum=-3.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:539,0,639 -chr1 4244712 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=2.914;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:392,0,616 -chr1 4291807 . C CA 797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.957;DP=608;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=1.31;ReadPosRankSum=2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:488,111:599:99:835,0,13539 -chr1 4338167 . A T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr1 4381489 . T C 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.622;DP=388;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,74:386:99:1072,0,11672 -chr1 4384476 . CACA C 1165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-1.779;DP=256;FS=3.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,58:253:99:1203,0,9483 -chr1 4384480 . GGTAAATATGGCCACACATCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT GTCAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTT,G 5542.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-2.704;DP=244;FS=3.260;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=22.71;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:26,153,54:233:99:6913,787,1300,4867,0,8356 -chr1 4384499 . CAGAGAGCTATTCAACCATGAATGCCATATTAATTTGAATGTTTGTTTCAGTG C 3864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=-3.958;DP=235;FS=7.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,117:197:99:3902,0,2976 -chr1 4392600 . T G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.359;DP=486;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:414,70:484:99:740,0,32199 -chr1 4392606 . A C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.779;DP=459;FS=5.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,69:457:99:746,0,32199 -chr1 4396687 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.947;DP=305;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,56:304:99:794,0,9427 -chr1 4403237 . ACTAAATGAAGAAACAAGAGTCTTATTATTCTACTACAAAAGATTAGGAAGATGTATTTCAATTCCTGACTTCTCAC A 11549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.650;DP=294;FS=3.542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,276:282:99:11587,836,0 -chr1 4405062 . AGTCTAAATTGAGGAAAACGAGAAACAGCAGGTGAAGTTTAAGATGTACCATCAAT A 927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.576;DP=243;FS=4.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,32:207:99:965,0,5650 -chr1 4410790 . GCTGAAAAACAAGCAAATTAGAGTATACTTCTCTAAGGGCACAGAAGAACATTACTGCACTTGTTTCGCCTCAGAAGAAAAGGTTACGCAC G 9187.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.607;DP=202;FS=2.544;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=34.07;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,199:202:99:9225,813,0 -chr1 4411144 . TCTGAGGAAGGAGAATGTTGTGATGATATAGACATAATAATAACGAAATGTAAGATCTTTTGGAAAACTCAAACACTCAC T 10307.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.916;DP=225;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=31.82;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:225:99:10345,917,0 -chr1 4415963 . ACTGGAGAACAAGAAGTTGTTTGAAGTTGTTTTTCTTTTTGGAAATTACTGAAGAAAAGGGAGTAAAGATAATACATATGTAAAGCTACATAC A 11668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=2.430;DP=252;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=32.71;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,250:252:99:11788,974,0 -chr1 4495645 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.723;DP=120;FS=8.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:599,0,3424 -chr1 4497199 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=1.286;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:417,0,2517 -chr1 4621185 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.142;DP=67;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:548,0,1758 -chr1 4673859 . C A 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:400,27,0 -chr1 4729412 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.477;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:314,0,502 -chr1 4783754 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.746;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,677 -chr1 5022852 . CA C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:267,0,344 -chr1 5023095 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,350 -chr1 5023220 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=21.41;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:328,0,167 -chr1 5023728 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.785;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:265,0,477 -chr1 5024148 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:404,0,389 -chr1 5028816 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=-0.688;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:236,0,5664 -chr1 5032173 . T C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-1.265;DP=122;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,34:122:99:710,0,5290 -chr1 5032783 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=2.167;DP=59;FS=9.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=6.40;ReadPosRankSum=-2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:406,0,3774 -chr1 5042395 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=-0.872;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:464,0,243 -chr1 5050231 . A G 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr1 5073310 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.320;DP=55;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:696,0,1168 -chr1 5075045 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=2.000;DP=19;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:348,0,181 -chr1 5082688 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:238,0,98 -chr1 5089190 . T A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=24.91;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:377,0,129 -chr1 5089223 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-2.900;DP=32;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=12.46;ReadPosRankSum=2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:427,0,757 -chr1 5102257 . A T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.326;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.166;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:566,0,1122 -chr1 5107877 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr1 5110684 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.700;DP=61;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:247,0,1838 -chr1 5113689 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=-3.021;DP=59;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:442,0,1475 -chr1 5127026 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.404;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:263,0,1217 -chr1 5170354 . C G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:268,0,774 -chr1 5205529 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.904;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:337,0,625 -chr1 5229379 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:238,0,98 -chr1 5231486 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-1.582;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:287,0,413 -chr1 5268173 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-0.553;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:359,0,507 -chr1 5268209 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.318;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:413,0,651 -chr1 5524427 . T C 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.769;DP=178;FS=10.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:1100,0,5089 -chr1 5526013 . AG A 869.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=1.611;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,34:41:28:907,0,28 -chr1 5526478 . G GA 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.627;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:387,0,121 -chr1 5526672 . T A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.586;DP=126;FS=6.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,32:126:99:744,0,3755 -chr1 5527109 . ATG A 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=-1.795;DP=57;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:315,0,382 -chr1 6398710 . G C 352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:381,30,0 -chr1 6398835 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:659,0,114 -chr1 6424040 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=7.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:47:441,0,47 -chr1 6425038 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:238,0,97 -chr1 6425586 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:512,0,158 -chr1 6425681 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-1.220;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:359,0,456 -chr1 6425983 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-1.391;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:295,0,1696 -chr1 6426307 . G C 1113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=1.455;DP=30;FS=2.863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:48:1142,48,0 -chr1 6426370 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:237,0,65 -chr1 6497370 . A AT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.607;DP=27;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:318,0,317 -chr1 6497416 . T A 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=-0.174;DP=56;FS=3.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:852,0,1063 -chr1 6501064 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-2.270;DP=23;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,416 -chr1 6501156 . G A 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=1.343;DP=38;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1086,0,463 -chr1 6504212 . TG T 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=1.242;DP=118;FS=14.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,63:114:99:1561,0,1407 -chr1 6511309 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=1.357;DP=24;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:443,0,729 -chr1 6511475 . A T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.55;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:387,0,506 -chr1 6511499 . G T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.956;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=31.88;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:387,0,506 -chr1 6518906 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,331 -chr1 6750838 . TA T 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.728;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:413,0,729 -chr1 6764333 . T TC 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=2.119;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.031;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:248,0,256 -chr1 6771074 . G GT 2945.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.632;DP=230;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,125:220:99:2983,0,2332 -chr1 6800805 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,607 -chr1 6800815 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.143;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:274,0,607 -chr1 6890425 . C T 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr1 6890575 . A G 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:51:746,51,0 -chr1 6890580 . A G 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:746,51,0 -chr1 6995270 . CTT C 368.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.21;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:406,28,0 -chr1 6996219 . G GAT 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.537;DP=69;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:391,0,115 -chr1 7051796 . T G 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr1 7051848 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr1 7156842 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=3.049;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.063;QD=7.19;ReadPosRankSum=-2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:280,0,1234 -chr1 7158339 . T TA 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.606;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:53:265,0,53 -chr1 7167995 . A G 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=2.592;DP=73;FS=2.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,45:73:99:1509,0,910 -chr1 7494242 . CA C 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.251;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:261,0,128 -chr1 7494962 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,340 -chr1 7585406 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-0.207;DP=37;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:747,0,414 -chr1 7592886 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-1.109;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:234,0,415 -chr1 7593023 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,420 -chr1 7601351 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:287,0,285 -chr1 7606318 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-0.581;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:495,0,562 -chr1 7612650 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:37:429,0,37 -chr1 7615712 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.718;DP=26;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:477,0,474 -chr1 7635405 . T C 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-0.531;DP=51;FS=10.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:723,0,1084 -chr1 7636226 . A C 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.518;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1151,0,1122 -chr1 7642569 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.301;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=15.38;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:628,0,665 -chr1 7663174 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:68:235,0,68 -chr1 7665547 . G A 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.354;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=26.12;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1282,0,288 -chr1 7665968 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=2.480;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=23.07;ReadPosRankSum=-2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:582,0,242 -chr1 7666090 . T C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:403,0,222 -chr1 7666176 . TA T 789.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=-1.630;DP=37;FS=5.237;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=21.33;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,30:34:8:826,8,0 -chr1 7719370 . G T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.796;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=23.82;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:457,0,204 -chr1 7725830 . TCTACAAGAGAAAGGGGACGTTAGCTCATCTGAAATCACTGCAAGCAAACTGCTATGAAAGTGAAAATGGGCAGGTGCATCAC T 8355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.509;DP=221;FS=6.986;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=30.24;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,203:205:99:8393,611,0 -chr1 7725934 . A T 3575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=-2.330;DP=223;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=16.03;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,104:222:99:3604,0,3897 -chr1 7726554 . G A 7234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.365;DP=419;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,222:418:99:7263,0,6931 -chr1 8080916 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.295;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:257,0,1916 -chr1 8140749 . T TA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.500;DP=71;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:267,0,2049 -chr1 8140969 . C A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-1.155;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:545,0,770 -chr1 8141416 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=1.202;DP=51;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:229,0,2142 -chr1 8143269 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.553;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:490,0,1152 -chr1 8143435 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.541;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:256,0,2347 -chr1 8183125 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.153;DP=34;FS=3.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:269,0,771 -chr1 8197776 . G A 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=1.914;DP=342;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,67:341:99:1102,0,10327 -chr1 8275171 . G T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=-0.896;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:454,0,173 -chr1 8366584 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.302;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:301,0,1247 -chr1 8576416 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:85:235,0,85 -chr1 8576976 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.033;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:396,0,1464 -chr1 8581546 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=1.964;DP=34;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:380,0,1859 -chr1 8581555 . G C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.273;DP=33;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:371,0,1859 -chr1 8581603 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=2.393;DP=34;FS=5.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:318,0,869 -chr1 8584449 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.232;DP=53;FS=6.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:354,0,1504 -chr1 8588441 . AATACCTGCAGCAGACAAAACCCTCTCTTACTCGGGAGGAAAAACAATCCAACATTGCATTCATAGTGTAAATCTCCACACACTG A 1845.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=1.376;DP=57;FS=2.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=32.38;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:1883,159,0 -chr1 8596530 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.682;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:465,0,702 -chr1 8596633 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.265;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:232,0,1101 -chr1 8702709 . G T 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 -chr1 8707670 . C A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr1 8707761 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=1.555;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,242 -chr1 8707832 . G T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-0.952;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:446,0,436 -chr1 8707867 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,591 -chr1 8719152 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-0.968;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:293,0,982 -chr1 8719612 . C A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=-0.433;DP=24;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:431,0,463 -chr1 8720570 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.328;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:620,0,780 -chr1 8961375 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:307,0,357 -chr1 9010698 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-1.535;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=12.93;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:442,0,638 -chr1 9099621 . C G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-2.070;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:307,0,510 -chr1 9113860 . G GA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.044;DP=98;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:240,0,1995 -chr1 9115948 . C CT 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.063;DP=108;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,27:100:99:331,0,2019 -chr1 9131285 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.898;DP=387;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:328,58:386:99:507,0,12580 -chr1 9133889 . A G 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.442;DP=347;FS=0.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,66:347:99:1024,0,10686 -chr1 9134120 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-1.343;DP=396;FS=21.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,60:396:99:547,0,13619 -chr1 9138608 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=17.86;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:314,0,284 -chr1 9259048 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.646;DP=44;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:308,0,1240 -chr1 9286667 . C A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.627;DP=67;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:728,0,1500 -chr1 9639719 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.872;DP=64;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:329,0,1933 -chr1 9646248 . C A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-0.485;DP=102;FS=4.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,20:102:99:337,0,3234 -chr1 9872946 . ATG A 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.234;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:265,0,1637 -chr1 9914472 . C CA 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.749;DP=180;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,37:165:99:406,0,3518 -chr1 9915080 . G GCC 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=2.289;DP=59;FS=6.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=8.69;ReadPosRankSum=-2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:908,0,745 -chr1 9915307 . T TAC 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.849;DP=26;FS=6.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:244,0,507 -chr1 10281008 . ACTGAAAGAAGAAAGATGAGTTACAACCTTTACTTTTTATGTTTATAAAGAGAGCAAGAATAATCTAGACCACTTAC A,AGAAAGAAGAAAGATGAGTTACAACCTTTACTTTTTATGTTTATAAAGAGAGCAAGAATAATCTAGACCACTTAC 1592.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,11,32:43:99:2023,1466,1452,481,0,252 -chr1 10281011 . GAAAGAAGAAAGATGAGTTACAACCTTTACTTTTTATGTTTATAAAGAGAGCAAGAATAATCTAGACCACTTACC G 1234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.434;DP=45;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,33:44:99:1272,0,252 -chr1 10288719 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=1.040;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:297,0,3004 -chr1 10293292 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.902;DP=240;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,43:240:99:594,0,7447 -chr1 10963760 . G GT 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-0.584;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:436,0,428 -chr1 10964684 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=-2.176;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:243,0,417 -chr1 10964690 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,336 -chr1 10964842 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.103;DP=41;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:232,0,1862 -chr1 10965691 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.54;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:334,0,57 -chr1 11082018 . T TA 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.603;DP=41;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:263,0,450 -chr1 11556286 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:258,0,94 -chr1 11559632 . A AT 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=2.747;DP=38;FS=9.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:301,0,198 -chr1 12124996 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.258;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:300,0,730 -chr1 12125137 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-1.156;DP=52;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:652,0,1023 -chr1 12482580 . T C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.833;DP=25;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:478,0,568 -chr1 12486180 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr1 12842293 . T G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.258;DP=73;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:251,0,3368 -chr1 12842378 . G GA 1879.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.104;DP=70;FS=2.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1970,0,325 -chr1 12843062 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.313;DP=119;FS=8.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=4.57;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:572,0,4225 -chr1 12843597 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-1.305;DP=113;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:864,0,2792 -chr1 12887255 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr1 13293122 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-2.001;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:316,0,1873 -chr1 13367639 . TA T 212.52 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:7:249,0,7 -chr1 13384347 . G C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.212;DP=20;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,129 -chr1 13384356 . C A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=2.436;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.24;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:399,0,294 -chr1 13384538 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.479;DP=95;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:300,0,3951 -chr1 13411692 . A G 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.780;DP=60;FS=5.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:1127,0,1864 -chr1 13411867 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=-1.468;DP=149;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,33:142:99:618,0,4156 -chr1 13412027 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=-0.526;DP=67;FS=24.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:353,0,4463 -chr1 13412037 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=-0.376;DP=69;FS=15.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:99:353,0,4463 -chr1 13412121 . G A 2083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.361;DP=146;FS=5.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,61:146:99:2112,0,3072 -chr1 13412331 . G A 1130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.561;DP=89;FS=4.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:1159,0,2232 -chr1 13412412 . C A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.813;DP=104;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:459,0,3756 -chr1 13412613 . G A 1992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=1.014;DP=139;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,58:139:99:2021,0,2723 -chr1 13412628 . C G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-2.563;DP=147;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,29:147:99:501,0,4641 -chr1 13412654 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.697;DP=136;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,28:136:99:500,0,4692 -chr1 13412821 . G A 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=1.317;DP=94;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,53:89:99:1785,0,1445 -chr1 13413123 . A G 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=2.275;DP=109;FS=3.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,40:104:99:1350,0,4200 -chr1 13957152 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-1.478;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:449,0,2261 -chr1 13959331 . G T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-0.436;DP=195;FS=9.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,31:194:99:369,0,6233 -chr1 13980109 . CAA C,CAAA 644.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=-0.851;DP=71;FS=7.610;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-2.151;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,11,43:65:99:986,733,1951,119,0,362 -chr1 14018846 . AT A 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=-1.277;DP=52;FS=4.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:238,0,2994 -chr1 14019205 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=-1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:311,0,314 -chr1 15202170 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:338,0,49 -chr1 15226134 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=-0.538;DP=40;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:375,0,584 -chr1 15354295 . G A 1013.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-2.748;DP=28;FS=2.649;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=26.99;ReadPosRankSum=2.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:9:1041,9,0 -chr1 15359176 . A ATC 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.146;DP=48;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=5.35;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:294,0,1165 -chr1 15375524 . C T 1939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.097;DP=92;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=21.08;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,57:92:99:1968,0,1242 -chr1 15388162 . CTAAAGG C 4575.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-0.296;DP=124;FS=3.118;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=33.88;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:123:99:4613,429,0 -chr1 15388171 . AGTTTGCGCTAATTTTCTCTTAACATTTGCAAATTAATCAACCGTAAGGGGTTCAGATTGTTGACCGATTGTTTCTCATGTGTCTTTCTTTC A 4659.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=-0.835;DP=117;FS=2.154;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=32.07;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,113:116:99:4697,433,0 -chr1 15396680 . ACTGCACAGCACCAGAATGAAAAGTGTTATTCAACTAGGCATTATAAGTGCTTCAAACTTAACTAATTAAAAGTGTAAATTCATAAAGAACCCAC A 2686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=2.303;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=28.60;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2724,216,0 -chr1 16211857 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr1 16240147 . AAGGTATAAGACACTCTAGGATCTCAGTAGAGGTTGTGCTGACAGGCTGTTGCTGAAACTGAATGATGACATTTTGTTTTGTTTGTTTGTT A 4362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=1.697;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=31.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:4400,348,0 -chr1 16240301 . G C 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.167;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1258,0,2021 -chr1 16263896 . C A 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=-0.157;DP=108;FS=3.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:1070,0,2167 -chr1 16264208 . C T 2454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-2.706;DP=118;FS=1.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,76:118:99:2483,0,1393 -chr1 16265065 . A G 3543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=35.02;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:3572,247,0 -chr1 16266348 . C CTT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,18:18:99:249,0,2621 -chr1 16266456 . T TC 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-2.768;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,27:72:99:303,0,3972 -chr1 16266458 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-1.239;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:303,0,3972 -chr1 16276787 . A T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=1.046;DP=104;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.33;ReadPosRankSum=2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:895,0,2940 -chr1 16277109 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.758;DP=114;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:698,0,3989 -chr1 16277683 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.448;DP=50;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:1012,0,934 -chr1 16277754 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=-0.119;DP=78;FS=3.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:283,0,2742 -chr1 16279988 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.313;DP=43;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:598,0,1928 -chr1 16280059 . A G 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.240;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.442;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1261,0,182 -chr1 16297113 . C T 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.096;DP=67;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1129,0,1187 -chr1 16423403 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.579;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:418,0,382 -chr1 16486986 . C CT 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.715;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=19.15;ReadPosRankSum=-2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:84:516,0,84 -chr1 16487583 . A AT 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=-0.573;DP=37;FS=5.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:491,0,251 -chr1 17337121 . AT A 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.995;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:276,0,436 -chr1 17388691 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.400;DP=68;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,11:68:99:236,0,4614 -chr1 17530422 . ACTACAGAGAATTACAGTCGTTTATAATCTGACATGCTGAATGAAAAGCAACACAAAATGCTAAACAACACTGAC A 3449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.041;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=32.74;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,72:75:99:3487,331,0 -chr1 17609817 . G A 2095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.329;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,60:122:99:2124,0,2130 -chr1 17671577 . TC T 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-1.061;DP=38;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:345,0,531 -chr1 17676006 . T TA 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.292;DP=72;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:503,0,607 -chr1 17677185 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.997;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:314,0,5956 -chr1 17677189 . T G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.059;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:314,0,5956 -chr1 17756078 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:267,0,315 -chr1 17808203 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:337,0,1291 -chr1 17847467 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=1.005;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:234,0,1705 -chr1 18071410 . GA G 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.510;DP=19;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:71:344,0,71 -chr1 18095012 . CA C 623.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.474;DP=31;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=20.12;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:661,0,138 -chr1 18098113 . C A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.744;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:729,0,1437 -chr1 18103198 . T A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.588;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:682,0,717 -chr1 18188377 . GTCAGGTACGCAGAGGCACACAGATGACTACCACTACCAGAAATGAGAACCACAGTGACCTTATTTTGCTTATTGGCTGTATTTTCTATGT G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:263,0,591 -chr1 18209941 . TA T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DP=17;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:95:267,0,95 -chr1 18215080 . TCCTGCAAGATACAGTCGCACACTTAACTGGAGGAGTTGCATCAGGGCAAGCATTGCTTTGCTGTTGCTGACTTGAGTCAAAACATA T 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.154;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:425,0,1549 -chr1 18291820 . T C 2200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.357;DP=436;FS=4.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,106:435:99:2229,0,12382 -chr1 18292545 . C T 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-1.776;DP=373;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,78:372:99:1465,0,11416 -chr1 18305321 . CTG C 1187.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.641;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,44:72:99:1225,0,774 -chr1 18326082 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.798;DP=116;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,19:116:99:256,0,3767 -chr1 18332999 . AACCTGAACAAAACAGACCACTATCAGTCTCTCTCAGCGTGCATTTCAGCTGCATTCACTTTCTTCCTGACAAACGAAATCATTCTG A 3749.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.179;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3787,311,0 -chr1 18356660 . T C 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr1 18361143 . T C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.283;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=27.16;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:490,0,123 -chr1 18385682 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.158;DP=86;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:390,0,2524 -chr1 18395780 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.021;DP=57;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:440,0,1561 -chr1 18407214 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.466;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,126 -chr1 18432281 . CAA C,CA 611.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.329;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,13,19:34:99:903,455,504,334,0,268 -chr1 18530003 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:233,0,392 -chr1 18545755 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,176 -chr1 18566420 . G T 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr1 18568395 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr1 18571829 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,103 -chr1 18572776 . G C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.760;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:451,0,325 -chr1 18577377 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.28;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:321,0,53 -chr1 18583347 . ACTAAACACAACAATAAAACTCAGTGCATGATTAACAAGCAAATGTATGCGAATATTAATAGTTGGTTTAAATAC A 8430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=4.056;DP=313;FS=4.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=26.94;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,282:301:99:8468,0,953 -chr1 18627752 . CGT C 1001.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.528;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=25.04;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:73:1039,73,0 -chr1 18628901 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.599;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,143 -chr1 18629245 . TA T 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-1.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:49:510,0,49 -chr1 18734847 . AT A 890.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:928,79,0 -chr1 18739020 . C T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.917;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=32.41;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:43:968,0,43 -chr1 18850746 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,396 -chr1 18950387 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-2.266;DP=45;FS=7.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=26.46;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,32:45:99:1219,0,330 -chr1 18950510 . G A 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.964;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,32:45:99:1222,0,353 -chr1 18959646 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.354;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.157;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:1023,0,323 -chr1 19650515 . T A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-3.070;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:1039,0,1042 -chr1 19650614 . T C 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-2.829;DP=35;FS=8.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=29.11;ReadPosRankSum=-1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:1047,0,1042 -chr1 19650670 . A C 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.514;DP=44;FS=15.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=33.24;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:1491,0,492 -chr1 19650691 . T G 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=1.304;DP=52;FS=13.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=28.13;ReadPosRankSum=-2.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:1491,0,495 -chr1 19650747 . A C 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.300;DP=43;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=34.02;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,23:24:99:1491,0,492 -chr1 19650785 . T G 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,25:25:99:1491,0,542 -chr1 19650849 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:268,0,843 -chr1 19650856 . AG A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.931;DP=14;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:268,0,796 -chr1 19651010 . T C 4313.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4342,320,0 -chr1 19651102 . A T 2719.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2748,217,0 -chr1 19651342 . T G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-1.891;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=4.92;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:368,0,1467 -chr1 19651359 . T A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.569;DP=45;FS=1.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=24.64;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1137,0,438 -chr1 19651372 . C G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.977;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.86;ReadPosRankSum=2.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:551,0,498 -chr1 19651740 . C CAT 499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:537,35,0 -chr1 19719505 . C T 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr1 19719602 . G T 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-2.133;DP=98;FS=2.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:947,0,2169 -chr1 20124223 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.638;DP=41;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:571,0,497 -chr1 20127711 . T C 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:528,36,0 -chr1 20128685 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.220;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:358,0,408 -chr1 20328074 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.655;DP=154;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=3.10;ReadPosRankSum=2.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,30:154:99:506,0,4772 -chr1 20330684 . TCTGACAGAAAACACACATTTTCAGAACTCATTGAATACCACTGGAAAAATCCAAAGTACTGACATTCAATTGATGCATAC T 6928.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.342;DP=164;FS=3.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=29.66;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:162:99:7462,611,0 -chr1 20335811 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-0.914;DP=200;FS=3.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,36:200:99:515,0,6621 -chr1 20339786 . G GT 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.084;DP=221;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,42:207:99:370,0,4528 -chr1 20347437 . ACAGGTCTAGAGAAAAGCCGTTGGATATTTGTGATGTACCGTGAAGCAGTATATGTCTCAAGTTGTTATCACAATGTTGGGTTCTTATTGTATTTTTGT A 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-1.118;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:338,0,4661 -chr1 20347441 . GTCTAGAGAAAAGCCGTTGGATATTTGTGATGTACCGTGAAGCAGTATATGTCTCAAGTTGTTATCACA G 3162.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.674;DP=119;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,81:108:99:3200,0,1612 -chr1 20347514 . TGGGTTCTTATTGTATTTTTGTCAGGATGTG T 3161.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.257;DP=121;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.966;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,84:110:99:3199,0,1652 -chr1 20393432 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.154;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:300,0,357 -chr1 20556735 . A G 731.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=2.227;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=29.27;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:22:760,0,22 -chr1 20696544 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=-1.449;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:310,0,2679 -chr1 20704497 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=1.094;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:469,0,2564 -chr1 21422059 . G GA 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=-0.431;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:454,0,423 -chr1 21451240 . T TAA 726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:59:764,59,0 -chr1 21545771 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.664;DP=34;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:237,0,966 -chr1 21545949 . A T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr1 21619665 . GCCTAGAATGCAGGAAATACATCAAAGCTTTATCCACACACACATGCAAACACACACACTGCAGATGCTCTCAAATAAACATACTCA G 2268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=1.674;DP=73;FS=3.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=31.08;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,64:68:97:2306,0,97 -chr1 22025459 . G T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.358;DP=144;FS=4.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,44:144:99:1135,0,3811 -chr1 22041527 . T G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.638;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:900,0,3108 -chr1 22041531 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.252;DP=105;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,23:105:99:434,0,6561 -chr1 22045439 . G A 3137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=1.139;DP=505;FS=8.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:368,134:502:99:3166,0,13974 -chr1 22053781 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-2.285;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:242,0,2383 -chr1 22066480 . A G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.358;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,43:197:99:940,0,12380 -chr1 22072588 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.635;DP=53;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:349,0,1457 -chr1 22104330 . TCCTACAAGAGCAAAAACAAATAAGAGTGAGTTGAGGATGATAGCAGTGTGAACATAAAGACCTTTTCATTTCATA T 6610.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=1.024;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=33.90;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,161:169:99:6648,428,0 -chr1 22264663 . A T 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.055;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=11.58;ReadPosRankSum=3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,39:112:99:1337,0,2511 -chr1 22272132 . AGTAGGACATCAGGCATTGATAAGCAAACAAATTTTACAATATGATGTTGTGTCAATTTTCAAAATCATCTAAAATGTTCTTACAG A 3934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=1.470;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,87:89:99:5264,390,0 -chr1 22278363 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=3.037;DP=72;FS=5.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:288,0,2513 -chr1 22284113 . TCCTGAAATAGAGAAATACTGTGCTAATGATATAGAAAGGAGTCAGCATCCTGTGGTTTGAGTGTTTGTGTGTCTAA T 1539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=3.595;DP=51;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=30.19;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,42:51:99:1577,0,3463 -chr1 22336892 . ACAGGTGAATGTGCCCTACGCTTGTGTTTACTGTCTTGCTTTTAAATGGATAATAAACTAATATTCAGCTTAACAAGAGCCTTTTTGTTT A 9571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=1.551;DP=221;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,194:201:99:9609,941,0 -chr1 22357617 . TA T 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-2.218;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:327,0,421 -chr1 22361765 . A T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.510;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:444,0,2447 -chr1 22558091 . T TA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.028;DP=27;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:238,0,364 -chr1 22720543 . C T 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=-0.800;DP=58;FS=5.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1161,0,859 -chr1 23267175 . C A 285.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:313,0,12 -chr1 23373924 . AT A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.551;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:98:241,0,98 -chr1 23726721 . CA C 1243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.373;DP=103;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,54:94:99:1357,0,575 -chr1 24073860 . GT G 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=-0.905;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:259,0,4052 -chr1 24173155 . G A 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=1.002;DP=66;FS=10.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,31:66:99:963,0,1089 -chr1 24256704 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.475;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,456 -chr1 24348802 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=-0.713;DP=107;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,24:107:99:390,0,4390 -chr1 24512030 . C A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.843;DP=209;FS=5.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,37:208:99:482,0,6404 -chr1 24518119 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.373;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,29:145:99:501,0,4364 -chr1 24536560 . GCTTAAAATAAATAAGGGAGAAAAGAAAATGAGTAAAAAAGACATTATAATGTTTTATAATAAAATATAATAACTGTCACTTAC G 22022.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.570;DP=519;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,494:495:99:22060,1633,0 -chr1 24536715 . G C 3263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3292,248,0 -chr1 24536716 . TG T 3228.29 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3265,245,0 -chr1 24775360 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.915;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:330,0,536 -chr1 25135186 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:298,0,192 -chr1 25269007 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.468;DP=54;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:251,0,826 -chr1 25321337 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-0.691;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:29:426,0,29 -chr1 25327633 . A C 1097.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.388;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=34.31;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:2:1124,2,0 -chr1 25327732 . T G 2440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=1.133;DP=65;FS=4.676;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.952;QD=30.27;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,61:65:99:2469,141,0 -chr1 25345851 . G A 1430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=1.051;DP=39;FS=2.981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:72:1459,72,0 -chr1 25346140 . A G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.024;DP=90;FS=13.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:435,0,2844 -chr1 25346638 . C A 2060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=-1.799;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=33.24;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:2089,0,944 -chr1 25346639 . T G 2060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-1.373;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=33.24;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,45:62:99:2089,0,927 -chr1 25346740 . GT G 1649.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.307;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=28.94;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:1687,0,201 -chr1 25347030 . A G 2656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-0.574;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=33.21;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,67:80:99:2685,0,147 -chr1 25347806 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=2.172;DP=99;FS=5.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:339,0,2774 -chr1 25350541 . A C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.749;DP=106;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,29:105:99:669,0,2875 -chr1 25356222 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.680;DP=119;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,21:119:99:337,0,3785 -chr1 25358893 . C T 1922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.605;DP=99;FS=5.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,57:99:99:1951,0,1512 -chr1 25359141 . T A 2987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.887;DP=117;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=25.54;ReadPosRankSum=-2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,80:113:99:3016,0,835 -chr1 25389936 . C G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.683;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1180,0,2189 -chr1 25389980 . T A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-0.036;DP=120;FS=8.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,31:120:99:735,0,3544 -chr1 25390075 . T C 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.527;DP=75;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:1221,0,1341 -chr1 25390283 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.82;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:385,0,246 -chr1 25626604 . GAA G 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=1.036;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.690;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:407,0,2348 -chr1 25665734 . TGTAAGTCTTATCTGTTTATTGTTCTTTATATTATTTTATTATTTTAGAGATTCATTGATATTCTATTGCATGTGGTGTAGCAGTACAGAATAGGTATGCATCGTCTTGGTAGTACTGGTCAAATAATTCAGAAAATGCTTTTTGTTTAAGTATGATCAGACAAAATTTCACATGTTCTTTAAGTACAATACTAAATGTGCATTTAATGTTAATATCTTTTTGATGTCATTTGGATTTTGGATTATTGTATTGTGATTCTGTAG T 6763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=3.712;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=33.99;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,178:199:99:7732,0,9700 -chr1 26262846 . A T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=1.890;DP=35;FS=11.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:407,0,846 -chr1 26262895 . T C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=2.033;DP=45;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=14.53;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:682,0,764 -chr1 26660026 . C A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr1 26692589 . G A 520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:549,39,0 -chr1 26692622 . C A 697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:726,51,0 -chr1 27450895 . G GT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.082;DP=70;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:265,0,1077 -chr1 27682127 . GCTTCAGAAAATTAAAACAAAACAAAAGTAGATTAAATAAATACAGAAACAATGTACATTAGATATATGCATGTTCAATAC G 2308.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=2.077;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,53:57:99:2346,204,0 -chr1 27810410 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:91:283,0,91 -chr1 27890450 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.981;DP=39;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:265,0,1030 -chr1 27891168 . T TA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=-0.395;DP=54;FS=11.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:250,0,496 -chr1 27891456 . TA T 956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=-0.945;DP=42;FS=1.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:37:994,0,37 -chr1 27917142 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=-0.225;DP=77;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:278,0,2418 -chr1 27989206 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.496;DP=97;FS=0.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:559,0,2990 -chr1 27991735 . ACTAGTAAAGGAAGAAAACAACACTGCGATGAAACATGTAAGTTCGACGAGTTTTTTCTTACAACAATACATTTAACAACCAAAATACAGCGATATATTTGACAACGAAAAACTTAATCCACTTCTCAC A 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.950;DP=102;FS=14.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:730,0,50821 -chr1 28105240 . T C 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:439,30,0 -chr1 28105251 . T C 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr1 28108866 . G A 3151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=5.453;DP=105;FS=14.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=30.02;ReadPosRankSum=-7.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,83:105:99:3180,0,450 -chr1 28109559 . A T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-2.871;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=13.73;ReadPosRankSum=-3.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:399,0,418 -chr1 28109664 . A G 6442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:6471,460,0 -chr1 28109700 . G A 12054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=195;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,186:186:99:12083,834,0 -chr1 28109750 . C T 4622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=-2.274;DP=114;FS=7.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=27.73;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,110:112:99:4651,325,0 -chr1 28109874 . A G 16509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=400;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,396:396:99:16538,1197,0 -chr1 28109904 . A G 15498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=374;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,368:368:99:15527,1107,0 -chr1 28110044 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.803;DP=20;FS=15.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=28.44;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:57:597,0,57 -chr1 28110135 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr1 28110446 . G T 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1306,102,0 -chr1 28110457 . C G 1177.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1206,90,0 -chr1 28110506 . C A 593.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=2.178;DP=26;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=22.84;ReadPosRankSum=1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:27:622,0,27 -chr1 28257387 . A G 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 -chr1 28257428 . G T 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr1 28257451 . T C 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr1 28438398 . G T 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:589,42,0 -chr1 28717715 . G GA 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.922;DP=108;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:303,0,1926 -chr1 28724867 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-0.628;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=2.96;ReadPosRankSum=2.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,32:168:99:526,0,5130 -chr1 28731463 . T C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-0.808;DP=108;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,23:107:99:443,0,3137 -chr1 28768844 . G A 3390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.614;DP=223;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=15.21;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,27:222:99:3419,0,6876 -chr1 29064095 . T G 1617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.592;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,40:44:41:1646,41,0 -chr1 29064125 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,504 -chr1 29064156 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=29.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:348,0,311 -chr1 29064162 . A C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:348,0,311 -chr1 29064192 . A C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=2.088;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,395 -chr1 29064444 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.524;DP=72;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:464,0,2804 -chr1 29064501 . A G 2442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.286;DP=64;FS=6.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2471,184,0 -chr1 29064517 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-0.786;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:449,0,1627 -chr1 29066272 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=-1.771;DP=74;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:747,0,1798 -chr1 29066296 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.150;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:269,0,1686 -chr1 29066324 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-2.652;DP=71;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:557,0,1952 -chr1 29066370 . A T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.065;DP=94;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:332,0,2924 -chr1 29066681 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=-0.582;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:695,0,5695 -chr1 29066683 . A C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.124;DP=102;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,28:102:99:695,0,5695 -chr1 29066791 . C T 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-2.255;DP=84;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=13.89;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:1195,0,1722 -chr1 29067442 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr1 29067756 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,141 -chr1 29071086 . G A 660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:689,48,0 -chr1 29076879 . C T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-0.792;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:1021,0,180 -chr1 29331533 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-1.150;DP=35;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:260,0,977 -chr1 29334209 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.337;DP=25;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:260,0,541 -chr1 29430073 . C G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.502;DP=60;FS=9.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:277,0,1941 -chr1 29430182 . A AT 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=1.002;DP=43;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:617,0,2022 -chr1 29662554 . CCCTGGTGGAAACAGGAAAACAGGATGAAAATTTAATTTATACACATTACAGAGTGAATCTTTCCTGAAATATTTTGATTTGCATTTCTGGA C 2023.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-0.712;DP=49;FS=3.104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2061,163,0 -chr1 29818275 . A C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.458;DP=88;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:398,0,2607 -chr1 29910263 . A G 1448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1477,102,0 -chr1 29910479 . T A 2867.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.891;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:2896,208,0 -chr1 29910835 . A C 2177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=-0.641;DP=69;FS=2.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=31.56;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,57:69:99:2206,0,169 -chr1 29911022 . T G 4307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.184;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,106:110:99:4336,322,0 -chr1 29911300 . T C 2038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.825;DP=51;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:2067,0,176 -chr1 29912589 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:231,0,65 -chr1 30109830 . C CA 777.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.204;ClippingRankSum=0.905;DP=81;FS=1.367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,66:75:90:815,90,0 -chr1 30476916 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:368,0,361 -chr1 30491460 . C T 333.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:362,30,0 -chr1 30491474 . T A 375.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:404,30,0 -chr1 30500970 . T C 467.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.510;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:12:495,12,0 -chr1 30746192 . GT G 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.765;DP=34;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:338,0,274 -chr1 30746550 . CT C 779.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.380;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:817,0,254 -chr1 30962889 . TA T 781.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-1.569;DP=84;FS=8.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=9.31;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:819,0,802 -chr1 30963129 . A C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.966;DP=161;FS=1.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,35:160:99:546,0,5917 -chr1 30963147 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.826;DP=161;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,29:159:99:323,0,6070 -chr1 30963404 . GCCTGAAAATCCAAATCCAATAGTCATATAAAGCAGAGAGTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATCCAATATTGTCTGACCTGATGGCACTTA G 3406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=1.718;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=21.84;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,127:141:99:3444,0,1451 -chr1 30963547 . G T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.736;DP=146;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,27:146:99:434,0,4620 -chr1 31114981 . TGTAAGAACTGGTTGGAAGGAAGGTAATTGTGTCCATCTGTAAAATCCACATCCACATTTAATATGATTCATTTCACAG T 1589.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=3.322;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,41:58:99:1681,0,6821 -chr1 31262684 . CT C 922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.266;DP=81;FS=15.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:960,0,866 -chr1 31263534 . A G 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.816;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,57:148:99:1965,0,3093 -chr1 31277488 . G A 1939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=-0.221;DP=143;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,57:143:99:1968,0,3020 -chr1 31318903 . G A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.093;DP=144;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,61:144:99:2068,0,2647 -chr1 31321241 . C T 2871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-0.280;DP=220;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,84:220:99:2900,0,4575 -chr1 31322320 . AT A 1085.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.473;DP=124;FS=6.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,51:111:99:1123,0,2071 -chr1 31323094 . G C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.411;DP=59;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:269,0,3162 -chr1 31323361 . TA T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.962;DP=58;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:241,0,1119 -chr1 31416275 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.940;DP=53;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:387,0,1362 -chr1 31425702 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-1.590;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:266,0,992 -chr1 31433706 . GA G 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-0.246;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.455;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:563,0,216 -chr1 31471585 . C T 1748.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:1777,129,0 -chr1 31471678 . G T 1742.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1771,126,0 -chr1 31471971 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=1.194;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:280,0,520 -chr1 31859200 . G A 614.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:643,45,0 -chr1 31926459 . C T 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr1 31926572 . G A 301.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:330,27,0 -chr1 32015181 . T A 942.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-1.445;DP=29;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=32.51;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:971,69,0 -chr1 32016448 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr1 32016908 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr1 32017004 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:64:309,0,64 -chr1 32881510 . T A 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -chr1 32939193 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.788;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:412,0,418 -chr1 32948720 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:247,18,0 -chr1 32992987 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.164;DP=35;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:419,0,850 -chr1 32997336 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.377;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:583,0,330 -chr1 33020913 . AT A 1157.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.698;DP=72;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,46:72:99:1195,0,936 -chr1 33021021 . A C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.496;DP=156;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,37:155:99:738,0,4821 -chr1 33021274 . T A 2501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.216;DP=165;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,70:165:99:2530,0,3173 -chr1 33021511 . A AT 830.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-2.000;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:868,0,2086 -chr1 33024841 . AT A 293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:331,33,0 -chr1 33024990 . G A 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.969;DP=27;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=12.62;ReadPosRankSum=-1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:378,0,115 -chr1 33027489 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:330,0,91 -chr1 33029043 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:336,0,552 -chr1 33029284 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=-2.628;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:258,0,566 -chr1 33029351 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.923;DP=38;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:481,0,816 -chr1 33030721 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=-0.818;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:366,0,2934 -chr1 33040946 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.177;DP=16;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:295,0,207 -chr1 33149986 . T A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=1.004;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:458,0,576 -chr1 33180477 . T A 2934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.779;DP=176;FS=2.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,83:176:99:2963,0,3004 -chr1 33180547 . C T 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.175;DP=190;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,50:190:99:1205,0,5482 -chr1 33180943 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=1.395;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:233,0,462 -chr1 33286248 . CAGGTAACTACATCCATTATTGTTACGGGGAAAAGGTAGAGGTCTGTTTACTGGACTGTCAGTGTTTAAGGTTTTCACTCTATGTACAGTACATGATTTAATTAAATAAAAAAATGCATAACATAAATGAAGACTATTTTCCTTCTCTTTTTTTTTTTATTT C 1945.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=2.106;DP=58;FS=1.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,53:58:99:1983,0,287 -chr1 33289452 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-0.483;DP=54;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:359,0,3308 -chr1 33289453 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-0.227;DP=53;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:359,0,3308 -chr1 33289581 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-1.620;DP=54;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:469,0,1446 -chr1 34044468 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:229,0,67 -chr1 34048649 . TG T 341.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:379,36,0 -chr1 34173395 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.382;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:295,0,954 -chr1 34229741 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:315,0,487 -chr1 34312141 . C T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.119;DP=52;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:877,0,972 -chr1 34317306 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.210;DP=50;FS=4.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:382,0,1455 -chr1 34321067 . A G 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=1.279;DP=100;FS=3.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:1346,0,2095 -chr1 34328189 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-1.003;DP=267;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,51:265:99:685,0,7741 -chr1 34332291 . T TC 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,222 -chr1 34335896 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.300;DP=206;FS=4.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,42:206:99:761,0,8583 -chr1 35189099 . G A 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=1.366;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=13.48;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:756,0,1161 -chr1 35193404 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.173;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:349,0,1240 -chr1 35270082 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.268;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:638,0,1231 -chr1 35316484 . A T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=2.176;DP=82;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:407,0,2603 -chr1 35317215 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-0.799;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:590,0,1260 -chr1 35321582 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.955;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,1100 -chr1 35322191 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.259;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:396,0,893 -chr1 35322655 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.417;DP=68;FS=2.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:273,0,2081 -chr1 35331429 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=-0.110;DP=87;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:308,0,2657 -chr1 35340749 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-0.601;DP=76;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=7.42;ReadPosRankSum=2.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:592,0,2000 -chr1 35498390 . GT G 348.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.556;DP=16;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:13:386,0,13 -chr1 35519894 . C A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=-0.638;DP=95;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:557,0,2526 -chr1 35520030 . T TG 3255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3293,235,0 -chr1 35542827 . A C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.156;DP=77;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:440,0,3408 -chr1 35667555 . C G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-1.222;DP=62;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:478,0,1636 -chr1 35726981 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-0.011;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:589,0,1064 -chr1 35727043 . C CT 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.445;DP=53;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:543,0,662 -chr1 35727210 . C CA 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=2.612;DP=51;FS=4.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:536,0,724 -chr1 35734858 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,186 -chr1 35740437 . T C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=-1.219;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:411,0,799 -chr1 35786622 . C T 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-1.293;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,37:52:99:1324,0,391 -chr1 36056873 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:267,0,271 -chr1 36373866 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-0.436;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:264,0,1266 -chr1 36409508 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.684;DP=64;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:273,0,1948 -chr1 36410204 . T A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.352;DP=36;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:411,0,815 -chr1 36445749 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.729;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:736,0,1237 -chr1 36448700 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.215;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:233,0,265 -chr1 36454554 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.489;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:270,0,641 -chr1 36480406 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-1.796;DP=31;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:278,0,738 -chr1 37046011 . T A 232.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:261,0,22 -chr1 37046094 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.169;DP=25;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:408,0,385 -chr1 37046132 . G A 726.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-1.428;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=33.04;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:26:755,26,0 -chr1 37062235 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.096;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,251 -chr1 37155459 . A G 251.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:280,0,18 -chr1 37156307 . TA T 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:303,0,231 -chr1 37186109 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.344;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:239,0,970 -chr1 37189912 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-1.727;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:353,0,464 -chr1 37209120 . A G 2314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.257;DP=74;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=31.28;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,62:74:99:2343,0,159 -chr1 37268027 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.034;DP=74;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:927,0,1601 -chr1 37422443 . C T 2787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-1.590;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=30.30;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,70:84:99:2816,0,199 -chr1 37422501 . C T 1760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=1.129;DP=56;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=31.44;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,44:52:99:1789,0,271 -chr1 37429154 . G A 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:904,63,0 -chr1 37429163 . G A 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:63:904,63,0 -chr1 37442549 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=2.039;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:617,0,1024 -chr1 37442550 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=1.850;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:617,0,1024 -chr1 37456960 . G T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr1 37484762 . G A 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:36:508,36,0 -chr1 37484816 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:234,0,97 -chr1 37484906 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-3.338;DP=20;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:450,0,432 -chr1 37485041 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.870;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:319,0,576 -chr1 37485092 . T A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.409;DP=36;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:920,0,1315 -chr1 37485093 . T G 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.409;DP=36;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:920,0,1315 -chr1 37485111 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.357;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:312,0,2725 -chr1 37485251 . C G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.208;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:498,0,537 -chr1 37485364 . G T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.029;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:738,0,537 -chr1 37485410 . A G 2119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.922;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=33.14;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,16:22:66:2148,66,0 -chr1 37485583 . C T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr1 37586147 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.099;DP=17;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:80:589,0,80 -chr1 37586251 . T G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.085;DP=44;FS=25.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:263,0,817 -chr1 37586480 . C A 442.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=34.06;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:470,0,6 -chr1 37586545 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.841;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:55:853,0,55 -chr1 37586600 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-2.276;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:240,0,545 -chr1 37586734 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:236,0,56 -chr1 37586860 . C A 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:40:508,40,0 -chr1 37586967 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,99 -chr1 37601586 . T A 225.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.58;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:254,0,18 -chr1 37677771 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.326;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:292,0,656 -chr1 37729536 . T C 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr1 37903894 . G A 442.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.668;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=31.64;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:470,0,5 -chr1 38106734 . C G 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.147;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=26.88;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:942,0,159 -chr1 38552364 . G T 2369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.513;DP=149;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:2398,0,2706 -chr1 38552414 . TC T 1762.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=-2.966;DP=177;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,72:161:99:1800,0,2089 -chr1 38565426 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.458;DP=57;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=18.22;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,32:57:99:1067,0,892 -chr1 38575968 . CA C 1074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-1.668;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1112,0,1450 -chr1 38578966 . GA G 3156.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-1.351;DP=278;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=11.36;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,152:276:99:3194,0,2709 -chr1 38781475 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=2.523;DP=40;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:297,0,1302 -chr1 38826736 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:269,0,62 -chr1 38827660 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,161 -chr1 39003945 . GA G 2898.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.537;DP=159;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,104:149:99:2936,0,592 -chr1 39005174 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=-1.357;DP=165;FS=7.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,37:164:99:465,0,6922 -chr1 39020253 . G A 4874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.589;DP=365;FS=4.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.36;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,145:365:99:4903,0,7533 -chr1 39063530 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=-0.014;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,41:180:99:861,0,5324 -chr1 39159748 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.417;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=26.51;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:532,0,157 -chr1 39159940 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.321;DP=49;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:359,0,1331 -chr1 39160022 . C T 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.108;DP=36;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:67:1139,0,67 -chr1 39163157 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-0.545;DP=64;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:432,0,1734 -chr1 39172803 . AT A 1891.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=1.337;DP=261;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.623;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,87:257:99:1929,0,4110 -chr1 40132322 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr1 40139745 . G GA 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.512;DP=115;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:291,0,1937 -chr1 40141753 . G C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-2.291;DP=67;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:573,0,1813 -chr1 40176407 . C CA 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.774;DP=76;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:295,0,1509 -chr1 40244399 . G T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:87:865,0,87 -chr1 40244683 . A G 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.486;DP=28;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=28.13;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:816,0,190 -chr1 40251424 . CACCTGAGAACAATCCACACGCAATAAATAATGAGAAATGGAACAAATATCACATGATTTAAATGAAGGCGACCTGAGAGATTTAATTAACTTCAGCTTAAAAATCTCATGCTGAAGTTTATGAATAGAGTTTGTT C 5172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=4.592;DP=170;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=30.43;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,131:169:99:5210,0,11057 -chr1 40254490 . TCTGTGGGTGAAAGCAAAATAATACATCACACATTTTCCCATAAAAGATTCTAAAAGATAAATTGACATAAGTGAAAACACCAAC T 7002.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=1.593;DP=176;FS=6.252;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:7040,505,0 -chr1 40338862 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-1.990;DP=24;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:599,0,217 -chr1 40339454 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-2.342;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:443,0,536 -chr1 40339614 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=9.85;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,420 -chr1 40339626 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.021;DP=32;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:243,0,716 -chr1 40339646 . G C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-1.053;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=25.34;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:70:687,0,70 -chr1 40372054 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,176 -chr1 40395083 . T A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.114;DP=320;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,66:320:99:1097,0,9763 -chr1 40395103 . A C 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.982;DP=324;FS=3.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,73:324:99:1389,0,9689 -chr1 40401076 . C T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.703;DP=306;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,55:306:99:887,0,20403 -chr1 40401077 . A G 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=1.445;DP=300;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,53:300:99:887,0,20403 -chr1 40401429 . C T 3080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-1.634;DP=230;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=13.39;ReadPosRankSum=2.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,88:230:99:3109,0,4844 -chr1 40401462 . A G 2832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-2.961;DP=208;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,80:208:99:2861,0,4528 -chr1 40401553 . A G 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.637;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,40:205:99:713,0,6690 -chr1 40401681 . C CTA 2713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.147;DP=157;FS=4.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,78:151:99:2751,0,3037 -chr1 40453486 . A C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.629;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:560,0,748 -chr1 40453510 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-0.602;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:651,0,875 -chr1 40453579 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.520;DP=42;FS=4.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:485,0,665 -chr1 40509407 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-1.350;DP=42;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:289,0,1061 -chr1 40524868 . A G 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.654;DP=70;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:1074,0,1155 -chr1 40525210 . G C 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.450;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:757,0,1039 -chr1 40526509 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr1 40633950 . G T 1555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1584,111,0 -chr1 40803426 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.014;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:518,0,867 -chr1 40960281 . C T 1859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.322;DP=113;FS=5.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1888,0,2082 -chr1 40986778 . GCTGAGACAGAAATAGACAGTCTGAGTACAACAACCAAGTTAAAGCCTGATGAGCAACAATGCCCAGAGGCAGACATGGGTGAGAGTCAGGGGCGTAC G 908.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=2.407;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,112:114:99:946,315,0 -chr1 41068817 . ACACCTATGGAAGAAAAAAAAAAGATGAGTAAAATGTTGTGATTGATGGGCATGAAATAACGCAATTTCTCTCACAACT A 1537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.287;DP=42;FS=7.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=29.48;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,37:39:32:1575,0,32 -chr1 41070634 . CCCTTAAAACACAATAAAATCATTAGTTGTGTAGTAACATACTGTATTTTCTTCTGCACTATTTCCATTAATAAAAAATAGCTGAAATAGAAAGGAAAAACTCA C 1047.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=1.297;DP=29;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=28.40;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1085,0,818 -chr1 41077996 . A G 4808.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=1.578;DP=139;FS=5.593;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=34.60;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,124:139:24:4837,24,0 -chr1 41078149 . T G 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-2.528;DP=104;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1409,0,2850 -chr1 41078153 . A G 3716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.044;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=34.41;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,93:108:85:3745,0,85 -chr1 41078171 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=-2.013;DP=118;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,18:117:99:233,0,3922 -chr1 41078369 . C G 2618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=2.164;DP=100;FS=6.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,70:99:99:2647,0,758 -chr1 41078381 . T C 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=2.133;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=22.50;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,48:73:99:1671,0,845 -chr1 41199638 . TA T 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.372;DP=40;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:299,0,756 -chr1 41521646 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.255;DP=115;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,38:114:99:843,0,3904 -chr1 41597030 . C T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.591;DP=72;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:802,0,1560 -chr1 41597210 . T C 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.353;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:877,0,1428 -chr1 41678467 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-1.596;DP=39;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:475,0,869 -chr1 41711566 . G C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-0.099;DP=40;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:477,0,842 -chr1 41912179 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=-1.508;DP=33;FS=5.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:298,0,833 -chr1 41915848 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=-0.125;DP=51;FS=4.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:279,0,1480 -chr1 41982868 . GAGGTAGAAATCTGCTTTCCTCAATCTCTGAGCTCATTCTAAAACTAATAATGTATCCAGAATCCTGACTGTGTTTTGCTTTGAATC G 1183.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.776;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:99:1221,0,176 -chr1 41994722 . T C 1798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.360;DP=113;FS=4.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,52:113:99:1827,0,2101 -chr1 41994743 . G C 2108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=2.651;DP=116;FS=7.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.395;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:2137,0,1864 -chr1 42153957 . G GA 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.698;DP=52;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:540,0,604 -chr1 43159636 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:347,0,146 -chr1 43159666 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:234,0,240 -chr1 43364646 . T C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.994;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:710,0,837 -chr1 43418003 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.468;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:291,0,846 -chr1 43595129 . C CTT 212.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr1 44077097 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:355,0,53 -chr1 44371510 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.713;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:245,0,460 -chr1 44380783 . C T 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=1.589;DP=66;FS=3.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:882,0,1248 -chr1 44403802 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.599;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=10.85;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:256,0,398 -chr1 44404311 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.509;DP=29;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:401,0,625 -chr1 44404567 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.206;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:421,0,758 -chr1 44404579 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.448;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:423,0,713 -chr1 44411758 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:234,0,293 -chr1 44424166 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-1.256;DP=44;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:411,0,2155 -chr1 44424169 . T A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-1.534;DP=42;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:411,0,2155 -chr1 44428730 . G A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.838;DP=65;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1014,0,1172 -chr1 44445336 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.027;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.406;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,260 -chr1 44621859 . G T 1325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.837;DP=67;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=19.79;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,39:65:99:1358,0,927 -chr1 44622082 . C T 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=1.080;DP=86;FS=21.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,46:85:99:1476,0,1416 -chr1 44622356 . CT C 2298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.003;DP=168;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,75:166:99:2336,0,2627 -chr1 44622523 . A G 2349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-1.695;DP=151;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,67:151:99:2378,0,2918 -chr1 44622557 . G A 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=-1.992;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:1182,0,3191 -chr1 44622575 . A G 2059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-0.268;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=16.22;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:2088,0,2227 -chr1 44622880 . C CTT 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.632;DP=139;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,31:108:99:621,0,5297 -chr1 44622888 . T A 1480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-1.105;DP=129;FS=7.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,64:128:99:2123,0,3267 -chr1 44623000 . A G 3166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=0.899;DP=115;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:3195,0,1497 -chr1 44623049 . A AT 1774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.867;DP=68;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1840,0,321 -chr1 44623103 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=4.183;DP=87;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:305,0,6425 -chr1 44623263 . T C 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=2.136;DP=58;FS=7.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=17.63;ReadPosRankSum=-2.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1051,0,1006 -chr1 44623392 . T A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.216;DP=161;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,43:160:99:1018,0,8280 -chr1 44623514 . A C 5395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-1.749;DP=186;FS=9.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=29.01;ReadPosRankSum=2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,141:186:99:5424,0,950 -chr1 44645190 . C G 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.021;DP=143;FS=3.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,37:143:99:835,0,3832 -chr1 44645259 . C T 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.097;DP=118;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,56:118:99:1928,0,1996 -chr1 44769284 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-2.358;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=22.91;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:578,0,271 -chr1 44787597 . G A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr1 44846052 . G A 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.502;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,43:136:99:1134,0,3488 -chr1 44878145 . G A 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.528;DP=68;FS=1.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=16.83;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1173,0,1252 -chr1 44897989 . CGTGAGTATTCAGATCGTACTTACCAATGAGCGATGTACCAATTGTTCTGCGTTTCAACACATTCTTCATTTATTTAG C 16120.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-1.639;DP=374;FS=3.226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=30.09;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,373:374:99:17180,1390,0 -chr1 44996202 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=-1.479;DP=38;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:319,0,1256 -chr1 45000167 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=2.060;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:646,0,614 -chr1 45002644 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.406;DP=56;FS=10.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:717,0,1228 -chr1 45014456 . G A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:436,0,409 -chr1 45015187 . C T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.479;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:538,0,569 -chr1 45020766 . A T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.281;DP=29;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:363,0,757 -chr1 45021299 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.496;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:510,0,592 -chr1 45021671 . G T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.081;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:396,0,1230 -chr1 45025385 . A C 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.353;DP=117;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=11.00;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,40:117:99:1315,0,3585 -chr1 45026053 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;ClippingRankSum=-2.604;DP=30;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=14.13;ReadPosRankSum=2.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:452,0,626 -chr1 45026248 . T C 1781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.378;DP=101;FS=6.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,55:101:99:1810,0,1728 -chr1 45027162 . G A 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=2.689;DP=106;FS=5.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,37:104:99:1243,0,2376 -chr1 45027217 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.033;DP=136;FS=17.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,34:136:99:808,0,3840 -chr1 45030971 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=5.134;DP=121;FS=21.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,21:119:99:245,0,4078 -chr1 45037341 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-1.830;DP=189;FS=4.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,34:189:99:497,0,5909 -chr1 45040175 . G A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.248;DP=68;FS=2.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:992,0,1283 -chr1 45040416 . G A 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.287;DP=45;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=18.57;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:864,0,688 -chr1 45047767 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=1.701;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:369,0,381 -chr1 45107817 . C A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.037;DP=66;FS=3.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:400,0,1742 -chr1 45108507 . C A 663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-0.871;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=14.12;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:692,0,1306 -chr1 45108720 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.554;DP=56;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:557,0,1559 -chr1 45109191 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.451;DP=76;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:879,0,1780 -chr1 45125502 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.673;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:257,0,1667 -chr1 45133763 . G C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.660;DP=72;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:441,0,1954 -chr1 45159189 . C G 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.074;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:431,0,2304 -chr1 45165242 . C G 2479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.130;DP=200;FS=8.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,73:186:99:2508,0,3911 -chr1 45165264 . G T 2644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.272;DP=186;FS=6.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,78:183:99:2673,0,3468 -chr1 45173749 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=-0.210;DP=32;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:232,0,845 -chr1 45201784 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,99 -chr1 45257811 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,440 -chr1 45270380 . G T 225.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:254,0,15 -chr1 45278144 . G T 1864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.589;DP=157;FS=8.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,55:155:99:1893,0,3536 -chr1 45278390 . G T 4646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=1.557;DP=378;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,135:378:99:4675,0,8709 -chr1 45308313 . C T 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-2.811;DP=61;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1017,0,1786 -chr1 45317246 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=1.763;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:243,0,1225 -chr1 45321657 . T A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.397;DP=70;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:797,0,1746 -chr1 45321672 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-2.387;DP=77;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:482,0,3039 -chr1 45324884 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.199;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:487,0,3268 -chr1 45325075 . CTT C 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-3.604;DP=79;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:546,0,2781 -chr1 45416353 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.055;DP=49;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:360,0,1364 -chr1 45458553 . G T 2082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=1.326;DP=78;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,54:78:99:2111,0,1253 -chr1 45462902 . C T 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.180;DP=127;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,39:127:99:1046,0,3429 -chr1 45469203 . T TA 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-1.911;DP=78;FS=5.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:980,0,764 -chr1 45470226 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.489;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=14.15;ReadPosRankSum=-2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:283,0,803 -chr1 45502530 . G A 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.853;DP=374;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,71:373:99:1051,0,13908 -chr1 45504426 . G A 1790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=1.726;DP=592;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=3.02;ReadPosRankSum=2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:471,118:589:99:1819,0,17813 -chr1 45519529 . C T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.976;DP=26;FS=8.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:98:828,0,98 -chr1 45543288 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=29.60;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40:413,0,40 -chr1 45582618 . C T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-2.429;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:638,0,112 -chr1 45584529 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=1.632;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=31.92;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:507,0,100 -chr1 45587045 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.114;DP=54;FS=6.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:263,0,1583 -chr1 45591440 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.969;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:285,0,550 -chr1 45605706 . C A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=-3.342;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=19.14;ReadPosRankSum=4.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:545,0,421 -chr1 45605766 . C T 466.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=36.10;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:494,0,7 -chr1 45625730 . G C 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr1 45625759 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.274;DP=20;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=23.39;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:41:496,0,41 -chr1 45663646 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-2.406;DP=366;FS=13.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,69:366:99:1039,0,11033 -chr1 46040937 . T TA 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=2.768;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=6.16;ReadPosRankSum=-3.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,61:123:99:1212,0,1160 -chr1 46085452 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr1 46085854 . T C 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr1 46121436 . A ATG 1417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=-1.710;DP=77;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,46:67:99:1455,0,1484 -chr1 46134953 . G A 5625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.595;DP=224;FS=4.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,152:221:99:5654,0,1808 -chr1 46169412 . G T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.171;DP=27;FS=10.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:457,0,541 -chr1 46169475 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.015;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:723,0,1192 -chr1 46214904 . TA T 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.237;DP=28;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:378,0,239 -chr1 46215051 . CT C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.266;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:297,0,263 -chr1 46305238 . C G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=3.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=17.45;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:482,0,634 -chr1 46306148 . A T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-1.282;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=18.69;ReadPosRankSum=2.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:757,0,630 -chr1 46319477 . AGTACGACACGCACAACATGTTACATTAATTGTGTAGGTATTTGTATATTAATGCATTTGTGTTTTATCTTCAG A 1210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=1.568;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=28.91;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1248,0,441 -chr1 46339021 . A C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=1.206;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:546,0,477 -chr1 46339228 . T C 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=2.231;DP=40;FS=8.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1056,0,308 -chr1 46339590 . TATTA T 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-1.195;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:309,0,8619 -chr1 46339595 . CTTCCTGGCTTACTAACACACTCATTTACTAACTCACTACCGTTCTCACTTTCTAGCTCACTTCCGCTT C 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-0.045;DP=53;FS=4.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:317,0,8619 -chr1 46346276 . AAC A 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.616;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:271,0,430 -chr1 46363162 . C G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.376;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=15.67;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:514,0,502 -chr1 46423860 . G A 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-5.099;DP=107;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=6.63;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:738,0,2996 -chr1 46763756 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.425;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:299,0,825 -chr1 46768721 . C CT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=1.122;DP=21;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:256,0,147 -chr1 46920483 . T A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.567;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1150,0,605 -chr1 46999064 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:296,0,336 -chr1 47000283 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=-0.465;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,464 -chr1 47091094 . T G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.635;DP=49;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:681,0,863 -chr1 47110596 . C T 2360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-3.388;DP=279;FS=3.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,88:279:99:2389,0,7230 -chr1 47113791 . T C 1848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.853;DP=102;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=18.12;ReadPosRankSum=2.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:98:99:1886,0,1717 -chr1 47113970 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=1.004;DP=107;FS=3.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:818,0,4380 -chr1 47151192 . T G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.184;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:74:955,0,74 -chr1 47151210 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-1.643;DP=26;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=22.03;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:601,0,647 -chr1 47151508 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.412;DP=19;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=16.57;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:343,0,207 -chr1 47335539 . A C 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.908;DP=104;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,33:104:99:847,0,2439 -chr1 47335701 . A AT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-0.852;DP=116;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,25:98:99:332,0,1968 -chr1 47354362 . A ACG 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.602;DP=128;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.437;QD=4.69;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:638,0,3799 -chr1 47457665 . CA C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.657;DP=36;FS=10.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:525,0,1634 -chr1 47457670 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.146;DP=36;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:525,0,1580 -chr1 47458640 . T G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,456 -chr1 47470977 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=1.393;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:285,0,2311 -chr1 47494340 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.899;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:288,0,600 -chr1 47496945 . C G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.377;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:387,0,1159 -chr1 47502296 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.631;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:241,0,835 -chr1 47504228 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.030;DP=38;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.39;ReadPosRankSum=-1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:309,0,976 -chr1 47514624 . T C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.706;DP=36;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.503;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:541,0,731 -chr1 47524311 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.010;DP=51;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:709,0,982 -chr1 47590840 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-1.210;DP=52;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:244,0,1531 -chr1 47617814 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.256;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:339,0,1154 -chr1 47631743 . A C 717.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-0.419;DP=21;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:20:746,0,20 -chr1 47638792 . C CT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:280,0,304 -chr1 47640008 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:399,0,492 -chr1 47653331 . A G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=2.774;DP=59;FS=5.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:526,0,1576 -chr1 47657796 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-0.004;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:742,0,2943 -chr1 47658965 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=4.087;DP=69;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=5.08;ReadPosRankSum=-2.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:379,0,1902 -chr1 47663363 . G A 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=1.692;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=30.35;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:69:969,0,69 -chr1 47668525 . A AT 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.667;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:83:343,0,83 -chr1 47972041 . CCAGGTTTCAGATTTATTTATTTTTTTGTCTCAACATATTAATCCTCTGAACACAACGCATGTTTGTTTATCACTATTCGGTATTCTGTTAATTCTTTCAA C 5176.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-1.372;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,113:117:99:5214,360,0 -chr1 47972246 . C T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-0.164;DP=165;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,41:165:99:920,0,4767 -chr1 49874368 . AT A 244.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.869;DP=15;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=16.28;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:0:277,0,0 -chr1 50087829 . C CA 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.170;DP=325;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,61:297:99:583,0,6536 -chr1 50105966 . TGGTTTGTGATTGACATTTGCATACTGCATGTTTCTTCATTATTCAGTAGCTGATGTGAAAGTACACATTTCACTTCTGAATTCA T 880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=1.094;DP=276;FS=1.853;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=3.19;ReadPosRankSum=-2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,259:264:99:918,363,0 -chr1 50111007 . AGTAAGAAGGCAGTTTTGTTAGCTTTAAGTCTCTTTTGGGCATTATAACTAAAGTTTGTTTAATTTTGCAG A 11903.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.210;DP=274;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=32.70;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,257:261:99:11941,960,0 -chr1 50111353 . AGGCTGGACCACCAGGACT A 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=4.991;DP=253;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=1.04;ReadPosRankSum=-5.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,35:251:99:300,0,28040 -chr1 50111440 . AAGGCAAGAAGGAACTTGTTCAACCAAAAACACACACATTTAAGTTGCATTAGTTTATTTACAAAGTAGTGTTTCTAC A 9221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=2.213;DP=248;FS=1.651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=30.58;ReadPosRankSum=-2.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,225:231:99:9259,668,0 -chr1 50114962 . GT G 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=-1.096;DP=19;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,502 -chr1 50114967 . T G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.197;DP=20;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:248,0,537 -chr1 50419748 . C T 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.412;DP=487;FS=4.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,85:486:99:1112,0,15393 -chr1 50422314 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=1.077;DP=364;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,62:364:99:762,0,11494 -chr1 50422681 . C T 1952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.030;DP=381;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,93:380:99:1981,0,10984 -chr1 50558897 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,133 -chr1 50695062 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.559;DP=40;FS=4.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=12.47;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:527,0,898 -chr1 50695445 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.856;DP=36;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:624,0,624 -chr1 50696553 . C A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.451;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:834,0,927 -chr1 50696675 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.350;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=15.72;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:610,0,755 -chr1 50696919 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.667;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:617,0,2199 -chr1 50696925 . T C 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=1.164;DP=48;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:617,0,2224 -chr1 50697622 . T C 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.330;DP=51;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:869,0,894 -chr1 50800959 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.048;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:271,0,1065 -chr1 50811072 . G A 2239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.317;DP=394;FS=6.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,101:394:99:2268,0,12037 -chr1 51009935 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.780;DP=125;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.222;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,34:125:99:806,0,3478 -chr1 51046101 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,195 -chr1 51053187 . AAGGTGAGCTTTCGGATCAACGTCTAACATGTAAACATTTTTTTGTTGTCTTTTCGTCAGCCATTTTGCTTCTCCCAC A 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.151;DP=23;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.563;QD=32.34;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:781,0,460 -chr1 51064595 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=1.046;DP=31;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:464,0,631 -chr1 51067431 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:80:475,0,80 -chr1 51101730 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=2.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:337,0,354 -chr1 51102691 . G C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=-0.791;DP=75;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:303,0,2581 -chr1 51109489 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=12.70;ReadPosRankSum=2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:295,0,415 -chr1 51154005 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.636;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=24.55;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:372,0,129 -chr1 51207367 . ATC A 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.420;DP=116;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:493,0,6799 -chr1 51207368 . TCTAGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTAC T 3079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.746;ClippingRankSum=-0.423;DP=125;FS=6.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.949;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,84:123:99:3117,0,2652 -chr1 51207371 . AGAAAGAATGGCAGAAATACCTCAGCCTGTGTAGTTAATCATTTCTAGGCCTCCATGAAGTGAATTTACTTATTTGCATACTTACG A 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.357;DP=125;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,27:125:99:502,0,6799 -chr1 51438354 . C A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-2.060;DP=51;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:412,0,1266 -chr1 51486411 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.562;ClippingRankSum=-1.680;DP=257;FS=8.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=0.96;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,40:255:99:274,0,7847 -chr1 51500144 . T A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.521;DP=234;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,60:234:99:1339,0,13209 -chr1 51516970 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.403;DP=117;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,26:117:99:566,0,3629 -chr1 51517015 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.400;DP=87;FS=9.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:232,0,2683 -chr1 51522451 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.192;DP=108;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:597,0,3066 -chr1 51524596 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-0.324;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,30:122:99:642,0,4426 -chr1 51525062 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=1.333;DP=28;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:468,0,440 -chr1 51530510 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,267 -chr1 51530513 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,267 -chr1 51530983 . TA T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.843;DP=57;FS=6.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:319,0,1046 -chr1 51533359 . G T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.385;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:511,0,2179 -chr1 51533364 . GCCTTAAACAAATAAATAAATAAAACACACACAATCACATGTAAAAGCCCAGTGAATACACACACTGGACACAGCAGAATGGGTTTTA G 2294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.849;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2332,206,0 -chr1 51549636 . C T 3298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.615;DP=314;FS=5.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.326;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,106:312:99:3327,0,6892 -chr1 51549663 . TGTAAGTATCATTAGTTGAAGATCATTTAAAGTAAGATAGTTTGCGTTTATCCTTTTGTTTTTCTGTTTATTTCAG T 22134.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=2.986;DP=505;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=32.50;ReadPosRankSum=-2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,500:503:99:22172,1556,0 -chr1 51553823 . G C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.155;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:366,0,439 -chr1 51554862 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.598;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:336,0,907 -chr1 51554870 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:336,0,942 -chr1 51556878 . A C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.713;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:233,0,436 -chr1 51565413 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.558;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:423,0,1580 -chr1 51565440 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=1.590;DP=63;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:299,0,1794 -chr1 51567468 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-2.201;DP=74;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:242,0,2227 -chr1 51631189 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=21.62;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:612,0,353 -chr1 51713620 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.278;DP=84;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:356,0,2525 -chr1 51717002 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=1.180;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:283,0,1139 -chr1 51720266 . T C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.204;DP=63;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:728,0,1452 -chr1 51720756 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.809;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:274,0,1156 -chr1 51721020 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.609;DP=56;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:249,0,1645 -chr1 51725009 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.010;DP=69;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:383,0,1963 -chr1 51737856 . G A 1160.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.738;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=16.12;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1198,0,1135 -chr1 51739079 . G C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.687;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:524,0,825 -chr1 51739746 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.398;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:379,0,599 -chr1 51740354 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.156;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:362,0,571 -chr1 51743519 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.108;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:232,0,778 -chr1 51752641 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.888;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:392,0,313 -chr1 51766492 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:318,0,248 -chr1 51774915 . G T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.086;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=22.33;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:698,0,356 -chr1 51911928 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-1.130;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,529 -chr1 51916414 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.127;DP=154;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,31:154:99:263,0,3390 -chr1 51922155 . T C 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=1.919;DP=214;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,59:213:99:1381,0,5982 -chr1 51935102 . CT C 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.367;DP=48;FS=8.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:689,0,1316 -chr1 51935361 . G T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=1.273;DP=39;FS=15.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:377,0,827 -chr1 51935695 . T TA 802.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-3.531;DP=70;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:840,0,1232 -chr1 51936492 . GT G 2148.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=1.166;DP=175;FS=4.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,99:167:99:2186,0,1452 -chr1 51957089 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.689;DP=36;FS=3.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:274,0,785 -chr1 51958403 . A C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-0.672;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=15.53;ReadPosRankSum=-1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:727,0,662 -chr1 51958479 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.089;DP=55;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:329,0,1803 -chr1 51958627 . G A 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.968;DP=48;FS=2.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:804,0,777 -chr1 51968133 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=-1.023;DP=66;FS=5.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:338,0,1806 -chr1 51991561 . C CT 1049.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-2.242;DP=137;FS=2.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1087,0,2184 -chr1 52033365 . CT C 2515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=-0.867;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=29.38;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,3:32:99:2553,0,410 -chr1 52033433 . C A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-3.380;DP=169;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,56:168:99:1251,0,5457 -chr1 52033490 . A G 1657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.676;DP=186;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,66:186:99:1686,0,5379 -chr1 52033529 . C T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-2.776;DP=171;FS=9.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,44:171:99:780,0,6313 -chr1 52033648 . T A 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.194;DP=207;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,65:207:99:1724,0,5425 -chr1 52046113 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=-0.569;DP=34;FS=3.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:551,0,637 -chr1 52046289 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.310;DP=38;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:546,0,998 -chr1 52052606 . T A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.586;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.894;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:605,0,596 -chr1 52067455 . G T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=-2.214;DP=153;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,41:153:99:976,0,5680 -chr1 52067514 . G GA 886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.087;DP=161;FS=3.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,47:132:99:924,0,1999 -chr1 52068655 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-1.893;DP=197;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,31:195:99:354,0,6226 -chr1 52115344 . C G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.521;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:433,0,390 -chr1 52601553 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.180;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:257,0,796 -chr1 52601976 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:244,0,339 -chr1 52606420 . C T 1403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.524;DP=173;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,55:171:99:1432,0,4232 -chr1 52611941 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.804;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,40:93:99:239,0,3630 -chr1 52636564 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:48:378,0,48 -chr1 52636572 . T A 419.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:5:447,0,5 -chr1 52644518 . C A 1137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-2.066;DP=151;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,33:137:99:1166,0,3272 -chr1 52645118 . C G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=1.248;DP=129;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,25:129:99:316,0,7728 -chr1 52645167 . A C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-1.797;DP=164;FS=1.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,29:164:99:416,0,6179 -chr1 52646202 . A G 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.677;DP=33;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1039,0,869 -chr1 52646911 . A G 2720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-1.528;DP=46;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=27.45;ReadPosRankSum=2.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:2749,0,491 -chr1 52646972 . A G 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.976;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:794,0,2332 -chr1 52647332 . A C 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.814;DP=63;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:809,0,2407 -chr1 52858102 . C A 652.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:681,14,0 -chr1 52858160 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:267,0,231 -chr1 52858315 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.776;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:99:834,0,99 -chr1 52858317 . C T 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.776;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=31.91;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:92:834,0,92 -chr1 52858912 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-1.006;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:724,0,107 -chr1 52858929 . C A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=2.119;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=16.10;ReadPosRankSum=-2.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:318,0,507 -chr1 52859163 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,103 -chr1 52946885 . GAC G 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.561;DP=145;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,29:145:99:524,0,5444 -chr1 52950665 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.243;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,27:163:99:355,0,5345 -chr1 52955719 . C G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.309;DP=109;FS=2.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,30:109:99:685,0,2826 -chr1 52982194 . A G 201.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:230,0,25 -chr1 52987111 . CCCTGAAAGCCAAATTAAATACATTTGCTAACACAATATCACTGCTAAAAAAACACCACATTTTTAGATCCTCCAGTA C 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=1.853;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=4.02;ReadPosRankSum=-2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,98:102:99:499,192,0 -chr1 53055275 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.945;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,670 -chr1 53086636 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=2.103;DP=29;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=10.10;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:321,0,999 -chr1 53113024 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-0.368;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:591,0,3411 -chr1 53113034 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.393;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:591,0,3411 -chr1 53116540 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.350;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.428;QD=6.10;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:364,0,1448 -chr1 53132453 . A G 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=2.059;DP=62;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.987;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:811,0,1319 -chr1 53134470 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.383;DP=68;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:437,0,1878 -chr1 53143882 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.846;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:727,0,1282 -chr1 53146940 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=1.185;DP=64;FS=1.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:239,0,5299 -chr1 53146941 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=1.068;DP=64;FS=1.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:239,0,5299 -chr1 53147117 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-2.195;DP=40;FS=3.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:591,0,1103 -chr1 53147123 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.826;DP=39;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:279,0,2403 -chr1 53147435 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=1.534;DP=39;FS=7.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:393,0,1014 -chr1 53148453 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,291 -chr1 53153978 . ACTGCAAAAAAGAAAAGACGTTGTATTTCTAAAATAAAGAGGCCGTTTTTTTATTTGCTTTTTATATGCAAAAATAC A 2580.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=2.137;DP=67;FS=2.413;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=26.70;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,57:60:99:2618,202,0 -chr1 53195999 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.359;DP=35;FS=6.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:243,0,1246 -chr1 53196896 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.913;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:289,0,1494 -chr1 53249291 . A C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.826;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:619,0,195 -chr1 53254340 . T G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-0.510;DP=39;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:471,0,435 -chr1 53254395 . T C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.516;DP=21;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:532,0,117 -chr1 53255308 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.974;DP=40;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:610,0,612 -chr1 53255473 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.466;DP=24;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.24;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:274,0,357 -chr1 53255494 . C G 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.979;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=30.45;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:820,0,57 -chr1 53255625 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.850;DP=36;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:280,0,889 -chr1 53256275 . T C 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.029;DP=50;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:889,0,865 -chr1 53256720 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:319,0,297 -chr1 53259597 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr1 53260212 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.506;DP=150;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=3.39;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:536,0,4542 -chr1 53260381 . G A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=2.145;DP=200;FS=8.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,53:200:99:1287,0,5708 -chr1 53280180 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-1.108;DP=127;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,34:127:99:713,0,4995 -chr1 53280333 . A C 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.244;DP=125;FS=4.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,46:124:99:1545,0,3392 -chr1 53290562 . C T 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.162;DP=358;FS=6.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,98:358:99:2329,0,9812 -chr1 53310395 . T A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-2.800;DP=444;FS=6.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:376,67:443:99:588,0,14127 -chr1 53312431 . A T 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.821;ClippingRankSum=-1.608;DP=359;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,93:358:99:2063,0,8990 -chr1 53316250 . A G 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.722;ClippingRankSum=1.438;DP=323;FS=5.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,72:320:99:1391,0,8872 -chr1 53316458 . AT A 1127.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-2.139;DP=289;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,77:261:99:1165,0,5068 -chr1 53661747 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:288,0,499 -chr1 53769215 . G A 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.117;DP=146;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.282;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,44:146:99:1114,0,3856 -chr1 53771862 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.583;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,22:134:99:245,0,4249 -chr1 53860167 . A AAC 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=-0.386;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:283,0,207 -chr1 53874242 . G A 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.430;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=25.33;ReadPosRankSum=2.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1320,0,454 -chr1 53874245 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.141;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:354,0,1998 -chr1 53875729 . G T 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.360;DP=50;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:638,0,1025 -chr1 53883294 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=1.812;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:341,0,2466 -chr1 53883356 . G GT 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.417;DP=58;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:267,0,1037 -chr1 53884260 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-0.015;DP=39;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:394,0,1202 -chr1 53890457 . G GA 1588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=1.338;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=16.21;ReadPosRankSum=-1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1626,0,1497 -chr1 53891470 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.113;DP=152;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.456;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,25:152:99:319,0,5058 -chr1 53891600 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-0.591;DP=103;FS=2.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:464,0,2965 -chr1 53897485 . T C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.128;DP=134;FS=4.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,32:134:99:695,0,3882 -chr1 53902681 . G C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.248;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:410,0,682 -chr1 54056591 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.385;DP=76;FS=15.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=4.73;ReadPosRankSum=2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:388,0,2161 -chr1 54058939 . G C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=1.639;DP=73;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:535,0,1987 -chr1 54127104 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.026;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:500,0,496 -chr1 54179767 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,355 -chr1 54205078 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.077;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:255,0,686 -chr1 54220092 . C CA 526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-3.716;DP=94;FS=13.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=5.60;ReadPosRankSum=3.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:564,0,1339 -chr1 54220192 . C T 1693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.001;DP=250;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,72:250:99:1722,0,6513 -chr1 54223704 . G C 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.032;DP=429;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:350,78:428:99:1189,0,13419 -chr1 54223818 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.456;DP=300;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,48:294:99:619,0,9556 -chr1 54225308 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=1.307;DP=280;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,41:278:99:356,0,9300 -chr1 54237476 . G A 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=1.068;DP=329;FS=1.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,72:328:99:1447,0,10023 -chr1 54245144 . G C 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.790;DP=208;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,49:205:99:1251,0,10239 -chr1 54245435 . G C 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.290;DP=237;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,52:237:99:977,0,10468 -chr1 54263746 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.480;ClippingRankSum=-4.045;DP=492;FS=29.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=0.61;ReadPosRankSum=3.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:419,70:489:99:329,0,15769 -chr1 54264908 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.058;DP=247;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,49:246:99:821,0,7618 -chr1 54264983 . C T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.288;DP=418;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,84:417:99:1430,0,12269 -chr1 54265082 . A G 8107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.245;DP=401;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,244:384:99:8136,0,4682 -chr1 54266239 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=-1.322;DP=544;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=0.76;ReadPosRankSum=4.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:468,75:543:99:439,0,17852 -chr1 54267576 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=2.562;DP=382;FS=0.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,53:382:99:345,0,12578 -chr1 54296153 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.712;DP=35;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:396,0,782 -chr1 54297739 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.320;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=15.51;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:602,0,703 -chr1 54297751 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.548;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:235,0,1008 -chr1 54454487 . T G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-0.657;DP=191;FS=11.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,30:190:99:369,0,6188 -chr1 54462056 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=1.840;DP=157;FS=6.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,33:156:99:608,0,4651 -chr1 54463235 . A C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=1.390;DP=196;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,37:196:99:563,0,6021 -chr1 54479753 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.780;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:681,0,1146 -chr1 54486046 . A G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=2.945;DP=56;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:687,0,1131 -chr1 54487232 . TGGTGACACTCTTTGTTTTTATAGATTTCGACTGTGTTTTAGAGTCGATCCAATGATTTGAGGTCCTCTAAATGTTTGTTTCCTGCA T 5789.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.842;DP=132;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=29.04;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,124:128:99:5827,492,0 -chr1 54489868 . C G 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.467;DP=95;FS=5.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,35:95:99:1179,0,2001 -chr1 54493730 . T G 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.067;DP=164;FS=9.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.762;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,48:164:99:1167,0,4354 -chr1 54494450 . G A 1456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=2.008;DP=106;FS=6.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:106:99:1485,0,4684 -chr1 54494456 . A C 1456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=1.526;DP=100;FS=2.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1485,0,4605 -chr1 54501269 . G A 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=1.680;DP=171;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=12.02;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,63:171:99:2083,0,3611 -chr1 54501902 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=-0.793;DP=132;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,26:131:99:377,0,3790 -chr1 54501990 . G A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=1.690;DP=126;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:737,0,3324 -chr1 54503488 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-1.690;DP=121;FS=9.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,22:121:99:337,0,3880 -chr1 54504182 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.270;DP=128;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=11.65;ReadPosRankSum=2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,45:127:99:1520,0,2821 -chr1 54506247 . TGTAAGTAAACATCTGAAATAAGGCAGCTTCCACATTCTTTTGAGTTTATTCCTCATTTTGCTTACTTCAACTCTCCAG T 7348.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.611;DP=167;FS=2.980;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.743;QD=35.36;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,165:167:99:7386,629,0 -chr1 54516283 . G A 4828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.378;DP=358;FS=10.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,141:357:99:4857,0,7199 -chr1 54517091 . T C 4514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-2.291;DP=362;FS=9.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=12.47;ReadPosRankSum=2.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,133:361:99:4543,0,7732 -chr1 54519938 . C T 5627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=-0.322;DP=336;FS=6.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.75;ReadPosRankSum=3.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,74:335:99:5656,0,9668 -chr1 54549429 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,139 -chr1 54592046 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=1.249;DP=148;FS=4.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,39:148:99:907,0,4309 -chr1 54604933 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:443,0,327 -chr1 54651033 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.745;DP=50;FS=2.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:365,0,1344 -chr1 54661901 . G A 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-3.087;DP=101;FS=2.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=14.52;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,43:101:99:1495,0,1847 -chr1 54667366 . C T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.952;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:635,0,309 -chr1 54667549 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.590;DP=74;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:438,0,2054 -chr1 54667591 . ACTGAAGCAGAGAGAGATGAAGAGGGTAAAGAGTAATGTTTTCAGGAGTAAAGAGGAGCTGAATCTATATGCAGTGAGATCTGTGTTGATGCTCAC A 3253.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=1.319;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:3291,275,0 -chr1 54674000 . C A 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=1.500;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:819,0,1003 -chr1 54700827 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.502;DP=39;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:349,0,1003 -chr1 54812362 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:264,0,452 -chr1 54826614 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:308,0,53 -chr1 55187015 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-1.811;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,411 -chr1 55221918 . A T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=25.28;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:458,0,211 -chr1 55240655 . TCTGACAGCCGAGGTCAAGGGTCATGAACAACACAACCGAGTCTACAACAGCAGAAACTGCTCATACAGTGTAAAGGATAC T 4693.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=1.903;DP=123;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=33.23;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,108:120:99:4731,0,3049 -chr1 55248263 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.646;DP=35;FS=5.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:290,0,1324 -chr1 55248512 . T C 489.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=34.41;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:0:515,0,0 -chr1 55248558 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-0.245;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:438,0,629 -chr1 55251311 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.262;DP=114;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,32:114:99:772,0,3036 -chr1 55254437 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.063;DP=71;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=3.33;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:265,0,2029 -chr1 55289508 . A G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.285;DP=68;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:496,0,2827 -chr1 55302357 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.800;DP=44;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:624,0,806 -chr1 55312714 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=1.588;DP=16;FS=8.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:341,0,246 -chr1 55324298 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.693;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:401,0,281 -chr1 55324310 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:279,0,419 -chr1 55401445 . T C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr1 55410173 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,278 -chr1 55437899 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=40;FS=8.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:279,0,1095 -chr1 55446831 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-2.182;DP=43;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=7.76;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:362,0,1180 -chr1 55450967 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=2.850;DP=34;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=6.52;ReadPosRankSum=-2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:250,0,1856 -chr1 55468661 . A T 1874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.201;DP=156;FS=6.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=12.02;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,59:154:99:1903,0,2724 -chr1 55484357 . GACCTTAAAACAATTAAATGAATTATTTCAATCATTGTTTGTTTTGAGAGTTCAGCGTTTCTCTGTGT G 591.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=29.59;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:27:629,0,27 -chr1 55497164 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-2.183;DP=93;FS=3.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:316,0,2795 -chr1 55505243 . AACCTGTCCAATCAGAACAAGACAATGTCACACTGCAGCATGTTAGCCAATTGATAATGATTGACCAATTAAATACAC A 1232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=1.476;DP=54;FS=10.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=22.83;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,48:53:99:1270,0,253 -chr1 55547822 . G C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.111;DP=170;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,43:170:99:987,0,4785 -chr1 55549220 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=1.216;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:382,0,851 -chr1 55549223 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=1.088;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:382,0,854 -chr1 55561000 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:316,0,239 -chr1 55638407 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.455;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:625,0,790 -chr1 55652841 . G T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.226;DP=57;FS=2.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:480,0,2710 -chr1 55661727 . C T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=-0.348;DP=175;FS=10.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,38:174:99:804,0,5292 -chr1 55708651 . T C 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=1.330;DP=114;FS=7.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1618,0,2095 -chr1 55710020 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-5.124;DP=57;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=6.77;ReadPosRankSum=-2.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:414,0,1546 -chr1 55719596 . T G 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.636;DP=108;FS=0.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,26:108:99:715,0,6315 -chr1 55727959 . T TA 786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.087;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:824,0,1002 -chr1 55730713 . T TTG 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.940;DP=101;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:556,0,1781 -chr1 55751531 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.702;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=23.43;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:450,0,169 -chr1 55804026 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-2.421;DP=73;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:452,0,4450 -chr1 55838796 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.497;DP=71;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:467,0,694 -chr1 55838846 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.450;DP=51;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:573,0,635 -chr1 56043042 . T C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr1 56055350 . TA T 204.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.967;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:17:242,0,17 -chr1 56286183 . GCT G 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=4.671;DP=92;FS=3.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=3.12;ReadPosRankSum=-4.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:324,0,2985 -chr1 56316430 . T C 5733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.164;DP=344;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,177:343:99:5762,0,5980 -chr1 56317657 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=2.025;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,673 -chr1 56317675 . C G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=2.700;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.05;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:239,0,673 -chr1 56318670 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,487 -chr1 56323758 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.655;ClippingRankSum=2.073;DP=295;FS=5.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=0.69;ReadPosRankSum=4.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,14:244:99:233,0,5762 -chr1 56373094 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.574;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:491,0,525 -chr1 56460439 . C T 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.530;DP=252;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,57:251:99:886,0,9570 -chr1 56460591 . TCA T 1556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=6.150;DP=83;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=18.76;ReadPosRankSum=-5.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:1594,0,1420 -chr1 56460595 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=5.936;DP=83;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=5.55;ReadPosRankSum=-4.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:489,0,7790 -chr1 56494919 . AT A 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.566;DP=42;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:395,0,583 -chr1 56579709 . C T 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.761;DP=58;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=21.62;ReadPosRankSum=2.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,36:56:99:1282,0,683 -chr1 56580177 . C T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-1.076;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:842,0,1499 -chr1 56586292 . G A 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.710;DP=80;FS=5.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:1337,0,1335 -chr1 56590481 . C G 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=2.152;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=22.20;ReadPosRankSum=-2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:894,0,447 -chr1 56593633 . C A 1757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-0.842;DP=72;FS=5.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=24.41;ReadPosRankSum=2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1786,0,702 -chr1 56600538 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=1.819;DP=60;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1048,0,992 -chr1 56614602 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-1.121;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:659,0,716 -chr1 56694466 . C T 4839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.057;DP=303;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,136:303:99:4868,0,5581 -chr1 56731613 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,461 -chr1 56764912 . A G 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.549;DP=132;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,64:132:99:2216,0,2114 -chr1 56764960 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.369;DP=114;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:280,0,3626 -chr1 56808517 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:54:236,0,54 -chr1 56810737 . A T 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 -chr1 56810761 . C T 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:613,42,0 -chr1 56834529 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-0.075;DP=17;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:587,0,34 -chr1 56850851 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=2.178;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=30.60;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:35:579,0,35 -chr1 56851023 . A G 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.531;DP=27;FS=8.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=30.51;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:99:852,0,103 -chr1 56854658 . T A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-0.796;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:814,0,157 -chr1 56887446 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:255,0,53 -chr1 56894638 . G A 204.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.27;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16:233,0,16 -chr1 56970063 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=-0.223;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=13.22;ReadPosRankSum=2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:438,0,649 -chr1 56971292 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.539;DP=28;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=15.99;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:476,0,733 -chr1 56972584 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.199;DP=29;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=11.75;ReadPosRankSum=-3.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:369,0,1141 -chr1 56972593 . A G 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-1.771;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=22.89;ReadPosRankSum=-1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:921,0,482 -chr1 56981368 . C A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-1.539;DP=73;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:975,0,1471 -chr1 57108186 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.804;DP=106;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,25:106:99:560,0,6028 -chr1 57110260 . AT A 1157.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.599;ClippingRankSum=-0.111;DP=114;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,58:102:99:1195,0,908 -chr1 57111868 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=-0.658;DP=112;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,23:111:99:415,0,3639 -chr1 57116802 . T A 4738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-2.640;DP=350;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=13.54;ReadPosRankSum=2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,137:348:99:4767,0,7560 -chr1 57118259 . A G 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-2.034;DP=206;FS=25.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,55:206:99:1293,0,5697 -chr1 57119184 . T C 4891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-3.649;DP=252;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=19.41;ReadPosRankSum=2.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,115:241:99:4920,0,8359 -chr1 57149994 . G A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr1 57150107 . T A 415.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=31.97;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:443,0,7 -chr1 57210689 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.607;DP=33;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:276,0,936 -chr1 57455963 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr1 57635284 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:281,0,372 -chr1 57636602 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=1.282;DP=26;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:484,0,808 -chr1 57653704 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=-0.087;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:235,0,651 -chr1 58312263 . A C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:404,0,51 -chr1 58312335 . T C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr1 58312336 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr1 58318695 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.223;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:338,0,612 -chr1 58319924 . T A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.267;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:470,0,483 -chr1 58320932 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,214 -chr1 58347593 . A C 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr1 58348200 . A C 347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:376,30,0 -chr1 58348546 . G T 885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:914,66,0 -chr1 58348860 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr1 58348861 . A T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr1 58351341 . C T 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:477,33,0 -chr1 58375252 . A G 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:57:782,57,0 -chr1 58375461 . A G 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.799;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1101,0,1158 -chr1 58375524 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.560;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=17.76;ReadPosRankSum=2.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:419,0,601 -chr1 58375589 . C CGA 954.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:67:992,67,0 -chr1 58375718 . GTT G 587.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.734;DP=23;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=25.55;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:26:625,26,0 -chr1 58375799 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-2.289;DP=26;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=15.57;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:433,0,511 -chr1 58375856 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-1.927;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.040;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:263,0,222 -chr1 58375990 . TAA T 390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:428,31,0 -chr1 58376228 . G T 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 -chr1 58376270 . A G 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr1 58376354 . G T 418.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=32.20;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:446,0,7 -chr1 58376373 . A T 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr1 58376746 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr1 58377365 . G C 1675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1704,117,0 -chr1 58378583 . G C 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:1170,0,326 -chr1 58378742 . C T 2022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-0.341;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=29.75;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,54:68:99:2051,0,247 -chr1 58379127 . T G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.694;DP=26;FS=4.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.84;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:674,0,222 -chr1 58381399 . T A 711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:740,54,0 -chr1 58381653 . G A 847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:876,63,0 -chr1 58381674 . G C 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1064,78,0 -chr1 58382590 . A C 566.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:595,45,0 -chr1 58384570 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=-1.255;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:565,0,223 -chr1 58698253 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=-2.866;DP=45;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=4.55;ReadPosRankSum=-3.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:233,0,1332 -chr1 58698509 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:320,0,517 -chr1 58698911 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-2.524;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,179 -chr1 58699652 . C A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.402;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=19.71;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:797,0,587 -chr1 58703504 . C A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.227;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=17.99;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:640,0,410 -chr1 58704068 . T A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=4.200;DP=39;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.10;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:461,0,687 -chr1 58706175 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-1.011;DP=40;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=8.09;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:352,0,1037 -chr1 58708505 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.848;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:678,0,742 -chr1 58722848 . C A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-2.272;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:94:653,0,94 -chr1 58733672 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:264,0,97 -chr1 58737452 . G T 2416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.319;DP=112;FS=31.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,72:112:99:2445,0,3131 -chr1 58737504 . A G 7257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-2.053;DP=197;FS=8.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=36.51;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,158:197:99:7286,0,590 -chr1 58737677 . T TA 7366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-0.749;DP=228;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=32.31;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,180:224:99:7404,0,1997 -chr1 58737791 . G GT 7824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.875;DP=327;FS=2.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=23.93;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,260:313:99:7862,0,416 -chr1 58740826 . T C 7369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=-0.013;DP=257;FS=13.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,203:257:99:7398,0,968 -chr1 58740884 . C T 5423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-1.598;DP=239;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=22.69;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,183:237:99:5452,0,1040 -chr1 58744805 . T C 2005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=3.590;DP=100;FS=63.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,59:99:99:2034,0,1303 -chr1 58745453 . A C 2866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=2.255;DP=144;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,87:144:99:2895,0,1889 -chr1 58961708 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:277,0,245 -chr1 58963740 . T A 638.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-0.193;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=23.64;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:666,9,0 -chr1 58963934 . A G 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:460,33,0 -chr1 58964198 . G A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr1 58964279 . G A 1420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1449,116,0 -chr1 58964592 . G A 751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:780,54,0 -chr1 58964601 . C T 751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:54:780,54,0 -chr1 59177473 . T A 801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.131;DP=23;FS=3.617;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=34.86;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:830,66,0 -chr1 59187328 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.642;DP=49;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:315,0,1583 -chr1 59215584 . A G 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr1 59224029 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.251;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:382,0,204 -chr1 59224424 . C T 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-0.578;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:810,60,0 -chr1 59230829 . C T 702.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=1.598;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=30.56;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:14:731,0,14 -chr1 59239912 . C G 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.372;DP=35;FS=6.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=31.76;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1140,0,116 -chr1 59394487 . C T 3023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3052,214,0 -chr1 59401163 . G A 1974.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2003,144,0 -chr1 59401567 . T C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr1 59405597 . G C 365.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.25;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:23:394,23,0 -chr1 59405664 . G GT 364.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:402,29,0 -chr1 59405847 . T C 1047.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1076,78,0 -chr1 59405879 . A T 3523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3552,259,0 -chr1 59410537 . G A 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:598,42,0 -chr1 59436887 . A T 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1037,78,0 -chr1 59439734 . G A 1708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=-0.026;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,47:54:63:1737,0,63 -chr1 59440219 . G A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=2.478;DP=37;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=27.62;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1050,0,270 -chr1 59447806 . G A 1123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=-0.120;DP=48;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=23.41;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1152,0,458 -chr1 59448369 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.794;DP=52;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:338,0,1396 -chr1 59448518 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=1.892;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:289,0,272 -chr1 59477096 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:256,0,52 -chr1 59486515 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:261,0,56 -chr1 59489834 . C T 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.966;DP=40;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=31.59;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:55:1292,0,55 -chr1 59490122 . G A 1954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-1.025;DP=74;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,54:73:99:1983,0,443 -chr1 59490734 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:327,0,240 -chr1 59498735 . A G 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.599;DP=31;FS=11.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:347,0,762 -chr1 59498823 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=1.358;DP=42;FS=4.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:639,0,1745 -chr1 59498830 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=2.791;DP=40;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:639,0,1742 -chr1 59498888 . A T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:390,0,95 -chr1 59500427 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.966;DP=38;FS=1.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:297,0,937 -chr1 59500673 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,325 -chr1 59513561 . C A 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-2.037;DP=44;FS=12.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=31.49;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1414,0,169 -chr1 59523972 . C A 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.353;DP=54;FS=7.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:95:1745,0,95 -chr1 59546569 . T C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr1 59546575 . G A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr1 59616827 . G T 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 -chr1 59620649 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,101 -chr1 59667891 . A T 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.537;DP=55;FS=3.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=31.27;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1748,0,224 -chr1 59668533 . T C 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=-2.637;DP=46;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=21.91;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:1036,0,534 -chr1 59668640 . A T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=1.550;DP=73;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1098,0,1338 -chr1 59668692 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-0.870;DP=28;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.49;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:350,0,540 -chr1 59668715 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=1.615;DP=23;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=11.29;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:288,0,411 -chr1 59668726 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=1.954;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:312,0,444 -chr1 59668818 . C A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=3.194;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:358,0,862 -chr1 59668827 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=3.325;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=18.32;ReadPosRankSum=-3.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:358,0,852 -chr1 59669431 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.132;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:498,0,201 -chr1 59669439 . AT A 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-1.009;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:331,0,124 -chr1 59669537 . T A 853.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.437;DP=21;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=29.24;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:6:881,0,6 -chr1 59670264 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.221;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:533,0,1003 -chr1 59670296 . T C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=1.106;DP=38;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:605,0,615 -chr1 59671131 . A C 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.210;DP=60;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,49:60:99:1761,0,150 -chr1 59697444 . C T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=4.054;DP=45;FS=7.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=24.93;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1150,0,239 -chr1 59697480 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=1.194;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.887;QD=21.37;ReadPosRankSum=-3.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1225,0,405 -chr1 59714507 . G A 3317.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-2.610;DP=89;FS=1.613;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=33.61;ReadPosRankSum=-1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,83:89:99:3346,133,0 -chr1 59772209 . C T 1056.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-1.348;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1085,78,0 -chr1 59786922 . G A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.025;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:72:1057,0,72 -chr1 59790367 . C T 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:442,33,0 -chr1 59799397 . G A 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.117;DP=48;FS=5.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:77:1488,0,77 -chr1 59799712 . C G 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.802;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1118,0,149 -chr1 59800132 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=-1.683;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=17.07;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:489,0,378 -chr1 59800371 . C T 973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.763;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=28.95;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1002,72,0 -chr1 59808711 . C A 1197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.622;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:55:1226,55,0 -chr1 59846502 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=1.101;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,878 -chr1 59846511 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.796;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,878 -chr1 59895933 . G A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=1.476;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:999,0,352 -chr1 59896403 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-3.098;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:529,0,404 -chr1 59903174 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr1 59918977 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-0.493;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:498,0,142 -chr1 59920114 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=2.850;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:489,0,190 -chr1 59922727 . TCTGCAGGTCAAAGCAACAGAAGCTGATGTATGATCTGATTACTGTGGGGTTTGTCGCTCTCTCATGTATTATTGTCTAC T 1201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.487;DP=32;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:99:1239,0,469 -chr1 59940959 . AGT A 230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 -chr1 59943362 . TG T 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,0:4:99:343,0,1573 -chr1 59943364 . TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG T 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=19.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,1573 -chr1 59943525 . CAT C 1295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.911;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=28.76;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:78:1333,0,78 -chr1 59943770 . C T 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-1.282;DP=42;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:882,0,509 -chr1 59950819 . G A 3141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-0.710;DP=101;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,86:100:65:3170,0,65 -chr1 59964320 . GAC G 2870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=5.333;DP=208;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=13.80;ReadPosRankSum=-5.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,82:187:99:2908,0,3431 -chr1 59964557 . C T 12111.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.296;DP=351;FS=1.591;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=34.51;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,316:351:99:12140,285,0 -chr1 59964696 . CCCTGAGGAAGACGATGAGTGTGAGTGTGTGTTACTCAGGTTCGTGTGTTACTCAGGTGTGTGCGTGTGTGTATA C 14388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=1.953;DP=352;FS=3.508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=34.93;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,317:335:99:14426,857,0 -chr1 59980995 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:262,0,251 -chr1 59998016 . CCGACACACACCGCATTACAGCGGAAACACAACCGAG C 3143.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=9.612;DP=264;FS=58.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.91;ReadPosRankSum=5.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,106:203:99:3181,0,20053 -chr1 60007179 . A T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=2.611;DP=36;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=30.66;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:83:1132,0,83 -chr1 60007365 . A C 1060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1089,81,0 -chr1 60013432 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=34.80;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:58:411,0,58 -chr1 60017464 . C T 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr1 60021907 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.08;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:319,0,186 -chr1 60022483 . C G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:67:444,0,67 -chr1 60027548 . CA C 337.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:375,30,0 -chr1 60032637 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:390,0,117 -chr1 60032849 . A G 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.503;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:816,0,223 -chr1 60032925 . G A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-1.187;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.11;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:999,0,354 -chr1 60045530 . TGGTGAGACTCGCTCTCTGCCATCACTCGTGTGTGTGTGTGTGTTTATTCTAGCTAATATGTGTGTGTGTGTGTGTA T 1521.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.636;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1559,118,0 -chr1 60046474 . G T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=-1.014;DP=35;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=29.00;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:99:1340,0,224 -chr1 60053402 . G C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.325;DP=31;FS=7.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:884,0,127 -chr1 60053873 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=1.441;DP=31;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:905,0,141 -chr1 60055250 . G C 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.933;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1579,0,123 -chr1 60058880 . G C 3885.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.738;DP=109;FS=5.941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,101:109:99:3914,194,0 -chr1 60121803 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=2.446;DP=152;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,35:152:99:731,0,4616 -chr1 60121968 . TCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC T 337.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:98:375,98,0 -chr1 60126051 . C T 394.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.91;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:5:422,0,5 -chr1 60127035 . CTATTGCTCCACCCACTGCTTCTCCCACCATGTCATCCACTACACTATCCACGGTAGCACCACCCACCACACCACCTACAGCACCCCCCACGCTTCCATACACCATGCCACCCACTGCTCTAAACACTGCGACAGT C 3025.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.896;DP=93;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,86:93:99:3063,0,143 -chr1 60136526 . G A 1934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-1.654;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=32.52;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1963,132,0 -chr1 60136528 . T A 1934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-1.732;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:1963,132,0 -chr1 60142512 . A T 2155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.291;DP=55;FS=3.090;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:2184,160,0 -chr1 60144844 . AGTAAGTCCCTCAGAGAGGTTACCTGTCTACTGTCGGTGCACACACAATCTAACAAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAG A 2760.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.750;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=27.54;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:2798,208,0 -chr1 60152362 . A G 4243.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=-0.453;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,104:106:99:4272,307,0 -chr1 60159907 . C T 325.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=29.55;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:353,0,12 -chr1 60165525 . T G 714.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.722;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=32.49;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:23:743,0,23 -chr1 60181545 . C T 1593.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=1.397;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=33.91;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,42:47:25:1622,25,0 -chr1 60187250 . A AG 1779.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.014;DP=54;FS=4.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=32.95;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:10:1816,0,10 -chr1 60187996 . A G 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-1.332;DP=43;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=30.88;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:84:1356,0,84 -chr1 60231730 . C T 12897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=-1.398;DP=391;FS=2.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.269;QD=32.99;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:41,350:391:99:12926,217,0 -chr1 60232280 . CCCTGAAACACAGAGACTGATTCAGTGAGTTCTGAACAACAGAGCAGATCCAGAACACACACACACACTCATGATGAAGATCAGACTCA C 18405.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=2.755;DP=503;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=32.44;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,460:463:99:18443,1349,0 -chr1 60232580 . C T 8840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.939;ClippingRankSum=-2.190;DP=313;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.869;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,273:311:99:8869,0,101 -chr1 60236279 . CCCTGAGGGAACAGATGACCTATTTCACCATGCGCTGTTCACTGTGCAGATCTGAGATGAGTGTGAAGATACTCA C 17679.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=2.438;DP=471;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=30.19;ReadPosRankSum=-2.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,443:445:99:17717,1617,0 -chr1 60244387 . CCCTGACAACACACACACAGTTACACACACACACACACACACACACACACATACAGGTCTTCAGGTGTGGAGGCGTGCCTTA C 1262.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=2.535;DP=304;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,263:269:99:1300,460,0 -chr1 60244576 . CCCTGGGAAGAAAAGCAGACCGATTATTTCAGGGAATATATCCATGAGTGTTGAGAGATTACTTAAGATACTGAGATCTGAACACATA C 10365.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=1.430;DP=292;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,269:274:99:10403,803,0 -chr1 60245417 . CCCTGAGAAGAATAATGTGCTGAGGATGACCCCGAATTTGCTCATATGTGTTGTTTCAGCATGTTCGATGGGTCACTTA C 20618.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=2.439;DP=472;FS=6.927;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=27.84;ReadPosRankSum=-2.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,468:470:99:20656,1571,0 -chr1 60248907 . TCCCCTGCGG T 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=-1.568;DP=307;FS=116.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=1.14;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,74:152:99:387,0,3309 -chr1 60250086 . C T 17754.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-1.823;DP=507;FS=0.561;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=28.65;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:47,460:507:99:17783,579,0 -chr1 60254445 . G A 18659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.464;DP=515;FS=2.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,469:514:99:18688,705,0 -chr1 60254811 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.612;ClippingRankSum=3.230;DP=314;FS=9.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=1.04;ReadPosRankSum=3.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,51:140:99:355,0,2371 -chr1 60254813 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.670;DP=317;FS=7.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,55:143:99:354,0,2359 -chr1 60281130 . A G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:426,0,733 -chr1 60281133 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=18.94;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:426,0,733 -chr1 60281256 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=1.937;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=23.89;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:745,0,997 -chr1 60285856 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=3.399;DP=26;FS=9.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:583,0,776 -chr1 60286102 . C T 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.672;DP=52;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1483,0,265 -chr1 60297374 . C A 4730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.843;DP=134;FS=1.135;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,122:134:99:4759,150,0 -chr1 60302935 . G A 1225.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.613;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:11:1253,0,11 -chr1 60304720 . GTA G 1085.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-1.754;DP=179;FS=3.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,57:86:99:1123,0,943 -chr1 60309236 . G A 1469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-0.244;DP=42;FS=2.356;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=34.99;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:79:1498,79,0 -chr1 60310864 . G T 299.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.32;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:328,0,18 -chr1 60311476 . CGTATGTCGAAGATCTGATTGTTCACTCTCACACACTCGACACCGATTGGACTCATTTTATTATATGAATCTTCACAACACCCTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCAG C 2629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.979;DP=63;FS=1.884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=31.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:99:2667,266,0 -chr1 60313843 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.362;QD=22.46;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:410,0,209 -chr1 60315784 . C T 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=1.106;DP=59;FS=4.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,46:59:99:1721,0,292 -chr1 60323703 . G A 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-1.732;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=28.35;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,28:39:99:1134,0,702 -chr1 60325015 . G C 1982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=1.699;DP=52;FS=14.506;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=33.52;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,47:51:77:2011,77,0 -chr1 60325016 . C A 1922.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=1.520;DP=51;FS=14.981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=34.36;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:18:1951,18,0 -chr1 60326200 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-1.799;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,322 -chr1 60326340 . A G 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:314,24,0 -chr1 60328645 . A ATG 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=2.021;DP=18;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:319,0,156 -chr1 60330397 . G A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr1 60331960 . G GGTA 308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.97;MQ0=0;QD=17.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:21:346,21,0 -chr1 60337764 . CGT C 475.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr1 60345775 . G A 1341.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-1.405;DP=38;FS=2.823;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=30.17;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:68:1370,68,0 -chr1 60346474 . A G 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr10 58095 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.176;DP=58;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:444,0,1421 -chr10 100919 . CGTGAGTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCTCTGACCTCTGCTGTTTTCAG C 3205.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.565;DP=83;FS=13.232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=30.99;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,76:83:15:3243,15,0 -chr10 101088 . GAGGCAGGTTTAGCACACACACACTCACACACACACACACGCGCTGATGCGTGATATGTAAACTCAGCACACACTGGACTGAAGCCGCTGCTCTGTTGTCTGACAC G 3368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=1.206;DP=97;FS=6.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=34.73;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,90:97:99:3406,0,472 -chr10 112320 . GCTATGAGGACACACAGACAGAACAATCAGCTCATCTACACGTATACAAGCCAATCTCAAACCAGACTAATGCTCTGACCCTGCTCAC G 1805.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.035;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=28.41;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,41:46:66:1843,66,0 -chr10 114026 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=1.454;DP=52;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:229,0,1397 -chr10 168139 . CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT C 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.488;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=21.44;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:498,0,675 -chr10 168176 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,0:4:99:421,0,968 -chr10 168642 . C T 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.429;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.51;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:850,0,210 -chr10 217122 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.622;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,17:97:99:266,0,2718 -chr10 218195 . T G 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.357;DP=111;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:787,0,2809 -chr10 227942 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.173;DP=40;FS=8.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=7.62;ReadPosRankSum=-2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:333,0,1064 -chr10 273875 . A G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-1.119;DP=101;FS=3.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,33:101:99:844,0,2480 -chr10 282441 . C T 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=1.706;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,51:173:99:1263,0,4523 -chr10 289572 . A G 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-0.986;DP=128;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:748,0,3686 -chr10 289666 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=-0.667;DP=99;FS=9.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=2.95;ReadPosRankSum=-3.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:320,0,3830 -chr10 290236 . A G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.739;DP=17;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=31.03;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:702,0,567 -chr10 290705 . AT A 1374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.083;DP=123;FS=4.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,48:114:99:1412,0,1618 -chr10 291257 . A G 1688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.145;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1717,0,1731 -chr10 292115 . A G 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-1.506;DP=135;FS=6.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,46:135:99:1288,0,3565 -chr10 348604 . TA T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-1.313;DP=44;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=6.77;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:335,0,734 -chr10 351998 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.010;DP=54;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:334,0,1483 -chr10 357688 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=1.036;DP=55;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:327,0,1514 -chr10 359788 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.304;DP=52;FS=4.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=9.88;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:542,0,1084 -chr10 419246 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=2.108;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=18.27;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:613,0,503 -chr10 419408 . CTG C 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.873;DP=53;FS=2.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=9.96;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:565,0,2306 -chr10 419414 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.267;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.886;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:410,0,2409 -chr10 419558 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=3.472;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=8.28;ReadPosRankSum=-2.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:260,0,631 -chr10 420173 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,106 -chr10 420517 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.512;ClippingRankSum=-0.651;DP=29;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:392,0,457 -chr10 420980 . T C 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.018;DP=52;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:1094,0,1822 -chr10 421024 . A G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=-0.461;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=20.43;ReadPosRankSum=-2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:723,0,1894 -chr10 437932 . C A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.244;DP=32;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:484,0,467 -chr10 437981 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:260,18,0 -chr10 438079 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.054;DP=63;FS=7.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,3:38:99:321,0,6485 -chr10 438122 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.392;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,4:48:99:327,0,6485 -chr10 438123 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.055;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,4:49:99:334,0,6484 -chr10 438177 . T G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=-0.745;DP=63;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:330,0,6484 -chr10 438217 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.554;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:286,0,6486 -chr10 438318 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=1.488;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:239,0,1273 -chr10 438359 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-2.614;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:279,0,666 -chr10 438463 . G T 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-1.819;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=33.44;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:99:2011,0,550 -chr10 438512 . C G 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=2.100;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=38.15;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:2011,0,530 -chr10 438556 . T C 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.318;DP=18;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:2011,0,471 -chr10 438589 . A G 1982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=1.317;DP=28;FS=10.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:2011,0,530 -chr10 438622 . G T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=1.850;DP=43;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:519,0,1327 -chr10 438769 . A G 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-1.733;DP=42;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.634;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1381,102,0 -chr10 438825 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-3.204;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:238,0,250 -chr10 576519 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.558;DP=63;FS=10.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:229,0,1665 -chr10 582621 . G A 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=3.308;DP=70;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1261,0,2418 -chr10 590018 . G T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.498;DP=69;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:878,0,3196 -chr10 590019 . G T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.848;DP=70;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:878,0,3230 -chr10 595365 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.343;DP=48;FS=4.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:231,0,1377 -chr10 1196624 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:255,0,648 -chr10 1196855 . T C 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.197;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=31.38;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:67:593,0,67 -chr10 1201181 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.700;DP=97;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:467,0,2799 -chr10 1455553 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-1.200;DP=40;FS=23.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:371,0,412 -chr10 1455649 . G T 888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:917,66,0 -chr10 1562895 . GCCTGAGCACACAGAGACATGAGCACAACACACACAGACACACTCTCATACACACACACACACACAAACACACACACGCACTCATA G 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=1.304;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:678,0,1246 -chr10 1565591 . TGATGAGGAA T 852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.152;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=25.84;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:890,0,1581 -chr10 1565601 . CAAACACAAGGAGGAAATACAGAAAAAGCCTCACCAGAGGAAAACATAAACACAAACTCACCTT C 852.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=1.039;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:890,0,1584 -chr10 1567628 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=15.43;ReadPosRankSum=2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,778 -chr10 1577333 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=18.81;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:254,0,130 -chr10 1623764 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.037;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:244,0,2208 -chr10 1638472 . G A 2700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=-1.396;DP=150;FS=13.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,85:150:99:2729,0,3128 -chr10 1653433 . C T 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.515;DP=43;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1114,0,307 -chr10 1708446 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.916;DP=62;FS=2.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:243,0,1983 -chr10 1713929 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=1.468;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,22:114:99:361,0,3503 -chr10 1714245 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.634;DP=120;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:298,0,3650 -chr10 1735910 . AT A 11953.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-1.243;DP=280;FS=0.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=28.93;ReadPosRankSum=-2.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,32:269:99:11991,0,8669 -chr10 1736149 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-0.169;DP=238;FS=9.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=1.64;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,37:238:99:419,0,8199 -chr10 1736912 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.473;DP=267;FS=3.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,44:267:99:449,0,18750 -chr10 1739376 . T TG 2973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-1.409;DP=226;FS=31.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,101:224:99:3011,0,7721 -chr10 1740248 . C T 7215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=2.398;DP=434;FS=4.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,228:434:99:7244,0,7099 -chr10 1749591 . C A 534.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-1.302;DP=16;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:4:561,4,0 -chr10 1914536 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=1.383;DP=138;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,30:136:99:502,0,4776 -chr10 1916726 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.910;DP=108;FS=4.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:512,0,3838 -chr10 2017128 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=1.460;DP=32;FS=5.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:416,0,825 -chr10 2018101 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.103;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:370,0,739 -chr10 2602891 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.351;DP=34;FS=12.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:241,0,944 -chr10 2606124 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=1.453;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=25.69;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:531,0,397 -chr10 2606136 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:399,0,538 -chr10 2628449 . C G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.250;DP=48;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:277,0,1274 -chr10 2641216 . C A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr10 2676697 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.069;DP=75;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:353,0,2070 -chr10 2706317 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.336;DP=37;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:292,0,1056 -chr10 2721262 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-3.399;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:316,0,522 -chr10 2802805 . CACCTGGAATACAACGCACAGCTTTACAGGAACTGCCTTTACAATGACAATCAAATATGCAACTGGAAGCATTTCAATGAGGGGGTCGTCAGTCTT C 4018.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=6.027;DP=114;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=27.60;ReadPosRankSum=-2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,97:111:99:4056,0,2479 -chr10 2896951 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.221;DP=76;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:656,0,1902 -chr10 2974831 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.953;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:325,0,337 -chr10 3145300 . G A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr10 3150392 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr10 3151008 . T A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-0.761;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=28.70;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:631,0,107 -chr10 3164327 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:579,0,370 -chr10 3164394 . C T 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.153;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,41:137:99:1046,0,3602 -chr10 3276404 . T C 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=-0.236;DP=40;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:326,0,1353 -chr10 3276516 . T C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.600;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:731,0,697 -chr10 3276641 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.323;DP=81;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:445,0,2535 -chr10 3276731 . T C 1644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=2.530;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:99:1673,0,221 -chr10 3276740 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.826;DP=48;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:721,0,1353 -chr10 3276855 . T C 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-2.212;DP=72;FS=6.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:962,0,1761 -chr10 3276856 . A C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-0.233;DP=73;FS=2.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:347,0,2508 -chr10 3325302 . C A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=23.72;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:384,0,157 -chr10 3325325 . G T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-0.655;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:734,0,702 -chr10 3325439 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=2.421;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:254,0,504 -chr10 3348869 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.772;DP=39;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:462,0,789 -chr10 3363153 . T C 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.300;DP=53;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:702,0,1104 -chr10 3376881 . T A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=1.615;DP=108;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=4.45;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,24:108:99:509,0,3384 -chr10 3382920 . T C 1549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.058;DP=126;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,46:126:99:1578,0,2693 -chr10 3390859 . AACCTGGAACAGCCGATGGAAAGTGTGTCCTAAAACTTTATACAGCTGAAATCAGAAACAGATTACTGATAACATCGTCCT A 3249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.531;DP=101;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=32.18;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,89:97:99:3287,0,1163 -chr10 3411380 . C G 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.915;DP=57;FS=5.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:657,0,1282 -chr10 3415759 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.112;DP=64;FS=11.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:743,0,1380 -chr10 3427909 . C CA 4007.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=-0.714;DP=130;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=30.83;ReadPosRankSum=-2.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,95:129:99:4045,0,350 -chr10 3427959 . C A 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.173;DP=169;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=5.53;ReadPosRankSum=3.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,58:162:99:963,0,5003 -chr10 3428156 . T A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.254;DP=343;FS=11.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,63:343:99:951,0,10862 -chr10 3456481 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.486;DP=109;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=3.48;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:408,0,3178 -chr10 3458593 . G A 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-2.086;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1641,0,1766 -chr10 3459190 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.547;DP=93;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:843,0,2454 -chr10 3459816 . T C 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=1.075;DP=88;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:1157,0,2201 -chr10 3459928 . C CA 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-2.655;DP=85;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:307,0,1849 -chr10 3867295 . C T 247.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:276,0,22 -chr10 3892659 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.224;DP=44;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1149 -chr10 3976851 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.030;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:263,0,1568 -chr10 3977061 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.878;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:278,0,1078 -chr10 3987704 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.714;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:360,0,681 -chr10 4045060 . GGGTGAGATGTCACACACCATGAATCCAAAACACTTTAATATTCATTAAGCAACACTGCTCATGCGTCTGATCTGTATGTAACAACACTGCTAACGCTAGCAACTCTCTTTCCTTCTCTTTTTCCTAAACCTACCACTAAA G 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=4.015;DP=32;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=12.46;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:436,0,4310 -chr10 4094257 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.557;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:364,0,1509 -chr10 4095009 . T TTA 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.575;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:377,0,1634 -chr10 4095505 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:81:423,0,81 -chr10 4096957 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.072;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:269,0,2574 -chr10 4098505 . A T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-1.506;DP=67;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:277,0,2876 -chr10 4123088 . CT C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=-3.162;DP=52;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:391,0,636 -chr10 4123943 . A AT 451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.234;DP=53;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:511,0,1010 -chr10 4124007 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.616;DP=51;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:297,0,1640 -chr10 4321434 . TCCTGATTGTCAAAAAAGACACATTAGTCAGCATGTTAGATATGAAAAAATTAGAAAGACATTTGAAATCTTCAACATA T 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-1.297;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=28.93;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:934,0,343 -chr10 4324346 . ATACCTGTTCGGAATGCAAGTTATCCAACTTAAATAAACATCTCCACTGCAATTGTTTAAGATCCAAGAGAAACTGGCCATCATATT A 1251.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=1.631;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=34.77;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1289,112,0 -chr10 4563052 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=-0.458;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:799,0,849 -chr10 4563219 . CA C 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.821;DP=53;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:437,0,704 -chr10 4569856 . CTACAAGG C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:75:243,0,75 -chr10 4614818 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.073;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:404,0,2319 -chr10 4893122 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-1.151;DP=32;FS=5.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:424,0,1092 -chr10 4920975 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:54:231,0,54 -chr10 4944022 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:85:271,0,85 -chr10 4950877 . C A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-1.961;DP=76;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:410,0,2111 -chr10 4957806 . G T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=1.085;DP=57;FS=2.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:330,0,2016 -chr10 4972351 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.740;DP=80;FS=25.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:240,0,2746 -chr10 5025994 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-1.129;DP=306;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,45:306:99:367,0,9763 -chr10 5256267 . C A 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=-0.153;DP=106;FS=3.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=11.66;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,40:106:99:1264,0,2275 -chr10 5404359 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.185;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:336,0,888 -chr10 5404458 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=-0.022;DP=49;FS=6.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:381,0,1233 -chr10 5409456 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=1.322;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:229,0,1527 -chr10 5410535 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.423;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=17.21;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:751,0,819 -chr10 5433307 . G A 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-1.915;DP=158;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:1311,0,4162 -chr10 5465396 . T A 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.187;DP=168;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,53:168:99:1504,0,9705 -chr10 5478608 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=1.145;DP=92;FS=4.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:454,0,5036 -chr10 5478808 . A T 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.008;DP=117;FS=7.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,43:117:99:1523,0,2630 -chr10 5648925 . A C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-2.045;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:367,0,644 -chr10 5829777 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.025;DP=59;FS=6.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:466,0,1644 -chr10 6133858 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:57:391,0,57 -chr10 6133866 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:57:391,0,57 -chr10 6153464 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-2.409;DP=19;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:231,0,447 -chr10 6191478 . T TA 1714.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=-0.096;DP=443;FS=7.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,116:429:99:1752,0,9006 -chr10 6208805 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.423;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:340,0,299 -chr10 6210504 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.615;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:74:627,0,74 -chr10 6215246 . A T 2647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-0.902;DP=359;FS=5.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.052;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,105:359:99:2676,0,9626 -chr10 6245179 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-0.448;DP=38;FS=8.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:275,0,1213 -chr10 6245664 . CT C,CTT 425.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-0.573;DP=38;FS=2.187;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,20,10:36:99:606,125,310,412,0,684 -chr10 6246466 . T TA 267.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:305,21,0 -chr10 6246893 . C A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=-0.875;DP=54;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:491,0,1404 -chr10 6247110 . T G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-1.476;DP=47;FS=7.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:265,0,1323 -chr10 6248435 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.061;DP=33;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:407,0,666 -chr10 6250241 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:310,0,53 -chr10 6271084 . T A 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr10 6271086 . A C 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:422,30,0 -chr10 6275773 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.025;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:369,0,290 -chr10 6275895 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.690;DP=23;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=21.51;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:523,0,110 -chr10 6426961 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.372;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:369,0,411 -chr10 6427240 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-2.901;DP=33;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=7.24;ReadPosRankSum=3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:267,0,450 -chr10 6508961 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.081;DP=58;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:686,0,1291 -chr10 6610252 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-1.769;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,108 -chr10 6611342 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:401,0,310 -chr10 6751005 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=-1.406;DP=47;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:263,0,811 -chr10 6752410 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,142 -chr10 7004843 . C T 3030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-1.465;DP=227;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,92:227:99:3059,0,4575 -chr10 7004983 . CACCTGAATCACATAGGATTCATTAAATATTAGCAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTA C 7831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.807;DP=393;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,247:368:99:7869,0,4524 -chr10 7004988 . GAATCACATAGGATTCATTAAATATTA G 4136.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.012;DP=383;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,119:368:99:4174,0,9046 -chr10 7005016 . CAATGCAAACACTTTAAGCGCCTATAAGAGCTTTACATGAATATAAAAAGTAACCTGGA C 4129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.849;DP=406;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,132:391:99:4167,0,9062 -chr10 7007638 . TCCTAAGGAGAAAACAGGAGTTAAAATCAAGAAATGTATAAAAATGAACAGTGTCAAAAAACAAAGTGTAAACCTA T 13812.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=1.329;DP=341;FS=3.919;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=28.74;ReadPosRankSum=-2.665 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,329:335:99:13850,1008,0 -chr10 7011427 . G GA 1215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=-0.341;DP=74;FS=7.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=16.43;ReadPosRankSum=2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1253,0,806 -chr10 7080616 . A T 354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:383,30,0 -chr10 7081017 . A T 533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:562,39,0 -chr10 7087869 . C T 4228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=1.116;DP=127;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=33.30;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,109:127:99:4257,0,126 -chr10 7106611 . A C 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:738,54,0 -chr10 7107187 . T C 863.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=2.246;DP=24;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=25.43;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:8:891,0,8 -chr10 7107193 . C T 862.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=2.192;DP=19;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=29.77;ReadPosRankSum=-1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:15:891,0,15 -chr10 7107551 . C T 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr10 7157166 . T C 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:56:754,56,0 -chr10 7220019 . C A 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:457,33,0 -chr10 7289133 . TA T 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.867;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:866,0,445 -chr10 7446237 . TCACCTGAGAAAACAGTTCGTTTTTAGAATAGAACAACTATTTGTTCCTAATTCTTAGGTCATATTTCTGAGAATTGCGTCATGTGCA T 930.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.888;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.828;QD=28.78;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:99:968,106,0 -chr10 7494626 . C CT 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=1.535;DP=40;FS=7.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:460,0,461 -chr10 7653386 . AT A 291.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:329,30,0 -chr10 7657949 . G C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:302,0,335 -chr10 7692421 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.472;DP=113;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:262,0,3601 -chr10 7692554 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-1.373;DP=72;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:269,0,2270 -chr10 7692686 . C CT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-0.118;DP=91;FS=2.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:303,0,1763 -chr10 7759275 . C G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.980;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:499,0,4499 -chr10 7771661 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.503;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:426,0,3535 -chr10 7771705 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.566;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:599,0,3245 -chr10 7771821 . G A 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.466;DP=89;FS=5.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1338,0,1537 -chr10 7776440 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.045;DP=150;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,38:150:99:779,0,6188 -chr10 7776522 . G GT 751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=1.714;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:789,0,574 -chr10 7779753 . C A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=18.71;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,1:18:99:365,0,1055 -chr10 7780679 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=2.624;DP=44;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:322,0,1882 -chr10 7780873 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-1.372;DP=55;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:492,0,1535 -chr10 7781061 . T A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.244;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:384,0,3302 -chr10 7781103 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-1.082;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:821,0,1732 -chr10 7781201 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-0.957;DP=34;FS=11.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:325,0,1529 -chr10 7783299 . T A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.775;DP=29;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.546;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:446,0,628 -chr10 7783531 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.591;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=25.88;ReadPosRankSum=-2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:494,0,164 -chr10 7783737 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.112;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:268,0,2052 -chr10 7800109 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-0.136;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:350,0,1719 -chr10 8019626 . GA G 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=-1.404;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:549,0,629 -chr10 8019914 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=-1.411;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:403,0,2269 -chr10 8388511 . C A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.285;DP=36;FS=8.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:294,0,1176 -chr10 8415690 . T G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=1.630;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:388,0,246 -chr10 8439937 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,266 -chr10 8458828 . A G 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.479;DP=63;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=26.93;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,45:63:99:1725,0,464 -chr10 8459101 . CTA C 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.071;DP=123;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,21:123:99:328,0,4480 -chr10 8459173 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.471;DP=150;FS=0.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,39:150:99:939,0,4227 -chr10 8459314 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.663;DP=148;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,35:148:99:708,0,4515 -chr10 8459333 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.316;DP=160;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,33:160:99:599,0,5036 -chr10 8459480 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.775;DP=91;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:510,0,2589 -chr10 8459491 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=2.371;DP=80;FS=6.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:569,0,2224 -chr10 8459686 . T A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.276;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1271,0,660 -chr10 8503588 . A G 2258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-0.316;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,63:142:99:2287,0,2652 -chr10 8527780 . G A 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-0.245;DP=91;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:1312,0,1668 -chr10 8560399 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr10 8560584 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:256,0,191 -chr10 8588388 . T A 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.251;DP=96;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,41:95:99:1366,0,1761 -chr10 8588527 . AT A 1218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-1.594;DP=86;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1256,0,805 -chr10 8928577 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.251;DP=45;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:249,0,1269 -chr10 9012644 . T C 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=2.506;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=24.42;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:590,0,169 -chr10 9032638 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:364,0,411 -chr10 9096080 . AGT A 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.254;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:771,0,1286 -chr10 9319983 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.222;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:351,0,1571 -chr10 9346182 . G T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.245;DP=141;FS=5.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,49:139:99:1656,0,3103 -chr10 9355214 . CCCTTTTAGACAGAAACAAAACCAAATTGTGAGCAAGCCAGCTGCATAACACATTTGAATGAATTTGAATACAGTGCAGGACTAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGGACTAAA C 8110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=2.819;DP=190;FS=1.336;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=31.50;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,181:190:99:8148,707,0 -chr10 9355363 . G C 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-0.080;DP=167;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,67:167:99:2222,0,5041 -chr10 9367021 . A T 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr10 9367050 . A G 487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:516,36,0 -chr10 9367134 . G A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr10 9367400 . A C 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr10 9375510 . A C 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1311,93,0 -chr10 9375591 . T C 1557.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1586,114,0 -chr10 9395981 . G A 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.834;DP=93;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=18.47;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1746,0,1412 -chr10 9396028 . C T 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.986;DP=108;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.831;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,66:108:99:2330,0,1418 -chr10 9458887 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:242,0,58 -chr10 9459475 . C T 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr10 9460806 . AT A 537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.489;DP=67;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:575,0,766 -chr10 9461161 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.567;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:675,0,1585 -chr10 9461234 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=1.870;DP=61;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:827,0,1205 -chr10 9461753 . T C 234.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:263,0,15 -chr10 9481029 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.748;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:67:575,0,67 -chr10 9483881 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=-0.214;DP=32;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=9.81;ReadPosRankSum=2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:342,0,667 -chr10 9500859 . C T 4327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-1.497;DP=251;FS=0.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,133:251:99:4356,0,4269 -chr10 9500886 . A G 6313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-2.797;DP=371;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=17.02;ReadPosRankSum=1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,195:371:99:6342,0,6252 -chr10 9506381 . C T 7113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.521;DP=410;FS=0.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,223:410:99:7142,0,6535 -chr10 9628062 . T A 641.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=2.205;DP=20;FS=10.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=32.05;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:669,12,0 -chr10 9655597 . G A 3839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=1.102;DP=264;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,110:261:99:3868,0,4895 -chr10 9655714 . G A 3123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=2.359;DP=244;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,94:244:99:3152,0,5321 -chr10 9927367 . A T 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=2.119;DP=65;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1044,0,1001 -chr10 10220555 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.578;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:274,0,3291 -chr10 10240150 . A T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-0.960;DP=77;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:327,0,2414 -chr10 10240550 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-0.624;DP=72;FS=2.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:283,0,2177 -chr10 10242616 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.247;DP=67;FS=17.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:592,0,1776 -chr10 10242714 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-0.367;DP=52;FS=3.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=13.00;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:704,0,1106 -chr10 10242738 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.754;DP=65;FS=7.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:747,0,1549 -chr10 10242807 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.971;DP=42;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:544,0,913 -chr10 10330154 . GAGGTAAAGTTTGCGATTTCAGCACGTGTTTCACTGCGTAGCATCACTGCATTTTAGCACATGTTTGTTCTTTTC G 3038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=1.014;DP=103;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=29.50;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,71:79:99:3076,0,1523 -chr10 10337778 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.062;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:414,0,3569 -chr10 10359650 . G T 2370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.652;DP=237;FS=4.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.00;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,81:213:99:2843,0,4511 -chr10 10383140 . A T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=-4.112;DP=213;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,49:213:99:968,0,5779 -chr10 10501806 . G A 3274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.868;DP=244;FS=2.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,93:237:99:3303,0,4951 -chr10 10527150 . CA C 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=-1.994;DP=173;FS=12.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,36:163:99:518,0,3828 -chr10 10527427 . T G 2366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.102;DP=92;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=25.73;ReadPosRankSum=-1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,47:92:99:2395,0,2035 -chr10 10527453 . T C 3809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=2.053;DP=102;FS=6.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.399;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,59:102:99:3838,0,1148 -chr10 10527598 . A G 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-1.920;DP=34;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=31.70;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1106,0,288 -chr10 10752104 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,414 -chr10 10759208 . T A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.709;DP=34;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:698,0,437 -chr10 10761886 . GA G 305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:343,33,0 -chr10 10826713 . A AAC 620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-1.195;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:658,0,1399 -chr10 10967197 . AT A 510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-1.135;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:548,0,1896 -chr10 10967616 . T C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.305;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:762,0,2474 -chr10 11111974 . A G 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=1.139;DP=82;FS=3.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=13.91;ReadPosRankSum=-1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:1169,0,1705 -chr10 11132694 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=-0.247;DP=59;FS=6.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=5.54;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:355,0,1731 -chr10 11227501 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=4.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,411 -chr10 11245205 . TGGTGAATTATAAGTCATAATGAACACATTTAAAGTATTGTTCTGCTTGGTATTCATCTTCTAAGTGCACTTCAGCAGTCTTCTCAGTTAGTTTCAATATTTCTTTTCA T 10208.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=1.351;DP=322;FS=1.647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=31.70;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,289:295:99:10246,816,0 -chr10 11293145 . TA T 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.339;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=9.53;ReadPosRankSum=-2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:266,0,255 -chr10 11334103 . GA G 1338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.673;DP=170;FS=3.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,60:159:99:1376,0,2318 -chr10 11459046 . G A 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:460,36,0 -chr10 11480088 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.982;DP=184;FS=0.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,43:167:99:784,0,6064 -chr10 11481561 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=-2.295;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=1.37;ReadPosRankSum=2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,26:171:99:286,0,6534 -chr10 11558400 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr10 11755792 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.779;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,448 -chr10 11756427 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.309;DP=38;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:241,0,1119 -chr10 11869920 . C T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr10 11875063 . T C 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:373,27,0 -chr10 11976783 . GAA G,GA 396.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.990;DP=38;FS=5.643;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,17,10:30:99:702,163,177,380,0,345 -chr10 11977664 . T A 9889.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.785;DP=240;FS=4.447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=34.97;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,228:232:99:9918,693,0 -chr10 11979005 . TA T 2342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.596;DP=307;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,106:278:99:2380,0,3467 -chr10 11981405 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-2.010;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:690,0,1642 -chr10 11981406 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-2.300;DP=42;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=15.76;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:690,0,1635 -chr10 11981728 . C G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=-0.838;DP=36;FS=12.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:670,0,667 -chr10 11982469 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=13.38;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:336,0,458 -chr10 11982795 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:248,0,1269 -chr10 11982894 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:309,0,305 -chr10 12068664 . GTT G 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.354;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:348,0,142 -chr10 12659661 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,457 -chr10 12736067 . T C 917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:946,69,0 -chr10 12736088 . G C 862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:891,63,0 -chr10 12847983 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr10 13186504 . G A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-1.852;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=10.16;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:597,0,1276 -chr10 13247681 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.141;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:354,0,598 -chr10 13252394 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:340,0,266 -chr10 13424730 . A T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.654;DP=70;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:542,0,1877 -chr10 13425035 . A AT 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-0.691;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:295,0,1122 -chr10 13493040 . C G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.343;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:687,0,2286 -chr10 14457764 . G GT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.126;DP=120;FS=12.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,22:114:99:279,0,2517 -chr10 14561911 . G A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=1.104;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:751,0,774 -chr10 14571659 . AC A 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.507;DP=62;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:435,0,865 -chr10 14571818 . CA C 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.077;DP=97;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,47:88:99:981,0,1624 -chr10 14584953 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.775;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:351,0,429 -chr10 14899982 . AT A 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=-0.312;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:249,0,467 -chr10 14899986 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=-1.718;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=18.40;ReadPosRankSum=-2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:249,0,467 -chr10 14901550 . C CA 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.644;DP=73;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:300,0,1674 -chr10 15069215 . A C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:254,0,305 -chr10 15283863 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.670;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.56;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:313,0,412 -chr10 15332992 . C CT 644.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53:682,53,0 -chr10 15333341 . T TA 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.607;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:651,0,173 -chr10 15367434 . A T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-2.220;DP=103;FS=8.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:853,0,2711 -chr10 15384864 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.770;DP=54;FS=4.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=6.25;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:366,0,1424 -chr10 15437953 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.279;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:577,0,567 -chr10 15441852 . T C 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=1.859;DP=60;FS=7.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1154,0,873 -chr10 15569441 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.356;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,27:61:99:966,0,1088 -chr10 15569483 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.420;DP=50;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:949,0,792 -chr10 15603929 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.056;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:526,0,2995 -chr10 15609643 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-0.842;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=8.84;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:417,0,1952 -chr10 15609859 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.409;DP=38;FS=7.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:464,0,850 -chr10 15641557 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.052;ClippingRankSum=6.095;DP=98;FS=13.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=2.78;ReadPosRankSum=-5.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:301,0,6302 -chr10 15641564 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=3.611;DP=84;FS=11.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=3.45;ReadPosRankSum=-3.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,5:84:99:318,0,6302 -chr10 15647071 . GCTACAAACACACAAACACTTCATTACACTCATATCAGCGAACAGCACCCGAGACGTTCAGTACACATAC G 3996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.807;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=35.78;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,88:90:99:4034,336,0 -chr10 15665881 . TTCGCTATTAAAATGAATATATAACATTACGC T 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=1.200;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.667;QD=15.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:248,0,240 -chr10 15823828 . TGTGAGTGACTCCATATCCTTTCTGCAAATCTGCAAGCTCTTGGTGTGTGTTGTATTATTGTGGTTCTCTCGATCCACCAG T 1747.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.704;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,40:45:99:1785,0,567 -chr10 15859740 . A T 2447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.056;DP=91;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,67:90:99:2476,0,486 -chr10 16021313 . G GACAGAGGAA 1071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:76:1109,76,0 -chr10 16027531 . A G 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:51:670,51,0 -chr10 16027539 . A C 641.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:670,51,0 -chr10 16030443 . A T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.297;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=31.43;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:59:814,0,59 -chr10 16032022 . GA G 602.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.107;DP=27;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=22.32;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:22:640,0,22 -chr10 16048524 . CTACGCATAGCAAACTCCTGTAAAACTTCTGCACTTTTCCTCAATCCTGTGAATACAATTACTGTAATGCAAACTTACT C 5719.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-1.827;DP=206;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=27.77;ReadPosRankSum=0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,148:203:99:5757,0,1337 -chr10 16078841 . TA T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr10 16084559 . CT C 7510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.760;DP=304;FS=30.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=24.71;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,193:251:99:7548,0,434 -chr10 16084625 . AT A 958.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.101;DP=269;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,73:230:99:996,0,5389 -chr10 16085565 . G A 238.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:267,0,22 -chr10 16342066 . C A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr10 16342078 . G A 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:468,36,0 -chr10 16427223 . CA C 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=1.233;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:83:482,0,83 -chr10 16514960 . TA T 957.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.16;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:995,85,0 -chr10 16517421 . A G 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:235,0,22 -chr10 16699106 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.993;DP=36;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=7.24;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,288 -chr10 16869231 . TCTTTAGAGACAATGGAAAGTTAAGCATTACTTTGAGGTCAAGGCAAATTTAGATCTATCATGAAAAGCAAGTCTTAATGAACTAATTAC T 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=4.557;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=3.08;ReadPosRankSum=-2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,89:97:99:385,0,202 -chr10 17583491 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.956;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=23.56;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:900,0,339 -chr10 17607446 . TCCTGTAAAAAGCCACACACAGCATTGGGCCTTAAGTTCAAACAAATATTTGATTTACATAGAAAAATGTCCGGCTTCATCCAGCAATCGCTCA T 2360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=1.122;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=25.34;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2398,198,0 -chr10 17731773 . C CA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.255;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:238,0,1719 -chr10 17758292 . A AT 2786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=-1.098;DP=162;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=17.20;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,107:152:99:2824,0,728 -chr10 17824525 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr10 17970696 . AAGGTGTCTGATGGATGTGATTTATTGGTTTGCTTGTAAAGAGATTTAATTGTGGTTTTGATGTGGTGATCATGTGTTTTGTTTCTATT A 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-0.092;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=17.64;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:496,0,6355 -chr10 18832176 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=12;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:237,0,101 -chr10 18936289 . A C 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.507;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,54:180:99:1300,0,4743 -chr10 18936491 . C CA 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.079;DP=188;FS=7.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,35:161:99:320,0,3328 -chr10 18937089 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-1.174;DP=114;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:856,0,3054 -chr10 18937166 . G GT 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=-1.580;DP=161;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,32:142:99:324,0,2908 -chr10 18954705 . C A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.141;DP=93;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:286,0,2740 -chr10 18958142 . GTCAGGTACTTTTTCTCCTGAGAACATTGTGGATCATCTAATTTATGAGCTGTACTCTGGCTTATCTTCATTAGCTGTCTGTGTTTGTTTGCGCGTGTGTATGTGTGTGCGTGTTCGC G 2725.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.750;DP=77;FS=2.195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:2763,189,0 -chr10 19024594 . C A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.007;DP=64;FS=3.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:690,0,1369 -chr10 19024946 . G C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=1.464;DP=119;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,29:119:99:682,0,3513 -chr10 19458932 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:260,0,57 -chr10 19459314 . T A 488.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.744;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=34.92;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:515,0,2 -chr10 19549385 . T A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.448;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=32.93;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:588,0,776 -chr10 19549441 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.194;DP=46;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:99:588,0,781 -chr10 19549755 . T C 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:430,30,0 -chr10 19550366 . G A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:26:349,26,0 -chr10 19586825 . TCAGGTGATATGTTTCATTTTTTTACTGTATTATTTTTTTGTAATGTTTACTTATTTTTGCTATGTCATTAAGAGAGACAAACAAACTGTTGGGTTGGTTAAGTTGTGTTTGTTATTGGAATTAAACTGTAAAAGCTCTCTTGTGACTTTAATGTTTATTGTGTGCA T 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=2.180;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=27.77;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:99:426,0,4115 -chr10 19588754 . G C 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-1.142;DP=96;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,30:96:99:813,0,2507 -chr10 19596208 . G C 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.041;DP=73;FS=3.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:873,0,3644 -chr10 19596426 . T G 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.196;DP=61;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,27:61:99:973,0,1177 -chr10 20114604 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.453;DP=92;FS=6.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:429,0,2875 -chr10 20139143 . T C 1996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=1.149;DP=276;FS=7.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,80:275:99:2025,0,7551 -chr10 20165832 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.159;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:721,0,1254 -chr10 20180670 . C T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-0.634;DP=71;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=9.50;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:703,0,2188 -chr10 20260886 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DP=58;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:424,0,1523 -chr10 20268327 . CA C 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.190;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:286,0,302 -chr10 20268609 . A G 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.980;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,38:66:99:1303,0,1220 -chr10 20426810 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:397,0,409 -chr10 20429397 . CGGTAATGCTTCCAGACATAATGCCATGTTACACACTAACACAAACACACACTCTGACATTTTTAATGTGGTGCA C 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=1.604;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=30.95;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:873,0,2413 -chr10 20439681 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,642 -chr10 20441029 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:313,0,735 -chr10 20441034 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:348,0,649 -chr10 20441540 . T C 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr10 20444248 . A T 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr10 20460329 . C T 200.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:14:229,0,14 -chr10 20460439 . A G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.035;DP=46;FS=4.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:531,0,1149 -chr10 20482565 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:274,0,58 -chr10 20482623 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:321,0,173 -chr10 20483055 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:337,0,255 -chr10 20487754 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,384 -chr10 20488846 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-0.064;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:513,0,795 -chr10 20488942 . A C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.054;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:619,0,541 -chr10 20540205 . TA T 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.268;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.938;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:440,0,1523 -chr10 20554784 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.797;DP=45;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:391,0,1207 -chr10 20596899 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.819;DP=52;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:466,0,1262 -chr10 20621749 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-3.199;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:243,0,1211 -chr10 20621994 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=1.440;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:587,0,735 -chr10 20622207 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=1.826;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:301,0,807 -chr10 20644390 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.914;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:831,0,1688 -chr10 20667576 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.090;DP=61;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:371,0,1653 -chr10 20673460 . C G 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-0.478;DP=142;FS=3.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,56:142:99:1909,0,2823 -chr10 20679550 . C G 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.400;DP=120;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,44:120:99:1473,0,2512 -chr10 20681156 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=-0.353;DP=89;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:433,0,2609 -chr10 21486029 . TA T 269.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.20;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:307,27,0 -chr10 21521441 . G A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.520;DP=396;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,98:395:99:2084,0,11426 -chr10 21521504 . CGGTAAAGCTTGTCATCAAACTGATTGCTGAGGCTTCTTTTGTTTTTTTTTTATAGGGTCCTAATTGTACTATTTTACATGAACTGTTTACA C 11381.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.348;DP=348;FS=14.178;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=32.71;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,338:347:99:11473,1063,0 -chr10 21523438 . G A 1278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=-0.805;DP=225;FS=1.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,167:179:99:1307,311,0 -chr10 21551732 . G GA 359.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.250;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:29:422,0,29 -chr10 21727634 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=-1.570;DP=43;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:555,0,965 -chr10 21729712 . TA T 650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.479;DP=53;FS=4.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:688,0,362 -chr10 21734927 . G T 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr10 21738684 . A G 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr10 21738728 . T A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:527,36,0 -chr10 21739223 . T G 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr10 21739556 . T C 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr10 21739894 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,338 -chr10 21740064 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=24.75;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:350,0,123 -chr10 21749974 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr10 21750054 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.07;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,138 -chr10 21750276 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr10 21753642 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:388,0,180 -chr10 21753668 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:407,0,106 -chr10 21754092 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:54:398,0,54 -chr10 21754383 . C T 202.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:231,0,23 -chr10 21757613 . A G 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr10 21757793 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=30.75;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:51:428,0,51 -chr10 21757851 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=-2.177;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:321,0,284 -chr10 21764195 . A G 251.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.49;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:280,0,15 -chr10 21793363 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr10 21842616 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:48:269,0,48 -chr10 21846766 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.370;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:345,0,95 -chr10 21852056 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:265,0,173 -chr10 21852443 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.041;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:530,0,160 -chr10 21852516 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:427,0,241 -chr10 21853796 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:361,0,381 -chr10 21854072 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-1.642;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:408,0,410 -chr10 21862530 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr10 21862693 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr10 21862942 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr10 21863130 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-2.054;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:234,0,102 -chr10 21863688 . C T 211.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:240,0,19 -chr10 22004030 . A C 359.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:10:387,0,10 -chr10 22004498 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.469;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:309,0,477 -chr10 22019737 . C T 1866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1895,135,0 -chr10 22019763 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.270;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:413,0,1400 -chr10 22020547 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=2.073;DP=50;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=28.14;ReadPosRankSum=-2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1435,0,217 -chr10 22020559 . C T 1236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.882;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1265,0,320 -chr10 22020902 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=-0.941;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=9.93;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:465,0,1013 -chr10 22020988 . G A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-2.350;DP=39;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,30:39:99:1109,0,197 -chr10 22021037 . G A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.330;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=30.08;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1021,0,122 -chr10 22021198 . T C 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=1.737;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=31.77;ReadPosRankSum=2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:99:1458,0,125 -chr10 22021284 . G A 1353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1382,96,0 -chr10 22021318 . T C 1076.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1105,78,0 -chr10 22021344 . C A 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1374,99,0 -chr10 22021405 . A G 1826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1855,132,0 -chr10 22021786 . T G 1654.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1683,120,0 -chr10 22022086 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-2.223;DP=69;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:494,0,1862 -chr10 22026557 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,222 -chr10 22026558 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,222 -chr10 22062167 . T G 543.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:572,42,0 -chr10 22345148 . AAT A 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.790;DP=35;FS=2.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,2:30:99:569,0,767 -chr10 22345466 . T A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=-0.425;DP=200;FS=15.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,36:200:99:434,0,9084 -chr10 22677646 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=19.71;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:245,0,129 -chr10 22677663 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:272,0,128 -chr10 22710787 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.713;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,422 -chr10 22716974 . T TGACGG 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-0.662;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1008,0,994 -chr10 22730459 . C CA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.180;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:305,0,430 -chr10 22733193 . TA T 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=-0.563;DP=35;FS=5.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:346,0,603 -chr10 22945811 . G A 2231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-0.564;DP=176;FS=3.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,70:176:99:2260,0,3522 -chr10 22947531 . C T 1841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=1.072;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,58:159:99:1870,0,3316 -chr10 22958324 . AGTGAGTGCAGTGTTGAGGTATTCAAGTTTTCGACACCTATTTTACTGTACTATGGCATTCCAGCTCCTCCTCCTCATCTTCTCTTTCAG A 10524.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.690;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.748;QD=32.21;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,239:244:99:10562,764,0 -chr10 22958540 . TGTGAGGAACATTAAGTATACTGAAGGCATATGATATTGTGTAATGATTCGTTTTATGTGAGTGTGCATATGTGCATATGTGTATGTGTGTTGAACAG T 9435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=3.856;DP=223;FS=6.078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=31.96;ReadPosRankSum=-5.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,201:222:99:9473,846,0 -chr10 22961760 . G C 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-1.203;DP=93;FS=4.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=13.71;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1303,0,2370 -chr10 22972434 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.520;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:391,0,490 -chr10 23037025 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.148;DP=48;FS=9.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:428,0,1435 -chr10 23037731 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:350,0,888 -chr10 23037867 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.850;DP=34;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:257,0,852 -chr10 23050514 . G T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.814;DP=427;FS=0.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:360,66:426:99:608,0,14190 -chr10 23058635 . GAGGTACATTTTTGAAACACAGACTAATGTTCTTTAGAATAATTCCCGCATGGACCGTTTGTGATTTTTTTTATTCTTCTTT G 1000.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.940;DP=32;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=31.27;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:87:1038,0,87 -chr10 23097089 . C T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.867;DP=47;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=18.61;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:903,0,1942 -chr10 23097096 . C A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=-1.038;DP=47;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:759,0,1918 -chr10 23097523 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.291;DP=49;FS=2.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:275,0,1411 -chr10 23106748 . C T 2386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=-1.559;DP=76;FS=6.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,63:76:99:2415,0,222 -chr10 23106901 . T C 2789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-1.109;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=34.44;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,75:81:99:2818,0,519 -chr10 23106906 . AGTAAGCAGAATTTTTCAATATAAATGTTGTGCTTAATGACAATAAGATTCTGTGTTAAGCTTCATTTTCATGTTCCTATTTCTAACAG A 3752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.837;DP=81;FS=7.879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.933;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:3790,299,0 -chr10 23107097 . T C 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.052;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1393,0,1035 -chr10 23107158 . C T 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.813;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=18.30;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:1309,0,1566 -chr10 23107164 . G A 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.308;DP=75;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,30:75:99:1055,0,3369 -chr10 23107551 . TG T 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-1.801;DP=40;FS=10.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=3.943;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:576,0,660 -chr10 23107556 . A T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.643;DP=37;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQ0=0;MQRankSum=4.118;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:576,0,660 -chr10 23107644 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,380 -chr10 23108010 . A C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.682;DP=27;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:360,0,612 -chr10 23110526 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.902;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:641,0,453 -chr10 23112404 . A G 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr10 23112854 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.043;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:466,0,454 -chr10 23112861 . C T 1120.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:81:1149,81,0 -chr10 23118754 . C T 1585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1614,114,0 -chr10 23118778 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.135;DP=54;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:397,0,1458 -chr10 23118864 . A G 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.796;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:720,0,762 -chr10 23118913 . AAGGTAAACATTAGCATCTTTGTACATTATTATTCATATTCTTCAGTGACGGATAAATAAAAAGCAGAAATACTTGTCAATT A 565.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:82:603,82,0 -chr10 23126436 . A T 1421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1450,102,0 -chr10 23126722 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=-0.341;DP=42;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:532,0,941 -chr10 23394974 . ACGG A 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-1.486;DP=58;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:441,0,2941 -chr10 23394978 . TG T 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-0.092;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:794,0,1472 -chr10 23394980 . AGTTCAGGGTTTCAGAAGTGCTATGTGTTCAAGTGTGCTGTGATCTGACGTGTGTTGTCTTCATCAGGTG A 843.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-0.246;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:881,0,1657 -chr10 23397022 . C T 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.829;DP=62;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=12.71;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:816,0,1195 -chr10 24555795 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:271,0,50 -chr10 24755210 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.187;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:375,0,2049 -chr10 24804435 . C A 4432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.035;DP=271;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.510;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,120:271:99:4461,0,5530 -chr10 24804451 . C T 4533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.961;DP=263;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,123:263:99:4562,0,5799 -chr10 24804639 . T TA 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.768;DP=103;FS=7.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:719,0,1535 -chr10 24805603 . T G 3964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-3.649;DP=260;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,103:260:99:3993,0,11199 -chr10 24808961 . C T 2254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=2.677;DP=272;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,85:264:99:2283,0,6701 -chr10 24810355 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=1.068;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=14.17;ReadPosRankSum=2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:340,0,441 -chr10 24873817 . T A 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:721,51,0 -chr10 24930033 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,548 -chr10 24930372 . G C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.705;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:532,0,632 -chr10 25081170 . C CAA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=-1.963;DP=43;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:402,0,739 -chr10 25081710 . T TA 348.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.062;DP=32;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:57:395,0,57 -chr10 25117486 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.380;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:320,0,378 -chr10 25117719 . A G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:408,0,451 -chr10 25136285 . C T 2463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.543;DP=138;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,68:138:99:2492,0,2537 -chr10 25138848 . T TA 2477.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=-1.250;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2649,263,0 -chr10 25147695 . A C 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=-0.339;DP=56;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:851,0,1075 -chr10 25155425 . G C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:304,0,476 -chr10 25157796 . T A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.191;DP=74;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:913,0,1672 -chr10 25168120 . G A 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.021;DP=130;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,56:130:99:1741,0,2350 -chr10 25193623 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.074;DP=52;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:831,0,1703 -chr10 25830742 . C A 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.197;DP=84;FS=8.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,39:84:99:1451,0,1525 -chr10 25835158 . AAGGTACTGTTCTCTCTGCCTGCTTCTTAGATTAGAAACCATGACACATTGAGTCTTTTTAGTCCATTATAAACAATGGGTTCTGCTTTTC A 7333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=-0.851;DP=199;FS=14.255;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,194:198:99:7371,637,0 -chr10 25964320 . TCTGGCATATACACATCACATTATAATCCAAGTAAACAAAAAACAGACAAACAAAAAAAAAACTAAAATCCCAAAAGTGATGAACATGAATGGAGAAAAATGAAAGAGTATACAAATAAGTGTAAGAGATCTAAC T 6256.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=2.448;DP=159;FS=2.326;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=32.56;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,136:151:99:6294,753,0 -chr10 25967903 . TCCTGGGGGAAAAGAACTCCTGTTAGTACCACTTGCCATTTAAGAGACTTTAATTAGAAGTGGTTTTATGTTTGGGTAAGTTTTAAACTGGCTCA T 14561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=2.330;DP=369;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,348:352:99:14599,1049,0 -chr10 25979294 . A T 3236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-1.200;DP=221;FS=11.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,94:220:99:3265,0,4434 -chr10 26127290 . A T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr10 26129618 . T C 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:480,36,0 -chr10 26130697 . C A 513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:542,39,0 -chr10 26130753 . T C 203.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:232,0,23 -chr10 26133811 . G T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 -chr10 26133818 . T C 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:445,30,0 -chr10 26208491 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.661;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:392,0,2007 -chr10 26343619 . TCCTGTGACAGAATCGAATAATGATTAGTGTAAGATTTAATGGCAGTTTTTCCCTGTTATACATCAGTCACAATCCTTTTA T 3761.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.092;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.507;QD=29.54;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,82:86:99:3799,328,0 -chr10 26586566 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.549;DP=203;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,32:203:99:342,0,6648 -chr10 26619552 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.770;DP=38;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=11.86;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:479,0,884 -chr10 26727262 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.798;DP=46;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:236,0,1329 -chr10 26737699 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.517;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:352,0,2144 -chr10 26744992 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.290;DP=54;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:612,0,1191 -chr10 26748836 . A ATT 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.985;DP=51;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:398,0,1214 -chr10 26838231 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:427,0,242 -chr10 26838862 . AT A 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.561;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:306,0,1106 -chr10 26838865 . T A 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.921;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:416,0,1032 -chr10 26839018 . TA T 636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.818;DP=24;FS=2.993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.24;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=26.53;ReadPosRankSum=-1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:39:674,39,0 -chr10 26839793 . T C 208.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:237,0,25 -chr10 27175575 . G A 1292.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1321,99,0 -chr10 27175650 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.553;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=15.06;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:450,0,489 -chr10 27178997 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=-0.247;DP=29;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=21.37;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:648,0,368 -chr10 27194705 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.638;DP=25;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:521,0,346 -chr10 27201763 . C T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.699;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:871,0,482 -chr10 27202300 . G A 333.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.33;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:362,0,15 -chr10 27216532 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.094;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:474,0,295 -chr10 27223445 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.922;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:340,0,180 -chr10 27231318 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.529;DP=18;FS=12.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:331,0,281 -chr10 27231859 . T G 398.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:425,0,4 -chr10 27249989 . G A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.621;DP=39;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:533,0,845 -chr10 27302708 . C A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.164;DP=42;FS=6.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:735,0,718 -chr10 27313561 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-2.033;DP=28;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:572,0,353 -chr10 27562264 . CA C 839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.864;DP=104;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,36:104:99:877,0,1977 -chr10 27594161 . A G 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=-0.528;DP=99;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=18.33;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1843,0,2044 -chr10 27595271 . C T 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.249;DP=48;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:942,0,679 -chr10 27599383 . G A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=1.585;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=18.33;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:633,0,502 -chr10 27601180 . C T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.412;DP=82;FS=1.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1194,0,1529 -chr10 27601317 . T A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.867;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:1195,0,1389 -chr10 27607756 . G C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:606,0,660 -chr10 27607927 . T G 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 -chr10 27622889 . G A 1824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.536;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=12.25;ReadPosRankSum=3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,54:148:99:1853,0,3313 -chr10 27625673 . TGTGAGTACTCCTTTAACATTCAAGTAATGTTATAAAGATATTGTGTTGTGGTAAGGATTATGTTAAGCTAATTAAACGTTTGAATCCTCTCTGTTGTGAAG T 3757.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.883;DP=88;FS=4.974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,83:88:99:3795,170,0 -chr10 27626466 . GAGGTAAAAATCAACCCCCTGTGGCTTGAGATTCTCTGTTATGCTATTGTTGTAGAGACTGACCTTAATTTGCGCTGGAAAAGTCAGAAACTTTGATTTATGAATATTTAGGTCTGATATACTGCATACTTTTCATTTGGATGTTTTCATAAACACAATCTCTTCCCACCCAA G 5663.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=4.390;DP=134;FS=1.362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,126:134:99:5701,471,0 -chr10 27627412 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-1.555;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:429,0,552 -chr10 27642172 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.099;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:350,0,1467 -chr10 27642201 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=-1.062;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:327,0,1486 -chr10 27688303 . AAAGGTAAGTTGTTTTCGTCTCTTTGTCGACACGTTGTCCACTTCACCACACTGTTTAGTTTGGCACACGTGAGTCGGCGCAACAGACAGGCATTTACATTTTTTAGGGCCATGCATTTAATCTGTATTTCACCTT A 3054.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.713;DP=82;FS=2.400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=27.21;ReadPosRankSum=2.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3092,233,0 -chr10 27725288 . G A 4078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.325;DP=281;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,118:281:99:4107,0,5418 -chr10 27731733 . C T 2372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=2.043;DP=183;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=12.97;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,69:183:99:2401,0,4613 -chr10 27793740 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-2.105;DP=60;FS=4.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:459,0,2253 -chr10 27795934 . G A 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.933;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=9.70;ReadPosRankSum=-2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:241,0,459 -chr10 27797461 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=1.181;DP=28;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,762 -chr10 27818736 . A G 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-0.760;DP=84;FS=8.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=7.57;ReadPosRankSum=3.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:664,0,2264 -chr10 27819237 . G C 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.844;DP=111;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,47:111:99:1652,0,2190 -chr10 27819528 . T A 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=1.012;DP=130;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=10.42;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,43:129:99:1383,0,2621 -chr10 27831070 . G T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=1.170;DP=87;FS=7.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:1021,0,1763 -chr10 27832396 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:282,0,276 -chr10 28846793 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-3.642;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:297,0,2580 -chr10 28852563 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-1.465;DP=36;FS=5.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:99:240,0,2110 -chr10 29004895 . AACCTGTAGAGAAAAATCAAAATCAAGATCAATTCTCATGCTGAATGGCTGCACTTAAGCTCATGCATGCTGAAGCATTACTG A 12298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=-0.529;DP=281;FS=2.028;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,261:265:99:12336,1082,0 -chr10 29006327 . TACCTACAAGTGCAAATTGTCATTTGTTTGTTCAGTGCTTGGTCAAAGAGGCTGTGTTGAGCAGTAACTGAAGGTTGCTC T 13821.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=1.722;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=28.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,354:355:99:15167,1156,0 -chr10 29111971 . G C 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr10 29111981 . G A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:395,27,0 -chr10 29112242 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=1.931;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=22.43;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:275,0,96 -chr10 29113402 . AT A 421.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:459,48,0 -chr10 29136430 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr10 29136483 . A C 463.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:3:490,3,0 -chr10 29411554 . C CA 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.022;DP=30;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:351,0,352 -chr10 29414772 . C CT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=1.000;DP=171;FS=2.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,38:151:99:406,0,2792 -chr10 29419144 . ATTTTTTCCTAAAGATACAAATATAGCACTTTATGACTTCCTCTAAAAGCATTATGACTCCTGACCAGGAAAGGGAGACCTGGGAAATAAAAAATGATGGATAGAATTCTGCTATTTGAGACCAAAATAAGTGCTGGGATTATTTGAAGAAGCAT A 774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=12.259;DP=388;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.00;ReadPosRankSum=-7.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,286:360:99:812,0,26142 -chr10 29965392 . A AT 842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=-0.667;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:880,0,876 -chr10 29997753 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=7;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:69:245,0,69 -chr10 29997760 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:69:245,0,69 -chr10 30008493 . T TAA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=-1.077;DP=30;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:355,0,360 -chr10 30593359 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:279,0,172 -chr10 30597370 . TA T 206.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:244,24,0 -chr10 30642584 . G A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.430;DP=42;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:668,0,768 -chr10 30652661 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.480;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:518,0,1412 -chr10 30658027 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.012;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:566,0,498 -chr10 30682086 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=2.387;DP=33;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=22.57;ReadPosRankSum=-2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:773,0,382 -chr10 30724868 . C T 4320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.169;DP=322;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,130:322:99:4349,0,6176 -chr10 30724964 . C T 3142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.705;DP=234;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,93:232:99:3171,0,4709 -chr10 30732005 . C T 1545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=2.263;DP=94;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1574,0,1564 -chr10 30732019 . C T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=1.833;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1551,0,1662 -chr10 30733299 . ATTTTACCTATTTAATGATCAGTGATAAAGGTTGGTATACAAGACGAGATCAGTGAAAAAAATTGAGAAGAGAAGCATAGCGTGGTTTATTAC A 714.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=1.699;DP=117;FS=3.263;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:752,259,0 -chr10 30743705 . A G 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 -chr10 30759479 . C T 3455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-2.262;DP=363;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,132:363:99:3484,0,12821 -chr10 30760264 . ATTCAGGTTTGTACCAAGCAGTTTGCTTTATTTTATTTCACTCGAGCATGCTTGACTCCCTTTTATTGAAATATTTTTATTTTTCCCTCT A 5512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.893;DP=139;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:128:99:5835,544,0 -chr10 30806051 . C T 4308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.312;DP=316;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=13.64;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,116:315:99:4337,0,14437 -chr10 30810834 . CT C 2316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.329;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,71:180:99:2354,0,3546 -chr10 31344872 . C A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.273;DP=18;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=24.65;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:472,0,119 -chr10 32109989 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.810;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:375,0,583 -chr10 32244050 . A G 223.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:252,21,0 -chr10 32244216 . G T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.195;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:568,0,291 -chr10 32244274 . A C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.268;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:77:380,0,77 -chr10 32278762 . CAGGTAATCCATAATAAAGTGTCCATTTACAACCTTTTTCGCCATAGTAAACTTATGTCTACATTTCCTATATTTTTATATTTATTTCT C 1377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-2.400;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.249;QD=28.12;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,36:47:99:1415,0,974 -chr10 32280554 . A C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.694;DP=98;FS=3.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1177,0,1827 -chr10 32340684 . A T 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=-1.053;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.05;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,35:101:99:1043,0,2130 -chr10 32350196 . A G 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.831;ClippingRankSum=-0.232;DP=86;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1377,0,1192 -chr10 32366576 . G A 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.869;DP=109;FS=4.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,54:108:99:1766,0,1769 -chr10 32453132 . G GA 724.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-0.820;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,38:80:99:826,0,912 -chr10 32682048 . A C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,286 -chr10 32693543 . TA T,TAA 1254.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.360;DP=79;FS=5.425;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,29,33:73:99:1388,722,1144,644,0,1023 -chr10 33027730 . G GATCC 1442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,43:136:99:1480,0,3678 -chr10 33037827 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.911;DP=92;FS=4.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=5.13;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:500,0,2736 -chr10 33452825 . TA T 940.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.292;DP=91;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:978,0,1389 -chr10 33453076 . A C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.778;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:696,0,1378 -chr10 33453203 . T A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=1.549;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:505,0,507 -chr10 33454859 . T TA 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.123;DP=42;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:280,0,650 -chr10 33454878 . AT A 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.251;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:364,0,2140 -chr10 33454991 . A AT 1348.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.57;MQ0=0;QD=23.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1458,149,0 -chr10 33455598 . C T 6984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:7013,495,0 -chr10 33455659 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.153;DP=120;FS=9.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:293,0,2960 -chr10 33455700 . T C 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.338;DP=113;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=14.42;ReadPosRankSum=-2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,49:79:99:1658,0,1567 -chr10 33455716 . T C 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.966;DP=106;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,48:75:99:1655,0,932 -chr10 33456453 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=-2.084;DP=37;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:470,0,886 -chr10 33459978 . A T 5391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:5420,391,0 -chr10 33517013 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=18.54;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:362,0,272 -chr10 33543932 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,303 -chr10 33544170 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,348 -chr10 33544276 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:333,0,45 -chr10 33545714 . T A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=33.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:231,0,186 -chr10 33604211 . T A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=21.80;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:377,0,205 -chr10 33615187 . C T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=-0.264;DP=68;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,34:68:99:1182,0,1215 -chr10 33777922 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-0.710;DP=33;FS=5.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,628 -chr10 33786060 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.970;DP=31;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:353,0,661 -chr10 33786462 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=-1.045;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:450,0,582 -chr10 33812645 . AT A 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.518;DP=43;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:397,0,559 -chr10 33848710 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:359,0,316 -chr10 33855622 . CA C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.929;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=7.28;ReadPosRankSum=-2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:321,0,391 -chr10 33855967 . GA G 923.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.753;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:961,0,868 -chr10 33856792 . G C 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.059;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:997,0,1629 -chr10 33858380 . C T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.768;DP=73;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:1003,0,1365 -chr10 33875320 . C A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.080;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:606,0,797 -chr10 33875365 . G T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.491;DP=45;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:708,0,813 -chr10 33875440 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.667;DP=59;FS=6.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:469,0,1487 -chr10 33894340 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.928;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:620,0,790 -chr10 34134532 . C T 7991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.887;ClippingRankSum=-0.031;DP=493;FS=7.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,222:489:99:8020,0,8402 -chr10 34209220 . A G 698.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:727,54,0 -chr10 34218091 . TCTAGGGACAAAACAAAGCAGTCAGCAGTACGAACAGACAATCCACAGAGGAAGAGAGGATACATTATAAAGGCTAGCCGCAC T 1434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-0.709;DP=37;FS=7.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:99:1472,0,1790 -chr10 34218232 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.428;DP=76;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:240,0,2047 -chr10 34257890 . T G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.833;DP=44;FS=6.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:836,0,838 -chr10 34257955 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.450;DP=44;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=16.93;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:773,0,1596 -chr10 34257970 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=2.462;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=24.02;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:773,0,1528 -chr10 34258165 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.442;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:307,0,1378 -chr10 34259374 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.919;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=4.31;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:321,0,1941 -chr10 34259828 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.428;DP=41;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:452,0,801 -chr10 34260193 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=1.240;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,1997 -chr10 34260196 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=1.625;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:293,0,1997 -chr10 34260317 . A G 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.273;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:504,0,679 -chr10 34260752 . C G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=1.149;DP=40;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=18.34;ReadPosRankSum=2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:762,0,605 -chr10 34260817 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.948;DP=53;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=12.45;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:688,0,2593 -chr10 34260820 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=1.212;DP=57;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:688,0,2593 -chr10 34260928 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-1.590;DP=59;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=14.50;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:884,0,978 -chr10 34261190 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=2.131;DP=41;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:377,0,1491 -chr10 34261285 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.314;ClippingRankSum=-0.992;DP=53;FS=7.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:869,0,898 -chr10 34261437 . G T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.420;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:920,0,527 -chr10 34261661 . G C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.874;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:286,0,844 -chr10 34261895 . A T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.485;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:468,0,828 -chr10 34261948 . G A 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.520;DP=56;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1097,0,845 -chr10 34262094 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.832;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=11.70;ReadPosRankSum=2.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:473,0,863 -chr10 34262118 . G C 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=2.938;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=16.31;ReadPosRankSum=-2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:648,0,708 -chr10 34262149 . G A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=1.121;DP=52;FS=3.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=18.90;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1011,0,756 -chr10 34262313 . C G 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.088;DP=66;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1016,0,1056 -chr10 34270605 . T C 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 -chr10 34270617 . A T 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr10 34270629 . G A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr10 34283330 . C G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-0.623;DP=44;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:270,0,1262 -chr10 34331923 . CAT C 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=1.080;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:362,0,671 -chr10 34346675 . T C 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.885;DP=48;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:803,0,766 -chr10 34567426 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.779;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:242,0,1041 -chr10 34568158 . A C 2899.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.101;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,6:13:72:2928,72,0 -chr10 34568262 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=-1.176;DP=110;FS=12.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=2.38;ReadPosRankSum=-3.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:290,0,2754 -chr10 34568292 . T C 2899.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-1.007;DP=66;FS=3.547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:72:2928,72,0 -chr10 34642324 . GC G 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=1.180;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.26;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:492,0,756 -chr10 35690502 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.548;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:306,0,962 -chr10 35690590 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.129;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:298,0,976 -chr10 35693059 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.292;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:352,0,638 -chr10 35731895 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-2.023;DP=28;FS=6.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:363,0,591 -chr10 35753059 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.012;DP=49;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:253,0,1362 -chr10 35757846 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.695;DP=44;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:345,0,1156 -chr10 35762497 . GA G 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.376;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:281,0,431 -chr10 35762867 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.42;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,494 -chr10 35766366 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-2.029;DP=40;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:454,0,776 -chr10 35894017 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-2.100;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:690,0,656 -chr10 35984597 . AT A 663.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=1.074;DP=67;FS=3.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:701,0,954 -chr10 36008093 . C CT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.100;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:437,0,315 -chr10 36012587 . T C 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-0.521;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,47:167:99:1085,0,4427 -chr10 36016003 . A G 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.932;DP=188;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,54:188:99:1337,0,5137 -chr10 36032401 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-2.785;DP=101;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=2.79;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,19:101:99:310,0,3178 -chr10 36190286 . G T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.696;DP=37;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:543,0,797 -chr10 36192697 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.657;DP=73;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1298,0,1324 -chr10 36192963 . GA G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=-0.304;DP=61;FS=6.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:268,0,1202 -chr10 36193352 . AT A 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=-1.408;DP=94;FS=6.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=5.69;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:681,0,1006 -chr10 36200795 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=2.685;DP=88;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=3.69;ReadPosRankSum=-3.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,15:88:99:353,0,5628 -chr10 36200975 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.984;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:612,0,1855 -chr10 36269377 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.136;DP=42;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:340,0,1097 -chr10 36269389 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.343;DP=37;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:308,0,933 -chr10 36322170 . A G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.132;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:698,0,2379 -chr10 36327440 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.946;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,21:128:99:257,0,4061 -chr10 36344914 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=1.687;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:284,0,793 -chr10 36455003 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=-0.614;DP=108;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,18:108:99:232,0,3519 -chr10 36461231 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:275,0,519 -chr10 36461374 . A G 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=1.480;DP=22;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:532,0,272 -chr10 36619107 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.804;DP=44;FS=2.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.252;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,1239 -chr10 36623762 . G A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.637;DP=39;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:770,0,611 -chr10 36626913 . T G 1451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.948;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=31.50;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:66:1480,66,0 -chr10 36627131 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.362;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=30.31;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:998,0,114 -chr10 36630866 . G A 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.503;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:835,0,331 -chr10 36631635 . C G 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.094;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=26.29;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:922,0,444 -chr10 36631638 . T C 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-1.194;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:66:1177,0,66 -chr10 36633886 . C T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-0.733;DP=61;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=17.82;ReadPosRankSum=2.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1115,0,953 -chr10 36634371 . T G 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.574;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:99:1048,0,676 -chr10 36634518 . G A 1052.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.028;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=32.90;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:16:1081,0,16 -chr10 36634557 . A C 1038.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.100;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.238;QD=33.51;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:5:1066,5,0 -chr10 36634842 . T A 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.651;DP=26;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=27.84;ReadPosRankSum=-0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:95:752,0,95 -chr10 36635205 . C G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=2.212;DP=26;FS=4.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=30.99;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:88:834,0,88 -chr10 36635237 . A C 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=2.121;DP=33;FS=6.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=27.05;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:921,0,167 -chr10 36635284 . C T 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=-0.338;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=23.84;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:934,0,408 -chr10 36635346 . G T 1525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.449;DP=50;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1554,0,174 -chr10 36635459 . C G 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.198;DP=33;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1006,0,164 -chr10 36635612 . T G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=1.956;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=18.31;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:614,0,496 -chr10 36635751 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.228;DP=37;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:656,0,899 -chr10 36635752 . A G 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.125;DP=31;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=30.15;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1114,0,110 -chr10 36635821 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.208;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:504,0,516 -chr10 36636174 . A T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.366;DP=38;FS=11.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:964,0,354 -chr10 36636228 . A C 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=-0.023;DP=31;FS=6.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:798,0,218 -chr10 36673059 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,302 -chr10 36673060 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,302 -chr10 37242466 . T TTA 4990.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.141;DP=278;FS=7.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,130:277:99:5028,0,5013 -chr10 37243788 . TCTGAGGAAGAAAAGAAGAAAAAAAAAAGTTGGGATAGGAGGGGAAAATGGCTTTAACACGATGTAAATGAGAGGTGTGACTGAC T 16425.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=1.554;DP=393;FS=4.394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=32.18;ReadPosRankSum=-2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,373:384:99:16463,1289,0 -chr10 37543912 . AT A 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=-0.817;DP=71;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:602,0,1413 -chr10 37544696 . TG T 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.935;DP=35;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=18.11;ReadPosRankSum=2.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:671,0,1781 -chr10 37544698 . TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG T 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.250;DP=40;FS=5.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:664,0,1781 -chr10 37586198 . T G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.331;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=30.49;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:78:638,0,78 -chr10 37586309 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.421;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:404,0,717 -chr10 37855837 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=2.578;DP=60;FS=4.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=4.20;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:280,0,1624 -chr10 37856481 . GA G 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.144;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:516,0,467 -chr10 37859988 . C A 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.820;DP=100;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:100:99:1225,0,2107 -chr10 37870381 . G GT 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-0.789;DP=104;FS=9.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,29:95:99:507,0,1768 -chr10 37898332 . C G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-0.753;DP=28;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:396,0,555 -chr10 37933931 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.916;DP=95;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:375,0,2890 -chr10 37946160 . C A 702.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-0.456;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=34.44;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:731,17,0 -chr10 37948921 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.988;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:445,0,801 -chr10 37948966 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=29.06;ReadPosRankSum=-1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:50:377,0,50 -chr10 37952480 . A G 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.788;DP=75;FS=6.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,60:75:99:2200,0,307 -chr10 37952532 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.372;DP=148;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:250,0,4486 -chr10 37952637 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-1.755;DP=33;FS=16.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:273,0,799 -chr10 37952660 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.386;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:251,0,705 -chr10 37952714 . A C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.149;DP=48;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:44:99:1021,0,498 -chr10 37954210 . A C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.727;DP=28;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:533,0,364 -chr10 37954373 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.279;DP=40;FS=8.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:270,0,1049 -chr10 37954638 . A C 4797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.237;DP=171;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,128:171:99:4826,0,982 -chr10 37954950 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.658;DP=180;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,33:180:99:495,0,5791 -chr10 37954972 . G T 3305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.250;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,99:173:99:3334,0,2662 -chr10 37955115 . T TA 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.380;DP=141;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,28:136:99:252,0,2955 -chr10 37955170 . A C 4242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-0.938;DP=131;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=32.39;ReadPosRankSum=-1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,110:131:99:4271,0,206 -chr10 37955303 . A T 2504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-1.072;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:2533,0,1624 -chr10 37955339 . T A 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-1.116;DP=106;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,41:106:99:1414,0,2313 -chr10 37955408 . T A 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=1.102;DP=113;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:1624,0,2485 -chr10 37955635 . TC T 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.138;DP=89;FS=6.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:614,0,1238 -chr10 37955692 . C T 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.673;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1058,0,809 -chr10 38038041 . G C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr10 38302737 . T C 1029.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.859;DP=53;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:1067,0,1925 -chr10 38302746 . A G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.136;DP=53;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.985;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:1103,0,2041 -chr10 38403277 . T C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.115;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=27.76;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:528,0,112 -chr10 38462707 . A G 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.391;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,37:116:99:998,0,3381 -chr10 38462718 . A G 3216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=1.125;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,85:121:99:3245,0,1065 -chr10 38462856 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=-0.808;DP=81;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=2.50;ReadPosRankSum=-1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:231,0,3868 -chr10 38496478 . ACAGGGTAAACAATCCCTTATTATGATCAATATTGGCACTGCAGTGATTTGGTGAAACCCTTGTG A 1373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=1.192;DP=76;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1411,0,2206 -chr10 38496481 . GGGTAAACAATCCCTTATTATGATCAATATTGGCACTGCAGTGATTTGGTGAAACCCTTGTGAAGTGAATATGTGTTTGTGTTTTAA G 1195.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-0.801;DP=76;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=15.73;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1233,0,2192 -chr10 38496545 . GTGAATATGTGTTTGTGTTTTAA G 1373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=1.529;DP=74;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=18.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1411,0,2206 -chr10 38500170 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.314;DP=47;FS=16.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=7.53;ReadPosRankSum=-3.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:382,0,1383 -chr10 38560751 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:284,0,232 -chr10 38722760 . TGTAAGTTCAACTGCAAACCACTGACTCTCCATTAGACTGGATATAAATGCTGAAATTTCATTGTGTTTTGCTTTTTTTCAG T 1654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=1.639;DP=37;FS=3.378;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=27.21;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1692,139,0 -chr10 38730063 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.646;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:369,0,683 -chr10 38730181 . C G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=1.025;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.34;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,820 -chr10 38819758 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:263,0,95 -chr10 38820250 . C G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:357,0,159 -chr10 39448393 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.60;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:241,0,67 -chr10 40051756 . TA T 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=-1.128;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=9.65;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:510,0,394 -chr10 40427430 . ACG A 9354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=1.245;DP=544;FS=0.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,265:543:99:9392,0,10490 -chr10 40427433 . TGAGTATACTTTTTAAATGTATATAATTCACATATATTCAACAGCTATAGGAAGTATTCCCAGTTGTTTACATATTAATTGATGTGTTATTACTCTCTTCGTTTTCAG T 9393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=1.087;DP=544;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,264:544:99:9431,0,10110 -chr10 40439682 . AGTATGAATCTGTTTGTATGCTTATGCTGGATTTACTGTTAGTTATCCATATTTGTAGTTTATTTTTATTTGTGTGTGTGTGTTACAG A 2168.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=1.938;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=32.37;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,60:64:99:2457,0,125 -chr10 40443727 . AAGGTAAGAGTGCTCCCAATATACAAGCCTGATTTTATTAGACCACACTGATTTCCTGTCTTTCTTCTTGAATGATCTC A 1380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=1.988;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=30.32;ReadPosRankSum=-1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:1418,0,1002 -chr10 40494820 . GCCTGGAAAACATCTCAGAGTCAGTTTACATCTCTATTCGAGTAGCTGAGAAATAAGTCTGCAAACAAAAAAAAAGCATTTGAGCAAAAACAATGGGCAAAACACTATTACAATGTGCCTCTGCA G 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=7.062;DP=126;FS=24.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=2.38;ReadPosRankSum=-8.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,83:126:99:337,0,15740 -chr10 40574605 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr10 40574710 . AT A 280.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=20.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:318,30,0 -chr10 40575050 . T A 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr10 40650862 . AG A 1233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.535;DP=76;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1271,0,1314 -chr10 41268738 . A T 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-1.804;DP=90;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,35:90:99:1105,0,2064 -chr10 41268972 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.674;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:699,0,1516 -chr10 41475572 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.367;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,261 -chr10 41479699 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:272,0,441 -chr10 41644412 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:244,0,179 -chr10 41663001 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.416;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:349,0,487 -chr10 41680584 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,961 -chr10 42188357 . C T 3260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=-0.648;DP=399;FS=7.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,133:398:99:3289,0,12720 -chr10 42654880 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-0.529;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:290,0,854 -chr10 42655085 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-2.762;DP=29;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:527,0,413 -chr10 42681867 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.233;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:429,0,1173 -chr10 42681920 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.518;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:429,0,1216 -chr10 43287111 . A G 439.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.935;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:4:466,0,4 -chr10 43500300 . A T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=-1.667;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,2:16:99:978,0,371 -chr10 43500481 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.908;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:241,0,1070 -chr10 43500745 . T C 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=-1.124;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=34.87;ReadPosRankSum=3.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:1179,0,490 -chr10 43501139 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:353,0,189 -chr10 43501599 . T C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=2.342;DP=26;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=25.77;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:1021,0,116 -chr10 43502017 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=31.15;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:402,0,132 -chr10 43502032 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.695;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:587,0,329 -chr10 43502329 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.280;DP=19;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:395,0,291 -chr10 43527724 . G A 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=-0.054;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=17.84;ReadPosRankSum=2.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1188,0,990 -chr10 43527748 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.203;DP=71;FS=3.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:339,0,2025 -chr10 43529044 . C CT 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=-0.436;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:405,0,670 -chr10 43560970 . G GA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.814;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:523,0,2895 -chr10 43561231 . G T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=-0.917;DP=94;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,29:94:99:604,0,3058 -chr10 43662625 . G GA 532.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.479;DP=121;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,34:113:99:570,0,2130 -chr10 43662716 . C T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-0.292;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:1182,0,1469 -chr10 43904895 . C CA 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-2.771;DP=219;FS=12.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,56:188:99:466,0,4619 -chr10 44417111 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=1.050;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:429,0,268 -chr10 44703163 . AC A 1977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=5.526;DP=225;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=8.79;ReadPosRankSum=6.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,139:218:99:2015,0,3608 -chr10 44740730 . CTA C 1757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-1.111;DP=171;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,72:157:99:1795,0,2962 -chr10 44748945 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.756;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:416,0,501 -chr10 44827980 . T G 716.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:745,54,0 -chr10 44914344 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.652;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:319,0,886 -chr10 44928257 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:256,0,701 -chr10 45367998 . CTGATGAGCAGATTTTGAGAGAGTTAAAGACATGCTAAAGTATAAAAAATATACCACTTATTG C 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=1.226;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:503,0,3973 -chr10 45368063 . CACTTACCATT C 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.551;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:503,0,3281 -chr10 45549949 . C T 2913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.102;DP=470;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,129:470:99:2942,0,25514 -chr10 45552553 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=3.363;DP=25;FS=8.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.412;QD=30.51;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:791,0,268 -chr10 45552554 . A T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=3.262;DP=21;FS=5.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.03;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:791,0,276 -chr10 45554111 . C CG 1197.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=3.517;DP=46;FS=20.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQ0=0;MQRankSum=3.067;QD=26.04;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:99:1235,0,133 -chr10 45554114 . G C 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=2.367;DP=12;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=26.64;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:1235,0,128 -chr10 45619715 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.447;DP=40;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:492,0,813 -chr10 45621070 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=10.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:229,0,510 -chr10 45621094 . G C 679.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:708,51,0 -chr10 45705415 . TCTGTGGGATAACACACTCTTCAGACCCTCACGTTTACTCACACCTTTACCTGCAGCAGTGGAGCACTTATGATCTTCAGCATCAC T 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.458;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:448,0,2847 -chr10 45718784 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.053;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:283,0,851 -chr10 45923434 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.747;DP=36;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:360,0,877 -chr10 46007764 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=1.113;DP=545;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:467,76:543:99:411,0,17251 -chr10 46044017 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=1.493;DP=34;FS=5.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:266,0,881 -chr10 46152222 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-0.074;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:375,0,564 -chr10 46152225 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-0.334;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:317,0,830 -chr10 46152957 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.177;DP=67;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:826,0,1519 -chr10 46154043 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-2.622;DP=57;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:751,0,1268 -chr10 46154136 . T C 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-0.470;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=20.31;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:597,0,454 -chr10 46154143 . T C 1202.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=-1.051;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:48:1231,48,0 -chr10 46309274 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=-0.530;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:316,0,224 -chr10 46337719 . T C 502.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-1.350;DP=16;FS=3.233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=31.44;ReadPosRankSum=-1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,14:16:5:530,5,0 -chr10 46337769 . C T 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr10 46366771 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-1.669;DP=462;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:393,68:461:99:510,0,15068 -chr10 46381158 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.555;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:266,0,210 -chr10 46467079 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.171;DP=92;FS=5.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:279,0,2568 -chr10 46490701 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.225;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:341,0,1120 -chr11 8634 . C A 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.853;DP=43;FS=3.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1170,0,307 -chr11 25347 . C T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.280;DP=77;FS=4.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:1305,0,1390 -chr11 35120 . G C 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-0.950;DP=77;FS=1.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1582,0,1052 -chr11 36245 . G A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.128;DP=64;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:854,0,1182 -chr11 36610 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.442;DP=67;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.398;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:272,0,2000 -chr11 37088 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.411;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:285,0,961 -chr11 45143 . T A 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-0.028;DP=62;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:996,0,1122 -chr11 48626 . C A 3188.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-0.946;DP=196;FS=9.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,93:196:99:3217,0,3642 -chr11 48781 . AC A 4873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=2.046;DP=43;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=32.09;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:4911,0,1999 -chr11 49534 . C T 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=-2.884;DP=33;FS=6.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=28.11;ReadPosRankSum=2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:956,0,165 -chr11 49704 . G C 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-0.127;DP=96;FS=18.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1645,0,1578 -chr11 74535 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.058;DP=103;FS=2.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:1288,0,2118 -chr11 74779 . AACCTGCACAGCACAGCACAGAACACACTCTCAGCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGTGTGTATATATGTGTGTGTCTT A 7303.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=3.363;DP=188;FS=2.051;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=32.11;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,177:181:99:7341,713,0 -chr11 76370 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=28.34;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:340,0,52 -chr11 76440 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:265,0,95 -chr11 80772 . ACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGCTTTACTGCAGATCT A 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=4.441;DP=92;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=2.81;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,12:78:99:296,0,17246 -chr11 87458 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=2.442;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:325,0,1251 -chr11 87794 . G T 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=-2.267;DP=97;FS=3.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,36:96:99:1032,0,2629 -chr11 91107 . C T 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=-0.518;DP=79;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,28:79:99:871,0,1678 -chr11 99879 . G A 5167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-4.070;DP=348;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,147:348:99:5196,0,9665 -chr11 100444 . G A 4412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.785;DP=317;FS=4.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,132:317:99:4441,0,6121 -chr11 101582 . T C 4628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.001;DP=344;FS=4.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,140:344:99:4657,0,6821 -chr11 101678 . G A 4990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.065;DP=344;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,146:344:99:5019,0,6569 -chr11 104314 . CCCTGAACAGAACACAGACCGATCGTCAGCAAGCAGAACTCAGACTACACCATGGTCATTACAGTTAGTGAAACCAGGTCTACATATCCTCCCTA C 14884.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=2.422;DP=355;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.241;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,351:353:99:14922,1259,0 -chr11 106160 . CCCTGCAAACATTTTAAAAATGAGCATTTACTTATCAACACATTAATTTATCTGCATGTCCTGTGTCTACTTGATCTTGTACTTA C 17315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=1.466;DP=380;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,376:377:99:17353,1585,0 -chr11 107705 . C A 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-1.108;DP=76;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1309,0,1332 -chr11 111242 . CCCTGCAGAACACAGACGACTTGTCAGCCGGATGCTGTTCAGTAAAGATAGAGCTCAGTAATCCTCAATGCCTCA C 16094.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=2.118;DP=392;FS=2.055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=29.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,364:367:99:16132,1202,0 -chr11 111424 . CCCTAAAGAAACAATACGATCAGCCTCCGCAGAGATCATCAAGAGTTTGGAAGAATGTAAACAACAGAACTCA C 16020.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=1.587;DP=380;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,363:366:99:16058,1100,0 -chr11 112996 . CCCTAAAACACACACGTACAGACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATCAGACAGATGTTCTCTGGAGTGGTCAAATGGACAAAATATCCTCATGTACGCA C 15675.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=1.915;DP=355;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,351:354:99:15713,1414,0 -chr11 132950 . A T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=1.276;DP=55;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:378,0,1516 -chr11 132968 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=1.099;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:320,0,1638 -chr11 135155 . C A 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=1.209;DP=62;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:1349,0,772 -chr11 139180 . A G 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.309;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,44:84:99:1385,0,1358 -chr11 140817 . G T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.692;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:496,0,517 -chr11 183783 . T C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-2.938;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:446,0,655 -chr11 184014 . A T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=1.920;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:614,0,1276 -chr11 184228 . T C 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.732;DP=25;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:734,0,147 -chr11 185382 . G A 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=1.206;DP=149;FS=1.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,66:149:99:2161,0,2593 -chr11 188453 . A T 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-1.713;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:674,0,1017 -chr11 189493 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=1.120;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,203 -chr11 202850 . AGTACACACACCTCACAACTACATTTCCCAGCATGCCTCCTGATACACCTGTAGCTCCGCCCTCTGCATGTGTTCATGTGGGCTGAAAATGAAAATGCATAATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCACTGTGCAG A 557.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:57:595,57,0 -chr11 212851 . GACCTGAGCGAGGAGAGGGACAGCAGACGGTCAGCACGGTAAACACTGATATCACCGCAGTAAAACACACACACACACACACAC G 13801.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.167;DP=423;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=32.63;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,405:408:99:13839,1179,0 -chr11 212971 . C T 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.018;DP=373;FS=0.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,80:370:99:1408,0,10518 -chr11 213010 . C G 6428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=1.827;DP=380;FS=8.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,182:378:99:6457,0,6318 -chr11 234866 . A C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.368;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:510,0,1397 -chr11 235488 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-1.658;DP=17;FS=10.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:412,0,202 -chr11 236093 . G C 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.193;DP=52;FS=3.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,28:52:99:908,0,1006 -chr11 236145 . T A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.671;DP=48;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:975,0,582 -chr11 247109 . C T 5995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.404;DP=313;FS=8.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,186:313:99:6024,0,4222 -chr11 248486 . A G 6561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-1.493;DP=337;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,202:337:99:6590,0,4507 -chr11 254574 . G A 5850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.282;DP=351;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=16.67;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,182:330:99:5879,0,5039 -chr11 255762 . C T 5370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.179;DP=320;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.210;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,153:319:99:5399,0,5284 -chr11 264993 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:327,0,170 -chr11 267931 . A AT 871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-1.567;DP=88;FS=9.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:909,0,2775 -chr11 268851 . G C 1777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.287;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,55:124:99:1806,0,2016 -chr11 278025 . G A 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.612;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:1470,0,2063 -chr11 308047 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.968;DP=79;FS=3.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:342,0,2313 -chr11 308122 . G A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.496;DP=93;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1644,0,1589 -chr11 309081 . T A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:386,0,404 -chr11 310387 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr11 318186 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:319,0,313 -chr11 318225 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:330,0,248 -chr11 327480 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.375;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:388,0,1030 -chr11 327495 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.742;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:388,0,1033 -chr11 327691 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.564;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,451 -chr11 416754 . TCCTACAGGCAAAAAAGGAAAAACATCATGACAGAAAACATTTATATAAATGAGTTCTTCAAATCCTTTTGTTCTTTTAACCAAAAATATGAGCGTTATTAATCAAAAGAGAATTATCATCATCATCATCATCATCACACATGTTCA T 12776.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=2.213;DP=307;FS=2.086;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=25.35;ReadPosRankSum=-2.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,293:297:99:12814,975,0 -chr11 434260 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=24.49;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:420,0,162 -chr11 440148 . T G 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.763;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:772,0,800 -chr11 442797 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=1.582;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:343,0,679 -chr11 442799 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.564;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:361,0,656 -chr11 442853 . G T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-1.200;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=16.60;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:410,0,442 -chr11 442867 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.605;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:446,0,406 -chr11 443060 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-1.879;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:330,0,396 -chr11 443232 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.635;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:314,0,706 -chr11 444474 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.602;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:240,0,1232 -chr11 461578 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.302;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.578;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:317,0,1351 -chr11 461781 . G C 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=-1.296;DP=75;FS=7.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1125,0,1579 -chr11 463707 . G A 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.745;DP=112;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:2048,0,4306 -chr11 463716 . G A 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.418;DP=114;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,52:114:99:2048,0,4186 -chr11 478628 . G A 3576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.429;DP=246;FS=10.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=14.54;ReadPosRankSum=3.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,104:246:99:3605,0,5041 -chr11 530550 . GAC G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.469;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:457,0,303 -chr11 530650 . A AGT 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-1.286;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:893,0,675 -chr11 557714 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.812;DP=28;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:423,0,532 -chr11 558371 . T G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.134;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:313,0,1590 -chr11 579403 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.635;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:232,0,601 -chr11 692899 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.456;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,364 -chr11 733531 . C A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=-1.698;DP=63;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:771,0,1264 -chr11 733561 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-1.293;DP=67;FS=9.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:839,0,1290 -chr11 736899 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-0.192;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.053;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:397,0,938 -chr11 795226 . C T 3101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.018;DP=176;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,89:176:99:3130,0,2989 -chr11 797947 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.833;DP=192;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,40:192:99:656,0,5323 -chr11 799302 . C T 2378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-1.490;DP=154;FS=4.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,68:154:99:2407,0,2840 -chr11 799998 . A G 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-1.608;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=7.19;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:596,0,2250 -chr11 801617 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,188 -chr11 801618 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,180 -chr11 801855 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:288,0,208 -chr11 802112 . TGCACATCTGTGTTGGTGTGTGCATCGGGTGCATGCATTCATGCGTGTGTGTGTGGGGGGTGGGGGGTGGGGGGTGCGTGTGCCTGCGTGTGTGC T 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.510;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=13.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:504,0,2342 -chr11 1313806 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.182;DP=210;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,31:210:99:274,0,6764 -chr11 1350794 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=3.732;DP=184;FS=9.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,38:184:99:647,0,9897 -chr11 1354889 . C T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.723;DP=146;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,34:143:99:722,0,3967 -chr11 1393358 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.414;DP=38;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=6.28;ReadPosRankSum=2.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:267,0,1023 -chr11 1489581 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=-0.965;DP=157;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,34:157:99:701,0,4782 -chr11 1519680 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.390;DP=142;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,29:142:99:491,0,8093 -chr11 1527214 . T C 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.055;DP=114;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:489,0,2954 -chr11 1527244 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.874;DP=125;FS=8.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:656,0,3319 -chr11 1535377 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.535;DP=130;FS=8.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,33:130:99:724,0,3673 -chr11 1538588 . CA C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-2.441;DP=81;FS=12.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=2.80;ReadPosRankSum=2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:264,0,6082 -chr11 1538591 . T G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-2.034;DP=80;FS=12.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:254,0,6082 -chr11 1538886 . A G 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-1.170;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=34.42;ReadPosRankSum=-2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:1577,0,2660 -chr11 1539171 . A G 1980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.186;DP=74;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=26.77;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:2009,0,1908 -chr11 1726276 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.549;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.033;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:280,0,520 -chr11 2033550 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=-1.314;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:362,0,1884 -chr11 2033621 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.412;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:483,0,524 -chr11 2228055 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.806;DP=409;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:351,56:407:99:304,0,15930 -chr11 2230501 . G T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-3.189;DP=39;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:685,0,710 -chr11 2231776 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.656;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.789;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:298,0,499 -chr11 2232429 . T C 1093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=32.28;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:78:1122,78,0 -chr11 2233513 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.500;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:276,0,1220 -chr11 2340595 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=21.91;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:313,0,135 -chr11 2491577 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:238,0,466 -chr11 2589705 . A G 212.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:241,21,0 -chr11 2596448 . C A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-2.045;DP=102;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:716,0,2458 -chr11 2596481 . T C 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.136;DP=97;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:1342,0,1728 -chr11 2597345 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,219 -chr11 3360491 . TCTAAAAAAAGCAACAGTGAGACCCCTCAGTTTTACAATGAAGTGTAGAGCACACAGTGAAGCAGATGATGGATCTTCAC T 4929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=1.861;DP=124;FS=2.084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=32.31;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,119:123:99:4967,359,0 -chr11 3367460 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:285,0,280 -chr11 3367499 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.150;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:291,0,248 -chr11 3400007 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.209;DP=24;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:298,0,430 -chr11 3401068 . GT G 714.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.401;DP=29;FS=3.150;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=2.096;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:52:752,52,0 -chr11 3655717 . T C 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 -chr11 3656003 . T C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-1.130;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:451,0,892 -chr11 3656008 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.178;DP=29;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=7.58;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:248,0,1162 -chr11 3666945 . GCTGCAAAGCAAAAGGAGCAGAATACAGTTTGTGTTGAGACAATGACAGACTAGTTGAACAATTAATTTAATAAACGCTCAC G 1328.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=2.550;DP=34;FS=6.384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=29.76;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,31:34:36:1366,36,0 -chr11 3687363 . CCCTGGGAAAATATCAATTCGTTAGTTTCAAGTTTGCATTAAGCAGTCTAAAAGTTGTGTTGGCTTTTAGTTTTTGTCTTCCCA C 2626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=1.820;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=29.51;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,74:88:99:2664,0,3090 -chr11 3691212 . A C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=2.377;DP=76;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=15.68;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1220,0,1411 -chr11 3910150 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,479 -chr11 3922268 . A T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.413;DP=109;FS=9.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:432,0,3159 -chr11 3955825 . TCA T 1193.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-3.170;DP=284;FS=13.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,68:273:99:1231,0,11299 -chr11 3961226 . G A 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=1.119;DP=374;FS=1.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.154;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,80:374:99:1530,0,11297 -chr11 3966665 . C T 2349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-3.109;DP=338;FS=2.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,100:338:99:2378,0,12326 -chr11 3966673 . C T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.506;DP=333;FS=4.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,66:333:99:1012,0,13784 -chr11 4026312 . C A 2090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.467;DP=266;FS=3.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,81:262:99:2119,0,10236 -chr11 4028080 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.976;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,26:123:99:473,0,3701 -chr11 4028130 . G A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=4.074;DP=119;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,33:111:99:895,0,4453 -chr11 4028469 . G C 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.123;DP=268;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.039;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,66:268:99:1502,0,7691 -chr11 4031039 . A G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=2.857;DP=154;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,30:149:99:568,0,5413 -chr11 4032812 . T A 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=1.305;DP=69;FS=3.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:820,0,2792 -chr11 4033474 . A T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.821;DP=78;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:329,0,2170 -chr11 4051572 . C A 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=-0.545;DP=280;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,87:279:99:2385,0,7490 -chr11 4057568 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-1.976;DP=36;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:452,0,820 -chr11 4057588 . G T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.059;DP=38;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:588,0,700 -chr11 4821958 . G C 1355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.749;DP=50;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=27.12;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,38:48:99:1384,0,180 -chr11 5573885 . C CA 1025.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=1.626;DP=181;FS=19.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,66:163:99:1063,0,2235 -chr11 5590559 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-1.799;DP=117;FS=5.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=4.37;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,25:117:99:539,0,3492 -chr11 5597136 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=3.590;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:245,0,1694 -chr11 5597149 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=3.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=9.32;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:99:252,0,1694 -chr11 5597248 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.872;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,263 -chr11 5597926 . TG T 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.249;DP=24;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=16.57;ReadPosRankSum=-2.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:435,0,569 -chr11 5661056 . GAGGTAAGGATGTCCTCCCTTCTTTGGATTTGTACTTTATTTTGGCTGGATGGCATGTAAAACCCATTTCACTCTTAATGTTTTC G 1609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.347;DP=41;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1647,161,0 -chr11 5756236 . T C 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.947;DP=107;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=16.94;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,53:107:99:1841,0,1997 -chr11 5764737 . T TA 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=1.288;DP=60;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:635,0,966 -chr11 5765024 . A G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=34.05;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:94:607,0,94 -chr11 5765026 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=1.355;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:428,0,483 -chr11 5768011 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.134;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:412,0,1108 -chr11 5768041 . A G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.961;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:463,0,483 -chr11 5847993 . C G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.085;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=24.38;ReadPosRankSum=-1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:467,0,126 -chr11 5848025 . C T 841.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.528;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.02;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:870,66,0 -chr11 5848761 . T G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.637;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,275 -chr11 5855658 . C G 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=-1.264;DP=113;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.056;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:1447,0,2143 -chr11 5871172 . A C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr11 5879087 . G A 7006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-1.932;DP=488;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,199:488:99:7035,0,9646 -chr11 5890667 . TCCTGAAAAAAATAAACAGACGTCATGATTTATCGTAATCTTACCAAAGTAAAATGTGATGGACGTAAACATACAGCTTAAATGATTTTCACTCA T 18108.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=404;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,404:404:99:18146,1383,0 -chr11 6108635 . T TTG 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=-1.610;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:268,0,364 -chr11 6151604 . TGGTAAGCTTCGGAGGTCTTCAGAGTGCTGTTAAACGTGTTTTTTTCCCCCTCAGACTCTGACTTCTTCGGCTTACTGTCTGCA T 1347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-5.874;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=8.81;ReadPosRankSum=-5.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,43:137:99:1385,0,24422 -chr11 6179060 . TA T 842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.352;DP=181;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,51:164:99:1095,0,2333 -chr11 6257327 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,206 -chr11 6296309 . C A 1314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.346;DP=72;FS=7.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1343,0,1388 -chr11 6350168 . G T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.952;DP=32;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:355,0,649 -chr11 6456722 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-0.517;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:300,0,564 -chr11 6466515 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.856;DP=29;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:423,0,608 -chr11 6466724 . T C 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.383;DP=67;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.58;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1139,0,1234 -chr11 6482860 . C T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.857;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=21.23;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:750,0,1127 -chr11 6482863 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.601;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=21.87;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:750,0,1127 -chr11 6486973 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-1.215;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,309 -chr11 6488684 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=1.352;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:402,0,362 -chr11 6515700 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=1.491;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:360,0,1033 -chr11 6524820 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=24.28;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:441,0,156 -chr11 6539011 . AGTAAGTTCCTTTTATTGCACGCATGCATGTCTTTTATAGTAGAGTCTAACTGAGCAGATGAGTGTACAGAAAGTATTGTCGCTGACCATAGCCGCGTTATTTCTACAG A 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=2.373;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=3.74;ReadPosRankSum=-3.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,93:98:99:404,0,435 -chr11 6935945 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=1.626;DP=29;FS=13.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=7.41;ReadPosRankSum=-3.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:243,0,740 -chr11 7025029 . TG T 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.516;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=7.49;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:292,0,518 -chr11 7025440 . T C 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.511;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:339,0,559 -chr11 7065646 . A G 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 -chr11 7077907 . G A 278.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:307,0,18 -chr11 7112990 . GCTTTGAAGGGATAAAGACGTAAGCTTTAAACCTATACCAACAGATAAACATCTGAGGAAACATCAGATTCCTCTTAC G 1484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=2.314;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=34.53;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1522,128,0 -chr11 7128195 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:281,0,137 -chr11 7356250 . C G 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.876;DP=342;FS=4.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,79:341:99:1596,0,9699 -chr11 7383418 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=-1.025;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=13.81;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:263,0,354 -chr11 7486460 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=-1.247;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=8.93;ReadPosRankSum=2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:305,0,801 -chr11 7816798 . T C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.967;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:618,0,3258 -chr11 7882751 . A AT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.736;DP=36;FS=12.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:244,0,557 -chr11 8128044 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,442 -chr11 8129127 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:303,0,94 -chr11 8296254 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.453;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,456 -chr11 8765487 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:369,0,311 -chr11 8765491 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.619;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:406,0,403 -chr11 8765497 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.239;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.150;QD=10.58;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:261,0,759 -chr11 8766259 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=1.273;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:285,0,943 -chr11 8766299 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.838;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:591,0,651 -chr11 8767257 . TA T 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-0.184;DP=34;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:370,0,319 -chr11 8768036 . C G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.011;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:573,0,1091 -chr11 8768140 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.917;DP=61;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:959,0,1383 -chr11 9522772 . T A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr11 9522782 . C T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr11 10499515 . AACCTGCACAGAAATAAACTCGTTAATTGGAGCAAAAACCCCAATAGTGACTCTATTAGTGGTTATGAATCAAATGAGCAAATGTACAGAACTC A 1257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=1.072;DP=70;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1295,0,856 -chr11 10499516 . AC A 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=-1.261;DP=69;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.800;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:852,0,1357 -chr11 10499519 . TGCACAGAAATAAACTCGTTAATTGGAGCAAAAACCCCAATAGTGACTCTATTAGTGGTTATGAATCAAATGAGCAAATGTACAGAACTCACC T 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.355;DP=65;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:852,0,1373 -chr11 10529564 . C CTG 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=1.586;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:429,0,164 -chr11 11023178 . G GT 690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.232;DP=129;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,58:100:99:1035,0,886 -chr11 11023951 . CT C 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.743;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,21:22:34:552,0,34 -chr11 11024090 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.298;DP=48;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:344,0,1461 -chr11 11024344 . G GT 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-1.570;DP=41;FS=1.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:365,0,412 -chr11 11149213 . CAAGGTAAAGGTCACATGCTCATTTATACAGCTTTCAGTGTTGTTGTATGTTGATATTTGTGGTTTCTTTTTTTTTTTGGTTG C 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.033;DP=24;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:456,0,4094 -chr11 11179371 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.031;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:271,0,574 -chr11 11200876 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.365;DP=64;FS=5.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:404,0,1887 -chr11 11207038 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.394;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:275,0,1055 -chr11 11242394 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=1.113;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,34:207:99:410,0,6995 -chr11 11265643 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.992;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,404 -chr11 11372763 . GGTAAGAGCCTGACAT G 219.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=222;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=0.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:257,126,0 -chr11 11393054 . TAA T 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.005;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,2:239:99:357,0,8119 -chr11 11395929 . GA G 3220.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-0.218;DP=330;FS=7.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,138:285:99:3258,0,3938 -chr11 11399324 . TCCTATAAGGAATAACAAAAATCCAAACTCAATCTAACTATAAGTCAATCTTCAATGTGTAAACATCTGTTTGTACATTGAAATACTGA T 4701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.738;DP=108;FS=3.345;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=32.32;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:4739,399,0 -chr11 11399426 . T G 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-1.126;DP=114;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.303;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:657,0,3314 -chr11 11455381 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.113;DP=79;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:373,0,2376 -chr11 11638886 . GTACCTGAACGAAGCAAAACAGAACGGTTTATCTGTGACATTTACCTCCATTGTGAGACACAAAAATCATTTTCAACAAAGTATGTTTTTATT G 12202.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=2.320;DP=320;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,317:319:99:13484,1154,0 -chr11 11910770 . GCTGTTTGGAACAAATTTAAATCACATAAGCAAAGCTTTAAGATGGAGTACAAAAATAGACAGGTCACTTTCTGAATGGGAGCTTAC G 10112.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:203:99:10150,945,0 -chr11 12033901 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:315,0,549 -chr11 12339301 . A T 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.970;DP=202;FS=0.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,89:202:99:3032,0,3519 -chr11 12488076 . A G 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.167;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:594,0,187 -chr11 12488169 . C T 250.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:279,0,14 -chr11 12488558 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:283,0,106 -chr11 12488686 . A G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.869;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:49:494,0,49 -chr11 12488691 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:49:494,0,49 -chr11 12734898 . T G 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr11 12748332 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=32.78;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:356,0,101 -chr11 12916730 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-1.270;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:232,0,1148 -chr11 13280744 . AT A 731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.049;DP=74;FS=7.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:769,0,914 -chr11 13368205 . T A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.882;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=5.68;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:500,0,2351 -chr11 13368243 . GAGGTATCGTTCATCATTGTAGCTGAGTAATACAAAAATGCTTATTCCACCTTTTTTTTCTAAATATTTTCTTTTGTCCTCCT G 2867.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.858;DP=76;FS=2.937;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:2905,196,0 -chr11 13396146 . C A 5192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-1.330;DP=438;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,152:406:99:5221,0,11203 -chr11 13396168 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-3.775;DP=384;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:318,65:383:99:411,0,25091 -chr11 13397862 . G A 2365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=-3.923;DP=60;FS=19.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=24.65;ReadPosRankSum=-4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,9:54:99:2394,0,3086 -chr11 13690628 . TA T 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=1.120;DP=46;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:507,0,1029 -chr11 13718997 . G GA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-0.622;DP=106;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:269,0,2092 -chr11 14304515 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:346,0,100 -chr11 14304529 . A C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:364,0,97 -chr11 14314282 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=1.461;DP=29;FS=3.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:406,0,622 -chr11 14333483 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=-0.393;DP=59;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=7.42;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:466,0,1653 -chr11 14342463 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-1.482;DP=80;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:280,0,2574 -chr11 14522176 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,131 -chr11 14567989 . AGCAGGTATGTGTCTTTTCAAGTGTTGTTGTTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTCAAGTGTAGATTATTTTTCCATCTTGATCATCTGCTTTTCAT A 10618.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=1.352;DP=268;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=27.15;ReadPosRankSum=1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,235:237:99:10656,837,0 -chr11 14576538 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.155;DP=221;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=1.52;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,31:220:99:364,0,15453 -chr11 14576547 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.179;DP=224;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,32:223:99:374,0,15453 -chr11 14582655 . C A 4892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.678;DP=214;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,74:213:99:4921,0,4344 -chr11 14583127 . G A 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-0.967;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.238;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,41:162:99:835,0,4565 -chr11 14583465 . C CT 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.688;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:788,0,1389 -chr11 14586512 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.238;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:316,0,1632 -chr11 14586571 . A AT 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-2.354;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:353,0,1739 -chr11 14586798 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-3.438;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:499,0,1776 -chr11 14824775 . A G 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 -chr11 14825001 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-2.001;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=20.22;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,370 -chr11 14825890 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,231 -chr11 14826435 . G A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr11 14826438 . C T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr11 14826614 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,203 -chr11 14827290 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.892;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:270,0,206 -chr11 14827668 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,237 -chr11 14828217 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:248,0,209 -chr11 15056555 . A G 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -chr11 15060450 . C A 362.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.791;DP=62;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=5.84;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:390,0,12 -chr11 15060577 . C G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr11 16240102 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.057;DP=70;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:291,0,2116 -chr11 16300000 . T G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=-0.359;DP=59;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,41:58:99:1598,0,430 -chr11 16300113 . G A 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.305;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=19.14;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1062,0,934 -chr11 16300458 . G GA 203.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:28:241,0,28 -chr11 16395337 . AT A 284.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;QD=23.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:26:320,26,0 -chr11 16395876 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=1.538;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.95;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:495,0,507 -chr11 16396465 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=1.182;DP=23;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:382,0,440 -chr11 16448787 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=1.195;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:400,0,268 -chr11 16468359 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=1.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=26.36;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:740,0,216 -chr11 16469317 . ACTAGACAAACGGGGAAAAAAGGAAAAAATGAAAAGCTGAAACAAACAACAGAATTGACTAGTGTTTTTTATAATAC A 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,854 -chr11 16479396 . C A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:400,0,445 -chr11 16479479 . AT A 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.293;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:314,0,378 -chr11 16528213 . C T 10255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.354;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.035;QD=28.92;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,109:277:99:10284,0,8268 -chr11 16543103 . G A 1465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.079;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:1494,0,2017 -chr11 16550060 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.414;DP=64;FS=2.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:287,0,1970 -chr11 16564411 . A G 10314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-1.112;DP=219;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,97:216:99:10343,0,3147 -chr11 16569072 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=1.611;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=30.73;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:397,0,48 -chr11 16599606 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-1.202;DP=238;FS=4.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,51:238:99:1024,0,11902 -chr11 16708998 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.344;DP=45;FS=9.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:507,0,1021 -chr11 16714649 . T C 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.811;DP=61;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1289,0,834 -chr11 16715615 . A G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:499,0,281 -chr11 16716474 . C A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-1.953;DP=73;FS=8.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:801,0,1823 -chr11 16716566 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-2.171;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:250,0,2443 -chr11 16717140 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=-0.665;DP=37;FS=10.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.35;ReadPosRankSum=2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:522,0,1355 -chr11 16779834 . G GA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-2.357;DP=90;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:268,0,1564 -chr11 17042334 . TA T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.793;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:86:258,0,86 -chr11 17123584 . TAA T,TA 457.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.300;DP=64;FS=2.098;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,8,15:28:99:12207,378,432,191,0,204 -chr11 17359605 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=3.072;DP=199;FS=8.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,38:198:99:626,0,5993 -chr11 18226620 . A G 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.452;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:614,0,564 -chr11 18245637 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.116;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.834;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:399,0,1100 -chr11 18257301 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.264;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:273,0,1787 -chr11 18486567 . A T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.150;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:530,0,995 -chr11 18510124 . G T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.102;DP=145;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,43:145:99:1085,0,3844 -chr11 18510223 . C T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.726;ClippingRankSum=-0.309;DP=169;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,42:163:99:792,0,4725 -chr11 18545857 . A T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr11 18577726 . GCTAATATGAAAAGGAAGAAAATAGTTAAACGGTTGAAAAAACAAACAATACAAGTGAACACTGGGTTAC G 3066.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=3.115;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=29.21;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,91:105:99:3104,0,2577 -chr11 18582791 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:272,0,63 -chr11 18586788 . C T 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr11 18604530 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-1.821;DP=58;FS=14.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:369,0,1655 -chr11 18610869 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.817;DP=53;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:315,0,1437 -chr11 18635116 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-1.080;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:309,0,562 -chr11 18694451 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.554;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:400,0,592 -chr11 18766155 . TA T 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-1.136;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:654,0,723 -chr11 18767245 . C CA 1798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:99:1836,147,0 -chr11 18776550 . AACCTGTGGCAAAACCAACATTTCTTAAAAAAGAAAATTAAATTAAAGAAAGTATGCTAGAGTAAAGAATTAACTATTTGGAGATTATTTATTTAGAAGGTATGTCACTC A 3988.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=1.182;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,99:101:99:4026,319,0 -chr11 18956108 . ACGCTCT A 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=4.362;DP=54;FS=9.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=5.74;ReadPosRankSum=-3.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:347,0,2462 -chr11 18956215 . CT C 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,0:27:99:410,0,4245 -chr11 18956217 . CGGTCGGACTCCTTGCCT C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;ClippingRankSum=-1.545;DP=57;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=6.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:428,0,4245 -chr11 18956237 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-1.225;DP=45;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=8.73;ReadPosRankSum=-4.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:421,0,4245 -chr11 19007103 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-1.079;DP=37;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.537;QD=16.45;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:637,0,670 -chr11 19094575 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.533;DP=90;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:258,0,2830 -chr11 19098323 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-0.716;DP=74;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:245,0,2657 -chr11 19124673 . A AT 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=-0.154;DP=342;FS=8.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,50:324:99:621,0,6709 -chr11 19124980 . C T 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-1.374;DP=341;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.32;ReadPosRankSum=2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,71:340:99:1160,0,13689 -chr11 19125071 . TCTGCAAGACAAAAAGAGGGAACATAGTGAGTTGGGTCGTTCAGACAAACATTATTGATATGCATATAGAGACGCAAGCATTATATCTTAAGCATGTGCGATATTTAC T 10371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=3.500;DP=241;FS=1.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=31.63;ReadPosRankSum=-3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,226:239:99:10409,888,0 -chr11 19433839 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=-2.731;DP=54;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:244,0,1502 -chr11 19462556 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-1.585;DP=87;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:985,0,1937 -chr11 19926404 . AAGGTTCATTATAGATTTCATACTTATTTTATCTTATCAACATCATAGATGTTAAACATTGCTTGACGCATGAACTCTTTATCC A 19643.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.772;DP=316;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,302:303:99:19681,1621,0 -chr11 20031628 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-0.826;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:247,0,1416 -chr11 20478318 . GAAAGGTAAATTGAAGGATTCTGAAATGGTTTTGACGGGATGTGGGAAAAGTAAAATAGTACACAAATTGCTGATTATTTAGGCCTATTAAGCAGTTTCTATTCTTTT G 2407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.615;DP=68;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,59:67:99:2445,0,525 -chr11 20478560 . CACAGGTAGGTTAAAATATATATGTATAAACACTAAAAAATTTTAATTTTAATAAAATGCTCTCAAGTGATTAATTGTGTTT C 943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=1.330;DP=33;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=28.60;ReadPosRankSum=-2.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:981,0,1162 -chr11 20536093 . T C 7519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=-0.292;DP=258;FS=1.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,165:250:99:7548,0,6639 -chr11 20536116 . A C 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=-0.772;DP=291;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=4.90;ReadPosRankSum=-2.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,94:279:99:1455,0,21684 -chr11 20536219 . T C 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=7.827;DP=301;FS=21.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=4.23;ReadPosRankSum=-4.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,70:265:99:1300,0,17128 -chr11 20536221 . TG T 1266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=7.620;DP=303;FS=17.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=4.18;ReadPosRankSum=-4.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,65:263:99:1304,0,17128 -chr11 20536333 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.120;DP=114;FS=12.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=1.78;ReadPosRankSum=-4.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,18:108:99:231,0,3563 -chr11 20536591 . C A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-3.548;DP=133;FS=22.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,25:126:99:457,0,7189 -chr11 20536613 . A T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-1.893;DP=101;FS=20.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=6.82;ReadPosRankSum=2.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:717,0,2779 -chr11 20536753 . CA C 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=-5.128;DP=132;FS=11.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=3.20;ReadPosRankSum=5.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,32:113:99:460,0,4421 -chr11 20536924 . G A 4172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-2.834;DP=358;FS=44.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=11.66;ReadPosRankSum=2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,122:299:99:4201,0,9877 -chr11 20537661 . T C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.427;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:613,0,856 -chr11 20537667 . C T 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.258;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:607,0,856 -chr11 20540062 . C T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.907;DP=123;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=10.02;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1261,0,4598 -chr11 20540147 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-2.193;DP=90;FS=13.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=3.76;ReadPosRankSum=2.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:367,0,2892 -chr11 20540602 . AT A 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-2.445;DP=102;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:351,0,3716 -chr11 20541145 . T C 1766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=-0.888;DP=188;FS=20.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=9.40;ReadPosRankSum=3.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,43:162:99:1795,0,6674 -chr11 20541321 . T C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-2.873;DP=121;FS=23.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,49:118:99:1119,0,5496 -chr11 20542699 . A C 4452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-2.052;DP=161;FS=2.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,116:156:99:4481,0,947 -chr11 20542733 . G A 5873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.311;DP=198;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=29.67;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,149:191:99:5902,0,867 -chr11 20542853 . G A 6913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=-6.950;DP=245;FS=47.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=28.22;ReadPosRankSum=5.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,149:225:99:6942,0,4682 -chr11 20544377 . C G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.417;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=14.96;ReadPosRankSum=4.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:522,0,570 -chr11 21277455 . G T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:34:457,0,34 -chr11 21287038 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.951;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:288,0,1866 -chr11 21504681 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,170 -chr11 21578145 . A C 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=5.136;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=5.95;ReadPosRankSum=-4.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,11:130:99:814,0,8643 -chr11 21579984 . G T 6229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=1.264;DP=679;FS=8.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:457,217:674:99:6258,0,35472 -chr11 21988235 . TA T 931.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.044;DP=113;FS=0.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:969,0,1662 -chr11 22100581 . C A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-1.057;DP=61;FS=6.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:900,0,1162 -chr11 22113891 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,249 -chr11 22247130 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-0.728;DP=56;FS=2.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:351,0,1518 -chr11 22309794 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.026;DP=71;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:552,0,1873 -chr11 22416105 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.690;DP=104;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:290,0,3264 -chr11 22868865 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.637;DP=96;FS=5.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:653,0,2602 -chr11 22926574 . GA G 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=-0.354;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:369,0,1664 -chr11 23825969 . G GT 979.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=-1.920;DP=146;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,56:117:99:1114,0,1296 -chr11 23827491 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.212;DP=135;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.825;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,24:134:99:360,0,4039 -chr11 23840011 . TCTGAAAAAAGAAGAATTTAAAGTAGCTGGTTTTCAATATTTTCTCAGTACAACATCAGTAAGAGGAGAAAAAAAAAAAAACTTGTTAC T 6445.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=2.323;DP=164;FS=2.057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=29.14;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,159:162:99:6483,470,0 -chr11 24228581 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.889;DP=39;FS=8.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:290,0,1103 -chr11 24501996 . CT C 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.872;DP=20;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:302,0,196 -chr11 24509348 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-1.828;DP=100;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:284,0,3125 -chr11 24514422 . G GT 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=1.327;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:646,0,634 -chr11 25018065 . GCTAGAAAACAAATTAACAGCTCTGTGAACACACTTCCTTGGAACAAAAACCATTTCAAGACTGTTCAATGATTGTGTCCGACTTAC G 12144.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.736;DP=303;FS=2.067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,297:300:99:12182,876,0 -chr11 25277863 . CGTAAGTTGGAG C 245.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=424;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=0.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,0:0:99:283,138,0 -chr11 25278061 . AGTATGAAGCCTTAAGCTATGCCATTTAATTACTGTCATTAACGTGAAGTTTGTGTTTAATTTGTTATTCTTAACTCTCTCATCAG A 11860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=1.710;DP=268;FS=1.462;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=30.77;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,261:268:99:11898,1082,0 -chr11 25715636 . GGGTGACCATAAGCAGCACTTCTTGCCTCGAAATCACAAGCCTCGTCTGAATTGGCACTCTTTGGTCAGACAGTATTTTGTCATCAGCTGTGCTTGTTTCAGCA G 3564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=1.043;DP=109;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=32.70;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,97:109:99:3602,0,1673 -chr11 25716187 . CCAGGTCAGATTTTCTACTTTATTTAAAATTAATTCAGGTAAATGATCGACTGACTTTTACCTAAAAAATGAATGCTTG C 4169.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=1.007;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=24.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:99:99:4207,323,0 -chr11 25747170 . T TA 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-1.444;DP=49;FS=8.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:470,0,1273 -chr11 25747918 . TA T 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.239;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.696;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:327,0,166 -chr11 25769272 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=-2.184;DP=100;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=2.94;ReadPosRankSum=2.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:322,0,3096 -chr11 25776778 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.067;DP=93;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:514,0,2563 -chr11 25792397 . CTAAAGGTAACAAACCACCCCGTCA C 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=1.803;DP=172;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,40:166:99:873,0,5752 -chr11 25792400 . AAGGTAACAAACCACCCCGTCATGACTAGCTGTTTCACCTAATGATGTTAATGTAAATATGTGTTGTTGTCTACTCAT A 4526.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-1.732;DP=172;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,122:165:99:4564,0,1814 -chr11 25792424 . ACTAGCTGTTTCACCTAATGATGTTAATGTAAATATGTGTTGTTGTCTACTCAT A 810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=1.496;DP=169;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=4.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,40:165:99:848,0,5752 -chr11 25805162 . AGTAAGTCAATAATGTGATTTAATTGATTGATTGTGAACTGTTATTGTGTCAGATATCTGACTGATCAGTGTCTCTCAG A 6671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-1.442;DP=201;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,177:192:99:6709,0,156 -chr11 25809994 . A AT 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.053;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:313,0,99 -chr11 25909311 . T TTAATCCTCA 1830.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1868,117,0 -chr11 25970576 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-1.372;DP=127;FS=9.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,37:127:99:922,0,3455 -chr11 26106906 . TGG T 1103.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.914;DP=75;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,38:70:99:1141,0,2845 -chr11 26106908 . GAGGTGAAGATCTTAATAGAACACATCAGAGTGTCTGTATTTGGTTCGCAGAACTGGATGAGTCACTGAAATGTTGTCTTGTGATTGC G 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.074;DP=82;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:968,0,2843 -chr11 26106910 . GGTGAAGATCTTAATAGAACACATCAGAGTGTCTGTATTTGGTTCGCAGAACTGGATGAGTCACTGAAATGTTGTCTTGTGATTGC G 1096.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.617;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1134,0,2845 -chr11 26234709 . GGGTGGGCAGAATCCTCGGTTACTTTCACATTGCAGCGGTTTTATCTGAGCTCAATCCTCTGGCTCTGGAGGAGTTGTAAATAGTCTTTTGTGATTCACACAATATTGAGTGCTGTTATTGACCTTTTTCTGTTTTTTTTGTTCTCCATTTCCTTCCTCAA G 9520.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.824;DP=289;FS=5.366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.94;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,264:279:99:9558,723,0 -chr11 26236268 . C CA 1671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=2.108;DP=516;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:369,129:498:99:1709,0,10027 -chr11 26244240 . G GA 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-2.152;DP=231;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,30:192:99:289,0,4313 -chr11 26244636 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=2.031;DP=35;FS=5.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:396,0,1323 -chr11 26262283 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.748;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:334,0,1157 -chr11 26317491 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=-0.360;DP=70;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:252,0,2267 -chr11 26339332 . G A 1772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-1.345;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,55:159:99:1801,0,3514 -chr11 26348649 . C G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=1.851;DP=44;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:252,0,1315 -chr11 26348761 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.295;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:324,0,211 -chr11 26371300 . A G 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=-0.711;DP=136;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,57:135:99:2008,0,2700 -chr11 26377237 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-2.823;DP=112;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=5.70;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,29:112:99:667,0,2995 -chr11 26475958 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=1.572;DP=74;FS=12.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:894,0,1644 -chr11 26499499 . GGGTAAGCAGTGCCTTTTTAGATTTGTACATTAAAGTAAAAATGTTAGGAACAGTGATGGGAAAGTCTGTCTTCACTTTTTTGTACTTTA G 3450.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.831;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=31.56;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,82:86:99:3488,270,0 -chr11 26615153 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.779;ClippingRankSum=0.285;DP=101;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=3.07;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:338,0,6128 -chr11 26615161 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.956;DP=95;FS=3.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,17:95:99:326,0,6128 -chr11 26619638 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=-1.239;DP=121;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:261,0,3425 -chr11 26647472 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.599;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:256,0,1274 -chr11 26715960 . CT C 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.021;DP=70;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:267,0,1035 -chr11 26716279 . CT C 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=1.252;DP=53;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:508,0,363 -chr11 26767284 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:341,0,187 -chr11 26767381 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.431;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:309,0,588 -chr11 27245331 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:256,0,705 -chr11 27307505 . TCCTAATAAACCACAGGAAAATTACAAATACTAAGCAGAATGATGGAAACATATGGCCTCTACCAGTGCCTTTATTAAATAAATAAAATATAGTA T 2142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-3.056;DP=77;FS=12.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,58:75:99:2180,0,1920 -chr11 27307507 . CTAATAAACCACAGGAAAATTACAAATACTAAGCAGAATGATGGAAACATATGGCCTCTACCAGTGCCTTTATTAAATAAATAAAATATAGTACT C 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=1.976;DP=76;FS=8.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:382,0,3421 -chr11 27326237 . GAGGTTTTTGGTCACTTTTATTCACTTAGAAAACTAATGTTGGTTTGCACATGCAGATTTTGCTGACTTTCTTTTACCAACCACTCACTGT G 9705.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=2.153;DP=257;FS=5.303;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,233:236:99:9743,701,0 -chr11 27334812 . GT G 3155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-4.545;DP=192;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,18:191:99:3193,0,14581 -chr11 27494952 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,329 -chr11 27496073 . A G 293.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.34;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:322,0,19 -chr11 27499346 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.096;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:606,0,1584 -chr11 27502892 . TCCTGTTTGGAACATACAAACTGGTTTAGCGATACGTTTTATGGCATTTGGAGTCATTTTGGTAACGTTTCAGAAAGAGTTTA T 4033.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.021;DP=98;FS=2.443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=29.51;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,95:98:99:4071,316,0 -chr11 27541888 . AT A 2596.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.780;DP=328;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,131:313:99:2634,0,3908 -chr11 27548342 . CT C 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.487;DP=68;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:704,0,1151 -chr11 27639510 . GA G 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.957;DP=40;FS=16.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:408,0,406 -chr11 27640158 . GT G 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.462;DP=31;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:282,0,382 -chr11 27642508 . A G 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 -chr11 28364529 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-2.043;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:414,0,1236 -chr11 28394717 . CACCTATAAAAAAGTTAATTAATAATCAGGTAAATGCACATGTATATGAACTGAATGTTAAAGTGAACTTCTGAAATAGAATTGTTTAGGACACTG C 732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=-1.028;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:770,0,3083 -chr11 28523435 . T G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.460;DP=62;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:310,0,1765 -chr11 28581949 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-2.172;DP=37;FS=1.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:274,0,1069 -chr11 28694476 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr11 28695562 . T C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=-0.580;DP=200;FS=2.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,48:199:99:974,0,5399 -chr11 28719655 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.721;DP=51;FS=6.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:430,0,1298 -chr11 28719864 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=1.086;DP=54;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:235,0,1629 -chr11 28724249 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.770;DP=75;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:352,0,2235 -chr11 28797488 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-1.048;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:529,0,3418 -chr11 28816795 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.414;DP=65;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:262,0,1796 -chr11 28830089 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=-0.858;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,2036 -chr11 28866202 . A C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.960;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=5.41;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:548,0,2709 -chr11 28955985 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-1.606;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:350,0,940 -chr11 28956457 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-1.859;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=5.23;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:248,0,1195 -chr11 29298911 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,370 -chr11 29299000 . A C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.207;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:521,0,851 -chr11 29299113 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.787;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:303,0,775 -chr11 29300811 . CTCTT C 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=3.160;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:293,0,731 -chr11 29467984 . GCTAAAGTAAAGCCAGAAAAGATCATGAATGAGAGTTGCATATTTGCATAATGTATTCAGATCTAAAATGAAACTGTATTTGAAAATTATAACACTGTAC G 4668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=2.667;DP=106;FS=2.165;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=30.17;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:4706,385,0 -chr11 29474366 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.307;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,28:137:99:480,0,4030 -chr11 30321204 . C A 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr11 30417305 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.042;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.72;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:232,0,288 -chr11 30529678 . T C 4009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=1.368;DP=614;FS=5.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:444,168:612:99:4038,0,17121 -chr11 30532258 . C T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-0.228;DP=467;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:375,91:466:99:1505,0,14902 -chr11 30794910 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.595;DP=43;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:338,0,1417 -chr11 30795043 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.058;DP=43;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:485,0,934 -chr11 30795044 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-1.360;DP=42;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:313,0,1135 -chr11 31205207 . AT A 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-2.981;DP=139;FS=11.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,33:125:99:543,0,1687 -chr11 31992649 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.683;ClippingRankSum=-0.083;DP=39;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=5.51;ReadPosRankSum=3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:243,0,1727 -chr11 31993406 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.263;DP=26;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:388,0,668 -chr11 31994175 . A C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.07;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:293,0,94 -chr11 31994356 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-2.523;DP=28;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:426,0,1008 -chr11 32576550 . GTA G 323.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:361,24,0 -chr11 32712187 . G A 465.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:494,36,0 -chr11 34678626 . T TA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.519;DP=74;FS=2.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:385,0,1158 -chr11 34736697 . G C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.152;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:320,0,306 -chr11 34759652 . T C 1845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-4.498;DP=86;FS=1.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=21.46;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,25:86:99:1874,0,3240 -chr11 34770841 . G A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.658;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.731;QD=2.79;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,28:151:99:449,0,4859 -chr11 34773199 . T A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=1.150;DP=120;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,34:119:99:859,0,3195 -chr11 34782170 . A G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-2.427;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,38:175:99:740,0,6179 -chr11 34786894 . A T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.431;DP=144;FS=9.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,36:144:99:823,0,4207 -chr11 34846478 . A T 1777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.244;DP=209;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,69:209:99:1806,0,5322 -chr11 35036428 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.955;DP=63;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:339,0,1732 -chr11 35238463 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,107 -chr11 35238636 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,220 -chr11 35329793 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-0.655;DP=50;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:289,0,1362 -chr11 35329817 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.951;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:317,0,1311 -chr11 35330138 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=-2.041;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:476,0,1565 -chr11 35330177 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.410;DP=47;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:581,0,1004 -chr11 35635495 . A AT 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-0.863;DP=40;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=7.24;ReadPosRankSum=2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:385,0,389 -chr11 37122588 . C CA 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.094;DP=29;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:276,0,175 -chr11 37214293 . C G 2529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-1.911;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,63:83:99:2558,0,357 -chr11 37214597 . GT G 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=0.119;DP=86;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=6.942;QD=4.65;ReadPosRankSum=3.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:437,0,2784 -chr11 37214931 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.156;DP=83;FS=7.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.541;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:244,0,2683 -chr11 37281252 . CACCTGACAGAAAGGAGCAGTTAGAAATATACATGCGCTATAACGAAATGTGTTTTGCTGTTCGT C 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=29.05;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:502,0,1379 -chr11 37296632 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-1.218;DP=46;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:426,0,1129 -chr11 37311324 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.032;DP=53;FS=7.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:249,0,1527 -chr11 37311545 . A C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.683;DP=72;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:256,0,1934 -chr11 37315689 . T A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.603;DP=30;FS=6.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:381,0,641 -chr11 37325703 . TGGTACAGTATTGCTTTTAAACGGGCATTTTCACCTGGAGTTAGTTTCGGAATCATCTTGTTTTTGTGTATTTCA T 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=5.096;DP=114;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=2.82;ReadPosRankSum=-3.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,90:100:99:359,0,114 -chr11 37939885 . TGGTAAGAGCATGTATAAATGAGTGCATGATAATATCATCACATCCATCTCAAATCTGCATCCCCTGAGCTGAAAGGAGTGAATTGTTTGCTGTGCA T 2404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=3.774;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.354;QD=32.62;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,57:66:99:2442,0,2953 -chr11 37983669 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr11 37983991 . T TC 412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:450,36,0 -chr11 38054882 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:235,0,58 -chr11 38117491 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.813;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:351,0,391 -chr11 38117527 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.543;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:416,0,265 -chr11 38117735 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.629;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:412,0,637 -chr11 38117895 . C G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=1.276;DP=34;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=12.43;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:451,0,772 -chr11 38117906 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.571;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:427,0,724 -chr11 38201980 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:350,0,53 -chr11 38220860 . T C 200.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:229,0,19 -chr11 38223438 . G T 244.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.61;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:273,0,15 -chr11 38437494 . C G 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-0.976;DP=71;FS=3.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:499,0,1760 -chr11 38489677 . AGTAAGAACAGCACAGGAAAACACATATCAAAACCGTACCATGCACCATCAACTCACTGTATTGCGTGTTTTACAG A 1956.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=1.578;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=26.46;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:99:1994,160,0 -chr11 38514215 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=2.149;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:724,0,710 -chr11 38515202 . A AG 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.974;DP=44;FS=7.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:368,0,580 -chr11 38622628 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.48;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:61:363,0,61 -chr11 38813572 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=24.98;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:353,0,92 -chr11 38875135 . C T 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-0.282;DP=55;FS=2.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1101,0,814 -chr11 38995164 . C CA 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.725;DP=56;FS=21.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:252,0,982 -chr11 39089184 . CGGTAAGATCAGCCCTTCTGTCTTTAGTTTTGTGCTGTTTTACTTCAGCTAAATCTGTCTTTTGTGCTCTGTCA C 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.945;DP=18;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:557,0,1460 -chr11 39316778 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-1.423;DP=30;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:483,0,583 -chr11 39319320 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,241 -chr11 39324982 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,408 -chr11 39755791 . C T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr11 39774806 . AT A 3246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=-1.297;DP=206;FS=4.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,115:205:99:3284,0,2721 -chr11 39774923 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-2.277;DP=288;FS=18.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,55:288:99:894,0,15925 -chr11 39775010 . A AAT 3493.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=-0.311;DP=170;FS=20.252;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=20.55;ReadPosRankSum=3.610 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,128:142:99:3531,179,0 -chr11 39775957 . TAG T 877.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=-0.437;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=4.50;ReadPosRankSum=5.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,43:179:99:915,0,5374 -chr11 39776411 . A T 5458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.345;DP=264;FS=23.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,164:264:99:5487,0,3478 -chr11 39777202 . C CT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-1.732;DP=372;FS=15.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,60:348:99:270,0,8100 -chr11 40238572 . C T 1630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.599;DP=57;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1659,0,291 -chr11 40238856 . TA T 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.035;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:453,0,175 -chr11 40238988 . A G 1836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.497;DP=89;FS=4.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,56:89:99:1865,0,1128 -chr11 40239561 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,277 -chr11 40240961 . T A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-2.850;DP=53;FS=5.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=18.69;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:1019,0,1373 -chr11 40241913 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=1.347;DP=21;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=17.66;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:399,0,247 -chr11 40242015 . A T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-1.041;DP=42;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1254,0,132 -chr11 40242120 . C G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:375,0,200 -chr11 40244024 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.845;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:474,0,363 -chr11 40244389 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=1.646;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=27.54;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:524,0,107 -chr11 40245389 . A C 247.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=34.29;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:276,0,22 -chr11 40246428 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.534;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:318,0,547 -chr11 40278196 . C T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=3.005;DP=62;FS=3.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,33:62:99:1218,0,2861 -chr11 40278198 . G T 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=2.641;DP=61;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=19.50;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1218,0,2861 -chr11 40278274 . T G 1656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=1.765;DP=88;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=18.83;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1685,0,1522 -chr11 40278424 . G C 1914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=-0.187;DP=90;FS=3.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=21.28;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,59:90:99:1943,0,1000 -chr11 40309504 . G A 4475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=-1.229;DP=212;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,135:212:99:4504,0,2610 -chr11 40309845 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=3.489;DP=46;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=6.80;ReadPosRankSum=-3.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,2323 -chr11 40309847 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=3.489;DP=46;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=6.80;ReadPosRankSum=-3.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,2323 -chr11 40311320 . C T 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.031;DP=102;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.987;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1775,0,1851 -chr11 40381741 . GT G 2552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-1.396;DP=183;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,107:163:99:2590,0,1099 -chr11 40908664 . A C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr11 41398506 . GA G 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=-0.113;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:287,0,104 -chr11 41398888 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:288,0,643 -chr11 41400158 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:378,0,288 -chr11 41401938 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:299,0,260 -chr11 41429763 . AGTAAGTTTCACTTGAGGTGGCAGCAGTGTGAAATTTCAGACTTCAGCTCTGTGATTGTGTTGGAAGTATTTAGGACATTACTAAGTGGTGGATGGACATATAATTAATGCATCTCCTTATATGACTGTTCATTTTTCCTTTTTTCAG A 13425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.515;DP=433;FS=6.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.427;QD=31.01;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,422:432:99:13779,0,144 -chr11 41430200 . T G 2005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=-1.751;DP=281;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,80:280:99:2034,0,8012 -chr11 41478270 . A T 483.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5:511,5,0 -chr11 41491692 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,210 -chr11 41493604 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:248,0,133 -chr11 41495108 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:307,0,56 -chr11 41587731 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=1.184;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:703,0,1377 -chr11 41587739 . C A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.362;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:703,0,1377 -chr11 41587925 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.061;DP=31;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:378,0,654 -chr11 41593032 . G A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.034;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:812,0,1411 -chr11 41602767 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.594;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:286,0,754 -chr11 41607755 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:307,0,236 -chr11 41608113 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,321 -chr11 41609569 . A T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.551;DP=29;FS=9.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:626,0,348 -chr11 41610158 . G T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.099;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=25.20;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:507,0,159 -chr11 41610938 . C G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=-2.144;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:395,0,505 -chr11 41613624 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.427;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=7.59;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:271,0,845 -chr11 41619076 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:93:253,0,93 -chr11 41630304 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=23.82;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:31:459,0,31 -chr11 41632172 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,460 -chr11 41652443 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.274;DP=48;FS=8.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:630,0,1008 -chr11 41653561 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:341,0,483 -chr11 41653899 . T G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.407;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:677,0,1073 -chr11 41656477 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=1.056;DP=41;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:650,0,706 -chr11 41656567 . A G 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.797;DP=47;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:555,0,1131 -chr11 41665638 . T A 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.141;DP=64;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1035,0,1131 -chr11 41703673 . T A 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr11 41803688 . C G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,351 -chr11 41803739 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:291,0,135 -chr11 41840874 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:336,0,46 -chr11 41840892 . T C 326.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:355,0,14 -chr11 41894977 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,115 -chr11 41948266 . C G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr11 41985830 . C T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=1.354;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:658,0,667 -chr11 42081628 . AT A 352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:390,39,0 -chr11 42088542 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:50:291,0,50 -chr11 42088543 . A AT 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:50:291,0,50 -chr11 42088968 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=15.69;ReadPosRankSum=-1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:389,0,420 -chr11 42090827 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:265,0,62 -chr11 42090889 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:241,0,293 -chr11 42091306 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:456,0,135 -chr11 42093352 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,138 -chr11 42093737 . A C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=1.576;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.825;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:541,0,545 -chr11 42095581 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:378,0,319 -chr11 42096621 . G A 472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:501,36,0 -chr11 42154007 . A AG 1383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.056;DP=145;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,60:141:99:1421,0,1861 -chr11 42407632 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=-0.431;DP=51;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:814,0,955 -chr11 42407797 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.934;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.613;QD=32.05;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:31:509,0,31 -chr11 42407822 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:269,0,120 -chr11 42408319 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.592;DP=14;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:391,0,87 -chr11 42408442 . T C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=24.87;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:451,0,151 -chr11 42408466 . A C 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:443,0,340 -chr11 42408516 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.065;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:394,0,115 -chr11 42408795 . A G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-2.117;DP=18;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=18.10;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:354,0,552 -chr11 42408796 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.107;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,552 -chr11 42409398 . G C 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=-0.515;DP=35;FS=5.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:915,0,290 -chr11 42411059 . T C 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.201;DP=63;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:995,0,1189 -chr11 42411343 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.081;DP=47;FS=6.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:330,0,1268 -chr11 42411519 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-1.217;DP=57;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:865,0,1134 -chr11 42558692 . C G 3105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=1.008;DP=219;FS=4.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,97:219:99:3134,0,4233 -chr11 42571317 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=1.892;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:371,0,2923 -chr11 42797131 . C G 1110.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-1.040;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:87:1139,87,0 -chr11 42797650 . C A 613.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=33.26;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:6:641,6,0 -chr11 42798258 . T C 407.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=33.98;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:435,0,6 -chr11 42798690 . A T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr11 42799117 . A G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr11 42799592 . C T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr11 42801680 . A AT 394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;QD=20.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:55:542,55,0 -chr11 42801995 . CT C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-2.475;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:69:240,0,69 -chr11 42802112 . T C 742.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:54:771,54,0 -chr11 42803404 . A AG 389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:427,42,0 -chr11 42805461 . A G 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr11 42805891 . G A 1263.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.647;ClippingRankSum=-0.403;DP=34;FS=3.144;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:54:1292,54,0 -chr11 42806019 . C T 429.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=33.07;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2:456,0,2 -chr11 42806452 . T C 1874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1903,132,0 -chr11 42814977 . G A 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1549,111,0 -chr11 42826774 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.488;DP=50;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:334,0,1269 -chr11 42832271 . G C 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-0.387;DP=35;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:700,0,434 -chr11 42832283 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.103;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=21.48;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:694,0,318 -chr11 42840417 . C G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-1.122;DP=30;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:418,0,1215 -chr11 42841565 . G A 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-0.207;DP=60;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.404;QD=19.68;ReadPosRankSum=1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,38:60:99:1209,0,860 -chr11 42843159 . A G 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.756;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.609;QD=30.26;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1148,0,129 -chr11 42843345 . G T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.035;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=22.23;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1051,0,924 -chr11 42843383 . G T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=1.061;DP=53;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=22.58;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1225,0,1248 -chr11 42844299 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-1.238;DP=46;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:264,0,1266 -chr11 42845864 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.128;DP=27;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:469,0,454 -chr11 42866664 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.437;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:556,0,523 -chr11 42883762 . A G 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=1.232;DP=55;FS=4.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1443,0,422 -chr11 42949430 . ACAGGTACAATCATCTCAGAATTTAACACTGAGGAGTCATTTTAGACCTAAAAAGTTGCATATTATAACTGTACCGTTATTAAAGCTGATCAATGGTATGACATGTT A 4840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=1.155;DP=119;FS=1.603;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,111:117:99:4878,473,0 -chr11 43037017 . C G 638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:667,48,0 -chr11 43037453 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:422,0,316 -chr11 43040033 . T A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.83;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:351,0,136 -chr11 43040158 . C G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.914;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:293,0,308 -chr11 43040680 . GA G 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.626;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:408,0,281 -chr11 43040683 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.495;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:408,0,281 -chr11 43041423 . C T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.942;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=17.71;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:524,0,507 -chr11 43049861 . T C 2695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-2.132;DP=219;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,82:219:99:2724,0,9334 -chr11 43055765 . C T 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=1.371;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,51:141:99:1753,0,3118 -chr11 43059976 . C T 2041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=1.163;DP=155;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=13.17;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,62:155:99:2070,0,2907 -chr11 43065404 . C T 3316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-1.612;DP=194;FS=12.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,102:193:99:3345,0,3290 -chr11 43065434 . C T 1612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.725;DP=185;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.873;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,60:184:99:1641,0,4651 -chr11 43065479 . C T 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.939;DP=157;FS=2.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,51:157:99:1458,0,4012 -chr11 43067479 . A C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=5.645;DP=147;FS=18.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,30:147:99:474,0,9594 -chr11 43067480 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=5.806;DP=143;FS=19.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=3.19;ReadPosRankSum=-2.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:485,0,9594 -chr11 43067578 . A G 5718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-4.534;DP=203;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=28.17;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,152:199:99:5747,0,954 -chr11 43067753 . C A 780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:809,60,0 -chr11 43068629 . C A 2042.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2071,147,0 -chr11 43068732 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=-0.439;DP=33;FS=14.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:381,0,776 -chr11 43068978 . G C 698.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:727,51,0 -chr11 43068998 . A T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr11 43069190 . G A 812.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:58:841,58,0 -chr11 43069213 . T A 1276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:88:1305,88,0 -chr11 43069263 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-2.383;DP=14;FS=14.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,269 -chr11 43069386 . T C 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr11 43069471 . A G 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:275,21,0 -chr11 43069847 . AG A 795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.21;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:58:833,58,0 -chr11 43070288 . G T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-0.509;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:468,0,855 -chr11 43071294 . G T 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr11 43071599 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.543;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:252,0,414 -chr11 43074080 . A C 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-1.590;DP=187;FS=7.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,54:187:99:1241,0,6268 -chr11 43077155 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=-1.077;DP=85;FS=4.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1369,0,2924 -chr11 43077164 . C G 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.569;DP=72;FS=11.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1316,0,3172 -chr11 43089967 . G A 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.997;DP=227;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,66:226:99:1721,0,6263 -chr11 43090558 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.928;DP=163;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,42:163:99:968,0,4599 -chr11 43090949 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.408;DP=89;FS=31.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=3.86;ReadPosRankSum=-4.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:372,0,2711 -chr11 43091116 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=3.093;DP=75;FS=2.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=3.13;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:263,0,2406 -chr11 43102204 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=-1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,178 -chr11 43121556 . G GAT 578.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.519;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:5:615,0,5 -chr11 43125151 . G GA 943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-1.060;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,58:71:90:1306,0,90 -chr11 43132402 . T C 1750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.340;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=27.25;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:63:1779,63,0 -chr11 43143217 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.489;DP=38;FS=6.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:711,0,688 -chr11 43143995 . A G 1970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=1.681;DP=129;FS=22.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1999,0,2615 -chr11 43150486 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=-0.058;DP=113;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:769,0,2960 -chr11 43150713 . A G 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.546;DP=93;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:730,0,2730 -chr11 43161208 . T C 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.423;DP=170;FS=4.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,54:170:99:1466,0,6086 -chr11 43161249 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=2.035;DP=184;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=3.69;ReadPosRankSum=3.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,48:184:99:707,0,8472 -chr11 43165444 . A T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=1.801;DP=39;FS=12.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=11.05;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:459,0,860 -chr11 43165802 . A T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.505;DP=65;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1197,0,1247 -chr11 43166156 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.181;DP=49;FS=6.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:451,0,2476 -chr11 43176254 . C G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=-1.333;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:408,0,406 -chr11 43176376 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.199;DP=33;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:530,0,598 -chr11 43176773 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.475;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:356,0,1444 -chr11 43176908 . G T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=2.362;DP=23;FS=18.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:497,0,317 -chr11 43180328 . C A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:316,0,335 -chr11 43182195 . T G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.34;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:362,0,53 -chr11 43235652 . G A 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=-0.368;DP=98;FS=1.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,33:98:99:1135,0,2392 -chr11 43248922 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-1.680;DP=94;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:275,0,2979 -chr11 43289535 . TG T 394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:35:432,35,0 -chr11 43300669 . G C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=1.521;DP=79;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=3.74;ReadPosRankSum=-1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:324,0,2150 -chr11 43329102 . C A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.470;DP=66;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.951;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:66:99:1118,0,1087 -chr11 43566508 . G T 453.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.470;DP=13;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=34.92;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:481,0,5 -chr11 43569001 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:271,0,391 -chr11 43570997 . T C 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.651;DP=43;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.895;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:693,0,808 -chr11 43573627 . G C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-0.520;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=5.04;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:462,0,4334 -chr11 43580208 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.62;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:354,0,144 -chr11 43581043 . A G 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.493;DP=58;FS=9.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:909,0,1507 -chr11 43581556 . GA G 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.495;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,36:104:99:963,0,1818 -chr11 43601655 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:292,0,244 -chr11 43606822 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:285,0,478 -chr11 43687747 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.850;DP=39;FS=5.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:233,0,1109 -chr11 43793662 . C A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.417;DP=57;FS=6.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:400,0,1520 -chr11 43799416 . G T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.928;DP=68;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:905,0,1464 -chr11 43811333 . GAGGTGAGATGAAGCATGTGTGTGTGTGTTTTATGACCGTATATATGTCATACTGATACACTCAGATGACTCTCTCTGCCTTTTCTTCCCAC G 2129.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.099;DP=53;FS=6.201;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,49:52:77:2167,77,0 -chr11 43849110 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.165;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:309,0,375 -chr11 43997114 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:425,0,119 -chr11 44019107 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:407,0,254 -chr11 44113199 . G GA 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.114;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,41:181:99:455,0,3894 -chr11 44113550 . TCACA T 224.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:15:262,15,0 -chr11 44113872 . AAG A 4017.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-1.207;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,119:132:99:4055,0,131 -chr11 44120331 . C T 4502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-2.377;DP=264;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,155:261:99:4531,0,3775 -chr11 44127074 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,223 -chr11 44136116 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.709;DP=195;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,49:195:99:1098,0,5623 -chr11 44139712 . C T 4957.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=1.014;DP=139;FS=1.309;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=26.97;ReadPosRankSum=3.511 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,128:138:99:4986,198,0 -chr11 44140458 . C G 2630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-2.896;DP=172;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,80:171:99:2659,0,2888 -chr11 44161664 . G A 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.994;ClippingRankSum=-0.345;DP=228;FS=8.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,67:226:99:1711,0,5699 -chr11 44161676 . G A 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.643;DP=230;FS=5.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,65:229:99:1589,0,5989 -chr11 44162084 . G A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-1.979;DP=183;FS=6.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,42:182:99:824,0,5034 -chr11 44491134 . GAGGTCAGAAACAGCACAAACAACCCAGCAATCTGGGAATATTTACCCTGAACACACACAAAAACATCCCTGCACGTGTATTATTACAGTTCCACACTGTTTGTTTTAC G 12688.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.102;DP=295;FS=3.377;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,271:272:99:12726,1189,0 -chr11 44494067 . T C 4299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.999;DP=342;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,129:341:99:4328,0,9535 -chr11 44568553 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.548;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:452,0,439 -chr11 44570278 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:283,0,105 -chr11 44583264 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:87:229,0,87 -chr11 44693858 . G T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=1.184;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=7.77;ReadPosRankSum=-2.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:541,0,1717 -chr11 44694102 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-1.985;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:501,0,741 -chr11 44707617 . TA T 315.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.425;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=21.06;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:16:353,0,16 -chr11 45003375 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.065;DP=42;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:533,0,839 -chr11 45100239 . C A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:355,0,54 -chr11 45248862 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=-0.790;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=12.95;ReadPosRankSum=2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:339,0,407 -chr11 45354620 . C G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-0.150;DP=93;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:630,0,2468 -chr11 45358514 . C CT 313.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr11 45358520 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 -chr11 45411685 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.976;DP=135;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,38:135:99:895,0,4464 -chr11 45416297 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-1.343;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,26:149:99:355,0,4386 -chr11 45418850 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.185;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=2.05;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,27:149:99:334,0,4407 -chr11 45419288 . C T 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.713;DP=147;FS=2.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=11.58;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,54:147:99:1730,0,3011 -chr11 45431405 . G A 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.542;DP=105;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1286,0,2256 -chr11 45431419 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-1.097;DP=108;FS=6.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:108:99:1230,0,2309 -chr11 45438715 . C T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-1.187;DP=168;FS=11.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,44:153:99:1002,0,3203 -chr11 45443826 . A G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-1.777;DP=177;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,36:177:99:588,0,5369 -chr11 45445312 . A C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-1.027;DP=187;FS=2.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=5.96;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,51:187:99:1142,0,5065 -chr11 45447445 . A C 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=1.541;DP=149;FS=4.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,37:148:99:827,0,4282 -chr11 45448942 . GT G 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.030;DP=43;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:348,0,627 -chr11 45449279 . G GT 963.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.892;DP=81;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,42:73:99:1001,0,757 -chr11 45458182 . GCTGAAACCAAAGCAGAAATGTTGAGATGAGACCATATATTGATGTTATCAGTGGTCCTTATAGATTTCACGATGGTGATTTCATAC G 1831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=3.286;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,44:49:99:1869,0,1527 -chr11 45464702 . G A 687.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.456;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=19.63;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:12:715,12,0 -chr11 45474683 . G A 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=1.677;DP=113;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,43:113:99:1431,0,2305 -chr11 45478327 . A G 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.576;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:1552,0,2621 -chr11 45571352 . C T 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.861;DP=150;FS=0.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1072,0,3798 -chr11 45571646 . G A 2751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-2.485;DP=180;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,83:180:99:2780,0,4142 -chr11 45652929 . G C 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.426;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:631,0,374 -chr11 45653094 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-1.154;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:387,0,338 -chr11 45656497 . CAAAGTAAGAGCGCCTGATACACTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGTGTAACTATACACATCCTGTTTGTGACG C 859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:77:897,77,0 -chr11 45656578 . G A 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-1.387;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:77:897,77,0 -chr11 45658096 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.813;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:297,0,420 -chr11 45658399 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.496;DP=48;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:660,0,2250 -chr11 45658400 . A T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.156;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.856;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:660,0,2271 -chr11 45658412 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=57;FS=2.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:239,0,3348 -chr11 45660627 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.058;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:507,0,1008 -chr11 45663195 . A T 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.245;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,38:78:99:1402,0,1324 -chr11 45663249 . A G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.538;DP=74;FS=4.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=5.62;ReadPosRankSum=3.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:444,0,4971 -chr11 45714557 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.706;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:513,0,312 -chr11 45714639 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=3.112;DP=26;FS=10.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:404,0,431 -chr11 45718173 . A G 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.552;DP=55;FS=11.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:840,0,1154 -chr11 45718839 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=-1.214;DP=42;FS=6.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:358,0,1096 -chr11 45718889 . A G 5214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=1.562;DP=168;FS=9.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=31.04;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,131:168:99:5243,0,760 -chr11 45719044 . C T 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.453;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=13.61;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:1376,0,2009 -chr11 45719189 . T TTG 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=1.030;DP=126;FS=3.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=7.39;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,36:108:99:968,0,2696 -chr11 45719288 . A T 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.491;ClippingRankSum=2.967;DP=92;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=9.87;ReadPosRankSum=2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:90:99:936,0,1967 -chr11 45720777 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=2.286;DP=45;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=15.68;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:734,0,778 -chr11 45728179 . A G 1777.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=1.251;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.296;QD=34.86;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,46:51:17:1806,17,0 -chr11 45728796 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:337,0,47 -chr11 45735598 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.169;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:567,0,718 -chr11 45735652 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.636;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:706,0,894 -chr11 45736674 . C G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.905;DP=45;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:99:1431,0,133 -chr11 45736768 . G C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.887;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.446;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:779,0,793 -chr11 45737018 . G T 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1178,84,0 -chr11 45746262 . A T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:465,0,421 -chr11 45749516 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.867;DP=14;FS=16.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.48;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:329,0,155 -chr11 45749633 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.326;DP=49;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:556,0,1071 -chr11 45750148 . T G 228.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:257,0,16 -chr11 45751257 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=3.444;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,319 -chr11 45752267 . AACCTGGCGGAGAAACAGGAGTGAGTGCAGGGGTCCAGTTCATTAACGGAGCACACTATCTAGCATTCTC A 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:359,0,499 -chr11 45752979 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.99;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:258,0,516 -chr11 45769156 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.598;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=19.90;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:486,0,311 -chr11 45769272 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.514;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:358,0,368 -chr11 45769317 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=3.594;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,705 -chr11 45769318 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=3.594;DP=22;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,705 -chr11 45769414 . T G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=2.633;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:590,0,746 -chr11 45769426 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=2.812;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=13.16;ReadPosRankSum=-3.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:410,0,662 -chr11 45769538 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:301,0,469 -chr11 45772244 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-1.058;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:284,0,1360 -chr11 45774198 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.481;DP=49;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.279;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:779,0,843 -chr11 45778674 . C G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-0.192;DP=75;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:548,0,1964 -chr11 45854833 . C T 372.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=31.03;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:400,8,0 -chr11 45858485 . A G 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr11 45859880 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr11 45900362 . T C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr11 45900363 . A G 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr11 45901079 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:460,0,119 -chr11 45903722 . C T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=-1.547;DP=114;FS=6.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:824,0,3231 -chr11 45903923 . C A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=1.119;DP=211;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,45:211:99:830,0,5910 -chr11 45904180 . G T 1990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=2.212;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=27.67;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,51:56:29:2019,29,0 -chr11 45908344 . C A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.424;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,33:110:99:911,0,5830 -chr11 45908353 . T A 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.863;DP=93;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:911,0,5830 -chr11 45930596 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.613;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:253,0,729 -chr11 45930794 . T G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.290;DP=44;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:330,0,1117 -chr11 45930853 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.352;DP=44;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:245,0,1247 -chr11 45936820 . C G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:88:283,0,88 -chr11 45937776 . C T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr11 45941095 . T C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr11 45955670 . T C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr11 45955854 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.969;DP=56;FS=10.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:580,0,1342 -chr11 45955882 . G A 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-0.126;DP=61;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=13.23;ReadPosRankSum=2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:835,0,1266 -chr11 45973039 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-1.495;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:835,0,743 -chr11 45977077 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.656;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:429,0,1548 -chr11 45977110 . GCAGGTCAGTGTGTGTCTCTGTGTGCATGTGTGTGTGCGCGCGAGCATTTGTGTGTGACTCGGTGTGTTCTCTGCT G 2744.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-1.837;DP=64;FS=6.182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:99:2782,250,0 -chr11 45981382 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=4.004;DP=28;FS=12.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=10.71;ReadPosRankSum=-3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:328,0,670 -chr11 45986554 . A G 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-2.385;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=21.66;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:548,0,356 -chr11 46002199 . C T 4812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-1.639;DP=377;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,144:377:99:4841,0,7923 -chr11 46033266 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.515;DP=39;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:273,0,1101 -chr11 46033954 . CT C 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.185;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:40:394,0,40 -chr11 46034749 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-2.392;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:270,0,823 -chr11 46035004 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-0.043;DP=40;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:435,0,989 -chr11 46036855 . T G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-2.908;DP=45;FS=6.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.842;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:530,0,1426 -chr11 46037620 . A T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.100;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=20.15;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:653,0,526 -chr11 46038779 . T C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.843;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:623,0,1634 -chr11 46045843 . G A 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.932;DP=77;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1377,0,1371 -chr11 46094988 . G A 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.880;DP=219;FS=12.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,71:215:99:1944,0,5400 -chr11 46095496 . G A 1502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=-1.377;DP=146;FS=18.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,54:73:99:1531,0,279 -chr11 46097360 . T G 5519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:5548,0,3396 -chr11 46099086 . T TA 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-1.279;DP=34;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:505,0,1341 -chr11 46099104 . AACACACACACACACACACACACAC A 2372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.318;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=32.79;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:2410,0,692 -chr11 46133264 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr11 46136091 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.760;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:285,0,470 -chr11 46146909 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-1.621;DP=60;FS=7.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:447,0,1565 -chr11 46147319 . G A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.586;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:694,0,1630 -chr11 46160134 . T A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.979;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:681,0,692 -chr11 46160152 . A G 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=1.564;DP=33;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:577,0,554 -chr11 46166637 . G C 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.533;DP=61;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:723,0,1346 -chr11 46168009 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.452;DP=67;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:929,0,1834 -chr11 46168017 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.484;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:491,0,2332 -chr11 46168509 . A T 261.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:290,0,22 -chr11 46179770 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.047;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:312,0,922 -chr11 46190166 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.549;DP=39;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.042;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:599,0,715 -chr11 46192742 . G T 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=-0.061;DP=138;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,55:138:99:1766,0,2849 -chr11 46193251 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,410 -chr11 46197127 . G GCT 754.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.890;DP=60;FS=7.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:62:792,0,62 -chr11 46197258 . C T 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.811;DP=59;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=19.39;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1172,0,2830 -chr11 46200088 . C A 4765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.174;DP=378;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.893;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,142:376:99:4794,0,7912 -chr11 46204442 . G A 3379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-1.769;DP=287;FS=0.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,103:285:99:3408,0,6338 -chr11 46207308 . C A 1709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.157;DP=147;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,51:147:99:1738,0,3274 -chr11 46207365 . G A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.460;DP=137;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,42:137:99:1127,0,3689 -chr11 46207950 . G A 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.766;DP=137;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,47:137:99:1580,0,3110 -chr11 46215735 . T C 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.346;DP=100;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.55;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,39:100:99:1183,0,2109 -chr11 46231266 . C T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.795;DP=36;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.093;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:781,0,482 -chr11 46234128 . G A 1721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=2.850;DP=216;FS=4.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,67:216:99:1750,0,5538 -chr11 46246371 . A C 1272.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.038;DP=48;FS=14.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:52:1301,52,0 -chr11 46246383 . T C 2084.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=1.334;DP=132;FS=8.725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2113,147,0 -chr11 46249480 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.155;DP=48;FS=3.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:775,0,858 -chr11 46251528 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=5.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:251,0,1543 -chr11 46251537 . C A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.354;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:432,0,1335 -chr11 46253490 . C A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.534;DP=44;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:827,0,561 -chr11 46259079 . G A 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.834;DP=78;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,43:78:99:1408,0,1224 -chr11 46263729 . GTTTTATTTCTCAGATTTGTGAGGAAAAAGTA G 966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=2.279;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:1004,0,3679 -chr11 46263845 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.746;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:337,0,353 -chr11 46266807 . G A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr11 46267648 . T A 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-0.708;DP=41;FS=18.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:874,0,550 -chr11 46268504 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-1.036;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:422,0,918 -chr11 46268656 . G T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=-0.933;DP=36;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:704,0,1318 -chr11 46280079 . G T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=-0.432;DP=46;FS=11.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:573,0,838 -chr11 46291882 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.234;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:441,0,975 -chr11 46292281 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=1.939;DP=57;FS=8.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:489,0,1435 -chr11 46293284 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.271;DP=36;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:522,0,649 -chr11 46299387 . G A 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.047;DP=164;FS=0.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,47:164:99:1129,0,4352 -chr11 46301351 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.786;DP=177;FS=5.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1107,0,3828 -chr11 46301425 . TCA T 601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.970;DP=52;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=11.57;ReadPosRankSum=3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:639,0,531 -chr11 46302112 . G A 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.865;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,42:116:99:1397,0,2473 -chr11 46303069 . G A 2817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.637;DP=116;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=24.29;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,77:116:99:2846,0,1008 -chr11 46335409 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.848;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:336,0,248 -chr11 46368560 . A T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.181;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:406,0,1139 -chr11 46374769 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,366 -chr11 46390720 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.031;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:776,0,855 -chr11 46407451 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.539;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=20.80;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:569,0,291 -chr11 46407578 . G A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-1.077;DP=38;FS=5.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=2.569;QD=26.31;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1028,0,211 -chr11 46407608 . CGGTCAGTCCAGTTATTATCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTTACTCACTGACCTGTGTGTGTGTGCA C 1590.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=1.436;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1628,148,0 -chr11 46407738 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.487;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=21.45;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:779,0,398 -chr11 46407783 . AGTATGACTGACACACACACACACACACACAAACACACACACACACACCTTTTATATTTTTATAGCCTTTTCATATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAG A 1578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.518;DP=36;FS=6.146;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=33.34;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1616,156,0 -chr11 46408858 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.753;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:358,0,586 -chr11 46408870 . T C 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=1.891;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:539,0,576 -chr11 46415923 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.798;DP=78;FS=6.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=11.01;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:887,0,1694 -chr11 46417267 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-2.049;DP=46;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=6.17;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:312,0,1257 -chr11 46439828 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,452 -chr11 46442844 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.119;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:277,0,393 -chr11 46461913 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.822;DP=74;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:360,0,2261 -chr11 46461961 . G C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.664;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:497,0,2215 -chr11 46547575 . G A 1910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.118;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,53:117:99:1939,0,2194 -chr11 46550491 . G A 2312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-1.091;DP=199;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,71:198:99:2341,0,4546 -chr11 46572183 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.607;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:816,0,1697 -chr11 46591816 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.026;DP=57;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:707,0,1294 -chr12 152633 . C T 346.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=31.47;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4:373,0,4 -chr12 152738 . G T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=27.34;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:77:411,0,77 -chr12 152858 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.690;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=27.21;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:518,0,111 -chr12 287169 . AACACACACACACACACACAC A 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=4.295;DP=50;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:443,0,3378 -chr12 287491 . C CTG 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.048;DP=90;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:382,0,601 -chr12 293178 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=30.06;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:419,0,44 -chr12 295483 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr12 295486 . T A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr12 295687 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.467;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=23.11;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:86:398,0,86 -chr12 295784 . T C 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:447,30,0 -chr12 295794 . A G 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:447,30,0 -chr12 295915 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=1.468;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,324 -chr12 295917 . T G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.929;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,324 -chr12 323503 . TGC T 1806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=-2.261;DP=333;FS=13.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=5.43;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,6:325:99:1844,0,11429 -chr12 323560 . AGT A 1318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=2.588;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=4.87;ReadPosRankSum=4.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,111:262:99:1356,0,12525 -chr12 509075 . C T 1848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=-0.439;DP=64;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,52:64:99:1877,0,201 -chr12 511729 . C T 2787.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-0.710;DP=77;FS=3.317;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,69:77:52:2816,52,0 -chr12 511739 . C T 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=-0.636;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1306,0,1455 -chr12 514095 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.483;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:621,0,1318 -chr12 520315 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=1.909;DP=34;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:245,0,1397 -chr12 520324 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=1.342;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=31.34;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:937,0,178 -chr12 520344 . C A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.423;DP=23;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=22.69;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:550,0,167 -chr12 520406 . G A 2306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=1.503;DP=72;FS=6.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,60:72:99:2335,0,106 -chr12 520539 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.103;DP=75;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:534,0,2058 -chr12 520596 . T G 2587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.820;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=32.00;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,62:66:99:2616,156,0 -chr12 521424 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.287;DP=50;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:526,0,1142 -chr12 528719 . C T 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.148;DP=53;FS=9.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1366,0,373 -chr12 545481 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:352,0,45 -chr12 545511 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,328 -chr12 545531 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.238;DP=16;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:517,0,39 -chr12 545621 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:259,0,716 -chr12 545657 . A G 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.031;DP=27;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=30.10;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:70:841,0,70 -chr12 545822 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=1.817;DP=39;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:654,0,712 -chr12 545844 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-2.072;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:698,0,767 -chr12 545952 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=19.47;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:593,0,370 -chr12 545964 . T G 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.281;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=21.33;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:732,0,393 -chr12 546126 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:300,0,819 -chr12 546132 . C G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.858;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=14.30;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:300,0,820 -chr12 546281 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.626;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:343,0,390 -chr12 546516 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.899;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:549,0,444 -chr12 546627 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:397,0,408 -chr12 546631 . T C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:31:676,0,31 -chr12 546801 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.788;DP=28;FS=10.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:746,0,217 -chr12 546862 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.228;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:337,0,922 -chr12 548470 . A G 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=-0.149;DP=35;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:616,0,604 -chr12 550616 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=1.833;DP=24;FS=4.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=28.62;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:715,0,149 -chr12 551895 . G C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:74:475,0,74 -chr12 551988 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.883;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:336,0,334 -chr12 552007 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:316,0,178 -chr12 552084 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 552093 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr12 552411 . C A 382.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.290;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:410,0,8 -chr12 552443 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=17.24;ReadPosRankSum=-2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:304,0,355 -chr12 552690 . G T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=-1.716;DP=30;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=31.29;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:967,0,218 -chr12 552831 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=1.951;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:265,0,1036 -chr12 553500 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=1.833;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:355,0,624 -chr12 553632 . TA T 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.929;DP=15;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:80:280,0,80 -chr12 553875 . A G 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-2.548;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:515,0,118 -chr12 553888 . T C 291.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:320,0,19 -chr12 554228 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.151;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:427,0,247 -chr12 554319 . G C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,161 -chr12 554652 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:269,0,60 -chr12 554722 . C T 252.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.60;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:281,0,21 -chr12 554991 . AG A 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.944;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:322,0,202 -chr12 555104 . C T 283.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:312,0,18 -chr12 555941 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:323,0,246 -chr12 556227 . G A 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:472,33,0 -chr12 556255 . C T 590.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:3:617,3,0 -chr12 556341 . A G 609.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.211;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=33.88;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:25:638,0,25 -chr12 556381 . T C 712.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=1.187;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=28.21;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:15:741,15,0 -chr12 556476 . A C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.009;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=28.71;ReadPosRankSum=1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:545,0,106 -chr12 556514 . T A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-1.156;DP=21;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:518,0,241 -chr12 556645 . G T 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.995;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:980,0,200 -chr12 556684 . GT G 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.215;DP=34;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:621,0,183 -chr12 558402 . A T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:446,0,244 -chr12 558465 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.099;DP=19;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=23.41;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:473,0,166 -chr12 558654 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:474,0,214 -chr12 558784 . T A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.168;DP=19;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:74:618,0,74 -chr12 558821 . T A 238.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:267,0,22 -chr12 558894 . A G 512.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.810;DP=15;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:3:539,3,0 -chr12 559951 . T A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.611;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=29.73;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:41:385,0,41 -chr12 560239 . C A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:556,0,348 -chr12 560410 . T G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.134;DP=22;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:340,0,458 -chr12 560575 . A C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-1.237;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:352,0,224 -chr12 560745 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,735 -chr12 560746 . GT G 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.753;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=18.07;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,735 -chr12 560890 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,135 -chr12 561479 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:49:275,0,49 -chr12 572968 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.589;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:260,0,768 -chr12 573005 . G T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.407;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=21.34;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:839,0,446 -chr12 573224 . G T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-1.260;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:592,0,288 -chr12 574074 . C T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-0.071;DP=39;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:635,0,1540 -chr12 574077 . C T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.146;DP=40;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.167;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:635,0,1546 -chr12 576426 . C T 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.645;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=20.37;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:1067,0,1618 -chr12 576427 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-1.208;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=20.37;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:1067,0,1618 -chr12 576524 . G T 1791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.198;DP=53;FS=8.126;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,48:53:39:1820,39,0 -chr12 577445 . C G 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.517;DP=56;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,47:56:99:1761,0,133 -chr12 578857 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=1.306;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=24.72;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:671,0,208 -chr12 580746 . G A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.206;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:967,0,304 -chr12 583681 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-1.927;DP=53;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:330,0,1402 -chr12 583747 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.249;DP=30;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:846,0,153 -chr12 583807 . T C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.935;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:695,0,243 -chr12 585264 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=2.948;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:422,0,535 -chr12 585330 . A G 621.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=1.059;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=31.09;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:27:650,0,27 -chr12 588145 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.353;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:502,0,636 -chr12 594660 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=27.98;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:86:392,0,86 -chr12 597241 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-0.107;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:334,0,1008 -chr12 598983 . T C 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr12 598989 . A G 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 -chr12 601123 . C G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.936;DP=22;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:352,0,344 -chr12 601401 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.651;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:433,0,325 -chr12 601557 . T C 605.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=33.33;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:7:633,7,0 -chr12 604651 . G A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.013;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:937,0,795 -chr12 606113 . A G 1175.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=-0.907;DP=35;FS=5.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:26:1204,0,26 -chr12 609588 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:282,0,259 -chr12 611303 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.074;DP=47;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:844,0,799 -chr12 614036 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-1.197;DP=17;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=28.52;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:52:513,0,52 -chr12 616130 . G T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.686;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:554,0,421 -chr12 616233 . G A 857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.157;DP=24;FS=2.706;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:59:886,59,0 -chr12 616288 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.529;DP=45;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=22.11;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:1023,0,565 -chr12 616312 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.593;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=32.61;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:40:1398,0,40 -chr12 616872 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-0.861;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=25.07;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:680,0,194 -chr12 621157 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-1.156;DP=34;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:568,0,605 -chr12 623134 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=1.943;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:379,0,429 -chr12 623152 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=1.115;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=12.67;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:269,0,326 -chr12 658832 . C G 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr12 705516 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr12 749902 . A G 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:584,45,0 -chr12 790746 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=-3.256;DP=40;FS=10.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=15.54;ReadPosRankSum=3.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:650,0,1974 -chr12 805262 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=22.41;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:342,0,173 -chr12 807382 . C T 599.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.091;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:627,11,0 -chr12 815611 . C A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-0.427;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=20.79;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:631,0,366 -chr12 816242 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.223;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:324,0,259 -chr12 817542 . C A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.279;DP=28;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=21.99;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:644,0,247 -chr12 818068 . C G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:639,0,453 -chr12 818119 . T C 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.173;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=18.88;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:538,0,365 -chr12 823923 . A G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.827;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:559,0,281 -chr12 823999 . C T 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=-0.081;DP=29;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=29.54;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:885,0,129 -chr12 824059 . T C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=25.65;ReadPosRankSum=-2.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:490,0,159 -chr12 827293 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=-1.001;DP=52;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=8.53;ReadPosRankSum=3.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:472,0,1363 -chr12 827347 . A G 1843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-0.572;DP=100;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1872,0,1806 -chr12 827380 . T A 2574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.659;DP=115;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,73:115:99:2603,0,1454 -chr12 827430 . G A 4721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-0.857;DP=201;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=23.49;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,133:201:99:4750,0,2344 -chr12 827569 . A C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-4.756;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=3.19;ReadPosRankSum=-4.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,25:125:99:427,0,3938 -chr12 842695 . T C 2565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.445;DP=152;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,80:152:99:2594,0,3172 -chr12 842811 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=1.339;DP=107;FS=6.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=2.66;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,20:107:99:313,0,3284 -chr12 845346 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.176;DP=27;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:565,0,351 -chr12 845357 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=20.73;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:650,0,388 -chr12 847468 . C G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.197;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:609,0,493 -chr12 850186 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,203 -chr12 983723 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,255 -chr12 985128 . TA T 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-1.083;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:54:320,0,54 -chr12 1045061 . AGTGTGT A 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=4.233;DP=50;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=7.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:391,0,1797 -chr12 1114118 . T C 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.732;DP=65;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,44:61:99:1612,0,392 -chr12 1216220 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.179;DP=98;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:276,0,2995 -chr12 1273106 . CA C 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.875;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:19:291,0,19 -chr12 1446567 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,182 -chr12 1449132 . T A 638.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-1.349;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=33.17;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:8:666,8,0 -chr12 1565905 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:303,0,488 -chr12 1627775 . T G 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=-0.807;DP=78;FS=7.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,42:78:99:1452,0,1251 -chr12 1627915 . C G 1344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-0.949;DP=71;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1373,0,987 -chr12 1731377 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.601;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:438,0,322 -chr12 1733586 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=-2.127;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:476,0,461 -chr12 1787035 . GT G 253.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.05;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:291,22,0 -chr12 1787038 . A C 262.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:22:291,22,0 -chr12 1877586 . A G 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.040;DP=88;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=20.69;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,55:87:99:1849,0,1054 -chr12 1928887 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.295;DP=44;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:751,0,646 -chr12 1929770 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-2.936;DP=38;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:603,0,737 -chr12 1929918 . C T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.661;DP=47;FS=6.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:1124,0,1615 -chr12 1929934 . A T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=-0.885;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:1132,0,1615 -chr12 1931534 . T A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=2.665;DP=48;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:377,0,1374 -chr12 2151293 . TA T 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-1.113;DP=105;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.978;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,27:87:99:503,0,1413 -chr12 2153952 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-1.668;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,25:92:99:573,0,2552 -chr12 2157031 . C A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=-0.778;DP=107;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:536,0,3019 -chr12 2666947 . G A 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr12 2677320 . T C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=1.674;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:545,0,146 -chr12 2685799 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:371,0,172 -chr12 2685929 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=1.344;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:346,0,132 -chr12 2746644 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.716;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=11.55;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:340,0,677 -chr12 2764712 . T G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.052;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:626,0,1621 -chr12 2766171 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.919;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:387,0,114 -chr12 2768770 . C T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.381;DP=55;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:637,0,1304 -chr12 2769793 . G T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.878;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:649,0,554 -chr12 2770386 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.532;DP=52;FS=7.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:278,0,2701 -chr12 2770863 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=-0.616;DP=49;FS=7.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:275,0,1334 -chr12 2772024 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=1.350;DP=51;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:448,0,1294 -chr12 2779176 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.692;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:524,0,480 -chr12 2934856 . A T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=1.266;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=17.78;ReadPosRankSum=-2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:366,0,287 -chr12 2934867 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.444;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:288,0,356 -chr12 2934988 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:307,0,129 -chr12 2935009 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:238,0,66 -chr12 2935351 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.453;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,428 -chr12 2949801 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=1.588;DP=17;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,272 -chr12 3053936 . C T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr12 3318187 . G C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.334;DP=63;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:357,0,1716 -chr12 3350409 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:290,0,957 -chr12 3350805 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.993;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,245 -chr12 3353484 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:256,0,355 -chr12 3356777 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:313,0,1022 -chr12 3357222 . A C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=2.523;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=17.18;ReadPosRankSum=-2.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:389,0,319 -chr12 3358699 . C A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.908;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:404,0,1222 -chr12 3421769 . CGGTGAGTTTGGTTTCTTCAGAAGCTTTCAGATGTGTGTTTCAGATGGTGTGTAAGTGTTTGTGTGTTGTGTGCA C 1478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.738;DP=45;FS=2.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:99:1516,0,625 -chr12 3428031 . T G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:277,0,557 -chr12 3428771 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.369;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:549,0,463 -chr12 3471273 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.424;DP=40;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:258,0,1100 -chr12 3471462 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.462;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.89;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:295,0,693 -chr12 3473752 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=14.47;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:361,0,465 -chr12 3477908 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=1.967;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:265,0,404 -chr12 3478658 . C T 241.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:270,0,22 -chr12 3479254 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:276,0,392 -chr12 3487791 . G T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,423 -chr12 3489430 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:371,0,170 -chr12 3490674 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.572;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:437,0,652 -chr12 3491389 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,172 -chr12 3498715 . TCCTGGACGAACACATTATTACTCCATCTGCAGATCTTTCAGAAGTGTAAACACGTGTAGAATAAGGATATTTTAGCATCTTATTAGAGGTTGCTTA T 243.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:281,22,0 -chr12 3611750 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=2.069;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=14.87;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:281,0,295 -chr12 3642061 . T A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.560;DP=121;FS=1.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:406,0,3698 -chr12 3648622 . T C 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.191;DP=24;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:673,0,178 -chr12 3651127 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=3.636;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:234,0,854 -chr12 3660518 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.317;DP=37;FS=8.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:279,0,1023 -chr12 3684377 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-1.510;DP=47;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:275,0,2993 -chr12 3684927 . G T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=1.362;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=7.85;ReadPosRankSum=3.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:648,0,2189 -chr12 3687681 . C T 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.866;DP=300;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,52:300:99:1263,0,16667 -chr12 3688068 . CA C 880.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-2.770;DP=297;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.062;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,71:291:99:918,0,9736 -chr12 3696635 . G A 2147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=1.967;DP=625;FS=4.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:492,127:619:99:2176,0,16424 -chr12 3701710 . G A 5697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.870;DP=443;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=12.86;ReadPosRankSum=2.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,168:441:99:5726,0,9124 -chr12 3709017 . A G 5980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=-0.220;DP=742;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:505,237:742:99:6009,0,18265 -chr12 3713661 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=1.277;DP=412;FS=6.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=1.57;ReadPosRankSum=3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:343,68:411:99:674,0,12650 -chr12 3714666 . C CA 15616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=2.596;DP=554;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=28.19;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,402:518:99:15654,0,1990 -chr12 3716172 . A G 8127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-2.139;DP=454;FS=5.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=17.90;ReadPosRankSum=2.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,258:453:99:8156,0,6529 -chr12 3805135 . C CT 1358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-1.350;DP=165;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,71:130:99:1451,0,1491 -chr12 3882225 . AT A 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.199;DP=42;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:543,0,393 -chr12 3902312 . GACAGGTCAGAAGGTAATACATTTAGTCGCTGTCTTCAATAGTAAAGGAGGTGTTGATGGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCC G 1106.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=1.746;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=28.38;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:99:1144,0,706 -chr12 3903663 . T A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr12 3915504 . CCCTACATCCAAAATGCATAAGACGTGAGGTATATTTAACCCAACCCTCAACAACTGTGTTTTTGTTTCATATATATGTGTGTATCCTGTA C 782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:74:820,74,0 -chr12 4175371 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-2.134;DP=40;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,588 -chr12 4304780 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.747;DP=55;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:230,0,2243 -chr12 4316776 . T A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.624;DP=140;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:684,0,3798 -chr12 4356768 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-1.969;DP=38;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:338,0,1534 -chr12 4356787 . T G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.742;DP=41;FS=10.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:355,0,1671 -chr12 4356840 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=1.183;DP=32;FS=10.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1055,0,118 -chr12 4356922 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=2.493;DP=19;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:254,0,462 -chr12 4357004 . T A 1617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.926;DP=62;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:1646,0,569 -chr12 4357086 . A T 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-1.046;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:870,0,1267 -chr12 4361076 . G T 2118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.915;DP=87;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,62:87:99:2147,0,594 -chr12 4361121 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.374;DP=88;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:358,0,2467 -chr12 4364301 . T A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.234;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:62:674,0,62 -chr12 4368419 . A T 2141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.041;DP=77;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,58:77:99:2170,0,385 -chr12 4368552 . A G 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.513;DP=73;FS=6.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1290,0,1358 -chr12 4368701 . T C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-2.137;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:696,0,1821 -chr12 4487820 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.549;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,429 -chr12 4488117 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=24.15;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:318,0,118 -chr12 4556240 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.078;DP=54;FS=7.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.167;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:846,0,980 -chr12 4606917 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=2.644;DP=37;FS=1.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:370,0,960 -chr12 4607981 . C A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=1.718;DP=84;FS=2.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:482,0,2218 -chr12 4611099 . T G 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=1.180;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,35:103:99:1145,0,2409 -chr12 4614505 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.707;DP=92;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,21:92:99:437,0,2666 -chr12 4615513 . T C 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=-1.014;DP=83;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:665,0,4279 -chr12 4615515 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=-1.166;DP=83;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=8.18;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:707,0,4275 -chr12 4620391 . A T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.338;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:500,0,2677 -chr12 4625381 . GCTGCATAGTGAGAAGGGTTTAGATACACAGGCACACATGCACGTCTACAAAAGCACTTCAACACACACACTTCTGGAACAGCCGCGTCAAATGAACACAAGTGAGAAGCGTACAAGCTTGTGGATTATTGTTTATTTTATCATGGGTTTAGTGTGTTTGATATTTAC G 21275.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.383;ClippingRankSum=6.232;DP=482;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,464:482:99:21313,1821,0 -chr12 4634516 . T G 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=-0.055;DP=319;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,61:317:99:824,0,9239 -chr12 4638558 . T A 2030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.992;DP=403;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=5.04;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,97:402:99:2059,0,11652 -chr12 4644973 . C CTG 780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-2.235;DP=104;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.970;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:1114,0,1598 -chr12 4645681 . T C 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.045;DP=273;FS=7.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,105:273:99:3458,0,5544 -chr12 4724266 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=16.12;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,612 -chr12 4729905 . G T 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.232;DP=47;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=28.89;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1386,0,296 -chr12 4730016 . C G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=3.934;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:274,0,1666 -chr12 4730017 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=4.092;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:274,0,1666 -chr12 4730138 . T A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=2.690;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:620,0,629 -chr12 4733016 . G C 4042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=1.855;DP=369;FS=13.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.657;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,124:369:99:4071,0,8266 -chr12 4737701 . C T 3381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-0.050;DP=421;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=8.03;ReadPosRankSum=2.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,132:421:99:3410,0,10594 -chr12 4901183 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.098;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:243,0,1499 -chr12 4912289 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.756;DP=39;FS=8.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:291,0,2190 -chr12 4915002 . G C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.185;DP=51;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:619,0,1038 -chr12 4925517 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.182;DP=109;FS=6.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:326,0,3288 -chr12 4927636 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.869;DP=96;FS=1.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:627,0,2519 -chr12 4929371 . T TA 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-0.968;DP=69;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:275,0,1321 -chr12 5001059 . A AT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.229;DP=80;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:307,0,1410 -chr12 5103716 . T G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.104;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:31:507,0,31 -chr12 5103789 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.475;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=33.38;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:629,0,31 -chr12 5227416 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.888;DP=103;FS=7.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=4.76;ReadPosRankSum=2.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:518,0,2930 -chr12 5236212 . G A 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.910;DP=125;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,33:125:99:770,0,3480 -chr12 5244964 . T C 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-1.648;DP=99;FS=6.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.291;QD=19.57;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1966,0,1553 -chr12 5244970 . T A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=-1.394;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:594,0,4761 -chr12 5245390 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.139;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:437,0,654 -chr12 5245876 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=1.617;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=9.02;ReadPosRankSum=-1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:371,0,1810 -chr12 5245878 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=2.276;DP=37;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:371,0,1810 -chr12 5246794 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.269;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=2.89;ReadPosRankSum=2.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:242,0,3081 -chr12 5246860 . G A 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.025;DP=84;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:494,0,2977 -chr12 5247318 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=1.517;DP=89;FS=5.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:292,0,2905 -chr12 5247386 . T C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=1.438;DP=79;FS=7.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:557,0,2234 -chr12 5254222 . C G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-1.785;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:406,0,3233 -chr12 5254723 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.518;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:256,0,2497 -chr12 5288851 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-0.902;DP=76;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=4.92;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:402,0,2080 -chr12 5347745 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.577;DP=85;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:311,0,2585 -chr12 5356932 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.987;DP=136;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:285,0,4091 -chr12 5357494 . T C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.045;DP=108;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:453,0,3345 -chr12 5358168 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.777;DP=119;FS=3.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:353,0,4084 -chr12 5359723 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.894;DP=133;FS=5.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,29:133:99:557,0,3920 -chr12 5360046 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.596;DP=183;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,44:183:99:951,0,5374 -chr12 5360097 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.194;DP=175;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=3.54;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,36:175:99:647,0,5475 -chr12 5363691 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-3.828;DP=104;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:753,0,3490 -chr12 5367914 . G A 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.944;DP=98;FS=5.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.601;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:1128,0,2317 -chr12 5367947 . G C 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-1.072;DP=86;FS=0.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,35:86:99:1139,0,1651 -chr12 5368042 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-2.170;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:635,0,4272 -chr12 5368043 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-1.483;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:635,0,4272 -chr12 5372607 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.502;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.376;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,31:153:99:552,0,4666 -chr12 5376877 . T A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.406;DP=134;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:663,0,3899 -chr12 5377031 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.998;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,21:117:99:319,0,3460 -chr12 5385737 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-0.951;DP=31;FS=6.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:294,0,779 -chr12 5439927 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=2.177;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:276,0,198 -chr12 5492353 . G T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.620;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=24.37;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,137 -chr12 5493587 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,232 -chr12 5494785 . A G 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:559,39,0 -chr12 5606184 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:235,0,49 -chr12 5652933 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.905;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:268,0,463 -chr12 5667589 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.373;DP=40;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=14.87;ReadPosRankSum=1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:623,0,710 -chr12 5672377 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.308;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:252,0,1931 -chr12 5675277 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=-0.688;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:686,0,648 -chr12 5675535 . A G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.392;DP=40;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:728,0,794 -chr12 5693545 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.049;DP=46;FS=6.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:528,0,997 -chr12 5693567 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-1.712;DP=38;FS=5.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:358,0,971 -chr12 5701324 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=1.209;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:388,0,656 -chr12 5738026 . GGGTAAGTCAACCAGTGTTTCCTTCTTCACACTGAGGTGTTTTTGAGCGTGCATTCTTACAGTCTCTCACTGTCCTTCTA G 14197.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.138;DP=379;FS=1.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,372:379:99:14235,1309,0 -chr12 5738243 . AGTGAGTTTACAGCTGGGTGGTGATGTGAATGCACTTATGCAATAGAAATGGCTCCATTGTAACGTGTGCTTTTGCAG A 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.922;DP=359;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:99:704,0,1593 -chr12 5742083 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=9.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:261,0,663 -chr12 5742553 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.172;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:741,0,1486 -chr12 5742557 . A G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.541;DP=38;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:741,0,1486 -chr12 5742616 . T A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.938;DP=39;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=10.20;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:426,0,1014 -chr12 5744921 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.504;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=27.89;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:959,0,232 -chr12 5745072 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=1.234;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:626,0,1352 -chr12 5745107 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.592;DP=66;FS=5.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:720,0,1925 -chr12 5745231 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-0.201;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:388,0,2105 -chr12 5747583 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=2.503;DP=92;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:497,0,2542 -chr12 5750139 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-2.670;DP=141;FS=6.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.42;ReadPosRankSum=2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:511,0,4263 -chr12 5750328 . C A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=1.370;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:697,0,2826 -chr12 5754942 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=1.711;DP=114;FS=2.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:675,0,3552 -chr12 5760541 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr12 5762675 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:349,0,332 -chr12 5773481 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=-0.636;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=13.72;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:426,0,510 -chr12 5786235 . GA G 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.537;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:546,0,923 -chr12 5796754 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=18.06;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,221 -chr12 5798127 . G C 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=2.249;DP=239;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=2.51;ReadPosRankSum=2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,46:239:99:629,0,6465 -chr12 5803186 . T G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.498;DP=216;FS=1.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,56:215:99:1282,0,6175 -chr12 5812511 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.839;DP=33;FS=9.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:247,0,944 -chr12 5895586 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.591;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:396,0,424 -chr12 5916047 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=-0.608;DP=20;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,378 -chr12 6059412 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.477;DP=50;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:253,0,1375 -chr12 6074720 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=-1.182;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,16:86:99:258,0,2636 -chr12 6076578 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.575;DP=121;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:304,0,3402 -chr12 6123091 . T C 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.084;DP=79;FS=5.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=20.00;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1608,0,3132 -chr12 6123099 . T A 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=1.138;DP=81;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=19.50;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:1608,0,3132 -chr12 6164352 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.353;DP=80;FS=3.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=3.00;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:268,0,2372 -chr12 6189272 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=2.167;DP=99;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:505,0,2913 -chr12 6189521 . A C 2190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-0.043;DP=118;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=18.57;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,67:115:99:2219,0,1714 -chr12 6199046 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=2.585;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:251,0,442 -chr12 6200920 . C G 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-1.891;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=15.83;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:503,0,551 -chr12 6201314 . AT A 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.757;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=4.512;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,1611 -chr12 6220061 . G T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.621;DP=37;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:981,0,243 -chr12 6224718 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=1.115;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.06;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:650,0,430 -chr12 6232262 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=1.319;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,625 -chr12 6232322 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=1.202;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:320,0,467 -chr12 6232391 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.475;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:667,0,604 -chr12 6234864 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.992;DP=33;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:417,0,737 -chr12 6255924 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.571;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:290,0,1134 -chr12 6281230 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.509;DP=61;FS=3.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:709,0,1557 -chr12 6281268 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-1.647;DP=54;FS=9.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:283,0,1400 -chr12 6284255 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:237,0,97 -chr12 6333657 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=1.336;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=13.08;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:316,0,477 -chr12 6333920 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-0.088;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:352,0,451 -chr12 6363671 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.031;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,186 -chr12 6374066 . T C 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-2.003;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:724,0,1637 -chr12 6374145 . T C 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.704;DP=98;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,37:98:99:1211,0,2159 -chr12 6376243 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.944;DP=96;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,20:96:99:404,0,2754 -chr12 6379159 . G C 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=-0.271;DP=117;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=8.94;ReadPosRankSum=3.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,38:117:99:1074,0,3075 -chr12 6379234 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.029;DP=110;FS=3.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:1022,0,2797 -chr12 6384089 . A G 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=1.036;DP=117;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,47:114:99:1666,0,2239 -chr12 6423594 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.683;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,289 -chr12 6665222 . A AT 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-1.101;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:396,0,2516 -chr12 6665356 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-0.051;DP=61;FS=7.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:768,0,2199 -chr12 6665495 . C T 2936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.027;DP=174;FS=3.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,91:174:99:2965,0,4167 -chr12 6677647 . G A 2607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-1.189;DP=158;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=16.50;ReadPosRankSum=2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:2636,0,2552 -chr12 6679620 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.516;DP=167;FS=16.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,28:167:99:377,0,5319 -chr12 6688146 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.476;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1032,0,1132 -chr12 6705997 . A T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=31.14;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:41:433,0,41 -chr12 6727902 . T C 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.963;ClippingRankSum=-0.181;DP=120;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,30:119:99:693,0,3032 -chr12 6727915 . C T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.436;DP=130;FS=0.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,35:130:99:857,0,3675 -chr12 6730292 . C T 2130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=-1.564;DP=132;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:2159,0,2277 -chr12 6731381 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.877;DP=105;FS=7.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:377,0,3296 -chr12 6736481 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.991;DP=54;FS=2.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:303,0,1575 -chr12 6794235 . A C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-1.994;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:304,0,887 -chr12 6848718 . TCTGCAAAAACCCAGGCAAAATGGTCCTTGGAGAAATATTCTCTAATCACCAATAGATGTTTTCGCTGAGGGTATGAGTGTAC T 3338.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.911;DP=81;FS=3.755;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=28.86;ReadPosRankSum=-2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,75:81:99:3376,276,0 -chr12 7131610 . CAGGTAAAACAAACATTGATCTTGTGGTGGTGATGATGGAGCTTAATCCAGCAAAACATCAGTGCTTTCCTTTGTATATTTAT C 2750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=2.016;DP=72;FS=2.195;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=32.83;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:2788,227,0 -chr12 7871358 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=-2.276;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:289,0,342 -chr12 7941337 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-1.588;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:260,0,374 -chr12 8084377 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.529;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=7.38;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:279,0,863 -chr12 8105780 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.543;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:282,0,552 -chr12 8271818 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=24.63;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,129 -chr12 8272602 . A C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=1.021;DP=37;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=15.53;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:603,0,962 -chr12 8272786 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.029;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:361,0,1274 -chr12 8309153 . GACCTAAGACAAGGGTGTAAATGTCTCAAGGCAATGTTTGTACCCACACATGGGCAGATGGAAGAGGACAGACATGGTAAAGTTAAGACATGTTAGAGGTGGGCATGGACATT G 2062.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=3.149;DP=63;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=32.74;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,49:63:99:2100,0,4308 -chr12 8311974 . GTA G 278.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:316,21,0 -chr12 8383013 . G C 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.597;DP=73;FS=1.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1041,0,1375 -chr12 8846713 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.488;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:349,0,1243 -chr12 9139044 . TA T 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:310,27,0 -chr12 9229769 . G T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-0.531;DP=81;FS=0.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:713,0,2097 -chr12 9230461 . T TG 1611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.27;MQ0=0;QD=28.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1649,126,0 -chr12 9274782 . C A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.343;DP=36;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:297,0,955 -chr12 9274846 . A G 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=-0.752;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:743,0,773 -chr12 9275098 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=2.448;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:299,0,1962 -chr12 9275155 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:402,0,81 -chr12 9275803 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.217;DP=16;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=26.61;ReadPosRankSum=-1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:76:454,0,76 -chr12 9276268 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.967;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:388,0,139 -chr12 9277952 . A C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.870;DP=29;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:553,0,322 -chr12 9278714 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.109;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:50:425,0,50 -chr12 9278834 . A G 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:60:854,60,0 -chr12 9332890 . G T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=1.084;DP=71;FS=0.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:900,0,1402 -chr12 9362431 . C A 1477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-2.032;DP=115;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,49:114:99:1506,0,2105 -chr12 9377270 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.990;DP=78;FS=3.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:1174,0,2898 -chr12 9378118 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.090;DP=58;FS=3.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:549,0,1350 -chr12 9625420 . G T 2258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.182;DP=247;FS=3.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,73:247:99:2287,0,6493 -chr12 9625429 . C T 1603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.014;DP=249;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,71:248:99:1632,0,13666 -chr12 9634994 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr12 9635073 . G A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr12 9635605 . C T 2112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=2.089;DP=273;FS=7.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,84:273:99:2141,0,7492 -chr12 9778325 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.509;DP=42;FS=2.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:478,0,931 -chr12 9859290 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-1.431;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,603 -chr12 9859317 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=8.77;ReadPosRankSum=-0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,685 -chr12 10060138 . T G 2180.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2209,162,0 -chr12 10060224 . A C 1688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1717,123,0 -chr12 10060235 . G T 1542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1571,111,0 -chr12 10060318 . G A 2615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2644,195,0 -chr12 10060365 . G A 2925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2954,214,0 -chr12 10060518 . T C 3665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3694,265,0 -chr12 10062237 . A T 3511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:85:99:3540,256,0 -chr12 10064288 . G A 3390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3419,249,0 -chr12 10069642 . T C 2438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2467,175,0 -chr12 10069797 . C A 3656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3685,265,0 -chr12 10069962 . A G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr12 10069966 . A G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr12 10109441 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=14.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:446,0,888 -chr12 10109834 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-1.932;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:232,0,193 -chr12 10113027 . T A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-0.415;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:523,0,504 -chr12 10113272 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=2.196;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:232,0,373 -chr12 10114000 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=1.928;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:368,0,352 -chr12 10156147 . T A 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.222;DP=52;FS=6.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,37:52:99:1383,0,379 -chr12 10165051 . A T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:415,0,268 -chr12 10165115 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,249 -chr12 10198840 . G GT 323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:361,33,0 -chr12 10199843 . A T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr12 10200505 . G A 766.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:795,54,0 -chr12 10202024 . T A 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr12 10202034 . C T 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:426,30,0 -chr12 10202109 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr12 10203893 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-1.813;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=33.10;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:624,0,363 -chr12 10203897 . A T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.848;DP=26;FS=4.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:624,0,307 -chr12 10204054 . A G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.118;DP=23;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:78:589,0,78 -chr12 10222666 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-1.037;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=17.46;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:552,0,312 -chr12 10237402 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.220;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:471,0,311 -chr12 10264536 . C CT 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-0.339;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=14.33;ReadPosRankSum=-1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:682,0,402 -chr12 10309059 . T C 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr12 10311059 . G A 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1183,87,0 -chr12 10335584 . G A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 -chr12 10335902 . G A 992.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1021,72,0 -chr12 10336030 . A T 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1369,96,0 -chr12 10338789 . G C 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:445,30,0 -chr12 10338799 . T G 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 -chr12 10431256 . A G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr12 10432412 . C A 1024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1053,72,0 -chr12 10432415 . G A 1024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:72:1053,72,0 -chr12 10451709 . A C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr12 10493248 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:266,0,90 -chr12 10522045 . A G 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.895;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=23.51;ReadPosRankSum=1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:992,0,373 -chr12 10534625 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,111 -chr12 10541700 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,371 -chr12 10555761 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-1.386;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:330,0,418 -chr12 10555928 . A G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=-0.380;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:581,0,693 -chr12 10559435 . G T 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.477;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=17.88;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:797,0,690 -chr12 10562838 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:280,0,445 -chr12 10609866 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.534;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.146;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:768,0,840 -chr12 10610020 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=1.395;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.973;QD=18.99;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:351,0,423 -chr12 10610030 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=1.629;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:247,0,641 -chr12 10611060 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=1.586;DP=47;FS=6.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:413,0,1247 -chr12 10611076 . T G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=2.664;DP=57;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=13.12;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:776,0,1256 -chr12 10611212 . A G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=2.409;DP=65;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=7.09;ReadPosRankSum=-2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:489,0,1631 -chr12 10632890 . T G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.994;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:849,0,320 -chr12 10730628 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=-1.610;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:448,0,296 -chr12 10747892 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=-0.108;DP=26;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=20.76;ReadPosRankSum=3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:568,0,262 -chr12 10748424 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:406,0,214 -chr12 10748543 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.866;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.71;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:255,0,324 -chr12 10748552 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=8;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=27.97;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:252,0,363 -chr12 10749818 . T G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:76:393,0,76 -chr12 10751810 . T A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-0.280;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:76:640,0,76 -chr12 10756737 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.952;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:272,0,598 -chr12 10757621 . A C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.448;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:545,0,329 -chr12 10757640 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=1.207;DP=24;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.969;QD=25.03;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:629,0,170 -chr12 10758090 . A C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.075;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=12.51;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,649 -chr12 10779496 . A G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.238;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=31.67;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:36:535,0,36 -chr12 10805505 . G T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-2.592;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:666,0,330 -chr12 10814408 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-1.870;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:563,0,612 -chr12 10814681 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.555;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,340 -chr12 10858415 . A G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-0.772;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=9.36;ReadPosRankSum=-2.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:693,0,1946 -chr12 10858428 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.259;DP=76;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:270,0,2712 -chr12 10858749 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.269;DP=119;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=4.12;ReadPosRankSum=-2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,31:118:99:518,0,7104 -chr12 10858767 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-3.221;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,23:124:99:298,0,6351 -chr12 11027284 . G T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr12 11029193 . C T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr12 11034538 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr12 11034567 . T G 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 -chr12 11059992 . G A 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:490,36,0 -chr12 11060112 . T G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:338,27,0 -chr12 11159392 . TGTGAGTATGTCTCTCTCTTTCTGACATGCGTACAGTGTCATTGCTGTTTACCGCACACACTATGCAAAAACCATGCTTTTCCTTGCTCTAG T 1619.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.193;DP=42;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=28.45;ReadPosRankSum=-2.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,38:42:99:1657,0,221 -chr12 11179383 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.989;DP=38;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:969,0,359 -chr12 11179485 . T C 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.584;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=25.61;ReadPosRankSum=-1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:566,0,166 -chr12 11180485 . A C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.801;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:451,0,479 -chr12 11180529 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:308,0,58 -chr12 11201460 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=16.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=21.62;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:266,0,144 -chr12 11203860 . G A 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-1.287;DP=74;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=21.33;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,46:74:99:1607,0,931 -chr12 11204475 . A G 1906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.379;DP=57;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=33.45;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:96:1935,0,96 -chr12 11204659 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.644;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:344,0,2564 -chr12 11206958 . C G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.949;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:566,0,624 -chr12 11207215 . G C 1777.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=29.13;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:99:1806,126,0 -chr12 11207268 . A G 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.810;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:584,0,802 -chr12 11207372 . C A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-2.591;DP=97;FS=10.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=5.21;ReadPosRankSum=2.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:534,0,3167 -chr12 11207529 . C G 1299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-0.110;DP=34;FS=3.003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,32:34:62:1328,62,0 -chr12 11208054 . A T 2787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.979;DP=100;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.553;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,72:100:99:2816,0,708 -chr12 11208103 . T A 2612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.338;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=29.03;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,67:89:99:2641,0,513 -chr12 11208248 . T TA 997.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.078;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1035,0,1026 -chr12 11208504 . AT A 688.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=-1.280;DP=55;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:726,0,324 -chr12 11239056 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.994;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:658,0,430 -chr12 11239395 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:387,0,172 -chr12 11239700 . AT A 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,614 -chr12 11239706 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:393,0,614 -chr12 11239817 . T A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:419,0,396 -chr12 11246394 . T C 7541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.652;DP=383;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,224:383:99:7570,0,5719 -chr12 11253841 . C A 7908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.078;DP=399;FS=12.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=19.82;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,237:398:99:7937,0,5502 -chr12 11278606 . A C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=25.44;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:588,0,205 -chr12 11453761 . C CGAAAAGACCAATTGTGGATGCT 13182.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,314:314:99:13220,865,0 -chr12 11457051 . GCTTGAAAAAAGAGAGGAAAAATTAAATTAATGACTGCTGTGGAAAATTAGTTCTTTCATAATAAGGAAACTTATAATGTAACAACATTATTAC G 13051.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.626;DP=358;FS=1.451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,334:341:99:13089,994,0 -chr12 11584850 . TCCAAAC T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:32:342,0,32 -chr12 11584860 . ATGCAAAAAAAAAAAACAAATTGGAAAAAAAAAATCAATGCAATCAATTAAGATACAAATGTAAAGAAGATGGGCTAGCACTT A 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:32:342,0,32 -chr12 11712591 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-0.344;DP=470;FS=4.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:394,73:467:99:513,0,20467 -chr12 11713930 . TGTGAGACACCACTTCCTTTTCACTTCACAGAGATGACGTGCTCTCCATATTGACTTCTAAAACTCTCCTTCCTCCTTTCAG T 9772.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=1.692;DP=373;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=26.20;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,317:335:99:9810,897,0 -chr12 12274527 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=-0.834;DP=87;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:433,0,2459 -chr12 14295079 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=-0.954;DP=117;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=3.24;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:407,0,3717 -chr12 14295080 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.620;DP=115;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:619,0,3528 -chr12 14295179 . T C 1929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.422;DP=111;FS=12.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,54:111:99:1958,0,1905 -chr12 14996260 . G GA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.272;DP=46;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:240,0,742 -chr12 15339482 . C T 2169.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=1.476;DP=66;FS=7.324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=32.88;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:2198,157,0 -chr12 15339636 . T C 1821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.049;DP=109;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=16.71;ReadPosRankSum=-5.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,47:69:99:1850,0,1337 -chr12 15339641 . A T 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=-0.831;DP=76;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=15.39;ReadPosRankSum=-6.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1198,0,1710 -chr12 15339793 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-1.934;DP=210;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:675,0,2402 -chr12 15339867 . A T 1162.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=44;FS=8.893;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:90:1191,90,0 -chr12 15339887 . C A 259.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:288,0,22 -chr12 15341590 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.354;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:84:362,0,84 -chr12 15341922 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=1.866;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,320 -chr12 15342283 . G A 4037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.878;DP=146;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=27.66;ReadPosRankSum=-1.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,102:122:99:4066,0,446 -chr12 15342539 . C G 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.762;DP=68;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:876,0,262 -chr12 15342576 . T A 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=1.151;DP=99;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=14.66;ReadPosRankSum=-1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1480,0,841 -chr12 15542002 . G T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr12 15545381 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.000;DP=13;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,176 -chr12 15733845 . C T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr12 15734721 . G T 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr12 16313548 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:68:243,0,68 -chr12 16313554 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:68:243,0,68 -chr12 16364499 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.708;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:97:675,0,97 -chr12 16497491 . A T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.368;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,286 -chr12 16931830 . A G 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr12 17081068 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:364,0,530 -chr12 17081600 . A C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:397,0,246 -chr12 17084464 . G A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-1.309;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:74:553,0,74 -chr12 17172247 . C CA 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-1.900;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:392,0,1511 -chr12 17527557 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=2.109;DP=121;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,24:121:99:413,0,3778 -chr12 17543441 . C G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.652;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,25:138:99:387,0,4329 -chr12 17563253 . A AC 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:258,18,0 -chr12 17563602 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-0.466;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:276,0,1205 -chr12 17563629 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.246;DP=45;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:373,0,1144 -chr12 17684037 . ATATTTATGGTTTTCCTACATGATATGCAAATAAACACAGTACAGACTTGAGATTGCCATGCCAGAAAATTTAT A 505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:87:543,87,0 -chr12 17684168 . C CA 1799.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.881;DP=57;FS=3.087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=31.57;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:1837,168,0 -chr12 17684223 . C A 1963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-3.903;DP=60;FS=16.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=32.73;ReadPosRankSum=2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,52:60:52:1992,0,52 -chr12 17684236 . C A 1374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-4.172;DP=46;FS=29.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=29.89;ReadPosRankSum=4.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1403,0,255 -chr12 17703580 . G T 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1095,75,0 -chr12 17703581 . A T 1066.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:75:1095,75,0 -chr12 17729972 . A C 896.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.351;DP=26;FS=3.098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=34.49;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:31:925,31,0 -chr12 17811793 . G T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-1.332;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:627,0,104 -chr12 17943854 . T A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.339;DP=104;FS=14.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,55:104:99:1856,0,1825 -chr12 18018091 . T A 2992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=-0.448;DP=94;FS=5.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=31.84;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,78:94:99:3021,0,189 -chr12 18026140 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.161;DP=106;FS=5.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:280,0,3484 -chr12 18057030 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=26.56;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:347,0,337 -chr12 18057040 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=26.56;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:347,0,337 -chr12 18198485 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr12 18226726 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-0.722;DP=252;FS=9.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,36:252:99:305,0,8419 -chr12 18240585 . G A 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=-2.073;DP=353;FS=3.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=2.89;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,64:353:99:1047,0,11397 -chr12 18467596 . G GA 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-3.084;DP=117;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:315,0,1716 -chr12 18550646 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,977 -chr12 18550648 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-2.173;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.51;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:339,0,996 -chr12 19953634 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-1.218;DP=50;FS=3.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:245,0,1536 -chr12 19953648 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.786;DP=44;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:262,0,1289 -chr12 19969423 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.592;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:238,0,1306 -chr12 20204071 . T C 4250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.444;DP=371;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,128:370:99:4279,0,12599 -chr12 20208379 . T C 3295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.095;DP=347;FS=5.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=9.50;ReadPosRankSum=2.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,123:345:99:3324,0,7694 -chr12 20212809 . A G 4523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.346;DP=361;FS=0.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=12.53;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,133:360:99:4552,0,7937 -chr12 20241534 . GA G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.868;DP=100;FS=8.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,28:93:99:584,0,1164 -chr12 20241719 . T TA 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.356;DP=144;FS=1.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,62:117:99:975,0,1114 -chr12 20241965 . T G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.269;DP=106;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:423,0,3156 -chr12 20242731 . T A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.523;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:697,0,1752 -chr12 20252579 . AT A 2045.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.115;DP=157;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.727;QD=13.03;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,57:154:99:2083,0,5992 -chr12 20252583 . T A 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.523;DP=156;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,56:156:99:2083,0,6201 -chr12 20252771 . A AC 1299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.525;DP=148;FS=5.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,48:139:99:1337,0,2769 -chr12 20253940 . TA T 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.270;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:722,0,839 -chr12 20254871 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=2.083;DP=37;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:353,0,1870 -chr12 20255468 . T C 3808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-4.407;DP=171;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,68:170:99:3837,0,6131 -chr12 20263551 . G A 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.852;DP=99;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:1372,0,2023 -chr12 20265705 . C T 4302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=-1.819;DP=286;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,122:285:99:4331,0,5460 -chr12 20267005 . C T 2006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=-1.120;DP=165;FS=5.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.549;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,59:164:99:2035,0,5426 -chr12 20286387 . G C 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.568;DP=62;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.136;QD=22.87;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1446,0,982 -chr12 20286465 . C CT 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=-0.416;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.185;QD=10.19;ReadPosRankSum=3.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:547,0,581 -chr12 20286572 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.902;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:234,0,958 -chr12 20287193 . T A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.831;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:558,0,907 -chr12 20287793 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.402;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:371,0,1540 -chr12 20296215 . A G 6429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.641;DP=431;FS=23.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,186:431:99:6458,0,8086 -chr12 20298862 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=6.032;DP=184;FS=10.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=2.60;ReadPosRankSum=3.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,34:184:99:507,0,5680 -chr12 20335112 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:235,0,348 -chr12 20406228 . TGTATGCTCTTTAAACAATGCATTATTTAAAGCAGCGCAGTTCAAATCTGCATTCGTTTGCTCACGTTGTGGCTTTTTTGTATCTGTGTCAG T 1549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=2.260;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=26.57;ReadPosRankSum=-2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:1587,164,0 -chr12 20446746 . CAGGTGTGTTGATGGTAATTGGTCTTACCCTTAAACCATTATTTTTAACACTGTAAATCATCTTTATAGGCTACATAATTTTTCTCACTGTACGTTTTAT C 8775.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.839;DP=299;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=29.35;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,237:242:99:8813,623,0 -chr12 20449982 . G GA 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=1.140;DP=139;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,33:131:99:313,0,2676 -chr12 20469478 . T C 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.231;DP=92;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:1500,0,1725 -chr12 20479414 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=-0.519;DP=65;FS=15.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.571;QD=17.87;ReadPosRankSum=2.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1190,0,2381 -chr12 20479778 . G T 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.934;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:1328,0,1404 -chr12 20526568 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:274,0,539 -chr12 20811677 . G A 2104.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2133,153,0 -chr12 20814487 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr12 20814514 . T C 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr12 20814598 . T C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr12 21055306 . C CT 550.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.919;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:588,0,192 -chr12 21070653 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=1.222;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.177;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:300,0,227 -chr12 21088396 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:237,0,165 -chr12 21088474 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:236,0,58 -chr12 21195367 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-2.861;DP=37;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=13.26;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:519,0,776 -chr12 21218880 . GAGGTTTGTATAAACCAGTCTGTTTTTTTCCGAAACGCCAAAACGTAGAATCAGAAGTTTATTCCTTTTGTTTGC G 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.310;DP=42;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:323,0,12927 -chr12 21218882 . G C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-3.134;DP=26;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:325,0,2302 -chr12 21218991 . A T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-2.256;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.596;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:470,0,457 -chr12 21381214 . T TCA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.034;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=9.62;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:345,0,325 -chr12 21431019 . C A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.879;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:349,0,440 -chr12 21431113 . T G 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.896;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=27.34;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:493,0,164 -chr12 21431219 . A T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.200;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:409,0,404 -chr12 21431847 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:305,0,61 -chr12 21688850 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.391;DP=37;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:474,0,834 -chr12 21701222 . G A 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr12 21702556 . GCTGAAACAGAGGAAAACAAACGGAACAGGTGAGTCTCAGACAAACAGGTATGTAAAATTGTGTTTACTGTACTGTAATGTTTGCTCAC G 17240.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-2.413;DP=399;FS=6.800;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,375:399:99:17278,1414,0 -chr12 21702866 . CCCTGTAAAATACAACAAATGCATAATTTAAAATGATAATAGGCCTAATGTATTTTTACTATATAAATTATGATATTGGGAATACATA C 15013.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.587;DP=390;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=29.16;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,374:385:99:15051,1099,0 -chr12 21702969 . G T 5086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.672;DP=395;FS=0.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,152:394:99:5115,0,8087 -chr12 21705836 . T C 1680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.732;DP=124;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,51:123:99:1709,0,2387 -chr12 21705902 . C A 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=-0.477;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:113:99:1312,0,2614 -chr12 21705982 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.018;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=8.71;ReadPosRankSum=2.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:333,0,807 -chr12 21732079 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.879;DP=56;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:352,0,1638 -chr12 21759311 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.352;DP=64;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:468,0,3485 -chr12 21823682 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.239;DP=41;FS=12.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:758,0,654 -chr12 21830860 . T C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.565;ClippingRankSum=-0.589;DP=52;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:666,0,1326 -chr12 21831277 . T C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.252;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:580,0,1011 -chr12 21836867 . CT C 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.479;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:308,0,101 -chr12 21837198 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=1.098;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:316,0,1596 -chr12 21900949 . G T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.727;DP=53;FS=3.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:827,0,1039 -chr12 21900990 . G GT 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.384;DP=46;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=12.08;ReadPosRankSum=-1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:593,0,410 -chr12 21913674 . GAA G 965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-1.202;DP=72;FS=8.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=13.41;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:1003,0,1788 -chr12 21919973 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.180;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:292,0,612 -chr12 21924570 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.424;DP=143;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:2114,0,2780 -chr12 21982449 . AGTAAGTAATTTAGCTTTCACTTGGGTTTTTTATTATTCATTTACATAATCTTATGTTGTGTGTGTGTATTAATTAATAATTATGAAGAGAGTAAGTTAAAGGATAGTGAGTGAATGAGTAAATTATATTTTTCTTTGAGCACAG A 6734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.967;DP=174;FS=1.784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=23.40;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,166:171:99:6772,499,0 -chr12 21990377 . C CA 4589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.182;DP=165;FS=1.021;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=27.82;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,135:150:99:4627,142,0 -chr12 22004440 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,103 -chr12 22010779 . T G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.441;DP=57;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:902,0,1085 -chr12 22035583 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-1.485;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,458 -chr12 22038181 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.962;DP=24;FS=14.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:258,0,354 -chr12 22128670 . G A 1204.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.207;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=29.14;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:54:1233,54,0 -chr12 22129126 . A T 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.828;DP=33;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:72:1109,0,72 -chr12 22129278 . A G 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.215;DP=35;FS=12.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=24.62;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:890,0,276 -chr12 22129390 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-1.342;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=30.56;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:884,0,91 -chr12 22129393 . C G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-1.613;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=20.07;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:550,0,522 -chr12 22129560 . T C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=1.575;DP=22;FS=8.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:34:753,0,34 -chr12 22129561 . G C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=1.827;DP=22;FS=8.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=32.94;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:34:753,0,34 -chr12 22129723 . T A 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr12 22129843 . T C 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=1.714;DP=20;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:565,0,34 -chr12 22129899 . G T 723.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.211;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=29.62;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:17:752,17,0 -chr12 22129909 . A T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.236;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=27.51;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:606,0,148 -chr12 22130020 . A G 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.065;DP=33;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:801,0,245 -chr12 22130053 . C T 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=1.784;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.643;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1050,0,110 -chr12 22130236 . A C 1322.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.306;DP=34;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1351,99,0 -chr12 22133516 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.809;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:62:670,0,62 -chr12 22137571 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=2.100;DP=23;FS=9.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:40:440,0,40 -chr12 22137620 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=2.166;DP=15;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:258,0,103 -chr12 22138395 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=1.589;DP=9;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=24.86;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:252,0,125 -chr12 22138396 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=11;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:252,0,125 -chr12 22138602 . T A 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr12 22138886 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.086;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:413,0,44 -chr12 22139076 . G GA 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.548;DP=32;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:54:722,0,54 -chr12 22139132 . A G 1315.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-0.738;DP=43;FS=1.728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=30.59;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,37:42:9:1343,9,0 -chr12 22139331 . T C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr12 22140244 . A G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.107;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:387,0,53 -chr12 22140472 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=22.93;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:441,0,52 -chr12 22140897 . A C 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr12 22148227 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr12 22484626 . T C 492.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.425;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:25:521,0,25 -chr12 22905047 . TA T 331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:369,36,0 -chr12 23452745 . C T 213.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:242,0,17 -chr12 23731957 . C CT 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.868;DP=48;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:392,0,653 -chr12 24024620 . AAGGTTCCAGAAAACTTAAGTAATGTTTTCAAATGTAACTTTTATATGTGTTAGGATTAAAGTTTTGTTTTTTTGT A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=3.153;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:320,0,3634 -chr12 24676263 . T A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:444,33,0 -chr12 24850100 . A G 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:284,0,22 -chr12 25096910 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,956 -chr12 25206707 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=1.350;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:350,0,1276 -chr12 25211090 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-1.508;DP=38;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:269,0,1042 -chr12 25217859 . T C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.415;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:541,0,398 -chr12 25347534 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.873;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:779,0,1440 -chr12 25501629 . A T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-1.039;DP=103;FS=5.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,31:103:99:784,0,2684 -chr12 25505856 . G A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.641;DP=92;FS=9.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:725,0,2359 -chr12 25517838 . A C 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.152;DP=103;FS=2.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,44:102:99:1563,0,1976 -chr12 25534921 . A G 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=1.970;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=7.79;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,31:101:99:823,0,2708 -chr12 25540559 . C T 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=1.066;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,40:110:99:1303,0,2418 -chr12 25551472 . A T 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.387;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:79:99:1078,0,1660 -chr12 25553808 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=3.107;DP=93;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=3.21;ReadPosRankSum=-3.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:327,0,2813 -chr12 25553841 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=3.871;DP=79;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:357,0,2370 -chr12 25554014 . C T 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-0.153;DP=91;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,33:91:99:1013,0,1967 -chr12 25554047 . C T 1320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.470;DP=103;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,40:103:99:1349,0,2086 -chr12 25971905 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.24;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:240,0,314 -chr12 25990555 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:266,0,310 -chr12 26303691 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=1.319;DP=90;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:1405,0,1699 -chr12 26303881 . G A 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.332;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:1377,0,1651 -chr12 26303943 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.087;DP=55;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:339,0,1546 -chr12 26304698 . A G 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=2.713;DP=58;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1034,0,911 -chr12 26338438 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.125;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:306,0,1078 -chr12 26348607 . T G 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.031;DP=94;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:1225,0,2040 -chr12 26349632 . C T 1694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-1.357;DP=139;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.924;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,51:139:99:1723,0,3011 -chr12 26353701 . CACCTAAGATGAGATGAGAAAATGGAACAGGGTGAAATACTGCAACCATTACTGTTAGTTTTCAAAGCAGACCGTTTGGTGTCGCCTGCTTTCAGTTT C 4444.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.012;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=26.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,100:102:99:4482,357,0 -chr12 26363373 . G A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.864;DP=74;FS=4.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=13.65;ReadPosRankSum=2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:1038,0,1596 -chr12 26411236 . C CA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-1.213;DP=52;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:255,0,1140 -chr12 26416456 . C G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=-0.732;DP=93;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.110;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:631,0,2622 -chr12 26416832 . A C 1930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-2.365;DP=144;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,58:144:99:1959,0,2906 -chr12 26419782 . C G 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.268;DP=134;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:792,0,3879 -chr12 26434415 . C T 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=2.154;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=11.30;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,43:122:99:1418,0,2724 -chr12 26460696 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=1.816;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:410,0,412 -chr12 26566953 . G T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=4.970;DP=80;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.399;QD=16.98;ReadPosRankSum=2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1387,0,1392 -chr12 26567185 . TC T 1889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.543;DP=93;FS=4.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,61:88:99:1927,0,566 -chr12 26567328 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.450;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=21.87;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1056,0,563 -chr12 26568026 . A ATT 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.323;DP=40;FS=6.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:616,0,281 -chr12 26569947 . A AG 1598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.306;DP=83;FS=4.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,54:81:99:1636,0,781 -chr12 26570990 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=2.534;DP=60;FS=2.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:856,0,1094 -chr12 26571162 . T A 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=-1.008;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=19.77;ReadPosRankSum=2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,32:58:99:1175,0,1766 -chr12 26571163 . C T 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-1.073;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1168,0,1766 -chr12 26571594 . T C 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=-1.087;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1291,0,1240 -chr12 26571702 . C T 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.860;DP=66;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.106;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,40:66:99:1338,0,840 -chr12 26571720 . G A 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=-2.374;DP=83;FS=2.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=13.15;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1120,0,1370 -chr12 26571795 . G A 1274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-1.787;DP=76;FS=5.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,39:75:99:1303,0,1280 -chr12 26571846 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.771;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:958,0,942 -chr12 26571911 . T A 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=1.077;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,43:71:99:1440,0,937 -chr12 26618241 . A ATT 2039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=1.891;DP=213;FS=19.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,66:190:99:2077,0,4552 -chr12 26618384 . C A 2788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=3.159;DP=354;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=7.88;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,104:352:99:2817,0,20586 -chr12 26618491 . A G 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=6.576;DP=148;FS=7.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=6.28;ReadPosRankSum=-4.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,44:148:99:958,0,5867 -chr12 26618801 . G GA 4243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.104;DP=388;FS=38.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,188:364:99:4281,0,4420 -chr12 26619445 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=2.428;DP=41;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:277,0,778 -chr12 26620928 . T TAA 1101.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-1.136;DP=42;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=26.23;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1139,0,309 -chr12 26624317 . G A 2060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.115;DP=92;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,59:92:99:2089,0,1121 -chr12 26635606 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=23.78;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:266,0,94 -chr12 26637772 . T TAA 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=4.054;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=3.39;ReadPosRankSum=-3.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:341,0,1446 -chr12 26637927 . CT C 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=1.194;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:74:391,0,74 -chr12 26638049 . T TTC 932.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.078;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:970,0,135 -chr12 26642392 . G A 1549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.200;DP=64;FS=9.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=24.22;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,43:64:99:1578,0,563 -chr12 26724978 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.930;DP=70;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:525,0,1850 -chr12 26727608 . C T 6867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.881;DP=518;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,199:518:99:6896,0,11090 -chr12 26733871 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=-1.468;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,223 -chr12 26735805 . G C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.761;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:95:388,0,95 -chr12 26735900 . T A 251.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:280,0,22 -chr12 26767567 . G A 1467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=-0.103;DP=178;FS=4.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,57:178:99:1496,0,4447 -chr12 26789126 . G A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr12 26789962 . G A 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.558;DP=153;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,53:153:99:1606,0,3326 -chr12 26795972 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.171;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:288,0,493 -chr12 26803248 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:453,0,138 -chr12 26814054 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:369,0,162 -chr12 26814062 . C A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:369,0,162 -chr12 26815249 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:414,0,164 -chr12 26815438 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,230 -chr12 26820379 . T C 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:470,36,0 -chr12 26904349 . TA T 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=-0.194;DP=28;FS=8.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:474,0,257 -chr12 26905191 . T C 2276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.318;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,63:133:99:2305,0,2393 -chr12 26905453 . C CT 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.104;DP=103;FS=4.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:598,0,1050 -chr12 26905520 . G A 1316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-1.458;DP=94;FS=3.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=14.01;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,39:94:99:1345,0,1737 -chr12 26907518 . G GA 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=-1.366;DP=184;FS=3.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,46:159:99:511,0,2784 -chr12 26907580 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.729;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:336,0,4112 -chr12 26960425 . A G 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-1.833;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=16.19;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,57:126:99:2068,0,2371 -chr12 26995620 . C T 1518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=-0.185;DP=109;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,49:108:99:1547,0,2611 -chr12 27000000 . C A 2754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-0.566;DP=176;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=15.65;ReadPosRankSum=3.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,78:175:99:2783,0,3211 -chr12 27000509 . C G 3132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.092;DP=213;FS=8.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,92:212:99:3161,0,3950 -chr12 27011110 . GTT G 861.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.586;DP=76;FS=6.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:1031,0,1375 -chr12 27011502 . A T 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-1.321;DP=128;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,47:112:99:1086,0,2180 -chr12 27011611 . T A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=4.428;DP=97;FS=13.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:416,0,3042 -chr12 27011626 . C T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=3.620;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=12.32;ReadPosRankSum=-4.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,39:99:99:1248,0,2087 -chr12 27011642 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=3.849;DP=94;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=4.19;ReadPosRankSum=-2.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:422,0,2786 -chr12 27011817 . C G 3271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=-0.148;DP=122;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=26.82;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,90:122:99:3300,0,696 -chr12 27011892 . C T 1734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.275;DP=123;FS=0.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,50:123:99:1763,0,3028 -chr12 27012102 . A T 2054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-1.930;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:2083,0,1494 -chr12 27012546 . C T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.198;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:319,0,4881 -chr12 27128502 . C A 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=-0.323;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,68:102:99:2331,0,975 -chr12 27128737 . C T 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.465;DP=125;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:2110,0,2231 -chr12 27130791 . T A 2415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=1.203;DP=140;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:2444,0,2423 -chr12 27168166 . T A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=1.813;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:540,0,794 -chr12 27168554 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.320;DP=25;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:638,0,225 -chr12 27339132 . T A 2881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.772;DP=212;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,87:212:99:2910,0,6844 -chr12 27339201 . GAGGTACTGCTTTAAACCAAACTCACATTCCACATCATTATACCATCATCCTTACACTGTCCTTGTGTTTC G 8609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=2.258;DP=256;FS=6.950;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,209:216:99:9080,126,0 -chr12 27339421 . G A 3093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.016;DP=192;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,87:190:99:3122,0,3372 -chr12 27347902 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-2.084;DP=141;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:501,0,4310 -chr12 27347926 . G A 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-3.292;DP=129;FS=20.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,40:129:99:1051,0,3404 -chr12 27353860 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=4.702;DP=126;FS=15.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=6.27;ReadPosRankSum=-2.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,34:126:99:818,0,3597 -chr12 27354000 . A AT 816.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.446;DP=78;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:854,0,767 -chr12 27354434 . A C 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.086;DP=89;FS=1.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:1771,0,3056 -chr12 27354437 . T C 1738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.584;DP=91;FS=1.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=19.11;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1767,0,3056 -chr12 27354745 . G GA 1240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.160;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,50:99:99:1567,0,1158 -chr12 27355319 . T A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=1.712;DP=79;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:508,0,4392 -chr12 27355591 . GA G 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.034;DP=123;FS=13.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,60:120:99:1466,0,1350 -chr12 27356677 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=1.667;DP=74;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:276,0,2414 -chr12 27373386 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-2.102;DP=329;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,46:327:99:273,0,10542 -chr12 27384003 . A G 3459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.417;DP=701;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:531,161:692:99:3488,0,20767 -chr12 27388658 . T C 7541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.882;DP=445;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,233:445:99:7570,0,7647 -chr12 27394123 . A T 10194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.895;DP=299;FS=5.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=34.10;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,225:299:99:10223,0,1347 -chr12 27400269 . G A 7810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-1.059;DP=450;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=17.36;ReadPosRankSum=4.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,237:449:99:7839,0,7602 -chr12 27400993 . C T 2413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.460;DP=142;FS=5.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:2442,0,2301 -chr12 27413722 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.037;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:236,0,498 -chr12 27413733 . G A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.270;DP=21;FS=11.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:295,0,620 -chr12 27413787 . T G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=1.855;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:578,0,541 -chr12 27413870 . G T 2251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=-0.612;DP=102;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,65:102:99:2280,0,1342 -chr12 27413906 . G T 5421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5450,382,0 -chr12 27439072 . A G 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:625,42,0 -chr12 27453750 . A C 3795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3824,271,0 -chr12 27468105 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=-1.825;DP=70;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:231,0,2394 -chr12 27468231 . AT A 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.191;DP=90;FS=2.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:490,0,1414 -chr12 27469121 . C G 2960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=-0.186;DP=110;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,75:110:99:2989,0,2308 -chr12 27469280 . A G 2911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-0.002;DP=160;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,87:159:99:2940,0,2778 -chr12 27469382 . C T 2099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.701;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=17.65;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:2128,0,1924 -chr12 27469505 . A AT 1579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-2.179;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,68:104:99:1695,0,775 -chr12 27469652 . A T 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.841;DP=131;FS=5.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,58:131:99:2084,0,2592 -chr12 27472093 . CCCTGTGAAAGAAGCACACCATTATCATCCAGATTACAGCTTTTTTCTGCTTTACATCCACACACATCATTCATTTACTGTACATA C 821.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=3.788;DP=181;FS=4.541;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=4.54;ReadPosRankSum=-2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,142:147:99:859,298,0 -chr12 27473962 . G T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr12 27520060 . T G 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-1.318;DP=33;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.814;QD=23.08;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:790,0,377 -chr12 27520124 . C A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.718;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:837,0,241 -chr12 27520827 . G C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=24.99;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:528,0,159 -chr12 27521068 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,402 -chr12 27522055 . C A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.514;DP=44;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:289,0,1189 -chr12 27522632 . CA C,CAA 1040.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.062;DP=53;FS=1.971;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=19.63;ReadPosRankSum=-2.794 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,32,16:53:99:1121,337,472,815,0,1100 -chr12 27522869 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=2.395;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:504,0,1164 -chr12 27522872 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=2.395;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:504,0,1164 -chr12 27523383 . G C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.717;DP=39;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:861,0,482 -chr12 27524677 . C T 2148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-1.853;DP=107;FS=2.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=20.08;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,65:107:99:2177,0,1413 -chr12 27524955 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=-0.547;DP=78;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:469,0,3742 -chr12 27527243 . A G 1709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.531;DP=84;FS=21.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,51:84:99:1738,0,1190 -chr12 27529950 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.394;DP=56;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:969,0,969 -chr12 27574291 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.431;DP=77;FS=6.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:298,0,2435 -chr12 27597001 . C A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.401;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,32:123:99:593,0,4167 -chr12 27597309 . A G 8089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-2.725;DP=334;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=24.22;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,174:325:99:8118,0,4834 -chr12 27605144 . G A 5098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=-0.045;DP=293;FS=7.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,139:293:99:5127,0,5127 -chr12 27956710 . C T 8396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-1.492;DP=354;FS=11.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=23.72;ReadPosRankSum=-1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,234:344:99:8425,0,2375 -chr12 27974547 . C T 2097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;ClippingRankSum=-7.329;DP=460;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=4.56;ReadPosRankSum=3.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:325,127:452:99:2126,0,12535 -chr12 27982796 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.987;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:540,0,209 -chr12 27983270 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:278,0,430 -chr12 27983459 . T C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.299;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:632,0,659 -chr12 27984283 . G T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.306;DP=25;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=30.03;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:779,0,100 -chr12 27994022 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=14.62;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:306,0,371 -chr12 27994411 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.103;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:446,0,856 -chr12 28013330 . G T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.535;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:456,0,194 -chr12 28013517 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=2.372;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:235,0,266 -chr12 28016153 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=28.60;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:400,0,46 -chr12 28030228 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=-0.067;DP=23;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:445,0,298 -chr12 28033110 . T G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=1.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=28.91;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:404,0,92 -chr12 28034782 . G A 391.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.869;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=32.61;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:419,0,9 -chr12 28035284 . TG T 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-2.662;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=19.99;ReadPosRankSum=3.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:417,0,217 -chr12 28036672 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:382,0,125 -chr12 28036705 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=1.031;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=26.17;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:447,0,121 -chr12 28047103 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=1.021;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:624,0,452 -chr12 28053109 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr12 28053182 . G T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr12 28053991 . C T 295.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:324,0,18 -chr12 28057771 . G GT 603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:641,54,0 -chr12 28058205 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.064;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,443 -chr12 28062792 . C A 246.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:275,0,18 -chr12 28065035 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.862;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:617,0,295 -chr12 28068131 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=23.90;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:315,0,129 -chr12 28073499 . T G 4690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.062;DP=213;FS=6.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=22.02;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,140:213:99:4719,0,2421 -chr12 28073741 . G A 3398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.532;ClippingRankSum=-1.072;DP=195;FS=4.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,106:194:99:3427,0,3255 -chr12 28103756 . C T 3284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.008;DP=177;FS=10.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,100:177:99:3313,0,2752 -chr12 28106501 . A G 3758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.245;DP=209;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=17.98;ReadPosRankSum=2.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,114:209:99:3787,0,3299 -chr12 28109988 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.635;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,182 -chr12 28118526 . AATCTGGAAAATGAGGTCATGAATCGACACTATAAATGGGGAAAGCCTCAGAATTGATCAGAATATTAAGATCTATCAGGATTCTC A 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:319,0,3624 -chr12 28122127 . GCTGTGAATGTTACAATGAGCAAACTTTTATCGCATCTGAATAGAGCTACTTGTAACTACTGTATATATGTATAACCTGCCAGTTTTAC G 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:428,0,736 -chr12 28122240 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,206 -chr12 28124356 . G T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:476,0,42 -chr12 28132301 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=2.007;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=19.77;ReadPosRankSum=-1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:305,0,401 -chr12 28132330 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:352,0,225 -chr12 28137388 . G A 298.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.11;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:326,0,12 -chr12 28137655 . A T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.507;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=16.88;ReadPosRankSum=-3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:501,0,617 -chr12 28143346 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:302,0,93 -chr12 28146599 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.704;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:538,0,219 -chr12 28146634 . G T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.120;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.757;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:650,0,325 -chr12 28160793 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=23.58;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:382,0,174 -chr12 28161416 . T A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.457;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=22.92;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:372,0,229 -chr12 28161616 . G T 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.173;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.179;QD=25.84;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:700,0,179 -chr12 28161735 . T A 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.628;DP=43;FS=6.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:980,0,1250 -chr12 28161737 . A C 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.008;DP=45;FS=8.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.865;QD=20.95;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:971,0,1250 -chr12 28162277 . T C 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.506;DP=33;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=29.93;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1016,0,167 -chr12 28162676 . T G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:298,0,164 -chr12 28163387 . G GA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.219;DP=20;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:94:331,0,94 -chr12 28163523 . A G 736.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.779;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.857;QD=32.44;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:14:765,14,0 -chr12 28165066 . A T 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-2.317;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=25.39;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1171,0,367 -chr12 28188769 . CACCTATGAACAGCATGTTATTTAATCAAGACAAATGTTAAACCAGGACCATCAACTTCGATGCCAAACATCTTTTTTAAGATCTGAGCAGCAGTTTATTTGGGAGTCACGTATTTTTGATGAAGAGTGTATTAT C 1797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.686;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=25.27;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:99:1835,0,750 -chr12 28281997 . C T 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.451;DP=69;FS=6.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,37:69:99:1211,0,1124 -chr12 28295398 . C T 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.881;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=31.58;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1102,0,104 -chr12 28295841 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.827;DP=45;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:676,0,890 -chr12 28296283 . C CA 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-1.217;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:292,0,1061 -chr12 28321553 . C T 1609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.524;DP=84;FS=5.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1638,0,1153 -chr12 28323222 . C T 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.532;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:1169,0,910 -chr12 28329026 . G A 1597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-1.957;DP=76;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=21.02;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,47:76:99:1626,0,959 -chr12 28466481 . A G 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=2.556;DP=183;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,45:165:99:1128,0,5147 -chr12 28466567 . A T 2508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.196;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,68:94:99:2537,0,677 -chr12 28467144 . C A 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=-1.485;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1509,0,143 -chr12 28467336 . G A 1106.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1135,78,0 -chr12 28467574 . A T 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:490,33,0 -chr12 28530835 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.859;DP=36;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:710,0,483 -chr12 28535487 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=28.60;ReadPosRankSum=-2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:98:400,0,98 -chr12 28535656 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.624;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:670,0,542 -chr12 28535895 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:364,0,414 -chr12 28539793 . G T 240.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:269,0,18 -chr12 28542469 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr12 28594704 . G A 2404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.196;DP=118;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,72:118:99:2433,0,1631 -chr12 28596551 . TGGTGTGACCCTCAGGCATTTCATACAGTATTTATTTATGAATGCCTTTCATTACAACTTCTCATATTTTCTTTTATTTTTGTACA T 4274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.928;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4312,399,0 -chr12 28596710 . AGTAAGAGCTTTTTTTCTTTTTGACATGTTTTGCATTTTCACATAAAAGTTGAAGTACAATTTAAGTGTCATGTAATGTGTCAGTCCTCTTTTATCTTCTGTCAG A,ATCCTCTTTTATCTTCTGTCAG 1721.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=2.373;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=15.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,68,40:111:99:2903,198,7878,1635,0,12453 -chr12 28597461 . T C 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-1.445;DP=63;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=18.01;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1163,0,981 -chr12 28597569 . G T 1399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.701;DP=66;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,41:66:99:1428,0,857 -chr12 28597722 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:384,0,304 -chr12 28598497 . T C 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=2.579;DP=97;FS=8.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:889,0,2352 -chr12 28598598 . C CT 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=3.906;DP=111;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:589,0,2444 -chr12 28598784 . T C 4022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.687;DP=210;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,121:209:99:4051,0,3197 -chr12 28598911 . G T 4125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.315;DP=199;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,118:198:99:4154,0,2929 -chr12 28599024 . A G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=1.707;DP=80;FS=4.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,36:80:99:1362,0,3111 -chr12 28599032 . T G 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=1.409;DP=71;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=18.79;ReadPosRankSum=-1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1362,0,3080 -chr12 28599176 . T A 3700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.593;DP=236;FS=3.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=15.68;ReadPosRankSum=2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,103:234:99:3729,0,4488 -chr12 28600734 . TCCTACAGGAGAAAGAATATTGCTTGTAAATGAATGTAAAAAAGTCAACCAAATATCAAATGACACCTCATTA T 10228.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=1.701;DP=234;FS=1.531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=28.46;ReadPosRankSum=-2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,217:224:99:10266,905,0 -chr12 28630114 . G T 2521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.921;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.25;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,76:131:99:2550,0,1936 -chr12 28630564 . C G 2948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.318;DP=115;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,79:115:99:2977,0,921 -chr12 28644867 . GGGTAAAAAGTGCACATAATACTTTATAATCTGTGTTGAGCTCAAAGTGGATGTACACCTTTTTATGACAGGCTTGCTTTTATA G 3919.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=1.536;DP=101;FS=6.790;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,87:89:99:3957,377,0 -chr12 28654429 . A T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=1.605;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1450,0,1180 -chr12 28654621 . T G 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.797;DP=78;FS=3.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,46:78:99:1505,0,1078 -chr12 28654712 . G A 1897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=-1.335;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,53:64:99:1926,0,149 -chr12 28655428 . C A 1944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.840;DP=101;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1973,0,1327 -chr12 28655690 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.261;DP=52;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1037,0,728 -chr12 28657391 . C A 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.077;DP=108;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,52:108:99:1843,0,1817 -chr12 28657415 . C T 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.772;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:1592,0,1792 -chr12 28657761 . C T 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.058;DP=98;FS=5.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.247;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,57:98:99:1923,0,1424 -chr12 28659777 . A G 1712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=2.040;DP=93;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,47:93:99:1741,0,1636 -chr12 28662213 . G T 2165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=2.150;DP=109;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=19.87;ReadPosRankSum=-2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,63:109:99:2194,0,1727 -chr12 28662727 . A T 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-1.204;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,56:105:99:1842,0,1825 -chr12 28691300 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-3.799;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:331,0,344 -chr12 28691312 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=-3.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=20.67;ReadPosRankSum=2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:421,0,263 -chr12 28711896 . G C 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-0.175;DP=51;FS=2.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:918,0,983 -chr12 28713690 . A G 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.133;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:1244,0,1556 -chr12 28777729 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=28.55;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:66:428,0,66 -chr12 28780838 . GACCTAGAAGAGCACGGGAAAATTATTTAATCATTTACCTAACACGCTTGAGTGGAAGATGGCACAAGACTATCAACGT G 15160.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=1.995;DP=327;FS=1.646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=32.67;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,322:327:99:15198,1209,0 -chr12 28782969 . GCCTATAAGTCAACAATAAAACAATAAGTGTCAAATAGTCAAAGAAATGTCGGTATATAAATAATACATGTATAATTTATACATGTAATCTCCGTTAATTTA G 1921.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=3.434;DP=330;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=5.82;ReadPosRankSum=-2.984 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,311:315:99:1959,742,0 -chr12 28785409 . G GGCGT 1815.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.828;DP=59;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=30.78;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,47:53:46:1853,0,46 -chr12 28791412 . G A 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.146;DP=71;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:1062,0,1271 -chr12 28791463 . ACAGGTATGCGTTATCAGATGCGAAGGACAACATTTACTTATTCTATGACTGAATAATGTCCAAAGTCTTGTTGTTGTC A 3085.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=1.506;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:3123,276,0 -chr12 28792626 . T G 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=1.741;DP=79;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,40:79:99:1417,0,1469 -chr12 28792639 . C T 1519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=1.639;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,43:85:99:1548,0,1534 -chr12 28799693 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.470;DP=38;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:588,0,706 -chr12 28800160 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=-1.501;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.322;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:488,0,1564 -chr12 28800327 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.567;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=17.09;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:746,0,769 -chr12 28800350 . A AT 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.254;DP=52;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:735,0,478 -chr12 28803621 . G C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.712;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:621,0,2411 -chr12 28803729 . G A 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-1.457;DP=99;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=12.58;ReadPosRankSum=3.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,37:99:99:1274,0,2144 -chr12 28815773 . G A 2356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.756;DP=167;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,69:167:99:2385,0,3290 -chr12 28816678 . T A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.937;DP=46;FS=6.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:679,0,940 -chr12 28857190 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,254 -chr12 28873744 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.501;DP=23;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=23.77;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:575,0,157 -chr12 28876967 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=1.663;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=19.52;ReadPosRankSum=-1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:243,0,319 -chr12 28905061 . C A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.584;DP=94;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:1527,0,1650 -chr12 28905652 . C G 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-1.002;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:860,0,2319 -chr12 28905659 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-0.194;DP=52;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:860,0,2319 -chr12 29033419 . G A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-0.331;DP=76;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:990,0,1719 -chr12 29033752 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=2.000;DP=46;FS=5.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:312,0,1386 -chr12 29899195 . GA G 2024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.288;DP=156;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,85:144:99:2062,0,1108 -chr12 29899332 . TCTGTAAGAGAGAAACCAAAGAGCAAACATTAAAAGCTTTGAAATGCAATAATTGTGAAATGCATGTATGATTTCCAATGGCTCAC T 11837.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.863;DP=261;FS=2.517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.149;QD=35.10;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,253:256:99:11875,996,0 -chr12 29919452 . C G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=1.564;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:397,0,459 -chr12 29920532 . AT A 265.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:302,8,0 -chr12 30109324 . T C 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.317;DP=31;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:783,0,336 -chr12 30340023 . ACTGTCGATAAAAATAAATAACGGATTGTTAAAAGAGCCCAAAACAAGTGGATGAACAAATATCACATACTCAC A 941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:81:979,81,0 -chr12 30392667 . TCCTGCCATCAAAGAAAAACGCACAACCTCATGTCTATCCACTATTTCAAGAAGCAAATGTCTTAAATACCCATTACAAGTCACTTTCATCATA T 8037.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=4.268;DP=191;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=27.73;ReadPosRankSum=-2.452 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,180:189:99:8075,644,0 -chr12 30413102 . C CA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.185;DP=23;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:59:399,0,59 -chr12 30447391 . TGTAAGTTCATGATACTCGAGGCTTGCTATTAGCCCTTTTTTAGGATCACAGAAGTGTTGTAGTTAGTTCATTGTTTTGTTCTATGTGTTTCTTTCAACAG T 1169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.184;DP=44;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:99:1207,0,744 -chr12 30448913 . AAT A 539.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.241;DP=37;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:577,0,570 -chr12 30475866 . ACAGGTGAAGTTAGTTGTTGTGTTAGAATCTTTTTAGAACAACGTCTGTAATTTTGAAGCAAATGCATGCAAGGTTATCTCACCGTACCCATGCGCACCTTT A 10368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.952;DP=281;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=28.97;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,267:270:99:10406,757,0 -chr12 30493933 . A G 578.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:607,45,0 -chr12 30771812 . ACT A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.871;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:295,0,652 -chr12 30773098 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.366;DP=34;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:237,0,961 -chr12 30790528 . C T 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.797;DP=88;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:1015,0,1959 -chr12 30812757 . G A 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-1.318;DP=119;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,45:119:99:1490,0,2350 -chr12 31391021 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:305,0,246 -chr12 31392549 . A G 315.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=31.59;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:344,0,15 -chr12 31612048 . G GA 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:266,18,0 -chr12 31791770 . A AG 1447.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.86;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1485,113,0 -chr12 31867045 . G T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.343;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:335,0,534 -chr12 31880664 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:505,0,635 -chr12 31883882 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.269;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,646 -chr12 31884478 . A G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-1.203;DP=48;FS=8.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:626,0,1068 -chr12 31884602 . G C 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr12 31884801 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.746;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=23.25;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:656,0,284 -chr12 31885245 . AT A 510.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.248;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:36:579,36,0 -chr12 31885405 . G A 1221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.221;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=29.63;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:50:1250,50,0 -chr12 31885452 . G C 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.118;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=30.10;ReadPosRankSum=-2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:82:570,0,82 -chr12 31886255 . AAC A 248.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr12 31886645 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=1.532;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:434,0,1598 -chr12 31886646 . T A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=1.496;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:434,0,1598 -chr12 31887027 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=1.079;DP=45;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:552,0,1030 -chr12 31887237 . C T 553.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:582,42,0 -chr12 31887951 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=21.85;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:487,0,471 -chr12 31887952 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=1.992;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=21.85;ReadPosRankSum=2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:487,0,471 -chr12 31890663 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=2.542;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:283,0,992 -chr12 31895331 . G T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=3.742;DP=34;FS=4.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=29.23;ReadPosRankSum=3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:91:1022,0,91 -chr12 31908934 . A G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.332;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:1431,0,1338 -chr12 31939085 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=1.248;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:350,0,549 -chr12 31942066 . A G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-0.935;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:564,0,1648 -chr12 31948124 . C A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.860;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.02;ReadPosRankSum=-2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:521,0,803 -chr12 31948339 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.455;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,636 -chr12 31948802 . T A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.218;DP=49;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:858,0,802 -chr12 31948895 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.506;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:655,0,915 -chr12 31958246 . CGCCAAG C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=-1.540;DP=36;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:428,0,1301 -chr12 31958250 . AAGGTCAGACATTCGCAAACAGTTTACCTTAATGCTTTGTGAAATGCATTGATTGTGTGTGTGCGTTCTCAGAACTGTTTGTCTTTGATTTACTTTTCTGT A 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.509;DP=37;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:644,0,1123 -chr12 31958256 . AGACATTCGCAAACAGTTTACCTTAATGCTTTGTGAAATGCATTGATTGTGTGTGTGCGTTCTCAGAACTGTTTGTCTTTGATTTACTTTTCTGT A 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.488;DP=35;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:534,0,1295 -chr12 31990270 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.487;DP=47;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:841,0,712 -chr12 31990315 . A G 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1746,126,0 -chr12 31994301 . T TC 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.155;DP=24;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:293,0,296 -chr12 31994408 . A G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.271;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:451,0,690 -chr12 31994672 . C A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr12 31994876 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=2.861;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:255,0,442 -chr12 31994905 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,824 -chr12 31994906 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=2.174;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,824 -chr12 31995006 . T C 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1055,72,0 -chr12 31995015 . T G 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:69:1004,69,0 -chr12 32034345 . C T 771.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:57:800,57,0 -chr12 32034354 . T C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=22.87;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:417,0,194 -chr12 32034735 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.871;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:564,0,812 -chr12 32034947 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.341;DP=31;FS=11.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:474,0,646 -chr12 32034990 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.502;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:508,0,919 -chr12 32035568 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.296;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:291,0,989 -chr12 32035880 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.606;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:343,0,602 -chr12 32036558 . A C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.142;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:407,0,748 -chr12 32037018 . G T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.978;DP=41;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:778,0,724 -chr12 32073504 . T C 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.037;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=20.36;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:639,0,407 -chr12 32073608 . T C 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-1.246;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=22.08;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:801,0,448 -chr12 32077162 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=19.06;ReadPosRankSum=-2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,460 -chr12 32077168 . C A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,460 -chr12 32079699 . G C 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr12 32098208 . T C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.079;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:781,0,821 -chr12 32102733 . T C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.474;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:747,0,884 -chr12 32108727 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=1.300;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=16.46;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:555,0,579 -chr12 32109086 . T C 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.103;DP=58;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=19.72;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1172,0,854 -chr12 32109217 . C T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-2.209;DP=61;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:688,0,1431 -chr12 32109266 . T A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=1.703;DP=54;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:714,0,1184 -chr12 32109752 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=-0.029;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:446,0,569 -chr12 32109788 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.256;DP=27;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:450,0,442 -chr12 32116090 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr12 32137736 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-1.032;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:319,0,601 -chr12 32141767 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-1.417;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:482,0,307 -chr12 32141794 . T C 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.217;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:76:460,0,76 -chr12 32209542 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.537;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:273,0,429 -chr12 32209748 . C G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:241,0,133 -chr12 32211804 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=20.74;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:360,0,214 -chr12 32212010 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,279 -chr12 32214810 . TA T 315.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 -chr12 32215091 . A C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:316,0,115 -chr12 32226317 . T A 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:354,24,0 -chr12 32234229 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-0.790;DP=42;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:515,0,884 -chr12 32234340 . T C 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-0.621;DP=43;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=17.76;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:792,0,2082 -chr12 32234454 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-1.258;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:322,0,1673 -chr12 32235069 . AT A 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-2.276;DP=38;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:531,0,648 -chr12 32235311 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-0.646;DP=38;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:273,0,1092 -chr12 32235410 . C T 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=1.753;DP=49;FS=10.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.093;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:786,0,837 -chr12 32250959 . G C 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=1.997;DP=48;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:883,0,688 -chr12 32251014 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.218;DP=54;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:269,0,1587 -chr12 32251787 . T C 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=1.263;DP=55;FS=7.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1133,0,801 -chr12 32281447 . C T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.635;DP=47;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:695,0,906 -chr12 32281546 . G T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-2.149;DP=64;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,23:63:99:777,0,1322 -chr12 32281587 . C T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-1.203;DP=64;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:773,0,1407 -chr12 32282058 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.794;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:252,0,388 -chr12 32282357 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.337;DP=31;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:531,0,594 -chr12 32317234 . T G 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.791;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1082,0,918 -chr12 32317335 . C T 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.488;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:1285,0,1047 -chr12 32319474 . C T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.708;DP=74;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1284,0,1302 -chr12 32345397 . C T 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.200;DP=79;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=14.29;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:1157,0,1518 -chr12 32345401 . G GATAACTGAGT 1119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.057;DP=79;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1157,0,1520 -chr12 32345958 . T TA 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-1.318;DP=49;FS=4.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:445,0,617 -chr12 32346360 . T C 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.325;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=22.11;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:780,0,386 -chr12 32346400 . G A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=-0.302;DP=38;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:799,0,1200 -chr12 32347064 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=-0.356;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.03;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:379,0,477 -chr12 32347470 . A T 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-3.856;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:1046,0,147 -chr12 32347532 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.163;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=8.72;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:473,0,886 -chr12 32347730 . C T 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.807;DP=43;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=25.79;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1137,0,849 -chr12 32347877 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-2.298;DP=48;FS=7.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:254,0,1930 -chr12 32348265 . A AT 2319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=-1.313;DP=71;FS=8.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:2357,0,1474 -chr12 32348437 . G T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.998;DP=68;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:393,0,2815 -chr12 32348671 . G A 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.034;DP=53;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=30.66;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,43:53:99:1653,0,190 -chr12 32379266 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-1.047;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:313,0,624 -chr12 32405607 . G A 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=1.337;DP=218;FS=2.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,69:218:99:1854,0,5756 -chr12 32453751 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.192;DP=52;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:955,0,947 -chr12 32461553 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=3.156;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,1814 -chr12 32461559 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=2.268;DP=28;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=8.92;ReadPosRankSum=-2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:278,0,1814 -chr12 32471110 . GA G 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=-0.454;DP=30;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=14.09;ReadPosRankSum=-2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:504,0,545 -chr12 32471121 . A C 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.559;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=24.19;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:754,0,323 -chr12 32471263 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:81:460,0,81 -chr12 32471638 . A G 1261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:90:1290,90,0 -chr12 32471785 . T A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-0.071;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:498,0,972 -chr12 32485141 . T C 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:599,45,0 -chr12 32494209 . C T 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.625;DP=48;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,31:48:99:1016,0,1035 -chr12 32494220 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-1.889;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.33;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:400,0,2113 -chr12 32494366 . T C 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.703;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1068,0,1830 -chr12 32494471 . C T 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=-0.870;DP=83;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:1203,0,3053 -chr12 32494480 . C T 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.419;DP=84;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=22.49;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,52:83:99:1917,0,1088 -chr12 32494832 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.837;DP=93;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:368,0,2981 -chr12 32494861 . G GT 3408.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3446,284,0 -chr12 32494924 . A C 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=-1.968;DP=72;FS=3.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:987,0,2670 -chr12 32495001 . T C 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-1.706;DP=44;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=33.86;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:1518,0,1979 -chr12 32495010 . G T 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-2.109;DP=45;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=33.88;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:1553,0,1978 -chr12 32495216 . T C 7169.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-2.517;DP=90;FS=2.433;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=31.73;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,87:90:99:7198,506,0 -chr12 32495342 . T A 1045.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:33:1482,33,0 -chr12 32495401 . G T 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-3.225;DP=69;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=17.50;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1236,0,1323 -chr12 32495565 . A T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.618;DP=47;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:678,0,993 -chr12 32495662 . T C 3965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:3994,288,0 -chr12 32495828 . A T 3357.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3386,243,0 -chr12 32525441 . A T 5661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.159;DP=340;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,178:339:99:5690,0,5611 -chr12 32529894 . G T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.834;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:628,0,2953 -chr12 32564793 . C G 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=3.737;DP=64;FS=25.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=13.98;ReadPosRankSum=-3.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:923,0,867 -chr12 32564804 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=3.785;DP=33;FS=34.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=10.57;ReadPosRankSum=-3.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:377,0,460 -chr12 32564816 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:434,33,0 -chr12 32564996 . C A 2284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-1.531;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=32.66;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:99:2313,125,0 -chr12 32565106 . T C 3585.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:3614,251,0 -chr12 32565132 . C A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=1.629;DP=117;FS=86.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.68;ReadPosRankSum=3.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,43:70:99:1512,0,1387 -chr12 32565296 . A T 249.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=15;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:278,0,16 -chr12 32565558 . A C 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:433,31,0 -chr12 32571972 . A G 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.385;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1225,0,736 -chr12 32572207 . G A 3284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=3.864;DP=141;FS=5.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,85:105:99:3313,0,262 -chr12 32572249 . G T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-0.464;DP=87;FS=25.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=15.77;ReadPosRankSum=-5.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1400,0,862 -chr12 32572451 . A G 1821.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.397;DP=53;FS=9.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=34.37;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,49:53:3:1848,0,3 -chr12 32572792 . G GA 5920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-2.360;DP=236;FS=4.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=25.09;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,159:181:99:5958,0,1224 -chr12 32666960 . GA G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.460;DP=26;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:247,0,295 -chr12 32666972 . C A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=1.286;DP=22;FS=13.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:270,0,344 -chr12 32667789 . C CT 788.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.182;DP=112;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,37:103:99:826,0,1570 -chr12 32668580 . GA G 1087.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.391;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,43:50:3:1123,3,0 -chr12 32668818 . C T 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=-0.707;DP=117;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,42:117:99:1163,0,2476 -chr12 32676377 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=1.157;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:368,0,2619 -chr12 32691109 . G A 1921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.939;DP=114;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,60:114:99:1950,0,1898 -chr12 32789938 . C A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.352;DP=55;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:751,0,1131 -chr12 32846173 . G A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.128;DP=39;FS=4.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:570,0,740 -chr12 32846310 . T C 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.940;DP=33;FS=5.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:730,0,466 -chr12 32938699 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=-1.159;DP=44;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:540,0,926 -chr12 33118798 . G T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.733;DP=51;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=12.78;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:680,0,924 -chr12 33122743 . TGTACGTACTCAGCCATTATATATAATAAGACTTATTTTACATCCAGGTTTTAATGATCTTTTTGTTTCTTTATTTAG T 4729.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=1.700;DP=109;FS=3.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=34.80;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:109:99:4767,334,0 -chr12 33124943 . AAGGTAAGTTTCAGAAAGTACCTACTAAATGTTGAAATTGAATAATTAAACGTTTCATGAGTCTATAAATTGAGATTTCTTCCTTC A 285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=1.664;DP=58;FS=3.854;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:323,123,0 -chr12 33125398 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=1.108;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:767,0,719 -chr12 33126259 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=8.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,345 -chr12 33126285 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:240,0,465 -chr12 33219078 . C A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.858;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.63;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:419,0,444 -chr12 33219933 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:337,0,544 -chr12 33220372 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-2.683;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:313,0,515 -chr12 33221880 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=33.89;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:58:401,0,58 -chr12 33279633 . T C 258.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:287,0,18 -chr12 33279829 . T C 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:471,39,0 -chr12 33280093 . C T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.018;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:649,0,488 -chr12 33282983 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-0.237;DP=49;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:563,0,1097 -chr12 33283154 . A T 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr12 33284281 . T A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr12 33286378 . GTCCCGCTGGGCCTCCGAAGTCCGCCGAGCACCGCCACTCAATTGTCCGCA G 536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:574,42,0 -chr12 33299497 . GGGTAATACATGTCACAAACTTTCAACACTGGATGTTCTGGAATTATCAATGTCAAGTTCTAATGTTCATAAAAATAAATAAAACATCTCGTTCTCTATCACA G 1262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=2.407;DP=44;FS=6.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,37:44:99:1300,0,1391 -chr12 33300418 . TA T 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=-0.745;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:350,0,130 -chr12 33302503 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:36:244,0,36 -chr12 33303559 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=1.050;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=8.43;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:315,0,802 -chr12 33309283 . TGTAAGTTTCACACCTGACATACTGAGAATGTTAAAAGGTAATAGCTCTCCTTAAGGGTTACTTAAGGGATAGGACGTTATGGGCTCTTCATCTGATTTTACAG T 1311.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.691;DP=13;FS=3.123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,2:13:99:1349,519,0 -chr12 33311523 . C T 5125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-2.267;DP=344;FS=0.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,144:342:99:5154,0,6637 -chr12 33316550 . CGGTAAGTGTTGTTCTATGTCAAAAGCTGAGTTTGTCTGATGTCCATACTTGAACTCATTATTTTATGTGTCTGATGTGCTCTCA C 2021.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.026;DP=374;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,326:328:99:2059,764,0 -chr12 33318318 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.549;DP=40;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:366,0,1090 -chr12 33325411 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=2.533;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.91;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:335,0,175 -chr12 33325515 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.205;DP=26;FS=8.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=17.18;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,466 -chr12 33347805 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:238,0,180 -chr12 33351181 . G C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=1.381;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=20.05;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:309,0,148 -chr12 33351269 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=2.141;DP=12;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,185 -chr12 33351776 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,291 -chr12 33360818 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=3.051;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:417,0,1532 -chr12 33361093 . C G 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.111;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:628,0,1111 -chr12 33361984 . G C 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=-0.523;DP=46;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:1006,0,575 -chr12 33376895 . T C 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=-1.923;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,32:68:99:1168,0,1254 -chr12 33378725 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,103 -chr12 33380281 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.779;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:841,0,734 -chr12 33391486 . C T 1597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-1.569;DP=95;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=16.82;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,45:95:99:1626,0,1721 -chr12 33395446 . G T 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.873;ClippingRankSum=-0.601;DP=59;FS=2.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=26.00;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,41:59:99:1562,0,459 -chr12 33396884 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.840;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:314,0,3435 -chr12 33403793 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=1.455;DP=33;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:476,0,718 -chr12 33403935 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=22.94;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:464,0,236 -chr12 33406497 . G T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.357;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=19.66;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:559,0,397 -chr12 33406644 . A C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.999;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=15.26;ReadPosRankSum=-2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:303,0,854 -chr12 33406653 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=1.528;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:303,0,854 -chr12 33416295 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.313;DP=33;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:431,0,1127 -chr12 33425843 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-2.239;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:99:322,0,352 -chr12 33425864 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:99:297,0,352 -chr12 33430617 . G A 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.651;DP=33;FS=3.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:980,0,183 -chr12 33431452 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.452;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:425,0,196 -chr12 33435355 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.983;DP=26;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=25.61;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:694,0,166 -chr12 33453634 . T C 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=1.356;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:61:736,0,61 -chr12 33453930 . C CT 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.273;DP=38;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:357,0,450 -chr12 33454168 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:76:432,0,76 -chr12 33454205 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:340,0,189 -chr12 33454678 . C T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.836;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:777,0,735 -chr12 33473519 . T C 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.476;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,56:102:99:1785,0,1571 -chr12 33476723 . A G 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.939;DP=97;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1275,0,2111 -chr12 33476849 . A G 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=1.191;DP=82;FS=2.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,36:82:99:1269,0,1583 -chr12 33476874 . A G 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.351;DP=92;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:1360,0,1739 -chr12 33757886 . C T 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.362;DP=71;FS=12.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,35:71:99:1253,0,1271 -chr12 33758171 . C G 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=-0.835;DP=73;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=12.94;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,30:73:99:973,0,1417 -chr12 33854889 . T G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.655;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:372,0,392 -chr12 33873672 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.187;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:542,0,197 -chr12 34067537 . CA C 245.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=22.35;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:2:281,2,0 -chr12 34076888 . T C 789.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:818,60,0 -chr12 34077774 . T C 476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:505,36,0 -chr12 34489858 . A T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.809;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:338,0,947 -chr12 34517718 . A G 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=-0.560;DP=37;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:787,0,446 -chr12 34539222 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.385;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:394,0,610 -chr12 34585084 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.110;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:535,0,961 -chr12 34585125 . A AT 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-1.761;DP=55;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:558,0,853 -chr12 34586627 . G GA 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=-2.272;DP=55;FS=2.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:373,0,707 -chr12 34653758 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.694;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:244,0,639 -chr12 34656323 . C A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-1.292;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=21.28;ReadPosRankSum=2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:837,0,427 -chr12 34815553 . C T 3064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.772;DP=179;FS=1.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.001;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,88:179:99:3093,0,3295 -chr12 34831262 . T G 3065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.076;DP=161;FS=10.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=19.04;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,81:161:99:3094,0,6224 -chr12 34831272 . G T 3065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.065;DP=168;FS=13.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,88:168:99:3094,0,6224 -chr12 34835654 . T C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr12 34846072 . C G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-1.303;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=15.90;ReadPosRankSum=2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:378,0,655 -chr12 34846081 . T C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=2.113;DP=25;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:636,0,378 -chr12 34866007 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=-1.706;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:832,0,270 -chr12 34866012 . C T 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-1.278;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=33.49;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:832,0,228 -chr12 34866200 . A G 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.597;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=31.26;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1185,0,107 -chr12 34866231 . A C 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.700;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:1132,0,110 -chr12 34866507 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=1.909;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:319,0,112 -chr12 34866984 . T C 1590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=1.758;DP=42;FS=2.105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=23.45;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:75:1619,75,0 -chr12 34867035 . G A 1380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.016;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=32.11;ReadPosRankSum=-1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:99:1409,0,100 -chr12 34870794 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.315;DP=42;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:257,0,1162 -chr12 34873858 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.645;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:469,0,713 -chr12 34873950 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.688;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=20.37;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:456,0,291 -chr12 34876147 . A C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.694;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:581,0,296 -chr12 34876639 . C T 936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=1.352;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.77;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:30:965,30,0 -chr12 34876641 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.638;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:492,0,412 -chr12 34879432 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.188;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:395,0,549 -chr12 34881279 . G C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.012;DP=44;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:766,0,885 -chr12 34881309 . C T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.424;DP=49;FS=4.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:782,0,856 -chr12 34881693 . C A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=15.03;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:434,0,564 -chr12 34883288 . A C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.537;DP=33;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:447,0,660 -chr12 34943879 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.377;DP=19;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,362 -chr12 34944832 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=34.31;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:52:337,0,52 -chr12 34944869 . A C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,222 -chr12 34944939 . C G 838.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.157;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=34.95;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:867,27,0 -chr12 34944985 . T C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=1.382;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=20.66;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:710,0,467 -chr12 34948125 . A G 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-2.221;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=29.72;ReadPosRankSum=1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:801,0,139 -chr12 34948389 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=2.848;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:293,0,267 -chr12 34948598 . C T 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.030;DP=50;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.433;QD=34.22;ReadPosRankSum=-1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,44:50:28:1882,0,28 -chr12 34948607 . G C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-1.123;DP=57;FS=7.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:773,0,1572 -chr12 34951397 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.244;DP=22;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=14.85;ReadPosRankSum=-1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:355,0,309 -chr12 34951560 . T A 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-0.276;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:915,0,1454 -chr12 34963991 . T C 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.029;DP=33;FS=4.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=28.51;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:969,0,206 -chr12 34964039 . C A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.425;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:498,0,45 -chr12 34967056 . A T 256.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:285,0,22 -chr12 34968388 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.838;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:293,0,291 -chr12 34968554 . T C 2365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-2.271;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=30.33;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,60:78:99:2394,0,353 -chr12 34968557 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-0.477;DP=78;FS=7.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:444,0,2988 -chr12 34979435 . T G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.468;DP=47;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:404,0,1168 -chr12 35014059 . A G 1631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=-0.486;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=18.76;ReadPosRankSum=2.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,49:83:99:1660,0,1175 -chr12 35031859 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.249;DP=38;FS=1.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=6.23;ReadPosRankSum=-1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,1042 -chr12 35062925 . A G 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-1.323;DP=44;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1131,0,381 -chr12 35067910 . G T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-1.098;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:794,0,547 -chr12 35069695 . C T 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.892;DP=62;FS=2.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1203,0,879 -chr12 35074067 . C T 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-0.221;DP=55;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=22.30;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1255,0,638 -chr12 35123736 . G T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-0.039;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.044;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:906,0,700 -chr12 35124229 . G T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.127;DP=39;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:714,0,645 -chr12 35171946 . C T 240.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:269,0,22 -chr12 35234208 . T TA 2297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.224;DP=151;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=15.22;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,96:146:99:2335,0,1133 -chr12 35236742 . A C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:394,0,48 -chr12 35243388 . AACCTGAGGAAAACAAGAAGAAGATTAAGGTCATCATATCAGTTATAAGACCCAAAATCTAATCCCAAATTGCAGATTAAAAAACCCTGTGGTACTT A 3826.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.374;DP=109;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=32.43;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,89:97:99:3864,0,1627 -chr12 35243533 . T C 2029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.862;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,61:100:99:2058,0,1368 -chr12 35243617 . C T 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-0.667;DP=101;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,60:101:99:1995,0,1445 -chr12 35254152 . C T 1770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.634;DP=96;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,53:96:99:1799,0,1575 -chr12 35300024 . T C 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.611;DP=36;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:586,0,600 -chr12 35301871 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.134;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:331,0,546 -chr12 35301881 . AT A 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.320;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:277,0,345 -chr12 35302006 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-2.216;DP=53;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1024,0,1342 -chr12 35302607 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-1.154;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:343,0,395 -chr12 35308329 . CGCGTCCTGTCAACACAACCTCG C 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=27;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:44:331,0,44 -chr12 35308532 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=-0.123;DP=28;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:290,0,529 -chr12 35309143 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.379;DP=46;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=13.58;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:653,0,924 -chr12 35314293 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:410,0,91 -chr12 35615767 . T C 990.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=-0.394;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=34.16;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:0:1016,0,0 -chr12 35688277 . G A 2965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.636;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=34.89;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,76:85:39:2994,39,0 -chr12 35763331 . CAAGGTAAAAGCATAAATTTAGGCTTCATTTAAGAACAAAATGGTTTTATTCCATTATATTATGCTTTTTATCAATATGAATCTCTTTA C 5590.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=1.326;DP=140;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.923;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,138:140:99:5628,466,0 -chr12 35779120 . CT C 768.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=1.248;DP=64;FS=8.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=1.289;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:806,0,740 -chr12 35974853 . A C 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.363;DP=142;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,58:142:99:1972,0,2948 -chr12 35975007 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=2.666;DP=101;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.833;QD=6.55;ReadPosRankSum=-4.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:690,0,2873 -chr12 35975228 . C A 1990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=1.366;DP=142;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:2019,0,2826 -chr12 35983392 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.467;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:239,0,486 -chr12 35997152 . TACTAACCTACTCAAAAAGAGACATTTGTCATATTGCAGAATTACTGTAGGCGTCGACTGCATTTGAGTTAGGAGTTTTCTGTGGGTGTGAG T 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.422;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:270,0,944 -chr12 36005568 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=24.63;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,128 -chr12 36126458 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.849;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:306,0,170 -chr12 36126812 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=-1.513;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:240,0,400 -chr12 36128970 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:304,0,310 -chr12 36134091 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:298,0,608 -chr12 36300701 . A C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,438 -chr12 36301607 . G GA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:319,0,621 -chr12 36308983 . C T 1218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.278;DP=62;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.619;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1247,0,914 -chr12 36309006 . G A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.683;DP=63;FS=6.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1155,0,1938 -chr12 36309156 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.542;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:358,0,1185 -chr12 36440143 . CAGGTGAATAAATTGGTTTATTTTATTGCTACTTGTTTGCTTCTGAATAGTTGTTGTTTAGTCTTCTCTAAATTTTATTTCAATTTCTA C 960.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=1.953;DP=25;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=28.83;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:99:998,102,0 -chr12 36447447 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:291,0,220 -chr12 36448751 . A T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.663;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=31.95;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:65:763,0,65 -chr12 36453160 . A T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr12 36472371 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.111;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:386,0,592 -chr12 36501280 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.398;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:413,0,1647 -chr12 36503745 . G A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=1.073;DP=93;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1477,0,1656 -chr12 36505588 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:271,0,64 -chr12 36555175 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=1.430;DP=64;FS=2.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1174,0,1037 -chr12 36555336 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.689;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:384,0,4181 -chr12 36590367 . CT C 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.727;DP=35;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:404,0,368 -chr12 36758845 . C CA 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.127;DP=51;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:261,0,939 -chr12 37197171 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.420;DP=23;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=22.69;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:550,0,281 -chr12 37783799 . G C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=1.293;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:503,0,389 -chr12 37783829 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.670;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:290,0,555 -chr12 37784448 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=2.033;DP=44;FS=25.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:251,0,1252 -chr12 37789923 . G A 2629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.877;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=33.29;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,69:79:75:2658,0,75 -chr12 37791936 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=3.004;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:461,0,539 -chr12 37811290 . G A 210.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:239,0,18 -chr12 37818580 . G GT 739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:777,54,0 -chr12 37818583 . G C 748.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:777,54,0 -chr12 37818774 . G T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-2.580;DP=28;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=16.21;ReadPosRankSum=-1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:482,0,484 -chr12 37819972 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=2.534;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=19.78;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,208 -chr12 37820459 . C T 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.877;DP=38;FS=4.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=23.05;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:904,0,408 -chr12 37821274 . A C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=2.854;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=6.88;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:262,0,2029 -chr12 37821284 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.891;DP=28;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=8.46;ReadPosRankSum=-2.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,3:28:99:265,0,2029 -chr12 37821456 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=1.918;DP=39;FS=21.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:469,0,649 -chr12 37821467 . G T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=3.117;DP=43;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:916,0,630 -chr12 37821737 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=3.262;DP=25;FS=9.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=18.87;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:500,0,1181 -chr12 37822069 . A T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=1.064;DP=41;FS=2.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:693,0,1622 -chr12 37822072 . G T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.503;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:693,0,1622 -chr12 37822259 . A C 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=1.408;DP=40;FS=7.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:717,0,667 -chr12 37822991 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=3.009;DP=19;FS=14.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=22.04;ReadPosRankSum=-2.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:447,0,1092 -chr12 37823000 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=3.547;DP=28;FS=8.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:447,0,1088 -chr12 37888445 . G C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.318;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=24.87;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:451,0,162 -chr12 37888475 . C A 1680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.008;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,46:62:99:1709,0,361 -chr12 37891037 . G A 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1047,81,0 -chr12 37894660 . C T 679.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:708,51,0 -chr12 37907691 . C T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr12 37925479 . A G 4785.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4814,349,0 -chr12 37925549 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.240;DP=36;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=28.85;ReadPosRankSum=-1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1067,0,129 -chr12 37925648 . G T 2987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-1.845;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=35.80;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,69:77:99:3016,0,101 -chr12 37925657 . T C 2737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-2.576;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=30.30;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,69:78:99:2975,0,250 -chr12 37925737 . G GT 2815.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-3.537;DP=108;FS=15.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=26.07;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,70:102:99:2853,0,1743 -chr12 37925740 . G C 2824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-3.269;DP=103;FS=15.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=27.42;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,70:103:99:2853,0,1711 -chr12 37925984 . T A 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.200;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=27.73;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:1027,75,0 -chr12 37925996 . T A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr12 37927192 . C A 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 -chr12 37927643 . A C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 -chr12 37928205 . G A 811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:840,63,0 -chr12 37928665 . G A 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-2.372;DP=31;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=29.28;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:66:1306,66,0 -chr12 37928668 . A T 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:66:1306,66,0 -chr12 37929191 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.765;DP=30;FS=8.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=28.19;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:874,0,170 -chr12 37929358 . A C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.774;DP=22;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:592,0,154 -chr12 37929481 . G C 2314.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.064;DP=63;FS=4.618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.691;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:95:2343,95,0 -chr12 37929920 . C G 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr12 37930197 . C T 1429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1458,108,0 -chr12 37934331 . C T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.397;DP=34;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=25.79;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:905,0,279 -chr12 37936951 . C T 856.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.321;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=32.92;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:12:884,0,12 -chr12 37961533 . A G 1051.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.970;DP=32;FS=6.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:7:1079,7,0 -chr12 37961577 . A C 1490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1519,108,0 -chr12 37961689 . A G 2529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2558,181,0 -chr12 37961886 . A G 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1311,93,0 -chr12 37961911 . T C 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:442,33,0 -chr12 37962313 . A G 1539.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1568,111,0 -chr12 38539687 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=1.258;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:294,0,1631 -chr12 38539720 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=2.444;DP=58;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=5.39;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:341,0,1692 -chr12 38542025 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.910;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:948,0,1944 -chr12 38542491 . C T 2044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.443;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=24.64;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,56:82:99:2073,0,785 -chr12 38544048 . GA G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=-1.661;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:260,0,470 -chr12 38813795 . T C 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=-1.564;DP=124;FS=6.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,44:123:99:1505,0,3364 -chr12 38815197 . A AT 989.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=1.519;DP=195;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,60:184:99:1027,0,3482 -chr12 38946306 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.696;DP=47;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:389,0,1172 -chr12 38946392 . G A 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=-1.219;DP=74;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=18.54;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1400,0,1339 -chr12 38946456 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.522;DP=41;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:589,0,1732 -chr12 38946747 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-1.260;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,790 -chr12 38947123 . G C 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.458;DP=93;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,49:93:99:1792,0,1690 -chr12 38987231 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,384 -chr12 40064695 . A G 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.785;DP=30;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.207;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:889,0,145 -chr12 40065656 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.216;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:291,0,504 -chr12 40066191 . G A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.150;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=29.56;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,47:58:99:1743,0,198 -chr12 40089862 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.323;DP=20;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:58:367,0,58 -chr12 40090513 . T A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 -chr12 40091433 . T G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.540;DP=28;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:442,0,572 -chr12 40091470 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.978;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,217 -chr12 40099835 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.456;DP=65;FS=7.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:317,0,1972 -chr12 40232224 . C CA 437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:44:475,44,0 -chr12 40233280 . AT A 254.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.086;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:18:292,0,18 -chr12 40234531 . G A 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:546,42,0 -chr12 40234596 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:247,18,0 -chr12 40363435 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.759;DP=36;FS=3.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:280,0,1006 -chr12 40499796 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,126 -chr12 40499799 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,126 -chr12 40507770 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr12 40507788 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr12 40510363 . G A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr12 43009084 . G T 2313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.699;DP=91;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,68:91:99:2342,0,471 -chr12 43165691 . G GA 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=-0.694;DP=73;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:401,0,1045 -chr12 43166282 . C CT 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.373;DP=52;FS=8.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:321,0,697 -chr12 43166754 . AT A 924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:94:962,94,0 -chr12 43230223 . ATG A 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:26:306,26,0 -chr12 43230902 . GA G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=1.345;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=18.40;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:43:350,0,43 -chr12 43231694 . TAAGCAAATTATTTCAGTAAAAGATATCAGCTCACAATACAGATTTCTGACTTTTATCTTTTCCATGGAATTCTGACTTTTCTCAGAGTTCAG T 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=1.996;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:673,0,8649 -chr12 43281233 . CA C 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.347;DP=32;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,25:30:41:840,41,0 -chr12 43281566 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-0.716;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:552,0,952 -chr12 43299562 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.612;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:355,0,608 -chr12 43370637 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=-1.088;DP=22;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,693 -chr12 43370838 . A T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.771;DP=71;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:928,0,1559 -chr12 43373862 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.877;DP=77;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1009,0,1491 -chr12 44140092 . A T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=10;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=22.77;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:267,0,47 -chr12 44140688 . C CT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.417;DP=36;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:72:369,0,72 -chr12 44141559 . CT C 1178.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.111;DP=146;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,52:130:99:1216,0,1801 -chr12 44141700 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.315;DP=122;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,27:122:99:514,0,3671 -chr12 44141915 . A AT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-0.976;DP=74;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:255,0,1069 -chr12 44144863 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.079;DP=148;FS=1.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,27:148:99:409,0,4663 -chr12 44311967 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=2.521;DP=44;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.65;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:409,0,2946 -chr12 44312085 . T A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.309;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:454,0,1360 -chr12 44312223 . C G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-1.630;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:710,0,1082 -chr12 44312681 . TA T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=1.353;DP=40;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=7.57;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:340,0,593 -chr12 44312868 . A G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.632;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:904,0,965 -chr12 44313164 . T C 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.516;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:655,0,440 -chr12 44313337 . A C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.093;DP=49;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:632,0,1139 -chr12 44313466 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr12 44313860 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-3.675;DP=37;FS=14.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:441,0,863 -chr12 44313877 . A T 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-2.537;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:636,0,680 -chr12 44318748 . A C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=-0.318;DP=40;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:318,0,843 -chr12 44608523 . G C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=-0.708;DP=50;FS=5.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:701,0,986 -chr12 45242202 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.077;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,886 -chr12 45497225 . C G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.307;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:500,0,200 -chr12 45535238 . G A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr12 45535268 . G A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr12 45629355 . T C 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=1.183;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:1132,0,329 -chr12 45664961 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.156;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:478,0,867 -chr12 45917823 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.156;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:416,0,650 -chr12 45928512 . G A 3044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.345;DP=285;FS=5.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,95:284:99:3073,0,6330 -chr12 45972709 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.797;DP=86;FS=7.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:697,0,2082 -chr12 45990748 . C CT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.816;DP=192;FS=18.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,41:177:99:418,0,3733 -chr12 45995612 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.181;DP=43;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:248,0,1212 -chr12 45995953 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.728;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:341,0,607 -chr12 45997917 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=-0.234;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:617,0,649 -chr12 46012686 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.874;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:333,0,2233 -chr12 46994512 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-1.936;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:336,0,323 -chr12 46996651 . G A 1621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.069;DP=86;FS=1.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,52:85:99:1650,0,990 -chr12 47704454 . T C 1872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=28.00;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:99:1901,132,0 -chr12 47704471 . C G 1872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:99:1901,132,0 -chr12 47704528 . A G 1521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.520;DP=123;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1550,0,444 -chr12 47704629 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.488;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:97:362,0,97 -chr12 47704699 . T G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:21:285,21,0 -chr12 47704792 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:255,0,305 -chr12 47717181 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:373,0,626 -chr12 47773247 . G T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.301;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=19.26;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:818,0,1389 -chr12 47773250 . T A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.739;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=19.74;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:818,0,1389 -chr12 47798807 . G C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.714;DP=105;FS=1.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:694,0,2822 -chr12 47798969 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=1.548;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:588,0,2171 -chr12 47808194 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.010;DP=109;FS=7.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:698,0,3102 -chr12 47905483 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.995;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:430,0,2060 -chr12 47905579 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.242;DP=75;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:377,0,1958 -chr12 47905603 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.180;DP=75;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.698;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:400,0,2160 -chr12 47907220 . A T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=2.130;DP=68;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=14.73;ReadPosRankSum=2.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1030,0,1220 -chr12 47910404 . T C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-1.275;DP=87;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,23:87:99:532,0,2293 -chr12 47915409 . T C 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-2.261;DP=62;FS=8.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1054,0,1076 -chr12 47932331 . T C 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.153;DP=136;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.696;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,48:136:99:1629,0,4916 -chr12 47964809 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.671;DP=90;FS=5.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:1023,0,1956 -chr12 47968457 . C A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.980;DP=41;FS=6.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.451;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:683,0,714 -chr12 48044172 . A C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr12 48044199 . T C 287.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:316,0,16 -chr12 48069114 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-0.307;DP=76;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:362,0,1999 -chr12 48076795 . T G 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.513;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:931,0,562 -chr12 48076801 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.829;DP=50;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:262,0,2046 -chr12 48077267 . C T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.758;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=14.36;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:732,0,941 -chr12 48077321 . A G 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=-0.228;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=29.39;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,51:60:29:1880,0,29 -chr12 48079453 . A G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.941;DP=64;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=18.01;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1181,0,965 -chr12 48079483 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.269;DP=69;FS=8.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:310,0,1936 -chr12 48115967 . T A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr12 48161846 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=1.332;DP=58;FS=8.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=6.39;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:399,0,1412 -chr12 48174831 . G A 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=1.034;DP=90;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,36:90:99:1251,0,2472 -chr12 48216752 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.036;DP=65;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:509,0,1630 -chr12 48614293 . T G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.259;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:502,0,547 -chr12 48614510 . C G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:291,0,250 -chr12 48614576 . A G 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:588,42,0 -chr12 48631434 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.564;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:411,0,691 -chr12 48853950 . G C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.195;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,28:62:99:952,0,1094 -chr12 48854015 . G A 4162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.979;DP=204;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,124:204:99:4191,0,2779 -chr12 48857050 . G A 8217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.809;DP=309;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=26.59;ReadPosRankSum=2.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,223:308:99:8246,0,1984 -chr12 48857167 . C T 8563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.326;DP=328;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=26.11;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,230:327:99:8592,0,2435 -chr12 48857504 . G C 2591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.239;DP=374;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,107:373:99:2620,0,10016 -chr12 48858475 . T C 4952.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:4981,349,0 -chr12 48858485 . T A 3018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-1.390;DP=81;FS=4.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=28.70;ReadPosRankSum=-1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:3047,239,0 -chr12 48858571 . T C 7812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-0.640;DP=252;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=31.00;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,181:250:99:8104,0,4109 -chr12 48858577 . G A 4466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=-0.280;DP=287;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=15.56;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,122:285:99:4495,0,10814 -chr12 48858580 . G A 2115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=-1.314;DP=297;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=7.12;ReadPosRankSum=3.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,82:295:99:2144,0,15324 -chr12 48859770 . C T 7296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.373;DP=406;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,232:403:99:7325,0,5883 -chr12 48860306 . G A 13167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.464;DP=325;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=25.70;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,322:323:99:13196,969,0 -chr12 48863887 . G A 2171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-2.465;DP=407;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,100:384:99:2200,0,10672 -chr12 48882182 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.860;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:582,0,1563 -chr12 48928025 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:305,0,234 -chr12 48989405 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:303,0,175 -chr12 48989959 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr12 49060253 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.341;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:334,0,401 -chr12 49085116 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:246,0,1283 -chr12 49161837 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=-0.579;DP=35;FS=5.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:493,0,617 -chr12 49222696 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.870;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:299,0,397 -chr12 49243626 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=-0.237;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:494,0,621 -chr12 49339304 . TA T 1467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1505,148,0 -chr12 49339452 . G T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=2.529;DP=42;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:793,0,618 -chr12 49339596 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:311,0,351 -chr12 49356021 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:241,0,172 -chr12 49360351 . G A 1385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.035;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1414,0,1446 -chr12 49361089 . A G 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.296;DP=73;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:797,0,1597 -chr12 49379082 . A G 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.859;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:639,0,1117 -chr12 49379917 . G A 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=-1.393;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:1456,0,1990 -chr12 49384407 . C T 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=1.765;DP=99;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:1360,0,1969 -chr12 49525951 . C T 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=1.928;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,49:86:99:1528,0,1270 -chr12 49538817 . A C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:251,0,251 -chr12 49539681 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.854;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=23.10;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:421,0,331 -chr12 49540002 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=1.060;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:522,0,459 -chr12 49560165 . T C 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr12 49571610 . A C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-1.623;DP=24;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:549,0,623 -chr12 49571619 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=1.727;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:291,0,1192 -chr12 49571763 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:321,0,280 -chr12 49610827 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.291;DP=58;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.958;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:670,0,1105 -chr12 49610838 . G C 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=1.019;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:947,0,998 -chr12 49613780 . C T 1558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.083;DP=364;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,84:362:99:1587,0,10085 -chr12 49620855 . T G 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.527;DP=89;FS=5.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:826,0,4257 -chr12 49633883 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.545;DP=106;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:844,0,2631 -chr12 49634851 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.241;DP=68;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:375,0,1927 -chr12 49639277 . A AGC 766.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-0.137;DP=23;FS=6.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.41;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=33.34;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:19:804,0,19 -chr12 49708374 . A AT 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.422;DP=32;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:521,0,1318 -chr12 49708769 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=2.650;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:324,0,2395 -chr12 49709055 . A G 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.668;DP=26;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=22.49;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:613,0,352 -chr12 49709120 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.537;DP=16;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=33.24;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:35:560,0,35 -chr12 49710009 . T C 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr12 49710124 . CA C 600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:638,52,0 -chr12 49710309 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=1.505;DP=27;FS=13.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:563,0,406 -chr12 49710609 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:241,0,477 -chr12 49710958 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,317 -chr12 49712904 . C CA 422.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:59:564,59,0 -chr12 49725431 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.227;DP=38;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:445,0,813 -chr12 49770253 . G C 5214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.264;DP=596;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:398,198:596:99:5243,0,14820 -chr12 49831816 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,417 -chr12 49905949 . T C 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=1.237;DP=37;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=22.13;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:847,0,445 -chr12 49906153 . G T 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=-0.821;DP=50;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,34:50:99:1214,0,567 -chr12 50163764 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=1.642;DP=22;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:399,0,355 -chr12 50189139 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=3.454;DP=68;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:417,0,1838 -chr12 50189422 . T C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=0.021;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:470,0,2651 -chr12 50199223 . C A 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=2.714;DP=43;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=27.72;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,32:43:99:1220,0,236 -chr12 50218100 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.38;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,168 -chr12 50224109 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,316 -chr12 50227422 . T A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.778;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:94:429,0,94 -chr12 50234490 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:262,0,346 -chr12 50243645 . C T 2599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.772;DP=367;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=7.08;ReadPosRankSum=4.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,106:366:99:2628,0,9626 -chr12 50259933 . G A 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=-0.222;DP=156;FS=8.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,76:156:99:2449,0,2277 -chr12 50261738 . G A 5094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.053;DP=296;FS=3.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,151:296:99:5123,0,4988 -chr12 50266219 . C T 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.681;DP=201;FS=12.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,55:200:99:1165,0,7597 -chr12 50266264 . GGTCACAC G 1810.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,45:45:99:1848,0,1769 -chr12 50269935 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.320;DP=208;FS=16.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,30:208:99:254,0,10671 -chr12 50281559 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.809;DP=53;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:705,0,1090 -chr12 50298542 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.484;DP=91;FS=6.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:351,0,3164 -chr12 50299339 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=-0.160;DP=50;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:567,0,1340 -chr12 50299742 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.298;DP=38;FS=10.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:355,0,1006 -chr12 50300032 . C T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:681,0,369 -chr12 50319969 . A T 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-1.114;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,22:69:99:532,0,1650 -chr12 50332381 . G A 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.677;DP=214;FS=2.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,59:214:99:1368,0,5681 -chr12 50332435 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.062;DP=269;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,43:260:99:482,0,7965 -chr12 50403337 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.267;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=7.47;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:312,0,914 -chr12 50415717 . TCTGCACACACACACACACACACGCTCATCAGCGGCTCTGACACACACAGCTGGCGTGTGCAGCGCGGGCCTCAC T 1203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.954;DP=41;FS=4.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=29.36;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:99:1241,0,496 -chr12 50434225 . T G 1405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:99:1434,104,0 -chr12 50434281 . A AG 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=-0.615;DP=89;FS=4.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:442,0,1280 -chr12 50434476 . G C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.510;DP=130;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=5.38;ReadPosRankSum=-1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:727,0,2217 -chr12 50446138 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,443 -chr12 50479003 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.832;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:413,0,835 -chr12 50483930 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,208 -chr12 50544704 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-2.074;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:312,0,1327 -chr12 50544851 . A T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-1.641;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=11.47;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:361,0,581 -chr12 50548137 . T C 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-1.088;DP=46;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=26.71;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,34:46:99:1257,0,273 -chr12 50548218 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.806;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.92;ReadPosRankSum=-2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:337,0,974 -chr12 50571230 . A C 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr12 50615190 . G A 4402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=-0.978;DP=238;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=18.50;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,138:238:99:4431,0,3271 -chr12 50622278 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=17.72;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:294,0,241 -chr12 50651604 . T C 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=2.825;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=11.53;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,50:140:99:1643,0,3178 -chr12 50651682 . CGGTGAGTGACGATGATGATGATGAAGATCAGTTGTGCTGTGCAGAGGGCGGGACGTGACCTGATCATCCTGTTATCTGACTGGTTGTGTTCTGGTCCCGCA C 6420.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-1.482;DP=169;FS=1.852;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=31.80;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,157:162:99:6458,464,0 -chr12 50660810 . C T 4341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=-4.279;DP=365;FS=14.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.449;QD=11.90;ReadPosRankSum=4.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,130:364:99:4370,0,7866 -chr12 50660978 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=2.257;DP=307;FS=5.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,46:306:99:409,0,14287 -chr12 50661006 . G A 4596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=3.232;DP=304;FS=7.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,134:304:99:4625,0,5509 -chr12 50661394 . C T 3999.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-2.377;DP=321;FS=0.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=12.46;ReadPosRankSum=3.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,125:321:99:4037,0,6263 -chr12 50661756 . ACAGGTCACACACACACACTCAGCGCACGCACCGCTCACACCGCAACCCTAGAGTCAACACAACATAATGTTATAAATGACGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT A 10703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=-0.242;DP=277;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=30.57;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,237:247:99:10741,0,1575 -chr12 50662717 . C A 3175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.626;DP=256;FS=1.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.41;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,97:256:99:3204,0,7011 -chr12 50683773 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-1.569;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:240,0,1671 -chr12 50683776 . T A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.977;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=17.68;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:647,0,909 -chr12 50683830 . T C 1286.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1315,96,0 -chr12 50687702 . G T 324.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=32.43;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9:352,0,9 -chr13 73075 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.845;DP=113;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:355,0,3523 -chr13 77923 . CCCTGAGGAGCAGAGAACAGTGAGGGTCAGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTTTCTCGTA C 10224.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.398;DP=286;FS=1.641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.136;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,265:271:99:10262,779,0 -chr13 78374 . T A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.239;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,29:160:99:397,0,4812 -chr13 81420 . TCTGCAACAACACGAGCAGAAGACGGCTGTGATGTGTGTGTGTGCTGAATCAGGTGTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCAC T 5348.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.193;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,119:121:99:5386,426,0 -chr13 94306 . G A 878.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.427;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=29.28;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:1:904,0,1 -chr13 94392 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=-0.335;DP=26;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=24.03;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:81:653,0,81 -chr13 112891 . AGTGTGTGTGTGTGT A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=1.448;DP=48;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:99:1101,0,190 -chr13 163619 . A AT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:274,0,115 -chr13 164042 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.634;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:246,0,464 -chr13 195733 . C T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr13 195805 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr13 242647 . A G 8795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.046;ClippingRankSum=-6.459;DP=66;FS=14.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=28.41;ReadPosRankSum=-5.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:8824,0,1264 -chr13 335027 . C G 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=-0.564;DP=39;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:91:1198,0,91 -chr13 335172 . TCTGACCAACACACAGCAATCAGTTATATTGCGTGTGTGTTTGTGTGTGCATGTTGTACTAGTGGTGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTAC T 1662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=1.931;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,40:43:99:1700,0,679 -chr13 344505 . G A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr13 344506 . G T 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr13 388916 . TCTGAAACACACAAACCAACAACACACTCAGCATTTACACAGCATGACACAGGTATGATGTCCTCATGAACAGATGTACTGAC T 2576.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=2.815;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=35.09;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,57:60:99:2614,203,0 -chr13 418427 . C G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=3.884;DP=42;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=6.71;ReadPosRankSum=-3.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:310,0,2446 -chr13 418429 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=2.938;DP=42;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=6.52;ReadPosRankSum=-3.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,10:42:99:302,0,2446 -chr13 426475 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.106;DP=55;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:358,0,1753 -chr13 426546 . T C 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.492;DP=82;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1407,0,1408 -chr13 428387 . T C 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.567;DP=50;FS=1.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1330,0,376 -chr13 530719 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.530;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:263,0,2144 -chr13 532035 . GAGGAAAGACTCTTTTCACTGTTTAAACTTCAGTGTCAGAGTGTGTGTGTGAGTGGATATTAGTATGTCATAGACACTAACGACACTGTTCTGATGTTTGTTTGCTTGAAC G 4241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=2.602;DP=139;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,125:138:99:4279,0,2329 -chr13 534815 . CACACACACACACATT C 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:67:609,67,0 -chr13 535577 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.321;DP=45;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:283,0,1799 -chr13 550378 . G T 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=1.246;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=32.71;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1075,0,141 -chr13 593343 . C T 2584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.405;DP=104;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,71:104:99:2613,0,844 -chr13 644629 . G T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr13 681012 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:98:262,0,98 -chr13 685919 . C G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-1.540;DP=46;FS=2.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.874;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:361,0,2098 -chr13 702007 . T C 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=-3.610;DP=95;FS=85.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=10.58;ReadPosRankSum=-5.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,32:95:99:1033,0,2203 -chr13 702512 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:400,0,49 -chr13 702540 . T G 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr13 710858 . TGTACACCTCAGCTATACAACTGATCAATAATCATTAGTTTGTTCAGCCGTCATCATTGACTGATGTACTTTTGTTCCTGAAG T 540.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=1.752;DP=18;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:578,0,2333 -chr13 715880 . G C 1781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=-2.389;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,47:68:99:1810,0,549 -chr13 732326 . GCATCAGTGCTGGATGTTATCGTCATGGTAACAGCCTCAGTGCTGCTGGTCCAGCACTGTTAGGAGGGCATCAGTGTTGGATGTTGTTGCCATGGTAACTGCCTCCGTGCAGCTGGTCCAGTGCTGTGAGGAAGC G 1169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=3.132;DP=57;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1207,0,5759 -chr13 849620 . GT G 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:283,0,168 -chr13 852128 . C G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:350,0,266 -chr13 855515 . G C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=2.083;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=22.70;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:641,0,303 -chr13 855619 . A C 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.619;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=30.69;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:2512,0,683 -chr13 855892 . T C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=1.150;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:577,0,114 -chr13 856762 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=3.079;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.43;ReadPosRankSum=-2.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,858 -chr13 857955 . A G 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.941;DP=56;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1525,0,261 -chr13 871446 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-0.185;DP=36;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=23.83;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:886,0,358 -chr13 871482 . C T 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=-0.552;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=24.32;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:855,0,480 -chr13 871602 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.876;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=18.77;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:629,0,379 -chr13 992273 . A ATG 2491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-1.436;DP=147;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,79:103:99:2529,0,451 -chr13 995189 . T G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.811;DP=162;FS=15.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,26:162:99:307,0,5316 -chr13 1254580 . C A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:557,0,355 -chr13 1267333 . TA T 513.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.958;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:551,0,1096 -chr13 1267335 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.520;DP=34;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=15.38;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:551,0,1099 -chr13 1288188 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.419;DP=59;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:328,0,1589 -chr13 1288232 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.487;DP=48;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:311,0,1314 -chr13 1293185 . C T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.828;DP=46;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=14.32;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:687,0,837 -chr13 1307898 . A T 591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:620,45,0 -chr13 1307965 . A T 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr13 1406919 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-1.070;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:266,0,1668 -chr13 1408151 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.077;DP=107;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:306,0,4103 -chr13 1413985 . AGTACGGCCACTGATCATAGATACATTGCATTTATTTATTTAACCAGCGTCAAATCCTGACTCAAGTCTATTTCTAG A 5538.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.196;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=25.74;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,105:106:99:5576,443,0 -chr13 1421013 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=-1.939;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=2.79;ReadPosRankSum=3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,23:121:99:369,0,4763 -chr13 1421162 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.243;DP=125;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,27:125:99:505,0,3742 -chr13 1422589 . T G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=2.107;DP=113;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=4.95;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:99:588,0,4267 -chr13 1424551 . C G 1028.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=2.285;DP=24;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:19:1057,0,19 -chr13 1465952 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.186;DP=31;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:592,0,230 -chr13 1467334 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=-2.060;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:258,0,914 -chr13 1555280 . C G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-2.154;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:251,0,847 -chr13 1615080 . G A 1646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.322;DP=356;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,75:356:99:1675,0,10637 -chr13 1626042 . GTTGTAAGTT G 1377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.707;DP=117;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=11.78;ReadPosRankSum=1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,46:105:99:1415,0,1716 -chr13 1630928 . C A 2776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.732;DP=364;FS=6.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,109:354:99:2805,0,9553 -chr13 1653601 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.607;DP=134;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,22:134:99:269,0,8751 -chr13 1657148 . TA T 1369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=-1.892;DP=122;FS=3.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1407,0,1310 -chr13 1693864 . GAGGTATGGATGCATGCTTCAGAAATGGACATTCCCTATCAAACATCATGCTGCACTTGACCATGCTGTTTATCTGTGTTCGGGC G 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=3.419;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=33.06;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:963,0,1888 -chr13 1971384 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:353,0,184 -chr13 2034193 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.760;DP=22;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:300,0,222 -chr13 2087967 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.555;DP=57;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=6.26;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:385,0,1476 -chr13 2088062 . GT G 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.302;DP=42;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:296,0,603 -chr13 2088101 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=1.514;DP=44;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:738,0,758 -chr13 2127233 . T A 2795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-1.825;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,84:181:99:2824,0,4528 -chr13 2128782 . C T 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.027;DP=97;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1556,0,1732 -chr13 2129955 . AT A 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.791;DP=60;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:867,0,2218 -chr13 2130804 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.255;DP=28;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:378,0,638 -chr13 2132702 . G A 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.441;DP=46;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:766,0,1534 -chr13 2132814 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.887;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,866 -chr13 2168265 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-1.341;DP=106;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:439,0,3041 -chr13 2171923 . G T 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.146;DP=79;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:972,0,2061 -chr13 2196240 . C CGA 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.478;DP=34;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:450,0,491 -chr13 2197174 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.825;DP=31;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,754 -chr13 2197755 . T C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr13 2198873 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-2.014;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:470,0,218 -chr13 2200622 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-2.550;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:283,0,319 -chr13 2200824 . A G 411.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=34.28;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:437,0,1 -chr13 2202134 . A G 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr13 2207453 . G GT 1684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-1.793;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=24.78;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,42:47:99:1998,118,0 -chr13 2209029 . C A 1460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.690;DP=91;FS=2.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1489,0,1429 -chr13 2209115 . TCTGCTGGGAGAACACAAGCAGACCACTGAGAGAGGAGCAGTAAACACACACACAAAACACAGCACTGGCTGAGGAATGTGGGATGAAGTCATACAGGCAAACAGAC T 3347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=2.069;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=27.52;ReadPosRankSum=-1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,85:94:99:3385,0,1523 -chr13 2344897 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.140;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,19:112:99:243,0,6380 -chr13 2369412 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.621;DP=122;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,21:122:99:280,0,3772 -chr13 2370897 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=-2.674;DP=120;FS=4.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:375,0,3609 -chr13 2373053 . A G 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.833;DP=65;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1163,0,1205 -chr13 2373082 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-1.263;DP=45;FS=9.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:379,0,1179 -chr13 2373111 . C T 1028.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:1057,76,0 -chr13 2373308 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.239;DP=27;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:232,0,751 -chr13 2373352 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=2.087;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:265,0,1716 -chr13 2373457 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=-1.237;DP=69;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:483,0,2583 -chr13 2373492 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=5.375;DP=95;FS=15.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=2.18;ReadPosRankSum=-2.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,16:95:99:235,0,3923 -chr13 2373862 . C CTT 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:99:696,0,630 -chr13 2373867 . G A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,1:6:98:675,0,98 -chr13 2374041 . G T 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:431,30,0 -chr13 2375869 . T A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=1.029;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:350,0,594 -chr13 2397530 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:91:232,0,91 -chr13 2397542 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,121 -chr13 2398321 . A G 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr13 2408698 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.363;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:379,0,495 -chr13 2424816 . TC T 621.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:47:659,47,0 -chr13 2428609 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-2.434;DP=29;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.776;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:547,0,448 -chr13 2472454 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:338,0,420 -chr13 2473188 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.408;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.877;QD=16.19;ReadPosRankSum=2.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:433,0,434 -chr13 2474106 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.371;DP=49;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:233,0,1558 -chr13 2490729 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.882;DP=32;FS=8.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:463,0,651 -chr13 2796533 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=1.489;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=16.96;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:571,0,586 -chr13 2959246 . AACCTAGATTAAGGAATGAACGAATGGTAGTGTTGAGCAATTGAGCATCAGCAACAGTGAAATGTTGAGGAGCAGGACTG A 2744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.550;DP=88;FS=1.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,75:81:99:2782,0,412 -chr13 2978242 . TCCTGCAGTCAACAGATTAGTTCAATATAGCTCACAAAGGTGTGTTTGTGTGTACGTGAGTGTATGACTATATGATGCAAGAGACATA T 3091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.582;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:3129,258,0 -chr13 3570853 . TCTGAAATGACAAGAGAGCATACTTTTACTTGGCTTAAACGAAAAAAAAACAGCTCTGCTTAATTATTTAATATTCGAGTTCTTCCTCAC T 12877.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=2.096;DP=303;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,296:301:99:12915,950,0 -chr13 3575124 . A T 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.887;DP=258;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,56:258:99:1070,0,7406 -chr13 3599965 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=1.127;DP=151;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=1.96;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,29:151:99:324,0,4426 -chr13 3604781 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-2.782;DP=71;FS=8.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=3.48;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:275,0,2150 -chr13 3873154 . C T 2060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-1.166;DP=156;FS=2.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,60:155:99:2089,0,3320 -chr13 3881248 . C A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.564;DP=115;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,29:115:99:600,0,3128 -chr13 3886340 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=2.057;DP=51;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:242,0,2367 -chr13 3888209 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=1.931;DP=71;FS=5.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:388,0,2058 -chr13 3905820 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.026;DP=83;FS=2.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:487,0,2392 -chr13 3958115 . C CT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.852;DP=120;FS=2.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:99:256,0,2234 -chr13 3964953 . A T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.392;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:563,0,9731 -chr13 3965024 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.540;DP=138;FS=3.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,23:136:99:312,0,4321 -chr13 3969724 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr13 3976325 . T G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-3.845;DP=48;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:726,0,902 -chr13 3993745 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-1.313;DP=54;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:297,0,4437 -chr13 3993752 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.546;DP=64;FS=4.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:297,0,4437 -chr13 3993966 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.090;DP=90;FS=3.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:235,0,2843 -chr13 3997800 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.467;DP=120;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,24:119:99:439,0,7613 -chr13 3997805 . T A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-1.481;DP=119;FS=6.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=3.41;ReadPosRankSum=2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:434,0,7572 -chr13 3998515 . G A 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-1.667;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:606,0,2433 -chr13 4015362 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.332;DP=101;FS=1.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:657,0,2792 -chr13 4053994 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.725;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:290,0,1682 -chr13 4054475 . A G 402.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=33.57;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:2:429,2,0 -chr13 4086925 . C A 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:508,36,0 -chr13 4265594 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:266,0,545 -chr13 4281453 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:293,21,0 -chr13 4312161 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:376,0,367 -chr13 4317673 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.392;DP=138;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,27:138:99:524,0,4266 -chr13 4317716 . ACTAGAAAGAAAAAGTGAAACTTGTCATATCATGCTAACCTCAATTTTACAAGACAAATAAAAGAGGGTGTAGAACCTTAC A 5173.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=3.163;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,125:144:99:5244,0,564 -chr13 4326644 . A T 3093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.203;DP=355;FS=5.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,116:354:99:3122,0,10857 -chr13 4337908 . T G 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1042,75,0 -chr13 4338076 . T C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr13 4368743 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:269,0,305 -chr13 4369831 . A C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=2.931;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:286,0,423 -chr13 4370080 . CT C 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=-2.052;DP=50;FS=3.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:632,0,581 -chr13 4372214 . G GA 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-2.901;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=17.58;ReadPosRankSum=2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:424,0,238 -chr13 4375260 . GT G 346.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=20.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:37:384,37,0 -chr13 4560277 . G C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.689;DP=145;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:519,0,8498 -chr13 4564909 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-0.130;DP=148;FS=1.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,28:148:99:461,0,4479 -chr13 4645995 . A G 1491.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.238;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1520,111,0 -chr13 4645996 . A G 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.777;DP=33;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=29.24;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:993,0,205 -chr13 4655331 . AGTAGCGGGTGGTGTTTTCGTAGCGGGTGGTGTTTTC A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=-1.131;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.10;ReadPosRankSum=-2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,10:47:99:275,0,7568 -chr13 4658650 . GC G 1984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=1.941;DP=59;FS=15.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=33.64;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:2022,0,1189 -chr13 4658653 . TTAGCAGGAGCAGCC T 1984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=1.825;DP=58;FS=15.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=34.22;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,49:58:99:2022,0,1235 -chr13 4659761 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;ClippingRankSum=1.557;DP=93;FS=3.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:329,0,2690 -chr13 4677176 . TA T 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.641;DP=89;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:507,0,1945 -chr13 4694395 . TG T 2437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=391;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,72:72:99:2475,0,1532 -chr13 4704746 . CGTGAGTATTAACCTTCTGCCATTTCAGAATATAATCACGTTTCTGTTTTGGGTTTTAATCGATAACATGCTGGTCTGTGTGTTATAG C 9455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=3.818;DP=225;FS=19.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=31.29;ReadPosRankSum=3.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,216:222:99:9493,0,8812 -chr13 4704875 . G A 9464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=6.595;DP=202;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=36.27;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,109:202:99:9493,0,8812 -chr13 4704895 . A T 9464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.561;DP=194;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,46:194:99:9493,0,8812 -chr13 4706549 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:275,0,197 -chr13 4707876 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-2.224;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.790;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:384,0,181 -chr13 4753606 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.871;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:314,0,927 -chr13 4921796 . T A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:304,0,327 -chr13 4923718 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:95:234,0,95 -chr13 4928075 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:288,0,400 -chr13 5167380 . CT C 1893.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.412;DP=255;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,85:239:99:1931,0,3837 -chr13 5167604 . TA T 1794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.566;DP=279;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,86:259:99:1847,0,3513 -chr13 5248866 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-1.702;DP=30;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:306,0,382 -chr13 5542099 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.424;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:287,0,405 -chr13 5544760 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.101;DP=59;FS=6.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:348,0,1570 -chr13 5545501 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.446;DP=36;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:242,0,1270 -chr13 5546242 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=-1.397;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.306;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:252,0,1490 -chr13 5547916 . A T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:338,0,560 -chr13 5548822 . C G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-1.467;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:342,0,2067 -chr13 5626745 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=1.348;DP=79;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:295,0,4766 -chr13 5628358 . C T 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.358;DP=70;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1056,0,1382 -chr13 5629912 . A T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.343;DP=47;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:559,0,1725 -chr13 5630043 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.888;DP=73;FS=9.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:463,0,2061 -chr13 5642385 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.068;DP=109;FS=7.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,25:109:99:488,0,3236 -chr13 5670530 . C CA 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:259,26,0 -chr13 5753640 . T A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.035;DP=168;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,47:168:99:1177,0,4604 -chr13 5754260 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.577;DP=287;FS=9.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,65:287:99:1209,0,8135 -chr13 5754284 . T C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=-1.145;DP=270;FS=6.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,54:270:99:842,0,8369 -chr13 5754632 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=-1.402;DP=240;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,50:240:99:783,0,7078 -chr13 5754749 . G A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.142;DP=207;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,45:207:99:776,0,5990 -chr13 5757860 . TCTGTGAACAGTTTGACGTTAGAGTTGCATCACTGCATCATAAGAATAAGCTGGTCTGAATTGCACTCCCATTTAACGTTAC T 9072.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=1.156;DP=232;FS=1.975;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,202:206:99:9110,729,0 -chr13 5758955 . T A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.151;DP=167;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,41:167:99:893,0,4751 -chr13 5876743 . A C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.385;DP=439;FS=1.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:372,67:439:99:610,0,14269 -chr13 5882336 . T G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=1.225;DP=345;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,60:344:99:633,0,12313 -chr13 5882601 . A AT 739.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=-0.428;DP=194;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,61:183:99:777,0,3670 -chr13 5890571 . ACTATATTCATATGGAAGAAACCATAGTGACAATTATTTGGGGGGGGGGAATTAAGCAAATAAATCTAAAATCTTGCATAC A 785.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=30.58;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:59:823,59,0 -chr13 5914287 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.035;DP=112;FS=4.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:515,0,3378 -chr13 5914416 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-0.151;DP=132;FS=3.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,32:132:99:702,0,3776 -chr13 6250883 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.289;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:283,0,434 -chr13 6270432 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-1.002;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.874;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:278,0,3543 -chr13 6278840 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.387;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:301,0,1192 -chr13 6278860 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=1.619;DP=41;FS=7.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:304,0,1318 -chr13 6279015 . A G 1216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.347;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=30.92;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:89:1245,89,0 -chr13 6279156 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=28.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:45:488,0,45 -chr13 6321956 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=1.868;DP=14;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=24.55;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:89:372,0,89 -chr13 6326005 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=1.646;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=29.10;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:552,0,296 -chr13 6326030 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,275 -chr13 6326474 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=19.65;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:264,0,174 -chr13 6330869 . C T 1526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=3.098;DP=141;FS=32.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=10.83;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,49:141:99:1555,0,3119 -chr13 6341186 . A G 3224.61 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-2.026;DP=190;FS=8.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=16.97;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,103:190:99:3253,0,3002 -chr13 6470971 . A G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 -chr13 6471100 . G A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-1.152;DP=308;FS=0.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,63:307:99:1155,0,9191 -chr13 6474090 . A G 804.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:833,63,0 -chr13 6478477 . G T 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1137,90,0 -chr13 6484296 . T C 1457.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1486,105,0 -chr13 6484412 . CAG C 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.769;DP=180;FS=1.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-2.002;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:787,0,5124 -chr13 6487746 . A G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr13 6488029 . T TAA 243 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.00;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:280,0,12 -chr13 6491018 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.069;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:317,0,256 -chr13 6492243 . T C 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr13 6494437 . A G 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr13 6517566 . T C 1414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1443,102,0 -chr13 6525071 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.865;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:276,0,994 -chr13 6525227 . C A 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-1.737;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:33:1124,0,33 -chr13 6974631 . A T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.428;DP=128;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:619,0,4052 -chr13 6986883 . G T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.172;DP=213;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,33:213:99:341,0,6822 -chr13 6990424 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-2.101;DP=226;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,42:224:99:678,0,7236 -chr13 7069454 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr13 7139755 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-4.533;DP=76;FS=26.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=4.87;ReadPosRankSum=-3.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:398,0,2362 -chr13 7139832 . A G 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.112;DP=66;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.499;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1081,0,848 -chr13 7139863 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-2.293;DP=30;FS=20.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:355,0,574 -chr13 7157658 . CT C 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-2.018;DP=21;FS=17.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:361,0,220 -chr13 7623608 . G A 2789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.299;DP=223;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,81:223:99:2818,0,5039 -chr13 7633562 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.365;DP=287;FS=0.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,45:286:99:492,0,9457 -chr13 7633894 . T A 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-1.078;DP=96;FS=8.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=12.80;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,36:96:99:1257,0,2087 -chr13 7648955 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.547;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,26:122:99:454,0,3709 -chr13 7657518 . GCCACCTAACATCACAGAGATATGTGTAATCACACAGTCAACATAACCTCACGGCAACATAACACTTTAAATGAATGCCCAT G 4049.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-0.276;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=32.83;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,85:88:99:4087,398,0 -chr13 7684347 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.655;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:293,0,1799 -chr13 7711698 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=1.275;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:293,0,1323 -chr13 7987579 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.910;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:420,0,623 -chr13 7989193 . CAA C 204.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr13 7992578 . T G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr13 7992579 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 -chr13 8048391 . G A 700.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-1.262;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=33.31;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:15:729,15,0 -chr13 8048401 . A C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:315,0,216 -chr13 8048453 . A T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.318;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=26.10;ReadPosRankSum=2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:472,0,163 -chr13 8143139 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-1.340;DP=21;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:282,0,462 -chr13 8143470 . G T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.854;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:410,0,3337 -chr13 8206458 . TGGTAAGTAGTTTTAAACCTCTGTGTTAATGATTAAAGTGCTCTTCAGTAATGAATAAAATAGTTTCTCATATTAAGTGCTTTGTAACGTGTAAACGTTTATTTTTCA T 12796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=-0.726;DP=327;FS=10.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=36.79;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,315:321:99:12834,910,0 -chr13 8207628 . T C 684.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:713,54,0 -chr13 8235788 . CATTCTATGAAAATAAAAACAAACATGGCATTCATAAACGTATTTAAAAAGTATTTGTTTT C 407.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:445,33,0 -chr13 8291697 . A T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-1.585;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=21.44;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:457,0,233 -chr13 8307799 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-0.467;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,537 -chr13 8324021 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-1.126;DP=24;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:429,0,441 -chr13 8345429 . C T 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:432,0,275 -chr13 8345441 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.754;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:427,0,204 -chr13 8665164 . TA T 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.674;DP=60;FS=3.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.145;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,1:59:99:600,0,3794 -chr13 8665238 . C G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.034;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,28:82:99:399,0,4413 -chr13 8710442 . TCTGTTTAGGGGTGAAAGAGACATTAAGACTGAGGTGTTTTTGGGGTAAATGGTTATGTACCATGATTGCTGGGATATGTGTGTGCGCCTTAC T 8502.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=1.004;DP=180;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=35.48;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,176:180:99:8540,776,0 -chr13 8710566 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-2.463;DP=218;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,33:218:99:285,0,9736 -chr13 8739079 . A T 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.074;DP=60;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1133,0,2043 -chr13 8741402 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=1.490;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.102;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:339,0,1586 -chr13 8767446 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,134 -chr13 8768127 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,142 -chr13 8801786 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.115;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=10.06;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:320,0,656 -chr13 8802647 . A G 385.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:413,0,9 -chr13 8937240 . C A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.272;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1111,0,1550 -chr13 8951127 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=1.165;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:266,0,3392 -chr13 8974073 . G A 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.281;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=12.39;ReadPosRankSum=2.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:883,0,1819 -chr13 9185424 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.853;DP=43;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:387,0,1172 -chr13 9188292 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:294,0,1078 -chr13 9194704 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=1.260;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:230,0,941 -chr13 9221082 . G GT 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=1.508;DP=77;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,29:66:99:475,0,791 -chr13 9244352 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.744;DP=57;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:672,0,1320 -chr13 9398446 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.394;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:258,0,1080 -chr13 9551678 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.985;DP=314;FS=3.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,64:314:99:1091,0,9443 -chr13 9552079 . T A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.127;DP=391;FS=1.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,73:390:99:1176,0,12432 -chr13 9578173 . G A 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-0.228;DP=350;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,67:350:99:1092,0,10964 -chr13 9797932 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.519;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:348,0,325 -chr13 9800471 . A AG 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.709;DP=34;FS=8.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:873,0,943 -chr13 9926163 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.661;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:313,0,489 -chr13 10185741 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=1.493;DP=30;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.032;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:548,0,546 -chr13 10193323 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.083;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:545,0,534 -chr13 10216388 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.68;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:275,0,104 -chr13 10552701 . TCCTAAATGGTACAGAGTAATTAGGAAAATGTACAAGTCAAAAATATTCACAATAAGGCATTCATCATTAATGAACTCA T 2348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=2.785;DP=80;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=29.36;ReadPosRankSum=-1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,64:80:99:2386,0,3067 -chr13 11158027 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.981;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:471,0,501 -chr13 11159435 . GA G 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.923;DP=109;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=9.91;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1118,0,740 -chr13 11160285 . T TA 924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.053;DP=60;FS=5.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:962,0,2826 -chr13 11315564 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=16.80;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,612 -chr13 11325907 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.439;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:348,0,469 -chr13 11328994 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-2.023;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:393,0,277 -chr13 11390931 . AT A 595.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=-0.389;DP=35;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:57:633,0,57 -chr13 11392469 . T G 800.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:829,57,0 -chr13 11459112 . G A 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr13 11461886 . G GTT 8710.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.137;DP=32;FS=2.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=32.06;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,20:23:99:8748,873,0 -chr13 11482366 . A AC 543.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:47:636,47,0 -chr13 11482490 . GT G 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.722;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:310,0,306 -chr13 11483461 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.439;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.903;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:324,0,460 -chr13 11507198 . G T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:543,0,579 -chr13 11509344 . C A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=-0.478;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:759,0,536 -chr13 11512849 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-0.110;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:729,0,649 -chr13 11583998 . TGGTAAGGTGTTTTCCCTGTACCTGACAATACCATATTTCACTATGTTTTGTAAACTTCTTAAAAAGCTGTATATCTGTTTTCCCCCTTCACCCA T 4895.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.093;DP=117;FS=14.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,110:116:99:4933,209,0 -chr13 11681674 . C T 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr13 11743165 . GT G 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.646;DP=79;FS=8.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:571,0,323 -chr13 11743938 . C CT 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.262;DP=126;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,38:116:99:670,0,2051 -chr13 11752075 . A AT 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.580;DP=46;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:631,0,852 -chr13 11762172 . AT A 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.293;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.967;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:279,0,437 -chr13 11842217 . C G 3658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.424;DP=224;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=16.33;ReadPosRankSum=3.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,106:224:99:3687,0,3583 -chr13 11842249 . A G 3390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.313;DP=198;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,95:198:99:3419,0,3439 -chr13 11842321 . A G 2655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;ClippingRankSum=-1.226;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,80:204:99:2684,0,4343 -chr13 11842518 . T A 2518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.180;DP=182;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,75:181:99:2547,0,3662 -chr13 11842669 . G A 2484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.288;DP=202;FS=8.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,73:202:99:2513,0,4577 -chr13 11842789 . T C 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-1.964;DP=67;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1175,0,1165 -chr13 12310544 . A T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.516;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:611,0,348 -chr13 12358495 . T G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.058;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:698,0,363 -chr13 12502632 . GCTGTAAGATAGGGGAAAAAATGTTATGATCTGACAGGATTAACTAAAAATATAACCAAAAAAACTTGATAAATGTAC G 15218.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=-0.874;DP=350;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,341:349:99:15256,1255,0 -chr13 12895767 . T A 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.554;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:417,127,0 -chr13 12944194 . ACAGGTAAACACTTCCCTCTGTGATCAATCATATTCTAGCTATCCGTCTTCTCATTGTGCATCTGTTTTTTCTGATCGTGT A 1684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=1.168;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=27.48;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,40:43:99:1722,0,330 -chr13 13097922 . A G 1976.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2005,144,0 -chr13 13448406 . T G 209.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:247,18,0 -chr13 13448534 . A C 371.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.36;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:7:399,0,7 -chr13 13448555 . T G 365.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:7:393,0,7 -chr13 13448702 . T C 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:289,21,0 -chr13 13804022 . TA T 1185.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.908;DP=43;FS=7.782;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1223,121,0 -chr13 13864538 . C G 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:556,39,0 -chr13 15382372 . G A 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.853;ClippingRankSum=-5.025;DP=142;FS=104.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=11.05;ReadPosRankSum=-4.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,49:142:99:1597,0,3445 -chr13 15383218 . A C 1689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=5.123;DP=100;FS=83.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=16.90;ReadPosRankSum=-5.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,55:99:99:1718,0,1537 -chr13 15383547 . A AT 2722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-2.912;DP=183;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=14.88;ReadPosRankSum=3.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,122:161:99:2938,0,1072 -chr13 15383632 . A G 2917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=-0.853;DP=165;FS=21.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,80:162:99:2946,0,3002 -chr13 15384564 . ATT A,AT 4366.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=1.359;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:19,126,70:215:99:6048,1592,1484,3382,0,2994 -chr13 15385813 . T C 1277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=1.003;DP=426;FS=70.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:318,80:398:99:1306,0,12552 -chr13 15548982 . T G 4510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:4539,331,0 -chr13 15549098 . G A 2199.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=1.627;DP=59;FS=3.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,44:50:56:2228,56,0 -chr13 15549286 . A G 8007.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.761;DP=29;FS=3.834;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=29.96;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,12:24:99:8036,491,0 -chr13 15549355 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=-0.561;DP=29;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:350,0,1134 -chr13 15549396 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=1.130;DP=95;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:233,0,4040 -chr13 15549454 . A G 7279.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-1.668;DP=179;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=32.07;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:7308,376,0 -chr13 15549515 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.655;DP=211;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,42:200:99:346,0,10407 -chr13 15549587 . A G 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.985;DP=200;FS=9.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,60:184:99:1539,0,5938 -chr13 15549616 . C T 3162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=-3.565;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,94:170:99:3191,0,3143 -chr13 15549680 . G A 11941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.505;DP=89;FS=1.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,79:86:99:11970,825,0 -chr13 15549733 . G T 11941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.070;DP=60;FS=7.361;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=31.96;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:11970,825,0 -chr13 15549770 . G A 11941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.956;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=29.60;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,65:68:99:11970,825,0 -chr13 15549797 . G A 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=-1.050;DP=117;FS=0.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,38:104:99:1264,0,2679 -chr13 15549836 . A C 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=-1.825;DP=135;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=5.22;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,32:122:99:733,0,4067 -chr13 15549864 . G C 6650.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:6679,389,0 -chr13 15549896 . A G 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-1.099;DP=118;FS=9.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=6.01;ReadPosRankSum=2.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,35:112:99:737,0,4814 -chr13 15550034 . A G 5487.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.231;DP=152;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=29.58;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,121:140:47:5516,47,0 -chr13 15550327 . C G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.504;DP=61;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:359,0,2625 -chr13 15550345 . A G 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=1.431;DP=36;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=31.97;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1179,0,340 -chr13 15550346 . A G 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.460;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=20.39;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:742,0,1073 -chr13 15550395 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.810;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:406,0,476 -chr13 15550403 . C T 924.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.734;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:66:953,66,0 -chr13 15550440 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=2.407;DP=91;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=6.79;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:646,0,2576 -chr13 15601209 . GAGGTGAGTTACAAATGGCAATTGGTTACTTATAACAGGTCTGTTGTCCATAATAGTGTGAGCTGCTGTTTTTGTGTGTTTGT G 3207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=2.346;DP=91;FS=3.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=33.16;ReadPosRankSum=-3.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,84:91:99:3245,0,165 -chr13 16526530 . CGGTGAGAATCTCTGGCAATACAGTGTTTCTGAAATTATCATTTTGATTAGTTTGAAGTTGATTCTGTGTATTTTTTTTTGTCA C 2233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.939;DP=61;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=30.47;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,54:61:99:2271,0,1611 -chr13 17803933 . T C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.085;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=12.71;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:346,0,775 -chr13 17823843 . A C 909.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:940,66,0 -chr13 18068439 . A G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.191;DP=24;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=25.37;ReadPosRankSum=2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:637,0,181 -chr13 18095183 . G A 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=1.859;DP=39;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.942;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:847,0,463 -chr13 18113337 . T G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.069;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:519,0,506 -chr13 18132364 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-1.103;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:948,0,935 -chr13 18185131 . ACTAGAAGAACATTGATATACGTCATATTCATCATATTATTAATCATTAAAAGTTTTTTTTTTTAGCTGTGCAACATAC A 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=2.192;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=30.20;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:611,0,723 -chr13 18284206 . A G 245.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:274,0,21 -chr13 18289769 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,132 -chr13 18372491 . TA T 1523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.422;DP=176;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.954;QD=8.66;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,68:168:99:1561,0,2145 -chr13 18724969 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.173;DP=42;FS=1.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:262,0,1486 -chr13 18724985 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.344;DP=33;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.556;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:239,0,939 -chr13 19205662 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.682;DP=157;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,32:157:99:619,0,5074 -chr13 19742653 . G T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,293 -chr13 19767486 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=2.204;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:334,0,432 -chr13 19767544 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.555;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:295,0,218 -chr13 21807961 . T TA 587.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:625,41,0 -chr13 21808164 . CA C 287.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=1.004;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:18:325,0,18 -chr13 21832037 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,136 -chr13 21915763 . T A 3952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=0.204;DP=244;FS=6.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,110:243:99:3981,0,4480 -chr13 21916124 . TC T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.410;DP=44;FS=9.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:394,0,754 -chr13 21950865 . C G 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.337;DP=29;FS=9.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:613,0,732 -chr13 21958063 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,432 -chr13 21961476 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,253 -chr13 21961592 . CA C 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.607;DP=35;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:463,0,379 -chr13 21977414 . T C 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.860;DP=82;FS=3.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:1079,0,1598 -chr13 22006650 . C A 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.624;DP=98;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:1282,0,1946 -chr13 22025705 . GA G 472.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=1.187;DP=25;FS=12.788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:29:510,29,0 -chr13 22381510 . GT G 935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=-0.174;DP=115;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,41:108:99:973,0,1639 -chr13 22397051 . G A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=1.180;DP=58;FS=7.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:951,0,1097 -chr13 22401170 . G A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-3.500;DP=77;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=17.30;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:77:99:1360,0,1384 -chr13 22403536 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-0.810;DP=59;FS=5.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:828,0,1201 -chr13 22415075 . G A 2259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.737;DP=124;FS=8.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.210;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:2288,0,1766 -chr13 22457253 . C CT 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.074;DP=33;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:292,0,393 -chr13 22498065 . G T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-1.074;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.225;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:572,0,450 -chr13 22505567 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.041;DP=43;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1174,0,284 -chr13 22513379 . G C 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.151;DP=32;FS=7.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:594,0,559 -chr13 22513485 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=-0.710;DP=45;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:528,0,1044 -chr13 22621057 . C CT 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=1.012;DP=254;FS=8.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,44:235:99:348,0,5279 -chr13 22691932 . T TA 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.501;DP=71;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:502,0,678 -chr13 22758663 . C CT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-1.022;DP=86;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.134;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:307,0,4015 -chr13 22759766 . A T 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.852;DP=97;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1488,0,1919 -chr13 22760673 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:382,0,393 -chr13 22761976 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.594;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:700,0,575 -chr13 22812684 . G A 5120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.080;DP=295;FS=8.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=17.36;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,140:295:99:5149,0,5255 -chr13 22816130 . C CT 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-3.377;DP=641;FS=5.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:495,129:624:99:766,0,13142 -chr13 22819440 . TAA T 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-0.026;DP=60;FS=10.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.553;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:934,0,898 -chr13 22879547 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:80:413,0,80 -chr13 22879562 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:319,0,84 -chr13 22963788 . T G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=4.683;DP=45;FS=16.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=8.15;ReadPosRankSum=-2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:395,0,1188 -chr13 22982829 . GCCTGAGAAAGTAATAAAAATCATTACAAAAATGTAGCTTCACATTAAATAAAACTATTAATAGACCATGTTA G 1055.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=1.595;DP=26;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=30.14;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:78:1093,78,0 -chr13 22997286 . GCCTGACAATGCAAAATACTGAGAACAGCATCAACAAAAAATAACTCAACTGTTGTCATGCTTAAACTTGGCAGGTA G 2232.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=1.667;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=32.79;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2270,178,0 -chr13 22997392 . TCCTGGAAGTAAATCAGCATGTTCAGACCAAAGCTGGCTACTTAGTTTTGAGAAACCGTATTAGTTTTATGTCTACAAGATGTATATTTGTCATA T 1212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=1.161;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:1250,0,2277 -chr13 23006038 . TGGTATGCAAATGAGCATGTATGCAAATGTTTACTGTTTATTTAAAAAAAAAGAGATGCATTGTGATTGGCATTTTTCTTTACA T 1570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=2.317;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=29.41;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:99:1608,118,0 -chr13 23065546 . TA T 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.829;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:305,0,612 -chr13 23114137 . A T 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-0.911;DP=171;FS=7.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=12.53;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,68:171:99:2171,0,3346 -chr13 23126008 . C G 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.368;DP=143;FS=7.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:2049,0,2748 -chr13 23182641 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-1.234;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:518,0,1009 -chr13 23199613 . G A 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.473;DP=108;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,37:108:99:1224,0,2466 -chr13 23225263 . TCCTGTGCAGTGATGGATAGTACTTAAAGATGACTTTAAATGATATAAAAATGTCATTTAAAAAAGCATGGCTACTGTA T 3441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=2.663;DP=81;FS=2.447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=29.71;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,78:81:99:3479,276,0 -chr13 23420117 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.279;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,31:86:99:1024,0,1867 -chr13 23856047 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=1.447;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:274,0,141 -chr13 24125543 . GT G 1086.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.855;ClippingRankSum=3.715;DP=153;FS=10.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=7.10;ReadPosRankSum=-3.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:1124,0,1997 -chr13 24223040 . TCTATTAAACACAGAGGACATTTTCATTCGTGTTCAATGTAGATATTTTTTCAAAACAAAATTATTAAGCTTGGCACTGTTTTAC T 1895.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=1.418;DP=59;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=32.13;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,52:59:99:1933,0,1743 -chr13 24224440 . G T 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=-0.667;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1175,0,627 -chr13 24293700 . GA G 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.817;DP=57;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:398,0,851 -chr13 24294583 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=1.229;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:653,0,889 -chr13 24508782 . A T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:433,0,622 -chr13 24593981 . T G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.223;DP=53;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:466,0,2412 -chr13 24602787 . A C 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-1.186;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:830,0,831 -chr13 24743801 . G A 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.194;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=28.91;ReadPosRankSum=-0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:780,0,509 -chr13 24743811 . G T 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.537;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:780,0,509 -chr13 24748038 . GT G 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.711;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:602,0,601 -chr13 24805051 . TGGTTTGTCTTTTAAATTTACTTTTGCACTACAGCCTTTTTCTTCTTTTCTTATTTTAATATATGAACTAATGTATTCTTCTATGTA T 16541.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.765;DP=239;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=28.64;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,221:222:99:16579,1244,0 -chr13 24805783 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.643;ClippingRankSum=-0.906;DP=32;FS=8.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=16.40;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:553,0,551 -chr13 24887515 . C A 2477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.856;DP=131;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,73:131:99:2506,0,2116 -chr13 24888028 . C CT 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.201;DP=102;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:368,0,2636 -chr13 24926049 . TA T 8654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-3.392;DP=120;FS=8.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=33.41;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,44:100:99:8692,0,231 -chr13 24927383 . C CA 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=-1.608;DP=84;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:521,0,882 -chr13 25000783 . AGTTACTATTCACTTTGTCACTAATGCCGATTCTACATTTAATCACTGTTGCATTATTTGTTCCTAAACATTATTTTTTTATTTCAG A 1752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=1.648;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=30.97;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1790,130,0 -chr13 25430999 . A AGATTTT 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=3.241;DP=102;FS=4.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,29:91:99:798,0,2426 -chr13 25603338 . G GT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.898;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:268,0,295 -chr13 25650761 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr13 25696059 . CA C 1549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-0.793;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=25.41;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:1587,121,0 -chr13 25696302 . C CA 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.724;DP=168;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,53:136:99:578,0,1911 -chr13 25701590 . C CT 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.314;DP=62;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:646,0,1012 -chr13 25702713 . TA T 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.466;DP=85;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:850,0,1161 -chr13 25797111 . TCTATGAACAACACACATATTTTTCATTTTTTTCTATCACTAGAAGGCTACAAATTCAGCTAACAACAAAAATAATGATTACATAC T 1785.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=1.648;DP=41;FS=3.340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:99:1823,149,0 -chr13 25987168 . G T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:280,21,0 -chr13 26053681 . ACTACAGCAAAACACAATATTTGGATATTAAAAGGTAGCAATGTAATTTAATAAAATTCAGGAGCAGCTTAC A 6771.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=3.395;DP=195;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=34.73;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,159:187:99:6809,0,7704 -chr13 26060641 . G GA 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-1.414;DP=184;FS=4.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,43:172:99:530,0,3448 -chr13 26149172 . CT C 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.220;DP=34;FS=9.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:351,0,297 -chr13 27020990 . TA T 295.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.134;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:332,11,0 -chr13 27266674 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=1.325;DP=66;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.702;QD=3.63;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:268,0,2195 -chr13 27266935 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=3.142;DP=82;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:411,0,5491 -chr13 27413767 . A T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.225;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=16.43;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:554,0,555 -chr13 27434727 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.892;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:289,0,215 -chr13 27435804 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.312;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:475,0,562 -chr13 27436117 . T TA 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-0.198;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:400,0,398 -chr13 27477988 . A T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.466;DP=26;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:481,0,446 -chr13 27490213 . A T 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=1.387;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:737,0,171 -chr13 27501241 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.060;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:498,0,275 -chr13 27512992 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:374,0,330 -chr13 27513131 . C A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.312;DP=31;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:529,0,492 -chr13 27536956 . G T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.769;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:619,0,1749 -chr13 27537808 . AT A 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.396;DP=61;FS=5.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,36:51:99:642,0,136 -chr13 27537917 . A T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=-2.643;DP=64;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:391,0,1916 -chr13 27538094 . T A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-0.060;DP=59;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:371,0,1883 -chr13 27540889 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.633;DP=37;FS=4.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:362,0,1657 -chr13 27540916 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.549;DP=39;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=18.15;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:736,0,712 -chr13 27544916 . AGTAAGCTTGACTCACTTCTGTACTCACTGCTTCTGCTATCCTAAGAAGTTATTACACACTTCATTGTGTCCCATCAG A 1240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-0.561;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:99:1278,0,1111 -chr13 27545089 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-2.152;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=13.46;ReadPosRankSum=2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:486,0,708 -chr13 27545206 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.741;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:468,0,810 -chr13 28232770 . CA C 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.196;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:76:268,0,76 -chr13 28529248 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=-1.156;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:373,0,1314 -chr13 28631789 . G A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr13 28632650 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.215;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:468,0,928 -chr13 28632658 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.144;DP=26;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:468,0,928 -chr13 28632675 . A T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.528;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:478,0,515 -chr13 28665722 . C A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.968;DP=75;FS=7.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.82;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:390,0,2324 -chr13 28666854 . C G 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.739;DP=43;FS=2.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.27;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,3:43:99:728,0,3417 -chr13 28667318 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-1.475;DP=129;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.984;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,22:129:99:289,0,6002 -chr13 28668158 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-2.605;DP=78;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=4.70;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:395,0,3323 -chr13 28819895 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.230;DP=69;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:354,0,1891 -chr13 28819956 . G C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.464;DP=58;FS=15.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=8.46;ReadPosRankSum=2.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:519,0,1461 -chr13 28822432 . GA G 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.088;DP=26;FS=14.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:321,0,233 -chr13 28828203 . AACCTAAAGTCAAATTCAAAGAACGTTTTAGATGTTTAACTGAAAATCAATAGTAACCTGTTTGGATCAGCACACCCAGTCGAGAGGGCGGTTTCATTTCGGCCT A 3593.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.100;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=27.30;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3631,306,0 -chr13 28873736 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=-1.352;DP=38;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:322,0,1084 -chr13 28874618 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=1.027;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:477,0,2703 -chr13 28874671 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=-2.018;DP=89;FS=2.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.028;QD=3.95;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:380,0,3031 -chr13 28913004 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=-0.237;DP=43;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:259,0,1170 -chr13 28961255 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=-0.088;DP=330;FS=2.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,89:330:99:2114,0,9183 -chr13 28964658 . T C 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=-2.004;DP=284;FS=14.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,62:217:99:754,0,4767 -chr13 28967268 . A T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-2.603;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:606,0,2410 -chr13 28967663 . C A 1896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.964;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,74:223:99:1925,0,6402 -chr13 28968932 . A T 2406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-2.155;DP=110;FS=13.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=21.88;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:2435,0,1308 -chr13 28968953 . A G 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=2.288;DP=129;FS=4.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,51:113:99:1431,0,3463 -chr13 28969081 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.748;DP=200;FS=0.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,30:199:99:238,0,9033 -chr13 28969082 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.260;DP=201;FS=2.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,31:200:99:321,0,7424 -chr13 28976449 . TGTGAGCACCAGCTTAACAAGGCTCTTAATAAGATGTTTGTAACATTTATATGCTTGCATGTGTCATCTGTAATCTATAATATGAATTGCTGTGCAG T 1200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.953;ClippingRankSum=0.000;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.369;QD=30.02;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1238,0,3603 -chr13 28982563 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.636;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:311,0,1213 -chr13 29090032 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=-1.730;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:229,0,3741 -chr13 29090192 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-1.377;DP=122;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,21:122:99:288,0,3877 -chr13 29090217 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.666;DP=124;FS=3.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,21:124:99:274,0,4303 -chr13 29091018 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.085;DP=118;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,29:117:99:682,0,3382 -chr13 29417366 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.041;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:255,0,1069 -chr13 29450251 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=1.413;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:253,0,1289 -chr13 29453109 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.793;DP=79;FS=3.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:568,0,2148 -chr13 29519169 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-1.654;DP=51;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:418,0,1488 -chr13 29519250 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=1.205;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.35;ReadPosRankSum=-2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:629,0,1963 -chr13 29646092 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=-1.785;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:361,0,1461 -chr13 29646194 . C G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.051;DP=54;FS=2.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:274,0,1665 -chr13 29646347 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-0.481;DP=56;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:387,0,1567 -chr13 29647782 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.425;DP=54;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:398,0,1417 -chr13 30159462 . GT G 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.361;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=8.48;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:416,0,184 -chr13 30163728 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:284,0,56 -chr13 30216258 . T A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr13 30262645 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=-3.004;DP=154;FS=3.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,34:154:99:702,0,4641 -chr13 30267621 . TA T 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.912;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:496,0,720 -chr13 30376104 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.987;DP=375;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:326,49:375:99:244,0,13191 -chr13 30379536 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.818;DP=355;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,48:353:99:295,0,11941 -chr13 30392278 . TA T 4511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=-2.239;DP=278;FS=3.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,176:258:99:4549,0,1313 -chr13 30545226 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=-0.929;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:229,0,2531 -chr13 30698461 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.624;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:295,0,2961 -chr13 30803831 . C CA 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:310,30,0 -chr13 31124056 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.808;DP=40;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:466,0,858 -chr13 31135851 . TGGTACGGATGCGGGTTTTTTTACTTTATGTGCTAGCAGAAATGTATTAGCATAGTTTTAAGTTGTTTGTAAGACGCAAGTGAGAGTTGGAGAGCTTTACAGCTGACGTTTGGCTGTTTTTCTTTGCA T 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:249,0,3491 -chr13 31149598 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.888;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:258,0,534 -chr13 31311073 . AATATCCTTTGCATTTCAACAGCCACTTACAAAAGTTACGTTTTTGTTTTTACTTTTATGTCAGTGTTTCCTTAACAGCTTAC A 824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=-1.596;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=29.45;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:862,0,431 -chr13 31356801 . AGTAAGTTAACATATCAACATCCAATCGGTTTTCTGTCTATGGTTTTGAAACAATTAATTTATTGATTTATATGAATGAGATGTTATATTCTCTGTCTTCATGTAG A 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:350,0,848 -chr13 31371723 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.057;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:330,0,842 -chr13 31512955 . C G 1556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=-0.618;DP=199;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,60:197:99:1585,0,5419 -chr13 31513075 . G T 1804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=-2.066;DP=151;FS=9.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,52:151:99:1833,0,3574 -chr13 31513555 . C A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.780;DP=36;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:99:1355,0,1221 -chr13 31517424 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-1.511;DP=36;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:314,0,920 -chr13 31567076 . T C 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=-0.599;DP=95;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:1369,0,1977 -chr13 31569961 . A G 2492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.352;DP=185;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,74:185:99:2521,0,3819 -chr13 31575334 . GACCTAAACACACATTTAAGAAAAATACAACATTAAAAAAAATGTACAAAAAGCAACACCTGAGAACACCCATACATTTTTGCGAGATAT G 5814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=1.976;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,133:135:99:5852,545,0 -chr13 31575456 . G A 2104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.461;DP=173;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=12.17;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,63:172:99:2133,0,3759 -chr13 31579177 . T C 1935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.982;DP=149;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,57:149:99:1964,0,3114 -chr13 31593758 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-0.298;DP=29;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:338,0,692 -chr13 31603766 . T A 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=-1.888;DP=143;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=5.27;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:782,0,1412 -chr13 31603844 . A G 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.534;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=23.19;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,46:63:99:2254,0,367 -chr13 31603851 . T A 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=3.495;DP=94;FS=3.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.37;ReadPosRankSum=-2.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:533,0,1927 -chr13 31604010 . T A 1591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.186;DP=35;FS=10.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.179;QD=29.91;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:85:1620,0,85 -chr13 31604018 . A T 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.636;DP=40;FS=5.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=34.82;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:99:1575,0,219 -chr13 31604325 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.678;DP=57;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.983;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:576,0,480 -chr13 31604534 . G C 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 -chr13 31604650 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=-1.177;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:242,0,751 -chr13 31606203 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=24.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:253,0,61 -chr13 31648925 . C CT 965.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.684;DP=44;FS=9.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=21.95;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:71:1003,71,0 -chr13 31675594 . C G 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=64;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:1239,0,2908 -chr13 31675606 . A T 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-2.733;DP=68;FS=8.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:1239,0,2840 -chr13 31679270 . C A 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-1.199;DP=153;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=5.93;ReadPosRankSum=3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,39:153:99:935,0,4246 -chr13 31679505 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.104;DP=152;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,31:151:99:480,0,5162 -chr13 31755907 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:381,0,792 -chr13 31764212 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.819;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.492;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:311,0,1490 -chr13 31769612 . G GTC 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-0.498;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.097;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:922,0,2756 -chr13 31773672 . G A 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.782;DP=61;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=18.80;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,36:61:99:1175,0,821 -chr13 31786736 . C CA 530.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:53:568,53,0 -chr13 31786909 . T TAA 751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.971;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:789,0,667 -chr13 31787175 . CT C 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=1.350;DP=56;FS=8.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:595,0,1632 -chr13 31787273 . G T 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.254;DP=70;FS=5.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1463,0,818 -chr13 31788148 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.276;DP=24;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:229,0,627 -chr13 31789040 . C A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.334;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:493,0,489 -chr13 31790611 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.282;DP=62;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:1065,0,1105 -chr13 31790937 . T G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.491;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:387,0,1106 -chr13 31906717 . A T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.811;DP=50;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:736,0,918 -chr13 31906720 . TACCTGAAAGAGGAAAAACTTTAATTATACACGGATGTGTATTTATTAATTAATATTTAGGTTAATTCCATGTGTGACGTGAACTA T 1824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.348;DP=56;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=32.58;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,44:56:99:1862,0,2998 -chr13 31907083 . CT C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.591;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:393,0,113 -chr13 31907186 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.797;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:442,0,457 -chr13 31915426 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.462;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:422,0,465 -chr13 32331415 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr13 32678148 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.996;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:274,0,821 -chr13 32678219 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=2.605;DP=40;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:230,0,1090 -chr13 32853843 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.317;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:360,0,707 -chr13 32866566 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.501;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:362,0,551 -chr13 32903641 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=2.560;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=9.04;ReadPosRankSum=3.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,26:78:99:742,0,1901 -chr13 33017627 . T G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.421;DP=18;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:427,0,189 -chr13 33028089 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.579;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:365,0,435 -chr13 33028112 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=-0.067;DP=22;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:286,0,449 -chr13 33028503 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:362,0,335 -chr13 33053857 . G T 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.944;DP=139;FS=3.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=12.57;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,53:137:99:1776,0,2937 -chr13 33233156 . G C 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.211;DP=44;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:562,0,684 -chr13 33243656 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.747;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=20.03;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:529,0,309 -chr13 33256932 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.739;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:355,0,353 -chr13 33271698 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.879;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=6.61;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:392,0,1396 -chr13 33285969 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.912;DP=48;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:382,0,1224 -chr13 33300696 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-2.003;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:318,0,448 -chr13 33302487 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.273;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:350,0,1226 -chr13 33305617 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.896;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:493,0,523 -chr13 33317326 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-0.769;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.744;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,505 -chr13 33320006 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:278,0,209 -chr13 33381952 . CATTG C 507.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:58:545,58,0 -chr13 33381961 . AGAGGGAGTAAGACAGATGAAATATATTAAAAGAGCAGCAAGTCAAATGTTTTACCTAAAGCAATATTGTCAGCATTCATGAACTCAC A 507.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.869;DP=12;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:58:545,58,0 -chr13 33398063 . AG A 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=-0.889;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:391,0,388 -chr13 33398334 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=2.285;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:280,0,256 -chr13 33420043 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=-1.715;DP=51;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=7.56;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:414,0,1558 -chr13 33423672 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=3.837;DP=48;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:506,0,1069 -chr13 33423705 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.163;DP=45;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=6.17;ReadPosRankSum=-3.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:306,0,1213 -chr13 33423717 . G C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.337;DP=52;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:254,0,1464 -chr13 33434999 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-2.294;DP=74;FS=2.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:513,0,2079 -chr13 33441683 . ACTGCAGAAAACCCACAAAACCCATGAGCCTTCGATTACTTGGGGTGGAAAATAGGTTACATAGAGTAAAGATAAAGAGAACGACAC A 3602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.167;DP=79;FS=2.299;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=22.47;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,76:79:99:3640,337,0 -chr13 33448534 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.154;DP=83;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:1092,0,1670 -chr13 33471953 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=2.558;DP=89;FS=8.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:667,0,3348 -chr13 33475721 . GA G 3138.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.078;DP=338;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,136:314:99:3176,0,4949 -chr13 33479669 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-0.742;DP=48;FS=7.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:569,0,1005 -chr13 33482300 . CGTAAGTCTGTCGATCTCAGCCTTTTCAGCTCATGTCATGCATTGTTGGATGTTTGATGATCTTGTTTCGTGTTGTCTCCATCTGTAG C 2867.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.215;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,63:66:99:2905,222,0 -chr13 33488426 . G GT 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=-2.278;DP=196;FS=4.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=3.06;ReadPosRankSum=2.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,49:176:99:637,0,3431 -chr13 33492359 . A T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=2.022;DP=70;FS=6.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:430,0,2056 -chr13 33494895 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=1.198;DP=106;FS=4.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:876,0,2836 -chr13 33504378 . G T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:713,0,233 -chr13 33504379 . T TTTTCTTC 675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:713,0,233 -chr13 33504740 . G T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=-0.168;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:982,0,1049 -chr13 33536668 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.290;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.29;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:265,0,486 -chr13 33671124 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.496;DP=31;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:491,0,608 -chr13 33836669 . TCCTGAAAACAAAAGCACATCAATTCATAAGCACACAGCTGTACCACCTACAAACTTTTATTGTTATGAAAGCTTGTTCA T 9079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=1.716;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=31.20;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:211:99:9117,686,0 -chr13 33857819 . G A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=1.090;DP=126;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,47:126:99:1629,0,2669 -chr13 33860509 . A G 3072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.434;DP=227;FS=9.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,92:226:99:3101,0,4405 -chr13 33861488 . C T 1679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.572;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,48:124:99:1708,0,2616 -chr13 33870124 . A T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.209;DP=180;FS=4.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,61:180:99:1648,0,5536 -chr13 33870367 . C T 1835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=1.065;DP=145;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,53:145:99:1864,0,3663 -chr13 33870699 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.581;DP=174;FS=17.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,41:169:99:512,0,6231 -chr13 33880524 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.741;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,346 -chr13 33906697 . AAT A 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.892;DP=113;FS=4.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,48:86:99:968,0,1173 -chr13 33906797 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.151;DP=204;FS=19.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,37:204:99:590,0,6930 -chr13 33907248 . GACCTAAAAGTAAATAAAGATATATTTTATGAAAAACAGAGGAATGTACAGGGATAACCTCCTAAATGTAAATAAGATTTGTGTTATGT G 1623.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=2.389;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=4.54;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,321:323:99:1661,649,0 -chr13 34041007 . A AT 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-3.407;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=3.27;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:328,0,1694 -chr13 34045526 . C T 1979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=1.890;DP=164;FS=7.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=12.07;ReadPosRankSum=2.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,60:164:99:2008,0,3488 -chr13 35609982 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=3.165;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=25.98;ReadPosRankSum=-3.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:392,0,482 -chr13 35609992 . G C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=3.200;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:392,0,482 -chr13 35610846 . A G 282.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:311,0,19 -chr13 35695330 . C T 268.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:297,0,18 -chr13 35743940 . GCCTGCAAAATACAGTCCTTTGAGACATCAGAAATACAAGTGAAAGTGTTTTTCTGGTTTCATTCCACTTA G 7223.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=1.711;DP=168;FS=3.277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=36.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,167:168:99:7261,547,0 -chr13 35841700 . G C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr13 36190574 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:267,0,391 -chr13 36447181 . TCTATGTGTGTGAAAAAGACAATAATGATGTATGAGAGGGGTTTTGCAGAATTGACGGAATTGTATCTTACTGATACAGATGAATAAACAGATCAC T 7927.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=1.214;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=34.47;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,218:221:99:7965,737,0 -chr13 36559365 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:370,0,49 -chr13 36559378 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:231,0,97 -chr13 36591255 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr13 36723483 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.490;DP=226;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,30:185:99:273,0,6198 -chr13 36995165 . AG A 3587.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=-3.284;DP=322;FS=3.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,143:317:99:3625,0,20426 -chr13 36995167 . C A 4089.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=-2.815;DP=325;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,148:324:99:4127,0,20410 -chr13 37819324 . G GA 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.823;DP=159;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:431,0,1666 -chr13 37937101 . G C 1513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.170;DP=47;FS=5.552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,25:29:37:1542,37,0 -chr13 37937418 . A C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=19;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:99:461,0,333 -chr13 37937439 . AT A 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.143;DP=19;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=22.67;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:468,0,333 -chr13 37937602 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=14;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:233,0,622 -chr13 37937605 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=10;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:233,0,622 -chr13 38031334 . T G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr13 38031440 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.212;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,169 -chr13 38031762 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=-1.018;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:506,0,592 -chr13 39018905 . G T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.110;DP=43;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:690,0,829 -chr13 39114893 . C T 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-2.861;DP=53;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1015,0,710 -chr13 39247296 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:346,27,0 -chr13 39787757 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.550;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:323,0,745 -chr13 40757780 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.000;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.123;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:400,0,448 -chr13 40793016 . G GA 578.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-1.156;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15:616,15,0 -chr13 40793020 . A C 587.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:616,15,0 -chr13 41053934 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr13 41053939 . A C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:249,18,0 -chr13 41057645 . A C 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-0.364;DP=57;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:1581,0,433 -chr13 41058144 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.307;DP=22;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:441,0,234 -chr13 41058151 . A AT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.896;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:93:290,0,93 -chr13 41562790 . GCAGGTAAATCAGCTGTGCTGTAGAAACACATTTCTGTCTGTCAGCAGCGATTGCCAATGCAGATTTGTGCTTTATTTCTTCTTCTTCC G 929.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=1.609;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=33.20;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:99:967,0,1055 -chr13 42564296 . A C 1804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-1.631;DP=119;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=15.17;ReadPosRankSum=-1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,34:118:99:1833,0,3588 -chr13 42598103 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.101;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,943 -chr13 42671341 . TA T 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.104;DP=27;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:285,0,377 -chr13 42796366 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-1.089;DP=61;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:301,0,1829 -chr13 42973065 . G C 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.625;DP=271;FS=0.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.26;ReadPosRankSum=3.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,46:270:99:641,0,8919 -chr13 43002664 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=-1.855;DP=166;FS=5.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,26:166:99:263,0,8182 -chr13 43060500 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.099;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=25.84;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:75:390,0,75 -chr13 43125143 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:373,0,240 -chr13 43125220 . T A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:345,0,164 -chr13 43125453 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-1.585;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:611,0,152 -chr13 43125551 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.776;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:376,0,151 -chr13 43125927 . C A 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.780;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-2.403;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:93:791,0,93 -chr13 43127449 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=10;FS=11.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,143 -chr13 43169896 . C G 2336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.514;DP=84;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,62:84:99:2365,0,529 -chr13 43200565 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=21.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:243,0,99 -chr13 43200696 . G GT 350.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=25.00;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:11:387,11,0 -chr13 43202429 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.306;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:373,0,134 -chr13 43202882 . T A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;ClippingRankSum=4.500;DP=44;FS=9.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=12.95;ReadPosRankSum=-2.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:598,0,2026 -chr13 43202891 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=3.777;DP=38;FS=5.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=14.99;ReadPosRankSum=-2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:598,0,2074 -chr13 43203388 . A C 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.345;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=33.04;ReadPosRankSum=-1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:1492,0,356 -chr13 43203513 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=7.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,391 -chr13 43203793 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.282;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:840,0,627 -chr13 43216441 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.217;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:83:455,0,83 -chr13 43263816 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=-0.041;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:370,0,1999 -chr13 43297425 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.409;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:478,0,304 -chr13 43334495 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.354;DP=65;FS=5.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:755,0,1468 -chr13 43334736 . T C 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.156;DP=119;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.570;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,45:119:99:1579,0,4576 -chr13 43339425 . A G 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-0.557;DP=144;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=14.03;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:2048,0,2764 -chr13 43380246 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=1.815;DP=109;FS=16.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=1.96;ReadPosRankSum=-5.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:242,0,4401 -chr13 43381464 . A AT 752.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.716;DP=147;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=5.12;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,42:140:99:790,0,9733 -chr13 43386920 . CTAAATAA C 1757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-2.095;DP=244;FS=3.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,70:244:99:1795,0,8248 -chr13 43386929 . GGACGATAAGGATGTCAGCCCTAAACAACCGATGAGAACAGATTTACAGCTAGTTTTTTTAAACGTTTGACAAACTCACCAA G 1758.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-2.294;DP=250;FS=3.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,70:248:99:1796,0,8248 -chr13 43386981 . GTTTTTTTAAACGTTTGACAAACTCACCAA G 2263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.328;DP=249;FS=0.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,82:247:99:2301,0,11739 -chr13 43892996 . G T 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.026;DP=353;FS=4.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=9.16;ReadPosRankSum=2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,118:353:99:3261,0,15384 -chr13 43895139 . A G 4177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-1.611;DP=353;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,125:353:99:4206,0,7583 -chr13 43922121 . T C 4939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-1.654;DP=410;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,148:410:99:4968,0,9085 -chr13 43947904 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.255;DP=84;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=8.12;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:710,0,2015 -chr13 44236016 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.208;DP=34;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:252,0,943 -chr13 44236039 . G T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.052;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:601,0,557 -chr13 44236160 . C G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.928;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:367,0,364 -chr13 44236838 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-1.876;DP=17;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:255,0,338 -chr13 44237250 . T A 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:487,33,0 -chr13 44237255 . A AT 449.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:33:487,33,0 -chr13 44237452 . G A 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:48:666,48,0 -chr13 44238262 . G A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:261,18,0 -chr13 44238296 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:41:380,0,41 -chr13 44238403 . C A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.185;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:67:590,0,67 -chr13 44238641 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=2.051;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=13.94;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:307,0,384 -chr13 45321845 . G GA 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:309,0,131 -chr13 45322880 . AG A 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=-0.444;DP=300;FS=13.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,46:268:99:304,0,6619 -chr13 45335431 . C T 7229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=1.047;DP=325;FS=3.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,216:325:99:7258,0,3461 -chr13 45357925 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.119;DP=286;FS=7.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,45:284:99:310,0,8925 -chr13 45383105 . T TA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,197 -chr13 45387377 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.334;DP=36;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:681,0,561 -chr13 45391670 . A G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.070;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:607,0,440 -chr13 45401968 . T A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=1.729;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=31.65;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1136,0,116 -chr13 45408038 . TA T 2700.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.186;DP=106;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,81:106:99:2738,0,612 -chr13 45408179 . C T 6439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=-0.108;DP=205;FS=8.957;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=31.41;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,181:205:71:6468,71,0 -chr13 45428179 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=4.903;DP=170;FS=13.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,59:125:99:2019,0,2250 -chr13 45434251 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=18.60;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:363,0,686 -chr13 45461664 . C CT 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.070;DP=20;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=25.09;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:21:539,0,21 -chr13 45461732 . C T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr13 45463141 . G T 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 -chr13 45463253 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,378 -chr13 45507976 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:242,0,288 -chr13 45510830 . TA T 227.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr13 45512592 . C A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr13 45625218 . G A 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:443,30,0 -chr13 45625770 . T TC 255.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:293,24,0 -chr13 45630464 . T C 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=3.928;DP=40;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.161;QD=17.34;ReadPosRankSum=-2.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:722,0,986 -chr13 45632432 . A T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=1.336;DP=439;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:378,60:438:99:357,0,14998 -chr13 45633024 . T C 2236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=-3.477;DP=122;FS=13.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=18.33;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,61:122:99:2265,0,2215 -chr13 45633956 . AAT A 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.067;DP=34;FS=10.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.242;QD=14.67;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:536,0,537 -chr13 45635442 . TA T 6803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:6841,588,0 -chr13 45635475 . C CA 541.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.461;ClippingRankSum=4.731;DP=170;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=3.19;ReadPosRankSum=-4.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,43:158:99:579,0,7854 -chr13 45635478 . G A 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=2.686;DP=179;FS=8.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.444;QD=8.75;ReadPosRankSum=-3.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,58:179:99:1594,0,4546 -chr13 45636022 . TCTGTGGAAACAAACAGCAAACATGAAGCTTTTCCCCAAAACAAAAATATATGATAGCACTTGACACACAATGACCCCGCCGAGTTAAACTTTGAATGCATCAATTGATGGAAACGGATGATTAAAATGGAAGCGACGGGATGAAATAAAA T 1581.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=442;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,394:395:17:1619,17,0 -chr13 45637582 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:80:313,0,80 -chr13 45638565 . G A 5711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-1.263;DP=297;FS=17.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,175:296:99:5740,0,4153 -chr13 45652319 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.323;DP=121;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:453,0,4306 -chr13 45652448 . T C 2075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.979;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:46:99:2104,121,0 -chr13 45653645 . G GA 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.968;DP=115;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:264,0,2276 -chr13 45654320 . CA C 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.438;DP=73;FS=15.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:979,0,396 -chr13 45683143 . T C 2745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2774,205,0 -chr13 45683208 . T C 1057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1086,78,0 -chr13 45715939 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:232,0,142 -chr13 45730064 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:242,0,340 -chr13 46056749 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.446;DP=304;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,38:288:99:230,0,20165 -chr13 46088849 . C T 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-3.055;DP=232;FS=4.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,44:232:99:764,0,7648 -chr13 46092841 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.127;DP=359;FS=1.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,54:357:99:510,0,11455 -chr13 46093112 . G A 5816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-1.383;DP=289;FS=8.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,47:286:99:5845,0,7692 -chr13 46096548 . A C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.329;DP=268;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=0.92;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,39:267:99:274,0,8819 -chr13 46101980 . A G 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.747;DP=308;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,76:307:99:1556,0,9816 -chr13 46127388 . C G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr13 46144688 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.270;ClippingRankSum=0.352;DP=66;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:408,0,1728 -chr13 46190890 . G A 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=-0.129;DP=88;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1456,0,1520 -chr13 46288016 . C G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=1.443;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=11.19;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:487,0,928 -chr13 46288035 . A C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.748;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:406,0,760 -chr13 46410681 . T C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.727;ClippingRankSum=0.728;DP=50;FS=16.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:583,0,799 -chr13 46410684 . G T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.303;DP=50;FS=13.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=10.14;ReadPosRankSum=2.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:535,0,1720 -chr13 46507815 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.671;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:339,0,366 -chr13 46534780 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.481;DP=155;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,28:155:99:433,0,4905 -chr13 46535032 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.532;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,41:178:99:834,0,5258 -chr13 46747290 . C T 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=5.171;DP=155;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=6.33;ReadPosRankSum=-3.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,42:155:99:1010,0,7030 -chr13 46747321 . C CT 1616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=-2.003;DP=104;FS=7.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=15.55;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,70:85:99:1699,0,105 -chr13 46747508 . CT C 20571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-1.893;DP=370;FS=3.292;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=29.95;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:91,276:367:99:20609,398,0 -chr13 46748029 . G GTT 1639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.988;ClippingRankSum=-0.030;DP=283;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=2.238;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,80:224:99:2410,0,5049 -chr13 46909970 . GA G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=-0.431;DP=51;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=4.05;ReadPosRankSum=-3.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:244,0,3062 -chr13 46911605 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.914;DP=171;FS=3.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=1.93;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,28:171:99:358,0,5544 -chr13 46956861 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr13 46956884 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr13 47220011 . A T 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-0.828;DP=114;FS=3.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=18.37;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,18:114:99:2122,0,5745 -chr13 47220056 . G A 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.689;DP=80;FS=2.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.236;QD=26.17;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:2122,0,5663 -chr13 47220142 . AT A 1236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=1.471;DP=115;FS=1.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=10.75;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,49:109:99:1274,0,1560 -chr13 47220478 . AT A 1231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.218;DP=66;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1308,0,2035 -chr13 47221883 . C CA 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=-0.014;DP=50;FS=9.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:767,0,366 -chr13 47222049 . GA G 7382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-1.878;DP=125;FS=8.606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=30.70;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,104:117:99:7420,455,0 -chr13 47222258 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.703;DP=35;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:235,0,995 -chr13 47222280 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.856;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.402;QD=18.52;ReadPosRankSum=-2.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:658,0,504 -chr13 47336000 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=1.401;DP=85;FS=3.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:252,0,2522 -chr13 47406777 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr13 47412904 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=-2.931;DP=89;FS=6.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:283,0,5714 -chr13 47413155 . G GA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.785;DP=71;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:415,0,901 -chr13 47555718 . T G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.239;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=9.74;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:564,0,1258 -chr13 47728732 . G A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:247,0,25 -chr13 47813301 . G C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=23.06;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:305,0,133 -chr13 47817112 . T C 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr13 47819156 . T C 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 -chr13 47819941 . GT G 345.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:383,36,0 -chr13 47881803 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:303,0,299 -chr13 47882317 . A T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr13 47882482 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=22.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr13 47882832 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr13 47883572 . CT C 446.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=27.93;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:15:484,15,0 -chr13 47885496 . T G 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.853;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:727,0,270 -chr13 47885677 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=29.07;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:348,0,58 -chr13 47886097 . A T 728.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=1.018;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=34.70;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:26:757,26,0 -chr13 48153882 . A T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=-1.181;DP=20;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:70:580,0,70 -chr13 48190591 . C A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=28.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:313,0,321 -chr13 48190761 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:386,0,91 -chr13 48193781 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-2.188;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=20.46;ReadPosRankSum=2.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:417,0,395 -chr13 48195799 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=31.66;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:55:788,0,55 -chr13 48501800 . G C 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr13 48711630 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,297 -chr13 48711632 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,297 -chr13 48820449 . G GA 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:72:331,0,72 -chr13 49357161 . AATGGACATCTTGTAATCTGTCGAGACTTTACCTGCAGTTGATTTGATTTTCAACTTTCGCTGCTTCTCTTTTCATCCAGTC A 2297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=1.418;DP=104;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=22.09;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,67:99:99:2335,0,2626 -chr13 49359151 . C T 2897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=-1.741;DP=134;FS=8.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,84:134:99:2926,0,1666 -chr13 49375555 . AAGGTGAACTGCAAACATCTTCATTCGCTATTTCCCCCCCTCCTTCTCCAAATAAAAGTGAACTCCAATCCAACTCATTCCCTTAATATCTTCCCTCC A 5615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=2.413;DP=148;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=26.54;ReadPosRankSum=-2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,132:134:99:5653,428,0 -chr13 49375760 . ACAGGTAACGCTCCTTTTCCCAGCATGCATCTGTGATCTGGTGTGATCCTCAGCGTGGATGCTCAGCACTTTTCTTCTTCTTCTGTG A 3100.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=3.273;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,116:132:99:3138,0,4337 -chr13 49382318 . C A 209.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:238,0,23 -chr13 49394663 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.224;DP=175;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,41:175:99:840,0,4822 -chr13 49502758 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.692;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:399,0,738 -chr13 49718178 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=1.446;DP=23;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=15.21;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:378,0,378 -chr13 50031679 . TA T 233.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:271,27,0 -chr13 50132669 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-0.945;DP=39;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.144;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:249,0,1026 -chr13 50420784 . C CA 1270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-1.957;DP=113;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,63:96:99:1339,0,543 -chr13 50421019 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.841;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,30:194:99:320,0,5996 -chr13 50590469 . G C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.505;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:91:467,0,91 -chr13 50917098 . C T 569.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.085;DP=16;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=36.01;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:16:598,16,0 -chr13 50924159 . T C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.602;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=31.99;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:636,0,226 -chr13 50924162 . T C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.709;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:636,0,242 -chr13 50924489 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=1.280;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:371,0,234 -chr13 51214042 . T G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.816;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:553,0,863 -chr13 51230850 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr13 51328258 . G C 1640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.034;DP=88;FS=23.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=18.65;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,51:88:99:1669,0,1268 -chr13 51329735 . C T 3071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=1.549;DP=144;FS=6.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=21.33;ReadPosRankSum=2.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,90:143:99:3100,0,1818 -chr13 51340359 . G A 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.512;DP=83;FS=1.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,48:83:99:1552,0,1202 -chr13 51342225 . G A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=1.313;DP=58;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=21.70;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1287,0,660 -chr13 51342390 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.793;DP=45;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:789,0,569 -chr13 51385984 . G A 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.059;DP=70;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1295,0,1083 -chr13 51386020 . A G 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.533;DP=70;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,42:70:99:1434,0,973 -chr13 51399849 . C T 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.383;DP=45;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1293,0,234 -chr13 51408233 . C T 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.926;DP=65;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=21.49;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,42:65:99:1425,0,745 -chr13 51422474 . T A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-0.996;DP=29;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:845,0,121 -chr13 51426774 . A ATG 231.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr13 52034270 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=-2.514;DP=40;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:253,0,1866 -chr13 52039618 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.548;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:237,0,958 -chr13 52090883 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=1.030;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:268,0,372 -chr13 52091577 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-1.826;DP=41;FS=8.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:591,0,765 -chr13 52204996 . A G 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.046;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=33.74;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:99:1513,0,443 -chr13 52205049 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.523;DP=81;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:556,0,2700 -chr13 52205169 . T A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.755;DP=96;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.643;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1406,0,2498 -chr13 52205178 . T C 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=-0.405;DP=94;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1401,0,2343 -chr13 52205735 . G C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.959;DP=22;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:407,0,321 -chr13 52205857 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.022;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:297,0,762 -chr13 52258221 . CA C 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=3.200;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=33.11;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:567,0,288 -chr13 52262523 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:397,0,410 -chr13 52330622 . A G 1279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-1.370;DP=54;FS=5.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1308,0,1014 -chr13 52333356 . C T 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:229,0,24 -chr13 52340271 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-2.358;DP=248;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.595;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,38:247:99:408,0,9254 -chr13 52343202 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.298;DP=159;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=1.74;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,26:158:99:305,0,5182 -chr13 52346410 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.606;DP=209;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,40:209:99:661,0,6231 -chr13 52988501 . C A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-1.087;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1249,0,1232 -chr13 52990970 . T G 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.292;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=33.29;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:99:1160,0,221 -chr13 52991769 . C CT 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-2.424;DP=58;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=8.12;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:508,0,810 -chr13 52991781 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-1.543;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:830,0,967 -chr13 52994727 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=30.09;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:600,0,117 -chr13 52997288 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.000;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:266,0,1221 -chr13 52998129 . T G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:51:425,0,51 -chr13 52998623 . C G 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-0.404;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1154,0,628 -chr13 52998695 . A G 563.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:592,42,0 -chr13 52998918 . C A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.945;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:426,0,596 -chr13 52999772 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,168 -chr13 53000419 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.887;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=12.09;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,757 -chr13 53000605 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=2.069;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=30.38;ReadPosRankSum=-1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:575,0,1084 -chr13 53168111 . T C 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.781;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:460,0,1652 -chr13 53784662 . A T 1128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:78:1157,78,0 -chr13 53843906 . A T 2846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-3.762;DP=157;FS=15.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,90:152:99:2875,0,2106 -chr13 53851324 . G T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=-1.645;DP=24;FS=14.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=15.87;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:409,0,1422 -chr13 53885908 . A G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.711;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=21.26;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:836,0,474 -chr13 53888412 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:282,0,1274 -chr13 53913202 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=-2.871;DP=23;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=14.64;ReadPosRankSum=2.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:365,0,836 -chr13 53913206 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-3.307;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:365,0,842 -chr13 53915253 . CATAT C 308.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:28:346,28,0 -chr13 53936173 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.057;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:284,0,1114 -chr13 53942846 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:237,0,382 -chr14 7310 . C T 7972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.693;DP=275;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.330;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,213:273:99:8001,0,1108 -chr14 7325 . C T 8024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.903;DP=284;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=28.26;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,221:283:99:8053,0,1045 -chr14 47917 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=-0.313;DP=50;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1324,0,362 -chr14 97387 . AG A 609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.14;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:647,49,0 -chr14 97519 . C T 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:747,54,0 -chr14 97542 . G C 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr14 136010 . A AC 380.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.594;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:26:418,0,26 -chr14 144119 . GTA G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.43;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:70:328,0,70 -chr14 191951 . C T 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.349;DP=79;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1374,0,1268 -chr14 192142 . G A 2508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.168;DP=124;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,78:124:99:2537,0,1527 -chr14 192169 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=2.473;DP=117;FS=2.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,20:117:99:234,0,3441 -chr14 194501 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=2.306;DP=53;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:907,0,789 -chr14 197410 . A T 228.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:13:257,0,13 -chr14 197886 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:316,0,89 -chr14 199503 . TACC T 945.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=3.443;DP=83;FS=7.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:983,0,1111 -chr14 199519 . ATCATCTTCATCACCACCT A 1391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=4.300;DP=110;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,43:73:99:1429,0,4077 -chr14 211130 . TACCTGCACACAAACACACACCTGTGAGCGAGCGACACCTCCACACACACAGACAGATGTGCAGCACCGGCCAGCACTC T 14654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-2.820;DP=395;FS=4.109;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.311;QD=28.15;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,359:364:99:14692,1083,0 -chr14 213685 . GCCTGCAGAGAGAGAGGGTGAAGAGTGAGTGTGTGTGAGGATGTGTGTGTGTTGTGCATTGGGTTATAAGTGTGTATCAACAGTAAAGTGATGAA G 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-0.284;DP=29;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=23.47;ReadPosRankSum=-2.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:718,0,333 -chr14 223715 . ACACCTACAGCACAGAGCAGACAGTGTGTGTGTGTGTGTGATCAGCAGCAGTGTTCATCATCTCAGGTACG A 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=1.087;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=28.74;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:612,0,999 -chr14 226737 . TGGTGAGCAGCTTTACCAACACTGACGTCTCTGAAGAGTGTGTAGAAATGAAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA T 4472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.054;DP=192;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,123:134:99:4510,0,428 -chr14 244701 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:78:427,0,78 -chr14 274518 . C CA 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=599;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.09;MQ0=0;QD=0.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:389,21,0 -chr14 274521 . T C 360.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:389,21,0 -chr14 279898 . G T 4999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.930;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=30.86;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,131:160:99:5028,0,402 -chr14 296754 . A G 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.662;ClippingRankSum=5.547;DP=287;FS=75.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=4.74;ReadPosRankSum=6.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,38:196:99:1389,0,4145 -chr14 462357 . A G 351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:380,30,0 -chr14 462394 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr14 526320 . C G 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr14 565928 . AG A 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=22.88;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:36:289,0,36 -chr14 569700 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=23.85;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:386,0,108 -chr14 569977 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.021;DP=36;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:423,0,871 -chr14 600001 . T C 1022.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:72:1051,72,0 -chr14 659036 . AAGGTGAGCGGGTCTGCAGATCAGCCACTTCATTCGCTGCCTCATCATGGCTCGTCATCTCTGTGTGTGCTGGTGTGTTTC A 5528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=2.630;DP=132;FS=4.949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=29.05;ReadPosRankSum=-2.960 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,123:127:99:5566,405,0 -chr14 757368 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=1.813;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,464 -chr14 757370 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.718;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,464 -chr14 757676 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:278,0,148 -chr14 937507 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=2.752;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.482;QD=14.36;ReadPosRankSum=-2.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:258,0,711 -chr14 937901 . CTG C 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=1.054;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=12.73;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:432,0,1422 -chr14 938417 . C G 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr14 938980 . T TA 752.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.075;DP=25;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=30.11;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:64:790,64,0 -chr14 1000301 . GT G 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.223;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=24.12;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1026,0,128 -chr14 1033204 . T C 358.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=32.60;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:386,0,7 -chr14 1059916 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,406 -chr14 1132639 . ACAAGTGAGATGTTGAGCAGACTCTGATT A 1778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.014;DP=100;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.875;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1816,0,3708 -chr14 1132642 . AGTGAGATGTTGAGCAGACTCTGATTAAATGAGAGTGAATAGATGAGTTTGTCATCTGCATGAGCAAATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCATATCAG A 1598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.869;DP=101;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1636,0,3097 -chr14 1132670 . ATGAGAGTGAATAGATGAGTTTGTCATCTGCATGAGCAAATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCCATATCAG A 1778.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.172;DP=100;FS=1.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=17.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,51:100:99:1816,0,3708 -chr14 1147769 . TCA T 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=3.148;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=8.27;ReadPosRankSum=-2.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:277,0,2590 -chr14 1147772 . TCATCATCATC T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=3.099;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=7.58;ReadPosRankSum=-2.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:257,0,2599 -chr14 1203629 . C T 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.820;DP=74;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:911,0,1648 -chr14 1210114 . C T 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.170;DP=37;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.933;QD=20.05;ReadPosRankSum=2.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:770,0,492 -chr14 1213316 . ACAGAAAAAAATCGCC A 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=1.273;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=19.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:99:568,0,1068 -chr14 1297260 . C G 5427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.731;DP=150;FS=1.720;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=31.93;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,126:133:99:5456,346,0 -chr14 1297512 . C T 5671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.734;DP=205;FS=3.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.131;QD=27.67;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,136:155:99:5700,0,473 -chr14 1297513 . A G 5671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.958;DP=204;FS=3.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,136:155:99:5700,0,489 -chr14 1297812 . T G 1923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=-4.702;DP=168;FS=26.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,39:107:99:1952,0,1522 -chr14 1297839 . G C 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.797;DP=155;FS=40.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=11.10;ReadPosRankSum=2.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,58:93:99:1748,0,1716 -chr14 1297908 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-3.364;DP=236;FS=19.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:390,0,4867 -chr14 1338951 . T C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr14 1783550 . CA C,CAA 727.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.455;DP=129;FS=3.203;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:27,32,56:115:99:1283,677,1729,162,0,978 -chr14 1785997 . G A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=-0.127;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=26.81;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:779,0,527 -chr14 1786000 . T A 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=1.065;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=32.64;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:779,0,540 -chr14 1786845 . G GT 1559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=-1.866;DP=99;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:1849,0,156 -chr14 2057001 . G C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.387;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:347,0,297 -chr14 2065292 . A AC 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.268;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=25.36;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:82:367,0,82 -chr14 2065934 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:386,0,180 -chr14 2066616 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=2.339;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,240 -chr14 2183686 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr14 2229308 . T A 260.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:26:289,26,0 -chr14 2249100 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr14 2249210 . C T 1400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1429,99,0 -chr14 2249217 . G T 1400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:99:1429,99,0 -chr14 2318983 . G T 273.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:301,0,9 -chr14 2347642 . C A 471.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:500,36,0 -chr14 2348530 . A G 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr14 2348626 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-1.655;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:371,0,359 -chr14 2348788 . G C 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.448;DP=32;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=11.71;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:403,0,786 -chr14 2348971 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.463;DP=55;FS=2.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:397,0,1632 -chr14 2349382 . A C 965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-1.348;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=33.30;ReadPosRankSum=1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:39:1032,39,0 -chr14 2597761 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,372 -chr14 2741810 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.577;DP=32;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,603 -chr14 2805812 . C CA 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=3.070;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=4.53;ReadPosRankSum=-2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:300,0,832 -chr14 2809283 . C CA 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.352;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,52:71:99:1113,0,290 -chr14 2955336 . T C 954.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.231;DP=27;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:0:980,0,0 -chr14 2955399 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:278,0,412 -chr14 2989788 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=-0.963;DP=36;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:477,0,800 -chr14 2989818 . C T 2371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2400,172,0 -chr14 2989833 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-2.845;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:247,0,1867 -chr14 3111141 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.437;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.84;ReadPosRankSum=2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:292,0,173 -chr14 3184628 . A AT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.520;DP=27;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:247,0,318 -chr14 3184826 . GT G 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=1.047;DP=25;FS=9.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=22.39;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:597,0,215 -chr14 3185019 . CA C 665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.899;DP=45;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.741;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:703,0,656 -chr14 3185042 . T C 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=-2.353;DP=48;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:856,0,1023 -chr14 3185308 . A G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.738;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:626,0,1293 -chr14 3683244 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.477;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:499,0,314 -chr14 4312730 . GCTGAGGGAGGAAAAATGCAGGCGTTTCTGACTGATTGTTTACATAAATAAAACCTGATGACTATAAAATAACGCAC G 868.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=1.809;DP=29;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=29.96;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:906,0,2662 -chr14 4346605 . C A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.039;DP=24;FS=5.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=32.62;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:811,0,177 -chr14 4346613 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.582;DP=21;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:811,0,192 -chr14 4377588 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:563,0,402 -chr14 4380306 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-2.654;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:297,0,349 -chr14 4382542 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=5.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:333,0,198 -chr14 4382631 . TCTACACACACATACAAGTACATGAAAGTAGCCGTCAGTGGCACATTTAAGTGATTATTCACCATGTGTTAC T 1091.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-0.134;DP=28;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:99:1129,0,471 -chr14 4472370 . G T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=-1.738;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:713,0,330 -chr14 4501714 . T C 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.592;DP=42;FS=3.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:99:688,0,1138 -chr14 4502222 . T C 2354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-2.450;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:87:2383,0,87 -chr14 4591122 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:286,0,264 -chr14 4593932 . C T 338.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:366,0,5 -chr14 4596846 . C A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.805;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=24.02;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:797,0,288 -chr14 4596851 . T A 1394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:1423,99,0 -chr14 4597147 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.923;DP=38;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:400,0,844 -chr14 4597410 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=1.054;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=7.26;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:333,0,994 -chr14 4597881 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=1.126;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=15.81;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:629,0,722 -chr14 4598318 . C G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.130;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:845,0,586 -chr14 4598361 . C T 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.503;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:943,0,343 -chr14 4599030 . A C 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.152;DP=35;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:714,0,520 -chr14 4599282 . T C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-1.282;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=20.30;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:759,0,477 -chr14 4599372 . ATT A 320.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=26.68;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4:356,0,4 -chr14 4599673 . A T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=1.174;DP=32;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=25.74;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:852,0,252 -chr14 4599831 . A G 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-1.045;DP=32;FS=8.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=20.77;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:693,0,1058 -chr14 4599838 . CA C 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.453;DP=32;FS=7.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:693,0,1058 -chr14 4600059 . C T 545.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.651;DP=16;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=34.12;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:572,2,0 -chr14 4600139 . T C 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:638,45,0 -chr14 4600215 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=1.359;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:438,0,174 -chr14 4600298 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.161;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,526 -chr14 4600336 . T A 1201.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1230,90,0 -chr14 4600394 . C A 1191.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.026;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.530;QD=34.05;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,31:35:18:1220,18,0 -chr14 4600493 . T C 1389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1418,102,0 -chr14 4600542 . T C 1327.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1356,99,0 -chr14 4600633 . T G 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:487,36,0 -chr14 4600725 . T C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.424;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.880;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:438,0,121 -chr14 4600932 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-1.682;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,270 -chr14 4601054 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-2.245;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,371 -chr14 4601125 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:301,0,260 -chr14 4601342 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-1.575;DP=23;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:52:487,0,52 -chr14 4601719 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=1.101;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.317;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,460 -chr14 4601791 . T C 1050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:75:1079,75,0 -chr14 4602019 . A G 965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:994,69,0 -chr14 4602170 . A G 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.773;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=34.10;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:30:642,0,30 -chr14 4602320 . T C 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.604;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:412,0,510 -chr14 4611523 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=-0.671;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:35:507,0,35 -chr14 4821610 . A C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.220;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:602,0,435 -chr14 5072567 . T TGG 367.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.39;MQ0=0;QD=13.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr14 5923925 . G GC 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:256,0,54 -chr14 6574366 . A G 589.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=1.194;DP=27;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=21.84;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:21:618,0,21 -chr14 6590507 . A G 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.414;DP=167;FS=2.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,37:167:99:760,0,5243 -chr14 6591680 . A G 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=-1.990;DP=138;FS=17.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,44:138:99:1286,0,3516 -chr14 6947942 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:238,0,57 -chr14 6982983 . T C 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.552;DP=14;FS=11.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=34.95;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:37:520,0,37 -chr14 7076734 . ATG A 319.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:357,25,0 -chr14 7498478 . T A 248.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:277,0,16 -chr14 7708514 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:386,0,213 -chr14 7708528 . T C 287.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:316,0,19 -chr14 7870823 . G GT 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-2.017;DP=198;FS=8.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,47:165:99:430,0,2736 -chr14 7886325 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=1.354;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.198;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:580,0,918 -chr14 7886524 . A G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:587,0,656 -chr14 7887734 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.189;DP=32;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:482,0,540 -chr14 7887735 . A G 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.256;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=32.15;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:28:1057,0,28 -chr14 7887863 . A G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.145;DP=35;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:709,0,511 -chr14 7936954 . TA T 451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.053;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=26.57;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:489,0,309 -chr14 7936962 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.001;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:489,0,309 -chr14 8407092 . G GT 205.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:243,24,0 -chr14 8408291 . T TAC 607.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=31.99;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:19:645,19,0 -chr14 8442378 . A C 1701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1730,117,0 -chr14 8586198 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=2.011;DP=17;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=22.40;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:409,0,299 -chr14 8586489 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,397 -chr14 8662648 . C T 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:619,48,0 -chr14 8788113 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=18.60;ReadPosRankSum=3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:270,0,225 -chr14 8789136 . T C 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-0.233;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=31.19;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:964,0,114 -chr14 8844525 . A G 1704.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1733,129,0 -chr14 9061410 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-1.739;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:280,0,182 -chr14 9061506 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.955;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=23.16;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:422,0,197 -chr14 9578408 . C CA 1388.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-0.403;DP=63;FS=1.639;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=22.04;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,51:57:30:1426,30,0 -chr14 9580114 . GA G 8821.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.367;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.13;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,88:91:99:8859,645,0 -chr14 9580223 . GA G 2974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.223;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.535;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,109:118:71:3012,71,0 -chr14 9595304 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 9596859 . AAGGTAAATAATATCACAAAACTAAAGAGCGAACAATAAAACTGTAACATTATAATACTATCATGAATTTGCAAAATGTGCTGCTAATCAATCACTTCTTCTGT A 16119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.533;DP=456;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.615;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,444:445:99:16157,1301,0 -chr14 9599156 . C G 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr14 9640025 . G A 1223.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1252,84,0 -chr14 9745286 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,140 -chr14 9745287 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,140 -chr14 9745761 . A C 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr14 9745961 . T A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=1.830;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=26.09;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:41:983,0,41 -chr14 9746746 . C CT 368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:406,42,0 -chr14 9782058 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=-0.715;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:293,0,272 -chr14 9821572 . A G 1246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1275,87,0 -chr14 9821575 . C T 1246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:87:1275,87,0 -chr14 9822511 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr14 9822518 . C T 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:387,27,0 -chr14 10538168 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:433,0,485 -chr14 10538224 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.833;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:242,0,462 -chr14 10538244 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.116;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.69;ReadPosRankSum=2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:262,0,460 -chr14 10538299 . T C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:39:541,39,0 -chr14 10538315 . T C 559.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:42:588,42,0 -chr14 10538338 . T C 1770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.651;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.26;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:99:1799,132,0 -chr14 10806171 . CT C 772.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:810,78,0 -chr14 10806404 . T C 1119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1148,81,0 -chr14 10808917 . C T 8720.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.127;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=36.33;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,203:209:99:8749,611,0 -chr14 10809025 . C A 7863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=1.792;DP=171;FS=2.476;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,166:169:99:7892,542,0 -chr14 10809041 . T C 5849.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.116;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=28.57;ReadPosRankSum=2.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,137:143:99:5878,412,0 -chr14 10815411 . A C 4252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.891;DP=103;FS=4.001;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=26.26;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:4281,301,0 -chr14 10881256 . C CA 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.872;DP=227;FS=1.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,47:201:99:443,0,4146 -chr14 11466787 . CA C 245.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.869;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8:282,8,0 -chr14 11597976 . A T 1621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1650,114,0 -chr14 11628450 . T A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr14 11629115 . G A 7193.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.395;DP=171;FS=4.337;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=34.47;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:7222,511,0 -chr14 11632217 . C A 1744.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1773,126,0 -chr14 11650107 . T A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr14 11650113 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:257,18,0 -chr14 11650137 . CACCTTAAAAACAAGAACGCATGATTTATACTGCACCTTGCTATTACAAAACCCAATATTAGCAAACTATAACACCACCT C 463.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:65:501,65,0 -chr14 11652274 . G A 1219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:87:1248,87,0 -chr14 11659043 . C CA 2640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-3.396;DP=391;FS=10.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,145:363:99:2917,0,5111 -chr14 12215790 . T G 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr14 12234857 . G A 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr14 12235121 . C A 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr14 12235210 . T TA 614.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.569;DP=21;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=29.27;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:652,60,0 -chr14 12236567 . GA G 723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.92;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:761,64,0 -chr14 12343480 . G A 5707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:5736,415,0 -chr14 12425892 . A T 830.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:63:859,63,0 -chr14 12431642 . C T 1923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1952,141,0 -chr14 12433033 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 -chr14 12433038 . T C 961.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:990,66,0 -chr14 12464019 . G C 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:782,57,0 -chr14 12509512 . G T 2330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2359,183,0 -chr14 12688913 . G T 5224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=1.527;DP=118;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=29.96;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:5253,355,0 -chr14 12794442 . G A 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr14 12803827 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr14 12803828 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr14 13095208 . A AT 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr14 13294652 . GT G 1704.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1742,148,0 -chr14 13295459 . TC T 2267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.57;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2305,173,0 -chr14 13299017 . GT G 427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:465,39,0 -chr14 13303713 . T C 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr14 13305233 . T A 647.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:676,48,0 -chr14 13541348 . C T 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr14 13779660 . C T 797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:826,60,0 -chr14 13782996 . CT C 3129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.869;DP=214;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,140:172:99:3167,0,317 -chr14 13783349 . C CT 5973.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.676;DP=293;FS=1.127;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,255:267:99:6349,469,0 -chr14 13934750 . G C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.009;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:561,0,125 -chr14 13935250 . G GA 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.659;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:560,21,0 -chr14 13935460 . AG A 1802.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:28:1840,28,0 -chr14 13935484 . C T 1807.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:24:1836,24,0 -chr14 13935565 . T C 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=-1.715;DP=295;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=4.99;ReadPosRankSum=2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,62:236:99:1499,0,8584 -chr14 13936032 . C A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr14 13936375 . T A 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:669,48,0 -chr14 13936719 . T G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr14 13937585 . A C 334.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:363,27,0 -chr14 13937668 . A G 1442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1471,105,0 -chr14 13937715 . A C 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:479,36,0 -chr14 13937800 . A AG 2066.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.462;DP=118;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.526;QD=17.51;ReadPosRankSum=2.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,81:113:99:2104,0,968 -chr14 13937877 . CT C 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.109;DP=231;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,34:167:99:442,0,10302 -chr14 13943345 . T A 1411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1440,96,0 -chr14 13943424 . T A 1902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1931,132,0 -chr14 13943432 . C A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.283;DP=80;FS=7.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=3.92;ReadPosRankSum=-4.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:342,0,1223 -chr14 13943457 . C CA 972.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1010,75,0 -chr14 13995133 . A G 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr14 13995449 . T C 1154.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1183,84,0 -chr14 14014163 . C A 1613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1642,117,0 -chr14 14066257 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.511;DP=36;FS=3.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:239,0,1043 -chr14 14073289 . T G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr14 14436457 . C T 1413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1442,105,0 -chr14 14454818 . C T 621.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:650,45,0 -chr14 14457477 . C T 1007.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1036,72,0 -chr14 14460292 . G GT 834.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.893;DP=41;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:99:1036,106,0 -chr14 14747922 . G A 1385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1414,102,0 -chr14 14785162 . A AT 412.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr14 14785168 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr14 14785638 . A C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr14 14785688 . C T 476.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:505,36,0 -chr14 14835989 . G A 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:621,45,0 -chr14 14857470 . A T 730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:759,51,0 -chr14 14857477 . G A 730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:759,51,0 -chr14 14858895 . G A 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr14 14858911 . C T 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr14 14897854 . C T 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr14 14898614 . T C 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:45:678,45,0 -chr14 14933581 . C T 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr14 14946524 . C T 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:612,45,0 -chr14 14946958 . C A 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:560,42,0 -chr14 15218030 . A G 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:355,27,0 -chr14 15275355 . AT A 270.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:308,27,0 -chr14 15275595 . G A 2991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:3020,211,0 -chr14 15413652 . A C 9319.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.545;DP=193;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=35.97;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,189:192:99:9348,675,0 -chr14 15413720 . T A 11716.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.864;DP=312;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,299:302:99:11745,905,0 -chr14 15418945 . TCTGCAGAGGAAGATAAATGGCAAGTACAAGTCAGAACAAAAAAAAACACTATCGGAAACTCGGAATGACAGATGATTCCAGAAGATCTAGAAAACACACTCAC T 2698.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=2.980;DP=369;FS=2.094;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=7.31;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,341:344:99:2736,897,0 -chr14 15442744 . G C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr14 16662509 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr14 17468011 . A T 1134.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1163,84,0 -chr14 17469310 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.386;DP=27;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:304,0,231 -chr14 17471505 . T G 2786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.444;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,83:138:99:2815,0,3660 -chr14 17480718 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr14 17500667 . A G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr14 17501922 . G GTA 494.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:532,41,0 -chr14 17503398 . A G 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.977;DP=37;FS=27.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=21.62;ReadPosRankSum=3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:828,0,550 -chr14 17503411 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.646;DP=43;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:400,0,1715 -chr14 17503449 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.584;DP=59;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:319,0,1634 -chr14 17503473 . CA C 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=2.868;DP=51;FS=71.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:475,0,924 -chr14 17503616 . A G 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.188;DP=31;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:616,0,784 -chr14 17504868 . C T 3759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.527;ClippingRankSum=-0.524;DP=113;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=33.27;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,82:113:99:3788,0,1229 -chr14 17505005 . T A 1883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.423;DP=82;FS=41.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=22.97;ReadPosRankSum=-3.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,48:70:99:1912,0,636 -chr14 17505137 . A AG 2002.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-1.290;DP=65;FS=12.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=30.81;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,41:63:99:2040,0,1783 -chr14 17505154 . C A 2004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.273;DP=89;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,56:86:99:2033,0,1783 -chr14 17505395 . T C 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-2.135;DP=45;FS=24.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=27.60;ReadPosRankSum=2.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:2104,0,716 -chr14 17505396 . T A 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=-2.885;DP=48;FS=17.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=29.69;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:2104,0,717 -chr14 17505565 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.475;DP=21;FS=13.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:242,0,446 -chr14 17506038 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.639;DP=51;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:454,0,281 -chr14 17506084 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr14 17511135 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.222;ClippingRankSum=-3.715;DP=75;FS=6.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:353,0,1828 -chr14 17511408 . G T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.576;DP=126;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:1088,0,1375 -chr14 17511497 . A T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=2.188;DP=71;FS=12.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:828,0,778 -chr14 17784465 . C T 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr14 17882467 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-1.004;DP=20;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.59;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:460,0,137 -chr14 17882529 . G C 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr14 17883843 . A T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.845;DP=64;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:827,0,716 -chr14 18389369 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.18;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:57:350,0,57 -chr14 18389479 . GT G 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.612;DP=25;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=8.27;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:244,0,204 -chr14 18493765 . A AG 3314.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;QD=21.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:6068,447,0 -chr14 18494338 . CTG C 5247.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:5285,364,0 -chr14 18494628 . G T 2197.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2226,154,0 -chr14 18494811 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:259,0,562 -chr14 18494985 . A G 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=1.806;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=26.41;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:715,0,238 -chr14 18498855 . CA C 814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.35;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:852,85,0 -chr14 18499960 . A G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr14 18499962 . TG T 412.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr14 18501546 . C G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr14 18517354 . G T 1213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1242,90,0 -chr14 18523247 . G GA 708.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=-0.060;DP=37;FS=4.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:93:891,93,0 -chr14 18526499 . TCCTAAAAACAGGAGAAAGGGGTTTCAGTTAGACAACACGCTCAGGTATTTCATGACCAGCTTTCGTTCCAATAACATAATCTCACATA T 4456.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=1.913;DP=101;FS=2.703;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.109;QD=33.84;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,99:101:99:4494,361,0 -chr14 18556143 . CTG C 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.184;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:572,0,12564 -chr14 18556146 . AAAAGCAAAGCCAAATATCAGGACAACGAGGTAAAAACAGTATAACAGTGTCAGCTTGATTCTGCCAGATCAATCTGAAACAATTCACACCT A 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=3.327;DP=40;FS=7.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:572,0,12564 -chr14 18562590 . A G 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:675,45,0 -chr14 18588457 . GCTGTGCAGAATGAACAACATGTTTCATAGTGTACTTTACAAACCTTTTAGAGGGGAAATGACAAAAGGAACTTAC G 10741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=2.429;DP=245;FS=3.024;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=29.55;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,243:245:99:10929,867,0 -chr14 18593313 . C CT 229.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=255;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:3:265,0,3 -chr14 18595433 . T C 1182.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1211,87,0 -chr14 18600642 . GGTGTGTA G 228.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=19.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:32:266,32,0 -chr14 18624874 . C CA 1668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=-0.472;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=2.015;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,75:78:99:1983,221,0 -chr14 18625126 . G GA 2713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-0.916;DP=120;FS=1.728;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=22.61;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,109:118:99:2751,220,0 -chr14 18628176 . G T 14116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.069;DP=354;FS=3.035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.624;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,351:352:99:14145,1032,0 -chr14 18638866 . TA T 1000.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.337;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,45:55:81:1038,0,81 -chr14 18638905 . G GA 1006.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-0.260;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1211,129,0 -chr14 18641848 . T TA 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.780;DP=135;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,46:127:99:700,0,2158 -chr14 18737955 . GAA G 652.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.55;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:690,55,0 -chr14 18744336 . C A 2540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2569,177,0 -chr14 18764802 . CTG C 666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:704,49,0 -chr14 18967430 . T G 801.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:830,60,0 -chr14 18968436 . AT A 383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:421,42,0 -chr14 19004843 . C T 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr14 19004917 . A G 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:791,57,0 -chr14 19297254 . T A 218.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=13;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:247,0,25 -chr14 19297288 . T G 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=13;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr14 19297488 . A T 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr14 19297550 . G A 890.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:919,63,0 -chr14 19563221 . T C 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr14 19587177 . C T 850.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:879,66,0 -chr14 19662416 . C A 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr14 19713515 . C A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr14 19713516 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:306,21,0 -chr14 19713776 . C T 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 -chr14 19717513 . ACTGCACAGTTCACACAATGATTAATATTGCTCTTATGAATAACTCATGACTCTTATGATCAAGTTTTCACCTAC A 2446.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=1.310;DP=56;FS=2.277;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=29.65;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2484,202,0 -chr14 19780590 . A G 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1055,84,0 -chr14 19780650 . C T 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1046,78,0 -chr14 19970381 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:353,0,55 -chr14 20007114 . TA T 214.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:252,18,0 -chr14 20052930 . C CT 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-2.812;DP=273;FS=4.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,48:263:99:404,0,5850 -chr14 20111987 . T A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.858;DP=87;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1109,0,1901 -chr14 20156516 . G GT 2840.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-1.264;DP=183;FS=3.009;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,77:79:99:2878,231,0 -chr14 20156550 . C T 2102.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.170;DP=147;FS=4.475;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=14.30;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2131,147,0 -chr14 20156941 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.050;DP=21;FS=7.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=33.04;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:29:722,0,29 -chr14 20157070 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-0.208;DP=28;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:538,0,404 -chr14 20157561 . G A 212.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:241,0,23 -chr14 20158398 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=12;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:297,0,54 -chr14 20158429 . A T 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.210;DP=49;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:849,0,249 -chr14 20158578 . T A 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=4.722;DP=62;FS=67.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=27.66;ReadPosRankSum=-3.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,48:60:99:1801,0,194 -chr14 20356084 . TA T 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 -chr14 20983863 . C T 1204.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1233,87,0 -chr14 20990435 . T A 930.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:959,66,0 -chr14 20990576 . G A 1052.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.102;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=27.71;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,28:31:13:1081,13,0 -chr14 20990681 . G A 707.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-1.415;DP=52;FS=5.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=13.61;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:16:736,0,16 -chr14 21068588 . T C 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr14 21071556 . C A 328.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr14 21205022 . C T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr14 21219096 . G T 316.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:32:345,32,0 -chr14 21220413 . T A 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:447,39,0 -chr14 21220666 . C T 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:444,33,0 -chr14 21223453 . G A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr14 21223785 . A G 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=1.047;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=29.93;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1375,0,176 -chr14 21254173 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:359,0,250 -chr14 21931164 . A G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr14 21967733 . A G 1852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1881,138,0 -chr14 21999465 . G A 3022.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-0.806;DP=75;FS=7.758;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=30.95;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3051,220,0 -chr14 22001007 . G A 2361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.888;DP=63;FS=5.511;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,60:63:99:2390,180,0 -chr14 22001523 . C A 736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:765,51,0 -chr14 22026251 . G T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-3.775;DP=31;FS=7.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=32.09;ReadPosRankSum=3.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:1023,0,137 -chr14 22026314 . C T 495.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=33.02;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:1:521,1,0 -chr14 22037420 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr14 22053992 . G T 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:33:456,33,0 -chr14 22054055 . C T 3841.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.532;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=34.93;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,98:110:16:3870,16,0 -chr14 22064597 . C T 12317.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=1.617;DP=301;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,299:300:99:12346,879,0 -chr14 22068443 . G A 1076.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1105,78,0 -chr14 22107900 . G A 30328.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.520;DP=732;FS=5.640;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=38.65;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,715:731:99:30357,2151,0 -chr14 22113016 . GAAGGTAAGCTTATCTTTAGAATAATCAAAAGCAGAGCAGAGAATTATACTAAACTATCCATCAGCAATAACTCCAAACCAATTCCATCC G 14509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-1.919;DP=402;FS=2.042;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=33.49;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,369:373:99:14547,1080,0 -chr14 22113284 . GTAAGA G 11948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.232;DP=302;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,292:298:99:11986,864,0 -chr14 22113290 . CAGTCCGCCGGTGGTCTTCATTCGAATGTTCTTCAAACATCTTAACATTACGTTAACATCTCTCTTTTCTTTTCTCAGGA C 11945.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.241;DP=303;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=33.09;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,293:299:99:11983,864,0 -chr14 22125319 . G T 5344.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5373,382,0 -chr14 22184849 . C T 5128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5157,378,0 -chr14 22199807 . A T 5304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:5333,397,0 -chr14 22200256 . C T 3598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.811;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=33.39;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,88:91:99:3627,262,0 -chr14 22206786 . C T 443.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:472,33,0 -chr14 22213237 . GACCTACACCAGCAGAGACTCGCATTAGAGATTAAGAAGAAACAGAAGACAGAACGTAAAGGAGACTACAC G 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=34.61;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:591,0,672 -chr14 22213641 . A G 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr14 22237926 . C T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr14 22624403 . C T 3597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3626,247,0 -chr14 22624486 . C CA 604.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:642,49,0 -chr14 22634847 . CA C 637.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=1.653;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=21.26;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:675,42,0 -chr14 22690862 . GGGTATGAAACTCTTCAGTTTATATGCTTTGCTCATGGGGCGACTGTGGATTAACATGTGTTTCTGTTTTTCTA G 1475.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=297;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,280:280:99:1513,556,0 -chr14 22694521 . AGTATGTACATTTTTCATAACACAAACATACAAACTTACTGCAACTGCCAAAACTTCATTCAATATGTAATGTGTTTTTTTTTTTCTTTTTCTAG A 10467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=1.133;DP=288;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,285:287:99:10505,1024,0 -chr14 22764208 . AGTGAGCAGTCCCATCATCACACATTTGATTATCCCACTGTTGTGGGAACTTTATTGTGACCCTCTTTATGGCTTATGTTTACAG A 4836.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=2.405;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=27.01;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:4874,407,0 -chr14 22849079 . CTCTCTCTCTA C 1038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.641;DP=100;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=10.39;ReadPosRankSum=-2.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,33:40:99:1076,0,183 -chr14 22849285 . CA C 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DP=74;FS=20.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:322,0,943 -chr14 22983774 . CA C 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.207;DP=52;FS=7.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:440,0,433 -chr14 23116269 . ACTGACACAAAAAGAAGAAAAGTTTAAACCGTGAAGCTACTTAATAACAGACAGTATAAAACAACCCGTTTAGATGCCAAAAGTAGCTAAATCAGGGCGAGTTTAC A 6490.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.142;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,139:142:99:6528,601,0 -chr14 23143025 . C CA 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.241;ClippingRankSum=-2.992;DP=399;FS=7.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=0.69;ReadPosRankSum=1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,70:360:99:314,0,7396 -chr14 24503712 . T C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr14 24503862 . C A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:316,0,101 -chr14 24537780 . C T 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 -chr14 24553890 . C T 2135.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2164,147,0 -chr14 24574334 . A G 3157.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3186,248,0 -chr14 24574385 . T C 4061.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:4090,304,0 -chr14 24574498 . C G 3929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.337;DP=99;FS=2.199;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.215;QD=33.62;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,96:99:99:3958,289,0 -chr14 24576655 . GCAA G 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=27.16;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:336,0,54 -chr14 24583693 . C T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:350,24,0 -chr14 24612201 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.321;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=7.80;ReadPosRankSum=-2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,3:26:99:231,0,1586 -chr14 24637561 . ACTGCAAAAACAGATAGGATCTTATAACTGATGTTCCAATAGCGATGTATCTGTTTGTGAAATGTTTGTTTAGACTTAC A 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=2.285;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:475,0,1913 -chr14 24651279 . G GT 1418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-1.314;DP=75;FS=3.485;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:1694,164,0 -chr14 24651454 . AAAAAC A 340.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:40:378,40,0 -chr14 24651578 . T TA 1961.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=1.358;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=20.02;ReadPosRankSum=-1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,92:95:99:2339,182,0 -chr14 24652192 . TGA T 774.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.180;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=30.60;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:15:812,15,0 -chr14 24652226 . CA C 461.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.542;DP=21;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=21.99;ReadPosRankSum=-1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:24:499,24,0 -chr14 24652667 . G A 3744.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.022;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=34.76;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3773,268,0 -chr14 24660719 . CCCTAAAATACATGAAGCAGAGGGTATTTGATAAGCTCTGTGGCTGAAAATATTCCATAGGATGTTTTTAAAGACATCACAATTCGTA C 2664.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=2.167;DP=87;FS=3.061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=30.63;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:2702,271,0 -chr14 24903233 . G C 2091.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.866;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=29.93;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2120,151,0 -chr14 24903317 . G A 1688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=1.120;DP=41;FS=7.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.906;QD=30.00;ReadPosRankSum=1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1717,120,0 -chr14 24903343 . A G 2023.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.328;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.249;QD=26.23;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2052,144,0 -chr14 24903456 . A G 1788.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-1.501;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=28.24;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:99:1817,129,0 -chr14 24903470 . G C 1956.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1985,141,0 -chr14 24903591 . AAT A 707.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.312;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=19.13;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:51:745,51,0 -chr14 24903697 . C A 919.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:948,72,0 -chr14 25267738 . C CA 966.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.391;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:31:1042,31,0 -chr14 25278812 . G A 5638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:5667,429,0 -chr14 25280828 . TGGTGAGTAGTAATTATAATTTTTTTTTCCCTCAAATTCATCTATCATAGATTCATGCCAATTACATAATTTCTTTCTTGTTTTTGCA T 4115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.832;DP=104;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=28.95;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,96:103:99:4153,0,368 -chr14 25302679 . AT A 616.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:654,60,0 -chr14 25400857 . T TA 3982.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=1.548;DP=159;FS=2.099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=25.05;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,135:138:99:4020,398,0 -chr14 25497568 . T C 4784.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:4813,364,0 -chr14 25760499 . T C 1236.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.516;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=25.64;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1265,93,0 -chr14 26520284 . T TA 775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.449;DP=69;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,40:66:99:887,0,588 -chr14 26548487 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.197;DP=41;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.010;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:769,0,685 -chr14 26600735 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=3.343;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:466,0,707 -chr14 26915052 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-1.917;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=31.77;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:89:473,0,89 -chr14 26992601 . G T 3209.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.895;DP=146;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=21.98;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,93:146:99:3238,0,1962 -chr14 27076522 . T C 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.529;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=27.55;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:94:717,0,94 -chr14 27077250 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.085;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:42:521,0,42 -chr14 27115342 . TA T 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-1.750;DP=28;FS=10.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:462,0,154 -chr14 27115503 . TG T 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.306;DP=18;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:268,0,148 -chr14 27116043 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.775;DP=34;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=28.32;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:991,0,765 -chr14 27116358 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-1.226;DP=32;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.421;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:660,0,407 -chr14 27242941 . G T 11862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.907;DP=329;FS=7.234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,282:306:99:11891,525,0 -chr14 27243125 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.715;DP=13;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=19.91;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:287,0,102 -chr14 27243145 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.817;DP=16;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=17.42;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,174 -chr14 27243212 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,102 -chr14 27243354 . C T 5529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.291;DP=204;FS=6.182;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:5558,400,0 -chr14 27243360 . C T 6915.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6944,473,0 -chr14 27243512 . G A 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=2.515;DP=43;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=20.18;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:896,0,123 -chr14 27243524 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=3.001;DP=24;FS=16.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=13.70;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:357,0,168 -chr14 27243775 . C G 1510.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=1.080;DP=94;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:12:1538,0,12 -chr14 27243787 . T G 1393.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=1.042;DP=94;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:3:1420,0,3 -chr14 27243872 . T G 2213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.466;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=26.35;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:2242,173,0 -chr14 27243914 . G A 3326.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.904;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=26.83;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:3355,244,0 -chr14 27244023 . C T 2464.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=1.575;DP=80;FS=11.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=30.81;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:99:2493,195,0 -chr14 27244107 . A T 10570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-1.099;DP=339;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=31.18;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,249:253:99:10599,758,0 -chr14 27244143 . A C 5668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.503;DP=180;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=31.49;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:5697,403,0 -chr14 27244206 . G C 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr14 27244231 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:99:336,0,316 -chr14 27244391 . G C 1527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.953;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=18.86;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1556,114,0 -chr14 27245137 . A G 1732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1761,123,0 -chr14 27245187 . T C 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=-1.280;DP=52;FS=16.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1202,0,113 -chr14 27246059 . T C 2100.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2129,150,0 -chr14 27246161 . C T 5774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=1.211;DP=152;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=28.78;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,135:137:99:5803,397,0 -chr14 27246198 . G A 2074.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.916;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=34.58;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2103,144,0 -chr14 27246242 . C G 729.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:54:758,54,0 -chr14 27246251 . A T 729.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:758,54,0 -chr14 27246413 . G C 2733.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=1.238;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=22.23;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,64:68:99:2762,129,0 -chr14 27246422 . T C 2721.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=1.073;DP=71;FS=3.753;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=29.09;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:99:2750,117,0 -chr14 27246558 . TA T 814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.32;MQ0=0;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:80:852,80,0 -chr14 27246894 . A G 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr14 27246952 . T A 248.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.64;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:6:276,0,6 -chr14 27247183 . A T 453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:482,36,0 -chr14 27247259 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-2.041;DP=13;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.041;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42:384,0,42 -chr14 27247605 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:233,0,58 -chr14 27373982 . G T 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:30:428,30,0 -chr14 27394167 . G A 1887.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.379;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:1916,141,0 -chr14 27422753 . TA T 7458.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.516;DP=264;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=28.25;ReadPosRankSum=-1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,239:248:99:7496,727,0 -chr14 27434279 . C T 7390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:7419,506,0 -chr14 27434283 . C A 7390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:7419,506,0 -chr14 27461977 . G GA 1329.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.264;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=31.70;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:25:1367,25,0 -chr14 27490894 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=1.931;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:255,0,97 -chr14 27520436 . A AT 936.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=1.443;DP=81;FS=8.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=11.56;ReadPosRankSum=-4.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:974,0,626 -chr14 27520520 . CA C 7782.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:231:99:7820,725,0 -chr14 27520937 . G GA 6281.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.020;DP=245;FS=1.360;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,206:214:99:6319,627,0 -chr14 27596809 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=29.58;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:86:472,0,86 -chr14 27634108 . T G 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr14 27712565 . TA T 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-1.555;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:563,0,805 -chr14 27724861 . ACCACGTAAGTCAGTGGGTGTTTTAGTTTTACGTGATAAGTGAGTTGCAGCACTTATAAATGTCCGTCAATGTTTTCTGTGC A 7192.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=1.256;DP=420;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,218:406:99:7230,0,9816 -chr14 27724865 . CGTAAGTCAGTGGGTGTTTTAGTTTTACGTGATAAGTGAGTTGCAGCACTTATAAATGTCCGTCAATGTTTTCTGTGCTCACTGTTGTTTACACGTTGTTTGTCACAATAG C 5976.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-1.964;DP=407;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.044;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,172:393:99:6014,0,9370 -chr14 27724946 . CTGTTGTTTACACGTTGTTTGTCACAATAG C 7212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=1.038;DP=403;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=17.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,211:389:99:7250,0,9816 -chr14 27725216 . T A 5656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=-0.754;DP=306;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,178:305:99:5685,0,4298 -chr14 27725237 . T C 6231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.708;DP=347;FS=2.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,191:347:99:6260,0,5536 -chr14 27726712 . TGTAGGTTTTCATGGTAAAATATATTCGTGTATTGGTAAAAGACATGTGTAATTGTCTTAAATCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTGTGTGTGAATCTAG T 15509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=1.957;DP=427;FS=1.234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=26.08;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,402:413:99:16639,1105,0 -chr14 27735817 . AAGGTACTTAATACACCTTCACTTTAGAGCTTGAGAGTGTCTTGGCGCTCTCATCACTTTGCCTTTTGTCCTCCTGCTGCT A 6248.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.614;DP=182;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=34.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,180:182:99:6286,572,0 -chr14 27789042 . C T 3013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=1.338;DP=148;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,88:148:99:3042,0,2303 -chr14 27791006 . A G 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:457,33,0 -chr14 27792176 . G A 4024.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:4053,298,0 -chr14 27792547 . T C 3434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3463,244,0 -chr14 27792575 . T A 1554.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1583,117,0 -chr14 27793224 . C T 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=-4.136;DP=93;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:93:99:1276,0,4400 -chr14 27793225 . C G 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-3.320;DP=93;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1276,0,4390 -chr14 27793776 . C G 1601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1630,120,0 -chr14 27793883 . A G 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=5.903;DP=138;FS=5.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=7.57;ReadPosRankSum=-3.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1073,0,7648 -chr14 27796919 . A G 1934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1963,144,0 -chr14 27796925 . A G 1843.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1872,138,0 -chr14 27797475 . A G 3068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-0.781;DP=167;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,93:167:99:3097,0,2704 -chr14 27797733 . T C 7444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.378;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=26.98;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:7473,533,0 -chr14 27797816 . A G 10286.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:10315,725,0 -chr14 27797826 . G A 1954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=1.948;DP=136;FS=14.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=14.37;ReadPosRankSum=-2.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,56:136:99:1983,0,3294 -chr14 27797954 . C T 4145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=-2.198;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,113:237:99:4174,0,4168 -chr14 27798263 . C T 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.409;DP=210;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=7.22;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,63:210:99:1545,0,5577 -chr14 27798389 . T G 6404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:6433,460,0 -chr14 27799163 . A G 7361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-1.287;DP=187;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=35.02;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,186:187:99:7390,547,0 -chr14 27804615 . C T 4833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=1.314;DP=241;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,141:241:99:4862,0,3666 -chr14 27876578 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=1.626;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=24.91;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:377,0,130 -chr14 27877914 . T A 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr14 27878303 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.910;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=24.61;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:422,0,112 -chr14 27878483 . T A 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:443,33,0 -chr14 27879255 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr14 27882007 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-2.128;DP=47;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:519,0,1682 -chr14 27882576 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.083;DP=44;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:342,0,1958 -chr14 28109950 . A T 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:460,33,0 -chr14 28109954 . T C 431.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:460,33,0 -chr14 29048825 . C CA 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-2.283;DP=170;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,34:139:99:384,0,2524 -chr14 29050695 . C T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr14 29051369 . ACTGCAAAAGACAAAGAAACAAAAGTATCATTAGGGGAGTTCAGACACCGCAGTAGTAAACAAGCTCTCAGTGCGTGACAACTGTGTTGAACCGCAGCGAATGCCGCAAAACTAGTGCGAAAAACAATTCCTATCAAAAACATCCAATAATCCTGTATAATCGTCCTAC A 5405.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=3.396;DP=141;FS=1.875;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=32.74;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,137:141:99:5443,453,0 -chr14 29063802 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.473;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=2.209;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:682,0,1042 -chr14 29064055 . T G 773.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:802,60,0 -chr14 29064740 . A G 599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:628,48,0 -chr14 29064830 . CTGGAGCCGACAGGGCGAGGAGCCTGGG C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:276,0,778 -chr14 29064907 . CTGGGTGGCGCCGGCAGGGCGAGGAGCT C 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:276,0,778 -chr14 29200108 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr14 29200115 . C G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:261,18,0 -chr14 29445669 . AT A 339.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.397;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:28:377,0,28 -chr14 29468570 . G A 1854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-1.321;DP=143;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,54:141:99:1883,0,2905 -chr14 29473239 . C T 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=1.524;DP=114;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1866,0,1958 -chr14 29474750 . G A 2134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=1.523;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,61:148:99:2163,0,3078 -chr14 29478813 . AT A 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.694;DP=83;FS=6.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:583,0,1321 -chr14 29479033 . GA G 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.261;DP=61;FS=4.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:279,0,927 -chr14 29479768 . T A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=2.285;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=11.08;ReadPosRankSum=-2.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,45:112:99:1280,0,2129 -chr14 29483383 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=1.944;DP=143;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,42:143:99:1065,0,4190 -chr14 29485638 . C T 2159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=-0.398;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,64:157:99:2188,0,3184 -chr14 29486804 . C T 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=2.769;DP=167;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.48;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,50:167:99:1277,0,4340 -chr14 29488687 . C T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=-0.338;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,45:136:99:1291,0,3426 -chr14 29488830 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-1.338;DP=116;FS=0.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,39:116:99:1068,0,3059 -chr14 29497478 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=2.564;DP=41;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,2065 -chr14 29497480 . C G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=2.859;DP=40;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:378,0,2065 -chr14 29507838 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,228 -chr14 29524923 . C T 2866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=-0.041;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,96:198:99:2895,0,3246 -chr14 29532746 . C T 2723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.593;DP=231;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,81:230:99:2752,0,5267 -chr14 29532773 . A G 2617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.121;DP=218;FS=5.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,77:218:99:2646,0,4948 -chr14 29538451 . T C 3069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=1.643;DP=260;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,94:259:99:3098,0,5722 -chr14 29545489 . G A 2109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.861;DP=153;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,61:153:99:2138,0,3105 -chr14 29545953 . A C 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=0.274;DP=137;FS=5.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,60:136:99:2173,0,2610 -chr14 29546414 . C CA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.536;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,31:143:99:357,0,3239 -chr14 29546614 . G T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=-0.021;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:507,0,522 -chr14 29546649 . C A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.835;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:649,0,1059 -chr14 29547012 . T G 2559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.308;DP=186;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.279;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,75:186:99:2588,0,3942 -chr14 29565405 . AT A 2129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-1.624;DP=146;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,86:145:99:2167,0,1506 -chr14 29571065 . A T 2712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.607;DP=236;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,83:236:99:2741,0,5179 -chr14 29575145 . T C 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=3.125;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=28.28;ReadPosRankSum=-2.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:905,0,128 -chr14 29578932 . GAGGTGAGAGAGTATGAATGCACTCAACGGTTGTGTGGTTCCTATCATAGAGTCTGTCATGCAGCATACTTTGTGTGTGTATCAGATTGTCTTTTGTTGTTGTGTTTAATTCGTCTTTTTATTCATTTACACCC G 9256.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.818;DP=214;FS=6.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,206:213:99:9294,847,0 -chr14 29579086 . T G 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.424;DP=220;FS=9.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.892;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,73:219:99:1885,0,5994 -chr14 29582773 . GT G 1474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.742;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,56:59:99:1512,140,0 -chr14 29582914 . C T 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.156;DP=95;FS=6.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1291,0,2128 -chr14 30539860 . A G 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr14 30598962 . G A 203.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:232,0,25 -chr14 30616576 . A C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.42;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:82:239,0,82 -chr14 30623893 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.636;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=24.05;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:365,0,131 -chr14 30624154 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,133 -chr14 30624175 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.91;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,149 -chr14 30627224 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=1.517;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:268,0,526 -chr14 30628157 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.639;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:40:450,0,40 -chr14 30628774 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.23;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,389 -chr14 30651607 . A T 212.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:241,0,25 -chr14 30651873 . T G 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=-0.391;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=31.46;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:76:626,0,76 -chr14 30651908 . G A 477.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-0.810;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=31.81;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:10:505,10,0 -chr14 30652128 . G C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=1.370;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:626,0,196 -chr14 30652142 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,472 -chr14 30652199 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,142 -chr14 30669554 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.793;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:414,0,160 -chr14 30676214 . C T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr14 30677096 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-1.488;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:989,0,990 -chr14 30677710 . AAC A 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-1.581;DP=43;FS=3.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:266,0,749 -chr14 30677712 . CAA C 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.469;DP=41;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:245,0,978 -chr14 30678014 . T C 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.347;DP=54;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:828,0,1100 -chr14 30678080 . C A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.600;DP=60;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:1003,0,1115 -chr14 30678372 . C T 1400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:96:1429,96,0 -chr14 30678376 . C T 1400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:96:1429,96,0 -chr14 30680657 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.369;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:454,0,158 -chr14 30687033 . T A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.094;DP=23;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:318,0,477 -chr14 30687340 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.245;DP=48;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:357,0,1301 -chr14 30687391 . C A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.428;DP=40;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:299,0,1114 -chr14 30689137 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:243,0,57 -chr14 30690354 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.892;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:397,0,810 -chr14 30690859 . C T 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-1.545;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,37:95:99:1281,0,2022 -chr14 30715179 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.119;DP=38;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.28;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:495,0,710 -chr14 30715221 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.017;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:607,0,1192 -chr14 30717505 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-1.473;DP=15;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:289,0,186 -chr14 30717574 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,125 -chr14 30752858 . T A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=-1.457;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:719,0,1581 -chr14 30752862 . C T 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=1.119;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:771,0,1622 -chr14 30762116 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,334 -chr14 30775485 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.307;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,255 -chr14 30775773 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:319,0,61 -chr14 31147322 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=1.642;DP=36;FS=1.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=3.944;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:250,0,1780 -chr14 31153365 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=1.991;DP=30;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:248,0,844 -chr14 31226728 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:78:309,0,78 -chr14 31230326 . ACTGCAAAGGAGGAAATGCATCACAAAATGCCAAAAATGTGTATCCTGACAGTAAATGTATGTTCTCCTCTTAC A 2622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=1.674;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2660,227,0 -chr14 31281715 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:41:317,0,41 -chr14 31330259 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.094;DP=61;FS=5.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1007,0,1024 -chr14 31421419 . G A 3136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=3.115;DP=243;FS=1.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=12.91;ReadPosRankSum=4.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,92:243:99:3165,0,5079 -chr14 31450473 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:305,0,98 -chr14 31489858 . G C 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.113;DP=49;FS=2.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:1013,0,610 -chr14 31539646 . C A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=1.970;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:407,0,575 -chr14 31540843 . G T 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=-1.919;DP=42;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:857,0,645 -chr14 31541834 . A T 1230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-1.721;DP=63;FS=6.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=19.54;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1259,0,834 -chr14 31542596 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=3.482;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:549,0,1182 -chr14 31542649 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=1.081;DP=49;FS=7.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:289,0,1377 -chr14 31545516 . T C 2709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-1.570;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,74:110:99:2738,0,998 -chr14 31561815 . A T 1822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=1.085;DP=89;FS=4.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,55:89:99:1851,0,1200 -chr14 31583440 . T TA 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.519;DP=26;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:334,0,257 -chr14 31602637 . C T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.775;DP=39;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:757,0,649 -chr14 31602793 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.723;DP=47;FS=10.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:875,0,748 -chr14 31603314 . G A 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.175;DP=59;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=19.86;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1200,0,2212 -chr14 31603593 . C T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=1.854;DP=46;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=26.82;ReadPosRankSum=-0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1262,0,330 -chr14 31603812 . C T 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-0.046;DP=48;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=27.25;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1336,0,327 -chr14 31609687 . G T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=28.77;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:91:431,0,91 -chr14 31617108 . CA C 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:16:245,16,0 -chr14 31628491 . T C 2701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.865;DP=136;FS=3.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=19.87;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,81:136:99:2730,0,1946 -chr14 31628812 . CTT C 1154.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.740;DP=109;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=10.59;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1689,0,1120 -chr14 31634837 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:275,0,242 -chr14 31646027 . G A 1552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.340;DP=75;FS=6.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:1581,0,2540 -chr14 31655700 . A G 1438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=1.723;DP=75;FS=12.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=19.18;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,44:75:99:1467,0,1139 -chr14 31662675 . G A 1949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.704;DP=91;FS=5.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.467;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,53:91:99:1978,0,2673 -chr14 31663690 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.849;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:440,0,491 -chr14 31664004 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:231,0,98 -chr14 31670958 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=-0.626;DP=159;FS=8.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=1.39;ReadPosRankSum=-4.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,26:158:99:249,0,5257 -chr14 31671080 . G C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.270;DP=189;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,38:189:99:662,0,5797 -chr14 31672181 . T G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.634;DP=18;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.54;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:416,0,243 -chr14 31672274 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.421;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:530,0,1053 -chr14 31673023 . G T 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.385;DP=66;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=17.51;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:1184,0,1216 -chr14 31673098 . T A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-1.469;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:468,0,1272 -chr14 31677628 . A T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=3.359;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:846,0,3078 -chr14 31677637 . G T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=3.332;DP=61;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:846,0,3026 -chr14 31725278 . C A 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.105;DP=118;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:2095,0,1865 -chr14 31746299 . A T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.024;DP=27;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=20.32;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:577,0,935 -chr14 31749720 . A C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.052;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:417,0,756 -chr14 31750126 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.29;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,181 -chr14 31750609 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=1.792;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=16.48;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:259,0,255 -chr14 31756176 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:317,0,315 -chr14 31770939 . G A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.288;DP=75;FS=1.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1280,0,1262 -chr14 31772021 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=2.595;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:323,0,3459 -chr14 31772023 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=2.806;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:323,0,3459 -chr14 31773015 . C T 2127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.834;DP=100;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.696;QD=21.28;ReadPosRankSum=1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,60:99:99:2156,0,1383 -chr14 31773349 . A G 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.295;DP=80;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,53:80:99:1863,0,856 -chr14 31779856 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.376;DP=55;FS=7.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=18.61;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1052,0,590 -chr14 31784523 . C T 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-2.052;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:1050,0,1320 -chr14 31784524 . T A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-1.033;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=21.29;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1050,0,1320 -chr14 31784732 . A G 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.327;DP=55;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.584;QD=21.56;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,36:55:99:1214,0,668 -chr14 31785046 . A T 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.189;DP=51;FS=4.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,39:51:99:1469,0,274 -chr14 31785095 . G A 1767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-0.909;DP=62;FS=6.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=28.51;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,46:62:99:1796,0,382 -chr14 31785299 . TTG T 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=1.416;DP=38;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:319,0,392 -chr14 31786531 . G A 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-0.373;DP=56;FS=2.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1107,0,843 -chr14 31791421 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.672;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:383,0,708 -chr14 31797207 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.043;DP=58;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=25.84;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,42:58:99:1527,0,380 -chr14 31799462 . G A 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.446;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:1016,0,763 -chr14 31799639 . C T 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.220;DP=51;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:941,0,650 -chr14 31840706 . G C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.148;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1030,0,1139 -chr14 31845218 . T TA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=2.975;DP=77;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:268,0,1329 -chr14 31845241 . GA G 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=4.140;DP=93;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.938;QD=3.08;ReadPosRankSum=-4.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:338,0,1348 -chr14 31845358 . G T 1670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.957;DP=95;FS=6.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,46:95:99:1699,0,1687 -chr14 31857046 . G T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.044;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:498,0,196 -chr14 31858159 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-0.163;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:396,0,209 -chr14 31861190 . A G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=9.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=32.55;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:41:484,0,41 -chr14 31893893 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:442,0,157 -chr14 31951972 . TA T 1089.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.284;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1127,0,463 -chr14 31952398 . C T 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=1.763;DP=85;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=17.34;ReadPosRankSum=-3.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1502,0,1438 -chr14 31952416 . C T 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=2.954;DP=88;FS=5.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,40:88:99:1457,0,1652 -chr14 31952596 . G A 2455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.658;DP=136;FS=5.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,74:136:99:2484,0,2224 -chr14 31952624 . A T 3222.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.350;DP=175;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,97:175:99:3251,0,2642 -chr14 31960814 . C T 4155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-1.153;DP=191;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,120:190:99:4184,0,2430 -chr14 31961143 . C T 2585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=-0.773;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,78:142:99:2614,0,2267 -chr14 31961468 . T A 6705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.880;DP=298;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=22.50;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,192:297:99:6734,0,3630 -chr14 31961812 . AAC A 3875.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=-1.610;DP=140;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:3913,0,2715 -chr14 31962353 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=4.682;DP=76;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=3.18;ReadPosRankSum=-4.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:270,0,4775 -chr14 31974968 . A T 250.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:279,0,22 -chr14 32020957 . T G 3247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.138;DP=152;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,94:150:99:3276,0,2035 -chr14 32021385 . A C 2930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=1.111;DP=158;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,90:158:99:2959,0,2390 -chr14 32044359 . A G 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr14 32169047 . C G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:254,18,0 -chr14 32336787 . T C 842.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.711;DP=25;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=33.71;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:19:871,0,19 -chr14 32344471 . T C 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.043;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:652,0,211 -chr14 32347361 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-2.538;DP=22;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=19.40;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:455,0,320 -chr14 32347458 . G GT 890.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.403;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,58:81:99:1245,0,530 -chr14 32384273 . G A 2431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-1.295;DP=131;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,74:130:99:2460,0,1947 -chr14 32389490 . T A 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.044;DP=47;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=23.48;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:1132,0,562 -chr14 32390216 . GA G 304.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:342,34,0 -chr14 32390469 . A G 1337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.713;DP=61;FS=12.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,39:61:99:1366,0,763 -chr14 32399727 . C A 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.575;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:793,0,783 -chr14 32399811 . G C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.219;DP=38;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:817,0,1486 -chr14 32400318 . G A 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.008;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:855,0,1079 -chr14 32410654 . AAGGTATCGCTTTCTTTTCCTTAATAAATGTTTTATTATTGTTATGCAAGCTTTTGTGCTTTTTATTTATTTCTCTCCTTTGTATGAGT A 1628.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=3.606;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=34.65;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,42:47:99:1666,0,1802 -chr14 32411001 . A T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.559;DP=75;FS=3.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1340,0,1245 -chr14 32415151 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-1.239;DP=58;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=16.13;ReadPosRankSum=2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:964,0,1805 -chr14 32415673 . A G 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.213;DP=64;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=18.39;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1205,0,1956 -chr14 32415674 . G A 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.422;DP=63;FS=10.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=18.68;ReadPosRankSum=2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1205,0,1956 -chr14 32415798 . A T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=1.508;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:668,0,1083 -chr14 32421356 . G A 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.544;DP=119;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,59:118:99:2095,0,2082 -chr14 32426250 . A G 1341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=4.106;DP=89;FS=14.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:1370,0,1659 -chr14 32462030 . G C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-1.437;DP=49;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:865,0,752 -chr14 32478147 . C A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=-0.371;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:812,0,913 -chr14 32479707 . C A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=18.99;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:427,0,279 -chr14 32480126 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.981;DP=31;FS=8.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:473,0,682 -chr14 32480695 . C T 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.390;DP=64;FS=3.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:1134,0,1080 -chr14 32485508 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-1.465;DP=48;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:818,0,829 -chr14 32485537 . C T 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.525;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,52:102:99:1809,0,1802 -chr14 32486030 . C T 1428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.800;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=15.88;ReadPosRankSum=-2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:1457,0,1510 -chr14 32511648 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.012;DP=28;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:503,0,334 -chr14 32511678 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.263;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:388,0,393 -chr14 32511841 . A G 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=1.322;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:847,0,700 -chr14 32513316 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.630;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:478,0,456 -chr14 32514961 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.511;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,773 -chr14 32514965 . TG T 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:348,0,773 -chr14 32515895 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-0.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:336,0,191 -chr14 32516365 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:241,0,55 -chr14 32517216 . G GT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=20.44;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:303,0,384 -chr14 32517432 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,181 -chr14 32538637 . G A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=1.815;DP=56;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,33:56:99:1160,0,788 -chr14 32538981 . TA T 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-0.092;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,27:83:99:457,0,1751 -chr14 32539255 . T G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=1.783;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=18.49;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:1045,0,1996 -chr14 32539256 . G T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=2.260;DP=58;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:1045,0,1995 -chr14 32539345 . C G 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=2.065;DP=46;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=20.52;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:972,0,2678 -chr14 32540243 . G A 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.535;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1357,0,1447 -chr14 32546915 . A T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.661;DP=56;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1143,0,738 -chr14 32555423 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-0.199;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:28:612,0,28 -chr14 32555674 . A T 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:642,48,0 -chr14 32555707 . T A 542.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.302;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=33.93;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:18:571,18,0 -chr14 32558386 . A C 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr14 32560836 . C T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-1.090;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.98;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:95:448,0,95 -chr14 32562731 . A T 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr14 32625118 . T G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.619;DP=20;FS=9.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:542,0,347 -chr14 32670749 . C G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.222;DP=36;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:592,0,623 -chr14 32671141 . T C 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:30:421,30,0 -chr14 32671594 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=2.295;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:389,0,573 -chr14 32673027 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=2.839;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:473,0,467 -chr14 32673070 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.900;DP=27;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=8.51;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:258,0,664 -chr14 32676196 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.444;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:890,0,640 -chr14 32676623 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.889;DP=44;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:707,0,773 -chr14 32728528 . AAC A 1360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.814;DP=73;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=18.64;ReadPosRankSum=-2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1398,0,1306 -chr14 32730217 . T TA 1411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=-2.792;DP=322;FS=4.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,93:309:99:1449,0,5855 -chr14 32731074 . ACTACACAAAACAAGAAAAGATACAAACCATACTTAATGCCACAAACACTAGGTTTGAGCTAGTCTCTCTACAATTAATTATACTTTAAGTCATAACATCTACGTTACAATTTAGATCATACAAAATGAAAATTAC A 17472.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=5.983;DP=403;FS=0.793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=34.53;ReadPosRankSum=-2.712 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,378:402:99:17510,1410,0 -chr14 32735399 . C T 2086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-2.265;DP=111;FS=4.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=18.80;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,64:111:99:2115,0,1725 -chr14 32751785 . T C 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.788;DP=88;FS=4.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1719,0,1506 -chr14 32751980 . G T 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=-0.213;DP=59;FS=5.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1248,0,857 -chr14 32752071 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.944;DP=35;FS=11.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=16.28;ReadPosRankSum=2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:598,0,713 -chr14 32752551 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-1.085;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=18.08;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:444,0,353 -chr14 32753110 . G C 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.693;DP=92;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:2116,0,1098 -chr14 32753940 . A T 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=22.11;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:391,0,213 -chr14 32882005 . GT G 1425.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.794;DP=52;FS=7.482;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=27.42;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:1463,142,0 -chr14 32896063 . TG T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.550;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:286,0,478 -chr14 32897630 . A C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-2.354;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:494,0,473 -chr14 32915637 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-2.037;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=21.98;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,136 -chr14 32922653 . T A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr14 32923499 . A T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 32927474 . T C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-2.068;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=25.91;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:676,0,299 -chr14 32927558 . T TGC 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-2.647;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=29.12;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:73:445,0,73 -chr14 32941997 . TA T,TAA 203.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,7:11:99:288,194,265,122,0,131 -chr14 32942529 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.580;DP=28;FS=6.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=19.21;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:566,0,415 -chr14 32942579 . C CT 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.529;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:346,0,121 -chr14 32942664 . TA T 685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-0.509;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:50:723,50,0 -chr14 32943123 . A AC 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.087;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:614,0,212 -chr14 32943402 . G A 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-2.027;DP=43;FS=5.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=28.41;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1250,0,221 -chr14 32944410 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=1.284;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:814,0,445 -chr14 32946029 . G A 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.423;DP=51;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1258,0,400 -chr14 32947820 . G A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=1.096;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1177,0,1127 -chr14 33054314 . A AT 965.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.31;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:98:1003,98,0 -chr14 33054348 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-1.007;DP=33;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:583,0,483 -chr14 33054915 . C A 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=-0.657;DP=46;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=22.02;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1041,0,506 -chr14 33128360 . C A 276.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:305,0,17 -chr14 33314375 . G T 334.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.41;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:362,0,11 -chr14 33317751 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:267,0,53 -chr14 33376255 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:915,0,330 -chr14 33377386 . A T 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:885,0,282 -chr14 33381325 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:369,0,337 -chr14 33382503 . T A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,110 -chr14 33384711 . C T 333.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-0.348;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:362,0,16 -chr14 33385106 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:245,0,56 -chr14 33388731 . G A 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.265;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=26.18;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1128,0,319 -chr14 33390590 . A T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.273;DP=45;FS=12.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:958,0,540 -chr14 33523404 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:242,0,60 -chr14 33665688 . T A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -chr14 33708886 . C G 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.384;DP=93;FS=0.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:1053,0,2067 -chr14 33716308 . C T 1815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.734;DP=169;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,57:168:99:1844,0,3887 -chr14 33732975 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.289;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=16.13;ReadPosRankSum=-3.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:625,0,663 -chr14 33741945 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.331;DP=31;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:304,0,792 -chr14 33797190 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-0.049;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:231,0,705 -chr14 33800486 . A T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-1.858;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:397,0,573 -chr14 33839981 . GC G 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.654;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:611,0,759 -chr14 33840395 . C A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=1.044;DP=52;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=12.65;ReadPosRankSum=-1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:686,0,1121 -chr14 33847487 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-0.855;DP=75;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:1052,0,1491 -chr14 33899360 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=2.154;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:509,0,1039 -chr14 33899377 . G C 1449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1478,105,0 -chr14 33899418 . A G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.829;DP=18;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=30.15;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:77:571,0,77 -chr14 33925648 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:521,39,0 -chr14 33930749 . A G 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr14 34045580 . G GA 987.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.612;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1025,99,0 -chr14 34046519 . C CG 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.894;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:242,0,800 -chr14 34153030 . G T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-1.068;DP=22;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:322,0,435 -chr14 34195516 . T C 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.137;DP=78;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=15.88;ReadPosRankSum=-2.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,32:78:99:1267,0,3524 -chr14 34195545 . TA T 803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-0.308;DP=70;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:841,0,771 -chr14 34195865 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.660;DP=74;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:448,0,2362 -chr14 34196010 . CA C 996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.146;DP=67;FS=5.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,42:59:99:1034,0,182 -chr14 34210335 . TCCTTTCAGACACAAAAAAACACAAAAGATTCCAGAGGTGTTGCATATTCAGACAAGCCCGAGTCAATTATAAATGAGAAAACAGCTTCACGTTTACAGCACAAAAGACACAGTGATAGGCGAAAAGATAGGTGGAGACTTA T 5139.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=4.312;DP=130;FS=10.169;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=33.47;ReadPosRankSum=-3.565 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,120:130:99:5177,474,0 -chr14 34229154 . TTTTTTGACCTGAATTAACTCAC T 221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:86:259,86,0 -chr14 34240038 . AAGGTGAGTTCAGCTGTGCTAGTTAAAAACTTGTTCGTCTATTTAAACATTTGACTTAATCGTATGTTGTTTGGGAC A 6652.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.713;DP=180;FS=3.108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:6690,566,0 -chr14 34251933 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-1.107;DP=57;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:514,0,1475 -chr14 34257047 . T A 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-1.290;DP=137;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,47:137:99:1556,0,3395 -chr14 34276917 . AG A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=-0.152;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.80;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:243,0,308 -chr14 34277288 . A AT 1735.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-1.918;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,78:119:99:1773,0,852 -chr14 34277511 . C T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.240;DP=135;FS=0.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,42:135:99:1154,0,3612 -chr14 34277557 . T TA 1191.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-1.369;DP=166;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=7.18;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,56:157:99:1229,0,2492 -chr14 34289103 . G A 3959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-0.565;DP=344;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,119:343:99:3988,0,7765 -chr14 34315220 . T A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.399;DP=57;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:593,0,1068 -chr14 34319394 . C CT 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.247;DP=112;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,35:107:99:605,0,1935 -chr14 34322658 . A G 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-1.006;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,57:132:99:2068,0,2606 -chr14 34393631 . C A 1689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-1.090;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,52:139:99:1718,0,2987 -chr14 34406095 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.434;DP=54;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,29:54:99:993,0,869 -chr14 34406161 . C G 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.586;DP=63;FS=4.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1008,0,1073 -chr14 34406186 . C T 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.621;DP=67;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:809,0,1454 -chr14 34408423 . CT C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=1.685;DP=29;FS=3.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:266,0,453 -chr14 34429418 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.739;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:814,0,805 -chr14 34435226 . G A 2170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=-0.319;DP=167;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,67:166:99:2199,0,3333 -chr14 34435406 . G A 1912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.109;DP=156;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,59:155:99:1941,0,3287 -chr14 34448378 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-0.122;DP=82;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=6.11;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:529,0,2274 -chr14 34449928 . T TA 534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-0.423;DP=147;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,37:138:99:572,0,3052 -chr14 34461217 . C CA 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.532;DP=66;FS=4.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:532,0,1104 -chr14 34485333 . C T 3485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-1.718;DP=264;FS=16.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=13.20;ReadPosRankSum=2.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,102:263:99:3514,0,5498 -chr14 34492108 . T A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.987;DP=70;FS=7.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=8.30;ReadPosRankSum=2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:609,0,3717 -chr14 34492110 . G T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-0.256;DP=70;FS=7.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=8.15;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:599,0,3717 -chr14 34492931 . G A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.192;DP=80;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,32:80:99:948,0,6272 -chr14 34492940 . C A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-1.380;DP=87;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:948,0,6272 -chr14 34493461 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=1.362;DP=100;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:363,0,3007 -chr14 34499991 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.097;DP=64;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:458,0,1764 -chr14 34532197 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=3.199;DP=52;FS=10.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:236,0,1416 -chr14 34540200 . G C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:331,0,1019 -chr14 34541501 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.789;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:426,0,1008 -chr14 34730366 . TA T 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.203;DP=84;FS=15.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,25:73:99:401,0,3787 -chr14 34731076 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.249;DP=109;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,35:109:99:955,0,2866 -chr14 34731957 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.579;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,28:104:99:680,0,2814 -chr14 34764637 . A AT 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.635;DP=55;FS=4.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:460,0,1274 -chr14 34764653 . T A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=-0.829;DP=56;FS=3.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.997;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:695,0,1703 -chr14 34764878 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.684;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:232,0,847 -chr14 34765088 . G T 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.990;DP=33;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.907;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:57:1372,0,57 -chr14 34783302 . G A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.372;DP=81;FS=1.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:914,0,1854 -chr14 34801192 . A T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.967;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:525,0,463 -chr14 34801230 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.983;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:326,0,610 -chr14 34801602 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:294,0,97 -chr14 34802519 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:267,0,99 -chr14 34802558 . CT C 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.691;DP=15;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:60:289,0,60 -chr14 34802666 . C A 1032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.332;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:37:1061,37,0 -chr14 34802936 . C T 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 -chr14 34803853 . A G 529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:558,39,0 -chr14 34821764 . C T 1524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1553,111,0 -chr14 34856996 . A C 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr14 34892092 . A G 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-1.166;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:562,0,544 -chr14 34892104 . C G 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=-0.507;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.658;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:533,0,470 -chr14 34935569 . C T 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr14 34945272 . A C 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.371;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:945,0,245 -chr14 34957560 . A C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr14 35016380 . A G 607.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:636,45,0 -chr14 35071084 . A T 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=1.732;DP=38;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:764,0,609 -chr14 35071200 . C CT 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=-1.465;DP=65;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=6.69;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:560,0,659 -chr14 35071258 . A G 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=1.058;DP=96;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=11.92;ReadPosRankSum=-2.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:1173,0,2249 -chr14 35074028 . A G 2032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.997;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=19.36;ReadPosRankSum=-2.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:2061,0,1488 -chr14 35076228 . G A 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.178;DP=74;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1071,0,1228 -chr14 35076345 . A T 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-1.523;DP=81;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,48:81:99:1575,0,1020 -chr14 35078426 . G T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.310;DP=67;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:967,0,2451 -chr14 35078432 . G A 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.889;DP=66;FS=0.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:958,0,2440 -chr14 35078447 . G T 2305.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-1.433;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,61:68:29:2334,29,0 -chr14 35081703 . A G 3224.61 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.557;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=29.19;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3253,232,0 -chr14 35084254 . G A 2215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.405;DP=108;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,67:108:99:2244,0,1425 -chr14 35084509 . A G 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=-1.142;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.996;QD=16.37;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:1714,0,1795 -chr14 35084521 . G A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=-1.539;DP=103;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:103:99:1560,0,1809 -chr14 35084726 . G A 2020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.104;DP=119;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,63:119:99:2049,0,1956 -chr14 35092166 . C A 2161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=1.277;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,65:110:99:2190,0,1574 -chr14 35099602 . GCTGCAAAGGGAAACATACAGCCATTACAAAAACCCAAAAATGAAAACGGTCCTAATGAGAACCGGGTAGTTTGGTTTCAC G 2974.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.375;DP=89;FS=1.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,73:87:99:3012,0,2012 -chr14 35151030 . C T 2198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.591;DP=167;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,65:166:99:2227,0,3333 -chr14 35152354 . C T 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.633;DP=102;FS=5.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1277,0,2381 -chr14 35152369 . C T 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.050;DP=96;FS=5.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.643;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,34:96:99:1164,0,2266 -chr14 35155134 . C G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:352,0,404 -chr14 35177559 . C CAT 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-0.205;DP=27;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:500,0,540 -chr14 35177590 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.161;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:501,0,538 -chr14 35177963 . CT C 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.056;DP=35;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:654,0,350 -chr14 35691054 . C T 217.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:246,0,18 -chr14 35691528 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:243,0,129 -chr14 35693070 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.669;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:422,0,1291 -chr14 35693071 . G C 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.910;DP=31;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:659,0,805 -chr14 35765562 . G C 617.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:646,45,0 -chr14 35765677 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.036;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:285,0,501 -chr14 35788548 . G T 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:665,48,0 -chr14 35926546 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:254,0,326 -chr14 36167127 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.318;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=9.63;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:346,0,1669 -chr14 36167774 . G T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=20.38;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:334,0,220 -chr14 36168574 . A T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.198;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,589 -chr14 36168838 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.049;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:301,0,1237 -chr14 36169659 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:72:440,0,72 -chr14 36169913 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-1.505;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=13.77;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:400,0,587 -chr14 36182586 . C CT 251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:20:289,20,0 -chr14 36407549 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.741;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:319,0,329 -chr14 36407686 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.466;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,175 -chr14 36544621 . G A 2483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-0.846;DP=193;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,73:193:99:2512,0,4109 -chr14 36544832 . T C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=1.157;DP=125;FS=33.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,32:125:99:923,0,3605 -chr14 36545328 . GAA G 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=-1.534;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:705,0,1798 -chr14 36545525 . G A 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.538;DP=180;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,65:179:99:2153,0,3774 -chr14 36545709 . G T 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=-1.193;DP=174;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,57:174:99:1462,0,4407 -chr14 36562976 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.617;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:398,0,748 -chr14 36563026 . C A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.104;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:385,0,521 -chr14 36563121 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.366;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:484,0,925 -chr14 36563214 . G A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.589;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:511,0,514 -chr14 36564265 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=1.413;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=16.32;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,337 -chr14 36567138 . T G 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.467;DP=71;FS=6.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1186,0,1287 -chr14 36567192 . A T 1493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.363;DP=86;FS=2.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1522,0,1586 -chr14 36567257 . A T 1095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-1.442;DP=70;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:1124,0,1384 -chr14 36567343 . A C 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-0.428;DP=72;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1261,0,1335 -chr14 36567937 . G A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.321;DP=45;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:304,0,1266 -chr14 36706405 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=-0.883;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:388,0,757 -chr14 36708362 . G A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-1.936;DP=25;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.548;QD=28.67;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:90:745,0,90 -chr14 36708377 . A G 950.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:979,69,0 -chr14 36708729 . G T 823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:852,60,0 -chr14 36708753 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.276;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:336,0,595 -chr14 36712687 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=-0.584;DP=32;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=17.68;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:594,0,558 -chr14 36712863 . G A 654.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-1.957;DP=20;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=32.74;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:26:683,0,26 -chr14 36712868 . A T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-1.504;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=29.59;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:36:645,0,36 -chr14 36713003 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.041;DP=24;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:359,0,327 -chr14 36713230 . T A 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:556,39,0 -chr14 36713345 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.244;DP=13;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,155 -chr14 36713487 . G A 1193.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.740;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.285;QD=30.21;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:48:1222,48,0 -chr14 36713659 . A AT 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.371;DP=17;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:56:392,0,56 -chr14 36713795 . G C 533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:562,39,0 -chr14 36713801 . A T 533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:562,39,0 -chr14 36714268 . G GT 204.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:327,41,0 -chr14 36714432 . C G 549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:578,42,0 -chr14 36714642 . T C 1128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1157,84,0 -chr14 36714657 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.427;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:386,0,636 -chr14 36714720 . A C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=-1.073;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:230,0,304 -chr14 36715923 . G A 792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:821,57,0 -chr14 36716118 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=-0.888;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=20.84;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:52:445,0,52 -chr14 36787887 . G GA 615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.727;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:653,0,336 -chr14 36788027 . G C 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=-1.079;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:686,0,661 -chr14 36791655 . G A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-1.276;DP=49;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=15.08;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:767,0,909 -chr14 36791754 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-0.932;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:531,0,851 -chr14 36893343 . C T 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.356;DP=39;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:908,0,405 -chr14 36941918 . T A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr14 37014114 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:315,0,366 -chr14 37020440 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.362;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,401 -chr14 37095111 . G GA 246.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:284,24,0 -chr14 37097204 . G GA 267.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:305,30,0 -chr14 37446989 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-1.091;DP=67;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:315,0,1963 -chr14 37447008 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=-0.540;DP=69;FS=7.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:434,0,1917 -chr14 37449748 . A G 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=-0.215;DP=95;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=14.37;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,40:95:99:1393,0,2049 -chr14 37488397 . G GA 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.517;DP=46;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:482,0,630 -chr14 37508480 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:429,0,372 -chr14 37520244 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-1.236;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:337,0,337 -chr14 37569788 . GT G 1939.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.537;ClippingRankSum=1.819;DP=163;FS=11.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,85:141:99:1977,0,1079 -chr14 37570283 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.829;DP=33;FS=4.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:427,0,683 -chr14 37572299 . CTAA C 1396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=2.160;DP=49;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.957;QD=28.50;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:99:1434,0,117 -chr14 37635620 . G C 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.221;DP=132;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,49:132:99:1652,0,2770 -chr14 37649052 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=1.088;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.73;ReadPosRankSum=-1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:470,0,628 -chr14 37649126 . CACCTTTTGACAAAAAAAAAAAAAAAAGCATTTCGTAAATTATATAACTTCATATGCTAAGTCTGAGTAAGAAAAATAATCAAGCTTTAGCATTT C 1964.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=2.352;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2002,156,0 -chr14 37657384 . GCTACAGAAACAAACAACAGACTGCGATTAAACCCAAAACTTCCCTCAGATATGAATCACGGAGGGTTACTGTCTGAC G 1482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.271;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=30.59;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:99:1520,0,245 -chr14 37865342 . A T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:239,0,52 -chr14 37884297 . T TG 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.794;DP=19;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:53:346,0,53 -chr14 37884314 . T A 575.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:45:604,45,0 -chr14 37906649 . T C 2453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.534;ClippingRankSum=12.053;DP=330;FS=36.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=7.44;ReadPosRankSum=-11.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,73:329:99:2482,0,20099 -chr14 37907092 . C T 3090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=1.084;DP=633;FS=6.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:479,153:632:99:3119,0,18300 -chr14 37999196 . A G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr14 37999272 . A G 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr14 38025450 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-1.381;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:297,0,177 -chr14 38141038 . G A 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=1.598;DP=49;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:781,0,858 -chr14 38184262 . A T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=1.445;DP=45;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:757,0,774 -chr14 38207531 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-1.056;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:483,0,395 -chr14 38207532 . T G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=-0.803;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=22.74;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:483,0,395 -chr14 38758650 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-1.749;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:264,0,225 -chr14 40046457 . TAC T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,159 -chr14 40049083 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.520;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:363,0,467 -chr14 40062281 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.424;DP=33;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:435,0,672 -chr14 40062391 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-1.727;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:317,0,520 -chr14 40152269 . A G 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=-1.432;DP=80;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1122,0,1668 -chr14 40153652 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,345 -chr14 40182605 . A G 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=3.551;DP=153;FS=34.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=8.36;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,46:153:99:1307,0,4219 -chr14 40182639 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-1.194;DP=119;FS=59.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:241,0,8815 -chr14 40183014 . A T 6836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.931;DP=388;FS=16.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,201:388:99:6865,0,7142 -chr14 40183025 . TA T 4084.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.017;DP=346;FS=12.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,171:327:99:4122,0,4214 -chr14 40194323 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=1.002;DP=22;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:307,0,442 -chr14 40202690 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=0.204;DP=75;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:431,0,4598 -chr14 40202693 . T C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.531;DP=77;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:431,0,4598 -chr14 40202761 . T A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-2.239;DP=104;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=2.88;ReadPosRankSum=2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:328,0,3066 -chr14 40206488 . T C 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.797;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1110,0,1337 -chr14 40212106 . G T 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.543;ClippingRankSum=-1.550;DP=98;FS=13.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,23:94:99:307,0,2526 -chr14 40259432 . A G 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.985;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:414,0,470 -chr14 40287701 . C G 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:82:1216,82,0 -chr14 40287706 . GC G 1178.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:82:1216,82,0 -chr14 40287770 . T TA 802.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.067;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:840,75,0 -chr14 40287838 . A G 1917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=1.582;DP=46;FS=3.840;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=31.94;ReadPosRankSum=1.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1946,132,0 -chr14 40287872 . T A 1677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1706,120,0 -chr14 40288165 . C G 356.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:385,33,0 -chr14 40305879 . T A 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:518,39,0 -chr14 40305909 . T TA 288.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:326,30,0 -chr14 40311830 . G A 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 -chr14 40342928 . C T 2533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.011;DP=154;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,85:152:99:2562,0,2293 -chr14 40343153 . T G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-11.741;ClippingRankSum=0.078;DP=350;FS=369.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,82:349:99:305,0,8836 -chr14 40344378 . AT A 4883.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-1.303;DP=184;FS=3.971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=26.54;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,165:179:99:4921,474,0 -chr14 40344557 . C A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.513;DP=58;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:431,0,1650 -chr14 42078471 . G T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.642;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:707,0,1936 -chr14 42179075 . T G 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.572;DP=169;FS=4.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.706;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,58:168:99:1867,0,3795 -chr14 42179132 . G A 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=2.736;DP=141;FS=7.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,39:125:99:1018,0,3272 -chr14 42180600 . A G 3423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.443;DP=202;FS=10.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,97:202:99:3452,0,3496 -chr14 42181751 . T C 3472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.170;DP=236;FS=7.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.329;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,101:235:99:3501,0,4485 -chr14 42195455 . A C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=2.291;DP=70;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.48;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:902,0,1557 -chr14 42719576 . C CT 1002.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.155;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.348;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:99:1098,107,0 -chr14 42719748 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.172;DP=61;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:357,0,1721 -chr14 42719971 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=1.002;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:496,0,753 -chr14 42726809 . C A 4216.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4245,315,0 -chr14 42733346 . T G 1152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=1.309;DP=95;FS=2.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,33:95:99:1181,0,2223 -chr14 42747709 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.451;DP=50;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:569,0,1162 -chr14 42754715 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.214;DP=187;FS=7.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,36:182:99:587,0,5790 -chr14 42794147 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.462;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:381,0,2043 -chr14 42816099 . G A 1273.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1302,90,0 -chr14 42816121 . T C 1238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1267,90,0 -chr14 42816187 . C T 1277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1306,93,0 -chr14 42834349 . G A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr14 42835156 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr14 42835242 . A T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr14 42895533 . A T 2183.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2212,160,0 -chr14 42895592 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.008;DP=67;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:273,0,2069 -chr14 42919316 . G A 4173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.363;DP=163;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=25.61;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,112:163:99:4202,0,1306 -chr14 42919388 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.500;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=25.53;ReadPosRankSum=-2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:641,0,145 -chr14 42947295 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:392,0,163 -chr14 42948308 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:370,0,435 -chr14 42949615 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.713;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:349,0,449 -chr14 42971009 . A AT 373.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=1.475;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:6:410,0,6 -chr14 43000000 . C CA 851.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.970;DP=70;FS=6.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,38:68:99:889,0,738 -chr14 43000062 . T G 1372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-0.889;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1401,0,1474 -chr14 43000441 . C T 1420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=-1.323;DP=109;FS=6.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:1449,0,2185 -chr14 43003128 . A T 4579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-2.615;DP=312;FS=13.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=14.68;ReadPosRankSum=2.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,128:311:99:4608,0,6401 -chr14 43003499 . A G 4605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-2.202;DP=294;FS=4.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,134:294:99:4634,0,5289 -chr14 43134391 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-0.053;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=28.21;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:536,0,106 -chr14 43135561 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.706;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:334,0,610 -chr14 43274387 . C T 686.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:715,54,0 -chr14 43463956 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=1.014;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.28;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:299,0,517 -chr14 43470335 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr14 43480399 . C T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr14 43492335 . C T 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:831,60,0 -chr14 43496271 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=2.025;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,277 -chr14 43697596 . T A 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:569,42,0 -chr14 44139143 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:94:324,0,94 -chr14 44140145 . T C 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr14 44140643 . G A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 44409189 . A C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.230;DP=49;FS=4.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.73;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:799,0,857 -chr14 44412321 . A AG 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.718;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=17.58;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:84:301,0,84 -chr14 44415774 . G A 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.551;DP=112;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1661,0,2053 -chr14 45821247 . TCTGAAATTAAATCACGGCATGAGTAATCGATGTAAAGATATGAAAATGTTAAAGGAATGATAAAAATACCTAC T 5222.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=1.706;DP=149;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=28.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,131:132:99:5260,546,0 -chr14 45824329 . TCCTGCCACAAAAAAACAAGAGCACAGACTCATTTTCATGGATTCAACATAACTATCATACAGTTATTCTGCTCTATCATGTCTTA T 6416.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.212;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,143:145:99:6454,561,0 -chr14 46026908 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr14 46027854 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.752;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:399,0,48 -chr14 46029476 . C G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr14 46030807 . T G 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr14 47045894 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.339;DP=76;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:238,0,2718 -chr14 47541926 . G T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=-0.267;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:378,0,1164 -chr14 47542043 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=-0.099;DP=40;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:430,0,871 -chr14 47552004 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.720;DP=69;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:284,0,1959 -chr14 47563469 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=-1.328;DP=82;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:411,0,2322 -chr14 47563981 . G C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.948;DP=95;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:472,0,2757 -chr14 47564009 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-0.205;DP=103;FS=4.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:424,0,3103 -chr14 47606774 . ACC A 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=4.017;DP=134;FS=8.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=1.78;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:276,0,3490 -chr14 47666332 . C A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=-0.508;DP=141;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,26:141:99:395,0,4439 -chr14 47689224 . A G 207.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:236,0,23 -chr14 47689996 . C CT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=-0.934;DP=68;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:473,0,862 -chr14 47690994 . C CA 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.816;DP=71;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:359,0,1305 -chr14 47691052 . T A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=1.027;DP=73;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:569,0,2028 -chr14 47732141 . TTG T 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=1.030;DP=17;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=18.04;ReadPosRankSum=-1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:344,0,303 -chr14 47733483 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=1.111;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:283,0,343 -chr14 47736079 . C A 341.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=34.19;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:370,0,16 -chr14 47736361 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.83;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:390,0,84 -chr14 47737201 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:347,0,263 -chr14 47737501 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=24.15;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:487,0,182 -chr14 47738547 . CT C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-1.169;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:280,0,317 -chr14 47744029 . T A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=-0.515;DP=183;FS=3.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:687,0,1111 -chr14 48138968 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=-2.079;DP=45;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=7.73;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:376,0,1128 -chr14 48139462 . C T 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=1.688;DP=53;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.302;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:745,0,1066 -chr14 48145048 . GA G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.083;DP=35;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:319,0,481 -chr14 48274412 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.122;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:465,0,1034 -chr14 48274436 . A T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-1.639;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:465,0,1043 -chr14 48274698 . T TA 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.464;DP=38;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:419,0,398 -chr14 48282198 . C CT 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-2.671;DP=75;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:260,0,1379 -chr14 48286312 . C T 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-1.393;DP=101;FS=6.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,36:101:99:1065,0,2255 -chr14 48290232 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=2.481;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:455,0,793 -chr14 48305593 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:282,0,433 -chr14 48305878 . C A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-0.220;DP=45;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.39;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:631,0,888 -chr14 48306472 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=-0.374;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:370,0,2517 -chr14 48307521 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.165;DP=42;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=13.71;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:604,0,816 -chr14 48362468 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:430,0,244 -chr14 48375093 . T C 2446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.802;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=34.95;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,44:59:99:2475,0,136 -chr14 48375725 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.064;DP=82;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:284,0,2527 -chr14 48376591 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.463;ClippingRankSum=-0.273;DP=171;FS=7.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,54:170:99:986,0,4214 -chr14 48376795 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=1.156;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,44:247:99:644,0,7857 -chr14 48376828 . T C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=1.146;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,39:213:99:568,0,6804 -chr14 48379817 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.221;DP=166;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,41:166:99:935,0,4952 -chr14 48394042 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=-0.353;DP=194;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=2.07;ReadPosRankSum=2.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,32:194:99:430,0,6293 -chr14 48414146 . C T 3126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.066;ClippingRankSum=2.079;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,100:214:99:3155,0,3707 -chr14 48422116 . T C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.233;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,53:219:99:1115,0,6107 -chr14 48424337 . G A 3273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=-0.517;DP=206;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,93:206:99:3302,0,3603 -chr14 48438352 . A G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr14 48441362 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.354;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43:333,0,43 -chr14 48441382 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.107;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=23.91;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:339,0,44 -chr14 48455802 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.265;DP=70;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:244,0,1080 -chr14 48456061 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=1.093;DP=184;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.856;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,40:164:99:828,0,4432 -chr14 48460096 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=3.804;DP=167;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,40:166:99:291,0,6481 -chr14 48460153 . A G 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.328;ClippingRankSum=-0.988;DP=185;FS=1.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.29;ReadPosRankSum=3.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,52:184:99:1007,0,5474 -chr14 48460266 . T G 2556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.154;DP=169;FS=6.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=15.13;ReadPosRankSum=3.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,74:169:99:2585,0,3342 -chr14 48465714 . T C 4958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.486;DP=158;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=31.38;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,131:153:99:4987,0,221 -chr14 48469092 . T G 5790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.644;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=30.64;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,152:173:68:5819,0,68 -chr14 48469203 . G A 1502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.594;DP=134;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,45:128:99:1531,0,2906 -chr14 48469227 . A G 4458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.383;DP=121;FS=1.461;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=32.78;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,109:116:99:4487,245,0 -chr14 48469311 . C T 2162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=2.441;DP=170;FS=11.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,64:149:99:2191,0,3220 -chr14 48472141 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.009;DP=193;FS=8.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,37:177:99:702,0,5275 -chr14 48478521 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=-0.179;DP=101;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:317,0,2877 -chr14 48480221 . A G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-1.686;DP=155;FS=21.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,32:118:99:796,0,3254 -chr14 48488670 . G A 819.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=1.045;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.714;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:16:848,0,16 -chr14 48488691 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-1.976;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.028;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:337,0,551 -chr14 48488706 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.920;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:388,0,513 -chr14 48488759 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.901;DP=45;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:312,0,1002 -chr14 48488826 . G C 1013.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-2.328;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:25:1042,0,25 -chr14 48489061 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.049;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:346,0,854 -chr14 48489138 . A C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.122;DP=19;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.001;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:232,0,368 -chr14 48489333 . A C 1371.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:96:1400,96,0 -chr14 48489336 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=-0.913;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:714,0,375 -chr14 48489423 . A T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.618;DP=38;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=23.76;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:931,0,360 -chr14 48489607 . G T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.295;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:665,0,965 -chr14 48489622 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.583;DP=53;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:263,0,1486 -chr14 48490112 . G A 895.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.042;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:3:922,0,3 -chr14 48490551 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.587;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:416,0,722 -chr14 48490630 . G C 984.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:74:1013,74,0 -chr14 48490735 . G C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=1.204;DP=42;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:580,0,642 -chr14 48490791 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.171;ClippingRankSum=0.680;DP=33;FS=6.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:490,0,459 -chr14 48503785 . G T 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:448,33,0 -chr14 48510252 . C A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.171;DP=35;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:504,0,654 -chr14 48510385 . A G 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.068;DP=73;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1041,0,1281 -chr14 48510462 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=1.003;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:286,0,1841 -chr14 48510544 . T C 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.534;DP=65;FS=6.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:1066,0,1244 -chr14 48510563 . T A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-2.168;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:540,0,1716 -chr14 48510622 . T TA 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.796;DP=76;FS=8.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=7.33;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:594,0,1158 -chr14 48516431 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-1.348;DP=80;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:364,0,2165 -chr14 48517442 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.052;DP=56;FS=4.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:401,0,1212 -chr14 48519127 . T C 2062.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.506;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.311;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,55:63:14:2091,0,14 -chr14 48519361 . T C 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.743;DP=55;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=20.27;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1143,0,672 -chr14 48521286 . G A 2790.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=-0.762;DP=83;FS=1.275;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.742;QD=33.62;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,73:83:4:2817,4,0 -chr14 48524180 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.688;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,18:108:99:233,0,3346 -chr14 48525702 . T A 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.338;DP=99;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,32:96:99:1082,0,2150 -chr14 48527509 . A G 2308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.587;DP=69;FS=2.037;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=33.46;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:99:2337,132,0 -chr14 48527572 . C T 2982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-1.049;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.993;QD=34.80;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,71:78:99:3011,121,0 -chr14 48529790 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=1.422;DP=32;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:866,0,169 -chr14 48529802 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.261;DP=23;FS=10.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=19.42;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:475,0,232 -chr14 48529841 . G C 606.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.349;DP=20;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14:635,14,0 -chr14 48531798 . A T 4254.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=3.128;DP=130;FS=12.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=32.73;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,115:127:99:4283,104,0 -chr14 48532127 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.694;DP=22;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:345,0,309 -chr14 48532192 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.688;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:438,0,309 -chr14 48532219 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.680;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:430,0,174 -chr14 48539016 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=18;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:345,0,537 -chr14 48539025 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.068;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:345,0,537 -chr14 48539146 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.697;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,28:123:99:514,0,3660 -chr14 48539255 . T C 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.096;DP=193;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,49:180:99:1186,0,5189 -chr14 48539441 . C T 3445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=2.272;DP=99;FS=1.470;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=34.81;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,87:95:99:3474,127,0 -chr14 48539531 . T A 240.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=24.09;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:269,0,17 -chr14 48549667 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.665;DP=203;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,50:201:99:1222,0,15728 -chr14 48549668 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=-1.656;DP=203;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,50:201:99:1222,0,15728 -chr14 48571106 . CAA CA,C 546.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=4.016;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=8.67;ReadPosRankSum=-2.608 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,4,26:41:99:942,507,519,151,0,336 -chr14 48571415 . AG A 1521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-2.200;DP=471;FS=22.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,101:438:99:1559,0,20141 -chr14 48571581 . G T 4257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=2.356;DP=188;FS=5.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=22.65;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,126:188:99:4286,0,4055 -chr14 48571606 . C T 4107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=1.507;DP=142;FS=16.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=28.93;ReadPosRankSum=-2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,80:142:99:4136,0,2641 -chr14 48571691 . T TA 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.388;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:286,0,772 -chr14 48572031 . T TA 510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.058;ClippingRankSum=5.232;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=9.29;ReadPosRankSum=-5.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:548,0,680 -chr14 48572330 . GTT G 1528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=4.374;DP=220;FS=6.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,102:154:99:2858,0,3254 -chr14 48572437 . AT A 4494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.757;DP=231;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,170:202:99:4532,0,472 -chr14 48953164 . TA T 1561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-0.694;DP=128;FS=5.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=12.20;ReadPosRankSum=-2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,78:113:99:1599,0,1847 -chr14 48975133 . C T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=1.240;DP=60;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:676,0,1325 -chr14 48983461 . A T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=2.223;DP=30;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:404,0,608 -chr14 48987279 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-2.014;DP=56;FS=13.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:496,0,1451 -chr14 49005760 . T A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.495;DP=49;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:636,0,966 -chr14 49009582 . G A 1486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.986;DP=96;FS=5.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:1515,0,1875 -chr14 49010017 . C T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.750;DP=144;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,44:144:99:1182,0,3925 -chr14 49010064 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.785;DP=141;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,25:141:99:371,0,4854 -chr14 49011018 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.442;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:447,0,2754 -chr14 49011591 . T C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.145;DP=92;FS=1.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:795,0,2350 -chr14 49011727 . C A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.591;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:335,0,3459 -chr14 49012466 . C A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.033;DP=81;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,41:81:99:1512,0,1626 -chr14 49023716 . G A 2210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=-0.727;DP=183;FS=0.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=12.08;ReadPosRankSum=2.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,64:183:99:2239,0,4392 -chr14 49024419 . G T 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=-1.264;DP=142;FS=20.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,23:142:99:318,0,4484 -chr14 49024515 . G A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.063;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,47:148:99:1219,0,3944 -chr14 49024601 . T G 1761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.283;DP=153;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,52:153:99:1790,0,3609 -chr14 49024725 . T C 4861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.407;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=28.05;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,21:30:99:4890,234,0 -chr14 49024731 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.798;DP=34;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:562,0,1059 -chr14 49024828 . G T 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=1.420;DP=159;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,57:159:99:2006,0,4917 -chr14 49025121 . T C 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-1.173;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:570,0,487 -chr14 49025133 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.745;DP=19;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=28.15;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:563,0,143 -chr14 49025461 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.254;DP=60;FS=7.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:510,0,2655 -chr14 49025464 . T C 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.932;DP=60;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1034,0,1142 -chr14 49025465 . T C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.054;DP=59;FS=2.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:829,0,1913 -chr14 49025718 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.647;DP=47;FS=23.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=5.17;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:271,0,2078 -chr14 49026293 . TG T 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=2.539;DP=31;FS=8.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=19.83;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:652,0,1610 -chr14 49026295 . TGTGTGTGTG T 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=2.510;DP=44;FS=9.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=13.97;ReadPosRankSum=-2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:652,0,1591 -chr14 49039915 . A G 3535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=1.846;DP=301;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,108:299:99:3564,0,6427 -chr14 49053939 . C T 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=-0.354;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:602,0,775 -chr14 49065050 . C A 3017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.169;DP=261;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,89:226:99:3046,0,4522 -chr14 49119049 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-1.288;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,372 -chr14 49122450 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:240,0,344 -chr14 49154769 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=1.323;DP=57;FS=9.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:340,0,3693 -chr14 49155041 . TA T 1469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.786;DP=109;FS=3.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,48:107:99:1507,0,1709 -chr14 49156604 . GAA G 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.969;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:669,0,1161 -chr14 49157342 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:258,0,888 -chr14 49157366 . T C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=-0.164;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:662,0,483 -chr14 49157708 . C A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-0.684;DP=59;FS=16.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,29:58:99:1019,0,2165 -chr14 49241945 . TCCTTCAGCAAAAAACAAATTTATAACAAATGCATTTTCCTAACACAATCTAAAAGTACTACAGGAATCGTCTGCACA T 15212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=2.486;DP=403;FS=1.101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=25.95;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,384:396:99:15250,1139,0 -chr14 49242126 . A G 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=1.873;DP=328;FS=13.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,78:327:99:1584,0,9087 -chr14 49250456 . CGTGAGTTACTCTGGAGTGTGCTCATGCCATTTCCGTCTTGTTTTGTGGAGTGTGTGTGTGTGCCTGACTGGATGTTGTGTTTTTGCAG C 1096.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-0.788;DP=385;FS=4.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,345:347:5:1133,5,0 -chr14 49292334 . T A 3540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.121;ClippingRankSum=1.183;DP=257;FS=5.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=13.78;ReadPosRankSum=2.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,113:242:99:3569,0,4276 -chr14 49298550 . GATGTAAGT G 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=1.908;DP=318;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=0.78;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,49:300:99:733,0,8344 -chr14 49300866 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.209;DP=187;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,35:186:99:584,0,6024 -chr14 49619288 . T G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:299,0,295 -chr14 49799359 . A C 1327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.390;DP=113;FS=3.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:1356,0,1859 -chr14 49799509 . A G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=1.228;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:825,0,1569 -chr14 49799540 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.763;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:282,0,2143 -chr14 49809682 . G A 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.308;DP=72;FS=4.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1419,0,1015 -chr14 49809722 . T TA 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=1.537;DP=46;FS=2.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:669,0,415 -chr14 49810094 . T A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.620;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:629,0,635 -chr14 49810692 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-1.110;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.88;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:322,0,1042 -chr14 49811305 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.746;DP=21;FS=10.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.025;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,414 -chr14 49811453 . T G 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.613;DP=47;FS=11.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=19.93;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:965,0,721 -chr14 49811476 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-1.304;DP=48;FS=2.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:374,0,1328 -chr14 49811896 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=31.27;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:57:685,0,57 -chr14 49812499 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.265;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:724,0,5765 -chr14 50728538 . G C 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-1.081;DP=58;FS=9.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=16.58;ReadPosRankSum=2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:990,0,971 -chr14 50728835 . G A 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.548;DP=48;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:980,0,628 -chr14 50731139 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.273;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:289,0,862 -chr14 50858081 . C G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.761;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:477,0,892 -chr14 50967014 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.692;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=11.36;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:403,0,737 -chr14 51125028 . C T 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.175;DP=184;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,49:184:99:1089,0,5061 -chr14 51127919 . A G 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.340;DP=202;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,57:202:99:1314,0,5340 -chr14 51144802 . TAC T 737.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.255;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:775,0,1225 -chr14 51150516 . A T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=1.681;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=21.17;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:367,0,220 -chr14 51150562 . C A 968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1000,69,0 -chr14 51150617 . T G 3971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:99:4000,297,0 -chr14 51150661 . C G 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:571,39,0 -chr14 51150693 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.206;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:285,0,417 -chr14 51150727 . C CAA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.812;ClippingRankSum=0.654;DP=82;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=2.83;ReadPosRankSum=-4.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:305,0,2170 -chr14 51150758 . C T 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-2.959;DP=178;FS=4.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=11.30;ReadPosRankSum=2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,60:178:99:2039,0,4170 -chr14 51150913 . T C 4293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.780;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=24.68;ReadPosRankSum=3.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,117:170:99:4322,0,1385 -chr14 51150950 . A T 2771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=-1.334;DP=170;FS=9.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=16.30;ReadPosRankSum=-3.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,80:167:99:2800,0,2850 -chr14 51150983 . C T 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=1.544;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.119;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,51:174:99:1350,0,6837 -chr14 51150986 . T A 4406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=-1.212;DP=170;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=25.92;ReadPosRankSum=3.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,113:166:99:4435,0,1370 -chr14 51220100 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,378 -chr14 51254970 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.419;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:499,0,795 -chr14 51265245 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.156;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:413,0,842 -chr14 51265302 . CT C 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.542;DP=52;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:257,0,846 -chr14 51277099 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-1.170;DP=29;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:334,0,669 -chr14 51289094 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-1.954;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:363,0,430 -chr14 51290170 . A C 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.031;DP=28;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=29.46;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:853,0,251 -chr14 51290393 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.692;DP=24;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:381,0,791 -chr14 51290397 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.939;DP=21;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:381,0,803 -chr14 51290488 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=-3.295;DP=84;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:393,0,1202 -chr14 51290511 . C T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.519;DP=69;FS=11.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1022,0,809 -chr14 51291045 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:322,0,354 -chr14 51331334 . C CA 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.358;DP=25;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,398 -chr14 51332428 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.88;ReadPosRankSum=1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:330,0,391 -chr14 51336579 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.617;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:268,0,2276 -chr14 51378899 . G C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.652;DP=81;FS=15.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.878;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:386,0,2858 -chr14 51384120 . G C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.865;DP=95;FS=2.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=4.49;ReadPosRankSum=2.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:455,0,2866 -chr14 51386399 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=-0.919;DP=90;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=6.18;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:584,0,2472 -chr14 51392614 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=-0.248;DP=98;FS=3.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,17:95:99:247,0,2999 -chr14 51395720 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.652;DP=36;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:299,0,932 -chr14 51470891 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,139 -chr14 51471181 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,159 -chr14 51471538 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:319,0,105 -chr14 51530634 . C T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr14 51691784 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.344;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:592,0,697 -chr14 51748445 . AC A 789.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=2.531;DP=36;FS=4.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=21.94;ReadPosRankSum=-4.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:827,0,2088 -chr14 51748447 . ACACAC A 789.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.429;ClippingRankSum=2.362;DP=37;FS=4.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=21.34;ReadPosRankSum=-4.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:827,0,2162 -chr14 51939532 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:91:394,0,91 -chr14 51941829 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-2.758;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=22.63;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:345,0,113 -chr14 52514095 . C T 1698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.608;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=22.35;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,49:76:99:1727,0,910 -chr14 52551115 . C A 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:33:443,33,0 -chr14 53213170 . G A 2971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-0.935;DP=170;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,96:170:99:3000,0,2551 -chr14 53213332 . C T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-1.391;DP=80;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:939,0,1734 -chr14 53213724 . T A 3209.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.090;DP=185;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,100:184:99:3238,0,3912 -chr14 53213834 . G T 2102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.023;DP=193;FS=0.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,65:193:99:2131,0,4368 -chr14 53214041 . C T 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.066;DP=137;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,46:137:99:1225,0,3859 -chr14 53214078 . A T 1324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=1.045;DP=167;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,52:167:99:1353,0,4611 -chr14 53214301 . T C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-2.964;DP=168;FS=7.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,38:167:99:790,0,6312 -chr14 53214568 . AGT A 3483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.538;DP=117;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=29.78;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,90:113:99:3521,0,437 -chr14 53214791 . C CTG 1863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-0.005;DP=107;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,60:83:99:1901,0,443 -chr14 53215001 . GTA G 1732.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1770,144,0 -chr14 53215196 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.422;DP=138;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.685;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,26:138:99:380,0,4324 -chr14 53215247 . A G 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.491;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,37:159:99:742,0,5346 -chr14 53215494 . T C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.388;DP=130;FS=4.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,35:130:99:794,0,3735 -chr14 53215921 . GTT G 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.261;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:506,0,265 -chr14 53216074 . G A 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=1.424;DP=100;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:100:99:1275,0,1958 -chr14 53290762 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=-0.212;DP=20;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:267,0,272 -chr14 53290802 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-0.146;DP=25;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:332,0,521 -chr14 53293304 . ATG A 373.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:26:405,26,0 -chr14 53293512 . G A 3456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.938;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.110;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,84:120:99:3485,0,793 -chr14 53294046 . G A 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=-1.223;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=33.04;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:85:1457,85,0 -chr14 53294055 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.281;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=31.65;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,32:34:46:1328,0,46 -chr14 53294736 . TCTGCAGGACACACACAGCATATTCATGCATCTGTCTGTGCTGCTGTGCATCTTTTGTGTGTGATCGCTTCATCTGTAACCAGTAACGTGTGTGTGTGTGTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC T 6536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=2.170;DP=168;FS=2.454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,163:166:99:6574,485,0 -chr14 53295152 . G A 2013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=-3.062;DP=92;FS=0.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:2042,0,963 -chr14 53295376 . T C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=-0.165;DP=110;FS=4.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:585,0,3122 -chr14 53316699 . T A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.522;DP=33;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=16.84;ReadPosRankSum=-2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:584,0,613 -chr14 53318348 . A G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.425;DP=35;FS=5.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.949;QD=19.22;ReadPosRankSum=3.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:701,0,853 -chr14 53318424 . G A 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.223;DP=34;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=24.96;ReadPosRankSum=2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:877,0,963 -chr14 53318486 . TCTCTGATTGGTCAGTTTGGAGCTC T 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=1.182;DP=17;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:354,0,200 -chr14 53351225 . A G 2122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.651;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:99:2151,0,1263 -chr14 53357456 . AGCAGGTGAGACCGTGTGATGTGTGTGTGTTGTGTGTGTATTCTGTGTGTGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT A 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-0.880;DP=25;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=22.47;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:599,0,1137 -chr14 53361514 . TCAGGTGTGTGTTCTGTCCAGTACAGGTGTGTGTTGGTCATGCAGCACAGGTGTGTGTGTGTGTGATGTCTCTCTCTCTCTCTCCG T 1037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.760;DP=30;FS=2.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=34.59;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1075,0,114 -chr14 53362256 . T C 2727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.118;DP=219;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,82:219:99:2756,0,4575 -chr14 53362321 . G A 2230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.204;DP=147;FS=4.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,70:147:99:2259,0,3582 -chr14 53362413 . G A 2327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-2.100;DP=137;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=16.99;ReadPosRankSum=2.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,68:136:99:2356,0,2876 -chr14 53370217 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:486,0,80 -chr14 53372065 . C T 2532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.017;DP=367;FS=3.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,104:363:99:2561,0,9692 -chr14 53372143 . CACCTGCACACACAGACGCGTCAAACACACTGATGTACACACACACCCCTATACACACAGCACACCACCAGCGCGCGCTCTG C 20319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.458;DP=468;FS=3.452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,464:465:99:20357,1683,0 -chr14 53372236 . G A 2760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=-0.811;DP=455;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,120:454:99:2789,0,12874 -chr14 53402002 . A C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=1.268;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=25.44;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:359,0,109 -chr14 53412247 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:491,0,584 -chr14 53412408 . A C 1569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1598,117,0 -chr14 53412521 . C T 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:584,39,0 -chr14 53412523 . A G 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:584,39,0 -chr14 53413219 . C A 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:686,48,0 -chr14 53413267 . T C 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr14 53413676 . G A 1105.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1134,78,0 -chr14 53413752 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=-1.467;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,177 -chr14 53414365 . G T 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 -chr14 53414412 . A T 633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:662,45,0 -chr14 53414836 . T G 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr14 53414958 . A G 642.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.771;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=29.98;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:670,9,0 -chr14 53415105 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 53415106 . C G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr14 53420159 . TGC T 1088.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.667;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=34.33;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:76:1126,76,0 -chr14 53420448 . TGA T 677.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.882;DP=25;FS=2.481;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,22:25:1:712,1,0 -chr14 53453983 . T A 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=3.153;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=27.08;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:597,0,156 -chr14 53454191 . G A 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr14 53455341 . T G 207.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr14 53461071 . ATG A 283.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:32:321,32,0 -chr14 53461130 . A AAC 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.849;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:443,0,104 -chr14 53461492 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=5.130;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:383,0,2550 -chr14 53461580 . T G 2461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.707;DP=64;FS=8.548;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=30.82;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,60:64:99:2490,143,0 -chr14 53461667 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.150;DP=28;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:259,0,207 -chr14 53466860 . G A 2316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.429;DP=121;FS=8.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,71:121:99:2345,0,1686 -chr14 53495086 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-1.110;DP=47;FS=3.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:239,0,1198 -chr14 53501334 . C T 2196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=1.462;DP=114;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,71:114:99:2225,0,1544 -chr14 53509081 . CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT C 224.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:23:262,23,0 -chr14 53509149 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.517;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.741;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:246,0,1241 -chr14 53510211 . T G 1300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:99:1329,106,0 -chr14 53510250 . CT C 535.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,1:23:99:573,0,752 -chr14 53512112 . A C 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=3.843;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=14.53;ReadPosRankSum=-1.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,40:94:99:1394,0,1842 -chr14 53512587 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.395;DP=176;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,29:175:99:452,0,11728 -chr14 53539058 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=1.525;DP=120;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,25:120:99:320,0,6568 -chr14 53557811 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.753;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:322,0,1192 -chr14 53558098 . CGTCTGGTGTTTAACACTAGTCTAGAGTGCCATCTGGTGTTTAATACTAGTCTAGAGTGCCATCTGGTGTTTAACACTAGTCTAGAGTGCT C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-2.914;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:393,0,987 -chr14 53560567 . G GT 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.487;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:296,0,384 -chr14 53561554 . C G 5274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.225;DP=234;FS=4.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,106:131:99:5303,0,292 -chr14 53561556 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=1.401;DP=233;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,23:133:99:343,0,5314 -chr14 53561617 . A T 5276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=1.574;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=34.92;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,46:48:99:5305,0,214 -chr14 53561747 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.446;DP=92;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.889;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:331,0,1638 -chr14 53566006 . G C 244.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:273,0,15 -chr14 53566017 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:386,0,48 -chr14 53569659 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.524;DP=55;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=19.20;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,33:55:99:1084,0,742 -chr14 53569779 . T C 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1081,81,0 -chr14 53569797 . G C 1029.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1058,81,0 -chr14 53569923 . T G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.551;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:363,0,164 -chr14 53570058 . C G 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.144;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:642,0,662 -chr14 53570281 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-1.219;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:491,0,711 -chr14 53570376 . C T 1819.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1848,132,0 -chr14 53570382 . T C 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-1.123;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:651,0,632 -chr14 53570464 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=1.311;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:690,0,215 -chr14 53570501 . G T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:887,63,0 -chr14 53570593 . G C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.574;DP=37;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=11.91;ReadPosRankSum=2.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:469,0,782 -chr14 53573729 . T A 4622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.585;ClippingRankSum=-1.825;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,131:184:99:4651,0,1327 -chr14 53576681 . A G 8847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=219;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,218:218:99:8876,641,0 -chr14 53576711 . C T 3673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.233;DP=214;FS=0.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,102:213:99:3702,0,3677 -chr14 53576771 . G A 1459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=-1.280;DP=236;FS=4.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=6.19;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,63:236:99:1488,0,6420 -chr14 53582138 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=2.966;DP=214;FS=17.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=4.01;ReadPosRankSum=-2.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,48:213:99:887,0,6369 -chr14 53591252 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=3.952;DP=207;FS=17.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,31:206:99:272,0,6674 -chr14 53654211 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.648;DP=17;FS=10.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:315,0,206 -chr14 53715944 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-2.532;DP=32;FS=8.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:412,0,1088 -chr15 3214 . G A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.240;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,42:159:99:1019,0,4481 -chr15 3243 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.274;DP=147;FS=3.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,37:147:99:844,0,4163 -chr15 19442 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.790;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=6.13;ReadPosRankSum=2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:249,0,1429 -chr15 25547 . C G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.221;DP=66;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:368,0,1844 -chr15 25675 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-1.812;DP=66;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:474,0,1487 -chr15 25745 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-1.440;DP=65;FS=10.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:366,0,1735 -chr15 25766 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=-0.010;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:265,0,1481 -chr15 65494 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.662;DP=50;FS=4.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.963;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:407,0,1678 -chr15 66488 . T G 2076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.052;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,82:278:99:2105,0,7510 -chr15 100027 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=-1.299;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:234,0,1427 -chr15 424854 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr15 599925 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.856;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=21.32;ReadPosRankSum=1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:753,0,389 -chr15 599937 . T C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=1.826;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=22.43;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:701,0,317 -chr15 622061 . A G 1909.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1938,138,0 -chr15 764400 . G T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.331;DP=35;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:333,0,850 -chr15 764608 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.554;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:422,0,984 -chr15 783042 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-1.356;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:306,0,291 -chr15 783472 . T A 389.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:5:417,0,5 -chr15 787620 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=-2.025;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,308 -chr15 825951 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.263;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:345,0,484 -chr15 838241 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.398;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,310 -chr15 846982 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=1.873;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=24.32;ReadPosRankSum=-1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:466,0,564 -chr15 846997 . A C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=1.266;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:472,0,564 -chr15 859340 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.52;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,214 -chr15 859621 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.465;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:475,0,390 -chr15 860207 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:252,0,355 -chr15 861080 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,307 -chr15 874516 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-1.268;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:257,0,186 -chr15 882434 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=21.14;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,185 -chr15 891012 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=-2.383;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=13.80;ReadPosRankSum=2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:594,0,948 -chr15 891061 . A C 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=3.645;DP=51;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=12.45;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:663,0,1346 -chr15 891183 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.673;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=19.43;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:689,0,1027 -chr15 892535 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:243,0,52 -chr15 901447 . A C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:305,0,53 -chr15 907298 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=2.353;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=19.59;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:420,0,276 -chr15 907361 . C T 240.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:269,0,16 -chr15 909988 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=22.81;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:302,0,84 -chr15 910004 . A C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:324,0,125 -chr15 912793 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:249,0,428 -chr15 919116 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.818;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=22.08;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:249,0,125 -chr15 987143 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.374;DP=49;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:320,0,1764 -chr15 988245 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=-1.836;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:250,0,2059 -chr15 1041215 . CT C 205.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:22:243,22,0 -chr15 1041300 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-1.260;DP=32;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:253,0,678 -chr15 1098021 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=25.15;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:76:330,0,76 -chr15 1213076 . AT A 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-2.554;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=18.38;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:460,0,780 -chr15 1656938 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.652;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:604,0,1864 -chr15 1663197 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.948;DP=102;FS=5.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:629,0,2913 -chr15 1667580 . A G 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.690;DP=28;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:812,0,175 -chr15 1725635 . AACCTGGAAGAAACACACACACAGCAGCTGAGCACGGGAGACTGACACACATTCAGAAGATCGATCCTCCAGAGTCTG A 888.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.083;DP=21;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=27.44;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:72:926,72,0 -chr15 1817694 . C T 2424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.801;DP=405;FS=0.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,113:401:99:2453,0,10820 -chr15 1818670 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=-0.988;DP=70;FS=1.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:233,0,1843 -chr15 1830634 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.200;DP=575;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=0.38;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:500,73:573:99:245,0,19508 -chr15 1837404 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.340;DP=52;FS=9.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:339,0,2025 -chr15 2462129 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:244,0,871 -chr15 2518175 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.373;DP=148;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,28:148:99:460,0,4727 -chr15 2520123 . C CA 484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=-0.297;DP=132;FS=3.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,34:121:99:522,0,2365 -chr15 2525848 . GCAGGTAAACAGTAGTGGGGGGTGATTGGTGTGTAATTGAACACACTGATGTTGATCTGATGTGGTGGTCTGCTA G 4225.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=1.615;DP=109;FS=1.810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,104:109:99:4263,343,0 -chr15 2534488 . G C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=1.817;DP=52;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:300,0,2145 -chr15 2552070 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.291;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:312,0,486 -chr15 2570468 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=1.792;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=15.34;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,225 -chr15 2572120 . C T 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=-2.773;DP=79;FS=5.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:1049,0,1182 -chr15 2573031 . C CA 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:414,0,115 -chr15 2630388 . T TA 550.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-1.597;DP=121;FS=2.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,38:106:99:588,0,1678 -chr15 2665497 . A C 345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:374,30,0 -chr15 2720965 . T C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-1.318;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=32.46;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:580,0,120 -chr15 2720969 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-2.014;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:465,0,209 -chr15 2721169 . T C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:76:592,0,76 -chr15 2721517 . T C 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.391;DP=53;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,10:51:99:781,0,1789 -chr15 2721558 . T C 3582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-3.070;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=30.26;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,41:52:47:3611,47,0 -chr15 2722142 . C CT 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.120;DP=125;FS=4.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:569,0,2704 -chr15 2736429 . TACCTTGACAAGAAAACACACATTTTTAAGTAATCCATTGATCATTCACGCACAAATGTTTGTAATGTTGCGAGCGCTC T 8018.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=1.714;DP=187;FS=3.081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=31.11;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,186:187:99:8056,612,0 -chr15 2769280 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.057;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:243,0,1026 -chr15 3071751 . T G 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-0.854;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=30.03;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:32:929,0,32 -chr15 3268493 . CA C 203.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:241,24,0 -chr15 3508867 . T A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.567;DP=48;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:373,0,501 -chr15 3508873 . A C 901.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:930,63,0 -chr15 3508933 . A G 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr15 3508987 . T C 696.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:51:725,51,0 -chr15 3630856 . GC G 913.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:951,66,0 -chr15 4034785 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:261,0,746 -chr15 4034790 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:261,0,746 -chr15 4286902 . C T 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.449;ClippingRankSum=0.117;DP=129;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,43:129:99:1011,0,3185 -chr15 4407435 . C T 474.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=33.87;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:501,0,4 -chr15 4407537 . C T 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 -chr15 4407775 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.302;DP=52;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1071,0,641 -chr15 4412576 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-1.381;DP=68;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=11.28;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:795,0,1450 -chr15 4419313 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.922;DP=61;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:390,0,1696 -chr15 4426765 . C G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.611;DP=46;FS=1.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=11.39;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:552,0,1118 -chr15 4426779 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-2.447;DP=46;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:387,0,1253 -chr15 4444407 . A C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.832;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=2.71;ReadPosRankSum=2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:315,0,7013 -chr15 4444408 . A C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-1.310;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=2.71;ReadPosRankSum=2.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:315,0,7013 -chr15 4493855 . G A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.373;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:627,0,331 -chr15 4828131 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=-0.849;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:325,0,604 -chr15 4839976 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-0.356;DP=44;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:295,0,1188 -chr15 4840475 . G T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.697;DP=54;FS=7.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:248,0,1624 -chr15 4858147 . G C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.787;DP=210;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,34:208:99:383,0,8816 -chr15 4859126 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.030;DP=150;FS=6.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:472,0,5004 -chr15 4998959 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:286,0,405 -chr15 5006643 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.140;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.671;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:359,0,320 -chr15 5420523 . T G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-1.064;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,373 -chr15 5477997 . C T 1592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.932;DP=56;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=28.44;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,43:56:99:1621,0,305 -chr15 5567223 . A C 208.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:237,0,21 -chr15 5574639 . C T 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:261,21,0 -chr15 5590192 . G A 355.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=29.61;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:383,0,9 -chr15 5590216 . G T 452.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=32.35;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:479,0,2 -chr15 5616846 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.626;DP=39;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:361,0,695 -chr15 5692991 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=3.283;DP=22;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.85;ReadPosRankSum=-3.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:399,0,756 -chr15 5692992 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=3.345;DP=21;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=17.66;ReadPosRankSum=-3.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:399,0,756 -chr15 5764915 . CCACCTGTATGAAGAGAAACAAATGTGCACTGACAAAGCCTTCCCTAAACATACAAAGAATAAAAAAGGACAAGTAGTTGAAAATTCAGTCCATCT C 2014.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=1.662;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=30.39;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2052,191,0 -chr15 5792929 . CA C 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-1.299;DP=48;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=7.14;ReadPosRankSum=-2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:42:99:535,0,524 -chr15 5793094 . CT C 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=3.146;DP=295;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=1.68;ReadPosRankSum=-3.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:532,0,4416 -chr15 5793654 . TCTGGAAAAAAGAACCATGCATTAGCCAGGCACATGATAAAATTGTAAACAACAATGAAATTAGCGAGTCTGACAAAACCAACTTAC T 21531.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=4.099;DP=529;FS=1.517;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=27.24;ReadPosRankSum=-1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,521:528:99:23702,1810,0 -chr15 5793770 . GCTGTTTATGTGGAGAAAACAAGAAATTAAGAAAACAAGACAAACTTGTAACAGTTGTGTTCAAGAATGTGTTAAATGCCACAGTAAAAGAGGCAAACTTAC G 24654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=3.449;DP=642;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=29.95;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,627:640:99:26428,0,2882 -chr15 5860823 . C CT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-1.417;DP=225;FS=14.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,32:188:99:321,0,3206 -chr15 5861011 . G GT 1436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.004;DP=130;FS=4.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,89:112:99:1778,0,326 -chr15 5862470 . T C 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-2.556;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=21.61;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:671,0,124 -chr15 5863872 . G T 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.920;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:1276,0,4643 -chr15 5864017 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.894;DP=89;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:464,0,2717 -chr15 6450694 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=23.13;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:352,0,173 -chr15 6540001 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=-0.418;DP=393;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=3.99;ReadPosRankSum=3.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,82:393:99:1595,0,12163 -chr15 6563089 . T C 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=3.772;DP=39;FS=12.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=25.05;ReadPosRankSum=-2.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1005,0,120 -chr15 6685023 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.823;DP=95;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=3.50;ReadPosRankSum=2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:361,0,2931 -chr15 6692649 . T TA 904.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-3.623;DP=55;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=16.45;ReadPosRankSum=3.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,26:46:99:942,0,1169 -chr15 6728188 . A C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=2.143;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:371,0,535 -chr15 6728248 . A G 2022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=1.246;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=28.42;ReadPosRankSum=-2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:2051,0,106 -chr15 6728828 . T A 1068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:90:1097,90,0 -chr15 6728887 . A T 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:324,24,0 -chr15 6728914 . G A 395.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-2.620;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=28.27;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:6:423,0,6 -chr15 6736310 . T A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-2.478;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,31:154:99:585,0,4784 -chr15 6833661 . C G 1036.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.600;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=32.27;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:1065,75,0 -chr15 6868954 . T G 3918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.119;DP=153;FS=9.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,103:153:99:3947,0,1393 -chr15 6873696 . T A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=4.748;DP=60;FS=11.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:747,0,1383 -chr15 6873759 . T A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-1.717;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=13.48;ReadPosRankSum=-3.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:527,0,766 -chr15 6873838 . G GA 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.136;DP=57;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=14.38;ReadPosRankSum=-2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:859,0,581 -chr15 7114623 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr15 7115001 . AAAGGTAAGAAAATATTGCATTGTCTTAAATGTCAAAAAGGAATGGAGATTTGTATTATGTTTAAACACACATATGCTAATTCCATGTTTCTTAACTTCTT A 7778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=1.003;DP=200;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=32.61;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,182:188:99:7816,525,0 -chr15 7117709 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-3.193;DP=93;FS=9.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=3.47;ReadPosRankSum=3.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:351,0,5977 -chr15 7117715 . T A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-3.022;DP=93;FS=7.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:413,0,2837 -chr15 7117979 . T TA 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.476;DP=51;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:362,0,652 -chr15 7228840 . G GA 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.065;DP=63;FS=12.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:720,0,543 -chr15 7229775 . T TA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.711;DP=33;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:288,0,394 -chr15 7471044 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:272,0,254 -chr15 7471077 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:279,0,174 -chr15 8267599 . C A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.289;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=16.56;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:641,0,610 -chr15 8411258 . G C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.583;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.718;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,432 -chr15 8475468 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.678;DP=18;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=13.26;ReadPosRankSum=-1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:267,0,876 -chr15 8475885 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:242,0,105 -chr15 8476451 . A T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-2.729;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=26.11;ReadPosRankSum=2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:446,0,111 -chr15 8740226 . ACC A 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-1.140;DP=46;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:406,0,1200 -chr15 8934381 . A G 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=-1.181;DP=327;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.433;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,70:324:99:1239,0,13381 -chr15 8934457 . T A 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=-1.762;DP=264;FS=12.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,74:261:99:1842,0,7597 -chr15 9126710 . C CA 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=-1.578;DP=91;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:334,0,1366 -chr15 9376618 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=4.654;DP=125;FS=11.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=2.05;ReadPosRankSum=-5.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:284,0,3827 -chr15 9445388 . G A 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.766;DP=69;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.598;QD=17.49;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1235,0,1646 -chr15 9447243 . G T 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.105;DP=61;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,35:60:99:1154,0,957 -chr15 9452401 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=1.826;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=5.61;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:247,0,1721 -chr15 9456644 . TA T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.341;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:324,0,518 -chr15 9488271 . C A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.871;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:893,0,2119 -chr15 9488279 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.194;DP=52;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:893,0,2173 -chr15 9488361 . T A 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=-0.394;DP=52;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,34:52:99:1238,0,610 -chr15 9488398 . C A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.370;DP=38;FS=2.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:603,0,802 -chr15 9488464 . C A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=1.920;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=21.58;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:870,0,1204 -chr15 9488474 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.841;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:860,0,1204 -chr15 9488753 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.473;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:668,0,363 -chr15 9488861 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.146;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=20.15;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:391,0,527 -chr15 9488863 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-0.741;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=21.34;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:391,0,527 -chr15 9489187 . A T 1736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.367;DP=77;FS=3.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=22.56;ReadPosRankSum=-2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,50:76:99:1765,0,870 -chr15 9489401 . G A 7075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.066;DP=138;FS=4.248;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,123:135:99:7104,392,0 -chr15 9489471 . T G 1563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=1.211;DP=94;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,44:91:99:1592,0,2171 -chr15 9489510 . A C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.630;ClippingRankSum=-1.008;DP=44;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=8.74;ReadPosRankSum=-4.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:413,0,1505 -chr15 9489549 . T A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.525;DP=35;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.275;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:912,0,649 -chr15 9489670 . A G 4119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=1.260;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=25.11;ReadPosRankSum=-1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,95:104:27:4148,0,27 -chr15 9489671 . T C 4119.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.330;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=34.26;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,95:104:17:4148,0,17 -chr15 9489814 . G C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=4.420;DP=50;FS=14.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=12.64;ReadPosRankSum=-2.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:660,0,1856 -chr15 9489815 . G T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=3.946;DP=47;FS=9.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.97;ReadPosRankSum=-2.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:732,0,1312 -chr15 9489832 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-1.395;DP=27;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:337,0,534 -chr15 9490397 . T G 3048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.265;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=25.62;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,83:113:99:3077,0,1317 -chr15 9490650 . T A 3365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.583;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=32.66;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,73:79:99:3394,170,0 -chr15 9490673 . A G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.714;DP=123;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:535,0,4057 -chr15 9490834 . TA T 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-1.215;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=24.92;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:411,0,223 -chr15 9490993 . T C 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-1.022;DP=178;FS=6.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:886,0,6237 -chr15 9492012 . T C 1620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.332;DP=62;FS=13.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,43:59:99:1649,0,514 -chr15 9492233 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:338,0,255 -chr15 9492390 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=3.001;DP=29;FS=9.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=13.61;ReadPosRankSum=-3.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:423,0,479 -chr15 9492479 . A T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.575;DP=41;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:843,0,622 -chr15 9492522 . G A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=-1.814;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:741,0,710 -chr15 9492647 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:413,0,335 -chr15 9492893 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.805;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=26.12;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:838,0,307 -chr15 9493144 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=4.399;DP=34;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.432;QD=14.93;ReadPosRankSum=-3.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:536,0,753 -chr15 9493500 . A G 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=2.185;DP=22;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=25.26;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:584,0,191 -chr15 9493765 . T A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42:394,0,42 -chr15 9493779 . A C 323.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.39;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:352,0,16 -chr15 9494154 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-2.083;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:418,0,252 -chr15 9495426 . G T 1562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=-1.315;DP=68;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,45:61:99:1725,0,410 -chr15 9495462 . T C 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.927;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,42:51:99:1680,0,179 -chr15 9495515 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-2.285;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:300,0,211 -chr15 9496747 . CT C 341.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:376,0,1 -chr15 9498918 . A C 268.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:297,0,19 -chr15 10299359 . GT G 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.598;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:359,0,226 -chr15 10340275 . A T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=2.487;DP=39;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=15.71;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:641,0,695 -chr15 10389057 . G T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=1.236;DP=57;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.736;QD=17.84;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:1045,0,909 -chr15 10428217 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:246,0,62 -chr15 10534574 . A G 250.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:279,0,19 -chr15 10925352 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.185;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:618,0,244 -chr15 10925475 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=3.018;DP=27;FS=6.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:560,0,295 -chr15 10942407 . C T 1868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.302;DP=61;FS=5.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=30.64;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,51:61:95:1897,0,95 -chr15 10988889 . A T 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-1.187;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:93:424,0,93 -chr15 10989331 . C T 1513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.378;DP=51;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,40:51:99:1542,0,224 -chr15 11107798 . A T 456.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:33:485,33,0 -chr15 11107956 . A C 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 -chr15 11112280 . C A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-2.088;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,375 -chr15 11118631 . A T 1110.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1139,81,0 -chr15 11837737 . G T 1534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=1.417;DP=98;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:1563,0,1794 -chr15 11845494 . A G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.080;DP=77;FS=6.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:977,0,1210 -chr15 11859456 . A G 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.651;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:1748,0,2048 -chr15 11859570 . G T 1984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.174;DP=108;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:2013,0,1645 -chr15 11864665 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:270,0,331 -chr15 11896437 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-2.071;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,431 -chr15 12146873 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:372,0,249 -chr15 12935578 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.051;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:440,0,624 -chr15 12939382 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,252 -chr15 12939599 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=-1.220;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=18.12;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,273 -chr15 12996769 . G GT 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:260,0,149 -chr15 13003783 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.076;DP=38;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:867,0,499 -chr15 13003919 . CT C 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.488;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:483,0,574 -chr15 13004228 . G T 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.097;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1069,0,888 -chr15 13026151 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,300 -chr15 13564528 . C CA 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.348;DP=79;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:425,0,1291 -chr15 13565991 . GT G 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.377;DP=38;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:245,0,389 -chr15 13780216 . A C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.509;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:525,0,142 -chr15 13988329 . CGTAAGTCCAGGAGACATATTTAAATATTTCCCACTGATCCTTTTTTTTTTAAATCAAAACCAACATTTGACTAATTGTGTTTATTTGCTTCTTTTCAG C 2611.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.318;DP=73;FS=4.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=31.10;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,62:72:99:2649,0,249 -chr15 13989595 . GGCAGGTGATCTAAAAATTTTGTCATTTGTCATGTTAGATAAAGTCCTGATGCTCATAGAACTTTGAGAACTTTATTTACATAAGGAGACACTCTAT G 2767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.812;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=26.65;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,67:70:99:2805,241,0 -chr15 14009632 . G A 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=1.616;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.071;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:747,0,2258 -chr15 14009641 . T G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=1.784;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:747,0,2254 -chr15 14068106 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.121;DP=155;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,24:155:99:274,0,5210 -chr15 14112796 . ACTGCAGACAGCACACAAATACACAACCATCAAGACCGCATTTCTCAAGGTGGAATGAAATATCTGATTTAATATAAATAATATATAGAAATGATACTCAC A 4755.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.144;DP=118;FS=3.050;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.006;QD=30.87;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,109:111:99:4793,349,0 -chr15 14243097 . GCTGTATAAGACGAAAGAAAGAAAAGGGTTTTGTTATGGTTCACCACAGACTTATAATGGTTTCGGATTATAAAATGAGCCGGTTAC G 1686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=3.276;DP=51;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=33.07;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:1724,0,407 -chr15 14368985 . A AT 888.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.855;DP=139;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,50:134:99:926,0,1975 -chr15 14606108 . C T 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=1.547;DP=78;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:1192,0,1490 -chr15 14606132 . C T 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.539;DP=69;FS=8.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:880,0,1402 -chr15 14611656 . C G 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.004;DP=92;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.451;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,35:91:99:890,0,3123 -chr15 14611799 . C A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=-0.269;DP=46;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:544,0,943 -chr15 15092073 . GA G 3014.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-4.087;DP=276;FS=34.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=10.92;ReadPosRankSum=3.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,50:241:99:3052,0,3520 -chr15 15095246 . TCCTGCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTA T 2079.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.620;ClippingRankSum=0.392;DP=259;FS=8.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=8.03;ReadPosRankSum=-5.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,75:253:99:2117,0,14672 -chr15 15095250 . GCTGAACAGAGAAACAAACAACGCTTTTCGAGTCTGATAAACAACGGCTATTTGTGTGCCTCGCGAAATACGGTAAATAAACCGCAACCAACATTAGATTTAAAACAAAGAGACTTAC G 5827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=1.201;DP=249;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=23.40;ReadPosRankSum=3.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,162:248:99:5865,0,8970 -chr15 15174789 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=1.246;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=23.55;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:405,0,167 -chr15 15202040 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.410;DP=61;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:313,0,1690 -chr15 15213187 . T A 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-0.289;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:987,0,1018 -chr15 15230062 . TCTAAAAGACGTTTTGACAAGATGAGACGATGAGGGCAGTTAAAGTGAGGTGATGGGTCAACAGGGTGAACATCATCTCCTCAC T 9066.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.530;DP=208;FS=7.155;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=32.94;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,193:198:99:9104,813,0 -chr15 15348010 . A C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.257;DP=237;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,38:237:99:463,0,7773 -chr15 15397200 . C CA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-2.121;DP=38;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:287,0,473 -chr15 15832600 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr15 15893388 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.709;DP=56;FS=6.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:260,0,1660 -chr15 15908228 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.166;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.482;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,32:144:99:613,0,4545 -chr15 15912542 . CT C 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-2.957;DP=146;FS=5.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,18:144:99:645,0,3812 -chr15 15954882 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.454;DP=53;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.864;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:639,0,1195 -chr15 15955353 . C CT 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.124;DP=50;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:365,0,789 -chr15 15955738 . CA C 899.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-1.019;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:68:937,68,0 -chr15 15956343 . T C 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-0.550;DP=43;FS=6.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=19.44;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:864,0,834 -chr15 15956668 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.701;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:299,0,579 -chr15 15958603 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.654;DP=67;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:744,0,1447 -chr15 15965548 . A G 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.013;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:598,0,2439 -chr15 16067274 . T C 397.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=33.15;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:425,0,6 -chr15 16068164 . AT A 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=19.23;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:48:345,0,48 -chr15 16102075 . A G 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.954;DP=291;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,62:291:99:1212,0,8817 -chr15 16110253 . G GAC 3345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-1.814;DP=225;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,109:207:99:3383,0,3241 -chr15 16114490 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.244;DP=103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:545,0,5828 -chr15 16114700 . T G 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.104;DP=195;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,45:195:99:947,0,5961 -chr15 16115000 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.528;DP=33;FS=9.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:238,0,517 -chr15 16164679 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.125;DP=45;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:779,0,840 -chr15 16171366 . G A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-1.442;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1098,0,311 -chr15 16287082 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.070;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=24.13;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:559,0,187 -chr15 16288888 . CAGGTATCGCTCAGCTGGATGTTGTTAGGTTGTTTTGTAATGAAAATTTTGGATACATCCTTTGTGTTTTTTTTTACAATTCTGGTATGTTT C 906.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.688;DP=29;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=31.27;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:944,0,1766 -chr15 16329231 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.600;DP=240;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,40:240:99:471,0,7665 -chr15 16336023 . T A 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=1.554;DP=236;FS=11.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,60:234:99:1408,0,6527 -chr15 16336104 . T A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=3.995;DP=198;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=4.87;ReadPosRankSum=4.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,46:198:99:992,0,5781 -chr15 16339866 . T C 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.173;DP=167;FS=9.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,43:167:99:986,0,4692 -chr15 16358093 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.530;DP=194;FS=3.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,65:193:99:2114,0,4306 -chr15 16358386 . C CT 802.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=-0.576;DP=173;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:1327,0,2743 -chr15 16358986 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.238;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,446 -chr15 16391734 . A AT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.044;DP=115;FS=6.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,21:114:99:254,0,6775 -chr15 16391807 . CAT C 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-0.831;DP=119;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,30:118:99:706,0,3530 -chr15 16421064 . CCCTGTACACAGCGGATAAACACAACTGAATAAGTGTCATTTCAGTGAATTGACTGTCTGTTATTGATGAAAAATTAGTCATTTGTA C 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=1.552;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,12:14:59:516,59,0 -chr15 16443757 . TA T 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.116;DP=23;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=13.42;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:346,0,343 -chr15 16462692 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=1.230;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:265,0,732 -chr15 16547581 . G A 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:621,42,0 -chr15 16842542 . C G 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.218;DP=57;FS=7.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:57:99:869,0,1145 -chr15 16846074 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:272,0,1604 -chr15 16855319 . TA T 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.143;DP=46;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:361,0,505 -chr15 16857382 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.480;DP=67;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:558,0,1822 -chr15 16888205 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.726;DP=43;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:642,0,860 -chr15 16890981 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-2.829;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:603,0,860 -chr15 16910277 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-0.280;DP=55;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:327,0,1515 -chr15 17046026 . C CA 1043.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.527;DP=88;FS=7.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,49:82:99:1081,0,731 -chr15 17055056 . C CCCGACTGAAG 2430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-0.227;DP=258;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=9.42;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,77:227:99:2468,0,5426 -chr15 17201502 . GA G 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.661;DP=38;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=1.861;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:41:866,0,41 -chr15 17312839 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-2.123;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:378,0,2057 -chr15 18047609 . ACTGGGAGAAAAGCATTGATGTGGAGGGTTGTCAAAAAGTTAAGAGTCTTGACCTTTCAGACTTCAAAAATACCATCATTTCAGAC A 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.075;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=32.15;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:643,0,790 -chr15 18086223 . G T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-0.177;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:241,0,1053 -chr15 18086235 . TA T 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-0.051;DP=43;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:473,0,310 -chr15 18087960 . GTC G 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.078;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:257,0,783 -chr15 18088093 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-0.139;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=25.51;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:564,0,192 -chr15 18225675 . TAGGTGAGTGTTTTGTTGGTGAATGCACGGTTGGGGTTGTGTTTGTGTAAACGTGTGGTGGTGTGCTTCAC T 6317.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=3.172;DP=151;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=28.92;ReadPosRankSum=-1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,143:149:99:6355,516,0 -chr15 18232495 . TCTGTAAAAATGATTCATAAACTGATTCTCATTATCTGCTTCTTAAGCGCTCAGTATATTGACTCCTCAC T 2037.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.290;DP=72;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=28.30;ReadPosRankSum=-1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,49:66:99:2075,0,4263 -chr15 18232656 . GCCTGAGGGGAAGATTTTTCAACTTAATAAAAGCTTTAATTACGTGAAAATGTGAAAAAATATTTTGATAAATATAGTATCAGTCAAAGTTCA G 2284.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.537;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=35.32;ReadPosRankSum=-1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2322,216,0 -chr15 18240333 . C CA 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.754;DP=101;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:386,0,1712 -chr15 18365710 . T C 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr15 18499698 . CTG C 2216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-0.419;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,59:135:99:2254,0,2743 -chr15 18517628 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr15 18566030 . G T 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.293;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,46:61:99:1537,0,516 -chr15 18570065 . T C 4967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.668;DP=272;FS=6.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,153:272:99:4996,0,3985 -chr15 18627969 . T TA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.113;DP=26;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:334,0,234 -chr15 18639228 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:234,0,374 -chr15 18733983 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.288;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=18.65;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:364,0,294 -chr15 18759670 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=-1.249;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:617,0,387 -chr15 18759836 . A T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.087;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:88:644,0,88 -chr15 18764922 . A C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.122;DP=28;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:552,0,772 -chr15 18764923 . G A 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.268;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:552,0,772 -chr15 18834746 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.780;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:240,0,245 -chr15 18839738 . AT A 5243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-0.111;DP=263;FS=0.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,111:262:99:5281,0,10077 -chr15 18839863 . G GT 2431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-2.991;DP=271;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,150:258:99:2469,0,7949 -chr15 18840163 . C T 3157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-1.220;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=15.48;ReadPosRankSum=4.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,16:204:99:3186,0,21968 -chr15 18840171 . C A 3110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=-0.160;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=15.48;ReadPosRankSum=5.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,14:201:99:3139,0,21969 -chr15 18840438 . T TA 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.731;DP=222;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,41:218:99:518,0,16797 -chr15 18840439 . T A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.377;DP=220;FS=4.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,43:220:99:518,0,16770 -chr15 18846032 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.352;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:713,0,600 -chr15 18846173 . T A 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.635;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:924,0,746 -chr15 18846226 . G A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-2.707;DP=54;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=16.51;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:920,0,765 -chr15 18846281 . A T 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.499;DP=63;FS=6.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=18.36;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1185,0,785 -chr15 18846444 . G A 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-1.138;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:981,0,574 -chr15 18846488 . T C 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=-2.183;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=21.81;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1075,0,599 -chr15 18856621 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.868;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:329,0,568 -chr15 18869934 . C T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.872;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:543,0,782 -chr15 18965083 . G T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=1.326;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:637,0,396 -chr15 18966529 . T C 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.050;DP=60;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1051,0,1011 -chr15 18985420 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr15 19086579 . C A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-2.159;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=21.93;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:993,0,554 -chr15 19166356 . C CA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-2.636;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:255,0,411 -chr15 19201254 . C CA 536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=-0.050;DP=368;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,76:344:99:574,0,7304 -chr15 19211711 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-1.215;DP=127;FS=12.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.069;QD=1.86;ReadPosRankSum=-4.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,20:127:99:264,0,4339 -chr15 19211733 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.819;ClippingRankSum=5.555;DP=142;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=2.13;ReadPosRankSum=-5.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,24:142:99:331,0,8577 -chr15 19211734 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=6.129;DP=143;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=2.04;ReadPosRankSum=-4.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,23:143:99:320,0,8577 -chr15 19211885 . T A 4123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=-1.625;DP=211;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=19.54;ReadPosRankSum=2.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,119:210:99:4152,0,4068 -chr15 19268158 . G T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.077;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:417,0,470 -chr15 19300265 . TGTAAGTCACCATCATTTGTCATCTGATTTCGTACTGTTCTTTTAATGTCTACAAATAAACATTTCTCTTTCAGGATTTAGACAATGCAGGCTAATGTTTTTTCTCTCTTGTGTTTGTTTTAAG T 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=1.575;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=33.40;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:605,0,1329 -chr15 19329279 . G GA 2333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.560;DP=176;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=13.26;ReadPosRankSum=2.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,103:169:99:2371,0,1582 -chr15 19346074 . TGTGAGGATCGTTCGGATGCTCGGATACTTTTCTTTTTTCTGTATTGAGATTATATTAAAGTGAGTGTGTTTTTGCACCATAG T 7073.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=-0.490;DP=197;FS=2.068;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,190:194:99:7111,531,0 -chr15 19347342 . C T 3204.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-0.096;DP=210;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,93:210:99:3232,0,3889 -chr15 19427079 . T A 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.326;DP=98;FS=1.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,46:96:99:1644,0,1665 -chr15 19428496 . AC A 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-1.115;DP=21;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:288,0,189 -chr15 19429213 . CCCTGTAATCACAGCACACTTTGTTAAGTAATACACGAATACATCTATATGCCACATACATAAGAGCTGACAACGAATCGTACGTATAAGATTTATTACTACTTA C 3630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.424;ClippingRankSum=6.871;DP=154;FS=6.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=23.58;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,106:150:99:3668,0,19870 -chr15 19429553 . CTGTG C 4496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.128;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=30.93;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:95:99:4534,401,0 -chr15 19429559 . GAATTAAAACAGGATTAATTGTAGCATTCTTTGTAGCCTATACGTTGTCAGAGAACAGCTGACTATCAAGTAATAATTCTGAATACTCACCAA G 4410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.277;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:4448,397,0 -chr15 19490030 . G A 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=-0.110;DP=56;FS=6.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,44:56:99:1446,0,172 -chr15 19496892 . CAAGGTAACTATGATTATGCTTTAATGTCACTTTTTGACAGACTCGATTCCTTCTTTTTTTTTTTGATGGATCTTAATCTTCCTCAA C 2654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.920;DP=74;FS=4.381;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=24.29;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,70:74:99:2692,227,0 -chr15 19614859 . CTG C 1411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.880;DP=102;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=13.84;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1449,0,1418 -chr15 19792527 . AT A 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:673,67,0 -chr15 19794729 . GACCTGTGAGAAAATGCAAGTTGTTAAATTGCCGTTTGAATGGAGGTGGAAATGATGTAGCGCTCT G 3467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.519;DP=83;FS=1.643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,77:83:99:3505,285,0 -chr15 19796760 . A C 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=3.274;DP=62;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1232,0,842 -chr15 19855551 . G GT 247.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.579;DP=13;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=19.01;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:7:321,7,0 -chr15 19856133 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:277,0,413 -chr15 19903198 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,136 -chr15 19904770 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.62;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:365,0,54 -chr15 19922219 . G A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr15 19953477 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=1.637;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=26.55;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:453,0,133 -chr15 19953575 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.810;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:583,0,694 -chr15 19953618 . C A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=1.211;DP=37;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:744,0,530 -chr15 19956819 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=-0.933;DP=18;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:304,0,354 -chr15 19956966 . T C 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-0.882;DP=37;FS=13.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:768,0,541 -chr15 19966294 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=3.079;DP=18;FS=8.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:392,0,242 -chr15 19966391 . C T 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-2.146;DP=74;FS=11.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=24.23;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,53:74:99:1821,0,1304 -chr15 19966601 . TCTAAAAATCAGAAACTATTTTTGTAGATTATGAATATAAACATAAAATGCAATGCTGTCAAACGCTGAAGCCATTTTTTCTGAGTTAAAATATAAAAAAGGTTGAATGACAAAC T 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=2.732;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.941;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:565,0,9647 -chr15 19973259 . TCTAAGAGAGGGAATATTTTAATAAAGTCTTACTGAATTGAGAAATGCAAGAACAAATGTTTACCTACAATTACAGTGTATTCACACAC T 1061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.472;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=30.34;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1099,0,3090 -chr15 20055067 . C T 1937.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-1.732;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=29.11;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1966,141,0 -chr15 20075384 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=-2.154;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:419,0,2107 -chr15 20075386 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=-1.994;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:419,0,2107 -chr15 20075579 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=2.100;DP=30;FS=17.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=7.26;ReadPosRankSum=-2.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:246,0,1891 -chr15 20075747 . T A 5409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.262;DP=343;FS=10.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,150:343:99:5438,0,6596 -chr15 20075796 . A C 5966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-4.850;DP=378;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,163:378:99:5995,0,7330 -chr15 20075855 . CACCTGAAGGAAATGGAGGATGTAATCATTTATATCACAGTACACTTACACGTTAAATAAATCTAAATAAATATTCCATCGCATGATAAAAAAATATTCAGCAAAAGCATAAATCATCTT C 13010.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=1.002;DP=321;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,305:311:99:13048,928,0 -chr15 20078554 . G T 1900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=1.879;DP=108;FS=0.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1929,0,1859 -chr15 20078626 . T A 4990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-0.913;DP=291;FS=9.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=17.15;ReadPosRankSum=2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,153:291:99:5019,0,4883 -chr15 20079908 . A G 3091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.735;ClippingRankSum=2.157;DP=337;FS=0.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=9.17;ReadPosRankSum=3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,111:335:99:3120,0,8584 -chr15 20079917 . AACCTGTCAATCAAGCACATGTGATGAGTGGAATATTTGATCTGATTGGATCAGACTGAGTCTGAAATCTC A 13971.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=2.468;DP=357;FS=4.647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,340:345:99:14009,998,0 -chr15 20080050 . T G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=1.877;DP=259;FS=7.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,42:258:99:541,0,8378 -chr15 20082707 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=-4.963;DP=341;FS=50.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=0.78;ReadPosRankSum=-6.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,47:341:99:293,0,11653 -chr15 20083144 . A C 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=5.742;DP=328;FS=59.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,79:328:99:1719,0,9662 -chr15 20084937 . C A 3106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.183;DP=345;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=9.01;ReadPosRankSum=-2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,114:345:99:3135,0,9008 -chr15 20085322 . A G 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=6.609;DP=317;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,59:317:99:847,0,9617 -chr15 20085987 . T A 2530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=7.279;DP=381;FS=35.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,104:380:99:2559,0,11684 -chr15 20103130 . T A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.128;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,49:77:99:1753,0,963 -chr15 20103720 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.221;DP=75;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:374,0,2415 -chr15 20110285 . G C 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=-3.213;DP=66;FS=13.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:996,0,1217 -chr15 20110352 . T C 2768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.076;DP=141;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=19.64;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,83:140:99:2797,0,1900 -chr15 20110400 . C A 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=1.773;DP=125;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=14.64;ReadPosRankSum=-1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,53:124:99:1858,0,2576 -chr15 20110606 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.615;ClippingRankSum=6.045;DP=74;FS=3.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=9.17;ReadPosRankSum=-4.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:707,0,4126 -chr15 20110609 . C G 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=5.500;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=9.55;ReadPosRankSum=-4.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:706,0,4126 -chr15 20110690 . C T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=7.327;DP=74;FS=25.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=14.92;ReadPosRankSum=-5.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1132,0,1379 -chr15 20111205 . A C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=3.477;DP=109;FS=8.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:884,0,3041 -chr15 20116390 . G A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=1.158;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=19.86;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:902,0,635 -chr15 20117275 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-1.540;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,397 -chr15 20120233 . A T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-2.721;DP=47;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:669,0,974 -chr15 20120251 . G T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=-1.610;DP=41;FS=9.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:511,0,924 -chr15 20120614 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=-0.370;DP=46;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:366,0,1257 -chr15 20120815 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=4.114;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:540,0,1061 -chr15 20120827 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=4.268;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=10.92;ReadPosRankSum=-3.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:465,0,958 -chr15 20126463 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:327,0,172 -chr15 20126464 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:327,0,172 -chr15 20132165 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.230;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:463,0,667 -chr15 20134559 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.330;DP=38;FS=7.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.554;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:359,0,983 -chr15 20147236 . C A 245.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:274,0,22 -chr15 20161126 . G T 438.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.470;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=33.72;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:1:464,1,0 -chr15 20161977 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:256,0,55 -chr15 20162049 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:88:255,0,88 -chr15 20162210 . G A 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 -chr15 20219530 . C T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.021;DP=95;FS=3.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,39:89:99:1330,0,1702 -chr15 20231593 . CAGGTATGTGTAGTCTTATTCATTTTGACTCCTCTGACACTGATTACACCATGACTGCATCTGTATTAACATTCTAAT C 1679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=2.214;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=29.81;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:99:1717,0,526 -chr15 20504476 . G C 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.694;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=17.37;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:723,0,588 -chr15 20507249 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.628;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:337,0,588 -chr15 20507557 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:244,0,775 -chr15 20510051 . G T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-1.057;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:585,0,563 -chr15 20513717 . ACTGCACAGAAAACAGCACACGCTTTCTATCTTCTTTTAGAAATGCTGACAGGAGGTCCTAATGACGAGTTTTTAAGTGTTTTAC A 1770.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.523;DP=43;FS=4.623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=31.87;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:99:1808,157,0 -chr15 20515968 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:539,0,862 -chr15 20515974 . A G 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-1.147;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:539,0,862 -chr15 20517916 . G A 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.864;DP=43;FS=8.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:785,0,733 -chr15 20519045 . G C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=1.876;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:433,0,651 -chr15 20519060 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=1.873;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:506,0,550 -chr15 20677219 . G A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=-0.811;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,35:57:99:1218,0,677 -chr15 20731363 . T C 7459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=-0.773;DP=420;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,205:420:99:7488,0,7944 -chr15 20745035 . G C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=-0.191;DP=30;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=13.43;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:431,0,638 -chr15 20745868 . T C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.809;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=23.27;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:773,0,279 -chr15 20746167 . C G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.377;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.725;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:585,0,292 -chr15 20753511 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=-1.430;DP=39;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:563,0,766 -chr15 20753607 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.282;DP=28;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:368,0,594 -chr15 20753916 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.356;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:453,0,398 -chr15 20768804 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.261;DP=37;FS=10.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:563,0,738 -chr15 20839217 . GCTGAAAAGAAATACAGTTTCATGAGTCATTGTAAAAATTCTATCAAAACTAATAAATCACGTATGAAATACTACAAAC G 474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=3.361;DP=93;FS=2.320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=5.10;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,89:93:99:512,199,0 -chr15 21818370 . A AT 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=24.57;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:283,0,114 -chr15 21822404 . A T 259.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:288,0,19 -chr15 21893428 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:266,0,99 -chr15 21902129 . C CA 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-1.976;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.171;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:556,0,130 -chr15 21902261 . CA C 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.735;DP=25;FS=12.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:441,0,105 -chr15 21903834 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=17.24;ReadPosRankSum=-1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:373,0,771 -chr15 21903840 . CT C 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.317;DP=21;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:328,0,725 -chr15 21904353 . T A 340.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:369,27,0 -chr15 22842280 . TCTGTCATAAACACATCAATACAAACATGAAAATGATACTGCATGGTGAAAACACACAGAATAAGACACAAAGAGCTTAC T 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.47;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:262,0,768 -chr15 23064859 . G T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=-0.907;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,34:173:99:579,0,5113 -chr15 23065171 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.081;DP=157;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,27:157:99:349,0,5008 -chr15 23146627 . C A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=30.96;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:456,0,2992 -chr15 23274371 . AT A 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.010;DP=69;FS=11.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:467,0,458 -chr15 23275223 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.037;DP=96;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:247,0,3185 -chr15 23285037 . CCCTGAAAAAAATGTGAACATATTTCAGAAGTGTCAAACTGAACTATTTCAAGTTGATAGTTCTCACTACACATGATATTTCTTA C 4365.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=2.457;DP=102;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,98:102:99:4403,374,0 -chr15 23473294 . C CA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-1.155;DP=79;FS=2.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:249,0,1053 -chr15 23903335 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.048;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:405,0,4195 -chr15 23903339 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.007;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:405,0,4195 -chr15 23923131 . CT C 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-0.717;DP=23;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:342,0,185 -chr15 23923330 . G C 361.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:389,0,5 -chr15 23938896 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,549 -chr15 24092794 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.050;DP=249;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,37:248:99:306,0,8197 -chr15 24092995 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=-0.056;DP=277;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,42:276:99:380,0,8720 -chr15 24093160 . A T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.341;DP=241;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,49:241:99:860,0,7047 -chr15 24153446 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.021;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.263;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:488,0,2311 -chr15 24602425 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:345,0,177 -chr15 24602569 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.058;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:507,0,324 -chr15 24680937 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=-1.738;DP=129;FS=3.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,22:129:99:307,0,4038 -chr15 24688582 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.432;DP=112;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:386,0,3317 -chr15 24814570 . GTT G 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.184;DP=41;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:514,0,425 -chr15 24816487 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.980;DP=38;FS=5.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:284,0,935 -chr15 25873268 . A T 1918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.804;DP=594;FS=2.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:478,115:593:99:1947,0,18463 -chr15 25880373 . C G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.166;DP=151;FS=15.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,25:150:99:321,0,4773 -chr15 25890805 . G C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.165;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:255,0,776 -chr15 25963505 . GACCTAAATATCACAAATGTCACAGAAAGCAAATCTGAAACGCAGCTGTTGTTTACATGGCTTCTATTCAATCTTAATTCCGAAGAGTTGAGTGTTCACAGATTTGTTAAAGTGTACTTATACCAACAAACTTTTTTGTTGTTGTTGTACGTGTTTGAACATAAAAGGCTT G 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=3.016;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:336,0,9612 -chr15 25991441 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr15 26015339 . TA T 324.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.496;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=21.66;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:13:362,13,0 -chr15 26046641 . G A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=-2.221;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=27.49;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:578,0,143 -chr15 26240816 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=2.766;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:289,0,409 -chr15 26240997 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-1.517;DP=40;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:481,0,909 -chr15 26244901 . A T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-1.776;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=23.05;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:374,0,158 -chr15 26247252 . TA T 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.781;DP=28;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:54:563,0,54 -chr15 26251141 . T A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.887;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,21:93:99:420,0,2697 -chr15 26720218 . G GA 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.091;DP=32;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:46:449,0,46 -chr15 26850711 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.169;DP=72;FS=3.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:330,0,2073 -chr15 26869845 . G C 1507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.462;DP=57;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,42:57:99:1536,0,692 -chr15 26870927 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.355;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:468,0,1803 -chr15 27052279 . AT A 983.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=2.266;DP=73;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=13.48;ReadPosRankSum=-1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,42:64:99:1021,0,295 -chr15 27059577 . A T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.550;DP=87;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:314,0,2509 -chr15 27566106 . CTACCTAGTAGAAAAACACACAAAGAACAGATGAAGGCGATGTGGATACCAGCTGTGAAAATCAAATATTGTGTCTGTACA C 482.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.869;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=35.28;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:44:520,44,0 -chr15 27570034 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:247,0,227 -chr15 27573473 . GT G 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 -chr15 27598175 . C G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-1.078;DP=212;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,36:212:99:390,0,18456 -chr15 27604041 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.991;DP=409;FS=4.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:345,63:408:99:667,0,13446 -chr15 27604922 . C CCAAGTTGACAT 5448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.632;DP=260;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,160:233:99:5486,0,4653 -chr15 27606961 . AACCTGAAAAATTAAGTAACAGTCCCTAAATGATAAACTTTTAAATCTGAATAATATTTATAAGCAACAAAACTGT A 14327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=1.721;DP=315;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=29.42;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,300:301:99:14365,1301,0 -chr15 27607233 . GACCTAAACAGCAATACACATCAAATTAATCCAGAACACCACCTTTCAGCATCCTTTGTAAATACAAAGCTTATTTT G 11285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=1.277;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=31.33;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,276:279:99:11323,849,0 -chr15 27713454 . TGGTAAGAGTCATCTAGAGCTGATTTATTTCAGGTTATTTCTCTAACACAGGTGCTATAGATTTTCTTTATTTACTGCA T 563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.079;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:601,0,1017 -chr15 27714419 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.380;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.533;QD=16.91;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:248,0,173 -chr15 27754614 . AC A 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-3.174;DP=69;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:301,0,1345 -chr15 27773472 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.413;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:246,0,4368 -chr15 27943929 . A G 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 -chr15 27943944 . CA C 337.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:375,30,0 -chr15 27983603 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.621;DP=229;FS=12.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,38:228:99:423,0,7134 -chr15 28108863 . AAT A 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.203;DP=131;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,23:115:99:360,0,3164 -chr15 28111454 . AG A 2047.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-0.117;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,78:96:99:2085,0,147 -chr15 28111557 . CT C 1574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;ClippingRankSum=-0.750;DP=134;FS=26.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,60:126:99:1612,0,1671 -chr15 28111677 . T TA 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=1.276;DP=112;FS=36.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=5.91;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:699,0,1446 -chr15 28113517 . C CT 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=-0.518;DP=263;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,49:248:99:334,0,5485 -chr15 28115913 . GA G 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.857;DP=66;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:660,0,629 -chr15 28120351 . G GA 390.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:22:428,22,0 -chr15 28355004 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-2.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:258,0,343 -chr15 28357311 . CA C 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.849;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:61:316,0,61 -chr15 28446795 . TCCTACAAGAGCAAATAAGAGTAAATTAAAGTAAAGCTGAAGGAAAATAACAAGAGATGTTATATTAAAGTAGGGAACGCTTA T 6125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=4.133;DP=161;FS=1.602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=27.61;ReadPosRankSum=-3.796 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,137:143:99:6163,506,0 -chr15 28450040 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.523;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:390,0,387 -chr15 28501352 . TA T 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.170;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.642;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:535,0,227 -chr15 28501355 . G T 495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.673;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:535,0,199 -chr15 28733437 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-1.254;DP=376;FS=22.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,59:376:99:575,0,12048 -chr15 28805481 . A G 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=26.37;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:872,0,229 -chr15 28831060 . GT G 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-0.761;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:594,0,334 -chr15 28831243 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-0.124;DP=35;FS=5.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=25.19;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:910,0,304 -chr15 28832374 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.329;DP=28;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:372,0,690 -chr15 28832417 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,723 -chr15 28832702 . A T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-1.290;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:479,0,542 -chr15 28898054 . G GT 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=2.117;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:311,0,214 -chr15 28898288 . A AT 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-1.489;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:62:464,0,62 -chr15 28898767 . C CA 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-1.672;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=9.66;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:298,0,791 -chr15 28904669 . CACCTGCAAAATAGCAATGATAATGTCAGAGACACGATAAGAAATGATAGAGTGTAACAAGAAAATTTTTTT C 858.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=1.569;DP=21;FS=4.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=31.70;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:74:896,74,0 -chr15 28914067 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.482;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:232,0,312 -chr15 28944893 . C A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.845;DP=35;FS=6.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:624,0,593 -chr15 28946210 . T C 3136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.112;DP=187;FS=11.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,86:187:99:3165,0,3476 -chr15 29011635 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.432;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=10.25;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:305,0,501 -chr15 29058826 . T C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-2.003;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=16.86;ReadPosRankSum=2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:669,0,678 -chr15 29059438 . T C 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.489;DP=53;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:978,0,938 -chr15 29060459 . G C 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.183;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:821,0,913 -chr15 29061148 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.317;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:402,0,1308 -chr15 29061158 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=2.126;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:402,0,1295 -chr15 29061229 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.822;DP=34;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:521,0,1506 -chr15 29061376 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-1.374;DP=38;FS=4.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=12.94;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:520,0,827 -chr15 29062246 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=1.195;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:291,0,883 -chr15 29062574 . T A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=-0.632;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:686,0,704 -chr15 29062638 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.379;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:694,0,1111 -chr15 29063093 . A T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.955;DP=44;FS=6.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:709,0,834 -chr15 29063124 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.890;DP=51;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1055,0,714 -chr15 29063503 . T G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=11.51;ReadPosRankSum=-1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:270,0,469 -chr15 29121282 . C A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,267 -chr15 29121410 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,218 -chr15 29123478 . T C 668.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.754;DP=21;FS=6.410;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=31.86;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,18:21:5:696,5,0 -chr15 29151602 . T G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr15 29151677 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,542 -chr15 29152768 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:342,0,93 -chr15 29153088 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,266 -chr15 29153089 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,266 -chr15 29153445 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.52;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:309,0,230 -chr15 29153577 . A T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.910;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=26.61;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:454,0,130 -chr15 29154226 . T A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.209;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:370,0,460 -chr15 29154348 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.268;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:449,0,680 -chr15 29154998 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.775;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:412,0,284 -chr15 29155235 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:236,0,134 -chr15 29155237 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:236,0,134 -chr15 29156150 . C T 429.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=33.07;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:457,0,5 -chr15 29156711 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:429,0,140 -chr15 29157725 . C G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.256;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:268,0,207 -chr15 29158004 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.597;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,286 -chr15 29158007 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,286 -chr15 29158306 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=19.55;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:302,0,345 -chr15 29508333 . T A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-0.078;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1127,0,1750 -chr15 29508407 . T C 2052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.199;DP=119;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=17.25;ReadPosRankSum=2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,57:119:99:2081,0,2005 -chr15 29511327 . G T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.411;DP=70;FS=3.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:351,0,1970 -chr15 29511348 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=-0.924;DP=66;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:406,0,1870 -chr15 29511409 . C CA 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-1.645;DP=87;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:380,0,1665 -chr15 29516250 . T A 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.909;DP=71;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:385,0,2249 -chr15 29517878 . G GA 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.493;DP=58;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:704,0,532 -chr15 29517914 . A C 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.282;DP=61;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1076,0,1003 -chr15 29517993 . C T 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.110;DP=96;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,45:96:99:1606,0,1711 -chr15 29518669 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.170;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:357,0,704 -chr15 29538665 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.485;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=20.47;ReadPosRankSum=2.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:458,0,240 -chr15 29539052 . G T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-2.341;DP=32;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.757;QD=17.09;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:575,0,513 -chr15 29539622 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.80;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:377,0,210 -chr15 29645808 . G A 739.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=-2.444;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=30.83;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:16:768,0,16 -chr15 29677628 . T C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=1.393;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:451,0,531 -chr15 29681722 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:322,0,405 -chr15 29682309 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=18.29;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:266,0,388 -chr15 29682345 . A T 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:78:1096,78,0 -chr15 29682531 . A C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-2.911;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:396,0,717 -chr15 29683088 . T A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.554;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:384,0,803 -chr15 29683135 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=6.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=14.49;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:405,0,508 -chr15 29683523 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:318,0,396 -chr15 29683962 . T A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.571;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.128;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:380,0,483 -chr15 29685189 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.211;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=25.17;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:582,0,200 -chr15 29685708 . CA C 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=19.99;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:477,0,626 -chr15 29692105 . ACAGGTGCCTTCATACACGAGAGAATGATTTTAAAAATAAATCAGACTTTTGTCAGGTGTAAACGTGTTTTCTTC A 2125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.664;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=34.16;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2163,176,0 -chr15 29706765 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=3.425;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,567 -chr15 29708425 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=1.537;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:537,0,402 -chr15 29716742 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=1.279;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:593,0,847 -chr15 29718176 . T G 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=1.142;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:569,0,669 -chr15 29723235 . C A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr15 29723576 . C T 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr15 29724202 . C A 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr15 29726789 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,510 -chr15 29729275 . G C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:283,0,865 -chr15 29729357 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:459,0,638 -chr15 29729654 . A AT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-2.138;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:278,0,524 -chr15 29730524 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:323,0,280 -chr15 29734790 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.367;DP=58;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:811,0,2028 -chr15 29734798 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=-0.501;DP=59;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:756,0,2051 -chr15 29734838 . C T 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=2.580;DP=67;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1015,0,1017 -chr15 29735389 . A G 3964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.564;DP=142;FS=5.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=27.92;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,104:142:99:3993,0,868 -chr15 29735494 . G A 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.221;DP=93;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=23.50;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,60:93:99:2214,0,1556 -chr15 29803351 . CT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-1.639;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:285,0,117 -chr15 30137441 . T C 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.179;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:921,0,963 -chr15 30137455 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-0.238;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:890,0,895 -chr15 30137524 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.416;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:698,0,692 -chr15 30137579 . G C 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.468;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=19.28;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1243,0,904 -chr15 30137738 . C A 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.862;DP=53;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,37:53:99:1501,0,802 -chr15 30137739 . A T 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.858;DP=51;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,36:51:99:1501,0,804 -chr15 30141279 . T C 1879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.274;DP=116;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:99:1908,0,1984 -chr15 30146082 . C T 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=1.108;DP=90;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,40:90:99:1374,0,1648 -chr15 30146118 . G A 1481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.705;DP=88;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,44:88:99:1510,0,1526 -chr15 30149431 . G A 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=1.005;DP=91;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,49:90:99:1599,0,1471 -chr15 30160069 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-1.984;DP=33;FS=9.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:396,0,756 -chr15 30160163 . A T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.348;DP=55;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:869,0,1111 -chr15 30160291 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=1.826;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:639,0,789 -chr15 30160611 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.723;ClippingRankSum=-0.372;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:308,0,936 -chr15 30161087 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.489;DP=54;FS=6.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:242,0,1561 -chr15 30161402 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.571;DP=43;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:348,0,2065 -chr15 30161860 . C A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-1.729;DP=64;FS=3.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:861,0,1279 -chr15 30162196 . G A 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=1.888;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=20.68;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,25:39:99:876,0,513 -chr15 30166846 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr15 30167338 . C G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:490,0,136 -chr15 30167344 . A T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=32.98;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:490,0,136 -chr15 30175712 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=2.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=18.91;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:293,0,147 -chr15 30177977 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.438;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:755,0,611 -chr15 30178240 . A T 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.166;DP=47;FS=2.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=21.31;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1030,0,588 -chr15 30204284 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.037;DP=34;FS=8.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:341,0,1522 -chr15 30204285 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.147;DP=34;FS=8.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=9.20;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:341,0,1522 -chr15 30204524 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-1.635;DP=65;FS=4.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:405,0,1830 -chr15 30215172 . G A 336.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:365,27,0 -chr15 30221081 . A AGCACAACCATCAACG 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.366;DP=32;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=8.87;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,1289 -chr15 30240736 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=1.345;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:448,0,1051 -chr15 30249404 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-1.585;DP=33;FS=8.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:309,0,796 -chr15 30250672 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:268,0,52 -chr15 30252743 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.903;DP=51;FS=8.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:449,0,1277 -chr15 30252940 . G A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=2.481;DP=31;FS=8.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=17.99;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:586,0,493 -chr15 30330602 . A T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=3.421;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:494,0,460 -chr15 30330667 . C T 464.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:7:492,0,7 -chr15 30351921 . A G 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.581;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=34.49;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:856,0,191 -chr15 30352781 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:238,0,435 -chr15 30353025 . T C 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.178;DP=83;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1460,0,1395 -chr15 30359016 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.209;DP=82;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:380,0,2369 -chr15 30360412 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.358;DP=82;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1297,0,1363 -chr15 30365075 . A T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr15 30373036 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.359;DP=35;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:234,0,1728 -chr15 30376572 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,339 -chr15 30387662 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.473;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,297 -chr15 30459715 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=4.404;DP=155;FS=5.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.391;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,26:155:99:254,0,7445 -chr15 30459778 . T A 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=5.675;DP=149;FS=10.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:995,0,5178 -chr15 30459865 . T C 2123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.198;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=29.91;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,56:70:99:2152,0,1032 -chr15 30460004 . T C 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=1.108;DP=41;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=21.82;ReadPosRankSum=-2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:923,0,1067 -chr15 30460013 . T C 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.401;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:902,0,1771 -chr15 30460388 . A G 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.200;DP=156;FS=12.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,35:156:99:757,0,4745 -chr15 30460700 . T A 2724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=-3.626;DP=152;FS=22.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=17.93;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,77:152:99:2753,0,2575 -chr15 30460851 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-2.392;DP=105;FS=3.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=3.38;ReadPosRankSum=-2.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:383,0,4269 -chr15 30460872 . A G 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-0.918;DP=125;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,40:125:99:1092,0,4328 -chr15 30460887 . A T 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.743;DP=161;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,52:161:99:1497,0,5245 -chr15 30461137 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=-2.661;DP=105;FS=14.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=3.56;ReadPosRankSum=-5.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,23:105:99:402,0,3187 -chr15 30465395 . G C 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-2.895;DP=71;FS=3.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.908;QD=22.22;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1606,0,852 -chr15 30465963 . C T 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.742;DP=122;FS=6.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:2183,0,1991 -chr15 30465970 . T TA 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-1.721;DP=127;FS=6.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,36:117:99:555,0,2227 -chr15 30466168 . T A 1782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.169;DP=100;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,53:98:99:1811,0,1694 -chr15 30466230 . G A 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=-0.367;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=19.71;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,49:89:99:1802,0,2596 -chr15 30466239 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.334;DP=100;FS=3.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:646,0,4818 -chr15 30466395 . TAA T 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-1.361;DP=78;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=10.34;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,23:68:99:844,0,1791 -chr15 30466482 . A G 1609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.408;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1638,0,1524 -chr15 30466793 . G A 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.176;DP=109;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,43:108:99:1517,0,2233 -chr15 30466991 . A G 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.068;DP=103;FS=0.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:847,0,2735 -chr15 30467572 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.880;DP=83;FS=2.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:603,0,2329 -chr15 30467647 . A C 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=1.133;DP=70;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,41:70:99:1471,0,1059 -chr15 30467698 . T A 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-1.048;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:964,0,2318 -chr15 30467921 . A C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=-1.365;DP=23;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=27.95;ReadPosRankSum=-1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:671,0,111 -chr15 30470930 . T A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.750;ClippingRankSum=0.556;DP=144;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,45:144:99:1177,0,3695 -chr15 30471041 . A G 3179.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=2.070;DP=208;FS=6.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,92:207:99:3208,0,3719 -chr15 30474661 . TG T 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=1.882;DP=67;FS=3.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:387,0,1450 -chr15 30480724 . T C 1096.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.201;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.648;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:17:1125,17,0 -chr15 30480765 . C T 781.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-1.397;DP=24;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=32.56;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:8:809,0,8 -chr15 30480958 . C T 340.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:369,0,13 -chr15 30481245 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr15 30481778 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-3.100;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=27.20;ReadPosRankSum=2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:681,0,124 -chr15 30482136 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:258,0,94 -chr15 30483684 . T G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.622;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:334,0,922 -chr15 30483708 . G T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.951;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:291,0,782 -chr15 30484388 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=-1.893;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:235,0,641 -chr15 30510598 . T G 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.210;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:874,0,902 -chr15 30510657 . C T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=1.004;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.761;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:719,0,713 -chr15 30510760 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.046;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:567,0,704 -chr15 30534737 . T TC 320.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.589;DP=14;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:27:358,0,27 -chr15 30537579 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-1.183;DP=45;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:677,0,894 -chr15 30537644 . G T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-1.405;DP=45;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:705,0,854 -chr15 30537788 . T A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.147;DP=64;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:453,0,1723 -chr15 30537896 . T C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.734;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:478,0,2532 -chr15 30537899 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.935;DP=53;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:939,0,1658 -chr15 30538776 . A G 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.280;DP=28;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:617,0,356 -chr15 30539148 . A T 329.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:358,0,16 -chr15 30539469 . TA T 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-1.276;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=20.59;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:34:449,0,34 -chr15 30539520 . G C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=2.644;DP=34;FS=6.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=7.38;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:279,0,938 -chr15 30539632 . G T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-1.697;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=7.82;ReadPosRankSum=2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:591,0,1780 -chr15 30539702 . CTT C,CT 435.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-1.426;DP=41;FS=2.031;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,10,21:36:99:715,414,572,133,0,153 -chr15 30540077 . TA T 230.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.826;DP=18;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=12.82;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:26:284,0,26 -chr15 30540241 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.879;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:721,0,1432 -chr15 30540297 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.657;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:384,0,1204 -chr15 30540439 . C A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.307;DP=40;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:529,0,890 -chr15 30540669 . G A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.762;DP=57;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:708,0,1179 -chr15 30540930 . T A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-1.160;DP=47;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:893,0,786 -chr15 30541850 . C T 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.959;ClippingRankSum=0.010;DP=83;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=10.67;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,31:82:99:914,0,1832 -chr15 30541891 . A T 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.178;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,33:86:99:1082,0,1787 -chr15 30541964 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.114;DP=66;FS=5.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:533,0,1583 -chr15 30543363 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.483;DP=55;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:488,0,1440 -chr15 30547619 . G T 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=-1.137;DP=50;FS=2.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:482,0,844 -chr15 30547914 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.579;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:239,0,400 -chr15 30811449 . GACCTTTGGGGGAAAAAAACATGCATTCAAATCAACCTATTTGTTCCCTTCATGCTTTCAATGGAAGTGCAAAGAGTGAACGT G 15637.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.845;DP=305;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.125;QD=29.11;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,301:304:99:15675,1202,0 -chr15 31128242 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:317,0,98 -chr15 31162797 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.321;DP=36;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.048;QD=19.47;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:729,0,536 -chr15 31165825 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.279;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:370,0,460 -chr15 31167940 . G GGGACTCTAAAA 500.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.345;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:538,0,510 -chr15 31168102 . TGTAGGTTGTTTTTATGTTTTGATAGATAATTCTTTACAGTGTTAACCACAGGCCATTTTAATTCTTAACATATCTTTTGAACATACAG T 731.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.996;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:769,0,1276 -chr15 31261066 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.18;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:270,0,103 -chr15 31512805 . A G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.566;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.606;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:587,0,553 -chr15 31512881 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.581;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:301,0,301 -chr15 31513022 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,411 -chr15 31525181 . T G 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=2.065;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.897;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:654,0,664 -chr15 31534965 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.934;ClippingRankSum=-0.964;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=6.81;ReadPosRankSum=2.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,1848 -chr15 31578112 . G A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.031;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:582,0,228 -chr15 31581613 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.192;DP=25;FS=9.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:365,0,475 -chr15 31895992 . TA T 215.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.393;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:250,0,1 -chr15 31924445 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.847;DP=68;FS=6.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,33:68:99:1148,0,1138 -chr15 32055704 . G C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.823;DP=21;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:446,0,243 -chr15 32056159 . C T 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.468;DP=71;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:1458,0,927 -chr15 32056688 . G A 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.935;DP=64;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,30:64:99:1067,0,1071 -chr15 32056873 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=1.008;DP=52;FS=7.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:907,0,874 -chr15 32056902 . C A 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.545;DP=63;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.510;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1020,0,1281 -chr15 32086712 . C T 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.544;DP=189;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,68:189:99:2318,0,4215 -chr15 32101068 . C T 3168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.128;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,89:187:99:3197,0,3741 -chr15 32125561 . G A 3104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=-0.378;DP=214;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,92:214:99:3133,0,4199 -chr15 32129543 . GA G 909.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.713;DP=159;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,52:155:99:947,0,3737 -chr15 32129789 . TA T 1601.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-1.223;DP=186;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,62:171:99:1639,0,2951 -chr15 32170895 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,665 -chr15 32182917 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.65;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:94:348,0,94 -chr15 32397409 . C T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-1.936;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=20.22;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:736,0,478 -chr15 32406401 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,337 -chr15 32406702 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,487 -chr15 32801453 . T A 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-1.815;DP=97;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=12.41;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,53:94:99:1232,0,1337 -chr15 32801638 . C T 3843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=1.962;DP=209;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=18.39;ReadPosRankSum=-2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,105:209:99:3872,0,3826 -chr15 32801972 . A T 3359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-0.582;DP=188;FS=5.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,95:188:99:3388,0,3262 -chr15 32983500 . T A 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.378;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:582,0,666 -chr15 32983849 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.957;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:783,0,417 -chr15 32983881 . T A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-0.906;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:578,0,566 -chr15 32983918 . A T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.903;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:449,0,904 -chr15 32984669 . GA G 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=15.52;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,718 -chr15 32984671 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,718 -chr15 32985792 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.087;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:236,0,886 -chr15 32986810 . T C 1281.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:82:1310,82,0 -chr15 32986846 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.460;DP=31;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:466,0,819 -chr15 32987141 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=-0.193;DP=20;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,429 -chr15 32987530 . T C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.372;DP=21;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=27.70;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:610,0,115 -chr15 32988869 . T C 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.304;DP=38;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,30:38:99:1080,0,184 -chr15 32998482 . G A 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=1.004;DP=40;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,31:40:99:1194,0,311 -chr15 33134484 . CA C 8314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.525;DP=245;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=33.94;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,1:234:99:8352,0,7153 -chr15 33136061 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=1.020;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=21.61;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:374,0,164 -chr15 33136526 . A AC 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.288;DP=19;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:297,0,215 -chr15 33137015 . C G 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.323;DP=39;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=15.30;ReadPosRankSum=-2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:625,0,707 -chr15 33137807 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=3.797;DP=41;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=6.92;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:312,0,1107 -chr15 33138792 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.755;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:299,0,359 -chr15 33139064 . AT A 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=1.498;DP=24;FS=6.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=19.53;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:24:506,24,0 -chr15 33139747 . G T 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.566;DP=36;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:974,0,291 -chr15 33282270 . G C 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.515;DP=74;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=23.82;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,43:74:99:1791,0,1086 -chr15 33367371 . C T 1674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-1.496;DP=96;FS=1.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=17.45;ReadPosRankSum=1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1703,0,1485 -chr15 33367419 . G A 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-1.365;DP=90;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,43:90:99:1497,0,1460 -chr15 33436772 . A G 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.522;DP=86;FS=4.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:980,0,1832 -chr15 33437354 . A G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.267;DP=58;FS=2.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:987,0,692 -chr15 33437827 . CT C 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.364;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:507,0,870 -chr15 33437831 . T C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:507,0,869 -chr15 33507009 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-1.052;DP=31;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:579,0,524 -chr15 33507113 . T G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=1.690;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=16.71;ReadPosRankSum=-2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:563,0,423 -chr15 33511549 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.301;DP=37;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:248,0,1057 -chr15 33645171 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.376;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=19.11;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:334,0,711 -chr15 33645172 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=-0.795;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,711 -chr15 33791418 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=1.487;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:591,0,770 -chr15 33870371 . G A 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=2.181;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=16.01;ReadPosRankSum=-2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1341,0,1500 -chr15 33943398 . T C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.215;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.496;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:428,0,3405 -chr15 34167773 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.275;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:290,0,724 -chr15 34168190 . G A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.432;DP=59;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1091,0,1017 -chr15 34168321 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-0.143;DP=42;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:259,0,1153 -chr15 34196074 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.892;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,1412 -chr15 34199460 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-0.310;DP=74;FS=5.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:510,0,2016 -chr15 34281793 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.836;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:462,0,2801 -chr15 34386868 . G GT 1004.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-1.441;DP=155;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,57:146:99:1042,0,5237 -chr15 34387760 . G GA 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-3.486;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:724,0,560 -chr15 34387924 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=2.966;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:281,0,673 -chr15 34388464 . AT A 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.265;DP=69;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:693,0,924 -chr15 34388587 . TA T 587.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.280;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:625,0,951 -chr15 34399518 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:278,0,713 -chr15 34399752 . TG T 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:59:336,0,59 -chr15 34399937 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:418,0,107 -chr15 34400935 . TCTACAGTGCAAGCAGCAGCAGATGAAACATAATGAGTCACAGACAGAGCCGGGGGTTAAACTGATGCATGAAAGTAGCACATCTTAC T 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.736;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=24.08;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:567,0,4771 -chr15 34413937 . T C 635.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.598;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:17:664,0,17 -chr15 34453309 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.212;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:397,0,1863 -chr15 34463556 . AC A 2078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.550;DP=70;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,53:65:99:2116,0,193 -chr15 34465728 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,124 -chr15 34508417 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.474;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1039,0,923 -chr15 34508432 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.101;DP=69;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:450,0,1812 -chr15 34523419 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.779;DP=53;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:606,0,1214 -chr15 34543505 . G A 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-2.728;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=15.91;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:1556,0,1462 -chr15 34618905 . T G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.752;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,651 -chr15 34618906 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.521;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,651 -chr15 34635546 . T A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.856;DP=36;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:970,0,1832 -chr15 34636753 . G GGT 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.875;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:375,0,355 -chr15 34665161 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=2.060;DP=48;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:261,0,1399 -chr15 35713090 . A T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.073;DP=48;FS=6.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:698,0,980 -chr15 35714137 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.648;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,507 -chr15 35714603 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-1.125;DP=57;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:616,0,4237 -chr15 35714612 . A T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.487;DP=63;FS=2.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:623,0,4237 -chr15 35714882 . A C 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-1.969;DP=25;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=20.07;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:530,0,362 -chr15 35714986 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.907;DP=37;FS=7.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:464,0,838 -chr15 35715177 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.845;DP=41;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:307,0,1098 -chr15 35715800 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.146;DP=36;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:243,0,1040 -chr15 35717829 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=-0.181;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:467,0,326 -chr15 35719931 . A T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=3.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:397,0,774 -chr15 35720138 . T TA 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.296;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:71:345,0,71 -chr15 35875380 . G A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr15 36155900 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.076;DP=62;FS=6.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:282,0,1799 -chr15 36158275 . C CT 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.219;DP=24;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:55:515,0,55 -chr15 36159102 . GT G 604.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=1.506;DP=53;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=11.41;ReadPosRankSum=-1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:642,0,2142 -chr15 36159107 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=1.126;DP=50;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:642,0,2138 -chr15 36176853 . GCTGTGGAAAAACATGATAAATATTGCAGACAGATTTTGAAATCTGATTATTTAATGTCAGTGAAATCCTTATTGGTTCTGTTTAC G 2411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.455;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=34.43;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,60:65:99:2449,0,719 -chr15 36180189 . A G 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.328;DP=50;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1314,0,304 -chr15 36180664 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=1.089;DP=46;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:298,0,1221 -chr15 36181158 . A AAC 1177.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-1.356;DP=39;FS=2.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:24:1215,0,24 -chr15 36181160 . C CATTAAACGGCCCCGT 1174.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:62:1212,0,62 -chr15 36191815 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=1.248;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:624,0,1280 -chr15 36230509 . A T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.372;DP=49;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.543;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:790,0,915 -chr15 36231358 . C T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=2.511;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.251;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:1002,0,1354 -chr15 36231500 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.875;DP=47;FS=4.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:581,0,1091 -chr15 36231619 . C T 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=3.140;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=18.67;ReadPosRankSum=-2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:1018,0,2017 -chr15 36231926 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.059;DP=38;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.642;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:685,0,582 -chr15 36248329 . C T 4219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.405;DP=290;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,122:287:99:4248,0,5516 -chr15 36248562 . C CA 1368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-2.520;DP=182;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,67:171:99:1406,0,2444 -chr15 36259752 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,150 -chr15 36268110 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.574;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:326,0,648 -chr15 36294053 . C A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.222;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,29:95:99:774,0,2569 -chr15 36294072 . A C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.659;DP=100;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:777,0,2669 -chr15 36295373 . C T 1518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.531;DP=113;FS=9.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,45:113:99:1547,0,2408 -chr15 36295445 . G T 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.576;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=11.32;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,38:108:99:1251,0,2422 -chr15 36416309 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=33.48;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:96:363,0,96 -chr15 36534521 . C T 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=3.486;DP=75;FS=8.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,49:74:99:1725,0,830 -chr15 36534558 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.731;DP=45;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=5.62;ReadPosRankSum=-4.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:281,0,1304 -chr15 36534699 . T G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=2.834;DP=57;FS=18.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=11.35;ReadPosRankSum=-4.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:675,0,1338 -chr15 36539856 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.747;ClippingRankSum=1.155;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=2.74;ReadPosRankSum=2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,8:125:99:396,0,2802 -chr15 36542993 . T C 3429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-1.416;DP=218;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,97:216:99:3458,0,3880 -chr15 36544301 . G A 4392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-2.361;DP=275;FS=0.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,126:275:99:4421,0,4844 -chr15 36549321 . C T 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.313;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=18.85;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,68:118:99:2252,0,1819 -chr15 36717607 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-1.568;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,310 -chr15 36718042 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=-2.067;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.91;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:265,0,242 -chr15 36938034 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.089;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=5.71;ReadPosRankSum=2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:468,0,2165 -chr15 36993726 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=1.039;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:275,0,948 -chr15 36994473 . A C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=1.805;DP=81;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:404,0,2249 -chr15 36995368 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-0.798;DP=48;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:274,0,1374 -chr15 37280465 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-1.708;DP=11;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:302,0,97 -chr15 37280514 . C T 1760.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=1.680;DP=46;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=34.11;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1789,129,0 -chr15 37280581 . T C 1204.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1233,87,0 -chr15 37724110 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=-1.337;DP=67;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:428,0,1871 -chr15 37730389 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-2.767;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=15.83;ReadPosRankSum=2.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:867,0,919 -chr15 37789199 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=1.826;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:794,0,907 -chr15 37792313 . G GA 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.274;DP=42;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:512,0,555 -chr15 37841702 . G T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.254;DP=36;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=15.41;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:583,0,630 -chr15 37842055 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.602;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:432,0,789 -chr15 37842093 . T C 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=1.171;DP=32;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:542,0,612 -chr15 37842719 . A G 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.948;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:695,0,697 -chr15 37843037 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.509;DP=44;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:569,0,837 -chr15 37847244 . T A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.313;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:992,0,735 -chr15 37944042 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=17.30;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:357,0,317 -chr15 37976139 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.041;DP=41;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:459,0,882 -chr15 38124036 . C G 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.061;DP=18;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=30.99;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:586,0,115 -chr15 38124222 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.546;DP=16;FS=8.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=29.74;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:504,0,217 -chr15 38124265 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.547;DP=71;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:360,0,1407 -chr15 38124476 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=2.729;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:299,0,2277 -chr15 38124478 . T A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=2.770;DP=40;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=10.67;ReadPosRankSum=-2.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:455,0,1528 -chr15 38124595 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=1.306;DP=51;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:297,0,1523 -chr15 38181106 . C G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.573;DP=35;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:402,0,791 -chr15 38213651 . A T 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.395;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:719,0,558 -chr15 38639920 . TG T 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.356;DP=44;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.298;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:483,0,713 -chr15 38642738 . TA T 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=2.237;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=7.92;ReadPosRankSum=-2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:346,0,589 -chr15 38839515 . T G 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.814;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:495,0,611 -chr15 38849109 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=2.662;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:245,0,919 -chr15 38856895 . C CA 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.722;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:262,0,222 -chr15 39795573 . GACCTGACAGCGAGAGAGAAGCAGATTTACAAGCTTTTTCTTTCTTGACGTGCATCTGATCTTTTGATCTCAA G 351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=2.700;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=27.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:389,0,1388 -chr15 39817315 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.678;DP=23;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:261,0,519 -chr15 39817415 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.613;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:235,0,615 -chr15 39817673 . T C 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.101;DP=31;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.129;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:424,0,755 -chr15 39825224 . T G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=3.516;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:460,0,1030 -chr15 39931682 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.176;QD=18.12;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:300,0,253 -chr15 40197053 . C A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=-0.277;DP=34;FS=3.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:556,0,629 -chr15 40197258 . G T 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.009;DP=55;FS=3.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,35:55:99:1348,0,1313 -chr15 40197267 . T C 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.674;DP=50;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,31:49:99:1339,0,1313 -chr15 40203467 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-2.513;DP=29;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=24.65;ReadPosRankSum=2.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:743,0,170 -chr15 40220893 . C CT 649.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.778;DP=81;FS=4.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.968;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,32:70:99:714,0,879 -chr15 40476056 . CT C 747.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=20.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:79:785,79,0 -chr15 40476658 . G GT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.063;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:278,0,487 -chr15 40822314 . GGGTATGTAATAAACTATATATGTACAACAGCTTATCTTATACTAAAAATCTCAGTTATGAGAAGATAAAGACTAAATTGCTGTCGTTTTCCCCTTCA G 4103.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=2.398;DP=96;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,94:96:99:4141,338,0 -chr15 41219436 . G T 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-1.194;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:71:1055,71,0 -chr15 41219567 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.097;DP=95;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:314,0,1971 -chr15 42022178 . T C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.021;DP=33;FS=6.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=27.60;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:939,0,324 -chr15 42024771 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-0.727;DP=49;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:418,0,1552 -chr15 42112031 . T C 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-1.055;DP=170;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=6.85;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,48:169:99:1193,0,4474 -chr15 42180738 . G A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.375;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=6.57;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,35:120:99:817,0,3091 -chr15 42188235 . CAGGTTAACACTGTGCGCTGCTATACAGAATAAAGCAGCTAGGATGGTCCTAATGCAGTCTTTCTGTCTGT C 4816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=2.041;DP=126;FS=1.179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=21.83;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,112:124:99:4854,391,0 -chr15 42209733 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-0.006;DP=78;FS=14.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:495,0,2172 -chr15 42329397 . C CT 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.415;DP=38;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:273,0,309 -chr15 42358174 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.345;DP=41;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:620,0,836 -chr15 42359644 . CT C 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-1.069;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:334,0,321 -chr15 42592483 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.579;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:292,0,411 -chr15 42620686 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.525;DP=119;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,24:118:99:425,0,2972 -chr15 42620703 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-0.655;DP=136;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,27:136:99:463,0,3908 -chr15 42739163 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.186;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:306,0,1768 -chr15 42759328 . T A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.584;DP=22;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=27.62;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:842,0,369 -chr15 42759339 . A C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.665;DP=23;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=32.27;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:842,0,369 -chr15 42894225 . G A 539.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.519;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=33.70;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:4:566,4,0 -chr15 42949449 . A G 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.054;DP=34;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:591,0,637 -chr15 42980520 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.790;DP=138;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,26:134:99:281,0,4791 -chr15 43109636 . C T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-1.599;DP=53;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:902,0,1935 -chr15 43109642 . G T 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.909;DP=50;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:902,0,1930 -chr15 43112910 . T G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.326;DP=43;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:709,0,791 -chr15 43113343 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.467;DP=26;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:445,0,329 -chr15 43113928 . A G 1728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.197;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=32.62;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,46:53:43:1757,0,43 -chr15 43122216 . T C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=-1.368;DP=65;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:1191,0,1068 -chr15 43122258 . T C 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.193;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.722;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1144,0,1037 -chr15 44191658 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:263,0,296 -chr15 44192690 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=14;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:57:270,0,57 -chr15 44193090 . T TA 280.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:318,21,0 -chr15 44193256 . T C 381.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:10:409,0,10 -chr15 44193292 . G A 381.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=31.77;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:10:409,0,10 -chr15 44193478 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=34.38;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:372,0,122 -chr15 44262120 . G A 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.621;DP=360;FS=7.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,75:359:99:1358,0,10930 -chr15 44385022 . T A 1782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=1.481;DP=554;FS=10.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:443,110:553:99:1811,0,16537 -chr15 44387892 . C T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=-0.652;DP=524;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=1.79;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:435,85:520:99:966,0,17011 -chr15 44469225 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=35;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=16.96;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:622,0,551 -chr15 44473952 . TA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.507;DP=39;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:243,0,507 -chr15 44508904 . A G 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-1.157;DP=85;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:470,0,2779 -chr15 44611345 . G GCA 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-0.787;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:467,0,680 -chr15 44728909 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=1.473;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:385,0,718 -chr15 44808468 . C T 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.547;DP=58;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=23.55;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,39:58:99:1394,0,506 -chr15 44930161 . G T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-0.151;DP=40;FS=11.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=25.59;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1052,0,266 -chr15 44947325 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=1.859;DP=42;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:270,0,1213 -chr15 45636815 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.627;DP=32;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:519,0,646 -chr15 45660785 . G GCGGCAC 1073.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.758;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=28.26;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:43:1111,43,0 -chr15 45672975 . G GCAGCCC 342.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,12:12:9:379,0,9 -chr15 45682871 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-1.448;DP=71;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:490,0,2009 -chr15 45685114 . GCTGACAAAAACAGACTAATTAGATTTACTCCATTATTAACTACATCATAAGTATGAGGATAAGTTAACAGGGTTTAC G 1227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=4.914;DP=43;FS=10.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=28.55;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1265,0,5516 -chr15 45716657 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.451;DP=131;FS=6.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,36:131:99:887,0,3718 -chr15 45730218 . A G 908.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.196;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=33.65;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:7:936,0,7 -chr15 45730760 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=-0.044;DP=38;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:648,0,659 -chr15 45993312 . C T 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-2.027;DP=334;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,62:333:99:997,0,10480 -chr15 45996658 . G A 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-2.105;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,53:247:99:987,0,7389 -chr15 46010016 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.954;DP=269;FS=4.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,51:269:99:704,0,7946 -chr15 46101151 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-0.820;DP=68;FS=2.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:487,0,1744 -chr15 46445232 . C A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DP=72;FS=8.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:620,0,1735 -chr15 46462792 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=-1.966;DP=54;FS=13.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:240,0,1545 -chr15 46466009 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.152;DP=128;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=8.00;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,40:128:99:1052,0,3308 -chr15 46491680 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.519;DP=35;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:439,0,828 -chr15 46533117 . C T 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-0.026;DP=143;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,51:142:99:1544,0,3033 -chr15 46536990 . G A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=1.780;DP=59;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=12.20;ReadPosRankSum=3.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:748,0,1193 -chr15 46539661 . GC G 897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.501;DP=92;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:935,0,1151 -chr15 46539989 . G C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=2.236;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:362,0,590 -chr15 46540522 . G A 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=1.567;DP=76;FS=1.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:1061,0,1602 -chr15 46553530 . GCCTGATGACAGAAACACACTCTACATCACTGAAGAACACACTAATAAAGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCA G 2184.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=1.247;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=32.60;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2222,172,0 -chr15 46559257 . C A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,256 -chr15 46586972 . C CA 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.801;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=10.28;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:356,0,398 -chr15 46727943 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.815;DP=82;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.971;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:554,0,2135 -chr15 46755211 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-1.109;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:278,0,169 -chr15 46757275 . T TG 456.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:494,33,0 -chr15 46774472 . A G 29776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=741;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,738:738:99:29805,2220,0 -chr15 46774497 . T C 20410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=507;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,505:505:99:20439,1519,0 -chr15 46774557 . A G 7420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:7449,567,0 -chr15 46774955 . A G 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 -chr15 46781614 . A G 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.196;ClippingRankSum=-3.898;DP=406;FS=14.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,86:405:99:1458,0,12386 -chr15 46781681 . A G 8940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-5.158;DP=431;FS=5.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=20.74;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,275:431:99:8969,0,5134 -chr15 46782849 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-2.721;DP=297;FS=23.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,43:296:99:324,0,10695 -chr15 46786026 . T TA 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.966;ClippingRankSum=0.360;DP=201;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,59:186:99:893,0,3098 -chr15 46786351 . C T 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=-6.049;DP=218;FS=11.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=6.75;ReadPosRankSum=4.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,92:216:99:1500,0,16612 -chr15 46786363 . C T 2732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-5.202;DP=229;FS=10.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=11.93;ReadPosRankSum=5.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,95:229:99:2761,0,16219 -chr15 46792477 . AGTCAGTGTGCTTTACTCCAGTCATTCAGTTATTTCTTTACTGCACTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACCATGTCCTTTGCTCTCCGCAG A 2090.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=2.429;DP=238;FS=3.490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=8.78;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,236:238:99:2128,773,0 -chr15 46792629 . A T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.120;DP=54;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=19.11;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1060,0,1479 -chr15 46792630 . C CT 1013.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=1.480;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=19.49;ReadPosRankSum=-1.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1051,0,1479 -chr15 46836946 . T C 384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:413,30,0 -chr15 46839726 . C T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:318,24,0 -chr15 46969324 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=2.041;DP=64;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:307,0,1845 -chr15 46969552 . T G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-3.120;DP=66;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,9:66:99:229,0,4271 -chr15 46969828 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,1:8:99:244,0,247 -chr15 46971909 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=1.157;DP=72;FS=10.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,13:72:99:237,0,2198 -chr15 46972582 . CTG C 684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=-1.467;DP=57;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:722,0,834 -chr15 46981552 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-1.427;DP=76;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:253,0,2323 -chr15 46982968 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.489;DP=69;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:284,0,1422 -chr15 46983088 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-1.347;DP=70;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=7.87;ReadPosRankSum=2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:579,0,1825 -chr15 47346021 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-0.442;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.236;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:321,0,314 -chr15 47404954 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,455 -chr15 47420891 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.196;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:404,0,124 -chr15 47422446 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,578 -chr16 14888 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-1.397;DP=32;FS=7.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=15.18;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:514,0,473 -chr16 21058 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-3.029;DP=182;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=1.31;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,29:182:99:267,0,5775 -chr16 61562 . C A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-1.543;DP=62;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:462,0,1689 -chr16 360632 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=1.122;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=17.71;ReadPosRankSum=2.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:471,0,550 -chr16 361337 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:254,0,333 -chr16 361338 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.053;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:297,0,384 -chr16 410072 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.184;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:375,0,458 -chr16 567715 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.020;DP=33;FS=3.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:234,0,823 -chr16 822998 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=-0.297;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:387,0,1930 -chr16 1293619 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.958;DP=72;FS=5.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=6.00;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:460,0,1951 -chr16 1326587 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.272;DP=67;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:346,0,1942 -chr16 1340232 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=1.330;DP=77;FS=14.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:566,0,4439 -chr16 1340235 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=1.826;DP=80;FS=8.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:566,0,4439 -chr16 1345007 . G C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=-0.883;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:505,0,1536 -chr16 1345973 . C A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-1.039;DP=57;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:993,0,2120 -chr16 1346330 . A T 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.348;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:543,0,982 -chr16 1346450 . A C 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.518;DP=65;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,33:65:99:1161,0,1174 -chr16 1349144 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.754;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,1833 -chr16 1366974 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:278,0,60 -chr16 1367539 . T A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:355,0,476 -chr16 1367591 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=-0.550;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:254,0,812 -chr16 1367650 . T G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.749;DP=35;FS=5.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:239,0,1161 -chr16 1386033 . C G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.563;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:288,0,1325 -chr16 1418420 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.941;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,38:128:99:934,0,3352 -chr16 1418986 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.247;DP=111;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:277,0,3501 -chr16 1422427 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=-0.944;DP=49;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:239,0,4368 -chr16 1423449 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=1.331;DP=77;FS=6.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:290,0,2436 -chr16 1423651 . G C 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-2.994;DP=91;FS=5.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,31:91:99:852,0,3100 -chr16 1425435 . A T 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.376;DP=77;FS=5.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:649,0,3525 -chr16 1540267 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=1.639;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=22.26;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:429,0,195 -chr16 1747074 . A C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-2.260;DP=37;FS=13.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:619,0,597 -chr16 1747518 . T C 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:435,30,0 -chr16 1747696 . G C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.353;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:311,0,333 -chr16 1754276 . A T 307.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=30.80;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:336,0,13 -chr16 2281876 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.082;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:827,0,3420 -chr16 2296686 . GAGGTAAGTGGTTATTTTACTGCATAGTCTGTACTAACAGATGATTTAGATAATGTTAATCTGTTTGCATCTCAATTTC G 8611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-1.047;DP=220;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=32.16;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,191:194:99:8649,695,0 -chr16 2296940 . G A 1470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=-1.774;DP=208;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=7.07;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,58:208:99:1499,0,5899 -chr16 2303836 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=-2.355;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,418 -chr16 2437007 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-0.664;DP=40;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:298,0,1032 -chr16 2501848 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=-0.226;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:238,0,776 -chr16 3076229 . TCA T 626.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.870;DP=126;FS=3.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:1163,0,1409 -chr16 3078385 . G A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=3.108;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:696,0,505 -chr16 3078548 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=-0.445;DP=47;FS=11.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:379,0,1434 -chr16 3078908 . G GT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=1.361;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=10.41;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:288,0,115 -chr16 3079423 . AT A 244.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-0.382;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:29:282,0,29 -chr16 3084915 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-1.571;DP=36;FS=1.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:231,0,1085 -chr16 3085522 . G T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:464,0,691 -chr16 3087379 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=1.544;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:801,0,1074 -chr16 3143639 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-1.606;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:307,0,485 -chr16 3181206 . A G 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.395;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=9.13;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,39:122:99:1251,0,3016 -chr16 3242198 . T C 379.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=31.60;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:407,0,10 -chr16 3346948 . G T 5470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-4.307;DP=208;FS=56.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=26.30;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:5499,0,5946 -chr16 3346995 . T A 5467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.420;DP=664;FS=21.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=8.23;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,130:273:99:5496,0,5968 -chr16 3672745 . T C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr16 3672746 . T C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr16 3677897 . C A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-0.866;DP=40;FS=5.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:300,0,850 -chr16 3973039 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-1.079;DP=42;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:360,0,1357 -chr16 3973148 . A G 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:229,0,25 -chr16 3973280 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,380 -chr16 3980945 . A C 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:447,33,0 -chr16 3981368 . G T 200.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:229,0,22 -chr16 3981403 . A G 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr16 3981469 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=22.15;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:294,0,181 -chr16 3981525 . A G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr16 4777867 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.393;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:392,0,720 -chr16 5102947 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-1.705;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:568,0,1964 -chr16 5458371 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.964;DP=44;FS=9.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:494,0,1242 -chr16 5458473 . T C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.261;DP=44;FS=4.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:618,0,911 -chr16 5459216 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.530;DP=66;FS=5.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:300,0,1984 -chr16 5460770 . G C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=2.800;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:422,0,793 -chr16 5484943 . A AT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-1.814;DP=33;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=8.17;ReadPosRankSum=2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:307,0,796 -chr16 5506417 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.735;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:336,0,672 -chr16 5829667 . GCCAGGTGACTGAACTTCTCTCTCACAGCAAGAAGCAGAGACTCCCTCTCTGTTTCGCTGTTATTCTGAATGTTTCTGTGTCT G 2860.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=1.263;DP=81;FS=3.064;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=33.60;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:2898,244,0 -chr16 5841598 . G GT 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.180;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:359,0,290 -chr16 5964030 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-0.049;DP=62;FS=3.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:321,0,1921 -chr16 5964248 . A G 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.372;DP=286;FS=10.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,53:285:99:862,0,9134 -chr16 5975246 . G A 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=1.569;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.058;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,64:277:99:1246,0,9009 -chr16 6227706 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.229;DP=55;FS=1.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,10:55:99:384,0,3988 -chr16 6230605 . T G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.050;DP=39;FS=5.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:330,0,2067 -chr16 6449525 . C T 1597.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.368;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.260;QD=31.33;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,47:51:64:1626,64,0 -chr16 6478905 . GAGGTAAACCTACTTGCACACAGATATCTCACACATCCTGAATTCCCATCAGTGCTTCATAATGATCTCAACTTGTTTGCTTTGCAATTTT G 3375.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.906;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=35.81;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3413,272,0 -chr16 6485207 . G C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr16 6485268 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:336,0,379 -chr16 6698253 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.731;DP=30;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:423,0,594 -chr16 6700551 . G A 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr16 6715745 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.821;DP=91;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,27:91:99:659,0,2384 -chr16 6733764 . G T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.485;DP=79;FS=4.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:642,0,2003 -chr16 6741842 . A G 1866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-1.436;DP=127;FS=8.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,54:127:99:1895,0,2381 -chr16 6743477 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.300;DP=200;FS=4.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,33:200:99:341,0,9612 -chr16 6746170 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.352;DP=180;FS=2.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=3.27;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,38:180:99:616,0,7664 -chr16 6749065 . CA C 615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.415;DP=91;FS=13.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=6.77;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:653,0,1448 -chr16 6800414 . C G 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.234;DP=80;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:911,0,1818 -chr16 6818680 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.713;DP=53;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:296,0,1490 -chr16 6821517 . T G 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=1.056;DP=85;FS=4.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:1230,0,1448 -chr16 6827256 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.761;DP=62;FS=9.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:229,0,1906 -chr16 6830100 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-2.236;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:374,0,2134 -chr16 6831398 . G A 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=1.558;DP=54;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:904,0,1868 -chr16 6839512 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-0.089;DP=72;FS=5.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:370,0,2146 -chr16 6839723 . G GT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.661;DP=60;FS=6.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:265,0,954 -chr16 6842746 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-0.471;DP=65;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:269,0,1949 -chr16 6843267 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-1.133;DP=78;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:430,0,2333 -chr16 6856863 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-2.726;DP=31;FS=16.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:269,0,777 -chr16 6857067 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-0.113;DP=47;FS=1.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:240,0,1292 -chr16 6857373 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=1.340;DP=45;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.31;ReadPosRankSum=2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:312,0,1513 -chr16 6857485 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.443;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:305,0,1380 -chr16 6860959 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:360,0,580 -chr16 6892586 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=-0.361;DP=26;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:327,0,889 -chr16 6895764 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=1.656;DP=39;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:269,0,1058 -chr16 6952954 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=1.508;DP=42;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=8.38;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:380,0,1011 -chr16 6967467 . G C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.407;DP=30;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:273,0,1633 -chr16 6973914 . A C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-1.534;DP=36;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:229,0,1072 -chr16 6973975 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-1.815;DP=29;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:265,0,742 -chr16 6974405 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.880;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:236,0,877 -chr16 7044886 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-0.735;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=7.26;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:297,0,2118 -chr16 7044887 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.598;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:297,0,2118 -chr16 7062283 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.860;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:338,0,493 -chr16 7435637 . TA T 2224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=-1.181;DP=273;FS=0.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,88:260:99:2262,0,4680 -chr16 7435661 . T TAA 2382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.386;ClippingRankSum=-2.393;DP=274;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,106:233:99:3174,0,3994 -chr16 7445100 . TCTTCTCCATGGAAACAATGGGGAGACAGAAAGAGAGGGCTCATGTAGGAAGAACAGAAGACAGCGTAAAAGAGCTGAGGGAACGAGAGCTGGACTGAGCGTTAC T 1205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.218;QD=28.33;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:1243,0,5751 -chr16 7445805 . A G 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.821;DP=436;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.976;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,92:436:99:1740,0,13224 -chr16 7575811 . A T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:294,0,143 -chr16 7601552 . G T 4912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-2.605;DP=362;FS=5.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,145:362:99:4941,0,7180 -chr16 7618603 . C G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.637;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:247,0,1979 -chr16 7623305 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=-0.572;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=20.73;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:650,0,400 -chr16 7864739 . GAGGTAGTATTTCTTAAATAAATTTATGTTGAACACAAGATCAAAAATGACAGAAACTGTGATTTGATGTGATCACCAAAATGAATCGAATCAAATAAATGAAATGTTTTCCCTCTTTT G 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:393,0,873 -chr16 7961501 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:301,0,417 -chr16 8034586 . T C 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=1.836;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=8.01;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,39:125:99:1037,0,3344 -chr16 8034803 . C T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=-0.720;DP=113;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,29:113:99:697,0,3284 -chr16 8063271 . A C 1580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-0.204;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,44:93:99:1609,0,1580 -chr16 8133607 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.967;DP=65;FS=1.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:320,0,2205 -chr16 8148265 . C A 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:444,33,0 -chr16 8150711 . TC T 337.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:375,36,0 -chr16 8168644 . CT C 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.528;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:458,0,1563 -chr16 8200341 . A C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:314,0,92 -chr16 8405979 . A G 1378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.797;DP=199;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=6.93;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,60:198:99:1407,0,5237 -chr16 8634959 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.076;DP=39;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:307,0,1817 -chr16 8635493 . G GT 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-0.489;DP=67;FS=3.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:594,0,864 -chr16 8651809 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.306;DP=45;FS=4.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:371,0,1159 -chr16 8659374 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.520;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:403,0,542 -chr16 8859084 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=19.60;ReadPosRankSum=-2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:381,0,295 -chr16 8876799 . A C 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.550;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=24.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:470,0,116 -chr16 8935584 . C G 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-1.704;DP=70;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:852,0,1590 -chr16 8944955 . A T 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.192;DP=81;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:913,0,1745 -chr16 8944961 . AAGGTATTGATACACACAGGCATTATCAAAATCTATAAATGATCATGTACATGGTGTGTGATTTTTTGACGTGTGCTGTTAATGAC A 3528.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.397;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:83:99:3566,298,0 -chr16 8963187 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-0.039;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:270,0,4087 -chr16 8963376 . A T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.633;DP=144;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,25:144:99:418,0,9711 -chr16 8963378 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.652;DP=145;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,25:145:99:437,0,9711 -chr16 8963679 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-0.994;DP=109;FS=2.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,21:108:99:373,0,3307 -chr16 8965439 . A AC 505.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.984;DP=72;FS=0.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.740;QD=7.02;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:543,0,1909 -chr16 8966347 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=1.786;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:305,0,1926 -chr16 9054081 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=22.23;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,120 -chr16 9054988 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=-1.078;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:321,0,634 -chr16 9350926 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.101;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:374,0,812 -chr16 9566122 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.647;DP=108;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,24:108:99:600,0,6693 -chr16 9566128 . A T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=-1.218;DP=110;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:600,0,6693 -chr16 9667787 . G T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:41:333,0,41 -chr16 10728245 . A T 332.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:361,27,0 -chr16 10734521 . T A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr16 10736335 . G C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=1.795;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:305,0,474 -chr16 10739351 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr16 10761197 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-3.095;DP=32;FS=13.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:432,0,705 -chr16 10761304 . C T 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.273;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=16.65;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:944,0,974 -chr16 10761357 . T G 446.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:475,33,0 -chr16 10780902 . G A 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:651,45,0 -chr16 10823135 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=-2.166;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=21.78;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:246,0,98 -chr16 10823168 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-1.790;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=19.99;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:348,0,198 -chr16 10974286 . T C 1433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-1.966;DP=66;FS=3.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=21.72;ReadPosRankSum=1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,42:66:99:1462,0,804 -chr16 10993867 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=1.940;DP=44;FS=6.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:541,0,1042 -chr16 10993996 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=3.425;DP=25;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:254,0,753 -chr16 11022530 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:273,0,103 -chr16 11050020 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr16 11071421 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.790;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:238,0,2089 -chr16 11088619 . TA T 1089.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=-0.090;DP=120;FS=14.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=9.08;ReadPosRankSum=-3.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:1127,0,1062 -chr16 11187662 . G C 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-1.497;DP=65;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1234,0,898 -chr16 11308511 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.483;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:417,0,2230 -chr16 11353751 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.410;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:337,0,2184 -chr16 11355387 . A C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=2.007;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:339,0,391 -chr16 11371764 . A G 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=-2.219;DP=257;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,48:257:99:567,0,10224 -chr16 11572177 . GT G 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=-0.561;DP=53;FS=6.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:638,0,814 -chr16 11633961 . G GT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-1.205;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:249,0,780 -chr16 11801253 . G A 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.216;DP=45;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:786,0,820 -chr16 11811271 . G A 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-2.030;DP=44;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:787,0,800 -chr16 11811349 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=1.481;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:615,0,979 -chr16 11811354 . C A 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.215;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.057;QD=29.33;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:996,0,254 -chr16 11814156 . A T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.371;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:714,0,184 -chr16 11819161 . T G 1573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1602,114,0 -chr16 11819525 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.079;DP=38;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:361,0,937 -chr16 11821599 . A G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.462;DP=36;FS=5.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=18.91;ReadPosRankSum=-2.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:709,0,583 -chr16 11821611 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.048;DP=39;FS=3.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:266,0,1167 -chr16 11821778 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.628;DP=47;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:862,0,1162 -chr16 11822076 . G A 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-0.507;DP=33;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=27.93;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:950,0,108 -chr16 11826184 . A G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=1.159;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:516,0,1498 -chr16 11826190 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.131;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:516,0,1500 -chr16 11826549 . A C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:302,21,0 -chr16 11826628 . A T 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=1.171;DP=40;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1132,0,231 -chr16 11826639 . G C 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.428;DP=42;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:1267,0,240 -chr16 11826747 . G A 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.129;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,43:54:99:1778,0,222 -chr16 11826824 . G A 1839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1868,141,0 -chr16 11827054 . G C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.833;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:704,0,127 -chr16 11827064 . A G 1088.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:78:1117,78,0 -chr16 11827111 . A G 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:560,39,0 -chr16 11827455 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=1.096;DP=36;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:239,0,1034 -chr16 11905050 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.879;DP=290;FS=0.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,46:290:99:457,0,19730 -chr16 11940832 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=-1.692;DP=380;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:323,53:376:99:355,0,12779 -chr16 11942799 . C T 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=5.580;DP=278;FS=15.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,85:278:99:1913,0,8558 -chr16 11943021 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.144;DP=289;FS=7.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,45:288:99:405,0,9104 -chr16 11950722 . TGGTAGACGAAGCAAGACATAAAGAATATTATTGAAAGATATGATAACAGACTGTTGTTAAGCTTTTTTTTTTCTTGCTGTA T 2937.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.792;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=29.04;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2975,224,0 -chr16 11956125 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.681;DP=50;FS=8.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:853,0,824 -chr16 12048320 . GAGGTAGAGTGATCATTTCAGCATCCTTTTTACTTATTGACACTGAGATAAACAGACAGCTGATCATCTCCTTCAAC G 5305.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=2.569;DP=137;FS=10.253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=28.59;ReadPosRankSum=2.309 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,121:124:99:5343,493,0 -chr16 12226628 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.116;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.572;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:398,0,2153 -chr16 12340820 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,244 -chr16 12341149 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=-0.779;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:229,0,216 -chr16 12341251 . T G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.457;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=17.77;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:437,0,326 -chr16 12678817 . ACCTCCT A 219.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:257,22,0 -chr16 12685798 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr16 12693486 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.920;DP=31;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:375,0,724 -chr16 12695546 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=-1.002;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:454,0,295 -chr16 12695571 . T A 455.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=28.03;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2:482,0,2 -chr16 12695721 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:253,0,283 -chr16 12696738 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=-0.466;DP=39;FS=8.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=5.17;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:230,0,1126 -chr16 12841224 . G T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=1.043;DP=55;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:392,0,2225 -chr16 12841467 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.867;DP=46;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:387,0,1077 -chr16 12843299 . T C 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr16 12843495 . G C,T 462.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,12,3:15:92:587,127,92,463,0,456 -chr16 12843576 . GA G 1709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.510;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,20:25:59:1747,59,0 -chr16 12843636 . G C 1743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:83:1772,83,0 -chr16 12843658 . T G 1743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:83:1772,83,0 -chr16 12844050 . A AT 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.070;DP=29;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:269,0,386 -chr16 12845919 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.689;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:473,0,1419 -chr16 12891870 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=23.67;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:336,0,264 -chr16 12919856 . C T 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=1.022;DP=60;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1040,0,878 -chr16 12931748 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.590;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,860 -chr16 12946350 . T A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=1.366;DP=123;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,27:123:99:501,0,3582 -chr16 13050790 . CA C 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-2.665;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.86;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:298,0,266 -chr16 13327599 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.386;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:269,0,712 -chr16 13504984 . T TATGGTCCATGGG 1159.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1197,0,3897 -chr16 13724569 . TCTGGACAACAAAGACAAGACAAAATGAGAAGATGCACCTGAAGGTAGAAAAAAATAGGAGGAGAAAGTCATAATCATTAC T 11605.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.596;DP=265;FS=4.804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=26.74;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,246:250:99:11643,1054,0 -chr16 13813916 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:27:387,27,0 -chr16 13814208 . C A 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:53:720,53,0 -chr16 13814225 . C T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:53:720,53,0 -chr16 13814313 . T G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-1.056;DP=33;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:371,0,454 -chr16 13814385 . T A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-1.939;DP=46;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:519,0,614 -chr16 13814953 . C T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-2.012;DP=55;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:979,0,1007 -chr16 14047740 . CACCTATGAAAAGAGAAACCAACTGTAACCTCTTCCTTCTTCCAGCATAGTTGCTCTGTGACTGAAGTAGCTAAAGTACTG C 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=2.143;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=34.11;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:583,0,484 -chr16 14275763 . C A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.830;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:368,0,536 -chr16 14376182 . CAGGTGAGACCGATGAGTTGCTCCACAGGTTTTTTAAAAAAACACTCTTCATTTCTCATGATCTCTTTCTTTTCA C 1107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.797;DP=44;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=25.18;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,33:42:99:1145,0,1221 -chr16 14469413 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-1.071;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=29.87;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:75:536,0,75 -chr16 14497140 . C G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-1.466;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.76;ReadPosRankSum=3.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:294,0,389 -chr16 14497177 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=13.74;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,330 -chr16 14498220 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:238,0,447 -chr16 14524913 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.434;DP=31;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=10.96;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:368,0,713 -chr16 14558550 . C G 1532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.596;DP=125;FS=3.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,45:123:99:1561,0,2621 -chr16 14568242 . CCAGGCATGTGTTTTACTTATTAATCATCAATATTTTACATTCATATTTATATTTCTGATTTTCATTCATGCTTTTGTTGACCTTTTTTTCTGGTGGGTTATTTACTGTGGATCATTATTGATCACACT C 3414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-2.708;DP=187;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.662;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,108:181:99:3452,0,14025 -chr16 14568243 . CAGGCATGTGTTTTACTTATTAATCATCAATATTTTACATTCATATTTATATTTCTGATTTTCATTCATGCTTTTGTTGACCTTTTTTTCTGGTGGGTTATTTACTGTGGATCATTATTGATCACACTCAGGTTCTCTCCCTGT C 1798.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.364;ClippingRankSum=2.843;DP=205;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,63:200:99:1836,0,25035 -chr16 14568396 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=-3.495;DP=190;FS=4.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,37:190:99:610,0,5669 -chr16 14572343 . CT C 888.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.262;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=26.93;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:70:926,0,70 -chr16 14619679 . T C 211.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:240,0,18 -chr16 15256239 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:312,0,159 -chr16 15257048 . AT A 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=1.033;DP=26;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:81:491,0,81 -chr16 15424947 . T C 4810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.587;DP=50;FS=3.234;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,38:49:99:4839,170,0 -chr16 15424948 . T C 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.979;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1357,0,991 -chr16 15431908 . T G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.418;DP=306;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,54:306:99:710,0,9482 -chr16 15453020 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.425;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:323,0,2249 -chr16 15623204 . C CA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=18.86;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:399,0,216 -chr16 15623609 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.376;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:325,0,353 -chr16 15721702 . ACTGTCAGGAAAAAAAATATATATAATAACAGCAATACTTTGTGAATAGAGACTAGATTTACAGAAACTTAC A 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.955;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=19.72;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:412,0,213 -chr16 15741347 . T C 1808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1837,129,0 -chr16 15741820 . AC A 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-0.158;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:292,0,339 -chr16 15768093 . C G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr16 15775782 . C T 4914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.803;DP=393;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.170;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,144:392:99:4943,0,8524 -chr16 15786747 . CA C 9762.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,1:3:99:9800,886,0 -chr16 15787523 . AT A 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=2.708;DP=141;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,28:138:99:362,0,3334 -chr16 15788075 . A C 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.267;DP=47;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:776,0,914 -chr16 15792760 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=1.554;DP=27;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=19.32;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:550,0,448 -chr16 15794105 . T A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-1.195;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:423,0,506 -chr16 15816237 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:236,0,305 -chr16 15824011 . C CT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=17.30;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:86:314,0,86 -chr16 15824058 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,137 -chr16 15953638 . A T 265.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:294,24,0 -chr16 15975948 . G A 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.601;DP=162;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,65:162:99:2116,0,3204 -chr16 15980561 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=1.059;DP=36;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:235,0,1134 -chr16 15981820 . GCAAGAGGTGTGTAACAATAATCAGACGGATTATA G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=1.313;DP=17;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:277,0,1723 -chr16 15981858 . GATTTACCTTTCTGTCCAAGTGTTTGTTTTGATCTTTCTGCTTTTTTGTTTCACTTTGGCTC G 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=1.794;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:277,0,1723 -chr16 15982093 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.564;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=16.10;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:624,0,708 -chr16 15988876 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.564;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:324,0,527 -chr16 15988951 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.093;DP=43;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=7.32;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:343,0,1116 -chr16 15991151 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:473,0,222 -chr16 15996916 . C A 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-1.014;DP=69;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1282,0,1237 -chr16 15997066 . C G 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=1.010;DP=98;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=6.07;ReadPosRankSum=2.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,27:98:99:623,0,2751 -chr16 15997128 . T C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=1.571;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:912,0,5483 -chr16 15997130 . T C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=1.928;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:912,0,5483 -chr16 16006270 . G A 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.760;DP=129;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,43:114:99:1434,0,2406 -chr16 16023282 . C T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.829;DP=46;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:781,0,1086 -chr16 16023370 . C A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.411;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:477,0,849 -chr16 16031991 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.757;DP=64;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:861,0,1343 -chr16 16032015 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-0.319;DP=58;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:674,0,1345 -chr16 16042429 . A AGACAGTCG 1639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.132;DP=49;FS=5.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=33.46;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,39:48:99:1677,0,178 -chr16 16045742 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.293;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:336,0,622 -chr16 16148849 . A T 1354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1383,99,0 -chr16 16148865 . A T 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr16 16148935 . C A 3014.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:3043,211,0 -chr16 16149371 . G A 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1455,102,0 -chr16 16149467 . A T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=-0.692;DP=56;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=16.07;ReadPosRankSum=3.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:928,0,1085 -chr16 16149524 . A G 982.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.763;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=32.64;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:1011,72,0 -chr16 16149602 . G A 2440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2469,172,0 -chr16 16149672 . G T 1372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1401,96,0 -chr16 16150031 . AT A 6019.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:6057,465,0 -chr16 16150072 . T G 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1455,102,0 -chr16 16150269 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.859;ClippingRankSum=1.430;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=6.39;ReadPosRankSum=-4.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:239,0,896 -chr16 16483415 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,138 -chr16 16678580 . CT C 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=-0.592;DP=46;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:452,0,775 -chr16 16678706 . C T 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-1.264;DP=154;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,69:154:99:2500,0,2973 -chr16 16678727 . A C 2852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-3.494;DP=185;FS=3.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,80:184:99:2881,0,3507 -chr16 16678747 . G A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=3.182;DP=211;FS=11.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,38:211:99:599,0,6869 -chr16 16678958 . A AC 1712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.728;DP=132;FS=4.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,56:131:99:1750,0,3810 -chr16 16679081 . T A,C 5109.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,98,33:131:99:5120,1064,1397,4130,0,7893 -chr16 16679102 . T A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=-0.419;DP=111;FS=5.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:618,0,7899 -chr16 16679180 . A T 1853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=7.333;DP=150;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,53:150:99:1882,0,3537 -chr16 16679468 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.946;DP=128;FS=19.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:704,0,3787 -chr16 16679539 . A G 2131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=-0.878;DP=176;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=12.11;ReadPosRankSum=4.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,62:176:99:2160,0,4101 -chr16 16679617 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=4.545;DP=159;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=3.33;ReadPosRankSum=-2.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,31:158:99:558,0,4736 -chr16 16680154 . AC A 4708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.288;ClippingRankSum=2.076;DP=264;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,126:263:99:4746,0,9389 -chr16 16680321 . T C 3876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-2.805;DP=198;FS=14.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=19.58;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,117:198:99:3905,0,2971 -chr16 16691845 . C T 3390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=-1.409;DP=251;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,99:249:99:3419,0,5036 -chr16 16691871 . T A 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-3.084;DP=225;FS=10.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,42:224:99:651,0,6916 -chr16 16691932 . A T 3348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-2.134;DP=175;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=19.14;ReadPosRankSum=-3.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,100:172:99:3377,0,2750 -chr16 16692022 . T TC 2202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.765;ClippingRankSum=0.412;DP=92;FS=27.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.327;QD=23.94;ReadPosRankSum=2.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,65:82:99:2240,0,713 -chr16 16692035 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;ClippingRankSum=0.493;DP=70;FS=18.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:256,0,4506 -chr16 16692063 . G GC 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DP=42;FS=17.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=6.02;ReadPosRankSum=-3.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:290,0,676 -chr16 16692065 . C CT 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=-0.047;DP=30;FS=17.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=14.89;ReadPosRankSum=2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:484,0,320 -chr16 16711651 . C T 814.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:843,60,0 -chr16 16711755 . T A 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 -chr16 16711905 . T G 1067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1096,81,0 -chr16 16712032 . T A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr16 16712034 . C G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:346,24,0 -chr16 16883244 . A C 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.018;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:596,0,573 -chr16 16970353 . G T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.957;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:333,0,883 -chr16 16992379 . A G 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr16 16992385 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr16 17344884 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.067;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:311,0,469 -chr16 17345038 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:375,0,787 -chr16 17377550 . T C 3662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.503;DP=231;FS=2.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.710;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,106:231:99:3691,0,4207 -chr16 17389540 . C A 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=1.448;DP=212;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,52:212:99:1162,0,6074 -chr16 17400055 . G T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.542;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:486,0,1126 -chr16 17400056 . T G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=1.252;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:314,0,1458 -chr16 18091641 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.913;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:566,0,412 -chr16 18092628 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-0.055;DP=33;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:475,0,595 -chr16 18126228 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.208;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,491 -chr16 18148620 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr16 18283695 . C A 2680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.078;DP=90;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,64:89:99:2709,0,892 -chr16 18285074 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.032;DP=144;FS=2.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,28:144:99:480,0,5901 -chr16 18323642 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.484;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:285,0,2831 -chr16 18369550 . C G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-2.220;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=4.51;ReadPosRankSum=2.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,29:127:99:601,0,3674 -chr16 18371603 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.582;DP=65;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:279,0,1953 -chr16 18451614 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,168 -chr16 18595824 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.092;DP=152;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,27:152:99:388,0,4826 -chr16 18605185 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:242,0,61 -chr16 18720635 . T A 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.379;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:801,0,130 -chr16 18745721 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.063;DP=47;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:253,0,1429 -chr16 18746281 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.007;DP=36;FS=5.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:290,0,927 -chr16 18977351 . G T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.166;ClippingRankSum=0.026;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:385,0,1574 -chr16 18992334 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.386;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=8.24;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,838 -chr16 19003047 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=1.843;DP=68;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:271,0,1991 -chr16 19004299 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.681;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:312,0,1022 -chr16 19005313 . T A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.644;DP=30;FS=7.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.975;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:500,0,603 -chr16 19006290 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=28.89;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:346,0,50 -chr16 19007044 . T TA 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-1.184;DP=22;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:374,0,121 -chr16 19254587 . A C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.391;DP=387;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,53:387:99:255,0,21903 -chr16 19256698 . TCCTGTTTAGGCAGAGATCATGAGCATAGCCCAATGCTTGCAAAAATAATCATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAAAACCATGCATAGTTTGGAATAACAGCACTCA T 16541.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=361;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,361:361:99:16579,1415,0 -chr16 19296875 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.891;DP=169;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,38:169:99:258,0,8727 -chr16 19311182 . GACATCATCATCATCA G 2734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=-1.151;DP=156;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,82:145:99:2772,0,2484 -chr16 19311183 . ACATCATCATCATCAT A 1542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=-0.464;DP=153;FS=3.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=10.08;ReadPosRankSum=2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,46:132:99:1580,0,3028 -chr16 19311198 . T G 2733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-0.270;DP=129;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,70:121:99:2762,0,2484 -chr16 19314776 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-1.134;DP=71;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:251,0,2031 -chr16 19319435 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.245;DP=74;FS=4.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:638,0,1980 -chr16 19319669 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-1.241;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,21:102:99:365,0,3104 -chr16 19343460 . GCTGAAACACACACACAAATCACAACCACTTCTACCAAATAAGTTAAACCCATCTCAGGATAAAGTTGTGTTTGTAC G 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:313,0,662 -chr16 19362891 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.894;DP=128;FS=6.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,22:128:99:287,0,3958 -chr16 19363096 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-2.097;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,34:140:99:710,0,4007 -chr16 19537330 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr16 19611066 . CAA C 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-1.203;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:97:422,0,97 -chr16 19611325 . T TTA 498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:34:536,34,0 -chr16 19678244 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.135;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:276,0,1632 -chr16 19699853 . TAA T 485.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQ0=0;QD=19.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:59:766,59,0 -chr16 19699981 . T C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=1.460;DP=34;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:406,0,841 -chr16 19733044 . CTG C 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=-1.461;DP=24;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.49;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:697,0,194 -chr16 19782656 . AT A 2236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.120;DP=168;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.462;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,95:153:99:2296,0,729 -chr16 19782732 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,258 -chr16 19813938 . A G 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:539,36,0 -chr16 19814605 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-3.065;DP=24;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:399,0,201 -chr16 19814614 . A G 461.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:490,33,0 -chr16 19816486 . T A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.227;DP=43;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.857;QD=18.55;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:826,0,1177 -chr16 19816490 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.647;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:482,0,1662 -chr16 19816873 . A G 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:528,39,0 -chr16 19817514 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr16 20172666 . A T 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:481,33,0 -chr16 20527466 . C CA 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.317;DP=25;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:280,0,239 -chr16 20810335 . G A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr16 21495766 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.462;DP=103;FS=6.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:489,0,2900 -chr16 21660854 . A C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.119;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:295,0,950 -chr16 21663705 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.042;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.36;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:244,0,464 -chr16 22217892 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.100;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:467,0,2468 -chr16 22222777 . T TGATTGC 1839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-0.876;DP=79;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,51:74:99:1877,0,646 -chr16 22354634 . A AT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.100;DP=36;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:294,0,571 -chr16 22354676 . A AT 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.524;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:831,0,700 -chr16 22354680 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-0.757;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:260,0,2537 -chr16 22355540 . G GT 444.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.628;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:42:534,42,0 -chr16 22378959 . T A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.185;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:433,0,907 -chr16 22381387 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.374;DP=44;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:604,0,883 -chr16 22382815 . CT C 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-0.035;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=11.90;ReadPosRankSum=-3.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:561,0,474 -chr16 22392427 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.506;DP=37;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:604,0,1286 -chr16 22394826 . T TA 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.212;DP=22;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=19.08;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:32:458,0,32 -chr16 22395728 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=2.219;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:235,0,402 -chr16 22395730 . C G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=2.793;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=17.23;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:235,0,402 -chr16 22396758 . G A 465.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:494,36,0 -chr16 22397312 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=-1.714;DP=107;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,24:107:99:471,0,3256 -chr16 22397635 . TTA T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.181;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,464 -chr16 22397788 . GTT G,GT 1507.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.85;MQ0=0;QD=23.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,49,10:59:99:2076,212,411,1549,0,1407 -chr16 22397966 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=27.83;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:54:248,0,54 -chr16 22398151 . C CT 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.154;DP=28;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.24;ReadPosRankSum=-1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:268,0,271 -chr16 22602549 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=2.672;DP=139;FS=0.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:238,0,5315 -chr16 22602573 . C A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=1.020;DP=147;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=5.23;ReadPosRankSum=-4.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,37:147:99:797,0,4302 -chr16 22616586 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,146 -chr16 22886012 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.754;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.679;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:347,0,1180 -chr16 22888151 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.241;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,10:48:99:235,0,3216 -chr16 22888160 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-1.242;DP=52;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,10:52:99:235,0,3216 -chr16 22890963 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.876;DP=244;FS=3.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=2.15;ReadPosRankSum=2.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,41:243:99:554,0,7849 -chr16 22891222 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.443;DP=242;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=2.26;ReadPosRankSum=2.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,41:234:99:574,0,7353 -chr16 22906989 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.687;DP=289;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,59:289:99:1081,0,9191 -chr16 23123768 . GAA G 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=1.131;DP=75;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:290,0,2887 -chr16 23131100 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.025;DP=94;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:287,0,2972 -chr16 23131144 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=1.210;DP=88;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:349,0,2808 -chr16 23220138 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.869;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:242,0,1315 -chr16 23526882 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.506;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,460 -chr16 23528337 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=1.193;DP=51;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:379,0,1420 -chr16 23528431 . A AG 497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.845;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:535,0,185 -chr16 23528677 . T A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.615;DP=20;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:93:657,0,93 -chr16 23528719 . G GT 363.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:9:400,9,0 -chr16 23530405 . TA T 671.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.251;DP=32;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:3:707,0,3 -chr16 23634403 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-2.681;DP=89;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,18:89:99:317,0,2852 -chr16 23638716 . T A 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.559;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:726,0,2435 -chr16 23645542 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=1.323;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:249,0,528 -chr16 23649617 . G A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr16 23665002 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.374;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:298,0,2166 -chr16 23678567 . A T 1059.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1088,78,0 -chr16 23679306 . T C 1260.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1289,90,0 -chr16 23679566 . C A 747.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:776,57,0 -chr16 23679657 . GT G 285.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:18:323,0,18 -chr16 23679873 . T A 1973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-0.624;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:2002,147,0 -chr16 23680004 . G A 2169.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2198,160,0 -chr16 23680138 . G A 1282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1311,93,0 -chr16 23680377 . T G 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1124,78,0 -chr16 23735690 . C T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.826;DP=43;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=13.48;ReadPosRankSum=2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:608,0,871 -chr16 23817260 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.436;DP=50;FS=4.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=15.10;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:783,0,938 -chr16 23821742 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-0.693;DP=36;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:290,0,925 -chr16 23937184 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.749;DP=187;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,41:187:99:810,0,5717 -chr16 23948730 . G C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.184;DP=198;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=4.66;ReadPosRankSum=2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,46:198:99:951,0,5883 -chr16 23967317 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.427;DP=151;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,30:151:99:519,0,4520 -chr16 23970068 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=1.626;DP=119;FS=10.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,22:119:99:364,0,3911 -chr16 24081593 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-1.115;DP=45;FS=11.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:678,0,1777 -chr16 24081874 . T C 1165.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1194,87,0 -chr16 24086360 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.623;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,26:149:99:377,0,4964 -chr16 24092226 . G A 1770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.161;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.579;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,54:160:99:1799,0,3610 -chr16 24093273 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-0.414;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,24:119:99:460,0,3501 -chr16 24094927 . G A 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.529;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,45:141:99:1068,0,3483 -chr16 24095552 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.646;DP=115;FS=6.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,20:115:99:290,0,3668 -chr16 24095757 . G A 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=2.762;DP=132;FS=9.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:815,0,3496 -chr16 24096951 . A T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.213;DP=137;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.024;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,26:136:99:462,0,4239 -chr16 24098057 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.145;DP=149;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,25:149:99:330,0,4774 -chr16 24098074 . ACTGTGGAGAAAAACACAATGTTACTGTAAAATCTTTGCATCTATAAAATGACATAATATAAAACCTCGAACTTAC A 6061.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.898;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,136:137:99:6099,489,0 -chr16 24102414 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:233,0,425 -chr16 24113219 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=-0.161;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:311,0,992 -chr16 24151467 . A T 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1515,108,0 -chr16 24151770 . A G 3021.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:3050,244,0 -chr16 24151876 . GA G 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.168;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:406,0,362 -chr16 24166277 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-1.685;DP=43;FS=5.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:233,0,1209 -chr16 24167512 . G C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.207;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:580,0,566 -chr16 24167514 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.276;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:484,0,1131 -chr16 24168697 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=1.280;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:333,0,359 -chr16 24172549 . C G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-1.519;DP=60;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:405,0,1382 -chr16 24174500 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.584;DP=85;FS=6.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=10.50;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:921,0,1603 -chr16 24180550 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.650;DP=57;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.845;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:742,0,1210 -chr16 24438927 . G C 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:448,33,0 -chr16 24484564 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,379 -chr16 24525911 . A C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.788;DP=19;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:282,0,279 -chr16 24525952 . TA T 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=1.237;DP=17;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.062;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:245,0,936 -chr16 24525954 . A T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=1.588;DP=18;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.117;QD=12.04;ReadPosRankSum=-2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,936 -chr16 24531902 . T C 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1562,116,0 -chr16 24534971 . A G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:359,0,81 -chr16 24703630 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=1.932;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,191 -chr16 24757457 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.102;DP=23;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,470 -chr16 24757828 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-1.150;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:272,0,949 -chr16 24758541 . G A 959.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:988,69,0 -chr16 24758687 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.258;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:517,0,590 -chr16 24758912 . G C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.953;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:379,0,291 -chr16 24759421 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.896;DP=15;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:295,0,947 -chr16 24783487 . CCA C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=-0.322;DP=18;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.37;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:32:314,0,32 -chr16 24783972 . A T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=-2.096;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:311,0,404 -chr16 24840199 . A G 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.493;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=31.38;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:593,0,111 -chr16 24840208 . T G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-1.077;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:410,0,398 -chr16 24840916 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr16 24841024 . G A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:349,27,0 -chr16 24841096 . T C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.873;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=32.30;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:31:545,0,31 -chr16 24962888 . A C 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=-2.341;DP=87;FS=4.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:598,0,4042 -chr16 24962957 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-1.595;DP=47;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:229,0,2009 -chr16 24963632 . C G 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-1.120;DP=108;FS=3.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,24:108:99:513,0,3224 -chr16 24963940 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=1.428;DP=121;FS=3.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,22:121:99:307,0,4699 -chr16 24963945 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.239;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,22:121:99:289,0,4777 -chr16 24964493 . G C 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.319;DP=109;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,31:109:99:774,0,2930 -chr16 25049374 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.974;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=3.80;ReadPosRankSum=2.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:256,0,1777 -chr16 25522187 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-0.139;DP=72;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:297,0,2075 -chr16 25534285 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=-1.787;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:251,0,3579 -chr16 25537017 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.788;DP=104;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:350,0,3319 -chr16 25554359 . CT C 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.315;DP=33;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:318,0,108 -chr16 25554718 . C CTT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-1.368;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:350,0,321 -chr16 25555213 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:373,0,359 -chr16 25557962 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-2.053;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=7.43;ReadPosRankSum=1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:266,0,800 -chr16 25625295 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=-0.571;DP=497;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:415,81:496:99:883,0,15962 -chr16 25726383 . C CT 1224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-2.595;DP=497;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:387,99:486:99:1262,0,9077 -chr16 25726411 . G C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=5.505;DP=804;FS=1.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=0.98;ReadPosRankSum=-5.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:688,114:802:99:819,0,26792 -chr16 25730636 . GA G 321.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.953;DP=17;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=18.93;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:359,0,17 -chr16 25786589 . AGTACATGCGCACTCTTTTATTTGCTTTTTACAGCAGCAGCAGGACGATCATCTCAGTGTGTCTCTTTCTCGCTGCCATGCCATAACCAAGAGAACAAATGAATTAACCCTATTTCTCTTTCAG A 2350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.082;DP=70;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=33.58;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,55:65:99:2388,0,2497 -chr16 25786755 . A T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.597;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:356,0,1786 -chr16 25786809 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=-1.034;DP=66;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:467,0,1780 -chr16 26031962 . A G 1087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:78:1116,78,0 -chr16 26031963 . C T 872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.537;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=31.88;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:29:901,29,0 -chr16 26032050 . A G 1136.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.048;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=28.42;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:47:1165,47,0 -chr16 26039238 . T TA 2267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-1.386;DP=96;FS=3.716;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=23.62;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:2379,150,0 -chr16 26048509 . A G 790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:60:819,60,0 -chr16 26089193 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=2.203;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:330,0,1904 -chr16 26102243 . A C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-0.970;DP=59;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:263,0,1820 -chr16 26103818 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=-1.448;DP=38;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.736;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:314,0,1122 -chr16 26114633 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.872;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:469,0,391 -chr16 26116990 . CA C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.919;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=19.77;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:314,0,100 -chr16 26140687 . C T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.093;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.393;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1127,0,368 -chr16 26154337 . G A 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.945;DP=412;FS=5.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:333,78:411:99:1222,0,13083 -chr16 26154454 . G C 11335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,44:44:99:11364,0,1977 -chr16 26154556 . G A 11335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=1.980;DP=194;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=33.27;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,93:192:99:11364,0,1990 -chr16 26154598 . T G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:622,0,3562 -chr16 26154958 . GT G 7669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-0.863;DP=300;FS=35.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=25.57;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,227:272:99:12854,0,825 -chr16 26161692 . G A 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=9.074;DP=145;FS=0.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=12.77;ReadPosRankSum=-8.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,58:135:99:1880,0,5836 -chr16 26161706 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=1.025;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,1:98:99:703,0,7317 -chr16 26161716 . G A 1442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.761;DP=98;FS=35.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=14.72;ReadPosRankSum=3.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,44:98:99:1471,0,1886 -chr16 26161746 . T C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=-7.045;DP=146;FS=28.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,35:146:99:741,0,7315 -chr16 26161974 . T C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=-0.867;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:512,0,682 -chr16 26186933 . AGTAAGTCAAGAACATTTACCTGCTGGACATCATTATTTAGAGTATTTCTGAATGAAACTCAAATGTTCTTCTCCACCTCACAG A 11260.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=-0.034;DP=250;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,248:250:99:11298,946,0 -chr16 26187239 . G A 9844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=3.752;DP=278;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=31.59;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,62:276:99:9873,0,16381 -chr16 26187352 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=-2.393;DP=283;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.525;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,79:281:99:572,0,25375 -chr16 26200975 . AGTAAGTTCAGCCACCATTTTTAAAAACATCTATCCAGAATACTCATTTCTGCACATCATCAGTCTACAAACTGGTACTGTGACATCATTCCTGACCTGCATTTTTATTATTAATATTTTGCAG A 8030.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,169:170:99:8068,723,0 -chr16 26211868 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,460 -chr16 26219918 . C T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr16 26227651 . T A 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.516;DP=369;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,77:369:99:1381,0,11248 -chr16 26231929 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.80;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:312,0,186 -chr16 26261411 . G A 3162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=-0.325;DP=142;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=22.27;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,81:133:99:3191,0,4136 -chr16 26261420 . A G 3153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.059;DP=147;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=21.45;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,86:139:99:3182,0,4136 -chr16 26261537 . A C 5024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.953;DP=108;FS=4.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=30.16;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,52:84:99:5053,0,767 -chr16 26261576 . T TA 890.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=1.016;DP=86;FS=12.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=10.36;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:928,0,1338 -chr16 26261681 . G GA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.084;ClippingRankSum=-1.129;DP=93;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=5.22;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:523,0,1996 -chr16 26261741 . TCA T 621.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.269;DP=57;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:659,0,2219 -chr16 26261892 . T C 3815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.556;DP=160;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=23.85;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,99:127:99:3844,0,661 -chr16 26262141 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=2.888;DP=42;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:538,0,948 -chr16 26262224 . T A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.015;DP=110;FS=10.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,40:77:99:1339,0,1296 -chr16 26262229 . A T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-1.124;DP=128;FS=7.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1142,0,1808 -chr16 26262314 . C G 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.951;DP=143;FS=8.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,34:104:99:864,0,3630 -chr16 26262358 . A G 3669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=-1.631;DP=115;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=31.91;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,56:81:99:3698,0,492 -chr16 26262395 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.077;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:343,0,2531 -chr16 26262422 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.369;DP=44;FS=4.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=7.86;ReadPosRankSum=2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:374,0,2740 -chr16 26262609 . T A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.727;DP=52;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:888,0,895 -chr16 26262747 . T A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.419;DP=40;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:512,0,828 -chr16 26262780 . C A 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=2.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:843,0,914 -chr16 26262867 . A T 1978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.063;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=34.72;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,42:57:99:2007,0,325 -chr16 26263032 . C T 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=2.059;DP=51;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:947,0,1890 -chr16 26263677 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-1.463;DP=44;FS=7.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:310,0,1328 -chr16 26263956 . A T 2031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-2.897;DP=156;FS=8.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=13.02;ReadPosRankSum=2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,60:112:99:2060,0,1915 -chr16 26264274 . T C 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-1.146;DP=154;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,50:125:99:1165,0,9906 -chr16 26264328 . A T 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-2.222;DP=186;FS=13.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,58:146:99:1566,0,8461 -chr16 26264348 . C A 2926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.136;DP=146;FS=10.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=20.05;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:2955,0,5892 -chr16 26264475 . G A 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-1.511;DP=119;FS=10.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1431,0,1912 -chr16 26264640 . A G 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.870;DP=135;FS=34.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:2003,0,2084 -chr16 26264658 . G C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-1.121;DP=153;FS=9.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:578,0,3810 -chr16 26264948 . G A 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=1.133;DP=82;FS=2.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,51:79:99:1813,0,982 -chr16 26264977 . C T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.930;DP=68;FS=6.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1226,0,1022 -chr16 26265089 . G A 2428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-0.838;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.859;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,78:139:99:2457,0,3278 -chr16 26265111 . C T 4711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=-3.776;DP=162;FS=10.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,103:131:99:4740,0,466 -chr16 26265272 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=2.518;DP=80;FS=7.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:915,0,1277 -chr16 26265486 . G A 1473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;ClippingRankSum=3.681;DP=120;FS=43.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,41:91:99:1502,0,1636 -chr16 26265512 . C T 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-1.547;DP=93;FS=6.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:881,0,2356 -chr16 26265563 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.809;DP=108;FS=20.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:337,0,3582 -chr16 26265600 . T G 3517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.098;DP=141;FS=7.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,90:115:99:3546,0,714 -chr16 26265739 . A C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=4.810;DP=45;FS=2.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=7.84;ReadPosRankSum=-4.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:381,0,2463 -chr16 26265747 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.582;ClippingRankSum=3.734;DP=42;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.28;ReadPosRankSum=-3.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:250,0,2731 -chr16 26265840 . G A 2657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.287;DP=187;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,67:132:99:2686,0,5077 -chr16 26265841 . T A 2657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.178;DP=191;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,69:135:99:2686,0,5077 -chr16 26265996 . G GT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=1.044;DP=46;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:282,0,1851 -chr16 26266002 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=1.181;DP=50;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:282,0,1851 -chr16 26266084 . T C 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-1.474;DP=89;FS=16.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,39:66:99:1310,0,919 -chr16 26266111 . T C 1909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.762;DP=88;FS=3.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,50:71:99:1938,0,562 -chr16 26266188 . T A 2039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=1.276;DP=120;FS=6.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:2068,0,1703 -chr16 26266235 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.103;DP=104;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:236,0,6877 -chr16 26266240 . G A 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.471;DP=98;FS=5.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,45:87:99:1740,0,3189 -chr16 26266277 . A G 1613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=1.749;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1642,0,1172 -chr16 26266350 . A G 3687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-1.065;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,91:121:99:3716,0,677 -chr16 26266405 . C T 3897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-3.326;DP=166;FS=6.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=23.48;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,104:149:99:3926,0,1266 -chr16 26266451 . C G 4859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-2.611;DP=168;FS=3.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.93;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,125:154:99:4888,0,509 -chr16 26266534 . C T 6163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6192,436,0 -chr16 26266551 . A C 6552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:151:99:6581,463,0 -chr16 26266662 . A C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=1.041;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.379;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,31:154:99:525,0,10570 -chr16 26266670 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.781;DP=162;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,25:158:99:530,0,10570 -chr16 26266756 . G A 3251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=2.874;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.254;QD=32.52;ReadPosRankSum=-3.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,84:99:99:3280,0,192 -chr16 26267432 . G A 2761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.340;DP=155;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,79:121:99:2790,0,1537 -chr16 26267684 . C A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr16 26286397 . G A 3166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=2.024;DP=203;FS=25.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,87:180:99:3195,0,3597 -chr16 26286411 . G A 2781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=2.944;DP=195;FS=15.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,77:172:99:2810,0,3678 -chr16 26286967 . A G 3811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.152;DP=202;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,116:200:99:3840,0,2975 -chr16 26289377 . A T 2445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.333;DP=152;FS=5.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:2474,0,2709 -chr16 26289392 . C A 2544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.385;DP=163;FS=0.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:161:99:2573,0,2944 -chr16 26429789 . A G 924.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:953,69,0 -chr16 26429802 . AG A 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:687,64,0 -chr16 26434185 . CA C 268.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:22:301,22,0 -chr16 26762173 . A C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:372,0,400 -chr16 26762270 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.098;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:331,0,3083 -chr16 26789042 . G T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-1.636;DP=85;FS=2.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:276,0,2769 -chr16 26824482 . T C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr16 26831044 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-2.589;DP=39;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=6.10;ReadPosRankSum=2.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:266,0,1103 -chr16 26840368 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=3.190;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:419,0,2134 -chr16 26840978 . GCACCTGCAATAAAAATATTGTAAATGTCTGTTCTTTTAATTATAAAACAAAACTAAATGGAATATTCC G 1046.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=2.315;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=21.81;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:1084,0,338 -chr16 26885493 . G A 298.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.22;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:327,0,13 -chr16 26891037 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.974;DP=125;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,30:125:99:607,0,3674 -chr16 26891223 . ACTGAGAAATGCACAAACAATATATCATTCCATTTCTGGTCAGTTTTATGGTTACAGTAACATTATGGTTTAAAGCTGCATGTAC A 4415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=3.304;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,112:125:99:4453,0,3135 -chr16 26893963 . C A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.25;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:407,0,342 -chr16 26895475 . T A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-0.216;DP=87;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1219,0,1806 -chr16 27230685 . C CT 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.254;DP=46;FS=2.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:358,0,523 -chr16 27270091 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=1.574;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:256,0,916 -chr16 27272031 . A G 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.331;DP=86;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,56:86:99:1955,0,1014 -chr16 27273964 . A T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=2.677;DP=124;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:479,0,6904 -chr16 27275752 . G C 1806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.063;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.028;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1835,0,1701 -chr16 27277934 . C CT 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=1.100;DP=98;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:402,0,1982 -chr16 27310469 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.635;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:888,0,239 -chr16 27318512 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.811;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:580,0,609 -chr16 27319323 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-2.372;DP=31;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:253,0,779 -chr16 27335166 . T C 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.014;DP=45;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=29.08;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1337,0,216 -chr16 27351597 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=-2.450;DP=62;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:281,0,1854 -chr16 27352355 . C T 1630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.590;DP=88;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,51:87:99:1659,0,1297 -chr16 27358407 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=24.85;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:401,0,125 -chr16 27360932 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,139 -chr16 27363085 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:375,0,332 -chr16 27385484 . G A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-0.876;DP=27;FS=10.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.522;QD=25.14;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:707,0,218 -chr16 27388079 . G T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.625;DP=37;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=18.13;ReadPosRankSum=2.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:699,0,631 -chr16 27388318 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.851;DP=45;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:859,0,1038 -chr16 27388483 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=2.136;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:347,0,472 -chr16 27400203 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.447;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:238,0,1510 -chr16 27401645 . GT G 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.398;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.485;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:307,0,184 -chr16 27401669 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.315;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:418,0,319 -chr16 27407829 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.088;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,35:201:99:434,0,6210 -chr16 27408475 . A AT 714.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=-1.973;DP=128;FS=12.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,42:111:99:752,0,1595 -chr16 27408598 . T A 1845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-0.128;DP=114;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,54:114:99:1874,0,2036 -chr16 27408897 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.308;DP=100;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:306,0,3149 -chr16 27409327 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.317;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:254,0,835 -chr16 27409460 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.424;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:231,0,585 -chr16 27414237 . A G 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr16 27414287 . T A 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr16 27414800 . A G 264.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.42;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:293,0,19 -chr16 27415647 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.712;DP=41;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:661,0,662 -chr16 27415821 . C G 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.464;DP=46;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1183,0,313 -chr16 27415852 . G A 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.208;DP=47;FS=7.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=28.44;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:1365,0,294 -chr16 27415932 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.203;DP=47;FS=6.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:861,0,741 -chr16 27538420 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=1.972;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:359,0,503 -chr16 27539981 . A T 911.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.193;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.276;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:12:939,0,12 -chr16 27600220 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.538;DP=17;FS=12.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:357,0,103 -chr16 27613475 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:336,0,246 -chr16 27614901 . C T 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=1.035;DP=40;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.974;QD=19.27;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:799,0,520 -chr16 27615093 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,357 -chr16 27615823 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,361 -chr16 27685008 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=1.015;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:685,0,363 -chr16 27685014 . G T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.350;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=31.27;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:685,0,353 -chr16 27717017 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=1.014;DP=45;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.59;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:280,0,1368 -chr16 27740185 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.837;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:381,0,734 -chr16 27782758 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=-1.521;DP=43;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:319,0,1054 -chr16 27782830 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=-1.112;DP=33;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=6.75;ReadPosRankSum=2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:251,0,916 -chr16 27787918 . T A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:81:461,0,81 -chr16 27795274 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:385,0,550 -chr16 27795277 . G A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=-1.429;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:385,0,550 -chr16 27795936 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.057;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:814,0,598 -chr16 27796873 . GTT G 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.549;DP=28;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:364,0,212 -chr16 27797858 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.055;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:379,0,1294 -chr16 27798137 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-1.381;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:632,0,412 -chr16 27799762 . A T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.603;ClippingRankSum=-1.023;DP=42;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:544,0,946 -chr16 27882829 . C CAT 2438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.190;DP=107;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=22.79;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:2476,0,1540 -chr16 27919132 . TCTGAGAAGAAGACAGTTAGACTTTAGGTAAACCAAGAATACACAATCAAACCATGTCATGTAAGGTGCATCAGACAAAC T 10631.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=1.613;DP=257;FS=2.137;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=33.13;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,241:244:99:10669,878,0 -chr16 27937614 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=1.562;DP=243;FS=0.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,45:242:99:616,0,7705 -chr16 28092514 . C A 1736.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1765,126,0 -chr16 28092684 . C A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr16 28093012 . A AT 278.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.134;DP=14;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=19.87;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:10:315,10,0 -chr16 28132296 . T C 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr16 28317553 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=22.14;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:316,0,138 -chr16 28321840 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:271,0,60 -chr16 28393809 . TA T 748.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.238;DP=41;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:786,0,174 -chr16 28624239 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr16 28631565 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,582 -chr16 28631568 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:354,0,582 -chr16 28633408 . G A 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=1.360;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=31.65;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:47:946,0,47 -chr16 28647198 . C T 989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.334;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=28.28;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1018,0,191 -chr16 28682749 . T A 1228.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=2.141;DP=32;FS=8.034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=30.41;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:8:1256,8,0 -chr16 28682752 . C T 1229.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=2.131;DP=31;FS=7.754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:9:1257,9,0 -chr16 28686168 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.495;DP=35;FS=1.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=32.48;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:65:1165,0,65 -chr16 28695194 . C CT 708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-1.414;DP=73;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=9.71;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,54:73:99:1204,0,305 -chr16 28696545 . C T 2092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-1.846;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,54:78:99:2121,0,682 -chr16 28697001 . G T 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.226;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=33.27;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:79:1126,0,79 -chr16 28701044 . T C 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.306;DP=39;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:1115,0,305 -chr16 28708860 . G A 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.931;DP=56;FS=2.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:782,0,2678 -chr16 28710351 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.131;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:525,0,943 -chr16 28719208 . CAGGTATACATGGTAACACACAACCAGTATTGTGCTCTTATGTAAAACATATAAGCATGATGGGTTGTTTTTGTTTT C 2845.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=1.110;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,62:65:99:2883,241,0 -chr16 28719631 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.516;DP=66;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:345,0,1928 -chr16 28760410 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:426,0,125 -chr16 28761286 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.311;DP=26;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:299,0,544 -chr16 28767274 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-1.240;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.860;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:592,0,594 -chr16 28767558 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.419;DP=36;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:345,0,845 -chr16 28776420 . G A 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=1.457;DP=44;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:809,0,1530 -chr16 28781666 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-2.438;DP=73;FS=7.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=5.53;ReadPosRankSum=2.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:432,0,1998 -chr16 28782553 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DP=54;FS=6.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:396,0,1477 -chr16 28838848 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:238,0,480 -chr16 28876554 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=1.758;DP=34;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=7.29;ReadPosRankSum=-2.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,938 -chr16 28886138 . A G 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 -chr16 28896596 . A T 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.514;DP=101;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,47:101:99:1710,0,1768 -chr16 28912102 . G T 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.065;DP=78;FS=5.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,34:78:99:1162,0,1475 -chr16 28925781 . G A 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.551;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:1460,0,1995 -chr16 28927249 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.319;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,34:76:99:1165,0,1374 -chr16 28927253 . G GA 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.403;DP=76;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:730,0,834 -chr16 28927399 . T G 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.783;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:917,0,1076 -chr16 28938709 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.239;DP=110;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=7.21;ReadPosRankSum=-2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,31:109:99:821,0,2822 -chr16 28938712 . G A 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=1.264;DP=105;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,28:104:99:619,0,5778 -chr16 28942373 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=2.033;DP=94;FS=5.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=2.50;ReadPosRankSum=-2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:263,0,2942 -chr16 28942730 . G T 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-0.566;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,38:96:99:1307,0,2018 -chr16 28945332 . C T 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.123;DP=157;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,46:155:99:1142,0,4046 -chr16 28949274 . A G 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-2.009;DP=112;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,39:112:99:1276,0,2265 -chr16 28949343 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.027;DP=110;FS=2.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=8.13;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:923,0,2895 -chr16 28951336 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.711;DP=128;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.05;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,49:128:99:1570,0,2514 -chr16 28961825 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.558;DP=98;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:400,0,2795 -chr16 28968241 . C A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.624;DP=60;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:953,0,1107 -chr16 29035473 . T G 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=-2.510;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,28:84:99:791,0,2042 -chr16 29038910 . T A 1770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.821;DP=102;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,54:102:99:1799,0,1852 -chr16 29043985 . A C 2059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-1.140;DP=125;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,66:125:99:2088,0,2183 -chr16 29044404 . A G 2427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.392;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,72:124:99:2456,0,1821 -chr16 29047455 . G A 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.004;DP=89;FS=8.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.433;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,46:89:99:1535,0,1557 -chr16 29052951 . C A 2173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.129;DP=128;FS=4.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:2202,0,2347 -chr16 29053215 . A G 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=-0.267;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.822;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,40:70:99:1357,0,1059 -chr16 29066304 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.331;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.549;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:504,0,522 -chr16 29066934 . A T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.620;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:747,0,783 -chr16 29068502 . C T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.343;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:749,0,691 -chr16 29312710 . C T 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.905;DP=48;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1006,0,639 -chr16 29349221 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-0.472;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:670,0,455 -chr16 29350000 . TTA T 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.116;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:460,0,629 -chr16 29350560 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.018;DP=35;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:660,0,504 -chr16 29350666 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=15.05;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,340 -chr16 29350807 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:264,0,417 -chr16 29377597 . C T 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.773;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=32.88;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:37:620,0,37 -chr16 29378698 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.232;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:419,0,375 -chr16 29387325 . A G 770.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.524;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:16:799,0,16 -chr16 29399532 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.848;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:596,0,120 -chr16 29399702 . G T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-1.776;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:351,0,161 -chr16 29429096 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.368;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.678;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,298 -chr16 29444400 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.649;DP=57;FS=3.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:931,0,1062 -chr16 29444447 . C A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=1.425;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=16.56;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:939,0,887 -chr16 29444543 . A G 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.048;DP=63;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1098,0,1072 -chr16 29444848 . T G 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.714;DP=52;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:1023,0,2051 -chr16 29444857 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=1.093;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.839;QD=18.42;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:1023,0,2043 -chr16 29444977 . C T 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.168;DP=77;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,36:77:99:1256,0,1339 -chr16 29445380 . G A 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.180;DP=56;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:976,0,951 -chr16 29451226 . G A 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=-0.343;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=16.77;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1001,0,945 -chr16 29452662 . C CT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=1.812;DP=344;FS=5.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=0.76;ReadPosRankSum=-2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,62:334:99:297,0,7325 -chr16 29459704 . C CT 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=-5.500;DP=300;FS=0.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,50:264:99:309,0,5335 -chr16 29574260 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:285,0,169 -chr16 29574264 . A C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,169 -chr16 29596346 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:380,0,131 -chr16 29621077 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.162;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=16.18;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:368,0,369 -chr16 29633160 . G T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.216;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=21.24;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:623,0,336 -chr16 29633876 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=21.22;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:389,0,635 -chr16 29633882 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.203;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=21.22;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:389,0,635 -chr16 29634960 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.175;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:647,0,136 -chr16 29645959 . GA G 1431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=-0.839;DP=194;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,77:163:99:1490,0,1631 -chr16 29652867 . A G 4021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.823;DP=217;FS=4.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,124:217:99:4050,0,3192 -chr16 29713396 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:643,0,184 -chr16 29717288 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:332,0,434 -chr16 29719065 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.872;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:455,0,297 -chr16 29722063 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.837;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=13.56;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:340,0,668 -chr16 29742192 . C T 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.821;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,35:94:99:1479,0,4210 -chr16 29767256 . A G 2577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-1.526;DP=148;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,73:148:99:2606,0,2736 -chr16 29783124 . C T 3269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=1.270;DP=202;FS=4.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,105:202:99:3298,0,3521 -chr16 29783411 . G C 2791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=-0.717;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,75:177:99:2820,0,7461 -chr16 29784784 . C T 3785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-0.035;DP=262;FS=10.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=14.45;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,112:262:99:3814,0,4989 -chr16 29784841 . C T 3517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.937;DP=217;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=16.21;ReadPosRankSum=3.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,98:217:99:3546,0,3973 -chr16 29787004 . C A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.098;DP=77;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:1125,0,1494 -chr16 29789960 . A G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.231;DP=19;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:545,0,162 -chr16 29790582 . C A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.070;DP=28;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:553,0,411 -chr16 29790732 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.300;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.54;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:634,0,464 -chr16 29791174 . G C 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.126;DP=42;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:687,0,748 -chr16 29791537 . T A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=1.181;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:902,0,829 -chr16 29791568 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.176;DP=49;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:795,0,873 -chr16 29791622 . G T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.694;DP=45;FS=11.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=17.64;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:822,0,775 -chr16 29791992 . T G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.753;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:571,0,471 -chr16 29796670 . T C 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.428;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=29.35;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:850,0,126 -chr16 29797074 . A T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-1.412;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:767,0,464 -chr16 29801692 . A G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.117;DP=21;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=26.04;ReadPosRankSum=1.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:575,0,154 -chr16 29801900 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.262;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=23.23;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:609,0,211 -chr16 29803521 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.263;DP=24;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=18.66;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:476,0,338 -chr16 29835541 . A G 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.700;DP=73;FS=4.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=20.07;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1493,0,788 -chr16 29835657 . C G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.544;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:793,0,814 -chr16 29835760 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=1.085;DP=61;FS=9.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=20.80;ReadPosRankSum=2.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,37:61:99:1297,0,858 -chr16 29835915 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=4.328;DP=28;FS=9.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=13.06;ReadPosRankSum=-2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:394,0,564 -chr16 29836570 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-2.583;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,360 -chr16 29836626 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-1.301;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:694,0,164 -chr16 29836702 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-2.245;DP=27;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:564,0,421 -chr16 29836748 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-0.755;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:318,0,662 -chr16 29837253 . A C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-3.142;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:587,0,106 -chr16 29845381 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.491;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:384,0,749 -chr16 29850151 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.287;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:542,0,766 -chr16 29855086 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.640;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:713,0,354 -chr16 29858132 . C T 1491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.078;DP=45;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=33.15;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:99:1520,0,118 -chr16 29859824 . T A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.122;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,481 -chr16 29860392 . C T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.112;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:660,0,369 -chr16 29860467 . C T 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-0.451;DP=27;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=26.32;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:739,0,233 -chr16 29860759 . A T 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.944;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:1009,0,240 -chr16 29861173 . T C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=-0.211;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=24.49;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:567,0,175 -chr16 29861367 . T A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.102;DP=32;FS=8.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:841,0,293 -chr16 29861631 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-0.652;DP=31;FS=11.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=16.90;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:552,0,537 -chr16 29888462 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.714;DP=37;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=16.86;ReadPosRankSum=-1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:652,0,675 -chr16 29888750 . C A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.572;DP=30;FS=11.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:440,0,661 -chr16 29888995 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=2.676;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=12.22;ReadPosRankSum=-2.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:407,0,1462 -chr16 29895527 . T A 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.028;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:918,0,682 -chr16 29904171 . A T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=2.436;DP=48;FS=1.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=14.45;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:722,0,2288 -chr16 29977156 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=19.83;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:286,0,182 -chr16 30891929 . T C 272.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;QD=14.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:22:337,22,0 -chr16 30964645 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=1.775;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:263,0,583 -chr16 31222964 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.788;DP=47;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:274,0,1107 -chr16 31233239 . ATAATCAGTTTTTCCAGAATTTTCATTTTTGTCATTTATTTTATCTCACTCTTGCAGAG A 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=-0.195;DP=69;FS=3.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:481,0,2313 -chr16 31241829 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=1.308;DP=76;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:418,0,2019 -chr16 31242168 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.901;DP=56;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:285,0,1587 -chr16 31248589 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.512;DP=84;FS=8.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:315,0,2648 -chr16 31257789 . A T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.526;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:360,0,4340 -chr16 31258240 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=1.355;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:402,0,621 -chr16 31281793 . T G 1682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.118;DP=100;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1711,0,1486 -chr16 31302008 . G T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.199;DP=82;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:613,0,2174 -chr16 31304458 . G T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.281;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:694,0,1364 -chr16 31304659 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-2.026;DP=58;FS=9.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:241,0,1618 -chr16 31319887 . T C 1992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-0.024;DP=67;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=29.74;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,54:67:99:2021,0,227 -chr16 31422509 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.901;DP=64;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:274,0,1972 -chr16 31453759 . AGT A 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.760;DP=120;FS=7.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:300,0,1750 -chr16 31494541 . GA G 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.298;DP=111;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=1.784;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,38:106:99:867,0,1678 -chr16 31758700 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.541;DP=223;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,47:223:99:916,0,9520 -chr16 31761797 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-1.121;DP=190;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,35:189:99:529,0,5970 -chr16 31762267 . T C 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.835;DP=230;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,50:230:99:945,0,7099 -chr16 31841992 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.320;DP=72;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.458;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:257,0,2278 -chr16 31927443 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.923;DP=348;FS=7.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,53:347:99:495,0,11381 -chr16 31930046 . T C 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=1.965;DP=222;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=4.75;ReadPosRankSum=-2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,51:222:99:1083,0,6923 -chr16 31936136 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:281,0,469 -chr16 31942295 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.458;DP=42;FS=3.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:264,0,1202 -chr16 32621176 . T C 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.363;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:617,0,1264 -chr16 32621236 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.680;DP=38;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:262,0,1097 -chr16 32841218 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.951;DP=62;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:262,0,1814 -chr16 33222843 . T G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-0.098;DP=53;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:268,0,2140 -chr16 33223404 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.693;DP=50;FS=2.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.260;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:275,0,1452 -chr16 33604845 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=1.008;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:265,0,1642 -chr16 33674458 . A G 1592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1621,126,0 -chr16 33674491 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.670;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:426,0,314 -chr16 33742022 . A T 4624.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=-3.176;DP=354;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=13.06;ReadPosRankSum=-1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,142:353:99:4662,0,6879 -chr16 33748808 . G A 5833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.255;DP=472;FS=0.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=12.36;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,172:472:99:5862,0,10452 -chr16 33749611 . G A 5003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=1.043;DP=395;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,156:394:99:5032,0,7483 -chr16 33749937 . C A 3974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.394;DP=328;FS=7.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,116:325:99:4003,0,7041 -chr16 33759389 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=1.402;DP=150;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,32:150:99:631,0,4656 -chr16 33759437 . A T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=1.818;DP=145;FS=6.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,35:145:99:647,0,4419 -chr16 33905132 . C T 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-1.281;DP=60;FS=9.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:715,0,1783 -chr16 33918408 . G A 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=1.761;DP=94;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=18.33;ReadPosRankSum=-1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,52:94:99:1751,0,1490 -chr16 33922346 . TCCTCCTCCTCCC T 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.653;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=23.35;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:481,0,380 -chr16 33985085 . T C 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=-0.771;DP=277;FS=72.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=4.20;ReadPosRankSum=2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,58:276:99:1191,0,8563 -chr16 33986804 . GCTAAAAGAGACAAATGGTCCTGTTGAAAGAGGAGCTAACAAATGCACCTCTGGGCAAACTTTAGCGGGCAGTTTCTGTACATCTCTGAC G 11407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.586;DP=313;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=26.87;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,284:302:99:11445,0,619 -chr16 33997941 . CCACCTAAAAAAACAAAAAAAGGAGAAATGTTTTATTGCCAGCCCTTTTATCAACATGGATTTTTCTGGGGTTCAAAACAACTGCTTAATTTCT C 11486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.429;DP=290;FS=2.107;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=31.78;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,273:276:99:11524,830,0 -chr16 33998564 . TCTACATCCATTTATAAAGCATACATAAGTATATAGTTAAGCATCTGTATTTTATGCATTGCTCTTGTGCGTAC T 14768.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-1.674;DP=243;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,237:238:99:14806,1238,0 -chr16 33999319 . G A 5251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.975;DP=437;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,157:437:99:5280,0,12812 -chr16 33999325 . T C 1125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=1.279;DP=426;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,81:425:99:1154,0,19577 -chr16 34005974 . C A 2353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.610;DP=97;FS=39.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=24.27;ReadPosRankSum=5.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,67:94:99:2382,0,653 -chr16 34012870 . A C 5341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.241;DP=408;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,162:406:99:5370,0,8099 -chr16 34024470 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-0.556;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:376,0,505 -chr16 34037367 . C CAA 1256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.565;DP=145;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,51:127:99:1565,0,2501 -chr16 34037392 . TA T 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.382;DP=141;FS=9.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1118,0,1374 -chr16 34037814 . C T 2307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.858;DP=246;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,83:246:99:2336,0,10816 -chr16 34037984 . A AAT 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-3.055;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=11.62;ReadPosRankSum=4.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:537,0,279 -chr16 34038663 . GT G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=-2.657;DP=298;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,63:272:99:936,0,8464 -chr16 34038683 . G A 3765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=-3.038;DP=296;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,117:295:99:3794,0,7466 -chr16 34046367 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:389,0,515 -chr16 34056233 . C G 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr16 34058546 . A G 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.951;DP=154;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,80:131:99:2536,0,1723 -chr16 34081344 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:296,0,716 -chr16 34081353 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:296,0,721 -chr16 34122246 . G T 1699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-3.466;DP=84;FS=5.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=20.24;ReadPosRankSum=3.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:84:99:1728,0,3137 -chr16 34122692 . G A 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.628;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,40:91:99:1680,0,3739 -chr16 34122693 . G T 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=0.792;DP=95;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:1680,0,3702 -chr16 34127957 . C T 3622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=-0.622;DP=221;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=16.39;ReadPosRankSum=2.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,101:221:99:3651,0,3934 -chr16 34130148 . G A 3155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.788;ClippingRankSum=-0.029;DP=231;FS=0.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=13.66;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,122:231:99:3184,0,3756 -chr16 34130541 . T A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.384;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:603,0,1552 -chr16 34130967 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.367;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:466,0,672 -chr16 34132472 . C CA 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=18.75;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:656,0,352 -chr16 34132592 . G GA 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.620;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:414,0,418 -chr16 34141344 . A G 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.109;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1091,0,1006 -chr16 34144829 . TGGTGAGCGCAAAGTTGAAAATAAAATGATTATTAATGTTTTTTTCCCCAAAAACGTGTTTCTTACAAAAAAAAACGTGTTTCTTACAATTGTCTTACAATTTTACCTGCCACA T 9749.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.936;DP=266;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=28.50;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,237:239:99:9787,736,0 -chr16 34145408 . G T 6190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=1.552;DP=443;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,179:443:99:6219,0,8714 -chr16 34217634 . G A 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.915;ClippingRankSum=-1.542;DP=195;FS=1.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,73:189:99:1746,0,3733 -chr16 34231368 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=1.010;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:246,0,1241 -chr16 34231371 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.742;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:291,0,1152 -chr16 34273466 . G C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.406;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,20:80:99:434,0,2280 -chr16 34274554 . C CT 368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-1.331;DP=43;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:574,0,175 -chr16 34387685 . G C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-1.775;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:272,0,402 -chr16 34403089 . G GATTAA 2584.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=1.256;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,76:138:99:2622,0,2343 -chr16 34431223 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=-1.509;DP=121;FS=4.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:285,0,3730 -chr16 34434640 . A G 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.732;DP=86;FS=13.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:495,0,2625 -chr16 34495528 . G T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-2.177;DP=141;FS=1.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=7.25;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,41:141:99:1051,0,3774 -chr16 34506783 . TGGTAACATGATGTTGTTCTTGTAGCTCCTTGTTGATTTTTCACTCTGACAGTTACAATTAAAAAAATATTTTCCCGCACA T 961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.941;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.052;QD=30.05;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:999,0,857 -chr16 34602120 . GCCTGACAAACAACAAACACAGTATTTACAGGATGAAATACAGCAAGGCTTATATATTAGAGCTTGCGGTTTGAGACTGTA G 3028.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=2.382;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=35.51;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,71:73:99:3066,222,0 -chr16 34610733 . C A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.990;DP=43;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:630,0,753 -chr16 34876765 . CT C 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-1.025;DP=78;FS=4.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,40:76:99:934,0,857 -chr16 34876945 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.764;DP=47;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=6.53;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:335,0,1951 -chr16 34877096 . ATT A,AT 308.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.451;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=1.152;QD=11.01;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,10,14:27:99:534,245,324,183,0,176 -chr16 34880860 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,412 -chr16 34983961 . T C 1196.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.038;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=28.74;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:52:1225,52,0 -chr16 34984111 . T C 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.217;DP=43;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.535;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:502,0,997 -chr16 34984112 . T C 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=1.323;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=24.97;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,30:44:99:1127,0,397 -chr16 35046117 . TGTGAGTCAGTACTTTTTCTCAGCAGCAAACTGAAGGTTATATTATATAATTGACAATACTGTACCCTCTCATCTGCAG T 1457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-2.003;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,35:39:99:1495,0,530 -chr16 35157976 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=-2.218;DP=25;FS=8.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:429,0,838 -chr16 35157979 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.773;DP=26;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,838 -chr16 35170374 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.253;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:416,0,712 -chr16 35317685 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.924;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:439,0,2035 -chr16 35333642 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,133 -chr16 35337006 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=1.840;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.033;QD=9.60;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:249,0,511 -chr16 35339242 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.716;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:241,0,489 -chr16 35346589 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-1.165;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:318,0,465 -chr16 35416124 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=-3.149;DP=180;FS=2.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=1.14;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,36:178:99:233,0,5582 -chr16 35463095 . G A 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=2.348;DP=90;FS=13.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,39:77:99:1455,0,1368 -chr16 35909240 . C CA 2003.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-1.703;DP=216;FS=2.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,87:198:99:2041,0,2534 -chr16 35909484 . C CT 678.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=-0.429;DP=128;FS=8.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,42:109:99:716,0,1368 -chr16 35962217 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=-0.316;DP=153;FS=13.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,31:152:99:556,0,4574 -chr16 36049835 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.341;DP=107;FS=6.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:382,0,3517 -chr16 36049857 . A C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.347;DP=99;FS=6.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,21:99:99:376,0,3178 -chr16 36050112 . G GT 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.817;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:253,0,953 -chr16 36207490 . T C 1919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.973;DP=123;FS=6.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,56:123:99:1948,0,2105 -chr16 36210332 . G A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.832;DP=161;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.756;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,41:161:99:931,0,4607 -chr16 36210362 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.204;DP=170;FS=10.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,35:170:99:664,0,5307 -chr16 36216943 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.578;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,21:125:99:291,0,4026 -chr16 36245094 . G GT 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-1.952;DP=68;FS=6.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:309,0,1107 -chr16 36245119 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.020;DP=75;FS=9.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:243,0,2353 -chr16 36245429 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.771;DP=70;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:258,0,2294 -chr16 36339635 . G T 644.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.385;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=29.63;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:672,9,0 -chr16 36339701 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr16 36341684 . G A 589.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:618,45,0 -chr16 36349685 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.283;DP=26;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:423,0,450 -chr16 36396634 . AAGGTTTGCTCAACATTTACATGGAAGTGAATTGTCTTTACTAAAGTCGCACTTCGCATTTACTTCCTTCGATTTAACCTTGTTCTATCT A 4981.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=1.426;DP=125;FS=9.412;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=33.13;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,119:125:99:5019,403,0 -chr16 36398129 . AAGGTATACTGAATGTTTGCTTAAGACATAAACTCACTTTTTTTTGTTTTGTGGTGTTATGGAAATTATGCAATGAACTGTGCTGTTTTGAGT A 3074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=2.045;DP=83;FS=8.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=33.93;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,75:83:99:3112,0,125 -chr16 36398345 . CGGTCAGTCCACTAACTGTTTTGATTTTAATGAAGATTTTATATCTGCCTCTACATCTGATTTCATTTGCATTTGGTGCTCTGTGCA C 1155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.849;DP=112;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1193,0,2211 -chr16 36398346 . GGTC G 2151.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-1.166;DP=109;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=19.74;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,64:106:99:2189,0,1356 -chr16 36398350 . AGTCCACTAACTGTTTTGATTTTAATGAAGATTTTATATCTGCCTCTACATCTGATTTCATTTGCATTTGGTGCTCTGTGCAGG A 2146.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-1.217;DP=110;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,66:110:99:2184,0,1356 -chr16 36408986 . C G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.341;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:258,0,874 -chr16 36421238 . GT G 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.734;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:286,0,599 -chr16 36421764 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.764;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:273,0,891 -chr16 36422596 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=1.028;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:337,0,1908 -chr16 36603171 . T TA 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.162;DP=106;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=3.00;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,30:99:99:355,0,1706 -chr16 36603313 . G GA 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-2.149;DP=108;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:468,0,1065 -chr16 36618053 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.172;DP=95;FS=6.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:312,0,2886 -chr16 36630025 . G C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.155;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:285,0,1225 -chr16 36630239 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-0.994;DP=63;FS=4.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:237,0,1700 -chr16 36642821 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.023;DP=60;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.063;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:717,0,1203 -chr16 36718978 . T G 777.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:806,57,0 -chr16 36719149 . C T 1222.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.490;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:53:1251,53,0 -chr16 36719688 . C T 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.877;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=33.21;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:32:1589,0,32 -chr16 36996387 . CTT C 477.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:37:515,37,0 -chr16 36999221 . C A 399.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=33.27;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:427,0,9 -chr16 37067502 . C T 1667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=-1.865;DP=283;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=5.89;ReadPosRankSum=2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,73:283:99:1696,0,23197 -chr16 37626787 . C G 696.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.498;ClippingRankSum=-1.258;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=33.19;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:14:725,14,0 -chr16 37973998 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr16 37988180 . T C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=-0.191;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:765,0,28 -chr16 37988368 . T G 1041.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.880;DP=28;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:8:1069,0,8 -chr16 37988371 . A C 1041.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.972;DP=28;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:8:1069,0,8 -chr16 37988471 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.456;DP=14;FS=5.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:469,0,42 -chr16 38014467 . C T 799.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-0.524;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=31.98;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:7:827,0,7 -chr16 38016107 . C T 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr16 38119463 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.324;DP=148;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,24:148:99:304,0,4819 -chr16 39184573 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.817;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=20.80;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:569,0,353 -chr16 39235503 . T C 715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:744,54,0 -chr16 39235617 . A AT 2212.30 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.642;DP=133;FS=3.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:2685,271,0 -chr16 39345071 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.269;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=18.95;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:521,0,296 -chr16 39382485 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=3.860;DP=69;FS=42.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=5.82;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:430,0,1961 -chr16 39382526 . A AT 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=4.224;DP=74;FS=9.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=7.00;ReadPosRankSum=-4.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:741,0,680 -chr16 39388712 . A G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr16 39396987 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-0.786;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:590,0,122 -chr16 39397005 . A T 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=1.600;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:1042,75,0 -chr16 39508257 . G T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-0.433;DP=153;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,28:151:99:490,0,4844 -chr16 39510158 . C CA 531.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-2.251;DP=181;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,44:168:99:569,0,3408 -chr16 39529939 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-0.719;DP=115;FS=2.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,19:115:99:265,0,3832 -chr16 39536495 . G T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-0.857;DP=97;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:431,0,5328 -chr16 39541982 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.745;DP=107;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=1.97;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:239,0,3375 -chr16 39693333 . A G 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 -chr16 39698851 . A T 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.637;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.385;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,45:70:99:1459,0,840 -chr16 39705472 . T G 735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:764,57,0 -chr16 39705530 . T C 863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:892,67,0 -chr16 39705556 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.613;DP=38;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:248,0,953 -chr16 39715190 . C A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.158;DP=64;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.201;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:617,0,2887 -chr16 39715191 . A C 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.415;DP=64;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:617,0,2887 -chr16 39818784 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr16 39916994 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=23.05;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:374,0,246 -chr16 39984876 . A C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr16 40051789 . C T 1388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-1.521;DP=48;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=28.93;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:1417,0,247 -chr16 40066523 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.634;DP=20;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,224 -chr16 40075414 . C T 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=2.672;DP=44;FS=9.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=20.06;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:911,0,536 -chr16 40075529 . T C 2189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-1.238;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,58:69:99:2218,0,138 -chr16 40081710 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.280;DP=90;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:230,0,2803 -chr16 40095740 . T TAA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.286;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:305,0,289 -chr16 40144346 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.505;DP=45;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=7.44;ReadPosRankSum=2.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:363,0,1404 -chr16 40681126 . A G 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.274;DP=26;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:758,0,137 -chr16 40681352 . A G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=23.26;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:540,0,206 -chr16 40794984 . GAGGTAAGCTCATGTTATGAGATAACAGATAAACTGATCCATTTCCACTGGAAATTACAACTCTGAAGTGTTTACTTCTGGTTCTCTTCTTTCC G 3741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=2.039;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=30.92;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3779,322,0 -chr16 40874390 . G GTGGAGAGAGCGGA 1873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.642;DP=82;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=22.85;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,51:76:99:1911,0,830 -chr16 40933514 . A G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.366;DP=29;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:351,0,625 -chr16 40965689 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=1.139;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=15.86;ReadPosRankSum=-2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:393,0,394 -chr16 41912471 . CT C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.784;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:306,0,132 -chr16 42052640 . AG A 372.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-0.434;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.72;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:14:410,0,14 -chr16 42101995 . G A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.945;DP=213;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,42:212:99:725,0,6356 -chr16 42304670 . CA C 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=1.119;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:442,0,445 -chr16 42305405 . T C 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-0.524;DP=87;FS=2.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1000,0,1875 -chr16 42305457 . AC A 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.018;DP=78;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:672,0,1388 -chr16 42307642 . T C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-0.164;DP=50;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:543,0,1274 -chr16 42308923 . GA G 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.048;DP=65;FS=10.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:386,0,830 -chr16 42309450 . T TTC 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.449;DP=52;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:979,0,257 -chr16 42309550 . G GA 724.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-2.412;DP=75;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=9.66;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,31:70:99:762,0,918 -chr16 42496524 . C T 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-0.441;DP=70;FS=3.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:758,0,1568 -chr16 42698404 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.709;DP=21;FS=16.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:498,0,379 -chr16 42698533 . A G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.913;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:808,0,546 -chr16 42715366 . G C 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=1.413;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=20.61;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:832,0,577 -chr16 42819700 . C CT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.625;DP=170;FS=4.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,32:161:99:303,0,3627 -chr16 43090643 . T TA 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=-0.405;DP=48;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.915;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:439,0,686 -chr16 43092922 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.635;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:506,0,1680 -chr16 43170838 . T C 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.446;DP=44;FS=4.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:488,0,972 -chr16 43210076 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=30.37;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:47:423,0,47 -chr16 43234170 . T G 1975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.425;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,54:162:99:2004,0,5535 -chr16 43234257 . G C 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.205;DP=144;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:955,0,4774 -chr16 43235819 . T TA 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.663;DP=52;FS=7.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:781,0,735 -chr16 43243034 . C A 4645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.934;ClippingRankSum=0.109;DP=304;FS=6.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.437;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,140:304:99:4674,0,5212 -chr16 43257891 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-1.562;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,303 -chr16 43338466 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.071;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:439,0,757 -chr16 43620516 . C G 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-0.015;DP=80;FS=0.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:950,0,1696 -chr16 43695018 . G A 4464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.610;DP=340;FS=8.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,130:340:99:4493,0,13476 -chr16 43695224 . T C 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-4.381;DP=243;FS=5.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,77:243:99:2039,0,6610 -chr16 43695370 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=3.410;DP=170;FS=2.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,32:170:99:541,0,5596 -chr16 43696135 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=-0.427;DP=84;FS=5.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:279,0,2694 -chr16 43733214 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:325,0,213 -chr16 43733238 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=18.26;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:430,0,310 -chr16 43742157 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.283;DP=26;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:416,0,455 -chr16 43742424 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.312;DP=31;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.141;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:496,0,585 -chr16 43742608 . A C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-1.385;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:480,0,478 -chr16 43754530 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=1.104;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:282,0,531 -chr16 43754610 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=3.005;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:296,0,747 -chr16 43770065 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=2.166;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.48;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:273,0,97 -chr16 43770925 . G A 275.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr16 43772223 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-1.342;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:306,0,1832 -chr16 43772224 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-1.077;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:306,0,1832 -chr16 43773850 . A T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.437;DP=32;FS=8.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:507,0,613 -chr16 43779758 . CCCTTTTAAAAATAAATATGATTTTTTAATGAAAAATAGAACTTCTAATATGTTGGTATACTCTTATCATGTATAAAAAAAGTCCCTTA C 2532.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.105;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,57:59:99:2570,179,0 -chr16 43780032 . GCTGGGGATAAAAAGAAACATTGCACATTATTTGAAATTGCTTGAAAAGCCAACGAGATTGTAGAAATTACCAAAAAATCCATTAACATTAAACATTTAC G 3116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.381;DP=75;FS=1.654;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=29.01;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,69:75:99:3154,293,0 -chr16 43781448 . G A 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-0.334;DP=136;FS=0.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,64:136:99:2220,0,2376 -chr16 43782187 . T A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.986;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:720,0,2032 -chr16 43782257 . G A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.280;DP=51;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:673,0,1060 -chr16 43784705 . TCTAAAAGTGTAAAAAATTTAATGCTTAAAAATTGTATAGCACAATATTTCATCCAAATTAGGTTATTACAGAACACCTAC T 2156.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.296;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=29.14;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:99:2194,214,0 -chr16 43784796 . T C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.010;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:610,0,1123 -chr16 43785308 . C A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.179;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:479,0,936 -chr16 43785335 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.568;DP=36;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:411,0,784 -chr16 43793117 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.921;QD=12.21;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:309,0,488 -chr16 44059347 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=24.88;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:277,0,101 -chr16 44079557 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:425,0,48 -chr16 44209132 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.740;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=23.37;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:85:332,0,85 -chr16 44238968 . G C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=-4.524;DP=42;FS=2.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:302,0,1175 -chr16 44239041 . A C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-2.234;DP=33;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:341,0,837 -chr16 44239209 . A C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=1.531;DP=37;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:526,0,796 -chr16 44239554 . T C 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.961;DP=86;FS=8.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,38:86:99:1342,0,1642 -chr16 44239569 . A G 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.322;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:648,0,3526 -chr16 44239648 . T G 2882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=-2.717;DP=77;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=29.57;ReadPosRankSum=2.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:2911,0,462 -chr16 44240010 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=1.496;DP=94;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.436;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:277,0,2893 -chr16 44241341 . C T 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.691;DP=73;FS=1.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,27:73:99:912,0,1564 -chr16 44242480 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-1.020;DP=87;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:346,0,2520 -chr16 44256912 . C T 4055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.746;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=32.97;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,108:123:59:4084,0,59 -chr16 44257363 . T C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-2.036;DP=56;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:753,0,1153 -chr16 44302205 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,267 -chr16 44353839 . T A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.350;DP=35;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:544,0,705 -chr16 44354777 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.457;DP=21;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=13.89;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:320,0,411 -chr16 44354880 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.183;DP=39;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:645,0,667 -chr16 44354933 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.767;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=15.19;ReadPosRankSum=2.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:484,0,489 -chr16 44371169 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.241;DP=54;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:884,0,828 -chr16 44377327 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-1.168;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:446,0,1028 -chr16 44390888 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-0.284;DP=40;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:701,0,689 -chr16 44454775 . G T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.766;DP=56;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:477,0,1603 -chr16 44455087 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-0.137;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:364,0,1048 -chr16 44455273 . G T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.020;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:411,0,656 -chr16 44455467 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=1.466;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,692 -chr16 44455472 . G C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:278,0,692 -chr16 44460996 . C T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=-0.298;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:952,0,1150 -chr16 44470605 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=1.176;DP=46;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=16.84;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:803,0,831 -chr16 44473180 . G C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-2.005;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:498,0,586 -chr16 44484306 . C T 818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=1.053;DP=47;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=17.42;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:847,0,802 -chr16 44487206 . G A 2090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.935;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.729;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,64:116:99:2119,0,1848 -chr16 44496836 . C A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.854;DP=135;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,39:130:99:1000,0,3380 -chr16 44500128 . GGGTGAGCGCTCCATTTTTAAATATTCATCTAGCTGTTTGCTACAAAATGAGATGCTAAAGTTGTCATGTCTGCA G 7143.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.664;DP=170;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=26.49;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,158:162:99:7181,631,0 -chr16 44501336 . C T 4385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.577;DP=198;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=22.15;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,131:198:99:4414,0,2159 -chr16 44501490 . C A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-1.605;DP=154;FS=2.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,18:152:99:803,0,9954 -chr16 44502190 . G A 3157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-1.049;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,81:105:99:3186,0,744 -chr16 44504010 . T TTA 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-3.055;DP=60;FS=5.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=14.83;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:927,0,1101 -chr16 44510709 . C T 2047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.093;DP=108;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,61:108:99:2076,0,1680 -chr16 44511128 . CAA C 1454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.021;DP=92;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.83;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1492,0,1907 -chr16 44511281 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.028;DP=98;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:254,0,6534 -chr16 44511287 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.375;DP=97;FS=3.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,17:97:99:254,0,6534 -chr16 44511498 . G C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-1.286;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:884,0,464 -chr16 44511776 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.049;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=23.17;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:677,0,249 -chr16 44511794 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.256;DP=35;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=21.88;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:794,0,466 -chr16 44511900 . C A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=3.421;DP=55;FS=3.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:639,0,1290 -chr16 44512005 . C T 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-1.540;DP=92;FS=16.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=17.55;ReadPosRankSum=3.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,50:92:99:1643,0,1867 -chr16 44512180 . A G 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.850;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:958,0,1442 -chr16 44515678 . G T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.246;DP=121;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,29:121:99:466,0,5216 -chr16 44564250 . G C 4428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=1.058;DP=281;FS=2.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,116:281:99:4457,0,5621 -chr16 44564488 . G A 1692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.743;DP=363;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,84:363:99:1721,0,10767 -chr16 44569076 . G A 5446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=2.425;DP=386;FS=2.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.099;QD=14.11;ReadPosRankSum=3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,154:385:99:5475,0,7859 -chr16 44570923 . G A 6816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.113;DP=442;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,192:442:99:6845,0,8310 -chr16 44595833 . T G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:345,0,252 -chr16 44607006 . G A 258.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:287,0,18 -chr16 44643177 . T A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.939;DP=37;FS=3.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:464,0,881 -chr16 44643257 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.138;DP=47;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:241,0,1377 -chr16 44646226 . A T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr16 44658410 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-0.810;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:310,0,855 -chr16 44665821 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.743;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:538,0,319 -chr16 44668630 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-1.265;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:426,0,899 -chr16 44673890 . C A 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=-1.564;DP=46;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=25.04;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,28:46:99:1180,0,1250 -chr16 44673900 . C A 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-0.295;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1187,0,1250 -chr16 44674177 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.75;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:44:383,0,44 -chr16 44674406 . GA G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.648;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:298,0,591 -chr16 44674945 . C T 1466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.197;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=23.28;ReadPosRankSum=-1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,42:63:99:1495,0,763 -chr16 44674995 . A G 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.819;DP=71;FS=2.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=29.04;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,55:71:99:2090,0,342 -chr16 44675085 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.221;DP=49;FS=3.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,37:49:99:1435,0,278 -chr16 44675201 . C T 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=2.856;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:735,0,677 -chr16 44675223 . T G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=1.030;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:709,0,906 -chr16 44694763 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.044;DP=56;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:487,0,1368 -chr16 44717907 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.217;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:87:466,0,87 -chr16 44753696 . A AC 3878.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-3.340;DP=166;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,98:152:99:3916,0,1189 -chr16 44759589 . T A 2322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.348;DP=384;FS=3.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,101:384:99:2351,0,11061 -chr16 44773835 . C A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:391,0,218 -chr16 44841729 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=-0.250;DP=77;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:614,0,2023 -chr16 44841783 . GA G 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.377;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.466;QD=3.57;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:316,0,1500 -chr16 44842043 . AT A 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.230;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=7.21;ReadPosRankSum=-2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:268,0,369 -chr16 44842088 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=1.886;DP=65;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:723,0,1349 -chr16 44843116 . C T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.787;DP=64;FS=3.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.069;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:1021,0,945 -chr16 44874976 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.438;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:678,0,688 -chr16 44921260 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-1.124;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:355,0,871 -chr16 44926079 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.401;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.204;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:316,0,493 -chr16 44928826 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr16 44928959 . G T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr16 44929847 . G T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr16 44930772 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.246;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:374,0,334 -chr16 44930862 . C G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:425,0,241 -chr16 44938096 . CCCTGTAACAGACAATAACACCCAACTCATAAAAACCGACATAAATCTCCCCTCAGCTGCGTGAATACATGATGTACTA C 725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=1.770;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=32.99;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:763,0,717 -chr16 44947000 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:231,0,67 -chr16 44947124 . TA T 5241.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.715;DP=12;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,3:11:99:5279,264,0 -chr16 44947287 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.586;DP=337;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.132;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,61:337:99:879,0,10781 -chr16 44955482 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=6.496;DP=132;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=6.13;ReadPosRankSum=-6.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,35:132:99:837,0,3739 -chr16 45056085 . G T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=2.869;DP=49;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.274;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:362,0,2961 -chr16 45056093 . C A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=2.596;DP=54;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:362,0,2995 -chr16 45056391 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.005;DP=53;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:301,0,1461 -chr16 45056932 . T C 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.439;DP=47;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,26:47:99:811,0,766 -chr16 45057860 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.054;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:419,0,756 -chr16 45057895 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.866;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=24.42;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:1005,0,356 -chr16 45058472 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.519;DP=26;FS=3.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:407,0,512 -chr16 45060659 . G C 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=-0.528;DP=49;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.852;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:775,0,897 -chr16 45077429 . A C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,126 -chr16 45093355 . C CT 460.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-1.007;DP=57;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:508,0,622 -chr16 45093571 . G GT 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.266;DP=87;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:630,0,850 -chr16 45093617 . T G 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-0.071;DP=117;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,41:117:99:1352,0,2590 -chr16 45097003 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:297,0,332 -chr16 45099566 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,390 -chr16 45145092 . A C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=-0.714;DP=113;FS=5.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,50:113:99:1710,0,1819 -chr16 45145239 . G T 1700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=-0.279;DP=127;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,54:126:99:1729,0,2300 -chr16 45145413 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.186;DP=130;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,36:129:99:605,0,3384 -chr16 45145449 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=1.137;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:1081,0,3013 -chr16 45161335 . T C 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=-0.904;DP=95;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:574,0,2656 -chr16 45194765 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-0.382;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:414,0,2322 -chr16 45194920 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.899;DP=64;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:350,0,1778 -chr16 45195219 . TAC T 1149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=1.239;DP=296;FS=3.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,59:282:99:1187,0,9205 -chr16 45195399 . G A 2592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.031;DP=201;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,76:200:99:2621,0,4159 -chr16 45195511 . G A 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=6.221;DP=211;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,52:210:99:1611,0,7682 -chr16 45195683 . TG T 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=-1.062;DP=239;FS=9.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,46:238:99:362,0,15479 -chr16 45195812 . G C 4729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.725;DP=276;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,143:274:99:4758,0,5829 -chr16 45195921 . G A 5006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.301;DP=299;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,148:298:99:5035,0,5192 -chr16 45212158 . T C 7182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.670;DP=268;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=26.80;ReadPosRankSum=-2.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,191:267:99:7211,0,1881 -chr16 45213145 . T C 6445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.042;DP=358;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,177:346:99:6474,0,6079 -chr16 45215124 . G A 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.042;DP=322;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,72:322:99:1418,0,9502 -chr16 45225186 . G C 2501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=-1.021;DP=359;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=6.97;ReadPosRankSum=-2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,107:358:99:2530,0,9119 -chr16 45232280 . T C 4078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.780;DP=356;FS=5.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,131:355:99:4107,0,7196 -chr16 45259108 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.468;DP=85;FS=3.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:301,0,4468 -chr16 45261414 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-1.093;DP=86;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,16:86:99:282,0,5105 -chr16 45261423 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-1.222;DP=79;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,12:79:99:274,0,5105 -chr16 45265304 . C CT 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=-0.204;DP=87;FS=14.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,31:84:99:644,0,1611 -chr16 45277166 . C G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,305 -chr16 45277793 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:328,0,477 -chr16 45277902 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,210 -chr16 45278692 . T C 562.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:44:591,44,0 -chr16 45280462 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,297 -chr16 45280792 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:231,0,400 -chr16 45447822 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:233,0,342 -chr16 45449953 . A G 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr16 45457452 . C A 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.757;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:697,0,179 -chr16 45457979 . A T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:307,0,227 -chr16 45458147 . T C 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:551,39,0 -chr16 45458963 . T C 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:353,24,0 -chr16 45459790 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:264,0,173 -chr16 45460892 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr16 45460920 . G T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr16 45461284 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-0.885;DP=29;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:730,0,275 -chr16 45463920 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:295,0,204 -chr16 45463979 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.118;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:230,0,936 -chr16 45511246 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=1.669;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:359,0,499 -chr16 45516738 . A T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.390;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:869,0,537 -chr16 45521808 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.309;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,179 -chr16 45522454 . G C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.784;DP=24;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:286,0,434 -chr16 45524366 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=-1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:70:248,0,70 -chr16 45525094 . G T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.527;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.264;QD=18.69;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:458,0,362 -chr16 45544487 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.714;DP=37;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:306,0,957 -chr16 45667885 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-0.355;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,28:168:99:253,0,9083 -chr16 45707389 . C T 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=-0.502;DP=63;FS=3.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,33:63:99:1077,0,1608 -chr16 45707721 . GCTGCTTAATCAAAGAAAGAGACACAATTCTTGATATCAACTAGGGTTGAGGCTGTGTTCTGTCTGTATTTATACGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTAC G 2708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.042;ClippingRankSum=-1.198;DP=83;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=32.64;ReadPosRankSum=-2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,61:78:99:2746,0,4476 -chr16 45707887 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-1.290;DP=73;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:295,0,2204 -chr16 45708019 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.325;DP=88;FS=6.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:363,0,2600 -chr16 45709207 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.197;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=4.87;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:510,0,2851 -chr16 45710487 . C T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-0.979;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:897,0,899 -chr16 45722275 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.955;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=10.80;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:428,0,768 -chr16 45722486 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=-0.866;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:436,0,688 -chr16 45728317 . G T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.484;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=21.86;ReadPosRankSum=-2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:531,0,406 -chr16 45748994 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.146;DP=24;FS=6.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:355,0,473 -chr16 45750732 . CCCTGCAAAACATCACATCCACTCAAGATGATGCTGTAAAAACACAAAACAGTCCAATCCATAGAGCTGAACATTTTTTA C 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:99:635,0,535 -chr16 45841234 . GCCTGAGAAACAACAGGGGGTAGCCAATGCCCAAATATGTAGTATATATATGTGTAGTTTCAGTATGGTTGACTTTAAGTTGTA G 1683.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=-0.101;DP=50;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=33.67;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1721,0,1680 -chr16 45866505 . C T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.806;DP=179;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,44:179:99:1048,0,10409 -chr16 45866598 . C T 2262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-2.814;DP=172;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,64:171:99:2291,0,8814 -chr16 45982227 . C T 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.020;DP=65;FS=5.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:896,0,1366 -chr16 45982477 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.688;DP=68;FS=7.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:429,0,1939 -chr16 45987649 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.086;DP=97;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:234,0,3012 -chr16 45987834 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=1.061;DP=66;FS=6.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:259,0,1952 -chr16 45988425 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.799;DP=69;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:421,0,1945 -chr16 46071098 . C A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.209;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:289,0,1196 -chr16 46071236 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.726;ClippingRankSum=0.987;DP=44;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:801,0,996 -chr16 46071414 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.880;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=4.54;ReadPosRankSum=-2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:269,0,1880 -chr16 46072674 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.313;DP=85;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:300,0,2649 -chr16 46127173 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-1.131;DP=48;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:260,0,1200 -chr16 46132200 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-0.264;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:474,0,2158 -chr16 46153643 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=-1.271;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:558,0,1141 -chr16 46153670 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=1.488;DP=51;FS=6.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:373,0,1389 -chr16 46160752 . C T 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.599;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=19.73;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1232,0,2976 -chr16 46160761 . A G 1203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.270;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=17.97;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1232,0,3037 -chr16 46188503 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=2.069;DP=55;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:375,0,1551 -chr16 46188770 . T A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.976;DP=42;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:814,0,561 -chr16 46188920 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=-2.111;DP=52;FS=6.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:285,0,2337 -chr16 46192512 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.307;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.628;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,470 -chr16 46202269 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:374,0,577 -chr16 46220827 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.234;DP=43;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:598,0,789 -chr16 46220864 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.144;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:603,0,1090 -chr16 46237448 . G C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.106;DP=34;FS=5.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:440,0,708 -chr16 46237465 . C A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=-0.590;DP=32;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:297,0,783 -chr16 46259627 . C T 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=-1.213;DP=224;FS=5.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,61:222:99:1441,0,6136 -chr16 46259994 . T C 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-0.659;DP=277;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,77:276:99:1871,0,7418 -chr16 46262770 . T C 6885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=1.188;DP=410;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,193:409:99:6914,0,7312 -chr16 46270601 . G A 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.116;DP=261;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,72:261:99:1643,0,6971 -chr16 46275084 . G A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.648;DP=221;FS=8.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,51:221:99:1076,0,6812 -chr16 46276302 . AGTACGTATTTGCCATTTGACTTGCAAGAGTGGTAAAAACCTGTATTTACTGTTGTGACTCTTGTGTACAG A 8796.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.333;DP=224;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,218:223:99:8834,746,0 -chr16 46276934 . CAGGTGTGTTAGTCTCTATTATATTTTTGTCTAATGATCTTCTCTTTCTGTCCTGTTATAATACTCTTGAATTGTTTCTTTGTTGTGTAA C 7362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=2.672;DP=187;FS=5.770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,173:187:99:7400,681,0 -chr16 46278659 . A T 2027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.659;DP=118;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=17.18;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,58:118:99:2056,0,2224 -chr16 46287055 . GCATGTTT G 504.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=3.154;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=3.056;QD=21.94;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:542,0,435 -chr16 46329843 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.293;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=14.58;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:422,0,520 -chr16 46618849 . G A 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-1.232;DP=44;FS=1.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:830,0,658 -chr16 46620593 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.398;DP=79;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:894,0,1829 -chr16 46667135 . C T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=-0.503;DP=37;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:939,0,292 -chr16 46669656 . GT G 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=-1.704;DP=28;FS=1.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:262,0,1978 -chr16 46669659 . A C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-2.308;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:262,0,1978 -chr16 46669668 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-2.422;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:474,0,1323 -chr16 46669798 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=-1.412;DP=41;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:230,0,1201 -chr16 47491066 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.847;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:522,0,2607 -chr16 47498126 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.184;DP=131;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,25:131:99:412,0,4046 -chr16 47619640 . T C 661.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=34.83;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:21:690,21,0 -chr16 48063041 . AT A 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.384;DP=36;FS=8.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:464,0,266 -chr16 48065649 . A G 2301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.881;ClippingRankSum=-0.929;DP=353;FS=3.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,97:349:99:2330,0,7966 -chr16 48273260 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-1.635;DP=27;FS=3.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:527,0,428 -chr16 48419372 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=3.344;DP=45;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:229,0,1134 -chr16 48420212 . A G 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.400;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:528,0,393 -chr16 48457237 . C G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:340,0,572 -chr16 48457396 . TCTGAACACAGCAGATCGGCACTTCAACACCACACAAATGCACATTAATCATTTATAAACAGCTGATGTGTCTGCTTCACTACATAC T 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=1.005;DP=31;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:99:1234,0,440 -chr16 48980983 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=1.122;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,365 -chr16 49391103 . T TA 537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=-1.867;DP=179;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,47:160:99:575,0,2542 -chr16 49677365 . G C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr16 49679246 . A G 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.375;DP=29;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:86:934,0,86 -chr16 49679361 . A C 3197.05 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.046;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,77:79:99:3225,232,0 -chr16 49684814 . G C 1156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=30.19;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:90:1185,90,0 -chr16 49684828 . T C 805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.528;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=25.50;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:834,66,0 -chr16 49684840 . A T 492.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=5.740;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=32.85;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:6:520,6,0 -chr16 49685141 . A T 2057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.844;DP=61;FS=1.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.122;QD=33.73;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:61:99:2086,0,162 -chr16 49685151 . G A 2332.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.836;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.515;QD=29.09;ReadPosRankSum=1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,54:60:48:2361,48,0 -chr16 49692542 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=1.692;DP=25;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=10.83;ReadPosRankSum=-3.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:299,0,499 -chr16 49706273 . G GT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=-0.859;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:245,0,545 -chr16 49802584 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=17.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:243,0,438 -chr16 49927389 . C CT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.354;DP=53;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:316,0,733 -chr16 49985564 . G A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-2.449;DP=95;FS=7.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=8.61;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:846,0,1484 -chr16 50493218 . ACTTCAGGGAAAGAAAAAAGTACAGTGCATTACATACTGCACAGTGATTTGATGAAAGTATGAGTGAACGGGTCTTAC A 2918.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=1.874;DP=81;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=28.55;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,71:81:99:2956,0,1237 -chr16 50657464 . T G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.918;DP=54;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=5.59;ReadPosRankSum=2.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:330,0,1569 -chr16 50662102 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:324,0,277 -chr16 51609998 . G A 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=1.251;DP=264;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,55:263:99:848,0,9693 -chr16 51617983 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=4.530;DP=288;FS=7.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=2.17;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,49:287:99:652,0,9133 -chr16 51624760 . C T 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.016;DP=223;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,53:223:99:996,0,6246 -chr16 51749636 . C T 1740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.705;DP=361;FS=0.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,84:361:99:1769,0,10840 -chr16 51795087 . A C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:613,0,621 -chr16 51974907 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.228;DP=166;FS=5.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,27:166:99:311,0,5372 -chr16 51976202 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-3.081;DP=103;FS=13.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,15:103:99:252,0,7290 -chr16 51976205 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-3.294;DP=107;FS=13.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,18:107:99:252,0,7290 -chr16 51992061 . TCTAAAATCAGCACATAACACTCAAACAGCTCCTCAGTTTCCTCACTCACAATCTCAACTCTTCAAAGACTCAC T 747.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=1.686;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=29.91;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:785,0,2394 -chr16 52008244 . C CA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.052;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:285,0,686 -chr16 52104044 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,295 -chr16 52537990 . G C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-0.515;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:418,0,162 -chr16 53066684 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,282 -chr16 53067213 . A C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,357 -chr16 53067232 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.781;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:236,0,1053 -chr16 53067356 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=1.006;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=16.83;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:449,0,423 -chr16 53068071 . G C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.161;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:575,0,2790 -chr16 53068087 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.149;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=13.88;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:639,0,1172 -chr16 53068209 . T C 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.498;DP=45;FS=6.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:753,0,896 -chr16 53070835 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-1.474;DP=21;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:369,0,378 -chr16 53071949 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.606;DP=14;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:75:371,0,75 -chr16 53131134 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.866;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:238,0,144 -chr16 53131509 . C G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.423;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=31.96;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:34:681,0,34 -chr16 53133243 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:310,0,61 -chr16 53433946 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-1.107;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,333 -chr16 53437557 . C T 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr16 53632653 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.704;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=16.66;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:478,0,457 -chr16 53634654 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-2.505;DP=34;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:336,0,2642 -chr16 54320564 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.059;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:247,0,339 -chr16 54347524 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,360 -chr16 54348060 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,244 -chr16 54461963 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:273,0,91 -chr16 54533494 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.856;DP=36;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,811 -chr16 54536519 . C T 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=-1.079;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=27.99;ReadPosRankSum=1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:868,0,152 -chr16 54545674 . C G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.905;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:258,0,1049 -chr16 54548183 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.699;DP=45;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:387,0,1198 -chr16 54548313 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.642;DP=17;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:411,0,113 -chr16 54548492 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=1.681;DP=49;FS=4.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:378,0,1297 -chr16 54548743 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.077;DP=32;FS=8.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:439,0,719 -chr16 54548782 . C CT 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.283;DP=26;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:238,0,354 -chr16 54549495 . T A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-0.628;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:441,0,586 -chr16 54550206 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.40;ReadPosRankSum=-2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:297,0,319 -chr16 54550531 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=23.48;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,104 -chr16 54551370 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.450;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:583,0,608 -chr16 54551731 . T A 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.149;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:996,0,1276 -chr16 54552686 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.599;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:323,0,333 -chr16 54553225 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-1.491;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:327,0,665 -chr16 54557268 . G T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=-0.800;DP=39;FS=2.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:883,0,439 -chr16 54557444 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=1.860;DP=29;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=30.27;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:906,0,442 -chr16 54559481 . AG A 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.234;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:280,0,122 -chr16 54630603 . G T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:459,0,448 -chr16 54635285 . A AG 2263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-0.773;DP=149;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,67:149:99:2301,0,2603 -chr16 54636142 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-0.220;DP=31;FS=4.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:647,0,512 -chr16 54637163 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-1.413;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,444 -chr16 54637302 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.742;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,552 -chr16 54637490 . G T 1860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-1.325;DP=107;FS=1.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,52:107:99:1889,0,1847 -chr16 54637847 . C T 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=-0.560;DP=76;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,45:76:99:1477,0,1136 -chr16 54638351 . C G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:359,0,175 -chr16 54638699 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.905;DP=32;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:468,0,596 -chr16 54638781 . A AT 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.276;DP=30;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:753,0,157 -chr16 54639014 . G T 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-1.183;DP=44;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:1007,0,327 -chr16 54640103 . TA T 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-0.197;DP=19;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:94:318,0,94 -chr16 54640234 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-0.516;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=11.63;ReadPosRankSum=2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:377,0,761 -chr16 54640567 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=2.412;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:248,0,2881 -chr16 54641983 . C CAA 744.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.896;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:782,0,493 -chr16 54644322 . G A 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-1.302;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,45:83:99:1389,0,1241 -chr16 54647886 . C T 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.255;DP=76;FS=4.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,38:76:99:1322,0,1334 -chr16 54655217 . A C 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-1.731;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=17.03;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,34:63:99:1101,0,1009 -chr16 54659559 . A C 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.451;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:1300,0,955 -chr16 54663859 . G A 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.242;DP=84;FS=4.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1492,0,1577 -chr16 54718893 . G A 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.018;DP=98;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=17.30;ReadPosRankSum=2.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,48:98:99:1724,0,1825 -chr16 54737607 . C A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-1.281;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:252,0,1265 -chr16 54738015 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.993;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:262,0,718 -chr16 54739111 . AAGGTAACTTTCCTTAACATCCGATCATTTCGGTGCTGTTTATTATATTTGTAATAACATTTAATGTAATTGATTATAC A 20666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.184;DP=566;FS=2.047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=28.77;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,539:543:99:20704,1539,0 -chr16 54740170 . T A 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=1.468;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:765,0,1060 -chr16 54740171 . A T 578.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.189;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:616,0,1994 -chr16 54766989 . A G 1595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=2.035;DP=68;FS=1.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=23.47;ReadPosRankSum=-1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1624,0,821 -chr16 54767128 . T G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.358;DP=157;FS=40.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,31:142:99:587,0,4391 -chr16 54767135 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-0.131;DP=148;FS=38.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,21:135:99:264,0,8110 -chr16 54768711 . C T 3955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.860;ClippingRankSum=-4.854;DP=292;FS=26.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=13.55;ReadPosRankSum=3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,105:258:99:3984,0,10604 -chr16 54768712 . A G 3955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=-4.767;DP=292;FS=26.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=13.55;ReadPosRankSum=4.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,105:258:99:3984,0,10615 -chr16 54772814 . C T 3011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=-5.158;DP=99;FS=41.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=30.42;ReadPosRankSum=3.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,81:99:99:3040,0,319 -chr16 54877764 . T C 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=4.156;DP=32;FS=11.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:930,0,288 -chr16 54892568 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-1.164;DP=87;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:684,0,2269 -chr16 54901946 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-2.308;DP=69;FS=6.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:477,0,2162 -chr16 54902573 . A G 1945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=1.093;DP=133;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,12:84:99:1974,0,5143 -chr16 54902626 . C G 1945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.974;DP=140;FS=41.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=13.90;ReadPosRankSum=3.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,19:107:99:1974,0,5230 -chr16 55507542 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.566;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:666,0,207 -chr16 55517666 . C A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.322;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:594,0,812 -chr16 55519734 . CA C 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=1.646;DP=32;FS=3.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:248,0,620 -chr16 55567560 . G A 4382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.490;DP=154;FS=6.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=28.46;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,110:136:99:4411,0,413 -chr16 55567762 . C T 1927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=1.068;DP=63;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=30.60;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:86:1956,0,86 -chr16 55568018 . A T 1102.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=1.476;DP=27;FS=9.542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=32.79;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1131,78,0 -chr16 55568088 . G T 2488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-1.015;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=30.29;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:58:99:2517,169,0 -chr16 55568095 . G T 2432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-1.939;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=33.39;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,56:58:99:2461,169,0 -chr16 55568809 . A AT 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:323,0,106 -chr16 55572468 . G T 1382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.717;DP=15;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=30.49;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:1411,0,106 -chr16 55572536 . T A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.091;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.282;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,2:14:99:534,0,886 -chr16 55572581 . T A 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=1.000;DP=69;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:372,0,687 -chr16 55572582 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.197;DP=58;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:397,0,684 -chr16 55572599 . C T 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=1.283;DP=77;FS=9.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.163;QD=13.39;ReadPosRankSum=-4.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:1059,0,1931 -chr16 55572640 . G T 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=1.209;DP=82;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=22.58;ReadPosRankSum=4.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,39:59:99:1880,0,480 -chr16 55572881 . C A 2751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=3.322;DP=258;FS=131.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=10.67;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,80:154:99:2780,0,2450 -chr16 55572891 . GA G 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-6.388;DP=267;FS=157.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=2.16;ReadPosRankSum=5.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,33:144:99:613,0,3660 -chr16 55573171 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=1.468;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.06;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:315,0,294 -chr16 55573174 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=1.246;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=23.90;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:315,0,294 -chr16 55573908 . A G 7500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-4.387;DP=222;FS=16.185;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=33.79;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,173:183:99:7529,457,0 -chr16 55574922 . A G 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=2.526;DP=26;FS=21.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=25.80;ReadPosRankSum=-2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:699,0,142 -chr16 55575063 . A T 2067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2096,150,0 -chr16 55575090 . C A 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 -chr16 55575336 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-2.188;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:591,0,289 -chr16 55575461 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.951;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.506;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:235,0,817 -chr16 55575462 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-3.096;DP=34;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:300,0,411 -chr16 55575734 . G C 1693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-2.042;DP=85;FS=4.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=19.93;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,50:83:99:1722,0,2380 -chr16 55576045 . T A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.253;DP=22;FS=13.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,488 -chr16 55580468 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.275;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=7.34;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:366,0,1175 -chr16 55587297 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=-0.485;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:489,0,1236 -chr16 55592632 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.271;DP=61;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:334,0,2816 -chr16 55603778 . G GT 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.203;DP=73;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:477,0,756 -chr16 55604100 . T C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.592;DP=53;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:483,0,1436 -chr16 55604202 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=-1.196;DP=54;FS=4.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:276,0,1559 -chr16 55604588 . T C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.963;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:592,0,454 -chr16 55604773 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.271;DP=60;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:280,0,2061 -chr16 55604792 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.197;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=5.34;ReadPosRankSum=2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:370,0,2778 -chr16 55604879 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.638;DP=65;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:300,0,2702 -chr16 55605187 . CTT C 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.541;DP=73;FS=6.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1054,0,1042 -chr16 55605728 . T C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=-0.129;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:451,0,795 -chr16 55605736 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=-1.078;DP=31;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=8.77;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:300,0,808 -chr16 55818001 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=13.63;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:260,0,320 -chr16 55824477 . A G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:354,0,395 -chr16 55826651 . A C 268.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.79;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:296,0,11 -chr16 55827544 . G A,T 202.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.044;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,4,5:10:99:324,164,196,123,0,151 -chr16 55828053 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=22.37;ReadPosRankSum=2.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:319,0,249 -chr16 55829190 . A C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:273,0,56 -chr16 55829444 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=28.58;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:314,0,139 -chr16 55829509 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=23.06;ReadPosRankSum=2.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:305,0,198 -chr16 55830021 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,168 -chr16 56024792 . A C 4062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=6.413;DP=272;FS=66.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=14.94;ReadPosRankSum=-5.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,114:226:99:4091,0,4669 -chr16 56024921 . G A 2682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.198;ClippingRankSum=-0.214;DP=216;FS=4.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.42;ReadPosRankSum=2.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,78:129:99:2711,0,2517 -chr16 56024964 . C T 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=3.401;DP=63;FS=11.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,46:55:99:1746,0,148 -chr16 56025294 . T C 1168.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1197,81,0 -chr16 56025366 . C T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-2.961;DP=64;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:724,0,1455 -chr16 56027209 . T G 4189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.199;DP=260;FS=2.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=16.11;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,115:259:99:4218,0,5027 -chr16 56028539 . C T 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.499;DP=163;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,34:121:99:826,0,4467 -chr16 56028562 . T G 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.672;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=18.71;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1319,0,2479 -chr16 56028665 . G T 5735.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=2.389;DP=68;FS=5.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=29.64;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,39:50:99:5764,160,0 -chr16 56028672 . A G 5656.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=2.599;DP=75;FS=5.012;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=34.47;ReadPosRankSum=-1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,44:55:80:5685,80,0 -chr16 56028946 . T C 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:782,54,0 -chr16 56029094 . T C 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=2.937;DP=56;FS=11.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=22.98;ReadPosRankSum=-2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1315,0,780 -chr16 56029098 . G T 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=1.925;DP=43;FS=8.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=29.92;ReadPosRankSum=-2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:1315,0,753 -chr16 56075795 . G A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.016;DP=56;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=7.76;ReadPosRankSum=2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:463,0,1415 -chr16 56099224 . G A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.635;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:381,0,1843 -chr16 56099232 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.515;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:381,0,1843 -chr16 56100965 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.080;DP=39;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=5.74;ReadPosRankSum=2.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:252,0,1120 -chr16 56125222 . GA G 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:277,25,0 -chr16 56125365 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-0.166;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:475,0,884 -chr16 56125889 . CA C 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.619;DP=71;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:582,0,1011 -chr16 56126599 . G T 1159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.748;DP=88;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:1188,0,4324 -chr16 56129044 . C T 2460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.648;DP=101;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,68:101:99:2489,0,884 -chr16 56138410 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-1.601;DP=45;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:433,0,1166 -chr16 56140260 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.092;DP=24;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:414,0,405 -chr16 56148195 . CA C 691.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=-0.374;DP=87;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:729,0,2030 -chr16 56161631 . T C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=2.937;DP=271;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=2.59;ReadPosRankSum=-2.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,51:270:99:731,0,8065 -chr16 56162802 . G T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.044;DP=255;FS=1.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,55:254:99:966,0,7608 -chr16 56165105 . A G 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.589;DP=193;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,59:193:99:1469,0,4739 -chr16 56178591 . G A 2580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-2.491;DP=137;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,82:134:99:2609,0,1698 -chr16 56196729 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.445;DP=211;FS=2.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,47:209:99:934,0,6168 -chr16 56199832 . C T 3968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=2.456;DP=195;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.548;QD=20.35;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,99:194:99:3997,0,7403 -chr16 56271870 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=19.30;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:395,0,284 -chr16 56322750 . C T 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.068;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,34:114:99:885,0,5636 -chr16 56334524 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=-0.598;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:414,0,1981 -chr16 56351925 . A C 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.061;DP=106;FS=0.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1794,0,1897 -chr16 56355051 . C A 2070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.751;DP=153;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,60:152:99:2099,0,3128 -chr16 56355105 . C T 2599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-2.823;DP=206;FS=4.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=12.62;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,80:205:99:2628,0,4177 -chr16 56370800 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-1.226;DP=111;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:471,0,4473 -chr16 56452667 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.117;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:670,0,2674 -chr16 56452668 . T C 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-0.110;DP=88;FS=4.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,30:88:99:985,0,2175 -chr16 56477925 . T G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.764;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:346,0,821 -chr16 56482891 . C G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.175;DP=101;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:314,0,3052 -chr16 56490173 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=-1.068;DP=104;FS=8.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,19:104:99:270,0,3034 -chr16 56497630 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=2.450;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:240,0,1446 -chr16 56508435 . GAGGTAAAGCTGCATGCATTGCACTTTCTCCAGATCAGCGTGTGAGATGTCATGAACAGGTGTGATTGTTTTAC G 6078.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=2.291;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,135:140:99:6116,458,0 -chr16 56510512 . C T 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-0.921;DP=143;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.846;QD=7.98;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,45:142:99:1170,0,3612 -chr16 56572634 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:266,0,255 -chr16 56581465 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.34;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,125 -chr16 56583362 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-1.228;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.720;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:267,0,1180 -chr16 56584313 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:382,0,136 -chr16 56585048 . TA T 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:324,0,149 -chr16 56726282 . G A 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.632;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.002;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:959,0,959 -chr16 56731975 . C T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.132;DP=46;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=17.58;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:837,0,778 -chr16 56808954 . A T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.488;DP=44;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:291,0,1170 -chr16 56832454 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-0.503;DP=114;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,19:113:99:269,0,3706 -chr16 56841352 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.020;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:292,0,812 -chr16 56844496 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=3.090;DP=38;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=7.28;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:305,0,1099 -chr16 56893678 . C T 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr16 56974214 . TGGTATATGTTCATCTGATGTGTGTTGGGATTCTGTGTGTGTGTTTGCTGTGCATGTGAAGTGTGTATTCATGCACGTGTTCTCCTCA T 234.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=1.655;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=4.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:97:272,97,0 -chr16 57446973 . TA T 633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.144;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:44:671,44,0 -chr16 57897439 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-1.422;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,27:180:99:237,0,5800 -chr16 57897475 . G A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=-2.052;DP=229;FS=2.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,40:227:99:516,0,6811 -chr16 57897526 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.971;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=0.99;ReadPosRankSum=2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,33:209:99:236,0,6194 -chr16 57899186 . C T 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.040;DP=202;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.533;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,50:202:99:1038,0,5752 -chr16 57920913 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.903;DP=64;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,12:64:99:258,0,4155 -chr16 57920914 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=1.255;DP=65;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:258,0,4155 -chr16 57946467 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-1.496;DP=43;FS=5.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=8.06;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:375,0,1409 -chr16 57947055 . A T 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.143;DP=100;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,37:100:99:1251,0,2202 -chr16 58024305 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.760;DP=88;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:316,0,2666 -chr16 58086099 . C T 639.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-0.861;DP=22;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:24:668,0,24 -chr16 58124945 . T A 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.118;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,55:179:99:1433,0,5086 -chr16 58126268 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.652;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=9.01;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:740,0,4462 -chr16 58126749 . C CA 466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.395;DP=105;FS=18.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:504,0,5646 -chr16 58127003 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=1.802;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:368,0,3558 -chr16 58127004 . A G 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.343;ClippingRankSum=2.115;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=5.66;ReadPosRankSum=-2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:368,0,3558 -chr16 58127426 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.065;DP=122;FS=4.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=2.18;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:294,0,3890 -chr16 58130149 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=2.765;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=26.13;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:603,0,1124 -chr16 58130219 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=-0.849;DP=56;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.26;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:771,0,1137 -chr16 58150632 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-1.046;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=18.58;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:883,0,672 -chr16 58150731 . C A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=1.489;DP=43;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:255,0,1178 -chr16 58153057 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.901;ClippingRankSum=-0.720;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:472,0,696 -chr16 58156785 . T C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.420;DP=66;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:429,0,829 -chr16 58159512 . T C 4368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=-1.232;DP=135;FS=3.121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=32.36;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,83:85:99:4397,322,0 -chr16 58159609 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.127;DP=166;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:480,0,1914 -chr16 58238982 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-1.260;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=6.60;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:266,0,911 -chr16 58242098 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=1.138;DP=44;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:259,0,1180 -chr16 58247006 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=2.694;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:285,0,1128 -chr16 58275485 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=-1.294;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:324,0,602 -chr16 58310307 . CAG C 895.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.022;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:933,0,992 -chr16 58311449 . C T 1636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.876;DP=121;FS=5.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,50:121:99:1665,0,2313 -chr16 58319242 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.470;DP=83;FS=5.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=3.60;ReadPosRankSum=2.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:327,0,2264 -chr16 58319257 . C G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.866;DP=85;FS=4.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.30;ReadPosRankSum=-1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:904,0,1766 -chr16 58319281 . G A 1416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-1.124;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-4.168;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,45:86:99:1445,0,1422 -chr16 58401104 . C A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=2.188;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:289,0,417 -chr16 58473259 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-2.110;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=6.29;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:280,0,1029 -chr16 58483032 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-0.347;DP=35;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:253,0,926 -chr16 58513188 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,182 -chr16 58547233 . C T 5126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.903;DP=454;FS=2.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,157:454:99:5155,0,12306 -chr16 58598863 . A G 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.873;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=17.79;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:829,0,694 -chr16 58598947 . A T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.126;DP=71;FS=0.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:616,0,2100 -chr16 58599596 . T TAC 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.615;DP=36;FS=1.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:298,0,434 -chr16 58621433 . C CT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=-1.278;DP=82;FS=7.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:266,0,1392 -chr16 58641673 . C T 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-3.165;DP=131;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=10.85;ReadPosRankSum=2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,44:131:99:1450,0,3124 -chr16 58654290 . G A 3624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.454;DP=201;FS=5.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.03;ReadPosRankSum=3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,101:201:99:3653,0,3680 -chr17 57530 . G A 4342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.220;DP=225;FS=5.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,130:224:99:4371,0,3338 -chr17 57721 . C T 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:425,33,0 -chr17 283053 . A G 207.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:236,0,18 -chr17 297890 . T G 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.600;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=22.45;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:971,0,443 -chr17 356396 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-1.312;DP=27;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:470,0,407 -chr17 366841 . G A 315.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=31.57;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:343,0,6 -chr17 374006 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=1.606;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:359,0,84 -chr17 374339 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.28;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89:271,0,89 -chr17 386756 . TA T 270.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:24:308,0,24 -chr17 454500 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr17 517757 . C T 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.408;DP=123;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.294;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,64:115:99:2095,0,1797 -chr17 523924 . T A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.620;DP=27;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:463,0,410 -chr17 523932 . A T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=2.126;DP=22;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:524,0,425 -chr17 557875 . T A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.239;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=26.48;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:346,0,48 -chr17 966027 . C T 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=1.475;DP=117;FS=5.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,24:117:99:547,0,6527 -chr17 966029 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=1.559;DP=119;FS=2.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,26:119:99:537,0,6527 -chr17 980424 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=-0.296;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:333,0,2996 -chr17 980431 . A G 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.169;DP=80;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:1346,0,1459 -chr17 980497 . A G 7679.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=-1.978;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=35.34;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,102:108:99:7708,540,0 -chr17 980907 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=1.077;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,497 -chr17 980927 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.606;DP=24;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=16.53;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:425,0,439 -chr17 980943 . A G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.154;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:351,0,433 -chr17 980979 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=3.571;DP=33;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=8.93;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:323,0,1029 -chr17 981191 . A G 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-1.683;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=29.78;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:1130,0,205 -chr17 981336 . A G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.323;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=34.24;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:778,0,313 -chr17 1430421 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,107 -chr17 1430483 . A G 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:431,30,0 -chr17 1430491 . T C 402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:431,30,0 -chr17 1431270 . G T 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr17 1431315 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr17 1502434 . G A 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-0.760;DP=50;FS=2.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:632,0,1026 -chr17 1526311 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.348;DP=150;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,31:149:99:488,0,4750 -chr17 2379572 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=-0.292;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=8.21;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:250,0,1024 -chr17 2381363 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.283;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:254,0,706 -chr17 2382538 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.600;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,172 -chr17 2385752 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.739;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:427,0,800 -chr17 2385755 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:432,0,800 -chr17 2388662 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=1.907;DP=40;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=16.42;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:685,0,714 -chr17 2408673 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=-1.359;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:646,0,628 -chr17 2421548 . G A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=-0.696;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=23.04;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,32:47:99:1111,0,382 -chr17 2545708 . A T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 -chr17 3543298 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.457;DP=25;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:356,0,443 -chr17 3544734 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=1.559;DP=30;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:496,0,484 -chr17 3544816 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.729;DP=32;FS=5.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:461,0,711 -chr17 3545498 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.329;DP=28;FS=12.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:410,0,621 -chr17 3844197 . T G 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=3.985;DP=190;FS=9.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,54:190:99:1298,0,7181 -chr17 3865753 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:298,0,342 -chr17 3866330 . C G 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-1.426;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=30.89;ReadPosRankSum=1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:955,0,122 -chr17 3974794 . G T 856.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:894,66,0 -chr17 3974796 . C G 865.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:894,66,0 -chr17 4171671 . T C 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr17 4171981 . A T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr17 4181398 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.197;DP=23;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,468 -chr17 4181452 . G T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.531;DP=47;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=14.87;ReadPosRankSum=2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:50:748,0,50 -chr17 4181492 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-0.244;DP=33;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:254,0,168 -chr17 4181708 . A T 4218.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-0.445;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=32.14;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:4247,323,0 -chr17 4181723 . TA T 3298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.042;DP=169;FS=2.327;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,107:112:99:3336,323,0 -chr17 4199416 . A T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:272,0,98 -chr17 4199900 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 -chr17 4199901 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,185 -chr17 4208820 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:292,21,0 -chr17 4864505 . T C 1530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-1.011;DP=250;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,67:250:99:1559,0,6958 -chr17 5343922 . A G 1341.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1370,102,0 -chr17 5371615 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:334,0,55 -chr17 5395899 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-1.115;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=29.26;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:555,0,119 -chr17 5717342 . A G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-1.727;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:328,0,524 -chr17 5787597 . T A 640.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:669,48,0 -chr17 6242477 . AAGGTCTGAGTCCTGTTTTAGCAGAGTTTATTTATCATTTGAGCTTTGCTGTGACTGGATCTGATCTACCGC A 549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=2.925;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=21.14;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:587,0,3648 -chr17 6572275 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.68;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:255,0,102 -chr17 6572643 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=-1.191;DP=34;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:295,0,947 -chr17 6849649 . C A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr17 7082825 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.395;DP=16;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:461,0,121 -chr17 7101401 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:277,0,56 -chr17 7110342 . G A 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.115;DP=21;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=27.32;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:602,0,115 -chr17 7379987 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.193;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:299,0,211 -chr17 7407766 . AGTAATCCAGCATCTCATGAATACATCACGCTTTGATACTAAAGAAATCCCATGTAACAGAACGTCTCATTCATAG A 1480.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.325;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=27.39;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1518,120,0 -chr17 7429007 . T C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.475;DP=32;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:705,0,376 -chr17 7429851 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:344,0,97 -chr17 7431278 . C T 379.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=34.54;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:408,0,13 -chr17 7463561 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=2.855;DP=27;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:293,0,651 -chr17 7464433 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-1.113;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:573,0,368 -chr17 7468437 . A AT 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.176;DP=23;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:244,0,246 -chr17 7468589 . A G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:589,0,123 -chr17 7470190 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,398 -chr17 7470192 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-2.927;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:321,0,398 -chr17 7640126 . GCCTGTAAAAGTATAAAGAGATCATGAGAAGAGCAGTAGATTATCGGTGATTATACGATCCCAAAACAATCCAGA G 1241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.783;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,30:33:99:1279,0,331 -chr17 7642677 . ACTGAAATCAAGCAATAAACACACATGAAAGGACTGCAATTAATTAATCACAGTGTTATTGATAAATGTGCTAACATGATCCCAC A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=2.006;DP=29;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=29.51;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:893,0,694 -chr17 7725683 . G A 508.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:8:536,8,0 -chr17 7735071 . G A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-1.156;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:399,0,191 -chr17 7746616 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,367 -chr17 7747899 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:297,0,244 -chr17 7779321 . G A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:66:417,0,66 -chr17 7785469 . C G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.065;DP=15;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:430,0,124 -chr17 7803330 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:261,0,101 -chr17 7803342 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:272,0,106 -chr17 7825591 . A G 282.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.44;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:5:310,0,5 -chr17 7869526 . C A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,138 -chr17 8042463 . TGGTAAGACTTTTCTGTGCAACTAAAACAAGAAATCATAGACACGTAAAGAATTTTTCTCAAGATGCATATGATTATTTCTA T 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=34.17;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:379,0,494 -chr17 8069644 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=1.258;DP=27;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:550,0,365 -chr17 8086109 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-1.152;DP=29;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:513,0,476 -chr17 8086319 . C G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=19.74;ReadPosRankSum=2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:423,0,414 -chr17 8101988 . T C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.059;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:545,0,544 -chr17 8102030 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=1.777;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:625,0,596 -chr17 8264043 . T C 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-0.476;DP=30;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:803,0,133 -chr17 8309952 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.836;DP=39;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:749,0,588 -chr17 8334791 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.601;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:426,0,377 -chr17 8421147 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:247,0,574 -chr17 8442888 . C CT 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.971;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:403,0,1911 -chr17 8466479 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.247;DP=136;FS=2.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,21:136:99:240,0,4344 -chr17 8573130 . TA T 590.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.563;DP=49;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:628,0,370 -chr17 8649932 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-1.184;DP=50;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:887,0,1605 -chr17 8672646 . C T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.576;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:819,0,1176 -chr17 8692232 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.537;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:293,0,789 -chr17 8772884 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.117;DP=261;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,40:261:99:372,0,11477 -chr17 8779743 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=1.128;DP=351;FS=9.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,52:350:99:314,0,14251 -chr17 8796759 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.837;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:396,0,323 -chr17 8818338 . C G 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.039;DP=49;FS=4.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:885,0,686 -chr17 8821221 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.831;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:583,0,692 -chr17 9062627 . A C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=12.67;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:307,0,574 -chr17 9099708 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.621;DP=36;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:235,0,986 -chr17 9099945 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.778;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:339,0,603 -chr17 9809839 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=3.028;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.261;QD=6.58;ReadPosRankSum=-3.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:311,0,1163 -chr17 9816070 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:271,0,56 -chr17 9872532 . CA C 386.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.839;DP=99;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:424,0,1434 -chr17 9873242 . G A 2665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.907;DP=97;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=27.48;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,73:97:99:2694,0,435 -chr17 9873270 . TG T 1139.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=1.312;DP=65;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,44:61:99:1177,0,271 -chr17 9902252 . CCCTGTTTTAAATTGGGGAAAAAAGAAAACAACCTTCATTAAAACTTCTGAACTTATTTCTGCCTGAAATCACGATCAAATTCCAGAAAACAGCAATTCTACTAA C 7877.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=1.679;DP=199;FS=3.216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=33.23;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,194:195:99:7915,575,0 -chr17 10013125 . C A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-1.618;DP=56;FS=4.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:370,0,2954 -chr17 10013126 . A T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.401;DP=55;FS=6.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:370,0,2954 -chr17 10014028 . T G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.814;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=6.82;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:485,0,1826 -chr17 10016582 . GCCTAAAAATAAAGAAGAAAACATAATAAGTCATATTTTCAGTGCAATTACAAGCATGATTTGTAGCAAAATCAACAAA G 2809.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=33.85;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:83:99:2847,240,0 -chr17 10023010 . TCCTGCCAAAAGCAGAAGGGTTTTGTATGAGTAAAAATTGTCAAGTGAGCATTACAAAAAATATGCTATCCTTCATTTGGAAATCTCA T 3079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=2.751;DP=79;FS=2.179;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=34.10;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,74:77:99:3117,223,0 -chr17 10025965 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=2.013;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:398,0,2142 -chr17 10029616 . C CA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-2.485;DP=84;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:305,0,1601 -chr17 10457616 . T C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-1.362;DP=79;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:531,0,2388 -chr17 10457844 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:338,0,438 -chr17 10498155 . G A 2213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=-0.403;DP=83;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=26.67;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,62:83:99:2242,0,465 -chr17 10521827 . CT C 1117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.435;ClippingRankSum=7.157;DP=267;FS=7.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=4.19;ReadPosRankSum=8.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,125:257:99:1155,0,3845 -chr17 10548243 . AAGGTAAAAACAAAAAATTATTAACTTTCAGATGGCTGGAGTTACCTAGTTTGCCTGATTACTGTATTGAAGTTTTTATTGATGTTGTTTTTTTGC A 2206.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=2.422;DP=184;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,175:177:99:2244,443,0 -chr17 10552235 . G GGCT 3107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.621;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=21.58;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,97:130:99:3145,0,885 -chr17 10569616 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=12.21;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,410 -chr17 11190790 . C CA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.877;DP=97;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:288,0,1450 -chr17 11192129 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-1.045;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,28:148:99:417,0,4390 -chr17 11242070 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.670;DP=13;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=19.37;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:280,0,125 -chr17 11242986 . C G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.252;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,25:127:99:399,0,3741 -chr17 11255676 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=1.213;DP=168;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,29:168:99:406,0,5462 -chr17 11317460 . T C 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:510,39,0 -chr17 11317512 . A T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr17 11335942 . G GA 507.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-0.612;DP=73;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:545,0,833 -chr17 11347920 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-0.063;DP=265;FS=7.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=2.01;ReadPosRankSum=4.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,45:265:99:560,0,8300 -chr17 11631839 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,332 -chr17 12036367 . ACAGGTCAGATTATCTGTTGTATTATCTTGCAAGATCACAATTCCTTCATTTAAATGTAATATGCGCACTG A 1316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=1.458;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.180;QD=33.76;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,35:39:99:1354,0,228 -chr17 12064548 . A AT 205.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr17 12090010 . ACTATAGGAAGGACATTGCATAGCAATAAATCAGAGAATGGCATGGCGTGTGAAACTCACCTCAAGCAACACAACAGAAAGCATGATAGTCAATGTTAAGAAGTAC A 6144.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=1.213;DP=151;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=32.28;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,144:150:99:6182,438,0 -chr17 12099994 . TCTGAAAGAGAAAGAAATTAACTAAACAATAAATAAAAATTCAACACAATTTAGTACAGAATGGGCCAAAATCGAAC T 5424.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=1.648;DP=125;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=34.13;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,123:124:99:5462,449,0 -chr17 12302955 . A C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.367;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:310,0,2110 -chr17 12564065 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=1.022;DP=135;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,22:135:99:242,0,4316 -chr17 12611851 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.570;DP=71;FS=4.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=3.95;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:309,0,2131 -chr17 12612653 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-3.060;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:329,0,2010 -chr17 12622484 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.199;DP=130;FS=1.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:363,0,4181 -chr17 12624633 . G C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=-0.745;DP=151;FS=5.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=2.89;ReadPosRankSum=3.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,28:151:99:465,0,4805 -chr17 12627416 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.506;DP=156;FS=0.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,26:156:99:378,0,5123 -chr17 12627661 . T TA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=1.350;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:271,0,422 -chr17 12674627 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.035;DP=49;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=4.95;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:271,0,1399 -chr17 12826983 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-1.106;DP=318;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=1.85;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,53:318:99:618,0,10113 -chr17 12828911 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.027;DP=569;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:487,78:565:99:452,0,18699 -chr17 12883502 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=-2.407;DP=91;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,19:91:99:380,0,2719 -chr17 12884145 . C G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.322;DP=145;FS=9.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,23:145:99:280,0,4704 -chr17 12909206 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.426;DP=62;FS=3.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:417,0,1692 -chr17 12909511 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.396;DP=93;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=4.92;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:486,0,2562 -chr17 12935090 . T A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.895;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:478,0,2520 -chr17 12972821 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.692;DP=252;FS=5.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,40:252:99:384,0,7595 -chr17 13498653 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:345,0,47 -chr17 14369396 . A G 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.708;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=12.37;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:560,0,858 -chr17 14596559 . G C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-0.864;DP=110;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:436,0,3076 -chr17 14638302 . T C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.087;DP=89;FS=0.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:637,0,2526 -chr17 14638343 . T G 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.168;DP=113;FS=2.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:855,0,3207 -chr17 14638557 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.002;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,37:199:99:609,0,6206 -chr17 14655174 . G T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.258;DP=72;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:373,0,1919 -chr17 14655271 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.849;DP=85;FS=7.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:268,0,2642 -chr17 14662000 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-5.443;DP=246;FS=5.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,36:245:99:316,0,8711 -chr17 14662042 . A T 4418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-2.090;DP=264;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,140:263:99:4447,0,4327 -chr17 14700773 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=1.806;DP=132;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,23:132:99:358,0,4251 -chr17 14760086 . T TC 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:338,0,414 -chr17 14774698 . CCACTAAAACAATTAAAGCCCACAGCA C 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-0.506;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=8.12;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:281,0,4161 -chr17 14774700 . ACTAAAACAATTAAAGCCCACAGCAGAGAATTAACAAAGGGTTTACTAAAAATAAGCATGGCTTTGATAAATGTGTTAAACAGATCATGCTTCTCAC A 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=1.075;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=13.82;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:507,0,3624 -chr17 14774726 . AGAATTAACAAAGGGTTTACTAAAAATAAGCATGGCTTTGATAAATGTGTTAAACAGATCATGCTTCTCAC A 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.303;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=7.39;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:281,0,4161 -chr17 14998963 . T C 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.515;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,49:142:99:1588,0,3056 -chr17 15001540 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.972;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,38:160:99:788,0,4742 -chr17 15027553 . A G 1390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.307;DP=181;FS=3.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,55:181:99:1419,0,4821 -chr17 15060754 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.134;DP=33;FS=12.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:234,0,1491 -chr17 15061429 . C T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.766;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:584,0,768 -chr17 15235429 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.217;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:335,0,1499 -chr17 15298391 . TCTGAATTATTGGCAATGCAAAACAATACTTTAAAATACTTTAAAGTTAATTTATCATAACAGTATGACAGTATTAATCTCACAAAAATAC T 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=2.416;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=22.24;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:927,0,2868 -chr17 15298624 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.248;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:316,0,1998 -chr17 15344381 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.487;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:270,0,1244 -chr17 15369722 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.128;DP=88;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:582,0,2307 -chr17 15378676 . T C 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=-0.361;DP=259;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,60:248:99:637,0,7261 -chr17 15379290 . A AT 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.015;DP=405;FS=11.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,89:382:99:764,0,7805 -chr17 15752763 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-2.165;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=3.72;ReadPosRankSum=2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:322,0,5020 -chr17 15759903 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=2.103;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:586,0,1994 -chr17 15786936 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-0.822;DP=70;FS=12.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.548;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:378,0,1937 -chr17 15806676 . A G 1365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.798;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=29.06;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,35:46:99:1394,0,244 -chr17 15847888 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr17 15938921 . T A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.861;DP=118;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,34:117:99:882,0,3221 -chr17 15940949 . A T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.500;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,45:150:99:1088,0,3915 -chr17 15944483 . C T 1084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.354;DP=126;FS=8.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,42:126:99:1113,0,3137 -chr17 15948796 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=-0.695;DP=102;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=5.81;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:621,0,2825 -chr17 16034742 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-1.113;DP=36;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:272,0,929 -chr17 16034772 . C T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.066;DP=36;FS=1.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:441,0,779 -chr17 16119834 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=1.077;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=8.87;ReadPosRankSum=-1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:312,0,1795 -chr17 16119927 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.039;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:265,0,405 -chr17 16122168 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.895;DP=35;FS=9.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:272,0,995 -chr17 16122265 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.370;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:393,0,555 -chr17 16122832 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,503 -chr17 16123458 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-0.298;DP=37;FS=5.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:519,0,1831 -chr17 16123464 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.590;DP=38;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:519,0,1822 -chr17 16124704 . TA T 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.250;DP=34;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:313,0,226 -chr17 16124964 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.652;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,567 -chr17 16464153 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.128;DP=35;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:273,0,978 -chr17 16574806 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:309,0,446 -chr17 16576384 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=1.109;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:284,0,143 -chr17 16633533 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.232;DP=56;FS=16.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:509,0,2990 -chr17 16634011 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.756;DP=93;FS=2.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:784,0,2298 -chr17 16645048 . T C 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.623;DP=78;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:646,0,1916 -chr17 16645313 . G T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=-1.583;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:281,0,1629 -chr17 16645494 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.224;DP=52;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:235,0,1506 -chr17 17855688 . C A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.121;DP=49;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:337,0,1502 -chr17 19252522 . GT G 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.712;DP=52;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:300,0,525 -chr17 19270386 . C T 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-0.483;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,43:68:99:1453,0,837 -chr17 19285214 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=3.240;DP=35;FS=9.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:234,0,921 -chr17 19311643 . C CA 1970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=1.857;DP=370;FS=18.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,116:361:99:2008,0,6678 -chr17 19315532 . TGGTAA T 8137.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.246;DP=363;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=22.42;ReadPosRankSum=-0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,202:317:99:8175,0,4152 -chr17 19326396 . CAGGTAACCTGATCTAATGCGTGGAAATGCTTTGATTTTTTAAAAATTCAGTATATTTGAAGATCACTTTTTTGTTTGGACTGTTGTAACCTCGCTTCTGTCTTT C 1865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.247;DP=270;FS=5.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,77:249:99:1903,0,9758 -chr17 19326399 . GTAACCTGATCTAATGCGTGGAAATGCTTTGATTTTTTAAAAATTC G 5527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.816;ClippingRankSum=0.034;DP=257;FS=5.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,165:248:99:5565,0,6096 -chr17 19326446 . GTATATTTGAAGATCACTTTTTTGTTTGGACTGTTGTAACCTCGCTTCTGTCTTTAGGAC G 5487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.421;ClippingRankSum=-0.115;DP=262;FS=8.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,165:253:99:5525,0,6098 -chr17 19327303 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=1.197;DP=20;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:253,0,507 -chr17 19439266 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=2.540;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:235,0,333 -chr17 19439850 . AT A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=-1.194;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:447,0,216 -chr17 20077661 . A T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.485;DP=22;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=12.17;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:296,0,120 -chr17 20078368 . AT A 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=1.678;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=11.81;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,515 -chr17 20078370 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,515 -chr17 20521603 . G GT 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=2.494;DP=151;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,31:140:99:341,0,2982 -chr17 20526020 . T A 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-0.537;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,44:90:99:1464,0,1517 -chr17 20759471 . GT G 3244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=-5.106;DP=272;FS=5.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,131:266:99:3282,0,3449 -chr17 20886372 . ACTGAAAATGCAAATATTATATATCATTGCACAATGTTCTGTAAAATAATTAAAGACCATAATTGTGAATATATATTGAGCAGACACACTTAC A 6568.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=-0.250;DP=152;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,146:149:99:6606,560,0 -chr17 20986038 . A AC 1382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.125;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=31.43;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:87:1420,87,0 -chr17 20987104 . AT A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.290;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:14:284,0,14 -chr17 21056606 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.460;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:396,0,399 -chr17 21087429 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,104 -chr17 21087812 . AT A 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-1.444;DP=15;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=32.38;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:523,0,99 -chr17 21157797 . AAC A 261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr17 21621383 . AT A 364.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.168;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=15.86;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:402,0,28 -chr17 21702891 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=1.427;DP=30;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:258,0,639 -chr17 21734102 . TGGTGAGTGTTGAGGAGCTGTCTTTACCCAAAAATGCTAAAACTGAGAAATGAGACCTGTTTGCAGATTTGGTTGACTACCAAAGATAATTAATTACGCATAACTGTCCTCCTCTCACACCA T 3370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=1.102;DP=92;FS=1.432;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=27.01;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,84:92:99:3408,376,0 -chr17 21735767 . A C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=2.790;DP=39;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:818,0,1097 -chr17 21735771 . C T 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=2.879;DP=34;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:818,0,1097 -chr17 21749730 . G A 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.377;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:636,0,600 -chr17 21812106 . A AT 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.171;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:333,0,461 -chr17 22376152 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-2.467;DP=69;FS=9.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.71;ReadPosRankSum=2.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:491,0,1901 -chr17 22377549 . T A 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=-7.162;DP=202;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.39;ReadPosRankSum=6.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,61:201:99:1319,0,15186 -chr17 22377561 . G T 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-7.621;DP=195;FS=0.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=6.62;ReadPosRankSum=6.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,61:194:99:1319,0,15186 -chr17 22377627 . T C 1471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.657;ClippingRankSum=0.886;DP=175;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=8.41;ReadPosRankSum=6.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,50:174:99:1500,0,16696 -chr17 22377633 . C A 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.306;DP=183;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=7.97;ReadPosRankSum=4.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,58:182:99:1487,0,16696 -chr17 22377699 . C T 3063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.524;DP=248;FS=9.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=12.35;ReadPosRankSum=3.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,95:246:99:3092,0,4866 -chr17 22377764 . C T 5348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.438;DP=267;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=20.03;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,119:267:99:5377,0,10416 -chr17 22377798 . A G 5348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-0.237;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,112:256:99:5377,0,10427 -chr17 22414862 . G A 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=-1.220;DP=170;FS=2.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,30:170:99:439,0,9153 -chr17 22417576 . G A 1469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.901;DP=52;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=28.26;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,40:52:99:1498,0,274 -chr17 22460365 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=-0.242;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:247,0,1951 -chr17 22483612 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=-0.511;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:99:236,0,3328 -chr17 22571306 . C CT 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=17;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:85:295,0,85 -chr17 22947224 . CT C 301.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=1.240;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:339,14,0 -chr17 23022874 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:320,0,149 -chr17 23050281 . A ACAGTTGGTCG 517.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=4.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:15:555,15,0 -chr17 23075921 . G A 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.536;DP=47;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=19.27;ReadPosRankSum=-2.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:934,0,590 -chr17 23084324 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-0.690;DP=58;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:291,0,1675 -chr17 23405588 . GTA G 986.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.273;DP=34;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=29.02;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:1024,0,234 -chr17 23763073 . C CT 467.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.286;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:35:541,35,0 -chr17 23794682 . C CT 451.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=-0.477;DP=168;FS=34.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,41:151:99:489,0,2906 -chr17 23796523 . A C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-1.535;DP=183;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,33:176:99:543,0,5563 -chr17 23811323 . TGGTGAGAACACTGATATCTTATGTACCGTAATGCATATCTGATAAACCATAATCATTAAGCATAACATACAATGTGAAATGTCCTGCA T 7693.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=1.234;DP=203;FS=2.316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,199:202:99:7731,571,0 -chr17 24050661 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-0.808;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:277,0,600 -chr17 24050841 . G T 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=2.503;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=25.11;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1083,0,379 -chr17 24298186 . C T 1920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-0.355;DP=93;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,59:93:99:1949,0,1113 -chr17 24433999 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.536;DP=227;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,45:227:99:776,0,7215 -chr17 24436389 . C CT 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.661;DP=207;FS=3.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,49:197:99:494,0,4108 -chr17 24438470 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.231;DP=184;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,27:184:99:229,0,6154 -chr17 24440255 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.685;DP=172;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,31:172:99:436,0,5414 -chr17 24444047 . C T 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.005;ClippingRankSum=1.229;DP=528;FS=4.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=2.44;ReadPosRankSum=2.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:429,92:521:99:1316,0,17200 -chr17 24456176 . TGTACGTTCACACACAAGCACACTTTTAGCACCACATGCTGCTCTTTTCACACACACACTAACTGTGCACGTTGTGTGTGGGTTTAG T 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.188;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=32.03;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:966,0,1504 -chr17 24488130 . TAGGTAAGGATTAAACTAATGTAAAATATTGACTGTGGAATTAATCGTTTGCTTTAAATGATAATTATATATGTCCTTTTCA T 1303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.793;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=36.95;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,31:34:99:1341,0,388 -chr17 24493130 . CCG C 747.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.378;DP=41;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:785,0,725 -chr17 24493970 . A ATG 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=1.727;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:373,0,510 -chr17 24497000 . TA T 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:247,0,139 -chr17 24515837 . A G 1281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=4.008;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.719;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1310,0,1146 -chr17 24554119 . ATG A 1485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.794;DP=98;FS=5.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,48:89:99:1523,0,1374 -chr17 24651587 . G C 6148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.364;DP=220;FS=3.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,164:218:99:6177,0,1175 -chr17 24719001 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:97:269,0,97 -chr17 25019915 . AT A 266.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=20.52;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:23:304,0,23 -chr17 25106172 . A AT 650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.148;DP=434;FS=19.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=1.50;ReadPosRankSum=-1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,83:379:99:688,0,7464 -chr17 25180683 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.084;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:318,0,1440 -chr17 25182991 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.782;DP=52;FS=4.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:301,0,1491 -chr17 25236872 . A G 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.175;DP=52;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=30.13;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1595,0,881 -chr17 25236875 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.232;DP=53;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,39:53:99:1595,0,882 -chr17 25236970 . T C 2064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.224;DP=66;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=31.28;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,57:66:49:2093,0,49 -chr17 25271826 . CT C 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=2.106;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:428,0,410 -chr17 25321815 . GT G 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=4.098;DP=73;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:507,0,1944 -chr17 25436339 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=1.843;DP=70;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:233,0,2194 -chr17 25444450 . CGGTAAGCAAACTTCCTCTGAATCCTTTTAAAAAATTTCTATAGCAAAAATATCTCTCTTTTCCTCTGTCTCTCA C 2871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=-0.220;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=36.46;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:2909,259,0 -chr17 25457723 . CCACCTAGATCAACACATACACAGTCAATTATTTCATAGAAGCTGAACAAAGAAAATGAACTGACATAAACA C 3352.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=2.914;DP=83;FS=2.139;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.223;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,79:82:99:3390,246,0 -chr17 25716124 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.990;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=21.85;ReadPosRankSum=1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:815,0,388 -chr17 25728714 . GTT G,GT 790.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,21,16:37:99:1188,446,389,611,0,513 -chr17 25729033 . A AT 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-1.861;DP=27;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:540,0,149 -chr17 25751065 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr17 26319868 . T TC 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=26.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:278,0,197 -chr17 26322070 . AC A 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.135;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=24.61;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:431,0,180 -chr17 26395159 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,171 -chr17 26431289 . C G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr17 26554824 . GA G 1047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1086,111,0 -chr17 26627333 . G C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr17 26629827 . C CT 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr17 26632278 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=-2.053;DP=160;FS=6.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,27:159:99:380,0,5075 -chr17 26645449 . A G 5553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.709;DP=175;FS=1.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=31.74;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,152:174:83:5582,0,83 -chr17 26654303 . A AG 2686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=-2.414;DP=165;FS=7.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=16.28;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,104:140:99:2724,0,1483 -chr17 26660071 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.988;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:372,0,330 -chr17 26770182 . T TA 749.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.728;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=22.05;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:32:787,0,32 -chr17 26773448 . TCCTGTTTTAAAATAATCAGAATGACAGTAAAACACAAGCAGAAATATTTTCCCAGTGGATATAATCAATAAAGAAAGAAACATGCAAATCCTA T 554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=1.815;DP=78;FS=2.117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=7.11;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,68:71:99:592,202,0 -chr17 27084320 . AC A 1920.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:1958,194,0 -chr17 27084796 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.302;DP=63;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:415,0,1752 -chr17 27085844 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,388 -chr17 27085936 . AT A 338.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.829;DP=19;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=17.83;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:16:376,0,16 -chr17 27113116 . G GA 789.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.102;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:827,0,223 -chr17 27113393 . T TA 1315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=2.695;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=12.30;ReadPosRankSum=-3.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,70:81:91:1563,0,91 -chr17 27113567 . CT C 2871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.615;DP=123;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=23.35;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,102:122:95:2909,0,95 -chr17 27114462 . TCTTCGGGAAAAAAAGACATGCAAAGATTTATTTTATTAAAGTTAAATATGAATTGGTTAATATAGTGAAGGCATTATAATTCAGGTATGTAGCACTCAC T 11841.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=1.129;DP=337;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,302:329:99:11879,0,3454 -chr17 27267764 . G GAA 1311.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-2.427;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=19.01;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:57:1969,57,0 -chr17 27303716 . C G 333.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-1.396;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=27.81;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:27:362,0,27 -chr17 27579833 . T G 1531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1560,117,0 -chr17 27867277 . C CA 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-2.093;DP=198;FS=25.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,52:177:99:592,0,3854 -chr17 27867553 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.859;DP=266;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,45:266:99:594,0,8627 -chr17 27868235 . G GT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-1.110;DP=255;FS=5.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,47:238:99:245,0,4801 -chr17 27868995 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=-1.556;DP=242;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,38:242:99:405,0,8176 -chr17 28687549 . G A 985.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.899;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=32.84;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:4:1012,4,0 -chr17 28688941 . C T 968.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:997,72,0 -chr17 28691955 . G A 607.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-1.244;DP=22;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=27.63;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:20:636,0,20 -chr17 28694436 . A T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-1.826;DP=16;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=34.61;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:582,0,100 -chr17 28698199 . C T 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 -chr17 28701462 . C T 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.377;DP=33;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=31.75;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:99:1076,0,234 -chr17 28739703 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.164;DP=116;FS=8.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,20:116:99:281,0,3715 -chr17 28739744 . G A 4072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.027;DP=144;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,114:144:99:4101,0,540 -chr17 28742683 . C A 3874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.015;DP=132;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,108:132:99:3903,0,355 -chr17 28748041 . G T 3428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.697;DP=130;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=26.38;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,94:129:99:3457,0,831 -chr17 28754188 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.390;DP=220;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,31:219:99:255,0,7308 -chr17 28763612 . TCTGTCAAAAGAAGAAAGTGAACAGTTTATTATACTGTTCTCAGGAAAGATGTCACATTTACTATTATTAAAATGACACTTAC T 4607.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.433;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=27.45;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:4645,328,0 -chr17 28763763 . TCTGTGTGAAAGAGCCAAAGACAGTCAATCACGTTAATTCATGAATACTGATTACAAATGAGCATGTCATTTCGCCAATAATATGAACAACAAAC T 579.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=2.679;DP=162;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,141:146:99:617,234,0 -chr17 28789259 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.053;DP=164;FS=6.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.338;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,30:164:99:444,0,5123 -chr17 28795736 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.231;DP=163;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,34:163:99:592,0,4969 -chr17 28858890 . C T 7595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-1.729;DP=237;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=32.05;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,197:237:99:7624,0,549 -chr17 28862668 . GCTGTTGCACACACAACAGTTGTTAGCTTTGTTAGTAAAGGTCATTTCTAATTTTAAAAAATGGGCTTGAATGTAC G 6281.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=1.231;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=30.21;ReadPosRankSum=-1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,160:164:99:6319,465,0 -chr17 28888416 . TG T 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 28888419 . A T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr17 29176738 . G GA,GAA 453.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,19:26:99:825,507,439,180,0,126 -chr17 29253637 . G A 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-0.249;DP=26;FS=5.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=30.03;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:47:809,0,47 -chr17 29253758 . GAC G 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:314,0,223 -chr17 29255016 . G T 317.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=31.70;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:345,0,12 -chr17 29310920 . G C 5123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.332;DP=155;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=33.06;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,133:154:99:5152,0,176 -chr17 29311405 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=1.971;DP=33;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=20.60;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:708,0,475 -chr17 29329131 . C T 6756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-0.779;DP=215;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.433;QD=31.43;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,178:213:99:6785,0,428 -chr17 29339616 . T A 1158.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1187,84,0 -chr17 29340269 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=1.211;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=34.84;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:594,0,202 -chr17 29365780 . C T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.502;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=32.77;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:99:782,0,100 -chr17 29367803 . G A 706.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=-0.096;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:26:735,0,26 -chr17 29370871 . A G 902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:931,66,0 -chr17 29400228 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=-0.394;DP=18;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:481,0,160 -chr17 29428139 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.80;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:42:334,0,42 -chr17 29428182 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=24.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:252,0,52 -chr17 29428224 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=28.14;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:394,0,92 -chr17 29428524 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:290,0,49 -chr17 29428858 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:274,0,56 -chr17 29431653 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:281,0,60 -chr17 29854642 . A T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.420;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:271,0,538 -chr17 29863491 . G T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-0.166;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=11.52;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:466,0,748 -chr17 30454620 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=-1.083;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:339,0,422 -chr17 30457603 . AGCAGGTAATCTAACCTCTAATGCTTCTCCTTTAACCATAGACTCCAGTTTGCTTGGCTTTTTCTGGAACGGTCTCTTGCATATTCATTCTTCTG A 2035.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=1.904;DP=64;FS=2.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=31.81;ReadPosRankSum=-1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,53:64:99:2073,0,2544 -chr17 30473888 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.221;DP=84;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:678,0,2196 -chr17 30545781 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=-0.302;DP=91;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,20:91:99:381,0,2778 -chr17 30551258 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=1.375;DP=55;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:462,0,1450 -chr17 30770375 . T TTTTATGG 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=327;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,0:130:99:783,0,5220 -chr17 30773431 . G C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=5.928;DP=375;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,59:375:99:280,0,14592 -chr17 30782818 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=1.392;DP=288;FS=2.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.465;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,51:288:99:704,0,9211 -chr17 30857076 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.137;DP=33;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:282,0,864 -chr17 30908885 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.481;DP=175;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,31:173:99:446,0,5398 -chr17 30917151 . ACTGTGGTGGAAGAGAGCGAAACAATAATTATTTACAATCATTTCAGATCAGCATCAATCATTTGAAACAACAATTCAC A 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=261;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,1:6:99:373,0,2914 -chr17 31240093 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr17 31338278 . TCTGAAGTAGGGAAGATATTGAGTGATTACATGAAGGATATTGGGTGATGATTTGGCTGAGCTGATCAATATGATTTCTTAC T 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=2.489;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=22.04;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:412,0,3115 -chr17 31687953 . AACCTGGAACGAAAGGAAATTTGTTTGGTACTAAAGTTTGATCATAAAGCTGCAATAACTAAATGTCTAGCAATGACTT A 3322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.817;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=34.84;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,84:86:99:3360,241,0 -chr17 31698364 . C A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-0.825;DP=115;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,33:115:99:759,0,2913 -chr17 31775420 . G A 609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:638,48,0 -chr17 31865018 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=1.350;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=33.11;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:29:558,0,29 -chr17 31865115 . T A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.520;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:61:612,0,61 -chr17 31865209 . C G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr17 31865317 . A C,T 1676.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,18,31:49:99:1856,1151,1132,714,0,629 -chr17 31865515 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.240;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:268,0,907 -chr17 31865527 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.317;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:235,0,765 -chr17 31871525 . A G 1352.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1381,96,0 -chr17 31900390 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.577;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=13.51;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:609,0,851 -chr17 31907215 . C CA 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-1.059;DP=65;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:307,0,920 -chr17 32563023 . C T 1358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.410;DP=125;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=10.87;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,42:125:99:1387,0,2893 -chr17 32596758 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.131;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:244,0,941 -chr17 32614424 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.490;DP=108;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:375,0,3253 -chr17 32706206 . A ATT 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.407;ClippingRankSum=5.302;DP=114;FS=5.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=2.13;ReadPosRankSum=-5.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:995,0,1805 -chr17 32744340 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=1.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:407,0,409 -chr17 32748599 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.735;DP=37;FS=8.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:280,0,994 -chr17 32755290 . AAAAAGGTGCCCATGTTTACAGTCTCAACCTAAATCTCATGCATACTACCAAGGTCATCCACTAGAAATCTAACTTGTATCTTTCT A 565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.954;DP=33;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:603,0,1592 -chr17 32812911 . G GA 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.84;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:46:252,0,46 -chr17 32816332 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=-0.226;DP=47;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:319,0,1353 -chr17 32818091 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=2.355;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:360,0,304 -chr17 32833493 . TGGTTGGTTTTTCTATTCTTGATTTCTGTTAATCCACTGTTTACGTTCAAGACTTAAATGAGGCTTGTTTTTTA T 12873.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=2.209;DP=332;FS=7.272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,315:324:99:12911,936,0 -chr17 32835881 . C A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=2.907;DP=329;FS=47.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,75:326:99:1523,0,10070 -chr17 32841433 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.183;DP=82;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:521,0,2254 -chr17 32928219 . T TA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-2.982;DP=42;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.806;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:375,0,804 -chr17 32928427 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.648;DP=57;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:441,0,1728 -chr17 32941845 . A T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.027;DP=172;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,37:170:99:690,0,5143 -chr17 32952766 . G T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=-0.673;DP=141;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:696,0,4102 -chr17 32984977 . A T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.846;DP=138;FS=7.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,25:138:99:342,0,4322 -chr17 33068360 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=-2.542;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:281,0,1800 -chr17 33390179 . TGTAAGTCTCTTCGAAACACCATTAATAATAATATTGGGTCTTTGCCACTGTTTGGCTAAGCTGTCCGAATTCTTTTTCAG T 1001.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.144;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:99:1039,0,712 -chr17 33578841 . GA G 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.104;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:246,0,390 -chr17 33600276 . AAACCTACTTAAAAAGCACACACTTTAGGCACTGAACGCATTTGGTAAATTAAATAACCTAAAACAGAACTATAGGAAATAAAT A 486.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.948;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=27.04;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:524,0,984 -chr17 33600393 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-1.975;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:321,0,358 -chr17 33628343 . A C 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-1.897;DP=285;FS=1.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,58:274:99:1027,0,8522 -chr17 33628542 . G T 1386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.378;DP=241;FS=4.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,63:240:99:1415,0,6386 -chr17 33646761 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:90:258,0,90 -chr17 33917412 . CCCTAAAGAAACAAACAGCTTCATAAATGTTCATCTCTAAAGCAACGTGATTAAAGCTGCTATTAGACTCA C 580.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=3.318;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:618,0,1493 -chr17 34077146 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.241;DP=121;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,23:121:99:341,0,3790 -chr17 34407044 . CT C 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.131;DP=39;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:512,0,230 -chr17 34411590 . C A 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.941;DP=299;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,68:299:99:1371,0,8697 -chr17 34413577 . AAGGTGGGACTTTGTTTAAAAATGGTTGCCTGTTTTTCATTCCTGTTTTTGACTCATAACGTCCATGTGTCTACATTGATTGTC A 13045.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=1.604;DP=317;FS=2.272;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=27.34;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,314:317:99:13083,1009,0 -chr17 34421078 . T C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.474;ClippingRankSum=-1.237;DP=163;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=3.05;ReadPosRankSum=4.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,37:159:99:526,0,6292 -chr17 34421144 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=1.255;DP=183;FS=6.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,33:179:99:252,0,7543 -chr17 34974350 . GT G 4525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=-0.151;DP=330;FS=1.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=13.71;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,186:288:99:4749,0,1158 -chr17 34977184 . G A 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.838;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.118;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:619,0,700 -chr17 34979275 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=1.331;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,346 -chr17 34979655 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,179 -chr17 35014921 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:62:291,0,62 -chr17 35264333 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.466;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=10.53;ReadPosRankSum=-1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:544,0,1006 -chr17 35370393 . C A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.107;DP=46;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:324,0,1151 -chr17 35396243 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.746;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:384,0,3931 -chr17 35396443 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.264;DP=102;FS=1.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:459,0,2973 -chr17 35411116 . A T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=-0.119;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=7.10;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:504,0,1741 -chr17 35411135 . GAGGTACTTTCGTGACTGCAATGATGTGTGTAAAAGGATTCATAAAGTCGCAAATGATGATAATATCGTTCTCTGAATTATT G 2661.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=2.732;DP=65;FS=2.247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2699,214,0 -chr17 35414856 . G GA 977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.591;DP=110;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,43:104:99:1015,0,1462 -chr17 35415122 . A T 1493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.626;DP=70;FS=11.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,44:70:99:1522,0,949 -chr17 35415252 . T A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-3.376;DP=63;FS=11.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=8.54;ReadPosRankSum=3.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:566,0,1084 -chr17 35415945 . T C 1511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1540,117,0 -chr17 35416039 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.914;DP=46;FS=4.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:432,0,1167 -chr17 35416059 . G T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=1.331;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:347,0,1673 -chr17 35442793 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.031;DP=99;FS=6.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:394,0,3096 -chr17 35442848 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=-0.645;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=5.03;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:431,0,2304 -chr17 35443220 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=1.310;DP=139;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,26:139:99:449,0,4360 -chr17 36055725 . A C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.745;DP=147;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,31:145:99:531,0,4317 -chr17 36055788 . GTT G 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.184;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:513,0,297 -chr17 36056102 . C CAA 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,19:19:98:613,0,98 -chr17 36057779 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-0.889;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,61:310:99:988,0,9312 -chr17 36853168 . G A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 -chr17 37035338 . TG T 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-1.898;DP=18;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:267,0,118 -chr17 37067421 . C T 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-1.328;DP=145;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=9.25;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,46:145:99:1369,0,7581 -chr17 37077335 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.797;DP=198;FS=11.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,28:196:99:357,0,12869 -chr17 37078616 . G T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.065;DP=120;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:580,0,3450 -chr17 37108150 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.142;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:386,0,691 -chr17 37112546 . TCTGAAAGAGGAAGAAAACACAGAACTGGAATACCAAAGTGAGAACAGATAACGAAATTAGTTCTGAGTATGATTTAGAGTGACAAAC T 1928.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=1.655;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:99:1966,171,0 -chr17 37413807 . T G 2472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=1.765;DP=184;FS=5.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=13.44;ReadPosRankSum=1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,77:183:99:2501,0,3467 -chr17 37450829 . G T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=21.78;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:355,0,212 -chr17 37462488 . CGACCTGCAAGAACAGCACACCTGAGATCCAAACACACTCTACATTGGCTCAAACTGTCCAAAATGACCATCA C 2497.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.162;DP=71;FS=2.607;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:2535,199,0 -chr17 37531798 . AG A 535.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.360;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=11.91;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:573,0,327 -chr17 37553396 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-2.223;DP=16;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,231 -chr17 37738389 . A G 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.437;DP=80;FS=9.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,32:80:99:1089,0,1506 -chr17 37785661 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:308,0,215 -chr17 37817583 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.268;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,406 -chr17 37958603 . C G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=1.439;DP=244;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,41:243:99:544,0,7733 -chr17 37961259 . T C 4589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.672;DP=243;FS=7.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,146:243:99:4618,0,3042 -chr17 38140837 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.083;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=16.45;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:604,0,961 -chr17 38146836 . C A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.732;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=21.53;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:674,0,376 -chr17 38164063 . C T 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr17 38165580 . A T 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:600,45,0 -chr17 38166868 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:395,27,0 -chr17 38192974 . CT C 516.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-1.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:24:554,0,24 -chr17 38372056 . C A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.569;DP=27;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:309,0,540 -chr17 38399828 . T C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.055;DP=42;FS=12.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:771,0,583 -chr17 38399990 . T C 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:631,45,0 -chr17 38423433 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.749;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:265,0,936 -chr17 38750259 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.383;DP=76;FS=6.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:485,0,2085 -chr17 38753796 . C T 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 -chr17 38753851 . G C 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:631,45,0 -chr17 38754257 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.564;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,23:125:99:341,0,3893 -chr17 38766127 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=2.846;DP=113;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,21:113:99:342,0,3597 -chr17 38823666 . GGT G 587.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:625,48,0 -chr17 38873222 . CACAGGTAAGAGAATTAACTAGATCAATACATGTTGCCTCTACAGCCTTGCTTTACTTCTTGATGTGTTTGTGTAATGTTTGCCCCCCTGTT C 3110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.088;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=27.61;ReadPosRankSum=1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,68:70:99:3148,248,0 -chr17 38917205 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-1.326;DP=36;FS=1.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:464,0,1804 -chr17 38917213 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=-1.384;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:419,0,1893 -chr17 39091350 . A T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.173;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:345,0,1006 -chr17 39873257 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-0.458;DP=259;FS=5.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,42:259:99:314,0,8447 -chr17 39888439 . C T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.377;DP=248;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,60:248:99:1243,0,7031 -chr17 39896190 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.767;DP=237;FS=24.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,50:237:99:915,0,13360 -chr17 40275560 . C T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.649;DP=91;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:629,0,2495 -chr17 40275629 . C T 3951.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:3980,283,0 -chr17 40275844 . T G 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 -chr17 40275859 . T A 590.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:619,45,0 -chr17 40275891 . C T 731.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:760,54,0 -chr17 40276022 . T A 2131.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2160,147,0 -chr17 40276136 . A T 3268.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3297,238,0 -chr17 40276214 . T G 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-1.390;DP=78;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:601,0,1991 -chr17 40576331 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-2.670;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,9:93:99:710,0,6568 -chr17 40576342 . C A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=-3.538;DP=183;FS=2.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=3.76;ReadPosRankSum=-3.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,18:109:99:717,0,6568 -chr17 40576623 . A C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=1.759;DP=156;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,27:121:99:557,0,4705 -chr17 40576735 . AT A 874.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=-1.547;DP=122;FS=7.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,39:90:99:912,0,1339 -chr17 40576880 . C T 941.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:970,72,0 -chr17 40581087 . A G 1392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.234;DP=45;FS=15.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=30.95;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1421,0,119 -chr17 40581455 . G A 2079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=2.104;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=33.54;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2108,147,0 -chr17 40583214 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.922;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:657,0,1329 -chr17 41018314 . T C 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 -chr17 41018660 . T C 309.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=34.44;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:338,0,13 -chr17 41018995 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:240,0,60 -chr17 41061763 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-2.007;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.365;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:283,0,216 -chr17 41487874 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:253,0,132 -chr17 41707747 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.697;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=8.25;ReadPosRankSum=-1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:284,0,788 -chr17 42973078 . GA G 1305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.971;DP=132;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=9.89;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,55:130:99:1343,0,2207 -chr17 42973154 . C T 4808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=-1.192;DP=161;FS=4.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=29.87;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,131:144:99:5050,0,754 -chr17 42973303 . C G 613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:642,48,0 -chr17 42973309 . T G 384.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:26:413,0,26 -chr17 42973791 . G A 1089.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.963;DP=31;FS=3.900;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:78:1118,78,0 -chr17 42973799 . A G 1375.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:96:1404,96,0 -chr17 42973853 . C G 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=1.364;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=29.99;ReadPosRankSum=-2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:95:928,0,95 -chr17 42973929 . C T 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:63:881,63,0 -chr17 42974132 . GA G 713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=21.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:70:751,70,0 -chr17 42974149 . T C 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.876;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=22.27;ReadPosRankSum=-2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:98:919,0,98 -chr17 42974298 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=6.926;DP=103;FS=37.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:917,0,7737 -chr17 42974313 . T A 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=6.655;DP=116;FS=33.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:920,0,7737 -chr17 42974343 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-3.288;DP=95;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:1024,0,2123 -chr17 42974715 . G T 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.955;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:1187,0,108 -chr17 42974932 . A T 1307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1336,96,0 -chr17 42975054 . T A 524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:553,42,0 -chr17 42975326 . A T 8832.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.463;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.911;QD=31.57;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,217:219:99:8861,638,0 -chr17 42975359 . CA C 3330.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-1.086;DP=184;FS=7.253;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=18.10;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,119:136:53:3368,53,0 -chr17 42975466 . T A 705.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=2.216;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=33.61;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:21:734,21,0 -chr17 42975746 . T G 1069.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1098,78,0 -chr17 42976041 . TA T 506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:544,52,0 -chr17 42976096 . C G 1992.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:99:2021,147,0 -chr17 42976311 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr17 42976312 . G T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr17 42976396 . T TA 5392.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:5430,373,0 -chr17 42977109 . G A 9048.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-1.734;DP=22;FS=13.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:99:9077,646,0 -chr17 42977444 . G T 6665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.483;DP=178;FS=2.581;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=29.10;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,157:161:99:6694,478,0 -chr17 42977470 . T C 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.602;DP=33;FS=6.702;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:35:982,35,0 -chr17 42977594 . C A 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr17 42977598 . A C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr17 42977987 . CT C 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=30.93;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:35:652,0,35 -chr17 42977995 . G T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.919;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=23.99;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:35:652,0,35 -chr17 42978398 . T C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.036;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=27.35;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:44:1040,0,44 -chr17 42978403 . A C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.433;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=31.94;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,23:24:77:1040,0,77 -chr17 42978667 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr17 42979163 . C A 429.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.290;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:457,0,9 -chr17 42979202 . C T 420.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.290;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=24.72;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:10:448,0,10 -chr17 42979477 . AT A 368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:406,31,0 -chr17 42979581 . A T 248.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=26;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.57;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:278,0,16 -chr17 42979731 . G C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=-2.997;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=2.16;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:342,0,1972 -chr17 42979802 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr17 42980138 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.284;DP=79;FS=11.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:465,0,730 -chr17 42980470 . T C 219.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:247,0,9 -chr17 43342252 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.177;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:322,0,289 -chr17 43393773 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.149;DP=52;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:229,0,1442 -chr17 43436221 . G T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.846;DP=83;FS=13.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,15:83:99:284,0,5209 -chr17 43436229 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.415;DP=80;FS=10.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:284,0,5209 -chr17 43467847 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=-1.012;DP=142;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,29:142:99:501,0,4223 -chr17 43656429 . C CA 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.799;DP=69;FS=7.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:292,0,1439 -chr17 43705963 . C G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.343;DP=52;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:398,0,1459 -chr17 43839579 . A G 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr17 43896705 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.433;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.325;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:343,0,2436 -chr17 43897452 . C CA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.795;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:279,0,412 -chr17 44015243 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=-0.040;DP=183;FS=3.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,31:163:99:517,0,5230 -chr17 44023973 . G A 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-3.358;DP=178;FS=3.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=4.58;ReadPosRankSum=2.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,40:178:99:843,0,5220 -chr17 44031632 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.152;DP=180;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,32:179:99:491,0,5573 -chr17 44125998 . G A 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.990;DP=45;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.02;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:704,0,774 -chr17 44127382 . A G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-2.626;DP=57;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1067,0,1006 -chr17 44127508 . A G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-2.208;DP=44;FS=2.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:610,0,853 -chr17 44237636 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:262,0,204 -chr17 44237655 . CA C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:98:250,0,98 -chr17 44237745 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.309;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,249 -chr17 44237917 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=-0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,213 -chr17 44294052 . G A 1309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-0.707;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1338,0,1772 -chr17 44460456 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.711;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:293,0,868 -chr17 44510002 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-1.669;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.966;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:279,0,1813 -chr17 44510059 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.477;DP=70;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:247,0,2099 -chr17 44510241 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.044;DP=66;FS=2.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:377,0,1843 -chr17 44510362 . T C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=2.452;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:431,0,2140 -chr17 44510444 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.093;DP=37;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:322,0,1187 -chr17 44510536 . G T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.242;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:442,0,894 -chr17 44515313 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.170;DP=49;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:840,0,913 -chr17 44520509 . G A 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.538;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:915,0,2059 -chr17 44520613 . T A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.461;DP=61;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:317,0,1718 -chr17 44522637 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.520;DP=58;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=7.82;ReadPosRankSum=2.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:482,0,2013 -chr17 44537671 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.244;DP=14;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.13;ReadPosRankSum=-2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,398 -chr17 44537674 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.788;DP=13;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.44;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,398 -chr17 44585823 . T A 380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:409,30,0 -chr17 45186967 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.620;DP=88;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:465,0,2435 -chr17 45239794 . GT G 4164.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=-0.648;DP=257;FS=3.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,165:228:99:4291,0,531 -chr17 45317370 . TCTAAACACATGAAACATAAAAATCATCACATTCATCATCTAAACAAACACTGCGCGTTCATGAGCTCAAAACCCTTAC T 1101.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.883;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=34.43;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:1139,0,683 -chr17 45378511 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:400,27,0 -chr17 45382217 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr17 45515644 . TTGTGTG T 216.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:254,22,0 -chr17 45515893 . AC A 622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=-0.914;DP=28;FS=2.764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:47:660,47,0 -chr17 45523444 . A G 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.178;DP=69;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=28.49;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,53:69:99:1994,0,331 -chr17 45528053 . A T 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=-0.217;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=27.84;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,44:63:99:1782,0,1048 -chr17 45528055 . C T 1753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.089;DP=60;FS=1.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=29.23;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,42:60:99:1782,0,1074 -chr17 45530965 . A AT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-1.815;DP=66;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:294,0,1146 -chr17 45533337 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.514;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=26.70;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:1043,0,269 -chr17 45545966 . A T 205.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.41;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:234,0,17 -chr17 45616639 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:395,0,134 -chr17 45619355 . GA G 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.445;DP=38;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=1.793;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:510,0,377 -chr17 45727280 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr17 45763177 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.186;DP=12;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:234,0,392 -chr17 45763183 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-0.467;DP=13;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,392 -chr17 45764391 . C T 789.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.578;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:818,60,0 -chr17 45814063 . G A 715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:744,54,0 -chr17 45900104 . GA G 829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.784;DP=88;FS=4.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:867,0,871 -chr17 45900918 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=5.567;DP=105;FS=9.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=2.50;ReadPosRankSum=-4.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,23:105:99:291,0,5024 -chr17 46054956 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-1.709;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:287,0,193 -chr17 46122637 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=3.583;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:495,0,1823 -chr17 46122638 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=3.623;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:495,0,1823 -chr17 46150485 . A T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=1.141;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=22.21;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:761,0,418 -chr17 46154591 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=2.503;DP=39;FS=13.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:467,0,927 -chr17 47174376 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=1.073;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:233,0,231 -chr17 47699094 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76:292,0,76 -chr17 47699114 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.893;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:416,0,197 -chr17 47699821 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,187 -chr17 47896207 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,169 -chr17 47932554 . T C 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:239,18,0 -chr17 48604312 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-1.447;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:264,0,344 -chr17 48612282 . TC T 249.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:287,27,0 -chr17 49082520 . G A 2286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-0.038;DP=298;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,88:298:99:2315,0,8121 -chr17 49084785 . TCACTG T 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=-0.865;DP=337;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,70:335:99:458,0,21855 -chr17 49084787 . ACTGAATGGAACAGACCATGGATAAACATTTAACCCATTCACTAGTAGTAGTGAAGTTCCACACACAAAACAGAGATCACTCTTAC A 9882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.933;DP=335;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=29.50;ReadPosRankSum=2.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,252:327:99:9920,0,2623 -chr17 49084792 . ATGGAACAGACCATGGATAAACATTTAACCCATTCACTAGTAGTAGTGAAGTTCCACACACAAAACAGAGATCACTCTTAC A 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.170;DP=329;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=1.24;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,70:327:99:446,0,21855 -chr17 49167483 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=1.943;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.040;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,43:120:99:1570,0,5397 -chr17 49167489 . C T 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=2.299;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=12.85;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:99:1570,0,5402 -chr17 49167771 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.259;DP=128;FS=4.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,24:128:99:377,0,3951 -chr17 49174607 . G C 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.137;DP=146;FS=2.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,34:146:99:613,0,3711 -chr17 49175913 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-1.706;DP=85;FS=2.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:533,0,2389 -chr17 49176217 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=2.268;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=5.51;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:243,0,1268 -chr17 49261247 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.542;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:373,0,1111 -chr17 49373639 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.376;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:380,0,1691 -chr17 49373650 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.259;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:382,0,1722 -chr17 49373842 . T TCA 883.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.897;DP=80;FS=17.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,35:61:99:921,0,741 -chr17 49373945 . CT C 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-1.752;DP=30;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:250,0,383 -chr17 49416912 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:240,0,199 -chr17 49434588 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:359,0,56 -chr17 49455944 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,518 -chr17 49456372 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,329 -chr17 49469544 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-1.602;DP=25;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:231,0,1509 -chr17 49471200 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.627;DP=161;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,29:161:99:415,0,5189 -chr17 49482078 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.252;DP=111;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:344,0,3494 -chr17 49482583 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.214;DP=108;FS=5.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,33:108:99:865,0,2831 -chr17 49495412 . CCCTGAAATACATATAACGATCTGTAAGTCTGGACGCGTGTCAAGTTTAATAAGTTATCATGCATTTATTGCAGACAGCGCTCATTTA C 1014.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-2.889;DP=75;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1052,0,2251 -chr17 49495415 . TGAAATACATATAACGATC T 1129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=2.366;DP=74;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.129;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1167,0,2076 -chr17 49495435 . GTAAGTCTGGACGCGTGTCAAGTTTAATAAGTTATCATGCATTTATTGCAGACAGCGCTCATTTACCTTT G 1129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=2.573;DP=73;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1167,0,2076 -chr17 49510625 . A G 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=1.123;DP=275;FS=24.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,64:274:99:1322,0,7456 -chr17 49515244 . G T 5395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.335;DP=279;FS=8.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=19.34;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,163:279:99:5424,0,4031 -chr17 49520980 . T C 2670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=-1.215;DP=236;FS=12.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,81:236:99:2699,0,5205 -chr17 49521001 . G C 3215.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-2.278;DP=248;FS=4.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,94:248:99:3244,0,5117 -chr17 49522176 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.865;DP=196;FS=3.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,29:195:99:299,0,6595 -chr17 49524834 . A T 3998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=-1.082;DP=232;FS=15.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=17.24;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,122:232:99:4027,0,3955 -chr17 49530975 . G T 5019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.960;DP=241;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.202;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,164:240:99:5048,0,1989 -chr17 49536604 . C G 2064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.813;DP=286;FS=0.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.823;QD=7.22;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,86:285:99:2093,0,7506 -chr17 49536706 . TCTGCGTTAAACAAGATGTTACCTTCTAGCACAAGAATCAAAATAGAAGCCAAAATGTGAACTATATGAAGTATAATACTTCCAAGGAAAAAAAATAAACGTAAACAGAGAATCAAATTAC T 12356.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.631;DP=280;FS=4.609;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=24.96;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,276:280:99:12394,1081,0 -chr17 49571583 . G A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-1.897;DP=57;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:555,0,3344 -chr17 49571590 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-1.725;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.512;QD=8.50;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:555,0,3344 -chr17 49573363 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.088;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:325,0,308 -chr17 49576062 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=1.785;DP=49;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:241,0,1524 -chr17 49806133 . A T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.695;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:403,0,937 -chr17 49806229 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=-2.381;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.73;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:257,0,952 -chr17 49807365 . A T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.860;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:475,0,827 -chr17 50005044 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=1.293;DP=286;FS=6.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=1.00;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,41:284:99:314,0,9528 -chr17 50029991 . A T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=1.204;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:588,0,732 -chr17 50045444 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=1.872;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:728,0,875 -chr17 50045537 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.521;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=15.45;ReadPosRankSum=1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,881 -chr17 50053214 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.824;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:230,0,1435 -chr17 50053664 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.493;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:472,0,120 -chr17 50150939 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:319,0,137 -chr17 50156088 . A C 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=2.080;DP=43;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=12.76;ReadPosRankSum=-2.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:577,0,882 -chr17 50300005 . C T 1799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-0.778;DP=236;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,70:236:99:1828,0,7312 -chr17 50300348 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.761;DP=252;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,37:250:99:287,0,8113 -chr17 50300892 . CA C 1309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.646;DP=292;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,68:286:99:1347,0,7960 -chr17 50387973 . A G 2195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.470;DP=292;FS=5.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,89:292:99:2224,0,7672 -chr17 50388524 . G A 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.245;ClippingRankSum=1.003;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,80:270:99:1710,0,6877 -chr17 50397828 . C A 3857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=1.401;DP=211;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,116:210:99:3886,0,3466 -chr17 50467244 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.941;DP=130;FS=9.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,27:130:99:515,0,4128 -chr17 50467478 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-1.747;DP=111;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:493,0,5126 -chr17 50471236 . A C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.525;DP=137;FS=3.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=5.79;ReadPosRankSum=-2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:822,0,3935 -chr17 50510770 . G T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-1.362;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:452,0,1764 -chr17 50511207 . G GT 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.226;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:353,0,200 -chr17 50511479 . G A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.542;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:696,0,721 -chr17 50512341 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-1.913;DP=48;FS=6.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:384,0,1815 -chr17 50543858 . A C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=29.98;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:358,0,52 -chr17 50613649 . A T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=1.053;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=11.38;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:381,0,716 -chr17 50641251 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.241;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:250,0,1624 -chr17 50641642 . A G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-2.277;DP=43;FS=8.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:722,0,756 -chr17 50724532 . T C 599.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:45:628,45,0 -chr17 50724674 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:423,0,332 -chr17 50815424 . CT C 724.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.693;DP=99;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:762,0,980 -chr17 50937437 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,150 -chr17 50947105 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-3.421;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,898 -chr17 51008759 . C T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-1.054;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:31:655,0,31 -chr17 51104426 . A G 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.016;DP=62;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=25.85;ReadPosRankSum=2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,44:62:99:1631,0,421 -chr17 51317873 . C CAT 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.377;DP=35;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:474,0,570 -chr17 51321777 . A AC 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=2.122;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=14.79;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:333,0,912 -chr17 51322225 . A G 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.536;DP=64;FS=2.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:1036,0,1435 -chr17 51323869 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:352,0,366 -chr17 51324091 . A AT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.960;DP=56;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:274,0,2091 -chr17 51482111 . A C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.159;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:529,0,398 -chr17 51542105 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.472;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:264,0,494 -chr17 51546691 . TCC T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-1.312;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,7:66:99:273,0,5333 -chr17 51546694 . TCCTCTGTTGTCGCTGTGGTGTTCTTCTC T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-2.263;DP=83;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,12:82:99:274,0,5333 -chr17 51577377 . G C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=1.320;DP=77;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=4.88;ReadPosRankSum=2.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:404,0,4723 -chr17 51577383 . A C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=1.333;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:404,0,4723 -chr17 51611647 . C T 1904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-1.017;DP=88;FS=4.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,58:88:99:1933,0,961 -chr17 51613893 . C T 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.093;DP=96;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=7.64;ReadPosRankSum=2.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:762,0,5309 -chr17 51671434 . G T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.395;DP=80;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,26:80:99:605,0,2348 -chr17 51731199 . G C 1608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.982;DP=127;FS=0.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,48:127:99:1637,0,2619 -chr17 51731384 . C A 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-1.785;DP=214;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,67:214:99:1752,0,6738 -chr17 51735528 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.721;DP=206;FS=2.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,32:206:99:323,0,6403 -chr17 51741475 . CACCTGCAAAAAAAAAAAACAAATCTGTAATGCGTGCAAAAAGAATAGCTGATGAGTATTCAGCATCATGTGAGCAA C 6525.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-0.062;DP=174;FS=10.128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=30.20;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,159:162:99:6563,472,0 -chr17 51749364 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.383;DP=137;FS=5.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=1.95;ReadPosRankSum=1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,23:137:99:296,0,4298 -chr17 51749405 . C A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=1.131;DP=217;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,38:217:99:525,0,8857 -chr17 51828460 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.446;DP=80;FS=8.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.192;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:613,0,2095 -chr17 51982275 . C T 233.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:262,0,21 -chr17 52112509 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.695;DP=57;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:266,0,1572 -chr17 52118365 . C A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.163;DP=40;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:684,0,653 -chr17 52120726 . C G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.959;DP=61;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:336,0,1558 -chr17 52130324 . C T 1195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=-0.824;DP=73;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=16.38;ReadPosRankSum=2.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:1224,0,1287 -chr17 52138154 . C A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=-1.757;DP=50;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=7.90;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:423,0,1359 -chr17 52140582 . G A 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.313;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:1032,0,2138 -chr17 52140667 . CG C 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,0:11:99:663,0,2456 -chr17 52140669 . AACAGTCATAAACAAAGCTGACAGAAACAGCTGATGGAGTATACACTAACCCGTGAATTATTTGGACGCAAGATGGCGCCG A 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=-0.343;DP=56;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=11.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:663,0,2224 -chr17 52141089 . A C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=-0.471;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.43;ReadPosRankSum=-2.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:314,0,943 -chr17 52142457 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-2.027;DP=40;FS=5.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=10.14;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:434,0,897 -chr17 52143167 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.712;DP=26;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:571,0,343 -chr17 52159921 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=1.339;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:464,0,588 -chr17 52212038 . C T 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.615;DP=75;FS=12.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,46:75:99:1566,0,957 -chr17 52234706 . C T 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.538;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:1427,0,1283 -chr17 52237350 . A G 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.185;DP=37;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=30.02;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:84:1139,0,84 -chr17 52237404 . A G 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.323;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:814,0,380 -chr17 52277725 . C T 5185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.152;ClippingRankSum=-0.459;DP=362;FS=0.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,150:361:99:5214,0,6925 -chr17 52283422 . C A 5045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.997;DP=329;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,145:328:99:5074,0,8478 -chr17 52310555 . TCAGGTTCGACTCCAATCAGAAAGTTAGAACTTGACTAGATTTTGCAACATGGTCGCAAATCCTGATGAGGTTATTTGTGATTCTTTGTG T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=1.422;DP=11;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:259,0,2238 -chr17 52323079 . G C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.60;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:399,0,236 -chr17 52323991 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.357;DP=30;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:390,0,953 -chr17 52327194 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:266,0,675 -chr17 52327224 . C A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-1.610;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:292,0,511 -chr17 52329666 . A G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.635;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=22.95;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:556,0,180 -chr17 52642631 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=-0.340;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:386,0,476 -chr17 52643341 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:234,0,65 -chr17 52644440 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-1.412;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=20.75;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:464,0,294 -chr17 53056197 . G A 6586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=-0.357;DP=404;FS=0.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,189:403:99:6615,0,6607 -chr17 53062394 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=-3.172;DP=224;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=5.42;ReadPosRankSum=4.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,51:223:99:1242,0,14461 -chr17 53062401 . G C 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-3.515;DP=237;FS=1.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=5.19;ReadPosRankSum=4.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,54:236:99:1258,0,14461 -chr17 53081136 . G A 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.702;DP=318;FS=6.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,67:316:99:1147,0,9213 -chr17 53109532 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-2.424;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=18.75;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:272,0,492 -chr17 53109533 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.75;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:272,0,492 -chr17 53109884 . T C 342.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:9:370,0,9 -chr17 53109894 . A T 342.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:370,0,9 -chr17 53159052 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=19.05;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,175 -chr17 53159948 . A C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.160;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:490,0,738 -chr17 53162679 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=1.248;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=8.32;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:386,0,225 -chr17 53164542 . C A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.191;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:476,0,1286 -chr17 53164546 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.095;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:271,0,1146 -chr17 53169506 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=-0.830;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:277,0,2671 -chr17 53169671 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-1.252;DP=72;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1085,0,1291 -chr17 53169857 . A C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=1.214;DP=85;FS=7.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,26:84:99:773,0,1802 -chr17 53179086 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.885;DP=60;FS=8.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.464;QD=9.73;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:612,0,1108 -chr17 53187192 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.465;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:475,0,451 -chr17 53399965 . C A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr17 53427799 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-0.253;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:465,0,291 -chr17 53428192 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-0.375;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:431,0,430 -chr17 53428242 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.318;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:431,0,420 -chr17 53428444 . G C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.190;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=15.76;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:438,0,445 -chr17 53432493 . C CT 1156.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-1.875;DP=139;FS=16.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,83:136:99:1587,0,1115 -chr17 53432715 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:236,0,407 -chr17 53473387 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,109 -chr17 53716964 . C T 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.019;DP=50;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:838,0,817 -chr17 53726203 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.328;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:393,0,409 -chr17 53762576 . G A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr17 53780871 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=1.911;DP=58;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:266,0,1661 -chr17 53781370 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.788;DP=22;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:415,0,390 -chr17 53799937 . T C 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:36:522,36,0 -chr17 53800209 . G C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr17 53800308 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.533;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=13.37;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:349,0,177 -chr17 53800548 . G A 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr17 53815893 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.713;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:240,0,1079 -chr17 53817220 . C T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=-1.471;DP=45;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:615,0,861 -chr17 53829341 . G A 1204.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:90:1233,90,0 -chr17 53829416 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.192;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=16.31;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:436,0,388 -chr17 53830441 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,171 -chr17 53844198 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:80:347,0,80 -chr17 53847624 . C A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=2.497;DP=33;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:69:857,0,69 -chr17 53847771 . G C 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.378;DP=38;FS=2.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=24.05;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:942,0,1045 -chr17 53847773 . G A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=-0.538;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:949,0,1045 -chr17 53862108 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.132;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:282,0,882 -chr17 53890539 . T C 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.381;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1097,0,790 -chr17 53894760 . G A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=-1.134;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=15.79;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,42:83:99:1339,0,1679 -chr17 53906239 . C G 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.406;DP=76;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,36:74:99:1279,0,1155 -chr17 53906461 . C T 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.144;DP=111;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1653,0,2212 -chr17 53906775 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.458;DP=29;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=15.85;ReadPosRankSum=2.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:488,0,1576 -chr17 53907203 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=1.638;DP=84;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:753,0,2299 -chr17 53907264 . T C 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.900;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:867,0,2080 -chr17 53908495 . A T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=1.345;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:439,0,2030 -chr17 53908920 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.770;DP=52;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:370,0,1483 -chr17 53909725 . T C 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=2.612;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:569,0,1032 -chr17 53909965 . A T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.298;DP=40;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=14.74;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:618,0,648 -chr17 53910379 . G A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=1.150;DP=43;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:284,0,1120 -chr17 53912963 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-0.427;DP=27;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:319,0,539 -chr17 53913668 . T C 381.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.78;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:409,0,8 -chr17 53916256 . T C 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr17 53919462 . CAGGTCTGTTCATTACTGCTCCTCTAGCCCGTCTGCTCCTGCTGGTCTGTGCTGGACTGAAGTGCTGTGAACTCCTGACTGAGAGCTCCGAGTCCTGCACCAGCCCAGCCGGAGCTCACTGATCAGCCATGAAGACACGAGCTCATCTTCATCACACACACACACACACACACACACACACTACTGTACACTGATGAGGGAAGACCCAAGCATTCCCAGTGTTCCCTCAGTGGACAGCACTGCAGTAAAGAGTGTGTTGATCATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT C 1023.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=2.537;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=29.25;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:1061,0,3536 -chr17 53919853 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.301;DP=30;FS=8.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:355,0,659 -chr17 53919916 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.057;DP=42;FS=2.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=5.18;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:246,0,1153 -chr17 53920300 . ACAGGTGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGGGGAAGCTCAGACTGATGCTGTGTCTCCAC A 1362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.318;DP=37;FS=4.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.323;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:64:1400,64,0 -chr17 53922183 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.429;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=24.70;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:794,0,209 -chr17 53922981 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:329,0,240 -chr17 53924811 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.025;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,15:78:99:267,0,2296 -chr17 53924839 . C T 2348.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=-0.627;DP=72;FS=1.578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.205;QD=32.62;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,65:72:47:2377,47,0 -chr17 53928887 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:234,0,63 -chr17 53959433 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr17 53966474 . A G 294.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:323,0,19 -chr17 53966605 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=23.71;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:289,0,230 -chr17 53966643 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:327,0,55 -chr18 1632 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=-1.642;DP=35;FS=8.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:249,0,971 -chr18 11556 . C A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.528;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:306,0,252 -chr18 15216 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.083;DP=47;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:239,0,1216 -chr18 75089 . TA T 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=-1.060;DP=67;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:602,0,733 -chr18 78019 . C A 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-1.240;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=13.37;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,39:97:99:1325,0,1927 -chr18 79336 . A T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.922;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:516,0,839 -chr18 117335 . G A 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.260;DP=72;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=13.80;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1022,0,1229 -chr18 129193 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=1.940;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=14.10;ReadPosRankSum=-1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:578,0,805 -chr18 129217 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=1.333;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.06;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:783,0,853 -chr18 137858 . C A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.811;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:658,0,1018 -chr18 142148 . T A 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr18 151108 . T C 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-1.384;DP=74;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,37:74:99:1311,0,1311 -chr18 161021 . AACCTGAGAAACACACACACACACACACACATTGTGAACATGATGTTTTCTGACACACTGAAGCAGAGGAGAGAGCAGACACTC A 3100.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.383;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=26.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,72:74:99:3138,233,0 -chr18 161139 . C T 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.641;DP=82;FS=7.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,39:82:99:1358,0,1351 -chr18 162737 . C T 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-1.858;DP=96;FS=6.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,34:96:99:1139,0,2187 -chr18 167751 . G A 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.180;DP=88;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=17.54;ReadPosRankSum=3.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,48:88:99:1572,0,1401 -chr18 169749 . CA C 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=3.136;DP=29;FS=12.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=10.09;ReadPosRankSum=-3.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:330,0,1380 -chr18 169751 . CACACACA C 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=3.522;DP=25;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=11.71;ReadPosRankSum=-3.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:330,0,1380 -chr18 228049 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:277,0,191 -chr18 230918 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.021;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=15.64;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:341,0,291 -chr18 234640 . C T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.716;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=16.87;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:686,0,682 -chr18 236373 . G T 1825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.999;DP=416;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,94:415:99:1854,0,12055 -chr18 238036 . A C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=1.099;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,289 -chr18 243676 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=15.56;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:386,0,409 -chr18 244699 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.403;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:433,0,365 -chr18 247594 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=2.062;DP=80;FS=7.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.062;QD=13.52;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:1110,0,1487 -chr18 252097 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,133 -chr18 253840 . C T 791.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-1.214;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:820,57,0 -chr18 256440 . C G 454.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.668;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=35.00;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:482,0,5 -chr18 256809 . C T 480.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:509,36,0 -chr18 259327 . C T 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr18 263913 . C G 210.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:239,0,24 -chr18 266032 . T C 4965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=-0.940;DP=397;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,157:396:99:5003,0,7879 -chr18 300916 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.337;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.965;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:560,0,463 -chr18 315516 . ACAGGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCACATCAGTTTTTTCTGCAGTGTGTGCTCTTCATCAGTGTGTGTGTTTCTG A 1058.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.830;DP=37;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=28.61;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:1096,0,5811 -chr18 328508 . T G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-1.232;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:410,0,485 -chr18 345775 . C T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=1.749;DP=55;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:968,0,766 -chr18 345871 . A T 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=2.503;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:699,0,1451 -chr18 345919 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=2.383;DP=43;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:482,0,869 -chr18 346381 . G A 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.649;DP=41;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.057;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:563,0,804 -chr18 683484 . C G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:314,0,50 -chr18 683546 . C T 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:432,30,0 -chr18 749229 . C T 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-1.116;DP=164;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.45;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,42:93:99:1742,0,1709 -chr18 749271 . T G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.369;DP=166;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.689;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:516,0,4236 -chr18 766921 . T A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.382;DP=140;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,36:139:99:823,0,3756 -chr18 997005 . G T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-1.672;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:407,0,663 -chr18 1044650 . TA T 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=-0.803;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=22.29;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:483,0,503 -chr18 1569005 . T G 724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:753,51,0 -chr18 1677538 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=1.169;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.90;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:433,0,1344 -chr18 1678250 . T A 430.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=32.44;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:458,0,9 -chr18 1680667 . AT A 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.322;DP=58;FS=7.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:683,0,1170 -chr18 1680760 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.267;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:292,0,1767 -chr18 1684641 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=-1.315;DP=121;FS=3.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,24:120:99:425,0,3655 -chr18 2374522 . T A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.601;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:448,0,329 -chr18 2375788 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,149 -chr18 2376856 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=2.493;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=10.83;ReadPosRankSum=-1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,422 -chr18 2380245 . TA T 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=2.007;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:309,0,166 -chr18 2381538 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=11.62;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:249,0,447 -chr18 2385511 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.227;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:415,0,162 -chr18 2395049 . GCTGTAGGACCAGAAAAACAACATCATTGGGATGAGGGGTGTAAAATAAAAATGCAAACTTGTATGAAAACAAAAACATTTATACATAC G 1114.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:99:1152,111,0 -chr18 2403233 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-1.290;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=15.41;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:475,0,433 -chr18 2456820 . AGTATGTATAAAGCATTGCAAATGTATTCATCAGTAAATATTAAGGATTGGTGTTTGTGTAAACCTCTGTCCTCTGTGTGTTTGGTAG A 5895.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=1.884;DP=149;FS=2.308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=32.77;ReadPosRankSum=-2.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,144:147:99:5933,429,0 -chr18 2470362 . G A 2806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.578;DP=167;FS=1.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,81:167:99:2835,0,2731 -chr18 2485087 . TGTAAGCAAAGTTTCATGGTTTTATCCGTTAAAAATTTGCAGCATAATAAAGATGACTCATTTTGACGTCCCTTTCAG T 9496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.843;DP=219;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,215:217:99:9534,727,0 -chr18 2485256 . AGTAAGACTCCGATCACATGACAAAACAATTAAAAGCCTTTTATCCTATCAGCTGTTGACTTCTCTGATTTCTCTACAG A 10035.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=3.422;DP=226;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.717;QD=27.00;ReadPosRankSum=-2.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,221:225:99:10073,743,0 -chr18 2505049 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-2.709;DP=73;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.705;QD=20.27;ReadPosRankSum=2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:1508,0,2833 -chr18 2549017 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=15.08;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:556,0,598 -chr18 2688907 . AT A 870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-0.373;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=17.41;ReadPosRankSum=2.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:97:908,0,97 -chr18 2716391 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,290 -chr18 4293140 . C T 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-1.338;DP=254;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,49:254:99:832,0,7737 -chr18 4480205 . CCCTGAAATCAGATGAAAACGGTAAAACAACAGCATACTTCTCCCAAACATTACCAGAGTTATAAGACTTTCAAAAAGAAGTGTAGGAATATCTTA C 8585.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.377;DP=233;FS=7.297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.642;QD=29.94;ReadPosRankSum=2.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,229:231:99:8623,688,0 -chr18 4486294 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=1.197;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:237,0,1823 -chr18 4495638 . TG T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,0:19:99:273,0,2055 -chr18 4495769 . GTAACCATGTTCAGACACTTAAAGCAGAGTTTGATATGCATTTTTATTGCAGACTTTATTTGGGGAAGGAAAAATTGATAAAA G 1348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.205;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:1386,0,4423 -chr18 4611101 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.58;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:304,0,42 -chr18 4649746 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.65;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,172 -chr18 4657780 . A C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-0.194;DP=43;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.438;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:352,0,991 -chr18 4658016 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.137;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:482,0,402 -chr18 4658169 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-0.204;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=17.51;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:361,0,331 -chr18 4658210 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.205;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=19.20;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:489,0,357 -chr18 4659826 . T A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=2.993;DP=29;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:385,0,348 -chr18 4659828 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=2.381;DP=28;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=9.99;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:308,0,774 -chr18 4660656 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:358,0,223 -chr18 4664330 . T G 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=-1.076;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,51:128:99:1746,0,2443 -chr18 4730987 . A T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=1.634;DP=41;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:681,0,773 -chr18 4731023 . C T 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.024;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:931,0,1157 -chr18 4772512 . A T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.883;DP=35;FS=2.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=12.96;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:482,0,664 -chr18 4772655 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=1.442;DP=50;FS=3.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:286,0,1470 -chr18 4772716 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=1.732;DP=61;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=7.31;ReadPosRankSum=2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:474,0,1678 -chr18 4773153 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.647;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:268,0,890 -chr18 4773295 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=1.133;DP=26;FS=1.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:347,0,543 -chr18 4773727 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.610;DP=40;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:294,0,2177 -chr18 4773852 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.154;DP=37;FS=5.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:264,0,1068 -chr18 4774370 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.684;DP=52;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:259,0,1507 -chr18 4790436 . C A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-0.912;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:648,0,383 -chr18 4790670 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-1.937;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:296,0,847 -chr18 4866845 . A G 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.306;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:552,0,558 -chr18 4866888 . A C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.267;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=14.88;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:430,0,448 -chr18 4867791 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.693;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:662,0,689 -chr18 4867948 . C A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-1.335;DP=57;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:889,0,1042 -chr18 4900225 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:239,0,437 -chr18 4900523 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=-0.402;DP=34;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:459,0,671 -chr18 4902474 . G T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=-1.393;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:551,0,475 -chr18 4904445 . C A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.513;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:628,0,516 -chr18 4904566 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.394;DP=23;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:386,0,391 -chr18 4904660 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.279;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:418,0,351 -chr18 4904774 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.528;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:444,0,846 -chr18 4906766 . A C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=12.66;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:408,0,1335 -chr18 4906767 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.344;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=12.66;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:408,0,1331 -chr18 4920563 . A C 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.473;DP=91;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1176,0,1879 -chr18 4921344 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.545;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.446;QD=10.17;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:547,0,972 -chr18 4925211 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=-0.455;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:341,0,939 -chr18 4929629 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,407 -chr18 4933825 . TA T 1075.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.224;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1113,0,2411 -chr18 5020445 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.590;DP=28;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:244,0,722 -chr18 5069910 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-2.080;DP=43;FS=4.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:826,0,661 -chr18 5171013 . GT G 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.210;DP=88;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:509,0,1170 -chr18 5173066 . TCTATAATAACAAATAAATATGCATAAATATGTTTTTAAAAAGCATGGATTATAAAAAAATGTGAAGATTAAGTAAACTCATTTAAAAACAAAAAGTAGCCACATAC T 3686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-0.831;DP=86;FS=4.437;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=35.12;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,80:85:99:3724,379,0 -chr18 5183018 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.177;DP=88;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=5.33;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:497,0,2405 -chr18 5231207 . C T 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:46:681,46,0 -chr18 5231515 . C A 2889.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.989;DP=82;FS=3.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=34.50;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,73:81:69:2918,69,0 -chr18 5237447 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.003;DP=212;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,31:212:99:270,0,6999 -chr18 5387149 . A T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr18 5389405 . T A 266.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:304,21,0 -chr18 5391300 . T G 457.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:486,33,0 -chr18 5584808 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.410;DP=43;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:329,0,1106 -chr18 5631681 . AAGGTAGAAGAAATGCCATGCACACACACACATACACACATACATGTCCCATTTTAATCAAATAATATTCTATTTTAAGGAATAAATAAATGTGAAATGTGATGGTATTGCATGCGTATGATTTATTTTAGTAAATAGTGTCTGTATTTTGTCTAC A 9263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.057;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.115;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,207:210:99:9301,655,0 -chr18 5634936 . AG A 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr18 5635918 . C CT 1368.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.578;DP=295;FS=4.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,96:265:99:1406,0,4055 -chr18 5788592 . AT A 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,1:6:99:469,0,1184 -chr18 5788594 . ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC A 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.536;DP=31;FS=5.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=13.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:469,0,1184 -chr18 5809672 . G T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=-0.927;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:546,0,634 -chr18 5816202 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.499;DP=51;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:229,0,1522 -chr18 5899114 . TA T 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-2.471;DP=47;FS=6.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=22.97;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,41:47:20:1117,20,0 -chr18 5985710 . G T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-2.230;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=17.54;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:379,0,366 -chr18 5986122 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:614,0,293 -chr18 5986262 . A C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr18 5986270 . C A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr18 5988459 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr18 6054889 . C G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-1.126;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:242,0,458 -chr18 6101482 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=-0.401;DP=75;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:263,0,2514 -chr18 6102185 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-3.718;DP=100;FS=2.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=2.50;ReadPosRankSum=-2.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:278,0,3164 -chr18 6107738 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-1.254;DP=252;FS=3.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=1.13;ReadPosRankSum=3.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,36:251:99:313,0,8447 -chr18 6115881 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=2.533;DP=82;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:246,0,2477 -chr18 6130483 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.601;DP=80;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.73;ReadPosRankSum=2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:487,0,2288 -chr18 6130614 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.850;DP=62;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=4.14;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:285,0,1796 -chr18 6370860 . G C 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr18 6371002 . G A 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-1.449;DP=56;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.846;QD=18.87;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1085,0,1257 -chr18 6371084 . CT C 898.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.671;DP=47;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,35:47:99:936,0,170 -chr18 6371136 . A G 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.218;DP=42;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1032,0,321 -chr18 6371221 . G T 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.502;DP=39;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:997,0,332 -chr18 6371276 . T C 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.588;DP=66;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.247;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,52:66:99:1880,0,271 -chr18 6371472 . T C 2840.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2869,208,0 -chr18 6395573 . A C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-3.001;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=26.93;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:486,0,121 -chr18 6411147 . A G 576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:605,45,0 -chr18 6415161 . G A 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:731,54,0 -chr18 6455860 . CG C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:357,0,348 -chr18 6456040 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.465;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:350,0,410 -chr18 6459124 . G A 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr18 6459133 . C T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:266,18,0 -chr18 6459251 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 6459254 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 6462704 . T G 879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:908,63,0 -chr18 6620022 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.373;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:860,0,308 -chr18 6702438 . A T 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr18 6702549 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr18 6712407 . T A 1547.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.707;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:11:1575,11,0 -chr18 6712433 . A G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-2.022;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.50;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:551,0,855 -chr18 6712445 . A G 1543.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=-2.355;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.559;QD=22.70;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,23:27:8:1571,8,0 -chr18 6789510 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,102 -chr18 6789868 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,249 -chr18 6790429 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:237,0,775 -chr18 6794359 . C A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:261,0,131 -chr18 6890831 . C A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=-0.917;DP=128;FS=13.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=2.45;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,23:127:99:342,0,4058 -chr18 6890884 . T A 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.597;DP=132;FS=9.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,32:132:99:707,0,4015 -chr18 6891695 . C T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.815;DP=145;FS=2.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,27:145:99:567,0,9123 -chr18 6894354 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.038;DP=121;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,27:120:99:538,0,3605 -chr18 6903399 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-1.724;DP=149;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,30:148:99:544,0,5143 -chr18 6941917 . T C 2739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=-1.891;DP=79;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=34.68;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,6:77:99:2768,0,5819 -chr18 6941922 . T C 2726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=-2.783;DP=86;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,10:84:99:2755,0,5819 -chr18 6942087 . T C 2347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-1.803;DP=107;FS=15.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=21.94;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,65:106:99:2376,0,6978 -chr18 7015916 . A G 4559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.629;DP=321;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,135:321:99:4588,0,9939 -chr18 7030878 . TGTAAGTAGTTTTCCCTTTAAATAACGAGTAAATAGATTATTTCTGAGGTTTTATATTAATGAAGTATTTTCTTGTTTAG T,TTAAGTAGTTTTCCCTTTAAATAACGAGTAAATAGATTATTTCTGAGGTTTTATATTAATGAAGTATTTTCTTGTTTAG 4104.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.962;DP=330;FS=1.891;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=12.44;ReadPosRankSum=-2.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,147,142:295:99:6812,2119,2767,2097,0,3128 -chr18 7030880 . TAAGTAGTTTTCCCTTTAAATAACGAGTAAATAGATTATTTCTGAGGTTTTATATTAATGAAGTATTTTCTTGTTTAG T 1990.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-2.640;DP=330;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,101:280:99:2028,0,5313 -chr18 7031277 . A T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=-1.946;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,47:228:99:861,0,7176 -chr18 7106853 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.012;DP=48;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:286,0,2361 -chr18 7705618 . CAGGTGCTGAGAGATACATTCTGCATGCAGCTAAAATAAATTCTGTGGTTATGAATGCAGGACGTTGTGTTTGTATGCTTTCCCATCACTCAA C 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-0.024;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=18.12;ReadPosRankSum=1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:599,0,491 -chr18 7834160 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr18 7963041 . TA T 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:441,0,262 -chr18 8119878 . TG T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.176;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:241,0,257 -chr18 8349494 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.566;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=3.30;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,29:137:99:484,0,4885 -chr18 10158312 . TCTGTGAAACATGTTCAGTATTCTTTCAAACCAAAAACAACAACAGCTCAGGATTAACAAAGTAACAAAATAAAAAAC T 2618.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.395;DP=57;FS=3.087;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2656,255,0 -chr18 10288758 . C G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.043;DP=41;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:275,0,1553 -chr18 10325535 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.878;DP=40;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:239,0,1085 -chr18 10327531 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-1.309;DP=43;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:333,0,1524 -chr18 10460807 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-1.371;DP=24;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:304,0,1041 -chr18 11484828 . TCCTAATACACAAAAGCATTATAAATTTGTATTTGGTAAACAGACTGGCTGCTGACAGTGGATGTACCTGTTTGTATCATGCGATTTTCAATGATCATAGTTTAAATA T 1685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=1.473;DP=40;FS=3.233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1723,148,0 -chr18 11573175 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-2.025;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=16.12;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:270,0,570 -chr18 11645334 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.081;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:377,0,1347 -chr18 11673403 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.198;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:380,0,1580 -chr18 11702983 . G A 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.412;DP=85;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:464,0,2296 -chr18 11725786 . G GCC 1050.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=1.511;DP=138;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:121:99:1317,0,2161 -chr18 11905487 . G GT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.405;DP=78;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:326,0,1490 -chr18 11908717 . CTT C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=-0.480;DP=44;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:530,0,1093 -chr18 12210526 . C T 288.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:317,0,17 -chr18 12320201 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.237;DP=43;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:253,0,1351 -chr18 12394439 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.496;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:499,0,563 -chr18 12602336 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.316;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:338,0,2190 -chr18 12603060 . TA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.395;DP=64;FS=2.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:595,0,1125 -chr18 13310766 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.752;DP=14;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=24.34;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38:369,0,38 -chr18 13317371 . T A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.868;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=25.82;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:493,0,120 -chr18 14196659 . C T 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-0.450;DP=121;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,38:121:99:996,0,3056 -chr18 14219193 . G A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-1.414;DP=66;FS=12.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:539,0,2494 -chr18 14272542 . GAAGGTATGTGGTAAAACTGGTGTTAGGTTTACATAACAGCATCTCGTTTGTTGTTTTCACAGTCTTGACATAAACTTCTCTCTCCC G 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.475;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=34.51;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:693,0,755 -chr18 14284441 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.213;DP=119;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,21:119:99:296,0,3545 -chr18 14284474 . T C 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=1.576;DP=124;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,29:124:99:599,0,3808 -chr18 14284915 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.795;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,19:105:99:292,0,3413 -chr18 14291648 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-0.667;DP=35;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:270,0,1359 -chr18 14317322 . GA G 710.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:76:748,76,0 -chr18 14359120 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.760;DP=87;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=3.38;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:322,0,2613 -chr18 14359138 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=1.836;DP=84;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.51;ReadPosRankSum=-2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:491,0,2320 -chr18 14449875 . T G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.431;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:612,0,708 -chr18 14471731 . AAC A 331.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=20.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:29:369,29,0 -chr18 14692759 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=27.80;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:334,0,583 -chr18 14692986 . G A 903.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=-1.131;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=33.48;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:932,66,0 -chr18 14711275 . AG A 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.428;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:558,0,1557 -chr18 14711279 . ATACAAACAAGCACTTTATCAGCTAGCTTTTTCTTTCTAATTGATCGAAATTTTGTAATATCGTGCACGTATTGATCATCTATATTGGCAGTTTGGTTAATTTTATTAATGTTTTATCAGTG A 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.662;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:558,0,1561 -chr18 14847802 . C CT 4584.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,146:146:99:4622,445,0 -chr18 14849044 . A T 8115.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-3.142;DP=248;FS=7.984;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=32.72;ReadPosRankSum=-2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,209:237:99:8144,120,0 -chr18 14871211 . G C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.350;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:89:701,0,89 -chr18 14878081 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=2.676;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=25.52;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:411,0,137 -chr18 14879067 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.070;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.756;QD=33.38;ReadPosRankSum=-1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:36:629,0,36 -chr18 14879151 . C G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.262;DP=21;FS=5.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=25.94;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:573,0,115 -chr18 14920150 . A AT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-2.237;DP=29;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=3.318;QD=9.03;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:299,0,332 -chr18 14920557 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.649;DP=53;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:357,0,3365 -chr18 14920823 . T TA 940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:88:978,88,0 -chr18 14959501 . T A 3374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.627;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=30.96;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,90:109:99:3403,0,291 -chr18 14994210 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=-0.604;DP=60;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:659,0,1403 -chr18 15045903 . T C 1008.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1037,75,0 -chr18 15049646 . C A 1152.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1181,87,0 -chr18 15052886 . G A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr18 15055350 . A G 2226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2255,157,0 -chr18 15055742 . GA G 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.635;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:348,0,135 -chr18 15138911 . T A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-2.698;DP=76;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=8.37;ReadPosRankSum=2.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:664,0,1827 -chr18 15145911 . G A 3562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.176;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,92:114:99:3591,0,424 -chr18 15146357 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=3.888;DP=39;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=8.99;ReadPosRankSum=-3.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:379,0,952 -chr18 15152339 . G A 210.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:239,0,25 -chr18 15177832 . C T 1798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.342;DP=60;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,48:60:99:1827,0,186 -chr18 15203445 . C T 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=2.723;DP=61;FS=12.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,38:60:99:1299,0,764 -chr18 15203457 . T G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=3.333;DP=46;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:782,0,786 -chr18 15244624 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-2.425;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:303,0,639 -chr18 15246483 . T TA 725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.894;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:763,0,114 -chr18 15246639 . T TA 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.481;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,28:38:99:798,0,220 -chr18 15246814 . T C 1517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=-0.987;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.878;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:72:1546,72,0 -chr18 15246815 . T C 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-1.175;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:748,0,857 -chr18 15246952 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.461;DP=59;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:373,0,1588 -chr18 15392424 . G T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.585;DP=68;FS=5.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:587,0,4040 -chr18 15392433 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.461;DP=71;FS=5.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=7.80;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:582,0,4040 -chr18 15406210 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=-1.943;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:303,0,293 -chr18 15439219 . T C 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 -chr18 15471967 . C CG 5077.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-2.250;DP=193;FS=2.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=26.31;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,170:172:99:5115,503,0 -chr18 15517776 . G GA 1618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.025;DP=62;FS=3.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,42:59:99:1656,0,229 -chr18 15537992 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.462;DP=45;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:247,0,1285 -chr18 15561175 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.148;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=23.78;ReadPosRankSum=1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:694,0,278 -chr18 15561195 . A G 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.386;DP=32;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:818,0,287 -chr18 15561943 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=24.67;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,137 -chr18 15563533 . T C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.883;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=34.49;ReadPosRankSum=2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:925,0,168 -chr18 15564175 . A G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.704;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=29.07;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:726,0,283 -chr18 15590909 . G A 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.704;DP=36;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=32.16;ReadPosRankSum=-0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1186,0,448 -chr18 15590912 . G A 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.240;DP=37;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=31.29;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1186,0,448 -chr18 15712495 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=-0.729;DP=42;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.35;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:463,0,910 -chr18 16378951 . CGTGAGTCATTTTATTTCTTCCATAACCTAGATGTTTTGTGCTAATTGCAAAGCATGATTTGTGTCCAGTTTCTAAAATTGAAATGTGTGTCTGCATTTAG C 17048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=431;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,430:431:99:18502,573,0 -chr18 16381864 . CAGGTAACTTCCTTTTGCGAATTAATTTTTTTTTTCTCAATCAAAAGGTTTGTCGAGCTTTTCACTGTTAATTATATGTGCTTTTGTA C 3835.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=3.429;DP=307;FS=2.060;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,269:273:99:3873,519,0 -chr18 16593995 . ACTGTTATATGCTGTAAGATTTGAACAGCAAGTGTGCAAGACAAAAAATATGCAGTCAAGTTATTTAATGCAACCTATATTATATACAGGATGCCTTCAAAAGTGTAAATCAAATAGCATTTCAAGTGCAGAATAGAAGATTGTGTGCCTAAAAAGTAGCTCTAAAAATGTAGTTCCAGTAC A 2063.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=3.755;DP=127;FS=3.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:2101,0,26968 -chr18 16637921 . A G 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr18 16637924 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr18 16640253 . T A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.100;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=5.62;ReadPosRankSum=2.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:343,0,1457 -chr18 16640306 . A G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.709;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:404,0,1036 -chr18 16664812 . GCTGCAATAAACACTGATTTTAACACTACTCTTTCTCCAATCCCACCTTAACATGCAGAGACAAAATAAACCATTTGTGTTGGCTGACTGATTTAAAGTGCCTGCACACAACAGTGATAACGTGAGGACAGAAACATGCTTAATTGAGGTGGCAAATCTTCTCGTGCACAGCCAACCCAAGAGTGCTAAATAGAGAGACATGCTGTACTAAACACATGGCATTAC G 1827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=3.905;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=25.32;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,41:47:99:1865,0,1719 -chr18 16757730 . T A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.482;DP=102;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:699,0,2741 -chr18 16789966 . C CT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.739;DP=115;FS=5.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,29:101:99:451,0,2010 -chr18 16790174 . A G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=-1.240;DP=135;FS=1.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,43:135:99:1084,0,3215 -chr18 16798614 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.384;DP=64;FS=6.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:243,0,1940 -chr18 17067856 . G T 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=5.005;DP=398;FS=7.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=2.98;ReadPosRankSum=2.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,77:398:99:1213,0,12266 -chr18 17067867 . ATCTGTACAAACCACATATAAATGATCAGTGTAACAAACAACAATATTGTT A 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=400;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=0.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,0:12:99:398,0,1329 -chr18 17162543 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.327;DP=78;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:339,0,2282 -chr18 17166286 . AC A 394.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.264;DP=95;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,26:87:99:432,0,1637 -chr18 17236622 . T TA 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=2.027;DP=49;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=5.10;ReadPosRankSum=-2.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:287,0,1283 -chr18 17263620 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.494;DP=76;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:632,0,1876 -chr18 17276024 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.513;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:468,0,471 -chr18 17367186 . G A 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-3.304;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,37:119:99:946,0,3016 -chr18 17367622 . C G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-1.179;DP=111;FS=5.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,27:111:99:563,0,2999 -chr18 17386549 . G C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-1.721;DP=39;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:231,0,1091 -chr18 17430333 . C A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-2.614;DP=152;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,43:152:99:979,0,3894 -chr18 17540670 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-0.904;DP=135;FS=5.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,28:135:99:562,0,4254 -chr18 17768153 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.785;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:271,0,431 -chr18 18069388 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.050;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:270,0,1137 -chr18 18069721 . G C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.191;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:486,0,902 -chr18 18069898 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.410;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:589,0,773 -chr18 18069973 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=-0.655;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:273,0,795 -chr18 18129449 . T C 2640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.436;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,80:127:99:2669,0,1597 -chr18 18129563 . C T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.817;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,30:132:99:616,0,3865 -chr18 18160433 . T C 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.388;DP=54;FS=11.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1161,0,673 -chr18 18210105 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=-0.222;DP=88;FS=7.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:291,0,2755 -chr18 18211551 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=-0.547;DP=202;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,35:193:99:562,0,6130 -chr18 18226275 . A T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=1.507;DP=140;FS=7.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:708,0,4143 -chr18 18228943 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.996;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:372,0,2026 -chr18 18236516 . A G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.514;DP=144;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,41:144:99:939,0,3843 -chr18 18333030 . T G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.588;DP=30;FS=9.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:258,0,799 -chr18 18333230 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-0.311;DP=43;FS=6.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:734,0,2098 -chr18 18333231 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.079;DP=50;FS=5.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:734,0,2049 -chr18 18333357 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.879;DP=63;FS=14.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,15:63:99:285,0,1870 -chr18 18349543 . G C 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-2.829;DP=140;FS=18.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=6.68;ReadPosRankSum=2.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,39:139:99:963,0,3809 -chr18 18354981 . C A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=4.873;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:624,0,2518 -chr18 18355002 . T C 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=3.942;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,31:98:99:880,0,2622 -chr18 18364402 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-2.548;DP=86;FS=5.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,17:86:99:311,0,2697 -chr18 18412905 . T C 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-1.087;DP=64;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:849,0,1688 -chr18 18414029 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=1.210;DP=53;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:421,0,1302 -chr18 18417409 . C T 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=-4.632;DP=263;FS=9.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,60:262:99:1216,0,7770 -chr18 18437976 . A G 4138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=4.926;DP=262;FS=33.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=15.80;ReadPosRankSum=-2.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,117:261:99:4167,0,4734 -chr18 18439571 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.049;DP=423;FS=0.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=0.50;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:363,57:420:99:240,0,13238 -chr18 18439670 . T A 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.264;DP=106;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:1493,0,2126 -chr18 18439803 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=24.07;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:293,0,96 -chr18 18441251 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.465;DP=197;FS=2.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,31:197:99:349,0,6271 -chr18 18476928 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:27:387,27,0 -chr18 18476934 . T G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr18 18613242 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:268,0,96 -chr18 18613697 . T G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.237;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:332,0,205 -chr18 18651066 . G GT 1003.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-1.841;DP=40;FS=2.504;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=25.09;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:84:1041,84,0 -chr18 18652057 . A C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-2.027;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:456,0,520 -chr18 18666341 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.573;DP=136;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,25:136:99:412,0,4135 -chr18 18677871 . GAGGTAAACCAACCACTGTCTTTTGTTTTGTTGTTGAATCTTTAAAAAATGTGAGATGTTTGATTGTTTTTTTTTGTGTCTGCATAC G 3600.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.799;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=34.96;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:3638,273,0 -chr18 18682636 . CTT C 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.285;DP=89;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:513,0,2961 -chr18 18778062 . TCTACAAGAAGTACAAGAAGTGATTAATGTCATTTAATCTGTGTTTTGTCAGAGATCCAGTATTTGCAGTGTAGAGTTGTGATAC T 3257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=3.144;DP=90;FS=3.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=25.35;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,80:87:99:3295,0,564 -chr18 18813713 . C T 12058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=-1.657;DP=133;FS=39.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=28.80;ReadPosRankSum=-4.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,61:89:99:12087,0,1805 -chr18 18813782 . A G 12057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-0.084;DP=753;FS=12.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,302:366:99:12086,0,1814 -chr18 18813866 . G T 2991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=3.270;DP=204;FS=8.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=14.67;ReadPosRankSum=-3.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,79:106:99:3020,0,927 -chr18 18813882 . T C 3894.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.810;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=26.23;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:99:3923,285,0 -chr18 18917928 . G C 2212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.162;DP=213;FS=21.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=10.39;ReadPosRankSum=2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,54:210:99:2241,0,10741 -chr18 18918836 . AT A 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.406;DP=219;FS=13.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,32:204:99:390,0,4176 -chr18 19194685 . G C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-1.370;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:436,0,531 -chr18 19231937 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=-0.615;DP=167;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,31:167:99:492,0,5538 -chr18 19241210 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.350;DP=80;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:400,0,2371 -chr18 19247148 . A G 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.100;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=12.20;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,32:88:99:1102,0,1943 -chr18 19429452 . GT G 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.338;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:501,0,1441 -chr18 19429589 . T C 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.379;DP=89;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:607,0,2436 -chr18 19598230 . TCTGAAAGACAAATAAAAGGTGAATTGAAGGACACAAATAGTTAAATCGCAAACTGATTAACATGGCAATCACTCAC T 5716.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.022;DP=139;FS=2.291;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,136:139:99:5754,400,0 -chr18 19762295 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=1.106;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:510,0,501 -chr18 19805666 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-1.239;DP=27;FS=9.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=17.84;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:520,0,325 -chr18 19806447 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=1.024;DP=36;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:379,0,895 -chr18 19807681 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.076;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:478,0,109 -chr18 19808305 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.537;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:312,0,528 -chr18 19818881 . TGTGAGTGTTACTTTGTTTGCTCGTAGGGTTGAATTGCCCTCGACTGCACTCAGCTTCTTGCTTCATCAAGAATTTTTAAAATGAGCTGTCAAAACTGCAAACTCATGTTTACTGGTGCATTTTTAACCAAGGGCTTTCTATTCATTTCACTAG T 13930.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.530;DP=304;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,300:304:99:13968,1222,0 -chr18 20006750 . A AT 2457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.811;DP=178;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=13.81;ReadPosRankSum=-1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,104:163:99:2495,0,3706 -chr18 20023110 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=23.37;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:332,0,133 -chr18 20023359 . AG A 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 20023362 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr18 20221792 . C T 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=-0.496;DP=248;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,67:248:99:1433,0,6678 -chr18 20223869 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-2.192;DP=203;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.070;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,35:201:99:476,0,6305 -chr18 20231466 . G A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.840;DP=230;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,67:230:99:1652,0,6240 -chr18 20235112 . TCTACAAAACAACATCAGATAAATGCACTATATTCAAGTCAGATTAGGCACTAATGTGTAAATTTTAAATGAAAAAAAAC T 8373.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.370;DP=190;FS=2.239;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=34.07;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,187:190:99:8411,716,0 -chr18 20235516 . GCCTAGTTTTAAAAGTAAACTGCTGTCAGACAGAGCACTTTTTAAACGACAATAATTATTCAAGAACAGTGGATTTA G 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,0:2:99:490,0,724 -chr18 20292260 . A C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.085;DP=35;FS=7.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.690;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:468,0,830 -chr18 20314479 . C CA 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=1.034;DP=67;FS=9.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:366,0,1239 -chr18 20314767 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.454;DP=83;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.328;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:627,0,2129 -chr18 20323754 . G GT 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.963;DP=49;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:260,0,1064 -chr18 20323827 . C CA 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.223;DP=67;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:239,0,1574 -chr18 20340246 . G T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=1.502;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=11.53;ReadPosRankSum=-1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:328,0,551 -chr18 20365051 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=-0.372;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:314,0,1277 -chr18 20365340 . CA C 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.544;DP=71;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:687,0,794 -chr18 20662861 . T TA 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-0.534;DP=26;FS=6.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:257,0,300 -chr18 20925467 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.508;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:237,0,2021 -chr18 20960981 . GCCTACCGGGAAAATAAAACCAGTTATATCTGTACAGCTTGATACTCATTGGCTGTGTTTGGTGACTGGGTTTAATCTGTGGCCTCA G 3178.72 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=1.469;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:3216,232,0 -chr18 20969320 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=1.281;DP=118;FS=3.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:281,0,3632 -chr18 21399597 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:280,0,404 -chr18 21401189 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=1.861;DP=62;FS=8.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:373,0,1732 -chr18 21642698 . GA G 775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=-0.982;DP=99;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,34:87:99:813,0,1220 -chr18 21677783 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=-0.434;DP=87;FS=7.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:265,0,2672 -chr18 21692933 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:361,0,986 -chr18 21693877 . T C 884.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.141;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=33.08;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:1:910,0,1 -chr18 21694689 . C CA 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-2.055;DP=245;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,50:232:99:502,0,7480 -chr18 21717049 . A G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.281;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=20.47;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:540,0,152 -chr18 21717087 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.137;DP=47;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=25.82;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:63:1242,0,63 -chr18 21717139 . C A 1512.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-1.827;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=24.79;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,38:41:4:1539,0,4 -chr18 21717212 . T G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-0.670;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=32.70;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:53:813,0,53 -chr18 21717242 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=24.43;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:297,0,134 -chr18 21770329 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=1.304;DP=41;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:308,0,1488 -chr18 21810980 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.307;DP=42;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:376,0,1069 -chr18 21811052 . GA G 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.979;DP=50;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:266,0,887 -chr18 22023802 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-1.823;DP=42;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:335,0,1109 -chr18 22068972 . GA G 4496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=-3.993;DP=253;FS=4.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=17.77;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,50:232:99:4534,0,5272 -chr18 22073944 . CTT C 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=-1.672;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:466,0,857 -chr18 22157390 . TGTGAGTACATCACACATGCAAATGCACTCATCTATGCAGATCACTGTTAATCAACATGTATTTAACTGGAATTAATCACAGCATATCATTAAATCATGATCTCTAACAAAGAAATATCCTTACCGGTTGTCAAAAGACATTTCCCATCATGCCTCTCCTCTCCTCGTGTTCAG T 1138.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=2.507;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=33.49;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1176,0,1527 -chr18 22172942 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-0.429;DP=52;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:469,0,1680 -chr18 22432482 . A C 1932.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=1.660;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=25.39;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:48:99:1961,139,0 -chr18 22433089 . G A 2735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.257;DP=183;FS=62.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=14.95;ReadPosRankSum=3.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,77:148:99:2764,0,2536 -chr18 22433225 . TCA T 258.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:33:296,33,0 -chr18 22433228 . TG T 258.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:33:296,33,0 -chr18 22434360 . T A 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:887,60,0 -chr18 22434364 . C T 858.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:60:887,60,0 -chr18 22435017 . T C 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 -chr18 22435041 . T C 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:478,33,0 -chr18 22435695 . C T 1677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1706,117,0 -chr18 22435847 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=1.230;DP=23;FS=14.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=27.99;ReadPosRankSum=-2.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:672,0,283 -chr18 22435853 . T C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=34.41;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:672,0,284 -chr18 22436279 . T A 887.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.011;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=25.82;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:916,69,0 -chr18 22437743 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=2.067;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.91;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:251,0,259 -chr18 22756366 . A AT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=1.499;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:461,0,2797 -chr18 22756558 . C CA 835.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-1.813;DP=65;FS=2.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,52:57:69:1130,0,69 -chr18 22756730 . T TA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=1.995;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=3.07;ReadPosRankSum=-1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:249,0,1350 -chr18 22840954 . AC A 357.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:395,30,0 -chr18 23136309 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.214;DP=24;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:265,0,543 -chr18 23141369 . TA T 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-1.339;DP=29;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:353,0,142 -chr18 23181659 . C A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr18 23653605 . AT A 384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.189;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,15:147:99:422,0,12736 -chr18 24523145 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,171 -chr18 24735748 . AACCTAAAATAAAGACAATTACGTAAATGCAATGTTCAGAGCAAAGCCTCACTTAAATGAGTAAATAAATGTTTAGTTTATTC A 4369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.416;DP=100;FS=3.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=32.36;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,99:100:99:4407,357,0 -chr18 25131400 . C G 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr18 25131496 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr18 25278058 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.619;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.518;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:417,0,276 -chr18 25278605 . T C 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-0.292;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:99:1372,0,655 -chr18 25279303 . C A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -chr18 25279642 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;ClippingRankSum=0.039;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=19.45;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:534,0,164 -chr18 25279933 . C A 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:616,42,0 -chr18 25342850 . GT G 449.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=1.504;DP=21;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=21.42;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:37:506,37,0 -chr18 25352823 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-1.641;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:285,0,2163 -chr18 25563127 . A G 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=-0.663;DP=50;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=12.34;ReadPosRankSum=-2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:645,0,1390 -chr18 25881394 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.377;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:474,0,639 -chr18 25881497 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.113;DP=21;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:355,0,372 -chr18 26022491 . T C 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr18 26231802 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.252;DP=75;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:321,0,2660 -chr18 26294746 . A AG 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.968;DP=26;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:563,0,107 -chr18 26299736 . A G 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr18 26362282 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr18 26362301 . T G 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 -chr18 26378453 . G T 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:722,51,0 -chr18 26378497 . C T 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:825,60,0 -chr18 26732553 . CA C 3173.72 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.488;DP=219;FS=12.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,130:213:99:3211,0,1990 -chr18 26744216 . TA T 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=1.977;DP=24;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=13.61;ReadPosRankSum=-2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:364,0,150 -chr18 26799063 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.580;DP=46;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:768,0,845 -chr18 26912337 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:229,0,103 -chr18 26996463 . T A 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=1.383;DP=58;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1164,0,764 -chr18 26996487 . T G 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.560;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,38:60:99:1281,0,754 -chr18 26996794 . A G 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.990;DP=60;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,38:58:99:1320,0,704 -chr18 27016858 . G GAT 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-0.347;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:378,0,260 -chr18 27017017 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.317;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:243,0,1286 -chr18 27017369 . G GA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-1.892;DP=44;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:712,0,223 -chr18 27234793 . GAGGTCAGACATTATTATAGCTTAGTTAACCATTTCTTTTGCCAATGTATCTGGTAAAATACTATGTCTCTGTGTTGCCGT G 494.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:50:532,50,0 -chr18 27254103 . T TA 1027.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.629;DP=42;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=24.47;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:5:1064,0,5 -chr18 27304795 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=1.016;DP=33;FS=6.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:894,0,172 -chr18 27573431 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=1.374;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=4.08;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:232,0,1993 -chr18 27573471 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.827;DP=39;FS=3.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:309,0,1172 -chr18 27573476 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.780;DP=40;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:316,0,1201 -chr18 27573853 . A G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=1.670;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:535,0,1132 -chr18 27574186 . CT C 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=2.246;DP=30;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:277,0,274 -chr18 27681299 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=-0.034;DP=114;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,20:113:99:312,0,5876 -chr18 27945212 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-0.767;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:443,0,745 -chr18 28318758 . A G 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:301,21,0 -chr18 28318767 . A G 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr18 28318990 . T G 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr18 28320239 . G C 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr18 28320382 . A G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr18 29353108 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-1.573;DP=57;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:367,0,1490 -chr18 29839179 . C A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-2.229;DP=132;FS=4.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=4.03;ReadPosRankSum=2.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,28:132:99:560,0,4106 -chr18 29854943 . C CT 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=-1.830;DP=68;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:256,0,1196 -chr18 29978186 . A G 567.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=1.302;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:8:595,8,0 -chr18 30409702 . T G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=-2.925;DP=137;FS=7.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,24:137:99:393,0,4320 -chr18 30409800 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.037;DP=123;FS=6.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,21:123:99:258,0,3746 -chr18 30414680 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.863;DP=135;FS=3.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:333,0,4329 -chr18 30415204 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=-0.506;DP=140;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,37:140:99:841,0,5408 -chr18 30417715 . A T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.856;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=14.22;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1052,0,1152 -chr18 30421553 . G GT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.284;DP=72;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:345,0,1427 -chr18 30422009 . A T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=1.827;DP=131;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,33:131:99:691,0,4374 -chr18 30425452 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.207;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=3.96;ReadPosRankSum=-2.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,23:106:99:448,0,3191 -chr18 30430067 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=1.029;DP=159;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,28:159:99:445,0,5213 -chr18 30445671 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.697;DP=124;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,22:124:99:350,0,4079 -chr18 30453904 . A G 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=-1.549;DP=302;FS=7.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,57:301:99:893,0,9763 -chr18 30453914 . TGTGTGTTATATGAGAATTGGAAAAAAAAAACGTTGTTTGAGTTTTTATTTCAATGTGCTAATTTCCGTTGTTTAATTTCAG T 11158.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=1.768;DP=296;FS=2.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,270:273:99:11196,811,0 -chr18 30945504 . A T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-2.636;DP=287;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,46:287:99:541,0,9506 -chr18 31083652 . G A 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:235,0,24 -chr18 31177290 . C T 577.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:606,42,0 -chr18 31454133 . G T 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:358,24,0 -chr18 31454223 . TA T 212.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:250,24,0 -chr18 31687660 . T A 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr18 31687707 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr18 31831769 . A G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr18 31836121 . G A 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr18 32097695 . A C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.064;DP=23;FS=8.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:367,0,368 -chr18 32385414 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.550;DP=38;FS=3.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:319,0,1142 -chr18 32389436 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.410;DP=51;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:447,0,1246 -chr18 32422737 . C A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.138;DP=163;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=4.04;ReadPosRankSum=2.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,36:163:99:686,0,5590 -chr18 32441001 . C CT 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.235;DP=119;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:253,0,2285 -chr18 32802262 . C CA 856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.259;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,42:75:99:894,0,2163 -chr18 32802414 . A C 20059.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=471;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,471:471:99:20088,1435,0 -chr18 32802686 . G A 3540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=-2.944;DP=89;FS=14.467;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.148;QD=27.24;ReadPosRankSum=2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:3569,259,0 -chr18 32809382 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-1.299;DP=247;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,35:247:99:253,0,8108 -chr18 32890594 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:408,0,520 -chr18 33539988 . G T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.735;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:422,0,341 -chr18 33582133 . A T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.472;DP=34;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:255,0,873 -chr18 33747197 . G A 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-0.542;DP=272;FS=26.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,61:269:99:1292,0,8508 -chr18 33747283 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.577;DP=238;FS=3.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,41:237:99:511,0,8352 -chr18 33749577 . CCCTGCAGGTGAAAAAACCAAAAGACTAAATTATTAACAGCTTTAAAAAAGCCAGCATATAAATTCACTAAAACTCCAAATCTACTAA C 14198.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.710;DP=317;FS=3.324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=33.15;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,315:316:99:14236,1157,0 -chr18 33835435 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-1.176;DP=72;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:495,0,1957 -chr18 33854305 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.736;DP=68;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:406,0,1971 -chr18 33914949 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.988;DP=55;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:263,0,1652 -chr18 33940534 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.465;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:317,0,1462 -chr18 34148054 . A C 3782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-2.403;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,81:224:99:3811,0,8644 -chr18 34148229 . G A 1622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=-2.206;DP=255;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,73:254:99:1651,0,8233 -chr18 34154124 . A G 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.755;DP=365;FS=2.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,64:365:99:881,0,11665 -chr18 34154518 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-0.443;DP=319;FS=9.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:425,0,9858 -chr18 34167547 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.537;DP=225;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,49:225:99:923,0,6779 -chr18 34167716 . G A 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=-0.054;DP=265;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=4.92;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,61:238:99:1332,0,6664 -chr18 34169537 . C T 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.408;DP=266;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,71:265:99:1593,0,7437 -chr18 34219489 . A G 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=1.547;DP=138;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,44:137:99:1227,0,3347 -chr18 34226096 . C CA 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.738;DP=101;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=2.14;ReadPosRankSum=2.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:253,0,2012 -chr18 34234199 . G C 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=-0.020;DP=69;FS=5.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:568,0,1794 -chr18 34237943 . G GT 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.355;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,27:85:99:483,0,1524 -chr18 34238437 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-1.508;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.256;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,29:87:99:770,0,3971 -chr18 34963111 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.669;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:330,0,1866 -chr18 34970576 . T A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.838;DP=88;FS=2.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:257,0,2647 -chr18 35004541 . T A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=-3.218;DP=63;FS=6.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=14.69;ReadPosRankSum=2.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:954,0,1283 -chr18 35008272 . C T 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.920;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=13.49;ReadPosRankSum=2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,47:117:99:1607,0,2351 -chr18 35028837 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.182;DP=152;FS=10.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,26:148:99:364,0,4621 -chr18 35029444 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-0.165;DP=155;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:487,0,4765 -chr18 35041902 . G A 1361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.099;DP=155;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,51:155:99:1390,0,3944 -chr18 35044805 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.007;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,31:143:99:550,0,4384 -chr18 35052157 . G A 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.553;DP=167;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,55:167:99:1534,0,4180 -chr18 35070399 . ATG A 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=31.26;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:99:554,0,958 -chr18 35070585 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=1.228;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:241,0,1270 -chr18 35070992 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.184;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:369,0,153 -chr18 35071091 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.003;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:348,0,169 -chr18 35075553 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.820;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:503,0,687 -chr18 35133691 . A C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=3.522;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.59;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:235,0,1070 -chr18 35142521 . GC G 517.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.484;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:555,0,1746 -chr18 35209078 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:307,0,97 -chr18 35210605 . A T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=1.085;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:443,0,362 -chr18 35222470 . T C 830.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-1.045;DP=31;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:16:859,0,16 -chr18 35227425 . G A 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr18 35531082 . C T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-0.636;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:535,0,881 -chr18 35531122 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-1.050;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:446,0,738 -chr18 35540283 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.043;DP=54;FS=1.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:229,0,1643 -chr18 35543107 . T G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=1.142;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:473,0,355 -chr18 35543860 . T TA 252.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=2.041;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:30:290,0,30 -chr18 35544764 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-1.723;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:443,0,470 -chr18 35559566 . T A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.513;DP=58;FS=6.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.410;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:410,0,1466 -chr18 35559578 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.246;DP=64;FS=5.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:436,0,1657 -chr18 35559827 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.798;DP=57;FS=6.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=9.08;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:546,0,3000 -chr18 35563320 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-1.715;DP=63;FS=7.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:502,0,3295 -chr18 35563347 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=1.043;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:513,0,1866 -chr18 35574091 . AT A 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=-3.398;DP=93;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:704,0,1427 -chr18 35583204 . C G 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-1.737;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,2:21:99:701,0,1784 -chr18 35583228 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.764;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,2:31:99:700,0,1861 -chr18 35583339 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.042;DP=37;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=5.94;ReadPosRankSum=-2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:248,0,2668 -chr18 35617568 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=-1.607;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=12.38;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:350,0,566 -chr18 35624076 . T TTA 2903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.388;DP=177;FS=2.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,91:165:99:2941,0,2877 -chr18 35624266 . A T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.246;DP=181;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,38:181:99:800,0,5501 -chr18 35624821 . A T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-0.326;DP=133;FS=10.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,30:133:99:632,0,4122 -chr18 35695023 . C T 2930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=3.066;DP=274;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=10.70;ReadPosRankSum=-3.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,92:274:99:2959,0,6246 -chr18 35695450 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-0.053;DP=129;FS=6.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,22:129:99:311,0,4283 -chr18 36697641 . C A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=3.893;DP=342;FS=7.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=1.41;ReadPosRankSum=-4.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,54:341:99:509,0,10722 -chr18 37187471 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:307,0,223 -chr18 37192969 . C T 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.751;DP=91;FS=0.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.245;QD=5.94;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:569,0,2341 -chr18 37197358 . GA G 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=-2.058;DP=57;FS=3.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:429,0,722 -chr18 37198941 . CAA C 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.532;DP=60;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:504,0,1096 -chr18 37202058 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.409;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:239,0,1298 -chr18 37202093 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=1.858;DP=53;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:501,0,1348 -chr18 37202402 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=-0.472;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:289,0,2096 -chr18 37202418 . C CT 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=1.149;DP=71;FS=7.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=5.67;ReadPosRankSum=-2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:440,0,1893 -chr18 37202629 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.185;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:412,0,1060 -chr18 37212200 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=1.268;DP=61;FS=3.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:867,0,1245 -chr18 37270725 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-1.606;DP=36;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:580,0,633 -chr18 37271257 . G C 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.895;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:593,0,814 -chr18 37271934 . C T 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-1.051;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=14.17;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:822,0,1080 -chr18 37291664 . C T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.012;DP=45;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=20.37;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:945,0,632 -chr18 37291747 . C CT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=1.285;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:64:456,0,64 -chr18 37331645 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.252;DP=98;FS=9.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:347,0,6082 -chr18 37331646 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=-0.318;DP=98;FS=7.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=3.16;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:338,0,6098 -chr18 37331658 . T C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.302;DP=88;FS=11.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,29:88:99:829,0,2302 -chr18 37332593 . T C 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-1.182;DP=153;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,31:153:99:535,0,4152 -chr18 37332804 . G T 3484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.243;DP=161;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=21.64;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,78:159:99:3513,0,2658 -chr18 37332891 . T A 2447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-2.908;DP=140;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,75:140:99:2476,0,3711 -chr18 37333809 . G A 4688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-2.697;DP=120;FS=8.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=29.51;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:4717,0,3665 -chr18 37334017 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.222;DP=111;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,18:110:99:243,0,3603 -chr18 37334094 . A T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-4.380;DP=83;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:515,0,6670 -chr18 37334529 . C CT 527.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.879;DP=188;FS=2.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.874;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,42:164:99:583,0,2387 -chr18 37334865 . G A 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=-0.705;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,40:89:99:1369,0,1603 -chr18 37438388 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-0.138;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:482,0,502 -chr18 37438409 . C A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=1.043;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=16.66;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:478,0,485 -chr18 37448272 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.152;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:496,0,473 -chr18 37482133 . A T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:24:357,24,0 -chr18 37482465 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.270;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.61;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:342,0,247 -chr18 37483715 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:271,0,55 -chr18 37483812 . A G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.041;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=29.85;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:72:655,0,72 -chr18 37483913 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=14.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:394,0,376 -chr18 37484159 . T A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:340,24,0 -chr18 37484490 . TTA T 312.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:25:350,25,0 -chr18 37487037 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.628;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=18.64;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:718,0,561 -chr18 37555762 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.222;DP=116;FS=1.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:99:546,0,3574 -chr18 37609618 . A G 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.828;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.331;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,56:160:99:1880,0,3824 -chr18 37610066 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=-2.210;DP=70;FS=11.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:259,0,2274 -chr18 37611533 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-1.213;DP=220;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,36:220:99:413,0,6924 -chr18 37613574 . A G 4237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=1.407;DP=238;FS=5.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.81;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,119:238:99:4266,0,7501 -chr18 37623904 . T A 1377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.418;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,39:103:99:1406,0,2261 -chr18 37730610 . T C 2458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=1.658;DP=213;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,75:212:99:2487,0,4607 -chr18 37748871 . G A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.928;DP=175;FS=2.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=8.74;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,57:175:99:1558,0,4493 -chr18 37800290 . T C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.874;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:541,0,2434 -chr18 37813906 . C T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-1.956;DP=66;FS=4.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:837,0,1267 -chr18 37820256 . T TC 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=-1.409;DP=51;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:277,0,912 -chr18 37820748 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=9.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=18.56;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:418,0,321 -chr18 37821205 . A T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.493;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=33.09;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:657,0,107 -chr18 37821348 . T A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-2.392;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=23.60;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:335,0,260 -chr18 37822179 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.147;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:884,0,162 -chr18 37822427 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.627;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=13.42;ReadPosRankSum=2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:404,0,560 -chr18 37824301 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=1.945;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:285,0,495 -chr18 37825010 . A T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.729;DP=54;FS=8.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:376,0,2413 -chr18 37825182 . GA G 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=1.041;DP=38;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:650,0,242 -chr18 37826629 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-2.777;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.740;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:328,0,1475 -chr18 37854135 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.080;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,18:86:99:339,0,2465 -chr18 37872347 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-3.406;DP=99;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,17:98:99:279,0,3190 -chr18 37894843 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.271;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:261,0,2505 -chr18 37897598 . G A 1456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.143;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,44:121:99:1485,0,2537 -chr18 38673707 . ACAGGTAAAATAAATTGTCACAGTGACCTCCCACAAAAATCTCCACATGGAAACAGATTGAATAGTGGTGAATTTCTTATACCTT A 2635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=3.020;DP=74;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,66:74:99:2673,0,1025 -chr18 38677150 . C T 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.713;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=8.74;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,43:130:99:1165,0,3278 -chr18 38680821 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.373;DP=124;FS=10.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,21:123:99:259,0,3974 -chr18 38681481 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-2.988;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.97;ReadPosRankSum=2.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:518,0,2960 -chr18 38682008 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.255;DP=93;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:1081,0,2051 -chr18 38682062 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.954;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:848,0,2337 -chr18 38683401 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.405;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,309 -chr18 38684170 . CA C 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-0.928;DP=93;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:442,0,1619 -chr18 38790137 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=-0.126;DP=32;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:269,0,1846 -chr18 39007700 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.287;DP=46;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:876,0,774 -chr18 39059136 . CA C 1353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-1.518;DP=98;FS=10.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:1391,0,477 -chr18 39449757 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,337 -chr18 39459706 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.120;DP=28;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:291,0,772 -chr18 39651060 . G GT 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-2.151;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:336,0,2192 -chr18 39704195 . C CAA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.475;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=9.57;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:391,0,223 -chr18 39704554 . AT A 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:285,0,276 -chr18 39704838 . C G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:291,0,417 -chr18 39860174 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-0.546;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:522,0,504 -chr18 39933193 . G GA 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.362;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:392,0,446 -chr18 39933196 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:392,0,446 -chr18 39933295 . T TC 1534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.849;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,73:128:99:1572,0,1306 -chr18 39933655 . A C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=1.258;DP=78;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=13.54;ReadPosRankSum=4.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:1084,0,1695 -chr18 39982616 . G C 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=-2.656;DP=281;FS=10.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=5.59;ReadPosRankSum=2.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,70:281:99:1599,0,13162 -chr18 39982620 . G A 5479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=3.085;DP=272;FS=5.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,156:272:99:5508,0,4211 -chr18 39982776 . A G 4486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4515,333,0 -chr18 39982878 . C CA 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-2.152;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,32:128:99:409,0,2656 -chr18 39983026 . A T 15909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=-2.337;DP=241;FS=2.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,155:241:99:15938,0,1155 -chr18 39983132 . A G 15909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,268:268:99:15938,0,1134 -chr18 39983268 . G A 4743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.895;DP=221;FS=3.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=21.47;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,142:221:99:4772,0,2615 -chr18 39983499 . A G 4428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=-0.083;DP=123;FS=18.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=30.18;ReadPosRankSum=-2.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,99:120:99:4457,0,225 -chr18 39983551 . A T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.727;DP=118;FS=8.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,32:115:99:470,0,4129 -chr18 39983779 . T C 9130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,221:221:99:9159,664,0 -chr18 39983914 . T A 3041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3131,214,0 -chr18 39983915 . T C 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-1.373;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=31.23;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,56:69:99:2183,0,224 -chr18 41668726 . GA G 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-1.528;DP=21;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=33.94;ReadPosRankSum=2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:750,0,328 -chr18 42268949 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=2.424;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=15.91;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:235,0,211 -chr18 42269737 . TAA T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,254 -chr18 42270145 . T TA 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.740;DP=22;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=22.49;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:532,0,163 -chr18 42281094 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=25.81;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:82:338,0,82 -chr18 42298093 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.835;DP=53;FS=3.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:685,0,1094 -chr18 42299385 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.018;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:492,0,641 -chr18 42309569 . G C 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.455;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:635,0,483 -chr18 42454617 . C CTT 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=-2.378;DP=137;FS=6.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=4.87;ReadPosRankSum=5.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,36:97:99:705,0,4616 -chr18 42502057 . A C 2965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.466;DP=358;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,107:358:99:2994,0,19234 -chr18 42502064 . A T 2962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=1.180;DP=333;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=8.90;ReadPosRankSum=-2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,100:333:99:2991,0,19269 -chr18 42722237 . A G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-1.402;DP=39;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:809,0,623 -chr18 42722539 . TTA T 278.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:316,22,0 -chr18 42723158 . C T 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:317,24,0 -chr18 42723457 . TA T 878.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.619;DP=37;FS=2.200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:42:916,42,0 -chr18 42749572 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=23.28;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:261,0,105 -chr18 42762757 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.302;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:606,0,994 -chr18 42764907 . T G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.846;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:766,0,127 -chr18 42771585 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.624;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=12.48;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:615,0,1042 -chr18 42781302 . C A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-0.981;DP=84;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:488,0,2541 -chr18 42782249 . T C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=-0.496;DP=31;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:402,0,1519 -chr18 42784081 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=-1.895;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=5.99;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,28:106:99:663,0,3001 -chr18 42813985 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.144;DP=130;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,26:129:99:475,0,3971 -chr18 42949594 . A G 1557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=1.107;DP=200;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,61:200:99:1586,0,5377 -chr18 42968647 . C T 2161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.544;DP=183;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,65:183:99:2190,0,4101 -chr18 42974205 . G C 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=-1.070;DP=192;FS=10.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=11.50;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,65:192:99:2237,0,4403 -chr18 42976907 . C T 2729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.112;DP=233;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,80:233:99:2758,0,5595 -chr18 42980984 . C CT 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.690;DP=109;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:857,0,1624 -chr18 42990918 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.158;DP=16;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,286 -chr18 43035295 . TCTACAAACAAAACACAAGACATGTAAATGACTCGGTAAAGACCAAATCTATTCAAGACAGTTAAATCATCAACACTGAGATAATTAGACCACAAATAAAACCCCTAC T 14935.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.358;DP=376;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=29.60;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,356:364:99:14973,1159,0 -chr18 43049259 . C T 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.098;DP=53;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=17.05;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,26:53:99:932,0,1002 -chr18 43050042 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.193;DP=48;FS=9.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.801;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:384,0,1296 -chr18 43050297 . A G 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=1.653;DP=52;FS=2.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:603,0,1717 -chr18 43054742 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=2.060;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:232,0,1107 -chr18 43061011 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-0.529;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:270,0,917 -chr18 43062437 . G C 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.556;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:764,0,805 -chr18 43070185 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.174;DP=76;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:529,0,3020 -chr18 43070363 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-0.429;DP=94;FS=4.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:545,0,2645 -chr18 43070381 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.609;DP=104;FS=8.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:422,0,2844 -chr18 43079615 . C T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.293;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,27:86:99:724,0,3668 -chr18 43079699 . AT A 1039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-1.319;DP=76;FS=6.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:1077,0,6212 -chr18 43112751 . C T 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.932;DP=182;FS=2.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,60:182:99:1589,0,4708 -chr18 43125286 . C T 1193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.455;DP=71;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1222,0,1185 -chr18 43126945 . C T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=3.581;DP=38;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:708,0,743 -chr18 43128134 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.165;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,474 -chr18 43128863 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.938;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:230,0,1091 -chr18 43187287 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=1.110;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:249,0,1121 -chr18 43195671 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=1.830;DP=27;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:483,0,431 -chr18 43200426 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.767;DP=38;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:453,0,839 -chr18 43207973 . C A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.880;DP=41;FS=4.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:497,0,1010 -chr18 43218450 . G C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.006;DP=95;FS=3.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:548,0,2640 -chr18 43226521 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.070;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:99:516,0,3367 -chr18 43236603 . AAGGTTAGAACGGCTTTCATGTTGCATGCTAAAGGCCCTTGAATTTAGCATGACGACACTTTAAACTACTTCCTTCCTTCTTTCCTTC A 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=2.944;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:285,0,10525 -chr18 43237108 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=-0.730;DP=68;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:449,0,1881 -chr18 43243758 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=-0.894;DP=162;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:475,0,4905 -chr18 43645119 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=1.126;DP=40;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:318,0,1762 -chr18 43645206 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=1.135;DP=53;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=6.32;ReadPosRankSum=1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:363,0,1370 -chr18 43674312 . G T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.394;DP=43;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:534,0,1536 -chr18 43676856 . T C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=1.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:374,0,2748 -chr18 43985122 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.005;DP=83;FS=2.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:572,0,4632 -chr18 43985127 . G T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.090;DP=81;FS=2.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:572,0,4632 -chr18 43992949 . C T 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.551;DP=72;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=12.72;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:944,0,1431 -chr18 43995692 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=1.728;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:592,0,2722 -chr18 43997020 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.431;DP=61;FS=8.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:252,0,3958 -chr18 44065740 . T C 3152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=-8.757;DP=277;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,71:140:99:3181,0,1311 -chr18 44088156 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.849;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:325,0,340 -chr18 44099455 . C T 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-1.814;DP=53;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:848,0,986 -chr18 44101070 . C CA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.119;DP=36;FS=5.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:248,0,528 -chr18 44102034 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.722;DP=39;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:769,0,608 -chr18 44112210 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.103;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.628;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,286 -chr18 44136634 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:441,0,230 -chr18 44228365 . T C 2689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.093;DP=91;FS=7.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,66:91:99:2718,0,1482 -chr18 44228366 . T C 2689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.130;DP=88;FS=6.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=30.57;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,63:88:99:2718,0,1510 -chr18 44231567 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.058;DP=79;FS=6.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:594,0,1969 -chr18 44231620 . T A 2087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.048;DP=116;FS=0.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,62:115:99:2116,0,1958 -chr18 44231992 . CTT C 664.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.982;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=11.87;ReadPosRankSum=2.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:865,0,744 -chr18 44239372 . C T 5431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.554;DP=208;FS=0.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.026;QD=26.11;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,145:207:99:5460,0,1507 -chr18 44239410 . G A 5409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.129;DP=223;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=24.26;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,154:223:99:5438,0,1712 -chr18 44266727 . T C 4337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-0.783;DP=204;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=21.26;ReadPosRankSum=2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,127:204:99:4366,0,2603 -chr18 44299715 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=30.40;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:393,0,295 -chr18 44299718 . G C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.344;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:393,0,295 -chr18 44299904 . A T 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=-2.165;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:325,0,266 -chr18 44416291 . G T 1364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.728;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=21.32;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,41:64:99:1393,0,788 -chr18 44419761 . CGGTAAGCAAAACACTTCTTTTGTGTCCAACAGAAGAAATAAACTCATAAAAACCACATGAGGAAGAACTAATGAGGAGGTAATTTTCCATTTTTGGTGAACTATCCCTTTAATTATAACAGTAACAAAGCATTTACACTGTTTTCCCCCTCCTGCATTGTTAAAGCGTATGCTAGTTTCCATCTTGTGCTTGCAAATTTGCTTCA C 1724.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=2.348;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=34.49;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1762,0,2813 -chr18 44453004 . A T 204.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:233,0,23 -chr18 44453631 . GCCTGAGTTTCAAATATAAGGTAATAATGAGCATGTGACCTAATGTAGTTTGAACAAGAGAAACAAACAGACTGTCCACACA G 2132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.667;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2170,179,0 -chr18 44475937 . C G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.441;DP=51;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:943,0,975 -chr18 44574259 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-1.882;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:602,0,374 -chr18 44574690 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=28.56;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:371,0,175 -chr18 44575013 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.227;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=24.67;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:423,0,171 -chr18 44580794 . T C 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.039;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:1341,0,698 -chr18 44581083 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.224;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=18.83;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:499,0,774 -chr18 44619016 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-1.472;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:237,0,1258 -chr18 44619504 . T C 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 -chr18 44620163 . A T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-1.807;DP=95;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,21:95:99:507,0,6132 -chr18 44620177 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.503;DP=84;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:503,0,6132 -chr18 44621122 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.102;DP=77;FS=3.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=5.45;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:448,0,7221 -chr18 44621139 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.565;DP=70;FS=3.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=6.01;ReadPosRankSum=-2.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:449,0,7221 -chr18 44625087 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=12.61;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:230,0,310 -chr18 44626299 . T G 825.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:854,63,0 -chr18 44627489 . C T 360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:389,30,0 -chr18 44627980 . T C 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=2.706;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=25.77;ReadPosRankSum=-2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:621,0,185 -chr18 44628149 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:278,0,545 -chr18 44632542 . C A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=29.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:296,0,228 -chr18 44669423 . C T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=2.064;DP=28;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:732,0,170 -chr18 44681606 . CCCTATTGGACGAACGCATCACTTGGGTAAGTCACTAATGCCATGCATTATTCAATAATAATTCAGAGAACTTCCCATCAGA C 1728.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.561;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=28.36;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:99:1766,146,0 -chr18 44759744 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.538;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:263,0,712 -chr18 44759838 . G C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:355,0,568 -chr18 44760099 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.675;DP=31;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:246,0,861 -chr18 44776753 . C T 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=-0.184;DP=98;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=13.21;ReadPosRankSum=2.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,40:98:99:1323,0,1902 -chr18 45039188 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.133;DP=36;FS=7.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:281,0,844 -chr18 45039389 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-2.753;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:287,0,1003 -chr18 45039681 . A G 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.532;DP=50;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:582,0,1224 -chr18 45040751 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=21.40;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:285,0,216 -chr18 45041413 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:488,0,217 -chr18 45042083 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.425;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=28.86;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:97:615,0,97 -chr18 45042579 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=1.550;DP=20;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=25.79;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:544,0,154 -chr18 45042810 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-2.855;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:361,0,136 -chr18 45042811 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,315 -chr18 45043289 . TC T 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.718;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:291,0,125 -chr18 45043443 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:295,0,448 -chr18 45093369 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.639;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:718,0,124 -chr18 45260992 . CTGAAGGATAGAAGAA C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:285,0,574 -chr18 45261009 . CACCTGAGCATCCATCTCTTTCTTCTTTCTGTTTTGCTGAATATATAAATCTGTACATTCAAACCTT C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:285,0,574 -chr18 45753043 . G A 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.447;DP=115;FS=2.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,47:115:99:1565,0,2269 -chr18 45790229 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=1.738;DP=30;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:316,0,745 -chr18 47079716 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=2.616;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:382,0,129 -chr18 47091915 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=4.600;DP=37;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=6.45;ReadPosRankSum=-1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:267,0,1981 -chr18 47237288 . C A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.725;DP=55;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,32:55:99:1105,0,758 -chr18 47240540 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.293;DP=30;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:436,0,692 -chr18 47242107 . A C 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-2.544;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1168,0,878 -chr18 47242291 . T G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=2.091;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:247,0,2138 -chr18 47242297 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=2.192;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:247,0,2138 -chr18 47242457 . A T 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.944;DP=45;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:99:811,0,777 -chr18 47248522 . G A 5269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.550;DP=269;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,160:269:99:5298,0,3804 -chr18 47256207 . G A 2865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=-2.043;DP=168;FS=1.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.798;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,89:166:99:2894,0,2649 -chr18 47268519 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:275,0,257 -chr18 47271543 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr18 47271546 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr18 47284237 . G T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:402,0,402 -chr18 47285354 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:309,0,260 -chr18 47285812 . C G 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.077;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:343,0,216 -chr18 47304543 . G C 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-0.941;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:630,0,867 -chr18 47304815 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.313;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:288,0,178 -chr18 47305649 . A AC 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.739;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:308,0,310 -chr18 47305764 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.471;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:600,0,879 -chr18 47305800 . T TA 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.755;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:460,0,277 -chr18 47310386 . C T 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=-1.159;DP=50;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=20.50;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,31:50:99:1053,0,679 -chr18 47319186 . T C 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.778;DP=60;FS=3.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1030,0,1019 -chr18 47357054 . GCTGCGATAAAACAAAACCCAACACTTCAGAACATGCAAACATACTTATGTTGAATTCATCTAAAATAAGTTAACCAATCATAC G 19358.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=429;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,419:419:99:19396,1547,0 -chr18 47395606 . G T 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr18 47437402 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=1.093;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,464 -chr18 47437404 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,464 -chr18 47438301 . C T 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -chr18 47502309 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.596;ClippingRankSum=-1.157;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=8.58;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:500,0,1202 -chr18 47502551 . A T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-2.519;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:500,0,1436 -chr18 47716506 . T C 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.985;DP=39;FS=5.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:523,0,817 -chr18 47716767 . C A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.813;DP=34;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:273,0,840 -chr18 47779729 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-0.490;DP=59;FS=3.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:955,0,932 -chr18 47784910 . T C 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.811;DP=51;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:99:1438,0,258 -chr18 47806650 . A T 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.421;DP=45;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=17.11;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:798,0,1682 -chr18 47806656 . G A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.402;DP=43;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:798,0,1723 -chr18 47818992 . C G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=1.275;DP=55;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:507,0,1376 -chr18 47883926 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.600;DP=36;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:435,0,718 -chr18 47886121 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-1.208;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=15.43;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:522,0,573 -chr18 47886388 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=-0.589;DP=32;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:625,0,418 -chr18 47906828 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=11.09;ReadPosRankSum=-1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,601 -chr18 48058813 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-0.245;DP=35;FS=9.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:230,0,949 -chr18 48065903 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.722;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:417,0,418 -chr18 48085144 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.907;DP=44;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:280,0,1207 -chr18 48097427 . C A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=-0.850;DP=66;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:523,0,936 -chr18 48097587 . T G 486.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.537;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:26:515,0,26 -chr18 48097793 . C G 903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-1.081;DP=55;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=16.43;ReadPosRankSum=3.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:932,0,1015 -chr18 48117878 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=2.468;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:301,0,305 -chr18 48118051 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.648;DP=37;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=7.83;ReadPosRankSum=-1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:318,0,1364 -chr18 48164436 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.151;DP=173;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,31:172:99:497,0,5492 -chr18 48272823 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr18 48273053 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr18 48893521 . C T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-1.092;DP=40;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:463,0,844 -chr18 49382595 . TGGTGTGTTTAGAGCTCATTTCTGATGAGACATTCCTGAATTATATTCTGTCTGTGATGTGTTTCTGCATCTTTTA T 5890.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=2.410;DP=172;FS=3.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=34.25;ReadPosRankSum=-3.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,158:172:99:6500,0,1538 -chr18 49386346 . C T 2220.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2249,154,0 -chr18 49386351 . G A 2220.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2249,154,0 -chr18 49693195 . CGTGT C 242.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=18;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:280,0,165 -chr18 49802011 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.026;DP=76;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1055,0,1339 -chr18 49806500 . GGT G 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=-0.198;DP=34;FS=7.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:600,0,598 -chr18 49808495 . ACCAGGTATGTGTGTATATATCTGCAGCGGGGGGCAGAGGTCATGTGCAGGTCAGAGGTCATGTGCTGTTGTCTGCTGT A 7700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.684;DP=250;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=30.80;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,223:226:99:7738,628,0 -chr18 49810050 . G A 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-0.595;DP=238;FS=1.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=6.90;ReadPosRankSum=2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,63:237:99:1671,0,6533 -chr18 49843384 . A G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr18 49846473 . T C 2616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.105;DP=129;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=20.29;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,81:129:99:2645,0,1571 -chr18 49854694 . TCTGAAGATGATCACGCACACACACACACATCAGTGACAGAAGAGCAGCGGTACACACTCACACACGCTCACACTCAC T 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=28.52;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:674,0,623 -chr18 49874558 . AAGGTCCACATCCCCACTGTAACACTGATACTCCCACCACTGTACACACACACACACACACACACACACACCGTCTCCTCCTCTCAGTGTGTTCTCTTCTTCATTCT A 10518.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=3.212;DP=298;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,259:271:99:10556,779,0 -chr19 8726 . TCCTACACAAACACACACACACACAAACACACACACACACACACACAGAGCAGTGTGAGCGGCTGCAGGACAGTGCCACCTGCAGGAGAGTCTGCTGCTCTTCA T 5075.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=2.746;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=32.64;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,120:134:99:5113,0,259 -chr19 28653 . CGTAAGTGTGGCCATCCTTTGACAGACATTGAAGATGTTTTCAGATTGTGAGTCTCTAACCCTGACATGTGTCTCTCTGCAG C 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:337,0,684 -chr19 61686 . C CTG 699.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.168;DP=140;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,31:75:99:737,0,1121 -chr19 61821 . A AGTGT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=2.272;DP=96;FS=5.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:696,0,1035 -chr19 64033 . GCCTGCGGAGCGGATGGTGAGTGTGTGTGAGAGAGAGAATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGACTCA G 12032.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.380;DP=308;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=28.34;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,305:308:99:13061,1017,0 -chr19 68669 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49:288,0,49 -chr19 69051 . T C 1095.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.139;DP=27;FS=9.890;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:37:1124,37,0 -chr19 69067 . A G 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-1.396;DP=31;FS=13.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:44:954,0,44 -chr19 74390 . T C 3746.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=-1.960;DP=109;FS=2.745;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=34.37;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,97:108:88:3775,88,0 -chr19 76305 . AACCTGCGGAGCACAGCGGACGCTCACACACACACACACACACGGGGAACACTGCTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGAGCTCC A 11252.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.101;DP=271;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=28.97;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,261:271:99:11290,926,0 -chr19 77116 . T G 544.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:573,39,0 -chr19 78043 . C T 4841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.249;DP=153;FS=3.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=31.65;ReadPosRankSum=3.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,131:152:96:4870,0,96 -chr19 78275 . G A 934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.734;DP=24;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:963,69,0 -chr19 78579 . T C 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=1.807;DP=70;FS=4.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=29.91;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,59:70:99:2122,0,116 -chr19 78657 . T C 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=-1.090;DP=31;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=31.70;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:43:1011,0,43 -chr19 79098 . A C 3053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-2.453;DP=96;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=31.81;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,82:95:94:3082,0,94 -chr19 79164 . T C 4510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-2.582;DP=149;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=30.27;ReadPosRankSum=2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,122:148:99:4539,0,385 -chr19 79300 . C T 4660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.630;DP=153;FS=11.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=30.46;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,125:153:99:4689,0,337 -chr19 79315 . A G 4362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=-0.300;DP=149;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=29.28;ReadPosRankSum=2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,120:149:99:4391,0,333 -chr19 80782 . C T 1518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=-3.928;DP=70;FS=15.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=21.70;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,45:68:99:1547,0,682 -chr19 81587 . C T 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.775;ClippingRankSum=-4.966;DP=64;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.735;QD=17.90;ReadPosRankSum=-4.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,38:63:99:1174,0,749 -chr19 81628 . T C 3044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-3.662;DP=121;FS=10.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,87:120:99:3073,0,689 -chr19 131744 . AACAGTGTTAGTAGTGTTGTCATAGAGACAGTGTAAGTAGTGTTGTCATAGAG A 629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=4.757;DP=57;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=11.05;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:667,0,6276 -chr19 328732 . G A 1757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.227;DP=210;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,69:210:99:1786,0,4960 -chr19 382009 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-1.424;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:376,0,705 -chr19 384747 . C A 2837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:2866,0,946 -chr19 384748 . A G 3906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:99:3935,0,440 -chr19 384828 . T C 3908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=-2.464;DP=164;FS=7.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=23.83;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,73:93:99:3937,0,360 -chr19 384832 . G A 3906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=-1.715;DP=178;FS=5.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,82:103:99:3935,0,449 -chr19 384923 . G C 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.199;DP=247;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,43:162:99:997,0,4544 -chr19 385002 . A C 16779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.651;DP=180;FS=4.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=29.93;ReadPosRankSum=4.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,122:134:99:16808,0,1002 -chr19 385075 . C T 16780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-1.645;DP=317;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.158;QD=28.77;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,147:241:99:16809,0,958 -chr19 385120 . T G 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.915;DP=359;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,72:261:99:1436,0,10266 -chr19 385202 . T C 16780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,190:190:99:16809,0,980 -chr19 385284 . C G 1093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=-0.141;DP=68;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.08;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:1122,0,295 -chr19 385293 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=2.361;DP=73;FS=10.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:388,0,1133 -chr19 385314 . GC G 958.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=-1.714;DP=48;FS=2.884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:17:43:996,43,0 -chr19 385319 . T C 873.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-1.667;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,14:16:2:900,2,0 -chr19 529258 . A G 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr19 546081 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.476;DP=88;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:479,0,2043 -chr19 991087 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.803;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:230,0,449 -chr19 1247610 . CA C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.166;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:63:99:535,0,459 -chr19 1248313 . G GT 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.237;DP=66;FS=4.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:485,0,901 -chr19 1955362 . A C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-2.016;DP=32;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:576,0,603 -chr19 1978658 . G GT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-1.802;DP=495;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,75:456:99:273,0,10608 -chr19 2012613 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=1.485;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.499;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:297,0,1032 -chr19 2012622 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=2.354;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:297,0,976 -chr19 2442453 . G GCA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=1.067;DP=19;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.83;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:357,0,180 -chr19 2735769 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.394;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:279,0,1023 -chr19 2735832 . T A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.602;DP=83;FS=3.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:343,0,2204 -chr19 2761500 . G A 373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:402,41,0 -chr19 2780204 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr19 2786523 . C T 890.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:919,72,0 -chr19 2786934 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:87:252,0,87 -chr19 2787108 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr19 2791074 . T A 690.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.819;DP=20;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=34.54;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:22:719,22,0 -chr19 2791365 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.08;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:85:259,0,85 -chr19 2791520 . A C 782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:811,57,0 -chr19 2801319 . T A 11192.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:220:99:11221,801,0 -chr19 2801369 . G T 2684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.264;DP=220;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,82:220:99:2713,0,4895 -chr19 2801500 . T A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=6.974;DP=163;FS=17.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=5.66;ReadPosRankSum=-3.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,44:163:99:951,0,4534 -chr19 2801524 . C T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=-1.291;DP=187;FS=8.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=5.07;ReadPosRankSum=-6.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,47:187:99:976,0,5260 -chr19 2801601 . A T 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=-0.243;DP=153;FS=8.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=9.90;ReadPosRankSum=-4.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,57:153:99:1543,0,4241 -chr19 2801624 . T G 5232.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:5261,385,0 -chr19 2801743 . CCA C 4113.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.37;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:4151,284,0 -chr19 2801869 . G T 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.583;DP=209;FS=9.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,69:209:99:1905,0,5370 -chr19 2801886 . A C 9687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=230;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,230:230:99:9716,692,0 -chr19 2801975 . T G 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=-2.319;DP=153;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,35:152:99:620,0,4253 -chr19 2806007 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=2.019;DP=140;FS=7.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=1.90;ReadPosRankSum=4.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:294,0,4399 -chr19 2819131 . G T 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr19 2831604 . A G 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr19 2884894 . A T 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr19 2925057 . C T 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr19 2931065 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:309,0,169 -chr19 2983604 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.548;DP=53;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:297,0,1479 -chr19 2995075 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.156;DP=197;FS=2.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,28:197:99:232,0,6218 -chr19 3081402 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.267;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:301,0,897 -chr19 3086852 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.579;DP=29;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:240,0,698 -chr19 3255811 . TGGTGAGTGTTTTTAGAGAGTGTCTTCAGCCTTTACTCTTCAGATGAGTTACTGATTAATGTGTGTGTTTTCA T 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=32.02;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:79:901,79,0 -chr19 3264744 . G GA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,125 -chr19 3370852 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.487;DP=50;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:336,0,1254 -chr19 3373284 . TGTAAGATGTATTTTCGAGTTTTAAGTGTTGTTATAACTTACCATCTATGTTTTATCGATGCAGTCTGTTGTGTGATGTGTTTAACAG T 4786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=1.655;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=34.69;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,123:138:99:4824,0,3372 -chr19 3373452 . G GT 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=1.714;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=3.58;ReadPosRankSum=3.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:295,0,1173 -chr19 3644098 . A G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=1.534;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:559,0,992 -chr19 3662994 . TCCTGTTATGCAGTAAGGTGTATAATATGTCACAATATGTATATGACTGCTGTGTGATAATATACTATATGATAAATCTTCCAGAAGCTGAAACAAGCATGCAAAAGATGGTTTA T 6843.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=4.259;DP=161;FS=3.211;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.980;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,153:161:99:6881,597,0 -chr19 3700750 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.712;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:99:394,0,2370 -chr19 3704780 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=1.542;DP=75;FS=2.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,22:75:99:530,0,3538 -chr19 3711801 . C G 1714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.187;DP=134;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=12.80;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,53:134:99:1743,0,5169 -chr19 3711938 . CTGAATG C 3186.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=1.145;DP=113;FS=4.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.20;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,76:101:99:3224,0,3931 -chr19 3711951 . AGAGTCGGAGTCTGAATGT A 3186.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.810;DP=106;FS=9.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=30.06;ReadPosRankSum=2.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,76:106:99:3224,0,4086 -chr19 3784770 . G A 3502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.600;DP=477;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=7.34;ReadPosRankSum=3.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,142:476:99:3531,0,23616 -chr19 3793735 . T C 3053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.854;DP=272;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,92:263:99:3082,0,5759 -chr19 3794883 . G A 4705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=1.058;DP=256;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,146:254:99:4734,0,3644 -chr19 3794901 . G A 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.639;DP=270;FS=1.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,150:268:99:4730,0,3669 -chr19 3800739 . T TA 5000.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-0.942;DP=255;FS=3.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=19.61;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,168:248:99:5038,0,1342 -chr19 3829552 . G C 389.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:418,30,0 -chr19 4268805 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=1.206;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=12.05;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:474,0,806 -chr19 4268817 . G A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=1.538;DP=32;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:394,0,669 -chr19 4278343 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.216;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:339,0,573 -chr19 4289110 . A T 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=-1.178;DP=51;FS=19.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=18.00;ReadPosRankSum=4.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:946,0,971 -chr19 4289152 . C T 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-4.030;DP=80;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.41;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:941,0,1844 -chr19 4661448 . A ATT 1961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-1.473;DP=160;FS=17.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,54:157:99:1999,0,3847 -chr19 4661554 . CT C 832.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=-3.293;DP=205;FS=6.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=4.06;ReadPosRankSum=2.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,37:201:99:870,0,11688 -chr19 4661881 . GCTGCAGTGGGATGAGAGAGAGAGGGAAATTGAAACTCTCCTACTGGCCACCATGCAGCTTATTCTGTCCCATAATTGCTCACTTATTCAGGACAAGCGAAGCAACCCACCACCAGTTTTTACATGCCGTTTAAGAGGGGAGATGAATGCTAGCACAC G 1196.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=10.101;DP=307;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=3.90;ReadPosRankSum=-8.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,211:280:99:1234,0,29764 -chr19 4668800 . A G 4087.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.208;DP=285;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,120:284:99:4116,0,5282 -chr19 4674023 . A G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-3.808;DP=72;FS=11.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.791;QD=7.83;ReadPosRankSum=-3.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,22:72:99:592,0,1840 -chr19 4686174 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-1.010;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:267,0,233 -chr19 4688416 . A G 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.720;DP=50;FS=6.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:1383,0,422 -chr19 4708723 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.387;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:349,0,317 -chr19 4721176 . A C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:285,0,64 -chr19 4722517 . A G 2148.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.139;DP=38;FS=11.422;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=31.12;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:99:2177,125,0 -chr19 4722717 . C G 6123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=4.011;DP=192;FS=50.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=31.89;ReadPosRankSum=-4.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,94:161:99:6152,0,1348 -chr19 4722730 . T C 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.910;DP=155;FS=87.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=6.68;ReadPosRankSum=-5.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,36:136:99:1064,0,6382 -chr19 4722799 . G GA 1011.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=-1.255;DP=165;FS=2.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,59:161:99:1049,0,5916 -chr19 4722974 . T G 4308.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.260;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=34.20;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,112:126:28:4337,28,0 -chr19 4725174 . C A 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-2.541;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,39:102:99:1328,0,2198 -chr19 4727209 . G C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-2.344;DP=62;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:552,0,1525 -chr19 4727386 . A G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=5.006;DP=83;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:630,0,2189 -chr19 4738662 . C T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-1.011;DP=128;FS=5.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,56:128:99:1892,0,2386 -chr19 4921013 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=-1.940;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:305,0,603 -chr19 5575341 . C T 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.159;DP=113;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,49:113:99:1644,0,2105 -chr19 5579559 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-3.796;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:340,0,1003 -chr19 5582749 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-1.683;DP=46;FS=7.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=7.47;ReadPosRankSum=2.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:372,0,1224 -chr19 5601169 . GGCAGGTAACGCCATTCACTTTCATTCGGCGCAACTTGCTGTATGTATTGATTTTGCTCATAACGTTTGCATTTGTCCT G 1298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.575;DP=53;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=24.50;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:99:1336,0,747 -chr19 5625197 . TAAA T 2411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=-0.144;DP=89;FS=5.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,9:87:99:2449,0,3907 -chr19 5625199 . A AT 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=-0.501;DP=89;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:254,0,4446 -chr19 5633496 . C T 1451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.436;DP=387;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=3.75;ReadPosRankSum=-5.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,83:387:99:1480,0,11407 -chr19 5633517 . A G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=-2.383;DP=380;FS=6.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,79:380:99:1479,0,11396 -chr19 5643900 . G C 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.032;DP=412;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:332,79:411:99:1327,0,12602 -chr19 5644517 . GCTGCAAGCAGACGACCATAATTGTGTTTAAAGAAAGTGTCTATTTGTTATTAAATTAAGTTTGATTTAGCTATGCTGATCTCAC G 15159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.042;DP=383;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=23.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,379:381:99:16414,1330,0 -chr19 5652348 . C T 6401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=-0.469;DP=493;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,189:492:99:6430,0,18343 -chr19 5654265 . A G 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.147;DP=397;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,67:397:99:864,0,12708 -chr19 5659168 . G A 4427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.499;DP=366;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,132:365:99:4456,0,7883 -chr19 5666590 . G A 3758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=-3.585;DP=507;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=7.41;ReadPosRankSum=3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:358,148:506:99:3787,0,13731 -chr19 5672564 . T C 3856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-1.692;DP=446;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:300,146:446:99:3885,0,11288 -chr19 5682987 . A AT 1401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=-0.641;DP=234;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,97:165:99:1879,0,1566 -chr19 5701337 . C T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.534;DP=56;FS=3.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.008;QD=16.87;ReadPosRankSum=-2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:973,0,888 -chr19 5714103 . C G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DP=60;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:883,0,1225 -chr19 5767931 . G A 1541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=1.093;DP=91;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=16.94;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,43:91:99:1570,0,1628 -chr19 5772769 . C T 3062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.284;DP=223;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,90:221:99:3091,0,4342 -chr19 5774436 . G GT 1107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.207;DP=167;FS=3.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,74:162:99:1476,0,1894 -chr19 5774554 . T C 2719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=1.047;DP=183;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,79:183:99:2748,0,3564 -chr19 5774966 . T TA 962.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.659;DP=130;FS=3.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,54:119:99:1000,0,1478 -chr19 5775311 . CT C 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=1.730;DP=32;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:247,0,408 -chr19 5783274 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.824;DP=92;FS=8.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.446;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:421,0,6146 -chr19 5783590 . C A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.888;DP=101;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=9.81;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,40:99:99:1019,0,3531 -chr19 5783776 . A AT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=-0.031;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:573,0,571 -chr19 5786351 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.263;DP=97;FS=4.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.245;QD=4.64;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:478,0,2855 -chr19 5787104 . GA G 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.586;DP=75;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:347,0,1218 -chr19 5878705 . GA G 695.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.103;DP=101;FS=7.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,33:99:99:733,0,3532 -chr19 5878773 . C G 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.731;DP=79;FS=2.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,27:79:99:833,0,1745 -chr19 5929752 . CT C 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.991;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:401,0,401 -chr19 5934841 . A C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=-1.590;DP=30;FS=5.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:450,0,607 -chr19 5935200 . GT G 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-1.295;DP=49;FS=6.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:423,0,2576 -chr19 5940642 . T C 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=-0.347;DP=65;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1302,0,789 -chr19 5942602 . C CTG 1996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.024;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.580;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,52:122:99:2226,0,2578 -chr19 5944213 . T G 632.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-2.563;DP=49;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.053;QD=12.91;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:772,0,879 -chr19 5964377 . T G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,246 -chr19 5969899 . T G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.283;DP=343;FS=0.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,53:342:99:511,0,11332 -chr19 5969944 . C A 5852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.610;ClippingRankSum=-0.289;DP=400;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.967;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,189:397:99:5881,0,6606 -chr19 5974576 . C T 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=-0.296;DP=238;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=7.69;ReadPosRankSum=-5.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,72:237:99:1858,0,6352 -chr19 5975374 . CCTGCACAAGTAAAACTGAAATGAGTACT C 690.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=281;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:99:728,295,0 -chr19 5981080 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.460;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=4.59;ReadPosRankSum=-1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:313,0,1777 -chr19 5981257 . C T 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.188;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,42:202:99:786,0,6376 -chr19 5981502 . A G 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=-3.672;DP=344;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,63:343:99:913,0,13234 -chr19 5982034 . T TGCCTG 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.804;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=31.22;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:484,0,189 -chr19 5986949 . CACTGGAGAAATAGAAATATGAAGCATGTTACATTATTTAAATTTTTTAATATTATTATTTACATTGTT C 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=1.027;DP=468;FS=8.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,65:453:99:449,0,40411 -chr19 5986950 . ACTGGAGAAATAGAAATATGAAGCATGTTACATTATTTAAATTTTTTAATATTATTATTTACATTGTTAGCTAAAGATTTTGGGTAGTAGTTGTGTCTCAC A 14903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=1.394;DP=476;FS=19.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,372:466:99:14941,0,12155 -chr19 5987021 . TAAAGATTTTGGGTAGTAGTTGTGTCTCACGTA T 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.937;DP=484;FS=9.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=0.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:413,65:478:99:438,0,40411 -chr19 5987161 . A T 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=2.614;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=17.45;ReadPosRankSum=-2.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,49:99:99:1756,0,1800 -chr19 5987755 . TCCTGAAGAGACAAAGACAATATACTGAGCATTTGCTTGACTAATATACTTACAGAAACTATTGAATGTGAACTATTAATGAATTTA T 2899.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-2.263;DP=90;FS=23.595;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=32.22;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,71:76:99:2937,147,0 -chr19 5987961 . G C 2757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.735;DP=386;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,109:384:99:2786,0,10965 -chr19 5988131 . G T 8671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.541;DP=639;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=13.57;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:394,243:637:99:8700,0,13978 -chr19 5988166 . G A 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=8.218;DP=331;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=3.16;ReadPosRankSum=4.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,64:331:99:1075,0,12820 -chr19 5988623 . T A 3894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=1.803;DP=241;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,83:239:99:3923,0,10931 -chr19 5988630 . T G 3894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=3.948;DP=259;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=15.04;ReadPosRankSum=-4.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,102:257:99:3923,0,10800 -chr19 5992261 . G C 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.951;ClippingRankSum=12.323;DP=497;FS=129.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=1.45;ReadPosRankSum=-11.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:413,83:496:99:748,0,32841 -chr19 5992268 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=6.808;DP=421;FS=12.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=1.79;ReadPosRankSum=-6.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,19:420:99:783,0,32827 -chr19 6002880 . G T 5995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.686;DP=362;FS=14.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=16.56;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,187:355:99:6024,0,5711 -chr19 6002952 . G A 4143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-0.981;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.267;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,118:237:99:4172,0,4117 -chr19 6003348 . TCTGTTGGGGGAGAGTCATTACTGATGATGCTGTGTGATGGTATCCAACAGCAAATGTGATGATCCGGTCACCTACTTAC T 11224.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=1.756;DP=298;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.770;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,285:288:99:11262,841,0 -chr19 6004237 . TCTTCAGGAGACAACAATATTGACAAATGTCATCATACAGTCAAAAATCATTTAGAGAGCAGTTCTGCTAATCTTCATCGAATCTGCTGCTTTATTTTAGTACATTATTAGGAAGGTAAGTTAGCAAAATATAATAAGTGCTTAATATAATATAATAAATACCACATAC T 14228.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=1.968;DP=321;FS=4.300;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,315:320:99:14266,1165,0 -chr19 6004568 . G A 3415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=1.730;DP=258;FS=43.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,99:257:99:3444,0,5681 -chr19 6004715 . G A 3966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=-4.316;DP=325;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=12.21;ReadPosRankSum=3.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,119:325:99:3995,0,9081 -chr19 6044652 . AAGGTTGTCGCTGTTAAATAATTGACACTCTAAAGTGGTTTACGGTTACAAGTGTGGGCCATTTTTAACATCCTCATTTGCATCCAC A 14183.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.576;DP=374;FS=1.995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=27.46;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,357:361:99:14221,1042,0 -chr19 6045323 . A T 3595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.005;DP=288;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,107:287:99:3624,0,8762 -chr19 6230107 . CA C 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.941;DP=51;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:856,0,565 -chr19 6242776 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=4.699;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=5.59;ReadPosRankSum=-2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:302,0,1413 -chr19 6243350 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=4.587;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=10.28;ReadPosRankSum=-2.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:491,0,1070 -chr19 6243580 . T C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.670;DP=41;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:728,0,665 -chr19 6301118 . AGTAGGTTCTTCAATCTACTCACACCCAACACAACCATCTATCGTATTAAAGAAATATTGAACCATTATATTCATGTTGTTGTTTTAATCGTTTTCCCCCAG A 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.369;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=34.70;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:523,0,650 -chr19 6309637 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:305,0,54 -chr19 6309735 . G C 264.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=6.532;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:17:293,17,0 -chr19 6310025 . G T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr19 6350709 . G T 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:666,48,0 -chr19 6353559 . A G 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.379;DP=48;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=21.04;ReadPosRankSum=-2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1038,0,679 -chr19 6353812 . C T 1465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.029;DP=81;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,43:80:99:1494,0,2421 -chr19 6672442 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr19 6673070 . G A 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:766,54,0 -chr19 6673168 . A C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:94:386,0,94 -chr19 6682815 . A G 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:474,36,0 -chr19 6984972 . G A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-2.483;DP=92;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,33:92:99:1111,0,1885 -chr19 7065000 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr19 7067854 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.123;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:378,0,560 -chr19 7069694 . AT A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.369;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=21.06;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:20:332,0,20 -chr19 7186083 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr19 7454408 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.933;DP=31;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.09;ReadPosRankSum=2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:465,0,580 -chr19 7468588 . A ATT 355.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 -chr19 7578507 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.872;DP=135;FS=5.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=2.66;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,24:135:99:388,0,4463 -chr19 7583396 . A G 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:275,21,0 -chr19 7583913 . G T 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 -chr19 7588182 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.619;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:273,0,175 -chr19 7620280 . A T 2794.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=1.670;DP=56;FS=3.502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=36.29;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2823,193,0 -chr19 7620831 . CGTAAGCAGGATGCTAAGGTTTTACTGAATATCATGTTTTGGTACCGTGTTTGAGTGTGTAACTTCTTTATTTTTCTCCTGTGCAG C 13650.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=1.153;DP=331;FS=10.324;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.06;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,305:308:99:13688,1052,0 -chr19 7640721 . C A 547.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:576,39,0 -chr19 7653886 . G A 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 -chr19 7664921 . T G 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:474,36,0 -chr19 7664939 . C T 612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:641,45,0 -chr19 7665017 . A G 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr19 7692434 . G C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr19 7791840 . G A 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 -chr19 7792272 . AGGGTGG A 413.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.54;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:451,36,0 -chr19 7802904 . A T 572.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:45:601,45,0 -chr19 7810710 . A T 10836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=264;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,264:264:99:10865,795,0 -chr19 8037248 . GT G 343 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.397;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:12:380,0,12 -chr19 8078548 . TA T 1672.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.351;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=23.90;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,63:70:99:1710,106,0 -chr19 8104872 . GA G 635.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-0.952;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.853;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:42:673,42,0 -chr19 8112084 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.448;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:333,0,520 -chr19 8123691 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.760;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:258,0,594 -chr19 8136877 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:263,18,0 -chr19 8136880 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr19 8141597 . CACCTGACACGGAAAACACAGCTCAGATATGAGTGCTGAAACAGTTATAACAATACATCACACAGTTATACATCAATTCACTT C 4507.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=3.032;DP=110;FS=1.350;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=31.08;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,101:110:99:4545,393,0 -chr19 8182549 . TGGTAAGTTGTTTTTTTATGAGGTCACAAATCTAAATCACATTTTATATTTGGTGAAATCATTTGCATATGACATCACATAATTCATATTCATAGTTATTATTACATGCCACATTGTGTTCTAAAGAAAGAGCATTCATTTGCTATTTTCAATGGTTGCTTTGATGTTATTGTGCCTGCA T 3207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=3.350;DP=91;FS=6.337;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=36.54;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,85:91:99:3245,314,0 -chr19 8189016 . GT G 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=-0.130;DP=51;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:372,0,712 -chr19 8189326 . AT A 1401.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1439,143,0 -chr19 8220617 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=-0.230;DP=57;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:685,0,818 -chr19 8252895 . T A 1532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.052;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=23.95;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,46:64:99:1561,0,435 -chr19 8270789 . T C 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-0.344;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:526,0,938 -chr19 8371620 . T A 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:291,20,0 -chr19 8371746 . T C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr19 8371761 . A G 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 -chr19 8426266 . G A 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:528,42,0 -chr19 8443591 . C T 1743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1772,138,0 -chr19 8589546 . A G 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr19 8589726 . A T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr19 9599946 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=2.118;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.95;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:265,0,2008 -chr19 9600721 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=1.328;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:244,0,818 -chr19 9640458 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.135;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:274,0,171 -chr19 10081660 . C CT 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=-2.296;DP=292;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=1.81;ReadPosRankSum=2.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,57:266:99:566,0,5140 -chr19 10082652 . T TA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=-0.059;DP=306;FS=0.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=0.79;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,44:241:99:278,0,4057 -chr19 10830081 . G GT 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-1.808;DP=83;FS=5.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:415,0,806 -chr19 11096364 . T C 815.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:844,57,0 -chr19 11096370 . C A 815.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:57:844,57,0 -chr19 11427965 . TCTGTAAAAGAAAATG T 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=2.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=29.14;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:99:795,0,111 -chr19 11479842 . G GA 804.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-1.933;DP=328;FS=9.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,82:294:99:842,0,5525 -chr19 11504982 . G GA 1301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.797;DP=335;FS=18.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.015;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,91:290:99:1339,0,5139 -chr19 11721691 . G GT 1247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=-2.721;DP=333;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,91:310:99:1285,0,5700 -chr19 11822262 . C CA 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.464;DP=208;FS=4.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,42:176:99:425,0,3634 -chr19 11922050 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=-0.216;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:280,0,1474 -chr19 11934696 . C T 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.513;DP=367;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,61:367:99:788,0,12005 -chr19 11947507 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.553;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:231,0,666 -chr19 12114656 . AT A 427.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.635;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:3:463,0,3 -chr19 12653264 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.938;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=5.03;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:360,0,1743 -chr19 12654262 . AT A 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=1.903;DP=18;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:260,0,166 -chr19 12654413 . T TA 573.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-2.099;DP=35;FS=3.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:611,0,124 -chr19 12975024 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.611;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:392,0,52 -chr19 13540112 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.074;DP=159;FS=0.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,29:159:99:442,0,4953 -chr19 13560154 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=1.303;DP=39;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:249,0,1119 -chr19 13735477 . G C 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr19 13740991 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.106;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:320,0,216 -chr19 13741296 . T C 4312.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4341,310,0 -chr19 13741334 . C T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.297;DP=104;FS=14.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:697,0,2878 -chr19 13843614 . T C 867.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.783;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:23:896,23,0 -chr19 13844270 . T A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr19 13846659 . G T 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:836,60,0 -chr19 14903415 . T TA 372.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.561;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:46:518,46,0 -chr19 15073948 . C T 383.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:412,30,0 -chr19 15455957 . AGTAAGTGCAGTTCACCAACCGTAACATCATGTATGCAATGAGTTCTTCAACGATTGTTTTATCTTTCACAG A 9313.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=3.350;DP=296;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=31.47;ReadPosRankSum=-2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,280:286:99:9351,886,0 -chr19 15519495 . A T 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.352;DP=30;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:842,0,207 -chr19 16613061 . G A 583.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:42:612,42,0 -chr19 16613148 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr19 16613430 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr19 16640477 . C CA 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.885;DP=86;FS=11.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:374,0,766 -chr19 16640631 . TCCTAAAATTGAAGCAGAAAATGTTGTTTTAGAATTACATGTCATTTAAATGCAAAAACCAGCTTCAAAAATGCACAACTGCCTTCA T 12966.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=1.245;DP=340;FS=7.079;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,334:336:99:13004,959,0 -chr19 16829510 . G GC 1065.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=2.780;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=26.64;ReadPosRankSum=-3.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:1103,0,233 -chr19 16829515 . A G 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=2.606;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=29.46;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:1103,0,243 -chr19 16865352 . G T 520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:549,42,0 -chr19 16865493 . C A 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr19 17093384 . T TG 200.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:238,17,0 -chr19 17120368 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-0.903;DP=48;FS=5.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:303,0,1374 -chr19 17121635 . T G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.420;DP=24;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,507 -chr19 17121689 . T C 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=1.086;DP=48;FS=9.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:579,0,1064 -chr19 17121851 . T C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-2.129;DP=36;FS=12.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=23.77;ReadPosRankSum=2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:884,0,318 -chr19 17155205 . T TA 705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=-0.944;DP=217;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,63:195:99:743,0,2683 -chr19 17160943 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=-0.781;DP=154;FS=4.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,23:154:99:250,0,5324 -chr19 17160945 . T C 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=-0.577;DP=157;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,46:157:99:1273,0,4219 -chr19 17528662 . A G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.685;DP=73;FS=9.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:918,0,1666 -chr19 17528906 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.199;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:814,0,1158 -chr19 17531090 . T G 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.051;DP=136;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,45:136:99:1176,0,4545 -chr19 17851000 . T TTA 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-1.170;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:267,0,982 -chr19 17851924 . TA T 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.578;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:404,0,635 -chr19 17988749 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.902;QD=10.66;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:252,0,505 -chr19 17988874 . AT A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=14;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=16.41;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:267,0,59 -chr19 18155936 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.835;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=21.73;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,139 -chr19 18156315 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,132 -chr19 18156637 . T G 2520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=3.331;DP=84;FS=21.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=30.01;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,65:74:99:2683,0,230 -chr19 18156638 . A T 2295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=3.127;DP=83;FS=15.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=27.66;ReadPosRankSum=-3.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,65:73:99:2683,0,181 -chr19 18157432 . G T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.472;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:519,0,602 -chr19 18157434 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.102;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:519,0,602 -chr19 18158853 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.926;ClippingRankSum=4.085;DP=30;FS=17.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=16.06;ReadPosRankSum=-3.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:510,0,368 -chr19 18159129 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=3.585;DP=21;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=18.75;ReadPosRankSum=-3.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:422,0,581 -chr19 18159130 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=2.561;DP=18;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=21.26;ReadPosRankSum=-2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:411,0,581 -chr19 18159673 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=1.683;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,110 -chr19 18160984 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=-1.775;DP=72;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=11.91;ReadPosRankSum=3.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:886,0,843 -chr19 18161013 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=-2.614;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.197;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:846,0,894 -chr19 18161358 . C A 1551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.422;ClippingRankSum=2.255;DP=58;FS=92.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=26.75;ReadPosRankSum=-4.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,43:58:99:1580,0,412 -chr19 18161495 . G C 2761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=2.185;DP=108;FS=17.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=25.57;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,74:88:99:2790,0,571 -chr19 18203881 . T C 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr19 18318898 . CTGGTTCCGCGCAAAAAGGAAGTTGTCATGGTCTCGCGATATTTTCACCACTTGACACGCAAACTTTAGGG C 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.881;ClippingRankSum=7.645;DP=208;FS=6.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=1.66;ReadPosRankSum=-7.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,185:207:99:382,0,390 -chr19 18340897 . CT C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=1.250;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:34:275,0,34 -chr19 18405719 . CAGGTGAGACATTTGAGACATTTCTCTACCATCATTCATTATCAACAAGTAATACATTTCATGAATGCATTGTGTTTGCTTTCGCTTCTCTGTT C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=2.602;DP=96;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=2.96;ReadPosRankSum=-3.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,82:90:99:321,0,1328 -chr19 18435899 . G C 4596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:4625,0,785 -chr19 18552034 . A G 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr19 18552112 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.549;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:229,0,654 -chr19 18557682 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=2.203;DP=23;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:375,0,284 -chr19 18963161 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.493;DP=55;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.478;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:282,0,1498 -chr19 19011058 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:383,0,267 -chr19 19017129 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.443;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:264,0,775 -chr19 19118257 . C A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.016;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:276,0,2733 -chr19 19238696 . G GA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-2.313;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:241,0,336 -chr19 19365474 . A T 377.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.474;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=31.42;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:405,0,11 -chr19 19435348 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=18.71;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:234,0,98 -chr19 19503970 . TA T 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.443;DP=28;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:333,0,175 -chr19 19690481 . C CT 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.579;DP=397;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=1.62;ReadPosRankSum=3.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,75:336:99:679,0,6499 -chr19 20055410 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:46:262,0,46 -chr19 20267283 . A AT 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-2.290;DP=299;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,59:294:99:399,0,5715 -chr19 20280887 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=1.805;DP=228;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,37:227:99:378,0,7306 -chr19 20539569 . CTT C 295.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:333,0,17 -chr19 20543747 . T C 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.639;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:716,0,879 -chr19 20673027 . C CA 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.621;DP=132;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:491,0,1981 -chr19 20680323 . G GA 226.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:367,44,0 -chr19 21203617 . C CCA 822.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-1.785;DP=81;FS=3.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:860,0,1440 -chr19 21279158 . GT G 240.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:278,28,0 -chr19 22817800 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.333;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:309,0,1825 -chr19 22817802 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.372;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:309,0,1825 -chr19 22840594 . TGTAAGTTGATTTTAATTTGTGTACTTTTTGTTTACTTAACTGTTTACTTGATTGTTTGTTCTAATGTTTGTGAATATAAAG T 2867.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.903;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2905,235,0 -chr19 22858939 . T G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.455;DP=33;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=12.78;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:450,0,723 -chr19 23387616 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,337 -chr19 23388615 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,427 -chr19 24081102 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr19 24140146 . G A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr19 24206637 . A G 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 -chr19 24206660 . G T 341.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:370,27,0 -chr19 24207149 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.157;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:390,0,715 -chr19 24207389 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=-1.991;DP=62;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:304,0,1461 -chr19 24207789 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-1.737;DP=15;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=28.65;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:50:458,0,50 -chr19 24208312 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-1.541;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:334,0,948 -chr19 24457127 . T C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.743;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,236 -chr19 24491318 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr19 24519609 . CT C 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.559;DP=29;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=15.06;ReadPosRankSum=-2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:72:475,0,72 -chr19 24749424 . GA G 2331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.536;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,94:154:99:2369,0,1048 -chr19 24918042 . TCCTGCTCAACCAAGAATTAAACAGATTGTCATCTACGACGTGGTTATAAAAACATGAACAGCCTTTATTCTGTTCAATCACGTA T 3653.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=1.692;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:3691,288,0 -chr19 24975811 . TGGTGAGTGTCACTTTGGCATTGTTATAGTTGCATGACGTTGTGGCATCCACAAAGTAGGTGCTAAACAGTTTTCTTCTCTATCTACA T 9461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=4.016;DP=294;FS=6.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=32.18;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,263:281:99:9499,0,941 -chr19 25575447 . AT A 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.353;DP=53;FS=6.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:443,0,491 -chr19 25952489 . G GATTC 10371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=399;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,265:375:99:10409,0,3947 -chr19 26142255 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-1.484;DP=48;FS=8.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:232,0,1158 -chr19 26227497 . G A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr19 27216829 . A T 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=-4.023;DP=144;FS=3.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=6.07;ReadPosRankSum=4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,37:144:99:903,0,4131 -chr19 27216907 . CCCCAT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=1.437;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=10.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:85:351,0,85 -chr19 27218214 . GCTCCAAGAGAAAACAGCACATCATGTCACAATACAATAACATCTTTCTTAAATGAAATGATTCAAAAAATTGAAAAGGAGATCATAC G 13929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.404;DP=350;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=34.72;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,336:341:99:13967,1000,0 -chr19 27226675 . CT C 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=5.408;DP=60;FS=18.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.93;ReadPosRankSum=-5.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:333,0,1082 -chr19 27307490 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=1.260;DP=129;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=1.84;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,21:129:99:265,0,4180 -chr19 27816476 . ACTGGCAAGTGACCCATAAATTAGTGAATATGCTGCTGCAGTGCTAGCATGGATTGGAATATAAACTGTGCTCCTCAC A 4734.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=1.523;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,116:118:99:4904,0,279 -chr19 27834556 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.971;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,304 -chr19 27837028 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:324,0,330 -chr19 27843028 . C CT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.505;DP=58;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:297,0,1003 -chr19 27950930 . ACTGTGAAAGTTATTTAAGCATTCAGGATCATTCAAGTAACAACAAACCACTCATTATTTTGTATTGCATGTGTACAGTGCACTGTGAACAGCTTCATAAGTAAATCAGAGACTCTAGTCTAAAGATTCATCATAACATGGCATAAATGAAAAAATGCTATCTTTGAAAGATTTATCGAAAACCCATTCTTAC A 1945.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=5.762;DP=99;FS=5.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=19.65;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,53:99:99:1983,0,29129 -chr19 27951228 . TCATTTTTTTTGTAGAGCATGTGTTCAGTGCACTGTGAAGAGCTTCATGGGTAAATCAGAGACTCTAGTCAAATGGTTCATCATGACATGCAATAATGTACAAAAGGCTTTCATTTTATGTAATTACCTC T 524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=4.524;DP=66;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:562,0,13339 -chr19 28085553 . A G 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr19 28086589 . C A 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:459,33,0 -chr19 28440332 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.343;DP=40;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:347,0,1319 -chr19 29272478 . G C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-1.139;DP=307;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,44:306:99:334,0,9937 -chr19 29758592 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.136;DP=238;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,34:238:99:254,0,7980 -chr19 30356760 . C CT 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=-1.073;DP=110;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,23:97:99:297,0,1948 -chr19 30513506 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:300,0,373 -chr19 30515243 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.594;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:444,0,1645 -chr19 30867540 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=1.341;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,19:92:99:324,0,2704 -chr19 30867759 . A G 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.694;DP=132;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:781,0,3589 -chr19 31045987 . G GA 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.690;DP=359;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,81:331:99:1029,0,6215 -chr19 31110429 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=18.23;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:247,0,252 -chr19 31596778 . C CT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.719;DP=303;FS=8.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,39:258:99:248,0,4804 -chr19 31597456 . T TA 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-1.588;DP=284;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,54:249:99:353,0,4694 -chr19 31667438 . G C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.972;ClippingRankSum=-1.139;DP=26;FS=16.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=24.38;ReadPosRankSum=-4.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:662,0,688 -chr19 31667440 . A G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;ClippingRankSum=-2.746;DP=25;FS=12.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=25.07;ReadPosRankSum=-3.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:655,0,688 -chr19 31671177 . G T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-0.862;DP=168;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,33:168:99:552,0,5202 -chr19 31687693 . C CT 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.928;DP=256;FS=3.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,55:224:99:482,0,4560 -chr19 31921944 . T TCCGGAGTACCGGTG 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=-0.174;DP=94;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:645,0,2378 -chr19 31928345 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-1.241;DP=77;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=3.48;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:296,0,2496 -chr19 31969164 . GCTAAAAGTCAAGACAGGTGAAGTATTAGTATCTTATTTCTTCTTTAAAGACATTTGAGAACGCACTGGTTTTACTAGATTAAAAACTCAC G 882.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-1.998;DP=44;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=20.06;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:920,0,1679 -chr19 31969165 . CTAAAAGT C 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.894;DP=43;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.816;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:387,0,2247 -chr19 31969173 . CAAGACAGGTGAAGTATTAGTATCTTATTTCTTCTTTAAAGACATTTGAGAACGCACTGGTTTTACTAGATTAAAAACTCACCT C 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.146;DP=44;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:387,0,2247 -chr19 32130412 . G A 2430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=3.518;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=18.41;ReadPosRankSum=-3.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,71:127:99:2459,0,1995 -chr19 32137796 . AGTGAGTGAAAATGCATATCTAAAAAAAACATTTTAAAATGTTAGACTGAGTTTCAAGGTCTGATTCGATTGTCATTATTTCACAG A 11682.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=-0.241;DP=262;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=32.32;ReadPosRankSum=2.838 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,244:247:99:12183,904,0 -chr19 32139222 . T TCGAAGGA 4736.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=301;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:117:99:4774,321,0 -chr19 32245791 . CAG C 842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=-0.371;DP=267;FS=3.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,50:250:99:880,0,8632 -chr19 32246435 . AACCTGTAGACACAAATAAAGTTTGATTTCACACGCAGTCAACTTTCATTTCGTCTGCAATCACAGATGGAAGGGAGCTGAT A 14674.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=1.586;DP=370;FS=6.013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=32.86;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,358:361:99:14712,1071,0 -chr19 32325890 . G C 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:825,57,0 -chr19 32326908 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr19 32644359 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=-1.686;DP=48;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:761,0,835 -chr19 32825809 . CA C 3091.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.798;DP=290;FS=2.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.360;QD=10.66;ReadPosRankSum=-2.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,141:267:99:3129,0,2952 -chr19 32828641 . AT A 1066.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=5.054;DP=167;FS=14.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,42:166:99:1104,0,8355 -chr19 33120313 . G GT 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.861;DP=37;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=2.195;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:472,0,229 -chr19 33123099 . T TA 808.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.243;DP=41;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:846,0,511 -chr19 33183956 . AAT A 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.787;DP=24;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:433,0,276 -chr19 33198602 . T C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr19 33309752 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.216;ClippingRankSum=0.362;DP=98;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.060;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:319,0,3025 -chr19 33394868 . A C 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.101;DP=71;FS=7.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:893,0,1476 -chr19 33848149 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.046;DP=125;FS=8.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,21:124:99:239,0,5532 -chr19 33871047 . T TA 1791.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=1.462;DP=174;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=10.30;ReadPosRankSum=-2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,92:159:99:1906,0,1583 -chr19 34194614 . CT C 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.348;DP=82;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=8.13;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:704,0,962 -chr19 34232768 . GAGGTGCGTCTGCGCTCACGAAGCCTACAGCATACTGAGGATATTAATGAGTGTCGATATAAACAACTTTTGATATTTGTTCCCC G 18116.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=1.724;DP=430;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,428:429:99:18154,1456,0 -chr19 34271073 . CA C 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.359;DP=75;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:353,0,790 -chr19 34272225 . AT A 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=1.488;DP=185;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,44:171:99:672,0,3746 -chr19 34638668 . C T 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.096;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=13.31;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,25:64:99:880,0,1297 -chr19 34877318 . G A 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-0.253;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:497,0,836 -chr19 34878469 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.626;DP=42;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:342,0,1271 -chr19 35149144 . CA C 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.196;DP=40;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:257,0,506 -chr19 35201160 . CT C 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:290,0,365 -chr19 35252914 . A ATT 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=-2.673;DP=107;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:1222,0,2118 -chr19 35253027 . G A 8031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.580;DP=160;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=30.67;ReadPosRankSum=-1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,100:160:99:8060,0,1074 -chr19 35253049 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.123;DP=133;FS=0.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,29:133:99:477,0,6566 -chr19 35253129 . AT A 1218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.687;DP=131;FS=4.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:1256,0,3235 -chr19 35253194 . A C 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.961;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.261;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,48:112:99:1189,0,5599 -chr19 35270920 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=27.86;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,119 -chr19 35270940 . T C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-1.051;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=26.18;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:578,0,153 -chr19 35271136 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.448;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=18.64;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:513,0,352 -chr19 35271405 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=20.09;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:410,0,281 -chr19 35271438 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.965;DP=15;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,204 -chr19 35273062 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.477;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:513,0,351 -chr19 35273290 . G A 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=-0.541;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=25.56;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:744,0,265 -chr19 35275401 . T A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.331;DP=28;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:763,0,151 -chr19 35277659 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:275,0,426 -chr19 35277680 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-1.001;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:281,0,508 -chr19 35280053 . A T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.303;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=26.02;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:887,0,245 -chr19 35281825 . T C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.137;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:728,0,100 -chr19 35284228 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.961;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:439,0,361 -chr19 35287762 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-1.078;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:329,0,674 -chr19 35290928 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-0.373;DP=36;FS=5.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.795;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:447,0,1184 -chr19 35290931 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.276;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=25.16;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:959,0,337 -chr19 35489433 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=1.355;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:302,0,195 -chr19 35501971 . T C 235.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:264,0,22 -chr19 35614812 . G GAC 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=-0.049;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:513,0,827 -chr19 35614886 . C A 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=2.368;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:646,0,2452 -chr19 35629810 . A G 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=1.334;DP=121;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.269;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:816,0,3397 -chr19 35630056 . G T 3421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=-2.725;DP=133;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,90:133:99:3450,0,1115 -chr19 35630108 . T G 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.604;DP=93;FS=11.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=8.78;ReadPosRankSum=2.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:845,0,2465 -chr19 35644458 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:265,0,610 -chr19 35644468 . G C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=15.78;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:265,0,610 -chr19 35644576 . A G 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.478;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=29.38;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:557,0,124 -chr19 35644626 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,225 -chr19 35644684 . A C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.612;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:306,0,367 -chr19 35645704 . A C 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-1.729;DP=65;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:1040,0,1283 -chr19 35645776 . G T 3132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.271;DP=99;FS=5.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=31.64;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,80:99:99:3161,0,341 -chr19 35645961 . CT C 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.339;DP=80;FS=6.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:440,0,846 -chr19 35645975 . G A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=0.036;DP=62;FS=3.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=13.32;ReadPosRankSum=2.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:854,0,1322 -chr19 35648617 . C G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.049;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:237,0,346 -chr19 35728694 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.470;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=8.73;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:421,0,1137 -chr19 35767079 . A G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-1.042;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:599,0,1194 -chr19 35810715 . G GT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.436;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:437,0,462 -chr19 36299721 . G GT 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-1.509;DP=40;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:321,0,534 -chr19 36359340 . C G 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.860;DP=38;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:361,0,925 -chr19 36509476 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.466;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,33:137:99:681,0,3806 -chr19 36509578 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=-3.311;DP=135;FS=0.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,25:135:99:344,0,4245 -chr19 36509635 . A C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=5.077;DP=151;FS=1.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=1.95;ReadPosRankSum=3.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,25:148:99:322,0,8161 -chr19 36515886 . G A 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.444;DP=190;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,51:190:99:1174,0,5149 -chr19 36516866 . G A 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=-0.171;DP=224;FS=5.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,61:223:99:1459,0,6027 -chr19 36589815 . G A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=-0.363;DP=150;FS=3.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,41:150:99:822,0,7185 -chr19 36596196 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.045;DP=143;FS=4.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:775,0,3845 -chr19 36604225 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-2.025;DP=170;FS=10.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,36:169:99:677,0,4988 -chr19 36608541 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.624;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:321,0,4453 -chr19 36608712 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.445;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.332;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,33:145:99:663,0,4175 -chr19 36609283 . G A 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.723;DP=112;FS=6.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,34:109:99:900,0,2752 -chr19 36630693 . G T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.146;DP=113;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,29:112:99:655,0,3063 -chr19 36633627 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.933;DP=157;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:157:99:768,0,4641 -chr19 36644397 . T G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=2.273;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:280,0,1703 -chr19 36645084 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=-2.531;DP=37;FS=5.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:245,0,1092 -chr19 36664378 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.764;DP=89;FS=0.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,28:89:99:723,0,2337 -chr19 36667803 . G T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-1.788;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:274,0,2609 -chr19 36667946 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=-0.258;DP=75;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:269,0,2207 -chr19 36687775 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-1.595;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:296,0,2175 -chr19 36924454 . T C 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:238,0,25 -chr19 36983371 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=-2.497;DP=275;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,45:275:99:575,0,8857 -chr19 37273959 . A G 2424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.791;DP=178;FS=5.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,66:178:99:2453,0,6710 -chr19 37273960 . G A 2424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.668;DP=181;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.367;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,67:181:99:2453,0,6781 -chr19 38175619 . A T 879.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:908,63,0 -chr19 38175796 . C G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.113;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:579,0,551 -chr19 38175818 . A G 853.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:882,63,0 -chr19 38682484 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-1.694;DP=122;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:311,0,3952 -chr19 38682974 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.180;DP=27;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:260,0,693 -chr19 38688185 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.098;DP=75;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:284,0,4638 -chr19 39103368 . C G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.847;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:241,0,354 -chr19 40997144 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:323,0,468 -chr19 41008822 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.214;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:233,0,2028 -chr19 41010381 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.965;DP=68;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:541,0,2429 -chr19 41012441 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.033;DP=74;FS=3.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:349,0,2524 -chr19 41013226 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=-0.892;DP=47;FS=7.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:263,0,1391 -chr19 41015372 . A G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.969;DP=132;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,32:132:99:741,0,3727 -chr19 41123302 . T C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.323;DP=119;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,28:119:99:627,0,3476 -chr19 41123446 . CGGTCAGTAGACAGGCATACTTTAATAAGCTGTTGTTAATTATGTAACAACTAATCATTTTTCTTAATAACA C 7089.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.648;DP=163;FS=3.371;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,162:163:99:7127,570,0 -chr19 41123571 . T G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.661;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,23:129:99:352,0,4179 -chr19 41300265 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=1.294;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,41:277:99:392,0,9180 -chr19 41852972 . C T 2077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.200;DP=111;FS=14.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:2106,0,1553 -chr19 41859566 . G GA 548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.414;DP=45;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:586,0,372 -chr19 41956834 . C T 2390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.091;DP=761;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=3.14;ReadPosRankSum=4.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:612,148:760:99:2419,0,23465 -chr19 41958553 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.527;DP=423;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:356,65:421:99:428,0,12778 -chr19 41995001 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=2.384;DP=36;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:255,0,985 -chr19 41995085 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=1.892;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.892;QD=18.70;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:290,0,223 -chr19 41995278 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=1.470;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:344,0,491 -chr19 41995711 . T TC 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=-0.814;DP=42;FS=13.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:884,0,465 -chr19 42017693 . T C 1481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=1.668;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=20.58;ReadPosRankSum=-1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,47:72:99:1510,0,808 -chr19 42040835 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.698;DP=20;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.14;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:551,0,115 -chr19 42120542 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:289,0,280 -chr19 42122087 . C G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,185 -chr19 42123303 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=-1.514;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:341,0,356 -chr19 42127227 . C CA 206.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:244,18,0 -chr19 42128264 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-1.271;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:718,0,726 -chr19 42128451 . AT A 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=2.062;DP=19;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:339,0,511 -chr19 42149473 . G C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=1.082;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:490,0,468 -chr19 42149713 . T C 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=3.170;DP=45;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:800,0,734 -chr19 42150209 . A G 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.181;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:818,0,204 -chr19 42150916 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=33.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:48:365,0,48 -chr19 42150926 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:48:365,0,48 -chr19 42151006 . T C 1343.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1372,96,0 -chr19 42151256 . C G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.231;DP=20;FS=8.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:542,0,167 -chr19 42151383 . G T 2007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.468;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=30.42;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:2036,0,242 -chr19 42151596 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-2.996;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.979;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:624,0,1281 -chr19 42151601 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-2.582;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:624,0,1281 -chr19 42152166 . G C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=3.172;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=13.87;ReadPosRankSum=-3.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,809 -chr19 42373271 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=2.638;DP=80;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=2.56;ReadPosRankSum=-2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:233,0,2560 -chr19 42373445 . G C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=1.045;DP=111;FS=2.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,19:111:99:249,0,3351 -chr19 42438477 . C A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.601;DP=41;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=14.36;ReadPosRankSum=1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:617,0,817 -chr19 42443198 . C CT 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-2.512;DP=140;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,41:133:99:704,0,2486 -chr19 42466738 . G C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.582;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:333,0,453 -chr19 42473056 . CT C 647.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-1.432;DP=23;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=28.16;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:67:685,67,0 -chr19 42475744 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.767;DP=36;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:235,0,967 -chr19 42487751 . AT A 2237.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:2275,180,0 -chr19 42487874 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=3.869;DP=216;FS=38.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=1.48;ReadPosRankSum=-3.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,26:216:99:348,0,17790 -chr19 42497022 . T C 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.217;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:673,0,512 -chr19 42503046 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.585;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:334,0,385 -chr19 42505922 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=1.388;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=9.47;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:246,0,1182 -chr19 42510796 . A G 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=-1.052;DP=22;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.200;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:28:741,0,28 -chr19 42511885 . T TA 344.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:382,27,0 -chr19 42540367 . T C 3291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=-2.180;DP=192;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,103:192:99:3320,0,3269 -chr19 42544511 . C T 3625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.071;ClippingRankSum=-0.580;DP=233;FS=2.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,115:233:99:3654,0,4345 -chr19 42545264 . C T 4359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.666;DP=249;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,126:249:99:4388,0,4250 -chr19 42558993 . GA G 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=2.267;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:351,0,101 -chr19 42560353 . T A 3201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=1.999;DP=231;FS=6.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,98:227:99:3231,0,4180 -chr19 42563224 . G T 2447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.504;DP=200;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,73:185:99:2476,0,3733 -chr19 42733734 . A G 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:359,27,0 -chr19 43252826 . G C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.015;DP=37;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:503,0,722 -chr19 43259426 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=9.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,378 -chr19 43260058 . CT C 482.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:38:520,38,0 -chr19 43260442 . GA G 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.568;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:641,0,222 -chr19 43260585 . GA G 1166.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.175;DP=53;FS=2.119;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=22.01;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,42:46:75:1204,75,0 -chr19 43260606 . A T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-2.862;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:676,0,1033 -chr19 43260702 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=1.205;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,1192 -chr19 43260705 . C A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=-1.264;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.045;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:503,0,873 -chr19 43261350 . A T 486.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=4.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=34.74;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:8:514,8,0 -chr19 43262140 . T A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=1.829;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=26.94;ReadPosRankSum=-1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:594,0,167 -chr19 43263451 . GT G 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-0.522;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:394,0,464 -chr19 43263908 . TA T 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.704;DP=29;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:347,0,314 -chr19 43265513 . GA G 593.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=23.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:631,63,0 -chr19 43315733 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.592;DP=82;FS=14.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,29:82:99:921,0,1833 -chr19 43367040 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=1.474;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=8.29;ReadPosRankSum=-1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:393,0,1326 -chr19 43368110 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.356;DP=69;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:350,0,2326 -chr19 43368368 . C T 1838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=1.481;DP=76;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=24.19;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,53:76:99:1867,0,1864 -chr19 43369296 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=24.91;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:377,0,112 -chr19 43369955 . TA T 248.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 -chr19 43375259 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-1.159;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:261,0,311 -chr19 43375343 . T C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=1.303;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:560,0,474 -chr19 43375465 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:247,0,369 -chr19 43376234 . T G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-2.520;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,237 -chr19 43376235 . A T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-2.520;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=23.07;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,237 -chr19 43377912 . T C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.964;DP=46;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=14.36;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:689,0,806 -chr19 43382665 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.530;DP=56;FS=2.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:657,0,1219 -chr19 43393327 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.849;DP=49;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:313,0,1352 -chr19 43399175 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.087;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=10.05;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:380,0,835 -chr19 43448287 . A C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.382;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:327,0,601 -chr19 43583379 . C T 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:496,36,0 -chr19 43585606 . TA T 333.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;QD=25.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:371,39,0 -chr19 43595387 . TGGTATTGTGGCTTTGGTCTTTATTTCAAATTGTGGTGAAGAGTGAAAAATAAAGTGAGCTACATTTAGATCTGTTTTATCA T 5032.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=2.929;DP=129;FS=2.164;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=29.80;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,124:127:99:5070,377,0 -chr19 43600711 . TGTGAGTGCTGAATATGTGACGAATGCACACGCACACAACCAAAAGGTTTTATCCAGTAATATTGTAGTTTTGATTTGATCATATGGTTCATTTACAG T 5225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.539;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,142:147:99:5617,0,314 -chr19 43784101 . C T 490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:519,36,0 -chr19 43793836 . T G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.215;DP=30;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:384,0,691 -chr19 43861998 . TA T 10904.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:138:99:10942,848,0 -chr19 43862439 . C T 4435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=-0.587;DP=281;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=15.79;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,125:281:99:4464,0,5289 -chr19 43937346 . TTA T 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.801;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=9.36;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:636,0,994 -chr19 43968215 . AAGGTAAGTCATGCTTCATTGCATTCCTATTAACAAAAACTGCTTCGTCTTAAAAACATTTGATGAAAGTGAATCACTCTTGTGTTTTCCAACCTC A 2402.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.304;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=34.51;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:2440,235,0 -chr19 43977821 . ACTGCAAAAAAACAAACAAACGATTAGTGGCTCAATAAAATAGAAGTGAATATTTGCAGATTCATTGTTTATTATTTCAGCTTAC A 17412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-0.230;DP=440;FS=4.218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,418:424:99:17450,1262,0 -chr19 43980762 . TCCTACACAAAAAAACATCAACCTATAAATAACGAGTCCTCAAAACTTAACCGATCCATAACCCACTGTATGCACACTTA T 14777.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=334;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,315:315:99:14815,1221,0 -chr19 44003277 . GCAGGTCTTCACTACATTTATCTCTATCTCTGTCGTTTTTGTGTAGTGTATAGGATTGTCTTGCTATATTGAGCCCATTCTTACTGTCTTTTTT G 1361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.759;DP=48;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,45:48:99:1399,0,560 -chr19 44006133 . A G 220.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:249,0,20 -chr19 44007399 . C T 285.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:314,24,0 -chr19 44011822 . GGTGTGTGTGTGTGTGT G 627.34 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:621,0,900 -chr19 44011869 . G A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-1.263;DP=45;FS=9.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:581,0,918 -chr19 44019137 . C T 2410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.111;DP=201;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,66:200:99:2439,0,8759 -chr19 44019139 . A C 2410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.608;ClippingRankSum=1.199;DP=200;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=12.05;ReadPosRankSum=2.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,66:199:99:2439,0,8706 -chr19 44019151 . TCCTAAAAATAAAAAAAGTTAAACAATTAATTACTAATTTAATTTAAGCAGCAGAAAAATGCCCTGTCCACCAAATGTGATTTATGAACTTA T 7689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=-0.970;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.015;QD=36.49;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,179:181:99:7727,611,0 -chr19 44019737 . C T 5253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.067;DP=308;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,145:308:99:5282,0,5483 -chr19 44163392 . T A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr19 44172314 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=-1.973;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=18.16;ReadPosRankSum=2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:337,0,308 -chr19 44172391 . T A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=3.266;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=21.22;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:389,0,339 -chr19 44172428 . A G 2792.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.634;DP=77;FS=4.502;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=33.21;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,59:63:99:2821,178,0 -chr19 44172617 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=3.882;DP=25;FS=24.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.55;ReadPosRankSum=-3.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:392,0,404 -chr19 44180430 . A AT 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:267,18,0 -chr19 44181335 . AACCTACATAAAGAGAAAAAGTCTCACTATTTATTTATAAAAATTCTGCCATCAGTTTATCTGTGGAAAGTGCTC A 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=2.985;DP=24;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=24.53;ReadPosRankSum=-2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:626,0,3673 -chr19 44185292 . TCTATAGAAACACAGATGTAGTGCACATAATGTTTTCAAGGATGTGTGTGTTGTTTGTACAACTGTCCTTGTTGAACAGAC T 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:375,0,2903 -chr19 44186615 . TAAATCTACATAAATAAAAGAAAATAAAAACAGTACTGTTTGTGGTGACACATGCCA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=29.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:273,0,730 -chr19 44193977 . AT A 642.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.528;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=27.94;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:71:680,71,0 -chr19 44204030 . C A 5900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.328;DP=345;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=17.10;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,165:343:99:5929,0,5712 -chr19 44210080 . C A 886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:66:915,66,0 -chr19 44214563 . G GA 328.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:366,33,0 -chr19 44370945 . G GT 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=34.52;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:45:417,0,45 -chr19 44370950 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.56;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:45:417,0,45 -chr19 44371267 . G C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.238;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=32.42;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:547,0,37 -chr19 44445798 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.182;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:442,0,118 -chr19 44446888 . AT A 618.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=1.582;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:25:656,0,25 -chr19 44447543 . TC T 1110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-1.377;DP=43;FS=2.175;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=25.83;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:87:1148,87,0 -chr19 44462566 . A G 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr19 44522160 . A AT 717.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-0.314;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,40:60:99:784,0,424 -chr19 44540503 . C T 284.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:313,24,0 -chr19 44570285 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.058;DP=52;FS=4.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:629,0,916 -chr19 44570347 . T TA 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.646;DP=54;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:774,0,704 -chr19 44570348 . A AT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.121;DP=53;FS=6.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:414,0,909 -chr19 44686752 . CAGGTAATGGATGACCCAGCGCTTTATCTGCTCTAACCCAGGGTCTCGTGCATCCCTCTCATCCAGACCTCTGCTCTTCTGCTTCCCGTAT C 9767.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=-0.551;DP=255;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,232:234:99:9805,907,0 -chr19 44781058 . GAT G 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=1.118;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,1:79:99:309,0,3295 -chr19 44783110 . C CA 399.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:41:437,41,0 -chr19 44784026 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr19 44786611 . GT G,GTT 933.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,18,19:37:99:959,515,612,530,0,597 -chr19 44786719 . T A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.824;DP=52;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=17.07;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:916,0,2536 -chr19 44786723 . T G 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=-0.634;DP=53;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:916,0,2569 -chr19 44789088 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.461;DP=35;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:739,0,495 -chr19 44816728 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.362;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=10.90;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:268,0,400 -chr19 44840232 . GAGGTGAAATCTGAACTCTCTCTTTACTGAATTAGAAAAGCCGGAACTCTTTCTAACTGGATTGTCTTTGAC G 7712.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.913;DP=232;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=33.24;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,172:181:99:7750,472,0 -chr19 44858277 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.057;DP=65;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.10;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:295,0,1873 -chr19 44874462 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-1.246;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:463,0,168 -chr19 44889794 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.368;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:245,0,1122 -chr19 44896753 . A G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-1.590;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:281,0,1030 -chr19 44928525 . C T 517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:546,39,0 -chr19 44968058 . A G 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=-0.962;DP=61;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:1002,0,1044 -chr19 44968441 . G A 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.180;DP=56;FS=5.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=22.48;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,36:56:99:1287,0,686 -chr19 44971554 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=1.246;DP=26;FS=19.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:403,0,514 -chr19 44972077 . TC T 382.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:31:420,31,0 -chr19 44972231 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=2.761;DP=30;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:256,0,777 -chr19 45040670 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=1.972;DP=96;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=8.42;ReadPosRankSum=-2.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,30:96:99:837,0,2619 -chr19 45041414 . A G 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.151;DP=66;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=15.50;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,31:65:99:1051,0,1129 -chr19 45042383 . G A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=-1.874;DP=99;FS=10.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,32:99:99:823,0,2561 -chr19 45049787 . G A 3045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-1.407;DP=166;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.481;QD=18.35;ReadPosRankSum=3.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,84:166:99:3074,0,3027 -chr19 45052949 . G C 2940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.563;DP=178;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=16.52;ReadPosRankSum=2.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,83:178:99:2969,0,3142 -chr19 45059925 . G T 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=-0.371;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=17.49;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1060,0,1075 -chr19 45138375 . A T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr19 45138424 . T G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr19 45152760 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.402;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,510 -chr19 45152977 . T A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=-1.724;DP=54;FS=7.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:863,0,1011 -chr19 45153322 . C G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.677;DP=58;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.81;ReadPosRankSum=1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,20:57:99:655,0,1255 -chr19 45226570 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-1.555;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:291,0,351 -chr19 45288697 . CAGGTATGTCTACAACTGTGATTTAAGAAACAAAGTTGGTCTAACTTGACTATAGTTGATTTTAAACCATCACTGTTCTCCTCCTCT C 1087.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:99:1125,108,0 -chr19 45289878 . CAGGTTAGGCCTTCATCCATTTCCCCAATTATGCTTCATGGTGGTTGAATTCCCTTTTGCTAACTCAAGTTGTGTTCT C 5188.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-0.755;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,116:117:99:5226,434,0 -chr19 45290191 . TGGTAAGCTTCCATTACAAGCTAACAAATGTCAAAAATAGCCTTGCATTCGTGCTGAAGTACTAATCATCCTCCCTCTGCA T 2632.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.767;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.375;QD=30.37;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:2670,196,0 -chr19 45294081 . T G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.683;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,1:33:99:900,0,2443 -chr19 45294086 . T C 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.195;ClippingRankSum=5.853;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.715;QD=12.82;ReadPosRankSum=-5.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:900,0,2441 -chr19 45322008 . C T 6670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-2.501;DP=395;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=16.89;ReadPosRankSum=4.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,186:394:99:6699,0,6763 -chr19 45324571 . C A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr19 45325019 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=1.210;DP=38;FS=11.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.409;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:273,0,1113 -chr19 45325637 . A AT 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.594;DP=37;FS=2.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.905;QD=15.26;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:602,0,529 -chr19 45325753 . C T 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=-0.389;DP=44;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.850;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:684,0,816 -chr19 45326070 . CG C 274.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:312,30,0 -chr19 45326183 . T C 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr19 45327484 . A C 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 -chr19 45327588 . A G 713.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:742,54,0 -chr19 45405503 . C CT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.911;DP=137;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:385,0,2648 -chr19 45471570 . TG T 270.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr19 45480339 . C T 3062.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3091,220,0 -chr19 45555823 . TCCTGCAGACAATAAAGATCATTAAAAGCTTTTGTCAGAAAGGAAATTTTAATAAGGACTCATCACATAATACATTTTCTTTTAAATACAAGAATA T 1436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.705;ClippingRankSum=2.395;DP=196;FS=1.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.725;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,43:194:99:1474,0,40934 -chr19 45569970 . G T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=0.921;DP=29;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:411,0,1109 -chr19 45569971 . T G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.787;DP=29;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:411,0,1076 -chr19 46815033 . A C 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.534;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:839,0,196 -chr19 46892023 . CGTAAGTAGAGGAGTAAGAGTCTTCAGCTTGAGCTCCACTACAGCAGACGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAG C 7885.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.121;DP=211;FS=2.421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=26.45;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,205:208:99:7923,580,0 -chr19 47033029 . AAC A 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-2.731;DP=77;FS=6.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=4.67;ReadPosRankSum=2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:397,0,1231 -chr19 47034402 . GCTGCAGGACACACACACACACACACACACACACAGTCCGGCAGTGAACACACACTTCATCAGCACACACACACACACACAGTCTCGCACACACACTGAC G 759.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.606;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:99:797,0,1400 -chr19 47133107 . TA T 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.106;DP=22;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=18.81;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:70:451,0,70 -chr19 47138568 . A G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.858;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:469,0,204 -chr19 47138583 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:411,0,191 -chr19 47285695 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.594;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=8.46;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:282,0,713 -chr19 47285815 . T G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.026;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:389,0,439 -chr19 47286088 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=1.672;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:411,0,426 -chr19 47456159 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:268,0,384 -chr19 47778175 . ATG A 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.754;DP=77;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:258,0,1821 -chr19 47778684 . CA C 610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-0.261;DP=59;FS=5.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:648,0,659 -chr19 47892700 . G C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.168;DP=137;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:247,0,4350 -chr19 47892750 . AAGGTAAAGTGCCTTGCAGTCATATTTCAGCAGCTGCATGTTGTTTTGAAGCAGGAGAATAGCTAGTGTTCTTGCTTTGTTTTTC A 4974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=1.872;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=34.15;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,134:138:99:5012,407,0 -chr19 47903449 . G A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=1.021;DP=106;FS=2.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,35:106:99:893,0,2724 -chr19 47905449 . G T 1240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=-0.248;DP=132;FS=0.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,46:129:99:1269,0,3533 -chr19 47906099 . T C 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.612;DP=153;FS=4.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,64:153:99:2212,0,3076 -chr19 47906286 . C A 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.619;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:822,0,1100 -chr19 47906299 . C T 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.031;DP=58;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.70;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:997,0,1127 -chr19 47918274 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-1.970;DP=46;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=7.41;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:369,0,1336 -chr19 47919635 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=-0.764;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:349,0,2153 -chr19 47919662 . C T 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-1.572;DP=75;FS=6.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:898,0,1602 -chr19 47931687 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.707;DP=82;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:432,0,2383 -chr19 47934426 . CAGGTCCGCCCCTGCTTCACATCTCTACATTCATTGAGCCTCATAAATGAAGTTGAACTAGAACCTAATGGCGTTTGTGTTGTTTTTCTGT C 2800.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=2.735;DP=69;FS=2.247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=34.67;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,65:69:99:2838,239,0 -chr19 47939311 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr19 47942055 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:315,0,592 -chr19 47944630 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:257,0,290 -chr19 47958249 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:262,0,578 -chr19 47958596 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=2.903;DP=87;FS=4.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:554,0,2277 -chr19 48209590 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:270,0,264 -chr19 48213369 . TA T 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:42:396,0,42 -chr19 48215339 . ATTTGAAAGAGATTCAACGATTGGTCGATT A 394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:43:432,43,0 -chr19 48268401 . CA C 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.19;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:273,0,156 -chr19 48324743 . G GCA 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.733;DP=21;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:252,0,373 -chr19 48325456 . GGACATTCTCCAGCACACACTCTCGCACACACACTCTCTTGTGCACACTCTCACTCTCACACACACTCTCAAGCA G 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=2.695;DP=46;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:449,0,2159 -chr19 48325865 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.344;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:270,0,1473 -chr19 48326209 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=1.539;DP=30;FS=9.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:252,0,762 -chr19 48500088 . CA C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.051;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:278,0,277 -chr19 48677991 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:330,0,1056 -chr19 48713502 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:278,0,62 -chr19 48782128 . A C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr19 49040647 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr19 49042020 . A T 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr19 49042107 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=1.012;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:537,0,1501 -chr19 49042108 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.227;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:582,0,1285 -chr19 49103880 . C G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.175;DP=340;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:282,58:340:99:703,0,19246 -chr19 49337507 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;ClippingRankSum=-2.627;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=18.44;ReadPosRankSum=3.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:766,0,527 -chr19 49337665 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.353;DP=48;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:730,0,866 -chr19 49494841 . A T 4192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=-1.410;DP=357;FS=4.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,127:356:99:4221,0,11384 -chr19 49494868 . G C 3159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=-1.806;DP=375;FS=6.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,123:373:99:3188,0,11363 -chr19 49505090 . C T 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.204;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1033,0,1689 -chr19 49519701 . T A 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.917;DP=98;FS=8.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,37:97:99:1257,0,2565 -chr19 49520516 . C T 1330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=1.057;DP=71;FS=3.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,39:71:99:1359,0,1112 -chr19 49520613 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.114;DP=80;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=7.67;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:642,0,1997 -chr19 49520798 . C CA 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.237;DP=88;FS=12.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:284,0,1798 -chr19 49521547 . A T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=-0.215;DP=81;FS=6.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,23:81:99:544,0,2241 -chr19 49528855 . G A 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.446;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:1106,0,3891 -chr19 49528858 . G A 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.592;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,30:83:99:1106,0,3904 -chr19 49530181 . C T 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.340;DP=118;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,34:118:99:885,0,3428 -chr19 49530193 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.635;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:755,0,3368 -chr19 49533041 . C A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=-0.675;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:251,0,799 -chr19 49533609 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-1.035;DP=27;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:231,0,731 -chr19 49535081 . C A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.196;DP=15;FS=9.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:98:430,0,98 -chr19 49536331 . C A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-1.610;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:383,0,261 -chr19 49540654 . G A 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.040;DP=119;FS=10.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:1027,0,2927 -chr19 49561885 . T C 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=-1.816;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,44:153:99:1019,0,4130 -chr19 49723190 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.275;DP=376;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=0.73;ReadPosRankSum=4.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,51:375:99:302,0,12434 -chr19 49725331 . TCCTGCACACCACAGAAGAAGAGCAGGTGAGAAAACACTTCCTGCAGAAAACACCTTCCAGCTTCATTGGTCGAGCGGCACGCA T 13009.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.555;DP=376;FS=10.837;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=34.60;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,302:348:99:13047,121,0 -chr19 49780767 . ACTGAAACAGAACAGTATGAGCTAACTGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACAGCTCAC A 12518.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=2.977;DP=309;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=33.79;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,305:308:99:12556,975,0 -chr19 49803381 . G A 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=1.881;DP=346;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=0.87;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,49:346:99:328,0,11426 -chr19 49803400 . TCCTGCAGGAGAGCACAGAGATGATGATGATGATGACGACAGGGCAAAGAACAACACGCCGAGCTGCACCTGACTCTA T 12499.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=1.116;DP=349;FS=1.577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=31.49;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,319:325:99:12537,945,0 -chr19 49803890 . TCTGAAGACAAAACATCCACCATCAGCAGATTTCCCACACTCCCCTTCCCCTTAAAGTGTCTGTAGACTTAC T 13212.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=-1.860;DP=315;FS=1.528;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.508;QD=32.34;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,308:314:99:14062,1056,0 -chr19 49810601 . AGTGT A 1506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-1.799;DP=266;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.980;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,8:165:99:1544,0,6549 -chr19 49870805 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=1.416;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.177;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:558,0,4513 -chr19 49873472 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.026;DP=102;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:99:288,0,3042 -chr19 49925904 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:233,0,106 -chr19 49941309 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-1.016;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:756,0,236 -chr19 49973511 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.166;DP=106;FS=4.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:308,0,3208 -chr19 50043538 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.296;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:297,0,2917 -chr19 50047097 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=1.215;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:274,0,1362 -chr19 50076202 . A T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.605;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:275,0,3455 -chr19 50076582 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.607;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:477,0,1970 -chr19 50076583 . A G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=1.607;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=12.13;ReadPosRankSum=2.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:477,0,2001 -chr19 50087669 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=1.540;DP=45;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:316,0,2079 -chr19 50087902 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=1.437;DP=52;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:262,0,4969 -chr19 50087913 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.652;DP=51;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=4.58;ReadPosRankSum=2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,10:51:99:262,0,4969 -chr19 50089654 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-0.862;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:441,0,1895 -chr19 50142487 . T C 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-1.900;DP=24;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=28.95;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:723,0,1160 -chr19 50142636 . G T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.745;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:652,0,853 -chr19 50144460 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.875;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:408,0,847 -chr19 50170248 . G A 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-1.143;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=12.31;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,33:80:99:1013,0,1564 -chr19 50178231 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=1.398;DP=52;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:445,0,1327 -chr19 50180458 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=1.065;DP=125;FS=13.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,30:124:99:634,0,3586 -chr19 50187669 . G A 3012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-2.336;DP=150;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=20.09;ReadPosRankSum=3.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,76:150:99:3041,0,4781 -chr19 50187685 . A C 3006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.629;ClippingRankSum=-0.498;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,78:134:99:3035,0,4781 -chr19 50211507 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-2.344;DP=55;FS=4.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=7.45;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:438,0,1518 -chr19 50215794 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.258;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:306,0,849 -chr2 7422 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.164;DP=89;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,12:88:99:247,0,2855 -chr2 51485 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=1.315;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:398,0,750 -chr2 53717 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.323;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:293,0,555 -chr2 83222 . T G 5757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:123:99:5786,391,0 -chr2 83224 . A G 5757.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,130:130:99:5786,391,0 -chr2 96410 . C T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=-0.606;DP=113;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,33:112:99:804,0,3298 -chr2 96524 . C T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=-0.904;DP=94;FS=3.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:314,0,3681 -chr2 100926 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-0.407;DP=114;FS=1.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=4.95;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,27:114:99:592,0,3311 -chr2 116825 . G A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=-0.501;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:572,0,1020 -chr2 117589 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.597;DP=59;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:312,0,1641 -chr2 155361 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.951;DP=39;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:332,0,869 -chr2 161354 . C G 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.662;DP=89;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:737,0,5192 -chr2 161358 . T A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.499;DP=95;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:742,0,5192 -chr2 172343 . G T 606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:635,45,0 -chr2 215113 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=-0.636;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:275,0,743 -chr2 217393 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-2.296;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:331,0,415 -chr2 334844 . A T 2511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-1.176;DP=64;FS=10.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:2540,0,1514 -chr2 335054 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=-2.940;DP=139;FS=3.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:139:99:265,0,4473 -chr2 335961 . A C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=-1.725;DP=31;FS=1.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=29.80;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:952,0,102 -chr2 359282 . T C 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.393;DP=51;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=30.41;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:99:1584,0,238 -chr2 359284 . A C 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.427;DP=51;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=30.51;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:99:1584,0,238 -chr2 366940 . A G 1793.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-1.588;DP=52;FS=5.785;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=34.50;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,44:47:90:1822,90,0 -chr2 367005 . A G 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.717;ClippingRankSum=0.393;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=7.03;ReadPosRankSum=5.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,42:136:99:1160,0,7176 -chr2 367051 . C A 1001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-0.417;DP=69;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=14.52;ReadPosRankSum=3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1030,0,1048 -chr2 409719 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:398,0,230 -chr2 447089 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.465;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:376,0,380 -chr2 447227 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=3.627;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:365,0,360 -chr2 447438 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=20.32;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:333,0,214 -chr2 447502 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=16.59;ReadPosRankSum=2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:360,0,397 -chr2 447505 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.375;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,1014 -chr2 870208 . GAC G 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.155;DP=116;FS=3.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=2.19;ReadPosRankSum=-1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,19:89:99:291,0,2226 -chr2 1335909 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=-0.386;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:303,0,227 -chr2 1409521 . T C 2987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.670;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=28.19;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,81:106:99:3016,0,495 -chr2 1476292 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.646;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:315,0,1188 -chr2 1753963 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=28.74;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:488,0,426 -chr2 1823672 . AT A 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.435;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:699,0,260 -chr2 1826370 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.204;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:230,0,668 -chr2 1946362 . AGGTGTCGAGTGGGAAGACTGCGACCGG A 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=3.547;DP=62;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:249,0,4156 -chr2 2472560 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.265;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:351,0,343 -chr2 2616065 . T G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:287,0,330 -chr2 2888657 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=1.263;DP=172;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,28:171:99:350,0,5590 -chr2 2941994 . T TA 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.329;DP=155;FS=3.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,28:150:99:259,0,3583 -chr2 3051349 . GA G 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-1.576;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=16.21;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:556,0,948 -chr2 3051352 . A G 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-1.393;DP=30;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=17.59;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:556,0,927 -chr2 3051886 . C T 1926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-0.159;DP=135;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,55:135:99:1955,0,2752 -chr2 3052097 . GT G 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=1.794;DP=82;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.561;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:675,0,1342 -chr2 3052774 . GT G 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=-0.275;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:927,0,652 -chr2 3066143 . T G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-1.087;DP=77;FS=16.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:547,0,5081 -chr2 3067538 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-2.270;DP=53;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:352,0,1512 -chr2 3069904 . A AT 237.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:275,27,0 -chr2 3074617 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=-0.584;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:544,0,144 -chr2 3086525 . GC G 1093.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.303;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1131,0,109 -chr2 3086765 . TC T 1250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-1.315;DP=68;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,48:63:99:1288,0,223 -chr2 3395824 . ACG A 705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=-0.380;DP=99;FS=7.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.13;ReadPosRankSum=-4.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:743,0,3973 -chr2 3396506 . T C 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.334;DP=303;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,57:287:99:821,0,13258 -chr2 3405822 . A G 5939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-1.145;DP=397;FS=3.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,181:395:99:5968,0,6678 -chr2 3419196 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:323,0,276 -chr2 3426095 . T C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.133;DP=55;FS=5.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:636,0,1220 -chr2 3449648 . TGTAAGTCGGATCCATTGATCAGGATAATGCTGAATAAAAACGACTATACGTTTCAATATGTTTTTTATCTGTTCTAG T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=2.268;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=37.47;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:99:1057,0,490 -chr2 3465232 . G GT 3794.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=-0.846;DP=155;FS=2.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:3832,0,1950 -chr2 3565819 . AT A 1780.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,1:10:99:1818,0,359 -chr2 3565956 . A G 469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:498,36,0 -chr2 3567173 . C CTT 900.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=-2.399;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=25.01;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:1:935,0,1 -chr2 3567352 . A AT 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=1.121;DP=69;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:645,0,1118 -chr2 3764921 . CT C 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.239;DP=24;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:343,0,179 -chr2 3771261 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.890;DP=22;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:412,0,759 -chr2 3771725 . TTA T 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.039;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,508 -chr2 3772585 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.537;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.65;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:396,0,48 -chr2 3772604 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-1.381;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=20.91;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,163 -chr2 3881078 . G A 2372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.864;DP=83;FS=9.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=28.59;ReadPosRankSum=-2.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:2401,0,150 -chr2 3881122 . TA T 1239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.714;DP=141;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.104;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,50:83:99:1277,0,1171 -chr2 3881171 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=-2.202;DP=79;FS=11.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:883,0,1498 -chr2 3881816 . T G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-1.917;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:464,0,479 -chr2 3882083 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.655;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.496;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:239,0,1730 -chr2 3884084 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-2.541;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=10.03;ReadPosRankSum=2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:269,0,523 -chr2 3911573 . TCCTGTGAAAATGAAATGAAATACAGCACTGGTTGTACAAGCTAGACCTGAGAAGTAAGCCCAGTCTACATAAATAATAATAATGTACAAGCAATA T 2319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=1.602;DP=53;FS=3.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.471;QD=31.01;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2357,214,0 -chr2 4003067 . A G 2223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-2.539;DP=289;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,87:289:99:2252,0,9426 -chr2 4003206 . C T 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.184;DP=296;FS=3.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,63:296:99:1180,0,9320 -chr2 4058271 . C T 1665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.010;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,50:149:99:1694,0,3820 -chr2 4064022 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=3.679;DP=72;FS=16.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.552;QD=3.89;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,12:72:99:308,0,4893 -chr2 4064029 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=3.540;DP=80;FS=12.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=3.40;ReadPosRankSum=-2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:300,0,4893 -chr2 4064192 . C T 2275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.196;DP=134;FS=4.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.837;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,63:134:99:2304,0,2370 -chr2 4105589 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-1.127;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:318,0,587 -chr2 4306457 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.270;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=12.63;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,321 -chr2 4320956 . G C 2232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-0.807;DP=192;FS=13.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,67:187:99:2261,0,4043 -chr2 4333089 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.465;DP=211;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,34:211:99:316,0,6652 -chr2 4425063 . C T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-1.705;DP=219;FS=4.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=8.51;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,70:219:99:1892,0,5745 -chr2 4733088 . G GT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=3.480;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=12.78;ReadPosRankSum=-2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:344,0,347 -chr2 4736993 . A AT 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.707;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:28:1008,0,28 -chr2 4789483 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr2 4790348 . T A 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-0.148;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1182,0,349 -chr2 4790350 . A C 1421.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-1.061;DP=42;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=33.85;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:26:1450,0,26 -chr2 4807885 . C CT 445.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:1:480,1,0 -chr2 4839349 . G A 1573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.900;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=32.12;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:29:1602,0,29 -chr2 5049527 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.138;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:491,0,598 -chr2 5065562 . TCTAGAATTACCGCAAAAATTGAGCATTAAGAATTCATATGTACTTCCACTAAAACGCTTTATAATGGTAAGAGCTCAGGGCAATACTAAC T 9163.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=2.426;DP=218;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=22.33;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,209:211:99:9201,705,0 -chr2 5068582 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=2.657;DP=128;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,34:128:99:958,0,7348 -chr2 5101126 . A G 500.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:529,36,0 -chr2 5398725 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:297,0,43 -chr2 5398746 . T A 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr2 5448689 . GGGTAAGTCTGATAAGTCACATTTTTTTCAGTTCTGCTTTAAGTAAAGTGCATCATTTCTTATTTAAAATGACTTTTTAAATGAATTCCCATTGTTTTGCCA G 1318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=3.966;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=26.91;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1356,0,4740 -chr2 5448868 . AAGGTCGGTAACTGTATTTCAAATTAAAAAGTGCATTGTTAATATGATTAATCGAGCATTGATTGTTTCCTTCAACCATTTCCAC A 2176.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=1.126;DP=57;FS=2.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=34.39;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2214,176,0 -chr2 5452401 . T G 416.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=29.87;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:444,0,5 -chr2 5455564 . CA C 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.404;DP=37;FS=4.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:71:523,0,71 -chr2 5749410 . ACTAGAAAAAAAAAGCATGCGCAAAACAAAAACAAGTTTATATGCAAGATTACTGTTGCTAACGGACTTATTTACCTATTTTAAATACTCATGTATGTAATTCATTTCCCCTTTACCTCTGATTGTAGACACTGTACAGTATGAAAAAGGAATGTTACATGGAATCAGGTCAGAGATGAGAAAGTGTTAC A 16554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.804;DP=367;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,358:364:99:16592,1648,0 -chr2 5794590 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:261,0,50 -chr2 5909196 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=-1.361;DP=20;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=19.19;ReadPosRankSum=-2.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:412,0,1028 -chr2 5987118 . T G 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.852;DP=40;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:688,0,655 -chr2 6265753 . G A 916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.179;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=32.74;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:945,72,0 -chr2 6265784 . T A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.824;DP=39;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=23.74;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:954,0,314 -chr2 6742404 . C T 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.107;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:810,0,826 -chr2 6761834 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.815;ClippingRankSum=-2.519;DP=30;FS=13.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:448,0,650 -chr2 6828596 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.839;DP=29;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:340,0,641 -chr2 6834197 . T A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.156;DP=41;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:455,0,900 -chr2 6841501 . AAGGTTCTGCTCTTTTACGCTCAATTTTCTGTTTTGAAATGATCGCAGGTAAAGTTTGTATATAAAGTCCCTTCACGTTGTGC A 2386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=1.821;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=31.10;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,53:55:99:2424,195,0 -chr2 6856309 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.074;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:335,0,924 -chr2 6858008 . T TA 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.349;DP=42;FS=5.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:290,0,515 -chr2 6858592 . T C 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:802,0,1054 -chr2 6858607 . T C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.088;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=22.86;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:705,0,1440 -chr2 6859199 . T C 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.934;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:480,0,681 -chr2 6859443 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.390;DP=51;FS=16.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:285,0,1929 -chr2 6862836 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.601;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:294,0,1141 -chr2 6867141 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-1.141;DP=39;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=7.40;ReadPosRankSum=2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:317,0,1012 -chr2 6870742 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.612;DP=83;FS=3.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,22:82:99:500,0,2212 -chr2 6889727 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=1.922;DP=47;FS=7.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:242,0,1343 -chr2 6943942 . G T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.027;DP=104;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,41:104:99:1405,0,3198 -chr2 6944162 . CA C 1615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=2.349;DP=110;FS=12.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,68:110:99:1653,0,944 -chr2 6945037 . G A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.791;DP=188;FS=2.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:1512,0,4807 -chr2 6945636 . A G 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.106;DP=137;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,35:137:99:729,0,4993 -chr2 6945867 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.120;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:377,0,1882 -chr2 6945887 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.683;DP=61;FS=6.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:234,0,2584 -chr2 6946258 . T C 1788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.844;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,68:204:99:1817,0,5234 -chr2 6951479 . TCTACATATGATAAAAATAAAGCAAACAAATGAAACTAACCACAAAAAACGCAAAAATAAGTAAAAAATAATACGCTAC T 1716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=7.346;DP=144;FS=12.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=11.92;ReadPosRankSum=3.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,48:144:99:1754,0,49107 -chr2 7384130 . A G 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr2 7384132 . G A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr2 7404268 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr2 7404947 . C T 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 -chr2 7405522 . G A 475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:504,36,0 -chr2 7446506 . TCTGTACAAAAGAAGTTCTGACTTTTTGAGCTCATGTACTTACATTGGAGGCATTGTAATTTAAACCTCTGGTAC T 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=-1.839;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=32.90;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,33:42:99:1419,0,641 -chr2 7488265 . TCTAGAGGAAAACAAAACAATAAAACTGAAAAAACGCTAGTTAACTACATGAAAATGAAACTAAAAAAGGAAAGTGAACCCAACACATGC T 3856.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=3.442;DP=108;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=29.32;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,91:108:99:3894,0,4403 -chr2 7831479 . A G 214.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:243,0,19 -chr2 8091142 . G A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr2 8437976 . A G 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=3.178;DP=506;FS=24.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=1.72;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:423,83:506:99:899,0,31563 -chr2 8437979 . T C 4856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.958;DP=524;FS=9.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:355,169:524:99:4885,0,13633 -chr2 8440073 . A AG 9077.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=1.702;DP=272;FS=4.829;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=33.37;ReadPosRankSum=1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,228:229:99:9622,673,0 -chr2 8445479 . T TTA 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.617;DP=169;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,32:148:99:549,0,4190 -chr2 8453996 . TCTGCAAAACACAAGCAGCCATTGGGGAATGTTCAAATGTGACCATTAGGGAAGAAAGAAATGAGACTTAC T 1818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.776;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=34.98;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,44:49:99:1856,0,989 -chr2 8518426 . GAGGTTCTTCGTCCCTGATGTCTAGAGTTCTGTGCAGTTGCTCCACATTGTATACTGTAAATCTAAACATCATTATCTGTTCCTCTTAC G 1951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=2.931;DP=61;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=32.00;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,51:56:99:1989,0,685 -chr2 8555698 . T C 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=1.163;DP=77;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=7.98;ReadPosRankSum=2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:643,0,2037 -chr2 8561329 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-1.339;DP=91;FS=3.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,17:91:99:292,0,2965 -chr2 8624406 . CG C 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.208;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:457,0,390 -chr2 9291922 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.022;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:290,0,438 -chr2 9369251 . T A 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:353,27,0 -chr2 9491143 . CA C 1032.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.109;DP=65;FS=7.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,42:61:99:1070,0,268 -chr2 9561098 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.165;DP=43;FS=6.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.207;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:659,0,848 -chr2 9579417 . T C 6176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=1.925;DP=376;FS=0.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,194:376:99:6205,0,6533 -chr2 9605471 . CTATAATACACCAGACAACGAAAATGAACATGAGGTTCGCTAGCTGATAGAAGAGCTCTGTGGGACCTTGATAAGATTTAAGGCATTCAGCCCAACAAGAAAAAAAAAGAGATAAAGCAGACAAGATGGTGAACTCTTAAAGCGATAGTTCACTCAAAATGGTCATCATTTACTCACT C 1347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=28.01;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,1:13:99:1386,0,7643 -chr2 9607489 . GT G 2476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=3.341;DP=359;FS=13.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=6.90;ReadPosRankSum=-3.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,110:330:99:2514,0,7339 -chr2 9607498 . G T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.370;DP=286;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,44:284:99:411,0,13028 -chr2 9630845 . A G 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.513;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:512,0,635 -chr2 9655154 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.100;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=24.90;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:601,0,317 -chr2 9655292 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,180 -chr2 9763467 . G T 1846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.213;DP=116;FS=8.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,54:116:99:1875,0,4254 -chr2 9772264 . GA G 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=3.000;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:247,0,182 -chr2 9778646 . T C 1519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=1.580;DP=204;FS=13.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.878;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,61:204:99:1548,0,5609 -chr2 9829315 . A T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr2 9830824 . G A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr2 9935987 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=4.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:523,0,525 -chr2 9937868 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.404;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=26.06;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:341,0,127 -chr2 9940340 . C CA 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-2.325;DP=329;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=1.72;ReadPosRankSum=2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,77:301:99:602,0,8660 -chr2 9975158 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.800;DP=46;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:366,0,1247 -chr2 10141635 . A G 6745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.299;DP=357;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,204:357:99:6774,0,5339 -chr2 10177958 . G A 4332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.771;DP=229;FS=2.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,129:229:99:4361,0,3592 -chr2 10187838 . A T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=2.266;DP=24;FS=9.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.968;QD=26.87;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:673,0,731 -chr2 10195960 . TCTAAAGACAGAGACATGTATAAAACAAGTTCACCATATACATAAAACACATAAAAACCTGTCCCGACACTCAC T 2780.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.653;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=30.82;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2818,243,0 -chr2 10272432 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.872;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=17.25;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:287,0,254 -chr2 10324493 . G T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=1.704;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:465,0,517 -chr2 10328422 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-1.315;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.381;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:326,0,401 -chr2 10329088 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.251;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=21.63;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:396,0,175 -chr2 10477408 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=27.56;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:359,0,89 -chr2 10725039 . T A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.705;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=29.72;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:682,0,117 -chr2 10895735 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.043;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:278,0,1039 -chr2 11122133 . A C 4594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.670;DP=144;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.988;QD=31.91;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,119:142:99:4623,0,580 -chr2 11127946 . G A 5450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.351;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=29.86;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,116:124:99:5479,310,0 -chr2 11128051 . G A 4936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-1.092;DP=126;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,122:126:99:4965,367,0 -chr2 11128270 . T C 1633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1662,117,0 -chr2 11128484 . T G 8419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:200:99:8448,606,0 -chr2 11420665 . A AT 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.564;DP=36;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:584,0,129 -chr2 11421421 . G GT 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-1.765;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=12.85;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:500,0,705 -chr2 11423486 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.363;DP=56;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:933,0,1097 -chr2 11424592 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=1.956;DP=45;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:487,0,1020 -chr2 11594287 . A G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.767;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:534,0,1287 -chr2 11594288 . T A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=1.912;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=15.33;ReadPosRankSum=-1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:534,0,1290 -chr2 11623630 . CT C 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.398;DP=47;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:242,0,822 -chr2 11717566 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-0.517;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:416,0,400 -chr2 11717752 . C G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.022;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:417,0,555 -chr2 11793889 . TA T 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-1.560;DP=59;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:296,0,741 -chr2 11794003 . A AT 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.534;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:278,0,480 -chr2 11989406 . C G 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr2 11989922 . C T 955.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.484;DP=30;FS=2.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=31.86;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:23:984,0,23 -chr2 11990170 . A T 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr2 11990653 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr2 11991436 . G T 611.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:640,51,0 -chr2 11992110 . G A 905.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.377;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=34.15;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:934,66,0 -chr2 12073353 . TA T 210.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.39;MQ0=0;QD=23.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:248,24,0 -chr2 12099990 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:303,0,213 -chr2 12210145 . CT C 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-0.354;DP=15;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:372,0,1246 -chr2 12210147 . GTGCACATCAAGAGTAAAGTTACAATAACCATCACTCAAAACTCACTGTAAGTGTGATGCAAGATCCTTACCA G 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.306;DP=16;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=20.92;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:372,0,1246 -chr2 12590722 . A T 871.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:900,63,0 -chr2 12690052 . C G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=1.669;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:308,0,511 -chr2 12694324 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.013;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:382,0,1049 -chr2 12727508 . G A 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.349;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=16.45;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:637,0,639 -chr2 12793208 . A C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=-0.405;DP=45;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:925,0,646 -chr2 12795406 . A C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.183;DP=47;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.689;QD=18.10;ReadPosRankSum=-1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:879,0,707 -chr2 12795799 . G A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=1.861;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1136,0,948 -chr2 12799130 . T A 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.010;DP=49;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=18.71;ReadPosRankSum=1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:945,0,747 -chr2 12802191 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=1.271;DP=28;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:322,0,535 -chr2 12812253 . C A 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.917;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:1003,0,1137 -chr2 12815057 . C A 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.510;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,25:60:99:873,0,1158 -chr2 12828638 . G C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=1.099;DP=58;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:879,0,1166 -chr2 12829113 . T C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-0.320;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:705,0,614 -chr2 12960763 . C T 673.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:702,51,0 -chr2 12960823 . G A 1187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1216,93,0 -chr2 13013720 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:304,0,388 -chr2 13029688 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.739;DP=34;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:384,0,765 -chr2 13048657 . T G 3241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=-1.653;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,90:199:99:3270,0,3692 -chr2 13051109 . G T 4154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.757;DP=289;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=14.38;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,118:289:99:4183,0,5799 -chr2 13205062 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr2 13606335 . G C 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=-1.030;DP=33;FS=8.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:541,0,622 -chr2 13842122 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-1.945;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:280,0,443 -chr2 13843274 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-0.529;DP=13;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,181 -chr2 13960583 . A T 292.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:19:321,0,19 -chr2 13978346 . G C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.34;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:252,0,141 -chr2 13984824 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-1.109;DP=22;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:251,0,448 -chr2 13985498 . A G 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.745;DP=25;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.850;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:487,0,250 -chr2 13985716 . T C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=1.569;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.185;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:404,0,421 -chr2 13985804 . T A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.162;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:523,0,551 -chr2 13985847 . T G 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.435;DP=56;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:852,0,606 -chr2 14126890 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.312;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:347,0,658 -chr2 14321223 . T C 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr2 14343955 . G T 573.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:602,42,0 -chr2 14400252 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.375;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:258,0,488 -chr2 14623612 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=2.209;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:334,0,660 -chr2 14795329 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-0.048;DP=20;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=15.24;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,383 -chr2 14797377 . A G 998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1027,75,0 -chr2 14797502 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-0.465;DP=31;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:351,0,405 -chr2 14801610 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr2 14895717 . G A 1695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-2.020;DP=132;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1724,0,2991 -chr2 14974878 . G C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.162;DP=34;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=10.70;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:392,0,777 -chr2 14997039 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=1.368;DP=35;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:289,0,875 -chr2 15016518 . T G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.436;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:364,0,710 -chr2 15210763 . G A 3665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=1.489;DP=245;FS=11.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,103:245:99:3694,0,4804 -chr2 15211266 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=3.280;DP=60;FS=7.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:359,0,3358 -chr2 15211725 . T A 2452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=1.641;DP=227;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,76:227:99:2481,0,5338 -chr2 15218931 . C CT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-1.355;DP=243;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,46:225:99:437,0,4937 -chr2 15220605 . G T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-4.065;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=3.99;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:595,0,4367 -chr2 15257020 . G T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=-2.312;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,53:204:99:1196,0,5452 -chr2 15257035 . A T 1056.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-1.415;DP=197;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,49:197:99:1085,0,5494 -chr2 15289491 . G C 3375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.546;DP=206;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,99:204:99:3404,0,3219 -chr2 15327581 . C T 927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.548;DP=198;FS=8.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=4.69;ReadPosRankSum=2.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,42:198:99:956,0,12190 -chr2 15327586 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=-0.386;DP=186;FS=3.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,40:186:99:938,0,12190 -chr2 15327648 . G A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=1.725;DP=172;FS=23.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,35:171:99:523,0,4985 -chr2 15338755 . C A 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.555;DP=213;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,69:213:99:1845,0,5413 -chr2 15338789 . T C 2809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.839;DP=223;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,85:223:99:2838,0,4474 -chr2 15651879 . G A 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr2 15984851 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=-0.571;DP=97;FS=3.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,18:97:99:291,0,3063 -chr2 16012424 . A C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-0.253;DP=82;FS=3.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:399,0,2285 -chr2 16019994 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.949;DP=139;FS=13.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,31:139:99:634,0,4033 -chr2 16030336 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.530;DP=96;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:698,0,2553 -chr2 16348975 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=1.068;DP=39;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.914;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:936,0,589 -chr2 16348976 . A G 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=1.068;DP=39;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:936,0,633 -chr2 16349085 . A G 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:752,54,0 -chr2 16349109 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.788;DP=29;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,380 -chr2 16349159 . C T 1301.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.286;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=26.04;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:19:1330,19,0 -chr2 16535034 . C CA 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-4.515;DP=268;FS=13.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.986;QD=2.11;ReadPosRankSum=3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,58:263:99:602,0,5653 -chr2 16535477 . CT C 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.827;DP=156;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,52:134:99:1095,0,2251 -chr2 16543714 . G A 3098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-2.493;DP=264;FS=3.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,93:255:99:3127,0,5493 -chr2 16544403 . TCTGCACAGAGGACGACCATGACTAGATTACATTCATATTATTGTGACTATGTTGATTTGGGAGTGCACATTTGAAAGACTAAACCAAAAACACTTGATATAC T 11543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=1.020;DP=301;FS=7.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=27.07;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,278:298:99:11581,0,356 -chr2 16556240 . G A 463.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=33.11;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:3:490,3,0 -chr2 16585626 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.669;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:258,0,256 -chr2 16588117 . CTTAAAAATTCACAACAGACAAGAAGCTTGTAACCAGAAACCTTGGTATTATAACCAGCAGCTTTGTGACATAGACAGAGAAAACATTTAAGATTTT C 1534.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:1572,0,350 -chr2 16918584 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-0.181;DP=43;FS=5.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:259,0,1347 -chr2 17086661 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:25:236,0,25 -chr2 17086679 . T C 207.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:236,0,25 -chr2 17272298 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.263;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.45;ReadPosRankSum=2.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:351,0,440 -chr2 17299006 . G T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.764;DP=71;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:929,0,1501 -chr2 17299151 . G T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=-2.610;DP=77;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.32;ReadPosRankSum=2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:900,0,1727 -chr2 17350160 . T A 1453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-1.267;DP=139;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.655;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,46:138:99:1482,0,3101 -chr2 17383219 . A C 972.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.413;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:72:1001,72,0 -chr2 17383334 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.035;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:774,0,422 -chr2 17383386 . G C 2384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=3.580;DP=58;FS=1.976;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=29.33;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,38:43:99:2413,106,0 -chr2 17383996 . G C 3452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-1.462;DP=115;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=30.02;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,91:114:99:3481,0,768 -chr2 17416111 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=-0.771;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:496,0,3191 -chr2 17428049 . G A 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.475;DP=124;FS=0.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,33:124:99:733,0,3343 -chr2 17428082 . A C 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.982;DP=133;FS=2.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=7.61;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,41:133:99:1041,0,3313 -chr2 18078065 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.105;DP=74;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:640,0,1850 -chr2 18275143 . T TA 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=-0.023;DP=175;FS=3.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,48:165:99:684,0,3040 -chr2 18275694 . TCTAGCAGAAAAATCAAACAGTGATGACTAGGAACAAACACATAAAACTGAGAAAACGCAAAGCATAAGGTTCTTAC T 9911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=2.903;DP=266;FS=5.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,240:262:99:9949,0,2454 -chr2 18285224 . G A 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.960;DP=238;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,57:238:99:1180,0,6721 -chr2 18561939 . T G 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr2 18938451 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:240,0,334 -chr2 18938640 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,292 -chr2 18986488 . T G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=-1.097;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:417,0,1525 -chr2 19237410 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.973;DP=37;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:230,0,1141 -chr2 19461972 . TCCTGCAGAAATAAGGGGCACACATTATGAATCAGACAGCTTGATGATATTTGATATATGGTGTAGATTTGTAAAAAAGGGCACATTCTTA T 11051.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.148;DP=291;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=30.33;ReadPosRankSum=0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,273:277:99:11089,798,0 -chr2 20292454 . AGTGAGACTGCTTGTTTTCCTACCAACATACATAAATGATCTGTAACAACACTTCCTGCCTAATGAGTGACTCTTGTTTGTTGGATCGTTAG A 3153.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.054;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:3191,311,0 -chr2 20337930 . ACTTAGAGAAGGACAAAAAACACACACATGATGTCATGTTTAATGTACAAATGAAACTGACAAGCTTCTATGTGATATTTGGCAGGATGTTTTCTGAAACGCAC A 2747.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=2.086;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=31.59;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:61:99:2785,263,0 -chr2 20459588 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.044;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:287,0,366 -chr2 20471556 . C A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=-3.034;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=11.43;ReadPosRankSum=-3.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:634,0,636 -chr2 20471993 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.254;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:52:364,0,52 -chr2 20584167 . A T 863.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.562;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=33.20;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:10:891,0,10 -chr2 20584254 . A G 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.827;DP=61;FS=13.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:730,0,1649 -chr2 20596997 . TCCTGTGAGGGATGATATCATCAGTGCACCAGTTGTCTATGGTTTGGATGAATCCTTACATTTATTATAAGGTGTTATTGAAAAGTGAAAGGGTTAATA T 5758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.170;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,139:142:99:5796,568,0 -chr2 20602920 . A G 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-0.854;DP=44;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=26.79;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1207,0,202 -chr2 20623999 . G A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-2.318;DP=42;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:898,0,554 -chr2 20661044 . T C 1117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-0.063;DP=94;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,33:94:99:1146,0,2132 -chr2 20664384 . CGTAAGAAAGCGAAACTAACCTGTATTTAAACATGTTAGGTCACAGAAACACACTTTCTTTCCTGACTGTTTTCTTTTACAG C 1784.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.634;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,45:47:99:1865,0,427 -chr2 20718774 . CACCTAAAACACGACAGAATCTTTAGCATATGACCTGCAGTCTTGTATGCACTTTGAATCAGATGTAAATTTGAATGCCACTT C 3278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=-0.086;DP=106;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=30.93;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,87:94:99:3316,0,824 -chr2 20752880 . GAGGTCAGGTCTACTCTTCAATCTCTGGCTTTCACCTGCAGTTTGTTTTTGCTCTTCATTCTACATGATTCTTTTGTTTTGC G 1546.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=1.652;DP=43;FS=3.547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=32.70;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:99:1584,132,0 -chr2 20770576 . CT C 2213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-3.381;DP=212;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,94:202:99:2251,0,2373 -chr2 20973321 . GAGGTTGCCTATTAACCTGATGGATGTTTTTTTTCATAAGGAGTAAGGGATGTTAAATGTAGCATTTAAATTTTTTTTTTTGT G 595.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.917;DP=115;FS=2.426;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=5.18;ReadPosRankSum=-1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,106:109:99:633,218,0 -chr2 21563011 . CA C 986.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.993;DP=214;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,62:202:99:1024,0,4008 -chr2 21564144 . T A 1777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=1.103;DP=134;FS=0.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,55:133:99:1806,0,2365 -chr2 21565343 . A T 1627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=-0.332;DP=237;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,61:235:99:1656,0,9223 -chr2 21568737 . G A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=1.040;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,58:201:99:1249,0,4876 -chr2 22315414 . GAGGTAAACTATCAGACCACGGTCACATTATTTAGAGTTTTTTTTTTAACCACTTTCTAATTGATTTTCCTTCTTAAACTTCAT G 3374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.638;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=31.42;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,81:83:99:3412,260,0 -chr2 22481455 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.472;DP=34;FS=8.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:253,0,1670 -chr2 22535647 . C CT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.116;DP=59;FS=8.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:305,0,1058 -chr2 22811445 . T G 1693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:99:1722,123,0 -chr2 22811451 . G A 1693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=-1.009;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1722,123,0 -chr2 22811533 . C G 3022.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:3051,220,0 -chr2 23192012 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-1.737;DP=398;FS=6.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:331,66:397:99:569,0,12840 -chr2 23192117 . T A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=1.461;DP=66;FS=5.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:429,0,1925 -chr2 23304903 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,407 -chr2 23314614 . C T 10674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.970;DP=289;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=29.94;ReadPosRankSum=2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,113:286:99:10703,0,5514 -chr2 23314753 . A C 2379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-1.792;DP=277;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,109:277:99:2408,0,12790 -chr2 23321683 . TA T 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=-0.531;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:270,0,236 -chr2 23322453 . G C 3530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.835;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,100:234:99:3559,0,4589 -chr2 23322816 . T C 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=33.09;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:99:3357,0,4326 -chr2 23322825 . A G 3328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-0.972;DP=247;FS=1.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,97:229:99:3357,0,4369 -chr2 23323616 . C T 3100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.977;DP=227;FS=0.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=13.66;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,93:227:99:3129,0,7719 -chr2 23327272 . G A 3385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.091;DP=231;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.973;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,98:230:99:3414,0,4379 -chr2 23452385 . C A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.630;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:491,0,390 -chr2 23478086 . G T 1861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.481;DP=104;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=17.90;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,57:103:99:1890,0,1672 -chr2 23478217 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=1.769;DP=48;FS=11.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.476;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:315,0,2746 -chr2 23478219 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=1.939;DP=47;FS=11.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:315,0,2746 -chr2 23478325 . A C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.231;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:608,0,961 -chr2 23482053 . T C 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.338;DP=89;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1024,0,1873 -chr2 23487635 . G A 2198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-0.182;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,68:116:99:2227,0,1649 -chr2 23544628 . G A 2318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=2.298;DP=184;FS=12.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,77:184:99:2347,0,3427 -chr2 23544690 . C T 2189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=-0.308;DP=144;FS=4.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=15.21;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,49:143:99:2218,0,7061 -chr2 23544707 . G C 2189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=-1.200;DP=152;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,52:151:99:2218,0,7028 -chr2 23547017 . G A 4511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-2.244;DP=306;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,133:303:99:4540,0,5520 -chr2 23549239 . A G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=-1.601;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=13.01;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:900,0,1507 -chr2 23552226 . CTA C 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,0:6:99:244,0,332 -chr2 23554617 . G T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=-0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:297,0,240 -chr2 23583139 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:317,0,529 -chr2 23584184 . T G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=1.337;DP=35;FS=13.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:621,0,629 -chr2 23586274 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=-0.404;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:680,0,790 -chr2 23587357 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.173;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:389,0,910 -chr2 23587606 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=11.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:282,0,379 -chr2 23587618 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-1.021;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:361,0,354 -chr2 23594745 . T C 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=1.133;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=30.61;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:518,0,376 -chr2 23599023 . A AGATAATGGTAAG 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:259,0,128 -chr2 23599379 . A C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-1.012;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=10.40;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:361,0,739 -chr2 23615784 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:336,0,274 -chr2 23645219 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.380;DP=36;FS=4.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.570;QD=17.47;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:657,0,630 -chr2 23660959 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.844;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:262,0,347 -chr2 23795426 . T C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=1.542;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:746,0,721 -chr2 23821197 . G A 924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.789;DP=39;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=23.71;ReadPosRankSum=-2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:953,0,390 -chr2 23832942 . T C 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.294;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:906,0,877 -chr2 23833237 . T TA 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.449;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:475,0,558 -chr2 23833259 . C G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=-0.207;DP=37;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:561,0,694 -chr2 23834069 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=-0.174;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:411,0,427 -chr2 23877953 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=-2.626;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=21.65;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:418,0,214 -chr2 23902983 . T A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.407;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:723,0,1068 -chr2 23920636 . C A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=-0.136;DP=79;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,30:79:99:1057,0,1684 -chr2 23926184 . A T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.478;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=13.16;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:844,0,1174 -chr2 23983696 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:377,0,287 -chr2 24009692 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,135 -chr2 24009954 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-1.743;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,454 -chr2 24010534 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:433,0,239 -chr2 24011377 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=18.62;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,185 -chr2 24012914 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.638;DP=30;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=10.26;ReadPosRankSum=-1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:336,0,710 -chr2 24013622 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=24.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:300,0,93 -chr2 24014190 . G C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=32.97;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:259,0,296 -chr2 24015039 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-0.708;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:426,0,661 -chr2 24015383 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.532;DP=32;FS=1.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:473,0,695 -chr2 24045599 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-0.762;DP=53;FS=5.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:703,0,1133 -chr2 24046089 . A T 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.655;DP=50;FS=1.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:757,0,954 -chr2 24047916 . T C 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.095;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1093,0,1467 -chr2 24250723 . TCTGCGGGAAACGCATTCCCTTAGTAAACCATCACGGTCAATGTTTACAATCAAAGTCGCTATGCTGAGCACATGTCTCGTGTTGAAACTTGC T 951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=2.254;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=33.16;ReadPosRankSum=-2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:56:989,0,56 -chr2 24407657 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-1.115;DP=64;FS=7.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=8.39;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:565,0,1517 -chr2 24420240 . C T 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=-0.332;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=15.68;ReadPosRankSum=2.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1079,0,1124 -chr2 24434065 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.866;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:302,0,1446 -chr2 24441929 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.497;DP=58;FS=10.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=9.05;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:553,0,1576 -chr2 24453198 . C A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=3.532;DP=49;FS=5.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=4.44;ReadPosRankSum=-2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:255,0,1457 -chr2 24453607 . A C 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-0.472;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1084,0,1191 -chr2 24453744 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=1.112;DP=64;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:470,0,1755 -chr2 24454152 . G A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-2.714;DP=86;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,34:85:99:1226,0,1784 -chr2 24454438 . G A 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.324;DP=85;FS=2.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1340,0,1613 -chr2 24454578 . G T 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.484;DP=65;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:1031,0,1323 -chr2 24470812 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.544;DP=65;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.141;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:671,0,1374 -chr2 24492405 . C G 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.069;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:924,0,1275 -chr2 24510028 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.068;DP=68;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:445,0,1821 -chr2 24513376 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.090;DP=79;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:700,0,2033 -chr2 24513444 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-0.084;DP=61;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:742,0,1339 -chr2 24518992 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=-0.345;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:872,0,1217 -chr2 24520507 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=1.660;DP=25;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:237,0,644 -chr2 24522651 . T C 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.726;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,36:75:99:1268,0,1310 -chr2 24532939 . C A 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.732;DP=174;FS=2.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,55:174:99:1503,0,4673 -chr2 24534716 . G GA 209.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr2 24540341 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.237;DP=43;FS=5.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:251,0,1236 -chr2 24646573 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:333,0,641 -chr2 24709511 . C T 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-1.144;DP=105;FS=6.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1326,0,2267 -chr2 24712210 . T G 2001.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=1.314;DP=97;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,47:95:99:2030,0,3816 -chr2 24725548 . GCTATGTATGTGAGAGCAAGATGAAGAAAATATATCAAGCATCAACTTACCAGAAAAAAGGAAATAAGTAC G 1896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=2.720;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=28.71;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,45:49:99:1934,0,1191 -chr2 24728732 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-1.488;DP=46;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:343,0,1310 -chr2 24734081 . T A 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.176;DP=72;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,40:72:99:1355,0,1166 -chr2 24739314 . C T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=-2.528;DP=85;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:984,0,1810 -chr2 24844432 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.410;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:593,0,1106 -chr2 24866728 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.010;DP=51;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:450,0,1331 -chr2 24876243 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.510;DP=48;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=6.04;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:318,0,2003 -chr2 24878355 . T C 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.875;DP=14;FS=8.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=32.66;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:34:706,0,34 -chr2 24878356 . T C 728.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=1.678;DP=14;FS=8.921;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=28.09;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,11:13:50:757,50,0 -chr2 24878417 . A T 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.162;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:1058,0,2306 -chr2 24878485 . T C 2763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.381;DP=110;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,72:109:99:2792,0,1136 -chr2 24878506 . T C 2788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=1.540;DP=134;FS=8.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,83:134:99:2817,0,1799 -chr2 24894741 . A C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.344;DP=65;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:514,0,1733 -chr2 24895024 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-2.833;DP=44;FS=20.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.59;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:318,0,2437 -chr2 24896937 . T G 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.897;DP=51;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:700,0,1103 -chr2 24896987 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=2.428;DP=35;FS=12.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:373,0,1946 -chr2 24898184 . A T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-2.012;DP=56;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:877,0,1108 -chr2 24898807 . G GT 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.493;DP=46;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:496,0,458 -chr2 24898872 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=-0.137;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:616,0,761 -chr2 24994909 . T A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.262;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:432,0,1259 -chr2 24995371 . TA T 3609.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=54;FS=3.966;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=29.32;ReadPosRankSum=-2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,37:44:99:3647,238,0 -chr2 24995447 . A G 2196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.013;DP=139;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:2225,0,2125 -chr2 25394172 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.910;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:247,0,254 -chr2 25395552 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-0.583;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=7.76;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:230,0,737 -chr2 25439857 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-1.145;DP=34;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:530,0,606 -chr2 25440454 . T A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.857;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:717,0,469 -chr2 25440517 . CT C 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.746;DP=31;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:307,0,258 -chr2 25463876 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=13.53;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:326,0,434 -chr2 25628381 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-0.055;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:287,0,944 -chr2 25676655 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.128;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:526,0,721 -chr2 25690635 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:284,0,356 -chr2 25721342 . C G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.783;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=18.75;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:647,0,517 -chr2 25741054 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.495;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:357,0,392 -chr2 25749727 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-1.065;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:256,0,518 -chr2 25779616 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=1.796;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:259,0,804 -chr2 25915554 . C T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.099;DP=41;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:586,0,719 -chr2 25920272 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.198;DP=41;FS=19.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:563,0,769 -chr2 25920283 . G A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.632;DP=42;FS=14.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:665,0,726 -chr2 25932249 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,141 -chr2 25932575 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:240,0,213 -chr2 25941895 . C T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.783;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:493,0,690 -chr2 25957933 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=-0.295;DP=51;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:969,0,781 -chr2 25963461 . A G 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-1.000;DP=46;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:657,0,924 -chr2 25963735 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=1.260;DP=28;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:266,0,705 -chr2 25971442 . A G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.417;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=24.84;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:674,0,224 -chr2 25992103 . G GT 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.509;DP=181;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,42:154:99:313,0,3383 -chr2 26125952 . A C 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr2 26125974 . C T 360.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:389,27,0 -chr2 26205010 . G A 3062.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=1.687;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=31.25;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:3091,229,0 -chr2 26205127 . T A 2361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-1.380;DP=74;FS=6.247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=31.92;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:2391,136,0 -chr2 26344975 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.356;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:414,0,2318 -chr2 26356314 . CG C 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.328;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:281,0,2541 -chr2 26431243 . C CT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=-0.350;DP=68;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:488,0,1083 -chr2 26431903 . A AT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.224;DP=105;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:303,0,1646 -chr2 26445664 . C A 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.113;DP=387;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,93:386:99:1995,0,11101 -chr2 26452250 . T C 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.032;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:467,0,2317 -chr2 26581200 . T G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr2 26581204 . A T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:265,18,0 -chr2 26618760 . C T 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-1.910;DP=266;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=5.76;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,68:266:99:1560,0,7784 -chr2 26619131 . CACCTGACAAACATCAAAAGATTATTGATGAGACGCGGGATGAAGCAGACATCTGCACTTTATAAGCAATAACACTT C 14504.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=1.725;DP=348;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=27.98;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,344:347:99:14542,1090,0 -chr2 26639846 . A T 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.706;DP=109;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:463,0,4463 -chr2 26639894 . AGTAAGAAGCCCAAAAATCTCTTCTTCTGTCTTTTCTTTTGTGCAACTTTAAGCAACTGCTGGACTGTAATGTGATTCCTTAG A 3642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-0.893;DP=110;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=33.12;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,95:103:99:3680,0,818 -chr2 26649752 . A G 1889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.028;DP=343;FS=0.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,87:343:99:1918,0,10434 -chr2 26747839 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-0.176;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:658,0,1169 -chr2 26758059 . C A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-1.622;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:481,0,1506 -chr2 26760894 . G T 507.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-1.309;DP=146;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,30:144:99:545,0,4799 -chr2 26760920 . A T 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.978;DP=136;FS=3.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,29:136:99:493,0,5381 -chr2 26768611 . C T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.058;DP=205;FS=3.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,36:204:99:508,0,6323 -chr2 26771667 . A T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.551;ClippingRankSum=0.785;DP=120;FS=0.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,31:120:99:512,0,3272 -chr2 26771927 . T C 1636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=0.246;DP=255;FS=3.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.42;ReadPosRankSum=-2.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,72:255:99:1665,0,7623 -chr2 26779405 . T A 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.765;DP=262;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,63:262:99:1368,0,7887 -chr2 26779551 . G A 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=1.628;DP=264;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.793;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,66:264:99:1427,0,7795 -chr2 26782936 . A G 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.060;DP=142;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.587;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,51:142:99:1245,0,5149 -chr2 26825187 . C A 1907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.684;DP=320;FS=3.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,83:320:99:1936,0,9046 -chr2 26829389 . T A 999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-2.837;DP=250;FS=7.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,53:250:99:1028,0,7694 -chr2 26830201 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.830;DP=160;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,30:159:99:421,0,5790 -chr2 26862582 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-1.122;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.87;ReadPosRankSum=2.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,764 -chr2 27478714 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=-0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:239,0,717 -chr2 27527268 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,325 -chr2 27528441 . T C 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=1.088;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.248;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:546,0,2107 -chr2 27528547 . A T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.712;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,29:84:99:978,0,1837 -chr2 27532757 . G C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=-1.108;DP=55;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.757;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:298,0,1590 -chr2 27536959 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=-0.425;DP=25;FS=1.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:324,0,533 -chr2 27548527 . AGTGAGTGACAACACCCTCAGAAAAAAAGTGTCATATTTATGAAATGCTTGCATGTGTTCACTTATTCTATCTCTCCTTTAG A 1340.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=5.047;DP=216;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=6.21;ReadPosRankSum=-5.007 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,195:207:99:1378,509,0 -chr2 27548726 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=1.393;DP=227;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,46:225:99:768,0,7568 -chr2 27639741 . C T 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=-0.023;DP=197;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,42:197:99:742,0,5592 -chr2 27682270 . C T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=-1.632;DP=173;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=6.83;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,48:173:99:1209,0,4665 -chr2 27686540 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.547;DP=202;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,30:202:99:246,0,6936 -chr2 27688629 . C T 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-1.239;DP=119;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,35:119:99:792,0,4055 -chr2 27688640 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.522;DP=121;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.520;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:393,0,4870 -chr2 27690525 . G GA 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.330;DP=127;FS=3.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:643,0,2319 -chr2 27691128 . A G 2305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-1.235;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,70:205:99:2334,0,4637 -chr2 27691360 . TC T 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=5.452;DP=131;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=2.83;ReadPosRankSum=-4.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,28:127:99:408,0,4326 -chr2 27691385 . T G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=4.728;DP=127;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=2.53;ReadPosRankSum=-4.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,21:127:99:349,0,6870 -chr2 27701542 . T C 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=-0.783;DP=52;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:750,0,1035 -chr2 27701747 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.344;DP=33;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:241,0,958 -chr2 27701841 . TC T 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-1.078;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:316,0,1454 -chr2 27701843 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.444;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:316,0,1454 -chr2 27710698 . C G 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-1.451;DP=292;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,64:291:99:1272,0,8815 -chr2 27794516 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:267,0,327 -chr2 27821936 . C A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=1.026;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:486,0,446 -chr2 27849695 . T A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-1.978;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:301,0,1822 -chr2 27849696 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-1.077;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:301,0,1822 -chr2 27969385 . C A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=-0.998;DP=66;FS=3.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:443,0,1631 -chr2 27995933 . A C 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=2.353;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:438,0,617 -chr2 27995936 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=2.353;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:438,0,617 -chr2 28038772 . A G 316.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.62;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:344,0,10 -chr2 28049994 . C T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,782 -chr2 28217593 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=-1.405;DP=115;FS=3.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,19:115:99:254,0,3703 -chr2 28218380 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-2.736;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,29:136:99:333,0,5080 -chr2 28239236 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-0.550;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:619,0,4688 -chr2 28239271 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.360;DP=143;FS=5.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=3.76;ReadPosRankSum=2.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,29:136:99:566,0,4161 -chr2 28245158 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-1.185;DP=161;FS=13.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=3.06;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,31:161:99:521,0,5076 -chr2 29192643 . AT A 5612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=1.039;DP=289;FS=3.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=19.42;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,1:275:99:5650,0,6947 -chr2 29196761 . TCTGGTAAACAGAAGCAGACATTTTTTCTATTGTTTCATGTTTTTTTTTTATTTAATTTTTTTTTAATAATATCCTGAC T 15386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=1.663;DP=343;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,330:342:99:15424,1301,0 -chr2 29575164 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,507 -chr2 29617764 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.179;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,25:123:99:443,0,4079 -chr2 29694112 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.663;DP=89;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=3.13;ReadPosRankSum=2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:307,0,2778 -chr2 29694322 . T TA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.991;DP=40;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:255,0,557 -chr2 29710630 . T C 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.333;DP=158;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,31:158:99:573,0,5083 -chr2 29820781 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.864;DP=231;FS=2.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,43:231:99:671,0,7234 -chr2 29821082 . T C 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.190;DP=306;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,62:306:99:1048,0,9380 -chr2 29832166 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.373;DP=42;FS=3.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:259,0,1145 -chr2 29832399 . TA T 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-1.028;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:279,0,1830 -chr2 29964173 . TCTGTGAAATAGTAAAGAAATAAACCAACAGTTAACGTACTAAAACATGTTGTAACATCAAAGAGCACATATATATTGTATGTTCATGACAAAAATATGATCTGCGTTCTATTAAAAAGGGGATCGTTTAGGAGACATTACAACTTGATGTAGTAACGTTACAGTAAATCAACGTAAAGCAATGAGCTAC T 1757.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=5.465;DP=363;FS=4.736;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=4.84;ReadPosRankSum=-3.426 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,335:346:99:1795,663,0 -chr2 29984303 . T A 722.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-1.378;DP=21;FS=2.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=34.43;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:14:751,14,0 -chr2 30005894 . C CA 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=1.705;DP=69;FS=12.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:260,0,1342 -chr2 30006786 . A AT 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-0.014;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:240,0,826 -chr2 30144375 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=-1.076;DP=53;FS=4.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:410,0,1456 -chr2 30219310 . TGTAAGTATTGCATTAGTTTCTTTAATAAATTGAGTGTTTTAATGTGATTGCAGACCTCTCTTCTTTTTTCAG T 3941.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.014;DP=88;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,86:88:99:3979,302,0 -chr2 30625695 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.080;DP=368;FS=1.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=0.80;ReadPosRankSum=1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,48:334:99:321,0,10859 -chr2 30638674 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-0.482;DP=229;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,33:228:99:289,0,7558 -chr2 30663073 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=-0.872;DP=231;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,35:231:99:349,0,7682 -chr2 30664228 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.130;DP=291;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,42:290:99:368,0,9626 -chr2 30667768 . C A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=1.457;DP=326;FS=9.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=1.12;ReadPosRankSum=-2.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,48:325:99:392,0,10819 -chr2 30673983 . C CT 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.780;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,50:141:99:757,0,1733 -chr2 30700814 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.423;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:265,0,325 -chr2 30727614 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.940;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,852 -chr2 31143644 . C T 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=-0.581;DP=153;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,38:153:99:910,0,4407 -chr2 31165006 . C A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-1.171;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,19:115:99:271,0,3752 -chr2 31167112 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-1.680;DP=58;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:229,0,2234 -chr2 31332986 . TGGTAAGATCATACTGTCAGATACACTTCCTAAAAAAGTATTCATTAACTAATTACTTTTAAATACGCCAAAACTGTTGTTTTGCGTTACA T 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=2.055;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=24.28;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:450,0,2003 -chr2 31423897 . C G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.758;DP=37;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:547,0,790 -chr2 31480287 . C A 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-0.022;DP=289;FS=7.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,58:288:99:1112,0,9268 -chr2 31480575 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.254;DP=298;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,44:297:99:335,0,9359 -chr2 31524795 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=-0.639;DP=72;FS=5.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:437,0,1845 -chr2 31548667 . TCTGTAATTAAAGTACACATTGATATCCAGTTGGTTAACTTCATTTGCATAAATTCGGGCTCTAAAGAGAACAGCGAGAGCTTAC T 8683.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=1.033;DP=218;FS=2.078;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,209:212:99:8721,635,0 -chr2 31550831 . TCTGAGCACAAAGTGAAAGAAACAATATTATTGTGCCATCATCAGCTCATGTGTGTATTGATGATTTAAACTCTCACACACACAGACAGAC T 6841.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=3.279;DP=160;FS=3.498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=27.28;ReadPosRankSum=-2.870 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,153:160:99:6879,512,0 -chr2 31569274 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.851;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:247,0,1905 -chr2 32133691 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.432;DP=42;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:300,0,1082 -chr2 32207605 . C CA 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=1.003;DP=60;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:279,0,1081 -chr2 32249223 . GCTATAAGAGAAGACAGTCTGAGCTGCACCCACATTTTTCATGTCCTCACAGAAATCAAATCACATAC G 2409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=1.668;DP=68;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=31.42;ReadPosRankSum=-2.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,63:68:99:2447,0,159 -chr2 32279934 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.325;DP=111;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:754,0,3080 -chr2 32287805 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.706;DP=105;FS=6.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,24:105:99:446,0,3021 -chr2 32329242 . C T 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.396;DP=33;FS=2.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=27.92;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,31:33:99:1237,0,190 -chr2 32329248 . TCTACAGTGATAAGCAATCAAAAATCACAATACTATTTAAATAGGTTACTGAACAACTAAAACAAATTCTACTGGATATCGTTAC T 984.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.297;DP=31;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=31.77;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:1022,0,1240 -chr2 32329347 . A G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.773;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:79:630,0,79 -chr2 32373378 . C CT 641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=-2.429;DP=203;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,51:180:99:679,0,4260 -chr2 32433670 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr2 32484333 . TCCTGGAGAAGAGCAAAAGAACATCCCAATTTAACACTGAAACCCAAAAAGAATTGAGCTGTGGAGTTTATCTCGTGAACTCA T 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.936;DP=129;FS=3.045;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,115:117:99:551,205,0 -chr2 32498885 . AAGGTGAGCAGGATGACATTTAGTCACAGTATAAATATCGAATCAGTACTTTTAGTAAATAAAATGCTATATGTTGTTTGTGGTTTTCTGTTTCCTTTTTC A 16285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.209;DP=439;FS=6.072;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.435;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,426:428:99:16323,1186,0 -chr2 32499074 . A G 3559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;ClippingRankSum=0.146;DP=456;FS=3.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.81;ReadPosRankSum=5.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,137:456:99:3588,0,12017 -chr2 32508486 . TACAGGTATGTGAGCCATCGTTTTCACTATCTGATTTGAAGTGAACTTATTTGTGCAGTACTTGCGTTTGGCATGTGATCGGTCAACTACGCCAGCATGTGACTTCCCTCATTTTTCCA T 20633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=4.340;ClippingRankSum=3.879;DP=546;FS=0.759;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=33.56;ReadPosRankSum=-1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,518:544:99:20671,1844,0 -chr2 32912498 . C T 1830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.313;DP=105;FS=5.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,59:105:99:1859,0,1598 -chr2 33045127 . T C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.471;DP=39;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=13.66;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:561,0,780 -chr2 33045145 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.007;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:433,0,683 -chr2 33045764 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=-2.554;DP=41;FS=6.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:565,0,816 -chr2 33134377 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.950;DP=85;FS=2.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:260,0,2680 -chr2 33135709 . T C 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.497;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:1402,0,1538 -chr2 33135733 . T C 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=-2.123;DP=80;FS=5.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.66;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,37:80:99:1281,0,1473 -chr2 33136062 . A C 5176.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=1.083;DP=26;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=29.44;ReadPosRankSum=-1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:7:5204,0,7 -chr2 33136220 . G A 2419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-1.832;DP=123;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=19.67;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,74:122:99:2448,0,2337 -chr2 33138212 . A T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.649;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:508,0,2919 -chr2 33140780 . G C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=22.60;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:322,0,126 -chr2 33398274 . C CTA 771.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-2.995;DP=171;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=4.51;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,37:171:99:809,0,5746 -chr2 33660163 . TGTAAGTTATAATCTTGTTCCAAAAATACAAAAAAAAAAATCCCAAACTCAGTGTTTTACATGCAAGACATTCTTTACAG T 7029.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.826;DP=195;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,188:195:99:7067,0,618 -chr2 33686625 . A G 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.037;DP=136;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,37:136:99:922,0,3889 -chr2 33687564 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=1.112;DP=146;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,25:146:99:337,0,4750 -chr2 33701660 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.151;DP=122;FS=17.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,23:122:99:359,0,3774 -chr2 33789855 . T G 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.651;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:506,0,896 -chr2 33837342 . A C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.454;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.381;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:408,0,1502 -chr2 33843771 . C CA 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.082;DP=52;FS=6.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:320,0,655 -chr2 35314718 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.553;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,33:143:99:677,0,4800 -chr2 35319088 . G T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-1.167;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,59:244:99:1280,0,7123 -chr2 35321928 . T A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=-3.024;DP=189;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,34:189:99:507,0,6284 -chr2 35331016 . G A 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=-0.418;DP=188;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,60:188:99:1583,0,4720 -chr2 35331785 . G GA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=-1.217;DP=69;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,21:65:99:268,0,1220 -chr2 35389405 . C A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr2 35389412 . T C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:21:293,21,0 -chr2 35582221 . CAGGTCAGTCCGGTGAAATGGTCATTTATTTTGTGCGTTGGCATACCACAAGGAGATCGCCTGTGTGACTTCCCTCTGCTGTTATTCCTCCTCCT C 10596.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.790;DP=228;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,227:228:99:10634,987,0 -chr2 35798328 . C CT 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-2.559;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:550,0,1807 -chr2 36328595 . G GA 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.465;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,23:99:99:270,0,2037 -chr2 36710684 . G GT 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.185;DP=18;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:33:304,0,33 -chr2 36845379 . GA G 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.198;DP=113;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,41:98:99:857,0,1396 -chr2 36902890 . A G 6459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-1.629;DP=397;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,183:385:99:6488,0,6578 -chr2 36905692 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=-0.996;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:491,0,1008 -chr2 36978902 . TGTACAACATCTGGCCGGATGGGGAACAAAATGAATAATGTGCAGGTCTTGATGCTTGCTTTTCTCTCTGTGTGTTTAG T 5191.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=2.181;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=32.70;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,120:132:99:5229,0,2512 -chr2 36982042 . TAGGTAGGATCTCTTTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTAC T 1878.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.451;DP=127;FS=3.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1916,0,4671 -chr2 36982044 . GGTAGGATCTC G 1680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=-0.664;DP=124;FS=4.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:1718,0,5327 -chr2 36982056 . TTTACAATTCTGTATTCTTTTGTCATCGACACCAGGATGGCTTCATATAATTCTGTGTGTTTGTGTTTACAGTG T 1680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.925;DP=127;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=13.23;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,56:126:99:1718,0,4994 -chr2 36986491 . GT G 1686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=-0.089;DP=119;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,71:115:99:1724,0,1033 -chr2 37122167 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.282;DP=123;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,26:123:99:454,0,3596 -chr2 37122231 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-1.707;DP=137;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,27:137:99:507,0,4294 -chr2 37174516 . C G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:280,0,352 -chr2 37207731 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.778;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:243,0,751 -chr2 37208525 . T C 1393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:1422,102,0 -chr2 37208634 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.278;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=18.48;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,127 -chr2 37209321 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-0.746;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:305,0,598 -chr2 37209522 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-0.579;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:398,0,491 -chr2 37209674 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=-0.599;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:270,0,772 -chr2 37209989 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-1.001;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:450,0,190 -chr2 37222968 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.757;DP=29;FS=3.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=9.30;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:298,0,738 -chr2 37266544 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-1.113;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:305,0,1301 -chr2 37353445 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=-0.154;DP=37;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:265,0,995 -chr2 37353472 . TA T 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.617;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:296,0,555 -chr2 37353616 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,455 -chr2 37378760 . A G 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=1.582;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=19.68;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:776,0,530 -chr2 37426234 . TCTAAAAAGGACAAACAAATTACTAAGACTTTTGAACAAAACCTGAACAAAAACAAACCAAAGATAACCTTGACATAC T 1949.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.069;DP=45;FS=2.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:99:1987,167,0 -chr2 37438308 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.953;DP=42;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:630,0,946 -chr2 37477689 . A G 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr2 37478672 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.150;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:303,0,259 -chr2 37479157 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.595;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:341,0,1054 -chr2 37479698 . A T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.216;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:334,0,999 -chr2 37510944 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.910;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,909 -chr2 37540486 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.458;DP=43;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=5.30;ReadPosRankSum=-2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:256,0,1087 -chr2 37542816 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.656;DP=53;FS=6.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:336,0,1464 -chr2 37552768 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.154;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=8.36;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:279,0,744 -chr2 37566388 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=2.849;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:262,0,408 -chr2 37572126 . T C 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.691;DP=32;FS=5.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:602,0,451 -chr2 37576853 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.149;DP=150;FS=6.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,32:149:99:590,0,4471 -chr2 37581730 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=1.258;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:99:333,0,5061 -chr2 37605884 . CG C 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.420;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:506,0,1831 -chr2 37698185 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.022;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.458;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:245,0,821 -chr2 37717280 . A G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-0.678;DP=46;FS=6.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:687,0,876 -chr2 37724465 . T G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-1.678;DP=31;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:241,0,883 -chr2 37729834 . A AT 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-1.634;DP=314;FS=4.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,73:304:99:1026,0,6904 -chr2 37731837 . T C 2022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-1.572;DP=348;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,94:347:99:2051,0,9120 -chr2 37736281 . AGAGAAT A 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=7.373;DP=169;FS=10.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.622;QD=2.73;ReadPosRankSum=-3.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,29:142:99:499,0,7978 -chr2 37736764 . GT G 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.530;DP=66;FS=7.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:573,0,372 -chr2 37755569 . TGAC T 310.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:29:348,29,0 -chr2 37758657 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-3.398;DP=38;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:466,0,812 -chr2 37768375 . C CT 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-1.187;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:582,0,110 -chr2 37770809 . ATT A,AT 528.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.817;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=13.20;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,22,13:37:99:818,185,233,455,0,552 -chr2 37775428 . G T 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-1.371;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,43:71:99:1395,0,886 -chr2 37809400 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-2.799;DP=99;FS=5.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.053;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:254,0,3250 -chr2 37816954 . G T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=1.732;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:775,0,687 -chr2 37864307 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.190;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,27:112:99:513,0,4169 -chr2 37876494 . T C 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.452;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1714,0,2812 -chr2 37880978 . A AGGGGCCAGGCATT 3660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.673;DP=121;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=30.25;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,92:116:99:3698,0,477 -chr2 37881216 . AGTCAGTAGCTTTGATGTCCCATAACATAAAGCACGAGCACAAAGAGAGCATAGATCTGAAACTGCTGCTTATCTTTCATCAG A 5616.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=2.411;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.888;QD=27.27;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,125:127:99:5654,433,0 -chr2 37884299 . C CT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.424;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=1.619;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:294,0,1456 -chr2 37884525 . T G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.343;DP=137;FS=2.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,26:137:99:436,0,4360 -chr2 37884857 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=1.041;DP=124;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,27:124:99:560,0,3821 -chr2 37886086 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.513;DP=94;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:574,0,5630 -chr2 37917876 . C CT 307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.377;ClippingRankSum=-0.590;DP=192;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,37:165:99:345,0,3466 -chr2 37923882 . C T 1762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=1.812;DP=225;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,73:225:99:1791,0,5627 -chr2 37979185 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.352;DP=39;FS=6.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:666,0,766 -chr2 37991725 . TGTAAGGTTGCAGCACAGCGTCATTTTGATGCTAAATGTTAGCCATGATTCTGAAATGATCTCTGCTTTATTTCAG T 9079.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=1.071;DP=212;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=27.96;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,209:212:99:9117,699,0 -chr2 37998092 . GCTAAAACAGAGGAAAAATCAAATAAACATCAAGAATGTATAGTATATTCGTGTGAGAAATTCATAGCAGTTATAAGCCATAC G 2437.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=1.669;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,54:55:99:2475,202,0 -chr2 38009465 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.955;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:277,0,820 -chr2 38045666 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-3.155;DP=95;FS=5.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=3.68;ReadPosRankSum=3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:378,0,2847 -chr2 38687859 . C G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:255,0,62 -chr2 38701644 . G T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:471,36,0 -chr2 38701659 . CA C 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-0.582;DP=24;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.672;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:38:375,0,38 -chr2 38706339 . C A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=1.274;DP=217;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=2.70;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,3:216:99:615,0,8153 -chr2 38732970 . G T 652.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:681,48,0 -chr2 39288387 . T G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-2.104;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:627,0,843 -chr2 39379990 . GGA G 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-1.628;DP=50;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:326,0,954 -chr2 39436950 . C CT 1110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1148,110,0 -chr2 39437330 . GA G 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:39:269,0,39 -chr2 39437642 . G GTT 637.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.745;DP=37;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:675,0,611 -chr2 39438676 . C CT 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.454;DP=67;FS=6.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:934,0,786 -chr2 39772212 . T TG 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-1.729;DP=110;FS=1.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,27:95:99:423,0,1901 -chr2 39772680 . G C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.083;DP=186;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,48:184:99:888,0,5558 -chr2 40584041 . T C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-2.024;DP=43;FS=4.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:595,0,905 -chr2 40584535 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=1.870;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=8.16;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:273,0,1052 -chr2 40655020 . A G 381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:410,30,0 -chr2 41525567 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-2.006;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:239,0,1287 -chr2 41526990 . A G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.353;DP=73;FS=5.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:316,0,2970 -chr2 41544149 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.555;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:237,0,636 -chr2 41544188 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.400;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,282 -chr2 41563524 . A AT 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=-2.338;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:516,0,829 -chr2 41568245 . G A 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.673;DP=154;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=7.91;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,48:154:99:1246,0,3982 -chr2 41570241 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=-0.786;DP=99;FS=6.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:338,0,2940 -chr2 41594680 . A T 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 -chr2 41594723 . C A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:276,0,53 -chr2 41594858 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:258,0,97 -chr2 41604336 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.252;DP=48;FS=12.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=9.31;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:475,0,1203 -chr2 41604437 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.463;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:461,0,426 -chr2 41702087 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.335;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:460,0,561 -chr2 41707381 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=18.23;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:575,0,462 -chr2 42087828 . C G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.769;DP=39;FS=9.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:349,0,969 -chr2 42090139 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.059;DP=33;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:293,0,920 -chr2 42118437 . A G 225.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.15;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:253,0,10 -chr2 42164423 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.309;DP=38;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:237,0,1092 -chr2 42186092 . A G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-1.681;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:374,0,498 -chr2 43043909 . T C 2911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.938;DP=103;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.323;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,77:103:99:2940,0,607 -chr2 43043957 . A T 2722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=-0.757;DP=105;FS=6.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=25.93;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,72:104:99:2751,0,844 -chr2 43044171 . T C 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=2.728;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=11.03;ReadPosRankSum=-2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:789,0,1553 -chr2 43047177 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=1.190;DP=68;FS=13.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:379,0,1870 -chr2 43049892 . G T 1561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.633;DP=78;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=20.02;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,47:78:99:1590,0,1060 -chr2 43050714 . T G 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=-3.377;DP=101;FS=1.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,48:100:99:1813,0,1703 -chr2 43058255 . A T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=-0.805;DP=59;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,34:59:99:1135,0,899 -chr2 43256702 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-1.767;DP=31;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=16.06;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:526,0,575 -chr2 43257358 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=1.684;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:420,0,1271 -chr2 43257769 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=1.257;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:624,0,814 -chr2 43258477 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=2.025;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:331,0,407 -chr2 43260005 . G GAC 789.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=-0.670;DP=54;FS=6.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=14.62;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:827,0,1186 -chr2 43260618 . G A 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.961;DP=63;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1191,0,1028 -chr2 43356725 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=2.686;DP=46;FS=2.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:369,0,1205 -chr2 43384363 . G A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=1.372;DP=56;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:1010,0,923 -chr2 43385412 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=2.901;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:326,0,614 -chr2 43492122 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=-0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:375,0,321 -chr2 43492141 . C G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.627;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,213 -chr2 43570468 . G C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.041;DP=30;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:512,0,510 -chr2 43589388 . C T 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-1.429;DP=51;FS=3.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:786,0,943 -chr2 43626199 . C T 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=1.018;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=12.91;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:790,0,1164 -chr2 43635705 . GT G 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.495;DP=28;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:407,0,172 -chr2 43666127 . G T 4736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.335;DP=274;FS=5.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,130:274:99:4765,0,4763 -chr2 43667332 . A G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.459;DP=108;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:733,0,3700 -chr2 43667524 . C G 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-3.767;DP=218;FS=21.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=7.81;ReadPosRankSum=3.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,65:218:99:1730,0,11557 -chr2 43668078 . T A 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=-2.167;DP=188;FS=26.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,65:188:99:1325,0,10042 -chr2 43668230 . A G 2835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.077;DP=186;FS=6.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.491;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,79:186:99:2864,0,3852 -chr2 43670346 . T G 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.745;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,32:64:99:1196,0,1206 -chr2 43681175 . A G 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-1.262;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=15.57;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1866,0,2124 -chr2 43690840 . TCAGGAGGACACAAATGCTTACATCCACACCTTCGTATGCTTTTAAAGCTGTTAAATGATCCAATAACTTG T 975.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,0:3:99:1013,397,0 -chr2 43700135 . G A 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.948;DP=151;FS=4.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,46:151:99:1170,0,4095 -chr2 43705706 . C CT 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.644;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,37:118:99:705,0,2542 -chr2 43705768 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.063;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:255,0,2403 -chr2 43706951 . A T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.337;DP=118;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,30:118:99:712,0,3524 -chr2 43707149 . AT A 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.454;DP=56;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:245,0,760 -chr2 43727894 . C T 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=2.353;DP=94;FS=8.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=15.56;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:1491,0,1627 -chr2 43732348 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.165;DP=59;FS=11.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:365,0,1639 -chr2 43732385 . T C 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=2.174;DP=65;FS=4.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=15.32;ReadPosRankSum=-1.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1024,0,1121 -chr2 43736268 . GA G 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.568;DP=45;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=16.02;ReadPosRankSum=2.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,29:45:99:758,0,364 -chr2 43765825 . CG C 2240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=1.353;DP=162;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.829;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,73:159:99:2278,0,2532 -chr2 43769143 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-1.163;DP=158;FS=6.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,29:158:99:452,0,4790 -chr2 43779122 . A G 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=1.399;DP=199;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,40:199:99:684,0,5970 -chr2 43779139 . GCTGGAAACAAACCCCACAATCAAGCTAAACGTACAGAGTTTACATCCTCATTTATAGAAGATTCAAGTGATTCACAAAC G 8803.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.436;DP=201;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,199:201:99:8841,774,0 -chr2 43858405 . A C 758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.597;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:787,0,447 -chr2 43865357 . T TAC 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.190;DP=28;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:397,0,402 -chr2 43867086 . C T 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.623;DP=37;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:628,0,669 -chr2 43868489 . AT A 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-1.034;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:352,0,349 -chr2 43872435 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.219;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:482,0,1322 -chr2 43879781 . G C 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.211;DP=39;FS=12.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:662,0,661 -chr2 43889863 . G C 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.195;DP=61;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1074,0,1023 -chr2 43949672 . G A 366.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.36;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:395,0,13 -chr2 44016399 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.966;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.16;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:344,0,509 -chr2 44016698 . A G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-2.216;DP=83;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:736,0,694 -chr2 44107140 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-1.490;DP=54;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:330,0,2109 -chr2 44109524 . T A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-1.060;DP=54;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:921,0,934 -chr2 44109890 . CAG C 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=2.973;DP=33;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:269,0,463 -chr2 44110055 . T TTG 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.993;DP=76;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:63:99:1008,0,821 -chr2 44243551 . C A 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-1.820;DP=56;FS=3.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=16.48;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:951,0,951 -chr2 44257827 . G GT 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-0.471;DP=501;FS=5.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:401,78:479:99:272,0,11146 -chr2 44265161 . C A 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.977;DP=38;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:581,0,1297 -chr2 44284454 . C G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=1.609;DP=159;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=3.03;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,30:159:99:510,0,4850 -chr2 44422838 . C G 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=-1.305;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:645,0,442 -chr2 44447714 . G GT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-0.090;DP=43;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:382,0,375 -chr2 44589870 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-0.138;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:583,0,1251 -chr2 44718360 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.652;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:322,0,957 -chr2 44728207 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.956;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:259,0,1120 -chr2 44830142 . T A 5057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.232;DP=413;FS=5.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,151:411:99:5086,0,8565 -chr2 45005333 . CTT C 671.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.086;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:858,0,884 -chr2 45005502 . C CT 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.383;DP=63;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=8.34;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:620,0,618 -chr2 45150564 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-1.965;DP=18;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:534,0,112 -chr2 45175741 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:248,0,196 -chr2 45179091 . TCTAGATGGGGAAAAAAAGAAGTAATGTTTTAAGGCATCGTTGAACATGGTCTGAAATCTCACTGATGTTTGAGCAGCTCTAGTGTGAGTGATTTACGTGTCAGTCATGAGTTTATAC T 594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=1.590;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:632,0,27034 -chr2 45194194 . GCCTGAACAAACACAGCAGAGAATCGTTATATACAAATGTCTGTCTGTTTGTCTATCCATCTATTTATAAATCTATACATGCA G 2158.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-1.929;DP=65;FS=2.186;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=33.21;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:32:2196,32,0 -chr2 45213803 . T C 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=1.047;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=26.43;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1006,0,331 -chr2 45216002 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-1.406;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:233,0,246 -chr2 45404629 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-2.164;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:325,0,368 -chr2 45487282 . G A 697.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-1.197;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=34.90;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:726,15,0 -chr2 45487451 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.166;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:298,0,2331 -chr2 45487722 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.864;DP=82;FS=5.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,21:80:99:441,0,2196 -chr2 45487808 . C A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.161;DP=81;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.103;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:280,0,2405 -chr2 45495189 . G T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-2.211;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:392,0,589 -chr2 45495244 . C G 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.735;DP=38;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:954,0,192 -chr2 45495359 . T C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.596;DP=24;FS=9.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:321,0,536 -chr2 45496939 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.910;ClippingRankSum=2.969;DP=39;FS=1.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:643,0,505 -chr2 45701733 . C G 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 -chr2 45707810 . AGTAAGTAGCTTTTAGCGAATGGAACGCTATATACAATCAAATAATTGAAAATGGCTGCTTTGGTGACAATCTTGTAAATTTTGACGTTGTCCATCCTTTGATAG A 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:519,0,901 -chr2 45721133 . TAA T 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=15.92;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:276,0,274 -chr2 46096347 . T C 4182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.442;DP=240;FS=21.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.426;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,118:240:99:4211,0,4397 -chr2 46096362 . G A 1538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.020;DP=227;FS=4.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,64:221:99:1567,0,5772 -chr2 46100894 . T G 2867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=-3.117;DP=214;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=13.40;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,82:214:99:2896,0,4496 -chr2 46102006 . TCCTGCAGATCAAACAAAAACAGTTTATCAAGTCCGTTTCCTCATATTACAGGACATGCCTGCCCTATTCATGCACACACAAAAGACAGCTTTTTTTAA T 9936.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-1.294;DP=270;FS=5.888;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=33.73;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,247:254:99:9974,742,0 -chr2 46184950 . T A 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr2 46186357 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr2 47433424 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr2 47641301 . GA G 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=1.321;DP=43;FS=7.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:348,0,593 -chr2 47877269 . A AT 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.263;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:352,0,488 -chr2 47943392 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.149;DP=50;FS=6.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=13.50;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:703,0,1067 -chr2 47943406 . G C 536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-2.606;DP=44;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=12.20;ReadPosRankSum=2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:574,0,986 -chr2 47943982 . G A 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-1.839;DP=50;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=15.58;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:807,0,2240 -chr2 47943991 . C T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.218;DP=53;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:807,0,2223 -chr2 47944309 . T C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=1.655;DP=21;FS=11.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:373,0,372 -chr2 47944359 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-2.984;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:478,0,368 -chr2 47944382 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-1.043;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=18.11;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:662,0,537 -chr2 47944729 . A C 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.799;DP=37;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:812,0,472 -chr2 48029835 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=26.88;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:297,0,61 -chr2 48213710 . T C 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-3.680;DP=91;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:707,0,2392 -chr2 48233476 . C CT 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-1.020;DP=55;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.812;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:99:764,0,462 -chr2 48331516 . A G 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.779;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=20.07;ReadPosRankSum=1.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:1092,0,1851 -chr2 48331520 . G T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=-0.840;DP=58;FS=1.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:1092,0,1851 -chr2 48418779 . G GA 1038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=-3.567;DP=96;FS=3.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=10.82;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,50:84:99:1076,0,763 -chr2 48438251 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=1.408;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=22.65;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:368,0,155 -chr2 48470861 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-1.485;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,117 -chr2 48470943 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:312,0,251 -chr2 49252649 . CT C 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.641;DP=54;FS=1.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=9.12;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:530,0,415 -chr2 49252707 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.427;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:264,0,374 -chr2 49254273 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=-0.184;DP=30;FS=7.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=9.83;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:323,0,568 -chr2 49256051 . T C 361.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:390,30,0 -chr2 49353113 . TG T 1332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:99:1370,0,1693 -chr2 49365062 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-1.068;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.03;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:447,0,723 -chr2 49380390 . A G 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr2 49570253 . C A 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-0.206;DP=44;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=9.08;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:437,0,1015 -chr2 49571156 . C CA 3518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.725;DP=211;FS=4.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,116:208:99:3556,0,3018 -chr2 49634428 . A AC 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:350,0,270 -chr2 49917210 . C G 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr2 49919150 . CA C 391.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:429,42,0 -chr2 49919800 . G C 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr2 49920264 . G A 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr2 49922386 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,229 -chr2 49987999 . AAC A 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=-1.606;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=24.06;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:69:350,0,69 -chr2 50019001 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:291,0,174 -chr2 50020107 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,317 -chr2 50021376 . A G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.972;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:242,0,458 -chr2 50023737 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.337;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,287 -chr2 50027999 . T A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=-1.028;DP=63;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:709,0,1471 -chr2 50060302 . G A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-2.428;DP=81;FS=7.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=15.71;ReadPosRankSum=2.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,36:81:99:1301,0,1435 -chr2 50111006 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.200;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:552,0,810 -chr2 50134238 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.691;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:550,0,940 -chr2 50138403 . T C 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.506;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1251,0,1197 -chr2 50138514 . G C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.032;DP=47;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:815,0,955 -chr2 50138580 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=-1.890;DP=45;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:406,0,1327 -chr2 50160833 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=-0.954;DP=33;FS=9.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=12.30;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:434,0,725 -chr2 50163279 . G T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=2.801;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:498,0,824 -chr2 50192675 . G A 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.432;DP=93;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:93:99:1110,0,1951 -chr2 50197123 . T A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=1.646;DP=23;FS=7.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:513,0,268 -chr2 50383812 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=-2.315;DP=60;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:435,0,3426 -chr2 50383815 . C G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-2.481;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:443,0,3426 -chr2 50392192 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.322;DP=46;FS=4.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=8.49;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:419,0,2538 -chr2 50403873 . G T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.901;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:616,0,458 -chr2 50408996 . G C 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.639;DP=19;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:32:744,0,32 -chr2 50408998 . T C 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.913;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=34.15;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:643,0,108 -chr2 50412818 . A C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=-2.606;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:411,0,723 -chr2 50413136 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.503;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:304,0,940 -chr2 50413506 . G A 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:53:711,53,0 -chr2 50413736 . T C 671.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:48:700,48,0 -chr2 50413747 . A G 798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:57:827,57,0 -chr2 50414203 . G A 564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:42:593,42,0 -chr2 50414213 . T C 564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:42:593,42,0 -chr2 50426800 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.134;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:311,0,140 -chr2 50434574 . AGTCAGTCACGCTTCAATAAACCTTATGAAATGTGATATATAAATTAGCTTGGCTTAAACCGCTGTCTTGTTTCTCTTAG A 2834.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.349;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=23.65;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:99:2872,244,0 -chr2 50436890 . T A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.133;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=14.62;ReadPosRankSum=-1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:496,0,640 -chr2 50499022 . C A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.81;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:290,0,137 -chr2 50501709 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:39:291,0,39 -chr2 50517858 . T C 298.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:327,0,19 -chr2 50632459 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:296,0,424 -chr2 50632568 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-1.266;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:326,0,303 -chr2 50638364 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.465;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:303,0,459 -chr2 50661618 . AAGGTTTTCATGTCATAATTAAAAAAATATTTTGTGTGCATATCCAAATACATGTAACTATCAGGCTGTTTGCTCTGATTTGT A 1506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=-0.203;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:40:99:1544,0,1143 -chr2 50664941 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.580;DP=31;FS=1.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:443,0,568 -chr2 50670747 . T G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:364,0,557 -chr2 50671818 . CT C 711.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:73:749,73,0 -chr2 50675336 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=-1.003;DP=26;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:413,0,925 -chr2 50689306 . C A 1788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.414;DP=59;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.808;QD=30.32;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,49:59:99:1817,0,146 -chr2 50691513 . A G 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=2.533;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,44:97:99:1492,0,1760 -chr2 50696450 . T G 1436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=1.115;DP=88;FS=2.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1465,0,1470 -chr2 50799778 . G A 2363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.748;DP=169;FS=4.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,74:169:99:2392,0,2994 -chr2 50799965 . CA C 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.340;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQ0=0;MQRankSum=4.229;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:356,0,527 -chr2 50809908 . G A 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=-1.143;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,63:197:99:1707,0,5098 -chr2 50815323 . G A 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.212;DP=142;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,42:142:99:1046,0,3806 -chr2 50819829 . C A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.127;DP=207;FS=0.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.379;QD=1.40;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,32:206:99:319,0,6919 -chr2 50847540 . TG T 757.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=-0.436;DP=33;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=22.96;ReadPosRankSum=-0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:795,0,670 -chr2 50848824 . A T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.815;DP=30;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=25.79;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:802,0,636 -chr2 50859985 . C T 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr2 50964997 . C T 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr2 50966703 . C A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.583;DP=46;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:771,0,766 -chr2 50966757 . T C 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=-0.785;DP=40;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=16.92;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:705,0,678 -chr2 50968663 . T A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.150;DP=41;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:684,0,594 -chr2 50968729 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.410;DP=43;FS=2.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.627;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:522,0,807 -chr2 50968780 . A G 1504.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1533,111,0 -chr2 50973279 . T A 2421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2450,178,0 -chr2 50975467 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.624;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=13.82;ReadPosRankSum=2.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:498,0,660 -chr2 50975500 . C G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.513;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=14.65;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:541,0,662 -chr2 50982316 . T C 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.924;DP=50;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:740,0,945 -chr2 50988881 . A G 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-1.099;DP=39;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:759,0,572 -chr2 51004410 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=1.655;DP=28;FS=15.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:345,0,336 -chr2 51020525 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.608;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.140;QD=14.04;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,373 -chr2 51020634 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-1.467;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=20.38;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:334,0,175 -chr2 51345678 . A G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=-1.244;DP=21;FS=10.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:296,0,417 -chr2 51347572 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=1.220;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:256,0,229 -chr2 51536872 . G A 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=1.142;DP=64;FS=8.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:1102,0,1591 -chr2 51539267 . G C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=11.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:300,0,787 -chr2 51539278 . A C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.453;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:300,0,793 -chr2 51541126 . TA T 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-0.470;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:262,0,763 -chr2 51541695 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-1.208;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,23:87:99:517,0,2353 -chr2 51653316 . A C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.875;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=30.14;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:420,0,48 -chr2 51705957 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.551;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:472,0,625 -chr2 51730929 . T C 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=2.619;DP=50;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=17.26;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:891,0,870 -chr2 51730965 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=1.564;DP=46;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:332,0,1179 -chr2 51730989 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=2.459;DP=43;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:503,0,946 -chr2 51733016 . G T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.627;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=18.27;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:613,0,502 -chr2 51736613 . C G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-0.191;DP=42;FS=10.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:257,0,1205 -chr2 51762207 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.012;DP=382;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,106:381:99:2517,0,10369 -chr2 52216760 . A G 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr2 52218075 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,412 -chr2 52218076 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=2.047;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.588;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,412 -chr2 52319571 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=34.11;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:267,0,58 -chr2 52331578 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.624;DP=58;FS=7.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:264,0,1741 -chr2 52352026 . G GA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=-1.725;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.615;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:390,0,504 -chr2 52712183 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.270;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=10.88;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:398,0,781 -chr2 52714380 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=1.802;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=6.87;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:248,0,1016 -chr2 52714592 . A T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.532;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,374 -chr2 52715142 . C A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.409;DP=32;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=17.06;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:574,0,704 -chr2 52716131 . T G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=1.973;DP=17;FS=12.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=13.93;ReadPosRankSum=-1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:265,0,342 -chr2 52716281 . T TA 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=-1.312;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=16.30;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:461,0,1115 -chr2 52716284 . T G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=-1.293;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=16.03;ReadPosRankSum=2.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:461,0,1070 -chr2 52721000 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=1.292;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:313,0,355 -chr2 52942312 . A AT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.832;DP=32;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:258,0,444 -chr2 53031296 . GT G 520.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.507;DP=34;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=15.32;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:558,0,345 -chr2 53032579 . T C 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr2 53035331 . T TA 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=-0.746;DP=56;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,32:49:99:753,0,363 -chr2 53212195 . C T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr2 53215375 . T A 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:657,48,0 -chr2 53215782 . T A 1799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-3.003;DP=50;FS=8.108;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,44:48:56:1828,56,0 -chr2 53215825 . A T 3193.69 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.021;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:3222,234,0 -chr2 53376651 . G A 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 -chr2 54164158 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr2 54214353 . C T 883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:912,66,0 -chr2 54328775 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-1.175;DP=192;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,34:191:99:498,0,6073 -chr2 54483552 . G A 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=1.567;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1074,0,1101 -chr2 54631222 . G C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr2 54631229 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr2 54634340 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.381;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:354,0,609 -chr2 54800747 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:340,0,210 -chr2 54805793 . A G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.725;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.355;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:422,0,251 -chr2 55022916 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-1.775;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=11.15;ReadPosRankSum=2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:240,0,857 -chr2 55022926 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-1.197;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:270,0,756 -chr2 55429726 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:297,0,333 -chr2 55849451 . AAGGTACAGATTCACATGCTATTCACACGCTACTAAAAAGTAAAAGTAAATTATTTGTGCTCATTGATTTCAGACTGTGATTGTATTATTGTTCTGTTATGGCGC A 6008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=1.722;DP=371;FS=3.642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.722;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,346:347:99:6046,988,0 -chr2 55852895 . C CA 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.511;DP=222;FS=2.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,50:192:99:461,0,3550 -chr2 55854831 . A AT 528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.396;ClippingRankSum=2.392;DP=167;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=3.17;ReadPosRankSum=-3.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,29:156:99:566,0,9019 -chr2 55912669 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:263,0,369 -chr2 56047043 . G T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=-0.051;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=15.34;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:427,0,460 -chr2 56047056 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=-0.734;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=15.31;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:411,0,419 -chr2 56051800 . G T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.753;DP=25;FS=1.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:412,0,392 -chr2 56067072 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.824;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:350,0,406 -chr2 56067085 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,410 -chr2 56201167 . G T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.238;DP=273;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,46:271:99:565,0,8354 -chr2 56372462 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.349;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=31.07;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:774,0,252 -chr2 56429811 . T C 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-2.669;DP=107;FS=19.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:587,0,3059 -chr2 56557929 . TCCTGAGGAAAAAGACAGACATGAGTTATCTGGCACCTAACCCAGCCTGCATGTTCACTGCAACATCAGTTCAGGTCCACAAACGCA T 15222.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-0.111;DP=476;FS=7.642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,436:441:99:15260,1189,0 -chr2 56640794 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.925;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:349,0,134 -chr2 56674115 . A C 445.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:474,33,0 -chr2 56674137 . C G 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr2 56683572 . C A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 -chr2 56683587 . C T 433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:462,33,0 -chr2 56722159 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr2 56722168 . G A 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:355,24,0 -chr2 56743422 . C A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:507,36,0 -chr2 56750574 . G A 399.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:428,30,0 -chr2 56777837 . C G 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:442,33,0 -chr2 56779984 . A C 387.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:416,30,0 -chr2 56780065 . A G 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr2 56791853 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:234,0,58 -chr2 56859945 . G A 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-0.545;DP=74;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:887,0,1628 -chr2 56918538 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=2.423;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=11.72;ReadPosRankSum=-2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,952 -chr2 56918539 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=2.126;DP=21;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=12.27;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:286,0,907 -chr2 56918929 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=23.48;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,107 -chr2 56920824 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=24.48;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:93:322,0,93 -chr2 56967069 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-1.349;DP=95;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:555,0,2722 -chr2 57018857 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=2.477;DP=50;FS=1.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=7.18;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:387,0,1337 -chr2 57018875 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=1.891;DP=43;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:329,0,1134 -chr2 57026883 . TCTGAGGAGAAACAAGATCTGCATATTTCTGGAAAGTGTAACGCATGCGTGCCGAAAAGGAAATAAGATGTCATAC T 1833.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.558;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=33.34;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1871,0,4472 -chr2 57029177 . G C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:394,0,432 -chr2 57029222 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-2.034;DP=32;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.113;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:436,0,565 -chr2 57153126 . T C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:526,39,0 -chr2 57199331 . T C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.929;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:527,0,504 -chr2 57201139 . A G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:424,33,0 -chr2 57201253 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-0.452;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:386,0,365 -chr2 57201295 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.385;DP=32;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:389,0,658 -chr2 57529245 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-1.161;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:294,0,541 -chr2 57529281 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=-0.167;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:469,0,507 -chr2 57531095 . G A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.037;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:570,0,443 -chr2 57531096 . C A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-1.156;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.604;QD=25.80;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:570,0,443 -chr2 57536645 . T C 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr2 57537599 . A T 326.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:355,0,14 -chr2 57538114 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.629;DP=32;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:232,0,859 -chr2 57648596 . G T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-1.148;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:702,0,1287 -chr2 57701969 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.239;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:365,0,4134 -chr2 57701970 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=1.116;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:374,0,4134 -chr2 57704906 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.960;DP=51;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:302,0,1711 -chr2 57706195 . C A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.426;DP=57;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:434,0,1507 -chr2 57706952 . T G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.597;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:438,0,909 -chr2 57733275 . G T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=1.403;DP=388;FS=9.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=2.73;ReadPosRankSum=3.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:317,71:388:99:1088,0,12362 -chr2 57762303 . A AT 1390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.268;DP=126;FS=6.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,52:125:99:1428,0,1723 -chr2 57847205 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=1.454;DP=94;FS=3.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:290,0,3022 -chr2 57888567 . CA C 300.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:338,27,0 -chr2 57888898 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr2 57888903 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr2 57895393 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.681;DP=65;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:233,0,2003 -chr2 58045455 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=26.98;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:56:298,0,56 -chr2 58187131 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:353,0,171 -chr2 58187679 . T A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.990;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:671,0,405 -chr2 58190550 . GT G 207.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=18.89;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:28:245,0,28 -chr2 58190774 . CA C 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.174;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=9.82;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:273,0,282 -chr2 58190822 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:329,0,357 -chr2 58190915 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,216 -chr2 58305593 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-1.247;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:356,0,180 -chr2 58343207 . G C 278.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:307,0,17 -chr2 58414302 . A G 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=1.433;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=21.51;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1319,0,676 -chr2 58414495 . T C 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.231;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1253,0,1294 -chr2 58417995 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.361;DP=87;FS=5.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,19:87:99:373,0,5375 -chr2 58418001 . C T 2530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-2.398;DP=84;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=30.13;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,68:84:99:2559,0,953 -chr2 58418023 . C T 4141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:4170,306,0 -chr2 58418743 . A T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.806;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=13.23;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:531,0,826 -chr2 58419259 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=2.580;DP=73;FS=2.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=4.22;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:336,0,2244 -chr2 58419580 . G A 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-1.424;DP=87;FS=1.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.909;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,41:87:99:1521,0,1929 -chr2 58419787 . T G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.675;DP=68;FS=0.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=12.88;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:904,0,1491 -chr2 58419833 . T A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=-1.888;DP=53;FS=4.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:640,0,1258 -chr2 58420041 . A G 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=-1.951;DP=67;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1014,0,1336 -chr2 58431776 . C G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:307,0,195 -chr2 58440654 . G C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-1.827;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:304,0,203 -chr2 58688876 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.036;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:421,0,273 -chr2 58688931 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.443;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:517,0,145 -chr2 58688980 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=-2.327;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=18.85;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:669,0,453 -chr2 58689208 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.426;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:257,0,461 -chr2 58689734 . T A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.805;DP=34;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:407,0,1192 -chr2 58689752 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.481;DP=38;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:264,0,1606 -chr2 58689809 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.055;DP=35;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=7.71;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:298,0,903 -chr2 58689938 . TTG T 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.224;DP=33;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:385,0,369 -chr2 58710222 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=-0.796;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:254,0,852 -chr2 58712164 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=2.355;DP=18;FS=14.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.177;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,474 -chr2 58712372 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=2.327;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=17.83;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:367,0,329 -chr2 58732729 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:254,0,136 -chr2 58737069 . T A 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:235,0,24 -chr2 58865569 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.785;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:261,0,1115 -chr2 59003288 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.151;DP=256;FS=13.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,40:254:99:418,0,7950 -chr2 59003339 . C T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=-0.095;DP=354;FS=7.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,63:353:99:901,0,10861 -chr2 59004612 . A G 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-1.600;DP=436;FS=5.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=2.24;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:359,75:434:99:1005,0,13899 -chr2 59239674 . C A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=-0.847;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:362,0,1183 -chr2 59487055 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr2 59489571 . A T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.188;DP=336;FS=19.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,64:336:99:538,0,15217 -chr2 59489704 . ATG A 1544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-4.019;DP=192;FS=26.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,21:186:99:1582,0,6817 -chr2 59493866 . A G 10375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=1.028;DP=645;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=16.09;ReadPosRankSum=2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:338,306:644:99:10404,0,10724 -chr2 59522367 . A C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.295;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:589,0,759 -chr2 59550418 . C T 204.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:232,0,11 -chr2 59557586 . G A 1027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.751;DP=66;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.342;QD=15.57;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,34:66:99:1056,0,1102 -chr2 59586607 . C T 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=-0.481;DP=96;FS=7.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:583,0,2494 -chr2 59603113 . G T 2064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.306;ClippingRankSum=-1.206;DP=160;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,72:160:99:2093,0,2983 -chr2 59619846 . C T 1200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-1.115;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=15.01;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1229,0,1268 -chr2 59623042 . AAGGTGCGTCTCACACACACCTGCAGAAAACCTGAGTGATGTCACTTCCTGTTTCTGAATGCTGTTTCTGTGTC A 3947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.316;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=28.22;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,88:92:99:3985,285,0 -chr2 59623744 . T G 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.232;DP=32;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:804,0,282 -chr2 59625504 . TCTGGAGAGAGTAAATGAGGAGATGGAGGAAAACAGAAGGAGATTCAGGACACACACACACACACACACACACACACTGAACATGTCTGTCTGAGAGTGCCGTAC T 1458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=6.053;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=19.45;ReadPosRankSum=-3.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:73:99:1496,0,13757 -chr2 59627747 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=2.124;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:479,0,1960 -chr2 59638369 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.970;DP=92;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:406,0,2721 -chr2 59660985 . G C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr2 59661020 . G A 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr2 59670140 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-3.130;DP=45;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=4.64;ReadPosRankSum=3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:237,0,1640 -chr2 59670501 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=1.045;DP=67;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:267,0,1902 -chr2 59697861 . C G 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.887;DP=36;FS=4.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:660,0,607 -chr2 59700861 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.702;DP=115;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,25:115:99:469,0,3343 -chr2 59709500 . T C 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.634;DP=87;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=15.01;ReadPosRankSum=-1.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:1334,0,1551 -chr2 60049852 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=-1.064;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=31.49;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:721,0,191 -chr2 60149440 . T A 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:455,36,0 -chr2 60161990 . G C 2283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-2.123;DP=71;FS=3.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=32.17;ReadPosRankSum=1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,60:70:84:2312,0,84 -chr2 60162038 . A G 2820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-1.324;DP=94;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.649;QD=30.01;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,74:92:99:2849,0,486 -chr2 60162152 . C A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.036;DP=109;FS=9.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,27:106:99:610,0,3106 -chr2 60162336 . C T 2200.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.010;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.723;QD=31.90;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,60:68:13:2229,0,13 -chr2 60162340 . A T 2886.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2915,199,0 -chr2 60215934 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:232,0,104 -chr20 30715 . C A 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:660,45,0 -chr20 30749 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.044;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=27.25;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:546,0,156 -chr20 30806 . T TG 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.042;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:396,0,168 -chr20 31355 . T C 1310.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1339,102,0 -chr20 31651 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=-0.694;DP=43;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:751,0,719 -chr20 33013 . T A 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr20 135128 . C CTG 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.592;DP=20;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:66:300,0,66 -chr20 135325 . G GGT 202.19 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:238,0,4 -chr20 143880 . ACG A 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-3.123;DP=28;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=25.81;ReadPosRankSum=3.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:93:760,0,93 -chr20 144037 . C T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-1.062;DP=75;FS=10.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:730,0,1992 -chr20 145467 . G A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=1.172;DP=114;FS=14.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:769,0,4290 -chr20 146240 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.329;DP=93;FS=6.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,24:93:99:545,0,2548 -chr20 148612 . T C 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=1.538;DP=83;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=15.62;ReadPosRankSum=1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,37:79:99:1325,0,1328 -chr20 154109 . G A 1827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.444;DP=171;FS=5.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,58:171:99:1856,0,3708 -chr20 168120 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=-0.229;DP=100;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:370,0,2780 -chr20 172538 . G T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=1.781;DP=70;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=6.94;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:514,0,4585 -chr20 172550 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=1.529;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:514,0,4585 -chr20 173887 . TCCTGTGAGAAACACACACACACAGTCATGAACACACACACACACACACACTCTGCTGAAGAAGAGCACTAGTGTCTGGCTCTTATTATCCCGTCCACACA T 6830.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=1.588;DP=189;FS=1.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=33.46;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,171:180:99:6868,513,0 -chr20 191985 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.708;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:273,0,1009 -chr20 201612 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-1.503;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=15.20;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:621,0,676 -chr20 226900 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.444;DP=42;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:301,0,1074 -chr20 239720 . T A 275.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:304,0,19 -chr20 239845 . G C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.090;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.491;QD=28.55;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:428,0,84 -chr20 239889 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.009;DP=59;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:364,0,1657 -chr20 239919 . A G 2572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.878;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=28.27;ReadPosRankSum=2.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,70:90:99:2601,0,382 -chr20 239984 . T C 2471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.202;DP=143;FS=2.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.177;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,70:142:99:2500,0,2559 -chr20 240006 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-1.515;DP=144;FS=3.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,27:144:99:433,0,4612 -chr20 246316 . C T 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.380;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.869;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,31:185:99:416,0,5887 -chr20 264408 . G T 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=-1.753;DP=140;FS=13.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,45:138:99:1160,0,3445 -chr20 268418 . G C 1614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-0.839;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,51:141:99:1643,0,4394 -chr20 280316 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-0.205;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=4.99;ReadPosRankSum=1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,27:113:99:592,0,3427 -chr20 292148 . CAGGTGCTAAATCCTCTGCTAATACATTTTCAACTTAATAGAGATGTGATTACTCATAAAGTTGTTTTTATTCTT C 1088.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=-1.370;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=34.02;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:99:1126,0,681 -chr20 326191 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=1.123;DP=67;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:525,0,1670 -chr20 341892 . C T 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.711;DP=72;FS=2.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:619,0,1623 -chr20 343403 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.471;DP=15;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:318,0,492 -chr20 343407 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-2.285;DP=15;FS=5.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.177;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:318,0,492 -chr20 344553 . TA T 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.194;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:409,0,1157 -chr20 420794 . T TA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=1.241;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=12.57;ReadPosRankSum=-2.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:339,0,352 -chr20 424302 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.301;DP=87;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:257,0,2673 -chr20 453662 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=-0.130;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:254,0,2616 -chr20 457399 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.248;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:380,0,4661 -chr20 556909 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=2.784;DP=53;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:910,0,886 -chr20 572562 . A T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.162;DP=66;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.798;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:1057,0,3048 -chr20 572567 . A T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.132;DP=63;FS=6.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:1057,0,2967 -chr20 574410 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=-0.220;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:413,0,1013 -chr20 605342 . A G 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.155;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,37:117:99:941,0,5003 -chr20 605382 . T A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-1.424;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:306,0,5210 -chr20 605745 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.420;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:245,0,501 -chr20 606607 . A C 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=-2.245;DP=58;FS=11.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,30:57:99:976,0,903 -chr20 716762 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-0.421;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:329,0,1355 -chr20 735297 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-3.131;DP=112;FS=6.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,36:112:99:969,0,3652 -chr20 756850 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.645;DP=90;FS=2.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:369,0,2563 -chr20 799234 . G T 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.624;DP=107;FS=1.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,44:107:99:1528,0,2036 -chr20 875349 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.736;DP=67;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:393,0,1914 -chr20 887067 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=-1.231;DP=59;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:314,0,1688 -chr20 889705 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.235;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:698,0,1350 -chr20 898594 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=-0.346;DP=55;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:975,0,871 -chr20 906415 . C A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-0.528;DP=54;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.729;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:673,0,1169 -chr20 907722 . CACCTACAAGCAAACGTAATCAGATAATAAATCCACAGGAAGCATTACGAAGCATGTATCAGAACTGAAGTGTGTTTGT C 2473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=1.037;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,71:89:99:2511,0,2013 -chr20 932691 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,0:4:99:368,0,340 -chr20 932758 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,0:0:83:484,0,83 -chr20 932767 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,0:0:83:484,0,83 -chr20 932905 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-1.096;DP=91;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:1000,0,1472 -chr20 932906 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=-0.223;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:253,0,2993 -chr20 966912 . GA G 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=-0.028;DP=36;FS=4.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:378,0,211 -chr20 1143264 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-1.672;DP=44;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:320,0,1705 -chr20 1143270 . G T 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=1.046;DP=45;FS=6.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:608,0,1291 -chr20 1221643 . ACT A 510.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=0.158;DP=140;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,27:136:99:548,0,4630 -chr20 1222188 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.141;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:249,0,1541 -chr20 1319008 . T C 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:858,0,638 -chr20 1319038 . T C 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.964;DP=34;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=29.30;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,24:34:99:1433,0,200 -chr20 1465239 . CA C 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.851;DP=48;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=4.29;ReadPosRankSum=-2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:243,0,608 -chr20 1985745 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.445;DP=49;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:370,0,1204 -chr20 2002101 . C G 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.619;DP=66;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=10.28;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:707,0,1386 -chr20 2014021 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-0.928;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:325,0,1997 -chr20 2060740 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.314;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:412,0,2237 -chr20 2085942 . GCCTGAACACACACACACTGCTGATCACGCACGTGCGAAGTGGTTGCAGAAGACGTGTGTGAATTTGTAGCGTA G 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=1.275;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:281,0,1809 -chr20 2085945 . TGAACACACACACACTGCTGA T 977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-1.040;DP=40;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:1015,0,1133 -chr20 2085967 . CACGCACGTGCGAAGTGGTTGCAGAAGACGTGTGTGAATTTGTAGCGTACCTTT C 973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.470;DP=45;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=21.64;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,30:45:99:1011,0,1133 -chr20 2112298 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 2112301 . G C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 2112429 . C G 270.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:299,24,0 -chr20 2230881 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:298,0,94 -chr20 2263593 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,180 -chr20 2301038 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-1.054;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:260,0,612 -chr20 2306116 . G A 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=-0.399;DP=305;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,80:305:99:1885,0,8742 -chr20 2306573 . G A 2418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.828;DP=153;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,72:152:99:2447,0,2349 -chr20 2324899 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.404;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:48:469,0,48 -chr20 2325181 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.403;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:344,0,448 -chr20 2341434 . TCTGCACATGCCGTCAGAGATAAAAGATTGAGATTACATCAAAACACATCCTGCTAAACCTCAGAATTAAACATGATTACAGATGCAAGCTTGGAAGGTTTGCAGAC T 547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=2.045;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:585,0,7340 -chr20 2341978 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=1.091;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:380,0,940 -chr20 2344615 . G A 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.528;DP=145;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=4.34;ReadPosRankSum=2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,34:145:99:657,0,4086 -chr20 2344687 . A G 2609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-1.163;DP=160;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=16.31;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,84:160:99:2638,0,2686 -chr20 2344705 . C T 2763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.668;DP=164;FS=2.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,81:158:99:2792,0,2713 -chr20 2355468 . C T 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.554;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:1298,0,5283 -chr20 2355480 . G A 2649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.921;ClippingRankSum=-1.315;DP=189;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=14.02;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,92:188:99:2678,0,3170 -chr20 2355528 . G A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=-0.611;DP=180;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,45:180:99:999,0,5078 -chr20 2355567 . C A 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.418;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.46;ReadPosRankSum=2.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,42:166:99:935,0,4590 -chr20 2381144 . T G 2046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=-2.038;DP=101;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=20.27;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,65:100:99:2075,0,1076 -chr20 2384780 . G A 3452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.821;DP=207;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=16.68;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,100:205:99:3481,0,3643 -chr20 2384807 . T A 3379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-1.808;DP=231;FS=2.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=14.63;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,109:230:99:3408,0,3672 -chr20 2489551 . G GTC 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:385,0,43 -chr20 2489618 . GGT G,GGTGT 1654.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.287;DP=75;FS=11.588;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=22.06;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,10,51:65:99:1713,1642,2633,124,0,223 -chr20 2508275 . A G 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.758;DP=101;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=16.23;ReadPosRankSum=-1.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,52:101:99:1667,0,1743 -chr20 2509828 . CAT C 3634.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.74;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3672,253,0 -chr20 2509965 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr20 2528549 . G GTA 1044.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.88;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:73:1082,73,0 -chr20 2528646 . C T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.435;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:1127,0,1551 -chr20 2537716 . G A 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.281;DP=94;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,43:94:99:1527,0,2234 -chr20 2585190 . G A 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.466;DP=72;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=17.25;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1270,0,1148 -chr20 2609418 . G C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.204;DP=94;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:561,0,2606 -chr20 2632660 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.116;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:390,0,432 -chr20 2632789 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=1.630;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=18.65;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:364,0,357 -chr20 2636998 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.749;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:251,0,526 -chr20 2639042 . G A 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=3.510;DP=51;FS=12.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,43:51:99:1700,0,120 -chr20 2639347 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=-0.255;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,25:131:99:251,0,9569 -chr20 2675422 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.56;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:64:323,0,64 -chr20 2699574 . T C 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=-2.888;DP=51;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:620,0,976 -chr20 2699640 . T C 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.335;DP=73;FS=11.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1204,0,1286 -chr20 2702022 . G C 1226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.696;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=25.56;ReadPosRankSum=-2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1255,0,308 -chr20 2705222 . C T 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=1.369;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,42:74:99:1375,0,1125 -chr20 2705644 . A G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=1.258;DP=40;FS=9.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:712,0,698 -chr20 2708694 . CAG C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.030;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:357,0,1972 -chr20 2708707 . A T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.210;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:711,0,1253 -chr20 2711280 . GCCTGTGGAAACAGAGATGTGTTATAAATGATGAGTGACAGTCCACCATGATGAGCTGAACCAGACCTAATGAAGGTGTTTA G 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.370;DP=13;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:377,0,1710 -chr20 2735471 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.692;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:409,0,936 -chr20 2753179 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr20 2754592 . G C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.374;DP=245;FS=6.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,48:245:99:694,0,7215 -chr20 2764756 . AGTAAGTGCTCTCGCAACCGGTTTTTTAAAGTGCAAATCAGAAATGTTTTATTAAAACGCTCTTTTGATCTAAACCAG A 1555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=1.723;DP=427;FS=3.394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,424:427:99:1683,207,0 -chr20 2771149 . G GA 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.336;DP=63;FS=7.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:299,0,672 -chr20 2771547 . GAA G,GA 396.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=2.849;DP=173;FS=2.293;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=2.29;ReadPosRankSum=-2.615 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:35,39,39:113:99:1400,199,1203,309,0,805 -chr20 2772411 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.372;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:247,0,1104 -chr20 2908713 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:262,0,52 -chr20 2983572 . G A 1532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.607;DP=265;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.091;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,73:265:99:1561,0,7255 -chr20 3004013 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=2.324;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=12.09;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,768 -chr20 3004016 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=3.269;DP=17;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=13.52;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,768 -chr20 3005371 . TGTAAGGGTGCCGCCTGCTTAGACTGTTAGAGACATGTTATCTAAAGTTCCTGCTTAATTAAGACGGCTTCTCTTCAG T 11611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.985;DP=300;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=28.80;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,285:289:99:11649,847,0 -chr20 3008736 . CA C 870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=6.906;DP=157;FS=8.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=5.55;ReadPosRankSum=-4.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,45:150:99:908,0,3505 -chr20 3008937 . A G 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:834,0,1093 -chr20 3009013 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=34.38;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:372,0,1508 -chr20 3009448 . A G 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-1.269;DP=104;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=11.99;ReadPosRankSum=-2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,36:103:99:1275,0,2565 -chr20 3009841 . AC A 649.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-5.198;DP=138;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,31:137:99:687,0,13348 -chr20 3009923 . A G 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=-1.073;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=4.29;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,21:152:99:685,0,13348 -chr20 3010159 . GA G 1172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=4.772;DP=154;FS=17.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=7.62;ReadPosRankSum=-4.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,53:142:99:1210,0,2100 -chr20 3010403 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.169;DP=101;FS=10.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:839,0,4120 -chr20 3010493 . A G 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.660;DP=102;FS=1.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:672,0,3473 -chr20 3010914 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-1.884;DP=65;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:352,0,3533 -chr20 3012031 . AT A 2745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.602;DP=236;FS=0.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,121:210:99:2783,0,2167 -chr20 3028804 . A C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.590;DP=121;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,26:121:99:474,0,3628 -chr20 3039382 . T A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:320,0,141 -chr20 3253886 . ACTATGAAAATAAGGAAAGCAAATTGAGTACTTTTGAGTATATCCATTGGATTGTGTGTGTGTGAGATTATGTTGTGTAACGTTTTAC A 5389.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.032;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=27.30;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:116:99:5427,486,0 -chr20 3254020 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-0.850;DP=141;FS=2.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,28:141:99:486,0,4338 -chr20 3284544 . A T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=1.995;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.498;QD=12.53;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:755,0,1289 -chr20 3288791 . T C 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-1.180;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=21.00;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:1057,0,604 -chr20 3321060 . GAGGTACGGATCCATCAAATGGATGTAATGAGACGGATTATTTTAGTTTGTTGTAACAAAATTCAGTTTTCTTTGAC G 2179.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.025;DP=51;FS=4.349;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2217,193,0 -chr20 3347712 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.276;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:247,0,2415 -chr20 3352502 . T C 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:90:1287,90,0 -chr20 3352585 . G C 2129.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=1.034;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=34.06;ReadPosRankSum=-1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:71:2158,71,0 -chr20 3352596 . CT C 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,0:29:99:671,0,896 -chr20 3352843 . C G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=5.662;DP=63;FS=8.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=3.79;ReadPosRankSum=-3.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:267,0,1999 -chr20 3353611 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=2.932;DP=77;FS=10.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=3.97;ReadPosRankSum=2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:334,0,9066 -chr20 3353953 . T C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-0.505;DP=95;FS=2.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=13.68;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,38:94:99:1328,0,2051 -chr20 3354106 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=2.258;DP=52;FS=6.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:433,0,1219 -chr20 3354132 . T A 1728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=3.771;DP=38;FS=11.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=35.51;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1757,0,170 -chr20 3354959 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr20 3355096 . T A 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=-0.569;DP=59;FS=1.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:477,0,2875 -chr20 3355726 . C A 2131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-3.022;DP=213;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=10.01;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,74:213:99:2160,0,15786 -chr20 3383494 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=1.407;DP=27;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:235,0,710 -chr20 3418781 . A T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-1.354;DP=43;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:589,0,899 -chr20 3479037 . T A 1618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1647,114,0 -chr20 3479126 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr20 3479756 . A C 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr20 3479763 . T A 286.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr20 3633633 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr20 3944790 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:229,0,312 -chr20 3951336 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:357,0,620 -chr20 4036037 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-1.141;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=3.45;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:242,0,1809 -chr20 4064972 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=-0.259;DP=77;FS=9.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:389,0,2426 -chr20 4065313 . A G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.354;DP=35;FS=8.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:99:681,0,1018 -chr20 4066530 . GT G 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=-0.611;DP=60;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:291,0,1020 -chr20 4169344 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=1.980;DP=94;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:643,0,5667 -chr20 4169346 . A T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=2.016;DP=96;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:643,0,5667 -chr20 4248106 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-2.235;DP=54;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:485,0,1422 -chr20 4248208 . C T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.321;DP=53;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:683,0,1135 -chr20 4250984 . G A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=1.377;DP=56;FS=5.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:952,0,916 -chr20 4254437 . G A 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.363;DP=55;FS=9.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1002,0,951 -chr20 4254572 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.352;DP=36;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:406,0,818 -chr20 4254908 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.754;DP=38;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:533,0,733 -chr20 4373113 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.435;DP=82;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:309,0,2453 -chr20 4381719 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.681;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:244,0,1747 -chr20 4489756 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.143;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:231,0,182 -chr20 4654847 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr20 4712948 . AT A 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-1.457;DP=20;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:325,0,149 -chr20 4754723 . CA C 1354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.026;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=10.58;ReadPosRankSum=-3.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:1392,0,5581 -chr20 4759355 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=2.693;DP=282;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,39:281:99:234,0,9359 -chr20 4770465 . C G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.654;DP=274;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,58:265:99:946,0,6915 -chr20 4776746 . A G 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=1.292;DP=281;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,60:280:99:1128,0,8205 -chr20 4779750 . C T 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-1.052;DP=226;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,41:223:99:667,0,7142 -chr20 4811689 . T A 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.592;DP=13;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:84:394,0,84 -chr20 4866526 . A C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.14;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:290,0,164 -chr20 4942733 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=-0.371;DP=36;FS=3.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:249,0,954 -chr20 5044828 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=1.371;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:358,0,618 -chr20 5108950 . C A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr20 5115842 . T A 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr20 5133203 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.887;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=18.39;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:396,0,627 -chr20 5133406 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr20 5134092 . T G 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:424,30,0 -chr20 5135363 . A G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.341;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:472,0,461 -chr20 5298843 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=2.100;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.100;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:43:452,0,43 -chr20 5298907 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=29.07;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:348,0,52 -chr20 5337422 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:231,0,102 -chr20 5337807 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr20 6039585 . TCCTGTAATGACAGAAGCCAACCATGATATCTGCCCTGGAAAGAGTTCAACACTCATACACCTATTATCCAA T 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.231;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=30.41;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:53:1058,0,53 -chr20 6057185 . T A 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.24;MQ0=0;QD=7.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr20 6143115 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.104;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:579,0,937 -chr20 6217742 . T TA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=-1.576;DP=29;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:244,0,255 -chr20 6398235 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=1.113;DP=51;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:283,0,1436 -chr20 6468313 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.253;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:484,0,705 -chr20 6561574 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:281,0,62 -chr20 6593271 . T C 2238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:99:2267,160,0 -chr20 6593358 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.580;DP=22;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=18.58;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:437,0,163 -chr20 6593393 . T C 2238.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2267,160,0 -chr20 6593524 . C T 243.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:272,0,15 -chr20 6593534 . G C 243.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:15:272,0,15 -chr20 7032747 . CA C 695.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-0.482;DP=86;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=8.09;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,34:73:99:733,0,673 -chr20 7033106 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-0.162;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,17:99:99:232,0,3242 -chr20 7033402 . TA T 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.439;DP=22;FS=8.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:246,0,150 -chr20 7067127 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.271;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=21.86;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:378,0,201 -chr20 7067223 . T C 860.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.501;DP=27;FS=2.764;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=31.88;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:16:889,16,0 -chr20 7323849 . T A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.501;DP=26;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:364,0,581 -chr20 7437715 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.749;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:337,0,1471 -chr20 7442392 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-2.813;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=4.01;ReadPosRankSum=2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:329,0,2264 -chr20 7502613 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.166;DP=90;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,18:90:99:307,0,2631 -chr20 7506014 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.291;DP=82;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:268,0,2522 -chr20 7506052 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.972;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:347,0,2589 -chr20 7513431 . T C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.351;DP=87;FS=3.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,23:87:99:528,0,2424 -chr20 7525009 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.510;DP=80;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:241,0,2976 -chr20 7526602 . C T 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-1.101;DP=59;FS=5.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=19.78;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:1195,0,1412 -chr20 7526618 . A G 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-1.425;DP=60;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:900,0,2734 -chr20 7526708 . T TA 561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-1.164;DP=73;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:599,0,1674 -chr20 8171823 . G T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:812,0,1299 -chr20 8238177 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,122 -chr20 8245601 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,428 -chr20 8250013 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.352;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:374,0,490 -chr20 8254308 . T TA 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.437;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:326,0,1225 -chr20 8255136 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.066;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=17.17;ReadPosRankSum=-1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:406,0,422 -chr20 8255286 . C A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:343,0,637 -chr20 8259453 . T C 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=2.143;DP=16;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:65:614,0,65 -chr20 8265134 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.004;DP=54;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:389,0,1487 -chr20 8272542 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.233;DP=45;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:389,0,1165 -chr20 8279103 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-1.313;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.839;QD=17.53;ReadPosRankSum=2.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:414,0,378 -chr20 8282127 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-1.138;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:677,0,980 -chr20 8285771 . C T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.091;DP=57;FS=2.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:697,0,1197 -chr20 8285825 . G A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-2.317;DP=56;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:668,0,1276 -chr20 8596959 . T G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-1.702;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:270,0,422 -chr20 9287259 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-1.583;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:329,0,843 -chr20 9311287 . G T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=-1.314;DP=64;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:289,0,1663 -chr20 9325765 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.592;DP=56;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:698,0,1264 -chr20 9325807 . T A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.489;DP=58;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:750,0,1273 -chr20 9355905 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.664;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:246,0,463 -chr20 9355925 . C A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.668;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:326,0,445 -chr20 9362721 . A G 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.933;DP=146;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,39:146:99:893,0,4143 -chr20 9368815 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=-1.971;DP=96;FS=11.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:268,0,2507 -chr20 9369813 . C T 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.116;DP=118;FS=2.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,42:117:99:1426,0,2563 -chr20 9377584 . C G 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.180;DP=140;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,42:140:99:989,0,3666 -chr20 9420223 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,110 -chr20 9480099 . A G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.390;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.407;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:837,0,99 -chr20 9599664 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.523;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:428,0,743 -chr20 9599666 . C CA 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-0.831;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:428,0,743 -chr20 9658042 . G C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:86:390,0,86 -chr20 9660156 . G A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr20 9756388 . T A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=-0.387;DP=119;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:440,0,3822 -chr20 9758920 . C T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.877;DP=99;FS=4.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=7.33;ReadPosRankSum=-2.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:754,0,4953 -chr20 9758921 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.865;DP=99;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=7.74;ReadPosRankSum=-2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,29:99:99:794,0,4951 -chr20 9933129 . C T 1949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.462;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:1978,0,3619 -chr20 9933182 . T G 4896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-1.040;DP=154;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,108:140:99:4925,0,549 -chr20 9933211 . A C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.112;DP=152;FS=3.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.770;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,38:138:99:765,0,4956 -chr20 9945042 . T C 4238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-0.802;DP=581;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.032;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:410,169:579:99:4267,0,15548 -chr20 9946800 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.083;DP=582;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=0.71;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:500,79:579:99:439,0,19327 -chr20 9956918 . G GT 1608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=1.931;DP=243;FS=15.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=6.62;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,79:226:99:1646,0,3625 -chr20 10004157 . G C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.133;DP=49;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=12.81;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:656,0,996 -chr20 10005490 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=1.447;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:494,0,501 -chr20 10154834 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-1.056;DP=282;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,48:282:99:491,0,20370 -chr20 10713908 . G A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr20 10727575 . C T 1637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=-0.159;DP=392;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,84:391:99:1666,0,12183 -chr20 10728063 . TA T 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-2.488;DP=38;FS=5.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:398,0,302 -chr20 10733907 . TCAGGTATGTGAGGACTTGTTTTTACTTCTTGAAGCATCACTGATGGTAAACAAAACTAATGTTTGGACAATATCTG T 15756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=380;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,327:328:99:18191,1514,0 -chr20 10734058 . T A 3818.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=-0.350;DP=251;FS=23.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=15.21;ReadPosRankSum=-7.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,109:251:99:3847,0,4971 -chr20 11281697 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-1.447;DP=20;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=22.09;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:493,0,147 -chr20 11915215 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.220;DP=67;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:675,0,1423 -chr20 11917150 . T TAC 1355.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:92:1393,92,0 -chr20 11917581 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.216;DP=42;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:556,0,876 -chr20 11917642 . TA T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=-0.530;DP=19;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:265,0,156 -chr20 11986364 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=2.180;DP=18;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,112 -chr20 11986468 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr20 12388421 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.979;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=25.42;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:435,0,305 -chr20 12389416 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.202;DP=53;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:353,0,2172 -chr20 12389421 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.744;DP=55;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:273,0,2150 -chr20 12389776 . G T 4972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-1.131;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=35.31;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:5001,0,439 -chr20 12389779 . C A 4972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-1.353;DP=46;FS=2.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=29.71;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:5001,0,454 -chr20 12389893 . T C 2340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.221;DP=64;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=33.99;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,51:57:99:2369,0,1163 -chr20 12389917 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=1.293;DP=56;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:380,0,2609 -chr20 12389932 . A C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,40:45:99:1490,0,1252 -chr20 12390040 . T C 3057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=-2.188;DP=204;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,92:147:99:3086,0,1857 -chr20 12390051 . C CA 939.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=-1.173;DP=183;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,42:125:99:977,0,2165 -chr20 12390115 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-0.063;DP=61;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=4.27;ReadPosRankSum=-2.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:289,0,2469 -chr20 12390137 . G A 763.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.635;DP=25;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=30.52;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:12:791,0,12 -chr20 12390415 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=-0.655;DP=39;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:396,0,785 -chr20 12461517 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.333;DP=23;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:360,0,415 -chr20 12461522 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=1.473;DP=24;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=13.82;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,415 -chr20 12461675 . G A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.116;DP=44;FS=5.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:554,0,615 -chr20 12462354 . AT A 1257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.467;DP=201;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,46:101:99:1295,0,1390 -chr20 12462955 . A G 501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:530,36,0 -chr20 12463078 . A AT 439.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:477,45,0 -chr20 12463093 . A G 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:487,33,0 -chr20 12464234 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=-0.370;DP=77;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:371,0,1221 -chr20 12464391 . C T 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-2.064;DP=29;FS=6.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=29.68;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:889,0,268 -chr20 12464529 . T C 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.515;DP=32;FS=10.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:394,0,360 -chr20 12464544 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=10;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=22.28;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:251,0,224 -chr20 12466844 . T C 288.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:317,0,15 -chr20 12717792 . C G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=1.764;DP=48;FS=4.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:553,0,1071 -chr20 12827398 . AC A 529.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:567,42,0 -chr20 13482950 . G GA 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=-1.261;DP=123;FS=9.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,30:120:99:326,0,2328 -chr20 13508246 . C T 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=1.806;DP=240;FS=8.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.729;QD=3.40;ReadPosRankSum=3.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,49:240:99:844,0,13512 -chr20 13808253 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.487;DP=36;FS=5.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:369,0,948 -chr20 13930197 . C T 4405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.887;DP=311;FS=2.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,111:309:99:4434,0,14354 -chr20 13931016 . G GA 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=1.659;DP=246;FS=7.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,45:242:99:242,0,6331 -chr20 13943210 . G A 5185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.191;DP=348;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,153:348:99:5214,0,6300 -chr20 13954546 . G A 3682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.235;ClippingRankSum=-2.077;DP=302;FS=3.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,106:302:99:3711,0,6752 -chr20 14574573 . T G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.706;DP=22;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:328,0,330 -chr20 14574619 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.183;DP=35;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:287,0,831 -chr20 14574912 . CAT C 730.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.639;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=17.82;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:768,0,463 -chr20 14575200 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=3.129;DP=105;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=3.33;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:378,0,3020 -chr20 14575372 . C G 3530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.272;DP=49;FS=3.577;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=29.50;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,34:42:99:3559,108,0 -chr20 14575389 . C T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=-0.844;DP=53;FS=15.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=11.39;ReadPosRankSum=-2.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:632,0,1407 -chr20 14575414 . A G 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-1.233;DP=73;FS=7.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.617;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:646,0,2281 -chr20 14575576 . G A 1324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-1.222;DP=90;FS=4.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,41:79:99:1353,0,2175 -chr20 14575581 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.956;DP=82;FS=6.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:422,0,3712 -chr20 14618253 . A T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.083;DP=82;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,41:82:99:1357,0,1378 -chr20 14725694 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,255 -chr20 14729259 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-0.137;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=16.84;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:466,0,371 -chr20 14729334 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.376;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=17.73;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:560,0,375 -chr20 14847661 . C G 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=-0.019;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=28.94;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1070,0,199 -chr20 14864043 . T A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-2.698;DP=125;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,35:124:99:817,0,3311 -chr20 14864121 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.696;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=12.34;ReadPosRankSum=-2.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:1435,0,2479 -chr20 14891971 . A G 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:761,54,0 -chr20 15030103 . AT A 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.298;DP=47;FS=6.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:552,0,426 -chr20 15030175 . CT C 1323.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.319;DP=65;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,50:58:13:1361,0,13 -chr20 15031077 . G GA 1050.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-1.284;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,44:58:99:1088,0,214 -chr20 15046584 . CCCTGTGTAATAGAGAAATAAAAAAGGTCAATCTGGCCATGTCTGCCTATACCAGAACAACACAATATTATCTGTCAGAGTGAAAAGCATGAACTCATA C 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.753;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,31:158:99:399,0,5590 -chr20 15046586 . CT C 4594.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-1.002;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,123:158:99:4834,0,1234 -chr20 15046588 . GTGTAATAGAGAAATAAAAAAGGTCAATCTGGCCATGTCTGCCTATACCAGAACAACACAATATTATCTGTCAGAGTGAAAAGCATGAACTCATACCA G 4434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.967;DP=161;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=27.54;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,124:159:99:4472,0,1313 -chr20 15048820 . CACCTGAATCAACAACCAGGACACAAATTAGAACACACACACAAAAACAACTATACCAATGAAGATTGATTACAGCACTTGAGCACTA C 4911.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=2.795;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=36.85;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,110:114:99:4949,431,0 -chr20 15098297 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=24.48;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:273,0,50 -chr20 15102537 . C A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:411,0,126 -chr20 15102627 . A G 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.122;DP=40;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:733,0,714 -chr20 15104378 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.908;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.37;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:277,0,474 -chr20 15118250 . TAC T 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.271;DP=11;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=26.25;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:326,0,58 -chr20 15155678 . A C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.493;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:51:430,0,51 -chr20 15167118 . C A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-1.218;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:474,0,472 -chr20 15167187 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:331,0,264 -chr20 15167232 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-0.843;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.475;QD=15.39;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:413,0,403 -chr20 15559932 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=-1.099;DP=211;FS=6.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,31:209:99:232,0,6723 -chr20 16023487 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.334;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:246,0,677 -chr20 16266667 . GT G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.041;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:255,0,100 -chr20 16478561 . G A 3498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=-2.226;DP=246;FS=4.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,98:246:99:3527,0,5086 -chr20 16478583 . T A 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;ClippingRankSum=-2.480;DP=225;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,89:224:99:2987,0,4671 -chr20 16482122 . C T 2898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-1.117;DP=206;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,84:205:99:2927,0,4034 -chr20 16516172 . CT C 207.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:245,24,0 -chr20 16539396 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=1.769;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:94:262,0,94 -chr20 16680475 . G A 1752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.438;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,50:101:99:1781,0,1807 -chr20 16691913 . A G 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr20 16704637 . G C 1010.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:83:1039,83,0 -chr20 16704735 . T C 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr20 16704741 . G A 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:353,24,0 -chr20 16783620 . A G 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.136;DP=142;FS=5.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,45:142:99:1156,0,3833 -chr20 16811692 . C T 2787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=2.852;DP=434;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=6.42;ReadPosRankSum=4.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,120:432:99:2816,0,11840 -chr20 16811710 . C T 2464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=1.190;DP=409;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,110:406:99:2493,0,12905 -chr20 16814849 . A C 5909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=3.909;DP=145;FS=21.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,38:145:99:5938,0,3807 -chr20 16815375 . G GA 3536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-1.603;DP=182;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=19.43;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,72:159:99:3574,0,2424 -chr20 16873179 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.425;DP=34;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:413,0,762 -chr20 16873493 . T A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-0.544;DP=42;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=7.45;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:341,0,1145 -chr20 16873845 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.494;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,27:59:99:965,0,1147 -chr20 16873939 . A G 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=-0.664;DP=30;FS=15.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=17.36;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:549,0,473 -chr20 16874722 . G GCA 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:307,0,231 -chr20 16896462 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.236;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=28.74;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:71:603,0,71 -chr20 16896496 . G A 657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:686,48,0 -chr20 16896649 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.754;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=22.15;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:427,0,206 -chr20 16896900 . A C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-0.124;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:416,0,275 -chr20 16897127 . A C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=-0.340;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,262 -chr20 16897213 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.933;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:294,0,361 -chr20 16897265 . A C 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:1004,72,0 -chr20 16897289 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=2.635;DP=27;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=10.70;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:317,0,504 -chr20 16897470 . T C 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr20 16897485 . G A 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr20 16898110 . A G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:651,45,0 -chr20 16898187 . G A 990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:69:1019,69,0 -chr20 16898193 . T C 990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1019,69,0 -chr20 16898475 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.031;DP=24;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:514,0,272 -chr20 16898682 . A G 368.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.48;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:9:396,9,0 -chr20 16899396 . T C 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-1.407;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=24.27;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:49:1193,49,0 -chr20 16899648 . A G 1005.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1034,75,0 -chr20 16899675 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-0.375;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:254,0,465 -chr20 16899996 . C A,G 237.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,5:9:99:347,179,168,168,0,154 -chr20 16900038 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=28.80;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:345,0,134 -chr20 16900188 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-1.336;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:459,0,318 -chr20 16900397 . A G 474.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=1.159;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3:501,0,3 -chr20 16900769 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=2.409;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:250,0,425 -chr20 16988065 . AT A 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.623;DP=46;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:400,0,680 -chr20 16988069 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-2.349;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=7.31;ReadPosRankSum=2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:357,0,833 -chr20 16988366 . C T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.492;DP=94;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.275;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,23:93:99:540,0,2767 -chr20 16989326 . G A 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-2.768;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:1042,0,1589 -chr20 16989592 . T A 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-2.051;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:757,0,1391 -chr20 17854936 . C T 4562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=1.223;DP=372;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=12.27;ReadPosRankSum=1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,137:371:99:4591,0,7907 -chr20 17864197 . CT C 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=-0.914;DP=225;FS=4.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,74:196:99:1419,0,6102 -chr20 17864206 . T C 904.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-4.337;DP=251;FS=0.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=3.60;ReadPosRankSum=4.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,56:230:99:1085,0,12042 -chr20 17864678 . G A 3774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.275;DP=292;FS=2.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,109:290:99:3803,0,6321 -chr20 18438426 . G C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-0.527;DP=27;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:312,0,619 -chr20 18439640 . GCTGAGGGAATATAAACAGGCTCAGATTGTTAAATCCATAATGATTGAACTTAAAGATTCAAGCAGGATACAGTAC G 2716.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=2.222;DP=65;FS=2.994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:2754,226,0 -chr20 18439726 . C G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=-0.556;DP=60;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:257,0,1821 -chr20 18439846 . GCCTAGAAAACAAACACACAAGCAAGCAGAAAGGGATGATCCTCCTGTCGATGAAGCAGAGACATTGAAGACAGTAAGACCAGACAAAGGACTGCGTA G 959.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;QD=21.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,38:43:99:1557,0,1851 -chr20 18464856 . A G 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.745;DP=101;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:441,0,3069 -chr20 18464923 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=1.445;DP=135;FS=4.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,22:135:99:283,0,4543 -chr20 18465360 . G GAC 863.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=1.030;DP=67;FS=16.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=12.89;ReadPosRankSum=-2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:901,0,1024 -chr20 18528679 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.788;DP=80;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:303,0,2305 -chr20 18607915 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.017;DP=78;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:403,0,2045 -chr20 18750626 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.778;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:253,0,780 -chr20 18795619 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:287,0,353 -chr20 18828788 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.899;DP=23;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:353,0,449 -chr20 18848640 . T C 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.041;DP=66;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.074;QD=12.10;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:827,0,2993 -chr20 18848649 . T G 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=-0.266;DP=61;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=13.09;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:827,0,2993 -chr20 18867145 . A G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.154;DP=23;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:390,0,410 -chr20 19069091 . CGGTAAGATCCAAAAAGCAAACCTCAATGTAAACAAAGCGTGCAAAATATTGAAAAAGCATGTGTTTTGTCTTCACA C 961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=4.688;DP=311;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=3.09;ReadPosRankSum=-4.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,281:305:99:999,0,4045 -chr20 19070055 . AT A 1930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.605;DP=193;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=10.00;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,87:173:99:1968,0,2675 -chr20 19395815 . C A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-0.474;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:411,0,178 -chr20 19395894 . C G 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.792;DP=48;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=29.89;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,39:48:99:1463,0,160 -chr20 19396051 . C T 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.407;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=30.54;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1372,0,166 -chr20 19397355 . T G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.453;DP=22;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:424,0,169 -chr20 19585462 . TGTACGTACTTTTATCATCATGGTATGAGCGTCACTCGATGTTTTAATAAACGGAATAGCAAACTGTCTTTGTTTTACAG T 1629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=2.324;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=36.32;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:1667,132,0 -chr20 20106974 . G A 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:458,33,0 -chr20 20292808 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.023;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:407,0,973 -chr20 20304017 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-1.569;DP=79;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=3.01;ReadPosRankSum=2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:266,0,2394 -chr20 20305055 . A AT 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-1.319;DP=89;FS=0.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:376,0,1522 -chr20 20347769 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,256 -chr20 20399504 . C CT 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-2.459;DP=123;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.394;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,41:116:99:620,0,1482 -chr20 20402254 . C CA 5943.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=169;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:5981,486,0 -chr20 20402257 . C CAGTCCAACAG 5943.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:164:99:5981,486,0 -chr20 20605611 . G T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=1.778;DP=50;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=6.28;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:342,0,1180 -chr20 20682972 . ACTAAAAAGCAGCCACAATACACATCAATCGATAGCTAGCCAATTAGCCAGCCAACTAACGTCAAACGTGCCAGAGACCGACTGCGTAAATAAAACAACAACAATAACAAACGTAC A 1055.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.596;ClippingRankSum=3.395;DP=67;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.705;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,32:67:99:1093,0,15425 -chr20 20684394 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,389 -chr20 20685581 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=-0.882;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:259,0,4541 -chr20 20767071 . A AG 846.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DP=154;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=5.50;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,43:144:99:884,0,3474 -chr20 20798440 . T G 4048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.423;ClippingRankSum=-1.865;DP=676;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=5.99;ReadPosRankSum=3.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:501,173:674:99:4077,0,20381 -chr20 20893915 . C A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.119;DP=321;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,55:321:99:670,0,9936 -chr20 21417788 . AC A 866.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:91:904,91,0 -chr20 21420926 . T TC 234.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:272,0,13 -chr20 21538009 . AAGGTAAGTGTCTGAAGAACATGCTCGTCTTTAACTTTTCGTTTCTATATCTATATAAAAGCTTCTCTCTTTCTC A 3536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.386;DP=98;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=30.34;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,94:97:99:3574,273,0 -chr20 21547559 . T G 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-2.243;DP=103;FS=1.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:689,0,5619 -chr20 21547583 . C T 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-1.174;DP=76;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=8.77;ReadPosRankSum=2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:695,0,5619 -chr20 21740978 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=1.274;DP=66;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=6.27;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:442,0,1873 -chr20 21747085 . TCTGCAAACACACAGAAGGATCTCTTAACTACTGAGGAATGCATTTGTCCTTAAAAGATTTTTTTAACATTGTTCACACCACAAGACCAAACCCTGTTGTTTTAAATGTAAAATAAC T 706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.647;DP=29;FS=3.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:744,0,1387 -chr20 21766091 . C T 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 -chr20 21809602 . G A 238.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:267,0,22 -chr20 21887601 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=1.249;DP=62;FS=8.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:307,0,2075 -chr20 22008319 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-1.129;DP=64;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:334,0,4091 -chr20 22261574 . G C 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=1.507;DP=174;FS=3.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,53:173:99:1316,0,4493 -chr20 22263623 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=1.397;DP=161;FS=5.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,29:161:99:397,0,5024 -chr20 22263644 . A T 1992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=3.321;DP=141;FS=6.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,59:141:99:2021,0,3272 -chr20 22265115 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=-0.283;DP=67;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:471,0,1662 -chr20 22339081 . A AGGG 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.683;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.363;QD=14.93;ReadPosRankSum=-1.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,276 -chr20 22470638 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.798;DP=34;FS=7.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:502,0,573 -chr20 22723155 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=1.359;DP=59;FS=7.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:698,0,1255 -chr20 22726185 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.159;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=15.17;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:893,0,2485 -chr20 22727181 . T TA 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=2.115;DP=41;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:441,0,537 -chr20 23347756 . C T 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.688;DP=70;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,27:70:99:950,0,1496 -chr20 23357854 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.007;DP=81;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,26:81:99:666,0,2002 -chr20 23359374 . AAGGTATAACTTTATTCCAGTCAGATTAGTATCACTAACCGGTCGACTGTTATTAACTGTGATGAGTCTGTCTTTGTGCTC A 2921.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=2.381;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=32.63;ReadPosRankSum=0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:2959,228,0 -chr20 23375325 . G A 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=1.353;DP=79;FS=9.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,32:79:99:1017,0,1946 -chr20 23478083 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.320;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:398,0,2431 -chr20 23609181 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-1.811;DP=142;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,43:141:99:884,0,3747 -chr20 23609409 . C T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.274;DP=96;FS=1.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,41:96:99:1361,0,2079 -chr20 23635182 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.304;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,22:132:99:263,0,4102 -chr20 23913274 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:286,0,526 -chr20 23954143 . GTA G 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.649;DP=59;FS=9.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:309,0,1921 -chr20 23956149 . A AT 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.767;DP=35;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:397,0,335 -chr20 24403434 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.666;DP=16;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:265,0,58 -chr20 24479326 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.714;DP=18;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:37:544,0,37 -chr20 24479347 . T C 869.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:898,63,0 -chr20 24479522 . T TA 208.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-1.768;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:29:246,0,29 -chr20 24481298 . T C 1520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-1.733;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=15.36;ReadPosRankSum=1.644 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1549,126,0 -chr20 24481343 . T TGTGGAGGATCTGCTGGTGTGGATCAGGTCCCTCCTGACGTACCTA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-1.133;DP=65;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:409,0,487 -chr20 24481399 . T C 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.168;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:1038,0,1344 -chr20 25300346 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=1.109;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:295,0,224 -chr20 25387743 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:237,0,159 -chr20 25470331 . G T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.059;DP=106;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=7.41;ReadPosRankSum=-1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,32:105:99:814,0,3469 -chr20 25470640 . G T 1294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=0.568;DP=211;FS=10.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,57:211:99:1323,0,5855 -chr20 25501629 . C T 2879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.459;DP=155;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,91:154:99:2908,0,2605 -chr20 25502717 . AG A 588.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.938;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=20.30;ReadPosRankSum=-2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:626,0,1068 -chr20 25540979 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=23.32;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:378,0,184 -chr20 25578129 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.668;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:761,0,144 -chr20 25581717 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=-0.853;DP=23;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:261,0,494 -chr20 25581789 . A AT 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.231;DP=39;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:310,0,651 -chr20 25585968 . CAGGTGACAAAGTGATCATTCCAATGATGAGTAGACACCCAATTACTAGTCAAAAATAAATGGATAAAAGACAGATGGCCACCTCAGCTGACCTTCTACTTGTCCATTAT C 2536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.762;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2574,239,0 -chr20 25617590 . ACAAGGTATTTAGTGAGGTTTTTGATGGATGCAATAATTGAATTGAAAATAATTGAAATTTTCTATCATTTAAAACTTTTTATT A 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=2.687;DP=34;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:552,0,6675 -chr20 25629890 . G T 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=1.238;DP=36;FS=3.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=35.92;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1455,102,0 -chr20 25629943 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.237;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:631,0,521 -chr20 25632516 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.162;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:315,0,1723 -chr20 25632517 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-2.261;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:315,0,1723 -chr20 25632598 . TCCTGTTGTAAATACAACAAACATGTATCAACTTACTTGTCTTATAAAAATGAAATAAACTTAAAAATGTAAAAACAGA T 1092.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=1.040;DP=28;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=28.83;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:99:1130,99,0 -chr20 25634711 . A G 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 -chr20 25648208 . T A 1997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-0.658;DP=317;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,88:317:99:2026,0,8045 -chr20 25670124 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.348;DP=12;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=26.65;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:41:348,0,41 -chr20 25672408 . G A 2687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.486;DP=124;FS=0.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.321;QD=21.68;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,78:123:99:2716,0,1495 -chr20 25675426 . GGGTACGAATCACTGTGTCGATGCTTGCTTAGAATGGGTTATTCTAGTAGCTAGTTAATATCAAAATACAGTTTTTTTGCTAATAATTTGTAAATTGTGTCTTCAAACA G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=1.580;DP=10;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:242,0,517 -chr20 25675866 . A C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:318,0,392 -chr20 25688901 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=2.678;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.55;ReadPosRankSum=-2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:293,0,301 -chr20 25694660 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.824;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:368,0,409 -chr20 25755430 . G A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.543;DP=46;FS=2.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=15.21;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:728,0,875 -chr20 25758839 . T A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.925;DP=76;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1334,0,1294 -chr20 25764493 . GTC G 1082.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.408;DP=63;FS=3.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1120,0,1187 -chr20 25908171 . G C 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=-0.248;DP=35;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:611,0,628 -chr20 25928348 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.627;DP=28;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:423,0,581 -chr20 25938892 . G A 2371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=-0.150;DP=147;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,68:147:99:2400,0,4811 -chr20 25939453 . G A 1955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=-0.566;DP=123;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,55:122:99:1984,0,2199 -chr20 25939593 . C CT 1211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=2.926;DP=78;FS=10.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,57:75:99:1435,0,245 -chr20 25939636 . TA T 973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=1.328;DP=70;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=13.91;ReadPosRankSum=-2.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1011,0,1215 -chr20 25947111 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-1.890;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.893;QD=19.34;ReadPosRankSum=2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:415,0,270 -chr20 25953369 . G A 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=2.324;DP=30;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=21.13;ReadPosRankSum=-2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:662,0,366 -chr20 25959183 . A T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.053;DP=49;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:469,0,1272 -chr20 25964051 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=25.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:281,0,96 -chr20 25990659 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-0.650;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=29.04;ReadPosRankSum=-1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:580,0,123 -chr20 26032577 . A G 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=1.096;DP=69;FS=10.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.492;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:873,0,1455 -chr20 26053436 . T G 1503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=-4.011;DP=96;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=15.66;ReadPosRankSum=2.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:1824,0,2102 -chr20 26053998 . T C 2216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=1.040;DP=119;FS=8.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=18.63;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,64:118:99:2245,0,1974 -chr20 26319091 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.682;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:305,0,567 -chr20 26319092 . A T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=1.154;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:305,0,567 -chr20 26360340 . CAGGTAACATTGGTTTATTTGATGATTACCTCTTAATCAGTCATTCAAAAACAATCTGTGACTGTCTCTTGTTTTCCACTCTACTAAA C 495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.706;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:533,191,0 -chr20 26364053 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.427;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:344,0,1753 -chr20 26383502 . G A 2038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-1.760;DP=94;FS=2.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,59:94:99:2067,0,1166 -chr20 26388740 . GA G 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-0.355;DP=29;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:370,0,190 -chr20 26415542 . G T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=18.84;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:537,0,1079 -chr20 26441715 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,105 -chr20 26508405 . A C 1679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=3.676;DP=186;FS=9.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=9.03;ReadPosRankSum=3.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,59:186:99:1708,0,10895 -chr20 26508407 . A G 1679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=3.945;DP=188;FS=9.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=8.93;ReadPosRankSum=2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:1708,0,10895 -chr20 26520635 . TCCTGTTAAAAATGAAAAAAAGAGCACAGGACACGCTAATTCCTTGAAATAAAAGGCATGCAGATAAAAGCGGGAAGAATTTAAAAACACTTTAA T 449.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=254;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:99:487,0,2389 -chr20 26520740 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:99:487,0,2389 -chr20 26540875 . C G 4642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-0.277;DP=287;FS=12.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=16.18;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,151:287:99:4671,0,4718 -chr20 26552592 . T C 4148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.388;DP=321;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,124:320:99:4177,0,6230 -chr20 26554616 . C T 3036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=-0.364;DP=236;FS=0.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,91:234:99:3065,0,4964 -chr20 26630829 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.895;DP=88;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:600,0,2406 -chr20 26836992 . G A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.532;DP=306;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,69:306:99:1398,0,9091 -chr20 26856602 . CT C 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.065;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:69:270,0,69 -chr20 26867843 . GCCTGCACACAAAAACATTGGTACGTTCAACAACACTTTCTCCTTTGGTACTGTTATGACCATGCTCGTTGATGGTGCAAGCTCA G 1106.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=1.829;DP=28;FS=3.033;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:99:1144,99,0 -chr20 26868615 . GCTGTTGATGCAGCAAAAATGTAGTCAAACCTCATTCTTCCTCTGTTAATTAATCACTGTTTAATTTTATACACAAAAATGTGTCTGATAC G 527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.134;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:47:565,47,0 -chr20 26924315 . CGGTAAATGTATTAAATGGTATTTCACATAGATAATGCATCTTTGATTTACAATCAACTTACTGTACCAGTTATGTTTTTGTTATATAAATGGCCAATTATCTTGTTTTTCA C 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=2.916;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=23.56;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:485,0,2127 -chr20 26969937 . TGTGAGTAACCTCCTTTTTATATTTATCCAGTGGATTATTCTCCATCGATCTTTCGTGTTAAGAGTCTGGTGTTTGTTTCACTGGTCTTTTATTTATTTTGTTACTTACCCAG T 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=4.889;DP=172;FS=18.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,20:172:99:497,0,74754 -chr20 26971497 . ATT A 234.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:272,19,0 -chr20 26971664 . CT C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-2.438;DP=56;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=6.76;ReadPosRankSum=1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:624,0,168 -chr20 26973713 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.979;DP=251;FS=6.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=1.40;ReadPosRankSum=2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,45:247:99:379,0,9402 -chr20 26973918 . G A 1279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=-0.552;DP=263;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=4.87;ReadPosRankSum=2.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,65:263:99:1308,0,7452 -chr20 26974183 . C T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-0.344;DP=233;FS=3.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,54:232:99:1150,0,6802 -chr20 26974683 . A AT 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.356;DP=53;FS=9.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:691,0,483 -chr20 26990956 . CT C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.854;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=20.81;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:391,0,191 -chr20 27031779 . C CT 392.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:58:534,58,0 -chr20 27125712 . GAGGTAAAGAGCGGTTTAGTCTGAGCTGCATTCTGTTACATACTTTCACATTGTGTTCTTTAAATAAATATTAACTCTTAATCTGAATTGAACCCACAATCC G 7329.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=1.108;DP=218;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=33.62;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,206:211:99:7367,593,0 -chr20 27137140 . T TG 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.471;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=8.33;ReadPosRankSum=-2.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:454,0,616 -chr20 27142747 . T TTG 486.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:524,39,0 -chr20 27253948 . C G 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 -chr20 27254206 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.923;DP=31;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:471,0,493 -chr20 27254242 . A T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=3.172;DP=37;FS=8.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:509,0,729 -chr20 27399565 . TGTACGTAACAAAATCCCCTAAGCTTTCTTATGTTGCTACTGCAGTTGGTTCTTTGACCCATGACCTGTGACCCATCATCGCTAGTACTTCAACATTTACACTCACAATTTTTTCTTTAG T 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:335,0,1315 -chr20 27401176 . T G 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.700;DP=32;FS=2.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1081,0,160 -chr20 27579960 . GA G 273.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=21.06;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:24:311,0,24 -chr20 28227833 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr20 28302631 . C CAA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=18.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,160 -chr20 28350169 . G T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:335,27,0 -chr20 28350255 . G C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr20 28431477 . A T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=1.246;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:574,0,530 -chr20 28452706 . G GT 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=-0.463;DP=41;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:526,0,436 -chr20 28530061 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=14.69;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:278,0,432 -chr20 28853120 . G GGCACCAACTCATCCGGT 1802.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.563;ClippingRankSum=-2.424;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,58:103:99:1840,0,1776 -chr20 28859253 . GTT G 941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=5.075;DP=182;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=5.17;ReadPosRankSum=-4.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,36:149:99:1003,0,3648 -chr20 28860524 . T C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:351,0,123 -chr20 28896910 . T C 2619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=1.027;DP=183;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=14.32;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,49:174:99:2648,0,7902 -chr20 28896919 . T C 2619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.121;DP=155;FS=7.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=16.90;ReadPosRankSum=2.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,40:146:99:2648,0,7956 -chr20 28897196 . T C 6709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.985;DP=54;FS=13.865;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,42:53:99:6738,404,0 -chr20 28897201 . T C 2201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=2.780;DP=53;FS=11.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=32.72;ReadPosRankSum=-1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,37:53:99:2230,0,642 -chr20 28897317 . T C 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-2.033;DP=197;FS=14.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,62:197:99:1599,0,5561 -chr20 28901763 . CAA C 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=2.405;DP=33;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:266,0,1038 -chr20 29071663 . G A 2492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=-1.298;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=22.26;ReadPosRankSum=5.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,69:112:99:2521,0,3094 -chr20 29289811 . ATCAGGTCTACAACTTCACACACCATTATATCTATAAACGTTGATTATAAACAGTCCTTTTGTTAAATCTGTTCTCATGTTTGATTTGTGATTTCT A 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.400;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,65:68:99:2395,0,521 -chr20 29294942 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.73;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:277,0,311 -chr20 29295043 . T C 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.268;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=28.54;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:856,0,426 -chr20 29308153 . CCCTAAATACAGCAAATAAAGCCGCATGAAATGCAAAGACATGCACTGTACTCTAACACAGGCGAACAGTATAAGCATTA C 4484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.400;DP=107;FS=2.301;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.810;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,103:106:99:4522,348,0 -chr20 29368098 . C A 1405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.386;DP=54;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:1434,0,395 -chr20 29415229 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:370,0,51 -chr20 29518562 . C T 4115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-3.858;DP=219;FS=13.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,103:216:99:4144,0,7753 -chr20 29518563 . A G 4115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.218;ClippingRankSum=-3.826;DP=215;FS=17.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=19.14;ReadPosRankSum=2.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,103:212:99:4144,0,7834 -chr20 29518754 . AT A 8088.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.468;DP=324;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=24.97;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,230:314:99:8126,0,1884 -chr20 29518882 . T C 6088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=-0.311;DP=297;FS=16.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=20.50;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,153:244:99:6117,0,3071 -chr20 29685994 . CGTAATGTAGTTTTACAATCACAGCACAAAACTGACATAAATTCACAGCCAGTATCATCAGAGTCTGTCAAGGCTCATATGGCTGATTGATCCCCTCACGTTTCTCCTCCATCTTCTAG C 3337.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=2.873;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,72:76:99:3375,283,0 -chr20 29811186 . C CT 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.379;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:452,0,613 -chr20 30057564 . CT C 1207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.213;DP=103;FS=6.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1245,0,814 -chr20 30059091 . CT C 2467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=-1.123;DP=230;FS=0.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=10.73;ReadPosRankSum=0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,122:203:99:2505,0,1487 -chr20 31002832 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-2.608;DP=22;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:310,0,373 -chr20 31003085 . A G 262.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=26.28;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:291,0,18 -chr20 31003626 . T C 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=1.778;DP=37;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:831,0,448 -chr20 31007314 . A C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=-1.743;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=3.74;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,23:111:99:469,0,3413 -chr20 31008034 . A G 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.811;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=22.83;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:987,0,283 -chr20 31008141 . A G 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=3.956;DP=86;FS=27.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:958,0,1877 -chr20 31008325 . T G 3304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-1.718;DP=112;FS=2.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=29.51;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,84:108:99:3333,0,502 -chr20 31008362 . G A 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.315;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.986;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:576,0,2854 -chr20 31300440 . G A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=-3.388;DP=223;FS=10.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:595,0,534 -chr20 31308326 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-5.316;DP=163;FS=7.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,41:162:99:926,0,5129 -chr20 31309441 . TGTAAGTTGCAGTTTTTTTGTCTTGTTTTTCAGATAATAATTCATGCGTACTCTTTGTTCTCTTTGTTTCCTGCTTGCACTTATTTAATATTCATATGTGTAATATTGGTAAGGTTTCTAAAATTATAATTGTTGTATTTTCTGCAG T 13042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.651;DP=379;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=34.41;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,373:378:99:13791,717,0 -chr20 31309899 . C T 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-5.863;DP=78;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,40:78:99:1336,0,2767 -chr20 31748797 . T C 5888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.253;DP=211;FS=11.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=27.91;ReadPosRankSum=3.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,20:189:99:5917,0,9695 -chr20 31748800 . A AG 5779.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=-0.142;DP=221;FS=4.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=26.15;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,34:199:99:5817,0,9696 -chr20 31748863 . G T 5587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;ClippingRankSum=2.075;DP=259;FS=7.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=21.57;ReadPosRankSum=6.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,161:238:99:5616,0,8927 -chr20 31749212 . G A 13516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=268;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.16;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,255:255:99:13545,974,0 -chr20 31749273 . AT A 4646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=-1.496;DP=170;FS=1.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,139:157:99:4684,102,0 -chr20 31749321 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.894;DP=48;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:377,0,1218 -chr20 32035530 . G A 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:372,27,0 -chr20 32048774 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-2.601;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.023;QD=11.75;ReadPosRankSum=3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:275,0,579 -chr20 32083639 . A G 2701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2730,199,0 -chr20 32083827 . T A 1026.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1055,75,0 -chr20 32083849 . T A 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 -chr20 32175247 . GT G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=1.413;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=15.34;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:605,0,349 -chr20 32175332 . T G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.740;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:300,0,2193 -chr20 32175469 . G T 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-1.261;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,34:107:99:905,0,2822 -chr20 32176410 . A T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.008;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,30:129:99:657,0,4087 -chr20 32176633 . G T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=-0.784;DP=139;FS=1.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.022;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,37:139:99:867,0,3775 -chr20 32176837 . G GA 1615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.003;DP=116;FS=2.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,65:105:99:1653,0,1036 -chr20 32180673 . A G 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-1.297;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:782,0,1321 -chr20 32183753 . T G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=1.998;DP=56;FS=2.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:383,0,1515 -chr20 32184722 . A T 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.444;DP=55;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:508,0,1370 -chr20 32185111 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=1.529;DP=63;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:457,0,1714 -chr20 32187080 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.332;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:419,0,1656 -chr20 32266149 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=1.582;DP=150;FS=16.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.018;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,35:150:99:730,0,4531 -chr20 32267809 . GA G 1922.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=-2.166;DP=136;FS=3.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,76:126:99:1960,0,1180 -chr20 32267934 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.074;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,20:97:99:328,0,3010 -chr20 32268019 . T TGC 1177.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.750;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1215,0,1555 -chr20 32268705 . TG T 627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=-0.861;DP=91;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:665,0,1544 -chr20 32268978 . TTG T 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=-1.153;DP=67;FS=5.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=8.37;ReadPosRankSum=3.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,28:62:99:598,0,1087 -chr20 32324960 . A ATT 1032.48 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=-3.367;DP=68;FS=6.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1253,0,594 -chr20 32325052 . AT A 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.013;DP=58;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.57;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:330,0,864 -chr20 32325531 . T A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-1.508;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=36.96;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:34:725,0,34 -chr20 32376288 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr20 32471073 . C CA 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-1.016;DP=239;FS=4.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,49:230:99:385,0,4989 -chr20 32479906 . A T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-1.226;DP=116;FS=1.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,37:116:99:949,0,2811 -chr20 32480163 . G C 2721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=-0.808;DP=129;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,84:129:99:2750,0,1461 -chr20 32485193 . A T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=-0.163;DP=96;FS=7.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:503,0,2441 -chr20 32517249 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=1.236;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:319,0,326 -chr20 32523430 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.562;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,303 -chr20 32552116 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-2.042;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,34:124:99:837,0,3368 -chr20 32552137 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.293;DP=140;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:244,0,4302 -chr20 32552868 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.594;DP=147;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,32:147:99:644,0,4434 -chr20 32559344 . G GA 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=1.626;DP=89;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:327,0,1415 -chr20 32559733 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=2.555;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:279,0,3442 -chr20 32559785 . GT G 2243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.684;DP=83;FS=3.126;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=27.03;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:2281,227,0 -chr20 32560101 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.807;DP=61;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:229,0,1844 -chr20 32796688 . C G 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.924;DP=24;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=27.74;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:90:694,0,90 -chr20 32978089 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.704;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:258,0,527 -chr20 32987472 . G C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-1.485;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:284,0,461 -chr20 33070037 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.996;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:242,0,399 -chr20 33185856 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:272,0,59 -chr20 33219176 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=-1.743;DP=151;FS=11.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,24:151:99:285,0,4864 -chr20 33228207 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.674;DP=124;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:377,0,8029 -chr20 33522964 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.587;DP=234;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,36:234:99:355,0,7686 -chr20 33525727 . G A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.492;DP=187;FS=8.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,34:187:99:485,0,5693 -chr20 33525870 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=-1.443;DP=172;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,30:172:99:323,0,6477 -chr20 33565155 . G A 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.039;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:66:743,0,66 -chr20 33610223 . A G 205.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:234,0,22 -chr20 33617838 . G A 677.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.520;DP=22;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=30.81;ReadPosRankSum=-1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:24:738,24,0 -chr20 33674325 . A G 1742.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1771,132,0 -chr20 33676108 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:385,0,49 -chr20 33677648 . T C 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:424,33,0 -chr20 33685245 . TCTAAAACCAGAAAAAAACACATGATAATACAAAACAAATACACACAGATTCAAAACGAACACTCTCCAAAAATACATCTAAGACTGGTAGACATAC T 3092.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=2.436;DP=73;FS=6.214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=37.76;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,67:70:99:3130,262,0 -chr20 33689604 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=-1.824;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:377,0,2250 -chr20 33698080 . T C 1898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=1.172;DP=61;FS=2.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=31.13;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,50:61:99:1927,0,172 -chr20 33708369 . A G 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-2.328;DP=55;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=18.87;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1066,0,996 -chr20 33708375 . A G 1659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=2.307;DP=51;FS=3.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1688,0,123 -chr20 33710964 . T C 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=2.725;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=29.76;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1546,0,126 -chr20 33711181 . A G 1450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=1.607;DP=70;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,39:58:99:1479,0,547 -chr20 33711214 . A G 1109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=1.413;DP=69;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=16.08;ReadPosRankSum=-1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,34:58:99:1138,0,785 -chr20 33713044 . G A 4450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-3.698;DP=204;FS=15.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,129:199:99:4479,0,2576 -chr20 33713171 . G T 2842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-0.371;DP=151;FS=16.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,83:146:99:2871,0,2187 -chr20 33774136 . TA T 819.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.720;DP=34;FS=2.618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.407;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,30:33:36:857,36,0 -chr20 33814535 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:307,0,174 -chr20 33834580 . A AT 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.659;DP=33;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:429,0,269 -chr20 33834910 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-1.015;DP=38;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:239,0,2225 -chr20 33834911 . C A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=-1.023;DP=36;FS=2.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:249,0,2206 -chr20 33835104 . GA G 212.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:250,24,0 -chr20 33835221 . G A 718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:51:747,51,0 -chr20 33835419 . A AT 936.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.425;DP=40;FS=3.117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=23.42;ReadPosRankSum=2.190 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1096,116,0 -chr20 33929844 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.516;QD=29.72;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:63:593,0,63 -chr20 34023981 . AAGGTAACTTAAAATGAAAGTTATTCCTCCATGACCAGACCATGATTTTAACAGTCTAAAACAACAATAATGTTTTTTTTTGTGAT A 2768.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.697;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=30.30;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2806,237,0 -chr20 34032608 . TCAGGTATGTGCACATTTTATTTAATTTATTTCAATTAGTCATCTGACTGTTTAAGTTTTGTCCATGTGACTATGTATATGTTTGACTG T 2862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.897;DP=76;FS=2.268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=23.29;ReadPosRankSum=2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:2900,211,0 -chr20 34057826 . GGCTAGCAGAAGATCCAACAAGCCCAGGGCCAGCAGAAGATCCAATAAGCCCAGT G 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:99:458,0,116 -chr20 34057952 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=23.60;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:335,0,338 -chr20 34064016 . A C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-1.805;DP=139;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=3.21;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,26:138:99:474,0,4390 -chr20 34069453 . A T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=1.343;DP=122;FS=3.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,24:122:99:415,0,3632 -chr20 34069467 . ACTGAGACGGATGGGAAAAGAAATAAGACATTTAGATTCTGAAAGCTTCAAAATCATTGATGGTATCTGAATGGAAAAGATACAGTACCAACAAGATGCTAAACAACGTTCTGGCAGACATGTTTATTTAGGACATGGTCACTTAC A 5915.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=2.898;DP=133;FS=2.294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=34.46;ReadPosRankSum=-2.961 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,125:128:99:5953,553,0 -chr20 34073749 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.091;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,29:164:99:440,0,5274 -chr20 34079009 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=1.453;DP=116;FS=2.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,26:116:99:545,0,3522 -chr20 34080835 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.791;DP=119;FS=7.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.322;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,26:119:99:525,0,3459 -chr20 34084041 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=1.485;DP=101;FS=3.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:338,0,6528 -chr20 34084048 . G C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.153;DP=117;FS=3.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:338,0,6528 -chr20 34086396 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-1.234;DP=137;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,20:137:99:301,0,4364 -chr20 34086594 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.340;DP=129;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,28:129:99:566,0,3898 -chr20 34088399 . C CCGTGACAGTTTG 4859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=-0.438;DP=144;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,118:130:62:4897,62,0 -chr20 34092889 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=-0.387;DP=139;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:509,0,9205 -chr20 34092895 . C A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.726;DP=139;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,26:139:99:517,0,9205 -chr20 34196208 . ACTGTCGAAGAAGAGAAGAGAAGATAAGCCAGTGCTTTAAAAATCTGTATAAGAAGTAAATGTCAATTCTATCGCTATTCATTCAC A 974.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=2.739;DP=27;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=31.77;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:1012,0,1419 -chr20 34244497 . T G 615.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:11:643,11,0 -chr20 34361480 . AT A 241.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:277,3,0 -chr20 34361482 . A G 250.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=22.78;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:3:277,3,0 -chr20 34361956 . CT C 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.383;DP=50;FS=1.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.193;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:672,0,152 -chr20 34363507 . GCAGGTTTGTGTGCATCACATTAATCCAAAAAATTTTGAATGTCTCTTGCTTTTGCTAAGCAACTCTTGTCTTGCTCTT G 11142.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=1.269;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,307:312:99:11180,895,0 -chr20 34365099 . A AT 5638.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-0.748;DP=183;FS=5.212;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:5891,555,0 -chr20 34407898 . T G 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr20 34472130 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-0.336;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:476,0,243 -chr20 34476639 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.022;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:320,0,1423 -chr20 34531801 . T TTA 336.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:50:664,50,0 -chr20 34544285 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=-1.901;DP=112;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,25:112:99:355,0,3825 -chr20 34622281 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=1.068;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:308,0,874 -chr20 34638257 . CAA C 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.710;DP=40;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=13.89;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:593,0,658 -chr20 34638261 . GGTGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTT G 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.076;DP=40;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:593,0,655 -chr20 34638263 . TGAGTTTGGCTGGATCTGATGCTACTGTAGCTACTATGTTTTTTTACTGCAGTGTTTCATGTATGCTTGTGTTTTAGGG T 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.833;DP=38;FS=9.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.535;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:650,0,624 -chr20 34657227 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-0.133;DP=51;FS=4.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:320,0,1396 -chr20 34658826 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.276;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:252,0,265 -chr20 34659439 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.317;DP=52;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:283,0,1495 -chr20 34667746 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-1.472;DP=69;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:267,0,3886 -chr20 34672194 . C CT 1026.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:90:1064,90,0 -chr20 34672260 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.157;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:459,0,394 -chr20 34672292 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.039;DP=26;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:544,0,121 -chr20 34672422 . G A 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-1.484;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1335,0,304 -chr20 34672521 . T G 1412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1441,102,0 -chr20 34679014 . CT C 1379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=-2.064;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,57:70:80:1417,0,80 -chr20 34686106 . A G 2687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2716,187,0 -chr20 34763364 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:321,0,97 -chr20 34803791 . C T 268.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.87;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:20:297,20,0 -chr20 34804912 . C T 2005.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2043,144,0 -chr20 34807413 . T A 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1080,72,0 -chr20 34807414 . T G 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1080,72,0 -chr20 34807900 . G T 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=-0.641;DP=221;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,46:191:99:1079,0,5765 -chr20 34808008 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.070;DP=74;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:431,0,2154 -chr20 34808010 . A T 2882.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2911,205,0 -chr20 34819758 . G A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.797;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=13.66;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:1176,0,1810 -chr20 34819916 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-0.678;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.759;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:272,0,1327 -chr20 34820237 . CT C 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.091;DP=89;FS=8.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1090,0,645 -chr20 34822426 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-1.640;DP=93;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=8.63;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:831,0,2383 -chr20 34981397 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:297,0,386 -chr20 35083728 . GGACGACGAC G 431.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.804;DP=66;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:91:469,0,91 -chr20 35084179 . T C 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=-0.803;DP=29;FS=8.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:313,0,682 -chr20 35084366 . GA G 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-0.573;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:312,0,624 -chr20 35084566 . C T 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=-1.349;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:862,0,914 -chr20 35085603 . GTA G 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-2.527;DP=50;FS=11.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:472,0,1421 -chr20 35089433 . TGGTGACTATTTTTAGTTGGGTATTATTTATTGGCCTTTTTATTCTTTTATCTTTTGTCGTCTAATCTCTTTTTCCTCTCTCTTTCCCCCA T 13659.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.893;DP=352;FS=3.073;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=30.99;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,346:347:99:13697,1172,0 -chr20 35091429 . G A 5338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-0.550;DP=394;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,167:393:99:5367,0,7115 -chr20 35093320 . G GA,GAA 3623.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=-2.844;DP=66;FS=5.699;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=34.32;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,9,23:36:99:8582,2534,4513,1660,0,1201 -chr20 35093379 . G C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-1.440;DP=170;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,51:169:99:1032,0,6010 -chr20 35135662 . T A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr20 35167464 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.090;DP=33;FS=5.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:576,0,558 -chr20 35184108 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=-0.153;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:393,0,542 -chr20 35233839 . T TA 276.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:314,29,0 -chr20 35268237 . G T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.065;DP=56;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:425,0,1508 -chr20 35268259 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=-0.059;DP=61;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1014,0,1037 -chr20 35268329 . T C 2734.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2763,199,0 -chr20 35272228 . G A 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:402,27,0 -chr20 35272236 . C A 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 -chr20 35272507 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.819;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=29.34;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:72:527,0,72 -chr20 35272892 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr20 35276785 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=26.62;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:321,0,51 -chr20 35278451 . A C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr20 35278452 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr20 35304645 . A T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=26.37;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:81:371,0,81 -chr20 35304676 . G A 750.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:57:779,57,0 -chr20 35307321 . C A 2341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.035;DP=74;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=31.65;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,61:70:57:2370,0,57 -chr20 35317421 . G A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-1.658;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,32:127:99:729,0,3643 -chr20 35319816 . C T 2659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.425;DP=153;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,81:152:99:2688,0,2544 -chr20 35321588 . T C 5657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:5686,403,0 -chr20 35321820 . T G 2533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.006;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,77:139:99:2562,0,2241 -chr20 35322025 . T G 2942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.292;DP=119;FS=6.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,80:119:99:2971,0,1105 -chr20 35322301 . G A 1985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.760;DP=85;FS=8.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,58:84:99:2014,0,1967 -chr20 35322307 . A G 2577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.130;DP=86;FS=7.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,59:86:99:2606,0,691 -chr20 35322478 . T C 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.887;DP=77;FS=3.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=18.48;ReadPosRankSum=-2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1451,0,1173 -chr20 35322512 . AT A 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-0.362;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:413,0,411 -chr20 35322576 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:294,0,224 -chr20 35407137 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.731;DP=50;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-2.169;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:234,0,1425 -chr20 35452605 . GT G 495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:533,52,0 -chr20 35453194 . GT G 1450.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-1.201;DP=48;FS=2.513;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=30.22;ReadPosRankSum=-1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:46:99:1488,120,0 -chr20 35478587 . AAGGTAATAGTTTTATTGTGTCAAGTAGTGTGTTTTCAGCTGTTAAATCACATGTATTCACAACCATTTATACGTCT A 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=2.731;DP=26;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.95;ReadPosRankSum=-2.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:660,0,3505 -chr20 35585921 . T G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.182;DP=20;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:437,0,113 -chr20 35615868 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr20 35615913 . A C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=1.377;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.89;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:291,0,96 -chr20 35616171 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.273;DP=59;FS=1.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:474,0,1821 -chr20 35671730 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=1.782;DP=27;FS=3.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:346,0,868 -chr20 35707834 . A C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-1.109;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.65;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:329,0,195 -chr20 35708023 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.292;DP=32;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:421,0,695 -chr20 35719307 . A C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.942;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=24.09;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:79:486,0,79 -chr20 35985528 . C T 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.238;DP=86;FS=5.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1599,0,2916 -chr20 35985529 . T A 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.205;DP=83;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1599,0,2916 -chr20 36004507 . G T 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=1.553;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.428;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:1273,0,1442 -chr20 36058443 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-1.041;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=23.52;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,165 -chr20 36067471 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-1.866;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,255 -chr20 36420891 . TG T 1754.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.694;DP=130;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,75:110:99:1792,0,675 -chr20 36421021 . T TA 359.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-1.668;DP=251;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,49:232:99:397,0,4773 -chr20 36423683 . G A 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=7.690;DP=258;FS=6.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=4.92;ReadPosRankSum=-2.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,62:257:99:1297,0,7461 -chr20 36423716 . T C 1452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-1.774;DP=251;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,66:251:99:1481,0,10323 -chr20 36441452 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-1.411;DP=230;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=1.02;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,33:230:99:263,0,7337 -chr20 36444859 . GA G 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=-1.541;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,27:103:99:368,0,1857 -chr20 36445489 . C T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.216;DP=93;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.629;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,27:93:99:682,0,2490 -chr20 36446618 . C T 1992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-0.504;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,56:111:99:2021,0,1952 -chr20 36457855 . G A 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.055;DP=96;FS=3.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,42:96:99:1539,0,1828 -chr20 36485933 . G A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr20 36485935 . C A 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:810,54,0 -chr20 36600014 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:285,0,210 -chr20 36798311 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=-0.142;DP=31;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:376,0,648 -chr20 36810085 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.650;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:448,0,1172 -chr20 36823014 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-1.772;DP=98;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:333,0,2842 -chr20 36841800 . C T 3170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=-2.635;DP=193;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,90:182:99:3199,0,5535 -chr20 36841976 . G C 1969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=-4.716;DP=325;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,92:325:99:1998,0,8665 -chr20 36872773 . G GA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-0.543;DP=22;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:258,0,168 -chr20 37025431 . A C 1612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1641,111,0 -chr20 37025453 . A G 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1374,93,0 -chr20 37322140 . AT A 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=-0.075;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:38:394,0,38 -chr20 37781693 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.300;DP=31;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:415,0,614 -chr20 37821158 . GAGGTAAGACCCACTCATTTACTGGCACAAATGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTAATTTCTCATATTTCACATTGGTTATATTGAGTAACATGGACGTAGAAAAGCCATGCTTGCACAATTCACTTGTTCATCCACTTGTGGGCATTTTAGGTAGTTTGGCTTTCCCAAATTGATAGATGTTGTTATTTC G 2684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-0.451;DP=96;FS=11.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=27.97;ReadPosRankSum=2.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,82:93:99:2722,0,1781 -chr20 37938062 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.298;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:330,0,1118 -chr20 37938479 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.950;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:253,0,1175 -chr20 38154223 . TCTGCCAAAGAGAAAGATACCAAGTCTTTAAATAATCTTAATAACTTAAGTTAACCCCATTGTTCAATCTGTTCAAACAGTTCTAC T 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:374,0,975 -chr20 38407514 . C T 1691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-3.432;DP=194;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.757;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,65:90:99:1720,0,985 -chr20 38407521 . G GT 1681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=-3.435;DP=254;FS=6.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=6.62;ReadPosRankSum=3.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,73:110:99:1719,0,1120 -chr20 38407672 . C G 9048.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.848;DP=324;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=27.93;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,230:239:99:9077,137,0 -chr20 38407713 . C G 10662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-4.915;DP=262;FS=4.761;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,155:177:99:10691,454,0 -chr20 38498514 . A T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-2.066;DP=140;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.253;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,28:140:99:350,0,5018 -chr20 38542976 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=1.306;DP=128;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,21:128:99:255,0,4142 -chr20 38790002 . G GT 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.874;DP=63;FS=2.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:383,0,750 -chr20 38833000 . G A 3597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=-0.417;DP=261;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,108:261:99:3626,0,5049 -chr20 38837232 . A G 3985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-1.683;DP=269;FS=10.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=14.82;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,114:267:99:4014,0,5158 -chr20 38839462 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=4.675;DP=236;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,32:236:99:246,0,16527 -chr20 38840737 . G A 3575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.447;DP=283;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.64;ReadPosRankSum=1.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,108:282:99:3604,0,5902 -chr20 38930140 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.385;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:470,0,692 -chr20 38981539 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr20 39281049 . TC T 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.061;DP=46;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=8.84;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:444,0,753 -chr20 39281834 . GGA G 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.655;DP=23;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:386,0,377 -chr20 39363446 . CA C 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.859;DP=28;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:294,0,384 -chr20 39367976 . CCCTTTAACCGATGGCAATACAAATTGTGTAAATATACAATATTGTATAATACAACTGTTTTGTACCAACTTTCACTTCTCATAATA C 657.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.315;DP=180;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,163:166:99:695,264,0 -chr20 39460399 . T C 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=34.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:271,0,22 -chr20 39713090 . AAGGTATGATGGTTTGAAGTAAACATTTGACCTTTTTTAATTTGATCACACATTAAACACTGAGAGTATTACTCTTC A 5306.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=-0.484;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,121:125:99:5344,420,0 -chr20 39713334 . T C 2335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.200;DP=135;FS=9.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=17.30;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:2364,0,2439 -chr20 39713349 . G A 2447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.983;DP=133;FS=9.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,67:133:99:2476,0,2453 -chr20 39829770 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:267,0,525 -chr20 39832391 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.033;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:405,0,358 -chr20 40279741 . C T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=-1.629;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=23.61;ReadPosRankSum=2.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:713,0,320 -chr20 40281124 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-0.182;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:482,0,165 -chr20 40282306 . G T 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.260;DP=31;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:629,0,467 -chr20 40283258 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.642;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=19.37;ReadPosRankSum=-1.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:590,0,476 -chr20 40284403 . G C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.041;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:822,0,566 -chr20 40284761 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=2.295;DP=47;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:314,0,1257 -chr20 40297942 . G A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=1.187;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=25.96;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:859,0,941 -chr20 40298378 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=1.031;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:230,0,273 -chr20 40300183 . C G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.814;DP=27;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.505;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:526,0,392 -chr20 40300254 . T A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=-1.347;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:322,0,284 -chr20 41835748 . T G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-1.173;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:403,0,321 -chr20 41849241 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:412,0,241 -chr20 41855396 . G A 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.243;DP=33;FS=5.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=22.24;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:762,0,421 -chr20 41869750 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.370;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:513,0,368 -chr20 42253748 . CT C 700.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.156;DP=67;FS=10.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:738,0,2593 -chr20 42254025 . CTA C 1141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.249;DP=73;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=15.64;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1179,0,1630 -chr20 42301332 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.554;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:335,0,852 -chr20 42301350 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=2.597;DP=34;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=11.43;ReadPosRankSum=-3.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:417,0,692 -chr20 42330005 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-0.760;DP=22;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.847;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:293,0,462 -chr20 42372897 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.181;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:264,0,445 -chr20 42655820 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.517;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:419,0,433 -chr20 42720514 . T G 2909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=1.750;DP=118;FS=19.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,40:113:99:2938,0,5114 -chr20 42734232 . TCTGTTGAAATATAGAAAAAGTAAGTCACAAATGCAAGCTTAATTCAGAATAAGTCTAAAATATAAAGATATAACCTTTGATCTCCAAAGATTTTTGTGTCAAACATGAACTAAACTTCCTACAGTAC T 12315.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=1.693;DP=267;FS=5.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=28.87;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,266:267:99:12353,1148,0 -chr20 42749429 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=-1.461;DP=40;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:261,0,1268 -chr20 42749689 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.981;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:288,0,1715 -chr20 42749779 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.489;DP=45;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.836;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:238,0,1330 -chr20 42848616 . C G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.783;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=30.05;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:33:479,0,33 -chr20 43154373 . GT G 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.959;DP=40;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:740,0,434 -chr20 43154617 . AG A 871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.741;DP=66;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:909,0,913 -chr20 43165171 . C T 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.728;DP=34;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:545,0,479 -chr20 43181364 . G C 2274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.094;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,69:107:99:2303,0,1203 -chr20 43181773 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-1.281;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=4.68;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:337,0,1671 -chr20 43183363 . T C 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.320;DP=69;FS=8.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,37:68:99:1201,0,1084 -chr20 43183381 . C T 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.180;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.035;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:1327,0,1083 -chr20 43746462 . T G 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=-0.540;DP=66;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,35:66:99:1126,0,1106 -chr20 43782125 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.896;DP=61;FS=8.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:380,0,1687 -chr20 43808604 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.091;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,39:237:99:375,0,11949 -chr20 43957168 . T A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr20 43974260 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:254,0,57 -chr20 44155478 . A C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.667;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,174 -chr20 44430393 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 44430394 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 44772906 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-2.052;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=9.70;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:232,0,492 -chr20 44812675 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=1.144;DP=82;FS=7.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=3.48;ReadPosRankSum=2.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:314,0,2274 -chr20 44991477 . GA G 775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.730;DP=55;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:813,0,254 -chr20 44991864 . GT G 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.876;DP=49;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:431,0,765 -chr20 45836847 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:298,0,289 -chr20 45870509 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.711;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.812;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:274,0,938 -chr20 45870528 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.643;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,778 -chr20 45911562 . C A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.206;DP=88;FS=4.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:462,0,5206 -chr20 45956523 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-0.787;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:307,0,478 -chr20 46426729 . GA G 482.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.441;DP=22;FS=3.197;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:27:520,27,0 -chr20 46760333 . G A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.089;DP=122;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:867,0,3274 -chr20 46776636 . T A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.589;DP=183;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,32:181:99:340,0,5603 -chr20 46779640 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=-3.240;DP=164;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.961;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,33:164:99:608,0,4749 -chr20 46845094 . G A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=-0.461;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=24.97;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,32:44:99:1127,0,255 -chr20 46845249 . A G 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.648;DP=31;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=27.77;ReadPosRankSum=-0.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:889,0,119 -chr20 46845332 . C T 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.501;DP=37;FS=3.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=21.32;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:817,0,240 -chr20 46845492 . TGA T 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.201;DP=16;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:274,0,266 -chr20 46964490 . AGCAGGTGTGCTGCGCTTACACATTCAGCCGCTACACACGTCCCTCTGCGTTTTCACGTCACACGTGTGCGTTTGTGTTT A 3735.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.152;ClippingRankSum=2.746;DP=113;FS=7.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=33.06;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,98:113:99:3773,0,2001 -chr20 46982765 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.590;DP=28;FS=6.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:246,0,687 -chr20 46982877 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=-1.336;DP=47;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:542,0,1040 -chr20 46987864 . AT A 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:258,0,138 -chr20 46988118 . A G 798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:57:827,57,0 -chr20 46988142 . T G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=28.14;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:394,0,362 -chr20 46988645 . T G 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr20 47011587 . A G 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-2.688;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=26.14;ReadPosRankSum=-2.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:1100,0,802 -chr20 47194829 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=2.626;DP=26;FS=13.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.95;ReadPosRankSum=-2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:391,0,292 -chr20 47195271 . A T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.67;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:94:388,0,94 -chr20 47218495 . TTCAGGTGAGTCAGTCAACATACAGTACGCAAAGCTGCTGAAGACAGGACATCAGTCTATAATAATGTGTGTC T 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.925;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:376,0,1173 -chr20 47222864 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=1.791;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=18.18;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:301,0,249 -chr20 47232927 . TAA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.952;DP=36;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:386,0,456 -chr20 47235762 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-0.386;DP=46;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.112;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:236,0,1339 -chr20 47236766 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.162;ClippingRankSum=-1.021;DP=44;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:400,0,1140 -chr20 47237324 . C T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=-0.220;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:466,0,408 -chr20 47237807 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.369;DP=48;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:299,0,1447 -chr20 47239758 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=1.234;DP=34;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:237,0,806 -chr20 47254753 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.974;DP=34;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=9.64;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:356,0,791 -chr20 47395966 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.380;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:235,0,171 -chr20 47525584 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=1.001;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:43:780,0,43 -chr20 47669633 . C CA 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.310;DP=86;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:316,0,1515 -chr20 47669644 . G A 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.365;DP=86;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,29:86:99:967,0,1984 -chr20 47669889 . A T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.530;DP=80;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:455,0,4818 -chr20 47670063 . A G 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=-0.688;DP=168;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,54:166:99:1231,0,5379 -chr20 47670232 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=1.081;DP=147;FS=6.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=1.90;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,32:142:99:307,0,5162 -chr20 47670387 . C T 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-1.649;DP=124;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:989,0,3286 -chr20 47670690 . C T 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-3.407;DP=99;FS=22.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.596;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,26:99:99:606,0,4914 -chr20 47670691 . A G 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.488;DP=97;FS=26.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,46:97:99:1704,0,1716 -chr20 47726775 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.059;ClippingRankSum=-1.333;DP=290;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,73:290:99:1453,0,16723 -chr20 47726786 . T TG 2128.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=-2.294;DP=301;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,71:285:99:2166,0,8109 -chr20 47737541 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=-0.569;DP=321;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.730;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,52:320:99:621,0,10506 -chr20 47763132 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.467;ClippingRankSum=0.133;DP=309;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,47:307:99:475,0,9476 -chr20 47864113 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=2.987;DP=137;FS=9.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=1.74;ReadPosRankSum=-1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,22:137:99:266,0,4510 -chr20 48017301 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.796;DP=37;FS=1.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:229,0,1455 -chr20 48176578 . C CT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.884;DP=39;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:245,0,2235 -chr20 48215752 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.406;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=33.26;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:272,0,244 -chr20 48215793 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.811;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.83;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,202 -chr20 48216873 . C G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.619;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:452,0,1787 -chr20 48222562 . AT A 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=1.090;DP=106;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:460,0,1563 -chr20 48705613 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.972;DP=26;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:703,0,228 -chr20 48707122 . T C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=1.137;DP=66;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1377,0,1162 -chr20 48707480 . T C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-1.260;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:806,0,855 -chr20 48709772 . G GT 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=-1.089;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:440,0,1986 -chr20 48786930 . TA T 1506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.612;DP=172;FS=13.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=8.76;ReadPosRankSum=-1.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,66:162:99:1544,0,2010 -chr20 48997230 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=-0.378;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:485,0,837 -chr20 48997351 . A C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.635;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=20.54;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:747,0,378 -chr20 49073102 . C CT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=-0.923;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:85:509,0,85 -chr20 49436883 . C T 2061.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=-0.586;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,64:68:99:2090,153,0 -chr20 49782226 . G T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.621;DP=121;FS=2.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,36:120:99:819,0,3031 -chr20 50252034 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr20 50270897 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:359,0,338 -chr20 51424115 . T A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.152;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=27.97;ReadPosRankSum=2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:1161,0,252 -chr20 51424176 . T A 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=-4.161;DP=51;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=16.76;ReadPosRankSum=3.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:883,0,1514 -chr20 51430387 . T C 5906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-0.820;DP=281;FS=5.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=21.02;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,171:269:99:5935,0,3398 -chr20 51435209 . T C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=-0.983;DP=196;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,35:196:99:576,0,6280 -chr20 51443221 . G A 6711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.373;DP=390;FS=0.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.046;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,194:390:99:6740,0,6875 -chr20 51446919 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.431;DP=389;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,52:388:99:276,0,12903 -chr20 51452974 . A C 1782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=-2.470;DP=382;FS=10.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=4.67;ReadPosRankSum=3.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:294,88:382:99:1811,0,11055 -chr20 51466905 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=-0.259;DP=75;FS=6.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.441;QD=2.88;ReadPosRankSum=-3.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:244,0,3870 -chr20 51467192 . C T 2596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=-0.169;DP=164;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=15.83;ReadPosRankSum=3.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,82:162:99:2625,0,2722 -chr20 51484780 . G A 4857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-1.192;DP=267;FS=1.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,151:266:99:4886,0,7017 -chr20 51491721 . T G 3513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.932;DP=207;FS=8.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,114:206:99:3542,0,3017 -chr20 51491793 . T C 2960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-2.170;DP=158;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,93:158:99:2989,0,2074 -chr20 51492253 . AT A 399.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:437,42,0 -chr20 51492644 . T C 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr20 51493956 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=2.541;DP=32;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=7.02;ReadPosRankSum=-3.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:253,0,897 -chr20 51494378 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=1.669;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.070;QD=13.85;ReadPosRankSum=2.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:333,0,448 -chr20 51494802 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=2.218;DP=22;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,780 -chr20 51495136 . G T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=1.837;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=29.29;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:819,0,226 -chr20 51495775 . A AT 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.591;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:240,0,582 -chr20 51496366 . G A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:999,72,0 -chr20 51499263 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=1.892;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=19.55;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:302,0,215 -chr20 51499321 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.268;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:245,0,749 -chr20 51501990 . C CA 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.369;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:21:330,0,21 -chr20 51513172 . C G 3392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-1.624;DP=186;FS=2.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=18.24;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,95:186:99:3421,0,3183 -chr20 51533221 . G A 5250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.216;DP=298;FS=6.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,149:297:99:5279,0,5178 -chr20 51539470 . C T 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=-2.630;DP=338;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.418;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:275,61:336:99:873,0,10235 -chr20 51541762 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=1.820;DP=329;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.144;QD=1.03;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,55:329:99:367,0,21858 -chr20 51611100 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=-0.619;DP=50;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:278,0,1383 -chr20 51707538 . C T 2371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-2.445;DP=135;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=17.57;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,68:135:99:2400,0,2343 -chr20 51711949 . C T 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.469;DP=81;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:1095,0,1633 -chr20 51714341 . C T 1432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.691;DP=90;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:1461,0,1514 -chr20 51727791 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.912;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:358,0,348 -chr20 51728743 . A T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:378,0,462 -chr20 51728756 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.491;DP=24;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:439,0,491 -chr20 51730950 . T C 366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:395,28,0 -chr20 51736015 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.503;DP=53;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:375,0,1427 -chr20 51747430 . T A 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.445;DP=29;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=32.65;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:975,0,808 -chr20 51747496 . A C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.397;DP=72;FS=9.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:428,0,2821 -chr20 51747570 . T A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-0.296;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.141;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:439,0,1117 -chr20 51747916 . GA G 464.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=33.58;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:15:502,0,15 -chr20 51747975 . A G 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.827;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:811,0,1124 -chr20 51748056 . A G 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.116;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=9.26;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:621,0,653 -chr20 51748100 . T C 965.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:69:994,69,0 -chr20 51788308 . T C 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:584,42,0 -chr20 51825455 . A G 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:567,39,0 -chr20 51825498 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr20 51825849 . A C 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=2.332;DP=51;FS=5.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=22.47;ReadPosRankSum=1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:1174,0,355 -chr20 51825966 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.577;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:281,0,1083 -chr20 51827251 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.476;DP=37;FS=7.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:357,0,956 -chr20 51985492 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.634;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,500 -chr20 51985554 . A T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.354;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=34.00;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:454,0,45 -chr20 52033435 . A T 222.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:251,21,0 -chr20 52039688 . A C 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1067,75,0 -chr20 52040286 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:48:286,0,48 -chr20 52041027 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.127;DP=20;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:454,0,247 -chr20 52042796 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.316;DP=53;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:886,0,573 -chr20 52087454 . T C 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-1.004;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=34.93;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,2:14:99:1752,0,249 -chr20 52087695 . A G 1895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1924,138,0 -chr20 52087742 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.267;DP=56;FS=18.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:284,0,1536 -chr20 52087770 . A C 3804.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:3833,268,0 -chr20 52087922 . C CA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.092;DP=45;FS=6.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:329,0,754 -chr20 52092419 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-1.013;DP=28;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:519,0,500 -chr20 52092943 . A T 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr20 52092999 . T G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:345,0,95 -chr20 52093092 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.437;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.113;QD=26.67;ReadPosRankSum=-2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:375,0,317 -chr20 52098048 . A C 1734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.233;DP=62;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,46:62:99:1763,0,384 -chr20 52098419 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.034;DP=93;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.298;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:268,0,2769 -chr20 52132928 . A G 2097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.701;DP=132;FS=5.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.078;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,64:119:99:2126,0,1945 -chr20 52137909 . G A 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.871;DP=80;FS=6.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=17.37;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,40:80:99:1418,0,1452 -chr20 52142676 . T C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=-2.266;DP=133;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,28:133:99:557,0,3943 -chr20 52161037 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=1.024;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:377,0,2276 -chr20 52208612 . A G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.127;DP=45;FS=6.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:589,0,1059 -chr20 52212848 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.641;DP=47;FS=5.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:234,0,1867 -chr20 52569305 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-1.733;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:311,0,52 -chr20 52617536 . T A 3028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.870;DP=195;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=15.53;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,86:195:99:3057,0,3581 -chr20 52617660 . ATGACCTGACACACACACACACGCACGCAGACAAACACAGACAGAGACAGAAAACAGTTGTCTCCCAAAAAACTCAAGAAATGTGTTGATTTAGCTCATTTATAGAAGAACTTTGAACAAGCATTGTTCAAAGAAAATGATTGTTTGAGTAAAAGATGAACGAGTATTAGCTGGAGATCTCTCAATATTCTCACAGATGATGTGTCCCAC A 6996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=5.369;DP=211;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=33.16;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,171:209:99:7034,0,9822 -chr20 52623962 . TCCTGAAAAACACACACATACACACAGGTCAAACACACTGTCCTCCTGCGGTTACTGGTGATTTGAGCTGATCTTA T 6926.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=-0.095;DP=159;FS=6.131;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,147:154:99:6964,619,0 -chr20 52624066 . T C 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.083;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=8.31;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,48:149:99:1266,0,3793 -chr20 52627628 . G A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.748;DP=175;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,50:175:99:1249,0,4615 -chr20 52672736 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-0.843;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:443,0,387 -chr20 52791613 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=-1.001;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:243,0,638 -chr20 52814803 . C T 1455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.146;DP=65;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,43:65:99:1484,0,725 -chr20 52829388 . C T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.024;DP=81;FS=6.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,31:81:99:1071,0,1737 -chr20 52829485 . T C 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.520;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:699,0,702 -chr20 52830359 . A C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=-1.427;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:275,0,418 -chr20 52864138 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.111;DP=73;FS=10.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,11:62:99:269,0,2450 -chr20 52864476 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.317;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:357,0,371 -chr20 52864729 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.244;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,166 -chr20 52866692 . C A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-1.169;DP=23;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=22.73;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:551,0,858 -chr20 52895759 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=-1.110;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,25:122:99:468,0,3695 -chr20 52895820 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.680;DP=134;FS=4.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:821,0,3598 -chr20 52909610 . T C 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr20 52910026 . GGGTGATTTAAGACTTTCATGCATGCATAGTCAGCTGAGGTGGTCAGGTGGTCAGGTGCAGCTTCTCCTGCGTCTCTGCATGTTTGCATGT G 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=19.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:99:275,0,1036 -chr20 52911722 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:91:269,0,91 -chr20 53060755 . C T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.848;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=25.81;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:596,0,145 -chr20 53167144 . T TAC 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.753;DP=24;FS=14.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:335,0,379 -chr20 53181927 . C T 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.489;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:1184,0,346 -chr20 53539032 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.092;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:384,0,389 -chr20 53743398 . T C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=1.320;DP=131;FS=5.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:745,0,3828 -chr20 53743473 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=1.257;DP=140;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:99:229,0,4382 -chr20 53745964 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=1.242;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=2.24;ReadPosRankSum=2.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:257,0,3165 -chr20 53815828 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.015;DP=90;FS=5.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:433,0,2748 -chr20 53817535 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.572;DP=67;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:442,0,3641 -chr20 53817541 . A G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=1.699;DP=59;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=7.01;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:442,0,3641 -chr20 53817631 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-1.184;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:497,0,2080 -chr20 53842012 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=1.258;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=5.97;ReadPosRankSum=2.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:613,0,2752 -chr20 53949575 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.256;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:89:369,0,89 -chr20 53952221 . A AT 224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 -chr20 54225106 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:239,0,62 -chr20 54257483 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=2.051;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.45;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:231,0,773 -chr20 54347562 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=5.085;DP=95;FS=52.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:308,0,3079 -chr20 54347611 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.282;DP=156;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.386;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,39:156:99:808,0,4645 -chr20 54390673 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.772;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:291,0,245 -chr20 54499390 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.811;DP=34;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.90;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:365,0,788 -chr20 54503700 . A G 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.350;DP=36;FS=5.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:443,0,1202 -chr20 54588470 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.708;DP=118;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:248,0,3453 -chr20 54596081 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.376;DP=468;FS=2.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=0.52;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:406,61:467:99:270,0,15965 -chr20 54632640 . C G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=-0.793;DP=294;FS=7.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,42:292:99:254,0,9306 -chr20 54775527 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.489;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:346,0,2533 -chr20 54803646 . A G 1898.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.981;DP=52;FS=2.533;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=32.95;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,49:52:71:1927,71,0 -chr20 55201977 . A T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.312;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:256,0,690 -chr20 55273772 . T C 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr20 55274810 . A G 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr20 55274852 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr20 55274895 . C T 325.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:354,30,0 -chr20 55275340 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:416,0,46 -chr20 55275355 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:345,0,51 -chr20 55401537 . A G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:395,27,0 -chr20 55401546 . T G 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr20 55449301 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=1.161;DP=44;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:324,0,1008 -chr20 55552182 . C A 208.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:237,0,18 -chr20 55754697 . A C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr20 55786635 . T C 5610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.054;DP=393;FS=2.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,175:331:99:5639,0,5445 -chr21 6316 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.752;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:283,0,2619 -chr21 24937 . CG C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.190;DP=28;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:357,0,336 -chr21 25587 . T A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-0.111;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:374,0,500 -chr21 25981 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:320,0,440 -chr21 30899 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.467;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:295,0,429 -chr21 164858 . TCTGCAGAAACACACAGATGTGAAGCGCAGAAGCAGAACCACATGCTCATTCCCTGAACAGCAGCAGTGTGTGACCTCACGTCAGAAGTAAGAGTGGGTCATACGTCAGCATAATCTTAC T 2149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=2.762;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=24.43;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,72:81:99:2833,0,4946 -chr21 188632 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-2.404;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:419,0,317 -chr21 189714 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:66:238,0,66 -chr21 189724 . T C 204.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:21:233,0,21 -chr21 195789 . T G 2507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.104;DP=187;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,72:172:99:2536,0,3416 -chr21 197418 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.206;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=12.36;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:263,0,398 -chr21 208307 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.034;DP=96;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:476,0,2764 -chr21 225759 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.393;DP=37;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:273,0,1060 -chr21 229133 . C G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.993;DP=52;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:303,0,1436 -chr21 235812 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=1.198;DP=100;FS=12.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:583,0,2715 -chr21 249227 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=1.114;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,16:107:99:269,0,6990 -chr21 254135 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:313,0,100 -chr21 258831 . C T 1980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.842;DP=225;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,75:225:99:2009,0,5476 -chr21 287427 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-2.964;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,25:134:99:441,0,4643 -chr21 287518 . C A 2390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-1.923;DP=421;FS=1.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.771;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,109:421:99:2419,0,11758 -chr21 290061 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.122;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=13.28;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:254,0,385 -chr21 321146 . G C 218.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:247,0,23 -chr21 367389 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=1.420;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.115;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:298,0,1929 -chr21 421080 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.508;DP=67;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:422,0,1712 -chr21 561861 . TAG T 753.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,0:27:99:791,0,901 -chr21 564080 . AG A 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-2.410;DP=69;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=3.75;ReadPosRankSum=2.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:296,0,4211 -chr21 566087 . GT G 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=-1.774;DP=60;FS=5.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:684,0,807 -chr21 567660 . C T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.677;DP=105;FS=9.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:958,0,2992 -chr21 568617 . TA T 795.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=-1.086;DP=84;FS=3.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:833,0,1108 -chr21 774501 . T G 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-0.755;DP=42;FS=6.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:736,0,708 -chr21 852725 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.485;DP=21;FS=10.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=10.27;ReadPosRankSum=2.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:244,0,486 -chr21 868309 . GCA G 1354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-0.590;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,49:144:99:1392,0,2735 -chr21 1395188 . CA C 202.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr21 1906643 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,378 -chr21 1941298 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=1.719;DP=26;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=8.18;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:241,0,712 -chr21 1941309 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.708;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:447,0,561 -chr21 1941310 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.589;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:450,0,353 -chr21 1941394 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.689;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,171 -chr21 1995842 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=2.435;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.61;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:342,0,636 -chr21 1995851 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=2.742;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=18.46;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:342,0,636 -chr21 2010631 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=-0.916;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:288,0,595 -chr21 2012161 . T C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-1.098;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=17.92;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:512,0,414 -chr21 2014825 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=19.82;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:385,0,274 -chr21 2015377 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=1.191;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:250,0,207 -chr21 2017482 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=1.588;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:230,0,1444 -chr21 2050828 . T C 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr21 2254557 . A C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr21 2359859 . C CT 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.726;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:246,0,1837 -chr21 2360303 . C CA 773.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.180;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,34:96:99:811,0,1533 -chr21 2562609 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:66:230,0,66 -chr21 2593062 . C CA 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.099;DP=73;FS=4.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:294,0,1224 -chr21 2618188 . T G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:300,0,54 -chr21 2629956 . G C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.116;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:395,0,393 -chr21 2631079 . AAC A 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.967;DP=14;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:83:400,0,83 -chr21 2652290 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.354;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:452,0,829 -chr21 2653583 . T C 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr21 2654595 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:311,0,58 -chr21 2663321 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=31.89;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:48:379,0,48 -chr21 2677537 . A T 204.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:5:232,0,5 -chr21 2678704 . C G 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr21 2685020 . A C 564.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:593,42,0 -chr21 2696098 . T C 1501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1530,102,0 -chr21 2698852 . A T 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=-1.804;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=22.56;ReadPosRankSum=2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:479,0,131 -chr21 2699065 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.296;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=26.65;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:428,0,48 -chr21 2700083 . A G 2267.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.675;DP=67;FS=2.122;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=33.85;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,63:67:99:2296,151,0 -chr21 2700176 . C T 2888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.255;DP=73;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.370;QD=31.63;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,69:73:99:2917,165,0 -chr21 2700406 . C A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.779;DP=30;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=33.66;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1038,0,204 -chr21 2700407 . A T 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.890;DP=30;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.66;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1038,0,234 -chr21 2711634 . C G 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr21 2718151 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=29.94;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:69:687,0,69 -chr21 2761130 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.977;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:250,0,169 -chr21 3311806 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,425 -chr21 3311928 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.873;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:573,0,118 -chr21 3313743 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.279;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:294,0,404 -chr21 3313986 . A T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.988;DP=36;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:381,0,808 -chr21 3321177 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.988;DP=20;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:307,0,357 -chr21 3867584 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.422;DP=63;FS=5.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:839,0,1363 -chr21 3964689 . TTATAAGGGTTTAGAATTTAGCATCATGTTC T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=3.010;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=13.03;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:402,0,3062 -chr21 3966414 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=1.327;DP=30;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:570,0,1100 -chr21 3966420 . G T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:570,0,1090 -chr21 4564371 . C CA 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=-1.420;DP=49;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:330,0,619 -chr21 4602206 . C A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr21 4843217 . A ATTC 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-0.884;DP=158;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,29:148:99:510,0,4713 -chr21 4874200 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.852;DP=50;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:260,0,1949 -chr21 4937639 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.188;DP=74;FS=6.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:296,0,2546 -chr21 5025121 . C CT 807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=-1.213;DP=75;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:845,0,819 -chr21 5025875 . A C 2576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.803;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2605,175,0 -chr21 5025876 . G A 2576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=1.215;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=32.25;ReadPosRankSum=-1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2605,175,0 -chr21 5026005 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=2.323;DP=33;FS=15.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:649,0,1306 -chr21 5026014 . A G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=1.737;DP=32;FS=12.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=19.40;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:649,0,1306 -chr21 5026257 . C G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=30.58;ReadPosRankSum=2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:96:487,0,96 -chr21 5034394 . G C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-1.643;DP=114;FS=5.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:765,0,2930 -chr21 5069711 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=-1.189;DP=183;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,35:182:99:553,0,5897 -chr21 5080632 . G A 2154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.890;DP=166;FS=2.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,65:166:99:2183,0,3385 -chr21 5082677 . G C 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=-1.049;DP=148;FS=11.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,32:147:99:558,0,6008 -chr21 5082692 . T C 3989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=-2.485;DP=129;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=30.93;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,95:127:99:4018,0,724 -chr21 5082743 . C T 2744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-1.524;DP=168;FS=5.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,79:167:99:2773,0,3180 -chr21 5082764 . C T 1513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-1.102;DP=177;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,60:177:99:1542,0,5972 -chr21 5082920 . C T 1480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=-0.059;DP=228;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,67:227:99:1509,0,11694 -chr21 5082926 . A G 6847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.464;DP=215;FS=4.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=31.85;ReadPosRankSum=1.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,162:215:99:6876,0,1057 -chr21 5082929 . A G 1789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-3.677;DP=221;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,71:220:99:1818,0,10323 -chr21 5083004 . T C 5203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=-2.101;DP=200;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.262;QD=26.02;ReadPosRankSum=3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,149:198:99:5232,0,695 -chr21 5083133 . T C 6065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=1.357;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,163:208:99:6094,0,828 -chr21 5083230 . G C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=-2.103;DP=161;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=7.40;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,49:161:99:1220,0,4187 -chr21 5083553 . C T 3354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-0.087;DP=252;FS=8.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,99:252:99:3383,0,5149 -chr21 5083658 . A G 3882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=-0.398;DP=242;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,113:239:99:3911,0,2920 -chr21 5083775 . A G 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=4.237;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=15.95;ReadPosRankSum=-3.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1161,0,1193 -chr21 5083855 . A AT 380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.100;DP=25;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:418,0,119 -chr21 5112739 . C T 256.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.53;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:285,0,20 -chr21 5205486 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=1.091;DP=67;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:319,0,2035 -chr21 5207864 . T G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-1.646;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:232,0,2230 -chr21 5208419 . C CA 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.060;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:355,0,187 -chr21 5208947 . A C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.936;DP=52;FS=4.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.78;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:485,0,1325 -chr21 5210852 . T C 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.245;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:476,0,958 -chr21 5240799 . AT A 644.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-1.593;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.153;QD=13.16;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:682,0,615 -chr21 5241942 . GT G 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.772;DP=37;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:310,0,571 -chr21 5242115 . T C 1290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-0.710;DP=34;FS=3.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=29.02;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:1319,0,124 -chr21 5242331 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.613;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:230,0,761 -chr21 5242428 . T C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.953;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:330,0,1785 -chr21 5242814 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=23.83;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:338,0,629 -chr21 5242891 . T C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.778;DP=36;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:576,0,796 -chr21 5243560 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=34.65;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:548,0,130 -chr21 5257254 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.42;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,133 -chr21 5278605 . C G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-0.978;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:257,0,424 -chr21 5444917 . A G 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.875;DP=59;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=10.22;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:631,0,1315 -chr21 5480229 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.347;DP=16;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=30.92;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:46:523,0,46 -chr21 5480338 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.334;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=34.93;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:41:959,0,41 -chr21 5482961 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.750;DP=74;FS=8.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:243,0,1168 -chr21 5482971 . G T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.256;DP=76;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=2.73;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,2502 -chr21 5484623 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr21 5709351 . T TC 749.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.561;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:787,57,0 -chr21 5733969 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=4.468;DP=391;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.358;QD=0.82;ReadPosRankSum=4.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,51:373:99:349,0,12297 -chr21 5801926 . G A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.720;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:578,0,698 -chr21 5802167 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.094;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:230,0,2546 -chr21 5802588 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.259;DP=29;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:246,0,853 -chr21 5818617 . CTG C 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=-0.689;DP=29;FS=4.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:272,0,710 -chr21 5832985 . C T 3641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-3.665;DP=279;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,108:277:99:3670,0,8336 -chr21 5837603 . C CA 813.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.031;DP=260;FS=8.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,77:244:99:851,0,12993 -chr21 5837623 . C CA 412.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-1.669;DP=247;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=1.67;ReadPosRankSum=1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,63:240:99:450,0,10921 -chr21 5873180 . A T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=0.847;DP=94;FS=4.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:689,0,2564 -chr21 5873230 . TCTGTAACACAAAAACCTCTTTGTTTATCCAAACTATAATCCCCGGCACGTTTGCATCTCCCTGTCCAGCTGTGCCTTTCTAC T 4523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.126;DP=105;FS=4.911;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,101:105:99:4561,382,0 -chr21 5883698 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-1.790;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:243,0,1031 -chr21 5883793 . T TA 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-1.172;DP=46;FS=4.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:410,0,2052 -chr21 5908250 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.897;ClippingRankSum=-0.942;DP=43;FS=10.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:539,0,1009 -chr21 5908434 . G C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-1.323;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:437,0,1338 -chr21 5916800 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,139 -chr21 5932773 . T A 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.544;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:322,0,1309 -chr21 5934394 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=-1.943;DP=51;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:280,0,1497 -chr21 6054443 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=32.98;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:490,0,42 -chr21 6070635 . G A 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=-1.200;DP=158;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,36:158:99:823,0,4856 -chr21 6164045 . A G 1172.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1201,87,0 -chr21 6285715 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=18.30;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:321,0,256 -chr21 6294329 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.022;DP=30;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:325,0,723 -chr21 6343142 . T C 203.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:232,0,21 -chr21 6346398 . A AAC 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.609;DP=19;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=20.20;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:421,0,164 -chr21 6650538 . C T 2524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-3.655;DP=358;FS=0.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,89:356:99:2553,0,20922 -chr21 6676272 . T C 5162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.855;DP=349;FS=6.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,150:349:99:5191,0,6457 -chr21 6679226 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=4.027;DP=303;FS=0.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=3.38;ReadPosRankSum=-2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,63:303:99:1051,0,8989 -chr21 6679700 . C T 4206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-2.636;DP=281;FS=0.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=14.97;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,120:281:99:4235,0,5446 -chr21 6680645 . T TA 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=1.152;DP=91;FS=23.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:274,0,1093 -chr21 6680665 . A AG 983.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=6.444;DP=124;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=2.108;QD=7.93;ReadPosRankSum=-4.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,40:123:99:1021,0,3028 -chr21 6680787 . G T 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.910;DP=172;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,53:158:99:1067,0,4696 -chr21 6681966 . A T 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.384;DP=207;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,66:206:99:1821,0,5450 -chr21 6773994 . G GA 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.206;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:94:349,0,94 -chr21 7304057 . G T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=-0.981;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=8.37;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,36:112:99:966,0,2887 -chr21 7304188 . C T 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.331;DP=135;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,47:134:99:1213,0,4406 -chr21 7304274 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=-0.699;DP=151;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=2.57;ReadPosRankSum=-3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,30:138:99:417,0,5013 -chr21 7304580 . A C 870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.710;DP=71;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,26:71:99:899,0,1636 -chr21 7304924 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.251;DP=35;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,927 -chr21 7304941 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.718;DP=33;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:265,0,892 -chr21 7306652 . A T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-2.188;DP=79;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.829;QD=2.79;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:258,0,1985 -chr21 7309011 . TA T 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=-1.393;DP=76;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:273,0,1228 -chr21 7347930 . C A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,457 -chr21 7526018 . C A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.013;DP=95;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:645,0,2880 -chr21 7563190 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-0.861;DP=77;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:415,0,2224 -chr21 7846107 . C T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=-0.332;DP=443;FS=14.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.06;ReadPosRankSum=4.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:347,96:443:99:1829,0,13242 -chr21 7847166 . C T 7212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=4.085;DP=615;FS=23.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.73;ReadPosRankSum=6.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:400,215:615:99:7241,0,13369 -chr21 7968764 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=1.061;DP=48;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:583,0,976 -chr21 7969533 . A T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.273;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:484,0,1721 -chr21 7969536 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.836;DP=52;FS=2.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:254,0,2165 -chr21 7969649 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.788;DP=39;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:243,0,1083 -chr21 7970456 . C CT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-2.985;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:414,0,394 -chr21 7970706 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.606;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:342,0,1308 -chr21 7970754 . T TA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-0.018;DP=36;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:248,0,929 -chr21 7971740 . GT G 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.375;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:344,0,373 -chr21 7977971 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-0.770;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:301,0,759 -chr21 7978080 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-2.670;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:370,0,573 -chr21 8136229 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,345 -chr21 8157822 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-0.387;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:364,0,370 -chr21 8161125 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:276,0,397 -chr21 8308831 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=-0.935;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:280,0,614 -chr21 8581312 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=1.111;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,386 -chr21 8770649 . A C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.921;DP=63;FS=1.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:363,0,1634 -chr21 8783412 . C T 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.465;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:809,0,1237 -chr21 8815837 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-0.643;DP=68;FS=4.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:297,0,1921 -chr21 8862396 . A G 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.011;DP=67;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=19.06;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:1305,0,984 -chr21 8905170 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.683;DP=89;FS=9.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:683,0,3055 -chr21 9110320 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.992;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:350,0,1195 -chr21 9110643 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-0.842;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:522,0,1212 -chr21 9110681 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;ClippingRankSum=1.917;DP=35;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=15.65;ReadPosRankSum=-1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:576,0,735 -chr21 9117217 . G A 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.998;DP=57;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.732;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,29:57:99:1054,0,909 -chr21 9255275 . C T 2512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.905;DP=136;FS=0.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,77:136:99:2541,0,2150 -chr21 9266049 . T G 2509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-3.367;DP=148;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.560;QD=16.96;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,76:147:99:2538,0,2636 -chr21 9301447 . T C 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=-1.217;DP=45;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:752,0,845 -chr21 9301486 . C A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.032;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:837,0,891 -chr21 9308756 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=1.588;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:422,0,655 -chr21 9351278 . G C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.063;DP=53;FS=4.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:772,0,1095 -chr21 9351305 . G C 1029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.385;DP=66;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,31:66:99:1058,0,1085 -chr21 9354682 . G C 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.275;DP=31;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:799,0,308 -chr21 9356561 . G GT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.966;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.903;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:308,0,232 -chr21 9356596 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=13.04;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:263,0,372 -chr21 9358688 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-1.317;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:268,0,529 -chr21 9358826 . G T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.74;ReadPosRankSum=1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:296,0,279 -chr21 9364966 . C T 1280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=2.319;DP=83;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,35:83:99:1309,0,3293 -chr21 9401967 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:307,0,51 -chr21 9404448 . A T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=2.939;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=11.87;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:408,0,721 -chr21 9404686 . A C 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-0.281;DP=59;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.346;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1100,0,951 -chr21 9406285 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=1.109;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:572,0,791 -chr21 9415659 . T A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.399;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:508,0,647 -chr21 9426017 . GA G 369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.087;DP=30;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:407,0,123 -chr21 9426885 . C A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.785;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:853,0,687 -chr21 9427070 . GA G 600.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.892;DP=33;FS=5.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:638,0,479 -chr21 9918545 . A G 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=-0.389;DP=56;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1068,0,940 -chr21 9926152 . A G 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-1.104;DP=48;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=22.95;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1130,0,537 -chr21 9990240 . G GA 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=-4.595;DP=213;FS=10.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=1.31;ReadPosRankSum=4.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,39:179:99:316,0,3314 -chr21 10001598 . G GT 1067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=-1.535;DP=556;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.92;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:403,97:500:99:1105,0,12829 -chr21 10305353 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.102;DP=42;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:579,0,831 -chr21 10305614 . C CT 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-1.065;DP=84;FS=3.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.677;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:671,0,1047 -chr21 10336297 . T TC 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-1.723;DP=72;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:531,0,1078 -chr21 10361531 . A G 3075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.348;DP=208;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=14.79;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,91:208:99:3104,0,3788 -chr21 10379091 . C CT 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-3.112;DP=208;FS=3.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,50:197:99:541,0,3783 -chr21 10379148 . C CT 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=1.401;DP=214;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,41:202:99:378,0,4554 -chr21 10387787 . C A 7553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-2.952;DP=556;FS=10.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:335,221:556:99:7582,0,11238 -chr21 11249106 . CT C,AT 372.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.444;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,17,6:27:99:521,110,307,374,0,1380 -chr21 11249224 . C CA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-2.210;DP=34;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:282,0,740 -chr21 11290945 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=3.020;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=14.13;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:325,0,868 -chr21 11290950 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=3.169;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=15.62;ReadPosRankSum=-2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:325,0,873 -chr21 11296969 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.445;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.38;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:422,0,1246 -chr21 11339255 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=-0.106;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:343,0,352 -chr21 11344956 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.828;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:331,0,590 -chr21 11348002 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.139;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:234,0,703 -chr21 11367696 . C T 4324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-1.099;DP=283;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,123:281:99:4353,0,5148 -chr21 11392198 . G A 6973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.898;DP=399;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=17.48;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,200:396:99:7002,0,6960 -chr21 11429425 . C CT 1946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=-0.120;DP=269;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,108:225:99:2161,0,2370 -chr21 11815150 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=-0.154;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:385,0,381 -chr21 11827452 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=1.493;DP=69;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:520,0,1775 -chr21 11916700 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-2.859;DP=25;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=12.19;ReadPosRankSum=2.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,1136 -chr21 11963626 . G GT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.510;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:326,0,335 -chr21 12147687 . CCCTGTAGAGAATTCCCACTGAGCCAATTGACTTCATGTGTTAAAAAAAATACACAATTCGCAAACATCATCATACAGTA C 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=1.756;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:656,0,1340 -chr21 12468027 . CCCTGACATAAAAATAAAAAGAGTTACAAAATCAACATATTTTGACTATGCTACTGCCCATTTTTGCACACA C 502.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.425;DP=17;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=29.57;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:540,0,375 -chr21 12901024 . GA G 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.709;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:351,0,170 -chr21 13048124 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.625;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:245,0,935 -chr21 13483853 . G GA 422.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.856;DP=34;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=12.43;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:578,0,123 -chr21 13484113 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-1.032;DP=32;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:379,0,740 -chr21 13839165 . C T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.952;DP=52;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:613,0,1173 -chr21 13843447 . G A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-0.338;DP=140;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,32:139:99:860,0,8319 -chr21 13914371 . AT A 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-1.354;DP=233;FS=14.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,42:229:99:326,0,5478 -chr21 13914684 . A AT 1827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.040;DP=194;FS=15.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.065;QD=9.42;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,68:191:99:1865,0,3601 -chr21 13944570 . T C 2259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=2.646;DP=171;FS=4.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=13.22;ReadPosRankSum=3.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,62:171:99:2288,0,7483 -chr21 13944579 . G A 2259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=2.978;DP=160;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,56:160:99:2288,0,7438 -chr21 13959738 . T A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=4.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:670,0,874 -chr21 13996079 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-0.354;DP=139;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,25:138:99:322,0,4261 -chr21 13996195 . C T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=2.777;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,28:127:99:534,0,3511 -chr21 13996218 . C A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=1.959;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:473,0,3753 -chr21 14011914 . C T 2234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.617;DP=128;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,62:128:99:2263,0,2104 -chr21 14021124 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.596;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:627,0,4296 -chr21 14022350 . C G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.689;DP=39;FS=10.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:327,0,909 -chr21 14045208 . T A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.613;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=7.93;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:282,0,820 -chr21 14045288 . A AT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=-0.810;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:266,0,267 -chr21 14131841 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=-2.784;DP=57;FS=2.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=21.08;ReadPosRankSum=2.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1230,0,726 -chr21 14374815 . C CT 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=-0.601;DP=58;FS=12.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:255,0,826 -chr21 14554089 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:426,0,189 -chr21 14554148 . A G 549.56 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.085;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=34.35;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:7:577,7,0 -chr21 14554206 . T C 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr21 15527853 . GT G 657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-0.751;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,26:34:99:695,0,114 -chr21 15538916 . AAGGTAATGAAAGATTCATACTCTAATAGGTAATGCTTCATACATATCTAACCTTTAATAATATGAATGCTTTAC A 11705.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.336;DP=381;FS=1.194;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=30.72;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,294:306:99:11743,849,0 -chr21 15543946 . TA T 2775.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.564;DP=139;FS=10.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,103:136:99:2813,0,498 -chr21 15617684 . G GT 870.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-0.304;DP=96;FS=4.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.07;ReadPosRankSum=2.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,38:89:99:908,0,1216 -chr21 15618025 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=5.072;DP=141;FS=52.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=5.79;ReadPosRankSum=-5.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,38:141:99:844,0,3919 -chr21 15619210 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=2.415;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=25.78;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:415,0,384 -chr21 15619218 . TA T 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=1.437;DP=14;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=16.48;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:99:268,0,1822 -chr21 15770754 . A AT 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-1.844;DP=39;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:707,0,200 -chr21 15788824 . G A 224.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:253,0,20 -chr21 15790348 . G A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr21 15790576 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.295;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:313,0,197 -chr21 15818729 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.950;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:551,0,109 -chr21 15827530 . CGGTGAGACATTACTGACTCATCCCACTCATTGCAGTACATAAACCACAGTCATCAGCCTTCATCCCTCATATGGTCTCTTTTCTCCAAA C 410.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:46:448,46,0 -chr21 15839103 . T A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-1.480;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=34.05;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:573,0,203 -chr21 15847344 . AGTATGATCTGAATTGAAGGTCTTTGTACCGTACAGACAACTTGACTCTTGGAAACATAAAATACCTTGTTGGTACTGCTAATGTATGAATTGAGTCGGTCTTGTTTGTCTTTTGCTCAG A 718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-0.410;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.199;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:756,0,2039 -chr21 15994308 . TA T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-1.868;DP=15;FS=12.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=17.52;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:51:300,0,51 -chr21 15994569 . G GA 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.092;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.877;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:245,0,299 -chr21 16080991 . C CA 817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.449;DP=66;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:891,0,265 -chr21 16101864 . TCCTTTAAAAACAGCCAGAGCAAACGAGATTATTTTGGAGATTTGGACCTTTTTAGATCTCTTTCACAGCCTTTACACATTATACACA T 8199.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=2.501;DP=196;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=33.31;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,189:193:99:8237,654,0 -chr21 16463612 . T A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-0.788;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:568,0,551 -chr21 16463822 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-1.673;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:267,0,745 -chr21 16501636 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.289;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=20.44;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:294,0,136 -chr21 16501673 . A G 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-0.206;DP=24;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=20.78;ReadPosRankSum=-1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:527,0,160 -chr21 16503217 . T G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.146;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:364,0,226 -chr21 16890213 . TGGTAAAATTGAAATCAGCTGAATGAAGAATTAATTATAACATCCTATATTCATGCATAATAAATAATATTATTTTCCTCCTAATTATTTAAATGCA T 1495.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=1.717;DP=249;FS=3.768;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,230:231:99:1533,539,0 -chr21 17460885 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,267 -chr21 17739828 . A G 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=-1.197;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:486,0,721 -chr21 17740771 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=2.127;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.644;QD=18.03;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:551,0,444 -chr21 17881990 . C T 1626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.010;DP=358;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,80:358:99:1655,0,10689 -chr21 17886762 . T C 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=1.376;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,34:115:99:860,0,2886 -chr21 18116726 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-0.226;DP=23;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:269,0,751 -chr21 18117751 . T C 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.146;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,26:109:99:579,0,3160 -chr21 18129709 . C T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=-0.248;DP=103;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:624,0,2742 -chr21 18139900 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-0.745;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:315,0,1885 -chr21 18144184 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-1.268;DP=106;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.443;QD=3.02;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,21:106:99:348,0,4008 -chr21 18144397 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=-0.767;DP=221;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,46:219:99:814,0,6501 -chr21 18163170 . AGTAAGTACTTTTAAAGGTTTGAGTGACGAAACATTGAAATAAGTAAATGACATTCTGTTTTATTGCAG A 890.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.849;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:928,0,464 -chr21 18163267 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-0.198;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:239,0,1698 -chr21 18435427 . C T 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-0.270;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,35:68:99:1134,0,1166 -chr21 18592169 . G GA 1886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-1.232;DP=316;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,98:308:99:1924,0,16094 -chr21 18635231 . C G 2225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.340;DP=384;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,101:369:99:2254,0,9623 -chr21 18662123 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-1.987;DP=71;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=3.25;ReadPosRankSum=2.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:259,0,2149 -chr21 18662239 . C A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-2.180;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,19:77:99:452,0,2253 -chr21 18662694 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-1.821;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,20:79:99:461,0,2115 -chr21 18663130 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=1.101;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:257,0,1897 -chr21 18739342 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.691;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1577 -chr21 18746075 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=2.550;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=5.55;ReadPosRankSum=-2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:483,0,2269 -chr21 18892622 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.972;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:331,0,2002 -chr21 18929588 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-1.131;DP=93;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:565,0,2595 -chr21 18934399 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.403;DP=73;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:594,0,1912 -chr21 18936706 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=-0.344;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.69;ReadPosRankSum=-2.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,719 -chr21 18937088 . C A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.801;DP=43;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:384,0,1164 -chr21 18938122 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-2.492;DP=53;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:370,0,1516 -chr21 18938209 . T TA 733.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.038;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:96:808,0,96 -chr21 19144046 . TCTATCAAGTGAAACGTACAGAACAAAAAGACAGGTGTGAAATCTCATAAGACTGAATTTACGGTGGGGATGAGACGTGCTGGATTAAGAAC T 6489.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=2.929;DP=152;FS=9.430;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=37.68;ReadPosRankSum=-2.966 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,146:152:99:6527,526,0 -chr21 19145754 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=2.177;DP=112;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,20:112:99:303,0,7478 -chr21 19145760 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=2.570;DP=114;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,19:114:99:313,0,7478 -chr21 19153504 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.548;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:301,0,1619 -chr21 19153505 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.548;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:301,0,1619 -chr21 19154237 . T A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:357,0,406 -chr21 19167990 . G A 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-2.827;DP=41;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1135,0,823 -chr21 19217113 . C G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.709;DP=34;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=12.02;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:437,0,728 -chr21 19460940 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.915;DP=85;FS=4.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:558,0,2376 -chr21 19461075 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=1.391;DP=89;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:396,0,2699 -chr21 19461105 . A G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=1.502;DP=91;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:524,0,2643 -chr21 19461603 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.917;DP=105;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:405,0,3438 -chr21 19462349 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.265;DP=37;FS=12.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:231,0,2289 -chr21 19462361 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.374;DP=33;FS=6.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:236,0,1076 -chr21 19463303 . T A 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.770;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:663,0,1008 -chr21 19463386 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr21 19463938 . G T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-0.282;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,39:172:99:785,0,5008 -chr21 19463994 . T C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.288;DP=118;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:637,0,3637 -chr21 19464565 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.317;DP=75;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:829,0,1714 -chr21 19495048 . G T 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:386,27,0 -chr21 19538163 . TTC T 207.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:245,19,0 -chr21 19538889 . TCTGTTTAAACAGAGCAGGCGGAAATTAAAACCAAATTTTGGGACGAATGAACATACCTCTGCACTTTTAACATGTTATATGCATTTTGTAAGCATTCTCAC T 9982.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=2.650;DP=263;FS=0.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,238:262:99:10020,0,1308 -chr21 19546542 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=1.528;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:237,0,469 -chr21 19549842 . G GT 2132.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=-0.667;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.680;QD=23.44;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:2284,222,0 -chr21 19560048 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.752;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=25.44;ReadPosRankSum=-1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:47:359,0,47 -chr21 19560855 . C T 1620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.297;DP=49;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=33.08;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:49:99:1649,0,486 -chr21 19570998 . TTG T 543.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.436;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.90;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:8:580,8,0 -chr21 19571576 . C G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:442,0,626 -chr21 19571584 . C G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:442,0,626 -chr21 19571676 . G A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.602;DP=88;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,61:84:99:1756,0,634 -chr21 19571938 . T A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=1.697;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:546,0,2135 -chr21 19572061 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.644;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:295,0,1756 -chr21 19572181 . CT C 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=1.268;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:369,0,444 -chr21 19572778 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.900;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:485,0,960 -chr21 19573339 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.370;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:382,0,555 -chr21 19581926 . T A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.058;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:437,0,391 -chr21 19599124 . A T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.065;DP=133;FS=0.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,26:133:99:473,0,4168 -chr21 19599940 . T C 3405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.919;DP=119;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=28.62;ReadPosRankSum=2.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,90:119:99:3434,0,642 -chr21 19599994 . G A 913.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.637;DP=130;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=7.03;ReadPosRankSum=2.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,38:130:99:942,0,3358 -chr21 19600030 . A T 3136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=2.061;DP=137;FS=1.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,90:135:99:3165,0,1487 -chr21 19604337 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.053;DP=110;FS=0.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:548,0,3108 -chr21 19605400 . A C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr21 19613448 . T C 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.602;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=33.55;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:99:934,0,552 -chr21 19613634 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:275,0,1157 -chr21 19648593 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-0.650;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=29.32;ReadPosRankSum=1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:78:468,0,78 -chr21 19660139 . CCCTGCAACAATACATGTACTTACATCACAACATTAAGCTTTACACATCAGATAAATGCTCAATAATTGTTA C 576.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.700;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:614,0,1539 -chr21 19660222 . A T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=-1.964;DP=32;FS=5.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=16.24;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:548,0,577 -chr21 19660264 . A T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.014;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=6.07;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:277,0,1122 -chr21 19660366 . C A 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=4.948;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=22.07;ReadPosRankSum=-4.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:867,0,499 -chr21 19719617 . C G 298.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:327,29,0 -chr21 19723448 . AGTATGAGTTTCATGCTTGATTTTGTCTTATCATTCAGTGTGTTTACACTTGCTTAGACTGACATGTAAGTGTTTCTCTAG A 1488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.866;DP=32;FS=3.912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:99:1526,171,0 -chr21 19724186 . C G 872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:901,66,0 -chr21 19724221 . C T 3030.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3059,217,0 -chr21 19726833 . C A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.387;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:649,0,366 -chr21 19743495 . T A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.191;DP=58;FS=6.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.498;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:366,0,3877 -chr21 19743504 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=-0.566;DP=70;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=4.83;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:366,0,3877 -chr21 19743611 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.503;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,24:85:99:585,0,2306 -chr21 19743898 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.151;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:296,0,1445 -chr21 19747591 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.376;DP=98;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,24:98:99:574,0,5725 -chr21 19747600 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.737;DP=93;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:574,0,5725 -chr21 19750670 . T G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.943;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:785,0,1567 -chr21 19751392 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.522;DP=89;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:700,0,2379 -chr21 19755095 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-0.187;DP=116;FS=4.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:450,0,3562 -chr21 19757372 . A T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=3.657;DP=74;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:334,0,2394 -chr21 19841574 . C CA 1325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-6.197;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=11.14;ReadPosRankSum=6.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,73:100:99:1492,0,1018 -chr21 19841585 . C A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.380;DP=96;FS=5.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=4.41;ReadPosRankSum=-2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,4:95:99:452,0,3545 -chr21 19853662 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,370 -chr21 19855646 . CCCTGAAGATGCAACAAATAAGTCATTCAAAGTGGAAATGCCACTTCAGTTTAGCAAAACTGGAGTTTAAGTATTACATCAATCTTTTTA C 650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.839;DP=45;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=14.46;ReadPosRankSum=-4.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:688,0,2253 -chr21 19855972 . G C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-0.267;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:317,0,882 -chr21 20097709 . G C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.111;DP=35;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:474,0,632 -chr21 20104927 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.485;DP=29;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:264,0,784 -chr21 20125510 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=1.374;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,19:62:99:474,0,1667 -chr21 20126091 . TA T 555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.700;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:70:593,0,70 -chr21 20126508 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.679;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:556,0,1912 -chr21 20175126 . GT G 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=2.278;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=25.76;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1248,123,0 -chr21 20211127 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-3.102;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:607,0,2683 -chr21 20213118 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.337;DP=29;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:338,0,530 -chr21 20213247 . A AT 578.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-2.780;DP=26;FS=5.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=22.26;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:27:616,0,27 -chr21 20414611 . A G 2825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=1.244;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,84:130:99:2854,0,1589 -chr21 20520653 . A T 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 -chr21 21025348 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.706;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:309,0,285 -chr21 21399778 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-1.312;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:327,0,530 -chr21 21517210 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=1.694;DP=34;FS=7.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:97:1052,0,97 -chr21 21529050 . T C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.163;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.36;ReadPosRankSum=-1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:370,0,199 -chr21 21529081 . G C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.771;QD=25.29;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:610,0,186 -chr21 21530155 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.758;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:402,0,386 -chr21 21969193 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr21 21969239 . C T 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:229,0,25 -chr21 22000078 . TGTAAGTACTGCCTCACTTATAAAAGTTGCAGAGTGTTTTGTATTGTTGTTTTCTAAAACAGACATTTAAAATTATATTTCAG T 5885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=5.049;DP=172;FS=6.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=34.22;ReadPosRankSum=-6.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,139:167:99:5923,0,5786 -chr21 22134639 . TC T 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.322;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,27:137:99:529,0,10456 -chr21 22135649 . AACCTATCAGAGACACAGAAAACACATGCAGTAGAAGACTTATTTTTCTGCTTTTCAGACGTTATTAGTGATGGCAGTTGATTGTCAGTTTATTTGGTTTGCTC A 9728.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=2.428;DP=224;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,222:224:99:9766,780,0 -chr21 22450710 . G GT 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=-2.352;DP=156;FS=1.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,34:130:99:376,0,2349 -chr21 22451052 . A AT 452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.669;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=4.87;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:490,0,1172 -chr21 22615260 . G GT 1152.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.350;DP=121;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1190,0,1386 -chr21 22993095 . G A 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr21 22993883 . A G 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr21 23692072 . C CA 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-2.815;DP=70;FS=7.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:346,0,1134 -chr21 23693193 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-1.365;DP=62;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:337,0,1814 -chr21 24317421 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=-0.872;DP=179;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=2.81;ReadPosRankSum=3.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,33:179:99:532,0,5580 -chr21 24321134 . T G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.458;DP=170;FS=3.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=3.03;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,34:170:99:544,0,7388 -chr21 24324240 . T A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=-0.639;DP=129;FS=3.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,34:129:99:828,0,3684 -chr21 24324462 . A T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.890;DP=192;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,46:192:99:973,0,6563 -chr21 24337545 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.505;DP=27;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=12.51;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:366,0,514 -chr21 24337575 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-1.549;DP=30;FS=8.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:365,0,664 -chr21 24340013 . CG C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=11.26;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:240,0,355 -chr21 24342562 . TA T 389.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=1.085;DP=17;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=22.94;ReadPosRankSum=-1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:17:9:426,9,0 -chr21 24388781 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-1.210;DP=64;FS=4.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:285,0,1959 -chr21 24395573 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.134;DP=33;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:267,0,1227 -chr21 24405825 . A G 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.388;DP=79;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,22:79:99:557,0,2180 -chr21 24465130 . GT G 748.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-4.458;DP=281;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,56:272:99:786,0,6619 -chr21 24466776 . GAGGTATGAAACCCCCATCACATGTGATGTCCACAGAATTACACATGACTGACTGTCACTGATGTCCTCCGCT G 14093.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.452;DP=431;FS=5.184;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=32.70;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,322:330:99:14131,1037,0 -chr21 24524385 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.778;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.393;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:241,0,1971 -chr21 24553138 . T G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=1.671;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:320,0,368 -chr21 24661310 . AATACCTATGGGGTGATATATTAAATATAAGTAGCTGTTTTTCACAATAAGACTTTAAACAAAATGTCTAAACATTC A 7185.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=1.131;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=28.50;ReadPosRankSum=-2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,175:177:99:7223,569,0 -chr21 24677052 . A AT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-0.451;DP=72;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:329,0,1918 -chr21 24677311 . C CAA 1084.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.404;DP=55;FS=3.099;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,44:46:99:1708,138,0 -chr21 24906306 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.739;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=16.61;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:377,0,355 -chr21 24914061 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.067;DP=46;FS=6.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=13.93;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:669,0,895 -chr21 24916180 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.620;DP=37;FS=5.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:459,0,875 -chr21 24916240 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.297;DP=47;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:332,0,1293 -chr21 24918277 . A C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.063;DP=48;FS=4.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.750;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:666,0,1010 -chr21 24918295 . G A 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=-1.265;DP=51;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.816;QD=19.02;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,29:51:99:998,0,768 -chr21 24920880 . C A 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=1.771;DP=54;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=10.51;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:596,0,1317 -chr21 24920904 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=2.787;DP=50;FS=1.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:292,0,1386 -chr21 24921531 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.995;DP=42;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=15.78;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:691,0,755 -chr21 24921762 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:591,0,754 -chr21 24921951 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-1.335;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:291,0,2136 -chr21 24921960 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=-0.435;DP=34;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:291,0,2136 -chr21 24922769 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=20.66;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:524,0,322 -chr21 24923316 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.614;DP=32;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:458,0,699 -chr21 24941446 . C A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.377;DP=71;FS=3.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:492,0,1958 -chr21 24941497 . C T 3867.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:94:99:3896,282,0 -chr21 24941833 . T C 2286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=2.092;DP=124;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,69:124:99:2315,0,1781 -chr21 24945294 . G C 373.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:402,30,0 -chr21 24945326 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.235;ClippingRankSum=3.982;DP=30;FS=6.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=16.23;ReadPosRankSum=-4.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:515,0,562 -chr21 24945357 . A C 1264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1293,90,0 -chr21 24979226 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.722;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:389,0,397 -chr21 24981634 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.112;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:366,0,720 -chr21 25000504 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=-1.357;DP=53;FS=4.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:280,0,1518 -chr21 25000631 . A G 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=-0.337;DP=63;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=7.11;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:476,0,1677 -chr21 25082322 . C CCA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=-1.263;DP=26;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:246,0,445 -chr21 25082848 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=-0.590;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,861 -chr21 25083492 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:277,0,52 -chr21 25127305 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:263,0,62 -chr21 25127349 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-2.431;DP=21;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=13.04;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,261 -chr21 25134539 . C CT 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=1.000;DP=45;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:493,0,447 -chr21 25134633 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=1.021;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:458,0,863 -chr21 25135085 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-1.068;DP=22;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,456 -chr21 25187633 . C A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.134;DP=44;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=11.27;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:524,0,973 -chr21 25191321 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.772;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:794,0,1374 -chr21 25197061 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.607;DP=33;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:280,0,981 -chr21 25197744 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=27.20;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:273,0,106 -chr21 25415033 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=1.610;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=19.83;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:405,0,296 -chr21 25415657 . A AT 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.361;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQ0=0;MQRankSum=1.994;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:521,0,1119 -chr21 25415660 . A T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.019;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=1.918;QD=15.40;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:521,0,1124 -chr21 25416479 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-0.989;DP=59;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:329,0,1718 -chr21 25416633 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.451;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=3.51;ReadPosRankSum=2.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:260,0,3942 -chr21 25416634 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.615;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=3.57;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:260,0,3942 -chr21 25416696 . G A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=-1.753;DP=73;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:954,0,1345 -chr21 25437633 . G T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-0.777;DP=159;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,30:159:99:522,0,4967 -chr21 25443584 . C T 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.555;DP=133;FS=1.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,37:133:99:925,0,3654 -chr21 25447416 . C A 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=1.629;DP=153;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,50:152:99:1333,0,3775 -chr21 25451172 . C CT,CTT 724.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.089;DP=60;FS=2.730;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=12.07;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,21,19:43:99:1184,474,365,526,0,471 -chr21 25451660 . C CT 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-1.055;DP=65;FS=3.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:253,0,758 -chr21 25462271 . T C 310.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:339,24,0 -chr21 25785425 . C CT 872.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=-3.445;DP=347;FS=0.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,76:323:99:910,0,6700 -chr21 25809438 . C A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=-0.603;DP=202;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,39:201:99:605,0,6223 -chr21 25879783 . A AT 1574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-0.262;DP=132;FS=6.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,69:104:99:1612,0,756 -chr21 25883577 . T TA 3120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.076;DP=177;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,118:146:99:3158,0,229 -chr21 25885967 . ATATTTATTAT A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=3.518;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=9.47;ReadPosRankSum=-2.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:255,0,1471 -chr21 25886880 . GA G 994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-0.156;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=16.86;ReadPosRankSum=-0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1032,0,177 -chr21 26027529 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.042;DP=48;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:544,0,922 -chr21 26057422 . A C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.16;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,354 -chr21 26057423 . G C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=24.38;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:272,0,354 -chr21 26058909 . GCCTGTAAAAGACAAAGTACTATAAACACAGGATGTTCATTTATTTATCTTTGTGCGAATCATAAGCAAGTGATACTGGCTTA G 15322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=1.446;DP=395;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,387:392:99:15360,1125,0 -chr21 26064053 . T A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=3.565;DP=56;FS=4.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=10.82;ReadPosRankSum=-2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:634,0,1366 -chr21 26065188 . T TA 917.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.853;DP=80;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,44:64:99:955,0,369 -chr21 26065516 . T A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.547;DP=40;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:587,0,806 -chr21 26066358 . G A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.184;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,51:256:99:927,0,7774 -chr21 26067276 . A G 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-1.222;DP=219;FS=3.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,43:218:99:744,0,6510 -chr21 26071228 . T TA 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-2.408;DP=208;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.895;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,42:198:99:283,0,13823 -chr21 26072543 . G C 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-1.673;DP=73;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:669,0,1805 -chr21 26119232 . C CT 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-1.075;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=6.77;ReadPosRankSum=-2.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:281,0,471 -chr21 26124393 . GT G 590.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=-2.095;DP=266;FS=5.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=2.22;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,47:237:99:628,0,4073 -chr21 26125155 . A G 1312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.581;DP=304;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,68:302:99:1341,0,8913 -chr21 26125412 . C A 6495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-0.221;DP=344;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,191:342:99:6524,0,4890 -chr21 26126968 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.357;DP=55;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.324;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:336,0,1538 -chr21 26329420 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=-2.390;DP=98;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:322,0,2874 -chr21 26361593 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-1.103;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:254,0,2215 -chr21 26362042 . T TGG 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=-2.402;DP=51;FS=4.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:699,0,868 -chr21 26386253 . TGTATGTGTTTGACTGCTCTCACCAAAGTATTATTTATGCCAGAAATGTCTTGTGTTACCGTTTTGTTTTTATCTGCAG T 16071.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=1.365;DP=366;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=28.28;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,362:365:99:16109,1240,0 -chr21 26390868 . CAA C,CA 1663.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.598;DP=120;FS=1.608;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,27,63:97:99:2151,1425,1743,447,0,350 -chr21 26592799 . C T 2131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.568;DP=66;FS=18.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=32.30;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,55:66:99:2160,0,163 -chr21 26593777 . C T 1685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1714,155,0 -chr21 26594416 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-1.415;DP=207;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=3.76;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,43:206:99:806,0,6237 -chr21 26600511 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:73:420,0,73 -chr21 26611139 . G A 2022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=-0.325;DP=71;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=28.49;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,57:71:99:2051,0,252 -chr21 26668041 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=-0.420;DP=73;FS=4.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.078;QD=7.83;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:600,0,3655 -chr21 26668042 . G T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-0.297;DP=72;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:600,0,3655 -chr21 26699428 . C T 1022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=2.139;DP=233;FS=9.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,52:233:99:1051,0,6961 -chr21 26700561 . G A 4098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.519;DP=212;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=19.33;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,124:211:99:4127,0,3052 -chr21 26709080 . G A 4173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-1.863;DP=249;FS=6.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,121:249:99:4202,0,4159 -chr21 26718973 . GA G 3777.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.513;DP=154;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=24.53;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,101:154:99:3815,0,5308 -chr21 26719003 . C T 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=-0.687;DP=126;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,45:126:99:1172,0,10583 -chr21 26719131 . GT G 285.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-0.091;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:16:323,0,16 -chr21 26745477 . CAGGTGAGCTTAGAGACGTGTGCCTTCCCAGAAATCTTCACACTTGTGTTTGATCGTCTCCTCATGGCAGTGTTTTTGTCGT C 10826.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=1.585;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:189:99:10864,839,0 -chr21 26773041 . T TA 3342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.44;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:72:99:3380,261,0 -chr21 26774364 . T A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=1.852;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:382,0,1188 -chr21 26774665 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=1.078;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=7.77;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:269,0,803 -chr21 26775383 . AT A 208.20 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.393;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=10.41;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15:285,15,0 -chr21 26775519 . TA T 992.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=32.02;ReadPosRankSum=-1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:96:1030,96,0 -chr21 26776116 . T TC 556.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=-1.123;DP=18;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=30.89;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:11:593,11,0 -chr21 26795445 . A T 6576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-1.132;DP=326;FS=5.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,193:326:99:6605,0,4825 -chr21 26796491 . A G 5887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=6.688;DP=453;FS=21.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:282,169:451:99:5916,0,9819 -chr21 26798749 . AAGGTAATTCTGATAACTAAGAAACAACAAAATAAACTTCAGGAGAATACGACAGATATATGACTCTGGTTATCTTTGCACTGATGATCTACTTCATTTTGC A 8259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=-0.296;DP=347;FS=5.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,238:329:99:8297,0,2768 -chr21 26798752 . GTAATTCTGATAACTAAGAAA G 2132.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.253;DP=335;FS=6.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,89:328:99:2170,0,9824 -chr21 26798774 . AACAAAATAAACTTCAGGAGAATACGACAGATATATGACTCTGGTTATCTTTGCACTGATGATCTACTTCATTTTGCAGGCG A 2147.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.039;DP=348;FS=8.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,91:341:99:2185,0,9857 -chr21 26802950 . GCTTGGAGGTTGAGAAGTGAACAAAGCTAGATGTTAGAATAGGAATTAATTAGGCATATATTTTACTGATGGATGCTTTGACGAGACTTAC G 5039.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-0.576;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:5077,484,0 -chr21 26803559 . TCTGTAGCAACAAAAAGAACCAACATTGTGTCTTTGCTGCACTTTCTGTAATGTGTCCAAAAATGAGAAATGTGTCATAC T 2884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.466;ClippingRankSum=1.893;DP=150;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,79:144:99:2922,0,23686 -chr21 26803675 . C T 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-1.247;DP=123;FS=7.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,35:123:99:884,0,3893 -chr21 26811278 . T G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-2.142;DP=102;FS=2.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,19:101:99:375,0,6671 -chr21 26823785 . C T 3754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-0.624;DP=199;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,113:198:99:3783,0,2985 -chr21 26825810 . T A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.984;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=14.32;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:243,0,288 -chr21 26848232 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:229,0,55 -chr21 26946683 . C T 1137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,31:44:99:1166,0,334 -chr21 26950011 . TA T 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.118;DP=24;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:68:420,0,68 -chr21 26969094 . C CA 362.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;QD=16.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:59:532,59,0 -chr21 26970296 . C A 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-0.102;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=28.22;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:40:669,0,40 -chr21 26970297 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.327;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:40:669,0,40 -chr21 27009110 . G A 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr21 27850964 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=6.483;DP=276;FS=15.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,49:276:99:584,0,8999 -chr21 27851267 . A G 7298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-1.499;DP=424;FS=0.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,221:409:99:7327,0,6908 -chr21 27882501 . A T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=-0.902;DP=138;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,36:137:99:840,0,3968 -chr21 27887382 . G A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=-0.890;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,39:128:99:939,0,3451 -chr21 27890801 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=5.630;DP=603;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=1.02;ReadPosRankSum=6.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:507,95:602:99:645,0,19613 -chr21 27907194 . G A 1089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=-0.895;DP=263;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.290;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,70:261:99:1118,0,10356 -chr21 27950142 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-1.827;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:317,0,189 -chr21 28123639 . A AAG 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.79;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:400,0,417 -chr21 28124930 . G GT 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.928;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:539,0,662 -chr21 28125529 . TA T 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.100;DP=23;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:415,0,108 -chr21 28257649 . GT G 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=2.349;DP=51;FS=9.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=5.54;ReadPosRankSum=-2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:320,0,615 -chr21 28294472 . C T 2073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-1.622;DP=117;FS=7.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,59:117:99:2102,0,2034 -chr21 28294523 . C T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.354;DP=170;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,49:170:99:1156,0,4475 -chr21 28401761 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.382;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=12.03;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:377,0,571 -chr21 28482795 . AGTATGTTTTTGTGACAAATACTGACAAAATAGCATGCCATTATTCTACTTGAAAGCATGCAATAATATTTGGCCTCTCTTCATGTGCAG A 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.045;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=31.51;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:699,0,1283 -chr21 28642502 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.694;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.237;QD=30.21;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:421,0,427 -chr21 28644169 . TA T 247.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=22.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:285,30,0 -chr21 28720394 . T C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr21 28720690 . T C 928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:46:957,46,0 -chr21 28754553 . GAGGTTTGCTCTGATAAAAGTTTGTGCCACATTTCAGGAAATTGCCGTTGGTTTTGATGAACGTTTCTTTCTTTAAATTGC G 288.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.809;DP=74;FS=2.268;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:326,141,0 -chr21 28757170 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-1.071;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=7.60;ReadPosRankSum=2.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:743,0,3238 -chr21 28767857 . T A 1035.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.092;DP=62;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,30:62:99:1064,0,1033 -chr21 28768196 . T C 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.182;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=11.10;ReadPosRankSum=1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:539,0,875 -chr21 28768285 . G A 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.313;DP=53;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.295;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:985,0,891 -chr21 28768401 . G A 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.149;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:573,0,1198 -chr21 28768974 . AT A 971.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=-0.913;DP=82;FS=1.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=11.85;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1009,0,1040 -chr21 28769738 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.110;DP=34;FS=8.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:319,0,823 -chr21 28769770 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.229;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.384;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:366,0,1035 -chr21 28775377 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=1.424;DP=70;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:353,0,2020 -chr21 28799079 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-1.306;DP=41;FS=22.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.38;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:413,0,1878 -chr21 28799814 . G A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.134;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:538,0,3061 -chr21 28799966 . G T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-1.794;DP=74;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:645,0,2057 -chr21 28800503 . T A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.817;DP=74;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=6.06;ReadPosRankSum=-2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,19:74:99:477,0,2032 -chr21 28806287 . C G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.949;DP=57;FS=4.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:242,0,1705 -chr21 28821557 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.265;DP=57;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:438,0,1489 -chr21 28919003 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=1.232;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=14.18;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:326,0,879 -chr21 28994526 . T G 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-0.008;DP=63;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:480,0,1521 -chr21 29004714 . CA C 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.299;DP=31;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:269,0,266 -chr21 29004871 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-1.205;DP=52;FS=7.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:316,0,1513 -chr21 29013509 . C A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=-0.076;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:233,0,2388 -chr21 29013967 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.579;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:400,0,386 -chr21 29222041 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=1.252;DP=83;FS=6.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:411,0,2525 -chr21 29228567 . G A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-0.761;DP=219;FS=7.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,45:219:99:858,0,6767 -chr21 29229486 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=-2.850;DP=267;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,57:267:99:783,0,13115 -chr21 29229558 . ACT A 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=-1.589;DP=151;FS=0.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=1.85;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,30:143:99:316,0,6867 -chr21 29229808 . A G 1959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.871;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=13.52;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,56:145:99:1988,0,3112 -chr21 29230272 . CAA C,CA 469.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=1.764;DP=34;FS=9.565;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=13.80;ReadPosRankSum=-2.096 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,9,18:29:99:670,441,650,165,0,140 -chr21 29230274 . A T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=1.300;DP=32;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:353,0,499 -chr21 29230478 . A G 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-1.212;DP=166;FS=4.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,41:165:99:850,0,6637 -chr21 29231119 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-1.804;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=25.58;ReadPosRankSum=2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:82:412,0,82 -chr21 29279890 . T G 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=-1.375;DP=125;FS=3.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=12.55;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,65:106:99:2177,0,1496 -chr21 29280028 . G A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=2.268;DP=27;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=22.73;ReadPosRankSum=-2.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,2:27:99:642,0,2129 -chr21 29280348 . A T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=2.945;DP=53;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:701,0,2262 -chr21 29282803 . C G 346.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.54;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:375,0,13 -chr21 29285091 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.764;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:310,0,497 -chr21 29285226 . C A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=1.152;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=25.74;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:440,0,123 -chr21 29324609 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:246,18,0 -chr21 29326570 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr21 29335303 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-1.225;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:248,0,449 -chr21 29340402 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-1.391;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:567,0,621 -chr21 29369873 . TCTGTAAAACAATCAGATTCATTTCACCTATGTTCGAAAAAAGATAAGGTATGTTTGCCTCTCTTCCACTCAC T 285.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:25:323,25,0 -chr21 29428239 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-1.590;DP=30;FS=9.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:462,0,465 -chr21 29440207 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.365;DP=23;FS=2.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:48:718,0,48 -chr21 29449129 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.607;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:266,0,1305 -chr21 29455249 . T C 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.817;DP=43;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:574,0,1048 -chr21 29455299 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=-1.388;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:268,0,1410 -chr21 29455372 . A T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=-0.033;DP=49;FS=2.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:388,0,1923 -chr21 29456104 . A T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-0.647;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:660,0,1072 -chr21 29456909 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=-0.528;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.951;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:376,0,519 -chr21 29458376 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.179;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:270,0,60 -chr21 29500302 . C A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.828;DP=42;FS=4.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,23:41:99:713,0,577 -chr21 29500338 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-1.517;DP=48;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:853,0,721 -chr21 29536139 . TCTGCAAAAGGACATTCAGAAAGTGAGGTAAACAGTAAAAGTTGAGGAGACTCCTGTGAAGTAGGAACGTTAACTAAC T 13652.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-2.434;DP=318;FS=6.145;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.840;QD=30.51;ReadPosRankSum=2.403 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,316:318:99:13690,1069,0 -chr21 29539219 . G A 2216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.041;DP=314;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=7.06;ReadPosRankSum=3.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,90:313:99:2245,0,8428 -chr21 29539306 . C T 5075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-1.871;DP=425;FS=0.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.94;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,154:424:99:5104,0,9130 -chr21 29547759 . G GAT 3209.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=1.846;DP=446;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=7.20;ReadPosRankSum=2.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,105:373:99:3247,0,14065 -chr21 29547925 . G C 5972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.262;DP=480;FS=2.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.899;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,188:480:99:6001,0,11560 -chr21 29550306 . G A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.448;ClippingRankSum=10.996;DP=305;FS=82.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=2.68;ReadPosRankSum=-9.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,62:305:99:846,0,10043 -chr21 29568576 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-1.286;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=23.12;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,181 -chr21 29651266 . T G 1828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-2.058;DP=58;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:53:1857,0,53 -chr21 29713585 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.243;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:431,0,754 -chr21 29713606 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.572;DP=30;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:345,0,655 -chr21 29713777 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=-0.818;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:261,0,339 -chr21 29741504 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.205;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:348,0,876 -chr21 29757444 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=2.144;DP=25;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:412,0,433 -chr21 29765782 . GCTGGAAAAAAAGATAATGAGCTTAAATGTCAAAACAAACGACCAAAAGACAATTATGTTTGTTATTTAGGGGAGATTTAC G 5230.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=1.703;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:5268,403,0 -chr21 29773343 . C T 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-2.542;DP=78;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=14.46;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,35:78:99:1156,0,1321 -chr21 29775974 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=-0.170;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:444,0,1288 -chr21 29781328 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-1.026;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:99:299,0,238 -chr21 29781410 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=1.670;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,238 -chr21 29781475 . T C 620.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:46:649,46,0 -chr21 29781599 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.929;DP=89;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:546,0,1281 -chr21 29781743 . A C 4261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.378;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=31.50;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:4290,314,0 -chr21 30042894 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:312,0,93 -chr21 30605256 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=25.62;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:32:310,0,32 -chr21 30769733 . C T 240.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:269,0,20 -chr21 30859072 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:539,0,362 -chr21 30859122 . A T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=-1.774;DP=26;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=15.64;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:435,0,487 -chr21 30859665 . A T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;ClippingRankSum=1.954;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:274,0,471 -chr21 30864034 . CCCTAGAATTCAAACCACAATGAGAAAAAAAGTCAGATATCAGAACATGCCATGTGTTACTATTTTCTTTAACTCTGGTACACAAAACACTGA C 1964.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=2.484;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=28.20;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,47:53:99:2002,0,742 -chr21 30864189 . CCCTATGCGCAACAAGCAGAATTTTAGTGCTCCAGATTTTTTAATAGGTTTCTGCTTATCATTTTGCAGCAAAACTTA C 1476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-1.105;DP=46;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=32.10;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1514,0,1430 -chr21 30865791 . CCCTGTATAACAAATCAACAACTGCATGAAATTATGGTTGTATTTGTTTGTATCAAAAAACTAAAATGTTTAAGTGGCTAATAATCTAA C 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=1.575;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=31.40;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:571,0,597 -chr21 31049225 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:297,0,367 -chr21 31054776 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.48;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,218 -chr21 31055844 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,147 -chr21 31155541 . TA T 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-0.143;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:528,0,499 -chr21 31156559 . TG T 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-2.725;DP=19;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=27.09;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:75:552,0,75 -chr21 31157069 . G C 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-1.431;DP=77;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:1251,0,1499 -chr21 31157600 . C CA 310.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-1.159;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.85;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:9:347,9,0 -chr21 31157739 . G A 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-3.299;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,31:81:99:1063,0,1740 -chr21 31157863 . G T 1489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.356;DP=99;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:1518,0,1950 -chr21 31225705 . G GA 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-2.143;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.718;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,30:125:99:366,0,2765 -chr21 31228219 . CCCTGCCAAACACACGCACACACAAATACCACCTTGTTTCTCAACCGTCAACATGATTAATTCAAAACAAAGTGTGTGAAGCCATTGACTGTTTCAGCA C 5837.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=1.552;DP=149;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,141:147:99:5875,525,0 -chr21 31230073 . C T 2741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.081;DP=210;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,82:209:99:2770,0,4320 -chr21 31525268 . A AG 563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=1.702;DP=180;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,49:166:99:601,0,5218 -chr21 31526250 . AT A 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.887;DP=76;FS=4.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:892,0,623 -chr21 31526376 . C CA 1234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-2.599;DP=141;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=8.76;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,55:132:99:1272,0,2038 -chr21 31527061 . CT C 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.250;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,28:69:99:609,0,827 -chr21 32027986 . T A 693.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.189;DP=20;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=34.70;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:15:722,15,0 -chr21 32267917 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=2.267;DP=14;FS=10.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.600;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:324,0,176 -chr21 32296712 . T A 2694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.718;DP=157;FS=5.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=17.16;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,76:157:99:2723,0,2753 -chr21 32296954 . A G 804.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:833,57,0 -chr21 32296969 . A T 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:660,45,0 -chr21 32375385 . G A 2097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=1.352;DP=129;FS=2.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=16.26;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,58:128:99:2126,0,2410 -chr21 32379093 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.058;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:386,0,442 -chr21 32384084 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=2.113;DP=46;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:402,0,2651 -chr21 32384085 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=1.866;DP=45;FS=7.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:402,0,2651 -chr21 32384664 . T TA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.532;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.930;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:391,0,350 -chr21 32385043 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.258;DP=34;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:312,0,864 -chr21 32385305 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=24.25;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:392,0,178 -chr21 32394951 . C CT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.386;DP=37;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:309,0,224 -chr21 32516549 . C A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.624;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:542,0,854 -chr21 32516871 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.220;DP=23;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:273,0,491 -chr21 32530294 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr21 32532501 . T C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr21 32532878 . C T 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 -chr21 32532905 . A T 702.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:731,51,0 -chr21 32658828 . G A 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr21 32968263 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.658;DP=67;FS=15.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:422,0,1947 -chr21 33032953 . AAGGTGAGAAAAAAGAGATAAGGTTAATGATAATGTTAAAATTACATAACTTGACTCTCTCTCTCTTTCTGTC A 589.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=3.262;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:627,0,1861 -chr21 33047741 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=1.357;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:382,0,828 -chr21 33065620 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.061;DP=15;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=22.78;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:370,0,157 -chr21 33095195 . T A 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=1.423;DP=175;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,42:174:99:931,0,5534 -chr21 33330403 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=-0.291;DP=37;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:566,0,1160 -chr21 33330845 . GA G 541.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.029;DP=52;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.42;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:579,0,557 -chr21 33330860 . A C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.604;DP=58;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:701,0,1164 -chr21 33331078 . C T 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=1.285;DP=70;FS=3.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:909,0,1437 -chr21 33438837 . C T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.879;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:351,0,602 -chr21 33680392 . A T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-0.404;DP=55;FS=5.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:751,0,1158 -chr21 33759002 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-2.510;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=10.56;ReadPosRankSum=1.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:556,0,1104 -chr21 33759091 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=2.613;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:307,0,1386 -chr21 33801839 . AT A 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.239;DP=36;FS=3.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:485,0,300 -chr21 33809449 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-2.400;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=22.20;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:339,0,178 -chr21 33835653 . C T 2208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=1.248;DP=81;FS=2.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,59:81:99:2237,0,489 -chr21 33844942 . G T 1770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.424;DP=72;FS=10.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=24.59;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,48:72:99:1799,0,1849 -chr21 33925081 . C G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=-0.627;DP=44;FS=4.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:580,0,853 -chr21 34270986 . T TA 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.198;DP=50;FS=8.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:466,0,196 -chr21 34271379 . T G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.598;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:342,0,1009 -chr21 34271854 . C CT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.301;DP=94;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=2.66;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:287,0,1457 -chr21 34271959 . C CT 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-1.267;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:327,0,961 -chr21 34290858 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.349;DP=32;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=18.24;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:612,0,481 -chr21 34290872 . A C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.791;DP=28;FS=6.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,641 -chr21 34293262 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.357;DP=164;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,38:164:99:778,0,4640 -chr21 34333320 . C T 3042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-0.021;DP=247;FS=0.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,92:247:99:3071,0,5349 -chr21 34607262 . CT C 1073.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.812;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,43:50:28:1111,0,28 -chr21 34607454 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-0.097;DP=43;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:254,0,1514 -chr21 34609728 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:273,0,390 -chr21 34609980 . C G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.963;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.38;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:366,0,918 -chr21 34610260 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.346;DP=67;FS=6.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.581;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:375,0,1948 -chr21 35387570 . C T 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.442;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,33:83:99:1053,0,1634 -chr21 35388727 . C T 1641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-1.280;DP=54;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.675;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,42:54:99:1670,0,250 -chr21 35388844 . A T 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.047;DP=89;FS=4.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=22.04;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,58:89:99:1990,0,1064 -chr21 35389368 . C T 2923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-1.250;DP=208;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.173;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,18:132:99:2952,0,6148 -chr21 35389436 . T A 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=-1.958;DP=155;FS=31.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.938;QD=18.86;ReadPosRankSum=1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:2951,0,6210 -chr21 35389519 . T C 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=-1.252;DP=93;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=31.43;ReadPosRankSum=2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:2951,0,6165 -chr21 35389642 . A G 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-0.023;DP=51;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=33.72;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:1748,0,1174 -chr21 35389692 . G T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=-0.082;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:506,0,2552 -chr21 35389700 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=-0.365;DP=118;FS=8.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:361,0,2757 -chr21 35389970 . C CT 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=1.381;DP=72;FS=18.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:423,0,1652 -chr21 35390202 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=2.222;DP=72;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:610,0,1750 -chr21 35390431 . C T 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.652;DP=61;FS=7.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=25.29;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,41:61:99:1571,0,517 -chr21 35390702 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-3.379;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:772,0,822 -chr21 35390907 . A G 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-2.413;DP=26;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=32.22;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:866,0,697 -chr21 35390913 . A G 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-1.999;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:866,0,692 -chr21 35391000 . C G 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.786;DP=71;FS=11.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,44:67:99:1885,0,548 -chr21 35391099 . G A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-3.128;DP=26;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=16.80;ReadPosRankSum=-1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:465,0,474 -chr21 35391122 . G A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=2.800;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=15.03;ReadPosRankSum=-2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:374,0,421 -chr21 35391133 . G A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=2.529;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:474,0,420 -chr21 35391200 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=4.037;DP=56;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:329,0,3408 -chr21 35391203 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=3.952;DP=56;FS=4.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=5.37;ReadPosRankSum=-3.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:329,0,3408 -chr21 35391329 . A C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.480;DP=13;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:51:430,0,51 -chr21 35391368 . T G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=-2.797;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=18.13;ReadPosRankSum=-2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:282,0,213 -chr21 35402960 . G A 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr21 35403117 . G A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr21 35404230 . G A 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=1.503;DP=30;FS=8.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:607,0,399 -chr21 35404345 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=3.486;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=8.56;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:302,0,1705 -chr21 35404350 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=2.641;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=8.30;ReadPosRankSum=-2.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:302,0,1705 -chr21 35404479 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.171;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:269,0,480 -chr21 35404993 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=-0.208;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:298,0,926 -chr21 35433101 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:272,0,295 -chr21 35433155 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=19.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:244,0,133 -chr21 35440685 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=2.443;DP=154;FS=13.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,32:153:99:643,0,4673 -chr21 35441111 . G C 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.082;DP=66;FS=19.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.519;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:370,0,1937 -chr21 35441128 . A AT 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=1.089;DP=60;FS=10.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=4.31;ReadPosRankSum=-3.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:296,0,1144 -chr21 35441212 . A T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.024;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:366,0,1436 -chr21 35441571 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=3.986;DP=108;FS=3.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=2.15;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,19:108:99:260,0,4040 -chr21 35441979 . GT G 1454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.716;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.803;QD=21.39;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,39:67:99:1492,0,1735 -chr21 35441983 . T G 1463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-1.289;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,41:69:99:1492,0,1821 -chr21 35442700 . C CT 2426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.384;DP=193;FS=7.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,111:183:99:2464,0,2149 -chr21 35708590 . A G 1995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-1.051;DP=142;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,60:140:99:2024,0,2521 -chr21 35746621 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.182;DP=31;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:392,0,627 -chr21 35746847 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.215;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:271,0,1044 -chr21 35749138 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.855;DP=45;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:392,0,1075 -chr21 35764331 . T C 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.287;DP=116;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,27:116:99:598,0,3414 -chr21 35777675 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=1.321;DP=38;FS=7.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:609,0,712 -chr21 35779520 . G GT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.158;DP=21;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:314,0,164 -chr21 35782973 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:381,0,218 -chr21 35833967 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.192;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:483,0,697 -chr21 35892923 . C CA 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.071;DP=16;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=16.17;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:80:296,0,80 -chr21 35920433 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,153 -chr21 35933306 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.386;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.38;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:262,0,94 -chr21 36063516 . G GA 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.613;DP=25;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:364,0,894 -chr21 36119301 . G A 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=-0.527;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,66:122:99:2104,0,2029 -chr21 36119511 . G GT 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=1.056;DP=72;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:523,0,803 -chr21 36120203 . T A 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.094;DP=76;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=16.37;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,35:76:99:1272,0,1304 -chr21 36121126 . C T 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.234;DP=99;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,31:99:99:864,0,2642 -chr21 36121230 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=4.058;DP=65;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=4.84;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:343,0,1939 -chr21 36123117 . GT G 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=-1.810;DP=98;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:701,0,1275 -chr21 36130124 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-2.002;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:675,0,402 -chr21 36312118 . G GA 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=-1.054;DP=97;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:367,0,1785 -chr21 36312895 . CACCTGCAGGCAATAAGGACAATGATTCTGAATTACACTACAGAGTTCACAGCTATCACTTTCATTCCTTTATGATGGATTACAGCTTACTCAGCAGGACCAAGTAACGGATCAGCAAGACAAACTT C 2817.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=1.689;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,80:84:99:3207,0,935 -chr21 36375568 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.352;DP=38;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:327,0,1068 -chr21 36375661 . G T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=101;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:454,0,4577 -chr21 36375743 . GCTGGAGAATCAGTCAGGAAACGATTAGGAAATCCATAGACATTTGCACAAACTAAATGTTTAGCGAACAATATTGGAATTGTAC G 2853.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.290;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=31.93;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,66:73:99:2891,0,1415 -chr21 36389098 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:363,0,334 -chr21 36408793 . G C 483.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:512,36,0 -chr21 36410092 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-0.885;DP=46;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:252,0,1243 -chr21 36410165 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.103;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:358,0,1256 -chr21 36509456 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=-0.797;DP=90;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:499,0,2783 -chr21 36509771 . G GA 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.239;DP=277;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.310;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,59:257:99:696,0,5535 -chr21 36510589 . A T 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=1.472;DP=135;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=5.80;ReadPosRankSum=2.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,33:135:99:811,0,3888 -chr21 36510652 . C CT 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=-1.874;DP=150;FS=1.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,33:142:99:314,0,6521 -chr21 36513598 . ACTGGCATGAGAGAATTTAAATAACTAGTTAGTTCACCATTACATGAAATGAAACATCTTTTACAGCTACAGCTGCTGGTACTGCTTAC A 15763.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=1.347;DP=296;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.022;QD=24.03;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,285:287:99:15801,1313,0 -chr21 36514000 . G A 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-2.924;DP=247;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=5.35;ReadPosRankSum=2.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,62:247:99:1350,0,6967 -chr21 36514130 . TCTGTGGTACAGACAGGCATGTTTTTACTATCTGTACGCGTAAGTGATTTATATTATTTATTTAATGCCTGTGTCTTTACAAACCTAC T 13738.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=2.434;DP=307;FS=7.219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,305:307:99:13776,1112,0 -chr21 36514356 . TCTGTTTAAATAAACAATCAAGACAAATCAATATTTTTATACCAAAATAATGATGTGATTTGTCTCCAAGAAAAAAAAGTAAGGAATGATTTCCTATATAC T 11051.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=2.972;DP=250;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,246:249:99:11089,898,0 -chr21 36519681 . CT C 1442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-0.457;DP=206;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,72:200:99:1480,0,5289 -chr21 36519742 . T C 1511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-3.175;DP=192;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,64:192:99:1540,0,6260 -chr21 36685151 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:231,0,67 -chr21 36723163 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.520;DP=25;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:389,0,464 -chr21 36723184 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=14.20;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:298,0,400 -chr21 36727194 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:89:240,0,89 -chr21 36727202 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:89:240,0,89 -chr21 36727689 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr21 36737334 . G C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=-0.021;DP=69;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:411,0,1868 -chr21 36749115 . A G 1845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-0.862;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,57:106:99:1874,0,3517 -chr21 36749123 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=-1.407;DP=118;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,21:118:99:390,0,9547 -chr21 36751504 . G A 1684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.512;DP=129;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.269;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,49:129:99:1713,0,2848 -chr21 36760454 . C G 1871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.238;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:140:99:1900,0,2861 -chr21 36766007 . G A 3305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=-3.672;DP=267;FS=11.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,95:267:99:3334,0,8664 -chr21 36768702 . T TCA 324.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:7:361,7,0 -chr21 36769342 . TGTAAGAGAGCACAGACACAATCCTCAAAACAAGTACATCTTATTTATGTATTTTATATGTGATTATGTGCTCTTTTGCACTTTGCAG T 18673.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=4.206;DP=424;FS=1.624;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,417:423:99:18711,1445,0 -chr21 36775214 . C G 2173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.035;DP=379;FS=7.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:282,97:379:99:2202,0,10662 -chr21 36840115 . C A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=-0.392;DP=51;FS=4.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:760,0,990 -chr21 36841572 . T G 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.065;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:496,0,474 -chr21 36875622 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=-1.113;DP=72;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=3.51;ReadPosRankSum=2.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:281,0,1636 -chr21 36877052 . C T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-0.680;DP=64;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:976,0,1360 -chr21 36877213 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.343;DP=52;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,22:52:99:480,0,1525 -chr21 36880530 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.63;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:88:401,0,88 -chr21 36976465 . C T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.493;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.267;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:558,0,164 -chr21 37073747 . T C 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.570;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:1017,0,1737 -chr21 37075226 . C CT 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.134;DP=88;FS=5.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.103;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:364,0,1275 -chr21 37422999 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.514;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=13.81;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:967,0,1422 -chr21 37469203 . G T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-2.008;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:461,0,673 -chr21 37469797 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.833;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:269,0,436 -chr21 37472827 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=31.86;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:274,0,62 -chr21 37472839 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=1.026;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:237,0,62 -chr21 37473122 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=23.13;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:352,0,165 -chr21 37473804 . A AT 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-0.281;DP=41;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=6.48;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:303,0,525 -chr21 37474160 . CA C 1204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.364;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,45:100:99:1242,0,1380 -chr21 37474192 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=-0.672;DP=106;FS=4.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,31:103:99:518,0,4556 -chr21 37474272 . G C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.515;DP=130;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,31:126:99:528,0,5307 -chr21 37474300 . G T 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-1.898;DP=121;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=8.30;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,38:120:99:1032,0,3466 -chr21 37483248 . C T 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.665;DP=135;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=13.08;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,51:135:99:1794,0,2913 -chr21 37546305 . C T 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=-3.881;DP=65;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=13.26;ReadPosRankSum=3.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:890,0,2963 -chr21 37546308 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=-3.827;DP=66;FS=1.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=10.95;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:890,0,2644 -chr21 37546815 . A G 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.093;DP=57;FS=2.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:792,0,2747 -chr21 37547075 . C A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.329;DP=43;FS=6.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:705,0,770 -chr21 37548759 . C T 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.143;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:476,0,1538 -chr21 37549096 . T TG 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.229;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:409,0,470 -chr21 37607256 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=-0.206;DP=46;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:236,0,1390 -chr21 37607635 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=-2.222;DP=74;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:861,0,2206 -chr21 37680589 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr21 37688498 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=-0.142;DP=247;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,45:247:99:663,0,7707 -chr21 37712768 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.936;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=18.08;ReadPosRankSum=-1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:661,0,528 -chr21 37749768 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=-0.071;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=7.61;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,783 -chr21 37755111 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-0.387;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.066;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:378,0,645 -chr21 37755292 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-0.872;DP=29;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=8.23;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:267,0,1032 -chr21 37840004 . G A 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:651,48,0 -chr21 37840119 . T C 990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1019,78,0 -chr21 37861522 . A C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-1.057;DP=42;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:784,0,1368 -chr21 37863918 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,431 -chr21 37902650 . G GT 3165.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-1.447;DP=170;FS=2.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,149:167:99:4444,234,0 -chr21 37946197 . G C 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=1.284;DP=78;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=14.86;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:78:99:1187,0,1501 -chr21 37957615 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.661;DP=54;FS=8.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:360,0,1489 -chr21 38022314 . A G 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=-0.896;DP=437;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:361,75:436:99:752,0,13874 -chr21 38029175 . G A 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.784;DP=307;FS=2.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,76:300:99:904,0,14378 -chr21 38029539 . G A 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=-3.075;DP=96;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,28:96:99:763,0,2548 -chr21 38278094 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.122;DP=189;FS=4.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.890;QD=3.64;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,40:189:99:717,0,5747 -chr21 38287727 . AT A 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:276,0,119 -chr21 38287987 . C T 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.926;DP=141;FS=6.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,37:141:99:858,0,3991 -chr21 38288189 . T TC 535.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=1.152;DP=141;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,33:141:99:573,0,4497 -chr21 38288476 . T G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=-0.637;DP=228;FS=9.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,48:228:99:836,0,7016 -chr21 38288733 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.946;DP=108;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:316,0,3865 -chr21 38288814 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.880;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=15.51;ReadPosRankSum=-2.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:354,0,488 -chr21 38288816 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.580;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=14.05;ReadPosRankSum=-2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:267,0,650 -chr21 38392446 . CA C 1657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.468;DP=96;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,61:91:99:1695,0,564 -chr21 38392535 . CTGTGTGTGTGTG C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.448;DP=60;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:333,0,2445 -chr21 38404031 . T TGA 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.285;DP=94;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=3.08;ReadPosRankSum=-0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:327,0,4676 -chr21 38404074 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.627;DP=131;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,30:131:99:394,0,6468 -chr21 38404150 . G GA 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.576;DP=78;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,22:68:99:383,0,1129 -chr21 38405809 . G C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-1.419;DP=141;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,28:141:99:452,0,3985 -chr21 38405989 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-1.775;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:511,0,1967 -chr21 38432940 . C T 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=2.236;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:469,0,302 -chr21 38438928 . GTCAAACACAC G 1677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=1.644;DP=55;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:95:1715,0,95 -chr21 38438939 . GATTATGCTAATTGACTGCTGAAAATTACAGCTGCAGAAATATGAACAAAGTAATTGTTACCTGA G 1677.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.402;DP=55;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=30.50;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,46:54:99:1715,0,735 -chr21 38444465 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-0.602;DP=171;FS=1.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,34:170:99:600,0,5163 -chr21 38457039 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=-0.876;DP=293;FS=0.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,66:292:99:1271,0,8673 -chr21 38713371 . G GA 319.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.004;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=22.84;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:19:357,0,19 -chr21 38718398 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.89;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:313,0,96 -chr21 38723395 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=2.228;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,134 -chr21 38778358 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=-0.869;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:278,0,994 -chr21 39001418 . T G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=-1.179;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:475,0,477 -chr21 39191445 . A C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-1.648;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:239,0,464 -chr21 39191921 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.033;DP=87;FS=6.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:597,0,2375 -chr21 39205373 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=-0.745;DP=114;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:690,0,3069 -chr21 39209430 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.453;DP=100;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:293,0,6307 -chr21 39209431 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=-0.685;DP=99;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:293,0,6307 -chr21 39218597 . G A 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.019;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,41:147:99:1039,0,4065 -chr21 39312971 . C G 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.491;DP=24;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:296,0,596 -chr21 39334229 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.227;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:514,0,550 -chr21 39583194 . T C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.125;DP=197;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=3.59;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,41:197:99:735,0,5780 -chr21 39677826 . CA C 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-1.093;DP=113;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:431,0,1535 -chr21 39875188 . C A 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.548;DP=197;FS=0.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,53:197:99:1263,0,5530 -chr21 40218643 . C T 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.354;DP=51;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.204;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:796,0,694 -chr21 40225036 . GA G 954.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.378;DP=56;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=17.05;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,37:55:99:992,0,389 -chr21 40235932 . T C 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.883;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:66:1575,0,66 -chr21 40250382 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-1.090;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:565,0,728 -chr21 40250395 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-1.784;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:275,0,954 -chr21 40250572 . C CA 385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.113;DP=46;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.801;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,23:43:99:423,0,435 -chr21 40250921 . G GCA 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.852;DP=50;FS=4.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:357,0,1503 -chr21 40251038 . C G 2807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2836,199,0 -chr21 40252100 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.323;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=16.44;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:357,0,427 -chr21 40475153 . T C 793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=4.237;DP=45;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.605;QD=17.64;ReadPosRankSum=-1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:822,0,716 -chr21 40477023 . G T 2157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.889;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,60:79:99:2186,0,415 -chr21 40477107 . G A 2647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.253;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=30.79;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,73:86:99:2676,0,125 -chr21 40493514 . G T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.255;DP=74;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,34:74:99:1209,0,1311 -chr21 40863747 . A C 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr21 40884429 . T G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:239,0,66 -chr21 41377030 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-1.261;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,18:100:99:262,0,3433 -chr21 41377724 . C T 1175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-1.658;DP=99;FS=7.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.88;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,35:99:99:1204,0,2211 -chr21 41378307 . T C 1755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.068;DP=105;FS=0.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1784,0,1869 -chr21 41378910 . G C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=2.421;DP=71;FS=6.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:275,0,4636 -chr21 41379547 . G GT 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-0.222;DP=102;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:285,0,1493 -chr21 41379603 . G A 2195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=-1.606;DP=130;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,68:129:99:2224,0,2062 -chr21 41403687 . A G 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=-0.593;DP=120;FS=4.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,51:119:99:1529,0,2278 -chr21 41519389 . C T 2065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.817;ClippingRankSum=0.544;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,67:106:99:2094,0,1277 -chr21 41548531 . GCTCCTGAA G 4149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.670;ClippingRankSum=-0.983;DP=270;FS=0.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,91:262:99:4187,0,10592 -chr21 41548533 . TCCTGAATTAAAGACAACTTTGATTAATGGAAACCATCCCTGATGGGTCCCATTGAATTAAAGTGAACACATGCAGACACTCA T 5305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=-2.385;DP=262;FS=0.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,155:246:99:5343,0,7089 -chr21 41548541 . TAAAGACAACTTTGATTAATGGAAACCATCCCTGATGGGTCCCATTGAATTAAAGTGAACACATGCAGACACTCA T 4149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.116;DP=256;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=16.21;ReadPosRankSum=-2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,89:247:99:4187,0,10575 -chr21 41582694 . AT A 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.839;DP=44;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:296,0,631 -chr21 41654215 . A ATT 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.713;DP=43;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:336,0,1069 -chr21 41655746 . T TAA 1310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-2.666;DP=67;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=19.56;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1764,0,908 -chr21 41695734 . A G 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,166 -chr21 41716529 . G T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,174 -chr21 41772083 . A G 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr21 41827951 . G GA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=-0.560;DP=24;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:307,0,286 -chr21 41866429 . T C 1740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=1.615;DP=67;FS=7.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,46:67:99:1769,0,658 -chr21 41911843 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,201 -chr21 41912482 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:59:249,0,59 -chr21 41938973 . C T 204.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr21 41953492 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr21 41953496 . T C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:299,21,0 -chr21 42094632 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.016;DP=37;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.020;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:815,0,448 -chr21 42101716 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-1.200;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.493;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:271,0,325 -chr21 42101930 . G C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.344;DP=14;FS=6.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=25.41;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:384,0,133 -chr21 42102010 . G C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.768;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=22.65;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:368,0,124 -chr21 42102597 . A AC 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=1.130;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.81;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:516,0,190 -chr21 42103001 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.700;DP=24;FS=4.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.033;QD=28.99;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:724,0,142 -chr21 42103333 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-2.770;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,252 -chr21 42104195 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=9.49;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:256,0,611 -chr21 42104206 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=-0.817;DP=26;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:355,0,596 -chr21 42105281 . A T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.359;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:402,0,318 -chr21 42109512 . A G 8121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.356;DP=243;FS=5.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=33.42;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,193:243:99:8150,0,2778 -chr21 42109966 . C T 4029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-3.487;DP=292;FS=25.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,117:290:99:4058,0,5729 -chr21 42115506 . C T 5879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.975;DP=325;FS=1.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=18.09;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,165:325:99:5908,0,5830 -chr21 42122173 . CT C 907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=-0.475;DP=109;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.968;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,43:105:99:945,0,1315 -chr21 42141801 . A C 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=-2.139;DP=46;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=12.73;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:614,0,1025 -chr21 42142094 . A G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.826;DP=59;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1133,0,2154 -chr21 42142224 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=2.326;DP=68;FS=5.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:820,0,1291 -chr21 42142876 . G T 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-1.369;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=28.27;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:1046,0,723 -chr21 42142879 . C G 1017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-2.176;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=26.78;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1046,0,707 -chr21 42142985 . A T 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-1.292;DP=53;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1013,0,773 -chr21 42143135 . G A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.507;DP=65;FS=10.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=18.06;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,35:65:99:1202,0,1120 -chr21 42143327 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.676;DP=56;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.530;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:384,0,1852 -chr21 42143758 . CG C 617.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=1.204;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:24:655,0,24 -chr21 42143826 . C A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-0.670;DP=54;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:992,0,838 -chr21 42144044 . A G 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.844;DP=42;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:810,0,1064 -chr21 42144179 . T A 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-2.070;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:937,0,947 -chr21 42144298 . T G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-1.871;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=15.30;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,30:68:99:1084,0,1294 -chr21 42144627 . G GA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=-2.660;DP=87;FS=18.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.059;QD=2.88;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:509,0,1484 -chr21 42665761 . A C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-1.396;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:378,0,48 -chr21 42665772 . G A 324.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.696;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:353,0,14 -chr21 42809274 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.303;DP=21;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:426,0,213 -chr21 43164012 . G GT 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-1.195;DP=37;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:86:524,0,86 -chr21 43166176 . A G 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.500;DP=62;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1289,0,2267 -chr21 43166184 . T C 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.774;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.492;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1289,0,2267 -chr21 43169506 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=1.121;DP=44;FS=8.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:354,0,1203 -chr21 43171339 . T G 508.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:537,39,0 -chr21 43236037 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.160;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1108 -chr21 43237099 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.954;DP=53;FS=5.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:232,0,1683 -chr21 43240998 . G GT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=1.387;DP=215;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,36:190:99:243,0,4091 -chr21 43241248 . AT A 986.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.778;DP=165;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=5.98;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,40:160:99:1024,0,8249 -chr21 43242561 . T TG 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=9.61;ReadPosRankSum=-4.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:287,0,658 -chr21 43243277 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.381;DP=112;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,17:112:99:253,0,7165 -chr21 43243278 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.483;DP=113;FS=3.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,18:113:99:253,0,7165 -chr21 43244000 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.68;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:295,0,51 -chr21 43244142 . C T 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=1.247;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:62:1282,0,62 -chr21 43273921 . T C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.825;DP=174;FS=5.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,43:155:99:1008,0,4127 -chr21 43274805 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.868;DP=86;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:312,0,3425 -chr21 43275169 . T C 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.530;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=9.07;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:536,0,2614 -chr21 43290607 . G A 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.801;DP=234;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,44:233:99:731,0,7219 -chr21 43293493 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.917;DP=203;FS=9.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,37:197:99:536,0,6884 -chr21 43302380 . T A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.521;DP=131;FS=4.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,24:131:99:375,0,4199 -chr21 43603558 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-0.084;DP=32;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:231,0,865 -chr21 43609328 . A G 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr21 43624431 . TA T 576.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=2.216;DP=22;FS=2.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:27:614,27,0 -chr21 43658731 . G C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.271;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:380,0,542 -chr21 43692372 . A C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:88:231,0,88 -chr21 43791949 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=1.154;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:352,0,342 -chr21 43795367 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.075;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:233,0,584 -chr21 43887504 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=2.165;DP=54;FS=4.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:231,0,2114 -chr21 43887560 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-1.336;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:270,0,1928 -chr21 43887580 . T C 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=2.023;DP=69;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:412,0,2151 -chr21 43887954 . T C 760.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.771;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:58:789,58,0 -chr21 43887963 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.189;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:287,0,405 -chr21 44022214 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.637;DP=33;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:235,0,888 -chr21 44027101 . A C 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.041;DP=302;FS=15.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,57:301:99:941,0,9683 -chr21 44027409 . GTACCTGCAATAAACACAGCACTGTGGTCAATCTGAACACACACACACACACACACACAGACAGGAAATGAGCGCTCGGTT G 1598.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-0.337;DP=397;FS=3.034;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,361:362:99:1636,604,0 -chr21 44029360 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:232,0,119 -chr21 44037507 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=5.493;DP=263;FS=14.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,40:263:99:245,0,8179 -chr21 44040885 . C T 3785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.222;ClippingRankSum=0.022;DP=390;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=9.71;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,131:389:99:3814,0,8696 -chr21 44041319 . G A 3312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=1.625;DP=301;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=11.01;ReadPosRankSum=-1.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,104:301:99:3341,0,6590 -chr21 44059066 . A C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=1.416;DP=55;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=6.70;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:397,0,1404 -chr21 44059194 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.810;DP=48;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=4.27;ReadPosRankSum=-2.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,5:48:99:233,0,3548 -chr21 44061178 . G GA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.440;DP=56;FS=7.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:250,0,1315 -chr21 44061963 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.722;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:254,0,1533 -chr21 44067109 . G A 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.069;DP=210;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=10.57;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,72:209:99:2248,0,4410 -chr21 44067188 . G T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.285;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=9.60;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:374,0,918 -chr21 44106357 . A T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:56:241,0,56 -chr21 44159871 . G T 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:356,27,0 -chr21 44160465 . T C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr21 44160467 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr21 44161869 . C T 2261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.035;DP=194;FS=7.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=11.66;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,71:194:99:2290,0,3820 -chr21 44162600 . C T 1785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.396;DP=238;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=7.50;ReadPosRankSum=3.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,74:237:99:1814,0,5949 -chr21 44176515 . GCA G 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=-1.708;DP=20;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:54:255,0,54 -chr21 44176746 . A C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr21 44186092 . A G 355.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:384,27,0 -chr21 44186752 . G A 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.786;DP=148;FS=5.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,55:148:99:1840,0,3200 -chr21 44195551 . GCACCTGTCAGATCAGCACGTTAACACCGCAGCACGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGCGTCACACACACT G 6091.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.021;DP=188;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=32.40;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,184:187:99:7163,609,0 -chr21 44203944 . A T 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.456;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:676,0,1462 -chr21 44206401 . C T 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=-0.823;DP=312;FS=5.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=2.45;ReadPosRankSum=2.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,58:311:99:794,0,9453 -chr21 44210575 . G A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.477;DP=117;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,34:117:99:832,0,3053 -chr21 44314303 . ATG A 2496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=-0.669;DP=220;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,96:165:99:2534,0,1815 -chr21 44314638 . ATCTC A 1056.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:83:1094,83,0 -chr21 44314933 . C T 1427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=-0.927;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,42:113:99:1465,0,2170 -chr21 44317326 . G A 6870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=2.654;DP=321;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=21.40;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,203:321:99:6899,0,4064 -chr21 44317332 . C G 14068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=334;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,332:332:99:14097,984,0 -chr21 44325735 . T C 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-0.236;DP=196;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,59:195:99:1529,0,4934 -chr21 44325764 . G C 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=2.016;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,32:45:99:1156,0,331 -chr21 44326448 . C T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.194;DP=48;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:593,0,1048 -chr21 44326469 . G T 727.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-0.443;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:765,0,1641 -chr21 44328848 . A C 5136.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:125:99:5165,376,0 -chr21 44330104 . GTTGCCCCACCTCCTTTTGCTGCTGCCCCACCTCCATCCACCA G 1565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=1.622;DP=117;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=13.38;ReadPosRankSum=3.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,50:79:99:1603,0,3152 -chr21 44330299 . C G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.081;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:374,0,2346 -chr21 44336196 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.887;DP=136;FS=8.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,31:136:99:657,0,4082 -chr21 44336920 . G A 1343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.410;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.961;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,57:191:99:1372,0,4897 -chr21 44345282 . G C 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-1.758;DP=121;FS=6.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=6.92;ReadPosRankSum=-2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:866,0,3183 -chr21 44345360 . C T 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=6.171;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=14.04;ReadPosRankSum=-3.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:1109,0,1433 -chr21 44349529 . C T 3073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.020;DP=120;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=25.61;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,86:120:99:3102,0,825 -chr21 44349975 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.072;DP=85;FS=9.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:690,0,2222 -chr21 44350153 . ACACACACACACACACACACACTCT A 226.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:2:262,0,2 -chr21 44360280 . G A 2126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=1.324;DP=126;FS=8.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:2155,0,2087 -chr21 44360445 . G A 2804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=-0.086;DP=130;FS=11.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=21.58;ReadPosRankSum=2.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,81:130:99:2833,0,1711 -chr21 44369530 . T C 3373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.829;DP=122;FS=2.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,92:122:99:3402,0,589 -chr21 44370611 . G A 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=-0.883;DP=253;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,73:253:99:1821,0,6607 -chr21 44370837 . G C 3073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=-0.698;DP=225;FS=0.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,70:225:99:3102,0,10690 -chr21 44371737 . G A 2958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=6.284;DP=133;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=22.25;ReadPosRankSum=6.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,88:133:99:2987,0,1448 -chr21 44376935 . T C 747.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:776,63,0 -chr21 44379348 . T C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr21 44443004 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=1.063;DP=275;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=1.67;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,50:274:99:488,0,9256 -chr21 44443241 . T A 1097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-0.702;DP=31;FS=2.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=28.75;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:87:1126,0,87 -chr21 44443345 . C T 344.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:373,27,0 -chr21 44446089 . GAGGTTTGTTTATAAGGGTGTTTTTCAACATATGCTGTGCTCTATGTGTGTTTATGAAGCGTTATAACGCCTGTATGTCTCTGTC G 1418.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=2.314;DP=36;FS=3.080;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=39.21;ReadPosRankSum=-1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:99:1456,124,0 -chr21 44454947 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.922;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:243,0,107 -chr21 44455045 . A G 208.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:21:237,0,21 -chr21 44490350 . A AGTC 3993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.353;ClippingRankSum=2.306;DP=181;FS=62.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=22.06;ReadPosRankSum=-0.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,127:175:99:4031,0,2703 -chr21 44496639 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr22 1710 . C T 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.738;DP=103;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,39:103:99:1270,0,1981 -chr22 5842 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.245;DP=84;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:978,0,1690 -chr22 23227 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.185;DP=62;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=13.77;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:882,0,1105 -chr22 24708 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.071;DP=51;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:597,0,1038 -chr22 28763 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.457;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=25.72;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:414,0,109 -chr22 44549 . T A 2184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=1.405;DP=197;FS=4.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,69:197:99:2213,0,4342 -chr22 46882 . C T 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=-0.671;DP=143;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,34:143:99:697,0,3922 -chr22 49274 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.476;DP=190;FS=1.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,34:189:99:231,0,4652 -chr22 51613 . G C 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=-0.026;DP=75;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:1277,0,1489 -chr22 53013 . A G 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.758;DP=256;FS=11.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,48:254:99:763,0,7735 -chr22 58265 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=-3.201;DP=200;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=1.12;ReadPosRankSum=3.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,30:199:99:253,0,7443 -chr22 65977 . C T 3933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=-0.456;DP=240;FS=7.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,112:240:99:3962,0,5036 -chr22 66117 . G A 4748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.783;ClippingRankSum=-0.070;DP=316;FS=13.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=15.03;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,132:315:99:4777,0,6193 -chr22 66665 . C A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-0.364;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:476,0,465 -chr22 68180 . A G 1731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=-2.942;DP=117;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=14.80;ReadPosRankSum=1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,49:117:99:1760,0,2901 -chr22 68577 . A G 2066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.340;DP=104;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,57:104:99:2095,0,3991 -chr22 69070 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.773;DP=74;FS=7.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:504,0,2551 -chr22 75934 . C T 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-1.679;DP=93;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=16.85;ReadPosRankSum=2.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,46:93:99:1595,0,1545 -chr22 75973 . C T 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=-0.246;DP=79;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:1035,0,1279 -chr22 76123 . G A 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=1.708;DP=104;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1569,0,1679 -chr22 76371 . C T 1285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.339;DP=97;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:1314,0,2446 -chr22 77651 . C T 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DP=76;FS=9.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1108,0,1241 -chr22 78149 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-1.071;DP=44;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=6.70;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:323,0,1081 -chr22 99115 . A T 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=1.303;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:954,0,756 -chr22 99233 . G A 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-3.175;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:65:99:927,0,1227 -chr22 120410 . C T 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=1.830;DP=60;FS=14.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:966,0,995 -chr22 121756 . CGTGTGTGT C 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:52:307,0,52 -chr22 125841 . G C 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-0.821;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=21.75;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:746,0,344 -chr22 133117 . T C 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.544;DP=30;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=29.76;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:921,0,124 -chr22 152333 . C T 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-1.938;DP=74;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,38:73:99:1207,0,1123 -chr22 152354 . C T 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-3.319;DP=77;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,31:77:99:1011,0,1438 -chr22 152660 . C A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-0.327;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:437,0,1590 -chr22 154847 . A C 251.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:280,0,22 -chr22 161257 . C T 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=-0.348;DP=53;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:937,0,855 -chr22 179890 . G A 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.017;DP=115;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,34:106:99:904,0,2787 -chr22 205775 . A G 5515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.250;DP=391;FS=10.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,165:389:99:5544,0,7264 -chr22 207476 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=-1.754;DP=365;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=1.75;ReadPosRankSum=4.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,73:363:99:666,0,10976 -chr22 212979 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=1.220;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,250 -chr22 217798 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=-0.487;DP=32;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=9.37;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:328,0,1089 -chr22 223725 . G A 5278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.231;DP=377;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,160:375:99:5307,0,6779 -chr22 223737 . C T 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=0.443;DP=337;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,75:335:99:1486,0,9565 -chr22 230514 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.935;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=15.98;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,212 -chr22 238636 . GAGGTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGGTCGGTCCACCTGTCCATCGTTTGTATGTGCAGGGGCGTGCTCTGGATGAGGGTCTCTCTCAGCTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGC G 1859.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=2.785;DP=58;FS=5.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=32.06;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,45:54:99:1897,0,3363 -chr22 262573 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.249;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,368 -chr22 291088 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:266,0,62 -chr22 295640 . C G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:298,0,277 -chr22 310211 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=26.24;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:448,0,126 -chr22 310244 . C G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=27.16;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:327,0,50 -chr22 391063 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:324,0,468 -chr22 421855 . G C 1363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.732;DP=119;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.762;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,45:119:99:1392,0,2313 -chr22 423528 . G A 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.813;DP=82;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,32:82:99:1079,0,1593 -chr22 426572 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=1.317;DP=85;FS=8.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,25:85:99:566,0,2164 -chr22 443180 . C T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.368;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:1226,0,2098 -chr22 443420 . T C 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.090;DP=70;FS=8.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=19.00;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,38:69:99:1358,0,1045 -chr22 443458 . CT C 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.469;DP=61;FS=15.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:541,0,1042 -chr22 448731 . C T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-1.758;DP=115;FS=7.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.904;QD=6.42;ReadPosRankSum=2.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:766,0,3156 -chr22 450541 . C T 2498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=-0.044;DP=193;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,76:193:99:2527,0,3929 -chr22 464789 . C T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.218;DP=54;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,24:54:99:807,0,987 -chr22 481804 . G GGT 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-1.483;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:957,0,1160 -chr22 481906 . C T 1247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.026;DP=95;FS=14.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1276,0,1727 -chr22 482016 . T A 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.181;DP=101;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,36:101:99:1093,0,1997 -chr22 526446 . C T 4451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-2.475;DP=337;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,129:325:99:4480,0,6586 -chr22 533075 . A G 3054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=1.181;DP=191;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.699;QD=15.99;ReadPosRankSum=-2.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,87:191:99:3083,0,3385 -chr22 544883 . G T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.102;DP=22;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:484,0,264 -chr22 552788 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-0.915;DP=32;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:269,0,824 -chr22 558501 . T TTA 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.890;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=26.03;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:636,0,432 -chr22 565087 . GA G 554.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.638;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:592,0,766 -chr22 565971 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,797 -chr22 566272 . T C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:393,0,87 -chr22 569012 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.322;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:470,0,347 -chr22 569992 . T C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:521,0,314 -chr22 578902 . A T 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.460;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:807,0,1794 -chr22 579786 . C G 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-1.798;DP=81;FS=6.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:665,0,1951 -chr22 580041 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=1.325;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:491,0,1330 -chr22 591305 . TCTAGGCAGAGTGCAGAACCGCACGTTAATAACACACAACAGAGACGTTTCATGTAGGCGTTCGGAAAGTTGCACGAACTCTCAC T 14972.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.910;DP=402;FS=2.948;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=28.96;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,384:393:99:15010,1128,0 -chr22 593101 . G A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-2.628;DP=130;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=6.76;ReadPosRankSum=2.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,39:129:99:907,0,3518 -chr22 596728 . C CGT 4555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.364;ClippingRankSum=3.862;DP=536;FS=12.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.443;QD=8.50;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:282,154:436:99:4593,0,8803 -chr22 597983 . T A 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-3.817;DP=54;FS=24.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.14;ReadPosRankSum=-1.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,37:52:99:1440,0,392 -chr22 598039 . A C 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-1.942;DP=115;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:99:919,0,3021 -chr22 602908 . C A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.608;DP=71;FS=4.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.029;QD=11.74;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:862,0,1574 -chr22 619661 . G A 2682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=-0.926;DP=206;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,85:205:99:2711,0,3946 -chr22 638364 . TGGTAAGAATCCCCACTAAAACCTAAACAACTCAGGTCAAGGGCGCTCTGTGAACGAACATTATTGAACATGTACTTCGGTTTGTCCTGTGTA T 3110.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.043;DP=75;FS=2.261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=28.54;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,71:75:99:3148,248,0 -chr22 656288 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.623;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:372,0,555 -chr22 656417 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=1.634;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.204;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:481,0,945 -chr22 659569 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.748;DP=34;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=10.43;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:383,0,716 -chr22 660052 . G A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.255;DP=43;FS=4.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:712,0,771 -chr22 660337 . C T 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.885;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=14.06;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:661,0,874 -chr22 663385 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=1.295;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:265,0,1104 -chr22 663798 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.487;DP=30;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=13.09;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:421,0,864 -chr22 670344 . G A 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.195;DP=151;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=12.17;ReadPosRankSum=3.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,56:151:99:1866,0,3400 -chr22 677634 . G A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=-0.527;DP=206;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,72:204:99:2212,0,4317 -chr22 677669 . C T 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.438;DP=88;FS=7.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:782,0,2163 -chr22 693744 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.003;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.260;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:281,0,1364 -chr22 693881 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.782;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:405,0,790 -chr22 734168 . T C 2213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=1.034;DP=201;FS=12.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=11.01;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,71:199:99:2242,0,4324 -chr22 736930 . G A 1505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=1.132;DP=188;FS=0.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,58:187:99:1534,0,4892 -chr22 743183 . G GA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=3.476;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=5.83;ReadPosRankSum=-3.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:323,0,2004 -chr22 748985 . C T 1068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-1.112;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,33:88:99:1097,0,1866 -chr22 779773 . G A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-1.087;DP=64;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.92;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:471,0,1682 -chr22 793186 . T C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-4.112;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=7.10;ReadPosRankSum=-3.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:575,0,2050 -chr22 793622 . G A 3085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.332;DP=113;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.292;QD=27.31;ReadPosRankSum=3.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,84:113:99:3114,0,628 -chr22 799965 . A C 228.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:21:257,0,21 -chr22 799968 . C A 228.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:257,0,21 -chr22 800729 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-1.290;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=10.01;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:659,0,1385 -chr22 808479 . TCCTGCACACAGCACACACACAATCTCCCATCATGCTCTGCTGCTGTCTCCGTCTGCACACACACTCTTGGCAGGCAAAAGCTCCATCTGTTCGCAGGCGGCAGTCATGAAAGCAGTGTCAGACACAACACAACCCTGAAAACCCACACAGACGCTCGTGTCGCCCACACACAAACACAGACGCTCGTATCGCCCTTA T 2516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=2.312;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=31.86;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,61:78:99:2554,0,5211 -chr22 811625 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.346;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:503,0,1569 -chr22 837910 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-2.544;DP=43;FS=9.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=15.09;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:677,0,709 -chr22 849640 . CA C 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.217;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.227;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:58:285,0,58 -chr22 849828 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.183;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:507,0,690 -chr22 861838 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:236,0,188 -chr22 880958 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.378;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=17.57;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:608,0,556 -chr22 892989 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.417;DP=26;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:241,0,1393 -chr22 892990 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.262;DP=25;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:241,0,1393 -chr22 903644 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=1.727;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:330,0,454 -chr22 904482 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.546;DP=34;FS=1.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:279,0,835 -chr22 934337 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.299;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:439,0,447 -chr22 956266 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr22 957722 . A T 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr22 967551 . G A 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr22 967587 . T C 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 -chr22 975213 . T A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:659,48,0 -chr22 977174 . T C 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr22 998770 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.161;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=11.03;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:282,0,576 -chr22 1002486 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=-0.380;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:468,0,250 -chr22 1195391 . T C 1137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=1.094;DP=325;FS=18.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=3.50;ReadPosRankSum=2.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,67:323:99:1166,0,10002 -chr22 1202351 . G A 1092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=2.608;DP=379;FS=1.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,71:376:99:1121,0,11724 -chr22 1202507 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.011;DP=302;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,43:302:99:263,0,9755 -chr22 1211370 . C T 4653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-1.927;DP=428;FS=0.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=10.87;ReadPosRankSum=2.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,143:426:99:4682,0,9566 -chr22 1260134 . C T 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.854;DP=140;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,46:140:99:1158,0,3415 -chr22 1349330 . A G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-1.091;DP=28;FS=8.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=15.06;ReadPosRankSum=2.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:450,0,543 -chr22 1383309 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.792;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:234,0,432 -chr22 1407655 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.231;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:320,0,120 -chr22 1408340 . A G 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.186;DP=52;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:898,0,931 -chr22 1408979 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.649;DP=88;FS=2.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.612;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:371,0,2698 -chr22 1408998 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=1.051;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,18:98:99:251,0,3144 -chr22 1409540 . TA T 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-0.433;DP=75;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.20;ReadPosRankSum=2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:352,0,1943 -chr22 1454182 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:231,0,222 -chr22 1553649 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.964;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:271,0,398 -chr22 1578545 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.155;DP=59;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:267,0,1735 -chr22 1649178 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=1.000;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:429,0,634 -chr22 1662559 . G C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.009;DP=61;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,16:57:99:452,0,1619 -chr22 1662907 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=-0.504;DP=71;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=7.62;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:569,0,1796 -chr22 1687776 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:315,0,417 -chr22 1694456 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-2.340;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:266,0,693 -chr22 1695499 . C G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.537;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,410 -chr22 1727079 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.603;DP=30;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:540,0,505 -chr22 1886944 . C T 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:555,45,0 -chr22 2060401 . A G 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr22 2074079 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=2.082;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,927 -chr22 2074107 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-2.333;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:257,0,1103 -chr22 2074164 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-1.298;DP=30;FS=9.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:343,0,764 -chr22 2113183 . C CA 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-1.395;DP=22;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:77:297,0,77 -chr22 2140718 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.732;DP=142;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,28:140:99:424,0,4429 -chr22 2162145 . C T 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.862;DP=236;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.509;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,44:236:99:677,0,7189 -chr22 2179917 . A G 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=1.253;DP=66;FS=5.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:694,0,3418 -chr22 2179927 . T C 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.459;DP=67;FS=2.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:694,0,3418 -chr22 2204712 . TGTAAGAGAATCAGATCTACTCTACATCATAGGTGTGTTTTGAAATCTGCAAATATATGTTTATTTTTGTCTGTGCAG T 2092.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=1.239;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=33.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2130,178,0 -chr22 2344069 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-1.506;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:506,0,488 -chr22 2346232 . T C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-1.974;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:578,0,172 -chr22 2346364 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.589;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=15.47;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:384,0,876 -chr22 2347692 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=-1.264;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:423,0,202 -chr22 2347731 . G A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-1.058;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:451,0,374 -chr22 2351326 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-1.643;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:347,0,428 -chr22 2351383 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.807;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:64:452,0,64 -chr22 2375509 . G C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=3.166;DP=27;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=14.36;ReadPosRankSum=-2.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:416,0,1123 -chr22 2381940 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-1.140;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.836;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:302,0,335 -chr22 2420490 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr22 2543065 . T C 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.450;DP=60;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,36:54:99:1284,0,592 -chr22 2596590 . G T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.122;DP=21;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=14.85;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:340,0,374 -chr22 2597218 . T C 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.713;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=28.13;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:85:422,0,85 -chr22 2636990 . A G 444.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=36.05;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:0:470,0,0 -chr22 2893452 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=2.037;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=22.34;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,129 -chr22 2970497 . AT A 2737.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.263;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=29.12;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,2:89:99:2775,0,2550 -chr22 3095287 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:250,0,673 -chr22 3095552 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.216;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1249 -chr22 3095553 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=1.078;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.509;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:330,0,1262 -chr22 3108678 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.765;DP=24;FS=14.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:242,0,847 -chr22 3108697 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.862;DP=26;FS=10.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:313,0,517 -chr22 3111636 . G C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-1.331;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:274,0,476 -chr22 3115899 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-1.381;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.841;QD=14.39;ReadPosRankSum=1.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:460,0,569 -chr22 3247206 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.192;DP=78;FS=6.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:528,0,2209 -chr22 3370676 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-0.534;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.694;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:456,0,722 -chr22 3370981 . GA G 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.628;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.514;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:377,0,679 -chr22 3372171 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=-2.402;DP=80;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=3.67;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:322,0,2359 -chr22 3508480 . A G 1519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.837;DP=74;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,41:74:99:1548,0,2600 -chr22 3888581 . A G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.256;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,22:73:99:568,0,1948 -chr22 3946355 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.029;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=2.47;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:263,0,2738 -chr22 4007881 . T C 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=1.467;DP=225;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,50:224:99:908,0,6450 -chr22 4017724 . C T 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=-0.463;DP=204;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,57:204:99:1405,0,6866 -chr22 4017733 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.708;DP=219;FS=23.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=1.12;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,33:219:99:273,0,9239 -chr22 4019726 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.700;DP=161;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,33:160:99:509,0,4702 -chr22 4023706 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.189;DP=230;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,34:229:99:260,0,7294 -chr22 4024125 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=-0.682;DP=222;FS=1.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,36:221:99:415,0,6949 -chr22 4033460 . G A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.459;DP=279;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,43:279:99:468,0,9008 -chr22 4039967 . C A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.206;DP=211;FS=7.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,48:211:99:1313,0,13476 -chr22 4039975 . T G 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.521;DP=228;FS=3.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,56:228:99:1313,0,13476 -chr22 4188671 . C CG 228.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:266,20,0 -chr22 4188673 . C T 237.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:20:266,20,0 -chr22 4324674 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-1.327;DP=37;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:242,0,1054 -chr22 4339569 . T TGC 657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.948;DP=345;FS=18.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,78:340:99:695,0,29667 -chr22 4339775 . CCCTGAAACATAAAAATCGATGTTGGTGAGAAACGTTTATTATCTTCTGTGTTAATCTAACATTTAATCAAAGGTATATAGAAAATCAACACTCAATAACAGCCATAGTTTTATTA C 15589.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.147;DP=354;FS=7.711;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.646;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,352:354:99:15627,1356,0 -chr22 4339937 . G A 3321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.286;DP=595;FS=8.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:445,150:595:99:3350,0,17132 -chr22 4343646 . TCCTATAATGCAGGGATTTAAAGTCTTAATACACCACTGGACTCATATCTTAAGTATAACTTTTTGAAATATCACAACATG T 17724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-1.354;DP=389;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,385:388:99:17762,1382,0 -chr22 4345564 . G C 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr22 4358463 . T C 1285.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1314,93,0 -chr22 4358512 . A T 688.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:717,51,0 -chr22 4521199 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=-0.555;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:261,0,235 -chr22 4526424 . T G 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr22 4610166 . A G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.837;DP=110;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:762,0,2956 -chr22 4611984 . T C 1774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.535;DP=112;FS=5.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,52:111:99:1803,0,1794 -chr22 4614191 . C T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=1.149;DP=88;FS=3.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:436,0,2274 -chr22 4616447 . T A 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=-0.155;DP=121;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1320,0,2004 -chr22 4618317 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.811;DP=189;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,47:189:99:1007,0,8002 -chr22 4641648 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=1.378;DP=42;FS=4.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:264,0,1952 -chr22 4642284 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=-0.461;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:294,0,1632 -chr22 4643485 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-1.231;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:541,0,803 -chr22 4643512 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-1.042;DP=36;FS=3.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:280,0,996 -chr22 4748143 . T G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-2.332;DP=40;FS=5.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:258,0,1134 -chr22 4756847 . A G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=2.423;DP=45;FS=4.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:559,0,983 -chr22 4756949 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-1.239;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:251,0,1239 -chr22 4757119 . T A 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.197;DP=57;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:1012,0,998 -chr22 4757193 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=-0.027;DP=55;FS=1.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:485,0,1471 -chr22 4757209 . C T 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.049;DP=51;FS=1.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,18:51:99:588,0,1191 -chr22 4757322 . A T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-1.376;DP=50;FS=4.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:371,0,1879 -chr22 4757337 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-0.779;DP=49;FS=16.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=4.89;ReadPosRankSum=1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:268,0,2042 -chr22 4757383 . T A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=-2.644;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:360,0,1020 -chr22 4757578 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.444;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:293,0,1093 -chr22 4761027 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=-0.642;DP=125;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,24:125:99:373,0,3875 -chr22 4761250 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-0.711;DP=120;FS=4.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:99:329,0,7926 -chr22 4761254 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=-1.169;DP=117;FS=6.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.539;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,20:117:99:324,0,7926 -chr22 4761383 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.571;ClippingRankSum=0.760;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:240,0,441 -chr22 4776452 . T A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.573;DP=49;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=18.22;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:921,0,832 -chr22 4785888 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.371;DP=197;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.810;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,35:197:99:479,0,7049 -chr22 4785986 . G A 1166.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.825;DP=192;FS=8.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,51:191:99:1204,0,7122 -chr22 4786192 . T C 3603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=1.138;DP=277;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.586;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,106:277:99:3632,0,6634 -chr22 4786249 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.782;DP=243;FS=7.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=3.16;ReadPosRankSum=2.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,47:242:99:795,0,7596 -chr22 4786293 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.408;DP=193;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,40:192:99:246,0,10067 -chr22 4786541 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-2.338;DP=76;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:829,0,1720 -chr22 4786607 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-1.317;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:239,0,1144 -chr22 4814683 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=25.90;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:339,0,80 -chr22 4859883 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-1.377;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:379,0,289 -chr22 4934426 . T G 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.206;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=13.30;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:281,0,423 -chr22 5062737 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=1.047;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.322;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:466,0,1495 -chr22 5095347 . T G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:325,0,319 -chr22 5095537 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-0.320;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:340,0,463 -chr22 5474642 . A G 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr22 5474656 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr22 5534404 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.085;DP=37;FS=11.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:255,0,999 -chr22 5556017 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:261,0,626 -chr22 5556026 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,626 -chr22 5581336 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.380;DP=75;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=7.61;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:599,0,1894 -chr22 5584722 . C A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.340;DP=92;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,32:92:99:1084,0,2050 -chr22 5591399 . TA T 2261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-1.621;DP=186;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=12.16;ReadPosRankSum=3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,76:184:99:2299,0,3947 -chr22 5622717 . A G 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:517,36,0 -chr22 5622731 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.444;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:267,0,502 -chr22 5633714 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=-0.485;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=19.75;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:443,0,243 -chr22 5682252 . G GA 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.290;DP=59;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:549,0,734 -chr22 5749118 . G A 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 -chr22 5749121 . T TA 218.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr22 5756691 . C T 839.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:868,69,0 -chr22 5858925 . C T 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr22 5970480 . T A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr22 5997640 . C T 291.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.43;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:320,0,15 -chr22 6906433 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=27.41;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:91:412,0,91 -chr22 6910070 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-0.231;DP=35;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:339,0,942 -chr22 6921819 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-1.350;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:297,0,1126 -chr22 6928855 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-0.830;DP=47;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:615,0,2256 -chr22 6948376 . T C 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-2.520;DP=292;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,56:290:99:934,0,8770 -chr22 6955962 . GA G 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.259;DP=133;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:866,0,2672 -chr22 6959724 . C T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.157;DP=449;FS=0.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:373,75:448:99:876,0,14230 -chr22 7530257 . G GC 533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:571,51,0 -chr22 7555674 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=10.89;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:246,0,427 -chr22 7558378 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.732;DP=45;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:229,0,1271 -chr22 7559259 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.088;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:240,0,1130 -chr22 7560678 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.712;DP=43;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:262,0,1262 -chr22 7583704 . A C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.836;DP=66;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:500,0,1825 -chr22 7652691 . G A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-2.814;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:70:647,0,70 -chr22 7652822 . C T 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=2.558;DP=38;FS=22.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=17.34;ReadPosRankSum=2.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:687,0,1097 -chr22 7652877 . G A 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.790;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=36.75;ReadPosRankSum=-0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:1505,0,220 -chr22 7653389 . TTA T 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.546;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=20.64;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,107 -chr22 7653455 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.532;DP=30;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,445 -chr22 7655813 . A C 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=3.000;DP=22;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:73:632,0,73 -chr22 7687306 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.079;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:234,0,456 -chr22 7714692 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=22.72;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:460,0,225 -chr22 7714797 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,326 -chr22 7714840 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-1.262;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:415,0,489 -chr22 7714910 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.200;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:358,0,644 -chr22 7715562 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=-1.369;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:239,0,626 -chr22 7737959 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=-0.988;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:333,0,386 -chr22 7737991 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=-1.427;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,423 -chr22 7832078 . CT C 220.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.044;DP=13;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=16.99;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:2:256,0,2 -chr22 7832140 . C T 616.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:645,45,0 -chr22 7832273 . C A 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr22 7832280 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:47:315,0,47 -chr22 8055859 . C G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,141 -chr22 8263913 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr22 8263945 . A T 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:774,54,0 -chr22 8264006 . A G 1341.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1370,96,0 -chr22 8292807 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=2.793;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.98;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:268,0,170 -chr22 8324041 . GA G 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.976;DP=28;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:332,0,272 -chr22 8355339 . GT G 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr22 8361457 . GA G 293.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:331,33,0 -chr22 8394186 . A T 1042.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1071,78,0 -chr22 8610717 . A G 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:524,39,0 -chr22 8610749 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.044;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.66;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:350,0,275 -chr22 8612761 . A C 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.778;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:429,0,224 -chr22 8777934 . T C 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=1.394;DP=43;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=11.86;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:538,0,851 -chr22 8805371 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:273,0,319 -chr22 8805549 . TGGTGAGTATCGTAAAGTTGATTGTGTTGTGTTCAGGCTAATATGAGAAGTGTTCCCAAACTCTGTGCTAATTTCTGATCATTTCTTTTA T 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.091;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.917;QD=33.98;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:513,0,1275 -chr22 8931009 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.688;DP=54;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:290,0,1541 -chr22 8931098 . A C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:365,0,117 -chr22 8931340 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.551;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=21.75;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:398,0,358 -chr22 8931342 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.791;DP=17;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=16.46;ReadPosRankSum=-2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:308,0,533 -chr22 8931456 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=14.22;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:270,0,173 -chr22 8931961 . T A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.133;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=19.25;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,326 -chr22 8931962 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=1.133;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,326 -chr22 8932600 . T G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=2.011;DP=18;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=12.38;ReadPosRankSum=-2.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,426 -chr22 9091271 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr22 9234764 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:386,0,171 -chr22 9299983 . T C 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:48:714,48,0 -chr22 9299987 . T G 685.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:714,48,0 -chr22 9367027 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr22 9370635 . A C 217.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:246,0,22 -chr22 9440970 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 9440979 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr22 9476945 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=1.326;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:464,0,2025 -chr22 9477021 . A G 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-2.233;DP=120;FS=7.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,50:120:99:1744,0,2217 -chr22 9558302 . A G 215.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:244,0,25 -chr22 9562187 . C G 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=-0.187;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=22.61;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:503,0,257 -chr22 9871767 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr22 9928108 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=-1.239;DP=26;FS=9.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:337,0,566 -chr22 10013283 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,129 -chr22 10020333 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=3.014;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.51;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:285,0,484 -chr22 10020436 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=-1.815;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:268,0,810 -chr22 10187484 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.594;DP=15;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=32.38;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:39:514,0,39 -chr22 10187574 . C T 1516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=1.973;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=30.95;ReadPosRankSum=-2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:78:1545,0,78 -chr22 10187872 . G A 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.433;DP=42;FS=7.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.751;QD=28.92;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1243,0,112 -chr22 10203680 . A G 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=1.172;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:500,0,1134 -chr22 10203682 . A G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.262;DP=34;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:714,0,726 -chr22 10203796 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-1.571;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:517,0,1487 -chr22 10203799 . A G 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.479;DP=60;FS=5.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1486,0,557 -chr22 10320617 . T C 2514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.239;DP=618;FS=3.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:483,133:616:99:2543,0,18461 -chr22 10322567 . T A 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=2.224;DP=259;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,70:259:99:1734,0,7541 -chr22 10370978 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.312;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,39:199:99:342,0,8784 -chr22 10371141 . GT G 384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=-1.704;DP=146;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:598,0,2754 -chr22 10371990 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.259;DP=194;FS=7.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.09;ReadPosRankSum=2.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,43:191:99:239,0,8712 -chr22 10372446 . C T 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-0.503;DP=163;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,40:162:99:768,0,5770 -chr22 10472039 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.507;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:239,0,2147 -chr22 10472042 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.285;DP=36;FS=1.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:99:239,0,2147 -chr22 10482997 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=2.039;DP=38;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:263,0,1051 -chr22 10503195 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.437;DP=25;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:240,0,684 -chr22 10540519 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.108;DP=57;FS=4.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:232,0,1696 -chr22 10540859 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.315;DP=54;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:297,0,1601 -chr22 10544859 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.499;DP=39;FS=3.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:267,0,1085 -chr22 10545965 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.962;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:246,0,971 -chr22 10550122 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.727;DP=43;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:329,0,1147 -chr22 10601516 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.503;DP=59;FS=4.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:360,0,1570 -chr22 10607144 . G A 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=2.513;DP=64;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=6.89;ReadPosRankSum=-2.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:469,0,1813 -chr22 10610063 . T G 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.931;DP=66;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:533,0,1700 -chr22 10624304 . T A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.058;DP=102;FS=11.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:562,0,2932 -chr22 10624919 . G A 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.098;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:726,0,3011 -chr22 10625559 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.696;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=22.60;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:322,0,546 -chr22 10625705 . T C 492.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:521,36,0 -chr22 10625728 . T C 365.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=33.27;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:394,0,13 -chr22 10625840 . T C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.650;DP=45;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=26.19;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:1207,0,444 -chr22 10626958 . C T 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-1.307;DP=103;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.61;ReadPosRankSum=2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:503,0,2982 -chr22 10627014 . T A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.575;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=6.78;ReadPosRankSum=2.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:652,0,2432 -chr22 10627537 . TCTGTGAATGTAAAGAAATCACAATTAAACTGACAGCAAATGTCGAGGCAGGTCAGCCAGGAGATGATATTAAAAAGTGCGAGCTAACTTAC T 3523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=3.652;DP=111;FS=2.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=31.75;ReadPosRankSum=-2.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,85:111:99:3561,0,8468 -chr22 10880632 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=1.442;DP=46;FS=7.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:246,0,1618 -chr22 10880647 . A G 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=1.295;DP=43;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1311,0,143 -chr22 10880764 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-2.137;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:260,0,1129 -chr22 10880765 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.198;DP=36;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:439,0,964 -chr22 11234012 . C CA 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.870;DP=196;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,37:155:99:440,0,2538 -chr22 12285505 . GA G 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.515;DP=180;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=6.60;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,56:175:99:1226,0,2871 -chr22 12960688 . G GCTCC 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=2.003;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=6.36;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:247,0,1165 -chr22 13185731 . C CA 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-1.465;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:425,0,520 -chr22 13185911 . C CT 674.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.578;DP=69;FS=0.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=9.78;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,31:64:99:712,0,751 -chr22 13187116 . G T 1083.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-1.577;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:1112,0,2154 -chr22 13241073 . T C 1614.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1643,123,0 -chr22 13246645 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=-0.537;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:473,0,686 -chr22 13855638 . C A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.894;DP=24;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:322,0,540 -chr22 13855752 . G C 2340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.472;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=27.73;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,53:55:99:2369,166,0 -chr22 13855861 . A G 1851.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1880,135,0 -chr22 13856093 . A C 1388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.046;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:67:1417,67,0 -chr22 13856124 . T A 1258.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.888;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=29.02;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:54:1287,54,0 -chr22 13856393 . T G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=2.135;DP=174;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,20:123:99:249,0,4130 -chr22 13857577 . C A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=-3.236;DP=30;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=13.29;ReadPosRankSum=2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:427,0,435 -chr22 13859527 . G C 4593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.575;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=30.72;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,89:98:99:4622,195,0 -chr22 13859533 . A C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=3.630;DP=124;FS=12.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=2.56;ReadPosRankSum=-2.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,21:109:99:346,0,3720 -chr22 13859550 . GACCTGAAAAATATAACCAACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTT G 1005.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=2.939;DP=207;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.098;QD=4.86;ReadPosRankSum=-4.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,41:160:99:1043,0,22123 -chr22 13859569 . ACTGAAATCAGTTGAAATGTATTTGGTCTTGTGATGATGACACAAAAATAAATTATTTTTCACAAAGGATGTGCTGTTAC A 2765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=-1.937;DP=188;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=14.71;ReadPosRankSum=-2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,81:142:99:2803,0,8413 -chr22 13859796 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=2.534;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=-2.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:577,0,563 -chr22 13860066 . C T 6113.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=-0.946;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=24.24;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,68:72:99:6142,436,0 -chr22 13860167 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.960;DP=299;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=1.30;ReadPosRankSum=2.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,39:248:99:417,0,8801 -chr22 13860580 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr22 14242603 . A C 4641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=5.512;DP=271;FS=25.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=17.13;ReadPosRankSum=-3.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,133:271:99:4670,0,5134 -chr22 14250566 . A G 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-2.994;DP=115;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,28:115:99:604,0,3302 -chr22 14637732 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr22 14910089 . T G 914.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.829;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:943,66,0 -chr22 14910286 . T C 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.764;DP=94;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,42:92:99:1501,0,1751 -chr22 14910380 . C T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=1.040;DP=60;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:981,0,1128 -chr22 14910440 . C CA 1086.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.162;DP=43;FS=2.496;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=25.27;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,35:39:51:1124,51,0 -chr22 15493360 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.050;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=17.63;ReadPosRankSum=-2.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:328,0,798 -chr22 15493369 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:328,0,802 -chr22 15774639 . G A 2505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.859;DP=115;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=21.79;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,79:115:99:2534,0,831 -chr22 15843263 . GCTGCGGAATAAAAATTTAAATGTTGGTGTGCAGTTCAATATCTAAAGAACCAGATCAAACAATTATCTTTGACGGACTTGTCATAC G 15855.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=2.437;DP=398;FS=3.006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=27.39;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,379:381:99:15893,1252,0 -chr22 16092555 . CCCTGACAAACACAGCAGAGTGATGAAGTGATGAATCTGGCAACCACGACAAAAAATTCAAATGTTAAAATTTTGTTGTTA C 2814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=2.064;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:2852,217,0 -chr22 16174053 . CT C 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-1.516;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:595,0,421 -chr22 16243981 . C T 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.870;DP=81;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:1292,0,3898 -chr22 16243991 . G T 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.732;DP=92;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.028;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,36:92:99:1292,0,3928 -chr22 16251198 . A G 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=1.056;DP=41;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:573,0,862 -chr22 16251213 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.468;DP=32;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:298,0,810 -chr22 16335874 . T C 414.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:443,36,0 -chr22 16336389 . C A 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1040,78,0 -chr22 16338351 . T A 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.179;ClippingRankSum=1.176;DP=116;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,40:116:99:1280,0,2702 -chr22 16338545 . T G 5123.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:127:99:5152,382,0 -chr22 16338619 . CTT C 1613.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.911;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:91:2347,91,0 -chr22 16339039 . A G 5738.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:5767,432,0 -chr22 16407722 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.270;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:280,0,574 -chr22 16512158 . TGGTCAGTTTTATTATTTAATAAATTCATTTACACACAAATATCTACCAGCAGTGGGCGTCATTATCCACATTATTATACTCCCATCATCA T 6084.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=1.554;DP=144;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,135:136:99:6122,512,0 -chr22 16516748 . AAAGTAAGGTTTTTTTTCCAGGTTAAGATCAGTTGGACTCAGACATGGTAGATCATTGACCATCGGTCTTTTTCTCC A 2659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=-1.638;DP=204;FS=5.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,78:202:99:2697,0,5055 -chr22 16524530 . TTTGAATGAGCTTCTAGGGGTTTAGTAATTTTCTCTTGTGCAATTATAATTAACAGGTAAAC T 766.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=3.077;DP=36;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=21.30;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,30:36:99:804,0,660 -chr22 16524720 . CAGGTATTAATAACATTTAATATGCACAATTTAATTTGTCTATAACTCCATATAGCCACACAATCTGTGTTTGCTCTGATTTACTTTTCTT C 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=4.548;DP=70;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=2.95;ReadPosRankSum=-2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,58:66:99:244,0,1860 -chr22 16524948 . G A 1489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1518,111,0 -chr22 16525426 . GAGGTTATGCCATTCTCAATATGTACTGTGTGCAAAGCTGCTAACAGAAATGTTATTATTAAATCATTGCATAAATAAAATGTAGCTAAAATTAAAATCTTAAGAGAATTAATGACCATCTCTTGTGTTATATGTCCATTGC G 1301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=-1.091;DP=67;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=19.43;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,37:67:99:1339,0,5827 -chr22 16564934 . A G 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.208;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:658,0,526 -chr22 16695756 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=-1.535;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.061;QD=23.62;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:477,0,208 -chr22 16713732 . CTTAAACACAAGGTTAAGGCTACAACCAACATATAAACAGCATCAAGACCAAACAATGACGACTAAGCTAAAAGGATAT C 6262.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=1.279;DP=139;FS=4.366;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=29.00;ReadPosRankSum=-2.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,135:139:99:6300,521,0 -chr22 16759826 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.871;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:243,0,488 -chr22 16819595 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-0.099;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:490,0,561 -chr22 16977728 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.675;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:421,0,333 -chr22 16980290 . G A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr22 16981083 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.531;DP=70;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:423,0,2660 -chr22 16981087 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.792;DP=72;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:330,0,2921 -chr22 17012202 . C T 578.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.492;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=32.15;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:26:607,0,26 -chr22 17012465 . A G 1047.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1076,78,0 -chr22 17342643 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-2.067;DP=31;FS=12.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=7.41;ReadPosRankSum=2.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:258,0,845 -chr22 17342813 . T C 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=-0.921;DP=66;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:935,0,1297 -chr22 17370370 . C A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=-1.035;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.015;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,27:49:99:865,0,797 -chr22 17370386 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.163;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:936,0,646 -chr22 17370474 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-1.109;DP=49;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:761,0,2093 -chr22 17373591 . T C 922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.064;DP=72;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:951,0,1512 -chr22 17409598 . G C 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-0.930;DP=81;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,42:80:99:1430,0,1394 -chr22 17422957 . A C 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=2.140;DP=85;FS=11.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:757,0,1713 -chr22 17440873 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:288,0,315 -chr22 17461952 . TGCAAGTGACAAGAGAATAAGTTGAATTTGATACTCTGTTTTTTGTGCTTGTAACTTCATGTTTGTTTGTTTTTGGTTGAAG T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=22.07;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:258,0,1507 -chr22 17681077 . ACTGTCAACCAAGAAGAGAAACGTATCAGAGACTCAGGAGTCGTCTGTGGAAAACTCTGCTGAATCTGTAC A 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:376,0,492 -chr22 17685108 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:303,0,376 -chr22 17685962 . ACTGTCAACCAAGAAAGTAAGCATATCAAAGAGACTCAGGAGTCGTCTGTAGGAAACTGTTAAATCTGTAC A 666.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.863;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=33.34;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:704,0,505 -chr22 17687662 . TCCTGATATACAGGAATATTTTAGCATTAGCATTTATGATTGCGTGTTATGTTAGAGATTTACATAGCATTACCAGTTTGAACAACAGAATTA T 560.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.139;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:598,0,1817 -chr22 17709124 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,201 -chr22 17709127 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=2.166;DP=11;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,201 -chr22 17730138 . GT G 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.270;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:532,0,1137 -chr22 17747798 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,460 -chr22 17755146 . AT A 3090.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.688;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,92:197:99:3128,0,2577 -chr22 17758023 . CT C 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-1.833;DP=97;FS=3.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:481,0,1697 -chr22 17758458 . AT A 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-1.061;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=8.05;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:440,0,669 -chr22 17761553 . TGGTAAGTAAACGAGCTGATTTAGTGATTTATGTTTGCTAAACTCTTCCAAATCCCCCTTCAAATCGGTCATTGTCTTTTTA T 17398.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.752;DP=437;FS=7.275;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=34.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,407:412:99:17436,1532,0 -chr22 17762433 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.571;DP=26;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:389,0,512 -chr22 17763468 . TC T 2800.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-5.505;DP=283;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,66:267:99:2838,0,22262 -chr22 17768053 . ACTGTCGAGACATGGTAAAAAGGGTTGCTACCATCAACATCAAGGACTGTGAACTGAAGACGATCAATGACACAATGCACACTTAC A 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:474,0,1934 -chr22 17813988 . CACCTGAAATTATATTTAAAGACAGTTACTTACATGATGATATAGTTCATGACTTTAAACAGATGTAGATATAATTAAAGATGAGAAGAGAATGAGAAGCGT C 2562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.557;DP=376;FS=18.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,114:361:99:2600,0,11635 -chr22 17813990 . CCT C 9620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.772;DP=366;FS=20.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=26.29;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,245:360:99:9658,0,3425 -chr22 17815799 . G A 9347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-1.181;DP=424;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=22.05;ReadPosRankSum=3.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,275:423:99:9376,0,5023 -chr22 17842258 . CCCTGACAGAAATAGGAGAGAATTCGTTATCGCTTTTTAATCGGTGAAGACGTGCAAGATCTGACCGGTAGTTTGCATA C 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:434,0,525 -chr22 17895426 . GCTGCTCACACAAAACAAACAGTCATTAAGCTTCTTTGATTAACTCATAGATGACATTTATATACATCATTGTGTGATTCATCGTAATTTAGTGAACTCTTGACATGCTGGTGTGTGTTTGAGATATGGTAAAATCAGAGTGTTTAAAAGCAGAC G 2907.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.638;DP=99;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,85:99:99:2945,0,1811 -chr22 18023387 . CGGTTAGCGTAATGACATGAGGAGAAAGACAAGTTGATCTTATCGATTGCAGTATAAATCTTCCCCGTCTAACGATGGTTTTGCTGGTTTTCCA C 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=1.508;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=29.36;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:507,0,709 -chr22 18087838 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:84:356,0,84 -chr22 18457313 . AG A 1562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-1.468;DP=62;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,40:59:99:1600,0,1757 -chr22 18460753 . TCTGTTAAAATATTTAAATATTAGATGTTTTAGGGGTACTGCATTTTTCTAACTAATAATGCATTACTTAC T 4955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=3.496;DP=114;FS=3.958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,108:114:99:4993,404,0 -chr22 18463389 . TCCTGATGAGGGCAAGCATAAGTTACTGAACGCCACAGAAGAAACTACCAACAGCTGCTTGAATTAAGCTCACA T 6671.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.937;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=30.82;ReadPosRankSum=-1.685 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,140:146:99:6709,603,0 -chr22 18766258 . CCCTGAGAAAAAAACAAAAAAAAACAAACACTATTTAGTACCACATTGGCCATAAGTTTCATAAAGACTACACTAAATACATA C 15500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.211;ClippingRankSum=1.538;DP=351;FS=8.842;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,331:348:99:15538,1342,0 -chr22 18949378 . G GT 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.030;DP=268;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,56:238:99:483,0,4531 -chr22 19322282 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=2.917;DP=30;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=11.56;ReadPosRankSum=2.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:375,0,614 -chr22 19322296 . T C 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=1.687;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=16.67;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:545,0,496 -chr22 19322354 . A C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-0.471;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=16.34;ReadPosRankSum=2.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:551,0,556 -chr22 19416968 . A G 245.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:274,0,22 -chr22 19507466 . A G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.818;DP=10;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.88;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:257,0,98 -chr22 19879541 . C CA 664.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.748;DP=102;FS=7.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:101:99:702,0,1669 -chr22 20428037 . TA T 476.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=1.257;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=19.07;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:25:514,0,25 -chr22 20455109 . T C 952.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:981,72,0 -chr22 20455127 . C A 972.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1001,72,0 -chr22 20458518 . C A 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr22 20458934 . T C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-1.448;DP=41;FS=4.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:895,0,483 -chr22 20459602 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,104 -chr22 20460018 . GCAGGTATAAAAGTAGCATTAAAACTCCTGCTCATTGATCTTTTAATGCCAATGGTATTTGATGCCAATCTCTAATTGTACCACATTTGTTATCTGCCTA G 1110.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=1.793;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,36:43:99:1148,0,1251 -chr22 20464753 . T C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=1.075;DP=25;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=31.63;ReadPosRankSum=-0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:57:819,0,57 -chr22 20464770 . A T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.175;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:501,0,169 -chr22 20469930 . A T 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 -chr22 20471344 . AAGGTACCAATAGCTAGTCTAATTGTGCACCACATTATACCAACTATGATTGTTCTCTAACATGCTGTTCTTTAC A 471.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:57:509,57,0 -chr22 20477599 . C CT 591.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-1.648;DP=56;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:629,0,740 -chr22 20484822 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.172;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:611,0,849 -chr22 20494943 . G A 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=-0.130;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.883;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,68:126:99:2216,0,2146 -chr22 20632375 . CA C 1774.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.368;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=22.75;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,62:69:76:1812,76,0 -chr22 20638133 . C T 3523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.531;DP=261;FS=3.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,114:260:99:3552,0,3900 -chr22 20640946 . GA G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=-1.708;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=12.82;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:268,0,152 -chr22 20661013 . A AG 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:339,0,205 -chr22 20727275 . T A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.604;DP=67;FS=2.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=10.77;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:750,0,2016 -chr22 20727650 . A G 1784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-2.402;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=17.85;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,50:100:99:1813,0,1834 -chr22 20728900 . GT G 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-0.312;DP=49;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:248,0,349 -chr22 20737862 . T A 1012.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.823;DP=142;FS=0.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,42:139:99:1041,0,3083 -chr22 20798048 . AC A 419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:457,34,0 -chr22 20798050 . C T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:34:457,34,0 -chr22 21035360 . G GA 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-0.327;DP=288;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.844;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,50:279:99:278,0,6304 -chr22 21050724 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.532;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:361,0,52 -chr22 21169776 . C CA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=1.934;DP=41;FS=5.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:384,0,416 -chr22 21285093 . GCTGAAAAAAAGAAAGAGAGCAGGTTACAAATGCCACGCAGAGAAATCAGGATTTCAGATTGGGGTTTGTGGGAGGAGCTAGTAC G 13759.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=1.703;DP=370;FS=3.022;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,366:368:99:13797,1049,0 -chr22 21577184 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.636;DP=76;FS=0.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:568,0,2055 -chr22 21674619 . AT A 329.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:367,36,0 -chr22 21675148 . TC T 217.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:255,24,0 -chr22 21983256 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,14:14:99:511,0,189 -chr22 21983307 . A C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.091;DP=14;FS=19.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=21.70;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:332,0,198 -chr22 21997400 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=23.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.48;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:87:322,0,87 -chr22 21997667 . A G 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=1.197;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=24.62;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:816,0,155 -chr22 22115077 . T C 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:24:320,24,0 -chr22 22115292 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.634;DP=17;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=23.40;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:426,0,168 -chr22 22115303 . T C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.42;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:419,0,160 -chr22 22390770 . A T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=1.326;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=8.64;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:348,0,923 -chr22 22400315 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-2.045;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:241,0,1116 -chr22 22505517 . TCCTGGAAACCAGAACCAAAGCAGATGAGTGCACATGCAAAGTACAACTCAAAGAAAGACTCTGAGTGAGTGTTTCTCTAA T 6334.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=1.870;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=28.23;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,155:161:99:6372,516,0 -chr22 22597331 . TA T 672.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.675;DP=36;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:91:719,0,91 -chr22 22597783 . TTG T 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-2.815;DP=42;FS=11.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=5.87;ReadPosRankSum=2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:284,0,360 -chr22 22638242 . AT A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.849;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:70:348,0,70 -chr22 22661166 . TTCCTCCTCCTCC T 1083.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.107;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:45:1121,45,0 -chr22 22665088 . T G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.527;ClippingRankSum=5.883;DP=59;FS=12.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=4.50;ReadPosRankSum=-4.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:294,0,2529 -chr22 22665090 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.757;ClippingRankSum=3.640;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=5.73;ReadPosRankSum=-3.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:51:99:326,0,2529 -chr22 22672622 . CGGTAAGCAGATCCTTGTTTTGAGGGGAGGAATGTTAGCGTTTTCACTTCTGATTGAATGGGTTTTGTCTTTTCA C 5952.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=1.604;DP=166;FS=9.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=33.67;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,146:150:99:6257,0,110 -chr22 22676064 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.219;DP=90;FS=7.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:249,0,3038 -chr22 22708460 . A AT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-2.336;DP=39;FS=11.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=6.74;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:321,0,388 -chr22 22787471 . A T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=2.822;DP=28;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:391,0,590 -chr22 22804767 . GAGGTTAAGATGATTATTCAATTATGACTATTTATCTATAAATTCTAGATTTAACCTTTTTTTTAAAGCAAGTTTATTTATGTTAA G 3039.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=1.427;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.630;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:68:99:3077,259,0 -chr22 23274990 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=1.671;DP=26;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.61;ReadPosRankSum=2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:616,0,301 -chr22 23275135 . A C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-2.471;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.63;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,866 -chr22 23275143 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=-3.079;DP=18;FS=8.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:328,0,866 -chr22 23329636 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=2.141;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,228 -chr22 23418630 . C T 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:275,21,0 -chr22 23418635 . A G 246.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:21:275,21,0 -chr22 23418678 . G A 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr22 23418756 . A G 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:950,72,0 -chr22 23418870 . A G 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 -chr22 23418940 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr22 23418950 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:21:292,21,0 -chr22 23527442 . G T 233.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:19:262,19,0 -chr22 24154121 . T A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.067;DP=110;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:579,0,3242 -chr22 24154186 . T C 1978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=-1.805;DP=96;FS=10.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=20.61;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,57:96:99:2007,0,1321 -chr22 24164429 . T C 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-3.480;DP=66;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:1111,0,3887 -chr22 24164436 . T A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=-2.934;DP=68;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:1111,0,3888 -chr22 24164452 . G C 2799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=-0.527;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=30.11;ReadPosRankSum=-3.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,61:90:99:2828,0,701 -chr22 24164504 . AGTGAGTCGTGCTTCTCCAGATGATTCTCTTGAAATACTCAAATCATGAAGTGAACTTAATGTTTCATCAGTTTTATTTTGTCTTTGTCACAG A 5745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=1.462;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,120:122:99:5783,460,0 -chr22 24194390 . A T 568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:597,42,0 -chr22 24194511 . A C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr22 24286781 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=-0.013;DP=43;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:499,0,973 -chr22 24331766 . C T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.527;DP=67;FS=2.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:1127,0,3652 -chr22 24406493 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.280;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:283,0,406 -chr22 24406525 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=12.72;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:270,0,666 -chr22 24415917 . T C 216.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:245,0,25 -chr22 24608259 . C T 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr22 24954938 . G T 1797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.675;DP=87;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=20.66;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,54:86:99:1826,0,1092 -chr22 24970610 . CT C 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=-1.854;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:298,0,266 -chr22 24971089 . T TC 988.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=-1.121;DP=40;FS=7.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1026,0,218 -chr22 25189180 . AAGGTTAGGCTTTTTTTCCCCCACATATAAATACATAGATTTTCCAATAAACAAAACAAAACTACTATAAATTCTCACTTGTTTGT A 1397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=-1.826;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=32.51;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1435,0,1588 -chr22 25196793 . GAGGTTCTGCCTTACAATTGTTTCTTTTTGTAGACGTTTCTTGATCTTGGTTCTTAACCATGCTTTTCTTTTCTTTC G 2236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=1.565;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=37.21;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,53:56:99:2274,0,220 -chr22 25243585 . C G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr22 25319862 . G A 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr22 25519309 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,169 -chr22 25542141 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=-0.799;DP=46;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:601,0,986 -chr22 25546904 . AT A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-1.496;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=8.19;ReadPosRankSum=-2.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:283,0,342 -chr22 25568551 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.689;DP=249;FS=1.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,40:126:99:287,0,5510 -chr22 25569592 . C T 2363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=5.501;DP=190;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=12.44;ReadPosRankSum=-3.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,70:190:99:2392,0,4803 -chr22 25581480 . A G 3114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=4.035;DP=190;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,99:190:99:3143,0,3246 -chr22 25582264 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=1.623;DP=72;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,31:69:99:1106,0,1813 -chr22 25608868 . A G 2538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=-2.320;DP=88;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=28.85;ReadPosRankSum=3.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,67:88:99:2567,0,479 -chr22 25609352 . C T 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:65:611,0,65 -chr22 25792976 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,145 -chr22 25794458 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-1.917;DP=20;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:473,0,45 -chr22 25795358 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,160 -chr22 25795571 . C A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.027;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:481,0,377 -chr22 25796264 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.910;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.91;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:237,0,245 -chr22 25798570 . C T 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 -chr22 25881141 . C T 5307.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-0.139;DP=22;FS=10.738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=29.28;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,14:19:99:5336,380,0 -chr22 25881143 . A T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.041;DP=22;FS=14.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:592,0,518 -chr22 25881189 . G A 2499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-1.322;DP=49;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=29.53;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:2528,0,337 -chr22 25881341 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-2.986;DP=113;FS=5.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,37:110:99:1052,0,3937 -chr22 25881403 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.386;DP=92;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:384,0,3408 -chr22 25881424 . G C 2477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.997;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=29.01;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,53:64:99:2506,0,145 -chr22 25881448 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-1.749;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:678,0,1233 -chr22 25881659 . A G 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=1.741;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=22.62;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1001,0,332 -chr22 25882257 . A G 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.511;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1042,0,144 -chr22 25882275 . CA C 370.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-1.504;DP=51;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:408,0,605 -chr22 25882370 . T C 1903.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.649;DP=126;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,54:121:99:1932,0,2539 -chr22 25882374 . T A 5091.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=-0.560;DP=128;FS=5.539;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,117:125:99:5120,285,0 -chr22 25882460 . T C 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.094;DP=38;FS=4.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=12.15;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:490,0,853 -chr22 25882479 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.031;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:320,0,287 -chr22 25882511 . CCT C 321.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:358,0,5 -chr22 26023426 . A G 201.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:230,0,24 -chr22 26023453 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=2.228;DP=11;FS=10.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.71;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,196 -chr22 26045988 . T G 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-0.850;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=24.58;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:569,0,114 -chr22 26062092 . GAGGTAGATTAGAGTTTATAATGCCCATCTAATTATGCCAAAAGAGGTTCACTAGGTGGTTGTTTTTTGTGGCTCCTATTTC G 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-0.151;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=24.21;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:473,0,2167 -chr22 26116538 . C T 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr22 26116603 . G C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr22 26155313 . T G 295.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:324,0,19 -chr22 26155439 . G A 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=1.422;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=26.26;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:76:501,0,76 -chr22 26155453 . G C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.551;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:374,0,162 -chr22 26155674 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=2.347;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=25.71;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:851,0,242 -chr22 26155726 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.854;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=17.62;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:504,0,441 -chr22 26391781 . A G 1753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1782,129,0 -chr22 26391797 . T C 2073.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:2102,157,0 -chr22 26391812 . G A 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=2.641;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=11.84;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:644,0,1199 -chr22 26392361 . C T 1539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.599;DP=88;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=17.50;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,43:87:99:1568,0,1678 -chr22 26392553 . A G 4579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:109:99:4608,328,0 -chr22 26392583 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.836;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:317,0,3544 -chr22 26392759 . G T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-3.380;DP=113;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,26:113:99:467,0,3881 -chr22 26392926 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=-2.125;DP=124;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,29:124:99:598,0,3680 -chr22 26393324 . T C 1544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=-0.021;DP=88;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1573,0,1393 -chr22 26393537 . T A 3780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3809,271,0 -chr22 26393595 . C A 1888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=-0.180;DP=99;FS=8.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,56:99:99:1917,0,1557 -chr22 26393643 . T C 4030.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:96:99:4059,289,0 -chr22 26393786 . A G 3083.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3112,223,0 -chr22 26393946 . A AC 2562.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2600,173,0 -chr22 26393947 . T A 2374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2555,170,0 -chr22 26394057 . T G 2991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.17;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:3020,215,0 -chr22 26394130 . G GA 1371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.054;DP=104;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,71:90:99:1647,0,261 -chr22 26394730 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.752;DP=95;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,17:95:99:302,0,6326 -chr22 26394732 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.806;DP=94;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:302,0,6326 -chr22 26394824 . G T 1892.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1921,138,0 -chr22 26394891 . G A 1778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.214;DP=61;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,46:61:99:1807,0,350 -chr22 26395028 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.191;DP=96;FS=3.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:340,0,3096 -chr22 26395188 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-1.468;DP=104;FS=2.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.004;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:542,0,2970 -chr22 26395298 . G C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.915;DP=66;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:564,0,2978 -chr22 26395318 . A C 2424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=2.818;DP=68;FS=1.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=30.29;ReadPosRankSum=-2.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,51:68:99:2453,0,318 -chr22 26395437 . G A 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:36:441,36,0 -chr22 26485645 . G A 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr22 26487019 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=2.123;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=31.45;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:40:500,0,40 -chr22 26519530 . T C 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-2.219;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=21.78;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:1161,0,1213 -chr22 26519631 . CT C 628.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.721;DP=61;FS=2.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:667,0,460 -chr22 26519733 . A T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-1.632;DP=30;FS=12.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:835,0,997 -chr22 26519740 . C A 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.706;DP=36;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=22.33;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:832,0,997 -chr22 26720535 . G T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,99 -chr22 26721183 . T C 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-1.498;DP=41;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:918,0,494 -chr22 26723403 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=2.578;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,420 -chr22 26729945 . A T 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:430,30,0 -chr22 26738088 . T C 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=4.678;DP=51;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=12.64;ReadPosRankSum=-3.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:673,0,1071 -chr22 26752793 . G A 1362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-1.449;DP=54;FS=11.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=25.24;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:54:99:1391,0,438 -chr22 26759553 . T C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=2.421;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:343,0,660 -chr22 26761788 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=10.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:303,0,390 -chr22 26771127 . G T 1335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.728;DP=62;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=21.54;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1364,0,723 -chr22 26771720 . AT A 850.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.925;DP=33;FS=7.754;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:64:888,64,0 -chr22 26772225 . C T 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-1.807;DP=86;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=25.85;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,59:85:99:2251,0,1344 -chr22 26772228 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=1.655;DP=82;FS=7.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=4.27;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:378,0,4659 -chr22 26777106 . T A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.520;DP=60;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=3.93;ReadPosRankSum=2.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:264,0,1814 -chr22 26779293 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.837;DP=105;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.879;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,21:105:99:350,0,3224 -chr22 26790181 . G C 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-1.979;DP=50;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:50:99:913,0,935 -chr22 26790223 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-1.678;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:286,0,4786 -chr22 26790264 . TCCTGACAGGGCAGAGCAGAAAGACACATGAATTCTGGGAAATGTAAAGCTGTTATTATTGCGTCGGTGTCAATA T 2351.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.350;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2389,211,0 -chr22 26823447 . G T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-2.942;DP=38;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.73;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:550,0,1635 -chr22 26834554 . C A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=-0.708;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=21.43;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:564,0,377 -chr22 26882008 . TA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.248;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:323,0,700 -chr22 26882010 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-0.277;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:263,0,768 -chr22 26892422 . CCCTGCAGATGAAGACAGATGAGTTTGGGTTGCGACTTTACATTTCATAAGATGTAATGAAGATCATGCAGCAGTCGGTTTCTCA C 2106.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,55:57:99:2185,0,535 -chr22 26933069 . T A 5303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.217;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,157:243:99:5332,0,2825 -chr22 27027633 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:259,0,59 -chr22 27027648 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:269,0,64 -chr22 27058940 . C A 1369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=5.230;DP=98;FS=2.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=13.98;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,42:98:99:1398,0,1854 -chr22 27062261 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=5.196;DP=77;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:641,0,1873 -chr22 27121864 . T A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=1.586;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:383,0,165 -chr22 27178728 . C A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=6.639;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=11.78;ReadPosRankSum=2.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,25:68:99:829,0,1439 -chr22 27182529 . G A 3604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=1.539;DP=188;FS=6.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=19.17;ReadPosRankSum=-2.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,109:187:99:3633,0,2708 -chr22 27195150 . AACCTGTGCAGACACCAGTTAACAATTAATCATATGTTAAACTGCACTTCACATGCAAACCAATTTGTAGCCAGCACTG A 8403.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=1.535;DP=201;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,198:201:99:8441,726,0 -chr22 27212641 . CAT C 384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=17.49;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:422,0,455 -chr22 27254633 . G A 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.808;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.485;QD=20.45;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:560,0,281 -chr22 27410429 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=1.399;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:680,0,722 -chr22 27433622 . TGGTTAGTGCATTTTTAAAACGACGCCACCAGCATCAACTGAGTGCTGACAAATAACTAAACTGTGTTCGTA T 977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=2.050;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=32.59;ReadPosRankSum=-2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:99:1015,0,1256 -chr22 27480277 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=1.413;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:287,0,1415 -chr22 27953094 . G T 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:524,36,0 -chr22 28322258 . C T 1386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1415,99,0 -chr22 28705160 . AAT A 441.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.68;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:479,36,0 -chr22 28709149 . G A 610.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:12:638,12,0 -chr22 29138836 . G C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr22 29185207 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=1.035;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=9.07;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:382,0,869 -chr22 29185327 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 -chr22 29186110 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.347;DP=25;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.890;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:273,0,407 -chr22 29186171 . G A 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.046;DP=39;FS=5.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:71:1176,0,71 -chr22 29187974 . T G 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr22 29188067 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr22 29188910 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=1.215;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=11.83;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:253,0,282 -chr22 29190948 . G A 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.110;DP=50;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:786,0,877 -chr22 29191005 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=2.048;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:417,0,668 -chr22 29292972 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:315,0,256 -chr22 29292982 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:315,0,256 -chr22 29318701 . T C 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr22 29491263 . A G 482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:511,36,0 -chr22 29527924 . G T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr22 29868433 . G T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:306,0,52 -chr22 30190452 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=3.308;DP=16;FS=15.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,264 -chr22 30190520 . T G 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=5.535;DP=149;FS=15.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=5.77;ReadPosRankSum=-6.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:888,0,5405 -chr22 30190578 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=-5.230;DP=188;FS=13.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=1.45;ReadPosRankSum=-4.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,24:132:99:301,0,5021 -chr22 30191133 . G A 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=-0.551;DP=79;FS=4.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:816,0,774 -chr22 30191322 . T A 2727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.195;DP=116;FS=6.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=23.52;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,72:102:99:2756,0,1662 -chr22 30191329 . A G 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=-0.367;DP=149;FS=0.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,26:127:99:464,0,7034 -chr22 30191923 . G T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=1.077;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:506,0,255 -chr22 30191925 . CT C 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=2.083;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:506,0,245 -chr22 30192036 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.634;DP=30;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:474,0,355 -chr22 30192040 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.636;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=26.22;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:474,0,355 -chr22 30192898 . A T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=1.001;DP=25;FS=34.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=31.67;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:51:820,0,51 -chr22 30192972 . G GT 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=13.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=19.56;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:409,0,136 -chr22 30193106 . A T 1904.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=2.523;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=29.76;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:98:1933,98,0 -chr22 30193140 . T C 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.950;DP=25;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=22.47;ReadPosRankSum=-1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:590,0,123 -chr22 30193383 . T C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.800;DP=83;FS=2.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:353,0,3976 -chr22 30193389 . G T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.310;DP=76;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:350,0,3976 -chr22 30194107 . T C 3634.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.069;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=31.04;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,85:89:99:3663,259,0 -chr22 30194175 . G GT 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-1.928;DP=93;FS=32.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:674,0,147 -chr22 30194679 . G T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=1.157;DP=13;FS=18.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=31.31;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:506,0,120 -chr22 30194688 . C G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.381;DP=42;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:232,0,917 -chr22 30195000 . CT C 636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.412;DP=158;FS=25.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,39:144:99:674,0,5207 -chr22 30195010 . T C 1088.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-1.042;DP=165;FS=6.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=6.60;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,44:153:99:1117,0,5552 -chr22 30195055 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=1.446;DP=148;FS=22.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,21:124:99:273,0,4400 -chr22 30195067 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.272;DP=139;FS=11.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,29:115:99:615,0,4628 -chr22 30195173 . A T 2538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.445;DP=107;FS=13.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=23.73;ReadPosRankSum=-3.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,56:81:99:2567,0,439 -chr22 30195207 . C CT 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.270;DP=205;FS=5.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,28:144:99:270,0,3147 -chr22 30195359 . C G 3340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=-0.509;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=33.75;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,87:99:99:3369,0,358 -chr22 30195402 . C T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-2.435;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=31.44;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:30:657,0,30 -chr22 30195638 . A G 3582.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.430;DP=105;FS=7.709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=34.12;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,84:87:99:3611,216,0 -chr22 30195851 . G A 1521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=35.98;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,8:10:79:1550,79,0 -chr22 30196001 . A T 1477.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-0.873;DP=29;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:4:1504,0,4 -chr22 30196051 . TAA T 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:99:242,0,138 -chr22 30196073 . T C 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.775;DP=73;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:680,0,3608 -chr22 30196078 . G T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.238;DP=84;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=7.65;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:671,0,3608 -chr22 30196149 . T A 2244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=1.282;DP=152;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:2273,0,4464 -chr22 30196151 . T C 2244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=1.430;DP=152;FS=3.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,63:117:99:2273,0,4464 -chr22 30196435 . G A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr22 30196978 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:426,0,109 -chr22 30197079 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.203;DP=76;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:339,0,3199 -chr22 30197112 . G A 781.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=-2.341;DP=24;FS=5.855;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=32.58;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:17:810,17,0 -chr22 30197404 . C A 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=1.172;DP=36;FS=3.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:675,0,999 -chr22 30197409 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.077;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:244,0,1879 -chr22 30197530 . A T 3895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.047;DP=220;FS=1.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.845;QD=17.71;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,103:209:99:3924,0,9353 -chr22 30197660 . G A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=-1.138;DP=155;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=5.59;ReadPosRankSum=4.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,38:151:99:894,0,4436 -chr22 30197917 . C G 3761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=-0.094;DP=165;FS=6.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,92:115:99:3790,0,946 -chr22 30198189 . G GAA 1129.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:77:1167,77,0 -chr22 30395146 . T G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-0.161;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:337,0,709 -chr22 30618082 . G C 289.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:318,0,19 -chr22 30847044 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=1.133;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,152 -chr22 30883607 . T TA 293.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:331,27,0 -chr22 30884616 . C T 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr22 30950055 . C T 936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:66:965,66,0 -chr22 30981150 . T A 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr22 31038410 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.560;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:394,0,356 -chr22 31038471 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.203;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:230,0,99 -chr22 31065757 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-0.193;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,361 -chr22 31087893 . A G 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=-0.859;DP=39;FS=3.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=28.07;ReadPosRankSum=2.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:1123,0,218 -chr22 32279231 . CT C 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=-1.230;DP=28;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:473,0,105 -chr22 32281195 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.40;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,175 -chr22 32366932 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.045;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=1.63;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:256,0,4454 -chr22 32393435 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=2.359;DP=21;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=16.51;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:375,0,354 -chr22 32558977 . TCTAAAAACGAGAAACTTAATGAAGACCACCAAGACTAAGGCTTTCTTTTTAGGAAAAAATGAGTTGATTATGCAC T 16294.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-0.781;DP=319;FS=3.612;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,316:317:99:16332,1399,0 -chr22 32718875 . AGTGAGAATTATGTTTAAAATACTAAAACTAATGTGCCTTAATGCATCCATTAATTAGTTAGTTGTTTTTTTCTTCAATCAAATGAGAGAAATGTGATGTTTTATTTAG A 1728.14 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.167;DP=31;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=25.41;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:10:1765,0,10 -chr22 33050627 . C CT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-2.148;DP=199;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,35:190:99:243,0,4391 -chr22 33151030 . T G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,354 -chr22 33151031 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=20.90;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,354 -chr22 33197050 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.574;DP=68;FS=5.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:483,0,1889 -chr22 33200822 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-1.724;DP=43;FS=2.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:388,0,1123 -chr22 33200958 . G A 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.987;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:782,0,2633 -chr22 33200961 . A C 753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.329;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:782,0,2703 -chr22 33201210 . C G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=2.013;DP=47;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:277,0,1370 -chr22 33201723 . G T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.273;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:682,0,489 -chr22 33218993 . G A 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:400,27,0 -chr22 33219001 . A G 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr22 33233368 . T A 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr22 33233386 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.955;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=22.22;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:406,0,207 -chr22 33234485 . C T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=-1.351;DP=27;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=23.81;ReadPosRankSum=2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:671,0,107 -chr22 33234721 . C A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr22 33235330 . G A 414.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=34.53;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:442,0,8 -chr22 33247103 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-1.312;DP=27;FS=13.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:259,0,692 -chr22 33247417 . G C 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.553;DP=25;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=25.51;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:666,0,229 -chr22 33247507 . T C 571.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:600,42,0 -chr22 33482956 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=2.077;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=14.08;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:338,0,375 -chr22 33502095 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=-0.991;DP=64;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,38:64:99:1280,0,876 -chr22 33509309 . G A 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.469;DP=61;FS=8.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.798;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:986,0,1025 -chr22 33523552 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-0.749;DP=50;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:234,0,1533 -chr22 33717696 . A T 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:470,33,0 -chr22 33717784 . A T 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr22 33719065 . A T 367.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.45;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:396,0,13 -chr22 33719161 . G A 396.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:425,30,0 -chr22 33719601 . C T 823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=1.364;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=33.34;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:28:852,28,0 -chr22 33722343 . C CT 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=2.228;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=22.25;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,290 -chr22 33722345 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=2.520;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=23.07;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,290 -chr22 33729600 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:241,0,153 -chr22 33744381 . G T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.173;DP=38;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:575,0,683 -chr22 33772473 . G A 5386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=-2.164;DP=294;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=18.32;ReadPosRankSum=2.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,147:294:99:5415,0,5255 -chr22 33772543 . AT A 2563.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.707;DP=257;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,104:248:99:2601,0,3487 -chr22 33772589 . C A 2565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=-0.353;DP=199;FS=7.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,74:199:99:2594,0,4303 -chr22 33772648 . C T 2270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.389;DP=121;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,68:121:99:2299,0,1923 -chr22 33772665 . T G 1578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.504;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=17.35;ReadPosRankSum=2.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,47:91:99:1607,0,1616 -chr22 34293070 . A AT 265.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:303,21,0 -chr22 34293582 . AT A 295.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:333,0,19 -chr22 35080578 . G T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,333 -chr22 35095477 . G A 1990.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:2019,147,0 -chr22 35095621 . C T 2698.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2727,202,0 -chr22 35095913 . A G 1683.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1712,120,0 -chr22 35096266 . A T 3362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:81:99:3391,244,0 -chr22 35096339 . A C 2407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2436,178,0 -chr22 35096523 . A AT 1314.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1352,114,0 -chr22 35096722 . A G 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr22 35096830 . C T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:440,30,0 -chr22 35096839 . C T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:440,30,0 -chr22 35096983 . A T 2469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2498,187,0 -chr22 35097115 . A T 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:560,42,0 -chr22 35097247 . G A 1351.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1380,102,0 -chr22 35097513 . T C 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:31:565,31,0 -chr22 35097524 . GTA G 477.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:28:515,28,0 -chr22 35097663 . C T 3175.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3204,235,0 -chr22 35097874 . A G 1157.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:75:1195,75,0 -chr22 35097883 . G A 1280.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1527,105,0 -chr22 35097934 . A G 1093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1122,87,0 -chr22 36012228 . CT C 2150.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.690;DP=174;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.500;QD=12.36;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,95:170:99:2188,0,1878 -chr22 36055505 . G A 4929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=-0.640;DP=253;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=19.49;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,128:252:99:4958,0,8793 -chr22 36055507 . G A 4929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=-0.470;DP=242;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=20.37;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,122:241:99:4958,0,8793 -chr22 36072659 . CA C 759.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-1.820;DP=160;FS=3.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,43:154:99:797,0,3321 -chr22 36074110 . G GA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-1.209;DP=80;FS=12.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,23:62:99:391,0,851 -chr22 36074258 . GA G 1662.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-1.103;DP=67;FS=2.228;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=24.82;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,58:65:99:1700,112,0 -chr22 36074813 . C T 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=2.579;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.04;ReadPosRankSum=-2.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:374,0,1229 -chr22 36075334 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=1.130;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:256,0,484 -chr22 36075597 . A C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr22 36075636 . A T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-1.350;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.30;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:604,0,112 -chr22 36075866 . T C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr22 36075871 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:21:293,21,0 -chr22 36077736 . C G 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.335;DP=40;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.571;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:682,0,691 -chr22 36078284 . C T 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-1.175;DP=22;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:639,0,99 -chr22 36380471 . G A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr22 36416318 . C G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.013;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:390,0,452 -chr22 37595569 . A T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.565;DP=80;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:281,0,2404 -chr22 37611966 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.187;DP=78;FS=5.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:410,0,2244 -chr22 37631336 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=1.964;DP=61;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=4.01;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:273,0,1791 -chr22 37639999 . T C 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=32.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:418,0,139 -chr22 37645224 . C G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.936;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.90;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:256,0,505 -chr22 37796903 . TCA T 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.423;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=16.32;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:66:282,0,66 -chr22 37798993 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.561;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.006;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:284,0,1716 -chr22 37798994 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=1.459;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:311,0,1655 -chr22 37799392 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.961;DP=25;FS=10.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.07;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:230,0,652 -chr22 37799461 . A T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-2.088;DP=37;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:693,0,1467 -chr22 37799555 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:247,0,700 -chr22 37809133 . C A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=2.499;DP=141;FS=12.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=6.81;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,41:141:99:988,0,3858 -chr22 37855553 . C G 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.924;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1250,0,2931 -chr22 37880873 . T G 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=-1.846;DP=69;FS=6.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,30:69:99:1090,0,1219 -chr22 37882237 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=2.337;DP=60;FS=3.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.450;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:955,0,1114 -chr22 37885127 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.027;DP=40;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:770,0,602 -chr22 37885147 . A T 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.811;DP=37;FS=5.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:671,0,579 -chr22 37888434 . A G 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.125;DP=51;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=21.05;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,31:51:99:1102,0,702 -chr22 37953879 . T C 1530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1559,120,0 -chr22 37953969 . A T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.191;DP=47;FS=6.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:533,0,1057 -chr22 37964145 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.032;DP=48;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:631,0,1027 -chr22 37964479 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.683;DP=58;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:455,0,1577 -chr22 37969268 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=1.444;DP=53;FS=14.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:52:99:434,0,1421 -chr22 37969886 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.334;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,879 -chr22 37987040 . C A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.887;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:390,0,281 -chr22 37998379 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.067;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=17.72;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:613,0,490 -chr22 38012700 . GTT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=22.75;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:242,0,166 -chr22 38012899 . C T 677.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=31.39;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:16:706,16,0 -chr22 38013236 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:314,0,246 -chr22 38066549 . G GT 812.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.601;DP=319;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,73:283:99:850,0,5673 -chr22 38067018 . A T 5777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-1.730;DP=337;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.938;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,175:337:99:5806,0,7072 -chr22 38198083 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=-1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,187 -chr22 38866035 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=-0.809;DP=26;FS=21.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=8.49;ReadPosRankSum=-2.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:249,0,1899 -chr22 38866056 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.073;DP=29;FS=14.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:249,0,1899 -chr22 38866060 . C CA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=-1.366;DP=31;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:261,0,1088 -chr22 38866174 . G T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-0.462;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:348,0,1034 -chr22 38867061 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.732;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=11.15;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:229,0,370 -chr22 38867900 . A C 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.684;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:719,0,1218 -chr22 38868411 . C A 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-0.877;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:1012,0,1503 -chr22 38868506 . A G 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-1.526;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=17.01;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:1015,0,1139 -chr22 38869692 . A G 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=-2.747;DP=72;FS=3.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:1236,0,1669 -chr22 38869852 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:343,0,456 -chr22 38870054 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.941;DP=28;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:378,0,964 -chr22 38871196 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-2.335;DP=62;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:710,0,1601 -chr22 39065342 . C G 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr22 39378703 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-1.193;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:363,0,543 -chr22 39415984 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:255,0,387 -chr22 39568978 . TCTTCGCAAATGGAAGCAAAGACATTGATTTAGATGACGCATTGTGCATTTGATTTCACTTAAAACCAGAATATTACATAC T 17192.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.019;DP=384;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,371:372:99:17230,1470,0 -chr22 39624966 . TCCTGTCAGGAGATGCAGAAAGTCTCACACAGGTCTGTGAAGAAATGCATGCTCACAAAACTGAGTGTGGTTTCCCTCA T 961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=3.033;DP=42;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:999,0,6834 -chr22 39650100 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=2.916;DP=44;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:525,0,941 -chr22 39650173 . TCCTGCAGCAGACGCACAGACAGTGATGTGACGTGTTGTTAATCAGTGCAGAGACGGATGTGTTTCAGCTTTA T 1786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.757;DP=57;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.304;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1824,0,2791 -chr22 39650343 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.970;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:316,0,1652 -chr22 39661877 . A G 760.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:58:789,58,0 -chr22 39662772 . A T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:21:305,21,0 -chr22 39662792 . C A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:21:305,21,0 -chr22 39677408 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=15.78;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:265,0,297 -chr22 39684807 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=-0.085;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:769,0,797 -chr22 39686036 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.257;DP=38;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.384;QD=7.23;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:303,0,1020 -chr22 39760666 . T A 1956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.161;DP=141;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,56:139:99:1985,0,2829 -chr22 39777032 . A C 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.484;DP=128;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=6.92;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,37:128:99:914,0,3456 -chr22 39782201 . AT A 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-1.396;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:352,0,381 -chr22 39830934 . C T 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-1.495;DP=92;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=8.39;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:800,0,2361 -chr22 39831225 . T A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.459;DP=85;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:385,0,2485 -chr22 39853715 . G C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.841;DP=40;FS=11.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:297,0,1020 -chr22 39895811 . A G 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:417,33,0 -chr22 40017766 . G A 860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.553;DP=58;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:889,0,996 -chr22 40334937 . C A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.024;DP=272;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.195;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,44:271:99:490,0,8525 -chr22 40335477 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=-1.778;DP=177;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,46:177:99:915,0,4389 -chr22 40526100 . GAGGTCAGTCCTTCTCCTGGCTTAATGCAACATAAGAAATCATTCAGCCTATAAAGTGCTCAGTGTCGTGTTTTATTGAC G 4827.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=1.316;DP=139;FS=8.455;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.922;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,131:139:99:4865,430,0 -chr22 40540913 . A AT 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=-2.208;DP=125;FS=21.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=6.85;ReadPosRankSum=6.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,99:121:99:893,0,188 -chr22 40543058 . TCTGCAATATGAGCGCATCATGTTTATTATAAAAGCAGCAGTGTAACTGAAGCTACGCTGCTCACAGACAGCAAACGCAC T 5744.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=1.877;DP=190;FS=2.241;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=30.24;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,161:164:99:5782,476,0 -chr22 40545291 . C T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.697;DP=169;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,34:168:99:590,0,5042 -chr22 40545947 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.541;DP=180;FS=11.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=1.66;ReadPosRankSum=2.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,29:180:99:327,0,5654 -chr22 40547387 . GCTGAGAAAATCATTTCCACATCATGATGTTCATCTGCTCATTTAAACTGTATTACAATTCAACTGTTTGCTTCTACTCAC G 9766.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=1.689;DP=258;FS=2.429;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=30.62;ReadPosRankSum=-1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,255:258:99:9804,734,0 -chr22 40581542 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:465,0,1027 -chr22 40591485 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.121;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:241,0,1925 -chr22 40597059 . C A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr22 40597065 . A G 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:299,21,0 -chr22 40637987 . G A 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-1.741;DP=289;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=5.52;ReadPosRankSum=3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,74:287:99:1623,0,8001 -chr22 40684597 . G A 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=-1.941;DP=377;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,75:376:99:1360,0,11569 -chr22 40697611 . G A 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.369;DP=256;FS=12.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,72:256:99:1745,0,6819 -chr22 40715785 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-1.718;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:246,0,901 -chr22 40789912 . TA T 545.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.173;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:58:583,58,0 -chr22 40790406 . C T 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=-0.355;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,40:124:99:916,0,2899 -chr22 40852243 . G A 2944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.336;DP=423;FS=0.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,121:423:99:2973,0,11623 -chr22 40954049 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.596;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:640,0,1139 -chr22 40956500 . AG A 281.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:319,30,0 -chr22 40957643 . G A 1032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=14;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:75:1061,75,0 -chr22 40957690 . T C 278.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:19:307,0,19 -chr22 41007919 . A AT 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.743;DP=80;FS=3.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:470,0,1143 -chr22 41067336 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.205;DP=77;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,14:77:99:231,0,2305 -chr22 41076974 . GT G 681.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-1.416;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=11.00;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:719,0,550 -chr22 41143017 . AAGGTACCGTCAGGCCAGATCTGAGTGTATGTTCTGCTTTGTTATGATTGCAATAAATACATCTCTCCCTACTTGT A 8188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=2.132;DP=226;FS=2.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=30.23;ReadPosRankSum=1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,210:226:99:8226,0,100 -chr22 41153643 . G C 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-3.248;DP=105;FS=4.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,11:60:99:843,0,2236 -chr22 41157114 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.707;DP=219;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,42:218:99:706,0,6694 -chr22 41160873 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:266,0,54 -chr22 41161012 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:237,0,372 -chr22 41161461 . G A 481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:510,36,0 -chr22 41161540 . G T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=-0.884;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:338,0,469 -chr22 41161635 . C T 350.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.79;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:7:378,0,7 -chr22 41168938 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-1.311;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:445,0,1193 -chr22 41188508 . GCAGGTGAAAGTTCAGTGGTTTGTGAAAGACTTGAACTGCATTTCTCTGCCATGTCTTTGACTGCTTTCTAGCAAACGTGTGTGATTCTA G 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=-0.519;DP=30;FS=3.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:99:241,0,6048 -chr22 41194172 . C T 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=-2.261;DP=124;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:434,0,3858 -chr22 41195821 . A G 6183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=-0.597;DP=110;FS=6.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=35.44;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:6212,0,1561 -chr22 41196101 . G A 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.701;DP=107;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,43:106:99:1523,0,2194 -chr22 41196260 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.188;DP=102;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:580,0,2975 -chr22 41198227 . T C 1564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.273;DP=126;FS=4.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:1593,0,2535 -chr22 41198473 . A T 3907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-1.167;DP=143;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=27.33;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,92:133:99:3936,0,1039 -chr22 41199007 . A G 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.824;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:769,0,1014 -chr22 41199081 . A G 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 -chr22 41289221 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-1.409;DP=39;FS=11.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:267,0,1003 -chr22 41291830 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.289;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.488;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,290 -chr22 41292460 . T G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-0.965;DP=50;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:286,0,1545 -chr22 41297414 . C A 676.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:705,48,0 -chr22 41302422 . TA T 1165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.272;DP=101;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,42:97:99:1203,0,1245 -chr22 41330347 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=-2.049;DP=145;FS=5.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,25:143:99:348,0,4538 -chr22 41373918 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-1.506;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:244,0,457 -chr22 41376112 . CAA C 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=2.688;DP=41;FS=9.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=5.53;ReadPosRankSum=-2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:264,0,1041 -chr22 41395893 . A G 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:362,0,313 -chr22 41398202 . A C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.788;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:394,0,389 -chr22 41398254 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.239;DP=24;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:281,0,494 -chr22 41453296 . A G 307.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=30.79;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:336,0,15 -chr22 41453702 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=28.18;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:310,0,326 -chr22 41453705 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:310,0,326 -chr22 41454260 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=-0.999;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:591,0,941 -chr22 41457272 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=2.301;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:624,0,225 -chr22 41481910 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.929;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=14.41;ReadPosRankSum=-1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:475,0,495 -chr22 41491287 . A G 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=1.603;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:84:620,0,84 -chr22 41681885 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=26.68;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:295,0,48 -chr22 41739167 . T C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:406,0,283 -chr22 41774905 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=-1.874;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=6.89;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:345,0,1158 -chr22 41776775 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.291;DP=69;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:235,0,2067 -chr22 41808760 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.326;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:308,0,1049 -chr22 41817425 . GATGAGTGTTTATCATTTCCAGTGGTTTTACTGCGTAAACTATATATCCGACTAACAGCAGAACATGTTTGTGTTCTAC G 2181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.494;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=30.33;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,52:57:99:2219,0,128 -chr22 41843175 . T C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr22 41845294 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.447;DP=145;FS=10.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,38:145:99:869,0,7554 -chr22 41957303 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=2.446;DP=46;FS=10.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:253,0,1376 -chr22 41975194 . T C,G 2681.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=0.804;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.614;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:29,61,56:146:99:3674,1376,2429,1390,0,2237 -chr22 41975325 . A G 15171.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=482;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,308:308:99:15200,1062,0 -chr22 42126291 . T G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-3.393;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:273,0,1133 -chr22 42133278 . A G 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.535;DP=251;FS=5.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,52:251:99:907,0,7534 -chr22 42133803 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.893;DP=209;FS=3.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=3.49;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,43:208:99:758,0,6665 -chr22 42133827 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.796;DP=214;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,44:212:99:812,0,6431 -chr22 42134820 . C A 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=-0.545;DP=198;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,52:198:99:1228,0,5348 -chr22 42183447 . G C 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr22 42215773 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.265;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:329,0,331 -chr22 42217428 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=1.173;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:331,0,403 -chr22 42217485 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,317 -chr22 42259716 . GGGTAGGAGAACAGCACTTGAACATTGCATCTGTGTTTATTTTGTATGTGTTATGTAAGGTTGTCTTTCA G 948.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.629;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=29.65;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:986,0,2136 -chr22 42260623 . T G 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.368;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:880,0,315 -chr23 144830 . A T 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.410;DP=34;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.052;QD=29.23;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1022,0,122 -chr23 263263 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.090;DP=41;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:81:389,0,81 -chr23 268222 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=25.52;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:309,0,141 -chr23 268576 . T C 795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:60:824,60,0 -chr23 268604 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:366,0,259 -chr23 268799 . A C 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.832;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.301;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,28:104:99:728,0,6491 -chr23 268806 . C A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=-1.575;DP=114;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,29:114:99:728,0,6491 -chr23 269099 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=1.588;DP=51;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:288,0,1646 -chr23 269657 . TC T 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-0.727;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.136;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:355,0,1463 -chr23 323101 . G C 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-2.121;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.716;QD=26.05;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:992,0,167 -chr23 327189 . AGTGAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCTGTAAACTGATAATAACACTAATAGACGTGTTTGTGTTTCAG A 6517.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=1.794;DP=154;FS=1.472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=32.38;ReadPosRankSum=-3.801 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,146:153:99:6555,462,0 -chr23 336059 . A G 521.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:576,42,0 -chr23 438105 . G T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr23 438256 . G C 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr23 484751 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.702;DP=21;FS=10.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:267,0,454 -chr23 489582 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.368;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:291,0,574 -chr23 506498 . ACTGAGAGAGCCAAACACAAATGCACAATTACAAATCGCAAACATGACACGATTCATGCAAGCGTTAAAGATGTCAGAAGCGTAC A 15259.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.490;DP=348;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=34.20;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,346:348:99:15297,1161,0 -chr23 512539 . C T 4240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-1.755;DP=280;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=15.15;ReadPosRankSum=2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,122:279:99:4269,0,11167 -chr23 512650 . C T 3655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=1.304;DP=241;FS=2.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=15.17;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,103:240:99:3684,0,4750 -chr23 514957 . T C 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.621;ClippingRankSum=-3.126;DP=314;FS=66.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,84:314:99:1961,0,7976 -chr23 518980 . T A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=-2.195;DP=108;FS=2.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,41:107:99:1024,0,1876 -chr23 520494 . T C 5837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=1.599;DP=382;FS=9.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,172:381:99:5866,0,6460 -chr23 523613 . CCCTACAATTAGGCAACACAACAGCATTATTATCAGACATAAATGTAATATTTTGAATAATGATAAGCTGTAAATATGTTCCTCA C 18281.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=1.459;DP=419;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,411:417:99:18319,1415,0 -chr23 543750 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.694;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:335,0,583 -chr23 603247 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:280,0,406 -chr23 608895 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=1.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=28.52;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:399,0,127 -chr23 608908 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:245,0,142 -chr23 612146 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-1.779;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.356;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:394,0,452 -chr23 612318 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.286;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:380,0,309 -chr23 813770 . GAGGTGGGTTGGGAAAACCTTATCATGGTTGGTAATCACTTGGTTTTCTATGATTGACCTTTATATACATCTTTAAACACTTCTGTTTCTATTTTAAT G 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:417,0,2386 -chr23 903925 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=-0.387;DP=11;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=21.62;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:266,0,176 -chr23 904443 . T C 288.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:317,0,18 -chr23 965276 . C A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-1.671;DP=43;FS=9.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:558,0,729 -chr23 965627 . T A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=-0.175;DP=52;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=12.51;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:679,0,587 -chr23 965674 . T C 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=2.135;DP=134;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,24:82:99:661,0,4659 -chr23 965675 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=1.984;DP=135;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:661,0,4659 -chr23 966062 . C T 9465.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=2.319;DP=265;FS=11.707;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=27.97;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,241:265:99:9494,269,0 -chr23 966096 . G A 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-3.225;DP=132;FS=27.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,50:132:99:1812,0,3147 -chr23 967880 . C T 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=4.832;DP=109;FS=33.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=15.81;ReadPosRankSum=-4.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,57:75:99:1752,0,839 -chr23 967881 . T C 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.664;ClippingRankSum=5.371;DP=101;FS=28.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=17.07;ReadPosRankSum=-5.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,57:74:99:1752,0,840 -chr23 968254 . A G 13060.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=-2.296;DP=343;FS=0.804;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.146;QD=28.38;ReadPosRankSum=1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,313:339:99:13089,588,0 -chr23 968424 . TCA T 1036.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=5.896;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=8.29;ReadPosRankSum=-5.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1209,0,1254 -chr23 968562 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-1.796;DP=25;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:357,0,380 -chr23 969102 . C G 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=2.309;DP=61;FS=17.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.70;ReadPosRankSum=-2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,34:53:99:1230,0,651 -chr23 969887 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.344;DP=32;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:241,0,681 -chr23 969899 . C A 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=3.225;DP=49;FS=28.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=24.28;ReadPosRankSum=-3.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,33:44:99:1218,0,408 -chr23 970034 . T C 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-1.556;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:826,0,586 -chr23 987465 . A G 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-1.950;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:597,0,114 -chr23 987487 . T C 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.480;DP=40;FS=1.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:90:890,0,90 -chr23 1349233 . G A 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-0.285;DP=76;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=11.64;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:913,0,1700 -chr23 1947142 . G T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-1.818;DP=26;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:318,0,94 -chr23 2075264 . C CT 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.261;DP=81;FS=4.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:405,0,1013 -chr23 2076632 . C T 1915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-1.682;DP=172;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,59:171:99:1944,0,3956 -chr23 2176355 . T C 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.127;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:394,0,1826 -chr23 2178508 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-3.412;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=7.16;ReadPosRankSum=2.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:372,0,1200 -chr23 2178535 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.723;DP=46;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:536,0,980 -chr23 2180038 . C T 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.470;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:879,0,1367 -chr23 2180461 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.984;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:325,0,2160 -chr23 2180687 . CTA C 360.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.896;DP=48;FS=6.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:398,0,1481 -chr23 2184478 . TTGTGTG T 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=3.281;DP=27;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,653 -chr23 2378775 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-1.481;DP=75;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:331,0,2242 -chr23 2442989 . G A 2177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=1.373;DP=507;FS=3.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,112:507:99:2206,0,14849 -chr23 2519709 . T C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:241,0,276 -chr23 2522575 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.21;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:317,0,205 -chr23 2522582 . G T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.546;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.06;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:317,0,205 -chr23 2560792 . CCTCT C 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.393;DP=13;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:360,0,119 -chr23 2726259 . TGGTAAGTTATTTTTATTCATCGATTTATGTTTTACACTTAAGCAGAAAAAACAATTTCGTTAAACTGTTTGTAACATTTGTTTATCCATGTCTCA T 1674.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=-1.694;DP=52;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=32.21;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,41:46:99:1712,0,119 -chr23 2847271 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-1.968;DP=127;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,24:127:99:394,0,5210 -chr23 2849203 . G T 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.161;DP=95;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:1595,0,1733 -chr23 2852339 . G T 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.297;DP=125;FS=0.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=7.04;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,36:125:99:908,0,3515 -chr23 2859354 . G A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.898;DP=135;FS=4.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:310,0,4271 -chr23 2882409 . C CT 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.494;DP=85;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=3.87;ReadPosRankSum=2.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,29:76:99:366,0,2290 -chr23 2890401 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=33.23;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:54:427,0,54 -chr23 2890403 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:54:427,0,54 -chr23 2894857 . T C 3901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.920;DP=313;FS=0.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,115:313:99:3930,0,13755 -chr23 2894858 . G A 4326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.742;DP=315;FS=0.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,118:315:99:4355,0,6672 -chr23 2901212 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=-2.306;DP=313;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=1.48;ReadPosRankSum=-4.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,48:313:99:490,0,10069 -chr23 2930957 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=1.272;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:831,0,832 -chr23 2930972 . G A 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.847;DP=44;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:584,0,830 -chr23 2933949 . AAGGTCAGCCAAAACGCACACGTGTCATGTAGTGCACTGTTAAACATCTAAACTGATGAATCTGCGCAGGTGATCACGTGTTTTATTTTCTTGTTTGCGTTATGTTTTTTC A 2480.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.803;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:2518,218,0 -chr23 2944989 . T C 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.354;DP=52;FS=5.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:756,0,1097 -chr23 2945494 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.145;DP=39;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:264,0,2832 -chr23 2945498 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=-0.601;DP=42;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:264,0,2832 -chr23 3421781 . A AAT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.290;DP=30;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=8.92;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:305,0,501 -chr23 3422255 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:276,0,887 -chr23 3423788 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.465;DP=29;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:582,0,429 -chr23 3515506 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.192;DP=68;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:321,0,2102 -chr23 3516809 . T C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.776;DP=20;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:378,0,523 -chr23 3516810 . T C 713.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-1.197;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:11:741,11,0 -chr23 3518594 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.212;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,21:68:99:585,0,1790 -chr23 3534597 . CT C 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-1.173;DP=38;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:262,0,457 -chr23 3569997 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:318,0,51 -chr23 3572589 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-1.437;DP=50;FS=4.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=6.02;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:329,0,2489 -chr23 3572596 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.423;DP=57;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:379,0,2774 -chr23 3572600 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-1.873;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:229,0,2856 -chr23 3572932 . A G 2349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-2.358;DP=386;FS=7.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,106:385:99:2378,0,10789 -chr23 3573018 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.388;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=6.04;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:306,0,2845 -chr23 3573019 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.040;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:306,0,2845 -chr23 3574607 . C T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.573;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.257;QD=17.71;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:843,0,757 -chr23 3588523 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.275;DP=53;FS=6.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.001;QD=4.54;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:269,0,2788 -chr23 3588525 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=1.794;DP=59;FS=12.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=5.56;ReadPosRankSum=-2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:356,0,5479 -chr23 3588531 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=1.378;DP=67;FS=10.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:340,0,5479 -chr23 3588539 . C T 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=2.751;DP=88;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=12.28;ReadPosRankSum=-3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1109,0,3222 -chr23 3588595 . C A 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.815;DP=139;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=7.42;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,41:138:99:1059,0,3728 -chr23 3588786 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=-0.594;DP=137;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:378,0,4364 -chr23 3588961 . A G 3175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-2.393;DP=237;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.208;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,85:237:99:3204,0,11937 -chr23 3588962 . T C 3175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-1.265;DP=240;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,87:240:99:3204,0,11933 -chr23 3589200 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-2.313;DP=74;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=5.15;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:409,0,4250 -chr23 3589204 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-2.067;DP=69;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=4.78;ReadPosRankSum=-3.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:358,0,4347 -chr23 3598006 . T C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.598;DP=29;FS=15.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=17.89;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:547,0,400 -chr23 3642990 . G C 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.891;DP=460;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=3.54;ReadPosRankSum=4.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,92:459:99:1658,0,14377 -chr23 3643314 . T C 8463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=1.315;DP=374;FS=22.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=22.63;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,242:373:99:8492,0,4398 -chr23 3667037 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;ClippingRankSum=-0.026;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:239,0,930 -chr23 3725927 . G A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=-0.820;DP=42;FS=2.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.872;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:549,0,830 -chr23 3726749 . GCTTTAAAAGTAACATGTTTACTCATTTTACTTTAAAAGAGTCAACTAATCA G 543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=2.282;DP=77;FS=2.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.372;QD=7.06;ReadPosRankSum=-3.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,20:70:99:581,0,17697 -chr23 3766777 . CTT C 1141.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=2.238;DP=182;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=6.27;ReadPosRankSum=-2.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,46:178:99:1179,0,5702 -chr23 3998135 . A C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=2.007;DP=14;FS=12.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:283,0,181 -chr23 3998326 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-0.978;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:82:314,0,82 -chr23 3998414 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.919;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=23.52;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,175 -chr23 4013141 . G A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.118;DP=44;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=18.18;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:828,0,668 -chr23 4037211 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-0.487;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:395,0,614 -chr23 4131838 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86:310,0,86 -chr23 4137696 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,102 -chr23 4139844 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=15.45;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,315 -chr23 4140539 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,145 -chr23 4298035 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:368,0,533 -chr23 4317348 . TA T 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=-0.231;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=15.42;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:361,0,236 -chr23 4322060 . AAGGTAATTGTTGAAAGAGAATTAAAACTGATCGAATCTTATTGTCTTCTGGAGCTTGTCTTTCATGGTCCTTCTTTTGGTCTTTTGC A 12746.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.005;DP=266;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=34.30;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,258:260:99:12784,1074,0 -chr23 4421010 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.393;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:343,0,1070 -chr23 4421566 . A G 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 -chr23 4534682 . G GT 1369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-3.304;DP=90;FS=1.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=15.22;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,48:90:99:1407,0,1694 -chr23 4573279 . A AAACCCTGC 2525.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2563,146,0 -chr23 4731891 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,244 -chr23 4754010 . C CA 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.063;DP=114;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:797,0,435 -chr23 4812901 . CACCTTAACAACACATACCATTACATTGGGCGTGACTACACGAAGTGCACATCTCTTCTTTACAGTCATGGTTTAAGGTTAAATGTT C 1793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=2.654;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=34.49;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:99:1831,0,901 -chr23 4840805 . G C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-0.755;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:275,0,348 -chr23 4840933 . G T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.810;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=11.53;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:282,0,481 -chr23 4972901 . GCTACACAAAAGGAAAGGACACTCAGTGTAAAACCATTCTGTCAAGTGTGACAATGACAACAACAACATAAAAGTGTATTAAC G 1873.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=3.977;DP=70;FS=3.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=26.77;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,54:68:99:1911,0,4569 -chr23 4979586 . TCCTAAGCACAGGCAGGTAACAAATGATATTACGTGAACTGCATCGCCTTTACACAAGTCTCCAAATTCTGCCTTCACTAACTCA T 3243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=1.347;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=28.99;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:76:99:3281,283,0 -chr23 4979716 . TCCTGATATCAGAGCATACAAAAACAGCATGACTGCATTTATAGTTTCTACTGTAAAGCCTGTGGCCTCAATTGTGTTAAAAGTGATTGTTGTTGTTGTTGTTGGAGAAATTGCTTGTTACTCAAACACATGCACCTGAGGCTCCGCCTA T 2773.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=2.139;DP=91;FS=6.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=30.48;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,67:91:99:2811,0,5393 -chr23 5244811 . CGGTAATAACACATACGATATTAAGTTAAAGACCTCATACAGTGTTGAATAAAATAATGTACTTATTGAATTGTTAATAATCGCGTGGTGTTGATGTGCATA C 5565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-1.177;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,145:176:99:5603,0,3342 -chr23 5652046 . CA C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.849;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:88:246,0,88 -chr23 5815660 . A G 1109.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-1.323;DP=24;FS=2.831;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=30.97;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:46:1138,46,0 -chr23 5815843 . G C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=2.176;DP=40;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:319,0,1230 -chr23 5815849 . G A 1378.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=1.641;DP=39;FS=2.334;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=29.49;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,34:37:22:1407,22,0 -chr23 5815918 . A G 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-3.465;DP=53;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=23.60;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:1279,0,1548 -chr23 5815975 . T A 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=-0.752;DP=83;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=10.53;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,28:69:99:902,0,3055 -chr23 5816103 . T G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.224;DP=65;FS=3.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=13.06;ReadPosRankSum=2.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:877,0,1603 -chr23 5816140 . G C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-1.172;DP=57;FS=5.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=5.72;ReadPosRankSum=2.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:354,0,2307 -chr23 5816284 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=-1.680;DP=28;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:375,0,417 -chr23 5816378 . A T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.421;DP=19;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:458,0,236 -chr23 6061788 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=-2.340;DP=27;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.546;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:397,0,506 -chr23 6061916 . C T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.643;DP=27;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:410,0,446 -chr23 6061928 . G A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=-0.176;DP=27;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:338,0,555 -chr23 6062039 . A T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.076;DP=39;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=15.33;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:626,0,632 -chr23 6119840 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=18.10;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:336,0,281 -chr23 6120251 . C A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.097;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=13.57;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:571,0,861 -chr23 6122504 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=-1.609;DP=33;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=14.14;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:495,0,606 -chr23 6124469 . C T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=2.266;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=12.14;ReadPosRankSum=-2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:429,0,767 -chr23 6124559 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=-0.146;DP=41;FS=4.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:609,0,846 -chr23 6125039 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-1.936;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:378,0,351 -chr23 6125089 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.473;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:295,0,295 -chr23 6370500 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.386;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,416 -chr23 6472534 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.604;DP=54;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:703,0,1250 -chr23 6472737 . A G 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=-0.814;DP=87;FS=13.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,36:87:99:1227,0,1671 -chr23 6481645 . T G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-1.734;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:33:723,0,33 -chr23 6691675 . C CT 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.404;DP=98;FS=1.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:511,0,1301 -chr23 6691796 . G A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-1.347;DP=178;FS=5.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=5.17;ReadPosRankSum=2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,57:178:99:948,0,8396 -chr23 6724400 . CA C 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-1.509;DP=113;FS=5.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:495,0,2743 -chr23 6725758 . A T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-1.059;DP=99;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.841;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:419,0,3168 -chr23 6744677 . T A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=-2.265;DP=87;FS=2.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:397,0,3381 -chr23 6744830 . A C 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=3.705;DP=93;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,25:93:99:629,0,2629 -chr23 6744865 . T C 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-0.503;DP=113;FS=3.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=7.39;ReadPosRankSum=-3.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,34:112:99:863,0,3080 -chr23 6744881 . A G 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-2.057;DP=114;FS=1.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:113:99:1266,0,2562 -chr23 6745067 . C G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.637;DP=114;FS=0.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:819,0,3001 -chr23 6745087 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.184;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,30:107:99:707,0,2718 -chr23 6747980 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:347,0,371 -chr23 6751091 . A G 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.614;DP=109;FS=8.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:683,0,2879 -chr23 6753630 . G A 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.022;DP=133;FS=1.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,38:133:99:944,0,3605 -chr23 6753851 . G A 1079.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=-0.907;DP=146;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.071;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,43:145:99:1108,0,3849 -chr23 6755246 . T G 2297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.069;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=25.25;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,62:91:99:2326,0,787 -chr23 6755273 . A C 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=2.073;DP=77;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,47:77:99:1612,0,1017 -chr23 6755333 . A G 1819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.869;DP=92;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=19.78;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,53:92:99:1848,0,1373 -chr23 6755354 . C A 2016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.509;DP=116;FS=0.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,61:116:99:2045,0,2022 -chr23 6757356 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=4.248;DP=96;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=2.76;ReadPosRankSum=-2.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,18:96:99:293,0,2948 -chr23 6757386 . T C 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=1.771;DP=86;FS=1.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,34:86:99:1244,0,3645 -chr23 6757392 . T C 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.810;DP=80;FS=3.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=15.20;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,30:80:99:1244,0,3702 -chr23 6758937 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.981;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=2.36;ReadPosRankSum=3.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,16:94:99:252,0,3060 -chr23 6761489 . G C 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.002;DP=149;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,40:149:99:944,0,4093 -chr23 6761939 . C A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-1.580;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:442,0,4649 -chr23 6764688 . G C 2295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.787;DP=168;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,67:168:99:2324,0,5084 -chr23 6764788 . C T 2440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=-0.168;DP=143;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,76:143:99:2469,0,2438 -chr23 6764806 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-1.290;DP=137;FS=5.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,25:137:99:390,0,4301 -chr23 6766060 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.983;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=5.38;ReadPosRankSum=-0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,36:146:99:814,0,4267 -chr23 6766086 . A G 2261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-0.614;DP=161;FS=1.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,66:161:99:2290,0,3226 -chr23 6766365 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=4.456;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=4.78;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:320,0,1741 -chr23 6766382 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=4.572;DP=52;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=4.92;ReadPosRankSum=-4.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:284,0,3069 -chr23 6766476 . T G 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-0.594;DP=87;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:2006,0,1044 -chr23 6766511 . T C 3170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=-0.106;DP=126;FS=4.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,87:126:99:3199,0,1064 -chr23 6766646 . T A 3881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.329;DP=126;FS=5.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,100:126:99:3910,0,481 -chr23 6766776 . A C 2890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.000;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,87:138:99:2919,0,1654 -chr23 6766800 . T G 2108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.352;DP=142;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,62:142:99:2137,0,2639 -chr23 6767065 . A G 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=-0.235;DP=125;FS=0.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=17.06;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,61:124:99:2161,0,2350 -chr23 6767118 . C A 2776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-2.646;DP=174;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=15.96;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:2805,0,3222 -chr23 6767330 . A G 2822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.566;DP=164;FS=4.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,79:164:99:2851,0,2702 -chr23 6767504 . C G 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=-1.123;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:65:1252,0,65 -chr23 6777735 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.846;DP=103;FS=3.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=4.50;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:492,0,2967 -chr23 6785993 . T C 2744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-2.431;DP=159;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,85:158:99:2773,0,2625 -chr23 6786035 . G A 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.435;DP=146;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.981;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,53:146:99:1300,0,8579 -chr23 6786304 . T C 5580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=1.030;DP=148;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=28.06;ReadPosRankSum=-1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,100:148:99:5609,0,2906 -chr23 6786318 . A G 4371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=1.990;DP=136;FS=7.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=32.15;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,82:136:99:4400,0,4161 -chr23 6786451 . A AT 963.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-2.356;DP=139;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=6.93;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,47:121:99:1001,0,1600 -chr23 6786589 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=-2.887;DP=155;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,33:155:99:356,0,11184 -chr23 6786612 . T C 3444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.197;DP=204;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.292;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,87:203:99:3473,0,4114 -chr23 6786731 . T C 6904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-0.443;DP=249;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,180:249:99:6933,0,1709 -chr23 6812117 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=2.824;DP=19;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=26.94;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:540,0,132 -chr23 6814590 . G A 498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:527,39,0 -chr23 6818734 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=-0.320;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:232,0,1205 -chr23 6847549 . A T 533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:562,39,0 -chr23 6856056 . T C 1953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=1.091;DP=238;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=8.21;ReadPosRankSum=2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,75:236:99:1982,0,6367 -chr23 6984175 . G C 1775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=3.602;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,45:60:99:1804,0,336 -chr23 7062695 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=-0.458;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=6.33;ReadPosRankSum=1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:421,0,2712 -chr23 7295154 . G C 1133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-2.812;DP=71;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,36:71:99:1162,0,1225 -chr23 7566241 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.694;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:273,0,620 -chr23 7575878 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.227;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:363,0,171 -chr23 7576396 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.582;DP=48;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:344,0,847 -chr23 7614944 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:55:333,0,55 -chr23 7615431 . T C 2194.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.573;DP=67;FS=7.147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=32.76;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2223,160,0 -chr23 7615563 . T C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.555;DP=38;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:369,0,357 -chr23 7615906 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.922;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:57:235,0,57 -chr23 7650229 . G T 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=-0.282;DP=242;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,80:242:99:2171,0,6034 -chr23 7650265 . G T 3025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.182;DP=237;FS=8.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,88:236:99:3054,0,4888 -chr23 7661582 . AC A 784.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=1.344;DP=69;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:822,0,1412 -chr23 7662629 . C CT 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-0.232;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQ0=0;MQRankSum=3.233;QD=8.28;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:294,0,1417 -chr23 7663838 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.302;DP=48;FS=6.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:645,0,1026 -chr23 7665717 . T TA 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=-1.397;DP=60;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,16:42:99:260,0,626 -chr23 7666547 . G T 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.418;DP=56;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:971,0,1044 -chr23 7765747 . C T 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=-0.211;DP=93;FS=7.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,34:93:99:1129,0,2078 -chr23 7789438 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,336 -chr23 7831239 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,134 -chr23 7839826 . G A 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.529;DP=32;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:567,0,538 -chr23 7846950 . G A 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-1.125;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,38:65:99:1340,0,978 -chr23 7848072 . TG T 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-1.071;DP=67;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:425,0,1159 -chr23 7850265 . CAA C 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.019;DP=45;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:601,0,583 -chr23 7867602 . G T 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=-0.701;DP=97;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,38:97:99:1171,0,1752 -chr23 7878296 . G A 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-0.434;DP=151;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,58:151:99:1931,0,3089 -chr23 7912533 . T G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.068;DP=41;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:514,0,886 -chr23 8806810 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-2.074;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,216 -chr23 8807263 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-1.626;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:457,0,451 -chr23 8813119 . TGC T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.741;DP=11;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=18.43;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,192 -chr23 8825858 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=24.89;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:302,0,94 -chr23 8825988 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-1.416;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:439,0,794 -chr23 8856333 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr23 8857532 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=26.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:95:294,0,95 -chr23 8904523 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=-0.022;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=21.79;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:660,0,947 -chr23 8904527 . T A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.741;DP=30;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=21.06;ReadPosRankSum=-1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:660,0,947 -chr23 8906493 . C T 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-1.352;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.607;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:999,0,210 -chr23 9174088 . C T 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr23 9247468 . C G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:278,0,52 -chr23 9335451 . T A 1605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.717;ClippingRankSum=5.743;DP=120;FS=9.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=13.38;ReadPosRankSum=-5.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,59:120:99:1634,0,2446 -chr23 9337971 . G A 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.528;DP=131;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:1878,0,5602 -chr23 9337977 . G C 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.647;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:1878,0,5569 -chr23 9356980 . A G 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-0.150;DP=165;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,69:165:99:2494,0,3305 -chr23 9394688 . C CT 1074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.431;DP=132;FS=0.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,51:129:99:1112,0,1822 -chr23 9395141 . A AT 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.976;DP=65;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=5.00;ReadPosRankSum=-1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:362,0,1104 -chr23 9504250 . T C 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.206;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.040;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:319,0,1454 -chr23 9504400 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.821;DP=33;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=12.69;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:447,0,693 -chr23 9504605 . G T 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=-0.278;DP=48;FS=10.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=16.62;ReadPosRankSum=-2.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:48:99:826,0,1427 -chr23 9506098 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.646;DP=35;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:558,0,1337 -chr23 9506615 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-1.427;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:251,0,741 -chr23 9506667 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=1.064;DP=20;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:383,0,367 -chr23 9506723 . G A 1032.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:83:1061,83,0 -chr23 9506747 . A T 2163.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:2192,154,0 -chr23 9509194 . G A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.059;DP=74;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=15.82;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1199,0,1240 -chr23 9522659 . C T 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=1.698;DP=56;FS=15.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=15.23;ReadPosRankSum=2.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,25:56:99:881,0,1090 -chr23 9525347 . C T 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.397;DP=58;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,23:58:99:804,0,1244 -chr23 9593442 . T A 1162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=1.069;DP=54;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=21.53;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1191,0,708 -chr23 9656411 . C CA 433.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.317;ClippingRankSum=0.032;DP=92;FS=7.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,28:88:99:471,0,1617 -chr23 9659270 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-1.461;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:245,0,311 -chr23 9660621 . A G 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=1.340;DP=94;FS=3.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:570,0,2827 -chr23 9672696 . CCAGGTGCGACTCGTGATTTCTCCATGCAGTAACCCATTTTCTTCATGCACTGATCTGTTCACTCATCTGATTGATTCATTTCTGATTCA C 11763.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=1.504;DP=353;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.285;QD=33.33;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,333:340:99:11801,944,0 -chr23 9681622 . C CATCGAG 1995.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.587;DP=152;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:2033,0,2893 -chr23 9875249 . T A 2034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.069;DP=100;FS=3.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,62:99:99:2063,0,1244 -chr23 9935754 . C T 3785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=-1.956;DP=224;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=16.90;ReadPosRankSum=3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,110:224:99:3814,0,4062 -chr23 9941849 . G A 3451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-0.325;DP=194;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,105:193:99:3480,0,3109 -chr23 10056288 . C T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.068;DP=40;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.67;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:655,0,741 -chr23 10056384 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.166;DP=50;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:717,0,934 -chr23 10056807 . C G 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.999;DP=62;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=17.87;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1136,0,1127 -chr23 10244097 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-1.385;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:396,0,473 -chr23 10269095 . A G 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=1.314;DP=188;FS=0.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=7.99;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,59:188:99:1530,0,5052 -chr23 10271780 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=-2.933;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=6.09;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:467,0,3979 -chr23 10283996 . A T 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=5.383;DP=147;FS=16.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=7.77;ReadPosRankSum=-3.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,46:147:99:1171,0,3771 -chr23 10284010 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=5.332;DP=116;FS=14.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=2.58;ReadPosRankSum=-3.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,23:116:99:327,0,3473 -chr23 10284034 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-1.713;DP=146;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.259;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,24:146:99:294,0,4675 -chr23 10357345 . GCTATTGAAATGAAAAATAACGATAAAAAATAAAGATCAGTTTCACTCCTTGCATAATACTGAAAAGAATATTTGACATCTTGCAGTTTGTGTAGTTGCGTAC G 14571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=288;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,284:284:99:14609,1329,0 -chr23 10457412 . AGTAAGTTTACCTCTGAAGAAGAAAGTGCATGCACATTTGAGTAGATTTATTTTGTATGGTTTGTAACAAATATCCTCTCTCCTGCAG A 1955.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=2.440;DP=347;FS=12.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=5.64;ReadPosRankSum=-2.319 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,317:323:99:11064,758,0 -chr23 10511961 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.115;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:294,0,2023 -chr23 10523730 . C T 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.566;DP=87;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.989;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,40:87:99:1446,0,1563 -chr23 10525989 . AAGGTCTGAGAAAAGTATCTATTTGTGAAGCTCTATGATTGGGCAAAAAAATCGATATCTCCATGTCTCCAATTATTTTTGTTTTCTTCTGCTC A 3862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.513;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3900,383,0 -chr23 10677284 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.508;DP=50;FS=1.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:336,0,1312 -chr23 10744754 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-2.566;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:383,0,3771 -chr23 10744882 . GA G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.291;DP=38;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:399,0,528 -chr23 10802751 . A G 921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=-1.106;DP=112;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.269;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,36:111:99:950,0,2828 -chr23 11557231 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.109;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.992;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:290,0,627 -chr23 11968353 . C A 206.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:235,0,20 -chr23 12592249 . A T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=-0.044;DP=109;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=2.47;ReadPosRankSum=2.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,19:109:99:298,0,3531 -chr23 12593535 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.046;DP=48;FS=4.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:336,0,1127 -chr23 12593590 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-0.187;DP=50;FS=5.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:245,0,1470 -chr23 12630490 . TA T 523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:561,49,0 -chr23 12632197 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr23 12632530 . G A 917.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-2.154;DP=25;FS=5.229;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:26:946,26,0 -chr23 12632598 . A T 2221.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=-0.802;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=31.29;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2250,157,0 -chr23 12632647 . C A 527.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.810;DP=21;FS=6.990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=25.14;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5:555,5,0 -chr23 12632923 . G A 1161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1190,81,0 -chr23 12632932 . C T 1161.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:81:1190,81,0 -chr23 12633168 . A G 4059.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.211;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=31.23;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:99:99:4088,286,0 -chr23 12633199 . A G 2806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.166;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2835,196,0 -chr23 12633269 . A G 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 -chr23 12633587 . C T 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr23 12641699 . A G 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,44:44:99:1654,0,176 -chr23 12980935 . C CA 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-4.058;DP=389;FS=5.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,68:374:99:438,0,8515 -chr23 12992485 . AGTAGGATCAACATGTGATTTACTTCAGACATGCTCCGAGATTTTCAAGAAATTAAGTATGATGTAATGTGTGTGACTAG A 12319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=1.123;DP=312;FS=12.230;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=30.11;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,305:312:99:12357,1019,0 -chr23 13012618 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.644;DP=114;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,20:114:99:306,0,3705 -chr23 13021367 . A AT 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=-0.368;DP=176;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,38:151:99:344,0,2787 -chr23 13045368 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:66:279,0,66 -chr23 13047462 . G A 13661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-0.473;DP=286;FS=1.307;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=32.97;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:43,217:260:99:13690,118,0 -chr23 13047527 . G A 5131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.904;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,117:303:99:5160,0,7784 -chr23 13047737 . G T 4832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=1.409;DP=299;FS=0.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,137:267:99:4861,0,5501 -chr23 13047978 . C A 9329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-5.394;DP=178;FS=1.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,76:101:99:9358,0,9607 -chr23 13047985 . G A 9471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=-4.292;DP=180;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=32.75;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,87:109:99:9500,0,9605 -chr23 13048102 . G A 9462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=-1.374;DP=298;FS=5.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=31.75;ReadPosRankSum=-3.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,97:270:99:9491,0,9603 -chr23 13048174 . C CAA 9440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=-3.933;DP=271;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=34.84;ReadPosRankSum=3.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,176:256:99:9478,0,9605 -chr23 13048315 . G T 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=-0.808;DP=204;FS=15.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=33.35;ReadPosRankSum=-4.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,49:170:99:6832,0,4388 -chr23 13048393 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=-0.758;DP=207;FS=20.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,37:169:99:313,0,10099 -chr23 13048503 . C T 5333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.257;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=23.71;ReadPosRankSum=-1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,116:123:99:5362,0,4590 -chr23 13048610 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=3.070;DP=67;FS=9.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=6.40;ReadPosRankSum=-2.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:457,0,2711 -chr23 13048627 . G GT 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=1.204;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,2:28:99:457,0,2711 -chr23 13048721 . A C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.960;DP=24;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=24.49;ReadPosRankSum=-2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:616,0,175 -chr23 13048745 . A C 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=2.057;DP=48;FS=23.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=27.37;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:99:1342,0,134 -chr23 13048849 . A G 4246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=2.838;DP=134;FS=7.343;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=31.69;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,94:100:99:4275,255,0 -chr23 13048850 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=3.129;DP=135;FS=7.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:685,0,3120 -chr23 13048950 . G A 1248.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-0.491;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=27.34;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:52:1277,52,0 -chr23 13048987 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=2.335;DP=20;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=22.34;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:83:475,0,83 -chr23 13049023 . G GAA 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-1.524;DP=16;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:373,0,259 -chr23 13049334 . C T 2991.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-2.499;DP=99;FS=5.105;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=30.22;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,76:86:13:3020,13,0 -chr23 13049443 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=-2.736;DP=95;FS=3.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:276,0,4484 -chr23 13049461 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.864;DP=101;FS=34.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=3.04;ReadPosRankSum=-2.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:335,0,3845 -chr23 13049484 . G GA 625.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.362;DP=73;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,24:62:99:663,0,1840 -chr23 13049487 . A T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.954;DP=70;FS=3.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:312,0,3109 -chr23 13049594 . T C 1667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-1.822;DP=41;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=27.60;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:34:1696,0,34 -chr23 13049878 . T A 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-0.849;DP=66;FS=4.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,34:41:99:1340,0,529 -chr23 13049955 . G A 3962.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.090;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=29.94;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,69:76:80:3991,80,0 -chr23 13049968 . C G 3973.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-1.051;DP=98;FS=3.486;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,58:66:91:4002,91,0 -chr23 13050056 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-0.511;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.36;ReadPosRankSum=2.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:250,0,1061 -chr23 13710884 . GC G 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=-2.295;DP=33;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.765;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:323,0,394 -chr23 13881047 . C A 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=20.43;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:539,0,341 -chr23 13921024 . CAT C 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-2.518;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:438,0,322 -chr23 13957012 . T TA 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-0.077;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=9.72;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:388,0,280 -chr23 13957325 . GT G 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.691;DP=57;FS=8.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.163;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:518,0,729 -chr23 13957718 . A G 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.051;DP=83;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:1227,0,1706 -chr23 14024672 . C T 242.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:270,0,11 -chr23 14294994 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr23 14374139 . T C 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.971;DP=46;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:846,0,735 -chr23 14374828 . G A 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.522;DP=48;FS=2.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=21.54;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:1062,0,586 -chr23 14375229 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=-1.193;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=11.43;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:314,0,551 -chr23 14375462 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.867;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:287,0,1450 -chr23 14376971 . C CA 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.469;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,25:74:99:434,0,2005 -chr23 14377240 . CCA C 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.264;DP=69;FS=7.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:525,0,1955 -chr23 14445026 . G A 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-1.041;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,29:63:99:983,0,1177 -chr23 14520994 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-2.057;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1090,0,1053 -chr23 14521080 . A T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.450;DP=130;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,27:122:99:537,0,3712 -chr23 14521099 . A T 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.526;DP=120;FS=2.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.972;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,65:113:99:2192,0,1677 -chr23 14892640 . A C 1681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.886;DP=99;FS=6.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1710,0,1810 -chr23 14899308 . T A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=3.596;DP=46;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:579,0,1026 -chr23 14945317 . C T 1554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.611;DP=122;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=12.74;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,48:122:99:1583,0,2420 -chr23 14945542 . T C 1282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=-0.952;DP=72;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=17.82;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,36:72:99:1311,0,1301 -chr23 14965238 . ACTGCAGTAAAGAGAAGAAAATCCAGTTAAGATCAGCTCATTTGCCAATAATCAATGTGTTTTGATCCTGTCAC A 5474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-1.889;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,134:136:99:5512,398,0 -chr23 14965386 . G A 1717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-2.429;DP=107;FS=0.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.286;QD=16.05;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,51:107:99:1746,0,2845 -chr23 15101843 . T A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.484;DP=47;FS=6.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:724,0,950 -chr23 15104026 . CA C 657.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-2.868;DP=58;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=11.34;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:52:99:695,0,567 -chr23 15104897 . GT G 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.652;DP=77;FS=2.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,29:67:99:608,0,703 -chr23 15153513 . A T 725.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:54:754,54,0 -chr23 15153946 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-0.922;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:55:324,0,55 -chr23 15154277 . T A 336.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.92;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:365,0,15 -chr23 15154748 . T C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:30:423,30,0 -chr23 15154811 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.633;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=27.08;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:617,0,119 -chr23 15154903 . T G 816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.552;DP=25;FS=5.006;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:60:845,60,0 -chr23 15156016 . A T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-1.695;DP=92;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:521,0,1794 -chr23 15156091 . A G 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:57:796,57,0 -chr23 15156123 . A G 2070.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:2099,147,0 -chr23 15156194 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.137;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:352,0,1114 -chr23 15156809 . A T 335.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 -chr23 15157443 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.810;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:414,0,290 -chr23 15157492 . A C 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:803,57,0 -chr23 15157997 . C CA 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.940;DP=23;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=19.94;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:31:496,0,31 -chr23 15316295 . C T 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.843;DP=67;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:908,0,1396 -chr23 15673939 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-1.868;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=25.55;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:82:386,0,82 -chr23 16438371 . G A 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr23 16443898 . C T 14163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=2.135;DP=534;FS=31.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=26.52;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,149:248:99:14192,0,734 -chr23 16443978 . C CTT 14153.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.496;DP=317;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=30.83;ReadPosRankSum=1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,222:225:99:14191,0,762 -chr23 16444064 . A G 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=5.919;DP=97;FS=30.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=9.07;ReadPosRankSum=-3.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:908,0,1728 -chr23 16444131 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.560;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:75:979,0,75 -chr23 16445269 . T G 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:479,33,0 -chr23 16445340 . T G 2509.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2989,220,0 -chr23 16445391 . C T 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.580;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=25.01;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,37:51:99:1429,0,362 -chr23 16445550 . G C 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr23 16447612 . T G 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:656,48,0 -chr23 16447669 . A G 593.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.735;DP=21;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:12:621,12,0 -chr23 16447688 . A C 765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:57:794,57,0 -chr23 16447809 . G GA 1210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.335;DP=137;FS=2.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,50:87:99:1248,0,1128 -chr23 16448213 . T A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=-0.731;DP=137;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:361,0,5912 -chr23 16448219 . T C 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.144;DP=139;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=4.70;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:682,0,3594 -chr23 16448321 . A T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:469,36,0 -chr23 16448998 . G A 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=2.012;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,35:75:99:1271,0,2827 -chr23 16449005 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-2.408;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:399,0,3703 -chr23 16449085 . C A 238.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:23:267,23,0 -chr23 16449317 . T G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-3.123;DP=44;FS=2.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=6.27;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:304,0,172 -chr23 16449887 . T A 2463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=1.498;DP=426;FS=43.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,96:317:99:2492,0,8798 -chr23 16449986 . C T 2480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-7.053;DP=266;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.171;QD=9.33;ReadPosRankSum=3.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,71:169:99:2509,0,3427 -chr23 16450032 . T C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=5.001;DP=206;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:676,0,2793 -chr23 16450051 . A T 10482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:10511,741,0 -chr23 16450066 . A C 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-3.665;DP=162;FS=51.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.253;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:982,0,1496 -chr23 16450108 . TG T 627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=-0.853;DP=246;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:665,0,2586 -chr23 16450143 . TA T 1351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-2.758;DP=238;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,49:100:99:1389,0,1413 -chr23 16450189 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.692;DP=107;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:355,0,1315 -chr23 16450211 . A C 3660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:99:3689,265,0 -chr23 16450538 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:57:266,0,57 -chr23 16451768 . C T 1836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1865,134,0 -chr23 16451826 . G A 8186.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=-3.764;DP=348;FS=48.102;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=23.53;ReadPosRankSum=3.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,201:225:99:8215,334,0 -chr23 16689435 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr23 16735786 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr23 16858696 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:296,0,316 -chr23 16917013 . T C 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr23 16917030 . T C 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:557,39,0 -chr23 16919815 . AAGGTAGCTGCCAACGACTGTTATTATTCTTTAGATTTTGTACTGTAACATTGTCAGAAGTAGCTTTCGTGTTTTCATTCGT A 2515.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.098;DP=63;FS=2.254;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=32.87;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:99:2553,221,0 -chr23 16975703 . G A 374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:403,30,0 -chr23 16983429 . AGTGAGTAGATAATAATGACAGTTGTACCCATATAATTAAACCATCATTGTCACAGTGTTTGCTTCTGCTCAATTTCAG A 985.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.884;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=14.50;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,48:56:99:1738,0,3297 -chr23 16983449 . AGTTGTACCCATATAATTAAACCATCATTGTCACAGTGTTTGCTTCTGCTCAATTTCAGACG A 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.482;DP=64;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:303,0,4934 -chr23 17044838 . A AT 3445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-2.990;DP=434;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,149:384:99:3483,0,5747 -chr23 17071498 . C T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=-4.557;DP=99;FS=32.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,26:60:99:975,0,2538 -chr23 17071518 . T C 3435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-5.736;DP=225;FS=10.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=15.27;ReadPosRankSum=-2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,88:120:99:3464,0,984 -chr23 17071580 . A G 4170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=-0.780;DP=284;FS=5.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=14.69;ReadPosRankSum=3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,109:150:99:4199,0,1164 -chr23 17118834 . AAGGTAATTTCATATACTTAAGACAACAATAAGCGTCACTAGCTTTAAGTAACATGTCTTTTCTGGTGTACTTATT A 2787.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.417;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:2825,226,0 -chr23 17150112 . A G 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=-0.407;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:696,0,706 -chr23 17606972 . T C 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr23 17645801 . C CA 402.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-1.366;DP=91;FS=1.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:440,0,1372 -chr23 18173629 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-2.060;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:245,0,436 -chr23 18206334 . C G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.559;DP=59;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:286,0,1777 -chr23 18545419 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=0.831;DP=235;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=1.20;ReadPosRankSum=0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,34:235:99:310,0,7741 -chr23 18550529 . T A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=1.412;DP=276;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,54:275:99:910,0,8428 -chr23 18731709 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.175;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.461;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:305,0,2515 -chr23 18733254 . T TG 623.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=3.093;DP=34;FS=3.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=18.35;ReadPosRankSum=-3.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:662,0,1148 -chr23 18743265 . T A 1043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.932;ClippingRankSum=1.694;DP=716;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.914;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:607,107:714:99:1072,0,30500 -chr23 18764242 . ATACCTGCATGACAAAACAACAACAAAAAAGGGATGTCAATTTAAATTCAATGAATAGAGAACTTTTTAAAGTTCCGACTCAAAAAAAAATAAAATC A 3053.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.517;DP=84;FS=4.362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,75:80:74:3091,74,0 -chr23 18897824 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.985;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.35;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:410,0,415 -chr23 18924421 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-2.025;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:232,0,258 -chr23 18924433 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=1.562;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=23.32;ReadPosRankSum=-3.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:588,0,224 -chr23 18927575 . A G 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.753;DP=25;FS=2.623;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=33.79;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:32:873,32,0 -chr23 18927701 . G C 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.189;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=33.77;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:70:1244,0,70 -chr23 18927735 . T C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.120;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:660,0,391 -chr23 18931525 . A C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.401;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:325,0,452 -chr23 18931549 . A G 648.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:677,48,0 -chr23 18933673 . A G 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=2.079;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=29.69;ReadPosRankSum=-2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:84:533,0,84 -chr23 18934095 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.016;DP=60;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:425,0,1659 -chr23 18935524 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.498;DP=60;FS=4.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:309,0,1768 -chr23 18936965 . T C 1755.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=-0.618;DP=51;FS=4.081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=34.43;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,46:51:14:1784,14,0 -chr23 18937866 . T C 1822.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.269;DP=57;FS=4.460;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.432;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,49:54:20:1851,20,0 -chr23 18939723 . T G 1453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.105;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,55:76:99:1482,0,370 -chr23 18939749 . A G 2962.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.730;DP=81;FS=3.644;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,75:81:99:2991,141,0 -chr23 18941564 . T C 2044.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=1.586;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=24.98;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:2073,116,0 -chr23 18944837 . T C 2710.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.610;DP=81;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,71:81:20:2739,0,20 -chr23 18948617 . G C 1422.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=-2.175;DP=36;FS=6.722;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.278;QD=29.97;ReadPosRankSum=2.106 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:36:33:1451,33,0 -chr23 18948618 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-1.466;DP=36;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:296,0,2043 -chr23 18948626 . C A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=1.156;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:968,0,745 -chr23 18965784 . C T 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.415;DP=93;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=19.58;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:99:1849,0,1432 -chr23 18965859 . G A 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.552;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,35:110:99:943,0,2910 -chr23 18965880 . T A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-1.141;DP=84;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,46:83:99:1560,0,1350 -chr23 19038988 . A G 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.350;DP=88;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,38:88:99:1328,0,1753 -chr23 19040124 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.115;DP=128;FS=0.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,31:127:99:710,0,3855 -chr23 19041867 . G A 1657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.003;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,48:104:99:1686,0,1883 -chr23 19240791 . C T 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.277;DP=62;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=21.71;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:1374,0,791 -chr23 19242878 . G A 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=2.699;DP=123;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=12.39;ReadPosRankSum=-2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:1552,0,2669 -chr23 19243317 . C T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.208;DP=151;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,50:151:99:1382,0,3875 -chr23 19282030 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.826;DP=72;FS=3.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:421,0,1994 -chr23 19306325 . GCTGTTTTACATAGATCAAGAAATGAACCCATGCAAAACACACTTTCACTTCAACTTCCTCTCGACCTTTCTAGACTGATGTGTGAAACCACTTCCTGGAGCAGTATCAGATTGGGTCTCTTCCATGACCTGCTTGTTATCCTTTTGGCCTGACAATGACCTCAGTGAGACTGGACGTGCTGTACTAAAATGAAACCCTGCTGAAAAGTGTAGAGGGAAGCGGTTAC G 2806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=3.555;DP=74;FS=1.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,68:74:99:2844,0,688 -chr23 19467255 . A G 400.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:429,30,0 -chr23 19469911 . A AT 268.70 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.290;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:305,6,0 -chr23 19489815 . TA T 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-0.347;DP=21;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:279,0,185 -chr23 19775120 . AT A 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=103;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.974;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,35:99:99:807,0,1536 -chr23 19892419 . CT C 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.538;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:92:316,0,92 -chr23 19992840 . AGTAGATTATATTAAATTACTGAAAAAAAATGCTTCTGAAATAATCAATCAGACTGAGAGATGAACGAATTTACCATGTTTAAATGCTCAAATGTTATATTTTGGTTTCAG A 1825.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.120;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,48:60:99:1863,0,487 -chr23 19999747 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=-0.810;DP=67;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:837,0,1424 -chr23 20000460 . C G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.195;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:278,0,453 -chr23 20001330 . TCTAAAGAGAAAGAAACCCAACATCAGCGACCGCTTGACAATTACAACTTAGTTTTCATTTGTGTTGCATTAC T 8455.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-2.106;DP=224;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=28.35;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,206:210:99:8493,626,0 -chr23 20001547 . A T 4115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=-2.896;DP=572;FS=7.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.666;QD=7.20;ReadPosRankSum=3.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:403,168:571:99:4144,0,15042 -chr23 20004225 . TCTGTAACGTACACAATAACAATTGATTTAATAAGGACAACGCGTGTATATCATTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCGACAAAAAGGAAGAGAGCAAAGCACCGCGCTCTTACCACGCACTCAC T 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.066;DP=144;FS=7.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,30:98:99:683,0,14931 -chr23 20004226 . CTGTA C 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=4.358;DP=92;FS=15.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=13.04;ReadPosRankSum=-3.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,48:92:99:1237,0,6315 -chr23 20004233 . GTA G 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=4.155;DP=93;FS=18.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,48:93:99:1237,0,6315 -chr23 20004238 . CAA C 1199.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=4.686;DP=95;FS=18.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=12.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,48:95:99:1237,0,6315 -chr23 20072663 . C T 4123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.523;DP=320;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=12.89;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,127:319:99:4152,0,6315 -chr23 20089422 . TGGTAAGACTTGCTCTTAATGATCATGCTAATGTTTATTTTGTACTGTAATGCATCTATGTCTGTTGCCCTGTGCACTGCA T 12919.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=1.317;DP=294;FS=6.256;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=31.08;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,288:294:99:12957,1080,0 -chr23 20105138 . AGTGAGATTCATTTATTTACTTGTTATATCTCTTTTTAAGTGGTTAAAACCTTCTAAATGGAGGATTTGGTCTCTTTACAG A 3982.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=1.694;DP=92;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:4020,310,0 -chr23 20110276 . G A 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=-0.281;DP=42;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=20.23;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:878,0,1325 -chr23 20110668 . A T 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.548;DP=52;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:613,0,1257 -chr23 20111645 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-0.153;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:540,0,452 -chr23 20114477 . C T 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=-1.153;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=14.53;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1016,0,1317 -chr23 20116144 . G A 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.575;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,38:79:99:1350,0,2482 -chr23 20117939 . C T 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.704;DP=74;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1268,0,1319 -chr23 20123770 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.586;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:471,0,902 -chr23 20258056 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-1.200;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.867;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:314,0,167 -chr23 20258391 . A AT 839.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.476;DP=70;FS=5.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:877,0,3291 -chr23 20258684 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.971;DP=40;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.618;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:721,0,643 -chr23 20270537 . CA C 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.955;DP=20;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=10.84;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:254,0,150 -chr23 20272021 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=24.64;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:250,0,106 -chr23 20434547 . A T 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.320;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1021,0,1121 -chr23 20456587 . C T 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.000;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=12.71;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:702,0,1217 -chr23 20457219 . G A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=-1.685;DP=79;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:1037,0,1513 -chr23 20464040 . A T 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 -chr23 20481858 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=-2.179;DP=87;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=7.89;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,27:87:99:715,0,2159 -chr23 20498488 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-1.064;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:459,0,4511 -chr23 20498497 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-2.319;DP=77;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:464,0,4511 -chr23 20547746 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.31;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:229,0,98 -chr23 20550036 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.652;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=18.05;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:299,0,256 -chr23 20550080 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:287,0,209 -chr23 20550546 . C CT 853.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=-0.518;DP=74;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,33:70:99:891,0,889 -chr23 20550752 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.327;DP=29;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:494,0,497 -chr23 20551063 . G A 1011.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.042;DP=55;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1040,0,877 -chr23 20551626 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-1.334;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:685,0,463 -chr23 20553495 . T C 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.960;DP=90;FS=8.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,45:90:99:1616,0,2473 -chr23 20554818 . T C 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=-0.082;DP=71;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=17.76;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,35:70:99:1289,0,1264 -chr23 20575793 . T C 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.327;DP=68;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1034,0,1371 -chr23 20628934 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.212;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,176 -chr23 20633483 . ACTAAAAGACAGATAAACAGCGGTCTAAAAGTCATCTTCTTCAACTCATACATCAAGTGTAGTCATTACTGAGGGTCACTGCTACAAAAAAAAACACACAC A 512.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=1.783;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:550,0,588 -chr23 20716587 . A C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,132 -chr23 20717139 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:342,0,1012 -chr23 20717141 . T A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=-0.735;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:342,0,963 -chr23 20717996 . G GA 523.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.323;DP=351;FS=4.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=1.49;ReadPosRankSum=-1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,69:340:99:561,0,7484 -chr23 20718094 . TCTTGAAATTAAAAACAGTACGCTGGTTAGAAATGGGTATGAATATGCAAATGTCGGGTATTTTATATTATAAGAGAACAGTGCTTGTGTATGGCTTAC T 3820.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=3.052;DP=107;FS=6.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=30.66;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,89:107:99:3858,0,1776 -chr23 20728829 . C T 1259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=1.080;DP=83;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:1288,0,1644 -chr23 20728847 . G T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=1.280;DP=84;FS=5.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=13.88;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,34:84:99:1194,0,1700 -chr23 20729816 . A C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=1.203;DP=53;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.775;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:887,0,865 -chr23 20745187 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.336;DP=58;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:259,0,1818 -chr23 20754955 . C A 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-1.147;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:523,0,1140 -chr23 20762848 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=1.034;DP=56;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:498,0,1506 -chr23 20783635 . C A 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.930;DP=70;FS=2.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.620;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:972,0,1442 -chr23 20796442 . C T 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-1.767;DP=71;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1127,0,1115 -chr23 20799721 . C CT 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-1.493;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:351,0,352 -chr23 20805906 . T TG 1831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.840;DP=93;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.545;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:1869,0,925 -chr23 20807240 . A G 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.314;DP=35;FS=7.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:616,0,594 -chr23 20815992 . G A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.201;DP=91;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1145,0,1943 -chr23 20816288 . AT A 615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.121;DP=35;FS=5.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:653,0,1269 -chr23 20816290 . A G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=1.007;DP=35;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.502;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:653,0,1263 -chr23 20816466 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=-1.683;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=8.58;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:337,0,954 -chr23 20937287 . TGTGAGTCTGGCCTGCATTTTAGTTTGATGTATCATAATGTTTTTTTGAGCAAGCAAACCTGATCATGTGAGCAGAAGCTAAATTTAGTATACGTTTCTCAG T 15709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=1.576;DP=311;FS=3.081;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,310:311:99:15747,1291,0 -chr23 20944384 . G A 2725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=2.401;DP=347;FS=8.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,106:347:99:2754,0,9108 -chr23 20944692 . C T 1773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.323;DP=375;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,89:373:99:1802,0,10807 -chr23 21002203 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:240,0,363 -chr23 21005192 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=3.355;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:323,0,326 -chr23 21010360 . AAGGTGTGCGTTTACAACATGCTAGATCTCTCTTGTGCAGTTATCAGGTACATGCTTATTTACCAGTTCCTCAACATCTCTGT A 1039.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=1.867;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.037;QD=34.66;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:99:1077,0,289 -chr23 21019392 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=1.805;DP=18;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,360 -chr23 21019907 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.306;DP=21;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:230,0,491 -chr23 21022987 . GA G 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=1.299;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:295,0,293 -chr23 21024570 . T G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.631;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:412,0,773 -chr23 21026424 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,247 -chr23 21131650 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.106;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:348,0,443 -chr23 21151974 . C A 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.201;DP=55;FS=15.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:665,0,1196 -chr23 21226079 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-1.874;DP=58;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:494,0,1525 -chr23 21228308 . GT G 806.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-1.153;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=17.16;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:57:855,0,57 -chr23 21559617 . C T 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.409;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,42:147:99:1003,0,3890 -chr23 21563585 . C T 1213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-1.172;DP=90;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1242,0,1596 -chr23 21564000 . A T 2222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.557;DP=152;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:2251,0,3098 -chr23 21571080 . TGA T 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=1.536;DP=40;FS=7.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=9.79;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:712,0,1146 -chr23 21578914 . A AGAAGCACCT 1648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.254;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1686,0,960 -chr23 21592586 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.548;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,23:108:99:441,0,3117 -chr23 21610840 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=-0.217;DP=65;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:248,0,2035 -chr23 21625793 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.134;DP=84;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:299,0,2539 -chr23 21631370 . G A 1234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-0.606;DP=69;FS=8.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:69:99:1263,0,1212 -chr23 21637803 . A G 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.116;DP=89;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.080;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:1035,0,2082 -chr23 21637881 . G T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=1.801;DP=87;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=15.32;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1361,0,1586 -chr23 21656916 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=1.253;DP=129;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.688;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,26:129:99:370,0,4774 -chr23 21657011 . CAGGTCTCGGCATTCACCTTCAGGTCATCTTAGATGTTTCTGTTTTATTAGAGGCTCACTTGGCTCAATGCTTCATCTTCTTTTGT C 6115.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.413;DP=144;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.700;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,126:128:99:6153,551,0 -chr23 21662537 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.119;DP=66;FS=9.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:519,0,1724 -chr23 21705031 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.386;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:230,0,225 -chr23 21739247 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.040;DP=63;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:371,0,2113 -chr23 21739830 . T G 2284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-2.383;DP=132;FS=0.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=17.31;ReadPosRankSum=3.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,64:131:99:2313,0,2512 -chr23 21741062 . G C 2100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.404;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,60:131:99:2129,0,2399 -chr23 21741083 . G A 1265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-1.144;DP=83;FS=6.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1294,0,1632 -chr23 21746936 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.827;DP=38;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.093;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:338,0,3930 -chr23 21747178 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.665;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=8.51;ReadPosRankSum=-2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:343,0,921 -chr23 21749318 . C A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=-0.164;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:426,0,1380 -chr23 21750654 . A G 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=1.137;DP=42;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:779,0,706 -chr23 21750690 . G T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=1.085;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=26.85;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,37:55:99:1505,0,815 -chr23 21755134 . GT G 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.493;DP=38;FS=5.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:644,0,315 -chr23 21756357 . A AAC 666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.28;MQ0=0;QD=35.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 -chr23 21756614 . C T 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:491,36,0 -chr23 21756630 . T A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr23 21756788 . C CT 425.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:463,39,0 -chr23 21756812 . T G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=40.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr23 21757061 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-3.440;DP=141;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,23:141:99:286,0,4741 -chr23 21757416 . C T 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 -chr23 21763847 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-4.098;DP=44;FS=14.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.489;QD=6.11;ReadPosRankSum=-2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:297,0,2212 -chr23 21764557 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=1.340;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.629;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:425,0,291 -chr23 21764609 . G A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-1.408;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,340 -chr23 21764611 . T G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,340 -chr23 21782988 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:268,0,98 -chr23 21795113 . C A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.718;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.230;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:346,0,331 -chr23 21820132 . GCCTGAGAAAAGAGAAGCAGCATTAACCACAAACACACAATGGATATTAGAGATGTCCTTTTTTCAGTGCAGAATCTGATGCTTA G 13213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.572;DP=312;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=29.51;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,308:312:99:13251,1128,0 -chr23 21820636 . CCCTTTTAAATAAAGATCACAAATGAATGTGAATTATCCAAACAGATGCATTTCATAACTATTTCAGCTAAGTGATGGCACTTGCTTA C 12687.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.128;DP=342;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=31.50;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,334:337:99:12725,245,0 -chr23 21846221 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.358;DP=72;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:474,0,1980 -chr23 21924801 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.030;DP=49;FS=8.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:755,0,923 -chr23 21925049 . A T 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.572;DP=59;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.481;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:759,0,1267 -chr23 21925946 . TC T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.204;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=8.49;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:258,0,460 -chr23 21926669 . GA G 247.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=37.98;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:0:282,0,0 -chr23 21927623 . C CT 306.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:49:457,49,0 -chr23 21928029 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-1.754;DP=49;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:586,0,1154 -chr23 21928484 . T C 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-1.191;DP=62;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=16.77;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:1068,0,1033 -chr23 21968432 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.812;DP=40;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:312,0,1118 -chr23 21968444 . A G 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.239;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:393,0,1167 -chr23 21990967 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.212;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,177 -chr23 21999460 . G C 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr23 21999753 . T G 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr23 21999765 . C T 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 -chr23 21999927 . G A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr23 22001183 . A G 1426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.684;DP=31;FS=3.244;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=33.02;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:66:1455,66,0 -chr23 22002996 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.299;DP=18;FS=13.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=14.54;ReadPosRankSum=-2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:290,0,337 -chr23 22015800 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=1.680;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=16.54;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:508,0,689 -chr23 22054528 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.133;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:278,0,372 -chr23 22076624 . G A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr23 22076960 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr23 22097636 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=2.285;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=20.55;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:316,0,191 -chr23 22098973 . C T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=-2.450;DP=29;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:498,0,166 -chr23 22099170 . G A 856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.474;DP=24;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=31.44;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,1:11:99:885,0,810 -chr23 22099244 . A C 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=-0.892;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:884,0,810 -chr23 22208976 . T G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:230,0,66 -chr23 22272758 . T A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=2.160;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=6.66;ReadPosRankSum=-2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:368,0,1323 -chr23 22344621 . T C 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-1.100;DP=92;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:496,0,2600 -chr23 22348703 . TGGTAAGCGGAAACACTGAAATCAATCATTTTTTTGCCATTTGTAAATATGGTAGAATCGATTGTATGTTTTCTGTATGCA T 2543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=-0.872;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=32.61;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,60:73:99:2581,0,4154 -chr23 22707448 . G A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=-0.047;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:366,0,606 -chr23 22720418 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-1.355;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:310,0,268 -chr23 22721420 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=2.011;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:252,0,432 -chr23 22791124 . TC T 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-1.189;DP=20;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:72:356,0,72 -chr23 22801591 . T G 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=1.834;DP=52;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=12.65;ReadPosRankSum=-2.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:686,0,1092 -chr23 22885527 . T TC 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=-3.578;DP=47;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=1.587;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:856,0,1847 -chr23 22932830 . T G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=-0.695;DP=407;FS=6.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=1.20;ReadPosRankSum=2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:347,60:407:99:517,0,13036 -chr23 22936927 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:261,0,54 -chr23 22968846 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.062;DP=204;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=2.66;ReadPosRankSum=2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,37:204:99:571,0,6533 -chr23 22969037 . CGTGAGTCATTCTGCTGTGGACAGATTTCTATACAAGAGCGCAACTTGCCTGTGTTTGTGATGCACTGTTGCTTTTATCTGCCTTCATTCAG C 14715.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=2.235;DP=385;FS=4.373;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.247;QD=28.14;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,380:384:99:14753,1322,0 -chr23 22969234 . CCAGGTACATAGATTGTCAAGTGTCGTCTTGTCAGTGGTTGGCCAGTAGGGGGTGACAAAGTAAAACTGTGTTGTTGTTTTTCCTCTT C 13983.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.642;DP=369;FS=9.892;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=33.84;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,342:345:99:14021,1293,0 -chr23 23214025 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-0.361;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:548,0,1895 -chr23 23214844 . C T 2323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=1.071;DP=115;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=20.21;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,74:115:99:2352,0,1316 -chr23 23220783 . C CT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=-2.055;DP=88;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:274,0,1352 -chr23 23412591 . G T 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=1.182;DP=44;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:828,0,632 -chr23 23416901 . A AGT 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=2.629;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=1.146;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:354,0,618 -chr23 23432090 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.128;DP=130;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,23:130:99:352,0,4061 -chr23 23468905 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=-0.534;DP=54;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:552,0,884 -chr23 23499106 . C A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:399,0,553 -chr23 23499109 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.635;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:354,0,682 -chr23 23547056 . A T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=25.89;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:74:313,0,74 -chr23 23547068 . G T 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr23 23694754 . TCTGTGAATGAGCAGAATTCGGTTAGAAACTGTTTCAGAATTACTAACGTCGGGTGACTGAAGCATGACAAGAGTTGTAGATAAAACTTAC T 14779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=1.967;DP=347;FS=8.798;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=25.02;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,315:346:99:14817,1284,0 -chr23 23694869 . G A 4842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.039;DP=303;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,136:302:99:4871,0,5531 -chr23 23953035 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.546;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:234,0,900 -chr23 24146964 . C CA 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.743;DP=61;FS=4.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:584,0,506 -chr23 24163971 . A G 1673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.465;DP=97;FS=5.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,48:97:99:1702,0,1778 -chr23 24200741 . A C 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-0.214;DP=50;FS=4.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=17.72;ReadPosRankSum=-1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:914,0,818 -chr23 24200906 . CT C 1554.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.667;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=30.78;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,25:31:76:1592,76,0 -chr23 24260824 . G C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.853;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:236,0,446 -chr23 24283959 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=26.62;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:321,0,92 -chr23 24284478 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr23 24289900 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:252,0,266 -chr23 24399907 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=2.021;DP=20;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=24.44;ReadPosRankSum=-1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:517,0,317 -chr23 24425584 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=-0.471;DP=22;FS=3.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:253,0,502 -chr23 24426870 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=-2.832;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.72;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:286,0,489 -chr23 24433597 . A C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.180;DP=26;FS=3.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=15.53;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:432,0,410 -chr23 24435332 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=1.362;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:299,0,857 -chr23 24472543 . G T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=-2.229;DP=39;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:459,0,824 -chr23 24472828 . T A 217.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:246,0,21 -chr23 24473016 . T C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.895;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.327;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:492,0,731 -chr23 24473018 . A T 1023.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.251;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=33.03;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:0:1049,0,0 -chr23 24494745 . CCCTATGACACAAATCACATGGAAACATAAGTATTAAGATATCACATTAAAAAGAAGAGGAAAATCCATGACCTCCAATACCAGTGAAATCTTA C 816.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=1.203;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:99:854,0,549 -chr23 24514548 . CT C 611.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.308;DP=336;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,63:305:99:649,0,8046 -chr23 24525401 . AT A 669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.838;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=12.88;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:707,0,717 -chr23 24527841 . G A 990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-1.585;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:1019,0,1072 -chr23 24544987 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,176 -chr23 24635744 . C T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-1.954;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=17.18;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:389,0,261 -chr23 24635938 . C CG 729.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=1.257;DP=36;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:767,0,207 -chr23 24637494 . C T 1418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.438;DP=85;FS=2.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1447,0,1568 -chr23 24657405 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-0.273;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:262,0,1842 -chr23 24726519 . C CT 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.735;DP=23;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:285,0,208 -chr23 24726815 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.689;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:392,0,663 -chr23 24727445 . TA T 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=-1.678;DP=18;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:296,0,224 -chr23 24730948 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=2.278;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:286,0,996 -chr23 24734471 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.096;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.682;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:306,0,258 -chr23 24780221 . ATAACCTATGGAGAAATAAAGGTTTTTTTTGGCATATAGTTAATGTACAATTTTTAAGTGCTTCACAAAAAACCTTTTTCTTT A 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=28.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:298,0,1261 -chr23 24791607 . AAGGTATGTGTGGTCATCCCTGAGAGATGATGTTATGTTTTTCTCAGTGTGCTCCTTTTGTACTCTAATCATTTTTTTGATGATCTATC A 734.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.664;DP=128;FS=2.879;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,117:119:99:772,244,0 -chr23 24803944 . T C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.166;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:671,0,437 -chr23 24881896 . AAGGTATTGTGGGCTGAAAATCACAATGTTAAATGATTATATAAATCTAAACTTTTGTCATTGCTTCTCCTGGC A 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:348,0,900 -chr23 24882826 . GAGGTCAGGCTCAGTTCTTATTAGTTTTTTAACTGATTTAAGTTCAGTTTAGAGTCATATACTGTGTGTTTTATCCCGC G 633.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.414;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=25.35;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:671,0,1797 -chr23 24886337 . G C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=1.670;DP=21;FS=11.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=13.66;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:315,0,516 -chr23 24984632 . TCCTGAGAGCAGATTCAGTTAAAACTTCCCCGTCATTTCACCAAAAGCAGTCAAGATTATTTATAATAAAAAAAACAACAACAACATTGCAGAAATCCAATATAGCATCCTTTAAAAACATATATATAATTATAATTTTTATAAATATATATAACCACCCACTTA T 9488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=2.826;DP=221;FS=6.727;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=29.18;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,211:217:99:9526,788,0 -chr23 25213858 . CGGTAAGTAGAAAAGCGTACGAAACAGCTTATGTATAAAGGTAAAATGTGACGCTTCTCGTGTTGTTTTTCTCAACA C 2781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.954;DP=65;FS=2.205;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=30.27;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,62:65:99:2819,210,0 -chr23 25257928 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.589;DP=56;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:267,0,3005 -chr23 25409969 . T G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.157;DP=121;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,25:121:99:432,0,3756 -chr23 25437116 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=-0.698;DP=120;FS=2.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=2.11;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:99:281,0,3850 -chr23 25511088 . C CA 391.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.296;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=24.50;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:13:429,0,13 -chr23 25511555 . A G 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.716;DP=37;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=19.37;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:745,0,546 -chr23 25512002 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.421;DP=39;FS=1.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=7.33;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:314,0,1336 -chr23 25519907 . AT A 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=12.98;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:73:266,0,73 -chr23 25583034 . AAGGTGAGCTGATCAAAGACTTTCTCATATTCTATTCAAAAACATCATGATGTGATTTTTCAATGTCCTTCTGTCTTTATACGC A 17699.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=1.723;DP=422;FS=3.839;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=33.84;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,396:397:99:17737,1419,0 -chr23 25593546 . GCAGGTAAGCTGATATCAAATGGATGTACATTTTTAATATAGGCTCTATTGCTTTGAATTTGGCATTAAACGAATGTTGATGTCTCT G 6574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=1.709;DP=150;FS=5.200;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,148:149:99:6612,646,0 -chr23 25593787 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.987;DP=487;FS=7.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:423,63:486:99:255,0,16607 -chr23 25626673 . AGTAAGACCCTCAAATCATGACACATTTATATTGAGGTTATTAAAATATCAAAAGTTGCAAGGAACAATTTCTACTCCACAAG A 865.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=2.619;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=33.25;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:99:903,0,702 -chr23 25630642 . TGTTAGTAGGAACGTTCATAAATTACTGTCTTTGCACACAAGAGTGGAAGTTACCCATCTTTTGCTCTCTCCTACAG T 1533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.359;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,37:40:99:1571,0,616 -chr23 25740418 . C G 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.213;DP=103;FS=4.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:387,0,3021 -chr23 25745936 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.440;DP=67;FS=2.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:366,0,1771 -chr23 25746102 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.500;DP=66;FS=6.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:239,0,2030 -chr23 25752364 . T A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.096;DP=91;FS=3.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=5.59;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:537,0,2601 -chr23 25752399 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=-1.075;DP=83;FS=3.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:358,0,2196 -chr23 25778918 . G C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-1.053;DP=49;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:310,0,1330 -chr23 26022292 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.686;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:254,0,2190 -chr23 26055311 . GCACACACACACACACACA G,GCACACACACACACACACACA 319.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.248;DP=29;FS=3.680;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=11.01;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,7,6:14:99:431,156,1708,275,0,335 -chr23 26064224 . TCTGACAAATAACAAAAAGCTTGTAATGCCAATATATGCAACGTTAAAAAAAGAAAAGCAGACAAGTAAATATTTTTTCCATAC T 4412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.625;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:4450,375,0 -chr23 26083679 . T TC 635.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=-1.225;DP=38;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:673,0,295 -chr23 26319150 . GCAGGTAACCTTACTTCATTACATGATCTAATAGATTGGTTAGATTAACATGTAAATTACATGTCATTGTCTAAAAACTAAATTAGTCTTACATATCTGTGT G 1699.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=1.524;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:99:1737,158,0 -chr23 26350593 . G GT 1107.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.296;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=10.65;ReadPosRankSum=-1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1145,0,1180 -chr23 26351883 . T C 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=1.033;DP=125;FS=0.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:583,0,4067 -chr23 26351997 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.183;DP=222;FS=0.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,34:220:99:333,0,7402 -chr23 26451367 . TATCCCATCAGCTTCGTAGAGGAACTGAAGCCGAATAAAGAGC T 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.833;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=25.44;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:546,0,2245 -chr23 26466162 . T A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=-1.184;DP=37;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=24.26;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:926,0,354 -chr23 26780744 . C CT 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.615;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=20.88;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:37:434,0,37 -chr23 26841594 . G GCGCTCGCAGTACTGGC 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=1.670;DP=17;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:323,0,398 -chr23 26974132 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.396;DP=51;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:441,0,1282 -chr23 26988896 . ATCAGGTAAAACCAAAAGATTTACAATGAAACTCTCGAATCAGTCAGAAACAAAGTCTGATCCATCTCTAAATTACAATT A 3083.37 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=2.588;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=29.22;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,81:87:8:3120,8,0 -chr23 27036180 . CA C 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:246,24,0 -chr23 27292760 . C A 9447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=-1.590;DP=336;FS=4.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,229:335:99:9476,0,6418 -chr23 27292762 . C T 9447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.411;ClippingRankSum=-1.065;DP=335;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,228:334:99:9476,0,6482 -chr23 27309839 . G T 4349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=-1.328;DP=180;FS=4.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,138:175:99:4378,0,606 -chr23 27312188 . C CT 1582.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.019;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,75:112:99:1620,0,2257 -chr23 27312801 . GT G 2187.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=-2.530;DP=115;FS=3.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,82:108:99:2225,0,318 -chr23 27313056 . CT C 851.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.873;DP=62;FS=7.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:889,0,695 -chr23 27315481 . T TC 740.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=-1.035;DP=33;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=22.45;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:778,0,111 -chr23 27316683 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:261,0,266 -chr23 27320195 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.353;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:315,0,312 -chr23 27373959 . G A 4852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.062;DP=169;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,125:169:99:4881,0,1065 -chr23 27495025 . GCCTAATAGGGAGAATCAGTATGTTAATTTAGCTGTTCAACACAAAGCTTTTTCTGTAGCCAGTATACCAACTTTATAGGAACTAAAATTGTGAGACAGTCTTA G 1783.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=2.375;DP=44;FS=6.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:99:1821,158,0 -chr23 27604503 . CCCTGAGAGGAAAGGAGACAGTCATCAAAATGAGGCTCTGCTGGTGTTATGACACAGCTGACGTAATGTGTATTTTTTGCTCTAA C 3269.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.057;DP=84;FS=2.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,73:77:99:3307,207,0 -chr23 27685208 . C CA 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-1.056;DP=24;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:305,0,211 -chr23 27688512 . T A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.698;DP=36;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:466,0,730 -chr23 27739112 . C CA 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=-0.196;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:70:307,0,70 -chr23 27754556 . G A 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.221;DP=72;FS=4.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=14.76;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,32:72:99:1091,0,1243 -chr23 27754571 . T C 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=1.168;DP=78;FS=4.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=15.59;ReadPosRankSum=-1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,36:78:99:1244,0,1330 -chr23 27759029 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=3.817;DP=39;FS=12.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=6.20;ReadPosRankSum=-3.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:270,0,2387 -chr23 27759031 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=2.205;DP=45;FS=7.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=5.59;ReadPosRankSum=-3.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:280,0,2387 -chr23 27817559 . AACCTGCATATAGAAAGGAAGATGTGAGGTCACTTCTAAGCCATCAAAAAATGACTAGTATTGCATACATTTGTGCTTTACAATCAT A 3273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=-0.296;DP=112;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.998;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,87:108:99:3311,0,3006 -chr23 27819421 . GCACCT G 1914.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-0.873;DP=144;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,55:143:99:1952,0,6838 -chr23 27819427 . GCACACAACAAAGAAACAGTGACACTACAGGGGATGAAAACATTCTATTAAGAAACACTGAAGAGCAAAACAT G 1914.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.588;DP=144;FS=1.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,55:144:99:1952,0,7585 -chr23 27923780 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.545;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,168 -chr23 27968352 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:312,0,407 -chr23 27968516 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.322;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:73:280,0,73 -chr23 28046155 . T TC 1187.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.494;DP=159;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:86:1225,86,0 -chr23 28249258 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=-0.911;DP=45;FS=7.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:260,0,1293 -chr23 28259627 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=22.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:90:231,0,90 -chr23 28260544 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:295,0,176 -chr23 28423513 . C T 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.686;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,32:66:99:1185,0,2006 -chr23 28424711 . T TC 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:239,0,321 -chr23 28424740 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.317;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:367,0,368 -chr23 28427217 . C T 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.823;DP=55;FS=5.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=12.58;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:720,0,1194 -chr23 28587106 . CA C 2257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.386;DP=176;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,92:171:99:2295,0,2093 -chr23 28588255 . CA C 2476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.442;DP=223;FS=5.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:215,3:218:99:2514,0,7033 -chr23 28629464 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=1.388;DP=51;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:291,0,1454 -chr23 28629637 . T C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.017;DP=71;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1078,0,2249 -chr23 28753943 . G A 2557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.146;DP=142;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,72:141:99:2586,0,2561 -chr23 28754595 . C T 1664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.953;DP=128;FS=9.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:1693,0,2514 -chr23 28758660 . C T 3336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.460;DP=185;FS=4.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,103:185:99:3365,0,2910 -chr23 28770560 . A T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=2.012;DP=150;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,30:146:99:425,0,4964 -chr23 28773120 . G A 2863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.614;DP=171;FS=3.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=16.75;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,80:171:99:2892,0,2947 -chr23 28775410 . G A 2793.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=-0.690;DP=182;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,79:182:99:2822,0,3402 -chr23 28782348 . C T 2959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.917;DP=176;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,93:174:99:2988,0,2822 -chr23 28791808 . G A 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-1.881;DP=150;FS=7.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,38:148:99:865,0,4030 -chr23 28804547 . TAGGTACCAGTGGAGATTATTGCCAATTGCCTCATTAAATTTTATACACGTGTAATATATATAAAGAATGAGTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTAAC T 8150.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-0.640;DP=230;FS=6.132;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=30.16;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,223:230:99:8188,778,0 -chr23 28926188 . AT A 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.191;DP=26;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:451,0,114 -chr23 28926530 . G GT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-1.937;DP=51;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=5.50;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:504,0,336 -chr23 29605625 . G GT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.953;DP=99;FS=8.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:299,0,1937 -chr23 29605651 . GT G 614.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.131;DP=73;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.541;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:652,0,650 -chr23 29640369 . T G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.239;DP=31;FS=15.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:426,0,2130 -chr23 29676587 . G A 1196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.872;DP=93;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1225,0,2904 -chr23 29750427 . CA C 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=0.475;DP=92;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:320,0,4193 -chr23 29823548 . T TA 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.026;DP=44;FS=3.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:402,0,2220 -chr23 29955496 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-0.323;DP=60;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:251,0,3688 -chr23 29955660 . ATT A 1468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.597;DP=233;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,59:230:99:1506,0,7295 -chr23 30100206 . TA T 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=1.659;DP=80;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.841;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,25:70:99:482,0,819 -chr23 30987416 . GGGTATGTTAGACATGTTATCTTCTCAGATTAGTCTTTTGTAAAACTTATTGTAGTTATAGAAAGCAACCTTCCTATGTCTAAGTCTTGTTTCATGTGTGTTTCTCTTCTGCCCACTCCACTA G 4732.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=1.401;DP=108;FS=6.061;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,106:108:99:4770,380,0 -chr23 31005822 . AT A 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.765;DP=137;FS=6.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.825;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,46:122:99:809,0,1308 -chr23 31012040 . GA G 230.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:28:268,28,0 -chr23 31023753 . C CTG 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.029;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:637,0,645 -chr23 31170036 . T C 357.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:27:386,27,0 -chr23 31170040 . T C 277.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:306,0,13 -chr23 31597249 . T TA 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=1.568;DP=317;FS=13.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,69:300:99:400,0,6027 -chr23 31879147 . G GA 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=-0.019;DP=88;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,20:81:99:319,0,1705 -chr23 32326031 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=1.055;DP=36;FS=5.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:485,0,775 -chr23 32326040 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.368;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:302,0,876 -chr23 32451644 . A T 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:564,39,0 -chr23 32566256 . T G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr23 32713866 . A G 4355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=-3.126;DP=504;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=8.64;ReadPosRankSum=2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,160:496:99:4384,0,12638 -chr23 32747225 . C CA 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.114;DP=199;FS=7.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,38:175:99:464,0,3002 -chr23 33942431 . C CT 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.835;DP=159;FS=3.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,42:146:99:556,0,2328 -chr23 33973653 . T C 2428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:2457,177,0 -chr23 33973667 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-1.146;DP=37;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:234,0,1864 -chr23 33973768 . T C 1649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1678,117,0 -chr23 33973815 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=1.079;DP=76;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:284,0,2266 -chr23 34141648 . C A 2282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=3.289;DP=70;FS=9.573;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.781;QD=32.61;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,63:70:34:2311,34,0 -chr23 34157958 . A T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.150;DP=35;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.483;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:517,0,639 -chr23 34161665 . T A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=-0.646;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=17.41;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:690,0,597 -chr23 34165401 . T C 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=1.069;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:499,0,1282 -chr23 34165562 . A G 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.986;DP=51;FS=1.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1012,0,720 -chr23 34165809 . A G 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=-0.318;DP=44;FS=6.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:635,0,768 -chr23 34166009 . C G 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=1.856;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.389;QD=17.02;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:675,0,629 -chr23 34166087 . A G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.116;DP=33;FS=8.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=24.51;ReadPosRankSum=2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:837,0,306 -chr23 34166183 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=-2.138;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:382,0,1041 -chr23 34166312 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.013;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=6.84;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:329,0,1134 -chr23 34166382 . G A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.621;DP=39;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:518,0,837 -chr23 34168022 . G A 277.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.82;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:305,0,8 -chr23 34266576 . C CT 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.288;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=19.71;ReadPosRankSum=-2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:392,0,576 -chr23 34266581 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=19.15;ReadPosRankSum=-1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:392,0,576 -chr23 34286725 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-1.727;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:313,0,650 -chr23 34286726 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.845;DP=26;FS=15.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:670,0,261 -chr23 34287044 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.990;DP=58;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:329,0,1851 -chr23 34287250 . T TTG 1565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.851;DP=138;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,50:118:99:1603,0,3510 -chr23 34287536 . AT A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.318;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:409,0,139 -chr23 34346894 . T G 2743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=29.31;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,1:4:99:2772,0,10605 -chr23 35027504 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:235,0,378 -chr23 35028486 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.347;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:286,0,673 -chr23 35195033 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.803;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:280,0,1392 -chr23 35414772 . G C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-2.518;DP=99;FS=11.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:291,0,3216 -chr23 35434665 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.583;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:634,0,1979 -chr23 35437939 . C G 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.041;DP=56;FS=5.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=18.55;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:1067,0,2126 -chr23 35588661 . A G 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.467;DP=26;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=34.14;ReadPosRankSum=-1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:916,0,330 -chr23 35588713 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.964;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:230,0,1415 -chr23 35588913 . A G 1430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.440;DP=48;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=29.81;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:1459,0,1243 -chr23 35612736 . G A 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:36:473,36,0 -chr23 35717663 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.116;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:397,0,363 -chr23 35717751 . A G 503.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=31.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:0:529,0,0 -chr23 35717885 . A G 452.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=32.63;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1:478,0,1 -chr23 35740939 . G C 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.978;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:406,0,2805 -chr23 35741007 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=-0.154;DP=84;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,16:84:99:284,0,2736 -chr23 35743618 . TCTGCACAGATGGGTCATGAAGACATGTTATCAAACTAATCACACAAATTAATAAATTACTAATAAAATAACACAAAATCATCCATTTTAAAATTTAACCACGTGATCTCAC T 13649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.549;DP=305;FS=5.946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.832;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,302:305:99:13687,1100,0 -chr23 35766427 . T C 5193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.245;DP=372;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,152:370:99:5222,0,7088 -chr23 35767567 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.507;DP=301;FS=91.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.230;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,48:300:99:514,0,9830 -chr23 35768660 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-1.334;DP=30;FS=9.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:363,0,636 -chr23 35798191 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=4.049;DP=117;FS=8.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:287,0,4550 -chr23 35970271 . GT G 1351.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=-1.129;DP=173;FS=2.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,57:168:99:1389,0,2914 -chr23 36016008 . T G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.465;ClippingRankSum=-2.121;DP=179;FS=7.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=1.81;ReadPosRankSum=2.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,32:179:99:352,0,6630 -chr23 36016055 . G GCA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.922;DP=179;FS=26.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.854;QD=1.91;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,28:120:99:379,0,2559 -chr23 36034274 . GA G 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-1.232;DP=42;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:292,0,1646 -chr23 36045198 . ACTAGTATAATGCAAAAAACAATGACACGTCATGAGCATGTACATCTCTTCTATTTGTAAAAAACTGCATTGGTATTAGATTAGAAAC A 1902.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=3.286;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=34.60;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,50:54:99:1940,0,1245 -chr23 36118470 . TTA T 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.749;DP=36;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:295,0,1069 -chr23 36138017 . GT G 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=-0.010;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=10.12;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:594,0,643 -chr23 36168306 . C CA 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-1.724;DP=73;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,24:70:99:405,0,1128 -chr23 36205546 . A C 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.735;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:629,0,1037 -chr23 36206308 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=1.039;DP=25;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:293,0,530 -chr23 36207046 . A G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=2.140;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:367,0,469 -chr23 36349571 . A G 1701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.386;DP=266;FS=4.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,75:266:99:1730,0,7204 -chr23 36356425 . T A 3909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=2.229;DP=547;FS=5.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,164:546:99:3938,0,13616 -chr23 36359039 . GAGGTGAGGTTAACTTTGTAATAAAATGTAAGGAAATTAAGGCTTGAATTTGGATGTCTAATTATGTATGGGTTAC G 13692.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=306;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,301:301:99:13730,1190,0 -chr23 36359603 . G A 5638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=4.730;DP=219;FS=8.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.245;QD=25.75;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,106:218:99:5667,0,7902 -chr23 36359605 . G A 5610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.267;ClippingRankSum=4.829;DP=217;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,105:216:99:5639,0,7902 -chr23 36359667 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.265;ClippingRankSum=-1.234;DP=236;FS=25.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=2.90;ReadPosRankSum=8.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,53:234:99:713,0,14752 -chr23 36360285 . T C 1609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=-0.976;DP=362;FS=19.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,82:361:99:1638,0,10585 -chr23 36361803 . AAGGTAGTTGCTGATTTTAATGTGGCACTCTAGTTTGTTTACAATTTTCCTCCATCTCAAACTTCTTTCTCTCTTCT A 5769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=7.049;DP=183;FS=9.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=31.53;ReadPosRankSum=-4.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,144:183:99:5807,0,10161 -chr23 36450404 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=-2.518;DP=19;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,419 -chr23 36465674 . A AGT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.547;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:239,0,1792 -chr23 36495742 . C T 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=1.470;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,39:128:99:1212,0,6902 -chr23 36533416 . G GA 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-3.895;DP=277;FS=0.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=2.14;ReadPosRankSum=2.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,83:241:99:1351,0,3065 -chr23 36542424 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:237,0,541 -chr23 36842454 . C CA 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.741;DP=148;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,39:130:99:589,0,2351 -chr23 36846432 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.404;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:334,0,1345 -chr23 36867472 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-1.482;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:230,0,334 -chr23 36980933 . A T 4343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.008;DP=209;FS=6.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,23:102:99:4372,0,4075 -chr23 36980996 . GA G 4353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=-0.066;DP=333;FS=7.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=13.07;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,171:268:99:4391,0,4075 -chr23 36981114 . A G 28205.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=323;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,300:300:99:28234,2002,0 -chr23 36981125 . G T 28252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.611;DP=325;FS=3.490;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,305:306:99:28281,2003,0 -chr23 36981244 . T C 28226.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-1.202;DP=391;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,349:354:99:28255,2002,0 -chr23 36981421 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=-2.482;DP=175;FS=8.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:603,0,5659 -chr23 37160184 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-1.395;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,313 -chr23 37175651 . CCCTGTATAAACACATTTGGGTATAATGTACACATTAAGTCACTAGCTGGAATGTCATCAAATTAGAGTATGTAATAGGAAGAGTGACACTCA C 3040.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.439;DP=96;FS=3.014;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:3078,246,0 -chr23 37175823 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-1.424;DP=93;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=5.06;ReadPosRankSum=2.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,22:93:99:499,0,2718 -chr23 37183570 . A G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.714;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:883,0,1000 -chr23 37187272 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-1.019;DP=41;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:589,0,783 -chr23 37892273 . T G 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-0.726;DP=31;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=22.61;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:729,0,340 -chr23 38186653 . C G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=23.07;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:282,0,62 -chr23 38186783 . T C 2824.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.483;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.019;QD=29.62;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,67:69:99:2853,202,0 -chr23 38186925 . G A 1046.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=2.281;DP=33;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=31.71;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:1:1072,1,0 -chr23 38187501 . T TA 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:36:426,36,0 -chr23 38187591 . T G 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.87;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1004,72,0 -chr23 38187608 . C G 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 -chr23 38599793 . T TTC 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.116;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:434,0,461 -chr23 39053842 . CA C 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=2.844;DP=44;FS=6.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=9.54;ReadPosRankSum=-2.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:457,0,717 -chr23 39674227 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-1.562;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:266,0,307 -chr23 39676129 . G A 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.778;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=14.67;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:351,0,133 -chr23 39677532 . A T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=1.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:257,0,103 -chr23 39890463 . C CA 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=-2.033;DP=278;FS=15.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,52:240:99:391,0,4853 -chr23 39894774 . G A 2437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.904;DP=135;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=18.06;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,74:135:99:2466,0,2201 -chr23 39896158 . A C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.619;DP=220;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=2.51;ReadPosRankSum=-1.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,39:200:99:580,0,5842 -chr23 39896650 . G T 3146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-3.129;DP=192;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.908;QD=16.39;ReadPosRankSum=2.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,94:192:99:3175,0,3447 -chr23 39902676 . C T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.880;DP=21;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:377,0,382 -chr23 39902913 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.921;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.843;QD=13.85;ReadPosRankSum=2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:499,0,743 -chr23 39903032 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=-0.060;DP=31;FS=1.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=19.83;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:643,0,456 -chr23 39906436 . T G 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-1.013;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:1512,0,894 -chr23 39906449 . A G 1163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.817;DP=70;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=16.63;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1192,0,1233 -chr23 39911468 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=-0.311;DP=75;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:272,0,2123 -chr23 39911515 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-1.185;DP=59;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:414,0,1595 -chr23 39914354 . G C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.107;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=29.73;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:53:385,0,53 -chr23 39948080 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,138 -chr23 39948680 . T C 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.414;DP=39;FS=4.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.270;QD=20.53;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:829,0,565 -chr23 40106921 . A G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:326,0,350 -chr23 40200163 . T C 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr23 40710270 . C T 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr23 40735127 . GAGGTAGGGGGGATACAAATGCATCTAAATATGCTTTAATATAACTATATATATGTATACATAGATATATGTCTGTTGTATCC G 654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=3.102;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=21.12;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:692,0,3132 -chr23 40745105 . C A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.578;DP=20;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,626 -chr23 40802331 . T C 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.441;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=29.59;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:916,0,114 -chr23 41320778 . CA C 282.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:320,30,0 -chr23 41321744 . G A 435.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:464,33,0 -chr23 42895003 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.470;DP=69;FS=8.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=3.55;ReadPosRankSum=3.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,14:69:99:273,0,2129 -chr23 42958584 . CCCTTGCGAGACAACATTTATTAGTTCATTTCATTCCCATACAAACATAACATACAAGATCATTCAGCA C 463.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=1.159;DP=32;FS=5.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:501,0,7630 -chr23 43010859 . A T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=2.656;DP=36;FS=29.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=16.58;ReadPosRankSum=-2.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:625,0,673 -chr23 43099629 . C A 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=-1.065;DP=48;FS=3.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.255;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1464,0,115 -chr23 43099716 . G T 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=1.546;DP=54;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=16.87;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:939,0,894 -chr23 43099822 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=1.946;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:269,0,1638 -chr23 43099847 . C T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.895;DP=31;FS=11.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:455,0,1290 -chr23 43099854 . A C 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.321;DP=29;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.357;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:576,0,361 -chr23 43207616 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=-2.613;DP=63;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=5.35;ReadPosRankSum=1.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:365,0,1772 -chr23 43207950 . GT G 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.544;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=4.45;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:389,0,664 -chr23 43617962 . T A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-2.659;DP=20;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.747;QD=14.29;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:314,0,589 -chr23 43864667 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.790;DP=332;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,45:331:99:258,0,11148 -chr23 43946088 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.322;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:461,0,959 -chr23 43952890 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:99:265,0,432 -chr23 44098074 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=17.92;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:297,0,307 -chr23 44159314 . C T 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.245;DP=199;FS=13.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=7.89;ReadPosRankSum=2.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,76:197:99:1599,0,7333 -chr23 44159491 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=-1.908;DP=238;FS=4.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.909;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,57:238:99:621,0,11658 -chr23 44216674 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=-1.190;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:387,0,763 -chr23 44217575 . G GT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.260;DP=26;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=9.18;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:276,0,288 -chr23 44349919 . T A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-1.620;DP=26;FS=5.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.774;QD=16.57;ReadPosRankSum=1.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:459,0,433 -chr23 44349996 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=-0.466;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=14.96;ReadPosRankSum=2.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:537,0,748 -chr23 44351299 . C T 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.531;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.230;QD=21.10;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:598,0,338 -chr23 44356356 . GA G 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.159;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:265,0,819 -chr23 44363545 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:283,0,314 -chr23 44368834 . C G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=0.396;DP=20;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=10.09;ReadPosRankSum=-1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:230,0,453 -chr23 44378701 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.222;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,365 -chr23 44524425 . C G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.350;DP=79;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:483,0,2128 -chr23 44633182 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.910;DP=18;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,347 -chr23 44739765 . GTTTTTGGAAAAAAATAAACCAAAAAAAGTGAAAGGAAAAAATGAAGTGTTTGTGCTGTAGTTTATCACCATACATTGACATTTATTAAACAAATCTGCAATTTTA G 321.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=5.791;DP=100;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=3.22;ReadPosRankSum=-5.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,13:100:99:359,0,14472 -chr23 44783680 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=1.529;DP=33;FS=19.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:404,0,700 -chr23 44791587 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-0.086;DP=53;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:486,0,1253 -chr23 44866601 . AAC A 1154.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.549;DP=81;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=14.26;ReadPosRankSum=1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,34:77:99:1192,0,1370 -chr23 44868326 . A T 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=-1.209;DP=155;FS=5.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,47:155:99:1228,0,4021 -chr23 44871033 . C T 2344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.419;DP=175;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,73:175:99:2373,0,3240 -chr23 44907929 . G A 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=-1.159;DP=71;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,28:71:99:918,0,1415 -chr23 44908132 . G A 781.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.167;DP=104;FS=12.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,32:103:99:810,0,2695 -chr23 44908294 . C G 2907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-1.607;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=27.69;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,75:105:99:2936,0,749 -chr23 44908423 . A T 1867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-0.192;DP=119;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.450;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,54:118:99:1896,0,2780 -chr23 44908587 . T C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=4.692;DP=39;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.760;QD=8.40;ReadPosRankSum=-4.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:356,0,989 -chr23 44912249 . A G 2606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.663;DP=85;FS=2.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=30.67;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,70:85:99:2635,0,231 -chr23 44917738 . G A 2273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=2.673;DP=139;FS=0.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.36;ReadPosRankSum=2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,64:139:99:2302,0,2547 -chr23 44921943 . T G 3590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=1.779;DP=122;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,96:122:99:3619,0,506 -chr23 44922004 . G A 2717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.196;DP=106;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=25.64;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,79:106:99:2746,0,575 -chr23 44922490 . G T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=3.601;DP=74;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:640,0,2805 -chr23 44922598 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.871;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:257,0,1954 -chr23 44922635 . T G 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=-0.169;DP=64;FS=5.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=15.78;ReadPosRankSum=3.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,28:64:99:1038,0,1196 -chr23 44922647 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.275;DP=66;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:312,0,2003 -chr23 44923483 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-4.126;DP=32;FS=6.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=8.99;ReadPosRankSum=2.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:316,0,804 -chr23 44923697 . A G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=7.040;DP=89;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=6.06;ReadPosRankSum=-3.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:568,0,2424 -chr23 44923780 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=1.656;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=10.99;ReadPosRankSum=-2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:413,0,786 -chr23 44923936 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=-0.867;DP=39;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:372,0,1037 -chr23 44924181 . C T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.552;DP=66;FS=2.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:769,0,2111 -chr23 44924184 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.173;DP=67;FS=1.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:328,0,3013 -chr23 44924365 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.107;DP=94;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:479,0,5790 -chr23 44924377 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.515;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.908;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:479,0,5790 -chr23 44928354 . T A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=3.331;DP=56;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:800,0,1184 -chr23 44928442 . T C 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.527;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=17.34;ReadPosRankSum=-2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:427,0,402 -chr23 44938564 . A G 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=1.011;DP=31;FS=1.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:904,0,132 -chr23 44941258 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=2.355;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,459 -chr23 44942993 . T C 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.437;DP=27;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=27.14;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:761,0,137 -chr23 44945193 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-1.077;DP=18;FS=5.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=25.65;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:490,0,197 -chr23 44945214 . A C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:311,0,290 -chr23 44948011 . A T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:405,0,587 -chr23 44948020 . A C 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=0.261;DP=23;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=32.16;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:89:768,0,89 -chr23 44950228 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.095;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:508,0,565 -chr23 44952535 . G C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.546;DP=34;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:318,0,856 -chr23 44952916 . A T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.369;DP=26;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=26.68;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:722,0,126 -chr23 44954509 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-1.511;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.04;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:314,0,362 -chr23 44954700 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-1.923;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:299,0,771 -chr23 44954763 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.841;DP=31;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:631,0,458 -chr23 44955440 . C G 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.492;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:714,0,248 -chr23 44958588 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=15.81;ReadPosRankSum=2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:297,0,263 -chr23 44958629 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.962;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,117 -chr23 44958698 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-0.020;DP=32;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:401,0,581 -chr23 44958767 . T A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-1.334;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:659,0,330 -chr23 44960928 . T C 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.885;DP=28;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:734,0,260 -chr23 44964129 . T C 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=1.137;DP=27;FS=4.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:757,0,141 -chr23 44964140 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=8.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:339,0,391 -chr23 44965393 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.154;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=24.85;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:95:401,0,95 -chr23 44965420 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=1.893;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=25.92;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:417,0,103 -chr23 44966466 . A T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.618;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:323,0,322 -chr23 45029927 . T G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=-2.180;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:305,0,511 -chr23 45031273 . C A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=2.371;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:408,0,1119 -chr23 45031808 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.087;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:468,0,695 -chr23 45048636 . T C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.780;DP=56;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:747,0,1101 -chr23 45049029 . G T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-0.109;DP=54;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.540;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:634,0,1251 -chr23 45049278 . A G 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=2.011;DP=46;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:650,0,853 -chr23 45089193 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.308;DP=127;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,22:125:99:250,0,4510 -chr23 45163187 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-1.183;DP=83;FS=7.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:269,0,3501 -chr23 45163522 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.619;DP=29;FS=6.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:366,0,1436 -chr23 45163525 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.551;DP=28;FS=6.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:366,0,1433 -chr23 45164602 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=-0.271;DP=45;FS=7.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:275,0,1287 -chr23 45167471 . G T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.544;DP=59;FS=2.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=7.52;ReadPosRankSum=2.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:472,0,1591 -chr23 45167758 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.116;DP=38;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,1065 -chr23 45170556 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-1.889;DP=30;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=14.19;ReadPosRankSum=-1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:454,0,498 -chr23 45182402 . C A 320.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:1:346,1,0 -chr23 45328168 . C T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.254;DP=43;FS=12.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:542,0,858 -chr23 45332427 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-0.077;DP=44;FS=2.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:337,0,1081 -chr23 45332595 . T G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=1.385;DP=67;FS=1.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:505,0,2045 -chr23 45348726 . C G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=-0.030;DP=68;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:303,0,2506 -chr23 45356885 . C A 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.786;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=17.02;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:777,0,799 -chr23 45357021 . G T 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-2.899;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:658,0,1084 -chr23 45357032 . C G 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=-0.930;DP=54;FS=5.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:762,0,999 -chr23 45360277 . G C 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-1.905;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.994;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:536,0,1426 -chr23 45382058 . TA T 2947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.322;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,121:247:99:2985,0,2988 -chr23 45574859 . G A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=-0.208;DP=251;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,41:251:99:450,0,9562 -chr23 45575809 . AT A 669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=-0.667;DP=204;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,49:191:99:707,0,3953 -chr23 45635676 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-0.326;DP=42;FS=13.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=6.88;ReadPosRankSum=-2.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:317,0,1021 -chr23 45635729 . C A 1190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=-1.012;DP=79;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=15.07;ReadPosRankSum=1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1219,0,1439 -chr23 45651033 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-1.068;DP=79;FS=14.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:319,0,2202 -chr23 45683818 . T C 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.655;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:96:866,0,96 -chr23 45756011 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.184;DP=34;FS=6.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:301,0,785 -chr23 45756026 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.277;DP=38;FS=5.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:427,0,817 -chr23 46140994 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.333;DP=40;FS=3.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:265,0,1107 -chr23 46147205 . C G 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=1.458;DP=69;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=12.00;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,26:68:99:856,0,1426 -chr23 46152245 . G A 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.718;DP=98;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,38:98:99:1295,0,2058 -chr23 46158903 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-2.010;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,1078 -chr23 46159450 . C T 1301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=-0.757;DP=151;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,49:151:99:1330,0,4142 -chr23 46161573 . TCTGTTAGCATTAGCAGATAATGTTAATTATCACTATGATCTGATATAATACTGCAGACGTGAGCTAAAGCTGTAC T 7328.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.006;DP=167;FS=2.284;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=22.19;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,160:163:99:7366,633,0 -chr23 46185985 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;ClippingRankSum=-0.386;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:260,0,691 -chr23 46190077 . T A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=1.453;DP=40;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=11.94;ReadPosRankSum=-1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:506,0,877 -chr23 46191715 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.082;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:440,0,452 -chr23 46196855 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:249,0,455 -chr23 46198236 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.017;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:233,0,1123 -chr23 46198922 . A C 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-1.552;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:351,0,492 -chr23 46199663 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.366;DP=27;FS=5.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:445,0,510 -chr23 46200661 . C CTG 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:344,0,347 -chr23 46355486 . G T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.935;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.73;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:530,0,479 -chr23 46355879 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=-1.506;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:509,0,995 -chr24 1668 . A G 3950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.084;DP=129;FS=1.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=30.63;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,103:128:99:3979,0,444 -chr24 8913 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.793;DP=42;FS=2.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:707,0,705 -chr24 9020 . G T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=1.091;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:506,0,757 -chr24 55098 . C G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=-2.617;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:647,0,1397 -chr24 55107 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-1.935;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:647,0,1382 -chr24 83867 . G C 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.921;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:478,0,951 -chr24 93190 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=1.313;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:380,0,406 -chr24 278032 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=1.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:336,0,175 -chr24 483001 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=-2.694;DP=135;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,21:120:99:271,0,3806 -chr24 483585 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.242;DP=94;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,30:93:99:751,0,2840 -chr24 483589 . A G 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=-0.167;DP=95;FS=4.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,28:95:99:703,0,2581 -chr24 487575 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-1.974;DP=122;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=1.80;ReadPosRankSum=2.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,21:122:99:248,0,7282 -chr24 487780 . A G 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.871;DP=138;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:906,0,3825 -chr24 488817 . AT A 855.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.028;DP=138;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,43:138:99:893,0,3629 -chr24 517809 . A G 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=1.277;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=12.88;ReadPosRankSum=2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,23:60:99:801,0,1261 -chr24 958653 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:244,0,62 -chr24 982131 . G A 2877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2906,208,0 -chr24 988707 . GCCTGCAAACAACAACAACAGCAGTTCAGATTCTGCCATGCATCAACATCGGTCTCTGCAAGAAGAACAGCGCACACA G 2638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=4.096;DP=75;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=34.08;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,64:75:99:2676,0,2595 -chr24 997569 . GA G 676.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=1.609;DP=40;FS=5.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:714,0,222 -chr24 1033856 . T G 2063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2092,147,0 -chr24 1033862 . A G 2063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:2092,147,0 -chr24 1033942 . G A 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.761;DP=103;FS=1.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,52:96:99:1697,0,1539 -chr24 1035660 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-0.889;DP=80;FS=5.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,26:77:99:820,0,1732 -chr24 1035706 . C T 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.265;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.487;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,36:56:99:1178,0,604 -chr24 1652251 . T C 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr24 2331135 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=-0.314;DP=97;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=3.28;ReadPosRankSum=2.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:346,0,2942 -chr24 2334648 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=1.411;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:322,0,1833 -chr24 2377094 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-1.352;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=15.17;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:362,0,403 -chr24 2377148 . GA G 269.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:307,31,0 -chr24 2381934 . GT G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.091;DP=62;FS=9.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:272,0,1145 -chr24 2556716 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.843;DP=115;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,21:115:99:341,0,3697 -chr24 2559551 . G A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.510;DP=105;FS=10.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=8.42;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,34:105:99:912,0,5991 -chr24 2559567 . G T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.359;DP=105;FS=2.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,32:105:99:994,0,2999 -chr24 2799250 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,262 -chr24 3235018 . C CA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.968;DP=208;FS=7.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,36:203:99:238,0,4796 -chr24 3240864 . T A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-5.996;DP=211;FS=9.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,49:211:99:871,0,16972 -chr24 3240871 . C T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-4.027;DP=210;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=4.05;ReadPosRankSum=3.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,42:205:99:878,0,16972 -chr24 3241056 . A C 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-2.488;DP=248;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,65:248:99:1546,0,7510 -chr24 3241621 . A G 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.854;DP=172;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,55:172:99:1302,0,6805 -chr24 3403789 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.325;ClippingRankSum=3.020;DP=34;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=7.26;ReadPosRankSum=-2.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:99:275,0,1181 -chr24 3403999 . G GT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.810;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:245,0,246 -chr24 3416602 . A T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=2.115;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:309,0,685 -chr24 3547578 . C A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-0.310;DP=216;FS=3.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,51:216:99:776,0,9173 -chr24 3556690 . ATC A 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.412;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.60;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:508,0,548 -chr24 4219640 . TA T 1310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.063;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,66:119:99:1348,0,2218 -chr24 4525494 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.622;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:232,0,1230 -chr24 4527731 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.915;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,17:87:99:287,0,2687 -chr24 5050639 . CA C 639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.147;DP=197;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,48:182:99:677,0,3462 -chr24 5061483 . A T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.165;DP=106;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:726,0,2976 -chr24 5341992 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.802;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:283,0,1719 -chr24 5369475 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.775;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:266,0,914 -chr24 5393608 . TG T 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=1.156;DP=40;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:483,0,705 -chr24 5394593 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=2.984;DP=36;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:278,0,1040 -chr24 5736851 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=-0.972;DP=43;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:384,0,1071 -chr24 5976784 . AT A 404.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.532;DP=72;FS=3.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=5.62;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:442,0,1302 -chr24 5978622 . A G 1004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=-0.538;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=15.22;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:1033,0,3684 -chr24 5983571 . T G 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-1.928;DP=89;FS=1.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,24:89:99:551,0,2488 -chr24 6013734 . T A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.395;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:430,0,546 -chr24 6095084 . A G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:239,0,192 -chr24 6192054 . G T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.215;DP=30;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.023;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:354,0,808 -chr24 6192087 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.118;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:244,0,768 -chr24 6192177 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.633;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:331,0,932 -chr24 6200241 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=3.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:311,0,1000 -chr24 6200467 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-1.728;DP=45;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:365,0,1123 -chr24 6200692 . C T 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=1.573;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=15.65;ReadPosRankSum=-2.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:576,0,661 -chr24 6200834 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=1.296;DP=39;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:372,0,943 -chr24 6201210 . C A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=-1.025;DP=46;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,2016 -chr24 6201442 . G T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-1.286;DP=43;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:314,0,1180 -chr24 6201855 . C A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:360,0,264 -chr24 6202326 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-1.699;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=24.55;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:421,0,126 -chr24 6202365 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.171;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.639;QD=24.10;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:462,0,155 -chr24 6203632 . G A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.017;DP=36;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.017;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:656,0,594 -chr24 6217443 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.811;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.564;QD=14.12;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:367,0,443 -chr24 6377921 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:250,0,124 -chr24 6427928 . G A 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.318;DP=49;FS=2.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:955,0,734 -chr24 6445945 . A AT 884.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=-0.059;DP=76;FS=19.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:922,0,2403 -chr24 6446404 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=4.502;DP=92;FS=11.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:711,0,6361 -chr24 6677293 . G C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-0.200;DP=22;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:328,0,446 -chr24 6677350 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=-0.894;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:70:709,0,70 -chr24 6678022 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.619;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=25.89;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:546,0,240 -chr24 6678323 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,154 -chr24 6678454 . G A 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.087;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=24.14;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:511,0,112 -chr24 6678628 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-1.572;DP=30;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:651,0,359 -chr24 6678665 . T C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.361;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.579;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:575,0,291 -chr24 6685697 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:315,0,139 -chr24 7407265 . C A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.62;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,143 -chr24 7468018 . G A 906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:935,66,0 -chr24 7611985 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.335;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:577,0,416 -chr24 7630993 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:452,0,232 -chr24 7649844 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.354;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.626;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:443,0,455 -chr24 7656386 . C A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=-0.494;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.996;QD=16.67;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:545,0,547 -chr24 7685736 . G A 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.670;DP=77;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,46:77:99:1521,0,1096 -chr24 7708955 . CA C 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=1.883;DP=40;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:367,0,589 -chr24 7731927 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=-0.221;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:735,0,828 -chr24 7731942 . TCTGTGAGACACATGGAAAAAGCTGCAGTAATTGAAACACTAGTTACTTAACACACACATATGAACACGCACTTAC T 2327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.672;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.450;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2365,212,0 -chr24 7736826 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.766;DP=41;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.189;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:587,0,789 -chr24 7743226 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.485;DP=55;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:279,0,3221 -chr24 7781102 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.694;ClippingRankSum=-1.222;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,58:186:99:903,0,6381 -chr24 7782826 . A C 1705.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1734,120,0 -chr24 7782902 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=5.674;DP=51;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:452,0,1254 -chr24 7783042 . G A 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:564,42,0 -chr24 7783530 . T G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=2.831;DP=35;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:640,0,567 -chr24 7975140 . C G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.796;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,168 -chr24 8023833 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=1.358;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:249,0,948 -chr24 8049249 . C G 703.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=-0.567;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:18:732,18,0 -chr24 8053960 . A T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:264,0,103 -chr24 8055505 . A T 6697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.321;DP=246;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.657;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,177:246:99:6726,0,1673 -chr24 8056141 . T C 991.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.679;DP=225;FS=2.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,53:225:99:1020,0,7502 -chr24 8056657 . A G 8383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=1.457;DP=331;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=25.33;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,194:331:99:8412,0,11287 -chr24 8060710 . A G 11278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.280;DP=522;FS=0.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.361;QD=21.61;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,340:522:99:11307,0,6122 -chr24 8521543 . T TA 501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.148;DP=196;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,46:195:99:539,0,3915 -chr24 8521829 . T TA 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=-0.846;DP=220;FS=8.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,45:197:99:322,0,3848 -chr24 8540132 . G A 253.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:282,0,19 -chr24 8540612 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=31;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:582,0,757 -chr24 8540939 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=-1.430;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:280,0,1052 -chr24 8542027 . T C 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.847;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:989,0,1078 -chr24 8545137 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.691;DP=19;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=20.67;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:421,0,44 -chr24 8631729 . TCTGAGGATTTGGACATGATTTGAGTCAACTCCGGATGATAACAACCATTTAAAAAATCAGTTTCAAGGCAAAATTCAGCTCGGTATCTAGATCAATTTACTAAATGGATCGTAC T 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=1.369;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:304,0,7728 -chr24 8661597 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=1.447;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:255,0,305 -chr24 8766564 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:300,0,60 -chr24 8783267 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr24 8802123 . T C 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.930;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:89:372,0,89 -chr24 9308845 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.728;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:467,0,1780 -chr24 9356362 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=-1.272;DP=108;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,28:108:99:649,0,2938 -chr24 9376717 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.840;DP=93;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:230,0,2972 -chr24 9381068 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.539;DP=115;FS=4.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,24:114:99:465,0,3524 -chr24 9381242 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=-0.201;DP=109;FS=0.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:480,0,3252 -chr24 9387861 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=29.58;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:324,0,60 -chr24 9390811 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:249,0,338 -chr24 9395199 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.317;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:505,0,423 -chr24 9395759 . A T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.592;DP=73;FS=0.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1027,0,1441 -chr24 9396538 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.466;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:345,0,1123 -chr24 9426474 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-1.399;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.921;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:279,0,476 -chr24 9474136 . T TA 900.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=-1.644;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:1216,115,0 -chr24 9515315 . G A 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.899;DP=63;FS=7.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=12.28;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:802,0,1347 -chr24 9525808 . G T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-2.342;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:291,0,3414 -chr24 9530696 . A T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=-1.588;DP=51;FS=13.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.436;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:774,0,932 -chr24 9532845 . T C 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.966;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=7.66;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:549,0,1758 -chr24 9666608 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=1.031;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:363,0,1823 -chr24 9667016 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.662;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:418,0,1574 -chr24 9673595 . CAT C 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.212;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:275,0,173 -chr24 9674247 . G T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=-0.129;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:380,0,705 -chr24 9696896 . C G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.622;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:554,0,987 -chr24 9717845 . G C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.013;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:305,0,1307 -chr24 9718368 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=1.402;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:339,0,1434 -chr24 9720173 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.687;DP=42;FS=1.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:256,0,1650 -chr24 9730075 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=-0.424;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:357,0,3748 -chr24 10110019 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.652;DP=36;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:319,0,958 -chr24 10119638 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.263;DP=39;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=8.30;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:352,0,1021 -chr24 10119659 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.418;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:533,0,871 -chr24 10130157 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:405,0,472 -chr24 10130325 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.734;DP=41;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,8:38:99:235,0,1190 -chr24 10146301 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.380;DP=16;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:413,0,198 -chr24 10146823 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,297 -chr24 10720649 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.475;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=10.93;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:367,0,712 -chr24 10839712 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:339,0,542 -chr24 10839719 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.313;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:272,0,704 -chr24 10842850 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=1.618;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:875,0,1174 -chr24 10843467 . T C 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.581;DP=70;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:504,0,3805 -chr24 10843469 . G T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.575;DP=73;FS=7.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:504,0,3805 -chr24 10855713 . G GTGTGGAACACA 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=2.606;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=10.19;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:557,0,373 -chr24 11123055 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=1.137;DP=49;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:330,0,1293 -chr24 11129071 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=1.508;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:506,0,1725 -chr24 11129072 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=1.127;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:506,0,1738 -chr24 11256063 . C T 1379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.034;DP=176;FS=6.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,54:174:99:1408,0,4576 -chr24 11369357 . A T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.954;DP=41;FS=9.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.304;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:411,0,892 -chr24 11369580 . G T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=2.950;DP=45;FS=10.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:556,0,1004 -chr24 11369603 . T G 356.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=19.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:676,54,0 -chr24 11369644 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=3.548;DP=41;FS=30.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=12.99;ReadPosRankSum=-3.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:561,0,600 -chr24 11369762 . C G 3016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.280;DP=110;FS=4.586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=27.43;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:69:99:3045,214,0 -chr24 11369788 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.422;DP=47;FS=5.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:529,0,668 -chr24 11370066 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.272;DP=25;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=8.79;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,391 -chr24 11628070 . C G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr24 11686305 . A AAAAAAGCTCCCCATCCAAG 612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.990;DP=356;FS=4.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,28:29:79:650,0,79 -chr24 11921093 . G T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr24 11923022 . T C 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=2.261;DP=33;FS=8.587;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:29:972,29,0 -chr24 11924314 . C A 1025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=4.389;DP=90;FS=42.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=11.40;ReadPosRankSum=-4.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1054,0,1019 -chr24 11924343 . T A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-1.614;DP=30;FS=2.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=15.09;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:481,0,82 -chr24 11924696 . G C 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=3.264;DP=60;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:585,0,636 -chr24 11925115 . G T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=-0.075;DP=17;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.565;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:603,0,34 -chr24 11950267 . T C 1237.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1266,87,0 -chr24 11950272 . T C 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.311;DP=44;FS=4.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=23.22;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:81:1050,0,81 -chr24 11950382 . T A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.423;DP=18;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:404,0,218 -chr24 11951246 . A C 761.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:99:790,0,171 -chr24 11951340 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.355;DP=76;FS=2.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=2.76;ReadPosRankSum=3.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:238,0,2219 -chr24 11951384 . A C 2213.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=-1.026;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:99:2242,118,0 -chr24 11951423 . T C 1813.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=1.129;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.207;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:99:1842,132,0 -chr24 11951478 . A C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.513;DP=18;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:251,0,366 -chr24 12316169 . A G 511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.224;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=28.43;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:32:549,0,32 -chr24 12500003 . T C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr24 12531775 . AT A 503.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.147;DP=39;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:541,0,167 -chr24 12645040 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,146 -chr24 12871114 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.403;DP=64;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=10.47;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:698,0,1428 -chr24 12874947 . A T 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.662;DP=70;FS=3.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:852,0,1511 -chr24 12887611 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.869;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:339,0,333 -chr24 12919715 . AT A 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.537;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:444,0,128 -chr24 12927187 . C T 1763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=1.613;DP=258;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=6.84;ReadPosRankSum=-2.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,74:258:99:1792,0,6818 -chr24 13143178 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=-0.020;DP=137;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,26:134:99:358,0,7817 -chr24 13156681 . T TA 1838.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-0.971;DP=206;FS=5.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,82:200:99:1876,0,2980 -chr24 13159533 . C T 5529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.042;DP=355;FS=0.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,159:354:99:5558,0,6264 -chr24 13917820 . TA T 1132.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-0.193;DP=101;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,49:92:99:1170,0,914 -chr24 13918005 . A AT 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-0.594;DP=90;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,24:83:99:264,0,1672 -chr24 14137974 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-0.097;DP=54;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:303,0,3410 -chr24 14138488 . A G 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-1.830;DP=251;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,106:251:99:3881,0,4913 -chr24 14289538 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.337;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:679,0,1646 -chr24 14290157 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.448;DP=56;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=4.64;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:288,0,1846 -chr24 14290183 . C T 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.937;DP=61;FS=3.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=13.32;ReadPosRankSum=3.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:841,0,1239 -chr24 14320098 . G A 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.093;DP=76;FS=3.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:861,0,1768 -chr24 14459034 . TA T 624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.250;DP=26;FS=3.098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=24.03;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:44:662,44,0 -chr24 14464684 . GC G 3866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-1.079;DP=159;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=24.32;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,119:146:99:3904,0,277 -chr24 14467468 . C CA 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=-0.610;DP=70;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.532;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:303,0,1085 -chr24 14471474 . C T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=-2.001;DP=33;FS=12.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:295,0,1858 -chr24 14481384 . C CGA 1478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.352;DP=316;FS=8.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.070;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,78:272:99:1516,0,6800 -chr24 14540628 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=1.999;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=12.51;ReadPosRankSum=-2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:366,0,516 -chr24 15066723 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:274,0,305 -chr24 15123600 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.292;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:409,0,680 -chr24 15135684 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.041;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:237,0,769 -chr24 15649947 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.684;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=25.47;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:232,0,103 -chr24 15650612 . G C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-1.194;DP=28;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=12.63;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,520 -chr24 15783101 . C A 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr24 15978946 . G C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.003;DP=165;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=4.50;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,34:132:99:771,0,3736 -chr24 15979015 . A G 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=1.978;DP=153;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,31:105:99:729,0,6632 -chr24 15979022 . T C 1457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.347;DP=126;FS=2.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,34:88:99:1486,0,2045 -chr24 15979025 . A G 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.059;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,30:86:99:830,0,3437 -chr24 16079362 . T G 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.996;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:426,0,253 -chr24 16368907 . G A 520.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:549,39,0 -chr24 16368944 . C T 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr24 16370039 . A G 7523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=-1.136;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=27.16;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,65:79:99:7552,326,0 -chr24 16370109 . C T 5017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-2.488;DP=472;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,146:412:99:5046,0,9996 -chr24 16370312 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=1.487;DP=104;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,16:95:99:266,0,6104 -chr24 16370314 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=2.347;DP=94;FS=4.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=2.53;ReadPosRankSum=-2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,16:86:99:266,0,6104 -chr24 16370542 . G C 1488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=-4.221;DP=84;FS=44.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=17.72;ReadPosRankSum=-3.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,43:65:99:1517,0,771 -chr24 16371617 . TA T 4862.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=-3.269;DP=613;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=7.93;ReadPosRankSum=2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:332,227:559:99:4900,0,8501 -chr24 16371928 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.312;DP=77;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=3.39;ReadPosRankSum=-2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:289,0,1786 -chr24 16371961 . C T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-1.822;DP=29;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=27.44;ReadPosRankSum=1.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:92:824,0,92 -chr24 16372062 . A C 1860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1889,132,0 -chr24 16372117 . T G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr24 16372493 . A G 3030.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:3059,214,0 -chr24 16407972 . A C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-0.231;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=23.98;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:340,0,134 -chr24 16407989 . T TA 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:425,42,0 -chr24 16408487 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=3.016;DP=18;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:245,0,218 -chr24 16412352 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr24 16428342 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:264,0,51 -chr24 16440539 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr24 16748168 . A C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-3.690;DP=166;FS=2.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,32:166:99:505,0,10563 -chr24 16748196 . G C 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=1.124;DP=166;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,38:166:99:754,0,5592 -chr24 16750029 . T A 1279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.294;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,39:109:99:1308,0,2455 -chr24 16750074 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.872;DP=66;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.750;QD=12.01;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:821,0,1389 -chr24 16750091 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.823;DP=36;FS=7.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=11.22;ReadPosRankSum=3.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:432,0,818 -chr24 16750394 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=1.056;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:237,0,454 -chr24 17463805 . C T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.242;DP=132;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,28:132:99:550,0,3871 -chr24 17566165 . T C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=1.049;DP=85;FS=3.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=5.53;ReadPosRankSum=2.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:498,0,2382 -chr24 17568609 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=-1.537;DP=101;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:479,0,2922 -chr24 17571131 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=3.090;DP=59;FS=9.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:339,0,1753 -chr24 17578345 . G A 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=3.303;DP=108;FS=7.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.788;QD=6.33;ReadPosRankSum=-3.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,30:108:99:712,0,2880 -chr24 17580783 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=25.62;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:310,0,95 -chr24 17684594 . GACCT G 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=8.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,0:53:99:468,0,10841 -chr24 17684600 . CTTTTGAGGCAGT C 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=-0.613;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=6.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,1:65:99:491,0,10841 -chr24 17727166 . C T 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=-0.453;DP=40;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=13.92;ReadPosRankSum=-1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:585,0,543 -chr24 17727501 . A T 479.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=1.504;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:0:505,0,0 -chr24 17727643 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr24 17728371 . T G 352.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:10:380,0,10 -chr24 17728458 . A G 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:39:503,39,0 -chr24 17728543 . A G 225.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8:253,0,8 -chr24 17746236 . TGTACGCGTGCAGAGACTTGCGCACCCACATTATTTGAATTTGCTTCTATCTTTTTTTTTTTTTTCTGACTTTATGCACGTTTCTTCTTTAG T 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:314,0,810 -chr24 17909309 . CGGTAGCTAACCTCTCTCTCGCAGACACTGACTGTTCACGTGCCCCTCACCAGCTGACAACCTCCTACCTTTTTCTCCACACA C 7357.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=3.495;DP=173;FS=2.841;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=26.94;ReadPosRankSum=-1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,159:169:99:7395,610,0 -chr24 18995650 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=-1.025;DP=270;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,42:270:99:419,0,10375 -chr24 19016114 . TTG T 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.193;DP=21;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:391,0,283 -chr24 19024878 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.784;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.928;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:532,0,204 -chr24 19024892 . CACCTAGGATTAATAACAAGTTTTGTTCTATAAGTTAAAAAAACTAGTAAAGACATATACAGTACAGCACAAATTTAAATATCAGATCAAACTGTGACACGCAGTCAAAAATAATATAGCGCATCTGTTCCTCAAAGAAAATAAGCCTTGATGCGTTATTTCCAGTGTGTGTTAATGTTTGGCTACGTTACCT C 842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.822;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:82:880,82,0 -chr24 19106631 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=-0.124;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:501,0,547 -chr24 19148359 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=-0.385;DP=31;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=20.41;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:661,0,431 -chr24 19167599 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.481;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:275,0,561 -chr24 19301212 . G A 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-0.048;DP=52;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:709,0,1016 -chr24 19304179 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-1.155;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=19.60;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:734,0,502 -chr24 19325619 . T A 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.553;DP=50;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:849,0,826 -chr24 19332409 . G T 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.943;DP=60;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:746,0,1354 -chr24 20091741 . C T 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=-1.200;DP=96;FS=11.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:1436,0,1850 -chr24 20093986 . A G 2438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=-1.010;DP=138;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,74:138:99:2467,0,2277 -chr24 20111763 . AAGGTAAGAGCTTTAAATGCCAGATTTTGGATTGTCAGCTGATTTTGTCATGTATGAGTTGGGAAGGAAATGTGTGTGATGGTTTTGTATTGC A 1171.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=1.181;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=9.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,124:126:99:1209,297,0 -chr24 20242042 . G A 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=1.135;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:440,0,289 -chr24 20245331 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:427,0,200 -chr24 20247167 . TG T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-2.489;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:261,0,673 -chr24 20256486 . T C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-1.060;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:381,0,2748 -chr24 20257169 . G A 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=2.234;DP=118;FS=9.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.094;QD=12.36;ReadPosRankSum=-2.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,44:118:99:1487,0,2251 -chr24 20258354 . G A 2263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.224;DP=131;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,70:131:99:2292,0,2156 -chr24 20440432 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.028;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=10.91;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,532 -chr24 20440505 . G C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:239,0,378 -chr24 20440559 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=1.449;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=21.54;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:416,0,251 -chr24 20440706 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-1.445;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:396,0,282 -chr24 20441581 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,226 -chr24 20441629 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=14.61;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:262,0,335 -chr24 20442280 . A C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=1.771;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=25.08;ReadPosRankSum=-1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:605,0,233 -chr24 20442763 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:340,0,91 -chr24 20669440 . A G 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 -chr24 20673344 . G A 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=-0.486;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:477,0,1469 -chr24 20673608 . C A 1262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-1.567;DP=83;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,36:83:99:1291,0,1640 -chr24 20674940 . G C 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.857;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:1021,0,1754 -chr24 20675018 . CT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-1.880;DP=87;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:324,0,1760 -chr24 20675355 . C A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.802;DP=91;FS=0.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,32:91:99:1103,0,1998 -chr24 20703921 . G A 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=-0.129;DP=66;FS=3.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.544;QD=10.53;ReadPosRankSum=2.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:723,0,1605 -chr24 20796909 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:412,0,464 -chr24 20940768 . GT G 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-1.200;DP=28;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:296,0,239 -chr24 21146006 . C A 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.411;DP=444;FS=4.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=2.66;ReadPosRankSum=3.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:344,79:423:99:1209,0,13232 -chr24 21161218 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.387;DP=352;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,49:352:99:245,0,12031 -chr24 21174763 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.116;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:247,0,2184 -chr24 21174808 . C T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.134;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:437,0,2404 -chr24 21178565 . C A 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.102;DP=118;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,36:118:99:939,0,3115 -chr24 21184580 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=-0.015;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:456,0,849 -chr24 21252521 . T TA,TAA 294.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.742;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=9.81;ReadPosRankSum=0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,10,10:22:99:612,239,197,217,0,210 -chr24 21253216 . TCCTGAATTAAAAAAAATATATATGCAAACACTTAAAAAAAAGGTGTACAGAATTAACATATAGATATTAAAAACAATGTCTTCTAAAATCAA T 4888.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=1.896;DP=156;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=31.34;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,138:145:99:5260,0,546 -chr24 21259143 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=1.012;DP=66;FS=4.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:258,0,3345 -chr24 21506231 . G GT 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-2.679;DP=219;FS=7.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,57:214:99:420,0,6613 -chr24 21525550 . T C 3542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=-0.336;DP=143;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,98:138:99:3571,0,996 -chr24 21600484 . T G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=-0.428;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,253 -chr24 21600738 . C A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-1.313;DP=24;FS=1.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.182;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:407,0,347 -chr24 21603598 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.598;DP=23;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:368,0,1047 -chr24 21603604 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.598;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:368,0,1049 -chr24 21604656 . C T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-1.388;DP=33;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:517,0,592 -chr24 21614357 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:235,0,58 -chr24 21763171 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.949;DP=163;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,30:163:99:458,0,5019 -chr24 21783430 . G C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.082;DP=215;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=3.11;ReadPosRankSum=2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,42:215:99:696,0,6698 -chr24 21790273 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.903;DP=184;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,30:183:99:362,0,5988 -chr24 21791222 . C CT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.707;DP=162;FS=9.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,31:151:99:287,0,3812 -chr24 21825742 . G T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-1.701;DP=278;FS=7.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:238,40:278:99:245,0,8728 -chr24 21941429 . ACCTGAGAGAAGAGCATTAAAAACAATACAGCGCTATGGAAAATGTCTCTGACTGTATGTCATTAGCAAACTGCTTCTTGACTTTTCATAACTTG A 1620.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.284;DP=49;FS=10.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=33.08;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,39:45:99:1658,0,1492 -chr24 21949101 . TCCTATAACACACTCTTAACTTATGAGCTTGCACAAGAACATAATACATTTTTGCATGCTTGTTTCTACAACACAATAATTGACTA T 1498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=1.798;DP=38;FS=7.134;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=28.25;ReadPosRankSum=-2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:99:1536,125,0 -chr24 21971334 . TA T 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.386;DP=28;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=14.42;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:441,0,196 -chr24 22111313 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=12.21;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:248,0,407 -chr24 22183325 . A T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=201;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,32:200:99:322,0,6508 -chr24 22183496 . C T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.108;DP=184;FS=3.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,47:184:99:959,0,4965 -chr24 22328292 . G T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.957;DP=37;FS=5.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=8.51;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:343,0,977 -chr24 22550606 . TCCTATCAGGTAAAAATAACTATTCTTTAAAAATGGTTTTTAAAAGGTGCAGGTATTTCTATCTGTGTAATGCTCATAAATGGA T 1952.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=3.276;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=30.40;ReadPosRankSum=-2.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,47:51:99:1990,0,1143 -chr24 22592146 . C CA 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.287;ClippingRankSum=2.012;DP=49;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:293,0,573 -chr24 22711387 . T A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.685;DP=308;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,50:307:99:535,0,9579 -chr24 23094583 . T G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=-1.197;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:256,0,570 -chr24 23096051 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=-0.991;DP=30;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:304,0,551 -chr24 23253272 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.840;DP=42;FS=20.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=10.92;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:487,0,847 -chr24 23253481 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=15.62;ReadPosRankSum=-1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:325,0,374 -chr24 23821593 . C G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.507;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:437,0,1484 -chr24 23822038 . T TAC 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.562;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:286,0,585 -chr24 23851636 . C A 1187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.510;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,34:69:99:1216,0,1226 -chr24 23851999 . C T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=-2.010;DP=69;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:973,0,1479 -chr24 23853077 . C CT 727.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.937;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:886,0,568 -chr24 23854095 . C G 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.396;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:1210,0,1506 -chr24 23855880 . G A 1413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.614;DP=79;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1442,0,1388 -chr24 23859867 . C A 1728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.064;DP=81;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,52:81:99:1757,0,939 -chr24 23860943 . A T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.714;DP=58;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:507,0,1510 -chr24 23910953 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.724;DP=38;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=13.76;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:551,0,746 -chr24 24299227 . G T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.739;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=17.27;ReadPosRankSum=3.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:460,0,816 -chr24 24316818 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:382,0,244 -chr24 24318319 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.315;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:412,0,380 -chr24 24354318 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=3.934;DP=56;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=13.50;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:784,0,1244 -chr24 24366996 . T G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=1.172;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.557;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:698,0,1031 -chr24 24367322 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=1.759;DP=45;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=7.51;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:375,0,828 -chr24 24367347 . G T 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.176;DP=45;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=12.48;ReadPosRankSum=1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:590,0,1319 -chr24 24367563 . A C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:253,0,408 -chr24 24369130 . GCTGCGGAGCAAGAATTTAAGCTTTACTTTGTCTATATTTCCAGAGGCAGCAAGCCAGATTTATGCTTTATTTGTGCCTTAC G 1422.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.473;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:99:1460,124,0 -chr24 24405495 . G A 1034.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.190;DP=62;FS=4.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1063,0,1066 -chr24 24424129 . CT C 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.215;DP=40;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:419,0,627 -chr24 24424725 . C T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.258;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:522,0,609 -chr24 24424750 . T C 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=1.221;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=16.06;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:719,0,751 -chr24 24425380 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.107;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:888,0,1003 -chr24 24425455 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-0.908;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=20.63;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:998,0,646 -chr24 24446385 . A C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=1.057;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:671,0,1909 -chr24 24446600 . TC T 1438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=-1.469;DP=153;FS=6.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.188;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,53:146:99:1476,0,2667 -chr24 24447038 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-0.060;DP=226;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,41:225:99:589,0,6988 -chr24 24447086 . G A 3694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.645;DP=214;FS=4.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,105:214:99:3723,0,3923 -chr24 24449732 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=4.584;DP=112;FS=28.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=2.09;ReadPosRankSum=-4.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:262,0,5245 -chr24 24451120 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=2.716;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=5.67;ReadPosRankSum=2.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:408,0,4156 -chr24 24457783 . G C 1432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.426;DP=91;FS=8.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.123;QD=15.74;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,42:91:99:1461,0,1897 -chr24 24463812 . G A 4122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=1.059;DP=216;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,127:216:99:4151,0,3184 -chr24 24465879 . C G 3501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-1.046;DP=202;FS=3.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,107:201:99:3530,0,3411 -chr24 24490756 . A C 3379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-0.041;DP=174;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=19.42;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,100:174:99:3408,0,2637 -chr24 24540017 . C G 3510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-2.242;DP=203;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=17.29;ReadPosRankSum=1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,97:203:99:3539,0,3507 -chr24 24544154 . GT G 482.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-0.315;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:27:520,27,0 -chr24 24567616 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.257;DP=34;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:237,0,835 -chr24 24627880 . A C 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-0.701;DP=41;FS=4.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:803,0,614 -chr24 24636015 . T G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-1.403;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:535,0,743 -chr24 24648191 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,147 -chr24 24650974 . C G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.97;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:271,0,63 -chr24 24656139 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.311;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=27.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:80:410,0,80 -chr24 24656630 . C T 294.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:4:321,0,4 -chr24 24709938 . C A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=3.496;DP=55;FS=7.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=12.50;ReadPosRankSum=-4.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:716,0,1253 -chr24 24716601 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=1.768;DP=181;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,30:181:99:366,0,5558 -chr24 24718725 . T G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=-4.748;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=3.63;ReadPosRankSum=-5.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,20:86:99:344,0,2461 -chr24 24719087 . G A 2717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.018;DP=176;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=15.44;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,79:176:99:2746,0,3174 -chr24 24719463 . A T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-1.908;DP=58;FS=7.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:489,0,1588 -chr24 24720247 . A C 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=-0.931;DP=54;FS=6.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:539,0,4301 -chr24 24720714 . A C 2061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=-1.873;DP=83;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=24.84;ReadPosRankSum=1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,55:83:99:2090,0,1937 -chr24 24720715 . G A 2055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=-1.719;DP=85;FS=0.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=24.19;ReadPosRankSum=2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,56:85:99:2084,0,1937 -chr24 24721914 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=3.445;DP=58;FS=2.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.918;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:384,0,1669 -chr24 24723322 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.744;DP=211;FS=6.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,31:211:99:280,0,6971 -chr24 24723929 . GT G 210.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:245,0,0 -chr24 24729629 . G A 1454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.392;DP=85;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,45:85:99:1483,0,1458 -chr24 24733669 . A G 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=1.353;DP=104;FS=7.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,64:104:99:2146,0,1345 -chr24 24734866 . G C 2042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=-1.160;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.160;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,64:109:99:2071,0,1625 -chr24 24738844 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-1.114;DP=127;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=2.93;ReadPosRankSum=2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:400,0,3528 -chr24 24772443 . TAA T 1401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=-0.066;DP=126;FS=1.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1751,0,1883 -chr24 24773019 . G A 7513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.420;DP=465;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,240:465:99:7542,0,8073 -chr24 24784324 . T A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=1.636;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:528,0,857 -chr24 24784335 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:255,0,933 -chr24 24784845 . T G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.079;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:399,0,774 -chr24 25069750 . C G 1861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.803;DP=102;FS=2.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,58:101:99:1890,0,1532 -chr24 25070311 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.995;DP=94;FS=3.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,18:94:99:305,0,2838 -chr24 25309912 . T A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.132;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:578,0,582 -chr24 25310451 . GGA G 834.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-0.771;DP=42;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:872,0,483 -chr24 25310812 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=-0.502;DP=56;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:627,0,1298 -chr24 25339114 . GAGGCAAGTGTGTTTCTGTGGATTATGAAAACAAGGCTTCTTTTTAACACTTACCAAATAAGTGTTCATTTATTCTTTCCTTCAC G 2342.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.490;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=25.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2380,207,0 -chr24 25339374 . TGGTAGGTGAAGTCACTTTTAAAAATCGTATCTGATGTATATTGTCTTATTGCAGTATAATTATCTTTTGCA T 1352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=1.613;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=30.06;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:99:1390,0,3380 -chr24 25340004 . C CT 832.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=25.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:87:883,87,0 -chr24 25341400 . GTT G 630.48 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.484;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=14.01;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:24:939,0,24 -chr24 25341507 . CA C,CAA 862.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.543;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:19,41,22:82:99:1143,213,639,761,0,1367 -chr24 25341615 . C CA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-1.763;DP=103;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=2.03;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,21:94:99:246,0,2024 -chr24 25346970 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.997;DP=129;FS=3.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,21:128:99:252,0,3933 -chr24 25347053 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=1.074;DP=140;FS=0.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,26:140:99:393,0,4383 -chr24 25348766 . GCTGTGGACAAACACACAGACAGAGCCAAAGAGGGAATAAGTGCAGAAGAGTTCATTGTAAGGTAATTATGTGTCATACCAGCTGTAATCACAC G 4871.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=1.702;DP=114;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:114:99:4909,391,0 -chr24 25404903 . C A 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.995;DP=49;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1139,0,421 -chr24 25538870 . GAGGTACAGACACATTTCAACATACTATACACAATACCATGAATCGTGTGGTCCTCAACTGATATGACATATGTACATATATGTTA G 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=36.69;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:669,0,706 -chr24 25539107 . AAGGTTAGTTATCATGTAAAGTACTAGTACAGTACTCTACCCATAATTCCCTATGGTTAACCCTCCAATTGGTTTTCCCT A 815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=27.17;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:71:853,71,0 -chr24 25623712 . ACT A 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=-1.368;DP=42;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=5.42;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:265,0,961 -chr24 25657250 . G GTTGAACGCATTGGCA 1886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-1.043;DP=68;FS=13.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=27.75;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,49:65:99:1924,0,377 -chr24 25660814 . AGTGAGTAAACAAACAGTCATGTCCTTCTCATCTCAAAGCCTTTCATTCATTTGAGTATGATTGCAG A 2273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.919;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=31.58;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,54:65:99:2311,0,1423 -chr24 25667430 . A AT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.725;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:287,0,164 -chr24 25976930 . AT A 615.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:653,45,0 -chr24 26202153 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=-0.083;DP=57;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:324,0,1616 -chr24 26210398 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-1.096;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:373,0,1707 -chr24 26236747 . AAGGTGCACTGATTCGCATGAACTAAATCTACCCTGAGCCCAAATATGGTGATTTTTAATATTGAATATCTGTGCCGC A 3741.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=1.692;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.533;QD=31.96;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3779,297,0 -chr24 26446816 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=-0.168;DP=40;FS=4.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:491,0,869 -chr24 26561441 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.469;ClippingRankSum=-0.383;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:260,0,1262 -chr24 26739920 . T C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-2.233;DP=24;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:696,0,141 -chr24 26742319 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=20.71;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:401,0,231 -chr24 26745939 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-1.278;DP=20;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=25.39;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:536,0,154 -chr24 26745978 . A G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.906;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=23.92;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:411,0,162 -chr24 26753072 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=25.91;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:45:365,0,45 -chr24 26783722 . T A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.246;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=19.71;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:245,0,178 -chr24 26783821 . C G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:43:425,0,43 -chr24 26783842 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.18;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:310,0,57 -chr24 26784179 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=-0.801;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:314,0,511 -chr24 26784630 . A G 397.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=33.10;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:4:424,0,4 -chr24 26784663 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=1.656;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,229 -chr24 26784773 . T G 322.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=32.20;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:350,0,12 -chr24 26813735 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.705;DP=22;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:603,0,105 -chr24 26817091 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=-0.531;DP=87;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:267,0,2706 -chr24 26828674 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.680;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=12.07;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:487,0,910 -chr24 26854000 . C T 274.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:303,0,19 -chr24 27076851 . C G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.053;DP=323;FS=1.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,47:318:99:376,0,10127 -chr24 27077377 . G A 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.123;DP=318;FS=5.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,64:317:99:1130,0,9555 -chr24 27077686 . C G 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-2.566;DP=271;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,63:271:99:1158,0,9262 -chr24 27078305 . TCTGGCAGAACCATCAGGTGTCATTTCATTCACATATAAATTATACAAGATATATATGGATTGGGACTCACTGACAAGACAGGGAAACAAGCCATACTTAC T 16962.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=2.243;DP=384;FS=2.820;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,364:374:99:17000,1429,0 -chr24 27079249 . A T 1956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=-0.766;DP=605;FS=4.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.682;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:484,120:604:99:1985,0,19008 -chr24 27079826 . G A 3512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=-2.395;DP=726;FS=7.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=4.84;ReadPosRankSum=3.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:557,168:725:99:3541,0,21272 -chr24 27174975 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=-0.075;DP=43;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=16.55;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:740,0,721 -chr24 27236094 . C T 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-1.214;DP=92;FS=4.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,33:90:99:1144,0,3555 -chr24 27236673 . G A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.581;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=27.26;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:846,0,111 -chr24 27236705 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:408,0,298 -chr24 27236811 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-2.357;DP=27;FS=10.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:356,0,581 -chr24 27236875 . A G 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=2.027;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:503,0,483 -chr24 27278898 . G GA 2380.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-2.775;DP=270;FS=18.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,126:231:99:2418,0,6649 -chr24 27288784 . A AC 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-0.283;DP=24;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=8.74;ReadPosRankSum=-2.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:247,0,1116 -chr24 27289774 . CT C 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=1.465;DP=53;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:553,0,602 -chr24 27289914 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=-0.111;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:429,0,1297 -chr24 27290940 . C CT 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-2.103;DP=40;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:313,0,376 -chr24 27323888 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.449;DP=76;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,17:76:99:410,0,4688 -chr24 27323890 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.462;DP=75;FS=2.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:410,0,4688 -chr24 27326305 . C G 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=-0.292;DP=71;FS=11.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:520,0,1816 -chr24 27560446 . G A 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.817;ClippingRankSum=-1.355;DP=44;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=17.34;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:791,0,1155 -chr24 27596651 . C A 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-1.030;DP=66;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:869,0,1251 -chr24 27603665 . C T 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.068;DP=61;FS=2.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,28:59:99:929,0,1047 -chr24 27608735 . G A 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-2.180;DP=62;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=26.64;ReadPosRankSum=2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,48:62:99:1680,0,247 -chr24 27766235 . TGGTAAGCCTATAAACGCTATTAGCCAATACAACTGTAACGATGAGTTAGATAATGATAATGCTGTCTGTTTATTTCCTCTCA T 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.566;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:297,0,687 -chr24 27804504 . G GT 263.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=1.826;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:25:301,0,25 -chr24 27807319 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.275;DP=165;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,26:165:99:273,0,5307 -chr24 27811521 . GA G 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.049;DP=37;FS=3.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:660,0,233 -chr24 27813708 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=1.144;DP=65;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:308,0,2034 -chr24 27830169 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=1.993;DP=142;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=1.58;ReadPosRankSum=2.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,23:135:99:253,0,4315 -chr24 27841183 . G A 2345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.343;DP=125;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:2374,0,3498 -chr24 27878993 . AAGGTATACTGCTGCAAAAGTGACATCACATTTTTGACTGTTGCAGTTTCAGATATTGTGTTGTCGCATAATATTTTTGGTTTGATTAT A 1894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.365;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=34.45;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,45:51:99:1932,0,1790 -chr24 27891114 . AT A 462.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=1.349;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:22:500,22,0 -chr24 28063397 . A G 1353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1382,99,0 -chr24 28065170 . T A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,371 -chr24 28066631 . T C 1745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1774,129,0 -chr24 28070994 . T C 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=1.055;DP=30;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:793,0,261 -chr24 28114137 . C A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-0.181;DP=113;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,27:110:99:564,0,2932 -chr24 28115408 . C A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=1.306;DP=42;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=7.80;ReadPosRankSum=-1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:356,0,1468 -chr24 28115556 . A T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.023;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.354;QD=9.03;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:290,0,901 -chr24 28547954 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.328;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.500;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,23:100:99:482,0,2955 -chr24 28584111 . G A 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-0.398;DP=88;FS=4.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:634,0,2315 -chr24 28749596 . T G 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=1.544;DP=54;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=7.66;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:442,0,1404 -chr24 29319862 . TA T 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=-0.561;DP=47;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:435,0,603 -chr24 29349108 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=-1.238;DP=40;FS=3.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:289,0,1167 -chr24 29370972 . A G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.926;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:260,0,883 -chr24 29571043 . GCTGTGAAGCATAGCAATAAATGCAATACATTACATTTAATCGATTTCTAAAGTAGTTTGACTCTTCTGGTACTCAC G 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.75;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:251,0,1336 -chr24 29686940 . C T 1138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-2.741;DP=282;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,62:282:99:1167,0,8661 -chr24 29687356 . CT C 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.827;DP=96;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,29:74:99:379,0,857 -chr24 29687794 . A G 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.311;ClippingRankSum=0.915;DP=384;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:325,56:381:99:318,0,12791 -chr24 29703712 . C A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.826;DP=477;FS=1.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:390,86:476:99:1160,0,20135 -chr24 29703736 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.279;DP=394;FS=4.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=2.03;ReadPosRankSum=5.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,66:379:99:829,0,11511 -chr24 29707712 . G A 1947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=-0.254;DP=627;FS=7.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:505,122:627:99:1976,0,18827 -chr24 29753226 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-0.630;DP=634;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:544,87:631:99:487,0,20360 -chr24 29809060 . G T 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.922;ClippingRankSum=2.465;DP=360;FS=2.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,71:360:99:1093,0,15270 -chr24 30524087 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.718;DP=61;FS=5.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:272,0,1846 -chr24 30524434 . A G 3148.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3177,229,0 -chr24 30524549 . A G 772.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=-0.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:22:801,22,0 -chr24 30578878 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=2.671;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:308,0,848 -chr24 30600070 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.137;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:370,0,479 -chr24 30758937 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.344;DP=33;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:243,0,1059 -chr24 31064636 . A G 250.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:279,21,0 -chr24 31165371 . T G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=1.888;DP=79;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:354,0,2326 -chr24 31198439 . CTT C 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.384;DP=163;FS=7.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,53:103:99:1694,0,1306 -chr24 31252355 . AT A 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.197;DP=19;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=16.51;ReadPosRankSum=-2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:351,0,101 -chr24 31404694 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.503;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.65;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:241,0,887 -chr24 31428116 . A G 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=-0.887;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:45:99:1305,0,180 -chr24 31437257 . GAA G 265.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:303,24,0 -chr24 31457095 . C A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=-2.436;DP=104;FS=2.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:245,0,3146 -chr24 31685431 . G A 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.346;DP=81;FS=8.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,57:81:99:2039,0,748 -chr24 31703426 . CGTGAGTAAAAGCTGCATTCGCCATTTGTCAGTCTGTGTGTCAGTCGTCGGTGAGCCGCCTCATTTTTCTGTCATGTTTTGAAG C 3684.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=1.003;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=32.04;ReadPosRankSum=-1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,100:108:99:3722,0,370 -chr24 31703576 . C T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=-0.012;DP=99;FS=4.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,27:99:99:672,0,2755 -chr24 31706002 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.325;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:260,0,1356 -chr24 32799078 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=1.664;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=25.40;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:94:333,0,94 -chr24 32799504 . T G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=28.45;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:87:455,0,87 -chr24 32803330 . C T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=19.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:307,0,220 -chr24 33105550 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr24 33153406 . TA T 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.140;DP=46;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:329,0,721 -chr24 33154568 . A T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.022;DP=30;FS=1.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:306,0,849 -chr24 33155057 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=-0.184;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:468,0,1292 -chr24 33155344 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=-1.815;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:363,0,1321 -chr24 33381955 . T C 1987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-2.987;DP=150;FS=10.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,58:148:99:2016,0,2973 -chr24 33389013 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:237,0,143 -chr24 33620525 . GCTGAAAGAAAATAAAAGTGGACCATTAACAACACTTATTTAACCATCATCAAATCCAATTCTTCTCATTGGACTGTGTGTTTCTTAC G 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,716 -chr24 33723395 . AGT A 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-1.537;DP=111;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,30:111:99:807,0,3335 -chr24 33723570 . ACC A,AC 1813.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-0.037;DP=47;FS=14.548;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,15,17:34:99:2254,417,669,1553,0,1508 -chr24 33723679 . G GC 1377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-1.762;DP=406;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,102:385:99:1415,0,7511 -chr24 33854457 . A AT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.084;DP=112;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=2.68;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,22:112:99:337,0,3321 -chr24 34522903 . TA T 2415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:99:2453,0,1484 -chr24 34716909 . G T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-1.457;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:450,0,372 -chr24 34865525 . G A 518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:547,39,0 -chr24 34928906 . C A 401.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:430,36,0 -chr24 34959490 . G GA 223.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:17:261,17,0 -chr24 35054884 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.044;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:460,0,887 -chr24 35100473 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=1.811;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:330,0,389 -chr24 35107862 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:246,0,408 -chr24 35408303 . C T 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-0.722;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=32.26;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:58:1125,0,58 -chr24 35413905 . T A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-0.113;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=23.36;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:402,0,161 -chr24 35414096 . T TA 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:46:291,0,46 -chr24 35414817 . GA G 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.480;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:44:270,0,44 -chr24 35415311 . T G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-2.452;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:399,0,311 -chr24 35416898 . T C 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr24 35417634 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.153;DP=24;FS=1.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=10.12;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:271,0,576 -chr24 35418528 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.775;DP=31;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:358,0,729 -chr24 35418675 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-1.488;DP=37;FS=3.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:240,0,3483 -chr24 35418676 . G T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.901;DP=36;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:240,0,3483 -chr24 35419729 . G T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=-2.002;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:405,0,1498 -chr24 35435961 . C T 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.517;DP=26;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:442,0,466 -chr24 35438421 . T A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.179;DP=34;FS=11.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:656,0,521 -chr24 35830187 . TA T 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.279;DP=120;FS=6.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,33:114:99:644,0,1969 -chr24 35875486 . G C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr24 36471207 . G C 1335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=1.951;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,40:69:99:1364,0,1035 -chr24 36490993 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.957;DP=37;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.808;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:577,0,626 -chr24 36657741 . AAC A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=2.166;DP=20;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=10.74;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:252,0,90 -chr24 36712199 . C CT 294 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=-0.091;DP=15;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=19.60;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:12:331,0,12 -chr24 36887287 . A T 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.912;DP=56;FS=5.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=22.10;ReadPosRankSum=1.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1266,0,936 -chr24 37018500 . G GT 991.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-3.251;DP=329;FS=3.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,86:298:99:1029,0,6836 -chr24 37053758 . C A 2341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.978;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,68:111:99:2370,0,1305 -chr24 37118756 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-1.079;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:288,0,626 -chr24 37175577 . G GT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.483;DP=45;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:326,0,552 -chr24 37178142 . GTT G 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.149;DP=194;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,43:187:99:954,0,6010 -chr24 37180336 . C T 1598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.370;DP=262;FS=2.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,63:262:99:1627,0,15209 -chr24 37182546 . G A 2093.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=1.605;DP=228;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,73:228:99:2122,0,11586 -chr24 37182555 . G A 2094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=1.045;DP=216;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,67:216:99:2123,0,11586 -chr24 37441573 . A T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.424;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=15.39;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:336,0,850 -chr24 37441575 . T C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:336,0,839 -chr24 37445776 . G T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.398;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:322,0,1074 -chr24 37478500 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=-1.832;DP=48;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:601,0,1050 -chr24 37478515 . T C 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=-2.006;DP=51;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:770,0,936 -chr24 37484904 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.339;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:660,0,1027 -chr24 37526714 . T TC 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.476;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:532,0,3867 -chr24 37683998 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=1.727;DP=37;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:287,0,2661 -chr24 37683999 . T A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.498;DP=36;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=7.19;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:287,0,2661 -chr24 37750445 . C CA 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.008;DP=73;FS=3.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:293,0,856 -chr24 37800914 . T C 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.697;DP=32;FS=1.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=18.24;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:612,0,570 -chr24 37891817 . G A 11016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=-0.083;DP=446;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=24.70;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,300:446:99:11045,0,3924 -chr24 38216633 . A G 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.453;DP=152;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,34:65:99:1123,0,1018 -chr24 38216765 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=2.329;DP=16;FS=19.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=13.05;ReadPosRankSum=-3.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:237,0,657 -chr24 38216770 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.540;DP=13;FS=16.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.466;QD=16.52;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:243,0,660 -chr24 38364588 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.020;DP=111;FS=3.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,18:111:99:238,0,3606 -chr24 38369979 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.777;DP=102;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:415,0,2892 -chr24 38375619 . T C 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=1.140;DP=133;FS=6.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,32:133:99:712,0,3902 -chr24 38378654 . A AC 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=-0.397;DP=78;FS=3.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,18:77:99:240,0,2099 -chr24 38379296 . A G 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.360;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,7:45:99:992,0,2652 -chr24 38379312 . A G 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.085;DP=45;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=21.42;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:44:99:992,0,2596 -chr24 38380087 . G GA 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.479;DP=89;FS=0.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:255,0,2375 -chr24 38382083 . A T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=-0.126;DP=58;FS=4.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=9.01;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:551,0,3164 -chr24 38382089 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-1.330;DP=57;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:551,0,3164 -chr24 38382404 . T A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-1.557;DP=75;FS=3.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=5.36;ReadPosRankSum=2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:430,0,2274 -chr24 38508521 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:272,0,51 -chr24 38770601 . A T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=6.539;DP=150;FS=15.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=2.89;ReadPosRankSum=-6.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,29:150:99:462,0,4636 -chr24 38770783 . TGC T 5797.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-2.381;DP=125;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:5835,509,0 -chr24 38842728 . CCCTGAGTGTACAAAACAAACTCAGCTTACTGTAATAGATATTCAATATTTTGGCATTTAAATATCATTCATATTAGTGGAACAGTAACAATAAATGCGAGTCTCA C 999.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=1.583;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.583;QD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1037,103,0 -chr24 38850169 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=1.249;DP=30;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:375,0,883 -chr24 38851812 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-0.675;DP=57;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:262,0,1611 -chr24 38941213 . T C 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.248;DP=71;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,33:71:99:1189,0,1236 -chr24 38945942 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:94:288,0,94 -chr24 38945958 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:94:288,0,94 -chr24 39075011 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:316,0,500 -chr24 39080806 . A T 2578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-2.554;DP=200;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,77:199:99:2607,0,7124 -chr24 39108148 . ACAGGTACAGCACCGATGCTTGTTGATGACTTTTATTTCATATGTGAGGGTCAAAATTGTGTCTGTGTGTTT A 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:344,0,458 -chr24 39148779 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=-0.640;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:364,0,2098 -chr24 39149963 . G T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=1.027;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=12.51;ReadPosRankSum=2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:466,0,1194 -chr24 39150029 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=1.476;DP=36;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=13.69;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:521,0,720 -chr24 39152791 . G A 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:564,0,463 -chr24 39152938 . C T 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-0.936;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=13.31;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:654,0,850 -chr24 39153049 . G C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=1.312;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:684,0,810 -chr24 39167577 . GCTGCACACAGAAACGCAATATAAATTCACACATCAATCTGAATAGAACATTATAAACAAAAGCAGCAGCAGCAAGCTTCTTAC G 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=2.162;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:99:636,0,658 -chr24 39182815 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:260,0,360 -chr24 39191817 . C G 2497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=-0.716;DP=792;FS=1.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=3.15;ReadPosRankSum=3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:638,150:788:99:2526,0,32238 -chr24 39192849 . G A 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.098;DP=317;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,65:317:99:1244,0,10267 -chr24 39224312 . T G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.801;DP=54;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:275,0,1671 -chr24 39296269 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=1.949;DP=34;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:601,0,559 -chr24 39298514 . AT A 278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.135;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:43:316,0,43 -chr24 39299429 . G A 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-2.083;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:537,0,156 -chr24 39299892 . TGG T 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=1.171;DP=34;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:560,0,527 -chr24 39320019 . C T 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.987;DP=44;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:738,0,824 -chr24 39325300 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.753;DP=52;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:346,0,1379 -chr24 39336174 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.347;DP=20;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:283,0,420 -chr24 39391532 . C T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-0.530;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:287,0,340 -chr24 39394185 . AGTGAGTCACTCTGCACAGATGATGCATTACTGTGGCCTCTACGGTCTGACTTTTCTTTAATGTTTCCACTCTCTGTTTGTGATTGGTCAG A 728.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.449;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=26.79;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:766,0,559 -chr24 39445514 . T TTA 1190.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.227;DP=90;FS=2.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=13.23;ReadPosRankSum=-2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:1228,0,1970 -chr24 39445544 . GA G 1760.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.364;DP=88;FS=6.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=20.01;ReadPosRankSum=-2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,66:79:14:1798,0,14 -chr24 39446335 . GA G 387.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=-1.030;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=9.69;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:425,0,409 -chr24 39446356 . T TA 1121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-1.119;DP=73;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.332;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,35:64:99:1159,0,672 -chr24 39458991 . G T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=1.171;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,36:64:99:1194,0,1014 -chr24 39602528 . CCCTGCAAGACAAAACCAAACTCAACCTCAGAAAATATACAATCCATAAACACAGAAATATTAATAAAATATA C 6419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.275;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.442;QD=33.26;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,166:179:99:6457,0,1122 -chr24 39805569 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.197;DP=420;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=1.97;ReadPosRankSum=3.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:349,70:419:99:856,0,13352 -chr24 40064333 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-1.006;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:246,0,1659 -chr24 40064345 . A T 1717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.023;DP=61;FS=1.955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=28.16;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,36:40:52:1746,52,0 -chr24 40064410 . C T 1545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:99:1574,114,0 -chr24 40064463 . AT A 1536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.159;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:99:1574,114,0 -chr24 40064520 . T C 781.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:5:809,0,5 -chr24 40064539 . C T 1055.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:84:1084,84,0 -chr24 40064649 . TA T 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=-1.540;DP=41;FS=11.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,3:29:99:421,0,1865 -chr24 40064753 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=-0.849;DP=14;FS=11.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=14.70;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:234,0,2044 -chr24 40065241 . T C 289.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr24 40065916 . GAC G 1484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1522,102,0 -chr24 40066447 . A T 1906.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:99:1935,135,0 -chr24 40066530 . T C 816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:60:845,60,0 -chr24 40066594 . T G 601.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:51:672,51,0 -chr24 40066776 . T A 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=-0.648;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=32.84;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:915,0,472 -chr24 40066782 . A T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.317;DP=34;FS=7.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:915,0,470 -chr24 40066842 . T C 1474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.099;ClippingRankSum=4.771;DP=201;FS=61.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=7.34;ReadPosRankSum=4.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,47:71:99:1503,0,13745 -chr24 40066864 . A C 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=6.130;DP=240;FS=49.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,47:98:99:1352,0,13749 -chr24 40066959 . G A 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.407;DP=162;FS=5.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=9.60;ReadPosRankSum=2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,16:111:99:1584,0,13743 -chr24 40066981 . A C 1437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=-1.487;DP=112;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=12.84;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,13:80:99:1466,0,13747 -chr24 40067034 . T C 1484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=2.395;DP=131;FS=13.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,14:104:99:1513,0,13744 -chr24 40067057 . G T 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=2.606;DP=159;FS=9.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,24:126:99:1468,0,13746 -chr24 40067428 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.15;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:430,0,95 -chr24 40128168 . A G 361.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.595;DP=35;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=10.34;ReadPosRankSum=-1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:399,0,1821 -chr24 40129760 . T G 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.116;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=27.26;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:737,0,175 -chr24 40129794 . G A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=-0.661;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:473,0,310 -chr24 40131830 . A C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.459;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=8.53;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:233,0,967 -chr24 40144183 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.920;DP=58;FS=1.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:259,0,3502 -chr24 40148690 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.444;DP=56;FS=4.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:371,0,1588 -chr24 40148723 . A G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=-2.158;DP=60;FS=6.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:271,0,1580 -chr24 40162505 . T A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.110;DP=30;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:545,0,467 -chr24 40328748 . GA G 666.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.144;DP=27;FS=6.923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:45:704,45,0 -chr24 40403272 . A C 887.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:916,63,0 -chr24 40403276 . T A 887.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:63:916,63,0 -chr24 40413926 . T A 1116.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.040;DP=33;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=33.84;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:53:1145,53,0 -chr24 40413952 . C A 1220.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.040;DP=34;FS=3.153;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.603;QD=31.89;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:45:1249,45,0 -chr24 40727073 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.34;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:274,0,149 -chr24 40748223 . A G 2111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.775;DP=184;FS=4.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,68:183:99:2140,0,3845 -chr24 40751208 . A G 1812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-1.646;DP=143;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,55:142:99:1841,0,3072 -chr24 40751507 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=-0.127;DP=141;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,25:141:99:350,0,4668 -chr24 40756367 . TCCTGAAAAACACACAAGCGTAATGTCCACATATGGATCAGCACAAGGTATTTACTGTGTGTTTGTGTTGTGTACTCA T 6624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=2.954;DP=153;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=28.36;ReadPosRankSum=-2.967 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,150:153:99:6662,554,0 -chr24 40775083 . A G 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=3.174;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=22.38;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:722,0,234 -chr24 40899221 . A G 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.324;DP=48;FS=8.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=12.83;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:644,0,875 -chr24 40938108 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-0.936;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,486 -chr24 40945465 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-2.154;DP=78;FS=7.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:441,0,2212 -chr24 40958981 . A AAT 1811.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-1.583;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=28.19;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:86:1849,86,0 -chr24 41086880 . GACCTGGCATGAGAAACAAACAAAAAAACTTTACTGATCATCCTCCTATTTGAAAACACCAAATCTGACATGTACTTCCAACTAAACAAAACTCAAAAGTGAACCACTGATATGTGAGATACAC G 2395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=2.381;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=29.95;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,72:80:99:2839,0,1164 -chr24 41087271 . C T 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.349;DP=72;FS=6.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:866,0,1507 -chr24 41103100 . C G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-1.142;DP=24;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.142;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:356,0,472 -chr24 41107242 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=22.38;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:364,0,158 -chr24 41122338 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.593;DP=26;FS=3.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:301,0,588 -chr24 41129235 . G T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=1.237;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=19.12;ReadPosRankSum=-2.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:315,0,196 -chr24 41129719 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.038;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:332,0,352 -chr24 41138286 . T C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr24 41138925 . C G 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr24 41139710 . G T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=1.910;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:370,0,287 -chr24 41139930 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=25.90;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:339,0,90 -chr24 41187931 . C A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.872;DP=26;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:586,0,496 -chr24 41188483 . T TTG 740.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=-1.542;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=20.02;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:778,0,194 -chr24 41190333 . ACT A 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=1.045;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:414,0,1700 -chr24 41193225 . G A 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.395;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:1141,0,752 -chr24 41193660 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.102;DP=66;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:261,0,1790 -chr24 41211552 . C CA 947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-1.072;DP=84;FS=8.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.566;QD=11.28;ReadPosRankSum=-1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,33:84:99:985,0,1573 -chr24 41211677 . T G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-0.785;DP=340;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=0.83;ReadPosRankSum=1.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:292,48:340:99:309,0,11240 -chr24 41211743 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=1.148;DP=36;FS=5.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:268,0,993 -chr24 41212249 . T A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:386,0,185 -chr24 41213319 . T A 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-1.130;DP=36;FS=1.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:728,0,676 -chr24 41213657 . A C 260.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.62;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:289,0,14 -chr24 41214865 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=1.268;DP=20;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:243,0,466 -chr24 41233178 . C T 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=-0.385;DP=119;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=13.11;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,46:119:99:1588,0,2461 -chr24 41344618 . G T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.591;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:458,0,144 -chr24 41366068 . C A 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.159;DP=83;FS=2.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,43:83:99:1346,0,1382 -chr24 41372255 . G A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=1.323;DP=79;FS=6.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,32:79:99:1057,0,1603 -chr24 41381931 . C T 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.386;DP=55;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:532,0,1382 -chr24 42232384 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.733;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:266,0,391 -chr24 42232850 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=29.98;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:358,0,223 -chr24 42242815 . CCCTTTAAGTATGAAGGAAAGCATTTTAAGTCATTAGTCTTAAATTAATCTAATGTAAATAACATAATAGGAAATGATCATTCACGGTTA C 20804.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=1.067;DP=393;FS=3.443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=30.03;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,379:380:99:20842,1656,0 -chr24 42244005 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=8.036;DP=419;FS=31.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=1.82;ReadPosRankSum=-3.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:351,67:418:99:789,0,14006 -chr24 42244628 . G T 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=1.479;DP=213;FS=34.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=3.55;ReadPosRankSum=3.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,46:213:99:784,0,7625 -chr24 42246657 . G A 354.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:383,27,0 -chr24 42247548 . C T 2108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=5.950;DP=410;FS=34.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=5.14;ReadPosRankSum=-3.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,97:410:99:2137,0,15216 -chr24 42247777 . G A 2176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-3.169;DP=250;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=8.71;ReadPosRankSum=-2.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,80:248:99:2205,0,6578 -chr24 42266011 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.219;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=24.57;ReadPosRankSum=0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:495,0,194 -chr24 42267108 . A T 3217.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:3246,238,0 -chr24 42267114 . C A 2576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:99:2605,199,0 -chr24 42270533 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.200;ClippingRankSum=-2.046;DP=104;FS=22.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=4.83;ReadPosRankSum=-6.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,26:104:99:531,0,2980 -chr24 42271629 . G A 1142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-3.112;DP=34;FS=27.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=33.61;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:76:1171,0,76 -chr24 42271692 . C T 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.844;ClippingRankSum=0.095;DP=143;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.478;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,47:142:99:1339,0,3426 -chr24 42273144 . GCTGAAGAGAAATGTAAGTGTTAATATGAGAATGGAAACACACAGAAGCAGTTCGAAACCTGATGTATACATGGTCATGTTTGGAAGACTTCTGCACATAAACTCAC G 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=30.57;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:343,0,935 -chr24 42304780 . G A 1711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1740,117,0 -chr24 42304783 . G A 1632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.844;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=32.41;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:99:1661,114,0 -chr24 42321052 . A G 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1000,75,0 -chr24 42321085 . G A 1150.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1179,81,0 -chr24 42322697 . G A 4404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:4433,316,0 -chr24 42322932 . C A 3433.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3462,250,0 -chr24 42350757 . TAACCTGTAGAATTGTGGCATTGTATTAAGGACTTTTAATACACCATTACTGCAACACTAACCAGGTCAAAATGAAAAACA T 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:250,0,321 -chr24 42350853 . G T 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:235,0,23 -chr24 42381294 . G C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.688;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:257,0,462 -chr24 42388140 . A C 325.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:354,27,0 -chr24 42391303 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.847;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:322,0,239 -chr24 42404100 . T C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.12;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:375,0,129 -chr24 42419294 . C G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr24 42461277 . A G 2936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2965,211,0 -chr24 42461310 . G A 2517.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2546,175,0 -chr24 42482985 . ACTGTAGACAGAAGATATTATAAAATTACACTGTACTGCTTGTACATTAGTTTCTGAATTGCGATAATCAGTTGTTATCAGCTTAC A 1639.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=-0.669;DP=40;FS=12.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.687;QD=32.99;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,37:39:99:1677,0,474 -chr24 42505216 . G C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 -chr24 42505217 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr24 42505532 . A G 4363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:4392,298,0 -chr24 42505534 . T C 4363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:4392,298,0 -chr24 42509706 . G T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:92:426,0,92 -chr24 42537103 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:268,0,232 -chr24 42618309 . T A 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr24 42618353 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=12;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=23.15;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:306,0,60 -chr24 42618380 . G C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.573;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=17.73;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:241,0,100 -chr24 42618657 . G A 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 -chr24 42621403 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-2.805;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:301,0,459 -chr24 42623097 . G C 810.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:76:839,76,0 -chr24 42623104 . ACT A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.434;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=24.32;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:654,0,661 -chr24 42623107 . ACACACAGACACACAAACATTAATCCTGATACATCATCTATGATCATCATATTCAGACTGTGCTCACG A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-0.868;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=31.43;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:99:654,0,661 -chr24 42623259 . T A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.133;DP=24;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.431;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:291,0,508 -chr24 42624794 . C G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-1.919;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=13.59;ReadPosRankSum=2.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:572,0,776 -chr24 42630940 . T G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-1.150;DP=41;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:478,0,855 -chr24 42911270 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=-1.992;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=22.10;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:426,0,241 -chr24 42914159 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.234;DP=34;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:375,0,763 -chr24 43051058 . G T 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=2.442;DP=44;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.859;QD=15.97;ReadPosRankSum=-2.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:731,0,768 -chr24 43094610 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.871;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=20.24;ReadPosRankSum=2.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:514,0,256 -chr24 43323234 . G C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.269;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:292,0,573 -chr24 43323264 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=1.286;DP=23;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=14.47;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:361,0,359 -chr24 43484128 . G A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=-0.039;DP=59;FS=3.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.844;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:764,0,1205 -chr24 43507002 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=2.945;DP=74;FS=4.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=3.04;ReadPosRankSum=-2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:253,0,2170 -chr24 43525775 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=1.528;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:272,0,610 -chr24 43551803 . TA T 961.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.625;DP=42;FS=2.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,35:39:22:999,22,0 -chr24 43552118 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.204;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:363,0,1066 -chr24 43617083 . G A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-1.036;DP=32;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:430,0,660 -chr24 43620180 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-1.083;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:327,0,1360 -chr24 43808939 . C T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.607;DP=72;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.673;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:514,0,1986 -chr24 43811193 . C G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=1.447;DP=77;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:292,0,2402 -chr24 43829675 . G T 1410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1439,102,0 -chr24 43845897 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.594;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:582,0,1260 -chr24 43848557 . C CAT 903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=1.351;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=31.16;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:941,0,199 -chr24 43850017 . C T 3282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-0.271;DP=197;FS=14.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=16.66;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,103:197:99:3311,0,3256 -chr24 43868817 . A ACT 1906.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=-3.580;DP=518;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:398,107:505:99:1944,0,16034 -chr24 43869208 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:239,0,257 -chr24 43892793 . TCAGGTAATGTGAACACCACAACAGCCCTGCACACCCATACCCCGACTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG T 1766.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=3.852;DP=57;FS=7.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.174;QD=31.00;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,46:57:99:1804,0,4330 -chr24 43901004 . CGGTGCGCACGCGTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCACGCTCACGGCTGCGCTGCTCACCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA C 2928.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.253;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=30.21;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,77:80:99:2966,278,0 -chr24 43908494 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.298;DP=107;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:553,0,2959 -chr25 2100 . TGGCAAGTGTCTCTCTGAGTGTGTGTGCGCATGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCA T 5218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=-3.080;DP=150;FS=14.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=34.79;ReadPosRankSum=2.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,125:149:99:5256,0,1077 -chr25 25578 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-1.038;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,25:170:99:242,0,5415 -chr25 38794 . T C 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:405,33,0 -chr25 171263 . C T 1204.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1233,90,0 -chr25 275991 . C T 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:599,45,0 -chr25 298484 . T G 5998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:134:99:6027,406,0 -chr25 298485 . A T 5998.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,132:132:99:6027,406,0 -chr25 299308 . G A 4394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.578;DP=123;FS=4.907;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.607 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,114:123:99:4423,235,0 -chr25 303895 . A G 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-2.250;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=28.78;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:575,0,117 -chr25 306520 . AGT A 1142.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.017;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=21.98;ReadPosRankSum=-0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,34:41:99:1180,0,99 -chr25 383347 . T TA 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.685;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:302,0,105 -chr25 400626 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr25 400632 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr25 467441 . GT G 1247.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.211;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1285,127,0 -chr25 490964 . CA C 1145.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.739;DP=495;FS=14.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,357:455:99:1183,0,4329 -chr25 490966 . GGTGAGTGTCCGTGGAAATGAGTTGTATACATTTGTCTGTACTTAATACTTAAACATGTTTATCTACATAATAAAAAGTTTCTTGTTTTAGTTAAAGCGGTAAATCCAGTAGCAACACAGTGAATAACGTTGTATAATAAACATCTGATTTTGATTCCA G 1145.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=2.181;DP=480;FS=11.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,335:435:99:1183,0,2853 -chr25 500417 . A G 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr25 502279 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-1.001;DP=75;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:521,0,441 -chr25 502355 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:309,0,460 -chr25 502370 . G C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.42;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:310,0,495 -chr25 506008 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=31.02;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:430,0,135 -chr25 527152 . GACCTGAAAAACACAGCAAAACAGCTTTCTCAGACTGGACCACACGATCGCAATCCAGCACTTCAGCTACAGCAACATCTTCTAAATATCAGTAGACACATGAACTC G 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=29.98;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:69:860,69,0 -chr25 878400 . TGA T 1239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=-3.900;DP=132;FS=11.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQ0=0;MQRankSum=4.340;QD=9.39;ReadPosRankSum=2.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,41:85:99:1277,0,1274 -chr25 882378 . C T 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.405;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=23.17;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:816,0,313 -chr25 882525 . GCTGTACAACAGAGGAAACACCTCTTGATGTCTCTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATC G 1513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.917;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.631;QD=29.26;ReadPosRankSum=1.223 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1551,130,0 -chr25 882636 . T C 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-1.866;DP=31;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:888,0,166 -chr25 948425 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.008;DP=49;FS=7.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:288,0,1328 -chr25 1104310 . C T 1046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.395;DP=73;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=14.34;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1075,0,2366 -chr25 1104889 . G C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:285,0,91 -chr25 1104963 . G A 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-0.485;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=21.24;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:814,0,435 -chr25 1104998 . G C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:405,0,976 -chr25 1105061 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=21.73;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:289,0,130 -chr25 1105190 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=-0.061;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:463,0,125 -chr25 1105431 . G T 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.154;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:389,0,398 -chr25 1105907 . A T 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.033;DP=47;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:1008,0,813 -chr25 1105968 . C T 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.776;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.928;QD=32.81;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,36:44:99:1472,0,121 -chr25 1139311 . G A 1522.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=-0.054;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,40:45:3:1549,3,0 -chr25 1141768 . A G 1611.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.709;DP=48;FS=1.803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.025;QD=33.58;ReadPosRankSum=-0.877 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:17:1640,17,0 -chr25 1146066 . C A 1172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=1.421;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:99:1201,0,100 -chr25 1150042 . G T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-0.392;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:597,0,108 -chr25 1151323 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=2.150;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.750;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:556,0,108 -chr25 1151325 . CCAGCAGCAGCTG C 602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:47:640,47,0 -chr25 1153300 . A C 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 -chr25 1155408 . G A 754.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=1.146;DP=23;FS=2.793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=32.82;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:26:783,26,0 -chr25 1208320 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.882;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.284;QD=23.95;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:651,0,447 -chr25 1208352 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=1.919;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:379,0,673 -chr25 1208367 . T A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.289;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:379,0,673 -chr25 1208527 . AT A 1169.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1207,109,0 -chr25 1208759 . A C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=1.184;DP=19;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:469,0,212 -chr25 1376873 . A G 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-1.211;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:472,0,171 -chr25 1377214 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-1.987;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=30.73;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:58:735,0,58 -chr25 1483268 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.622;DP=51;FS=2.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:295,0,1366 -chr25 1483361 . G T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-1.550;DP=69;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=10.13;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:727,0,1518 -chr25 1483366 . A T 2326.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=-0.276;DP=70;FS=1.731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=33.24;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,56:61:98:2355,98,0 -chr25 1553083 . T C 481.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=34.41;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:507,0,0 -chr25 1756758 . CT C 287.25 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;QD=26.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:9:324,0,9 -chr25 1821420 . C T 2085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.199;DP=96;FS=0.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.341;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,62:95:99:2114,0,1048 -chr25 1973464 . T C 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 -chr25 2139485 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=28.12;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:450,0,265 -chr25 2646557 . T C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.113;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.474;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:358,0,426 -chr25 2918702 . G C 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=1.068;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:417,0,341 -chr25 2978725 . AAT A 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.978;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:89:267,0,89 -chr25 2982344 . T TA 1716.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.521;DP=85;FS=3.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=20.20;ReadPosRankSum=-1.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,62:79:99:1754,0,174 -chr25 3025549 . T A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=-0.550;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:572,0,117 -chr25 3176576 . T C 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=10.67;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:391,0,758 -chr25 3203793 . G C 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=-0.169;DP=302;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=3.54;ReadPosRankSum=2.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,62:302:99:1098,0,9194 -chr25 3284823 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=1.390;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,27:118:99:665,0,7528 -chr25 3284832 . G C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.648;DP=124;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,25:124:99:658,0,7528 -chr25 3301963 . T A 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-2.193;DP=273;FS=0.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,71:270:99:1348,0,10226 -chr25 3302043 . C A 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.499;DP=273;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,64:271:99:1095,0,10809 -chr25 3302301 . A C 6759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:6788,481,0 -chr25 3304566 . A G 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr25 3354882 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.290;DP=291;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,42:291:99:337,0,9727 -chr25 3522073 . C T 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=2.362;DP=43;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=33.99;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,39:43:82:1490,0,82 -chr25 3527961 . T C 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:74:1012,74,0 -chr25 3529240 . G A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.650;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:543,0,141 -chr25 3530650 . T TG 516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:554,39,0 -chr25 3530978 . T TC 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=32.67;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:364,0,125 -chr25 3530982 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:364,0,125 -chr25 3533926 . ACTAAAAGAGAGTGGATTTTCTGGTAAATGGGTGATTTATTGATTTATTAGGATGTACAATGAGTAGAATTGTGCTTGTGAACCAC A 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.313;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:416,0,2045 -chr25 3556088 . G A 8774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-2.195;DP=333;FS=0.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,228:332:99:8803,0,2794 -chr25 3563741 . GCTTAGAGAAAAACAAGAGCTTTATGAAGAATCCAAATCAAGTGGAGTGCATGGGTCTACATTGAGTCTAAAGATCTTCAGCACTGAC G 16050.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=1.694;DP=360;FS=2.142;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=29.82;ReadPosRankSum=2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,354:357:99:16088,1318,0 -chr25 3563953 . C T 1055.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1084,99,0 -chr25 3563954 . TAAA T 1046.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1084,99,0 -chr25 3563958 . A T 1055.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1084,99,0 -chr25 3568796 . C A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr25 3594406 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:240,0,137 -chr25 3622573 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=-0.054;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=21.22;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:580,0,314 -chr25 3644697 . G A 837.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.722;DP=27;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.043;QD=31.03;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:16:866,0,16 -chr25 3655209 . A C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=1.509;DP=19;FS=8.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:77:649,0,77 -chr25 3673741 . TCCTGTCATCACATTATATATGAACTCAAGCGTTTATTCTATTACACAGACAAGACGACTGGTCATCTCAAAAATAGATGAAGGATAAAAAGTAAGTACTGCAATTTAGTCAGTCTTTAGTTTTTGAAACTAAACATTAAATCATTTCAATCAAA T 3137.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=2.851;DP=88;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,76:88:99:3175,0,2897 -chr25 3679698 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=-0.793;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:383,0,300 -chr25 3691996 . G T 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=1.018;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=27.63;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:68:636,0,68 -chr25 3693376 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,1:4:99:233,0,149 -chr25 3695348 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.231;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=24.29;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:344,0,136 -chr25 3710558 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.139;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:495,0,688 -chr25 3739006 . A C 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.421;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.513;QD=24.62;ReadPosRankSum=-2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,57:84:99:2096,0,708 -chr25 3740316 . T G 1439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=2.585;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1468,0,414 -chr25 3740348 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=3.879;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=12.66;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:446,0,638 -chr25 3740408 . G C 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DP=70;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=18.63;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,39:70:99:1332,0,1107 -chr25 3741000 . T G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=3.162;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=12.80;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:630,0,951 -chr25 3773777 . AACCTGAGAGAGAAATATGGATCAATTAAATGTGAATGAATCATCTCCACTATGATGATGTGTTACTGT A 5787.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=1.153;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,120:125:99:5825,501,0 -chr25 3773940 . A AT 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-1.675;DP=122;FS=7.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,24:118:99:245,0,2653 -chr25 3781068 . C A 2733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=-0.052;DP=112;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=24.41;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,81:112:99:2762,0,763 -chr25 3781386 . C G 3326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=1.218;DP=130;FS=0.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=25.59;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,90:130:99:3355,0,1047 -chr25 3925034 . T A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.905;DP=31;FS=6.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=24.83;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:798,0,239 -chr25 3937647 . A T 971.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:69:1000,69,0 -chr25 3938850 . T G 872.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:901,63,0 -chr25 3940178 . A C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr25 3940181 . C T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr25 3951145 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.468;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:304,0,135 -chr25 3955090 . C T 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr25 3955142 . G A 297.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:326,0,19 -chr25 3992684 . G C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.550;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=25.94;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:521,0,100 -chr25 4168423 . G A 248.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=20.73;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:6:276,0,6 -chr25 4195773 . ACTGTAATAAACACACACACACACACATGCAGTGGGATCAGATGGAATGTTTCCTCCATGTGTTTTTCGTGTGTGTAGTGTGTTTGTAC A 1647.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.093;DP=49;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,44:48:99:1685,0,674 -chr25 4232281 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=-0.489;DP=54;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:278,0,1628 -chr25 4450130 . A G 239.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:268,0,16 -chr25 4469141 . G A 1040.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1069,75,0 -chr25 4469213 . C T 1087.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=-1.733;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=28.68;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1116,84,0 -chr25 4850204 . C A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr25 4864117 . C G 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:33:483,33,0 -chr25 4864139 . T G 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:483,33,0 -chr25 4877830 . C T 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-0.260;DP=29;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:84:795,0,84 -chr25 4880162 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-0.453;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:426,0,170 -chr25 4880189 . T A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=1.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:386,0,96 -chr25 4925814 . G A 696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.612;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=20.49;ReadPosRankSum=1.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:725,0,500 -chr25 4925879 . C T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.996;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:603,0,427 -chr25 4930587 . TGTGAGATGATTTATCGTACTTTAGTGTCCCTCAGTTGTTTAGATTGTAAAAACTATCTTTGATTGTAAATAACTCTGCAG T 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,154 -chr25 4968955 . A G 377.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:406,30,0 -chr25 4968992 . T C 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr25 4996334 . T A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=-4.124;DP=154;FS=5.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=7.60;ReadPosRankSum=-3.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,47:154:99:1199,0,3938 -chr25 5029832 . TTTGAGGTTAGCCA T 4161.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.250;DP=255;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=16.32;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,128:245:99:4199,0,5004 -chr25 5029835 . GAGGTTAGCCACTGATTTCATGTCCTGGAATTTTAGATTGTGTGTACTGTGGTGTACAAACCTGGCCAGCACTGCAGACTGCAGTTTAAAGGTCATTTGTTTTTTTCC G 2709.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-0.628;DP=253;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,106:238:99:2747,0,5187 -chr25 5029848 . GATTTCATGTCCTGGAATTTTAGATTGTGTGTACTGTGGTGTACAAACCTGGCCAGCACTGCAGACTGCAGTTTAAAGGTCATTTGTTTTTTTCC G 4164.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.437;DP=238;FS=5.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.953;QD=17.50;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,123:229:99:4202,0,5004 -chr25 5038560 . G GT 2177.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-1.140;DP=136;FS=9.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,67:119:99:2215,0,1077 -chr25 5070144 . CT C 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=-1.050;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=21.87;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:759,0,992 -chr25 5210955 . AAGGTATACTGAGTAACTGGATGTACAGTAGTTTATACTCTTATATTATGCACAGTTTTATATCATCACGTC A 1169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=1.439;DP=36;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=32.49;ReadPosRankSum=-2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,29:36:99:1207,0,1035 -chr25 5213074 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.377;DP=31;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=19.41;ReadPosRankSum=-0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:630,0,1006 -chr25 5213076 . A T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-0.209;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:630,0,1006 -chr25 5235895 . C T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=1.667;DP=16;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.826;QD=29.92;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:41:507,0,41 -chr25 5253644 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.445;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,384 -chr25 5253671 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.637;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:261,0,299 -chr25 5311544 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:262,0,573 -chr25 5315897 . G A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=1.480;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=29.42;ReadPosRankSum=-2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:85:499,0,85 -chr25 5315931 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=1.212;DP=17;FS=9.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:413,0,155 -chr25 5316086 . G C 873.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:902,63,0 -chr25 5316240 . A G 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:555,42,0 -chr25 5316650 . T C 357.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.49;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:385,0,8 -chr25 5327639 . A C 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:398,33,0 -chr25 5327713 . T G 1190.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-0.060;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=32.70;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:84:1219,84,0 -chr25 5349829 . C T 1515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.253;DP=50;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1544,0,146 -chr25 5361766 . A C 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.637;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=27.47;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:825,0,126 -chr25 5389707 . AGTAAGAAGCTTCAGTATGGCCATCTAGTGGCGAATGACGGTTAAAGCACAATAAATATGTGTTGTCGTGTGTGACCTGATGCTGACTTTGTATTTACTGCTCCAACAG A,ATATGATGATCGGAAGGTAAGAAGCTTCAGTATGGCCATCTAGTGGCGAATGACGGTTAAAGCACAATAAATATGTGTTGTCGTGTGTGACCTGATGCTGACTTTGTATTTACTGCTCCAACAG 4499.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=2.407;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,112,25:139:99:5195,398,1721,4527,0,4934 -chr25 5398605 . T G 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr25 5627678 . C CA 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.256;DP=115;FS=0.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:269,0,2142 -chr25 5638866 . CT C 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.766;DP=45;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.630;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:646,0,167 -chr25 5658144 . CACA C 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=2.424;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:405,0,373 -chr25 5658148 . GGTACTGTTAACATGAGGCTTTTAAAATCTGATGTTGCCTTAGAACAGGTTTTCATCGGTTAAACGTGTTTTT G 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=2.205;DP=12;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=30.64;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:405,0,373 -chr25 5993093 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=1.333;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=17.41;ReadPosRankSum=-0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:481,0,486 -chr25 6006351 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-1.881;DP=55;FS=4.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1438,0,403 -chr25 6225803 . C G 2397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2426,175,0 -chr25 6226163 . T A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 -chr25 6226179 . C T 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 -chr25 6226273 . C T 656.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.451;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=26.28;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:16:685,16,0 -chr25 6226275 . T C 657.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=-0.501;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=24.36;ReadPosRankSum=1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:17:686,17,0 -chr25 6226393 . G A 1197.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.970;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=35.91;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:8:1225,8,0 -chr25 6226395 . G A 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.275;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.175;QD=29.64;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:947,0,248 -chr25 6226538 . T G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr25 6226641 . A G 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:660,48,0 -chr25 6226862 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.778;DP=26;FS=6.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=14.57;ReadPosRankSum=2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:407,0,518 -chr25 6226939 . T G 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:27:378,27,0 -chr25 6227096 . G C 983.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.760;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:2:1010,2,0 -chr25 6227129 . A G 1063.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1092,81,0 -chr25 6228087 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=8.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:295,0,382 -chr25 6228197 . T G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=2.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.48;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:329,0,173 -chr25 6228226 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-2.281;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=32.60;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:452,0,398 -chr25 6228236 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-2.663;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=24.93;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:452,0,398 -chr25 6228454 . G T 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:668,48,0 -chr25 6228467 . T C 681.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:710,51,0 -chr25 6228568 . C T 970.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=-1.114;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=34.67;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:6:998,6,0 -chr25 6228751 . A G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:413,0,284 -chr25 6228804 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=1.186;DP=26;FS=3.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:283,0,657 -chr25 6228805 . A G 1094.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:78:1123,78,0 -chr25 6228953 . TC T 640.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:678,52,0 -chr25 6228962 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-2.572;DP=19;FS=12.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:304,0,607 -chr25 6229177 . T A 1276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1305,96,0 -chr25 6229241 . G GT 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.370;DP=14;FS=8.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=32.48;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:492,0,233 -chr25 6229250 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.197;DP=18;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:492,0,233 -chr25 6252524 . C A 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr25 6265550 . A G 8507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.543;DP=253;FS=3.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,198:253:99:8536,0,2855 -chr25 6265554 . C T 8507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-0.751;DP=268;FS=2.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,209:268:99:8536,0,2835 -chr25 6271888 . T G 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=1.885;DP=73;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:636,0,3683 -chr25 6271911 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-4.818;DP=45;FS=12.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=6.37;ReadPosRankSum=-4.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:315,0,1069 -chr25 6271944 . T G 4264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4293,321,0 -chr25 6281871 . G A 7971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.419;DP=453;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,242:430:99:8000,0,6658 -chr25 6285784 . C T 6236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=1.740;DP=383;FS=2.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,225:379:99:6265,0,5317 -chr25 6297107 . CGCA C 1736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.193;DP=398;FS=0.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,125:389:99:1774,0,11878 -chr25 6297113 . AACAGGTACTGAACGCATTGGAAATCATTTCACTCGGTCGTGTTACAACTTACACAAACATGGATGACAGTTTACTCTCTTTCCCC A 5555.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.209;DP=390;FS=0.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.432;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,244:374:99:5593,0,6188 -chr25 6297116 . AGGTACTGAACGCATTGGAAATCATTTCACTCGGTCGTGTTACAACTTACACAAACATGGATGACAGTTTACTCTCTTTCCCC A 1767.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.118;DP=380;FS=0.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,117:364:99:1805,0,11838 -chr25 6331132 . G GA 933.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-3.693;DP=259;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=3.61;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,65:222:99:971,0,4352 -chr25 6375474 . AT A 1119.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.284;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:45:1157,0,45 -chr25 6411168 . G T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.65;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,180 -chr25 6441861 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=30.98;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:35:400,0,35 -chr25 6441862 . T C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:297,0,189 -chr25 6557064 . G GT 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.501;DP=86;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:323,0,1828 -chr25 6752450 . TA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.053;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:323,0,2074 -chr25 6857692 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-1.221;DP=18;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:515,0,114 -chr25 6859898 . G GA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.334;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:336,0,729 -chr25 7323499 . G A 588.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:617,48,0 -chr25 7980961 . TA T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=-0.442;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:243,0,993 -chr25 8086703 . AAGGTTAGAAGTTTGTAGAAACAACTTTTGAACGATTTGGGGTGTAATAACAATGTATCTTCTCAAAGGAAAATGTGCGCTTTCCCTAC A 903.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.878;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=29.95;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:99:941,0,910 -chr25 8118899 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:377,0,257 -chr25 8124618 . CGGTGAGGTTCGCTTTTACTTCACTCTTTGACTTTGTGTGTTTTATTTCTGATCTTTTTTTTTTTGATTTTTTGATAAACA C 729.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.818;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=31.73;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:52:767,52,0 -chr25 8124911 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.070;DP=28;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:440,0,572 -chr25 8129241 . G C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.536;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=24.65;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,322 -chr25 8129707 . T A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.754;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:429,0,208 -chr25 8143332 . C T 3162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=-2.840;DP=294;FS=18.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.455;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,101:294:99:3191,0,6705 -chr25 8144041 . GC G 4333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=-1.795;DP=325;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=13.33;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,196:287:99:4371,0,4434 -chr25 8152525 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=-0.519;DP=26;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:400,0,502 -chr25 8153157 . A T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.073;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:418,0,484 -chr25 8153384 . T A 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=1.177;DP=31;FS=5.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.475;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,20:31:99:751,0,805 -chr25 8153392 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.764;DP=26;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=27.80;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:751,0,805 -chr25 8154338 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:57:386,0,57 -chr25 8155296 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,183 -chr25 8156052 . A C 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=1.809;DP=29;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:814,0,169 -chr25 8170185 . A G 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=1.746;DP=41;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=22.07;ReadPosRankSum=-1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:933,0,496 -chr25 8178920 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.461;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:866,0,427 -chr25 8182735 . A G 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.471;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:438,0,432 -chr25 8182904 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.995;DP=22;FS=1.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:578,0,142 -chr25 8246599 . C T 5274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.032;DP=239;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,154:239:99:5303,0,2894 -chr25 8251531 . C G 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=4.669;DP=89;FS=42.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=6.87;ReadPosRankSum=-4.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:640,0,4880 -chr25 8251534 . CA C 602.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=5.245;DP=88;FS=36.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.11;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=6.85;ReadPosRankSum=-4.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:640,0,4880 -chr25 8252185 . GT G 656.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.966;DP=31;FS=2.586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.931;QD=21.19;ReadPosRankSum=-1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,25:28:24:694,24,0 -chr25 8295417 . TA T 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=-0.209;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:417,0,339 -chr25 8296071 . T C 1432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=-0.475;DP=86;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,43:86:99:1461,0,1582 -chr25 8309071 . G A 1135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=-0.100;DP=81;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=14.02;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,34:81:99:1164,0,1533 -chr25 8309097 . G T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.830;DP=72;FS=0.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1057,0,1994 -chr25 8309152 . G A 887.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.361;DP=66;FS=19.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=13.45;ReadPosRankSum=2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:916,0,1399 -chr25 8311098 . T C 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-1.309;DP=80;FS=4.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,46:80:99:1446,0,1131 -chr25 8318436 . T C 1440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-1.121;DP=56;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=25.73;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1469,0,934 -chr25 8318514 . T G 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=0.614;DP=45;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=26.35;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,32:45:99:1214,0,310 -chr25 8350168 . G C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=1.788;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,181 -chr25 8350384 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-1.491;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.491;QD=17.10;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:319,0,271 -chr25 8350494 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.597;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=21.49;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:372,0,207 -chr25 8358054 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:234,0,144 -chr25 8577400 . G GAATCTGA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=27.07;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:53:308,0,53 -chr25 8582778 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=4.600;DP=37;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:288,0,1013 -chr25 8585038 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,143 -chr25 8585043 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,143 -chr25 8585213 . A C 912.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.337;DP=26;FS=6.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=30.07;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:4:939,0,4 -chr25 8589272 . T C 462.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:491,33,0 -chr25 8589326 . C T 382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:411,30,0 -chr25 8590211 . C T 2181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.035;DP=82;FS=6.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,56:82:99:2210,0,691 -chr25 8590327 . A G 5412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-1.198;DP=190;FS=6.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=28.49;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,139:189:99:5441,0,1145 -chr25 8590420 . A G 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=1.636;DP=229;FS=3.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,76:229:99:2006,0,7182 -chr25 8590611 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=3.575;DP=41;FS=7.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:238,0,2950 -chr25 8590613 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=3.786;DP=46;FS=5.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:238,0,2950 -chr25 8590708 . C T 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.516;DP=72;FS=11.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:532,0,2660 -chr25 8590773 . C T 1500.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-3.540;DP=34;FS=2.017;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=31.73;ReadPosRankSum=2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,28:33:5:1528,5,0 -chr25 8591605 . C T 1594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=3.579;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=16.27;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,45:98:99:1623,0,2120 -chr25 8600156 . C A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=20.88;ReadPosRankSum=1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:404,0,233 -chr25 8600176 . A C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=2.793;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=17.81;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,176 -chr25 8659822 . T C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=1.135;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:274,0,2063 -chr25 8659870 . T G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=1.633;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:259,0,1852 -chr25 8661771 . C G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=1.117;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:313,0,2624 -chr25 8670485 . AGTCAAACTAATGTGTGCTGTATATGAATAGCTATGAAAGTCCAGGTCTTGTGTGTTCCTCCAGGCT A 1060.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=2.593;DP=49;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=21.65;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:1098,0,6384 -chr25 8686123 . GCAGGTGTGTGTGTGTGTCTAGAAATAGCCTGTATATATTTTATGGTCTTTTGACACGAGTTAACAAATGAAAAACTTGATGGTA G 1842.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=4.888;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,45:56:99:1880,0,6017 -chr25 8717042 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.239;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:236,0,462 -chr25 8719498 . A G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-1.250;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=14.58;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:451,0,545 -chr25 8719535 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=-1.746;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=11.58;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:445,0,794 -chr25 8826687 . C A 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.377;DP=30;FS=1.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:463,0,576 -chr25 8870197 . ACTGCAATCAAAACAAAAACACGAGTTTAAGGAGCCGAGGAGGATTAGCATAATAAGCGGACGTTTATCTCCAAAACTGCAGAAAAAGCGAAAC A 2725.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.458;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.574;QD=30.10;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2763,204,0 -chr25 8969472 . G A 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-2.884;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:383,0,1010 -chr25 8985130 . G T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=-1.567;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:314,0,1503 -chr25 9136650 . G A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.104;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:334,0,1410 -chr25 9886289 . T C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=1.550;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=16.90;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:400,0,358 -chr25 9886797 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=21.98;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:270,0,232 -chr25 9886814 . T C 485.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=34.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:512,0,2 -chr25 9891827 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.179;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:252,0,136 -chr25 10608593 . A C 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr25 10765535 . T G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.262;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.877;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:396,0,436 -chr25 10817886 . T A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=-1.216;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=14.84;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:325,0,310 -chr25 10820045 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=22.73;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,132 -chr25 10820689 . G C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.745;DP=19;FS=17.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=23.15;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:468,0,218 -chr25 10830676 . T A 5121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=1.293;DP=209;FS=10.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,133:195:99:5150,0,1812 -chr25 10854662 . G GA 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.840;DP=44;FS=2.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:343,0,639 -chr25 10854714 . C G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.540;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=4.91;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:259,0,1351 -chr25 10855206 . C T 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.659;DP=57;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=14.22;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:839,0,1235 -chr25 10855294 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.575;DP=44;FS=5.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:259,0,1290 -chr25 10855582 . A C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=-1.673;DP=49;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=9.00;ReadPosRankSum=4.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:469,0,2416 -chr25 10855655 . A C 880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.822;DP=54;FS=2.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=16.31;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,25:54:99:909,0,1481 -chr25 10856084 . T G 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-2.392;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:592,0,740 -chr25 10856128 . C G 974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.365;DP=54;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.916;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:1003,0,958 -chr25 10856182 . A G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.489;DP=46;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=16.04;ReadPosRankSum=-2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:766,0,852 -chr25 10856233 . T C 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.878;DP=61;FS=2.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=18.77;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,34:61:99:1173,0,927 -chr25 10856625 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.705;DP=44;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:303,0,1132 -chr25 10856700 . G A 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=-1.088;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:702,0,1142 -chr25 10856859 . T A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.024;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=9.50;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:627,0,1848 -chr25 10857006 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.824;DP=53;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.429;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,27:52:99:988,0,1005 -chr25 10857476 . C CT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=1.021;DP=26;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:242,0,219 -chr25 10857554 . CAA C 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=1.975;DP=43;FS=6.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1450 -chr25 10857758 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.032;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:243,0,468 -chr25 10857815 . T C 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.203;DP=40;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.150;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:732,0,1004 -chr25 10857831 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=1.383;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:693,0,909 -chr25 10858142 . G A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.437;DP=32;FS=18.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=15.71;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:531,0,1350 -chr25 10858148 . C G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.140;DP=31;FS=15.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:531,0,1336 -chr25 10860879 . G A 1375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.327;DP=92;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:1404,0,1670 -chr25 10861148 . GCTGCAAAAAGAGAGGCTGTTAGTTTAGATGGCTTCCATTAGTGCAACTAGCTTCTGCGAAACGAGACCTAC G 3781.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=2.393;DP=92;FS=6.380;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.940;QD=28.49;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:3819,283,0 -chr25 10863041 . G T 1232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-2.429;DP=76;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=16.22;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,36:76:99:1261,0,1268 -chr25 10865009 . G A 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.582;DP=80;FS=6.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=13.86;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,33:79:99:1137,0,1515 -chr25 10876890 . T C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=1.384;DP=46;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=8.26;ReadPosRankSum=2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:408,0,1071 -chr25 10887193 . G A 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.597;DP=72;FS=3.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=16.91;ReadPosRankSum=2.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,35:72:99:1246,0,1158 -chr25 10887373 . C G 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.687;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,25:44:99:752,0,616 -chr25 10889242 . G A 2031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=1.382;DP=68;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.840;QD=29.88;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,55:67:99:2060,0,182 -chr25 10953065 . C A 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.686;DP=67;FS=0.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,24:66:99:819,0,1446 -chr25 10991789 . A T 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.713;DP=49;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1426,0,235 -chr25 10992022 . A T 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.066;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1622,0,1647 -chr25 10992344 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-1.462;DP=76;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:283,0,2695 -chr25 10994423 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.828;DP=75;FS=2.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:289,0,2304 -chr25 10999291 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.255;DP=51;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:274,0,1440 -chr25 11008395 . AAGGTGATGGAGAGGCTTTTGCATAATAATCTTGCACATATCAATACTCAGGATTGTATGAGAGTCAGTTACTGAAGCTTTGCTCCTTCATTTT A 7320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.793;DP=190;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=33.15;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,177:180:99:7358,531,0 -chr25 11016212 . A G 1747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.743;DP=116;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,53:116:99:1776,0,2081 -chr25 11046230 . T C 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:44:571,44,0 -chr25 11071475 . A G 280.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:309,21,0 -chr25 11071777 . C G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=20.56;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:275,0,184 -chr25 11109593 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:236,0,446 -chr25 11109873 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.146;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:239,0,504 -chr25 11110058 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:379,0,312 -chr25 11110165 . C T 1283.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1312,90,0 -chr25 11110222 . G T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-2.005;DP=32;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=12.24;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:420,0,704 -chr25 11110291 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr25 11110315 . C T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr25 11110431 . T A 1250.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:87:1279,87,0 -chr25 11110440 . A G 1250.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:87:1279,87,0 -chr25 11113345 . T C 387.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.448;DP=12;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=32.27;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:9:415,0,9 -chr25 11114791 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.417;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:541,0,163 -chr25 11116973 . T C 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.059;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:328,0,208 -chr25 11154016 . G A 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.330;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.943;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,25:59:99:871,0,1159 -chr25 11154676 . G A 1080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=-0.731;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=25.73;ReadPosRankSum=2.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,29:41:99:1109,0,401 -chr25 11154961 . A T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-1.990;DP=24;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=12.45;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:327,0,1255 -chr25 11155541 . G C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.122;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:247,0,383 -chr25 11155862 . A T 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.102;DP=38;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=18.02;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:713,0,1139 -chr25 11155921 . AT A 448.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.249;DP=37;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:486,0,799 -chr25 11157608 . A T 1146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.220;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,35:56:99:1175,0,819 -chr25 11404348 . C T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.673;DP=29;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:261,0,755 -chr25 11404834 . T A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.318;DP=30;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:650,0,439 -chr25 11424329 . G T 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=-0.164;DP=40;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:603,0,735 -chr25 11424346 . T G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=-0.886;DP=34;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=11.49;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:419,0,675 -chr25 11564109 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:246,0,483 -chr25 11613430 . C A 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-2.270;DP=35;FS=7.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=21.11;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:767,0,429 -chr25 11632546 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-0.306;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:579,0,599 -chr25 11659744 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-1.383;DP=30;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:495,0,1689 -chr25 11659784 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.757;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=5.44;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:246,0,1132 -chr25 11670081 . G A 843.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=-1.285;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.64;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,24:39:99:872,0,504 -chr25 11672164 . A T 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.248;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:570,0,640 -chr25 11673023 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-0.618;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:232,0,1080 -chr25 11673904 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.118;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:264,0,790 -chr25 11674613 . TA T 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.318;DP=26;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:302,0,325 -chr25 11674705 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:292,0,291 -chr25 11714577 . A G 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.063;DP=73;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,42:72:99:1438,0,1054 -chr25 11714706 . A T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.409;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=19.77;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,38:62:99:1254,0,818 -chr25 12610766 . A G 1639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.542;DP=94;FS=6.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,50:94:99:1668,0,1648 -chr25 12614196 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=-0.336;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:231,0,1181 -chr25 12614366 . G C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-1.187;DP=41;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=17.04;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:727,0,771 -chr25 12614471 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=-0.734;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:450,0,802 -chr25 12615202 . G A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=1.359;DP=31;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=22.02;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:711,0,968 -chr25 12615893 . C G 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.966;DP=60;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=16.08;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:993,0,1153 -chr25 12615987 . T A 1002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=1.045;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,28:60:99:1031,0,1069 -chr25 12767196 . C G 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.956;DP=22;FS=10.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:411,0,366 -chr25 12767274 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.938;DP=29;FS=8.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:517,0,516 -chr25 13097448 . A AT 1138.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-2.414;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,54:146:99:1176,0,2252 -chr25 13152394 . T A 1652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.529;DP=99;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=16.69;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,48:99:99:1681,0,1681 -chr25 13152453 . C T 2072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.911;DP=124;FS=0.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,59:124:99:2101,0,2175 -chr25 13153833 . C T 1684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.429;DP=96;FS=6.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,48:96:99:1713,0,1664 -chr25 13154867 . A T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=1.013;DP=75;FS=10.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,28:75:99:979,0,1779 -chr25 13162990 . C A 2218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=-0.768;DP=140;FS=5.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,80:140:99:2247,0,2032 -chr25 13200677 . C T 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-1.690;DP=140;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,70:140:99:2852,0,5357 -chr25 13200682 . C T 2823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.317;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,70:138:99:2852,0,5357 -chr25 13201601 . C T 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.547;DP=117;FS=3.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=14.07;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,48:116:99:1674,0,2738 -chr25 13201783 . A G 2111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=-1.296;DP=120;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,62:118:99:2140,0,2061 -chr25 13201906 . C CA 876.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.127;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:914,0,541 -chr25 13202031 . A T 1367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=1.016;DP=106;FS=8.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,51:103:99:1639,0,1812 -chr25 13202836 . T A 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=1.915;DP=62;FS=0.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=17.53;ReadPosRankSum=-1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1115,0,1163 -chr25 13203172 . AT A 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=1.208;DP=73;FS=0.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:604,0,1081 -chr25 13204663 . T A 1651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.337;DP=90;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,50:90:99:1680,0,1404 -chr25 13204830 . G C 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=-2.897;DP=83;FS=20.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,38:82:99:1377,0,1623 -chr25 13228948 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-2.794;DP=48;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:244,0,1307 -chr25 13240920 . G A 1928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-1.130;DP=103;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,59:103:99:1957,0,1564 -chr25 13246002 . C T 2600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=-1.183;DP=147;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,79:147:99:2629,0,2394 -chr25 13251299 . T A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:278,0,187 -chr25 13251758 . T G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=-1.110;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=27.12;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:435,0,172 -chr25 13252905 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-1.203;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:328,0,288 -chr25 13469798 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.479;DP=36;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=7.72;ReadPosRankSum=-2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:306,0,1281 -chr25 13469805 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.022;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.682;QD=7.96;ReadPosRankSum=2.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:291,0,1170 -chr25 13469900 . A G 690.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:719,51,0 -chr25 13552728 . T A 3648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=-1.651;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,114:275:99:3677,0,10170 -chr25 13636870 . A T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-1.747;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:346,0,311 -chr25 13637200 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,384 -chr25 13960757 . G A 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=1.161;DP=60;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:1142,0,1137 -chr25 13960821 . C T 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.083;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:711,0,1674 -chr25 13963958 . G A 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=-1.321;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,43:59:99:1616,0,437 -chr25 13991658 . T C 2197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.884;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=32.92;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:40:2226,0,40 -chr25 14080786 . GCTGCATCAAACACACACACACACACACACAAACATGACAATGCAAATTGACATCTGAAACACCACCTCACTTCCAAACAGAAACCGGTACTCTCATGCCCTCTGCTGGTGAGTAAGCGCAATAAATCCAGAATTAACATTGAAGGAATCTTTTTTTACTCAAAATCTCTCTGAAATGTACTCTAATGTCCTAAATCCAGTTCAGAGTTGAAAAAGATCCAAAACCACAACATTAC G 6609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.508;ClippingRankSum=6.043;DP=234;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.169;QD=28.25;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,204:223:99:6647,0,6641 -chr25 14100593 . T TA 420.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=-0.817;DP=27;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:458,0,943 -chr25 14100600 . C A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.628;DP=30;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=14.33;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:458,0,940 -chr25 14101669 . T C 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.746;DP=70;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=16.73;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1199,0,1201 -chr25 14122097 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=1.997;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=19.68;ReadPosRankSum=-2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:717,0,392 -chr25 14295501 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=-3.170;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:235,0,428 -chr25 14674264 . GCACCTGTGAGCAAAGAAGAGAACATTTTTGTATCGACAAACTCTAGATGAAAAAGAAAAAAAAAACATGTCATGTTTAAACTCT G 1560.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.578;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1598,132,0 -chr25 14691004 . GCTTAAAGAACACATTTGAATGTACAAGACTGCTTTTTTACAAGTAAGAAAAAATTAGATATAACTTTAGGATGTACTTAC G 851.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=1.429;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:889,0,4140 -chr25 14771852 . A AT 564.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.008;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:602,0,808 -chr25 14772874 . C CT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.775;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:414,0,420 -chr25 15305898 . T A 385.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:414,30,0 -chr25 15642035 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=2.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=14.66;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:424,0,530 -chr25 15705603 . A AT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.071;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:34:293,0,34 -chr25 16004835 . CT C 447.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.014;DP=39;FS=9.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=11.48;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:485,0,708 -chr25 16005293 . T A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.307;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,29:125:99:664,0,7294 -chr25 16005299 . C A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=-0.582;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,28:123:99:664,0,7294 -chr25 16007048 . G A 2249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.019;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.06;ReadPosRankSum=-1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,66:160:99:2278,0,3203 -chr25 16149710 . G A 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.266;DP=148;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,38:148:99:819,0,4093 -chr25 16154235 . G C 3198.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.870;DP=224;FS=6.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,96:222:99:3227,0,4072 -chr25 16156963 . C T 2155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-1.682;DP=146;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=14.77;ReadPosRankSum=1.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,61:146:99:2184,0,3021 -chr25 16156979 . C G 2289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.614;DP=145;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.560;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,65:145:99:2318,0,2903 -chr25 16157432 . G T 2861.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.297;DP=204;FS=4.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=14.03;ReadPosRankSum=1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,88:202:99:2899,0,3839 -chr25 16157699 . G GT 707.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-1.475;DP=57;FS=5.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=12.42;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:745,0,1409 -chr25 16318401 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,178 -chr25 16365562 . T G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=-0.074;DP=34;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:297,0,834 -chr25 16372104 . AAGGTTAGTCTGCATCTGTGCATTTGCATTTGTTAACAGGTTTAAAGTTTGCAGGAATCAACATACAGTTTGTGTCGTAACATGAATTAGAAGTAGTTTGCTGTTGAATATTTTGTTTCTGT A 1314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.966;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=32.87;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:99:1352,0,873 -chr25 16379582 . T G 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=1.162;DP=60;FS=2.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:726,0,1237 -chr25 16595420 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.693;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=12.35;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:337,0,519 -chr25 16596518 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=2.357;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.359;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:406,0,1060 -chr25 16617111 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=21.71;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:267,0,135 -chr25 16660607 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.027;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=16.11;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:431,0,395 -chr25 16779872 . G A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.590;DP=63;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:926,0,1170 -chr25 16788715 . G A 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-1.058;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=10.83;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,36:107:99:1187,0,2376 -chr25 16789357 . G T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.037;DP=73;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=7.33;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:563,0,1900 -chr25 16790278 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.149;DP=43;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:269,0,2076 -chr25 16791371 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=-0.971;DP=76;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:615,0,1769 -chr25 16791756 . AT A 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.387;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,24:87:99:377,0,1858 -chr25 16792829 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=2.605;DP=112;FS=1.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=5.18;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,27:112:99:608,0,3394 -chr25 16797695 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.262;DP=38;FS=2.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:433,0,883 -chr25 16838279 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.258;DP=30;FS=5.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:368,0,676 -chr25 16886913 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.846;DP=31;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=10.35;ReadPosRankSum=1.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:349,0,697 -chr25 16899859 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=1.311;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=18.43;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:618,0,518 -chr25 16956445 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=1.806;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:587,0,156 -chr25 16957486 . G A 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.193;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=20.66;ReadPosRankSum=2.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:524,0,298 -chr25 16967107 . CAGGTGAGCTCAATTTCCTGTCAATCTGTTTACATCATATTAATTATGTCAGTTCTTAAAACTTGTGAGCTCATAAAGAGGTTTATTATCTGTTTATTCT C 2390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.697;DP=57;FS=2.136;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2428,197,0 -chr25 16982594 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.098;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:331,0,976 -chr25 17037048 . A T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.409;DP=81;FS=1.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.522;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:975,0,1814 -chr25 17037094 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=-0.204;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:806,0,2328 -chr25 17038293 . TTATACAGGTGGG T 3010.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-0.946;DP=123;FS=15.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.48;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,79:99:99:3048,0,1200 -chr25 17038297 . ACAGGTGGGCATAAAAGATATTAATCAATTAATCAATTATTATTAAAGAATAATTCAATAAAATGATGATAATATTTGG A 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.311;DP=118;FS=13.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:284,0,4067 -chr25 17038309 . AAAAGATATTAATCAATTAATCAATTATTATTAAAGAATAATTCAATAAAATGATGATAATATTTGG A 3121.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.569;DP=115;FS=10.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=27.15;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,75:96:99:3159,0,1149 -chr25 17044304 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=-1.879;DP=27;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=16.77;ReadPosRankSum=-3.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:481,0,444 -chr25 17051620 . AACAGGTAAAACAAAACTTATTCTGAGACTGTAACTGAGTAAGGTTTTGTTTTATATGTCTCAATTTCCTTT A 1273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=2.668;DP=39;FS=1.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=32.66;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,34:39:99:1311,0,665 -chr25 17056087 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.293;DP=53;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:253,0,1517 -chr25 17137291 . G A 3070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.713;DP=438;FS=7.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:311,126:437:99:3099,0,11709 -chr25 17296795 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:68:309,0,68 -chr25 17298425 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.792;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:448,0,238 -chr25 17310856 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.984;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,350 -chr25 17328626 . CA C 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.576;DP=66;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:326,0,860 -chr25 17330500 . A G 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.397;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:941,0,1794 -chr25 17331112 . G GT 414.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-1.560;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,30:106:99:452,0,2210 -chr25 17633250 . C A 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-1.276;DP=52;FS=3.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:642,0,1047 -chr25 17660891 . TACACAGGTATGCTGAGCTTTCCCTTCATTCACAGGAAACACATGGAGTCCATTTAGGTTTAATTTTACTTACTTATCC T 880.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=-2.892;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.844;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:918,0,679 -chr25 17660929 . ACACATGGAGTCCATTTAGGTTTAATTTTACTTACTTATCCACACAGAAG A 430.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=2.590;DP=50;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:468,0,1285 -chr25 17664011 . G A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=1.229;DP=46;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.138;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:591,0,1049 -chr25 17664238 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.376;DP=72;FS=3.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.132;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:623,0,1822 -chr25 17666029 . A AT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.659;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:290,0,521 -chr25 17666679 . A AT 609.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-2.166;DP=49;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:647,0,1301 -chr25 17690214 . CAGGTGGGTGAATTTGACATTGGCGGGAAGTTGTTATTGCATCACTGTGTACTGATATGTGCCTGGGTCACGTTTCT C 11034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=-2.820;DP=257;FS=3.602;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=31.14;ReadPosRankSum=3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,251:257:99:11072,953,0 -chr25 17690643 . GGTAAGTGAGCATTCATGGACGTATTGTTTGTAATT G,GGAGCATTCATGGACGTATTGTTTGTAATT 1022.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.668;DP=284;FS=3.358;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,0,12:13:99:1186,1022,2245,210,0,112 -chr25 17693470 . C T 4809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-2.270;DP=218;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.624;QD=22.06;ReadPosRankSum=2.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,140:216:99:4838,0,2610 -chr25 17693479 . GCAGGTAACCATGCCTGTACCAACTGATTGAATATCGATATCAGTGTCAAGATTCCCTGATGGTGGTGTTCTCAAATCTGTCCTGTTGTATTC G 1034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=1.715;DP=210;FS=3.554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,203:204:99:1072,408,0 -chr25 17695359 . AGTGCGTAAACAAGTTACTTTTGCAATGTAGCAATGGTCTAAAATAAACTGATGTTTAATGTTTTAATTTCTTCTACAG A 14128.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=2.433;DP=302;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=37.78;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,300:302:99:14166,1175,0 -chr25 17696376 . C CA 776.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.930;DP=319;FS=17.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,71:307:99:814,0,6629 -chr25 17697242 . CGTTAGTTACTCACTCTACCAACCAATTCATTACCCCTTTTCAAATAGCGTTAATTAAGACACTAACAATTTTTACCTTAACGTTTATAG C 10602.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.211;DP=276;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=29.61;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,271:275:99:10640,721,0 -chr25 17702839 . G A 3900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=-1.351;DP=314;FS=3.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,118:313:99:3929,0,6572 -chr25 17731439 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=2.257;DP=74;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:259,0,2326 -chr25 17771027 . C T 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.116;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=6.74;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,57:200:99:1376,0,5443 -chr25 17773634 . C T 1387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.405;DP=227;FS=6.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=6.11;ReadPosRankSum=2.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,63:227:99:1416,0,6312 -chr25 17774520 . CT C 410.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.598;DP=45;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:448,0,298 -chr25 17775178 . A T 1499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.259;DP=86;FS=10.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,41:86:99:1528,0,1498 -chr25 17775380 . TA T 736.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.350;DP=82;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.662;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,32:76:99:774,0,1066 -chr25 17775701 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.736;DP=55;FS=7.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=3.89;ReadPosRankSum=2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,11:55:99:242,0,3228 -chr25 17775702 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=1.675;DP=54;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:242,0,3228 -chr25 17775881 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=-2.779;DP=47;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:363,0,1034 -chr25 17775896 . C T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=-2.692;DP=58;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=14.00;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:840,0,1135 -chr25 17775960 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.096;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:683,0,2860 -chr25 17797876 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=-0.053;DP=73;FS=3.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:620,0,1916 -chr25 17809166 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.551;DP=60;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:297,0,1760 -chr25 17830765 . G A 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=-1.529;DP=84;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,31:84:99:1081,0,1770 -chr25 17831777 . G T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.681;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.721;QD=7.13;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:406,0,1463 -chr25 17831879 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.576;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:374,0,1878 -chr25 17832020 . C A 1005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=1.816;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:1034,0,1903 -chr25 17834904 . TA T 745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.248;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.872;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:786,0,431 -chr25 17918014 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=1.209;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=12.88;ReadPosRankSum=-2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:376,0,562 -chr25 17919207 . C T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.960;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=16.18;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:627,0,718 -chr25 17927561 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.094;DP=35;FS=8.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:266,0,904 -chr25 17933070 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.580;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=12.14;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:599,0,934 -chr25 17953321 . T C 1730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.694;DP=55;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,46:55:99:1759,0,139 -chr25 17953420 . C T 845.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-1.095;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:874,0,1061 -chr25 17956741 . G A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=-2.004;DP=47;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:601,0,1037 -chr25 17958255 . C A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=-1.460;DP=36;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.158;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:404,0,891 -chr25 18236606 . T C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr25 18338033 . GTA G 202.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.96;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:240,0,25 -chr25 18423853 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.529;DP=12;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,187 -chr25 18431135 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.289;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=8.61;ReadPosRankSum=0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:364,0,1069 -chr25 18454792 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=-0.161;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:330,0,674 -chr25 18541190 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.861;DP=76;FS=15.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,18:76:99:394,0,1898 -chr25 18542134 . C CA 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.914;DP=34;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=13.79;ReadPosRankSum=-1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:506,0,502 -chr25 18542531 . C G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=1.851;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:382,0,924 -chr25 18605839 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.752;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:262,0,301 -chr25 18609449 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.680;DP=60;FS=5.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=15.98;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,31:60:99:987,0,1034 -chr25 18933347 . A G 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr25 18933690 . A G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=22.46;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:410,0,195 -chr25 18983330 . T C 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.219;DP=119;FS=0.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.105;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,38:119:99:970,0,3094 -chr25 19048293 . G GA 745.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:80:786,80,0 -chr25 19062795 . G GA 1160.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-1.050;DP=187;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,76:168:99:1377,0,2174 -chr25 19062837 . G A 3860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-2.065;DP=201;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,118:201:99:3889,0,2826 -chr25 19063080 . C T 8032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.916;ClippingRankSum=-4.096;DP=143;FS=26.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=27.42;ReadPosRankSum=8.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,82:143:99:8061,0,8049 -chr25 19063385 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,100 -chr25 19063972 . A C 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.996;DP=102;FS=6.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:936,0,6210 -chr25 19063983 . T C 884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=2.930;DP=108;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,32:108:99:913,0,6210 -chr25 19064221 . A G 1591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=-0.950;DP=95;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,50:95:99:1620,0,1498 -chr25 19064255 . G GT,GTT 839.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=1.025;DP=85;FS=1.344;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=9.87;ReadPosRankSum=-2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:11,34,28:73:99:1373,418,428,533,0,712 -chr25 19064404 . G T 4576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=1.714;DP=330;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=13.87;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,132:329:99:4605,0,6643 -chr25 19064691 . G A 2257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=-1.021;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=12.90;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,64:175:99:2286,0,3988 -chr25 19442310 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-2.753;DP=92;FS=3.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:620,0,2487 -chr25 19449323 . G A 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.045;DP=53;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.337;QD=14.92;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:819,0,1218 -chr25 19451856 . A AT 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.974;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:298,0,320 -chr25 19453391 . CT C 315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=1.243;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:353,0,395 -chr25 19486571 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,134 -chr25 19486578 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,134 -chr25 19508919 . AAGGTGAATGACTCTGACTCTCAGCACTGAAGTTCAGCATCTCGGTGTCACTGACTAAACTGTGTGTTTGTTGAC A 7865.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=1.364;DP=182;FS=2.308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.15;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,171:174:99:7903,635,0 -chr25 20046827 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=1.561;DP=56;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:277,0,1635 -chr25 20075884 . GCTGAGAATAAAAATGAGATAAAAAAATTCAGTAAACCTTCAGACAAAACTGACATAAATCATTATTTCGGAAACATAC G 5929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.330;DP=127;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:123:99:5967,473,0 -chr25 20224331 . GAGGTTGGTTTCGTTTGTCTTTGTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTATTTCATGTTTACGTTGACATTTTTACTTCT G 513.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=2.384;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=6.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:75:99:551,161,0 -chr25 20723322 . GCTGTAGACACACCGAGACAGCATCGGCACTCTGCTTAAAACACCAAAACCAAAAACTCTTTGACATGGTTTTCTACGTAC G 761.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=3.342;DP=201;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=3.79;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,169:175:99:799,297,0 -chr25 20736425 . CGACCTAACAGTAGAAAATTTAAAAAGTGCAGCGTTCCAAAAAAAATCTGCATCACACAGCTATGCGATAAAGCATCACAATGCTCAAACTGAAAGACACAGACATTGTGTGCAAAAATTATGCAGTAAAAGAAGCGTAAATGTGCT C 8855.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.066;DP=205;FS=3.025;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.161;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,202:204:99:8893,878,0 -chr25 20754965 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-1.181;DP=20;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=30.29;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:67:634,0,67 -chr25 20846989 . C T 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-1.302;DP=48;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.442;QD=13.85;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:693,0,836 -chr25 20847356 . G T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.242;DP=52;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:385,0,1890 -chr25 20849691 . GA G 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-1.351;DP=43;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:356,0,311 -chr25 20858304 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;ClippingRankSum=-0.324;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:752,0,1188 -chr25 21238955 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-1.602;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.344;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:545,0,430 -chr25 21239492 . C T 1222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=2.068;DP=74;FS=0.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,35:74:99:1251,0,1305 -chr25 21239904 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=1.495;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:425,0,2174 -chr25 21278231 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.161;DP=86;FS=4.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:537,0,4663 -chr25 21317237 . CA C 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.136;DP=71;FS=6.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:597,0,1152 -chr25 21373692 . G GT 809.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=-1.326;DP=58;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.592;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:847,0,773 -chr25 21374775 . T G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.149;DP=44;FS=12.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:422,0,1326 -chr25 21375115 . T A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-1.191;DP=29;FS=3.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:369,0,609 -chr25 21375274 . C A 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.136;DP=68;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,29:68:99:1099,0,3254 -chr25 21375473 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.465;DP=39;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:670,0,766 -chr25 21375715 . A T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=3.512;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:344,0,3112 -chr25 21375716 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=3.445;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:344,0,3112 -chr25 21375803 . C T 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.136;DP=57;FS=9.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=17.29;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,28:57:99:1014,0,1014 -chr25 21419744 . C T 209.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.87;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11:237,0,11 -chr25 21669952 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.738;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.697;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:239,0,3011 -chr25 21750914 . TCTGATAATGAAAAAATGAAAAAAATTAATTTATTTACAATTAACAAACATATGACACATCAGAACAAATCTCAC T 1786.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=1.155;DP=43;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:99:1824,131,0 -chr25 21781052 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=2.354;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:965,0,1048 -chr25 21785943 . CT C 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.835;DP=35;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:90:383,0,90 -chr25 21786254 . C A 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-1.645;DP=86;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:745,0,2174 -chr25 21795314 . G A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-1.089;DP=101;FS=4.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=6.33;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,28:101:99:668,0,2783 -chr25 21795453 . C T 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.152;DP=133;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,37:132:99:887,0,3553 -chr25 21796082 . G A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=-1.209;DP=61;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:620,0,3422 -chr25 21796098 . C T 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-2.724;DP=65;FS=2.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=9.41;ReadPosRankSum=3.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:640,0,3422 -chr25 21797458 . G T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.037;DP=77;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,29:77:99:820,0,1505 -chr25 21802997 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.609;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=7.30;ReadPosRankSum=3.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:678,0,2332 -chr25 21813137 . C T 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.098;DP=78;FS=4.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,30:78:99:1053,0,1675 -chr25 21826523 . C A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.198;DP=66;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=7.62;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:531,0,1612 -chr25 21827055 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.817;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:308,0,136 -chr25 21910331 . A G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.717;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.181;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:269,0,389 -chr25 21910340 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.788;QD=20.06;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:269,0,389 -chr25 21950977 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=-1.022;DP=19;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:252,0,547 -chr25 22407586 . T C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.335;DP=40;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:517,0,871 -chr25 22414315 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.320;DP=43;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:266,0,1282 -chr25 22469750 . C A 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr25 22470876 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:58:296,0,58 -chr25 22477250 . ACCTGTTTAAAATTAAGTTGTTAACGTAAATAACAAAGTGTGATTAATAGTATAGTGTGTTTTATTTACTACTCG A 1603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.860;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=32.17;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:99:1641,131,0 -chr25 22513945 . G T 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.163;ClippingRankSum=-1.192;DP=440;FS=4.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,103:440:99:1891,0,13018 -chr25 22529804 . T A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.116;DP=38;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:273,0,1072 -chr25 22530847 . G A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr25 22537017 . TCCTATGCAAGAAAACCGAAGACAAGACAATTCTGCCATAGTATTCCTTAAAATCTGTGCAAGCATCACTGCTCTCTTA T 1522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.800;DP=54;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1560,0,6630 -chr25 22636870 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=1.010;DP=26;FS=6.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:275,0,1189 -chr25 22637477 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-2.307;DP=35;FS=10.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:492,0,746 -chr25 22639380 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.079;DP=52;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:316,0,1389 -chr25 22881519 . C T 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.548;DP=163;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=7.05;ReadPosRankSum=3.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,48:162:99:1177,0,4217 -chr25 22948376 . G T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.471;DP=131;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,23:129:99:339,0,4086 -chr25 22949188 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=-0.509;DP=130;FS=11.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,23:128:99:358,0,4018 -chr25 22956209 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.710;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,25:139:99:403,0,9084 -chr25 23015546 . C G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:245,0,302 -chr25 23225003 . A C 278.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.90;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:306,0,11 -chr25 23310765 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=-0.286;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:344,0,1034 -chr25 23339555 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-2.005;DP=94;FS=12.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:682,0,2448 -chr25 23339569 . C T 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-1.103;DP=101;FS=9.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:721,0,2538 -chr25 23357170 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-0.733;DP=107;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,25:107:99:495,0,3061 -chr25 23359913 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=-0.555;DP=137;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,37:137:99:1044,0,8082 -chr25 23360378 . A G 582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-1.174;DP=140;FS=9.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,31:140:99:611,0,4256 -chr25 23360723 . G A 2110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.423;DP=138;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.399;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,37:138:99:2139,0,3988 -chr25 23360783 . A T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.439;DP=145;FS=5.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,37:144:99:381,0,10588 -chr25 23482351 . T G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=29.68;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:43:325,0,43 -chr25 23577590 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.110;DP=56;FS=4.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:248,0,1634 -chr25 23700316 . CAT C 338.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.807;DP=74;FS=5.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,16:73:99:376,0,2475 -chr25 23703436 . G GTA 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.529;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:360,0,1914 -chr25 23705817 . G T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=-0.897;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:559,0,4141 -chr25 24011382 . AC A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:243,0,130 -chr25 24294272 . G A 1689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-0.215;DP=353;FS=0.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=4.79;ReadPosRankSum=2.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:271,81:352:99:1718,0,10446 -chr25 24315431 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=1.755;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.494;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:634,0,1910 -chr25 24348702 . A T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.101;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:400,0,660 -chr25 24359393 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=2.571;DP=227;FS=2.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=3.47;ReadPosRankSum=3.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,45:226:99:815,0,6947 -chr25 24359405 . C T 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=3.380;DP=239;FS=6.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,40:239:99:502,0,7649 -chr25 24538785 . G A 3255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.665;DP=245;FS=4.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,94:245:99:3284,0,5270 -chr25 24764157 . A T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=-0.586;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:644,0,607 -chr25 24764652 . A T 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.295;DP=51;FS=8.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:737,0,890 -chr25 24907723 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-2.002;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,10:44:99:405,0,2850 -chr25 24907733 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-2.781;DP=54;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:403,0,2850 -chr25 24993760 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-0.171;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:275,0,1252 -chr25 25438357 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.262;DP=27;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=21.18;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:600,0,230 -chr25 25446873 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=1.910;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:342,0,295 -chr25 25748198 . AAGGTATGTTCCTTCCTCCTCCTTTTCTTTTTTTTCAATCAAGTTGTTTTGATTTCTGACCTCCTCGCCTTTTTTGTCTTC A 5512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.845;DP=129;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=35.26;ReadPosRankSum=-2.960 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,121:125:99:5550,492,0 -chr25 25750065 . T TA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=-3.486;DP=287;FS=1.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,78:277:99:329,0,27559 -chr25 25750244 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-2.574;DP=169;FS=6.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.438;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,30:169:99:466,0,5772 -chr25 25750335 . C T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-0.400;DP=129;FS=3.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,31:129:99:716,0,3852 -chr25 26225315 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=28.68;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:315,0,47 -chr25 26363253 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:314,0,446 -chr25 26363615 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.857;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:326,0,364 -chr25 26363748 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,378 -chr25 26367493 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=-1.408;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:359,0,246 -chr25 26368132 . T C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.09;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:272,0,62 -chr25 26374685 . A G 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.286;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.207;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:990,0,2837 -chr25 26374694 . C T 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.287;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:990,0,2687 -chr25 26409908 . C T 1972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-1.161;DP=111;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,59:111:99:2001,0,1925 -chr25 26411353 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=3.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:301,0,732 -chr25 26411371 . A AT 920.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.32;MQ0=0;QD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1001,99,0 -chr25 26430111 . GT G 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.370;DP=46;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:367,0,381 -chr25 26680732 . T C 669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:698,51,0 -chr25 26691025 . TTG T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.311;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=13.09;ReadPosRankSum=0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:286,0,361 -chr25 26692409 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:299,21,0 -chr25 26693374 . C G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:302,0,220 -chr25 26748483 . G A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.934;DP=67;FS=4.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.069;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1096,0,1152 -chr25 26748754 . C T 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-1.406;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=13.00;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:821,0,1340 -chr25 26749586 . G A 1126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=-1.129;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=15.23;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,32:74:99:1155,0,1390 -chr25 26773066 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=30.18;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,103 -chr25 26773072 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:330,0,103 -chr25 27097417 . T C 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:48:672,48,0 -chr25 27097428 . A T 643.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:48:672,48,0 -chr25 27281022 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-2.074;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:230,0,276 -chr25 27384095 . A G 417.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:446,33,0 -chr25 27384252 . T G 531.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:560,39,0 -chr25 27419374 . C CA 484.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:522,54,0 -chr25 27607318 . CACCTGAAAGGGATATGACATCATATAGCTGAAAAAATATGGACAACATATTACCGAAATATTTAAATATTTGGTT C 2331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=1.674;DP=56;FS=2.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=26.67;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:99:2369,198,0 -chr25 27607673 . TCTGAAGGAGAATAAGACAGGTGAACTTTTCCAACAATAGTTACAAAAGTCAAGTTTTTGTGAAATTATGCTTAC T 2109.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=1.264;DP=59;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=26.90;ReadPosRankSum=-2.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,56:59:99:2293,0,373 -chr25 27690075 . G GA 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-2.065;DP=37;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:303,0,555 -chr25 27690136 . T C 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.436;DP=53;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:420,0,1363 -chr25 27692958 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=1.122;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:241,0,344 -chr25 27707282 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=20.58;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,323 -chr25 27754932 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.324;DP=348;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,47:320:99:398,0,10706 -chr25 28353895 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-0.513;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:231,0,1015 -chr25 28367772 . G A 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-2.775;DP=33;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:2216,0,149 -chr25 28367825 . G A 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.475;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=31.63;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:99:2216,0,146 -chr25 28367869 . A G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.124;DP=69;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:740,0,1187 -chr25 28368018 . A C 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.239;DP=12;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:595,0,109 -chr25 28368035 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-1.975;DP=22;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:357,0,475 -chr25 28368104 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.943;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:342,0,345 -chr25 28407888 . T C 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.302;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.983;QD=10.83;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:548,0,1075 -chr25 28407945 . G A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.919;DP=54;FS=2.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:431,0,1622 -chr25 28582172 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.501;DP=56;FS=2.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=6.05;ReadPosRankSum=2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:367,0,1583 -chr25 28583067 . G A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-0.423;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.578;QD=6.92;ReadPosRankSum=2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:506,0,1906 -chr25 28583213 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-1.599;DP=73;FS=5.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,17:73:99:376,0,2139 -chr25 28630218 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.063;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:333,0,1506 -chr25 28673504 . C T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.299;DP=76;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,25:76:99:703,0,1901 -chr25 28678524 . A AT 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=-2.181;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.381;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:341,0,1677 -chr25 28678560 . C CT 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.968;DP=73;FS=7.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:304,0,1276 -chr25 28691225 . G A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.501;DP=31;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:434,0,607 -chr25 28700926 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=1.385;DP=39;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:330,0,1014 -chr25 28700950 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.159;DP=36;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=5.60;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:230,0,1451 -chr25 29140689 . AAGGTGAGACGAACGAAATCTATTTTTTTCTTTTAGCACGCACCGCATGTCTTCTCTCTTTCTCCCATTCTTTAACACAATTTGCAATTTC A 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=1.949;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=31.45;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:509,0,816 -chr25 29200143 . A G 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=1.033;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:395,0,770 -chr25 29200537 . A G 425.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:453,0,8 -chr25 29201518 . A G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.328;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.22;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:407,0,417 -chr25 29201533 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.395;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:348,0,607 -chr25 29202448 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.014;DP=86;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,26:86:99:679,0,2236 -chr25 29266423 . C T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-0.903;DP=33;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.203;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:440,0,653 -chr25 29457201 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.801;DP=37;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=8.97;ReadPosRankSum=3.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:360,0,905 -chr25 29457340 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=1.492;DP=40;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:347,0,968 -chr25 29507700 . TA T 1627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.390;DP=138;FS=1.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,57:121:99:1665,0,1270 -chr25 29507709 . A C 328.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.705;DP=139;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.593;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,24:137:99:366,0,6305 -chr25 29507826 . GTA G 1875.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.553;DP=145;FS=3.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=12.94;ReadPosRankSum=2.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,52:135:99:1913,0,3041 -chr25 29519851 . AT A 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.128;DP=135;FS=4.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.987;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,27:131:99:357,0,3112 -chr25 29582063 . C CTG 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.467;DP=30;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=17.22;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:554,0,447 -chr25 29625700 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=1.804;DP=47;FS=4.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=12.80;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:630,0,1920 -chr25 29785030 . CTG C 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:240,0,106 -chr25 29855851 . GT G 1943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=-3.142;DP=247;FS=10.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,86:234:99:1981,0,3782 -chr25 29938702 . T C 3885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.087;DP=280;FS=0.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.635;QD=13.88;ReadPosRankSum=2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,88:279:99:3914,0,6556 -chr25 29938723 . A G 2284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=-0.282;DP=314;FS=6.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,95:312:99:2313,0,16209 -chr25 29938984 . G C 1157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=-2.110;DP=285;FS=1.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=4.06;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,62:282:99:1186,0,7927 -chr25 29939263 . T G 1465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-2.008;DP=226;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=6.49;ReadPosRankSum=2.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,62:226:99:1494,0,6089 -chr25 30028798 . T C 3027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.927;DP=266;FS=2.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=11.38;ReadPosRankSum=-2.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,94:265:99:3056,0,5919 -chr25 30028916 . A G 2910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.914;DP=365;FS=1.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=7.97;ReadPosRankSum=2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:250,115:365:99:2939,0,9324 -chr25 30145858 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-3.231;DP=242;FS=1.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,51:241:99:931,0,7339 -chr25 30303814 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=-0.176;DP=69;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:99:238,0,2194 -chr25 30695198 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=23.15;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:306,0,137 -chr25 30695352 . A T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:89:334,0,89 -chr25 30701498 . GT G 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.926;DP=45;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=7.26;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:364,0,645 -chr25 30701619 . CT C 1004.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.467;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.966;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1042,0,216 -chr25 31134846 . G A 4492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.621;DP=343;FS=0.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.924;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,149:341:99:5107,0,5792 -chr25 31211048 . C A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-1.079;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,29:162:99:420,0,5235 -chr25 31317045 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-0.621;DP=66;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:558,0,1804 -chr25 31317521 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.801;DP=82;FS=5.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:365,0,3294 -chr25 31320375 . T G 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=1.235;DP=62;FS=2.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:939,0,1161 -chr25 31321525 . C T 1037.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-0.444;DP=62;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,32:62:99:1066,0,1449 -chr25 31332689 . CA C 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.212;DP=37;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:385,0,166 -chr25 31333536 . GCTATGAAATGGATATAAAATAAACAATTGTAATAATTGTCAACATTTCATGGCAAATAACACAACGAGGAGCTGTAAAAATCAC G 13713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=1.070;DP=358;FS=6.701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.627;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,350:352:99:13751,1010,0 -chr25 31333723 . C A 5968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=-0.588;DP=379;FS=5.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,168:379:99:5997,0,7069 -chr25 31335700 . A G 6029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.272;DP=323;FS=2.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,183:322:99:6058,0,4743 -chr25 31340451 . G A 5904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=-0.622;DP=380;FS=0.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=15.54;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,168:380:99:5933,0,9346 -chr25 31346960 . A G 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-2.312;DP=443;FS=7.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:349,91:440:99:1427,0,13591 -chr25 31352777 . A T 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-1.387;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:410,0,452 -chr25 31352814 . AT A 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.470;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:75:440,0,75 -chr25 31362481 . T C 1319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=1.217;DP=92;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:1348,0,1689 -chr25 31380768 . A C 2026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=-1.825;DP=95;FS=0.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=21.33;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,60:95:99:2055,0,1203 -chr25 31381193 . G A 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-2.649;DP=71;FS=4.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:1102,0,1483 -chr25 31384026 . C A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=-1.176;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,19:79:99:435,0,2188 -chr25 31390569 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.506;DP=64;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:322,0,2218 -chr25 32090321 . T C 452.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=34.83;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:6:480,0,6 -chr25 32090372 . T C 1074.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.15;MQ0=0;QD=14.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:75:1103,75,0 -chr25 32090555 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:234,0,106 -chr25 32090676 . A G 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.064;DP=37;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=16.10;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:624,0,153 -chr25 32090855 . G A 3626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-1.780;DP=212;FS=2.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,51:151:99:3655,0,3581 -chr25 32090955 . A G 2478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-0.304;DP=97;FS=3.858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=25.55;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,50:57:35:2507,35,0 -chr25 32091006 . AT A 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.619;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:259,0,478 -chr25 32091058 . A T 2478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:2507,35,0 -chr25 32198097 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.988;DP=228;FS=0.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=1.27;ReadPosRankSum=2.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,34:228:99:317,0,7319 -chr25 32212685 . A T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr25 32232576 . G T 3267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-3.056;DP=200;FS=2.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=16.34;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,103:200:99:3296,0,3409 -chr25 32233207 . G A 1624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.448;DP=115;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=14.13;ReadPosRankSum=4.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,46:115:99:1653,0,2476 -chr25 32233233 . T G 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-1.367;DP=110;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=11.53;ReadPosRankSum=-3.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,38:110:99:1296,0,2555 -chr25 32233273 . T C 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=3.840;DP=108;FS=1.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,29:108:99:1136,0,6271 -chr25 32233279 . T A 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=4.278;DP=118;FS=9.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,40:118:99:1133,0,6271 -chr25 32233435 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=3.590;DP=136;FS=30.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,25:136:99:422,0,4350 -chr25 32233725 . T A 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.613;ClippingRankSum=-5.994;DP=121;FS=1.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=10.24;ReadPosRankSum=-2.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,37:121:99:1267,0,10377 -chr25 32233814 . C T 5075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=-1.670;DP=207;FS=5.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,98:207:99:5104,0,3739 -chr25 32233825 . G A 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.832;DP=194;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,81:194:99:1842,0,11671 -chr25 32233969 . G C 4433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-0.911;DP=218;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,125:217:99:4462,0,5992 -chr25 32235031 . A T 2519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.155;DP=140;FS=10.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,77:140:99:2548,0,2548 -chr25 32236944 . C T 3369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.907;DP=141;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,93:141:99:3398,0,1733 -chr25 32237099 . T C 2668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.035;DP=152;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,82:151:99:2697,0,2324 -chr25 32237330 . A T 3200.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-1.858;DP=167;FS=1.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,101:167:99:3228,0,2129 -chr25 32258684 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=2.202;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=16.98;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:266,0,273 -chr25 32262569 . T A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr25 32262679 . T C 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.195;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=28.07;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:99:786,0,99 -chr25 32262728 . C A 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.307;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.672;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:39:894,0,39 -chr25 32265381 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=-0.409;DP=59;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:382,0,1665 -chr25 32266104 . G T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=-1.644;DP=37;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:500,0,806 -chr25 32275163 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=19.81;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:266,0,263 -chr25 32400429 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=-1.149;DP=30;FS=6.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.915;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:262,0,1670 -chr25 32400439 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.049;DP=28;FS=6.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.35;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:262,0,1670 -chr25 32400524 . C T 561.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.373;DP=17;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.820;QD=33.05;ReadPosRankSum=2.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:23:590,0,23 -chr25 32400873 . A T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr25 32401712 . G GA 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=3.079;DP=25;FS=6.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=8.99;ReadPosRankSum=-2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:262,0,343 -chr25 32411641 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=2.036;DP=126;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,21:126:99:277,0,5737 -chr25 32457924 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.180;DP=49;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:232,0,1471 -chr25 32467958 . C G 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 -chr25 32468050 . A G 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr25 32470272 . G T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-1.610;DP=98;FS=2.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:424,0,2834 -chr25 32475759 . T A 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.289;DP=114;FS=5.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,30:113:99:729,0,3123 -chr25 32531303 . G T 2809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=1.282;DP=172;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,80:172:99:2838,0,2961 -chr25 32549838 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=1.039;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,48:117:99:1679,0,2303 -chr25 32549943 . G A 3805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.466;DP=206;FS=4.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=18.47;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,115:205:99:3834,0,3220 -chr25 32550065 . CGTAAGTTTTGCCTTTGCTCAAGATGTGGCTGACCATTAGTGTAATGTTCTCATGAGAATAACCCCTTTGAATCTGTTCACTTTTTAAAG C,CTGTGGCTGACCATTAGTGTAATGTTCTCATGAGAATAACCCCTTTGAATCTGTTCACTTTTTAAAG 6235.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=1.579;DP=223;FS=2.999;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=27.96;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,151,67:220:99:7450,1422,1856,4925,0,6139 -chr25 32550091 . TGGCTGACCATTAGTGTAATGTTCTCATGAGAATAACCCCTTTGAATCTGTTCACTTTTTAAAGTGC T 1781.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=1.464;DP=233;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.398;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,71:233:99:1819,0,7088 -chr25 32550530 . G T 4772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-0.819;DP=190;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,130:189:99:4801,0,1476 -chr25 32556088 . A G 4408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.312;DP=241;FS=5.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,123:240:99:4437,0,4215 -chr25 32556200 . CGTAAGACGCACTCAGAAAATATCCTTGAGATCAGTTGTTTGGGTGATCACTTTTTTAAACTCTTCCTTAATGTGGCTCTCCAG C 920.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=2.973;DP=271;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=3.40;ReadPosRankSum=-2.980 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,252:257:50:10470,50,0 -chr25 32559077 . G A 1310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=-1.370;DP=180;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,56:179:99:1339,0,7672 -chr25 32607003 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.168;DP=93;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=2.22;ReadPosRankSum=-1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:235,0,3030 -chr25 32640800 . T A 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=1.079;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:1042,0,1184 -chr25 32643910 . C T 1215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-0.237;DP=74;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,36:73:99:1244,0,1287 -chr25 32644227 . T A 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.248;DP=61;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.536;QD=17.39;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1089,0,1035 -chr25 32680851 . TCTACAGGGGAAATGCAGACTTGCAGTTTCCGTGTGATTGTATTATTTTGAATGCTCACAGCTGAGTAACTGCAGACTTAC T 1201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.136;DP=37;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=32.48;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1239,0,3935 -chr25 32741648 . G T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.416;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:494,0,341 -chr25 32810359 . G T 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=-0.005;DP=81;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:1429,0,2776 -chr25 32810360 . T A 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.851;DP=78;FS=0.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,37:78:99:1429,0,2737 -chr25 32810682 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=3.999;DP=42;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=7.47;ReadPosRankSum=-2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:342,0,1067 -chr25 32810864 . T A 1483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.052;DP=86;FS=2.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,47:86:99:1512,0,2163 -chr25 32812807 . TA T 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.869;DP=53;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,26:52:99:655,0,650 -chr25 32813715 . A G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=29.53;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:294,0,50 -chr25 32815302 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.903;DP=50;FS=3.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.74;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,24:50:99:865,0,860 -chr25 32815679 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=-2.596;DP=29;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=17.23;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:528,0,489 -chr25 32852916 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=2.211;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:245,0,1168 -chr25 32879113 . A G 1965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=-3.404;DP=307;FS=7.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,83:305:99:1994,0,8510 -chr25 32882963 . A C 2081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.288;DP=346;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,91:345:99:2110,0,11998 -chr25 33233476 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.292;DP=79;FS=5.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:305,0,2309 -chr25 33240884 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.650;DP=39;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=11.76;ReadPosRankSum=-1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:487,0,788 -chr25 33248672 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.691;DP=56;FS=14.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:356,0,1618 -chr25 33251590 . G A 1429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=-0.559;DP=191;FS=1.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,57:191:99:1458,0,4956 -chr25 33257663 . G A 853.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=1.661;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,38:148:99:882,0,4227 -chr25 33270701 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.289;DP=82;FS=6.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:530,0,2119 -chr25 33298631 . ACTGAATCATTGACGGACATTATTAATGGCACTCTCAAGATCCATTCCACTCTTAGTCAATGACATGCTCTTATGAAAGAAATCAAATAAACTTGAAGTGTTTACAAAC A 1847.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.465;DP=65;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=28.43;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,53:65:99:1885,0,941 -chr25 33299849 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-0.383;DP=70;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.100;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:430,0,1898 -chr25 33307228 . G T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-2.774;DP=52;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=13.50;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:730,0,2150 -chr25 33315699 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=1.318;DP=52;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=11.05;ReadPosRankSum=2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:603,0,1170 -chr25 33326071 . T A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.439;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=20.46;ReadPosRankSum=2.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:376,0,234 -chr25 33345110 . C CT 3208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-2.879;DP=232;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,133:207:99:3246,0,1735 -chr25 33347522 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-2.443;DP=227;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=3.33;ReadPosRankSum=2.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,44:220:99:784,0,6931 -chr25 33347532 . TCCTAAAAACAAACAAACATTAAATGAAAAAACGTTTCAACCAATACAGCATTTTATATTCAAATATATTATAATAGCACAACATAATCAGTTTA T 6629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=1.814;DP=227;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=29.21;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,188:192:99:6667,550,0 -chr25 33371965 . C T 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.208;DP=35;FS=1.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=26.94;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,26:35:99:971,0,242 -chr25 33492467 . G C 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=1.138;DP=227;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,55:227:99:1217,0,6522 -chr25 33497426 . A AT 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.748;DP=68;FS=5.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:590,0,967 -chr25 33497971 . C CT,CTT 1225.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-0.845;DP=109;FS=4.666;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:17,56,21:94:99:1930,218,318,1119,0,1505 -chr25 33498338 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=1.776;DP=33;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.783;QD=9.21;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:332,0,876 -chr25 33548371 . C A 305.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=30.52;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:333,0,10 -chr25 33721965 . CT C 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.713;DP=35;FS=9.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=14.71;ReadPosRankSum=2.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:50:552,0,50 -chr25 33770934 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr25 33770937 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:245,18,0 -chr25 34062433 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:234,0,296 -chr25 34827066 . G A 3884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-1.693;DP=209;FS=4.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,116:209:99:3913,0,3610 -chr25 35022016 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,287 -chr25 35034592 . G C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=1.222;DP=14;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:293,0,209 -chr25 35037434 . C A 953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:982,69,0 -chr25 35038627 . G C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.520;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:509,0,673 -chr25 35055011 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=-0.407;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=5.48;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:286,0,1217 -chr25 35065347 . C T 2482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.167;ClippingRankSum=-0.869;DP=433;FS=6.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:312,118:430:99:2511,0,11767 -chr25 35069056 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=-0.264;DP=272;FS=1.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,54:272:99:927,0,11235 -chr25 35073858 . G T 4361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.323;DP=298;FS=0.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=14.64;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,130:298:99:4390,0,5713 -chr25 35090215 . C T 420.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:449,33,0 -chr25 35090353 . C G 724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:753,54,0 -chr25 35093195 . A T 1727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.836;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=23.85;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1756,123,0 -chr25 35093233 . G A 1769.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1798,129,0 -chr25 35093379 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.598;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=33.25;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:28:660,0,28 -chr25 35201358 . T G 352.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:29:459,29,0 -chr25 35201488 . G A 753.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:782,57,0 -chr25 35202800 . G GT 357.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.954;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.31;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:395,0,225 -chr25 35328589 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-2.354;DP=66;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:433,0,1744 -chr25 35328652 . C T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.453;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:621,0,1943 -chr25 35331839 . T C 3515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3544,249,0 -chr25 35331845 . G A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.060;DP=83;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=19.29;ReadPosRankSum=-0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,50:83:99:1629,0,1124 -chr25 35334538 . T C 1783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=-1.946;DP=64;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.946;QD=27.87;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,48:64:99:1812,0,347 -chr25 35335055 . G A 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-0.173;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=18.55;ReadPosRankSum=1.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,33:58:99:1104,0,898 -chr25 35335100 . C G 2469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2498,178,0 -chr25 35335247 . T C 2485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2514,181,0 -chr25 35341852 . T A 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=1.069;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:338,0,1613 -chr25 35342543 . A AT 309.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=20.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:35:347,35,0 -chr25 35342901 . G A 630.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=1.396;DP=12;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:46:659,46,0 -chr25 35342916 . A T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:27:340,27,0 -chr25 35344098 . A AT 808.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.849;DP=29;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.723;QD=27.89;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:846,0,397 -chr25 35344779 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-0.755;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:233,0,2257 -chr25 35458879 . G A 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:264,21,0 -chr25 35458930 . GT G 1010.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.852;DP=43;FS=4.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.497;QD=23.51;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,38:43:44:1048,44,0 -chr25 35462597 . G A 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=-0.266;DP=252;FS=6.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,55:252:99:988,0,7696 -chr25 35465382 . C T 2928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=-1.967;DP=315;FS=3.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.30;ReadPosRankSum=2.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,110:314:99:2957,0,15512 -chr25 35466954 . C T 1524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.247;DP=237;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=6.43;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,71:237:99:1553,0,8809 -chr25 35470141 . G A 1456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-1.104;DP=193;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.611;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,60:193:99:1485,0,4877 -chr25 35471661 . C G 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-2.086;DP=139;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.590;QD=6.45;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,38:139:99:925,0,3614 -chr25 35471879 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-4.012;DP=114;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.88;ReadPosRankSum=3.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,30:114:99:812,0,7803 -chr25 35511812 . A G 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=2.161;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,32:87:99:1088,0,1888 -chr25 35514092 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.263;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:347,0,464 -chr25 35520340 . C A 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.219;DP=40;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:592,0,753 -chr25 35662984 . A T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.769;DP=31;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:511,0,644 -chr25 35663194 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.311;DP=26;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:395,0,466 -chr25 35663320 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-1.289;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:670,0,740 -chr25 35663606 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.934;DP=64;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:230,0,2772 -chr25 35664759 . A G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.319;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:622,0,689 -chr25 35665247 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.010;DP=53;FS=13.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.229;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:482,0,1467 -chr25 35666638 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.136;DP=39;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:430,0,813 -chr25 35666853 . CG C 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=-1.903;DP=56;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:270,0,1382 -chr25 35669018 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=-2.788;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=12.37;ReadPosRankSum=3.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:288,0,507 -chr25 35669038 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:266,0,465 -chr25 35669419 . T G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.079;DP=42;FS=4.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:382,0,1961 -chr25 35669516 . A T 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.650;DP=54;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:876,0,1510 -chr25 35669825 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.62;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:266,0,469 -chr25 35671134 . CTT C 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:263,0,428 -chr25 35672452 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.373;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:461,0,801 -chr25 35694920 . T C 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=1.711;DP=54;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=11.20;ReadPosRankSum=-1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:633,0,1184 -chr25 35695386 . A G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=1.269;DP=47;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:731,0,1100 -chr25 35764075 . G A 1876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=-0.186;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.160;QD=12.03;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,59:156:99:1905,0,3247 -chr25 35765559 . C T 678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-2.327;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,28:94:99:707,0,2433 -chr25 35765775 . C T 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=-3.213;DP=131;FS=2.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,38:131:99:969,0,3381 -chr25 35771299 . GACCTGAAACACACACCACAAAACAAAAACACGAGCAGATTCAACAAACTCCCAATCAAAATTGAAACCGATTTGAGTCAAAGGGGAGCTAATAAGTAAAAAACAGCTCAGCTCTTATTAAACAGGTGTATAAGTTT G 7758.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.736;DP=192;FS=2.047;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=29.20;ReadPosRankSum=-0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,180:184:99:7796,557,0 -chr25 35773803 . C T 1496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.800;DP=204;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,57:183:99:1525,0,4770 -chr25 35782213 . G A 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.864;DP=145;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=14.71;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,63:145:99:2161,0,2635 -chr25 35782282 . G C 1562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.607;DP=151;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,51:150:99:1591,0,3380 -chr25 35792045 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=-0.346;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:294,0,654 -chr25 35793458 . T A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=-0.444;DP=71;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=3.50;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,15:71:99:277,0,2095 -chr25 35795410 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:233,0,99 -chr25 35815217 . C T 1567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=1.103;DP=113;FS=1.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,49:112:99:1596,0,2099 -chr25 35839308 . G T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-1.099;DP=15;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:247,0,297 -chr25 35857983 . C T 1765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.670;DP=146;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.985;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,52:145:99:1794,0,3193 -chr25 35860651 . G T 1678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.119;DP=151;FS=4.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,53:151:99:1707,0,4414 -chr25 35860657 . C T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=-1.106;DP=153;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=3.01;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,29:153:99:488,0,6808 -chr25 35865294 . C T 1307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.824;DP=193;FS=4.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=6.78;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,59:193:99:1336,0,6873 -chr25 35865494 . T TTA 1166.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.635;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,34:64:99:1204,0,2252 -chr25 35865627 . AT A 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:14:240,0,14 -chr25 35865685 . C T 2379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-1.204;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=28.02;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:2408,0,342 -chr25 35865747 . C A 1248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=1.769;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.963;QD=16.22;ReadPosRankSum=-3.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1277,0,2304 -chr25 35865782 . C A 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=-0.158;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:67:99:1114,0,1875 -chr25 35866607 . C T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-2.266;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:373,0,266 -chr25 35866838 . C T 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.283;DP=68;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=15.36;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,31:68:99:1073,0,1273 -chr25 35885190 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.115;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=18.15;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:373,0,263 -chr25 35909119 . A G 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.984;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:304,0,497 -chr25 35909598 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.888;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:267,0,2899 -chr25 35933742 . T C 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=1.410;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:547,0,183 -chr25 35934216 . C G 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=-1.801;DP=35;FS=4.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=20.08;ReadPosRankSum=2.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:731,0,446 -chr25 35990888 . C A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.098;DP=49;FS=6.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:339,0,1154 -chr25 35992984 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=1.763;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:562,0,732 -chr25 35995188 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=-0.213;DP=47;FS=4.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:495,0,1067 -chr25 35997687 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.618;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:314,0,314 -chr25 35997849 . A T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.365;DP=40;FS=4.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:747,0,793 -chr25 35999494 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.151;DP=47;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:379,0,2222 -chr25 36000232 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.634;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:249,0,444 -chr25 36001095 . A AC 645.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-1.218;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=22.27;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:683,0,1000 -chr25 36001115 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=1.313;DP=38;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=8.05;ReadPosRankSum=-1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:334,0,2102 -chr25 36001455 . A T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:284,0,416 -chr25 36001636 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.344;DP=54;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:696,0,2555 -chr25 36001637 . C T 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.326;DP=54;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,19:54:99:696,0,2559 -chr25 36001749 . CT C 589.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.451;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=1.853;QD=19.03;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:17:649,17,0 -chr25 36003865 . AGTGAGTCTGAGTGTTTTCTCAGCGTCTGCAGGTGCCGCAGTGAATGAAGGATGTTCTTCTCTCCCACAG A 1080.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=2.137;DP=40;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=27.02;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,27:40:99:1118,0,4654 -chr25 36013214 . A AG 683.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-0.478;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.937;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:721,0,703 -chr25 36014733 . T G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.156;DP=14;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:429,0,220 -chr25 36014853 . C CT 676.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=-1.793;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,34:38:15:859,15,0 -chr25 36015296 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=28.68;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:315,0,165 -chr25 36015299 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.07;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:315,0,165 -chr25 36092295 . C A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.244;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:577,0,420 -chr25 36092440 . AAAGGTACGGTTAAAAAATAAAATATTAGCAGTTTTATGCGATTATTTTTTAAACCGTAAATCAATTAAATATTGTCTGTGTTTGTCACCC A 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.203;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.737;QD=25.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:528,0,681 -chr25 36104864 . C CA 2868.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2906,194,0 -chr25 36105754 . A G 5192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-5.998;DP=187;FS=30.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=27.77;ReadPosRankSum=0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,149:186:99:5221,0,670 -chr25 36110014 . T C 2956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=5.547;DP=132;FS=26.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=22.40;ReadPosRankSum=-5.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,86:131:99:2985,0,2793 -chr25 36110023 . A C 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.896;ClippingRankSum=-5.533;DP=111;FS=14.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=4.23;ReadPosRankSum=6.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,24:110:99:498,0,3208 -chr25 36110102 . G A 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.142;DP=60;FS=7.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1165,0,978 -chr25 36110714 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-1.517;DP=27;FS=3.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:604,0,298 -chr25 36111097 . T C 5916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.919;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=28.41;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:99:5945,431,0 -chr25 36112454 . C T 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=1.147;DP=108;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=11.47;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,37:106:99:1267,0,2366 -chr25 36112470 . A T 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=-2.176;DP=176;FS=9.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,47:174:99:1184,0,4900 -chr25 36112482 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=2.339;DP=223;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.365;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,33:221:99:280,0,9166 -chr25 36113515 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=3.532;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=12.32;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:324,0,351 -chr25 36113519 . A G 780.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:809,54,0 -chr25 36113713 . C G 7628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=251;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,184:184:99:7657,556,0 -chr25 36113744 . TA T 1159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=1.071;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=32.21;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:99:1197,214,0 -chr25 36113746 . TATATATATATATATATATATATATATATATATATA T 659.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=-2.597;DP=44;FS=20.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.99;ReadPosRankSum=-2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,19:28:63:916,63,0 -chr25 36113871 . G T 3160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=-0.345;DP=178;FS=12.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=17.76;ReadPosRankSum=2.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,86:172:99:3189,0,3111 -chr25 36113963 . T TA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.411;DP=197;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,33:164:99:258,0,5991 -chr25 36117595 . T C 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-2.852;DP=179;FS=2.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=3.66;ReadPosRankSum=-1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,49:176:99:683,0,12338 -chr25 36118059 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.832;DP=59;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=4.42;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:289,0,1759 -chr25 36118554 . TA T 2501.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-2.029;DP=114;FS=6.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,44:110:99:2539,0,3781 -chr25 36118608 . G A 1354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.230;DP=155;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=8.74;ReadPosRankSum=3.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,60:155:99:1383,0,8558 -chr25 36119194 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=-4.846;DP=363;FS=15.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,66:362:99:965,0,13632 -chr25 36119630 . A C 3227.04 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=-0.840;DP=94;FS=2.981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.355;QD=34.33;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,84:94:15:3255,15,0 -chr25 36120541 . A G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.240;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=20.83;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,23:28:99:674,0,370 -chr25 36120571 . T TA 519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.271;DP=45;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:557,0,772 -chr25 36120911 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.095;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:640,0,737 -chr25 36122111 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=5.775;DP=203;FS=33.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=1.85;ReadPosRankSum=-5.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,15:203:99:403,0,18152 -chr25 36122135 . T A 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=3.576;DP=179;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=7.22;ReadPosRankSum=-2.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,45:179:99:1321,0,12180 -chr25 36122148 . G A 1284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=5.163;DP=180;FS=21.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=7.14;ReadPosRankSum=-1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,50:180:99:1313,0,12180 -chr25 36122252 . T C 8135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.524;ClippingRankSum=-8.248;DP=275;FS=24.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=29.58;ReadPosRankSum=3.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,166:274:99:8164,0,7399 -chr25 36122460 . CA C 2381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.641;ClippingRankSum=-3.199;DP=170;FS=155.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=14.01;ReadPosRankSum=5.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,90:161:99:2419,0,3977 -chr25 36122526 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.057;ClippingRankSum=-4.359;DP=239;FS=10.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=1.86;ReadPosRankSum=8.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,43:239:99:472,0,16326 -chr25 36123414 . C A 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.230;DP=320;FS=8.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,70:318:99:1069,0,13583 -chr25 36123489 . A G 4426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.522;DP=354;FS=10.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,134:351:99:4455,0,9736 -chr25 36123775 . T G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=2.016;DP=239;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,41:239:99:541,0,8150 -chr25 36123886 . T C 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=2.542;DP=158;FS=2.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=3.22;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,32:158:99:537,0,8939 -chr25 36123911 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=2.554;DP=87;FS=4.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.37;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=3.24;ReadPosRankSum=-2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,6:87:99:310,0,9702 -chr25 36124008 . G A 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.134;DP=112;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=12.49;ReadPosRankSum=3.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,39:112:99:1427,0,5411 -chr25 36124279 . G GA 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=-2.018;DP=103;FS=7.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=3.68;ReadPosRankSum=2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,31:102:99:416,0,2511 -chr25 36124340 . AT A 231.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=-0.797;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=1.58;ReadPosRankSum=2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,31:134:99:269,0,6887 -chr25 36125414 . C A 2302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2331,166,0 -chr25 36126890 . A AT 1155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-3.088;DP=47;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=-2.438;QD=24.59;ReadPosRankSum=2.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,40:45:99:1193,0,158 -chr25 36128355 . C T 3409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=-7.606;DP=319;FS=5.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,116:304:99:3438,0,5715 -chr25 36130064 . C CA 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DP=27;FS=6.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=11.77;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:42:381,0,42 -chr25 36133674 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:289,0,664 -chr25 36135244 . GCTGCAAAACACATCATTCAGTTAAGGCTTTTGACAAAAATCTTAAAAACACACACAATCCCAGAAATACACAAAC G 2088.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-0.383;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=25.79;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,57:80:99:2126,0,4354 -chr25 36135386 . T G 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.664;DP=76;FS=6.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.373;QD=7.96;ReadPosRankSum=-2.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,24:74:99:633,0,2132 -chr25 36135441 . CCCTGCACAGAAAACCATTTAAAATGTCAAGATATACTTTCTGAATGTGTAGAAAGTGAACAGAGAAACTCA C 3802.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=-1.426;DP=104;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=35.58;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,88:98:99:3840,0,250 -chr25 36137933 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.901;DP=120;FS=0.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.768;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,26:120:99:515,0,3616 -chr25 36157683 . CAA C 664.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.456;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=34.99;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17:702,17,0 -chr25 36158210 . G GT 2201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=-1.141;DP=309;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,97:293:99:2239,0,4900 -chr25 36159479 . G C 3437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=1.533;DP=309;FS=10.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=11.13;ReadPosRankSum=1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,106:308:99:3466,0,6655 -chr25 36160036 . C T 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-1.240;DP=71;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,34:70:99:1233,0,1840 -chr25 36160320 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-0.682;DP=42;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=15.28;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:670,0,619 -chr25 36160567 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=1.116;DP=46;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=2.072;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:343,0,2040 -chr25 36160598 . G GT 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-1.040;DP=41;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=1.865;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:434,0,434 -chr25 36162494 . G A 6221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-1.360;DP=370;FS=1.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,178:369:99:6250,0,5990 -chr25 36162551 . A C 6109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=-1.756;DP=348;FS=6.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.946;QD=17.56;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,170:346:99:6138,0,6526 -chr25 36163229 . A G 2739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,0:22:99:2768,0,4294 -chr25 36163322 . A G 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.572;DP=172;FS=19.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,58:172:99:985,0,11385 -chr25 36163367 . G A 4025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=5.783;DP=258;FS=0.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,120:258:99:4054,0,8822 -chr25 36163880 . G GT 764.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-1.032;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=7.21;ReadPosRankSum=0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,52:100:99:1069,0,756 -chr25 36164087 . A T 6072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=-2.927;DP=253;FS=12.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=24.00;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,161:242:99:6101,0,2301 -chr25 36164301 . A G 4699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.194;DP=64;FS=9.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=34.45;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:4728,0,7659 -chr25 36164303 . T C 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-0.598;DP=60;FS=10.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:4730,0,7563 -chr25 36165165 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.311;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.999;QD=19.54;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:380,0,305 -chr25 36165388 . ACT A 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.893;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:299,0,415 -chr25 36166985 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=-1.526;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=23.19;ReadPosRankSum=2.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:492,0,763 -chr25 36167198 . A G 1504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,38:38:99:1533,0,343 -chr25 36167211 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.651;DP=23;FS=3.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:425,0,857 -chr25 36167289 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=3.971;DP=51;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=9.51;ReadPosRankSum=-2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,21:51:99:513,0,1657 -chr25 36167445 . G T 2388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.677;DP=123;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=19.42;ReadPosRankSum=-3.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,75:123:99:2417,0,1587 -chr25 36167761 . T C 422.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=32.52;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:450,0,6 -chr25 36168607 . T C 243.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:272,0,21 -chr25 36169814 . C CA 1103.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1141,107,0 -chr25 36170026 . C T 2116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.172;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,62:139:99:2145,0,4253 -chr25 36170155 . A G 2729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=6.813;DP=159;FS=26.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.233;QD=17.17;ReadPosRankSum=-3.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,71:159:99:2758,0,3052 -chr25 36170221 . G A 1526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=5.425;DP=120;FS=10.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=12.72;ReadPosRankSum=4.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,54:120:99:1555,0,3184 -chr25 36173095 . G T 1477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.313;DP=106;FS=7.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.566;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:1506,0,2233 -chr25 36173112 . C G 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=1.501;DP=123;FS=1.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,59:123:99:2096,0,2737 -chr25 36181559 . G A 5133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=0.180;DP=192;FS=9.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=26.74;ReadPosRankSum=4.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,91:190:99:5162,0,10423 -chr25 36182837 . T C 7928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-4.787;DP=252;FS=8.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,169:251:99:7957,0,1928 -chr25 36188668 . C T 4243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.414;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.691;QD=21.33;ReadPosRankSum=4.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,130:198:99:4272,0,2114 -chr25 36188758 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=-3.862;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1326,0,362 -chr25 36192013 . A C 6394.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=2.193;DP=166;FS=4.421;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=34.95;ReadPosRankSum=3.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,151:156:99:6432,486,0 -chr25 36192141 . G A 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:577,45,0 -chr25 36193472 . G A 2393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=-0.333;DP=391;FS=17.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.565;QD=6.12;ReadPosRankSum=3.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:286,105:391:99:2422,0,12221 -chr25 36193697 . C T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=-0.507;DP=290;FS=12.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,58:290:99:901,0,15060 -chr25 36193919 . G C 2142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=-0.182;DP=129;FS=22.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.095;QD=16.61;ReadPosRankSum=9.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:128:99:2171,0,2662 -chr25 36193990 . A ATT 936.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.772;DP=136;FS=16.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=6.89;ReadPosRankSum=5.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,43:136:99:974,0,6490 -chr25 36194912 . C T 6207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.428;DP=207;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,107:206:99:6236,0,3193 -chr25 36194945 . C T 2517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=-0.952;DP=139;FS=6.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,74:139:99:2546,0,5572 -chr25 36195228 . CGA C 1122.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.397;DP=80;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=14.03;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,37:67:99:1160,0,2033 -chr25 36196160 . C A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.179;DP=24;FS=6.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=12.12;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:319,0,711 -chr25 36197280 . A G 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=7.433;DP=248;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=1.26;ReadPosRankSum=-6.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,42:248:99:349,0,15883 -chr25 36197304 . C G 2514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=9.851;DP=256;FS=4.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.82;ReadPosRankSum=-7.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,61:256:99:2543,0,7532 -chr25 36197953 . T TA 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=14;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.27;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:311,0,100 -chr25 36198956 . T TA 623.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;QD=16.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:83:788,83,0 -chr25 36199501 . C A 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.778;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:561,0,638 -chr25 36199729 . T TA 2246.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2284,162,0 -chr25 36202472 . TTA T 310.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.635;DP=17;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=18.28;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:348,0,505 -chr25 36202617 . T TTG 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.933;DP=67;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,12:60:99:249,0,2159 -chr25 36202740 . TG T 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.663;DP=149;FS=4.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=1.53;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,24:148:99:265,0,4589 -chr25 36206821 . T TG 1007.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=-1.690;DP=220;FS=6.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,63:212:99:1045,0,9720 -chr25 36206905 . A G 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=-2.718;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:1320,0,2082 -chr25 36206991 . A G 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1042,78,0 -chr25 36207058 . T G 1953.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=1.662;DP=49;FS=9.912;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1982,141,0 -chr25 36212113 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=5.651;DP=108;FS=3.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.60;ReadPosRankSum=-3.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:309,0,3004 -chr25 36212947 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-1.492;DP=59;FS=4.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:357,0,1666 -chr25 36213212 . A G 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=2.806;DP=115;FS=5.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.942;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,26:114:99:389,0,10439 -chr25 36213224 . A G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=3.154;DP=106;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:379,0,10439 -chr25 36213308 . G A 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=-0.141;DP=89;FS=1.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,32:89:99:566,0,6981 -chr25 36213951 . CT C 259.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.121;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:297,0,1102 -chr25 36214479 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.676;ClippingRankSum=0.006;DP=75;FS=13.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:393,0,4743 -chr25 36214720 . A G 5198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.471;DP=314;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.195;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,152:312:99:5227,0,5100 -chr25 36216998 . C T 7556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-0.328;DP=104;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=32.31;ReadPosRankSum=-4.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,47:103:99:7585,0,1045 -chr25 36217166 . G C 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-3.280;DP=376;FS=6.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=4.17;ReadPosRankSum=-3.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,92:376:99:1597,0,15097 -chr25 36217271 . T C 1140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=-1.851;DP=316;FS=3.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,67:314:99:1169,0,9346 -chr25 36217450 . C G 1646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,36:36:99:1675,0,199 -chr25 36217916 . GTT G 3286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=1.042;DP=166;FS=3.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.430;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,86:159:99:3324,0,3765 -chr25 36278763 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.843;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:436,0,440 -chr25 36297567 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.429;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:356,0,396 -chr25 36306793 . G C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.774;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=24.14;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:342,0,136 -chr25 36307733 . AT A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.311;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:49:295,0,49 -chr25 36307766 . T G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.462;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=13.37;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:309,0,702 -chr25 36309437 . C A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.431;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:320,0,923 -chr25 36332717 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=1.092;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=20.37;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:293,0,180 -chr25 36333649 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=1.256;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:294,0,166 -chr25 36334991 . GT G 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-1.386;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=11.17;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:283,0,219 -chr25 36335817 . A T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=1.927;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:270,0,258 -chr25 36336660 . TAA T 350.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.92;MQ0=0;QD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:31:388,31,0 -chr25 36336737 . A C 208.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:237,0,19 -chr25 36400565 . C A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.892;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=19.20;ReadPosRankSum=-1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:297,0,225 -chr25 36405148 . TCCTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGAGAGAGTGAACACAGACAGCAGCTCACACTGTTTCCCATCAGCCACTGCACTCA T 5295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-5.058;DP=320;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,156:311:99:5333,0,8208 -chr25 36405727 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-0.643;DP=419;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:354,63:417:99:547,0,13491 -chr25 36655505 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=0.978;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:50:309,0,50 -chr25 36661031 . TTC T 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=3.751;DP=51;FS=8.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:589,0,1103 -chr25 36661077 . T TTA 398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-2.181;DP=52;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:436,0,1537 -chr25 36661870 . T G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.730;DP=39;FS=5.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:364,0,1662 -chr25 36661983 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-0.153;DP=43;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:298,0,1266 -chr25 36661999 . T C 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=1.620;DP=39;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=17.89;ReadPosRankSum=-2.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:726,0,704 -chr25 36668232 . G A 1400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=1.829;DP=69;FS=5.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=20.30;ReadPosRankSum=-1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,44:67:99:1429,0,737 -chr25 36707990 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-0.028;DP=40;FS=2.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:497,0,857 -chr25 36710035 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.549;DP=23;FS=7.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=8.99;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:235,0,504 -chr25 36710403 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:380,0,573 -chr25 36745701 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=22.70;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:346,0,186 -chr25 36749758 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=1.960;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=23.57;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:429,0,200 -chr25 36754456 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.163;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=21.74;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:376,0,200 -chr25 36757475 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=14.91;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:237,0,254 -chr25 36757758 . T G 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.636;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=24.61;ReadPosRankSum=-1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:742,0,245 -chr25 36812514 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=2.383;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=24.18;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:270,0,305 -chr25 36850319 . CA C 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.837;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:301,0,224 -chr25 37041833 . T A 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:1891,0,352 -chr25 37041916 . G A 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-2.187;DP=72;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=25.87;ReadPosRankSum=2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:40:99:1891,0,441 -chr25 37041957 . C T 1862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-2.784;DP=59;FS=6.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.175;QD=31.57;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1891,0,441 -chr25 37041978 . G C 1861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=-3.152;DP=62;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=30.03;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:1890,0,474 -chr25 37042126 . A AC 4297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=-1.316;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=35.46;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:4335,0,133 -chr25 37042130 . C T 4305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=-0.285;DP=91;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=31.16;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:99:4334,0,137 -chr25 37042241 . G T 4308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-1.175;DP=181;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,108:110:29:4337,0,29 -chr25 37099514 . GT G 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.283;DP=28;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:315,0,273 -chr25 37102880 . GCTGTTGGATGAAGTCATGATGCTTTTTAGTGAATCTGAACCTAAACAAGTTTTTTTACAGTAAAGATTTGCTCTTAC G 2861.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.703;DP=65;FS=7.406;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=32.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:2899,230,0 -chr25 37103532 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.739;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:364,0,1811 -chr25 37106364 . ACACCTGAGATAGGAGTGTCGTCTCCATTAATAAAACAATCTCATCAGCATCTTTAATACTGCTTTACACACAGACTGAAACT A 1928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.687;DP=58;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.782;QD=33.25;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,49:58:99:1966,0,324 -chr25 37109285 . TCCTGAGGGGAAATGGCAGATGAATATTTTAGATGTGATTCAGTGAATGTTTTTAGATATTATCTTGCGTTCAGTTCGCATTCAAGTACTGTAAATCA T 2104.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.173;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=34.94;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,48:50:99:2142,205,0 -chr25 37193902 . T G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.237;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:350,0,581 -chr25 37235551 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=1.727;DP=56;FS=17.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.73;ReadPosRankSum=-1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:237,0,2150 -chr25 37236079 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=1.861;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:503,0,899 -chr25 37278826 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=1.077;DP=34;FS=5.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:276,0,915 -chr25 37278841 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=1.657;DP=34;FS=8.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:318,0,874 -chr25 37293405 . G C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=2.034;DP=73;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:1207,0,1331 -chr25 37308439 . G A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.580;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.112;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:530,0,418 -chr25 37321769 . G A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.247;DP=52;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.071;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:650,0,1192 -chr25 37322013 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.929;DP=48;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:430,0,1224 -chr25 37332826 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-1.504;DP=110;FS=11.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,36:109:99:979,0,2728 -chr25 37335016 . A T 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.740;DP=169;FS=2.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,36:168:99:682,0,4934 -chr25 37341319 . C A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.426;DP=107;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,29:105:99:683,0,2821 -chr25 37344623 . G A 1604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=-0.113;DP=143;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,55:142:99:1633,0,2858 -chr25 37346996 . A G 6510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:160:99:6539,499,0 -chr25 37347080 . G A 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=-0.869;DP=190;FS=6.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,58:189:99:1487,0,4926 -chr25 37347119 . A G 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,21:21:48:781,0,48 -chr25 37348219 . G A 11140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.172;DP=210;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=36.38;ReadPosRankSum=2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,152:202:61:11169,0,61 -chr25 37348312 . T G 1329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=-2.284;DP=130;FS=40.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.644;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,53:130:99:1358,0,7237 -chr25 37349312 . T A 2111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=3.848;DP=29;FS=1.775;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.981;QD=26.15;ReadPosRankSum=-3.593 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,22:29:12:2139,12,0 -chr25 37349327 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-3.298;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=14.05;ReadPosRankSum=2.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,309 -chr25 37349372 . T G 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=2.297;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=31.30;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,30:32:99:1292,0,215 -chr25 37349414 . C T 2552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.885;ClippingRankSum=-6.116;DP=79;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=32.31;ReadPosRankSum=4.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,58:78:99:2581,0,326 -chr25 37349498 . C T 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=6.841;DP=84;FS=4.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=6.03;ReadPosRankSum=-6.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:535,0,2229 -chr25 37350643 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=1.587;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=9.34;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:327,0,1720 -chr25 37351068 . TA T 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:320,0,142 -chr25 37351776 . T C 1052.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:78:1081,78,0 -chr25 37351948 . C T 2067.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=-1.827;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=29.04;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:99:2096,156,0 -chr25 37351959 . T G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=-1.864;DP=42;FS=5.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.759;QD=7.97;ReadPosRankSum=-4.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:363,0,1284 -chr25 37351986 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;ClippingRankSum=-0.477;DP=83;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=6.59;ReadPosRankSum=3.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,25:80:99:575,0,3970 -chr25 37351995 . G A 1509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=-1.193;DP=95;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=15.89;ReadPosRankSum=2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,43:95:99:1538,0,2531 -chr25 37352110 . A T 379.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:29:435,29,0 -chr25 37358317 . C T 859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:888,60,0 -chr25 37358882 . C CG 329.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.386;DP=40;FS=1.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.15;MQ0=0;MQRankSum=3.702;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:367,0,1794 -chr25 37358888 . A G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.387;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=3.481;QD=8.07;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:359,0,1794 -chr25 37359218 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=-1.876;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,353 -chr25 37359257 . T C 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-2.502;DP=32;FS=24.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=25.31;ReadPosRankSum=-2.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:838,0,244 -chr25 37359348 . T C 3327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=-2.309;DP=166;FS=4.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=20.05;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,103:166:99:3356,0,2368 -chr25 37362547 . C T 1535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=3.463;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,50:133:99:1564,0,7802 -chr25 37362652 . G A 740.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-0.091;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:57:769,57,0 -chr25 37363898 . C T 25394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-4.929;DP=157;FS=9.202;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=27.14;ReadPosRankSum=2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,142:157:99:25423,1820,0 -chr25 37364189 . A G 2754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=-11.142;DP=230;FS=4.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=11.98;ReadPosRankSum=6.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,84:230:99:2783,0,5487 -chr25 37364654 . TA T 439.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.431;DP=41;FS=5.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.131;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:477,0,624 -chr25 37365399 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-0.027;DP=44;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=23.93;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:1081,0,862 -chr25 37366476 . T A 2511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=1.423;DP=80;FS=2.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=31.40;ReadPosRankSum=4.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,68:79:99:2540,0,100 -chr25 37366551 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr25 37373903 . C T 17591.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=-2.384;DP=289;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=27.04;ReadPosRankSum=2.944 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,282:286:99:17620,1270,0 -chr25 37374372 . A AT 388.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.73;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:426,42,0 -chr25 37375067 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=4.593;DP=34;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.063;QD=16.55;ReadPosRankSum=3.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,16:33:99:591,0,569 -chr25 37375076 . T C 1625.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1654,111,0 -chr25 37375079 . C T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=-5.196;DP=38;FS=10.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:685,0,567 -chr25 37375291 . T C 1264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1293,87,0 -chr25 37375293 . A T 1264.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1293,87,0 -chr25 37376618 . T A 12769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.833;ClippingRankSum=-12.289;DP=395;FS=5.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=32.33;ReadPosRankSum=6.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,140:393:99:12798,0,8147 -chr25 37376861 . C A 2436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:99:2465,181,0 -chr25 37376924 . C A 3934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=-1.593;DP=223;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.587;QD=17.64;ReadPosRankSum=2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,122:222:99:3963,0,5057 -chr25 37377074 . T C 7282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=3.468;DP=357;FS=12.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=20.40;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,219:356:99:7311,0,4622 -chr25 37377186 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=1.734;DP=14;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=31.63;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:46:471,0,46 -chr25 37378224 . T C 8778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=-1.517;DP=302;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.802;QD=29.07;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,231:301:99:8807,0,1256 -chr25 37378831 . CTG C 684.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:722,55,0 -chr25 37379001 . A C 979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=-0.098;DP=47;FS=7.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=20.85;ReadPosRankSum=-3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:1008,0,660 -chr25 37379240 . A G 299.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=29.97;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:327,0,6 -chr25 37379545 . T C 6327.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:141:99:6356,448,0 -chr25 37379668 . C T 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-10.054;DP=294;FS=68.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=3.67;ReadPosRankSum=-3.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,59:294:99:1107,0,9003 -chr25 37379743 . T C 1924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=-2.533;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=19.25;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,58:98:99:1953,0,1546 -chr25 37379756 . C T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.153;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:793,0,1137 -chr25 37379914 . C T 3143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=-2.498;DP=243;FS=10.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=12.94;ReadPosRankSum=4.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,89:243:99:3172,0,10081 -chr25 37379921 . C CT 3134.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.731;ClippingRankSum=-2.551;DP=238;FS=17.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=13.17;ReadPosRankSum=6.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,81:238:99:3172,0,10061 -chr25 37380083 . G T 313.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:7:341,0,7 -chr25 37380108 . TA T 670.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:68:708,68,0 -chr25 37381377 . G T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.925;DP=36;FS=1.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:477,0,766 -chr25 37382738 . G A 3883.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.350;DP=95;FS=4.219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.698;QD=28.57;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,93:95:99:3912,291,0 -chr25 37383222 . G A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr25 37383964 . C T 3489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=5.073;DP=305;FS=9.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,111:302:99:3518,0,7358 -chr25 37385319 . G A 15123.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=-2.816;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=32.00;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:99:15152,1064,0 -chr25 37385323 . T C 14776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:99:14805,1040,0 -chr25 37385340 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-1.159;DP=11;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:865,0,103 -chr25 37385355 . A G 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=32.53;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:865,0,103 -chr25 37385385 . T C 4939.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:103:99:4968,369,0 -chr25 37387021 . A G 5075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,124:124:99:5104,373,0 -chr25 37387387 . CTG C 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:499,42,0 -chr25 37387405 . CTCTT C 461.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:42:499,42,0 -chr25 37387446 . C G 479.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=34.22;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:11:507,11,0 -chr25 37387558 . T TC 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-4.179;DP=69;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=4.88;ReadPosRankSum=3.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:374,0,1453 -chr25 37387885 . T C 823.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.404;DP=22;FS=5.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=29.36;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:852,60,0 -chr25 37397151 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,257 -chr25 37397944 . GGA G 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.941;DP=38;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=32.28;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1264,0,226 -chr25 37398102 . A T 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-3.651;DP=60;FS=40.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,31:59:99:1026,0,1023 -chr25 37398279 . A G 2704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-1.562;DP=88;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,76:88:76:2733,0,76 -chr25 37399004 . G C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=1.189;DP=17;FS=10.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:493,0,126 -chr25 37399357 . C T 1200.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1229,96,0 -chr25 37399396 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=1.732;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=11.47;ReadPosRankSum=-2.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:292,0,426 -chr25 37399423 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.203;ClippingRankSum=-0.962;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.20;ReadPosRankSum=3.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:301,0,903 -chr25 37399450 . A G 1708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.085;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:99:1737,126,0 -chr25 37399486 . G A 894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.171;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.218;QD=33.14;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:33:923,0,33 -chr25 37401454 . T C 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.909;DP=71;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=22.22;ReadPosRankSum=-2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:71:99:1606,0,885 -chr25 37402198 . T TA 1814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-1.890;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=32.45;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:1852,0,1084 -chr25 37402208 . G A 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.334;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=28.50;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1852,0,1186 -chr25 37402370 . A C 9976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-2.243;DP=369;FS=5.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,269:366:99:10005,0,4656 -chr25 37403155 . T A 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:805,57,0 -chr25 37403862 . A G 1501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=-0.327;DP=212;FS=19.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.920;QD=7.08;ReadPosRankSum=-4.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,65:209:99:1530,0,6966 -chr25 37403907 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.472;ClippingRankSum=-4.545;DP=251;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=3.34;ReadPosRankSum=-3.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,55:251:99:867,0,10160 -chr25 37404944 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.204;DP=168;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=3.01;ReadPosRankSum=5.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,31:168:99:534,0,5560 -chr25 37405083 . AG A 786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=1.093;DP=124;FS=9.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=1.258;QD=6.34;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,36:124:99:824,0,3175 -chr25 37405120 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.464;DP=27;FS=11.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=17.99;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:514,0,421 -chr25 37405222 . G C 2292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=3.059;DP=71;FS=6.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=32.29;ReadPosRankSum=-1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,37:70:99:2321,0,2562 -chr25 37405396 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.667;ClippingRankSum=3.124;DP=176;FS=6.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=1.90;ReadPosRankSum=-5.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,46:174:99:363,0,12260 -chr25 37405420 . A T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-2.721;DP=102;FS=2.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=4.55;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,11:100:99:492,0,7278 -chr25 37405507 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-1.099;DP=36;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=24.99;ReadPosRankSum=2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:928,0,287 -chr25 37405552 . G C 1568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.671;DP=104;FS=5.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,46:104:99:1597,0,2089 -chr25 37405577 . G A 2708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=1.183;DP=175;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,81:174:99:2737,0,2949 -chr25 37458462 . TGTGAGCCAGACCTGCTTCTTTCATTCAGTTTTCTGCACAGCGTCACATGTTTGAGCACACTTACATTTAGTCATTTAGAAGACGCTTTCGTCCAAATCGACATTCATCGATTTACCAAGAGGAAATACACACAACAAATTTGTGCTTTGGTCCACAG T 2508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=3.390;DP=68;FS=3.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=35.22;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,61:68:99:2546,0,2250 -chr25 37461385 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=-1.280;DP=79;FS=1.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:327,0,5842 -chr25 37465124 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.902;DP=54;FS=7.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.870;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:301,0,1512 -chr25 37574970 . CG C 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=1.169;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:378,0,376 -chr25 38170321 . G GAT 227.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:265,17,0 -chr25 38253800 . C G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-3.035;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:354,0,666 -chr25 38255332 . CTG C 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=-0.184;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:323,0,547 -chr25 38259510 . AGTGAGTGTGTGCATGCATCAATGCTCCACTTATGTGTGGTGTTTTCTTCATCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCAG A 2075.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=2.311;DP=60;FS=5.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.656;QD=34.60;ReadPosRankSum=-3.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,50:60:99:2113,0,1436 -chr25 38259638 . C G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=1.032;DP=59;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:394,0,2034 -chr25 38263673 . C G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=2.704;DP=41;FS=12.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.163;QD=7.12;ReadPosRankSum=-2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:320,0,1142 -chr25 38305344 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.919;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=10.70;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:253,0,469 -chr25 38306323 . ATC A 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.09;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:70:246,0,70 -chr25 38328267 . T A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.440;DP=38;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:530,0,671 -chr25 38329013 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=-0.257;DP=45;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:432,0,2444 -chr25 38329021 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.148;DP=53;FS=4.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.721;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:412,0,2444 -chr25 38329479 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.475;DP=45;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:293,0,1203 -chr25 38333185 . T C 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-0.068;DP=77;FS=1.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,30:77:99:1004,0,1991 -chr25 38357515 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.073;DP=227;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,36:227:99:395,0,6930 -chr25 38363606 . GGGTGAGGAGAGCTTCAGAAACGGCAGCATCTTCATCATCATCATCATCACCCTCATCATTATTGTACTTCTCCATCCTCA G 10139.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.083;DP=270;FS=2.062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.75;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,250:253:99:10177,757,0 -chr25 38364752 . AAGGTAAAATCTGATCCAGGGTCAGCTCTGAGTGTGTCTGCAGTGTGTAGCAGTGGCATCTTTGAGCCTGTGTGTGTCTGTGTGTGC A 10588.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=-0.639;DP=257;FS=1.315;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=28.46;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,222:231:99:10626,1000,0 -chr25 38366898 . AGTGTGT A 232.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:34:270,34,0 -chr25 38367030 . AGT A 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=1.749;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:454,0,1580 -chr25 38368582 . CT C 891.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.955;DP=99;FS=6.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=9.01;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:929,0,1294 -chr25 38375466 . A G 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr25 38412812 . G C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=1.164;DP=20;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:29:582,0,29 -chr25 38414881 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.321;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,28:154:99:465,0,4670 -chr25 38435947 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-1.760;DP=78;FS=6.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:558,0,2048 -chr25 38436127 . G A 1408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.126;DP=107;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.251;QD=13.17;ReadPosRankSum=2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:106:99:1437,0,2065 -chr25 38439263 . T C 1694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.003;DP=113;FS=0.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=15.00;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,58:112:99:1723,0,1713 -chr25 38439879 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=-0.716;DP=132;FS=6.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=7.29;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,38:132:99:991,0,3485 -chr25 38440083 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.557;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:285,0,448 -chr25 38447143 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=2.224;DP=182;FS=1.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=3.49;ReadPosRankSum=-4.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,38:182:99:664,0,5448 -chr25 38448983 . GCGTGCGTGTA G 977.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-1.531;DP=17;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=31.37;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:1015,0,735 -chr25 38449000 . TTTGCACACATATTTTTGCGAGTATGTATGTGTGTGC T 981.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=-3.022;DP=25;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=27.86;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:1019,0,735 -chr25 38449244 . T A 512.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-1.736;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=27.82;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:540,6,0 -chr25 38450662 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.010;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:472,0,2716 -chr25 38450665 . C A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-0.208;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:472,0,2716 -chr25 38450863 . G A 1931.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-1.690;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=31.16;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,54:62:34:1960,0,34 -chr25 38452503 . G A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.621;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.091;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:420,0,862 -chr25 38452819 . TGTGC T 558.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:46:596,46,0 -chr25 38461722 . GGTCAGTAT G 715.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:56:753,56,0 -chr25 38467860 . CACACACACACAGGTGAGTCTGTCAGGTGATACGT C 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-0.667;DP=44;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.315;QD=7.13;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:351,0,1330 -chr25 38467869 . ACAGGTGAGTCTGTCAGGTGATACGTGCACACACACACACACACGCTGAGGTGGGTCTGTCAGTTGACCAATCGGCAATCATCTCTCTG A 495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.066;DP=41;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=12.09;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:533,0,1031 -chr25 38467903 . ACACACACACGCTGAGGTGGGTCTGTCAGTTGACCAATCGGCAATCATCTCTCTG A 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.334;DP=39;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:351,0,1331 -chr25 38484563 . G T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:314,0,278 -chr3 511325 . C G 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr3 555627 . T C 343.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6:371,0,6 -chr3 555679 . A G 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:499,36,0 -chr3 566388 . A G 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=3.059;DP=16;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=26.91;ReadPosRankSum=-1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:94:836,0,94 -chr3 566408 . A C 1323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:99:1352,99,0 -chr3 566423 . T A 1323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:99:1352,99,0 -chr3 566525 . G C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=2.228;DP=100;FS=17.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,23:100:99:454,0,3118 -chr3 566790 . A G 1334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1363,96,0 -chr3 567050 . T C 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr3 567257 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,153 -chr3 576967 . C A 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=-1.522;DP=46;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,25:46:99:869,0,695 -chr3 593443 . T C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr3 624219 . AACCTGACAATGAGCAACAGCATTAGTGGACATTGAATAGAGATATGCATGTGTGAATCCATTAAGTGAACCCAG A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.53;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:251,0,459 -chr3 641339 . C T 255.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:284,0,18 -chr3 651279 . G GA 277.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:315,21,0 -chr3 651444 . G GA 353.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:391,30,0 -chr3 699429 . C T 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:357,24,0 -chr3 716780 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=31.60;ReadPosRankSum=-1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:439,0,131 -chr3 716789 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=30.33;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:439,0,131 -chr3 719597 . G A 995.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1024,72,0 -chr3 733924 . ATCTC A 230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:268,21,0 -chr3 891248 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.74;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:312,0,59 -chr3 968817 . G A 1156.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1185,87,0 -chr3 989198 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.292;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=1.97;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,22:126:99:277,0,3781 -chr3 1002908 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr3 1019584 . A G 864.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=1.067;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:902,0,1137 -chr3 1777726 . C T 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr3 1777763 . C G 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:621,42,0 -chr3 1778687 . C G 313.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=31.39;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:342,0,15 -chr3 1783604 . T C 593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:622,45,0 -chr3 1787039 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.118;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.73;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:325,0,45 -chr3 1789546 . T G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:45:651,45,0 -chr3 1789550 . C G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:651,45,0 -chr3 1799799 . A G 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=1.734;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=32.55;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:484,0,131 -chr3 1799800 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=2.533;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:333,0,338 -chr3 1799977 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=1.091;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:334,0,354 -chr3 1800095 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=27.91;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:83:419,0,83 -chr3 1800320 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=1.022;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.352;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:352,0,399 -chr3 1808988 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=31.90;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:411,0,45 -chr3 1895639 . CAGCTCTACAGGGTACACACACACTTACACACACACATCGACCTATCGCAAACAAGCCAGCCTGA C 383.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=1.703;DP=128;FS=3.121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:119:99:421,178,0 -chr3 1907207 . C T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr3 1908001 . TGATCTTCAGACGTGACTATATATCAGTTTGAC T 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=-0.930;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:356,0,207 -chr3 1928784 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-2.520;DP=15;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=14.72;ReadPosRankSum=2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:249,0,280 -chr3 1928800 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-2.017;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.60;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:249,0,280 -chr3 1965111 . G A 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr3 1965406 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-3.559;DP=37;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:310,0,734 -chr3 2067625 . AGTGTGTGT A 209.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:247,19,0 -chr3 2097627 . TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACACACA T 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=3.888;DP=61;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=5.37;ReadPosRankSum=-3.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,49:59:99:399,0,659 -chr3 2134598 . C G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr3 2136845 . C G 297.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:22:326,22,0 -chr3 2305233 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=1.473;DP=24;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=12.28;ReadPosRankSum=-1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:323,0,196 -chr3 2306822 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.012;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:377,0,547 -chr3 2309799 . C T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.092;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.73;ReadPosRankSum=-1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:413,0,386 -chr3 2476690 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr3 2559244 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=-1.725;DP=34;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:250,0,1911 -chr3 2559247 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=-1.991;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.483;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:250,0,1911 -chr3 2560559 . GT G 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.391;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=19.69;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:34:431,0,34 -chr3 2688159 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr3 2688170 . G A 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr3 2846039 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-3.260;DP=37;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=12.99;ReadPosRankSum=3.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:509,0,616 -chr3 2909030 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr3 2991660 . A G 963.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:72:992,72,0 -chr3 2991757 . G A 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-0.722;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=26.15;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:69:972,69,0 -chr3 2991809 . C T 2323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:99:2352,163,0 -chr3 2991856 . A G 983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:72:1012,72,0 -chr3 2991888 . A T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.473;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=15.57;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:293,0,274 -chr3 2991914 . A AC 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=17;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:332,0,105 -chr3 2992033 . A G 739.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:768,57,0 -chr3 3120004 . G T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr3 3120048 . C A 282.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:311,21,0 -chr3 3154208 . T C 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-1.599;DP=20;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:322,0,220 -chr3 3155196 . A ATC 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=4.468;DP=95;FS=23.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=4.96;ReadPosRankSum=-4.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:508,0,488 -chr3 3155776 . A G 452.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:481,36,0 -chr3 3155958 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-1.936;DP=19;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=11.30;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:243,0,258 -chr3 3156606 . TA T 699.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=-1.267;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,32:35:94:737,0,94 -chr3 3156634 . T C 2701.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=-2.487;DP=60;FS=5.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=28.00;ReadPosRankSum=2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,55:59:99:2730,151,0 -chr3 3156883 . C CT 2139.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.049;DP=332;FS=127.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.170;QD=6.44;ReadPosRankSum=-5.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,108:289:99:2177,0,15025 -chr3 3156897 . G T 6667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.893;ClippingRankSum=-0.894;DP=425;FS=41.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.69;ReadPosRankSum=-3.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,155:350:99:6696,0,5705 -chr3 3157024 . A T 4692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.261;DP=113;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=28.39;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:4721,334,0 -chr3 3158054 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.663;DP=17;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=12.34;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:238,0,716 -chr3 3159071 . G A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=2.862;DP=38;FS=16.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=30.10;ReadPosRankSum=-2.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:38:91:1172,0,91 -chr3 3159273 . T C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=1.021;DP=52;FS=1.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:773,0,465 -chr3 3159282 . T A 1407.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1436,102,0 -chr3 3159544 . T C 921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:950,72,0 -chr3 3188392 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=1.362;DP=33;FS=13.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=7.87;ReadPosRankSum=-3.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:288,0,813 -chr3 3188448 . A C 664.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:693,48,0 -chr3 3189679 . A G 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-1.637;DP=36;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=29.30;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,3:31:99:1083,0,14711 -chr3 3189696 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-2.801;DP=57;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=18.01;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,5:48:99:1055,0,14712 -chr3 3189719 . CCCTTAATCAGATACATTTACAAAACAAAACATCACTTTAGTATAGTGCCAGGGCAAAACTCACAGGTTGTAATAGATCAATGACATAATGTTGACAGTATGTGTTTAAAATAATTGCAAACAAA C 1942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=5.449;DP=171;FS=12.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,61:145:99:1980,0,49355 -chr3 3189823 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=-3.754;DP=125;FS=5.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,25:118:99:279,0,16917 -chr3 3191202 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=-0.299;DP=88;FS=1.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.445;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:688,0,4389 -chr3 3191206 . G A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=-0.698;DP=85;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,32:77:99:1136,0,1866 -chr3 3533967 . G A 1164.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1193,84,0 -chr3 3534069 . C T 706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:735,51,0 -chr3 3534289 . G C 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr3 3628181 . C G 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr3 3628214 . C T 216.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:16:245,16,0 -chr3 3628322 . TG T 307.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:345,30,0 -chr3 3630489 . A T 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:442,33,0 -chr3 3648181 . G T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr3 3661586 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr3 3661587 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr3 3703477 . A C 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 -chr3 3734691 . A T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr3 3735000 . T C 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr3 3845457 . A G 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:308,21,0 -chr3 3845466 . C T 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr3 3845854 . T C 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:575,39,0 -chr3 3845901 . A T 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr3 3847273 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=22.48;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:343,0,121 -chr3 3852211 . T A 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr3 3868677 . C A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.499;DP=57;FS=4.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:242,0,1573 -chr3 3868878 . C A 1635.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.433;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1664,117,0 -chr3 3869042 . A C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:346,27,0 -chr3 3869716 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr3 3871820 . A T 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr3 3872046 . G T 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:895,63,0 -chr3 3872390 . A C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr3 3872510 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr3 3872571 . A G 569.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:598,45,0 -chr3 3872674 . AT A 719.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:67:757,67,0 -chr3 3872743 . T TA 657.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:62:695,62,0 -chr3 3873216 . A T 1351.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1499,108,0 -chr3 3873542 . A G 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr3 3873581 . G A 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 -chr3 3887437 . G A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr3 4016876 . AT A 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.768;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:48:246,0,48 -chr3 4255634 . T C 322.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=32.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:351,0,15 -chr3 4497147 . C G 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:391,27,0 -chr3 4497201 . G A 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 -chr3 4642963 . T A 366.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=11.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:395,27,0 -chr3 4650008 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.453;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:254,0,653 -chr3 4650376 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=2.000;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=23.70;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:360,0,171 -chr3 4655492 . A G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=2.039;DP=18;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=21.82;ReadPosRankSum=-2.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:421,0,149 -chr3 4711643 . T C 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=-0.134;DP=21;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=29.42;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:74:646,0,74 -chr3 4711868 . A G 540.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.123;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=27.04;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:6:568,6,0 -chr3 5377658 . G T 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr3 5718779 . C CT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:289,0,46 -chr3 5732310 . G A 4721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.322;DP=328;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,140:327:99:4750,0,6064 -chr3 5739223 . C T 5232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=2.597;DP=370;FS=11.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,156:370:99:5261,0,6921 -chr3 5745786 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.797;DP=349;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.923;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,51:347:99:425,0,11275 -chr3 5791627 . C T 2822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=1.232;DP=166;FS=3.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=17.00;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,82:164:99:2851,0,3542 -chr3 5791699 . T C 3855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.169;ClippingRankSum=-0.675;DP=255;FS=5.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=15.12;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,113:253:99:3884,0,4174 -chr3 5791768 . A C 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.083;DP=184;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,42:179:99:655,0,5897 -chr3 5791825 . A C 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=2.866;DP=196;FS=12.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.117;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,61:186:99:1571,0,4823 -chr3 5791837 . T C 2616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=4.498;DP=220;FS=22.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,80:207:99:2645,0,4425 -chr3 5864043 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.280;DP=244;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=1.04;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,36:244:99:281,0,8809 -chr3 6142240 . C A 2728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.236;DP=422;FS=4.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=6.47;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,117:422:99:2757,0,11413 -chr3 6518911 . G T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.824;DP=121;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=5.25;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:663,0,3227 -chr3 6518963 . G T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.952;DP=101;FS=4.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,30:100:99:724,0,2599 -chr3 6529764 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:267,0,133 -chr3 6531280 . TA T 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-1.527;DP=40;FS=4.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:445,0,541 -chr3 6575296 . G GA 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-1.963;DP=165;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.060;QD=1.67;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,28:128:99:312,0,2452 -chr3 6597738 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.521;DP=149;FS=6.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,31:149:99:564,0,4216 -chr3 6597924 . A G 2068.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.282;ClippingRankSum=-0.873;DP=196;FS=4.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,66:196:99:2097,0,3735 -chr3 6678237 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=1.664;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:315,0,132 -chr3 6825564 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.748;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:303,0,960 -chr3 7006870 . C CA 1745.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.147;DP=232;FS=2.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.028;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,77:197:99:1783,0,2550 -chr3 7181409 . C G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr3 7414210 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.64;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,101 -chr3 7500863 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.317;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:422,0,849 -chr3 7501151 . T C 741.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:770,54,0 -chr3 7502426 . A G 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=4.257;DP=64;FS=9.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=9.43;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:632,0,1204 -chr3 7503440 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-2.520;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,132 -chr3 7602178 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-0.231;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.65;ReadPosRankSum=3.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:331,0,1077 -chr3 7735653 . T C 1113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=1.273;DP=37;FS=26.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.125;QD=30.10;ReadPosRankSum=1.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,29:37:99:1142,0,188 -chr3 8237459 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=-1.309;DP=75;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:365,0,2594 -chr3 8238278 . C G 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=-0.722;DP=89;FS=8.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:539,0,2407 -chr3 8256500 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-1.514;DP=30;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:350,0,558 -chr3 8267863 . T A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-1.385;DP=227;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,64:227:99:1477,0,6194 -chr3 8435375 . G A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=1.253;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:475,0,2541 -chr3 8580920 . A T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=-2.454;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=20.96;ReadPosRankSum=2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:678,0,402 -chr3 8580977 . T A 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.582;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,31:48:99:1076,0,550 -chr3 8580995 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=-0.601;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:356,0,1221 -chr3 8581068 . A G 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=-1.388;DP=42;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=27.88;ReadPosRankSum=2.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,29:42:99:1199,0,333 -chr3 8581142 . A G 1589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-1.313;DP=55;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=28.90;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1618,0,400 -chr3 8595568 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.375;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:661,0,1034 -chr3 8595608 . T G 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.452;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=14.44;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:649,0,1030 -chr3 8666793 . C T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=-0.693;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=30.66;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:854,0,198 -chr3 8716334 . T C 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:499,36,0 -chr3 8716688 . A G 954.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:983,69,0 -chr3 9330089 . T G 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:399,27,0 -chr3 9331339 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.08;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:66:249,0,66 -chr3 9357163 . T C 555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:584,48,0 -chr3 9357178 . T A 353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:382,30,0 -chr3 9358075 . G A 359.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:388,27,0 -chr3 9822388 . C T 1350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.545;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=26.28;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1379,102,0 -chr3 9822390 . C T 1552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1581,108,0 -chr3 9825989 . C T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr3 9833623 . C T 1038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=2.531;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,28:37:99:1067,0,222 -chr3 9850926 . G A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=-0.099;DP=39;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:764,0,581 -chr3 9851812 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=-0.615;DP=69;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.681;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:449,0,1799 -chr3 9852277 . C A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=-3.856;DP=22;FS=5.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=12.03;ReadPosRankSum=2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,460 -chr3 9852498 . T C 615.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:644,45,0 -chr3 9870849 . A G 1202.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1231,87,0 -chr3 9876360 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:256,0,63 -chr3 9876468 . T C 626.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:655,48,0 -chr3 9876708 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.501;DP=48;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=13.14;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:659,0,788 -chr3 9877442 . G C,T 244.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,4,4:8:99:305,180,313,149,0,266 -chr3 10018345 . T G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=1.543;DP=51;FS=7.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:252,0,1461 -chr3 10046001 . T C 2718.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2747,196,0 -chr3 10046019 . G A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.339;DP=49;FS=4.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:628,0,1045 -chr3 10053003 . G A 1550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-1.022;DP=48;FS=3.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=32.31;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,41:48:72:1579,0,72 -chr3 10053684 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 -chr3 10053930 . C T 2233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.033;DP=75;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,60:75:99:2262,0,251 -chr3 10060246 . C T 602.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=28.00;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:5:630,5,0 -chr3 10062915 . A G 655.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:51:684,51,0 -chr3 10063008 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-2.383;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=22.78;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:256,0,226 -chr3 10063942 . G A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.326;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=26.25;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:422,0,130 -chr3 10064082 . G A 1134.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.991;DP=78;FS=8.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1172,0,1095 -chr3 10064760 . G GTT 1252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.796;DP=44;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.607;QD=28.47;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1290,0,117 -chr3 10065100 . C T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.083;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.056;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,30:104:99:747,0,2860 -chr3 10077673 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.289;DP=54;FS=13.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:273,0,918 -chr3 10078002 . C T 831.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=1.504;DP=15;FS=8.751;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=30.74;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:65:860,65,0 -chr3 10078033 . G A 1653.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=-2.176;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=27.51;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:99:1682,123,0 -chr3 10078036 . A C 1334.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.973;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=34.22;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,33:36:3:1361,0,3 -chr3 10078163 . G A 1659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-2.463;DP=96;FS=2.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,47:96:99:1688,0,1691 -chr3 10078182 . C T 1500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=-0.773;DP=83;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.997;QD=18.08;ReadPosRankSum=1.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,45:82:99:1529,0,1410 -chr3 10078255 . G GGT 913.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.025;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.51;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=25.38;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:951,0,124 -chr3 10093571 . T C 1054.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1083,78,0 -chr3 10095316 . G C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-1.012;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:392,0,771 -chr3 10102994 . A C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=2.072;DP=38;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:254,0,1030 -chr3 10133921 . C G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr3 10223661 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-1.133;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,140 -chr3 10224729 . C T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=22.27;ReadPosRankSum=1.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:340,0,150 -chr3 10237253 . G A 1573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=4.975;DP=145;FS=16.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=10.85;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,51:145:99:1602,0,3757 -chr3 10243658 . G A 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=1.243;DP=270;FS=12.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,46:270:99:562,0,10266 -chr3 10695092 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.197;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:236,0,673 -chr3 10695385 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.170;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.342;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:261,0,932 -chr3 10995085 . G T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=-0.024;DP=64;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:263,0,2210 -chr3 10995975 . T C 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.016;DP=34;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=15.52;ReadPosRankSum=3.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:556,0,191 -chr3 10997564 . G A 569.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-1.735;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:14:598,14,0 -chr3 11065527 . C G 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.155;DP=304;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,44:303:99:326,0,9783 -chr3 11286248 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.276;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=17.66;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:452,0,224 -chr3 11437577 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.357;DP=45;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:243,0,1247 -chr3 11465208 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.454;DP=39;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:442,0,886 -chr3 11474562 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=1.600;DP=44;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=7.99;ReadPosRankSum=1.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:380,0,1354 -chr3 11475799 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.389;DP=48;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:240,0,1378 -chr3 11477348 . A T 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.974;DP=39;FS=7.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:749,0,505 -chr3 11498173 . ACTGAAACATTAACAGCAGCACAGAGCATTCAAAACACACACTACAACCAGCTGCACTGCGGGGTCACGTGACTGATGATGTCAGCCTCAC A 2250.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=1.662;DP=49;FS=3.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=31.67;ReadPosRankSum=1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:2288,202,0 -chr3 11516574 . G T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=-0.587;DP=85;FS=2.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.81;ReadPosRankSum=2.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:522,0,2311 -chr3 11644955 . A G 213.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:242,15,0 -chr3 11644963 . T C 213.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.89;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:15:242,15,0 -chr3 11645020 . T G 436.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:464,0,5 -chr3 11645182 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.978;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=19.05;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,171 -chr3 11647942 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=3.011;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,456 -chr3 11827310 . A T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.600;DP=62;FS=4.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.704;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:313,0,2693 -chr3 11827911 . TA T 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.655;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:242,0,1542 -chr3 11831407 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.365;DP=53;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:297,0,1885 -chr3 11838620 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.668;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:316,0,429 -chr3 11838857 . T C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.455;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:493,0,475 -chr3 12210092 . C T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=-0.209;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=18.74;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:553,0,396 -chr3 12296928 . C A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:367,0,665 -chr3 12341922 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.517;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.326;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:384,0,645 -chr3 12342005 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.238;DP=20;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:244,0,701 -chr3 12368805 . T G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.491;DP=93;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=3.45;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:349,0,2758 -chr3 12435309 . T G 875.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:66:904,66,0 -chr3 12567436 . G A 1832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=-1.950;DP=66;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,49:66:99:1861,0,386 -chr3 12567542 . T TG 1437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.763;DP=56;FS=9.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.807;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1475,0,304 -chr3 12567573 . G A 1531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.068;DP=56;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,41:55:99:1560,0,313 -chr3 12567824 . G A 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.885;ClippingRankSum=2.992;DP=39;FS=4.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:688,0,696 -chr3 12568201 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:239,0,109 -chr3 12575275 . G T 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=-1.616;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1071,0,765 -chr3 12588008 . G A 2732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-1.397;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=26.53;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,73:103:99:2761,0,807 -chr3 12588105 . A G 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.760;DP=82;FS=6.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.858;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,55:82:99:2096,0,704 -chr3 12588715 . C T 965.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-1.193;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:994,0,759 -chr3 12595078 . G A 1381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-0.997;DP=46;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,37:46:99:1410,0,155 -chr3 12606408 . G C 1638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.460;DP=60;FS=2.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,44:60:99:1667,0,370 -chr3 12608507 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=1.233;DP=24;FS=1.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=25.95;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:651,0,147 -chr3 12619978 . C A 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.921;DP=27;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:456,0,594 -chr3 12796246 . C T 1340.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1369,99,0 -chr3 12796361 . A T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=1.423;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=12.86;ReadPosRankSum=-1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:427,0,566 -chr3 12798400 . T C 867.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:896,66,0 -chr3 12805995 . T C 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr3 12806890 . A C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.171;DP=23;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:492,0,286 -chr3 12817902 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.969;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:283,0,1711 -chr3 12970029 . C A 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.076;DP=94;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,49:94:99:1589,0,1599 -chr3 12971522 . C G 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.313;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=28.03;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:99:645,0,231 -chr3 12974442 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:308,0,136 -chr3 12981551 . T A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.343;DP=30;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=28.89;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:895,0,169 -chr3 12981929 . G A 1366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.654;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.390;QD=34.17;ReadPosRankSum=0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:99:1395,0,140 -chr3 12981984 . A C 1102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.025;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=32.43;ReadPosRankSum=1.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:65:1131,0,65 -chr3 12982036 . A T 1760.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.248;DP=48;FS=1.998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.544;QD=30.41;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:51:1789,51,0 -chr3 12982058 . G A 1640.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-1.321;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=27.49;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,40:46:26:1669,0,26 -chr3 12982328 . AT A 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.372;DP=23;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=18.47;ReadPosRankSum=-1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:70:462,0,70 -chr3 12982442 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:437,0,131 -chr3 12982536 . A G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=9.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.505;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:502,0,534 -chr3 12982856 . C T 1496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.296;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,11:13:43:1525,43,0 -chr3 12982878 . G A 1460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.524;DP=34;FS=2.098;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=28.99;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,15:20:28:1489,28,0 -chr3 12982924 . G C 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.017;DP=48;FS=19.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:912,0,379 -chr3 12983081 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.311;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=13.07;ReadPosRankSum=-2.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:342,0,654 -chr3 12983105 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=34.86;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:342,0,698 -chr3 12983357 . T G 1441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.719;DP=143;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,36:65:99:1470,0,986 -chr3 12983522 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=2.486;DP=21;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=24.56;ReadPosRankSum=-2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:544,0,509 -chr3 12983763 . T A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=2.492;DP=22;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=15.63;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:372,0,283 -chr3 12984293 . G A 1623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.136;DP=51;FS=1.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=31.84;ReadPosRankSum=0.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,42:51:99:1652,0,154 -chr3 12985238 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=2.669;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:446,0,195 -chr3 12985782 . C T 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.537;DP=59;FS=2.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=29.56;ReadPosRankSum=-1.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,47:59:99:1772,0,254 -chr3 12985886 . G A 1546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=1.822;DP=47;FS=11.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=32.91;ReadPosRankSum=-1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,36:47:99:1575,0,314 -chr3 12985993 . G T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-2.140;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=21.42;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:521,0,353 -chr3 12998479 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr3 13059618 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=25.38;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:282,0,104 -chr3 13059640 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.895;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:250,0,140 -chr3 13059791 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:299,0,289 -chr3 13064496 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.001;DP=9;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.42;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:230,0,97 -chr3 13100640 . G T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr3 13101226 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.403;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:51:608,0,51 -chr3 13101841 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:79:393,0,79 -chr3 13101979 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:67:265,0,67 -chr3 13101985 . T A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.82;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:265,0,67 -chr3 13102035 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:339,0,58 -chr3 13104973 . T A 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:857,60,0 -chr3 13105639 . C A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:57:280,0,57 -chr3 13105647 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:57:280,0,57 -chr3 13105949 . CTT C 243.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr3 13106348 . A T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:67:240,0,67 -chr3 13106355 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:67:240,0,67 -chr3 13108799 . AT A 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,127 -chr3 13108807 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:288,0,127 -chr3 13108918 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:382,0,206 -chr3 13109101 . A G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:383,0,131 -chr3 13229301 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.333;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:286,0,853 -chr3 13237368 . C T 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.952;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=19.14;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:947,0,672 -chr3 13237396 . A G 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-1.830;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.617;QD=19.39;ReadPosRankSum=2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:959,0,686 -chr3 13238506 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.051;DP=26;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.051;QD=16.22;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:450,0,403 -chr3 13283812 . T C 680.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:709,51,0 -chr3 13361801 . T C 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-0.501;DP=31;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=30.41;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:79:971,0,79 -chr3 13361812 . G C 871.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.853;DP=28;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=31.14;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:18:900,0,18 -chr3 13362542 . T C 315.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=1.393;DP=11;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=28.72;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:344,0,16 -chr3 13363404 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.536;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=14.64;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:321,0,124 -chr3 13363891 . G C 1675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.735;DP=27;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=28.44;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:99:1704,123,0 -chr3 13364022 . C A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.244;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:380,0,460 -chr3 13364074 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.322;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:80:459,0,80 -chr3 13365155 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=1.954;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:248,0,336 -chr3 13365157 . G A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.086;DP=13;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=31.60;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:86:439,0,86 -chr3 13365248 . G A 755.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=-0.867;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=31.75;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:56:784,56,0 -chr3 13365290 . T C 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:571,39,0 -chr3 13365886 . T G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=1.122;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,521 -chr3 13366247 . T G 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=-0.308;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:513,0,787 -chr3 13366427 . C A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.890;DP=18;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.890;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:448,0,181 -chr3 13387073 . A G 350.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:379,30,0 -chr3 13449103 . A C 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=3.636;DP=81;FS=15.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.57;ReadPosRankSum=-1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,24:81:99:560,0,2221 -chr3 13450257 . TAA T 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=-0.280;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=8.90;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:411,0,2302 -chr3 13450483 . C T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=-0.909;DP=124;FS=5.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.128;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,45:124:99:1262,0,2749 -chr3 13450732 . G A 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.232;DP=128;FS=7.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=7.38;ReadPosRankSum=2.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,38:128:99:973,0,3438 -chr3 13452013 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=1.278;DP=143;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.937;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,23:143:99:260,0,4615 -chr3 13452236 . A T 2943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=-0.736;DP=238;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=12.37;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,88:238:99:2972,0,5196 -chr3 13468093 . C G 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=-1.595;DP=212;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.385;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,40:211:99:644,0,6574 -chr3 13473037 . CACCTGTAAGCCAACATTGATGATCATCATGTGTACTATCAGAAAAGCTCAGAAAACACAAACTAGTAAAGAGTGGAGAAAAGTTAAATTGGGATGAATATCA C 4038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-1.473;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=30.83;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,104:116:99:4076,0,1804 -chr3 13483659 . CT C 1094.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.996;DP=108;FS=1.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.026;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,44:95:99:1132,0,3726 -chr3 13483733 . C T 2895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=-2.188;DP=163;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,77:161:99:2924,0,3027 -chr3 13483812 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=-3.056;DP=135;FS=0.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,36:133:99:821,0,4821 -chr3 13483845 . C G 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.323;DP=120;FS=16.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,32:120:99:627,0,5405 -chr3 13517927 . G C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-2.573;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=16.17;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,283 -chr3 13524434 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-1.401;DP=26;FS=10.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.132;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:578,0,305 -chr3 13596887 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=1.209;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:410,0,701 -chr3 13607474 . A G 2624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.198;DP=154;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.033;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,70:152:99:2653,0,2858 -chr3 13607643 . A G 3627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=1.042;DP=113;FS=4.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=32.10;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,83:109:99:3656,0,586 -chr3 13607650 . A G 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.623;DP=119;FS=3.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.385;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,36:119:99:871,0,4812 -chr3 13607882 . C A 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=-0.111;DP=325;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,55:324:99:650,0,13597 -chr3 13652782 . T C 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.736;DP=104;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,32:104:99:764,0,4092 -chr3 13666171 . A G 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr3 13666553 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:45:242,0,45 -chr3 13884099 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.963;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:292,0,1317 -chr3 14242520 . CA C 631.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.159;DP=52;FS=2.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=12.15;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:687,0,400 -chr3 14291912 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.867;DP=51;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:650,0,1269 -chr3 14291964 . G C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.706;DP=47;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:788,0,956 -chr3 14292197 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=1.397;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:583,0,666 -chr3 14292398 . A C 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.134;DP=46;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=13.41;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:645,0,966 -chr3 14292677 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,398 -chr3 14694183 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.393;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.367;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:425,0,1522 -chr3 14700681 . A G 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.145;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:977,0,1672 -chr3 14719772 . G A 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.084;DP=74;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=13.46;ReadPosRankSum=-2.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1024,0,1373 -chr3 14731822 . CTT C 232.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr3 14735891 . T G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.514;DP=59;FS=6.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:292,0,1948 -chr3 14739203 . C T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-2.035;DP=51;FS=2.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:957,0,814 -chr3 14739311 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-0.125;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=3.55;ReadPosRankSum=-2.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:234,0,1749 -chr3 14741693 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-0.805;DP=92;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:260,0,2710 -chr3 14743786 . ACTGAAAAAATAAAGATGTCAGAATTAAAATACATCATATTTTATATTACACCTCTTAGTATTGCAAACATAC A 1443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=1.541;DP=65;FS=4.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=22.21;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,41:60:99:1481,0,894 -chr3 14798215 . AAC A 2860.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=1.183;DP=120;FS=0.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=23.84;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,53:112:99:2898,0,1675 -chr3 14798280 . T C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.953;DP=158;FS=3.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.338;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,30:155:99:310,0,6578 -chr3 14806128 . C T 2373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=1.396;DP=174;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,71:173:99:2402,0,4745 -chr3 14949162 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=1.939;DP=218;FS=22.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,31:217:99:281,0,7433 -chr3 14956457 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=-1.016;DP=174;FS=3.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,30:173:99:389,0,4788 -chr3 14966067 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=-0.034;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:283,0,2237 -chr3 14966877 . T G 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=1.176;DP=75;FS=3.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=16.00;ReadPosRankSum=-1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1228,0,1896 -chr3 14977022 . C T 1235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-1.816;DP=81;FS=3.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=15.26;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,37:81:99:1264,0,1385 -chr3 14996203 . A T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.052;DP=35;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:440,0,505 -chr3 14996612 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.314;DP=87;FS=1.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,25:87:99:625,0,2325 -chr3 14996760 . A AT 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=-2.067;DP=63;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:251,0,1144 -chr3 14997556 . C G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=-0.684;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:316,0,2711 -chr3 14999555 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.788;DP=98;FS=0.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.622;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,22:98:99:460,0,2729 -chr3 15010610 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.619;DP=171;FS=9.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,29:171:99:386,0,5341 -chr3 15029835 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.197;DP=122;FS=3.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,21:122:99:271,0,4030 -chr3 15047174 . A G 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=1.717;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=18.05;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:985,0,941 -chr3 15047451 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.256;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:482,0,1584 -chr3 15048917 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.604;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=5.70;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:262,0,1116 -chr3 15075440 . G C 1340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=3.541;DP=45;FS=42.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=29.79;ReadPosRankSum=-3.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:44:99:1369,0,365 -chr3 15079558 . G T 2448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.743;DP=340;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.263;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,101:340:99:2477,0,8969 -chr3 15081509 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=-0.148;DP=114;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,23:114:99:444,0,3459 -chr3 15087442 . T C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.503;DP=86;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:484,0,2484 -chr3 15090835 . AAGCTCTCAAAGACTTTACCTTAAACAGCCAAGAAATTCCCACCTTGTTG A 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=-0.412;DP=97;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:293,0,4732 -chr3 15094461 . G A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.099;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=14.90;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:371,0,668 -chr3 15101043 . T C 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=-0.138;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=15.81;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:471,0,500 -chr3 15226103 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=-1.010;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.623;QD=8.62;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:235,0,575 -chr3 15233736 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=-1.357;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:249,0,869 -chr3 15250962 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-1.221;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:612,0,455 -chr3 15251853 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.986;DP=29;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:318,0,653 -chr3 15253900 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.970;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:285,0,572 -chr3 15275471 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-2.111;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:256,0,814 -chr3 15275817 . C T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.454;DP=39;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:474,0,902 -chr3 15276306 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-0.459;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.314;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:278,0,1602 -chr3 15292118 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=1.789;DP=34;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:278,0,2047 -chr3 15292309 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.347;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:232,0,444 -chr3 15292598 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.656;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:308,0,504 -chr3 15325077 . T A 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=1.418;DP=233;FS=0.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,41:233:99:553,0,7549 -chr3 15325131 . A T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=2.244;DP=267;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.836;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,50:257:99:837,0,7666 -chr3 15351537 . G A 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.302;DP=104;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,39:104:99:1307,0,2465 -chr3 15400824 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=-0.160;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=13.16;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:515,0,669 -chr3 15413837 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.437;DP=34;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:444,0,688 -chr3 15415226 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=-1.255;DP=24;FS=6.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:267,0,558 -chr3 15415434 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=-0.434;DP=39;FS=9.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=6.33;ReadPosRankSum=2.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:275,0,1757 -chr3 15416143 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.553;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:454,0,2363 -chr3 15416744 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.079;DP=62;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:392,0,2097 -chr3 15416784 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.391;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:756,0,1679 -chr3 15417239 . G T 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.250;DP=35;FS=8.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:538,0,756 -chr3 15417327 . TA T 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.175;DP=45;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=9.33;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:457,0,446 -chr3 15423606 . G T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=-0.271;DP=115;FS=5.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,32:115:99:830,0,3089 -chr3 15427419 . A T 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.476;DP=54;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.255;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:979,0,1053 -chr3 15428141 . C A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:622,0,629 -chr3 15439918 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-0.484;DP=145;FS=4.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.901;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,23:145:99:236,0,4406 -chr3 15440380 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.805;DP=177;FS=7.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.989;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,39:177:99:839,0,11778 -chr3 15440384 . G A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=-0.826;DP=183;FS=7.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,40:183:99:839,0,11778 -chr3 15440561 . A T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.223;DP=189;FS=0.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,37:189:99:487,0,4838 -chr3 15505100 . G GCCCC 7162.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=4.444;DP=382;FS=1.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=18.75;ReadPosRankSum=2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,222:370:99:7200,0,5248 -chr3 15585327 . T C 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=-1.058;DP=57;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=8.36;ReadPosRankSum=-2.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:505,0,1483 -chr3 15588839 . C G 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=-1.018;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=16.56;ReadPosRankSum=-2.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:525,0,481 -chr3 15588911 . G A 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.235;DP=33;FS=5.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:629,0,550 -chr3 15588944 . T C 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=2.420;DP=59;FS=9.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1144,0,925 -chr3 15590672 . G A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-1.142;DP=74;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.59;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,28:74:99:886,0,1523 -chr3 15590747 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=-0.104;DP=104;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:452,0,2954 -chr3 15592105 . T C 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.268;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:430,0,1832 -chr3 15592163 . C T 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-1.976;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=23.63;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:1068,0,1275 -chr3 15592168 . T C 1042.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.065;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:1071,0,1275 -chr3 15592255 . T G 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=-1.282;DP=97;FS=14.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=14.53;ReadPosRankSum=2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,40:96:99:1438,0,1940 -chr3 15592351 . C CT 2765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.672;DP=101;FS=0.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,79:100:99:2814,0,175 -chr3 15592493 . A G 2091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-0.163;DP=63;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=33.20;ReadPosRankSum=-1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,46:63:99:2120,0,396 -chr3 15592531 . A G 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-1.115;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:925,0,642 -chr3 15592728 . G C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=1.045;DP=53;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:903,0,989 -chr3 15592825 . CA C 1548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-1.437;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=29.78;ReadPosRankSum=-0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,38:51:92:1586,0,92 -chr3 15592916 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.117;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=10.59;ReadPosRankSum=-1.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:399,0,1267 -chr3 15592970 . GT G 515.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.966;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:553,0,687 -chr3 15592975 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=1.914;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=20.99;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:553,0,687 -chr3 15593063 . G A 1107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.584;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,32:65:99:1136,0,1521 -chr3 15593086 . A G 1154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.285;DP=71;FS=3.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=16.26;ReadPosRankSum=-0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,30:71:99:1183,0,1632 -chr3 15593095 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.489;DP=78;FS=1.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,16:78:99:309,0,4425 -chr3 15593200 . T C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-0.805;DP=54;FS=4.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:409,0,1386 -chr3 15595205 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=-1.066;DP=51;FS=3.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:373,0,1494 -chr3 15595317 . GT G 952.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.354;DP=148;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.88;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:1089,0,1666 -chr3 15595528 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=4.539;DP=102;FS=19.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=3.29;ReadPosRankSum=-2.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,20:102:99:364,0,3298 -chr3 15595572 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.716;DP=107;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=2.52;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,19:107:99:298,0,3544 -chr3 15607699 . A C 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.132;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:434,0,1570 -chr3 15610913 . C T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=4.195;DP=44;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:399,0,1145 -chr3 15611115 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.586;DP=90;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.123;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:1049,0,2006 -chr3 15640444 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:233,0,457 -chr3 15641663 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-0.979;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:352,0,650 -chr3 15642090 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=-0.343;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:316,0,551 -chr3 15642180 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=1.603;DP=22;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.735;QD=10.03;ReadPosRankSum=-1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:249,0,403 -chr3 15650182 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.047;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:484,0,823 -chr3 15665121 . C CT 2484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.131;DP=317;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=7.84;ReadPosRankSum=2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,138:295:99:2558,0,5801 -chr3 15665376 . G A 12734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=-0.487;DP=207;FS=7.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=32.79;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,57:205:99:12763,0,3514 -chr3 15725641 . A G 3711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.014;DP=576;FS=5.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:421,155:576:99:3740,0,16663 -chr3 15758931 . C G 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-1.183;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:808,0,1507 -chr3 15774789 . C T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.868;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.973;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:815,0,1426 -chr3 15775448 . GT G 222.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.401;DP=20;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,14:17:3:309,3,0 -chr3 15775591 . G T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.996;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:578,0,751 -chr3 15775603 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.353;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=14.72;ReadPosRankSum=-1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:573,0,764 -chr3 15777028 . CA C 2880.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:99:2918,212,0 -chr3 15779260 . G A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.105;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:372,0,1388 -chr3 15779604 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.041;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:308,0,907 -chr3 15852102 . CGTAAGTGTCCAAACAGTGTGCTCTGCAACATTATACTACTCTGCTATCTGTCATGTTTAGGGAAACATGATAAAACAAGGTCTTACTGTGCAGTGCTAATCGGTGCATGTTTCTCTCTGCAG C 20221.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=-1.622;DP=445;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=28.37;ReadPosRankSum=1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,442:444:99:20259,814,0 -chr3 15885944 . T C 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.176;DP=133;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,44:132:99:1160,0,4124 -chr3 15885948 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-1.498;DP=141;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,26:140:99:320,0,5948 -chr3 15901389 . A G 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.673;DP=105;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,25:105:99:517,0,3397 -chr3 15902562 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.105;DP=103;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,24:103:99:467,0,3089 -chr3 15902819 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.616;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:600,0,1096 -chr3 16009545 . A G 2117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.296;DP=278;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=7.62;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,87:278:99:2146,0,7040 -chr3 16020307 . G A 1668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.319;DP=258;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,76:257:99:1697,0,9414 -chr3 16029156 . T C 2416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=-2.028;DP=281;FS=7.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=8.60;ReadPosRankSum=2.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,92:280:99:2445,0,6974 -chr3 16092816 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:236,0,241 -chr3 16137196 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=1.677;DP=47;FS=4.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:303,0,1302 -chr3 16140664 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.315;DP=38;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:275,0,1085 -chr3 16142433 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=1.626;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:292,0,1612 -chr3 16152090 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-1.498;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:483,0,863 -chr3 16211362 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.397;DP=32;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=10.56;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:366,0,805 -chr3 16212657 . T A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=2.651;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:239,0,667 -chr3 16299626 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.040;DP=62;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:333,0,2525 -chr3 16299635 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-1.306;DP=55;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:388,0,1900 -chr3 16315906 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.146;DP=108;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:310,0,3464 -chr3 16315954 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=-0.334;DP=148;FS=8.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,38:147:99:853,0,4181 -chr3 16316008 . T C 1683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.067;DP=229;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.956;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,68:228:99:1712,0,6129 -chr3 16319584 . G A 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=1.004;DP=262;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=2.09;ReadPosRankSum=3.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,44:257:99:577,0,8164 -chr3 16325564 . G T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.157;DP=246;FS=2.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,38:246:99:371,0,8017 -chr3 16339166 . T C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=1.521;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:452,0,2714 -chr3 16359259 . C T 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-1.124;DP=105;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=12.10;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,38:105:99:1299,0,2226 -chr3 16363757 . C T 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.125;DP=97;FS=0.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,34:97:99:1129,0,2086 -chr3 16557398 . C A 1182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.468;DP=164;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,47:158:99:1211,0,4172 -chr3 16581441 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.763;DP=117;FS=5.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,28:117:99:589,0,5695 -chr3 16592627 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=2.655;DP=67;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=4.28;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:315,0,2190 -chr3 16592858 . T C 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-2.748;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,23:76:99:624,0,3785 -chr3 16592859 . G T 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-2.360;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:624,0,3785 -chr3 16597033 . T G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.960;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:251,0,1884 -chr3 16633652 . A G 275.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.58;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:27:304,0,27 -chr3 16635299 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.361;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:355,0,889 -chr3 16635379 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-1.376;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:356,0,604 -chr3 16690240 . A G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.836;DP=64;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=6.00;ReadPosRankSum=3.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:412,0,1720 -chr3 16707335 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=3.928;DP=76;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:292,0,4704 -chr3 16707338 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=4.081;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,13:71:99:309,0,4704 -chr3 16727196 . TA T 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.545;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:262,0,565 -chr3 16727207 . A T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.212;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:259,0,589 -chr3 16976644 . C G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.742;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=11.16;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:352,0,1187 -chr3 16976808 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=-1.462;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,902 -chr3 16976875 . AG A 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.529;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:313,0,434 -chr3 16979548 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:333,0,304 -chr3 16979962 . A C 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.653;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:381,0,134 -chr3 16980123 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=1.879;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:598,0,829 -chr3 16982432 . A C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=1.267;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:289,0,895 -chr3 16982793 . C T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.993;DP=33;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=20.02;ReadPosRankSum=0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:689,0,439 -chr3 17295043 . G A 3500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.944;DP=263;FS=16.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,102:263:99:3529,0,5444 -chr3 17295696 . C A 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=-1.281;DP=129;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,40:129:99:1077,0,4474 -chr3 17295704 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.485;DP=118;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,24:118:99:412,0,6438 -chr3 17321786 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-1.096;DP=66;FS=2.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.374;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,26:66:99:908,0,1379 -chr3 17326105 . C T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-2.370;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:363,0,388 -chr3 17377256 . TA T 633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:64:671,64,0 -chr3 17377317 . G T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-3.215;DP=27;FS=12.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=29.92;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:87:836,0,87 -chr3 17377436 . C T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=2.097;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.563;QD=14.76;ReadPosRankSum=-2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,18:42:99:648,0,1889 -chr3 17377442 . A G 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.991;DP=34;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=18.23;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:648,0,1947 -chr3 17377665 . G A 567.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:596,42,0 -chr3 17378024 . A G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=-1.875;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:36:290,0,36 -chr3 17378128 . AAC A 760.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=-2.695;DP=133;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=5.72;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,34:133:99:798,0,3889 -chr3 17378456 . A G 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.596;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.858;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,25:95:99:590,0,2562 -chr3 17381101 . G T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=4.353;DP=52;FS=11.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=4.30;ReadPosRankSum=-4.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,10:51:99:252,0,4128 -chr3 17381110 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=3.916;DP=59;FS=6.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.081;QD=3.69;ReadPosRankSum=-3.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:246,0,4128 -chr3 17381122 . G C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=1.085;DP=74;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:289,0,3078 -chr3 17385525 . C T 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=1.732;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=27.63;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:636,0,149 -chr3 17412364 . A G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:272,0,394 -chr3 17412380 . A G 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr3 17413076 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=-2.721;DP=106;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:485,0,3277 -chr3 17413136 . G T 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.136;DP=110;FS=2.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,41:110:99:1443,0,2478 -chr3 17413203 . A G 2977.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:3006,217,0 -chr3 17413285 . A G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-1.768;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=33.52;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:397,0,53 -chr3 17413298 . A G 783.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:812,60,0 -chr3 17413321 . G A 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-0.570;DP=60;FS=11.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=16.55;ReadPosRankSum=3.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,32:60:99:1021,0,1033 -chr3 17413484 . A G 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:574,42,0 -chr3 17424211 . A G 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr3 17434582 . C T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=-1.681;DP=74;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,26:74:99:901,0,1664 -chr3 17451810 . C T 507.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:536,39,0 -chr3 17452936 . A C 349.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:378,27,0 -chr3 17453007 . C T 1246.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1275,90,0 -chr3 17460848 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86:238,0,86 -chr3 17598524 . T G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-3.508;DP=31;FS=8.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:413,0,657 -chr3 17598643 . T C 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.047;DP=37;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.114;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:479,0,826 -chr3 17599016 . C A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=2.172;DP=31;FS=11.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:267,0,1810 -chr3 17599020 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=1.501;DP=32;FS=11.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.501;QD=7.46;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:267,0,1810 -chr3 17637082 . T C 2302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.725;DP=126;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=18.28;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,64:126:99:2331,0,2288 -chr3 17637107 . C T 2353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=1.047;DP=136;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.31;ReadPosRankSum=-2.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,73:136:99:2382,0,2230 -chr3 17637303 . T A 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=1.889;DP=86;FS=7.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=12.23;ReadPosRankSum=-1.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,33:85:99:1080,0,1578 -chr3 17637423 . T G 2124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-2.025;DP=102;FS=2.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=20.83;ReadPosRankSum=2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,62:102:99:2153,0,1342 -chr3 17637451 . GA G 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=-0.793;DP=93;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,21:79:99:289,0,1335 -chr3 17637673 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=3.157;DP=34;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=16.46;ReadPosRankSum=-2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:588,0,578 -chr3 17638264 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=-0.392;DP=87;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:472,0,2384 -chr3 17662116 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-1.513;DP=48;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:385,0,1190 -chr3 17662184 . CG C 1524.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=-1.942;DP=251;FS=0.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,78:248:99:1562,0,5002 -chr3 17668866 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=4.724;DP=67;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=6.62;ReadPosRankSum=-3.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:472,0,2279 -chr3 17668928 . A C 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.581;DP=113;FS=7.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,30:112:99:697,0,3045 -chr3 17668962 . C A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=4.153;DP=205;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,48:204:99:1007,0,6356 -chr3 17669422 . G T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.406;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:408,0,441 -chr3 17672720 . C CA 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.750;DP=51;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:378,0,698 -chr3 17672920 . G A 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=0.856;DP=103;FS=1.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.227;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,26:102:99:534,0,2865 -chr3 17736789 . G T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=3.702;DP=65;FS=10.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=6.18;ReadPosRankSum=-3.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:430,0,3337 -chr3 17736804 . T A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=1.667;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=10.36;ReadPosRankSum=-1.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,2:38:99:422,0,3337 -chr3 17737278 . A C 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.480;DP=35;FS=10.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:673,0,594 -chr3 17758666 . A T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-0.591;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:448,0,1913 -chr3 17788645 . T C 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.127;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=21.92;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1212,0,628 -chr3 17790965 . T A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.465;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=13.86;ReadPosRankSum=2.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:638,0,1231 -chr3 17791304 . G T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-2.075;DP=36;FS=3.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:443,0,831 -chr3 17794988 . C T 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.118;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,28:112:99:635,0,3059 -chr3 17798556 . T A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=-0.116;DP=116;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=3.03;ReadPosRankSum=1.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:380,0,3547 -chr3 17798915 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-1.412;DP=67;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,27:67:99:888,0,1467 -chr3 17799022 . T C 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-0.338;DP=91;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,49:91:99:1595,0,1466 -chr3 17801408 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.997;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:367,0,2621 -chr3 17808236 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.941;DP=62;FS=4.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:357,0,1674 -chr3 17809148 . G A 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=-1.411;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=18.53;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,34:67:99:1270,0,1244 -chr3 17832185 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.973;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:405,0,774 -chr3 17833235 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=-1.256;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:508,0,806 -chr3 17834629 . CCT C 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:37:516,37,0 -chr3 17914846 . CT C 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.274;DP=98;FS=4.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.105;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:561,0,363 -chr3 17914966 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-1.031;DP=144;FS=7.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,33:144:99:670,0,4364 -chr3 17915235 . C T 1653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.611;DP=162;FS=10.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=10.21;ReadPosRankSum=-2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,55:161:99:1682,0,3399 -chr3 17916128 . C A 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=-0.854;DP=237;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,63:236:99:1507,0,6438 -chr3 17916255 . T A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=1.436;DP=247;FS=3.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,59:247:99:1199,0,7090 -chr3 18030822 . C T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.369;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:520,0,953 -chr3 18068366 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.019;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:492,0,630 -chr3 18105404 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.299;DP=114;FS=4.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.917;QD=5.92;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,29:113:99:703,0,3325 -chr3 18106240 . GA G 350.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=-0.524;DP=208;FS=0.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=1.69;ReadPosRankSum=1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,32:178:99:388,0,3609 -chr3 18108474 . G A 2466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-0.876;DP=342;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,102:342:99:2495,0,8679 -chr3 18128346 . C T 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.264;ClippingRankSum=-1.110;DP=314;FS=1.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.901;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,79:301:99:511,0,9880 -chr3 18129759 . G A 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.875;DP=308;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,56:307:99:788,0,9571 -chr3 18131698 . C A 6223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=-1.727;DP=554;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=11.23;ReadPosRankSum=1.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,186:550:99:6252,0,12605 -chr3 18131731 . CTTTGGTAAGAGATTGAG C 468.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.920;DP=685;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,5:9:99:506,113,0 -chr3 18227253 . T C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=-0.240;DP=36;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:246,0,924 -chr3 18298754 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-1.931;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=26.43;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:88:319,0,88 -chr3 18299972 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=1.683;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=33.64;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:331,0,139 -chr3 18300167 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=25.52;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:92:309,0,92 -chr3 18309040 . T A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=1.280;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,23:72:99:593,0,1815 -chr3 18334453 . C A 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr3 18342238 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.206;DP=36;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:315,0,896 -chr3 18356922 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.218;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:468,0,472 -chr3 18360767 . T TG 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-1.076;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=26.93;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:62:495,0,62 -chr3 18384202 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=24.62;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:299,0,95 -chr3 18385041 . G T 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:621,42,0 -chr3 18385410 . A T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=14.64;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:321,0,467 -chr3 18390721 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:309,0,181 -chr3 18437390 . T C 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=2.569;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=16.45;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:423,0,439 -chr3 18443845 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.924;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.331;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:472,0,799 -chr3 18462939 . T C 2147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.555;DP=91;FS=4.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=23.60;ReadPosRankSum=1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,55:90:99:2176,0,2195 -chr3 18462960 . T C 1736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.381;DP=74;FS=6.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=23.47;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,44:73:99:1765,0,2351 -chr3 18472904 . T A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:252,0,212 -chr3 18542408 . CATTCTGAAACAGGACAGAAATGATTTTAAGATAATAACATATAAACCTTTGGACA C 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=-1.883;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:532,0,1859 -chr3 18542411 . TCTGAAACAGGACAGAAATGATTTTAAGATAATAACATATAAACCTTTGGACAGTTTCAGCATATTAACCTCAC T 492.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=2.323;DP=30;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=16.42;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:530,0,1290 -chr3 18542466 . TTCAGCATATTAACCTCAC T 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-1.883;DP=30;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:532,0,1853 -chr3 18580069 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.640;DP=63;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:380,0,1852 -chr3 18587360 . TGTGCGTTCTGCATCTCTTCACAGTCTAATTGAGCTATACATTATGAAATGGAGTCGTCTGGTGAGTTTTGTGATGCGAATGTGTGTTTTAG T 1823.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=2.330;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=33.37;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1861,162,0 -chr3 18609782 . G A 1713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=1.368;DP=256;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.008;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,70:254:99:1742,0,6948 -chr3 18621372 . C A 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-0.179;DP=25;FS=4.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:506,0,259 -chr3 18622299 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.636;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:480,0,564 -chr3 18643061 . C T 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.799;DP=200;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=5.35;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,49:199:99:1099,0,5718 -chr3 18645045 . C T 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-0.657;DP=195;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.194;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,47:195:99:922,0,5621 -chr3 18645229 . T C 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.032;DP=187;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,45:184:99:995,0,5338 -chr3 18654920 . T C 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.692;DP=246;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,62:246:99:1371,0,7966 -chr3 18660457 . T A 2726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=-0.191;DP=170;FS=5.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.006;QD=16.04;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,79:170:99:2755,0,3038 -chr3 18660776 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=-1.670;DP=56;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,11:56:99:232,0,1763 -chr3 19052411 . TCACAGGTGGGTTTATGAACATCAAAAAGAGATAAGCTGTTGTTTCCACTGATGCTCGCAGTAGTTTTGACTTTGTCTCCATC T 661.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.919;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:699,0,480 -chr3 19063644 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.317;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:238,0,379 -chr3 19077765 . A T 2082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.113;DP=254;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,98:252:99:2111,0,8695 -chr3 19089861 . A G 3902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.053;DP=354;FS=5.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,116:327:99:3931,0,9043 -chr3 19161564 . AAAAGTGCTGACACTGTAGCTTTCGGCTGGATGGATGTCATATAATTGTGTTTAATAAAACTGTATCCAGTGATAGGCCTGTTGTTTATTTCTGCGTTT A 1445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.222;DP=118;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,44:117:99:1483,0,12713 -chr3 19177832 . G A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.530;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.767;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,34:79:99:1199,0,1770 -chr3 19185783 . GT G 567.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=-0.836;DP=67;FS=7.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:605,0,711 -chr3 19513988 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.891;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.978;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,31:130:99:645,0,3826 -chr3 19514320 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-3.166;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,20:92:99:381,0,3170 -chr3 19521995 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-1.140;DP=67;FS=4.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:341,0,1807 -chr3 19533570 . C T 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-2.018;DP=102;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.81;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:723,0,5776 -chr3 19537172 . A AT 930.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=-0.008;DP=56;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=16.62;ReadPosRankSum=-2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:968,0,1552 -chr3 19537251 . G C 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-0.328;DP=61;FS=6.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,26:61:99:893,0,2813 -chr3 19537389 . G T 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.998;DP=43;FS=9.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=25.58;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1128,0,387 -chr3 19540063 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.481;ClippingRankSum=0.496;DP=59;FS=2.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:329,0,1719 -chr3 19540172 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.382;DP=57;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.044;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:243,0,4012 -chr3 19540177 . T G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.995;ClippingRankSum=0.920;DP=53;FS=1.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:243,0,4012 -chr3 19540325 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.966;DP=54;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=3.74;ReadPosRankSum=-2.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:230,0,3310 -chr3 19540362 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.606;DP=50;FS=16.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:258,0,1062 -chr3 19564028 . AGTAAGTGACAGGAATTGAGCAATATGTGTCCTCGAATAATAACTGGTTGTCTTTATGCATGTTTTGATACATTTTAGTTTTTTGGCAG A 4574.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=1.992;DP=116;FS=2.077;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=29.09;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,111:115:99:4612,368,0 -chr3 19584969 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.252;DP=83;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:237,0,2420 -chr3 19603934 . G T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=-0.080;DP=73;FS=1.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.455;QD=6.39;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:495,0,1931 -chr3 19681309 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=2.170;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:235,0,978 -chr3 19697414 . A G 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.028;DP=52;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.824;QD=19.19;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,30:52:99:1026,0,782 -chr3 19697731 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-1.126;DP=40;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:345,0,1093 -chr3 19702642 . A G 840.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:60:869,60,0 -chr3 19859717 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.375;DP=160;FS=11.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,41:160:99:893,0,4714 -chr3 19932154 . G A 1925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=-1.533;DP=244;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,75:242:99:1954,0,6592 -chr3 19932601 . C T 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.235;DP=183;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,43:183:99:973,0,5317 -chr3 19932678 . A G 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-1.022;DP=232;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,62:232:99:1357,0,6550 -chr3 19940575 . G A 8384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-1.426;DP=285;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=29.42;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,218:275:99:8413,0,1006 -chr3 19945722 . G A 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-0.742;DP=277;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=6.34;ReadPosRankSum=2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,74:277:99:1785,0,7569 -chr3 19964109 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=-1.870;DP=290;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,46:290:99:481,0,9252 -chr3 19973189 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=1.416;DP=293;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,42:293:99:597,0,19986 -chr3 19973195 . T A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=2.732;DP=308;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,48:307:99:614,0,19986 -chr3 19977778 . TCCTGTATGGAGAAAAGTAATGAATTAATGTAATGATCTATAAAACATAAATTAGTTTATGTGACATGAGATGCTCTGCTCA T 14244.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.765;DP=382;FS=2.454;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=25.86;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,360:363:99:14282,1045,0 -chr3 19997876 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=4.217;DP=103;FS=12.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,23:103:99:498,0,3210 -chr3 19997887 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=4.290;DP=112;FS=11.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,18:112:99:245,0,3762 -chr3 19998247 . T C 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.824;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:1194,0,295 -chr3 19998248 . T C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.283;DP=39;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=23.05;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:927,0,650 -chr3 20059624 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:271,0,365 -chr3 20113520 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:263,0,261 -chr3 20644566 . T C 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=-0.331;DP=50;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=17.96;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:926,0,854 -chr3 20644798 . G A 1256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.556;DP=67;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1285,0,989 -chr3 20644925 . C G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-1.965;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:452,0,1821 -chr3 20645323 . G T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.213;DP=56;FS=18.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:433,0,1435 -chr3 20663604 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-1.315;DP=56;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:333,0,1547 -chr3 20663679 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=1.169;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,21:97:99:425,0,2784 -chr3 20706926 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.837;DP=69;FS=1.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:291,0,2021 -chr3 20909920 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=1.385;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=16.21;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:401,0,377 -chr3 20911496 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.023;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=15.13;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:467,0,512 -chr3 20911572 . T C 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=1.374;DP=38;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:524,0,860 -chr3 21053798 . A C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.380;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:601,0,1236 -chr3 21076561 . A G 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=-0.471;DP=48;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:937,0,694 -chr3 21076573 . A G 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.043;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:738,0,1088 -chr3 21158743 . A AC 218.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=-0.120;DP=80;FS=5.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:256,0,1599 -chr3 21165124 . A C 1796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.201;DP=154;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=11.67;ReadPosRankSum=1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,58:153:99:1825,0,3897 -chr3 21166748 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.300;DP=177;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,27:177:99:238,0,5634 -chr3 21178266 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=1.766;DP=97;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:243,0,2941 -chr3 21178455 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-0.063;DP=102;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,20:102:99:333,0,3058 -chr3 21339248 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=-1.300;DP=68;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:354,0,1839 -chr3 21345050 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr3 21351960 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.934;DP=101;FS=2.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,19:101:99:304,0,3137 -chr3 21352504 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=1.388;DP=112;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.275;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,29:112:99:629,0,3759 -chr3 21353022 . C T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=-1.800;DP=83;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:501,0,2414 -chr3 21353801 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=18.65;ReadPosRankSum=2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:308,0,266 -chr3 21354911 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.399;DP=62;FS=7.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=7.95;ReadPosRankSum=-2.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:521,0,2806 -chr3 21354957 . C T 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=-0.797;DP=77;FS=3.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=8.04;ReadPosRankSum=2.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:647,0,3165 -chr3 21355793 . C T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-0.608;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,23:85:99:480,0,2307 -chr3 21356144 . A T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=-0.884;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=7.67;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:481,0,1369 -chr3 21362699 . C A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=-0.533;DP=75;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:444,0,2072 -chr3 21397843 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.306;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.217;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,24:65:99:803,0,1388 -chr3 21397855 . G C 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.575;DP=60;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,22:60:99:720,0,1287 -chr3 21464833 . G C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=27.58;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:304,0,52 -chr3 21466384 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=1.791;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=16.83;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:247,0,260 -chr3 21472458 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.860;DP=140;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:276,0,4475 -chr3 21494643 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.628;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.527;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,16:64:99:336,0,1863 -chr3 21495935 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=-0.486;DP=104;FS=8.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,21:104:99:357,0,3602 -chr3 21495961 . T A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-1.023;DP=102;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.997 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,19:102:99:315,0,3163 -chr3 22267574 . T TTC 1344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-1.222;DP=156;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,54:149:99:1382,0,3697 -chr3 22367044 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-2.379;DP=29;FS=16.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:574,0,507 -chr3 22371687 . AT A 579.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.136;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=12.60;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:617,0,401 -chr3 22373820 . GA G 708.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=-0.383;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:2:744,0,2 -chr3 22373942 . TA T 627.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.887;DP=30;FS=2.447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=20.93;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:20:665,20,0 -chr3 22747996 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:257,0,264 -chr3 22760243 . A G 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=1.029;DP=55;FS=5.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:465,0,1388 -chr3 22760487 . TG T 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=-1.517;DP=40;FS=2.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=10.04;ReadPosRankSum=2.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:439,0,911 -chr3 22760507 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.680;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:553,0,1046 -chr3 22760573 . T G 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.642;DP=57;FS=2.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:832,0,1227 -chr3 22761964 . A C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.683;DP=52;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:575,0,1548 -chr3 22761989 . T A 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.480;DP=49;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.927;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:450,0,1231 -chr3 23106079 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.811;DP=24;FS=6.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=15.45;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:399,0,425 -chr3 23271050 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:265,0,186 -chr3 23271540 . A C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=-1.969;DP=23;FS=12.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:494,0,295 -chr3 23512082 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=10.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:319,0,454 -chr3 23517361 . AGTGAGTTTGCTAGTTTGAGGAAATGGTCATTTGACAGATATAAATCTGTTTTCACATATTAAATCTACTCCAATCTTCTGTACTTTAG A 17514.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=3.486;DP=428;FS=3.219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,419:427:99:17552,1448,0 -chr3 23518206 . T A 4935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=4.371;DP=646;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:421,195:616:99:4964,0,29293 -chr3 23518688 . A C 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.336;DP=516;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:429,86:515:99:816,0,16729 -chr3 23520273 . AGTAAGTCTACAGAACATACAAAATAATTTAGTTACTAACTAAGGAAAGGATATGTTTAGGATTTAATTGTAACTCTTTTTGATCTGTGTAACAG A 3050.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=1.723;DP=387;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,368:369:99:16893,1276,0 -chr3 23521652 . TGTGAGTGCCTAAATAACAAGAGGCCTTGTTCAATATGCATTTGTTACAAAAAGCTTTCTACATTTGATGCTTATTTTTGGCCTTTTGTGCAG T 18974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=418;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,417:417:99:19012,1551,0 -chr3 23528761 . GT G 3230.05 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.629;DP=403;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,159:360:99:3268,0,3765 -chr3 23757223 . ACTGACAATAGACACAGAAACAAGCACTTGAAAAGGGGAAGACACACTTAAATACACATGGCTGGGGAATACATCTACTGACATAC A 1662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=2.185;DP=46;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=29.00;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,40:45:99:1700,0,1712 -chr3 23763224 . TCTGCTCAAACCAATGAATAGATTACAATTCATATACATGTATATTTATATGTGTACAAATAAGCTTGTCTGTTTGATATGAGATAC T 548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=2.331;DP=17;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=32.28;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:586,0,1116 -chr3 23811105 . T C 3071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=-1.937;DP=166;FS=0.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.773;QD=18.50;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,79:166:99:3100,0,3120 -chr3 23814128 . GA G 8583.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=-1.868;DP=247;FS=3.780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=34.75;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,208:222:99:8621,766,0 -chr3 23996824 . CT C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=-0.017;DP=43;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:314,0,599 -chr3 23999321 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.310;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.967;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,22:70:99:496,0,1438 -chr3 24027489 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr3 24356672 . G A 2274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=3.260;DP=305;FS=14.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,96:305:99:2303,0,7581 -chr3 24361773 . A T 2067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-1.050;DP=159;FS=7.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=13.00;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,60:159:99:2096,0,3524 -chr3 24361964 . AT A 2389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=-3.860;DP=247;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,99:234:99:2427,0,3354 -chr3 24362142 . TA T 660.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=-0.487;DP=215;FS=11.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,37:212:99:698,0,5153 -chr3 24362183 . T TA 1528.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=-1.606;DP=220;FS=4.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,72:217:99:1566,0,4567 -chr3 24402063 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=-0.805;DP=72;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:491,0,1860 -chr3 24417917 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=31.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:278,0,58 -chr3 24419038 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr3 24488159 . G A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=-2.500;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.349;QD=23.87;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:792,0,372 -chr3 24795972 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.807;DP=23;FS=6.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:237,0,1037 -chr3 24940148 . G GCACTGCCAGT 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=2.166;DP=29;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.06;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:242,0,675 -chr3 24975580 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.150;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:276,0,247 -chr3 25040218 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=2.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:328,0,128 -chr3 25074706 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:270,0,220 -chr3 25074809 . T C 796.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=1.042;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=28.16;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:62:825,62,0 -chr3 25137647 . G C 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.825;DP=92;FS=3.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,41:92:99:1380,0,1735 -chr3 25137679 . A G 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.487;DP=100;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=14.18;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,43:100:99:1446,0,1831 -chr3 25142133 . G T 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=-0.230;DP=55;FS=21.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:747,0,1039 -chr3 25152503 . G T 773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-1.367;DP=67;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:802,0,1590 -chr3 25156226 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=-1.372;DP=56;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=6.73;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:405,0,1605 -chr3 25161062 . T C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=2.341;DP=85;FS=8.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:703,0,2274 -chr3 25161259 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.514;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:376,0,1506 -chr3 25182231 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.361;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.113;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:339,0,1345 -chr3 25203287 . TA T 1705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-0.797;DP=178;FS=4.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,75:178:99:1743,0,2148 -chr3 25222768 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.288;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=5.07;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,22:92:99:495,0,2703 -chr3 25225884 . TGTGAGTGGATCTGCTATCATACCCTTTGGGGCTTTGGTTCTTGCATATGCAGTATAGTGAGTGTTCTTTCCTCCTCTTCAG T 5155.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=1.928;DP=125;FS=2.400;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,109:112:99:5193,458,0 -chr3 25227969 . C T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.887;DP=66;FS=0.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=13.47;ReadPosRankSum=2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,27:66:99:917,0,1309 -chr3 25325624 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=1.246;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:260,0,187 -chr3 25371173 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-0.583;DP=46;FS=7.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:46:99:777,0,756 -chr3 25371377 . C CA 1496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-1.701;DP=174;FS=3.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,84:161:99:1664,0,1714 -chr3 25371502 . TA T 4302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.785;DP=154;FS=6.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=27.94;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,36:142:99:4340,0,2022 -chr3 25393035 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.270;DP=37;FS=12.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:416,0,842 -chr3 25413962 . A T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=-0.683;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:546,0,935 -chr3 25482326 . A T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.380;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.99;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:364,0,426 -chr3 25501202 . A C 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr3 25502273 . TCTACTCAAAGAAATGACAGACAGACGAGATCAAAAAATCCACAACTGAAACCAAAGCAGTTGCCTTGTATAAGCACTCTTTGAGTCATTGTTAC T 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=2.164;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=13.83;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:300,0,5008 -chr3 25505494 . G T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.279;DP=87;FS=1.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,31:87:99:1024,0,1983 -chr3 25518675 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.360;DP=59;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:419,0,1724 -chr3 25522096 . C A 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.857;DP=60;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=16.43;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,30:59:99:1014,0,979 -chr3 25538012 . G GA 690.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.262;DP=62;FS=2.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.496;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,31:56:99:728,0,674 -chr3 25538105 . G GT 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.095;DP=59;FS=10.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.381;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:582,0,2403 -chr3 25538718 . A G 2531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.722;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.891;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,77:204:99:2560,0,4316 -chr3 25538784 . G A 2014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=2.561;DP=190;FS=0.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,64:190:99:2043,0,4253 -chr3 25592298 . CCT C 566.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.180;DP=140;FS=11.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,31:125:99:604,0,3278 -chr3 25810072 . G T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-0.691;DP=28;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:497,0,465 -chr3 25810292 . CAT C 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=2.864;DP=67;FS=7.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:467,0,2127 -chr3 25914445 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=1.776;DP=77;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,24:77:99:532,0,1907 -chr3 25914553 . G A 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.419;DP=75;FS=7.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:508,0,1933 -chr3 26263764 . A T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-1.195;DP=112;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=6.45;ReadPosRankSum=2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,32:111:99:751,0,2572 -chr3 26265223 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.281;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:333,0,2937 -chr3 26578319 . T C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=-0.850;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=16.02;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:557,0,556 -chr3 26591591 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-1.361;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=11.19;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:487,0,922 -chr3 26602516 . C T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.349;DP=54;FS=5.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:664,0,1183 -chr3 26674457 . GT G 811.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.820;DP=320;FS=1.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,64:311:99:849,0,8383 -chr3 26674620 . C A 1605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.327;ClippingRankSum=1.357;DP=316;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,83:315:99:1634,0,8674 -chr3 26682983 . T C 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=-0.704;DP=87;FS=7.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:86:99:1497,0,1570 -chr3 26774781 . G A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=-1.757;DP=132;FS=0.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=13.09;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,51:132:99:1756,0,2832 -chr3 26775164 . C T 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.708;DP=106;FS=10.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,31:106:99:765,0,2592 -chr3 26778077 . G GT 803.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=-2.981;DP=125;FS=10.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,43:112:99:887,0,1638 -chr3 26788250 . G A 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=1.576;DP=122;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,37:122:99:905,0,3266 -chr3 26792555 . G GTT 432.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.490;DP=64;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=6.76;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:552,0,974 -chr3 26797218 . G A 1149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-1.532;DP=161;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,47:160:99:1178,0,4323 -chr3 26798598 . C CT 354.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=1.073;DP=106;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=3.35;ReadPosRankSum=-2.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:392,0,1886 -chr3 26868149 . G A 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.260;DP=50;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,19:50:99:638,0,1096 -chr3 26877418 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:274,0,235 -chr3 26877551 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,470 -chr3 26884728 . ACTGCAAGGTACAAAGTAAGAATGATAAGTCCGTCTGCGCATGTTTGTTCATGAGCTGCCTATTAAATTTAAAATGACTTAC A 13905.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=310;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,309:309:99:13943,972,0 -chr3 26909269 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.112;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=4.58;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:294,0,1858 -chr3 26974747 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,108 -chr3 26990541 . C CT 536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.006;DP=77;FS=2.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,24:69:99:574,0,1113 -chr3 26999059 . G T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-2.112;DP=91;FS=6.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=5.38;ReadPosRankSum=2.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:518,0,2261 -chr3 27001810 . G T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=-4.234;DP=48;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=4.37;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:238,0,1422 -chr3 27012636 . G A 2115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=3.586;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=24.89;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,57:85:99:2144,0,759 -chr3 27014664 . T G 1334.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1363,99,0 -chr3 27015133 . T C 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 -chr3 27027192 . TCTGTTTGTCAACAACACATTATGGTCAACACGAATAGATAATACGTCATGTTCTTACAGACTATGAGCTAGACTTAC T 11967.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=3.599;DP=323;FS=4.815;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=31.79;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,308:317:99:12005,912,0 -chr3 27031733 . G T 3298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=2.246;DP=465;FS=13.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=7.09;ReadPosRankSum=3.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:337,126:463:99:3327,0,24066 -chr3 27092200 . A T 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:405,30,0 -chr3 27093053 . C G 230.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:259,0,17 -chr3 27095953 . CAT C 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.226;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=12.43;ReadPosRankSum=2.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:373,0,672 -chr3 27120692 . G A 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=1.074;DP=67;FS=5.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:1032,0,1311 -chr3 27203351 . C T 5704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=1.142;DP=461;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=12.37;ReadPosRankSum=3.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:343,112:455:99:5733,0,11549 -chr3 27203414 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.915;DP=355;FS=12.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.601;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,91:354:99:867,0,23460 -chr3 27205956 . G T 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.272;DP=230;FS=10.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,41:228:99:626,0,7563 -chr3 27758096 . T TC 598.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.680;DP=69;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,27:64:99:636,0,850 -chr3 27846420 . A G 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=1.025;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.786;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:358,0,984 -chr3 27918118 . G GA 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=-0.492;DP=214;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,34:185:99:333,0,3309 -chr3 28847101 . T C 705.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=-0.274;DP=20;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=28.71;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:733,11,0 -chr3 28904529 . C G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.026;DP=35;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.186;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:467,0,426 -chr3 28904540 . A C 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.775;DP=39;FS=6.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.952;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:578,0,450 -chr3 29487668 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:230,0,60 -chr3 29788019 . G C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr3 29788144 . G C 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:328,27,0 -chr3 29788243 . A G 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 -chr3 29788310 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr3 29789401 . T C 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr3 29791125 . A G 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr3 29792141 . T A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-4.636;DP=445;FS=23.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=1.79;ReadPosRankSum=4.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:365,75:440:99:826,0,13169 -chr3 29793884 . T C 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=-0.594;DP=560;FS=0.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=1.78;ReadPosRankSum=-1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:468,91:559:99:1025,0,17843 -chr3 29800288 . G A 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.818;DP=552;FS=7.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=1.47;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:466,85:551:99:838,0,17655 -chr3 30093664 . AAGGTGTGTGAACGACTTGTAAATCTGGACAGCTGTCAACCTGATTACAAACCCTAAATTATTGTGTCTTGCTATTTGTCCAC A 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.935;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=34.20;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:99:516,0,289 -chr3 30101714 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-1.705;DP=102;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:269,0,3375 -chr3 30102330 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=1.214;DP=101;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.923;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:436,0,8287 -chr3 30102457 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.775;DP=107;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:588,0,3128 -chr3 30125664 . ACTACATTTAGGGAAAGTAATGGAAAGAGGTGAAAATGAAATATTCTTTTAAAAATCAGTTATTTAGCATTTCAGCAAAGAGACTAGAGAGTGTTACATGGTGTTGATATCTTAC A 4518.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=1.662;DP=100;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=26.28;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,98:100:99:4556,401,0 -chr3 30128155 . G GT 509.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=-0.774;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.977;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:547,0,4801 -chr3 30128156 . C CTG 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,0:3:99:544,0,4801 -chr3 30291881 . CT C 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.647;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:249,0,1286 -chr3 30354139 . C CA 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-1.578;DP=115;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,35:112:99:526,0,2076 -chr3 30638239 . ACTTATAAAACAAACAAGATCATCAGAATTGAGATGGCAGAAATGTAAAGAGAAGGTATAAACAGACTCCTCCAACTCAC A 4832.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=1.700;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=23.86;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:4870,364,0 -chr3 30654940 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.865;DP=17;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=16.87;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:315,0,230 -chr3 30662130 . TGA T 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.57;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:64:313,0,64 -chr3 30815589 . G GA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.774;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=15.47;ReadPosRankSum=-1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:81:393,0,81 -chr3 30848818 . A AT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=-0.400;DP=23;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:248,0,367 -chr3 30866396 . ACTGTATGTGGAGGAAAAGAGTGAGACACCAATGTCATCATCATCTCACTTCTTTTTTTCCTATGCAGTATGAAATTCTATCCCTTAC A 739.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=1.542;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.735;QD=29.26;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:56:777,56,0 -chr3 31041592 . TA T 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.224;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:556,0,906 -chr3 31220565 . CT C 2406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.105;DP=350;FS=2.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=6.88;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,117:305:99:2444,0,4946 -chr3 31220721 . G GA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-0.477;DP=112;FS=8.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,28:97:99:347,0,1366 -chr3 31235550 . TCTGTGAAAACATATGGTTTGATGTATTAATGTTTAAGTGTATAATAAACTTGCAGCCTAAAGCCGCTAAACATAAAACAACAATCAATAAC T 1473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=1.949;DP=38;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=29.86;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,35:38:96:1511,0,96 -chr3 31247936 . AT A 605.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.406;DP=38;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=15.94;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:643,0,472 -chr3 31272309 . GCTGTAGTAAAACACAGTTTTAGTTCAGGCTAAGCTAAACAGTAAATTAATCAATAACAATTATAGAAGCAAATCAACAACAACAAACTAAC G 584.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=1.694;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=6.03;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:92:99:622,216,0 -chr3 31277702 . T A 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-1.410;DP=72;FS=12.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:1068,0,1382 -chr3 31279613 . G C 2454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-2.252;DP=121;FS=1.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=20.29;ReadPosRankSum=1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,74:121:99:2483,0,1548 -chr3 31391372 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,148 -chr3 31826483 . TGTGAGCCCAACAAAACCCCTTTAAGATCATTTTATCGTTTGCTGCCCTCTAGTGCTGAGTAACACCATGACATCTGCTTGTGTCCTGTCCCGTAG T 256.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=3.010;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=5.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:99:294,122,0 -chr3 31930691 . G C 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.809;DP=318;FS=11.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=2.02;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:264,53:317:99:671,0,9432 -chr3 31934484 . C G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=-3.858;DP=272;FS=5.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,40:272:99:374,0,9037 -chr3 31941349 . C T 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.524;DP=211;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=4.01;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,47:211:99:875,0,5728 -chr3 31959863 . A G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.603;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:501,0,739 -chr3 31986855 . G T 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.096;DP=165;FS=6.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,47:165:99:1150,0,4580 -chr3 31987095 . G A 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.132;DP=67;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:484,0,1899 -chr3 32016937 . T TA 356.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.485;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.602;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:394,0,694 -chr3 32021453 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=-1.060;DP=98;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.431;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:350,0,3051 -chr3 32061152 . TCTATAAAACGAATAATAAATATAATAATGATGACATCAGTTTAACAGCGGCTAGTTACATAAAACACATGAAATACGGACATAC T 5643.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.639;DP=133;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,123:125:99:5681,466,0 -chr3 32224431 . T G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.568;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:259,0,874 -chr3 32224745 . GAGGTCTGGTCACTTTTTTGGACGTCTGTCGGTTGTCTTGATCTGTCCTTTCCCTTCCTTTATTTTCTTCTCTATTTTCTGTCT G 2052.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-1.021;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,51:55:99:2090,122,0 -chr3 32243020 . T G 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.611;DP=81;FS=52.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=12.18;ReadPosRankSum=4.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:1015,0,1740 -chr3 32257092 . T C 1997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=2.950;DP=111;FS=6.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=18.00;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,60:111:99:2026,0,2641 -chr3 32257121 . T G 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=2.421;DP=75;FS=19.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=10.97;ReadPosRankSum=-4.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:851,0,1812 -chr3 32272656 . G T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-1.275;DP=45;FS=28.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.310;QD=17.75;ReadPosRankSum=-2.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:827,0,783 -chr3 32272670 . T G 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-1.769;DP=48;FS=31.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=17.97;ReadPosRankSum=2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:891,0,1323 -chr3 32272679 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.214;ClippingRankSum=0.155;DP=46;FS=10.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:343,0,2415 -chr3 32277873 . T C 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-1.716;DP=93;FS=4.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,26:93:99:598,0,5011 -chr3 32364738 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=1.284;DP=35;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:367,0,1698 -chr3 32364750 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=-1.002;DP=38;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:349,0,1698 -chr3 32365181 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.228;DP=34;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:271,0,1413 -chr3 32365182 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=1.673;DP=34;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:742,0,736 -chr3 32524399 . T C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.424;DP=244;FS=4.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.091;QD=3.43;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,49:243:99:865,0,7037 -chr3 32537450 . GA G 802.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.512;DP=167;FS=6.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,47:142:99:908,0,1831 -chr3 32560609 . GCAGGTAAGTGCATGCTATCATTACCACTGTATGTGATGTGTCTTTTATGTGGCAATCTCCCTCTAATGGATGCTGCATCTCCA G 1750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=1.784;DP=49;FS=1.688;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=31.99;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,43:49:32:1788,32,0 -chr3 32594776 . G GT 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=-1.463;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,18:46:99:420,0,672 -chr3 32647631 . CAGGTGATCAGTGAATCTGCTTCATGCTTACCTATTGGACTGTGAGTTATTACTTAGCTGTTGCTGTAGTGTCATGGTTCTTTATTTTGTCTTTGGCT C 1778.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=2.829;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.777;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:99:1816,160,0 -chr3 32653964 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.648;DP=61;FS=2.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=5.19;ReadPosRankSum=-1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:345,0,1695 -chr3 32663975 . C T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-3.496;DP=211;FS=13.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.136;QD=1.82;ReadPosRankSum=-6.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,29:211:99:412,0,13086 -chr3 32672640 . CGTGAGTTTGAACTTTACACTGTTTATGCAACAATAATCCATGCGCATTTAAATAACATATTTTACACATCTAGTCCTTCCTCTCACTTTTAGTTTTTCTGTCTTTTTGTGTTTTTTCAAG C 5723.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=2.067;DP=132;FS=1.294;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=32.19;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,123:132:99:5761,484,0 -chr3 32724203 . CT C 939.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.482;DP=65;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,40:58:99:977,0,234 -chr3 32726413 . C CT 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=-1.967;DP=80;FS=10.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.967;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:241,0,1426 -chr3 32790947 . AGTGAGAGACTGTCAATAACTATTTAGATTCACCTGCTCATTCTCACACGCTCATTGCTCAGTTAGTTTTATGACTTTCATTAATCTGTGAACTGCCTCAGTTGTTTGTGCAATGTCTTATTCCACACAG A 7806.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.565;DP=184;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=27.48;ReadPosRankSum=1.658 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,178:184:99:7844,656,0 -chr3 32878411 . AT A 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=2.007;DP=18;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=12.04;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:254,0,142 -chr3 33002025 . GGGTAATGTTTGCCAGGGATTCAGATTGTGAAGATGCCTGTTCAGATATTTAATCATGTCCCTGTATTTCA G 979.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=1.898;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.991;QD=28.91;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:99:1017,0,598 -chr3 33002127 . GAGGTACAGCATGCTCAAGAGTTTACTTTTTGGCTAATAAAAATATAATAATAACAAATACCTAAAGTAATTGTCCTTTC G 823.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=1.199;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:861,0,415 -chr3 33005309 . AAGGTAAGAGTAAACATTTTATTTGCTGACAGAGGGAGATTTATTTTGATGTTTGTAATCCTGGTTCTCTTTGTC A 872.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=2.718;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=34.91;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:99:910,0,733 -chr3 33098515 . C CTG 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.897;DP=54;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.235;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:646,0,476 -chr3 33586100 . GGGTGAGAGATATGCTCACCCTTGATAACTGTTGAATGCAAATATGTGAGATTTATTTAGATTTTTTCCATTTCTCTCCCTTCCCATA G 9611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=2.429;DP=248;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=35.54;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,246:248:99:11067,896,0 -chr3 34016472 . T A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.970;DP=157;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=13.91;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,67:156:99:2212,0,2771 -chr3 34026607 . G T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.681;DP=57;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:300,0,1486 -chr3 34257377 . C CA 1012.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=1.355;DP=204;FS=2.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,55:193:99:1050,0,4519 -chr3 34259386 . G GA 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.501;DP=47;FS=1.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:415,0,1233 -chr3 34259656 . CT C 488.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=-0.264;DP=58;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=8.43;ReadPosRankSum=0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:526,0,674 -chr3 34265415 . CA C 750.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=-1.015;DP=58;FS=5.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=12.94;ReadPosRankSum=-4.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:788,0,2113 -chr3 34265421 . A G 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.690;DP=55;FS=7.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=13.81;ReadPosRankSum=-4.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,20:54:99:788,0,2108 -chr3 34267214 . A T 2377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-1.372;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,38:91:99:2406,0,4087 -chr3 34322626 . TGGTAGCATATTTCATTTTCTTTTCTTTGTTTATTTTTTACTGCCAAAGAGAACCCTTTAGTAACAATTGTTTACATTTTTTTTTACTTTTTGGCAACA T 9400.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.968;DP=268;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=29.91;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,232:239:99:9438,726,0 -chr3 34363644 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.604;DP=48;FS=4.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:536,0,1052 -chr3 34546838 . TCCTAATGGAGATTAGAAAGAACCAAATAATATCACCATGTTTTCAATGAACTACGAATGTTTTTTTTCTTGTAGTGCAAGCTTA T 6322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.469;DP=144;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:6360,471,0 -chr3 34766619 . GGTGGATTTAAAAAAAAAAGACTGAATAAACA G 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-1.449;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:286,0,3314 -chr3 34838575 . C CT 288.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.462;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:326,0,327 -chr3 34889492 . G T 1555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-0.990;DP=184;FS=0.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,65:182:99:1584,0,4472 -chr3 34908659 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:242,0,60 -chr3 34908740 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=24.86;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:252,0,57 -chr3 35077201 . CCAGGTCTGTTGAGCATATCAAACACCCAGAGACAAAAACTCAAGATTCCCACACAGCATTTAATCTTTGATATGGGATTTCCATA C 2109.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=1.616;DP=398;FS=9.480;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.996;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,383:389:99:2147,767,0 -chr3 35497763 . ATG A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.290;DP=27;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:320,0,549 -chr3 35499686 . AGTAAGTATGCATGTCAAGACACTGACAGGCTTTTTTAATTGGTTTCAGAATCAATTCTAACATTAATCTCTATTTGTTAG A 3842.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=1.261;DP=97;FS=5.666;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=31.12;ReadPosRankSum=-2.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,94:97:99:3880,301,0 -chr3 35503531 . G GA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.749;DP=102;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=2.05;ReadPosRankSum=-2.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,21:91:99:246,0,1809 -chr3 35504342 . CCAGGTGAGAAGTATTAAATAGCTTTTTTTCCCATTTAATTTGAACATTAGCTTATTTATATTTGATTATTTGTATTTTG C 5363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=3.177;DP=163;FS=4.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=32.91;ReadPosRankSum=-3.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,134:145:99:5401,0,1424 -chr3 35595438 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.443;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:325,0,3092 -chr3 35616031 . AT A 1003.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=-1.155;DP=72;FS=3.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,44:71:99:1041,0,578 -chr3 35616313 . CT C 931.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.328;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,46:79:99:969,0,588 -chr3 35621530 . AGATTAGCTTAACTAAAAACAATAGCGCATACCATG A 2163.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.852;DP=364;FS=0.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,103:348:99:2201,0,22819 -chr3 35636504 . G T 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-1.032;DP=179;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,31:178:99:524,0,11396 -chr3 35669027 . G A 270.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr3 35719269 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=-0.753;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:274,0,1235 -chr3 35720413 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-0.830;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:518,0,373 -chr3 35733299 . GCCTACAGATAGTATGCAAACAAAGCAAATTACATCTGGACGTCATTGAATGTTTTTGTATATGTGTATGTGTGTTCATGGCAAACCCA G 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=2.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=24.06;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:350,0,376 -chr3 35931812 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=1.519;DP=110;FS=7.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:99:521,0,3433 -chr3 35935774 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.099;DP=82;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,19:82:99:396,0,2418 -chr3 36128179 . G T 1332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=1.301;DP=167;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,53:167:99:1361,0,4224 -chr3 36131031 . AGTAAGACAAACATGCTTTACAGGCTCTCCTGTACTCTTAAAAAAGGTCTTCAGTTATAGAAATCTCATGCAAGTTATTTAACATGTTTTGTAACAG A 8630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=4.162;DP=195;FS=3.863;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=29.64;ReadPosRankSum=-3.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,188:194:99:8668,642,0 -chr3 36209368 . T TA 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.775;DP=285;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,50:270:99:364,0,6079 -chr3 36233318 . CT C 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.502;DP=87;FS=6.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=1.364;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,32:71:99:427,0,781 -chr3 36241357 . C T 865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.666;DP=226;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,47:224:99:894,0,6834 -chr3 36291625 . CAGGTAAAAAAAATTATTTGAATTATAAATATATGCATCAAATATAAATATAAATCTGTTTACTGTGTCGACACATGAACCATGTGCCTCTGT C 426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.757;DP=112;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,94:96:99:464,192,0 -chr3 36291775 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.408;DP=107;FS=4.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:657,0,3002 -chr3 36445575 . T A 860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-1.561;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=33.78;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:60:889,60,0 -chr3 36724578 . G A 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.246;DP=254;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,54:253:99:1052,0,7715 -chr3 36730352 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.044;DP=222;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=2.15;ReadPosRankSum=-1.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,38:222:99:506,0,9703 -chr3 36730816 . T A 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.324;DP=143;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=3.29;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,29:143:99:499,0,5135 -chr3 36730957 . G T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.332;DP=159;FS=1.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,29:157:99:470,0,5081 -chr3 36749082 . CA C 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=-0.173;DP=72;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,29:64:99:529,0,634 -chr3 36762708 . TA T 615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=-1.272;DP=56;FS=1.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.805;QD=11.00;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:653,0,652 -chr3 36765428 . GA G 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.153;DP=36;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:325,0,371 -chr3 36766214 . C G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=1.001;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:415,0,1363 -chr3 36807952 . CCCTAAAAGAAAGTGTTAGCAAAATTATGTATTTAATGGATGCAAATATATATTTTAATGATGTTCCTACATTTA C 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.97;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:337,0,364 -chr3 37663736 . G GT 942.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-2.172;DP=258;FS=7.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,70:237:99:980,0,4561 -chr3 37746290 . A G 2040.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2069,153,0 -chr3 37746388 . G T 1184.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1213,84,0 -chr3 37753024 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.935;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,227 -chr3 37753881 . G A 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=2.707;DP=46;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=15.86;ReadPosRankSum=-3.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:758,0,673 -chr3 37753911 . A C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.227;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=23.04;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:83:466,0,83 -chr3 37775980 . GCTAAAGCAAAACCACAACAGAGACACATGGATGAGTAGCAGTACATTGCCATCCAGTGGGCCTTTCTGATCATAGCAGGAGACGGTGGTGATGTTATCATTCTTAC G 6125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=1.784;DP=167;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=25.73;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,149:154:99:6163,445,0 -chr3 37784024 . G A 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=4.463;DP=49;FS=32.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=12.75;ReadPosRankSum=-3.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:653,0,1754 -chr3 37784027 . C A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=2.917;DP=31;FS=8.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=17.41;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:99:568,0,2072 -chr3 38762167 . ACTAAAAAAACCACACGTGTGTGAAAACACGATACAGCCAAACTGCAAACTGAACTTGTTTAAAACTCACACAACAAACACAC A 3263.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=2.909;DP=77;FS=2.244;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=29.67;ReadPosRankSum=-2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,74:77:99:3301,276,0 -chr3 38908099 . T G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-2.581;DP=105;FS=14.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:388,0,2800 -chr3 38909201 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=20.67;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:421,0,381 -chr3 38909289 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.392;DP=33;FS=1.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:374,0,741 -chr3 38909489 . C T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=1.335;DP=49;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.811;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,13:43:99:346,0,1141 -chr3 38909701 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.520;DP=27;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:439,0,399 -chr3 38910190 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.353;DP=144;FS=3.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,21:137:99:263,0,4635 -chr3 38967076 . T G 1060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.294;DP=81;FS=6.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.101;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,30:66:99:1089,0,1243 -chr3 38967137 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.732;DP=19;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:256,0,398 -chr3 38967587 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=9;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:232,0,60 -chr3 38967657 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.181;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,433 -chr3 39127686 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.091;DP=53;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:312,0,1837 -chr3 39176249 . A AT 1586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.996;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=33.98;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:1624,0,438 -chr3 39229511 . A C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.56;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,164 -chr3 39234151 . C T 1050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.167;DP=277;FS=0.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.646;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,58:276:99:1079,0,8373 -chr3 39309702 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=-1.909;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:303,0,894 -chr3 39574587 . TGGTAATGTTGAGTCAATCTTCTGTCAACATTGCATTAAGTGATATGATATGTAAACTAATCTGTATTATCTCTGTTTA T 1642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.591;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,43:47:99:1680,0,994 -chr3 39659284 . C T 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=1.962;DP=118;FS=0.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.449;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:863,0,4316 -chr3 39682719 . GT G 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-1.663;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:80:259,0,80 -chr3 39682979 . GA G 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-1.232;DP=51;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=4.03;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:243,0,936 -chr3 39683530 . TA T 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.600;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:289,0,618 -chr3 39684713 . A AT 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-1.915;DP=128;FS=2.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,23:125:99:433,0,2688 -chr3 39686776 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.431;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=9.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:270,0,671 -chr3 39953582 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=-0.138;DP=62;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:235,0,1892 -chr3 40153469 . TCTGCAGTCAGGCTAAGGTTAAAGTGTGGATCACATTTAATAGATAAAGATACAGACTGACTGAATGAGCCTGAAGGATAC T 9686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=2.620;DP=252;FS=1.651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=30.03;ReadPosRankSum=-0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,244:250:99:9724,713,0 -chr3 40201934 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.113;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=20.52;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:377,0,862 -chr3 40202030 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:234,0,58 -chr3 40202084 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.871;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=11.54;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:432,0,841 -chr3 40202421 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.553;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,22:120:99:304,0,3750 -chr3 40211240 . GACCTGTCGAGTGTAACATGAAATAAGAGATGTGATCATCTATCTCTGTATAAACAGGTTTGTTTTTTTATCTCTTATTTTGTCAATTTT G 5369.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=1.705;DP=130;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.266;QD=28.00;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,129:130:99:5407,422,0 -chr3 40213691 . TC T 3474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.609;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.882;QD=24.82;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,112:125:99:4497,0,764 -chr3 40213693 . TTAAAAAGGAAAGAGAGAGGGTGATCATAAGTATGATTCATCTACATCAGAATATTTTTATAAAATAGATCAAACAGCAGACTAAACTCACC T 4117.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=-2.240;DP=144;FS=7.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,108:144:99:4155,0,1223 -chr3 40262871 . C T 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-3.088;DP=267;FS=9.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.001;QD=3.43;ReadPosRankSum=3.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,58:267:99:943,0,10654 -chr3 40262967 . TCCTGAAAAACGAGAGACAGCGAGTTGTTACAGTATCTTTGACCTTGATTCAGTTTTACAAAATCAAACCAAACTCA T 10297.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.269;DP=229;FS=2.672;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.36;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,222:224:99:10335,981,0 -chr3 40521574 . TCTGTGGAGAGACGGATGATTAGCACGAGTTGCCACACATGTGGTTCAACTGTGAGGTAAAGGTCAAAGCTTAGACTGCAGCTCAC T 12977.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.593;DP=292;FS=3.100;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,291:292:99:13015,1137,0 -chr3 40522892 . CCCTGTAATGCAAGGACACAAGCGTTACATTTTGTGAACTACTTGAGAAAGTTCTCAGTTTGGGTCAGAATCAAACTAATCGGTCTTCTCA C 21320.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=384;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,369:369:99:21358,1796,0 -chr3 40799060 . C T 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=1.494;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=11.39;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,1:29:99:404,0,1419 -chr3 40816614 . T TA 727.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,19:29:99:765,0,523 -chr3 40943396 . TCTGAAAAGAAAAATATACATTCTTCATTAAAAAACAAAACAGCCTCATGTGATGACTGACCATCAGTGAACCAAC T 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:346,0,321 -chr3 41698266 . T A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=-1.442;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:274,0,1038 -chr3 41715382 . AGTAAGTGTGACCTTAGTCGAATTTCGTAGCACATGTTCCTGATTTGAATGCATTTGAACTAGAATATAATAACTTACGCGGAAACCTGTTGTCTTCAG A 16801.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-0.568;DP=410;FS=3.835;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=32.06;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,389:395:99:16839,1455,0 -chr3 41716340 . G GACAGCATTAAT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=1.244;DP=441;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,33:397:99:329,0,15379 -chr3 41716703 . G GCA 11592.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=-0.453;DP=382;FS=2.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,280:355:99:11630,0,2060 -chr3 41917661 . TGGTAAGTATACCAAAACATTTTTACATATATTGGTATTAAAACTGAAAAGGATCATTGAGAATAGAAACTAATGGTTTTTGTTTCTTCATTGCA T 1777.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=2.177;DP=325;FS=1.183;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,291:302:99:1815,610,0 -chr3 41917840 . AAGGTGAAAAAACCATTCAACTATTGTGATGTTAGTTTGAAGATATTAGCAGACTTTGTTGACTTTCTTTAATCTTTATATAAT A 12330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.457;ClippingRankSum=2.732;DP=315;FS=0.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=31.05;ReadPosRankSum=2.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,287:305:99:12368,0,220 -chr3 42780496 . GCTGGGACAGCAGGAGGAGGAGCATCAGCTGAGAGTCTTTCTGCAGTATATTGAGATAGTCATGTTTTAACTTAC G 6829.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=3.792;DP=248;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=27.54;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,168:248:99:6867,0,22713 -chr3 43559707 . ACTGAAACACAGAGAGCGAGAGAACAGAGTGAGTCTCTGTTGTTGTTCCTCAGTCTCCTGTGGTTTGAGTTCCTAC A 2629.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=1.436;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=28.94;ReadPosRankSum=-2.410 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,60:63:99:2667,231,0 -chr3 43655259 . A G 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=-1.645;DP=24;FS=3.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=16.49;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:424,0,434 -chr3 43655376 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:336,0,159 -chr3 43695848 . GCTGCAAAGGAGACAGAAATGACAAGGTGAATCACAAACACGACTTAATCTGTTATGCTGATAGTCATCAAACAGAAAGCACACTTCAGTAC G 7748.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.001;DP=173;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,168:172:99:7786,694,0 -chr3 44043050 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.633;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,138 -chr3 44269730 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.507;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:350,0,2015 -chr3 44314644 . G A 962.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=-1.822;DP=299;FS=4.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=3.22;ReadPosRankSum=4.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,56:282:99:991,0,8828 -chr3 44315332 . C A 1008.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.634;ClippingRankSum=0.635;DP=199;FS=79.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=5.07;ReadPosRankSum=-4.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,40:198:99:1037,0,13646 -chr3 44315548 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.014;DP=301;FS=19.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,43:214:99:831,0,6797 -chr3 44315631 . C CA 282.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.48;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:31:430,31,0 -chr3 44317386 . G A 818.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=1.103;DP=26;FS=3.882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=31.49;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:66:847,66,0 -chr3 44317844 . C G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-0.473;DP=126;FS=18.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.582;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,22:115:99:401,0,3761 -chr3 44317999 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=7.042;DP=191;FS=94.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=1.76;ReadPosRankSum=-4.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,33:181:99:364,0,11492 -chr3 44318004 . G GT 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=6.797;DP=215;FS=89.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=2.60;ReadPosRankSum=-4.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,39:202:99:597,0,4996 -chr3 45408148 . T TTTGAGCCTC 1629.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,0:11:99:1668,0,1180 -chr3 45411241 . C CT 732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.045;DP=229;FS=2.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,68:201:99:978,0,2912 -chr3 45752671 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=-0.102;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:415,0,856 -chr3 45752719 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-1.116;DP=45;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:270,0,1196 -chr3 45754559 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=-0.194;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:256,0,550 -chr3 45816203 . T A 5302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.001;DP=671;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=7.90;ReadPosRankSum=1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:458,206:664:99:5331,0,17462 -chr3 45854846 . C G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.797;DP=46;FS=2.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=12.63;ReadPosRankSum=2.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:609,0,1027 -chr3 45854891 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.811;DP=39;FS=7.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:300,0,1045 -chr3 46192330 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr3 46404552 . A G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.92;ReadPosRankSum=-1.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:363,0,196 -chr3 46837457 . G GT 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=-0.639;DP=115;FS=16.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:319,0,445 -chr3 46838302 . G GT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-2.964;DP=220;FS=7.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,44:177:99:274,0,3560 -chr3 46838479 . G GT 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.855;DP=286;FS=7.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,61:269:99:730,0,5748 -chr3 46839575 . G GT 1225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-3.460;DP=299;FS=12.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,85:257:99:1263,0,4111 -chr3 46841020 . ATG A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=1.539;DP=293;FS=0.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,30:182:99:283,0,3899 -chr3 46844112 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:316,0,57 -chr3 46958513 . T A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.283;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:44:444,0,44 -chr3 47345241 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=25.31;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:332,0,90 -chr3 47360376 . A G 479.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:508,39,0 -chr3 47496702 . TA T 1556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-2.561;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.136;QD=23.59;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:1594,0,1351 -chr3 47498578 . T C 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=22.69;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:482,0,261 -chr3 47498765 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-1.336;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:509,0,715 -chr3 47499510 . C T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=-0.592;DP=63;FS=3.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=7.27;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:486,0,1672 -chr3 47681435 . G A 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=-1.407;DP=67;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:806,0,1360 -chr3 48060022 . TTC T 6466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=2.060;DP=713;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=9.07;ReadPosRankSum=-6.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:451,226:677:99:6504,0,18219 -chr3 48060558 . G GA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=-0.580;DP=34;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:278,0,416 -chr3 48060975 . CGTGAGTATCATCTTTGACATTGCTATTTGACATTTTTTTTATTGGTTTGTGTGTAGAGGTAATCACTAGGCTGTTCTTTTAAACTCAATAG C 17934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=5.593;ClippingRankSum=4.843;DP=434;FS=5.783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.232;QD=31.58;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,403:434:99:17972,1131,0 -chr3 48061157 . GCAGGTGAGTAAGATGACTTTAGTATACCAATGTCTTAAATGTTTCGGAAGTTTAATTTTTATTAAAGGAAAAACAGACACCAATGTTAAATAATTTTACAAGCATTCTATGCAATTATATTAGTAGTAATAAAGCATAGATGTAACAAAATTAAAGAATTATGCTTATTTCTGATTAATTT G 13948.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=2.588;DP=337;FS=1.056;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,323:337:99:13986,1271,0 -chr3 48061970 . TA T 2280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=-3.062;DP=269;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,110:253:99:2318,0,3005 -chr3 49788294 . TA T 275.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=22.99;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:5:312,5,0 -chr3 50281163 . T A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=-2.850;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:541,0,2717 -chr3 50282405 . T A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.075;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:768,0,764 -chr3 50282876 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=-0.053;DP=85;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:257,0,2077 -chr3 50283137 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.106;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:233,0,1163 -chr3 50285676 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.776;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:360,0,332 -chr3 50311103 . TG T 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-1.796;DP=31;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=10.09;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:350,0,677 -chr3 50616324 . G GA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-0.243;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:272,0,1799 -chr3 50617108 . T A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=-2.250;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:446,0,3808 -chr3 50617109 . T G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-2.615;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.520;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:446,0,3808 -chr3 50618186 . CT C 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.566;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:260,0,117 -chr3 50620193 . A G 741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.278;DP=42;FS=11.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=17.66;ReadPosRankSum=1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:770,0,955 -chr3 50674849 . G GA 653.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=3.633;DP=46;FS=3.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.019;QD=14.21;ReadPosRankSum=-3.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:825,0,167 -chr3 50675023 . CA C 1279 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.751;DP=56;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,45:52:12:1316,0,12 -chr3 50719540 . A G 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=1.157;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.931;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:680,0,723 -chr3 50719950 . G A 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.767;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=32.42;ReadPosRankSum=-0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:75:1487,0,75 -chr3 50799576 . C G 1349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-2.266;DP=95;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1378,0,1963 -chr3 50799673 . G GA 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.540;DP=153;FS=8.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.420;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,47:135:99:760,0,2228 -chr3 50838952 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.022;ClippingRankSum=1.066;DP=31;FS=1.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:249,0,1684 -chr3 51776412 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=1.454;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:515,0,1575 -chr3 51785406 . C T 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.938;DP=29;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:623,0,1138 -chr3 51785412 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-0.065;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=20.34;ReadPosRankSum=-0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:618,0,1138 -chr3 51785549 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=2.723;DP=55;FS=6.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=8.07;ReadPosRankSum=-2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:472,0,1492 -chr3 52066665 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=23.14;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:329,0,490 -chr3 52066675 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=25.06;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:329,0,490 -chr3 52276949 . A C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.970;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:384,0,757 -chr3 52499250 . G A 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=-0.241;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,25:53:99:827,0,972 -chr3 52511787 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:271,0,140 -chr3 52512390 . G C 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-2.160;DP=54;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:464,0,1446 -chr3 52941437 . AG A 271.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 -chr3 52941605 . C T 1847.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1876,132,0 -chr3 53196292 . A G 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=2.779;DP=55;FS=15.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,28:54:99:880,0,827 -chr3 53311958 . G A 1267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.449;DP=52;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1296,0,687 -chr3 53335393 . T A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.749;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=18.27;ReadPosRankSum=4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:485,0,302 -chr3 53337427 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=2.821;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:460,0,468 -chr3 53365582 . TGTAAGTCTAAAGTCTCTGTCACATTTTTGGTTTTTGCATCGATTAAAGATCTGTTCATGCTGGCTATTTCATCTCCAACTCTTTGCAG T 1151.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=1.065;DP=27;FS=2.876;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=28.15;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:99:1189,107,0 -chr3 53371717 . G GT 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=1.544;DP=40;FS=4.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:320,0,576 -chr3 53589915 . CGT C 454.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-0.422;DP=93;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,22:84:99:492,0,2251 -chr3 53592482 . G C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.031;DP=49;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=12.20;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:626,0,1091 -chr3 53605254 . G C 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=-1.253;DP=161;FS=0.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,45:161:99:1015,0,6776 -chr3 53605385 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-2.023;DP=101;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=5.37;ReadPosRankSum=-2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:571,0,2887 -chr3 53605408 . CGTGAGTCCTGCATCACAGAGCCTTTTACAGGACGTTCTGCTGGAGTCATTTCTGATTGTTGATGTTCTCTTTTAG C 5537.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.256;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=31.20;ReadPosRankSum=-1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,118:120:99:5575,439,0 -chr3 53611917 . T G 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-4.256;DP=123;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.241;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,34:123:99:794,0,3032 -chr3 53618281 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-2.580;DP=58;FS=1.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=8.32;ReadPosRankSum=2.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:511,0,1793 -chr3 53638394 . CT C 874.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.362;DP=241;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,62:230:99:912,0,4360 -chr3 53638774 . CT C 587.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=-1.371;DP=151;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,39:137:99:625,0,3809 -chr3 53639067 . C T 2420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-0.834;DP=391;FS=0.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=6.19;ReadPosRankSum=2.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,106:390:99:2449,0,10541 -chr3 53685925 . C T 1631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.850;DP=283;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.542;QD=5.77;ReadPosRankSum=4.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,78:276:99:1660,0,12772 -chr3 53685932 . T C 6865.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.863;DP=251;FS=6.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=27.35;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,166:245:99:6894,0,2051 -chr3 53686003 . A G 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=2.680;DP=219;FS=2.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,50:218:99:553,0,12476 -chr3 53686012 . G A 2668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=-1.057;DP=229;FS=0.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.943;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,87:229:99:2697,0,6559 -chr3 53690932 . T C 6856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=-1.193;DP=350;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=19.59;ReadPosRankSum=2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,208:339:99:6885,0,4485 -chr3 53691078 . G C 5744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-0.769;DP=292;FS=0.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=19.67;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,177:287:99:5773,0,3517 -chr3 53691117 . C T 6027.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=-1.188;DP=294;FS=0.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=20.50;ReadPosRankSum=1.924 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,182:292:99:6056,0,3817 -chr3 53712931 . C CA 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=1.129;DP=137;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.006;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,38:114:99:364,0,2350 -chr3 53830749 . C T 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=1.073;DP=57;FS=5.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.712;QD=8.65;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:521,0,1509 -chr3 53836794 . A T 1937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.297;DP=93;FS=4.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=20.84;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,58:93:99:1966,0,1140 -chr3 53842124 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=0.365;DP=64;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:304,0,1798 -chr3 53844123 . ACAGGTGAGCCCTGCAGCTCTGTCAAATCTAACTGCATTCACGATGATAAATGATCCGAGAAACTGCAATGCATAAAGAGTCATCTCTTCCCTATCT A 2398.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=1.471;DP=78;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.272;QD=30.75;ReadPosRankSum=-3.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,66:74:99:2436,0,1580 -chr3 53844291 . C T 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=-1.658;DP=54;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:478,0,1409 -chr3 53844374 . G A 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.107;DP=73;FS=9.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:495,0,2003 -chr3 53844399 . A G 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.567;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=11.08;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:992,0,1880 -chr3 53849542 . C T 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.264;DP=67;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=12.19;ReadPosRankSum=-0.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:845,0,1380 -chr3 53852334 . T C 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=-2.066;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.035;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:93:99:1095,0,1813 -chr3 53852599 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.881;DP=58;FS=1.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=5.25;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:333,0,1676 -chr3 53856406 . G C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.249;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=5.86;ReadPosRankSum=1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:368,0,1569 -chr3 53861003 . C T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.363;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=12.35;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:584,0,915 -chr3 53861312 . G A 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-1.220;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=12.24;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:99:677,0,1146 -chr3 53861376 . T G 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=1.011;DP=72;FS=6.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.65;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:1011,0,1832 -chr3 53861713 . G GT 334.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.348;DP=54;FS=4.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:372,0,800 -chr3 53861805 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-1.192;DP=48;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:456,0,1165 -chr3 53862378 . C G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-1.574;DP=28;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=7.31;ReadPosRankSum=1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:233,0,689 -chr3 53862731 . ATG A 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.913;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:371,0,1129 -chr3 53867070 . C T 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.813;DP=126;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.343;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,39:126:99:1023,0,3171 -chr3 53883528 . G A 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.330;DP=130;FS=4.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,29:129:99:557,0,7288 -chr3 53979269 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.487;DP=99;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,16:96:99:238,0,3146 -chr3 54024093 . T TG 200.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.55;MQ0=0;QD=28.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr3 54085982 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.535;DP=37;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:491,0,794 -chr3 54117850 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.712;DP=42;FS=28.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:290,0,2082 -chr3 54123089 . TCCTTAAAAACATGAAAGCAGAAAGAATAAACTCACATCTAGGATACTCCAGCTTGTTTAAAGTGCTTTAAATGGTGTTTTTGCAGCAGTGCAGGAAAGTAAAAGCTTCTGTACTCA T 1267.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=3.033;DP=35;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:2:1303,0,2 -chr3 54167991 . A G 2723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=1.382;DP=185;FS=19.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.047;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,80:185:99:2752,0,8103 -chr3 54171171 . A T 5053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=1.660;DP=427;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=11.84;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,159:425:99:5082,0,9128 -chr3 54171522 . CACCTAAAAAAGGATTGGTAATTGATCATTTCCATGTGGGAACAACGGGACCTATGCAAGGCAACAGTAAACCAGATATAATTGTTGATACTT C 5489.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=1.686;DP=213;FS=4.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=25.77;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,164:176:99:5527,0,489 -chr3 54173015 . T C 3763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=-0.372;DP=368;FS=0.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,125:368:99:3792,0,7796 -chr3 54175350 . GCCTATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATA G 3824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=-1.845;DP=235;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,120:224:99:3862,0,6527 -chr3 54175353 . TATGTGAGAGAGTATGTGGACCGTTGACAAGAAGATCACAGAGAAACTGTTTAAACAATCACATGCCATTTTATATAC T 3286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.254;DP=230;FS=0.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,98:224:99:3324,0,6915 -chr3 54175433 . CTT C 3286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=-0.859;DP=234;FS=0.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=14.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,98:226:99:3324,0,6888 -chr3 54176500 . GCCTGTGGTTTGGAAGGCATTTAGAGTTAGACATACTAAAGGCAAACCAATTCTTTTGAACATGAACTAATATGTGAATATAATAACTTA G 12047.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.353;DP=306;FS=6.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=30.48;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,287:290:99:12085,889,0 -chr3 54326005 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:430,0,303 -chr3 54467542 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.061;DP=32;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=8.02;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:285,0,803 -chr3 54467556 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.202;DP=29;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=12.34;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:386,0,634 -chr3 54467664 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.616;DP=21;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=11.61;ReadPosRankSum=1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:272,0,420 -chr3 54504291 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=1.396;DP=26;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.18;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:371,0,386 -chr3 54533343 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.049;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=20.16;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:371,0,233 -chr3 54533476 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.302;DP=17;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=26.93;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:486,0,103 -chr3 54541411 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=1.493;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=18.62;ReadPosRankSum=2.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:475,0,318 -chr3 54743872 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.471;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:276,0,197 -chr3 55285989 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.611;DP=46;FS=6.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,16:46:99:548,0,1046 -chr3 55286347 . AT A 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-1.945;DP=42;FS=4.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=12.30;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:554,0,792 -chr3 55286694 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=20.82;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:403,0,323 -chr3 55290199 . T G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.332;DP=54;FS=3.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=14.01;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:785,0,1051 -chr3 55326381 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-2.165;DP=56;FS=4.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:376,0,1534 -chr3 55407538 . C T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.158;DP=119;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=4.64;ReadPosRankSum=2.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,23:119:99:580,0,11855 -chr3 55407547 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.091;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:580,0,11855 -chr3 55413017 . G A 2028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.085;DP=137;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.644;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,60:137:99:2057,0,2614 -chr3 55419123 . C T 2236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=-2.184;DP=127;FS=2.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=17.61;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,66:127:99:2265,0,2891 -chr3 55437379 . G GCCGAGCCTGAA 516.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=206;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=2.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,0:0:24:554,0,24 -chr3 55437797 . T C 4328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=-2.187;DP=339;FS=6.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,128:328:99:4357,0,6697 -chr3 55443379 . CTTAGGAAAAAAGAAAAAGTATTACCTAGTGTACGATTTTAAAATGGATGAAAAAAAAAATTGACCAGTGCAGAACACATACT C 15612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=270;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,267:267:99:15650,1233,0 -chr3 55444772 . C T 1856.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.753;DP=260;FS=10.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.891;QD=7.14;ReadPosRankSum=2.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,80:260:99:1885,0,6359 -chr3 55449448 . CCCTTCAAAACAATAACAGTGTTAAAACCTCTGCCCAGTTTGTTAAACACAAACACTGCCCACACTTTGGCGTATGTA C 13838.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.069;DP=324;FS=3.694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=32.63;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,301:302:99:13876,1207,0 -chr3 55453460 . G T 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-4.513;DP=261;FS=6.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,75:259:99:1846,0,6936 -chr3 55454771 . T A 4683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.856;ClippingRankSum=0.015;DP=407;FS=11.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=11.51;ReadPosRankSum=2.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,140:406:99:4712,0,9300 -chr3 55454794 . GGACCTTGAAAACCCCAAAATAATATACTGTTAAATTAATTTTTATGAATTTAATAACAATGAATTGTAAAACGACCT G 14016.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=2.435;DP=333;FS=6.354;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=33.05;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,330:332:99:14054,1129,0 -chr3 55466423 . C A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=1.487;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:470,0,2557 -chr3 55466614 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=-3.753;DP=41;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:489,0,925 -chr3 55467029 . T C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-1.363;DP=29;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=14.51;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:449,0,1070 -chr3 55467034 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=-2.284;DP=29;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:449,0,1120 -chr3 55468214 . C A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.765;DP=43;FS=13.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=7.88;ReadPosRankSum=3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:367,0,1364 -chr3 55469448 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=2.881;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:491,0,2547 -chr3 55469458 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-1.570;DP=68;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:266,0,2886 -chr3 55469484 . A T 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=3.852;DP=62;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=11.01;ReadPosRankSum=-3.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:62:99:711,0,1471 -chr3 55469502 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=2.858;DP=61;FS=5.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=7.68;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:497,0,1607 -chr3 55520710 . TAA T,TA 1050.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.189;DP=55;FS=9.824;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,20,28:52:99:1419,700,767,539,0,462 -chr3 55578420 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=1.294;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=24.90;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:327,0,95 -chr3 55602618 . C T 488.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:517,36,0 -chr3 55603614 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.027;DP=27;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,19:27:99:727,0,223 -chr3 55603701 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=1.866;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:353,0,317 -chr3 55604065 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=1.281;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.676;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:514,0,154 -chr3 55604441 . A G 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=34.06;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:437,0,225 -chr3 55619893 . A T 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr3 55623354 . A C 596.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:625,45,0 -chr3 55624810 . GA G 365.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.750;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:403,0,217 -chr3 55646021 . G T 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr3 55649799 . C T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=1.237;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:339,0,225 -chr3 55649898 . T C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-1.664;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:91:355,0,91 -chr3 55688208 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=16.55;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:293,0,396 -chr3 55688490 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.717;DP=26;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,496 -chr3 55688773 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.708;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:400,0,369 -chr3 55688856 . CT C 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.931;DP=38;FS=19.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:447,0,384 -chr3 55689347 . G T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=-0.243;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:653,0,411 -chr3 55724120 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,418 -chr3 55725839 . A T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.040;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:362,0,785 -chr3 55726303 . G A 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.187;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=16.79;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,27:53:99:935,0,998 -chr3 55744416 . G A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:325,0,230 -chr3 55748552 . G A 1506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=1.614;DP=87;FS=0.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=17.32;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,47:87:99:1535,0,1471 -chr3 55774394 . C T 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.752;DP=74;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=14.69;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,38:74:99:1115,0,1270 -chr3 55844370 . G A 1295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-1.784;DP=81;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=16.00;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,38:81:99:1324,0,1446 -chr3 55897121 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.016;DP=24;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.07;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:654,0,193 -chr3 55931171 . G C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.253;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=17.88;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:529,0,912 -chr3 55950308 . G A 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.897;DP=328;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,68:326:99:1243,0,9734 -chr3 55952194 . A G 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=-1.065;DP=278;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=2.38;ReadPosRankSum=4.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,61:274:99:690,0,9891 -chr3 55952262 . T G 1316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.428;ClippingRankSum=1.576;DP=258;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=5.10;ReadPosRankSum=4.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,78:255:99:1345,0,8416 -chr3 55955175 . T G 1104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.224;DP=51;FS=1.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.172;QD=21.66;ReadPosRankSum=-1.958 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,32:51:99:1133,0,645 -chr3 55965846 . C T 3574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=-1.016;DP=230;FS=6.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=15.54;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,99:229:99:3603,0,4339 -chr3 55972190 . A G 6645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=-10.855;DP=501;FS=58.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,192:498:99:6674,0,10415 -chr3 55972529 . TCCTAGGCAGAAACAAGACTATCAGAGACAGGCTTGAAGAAAACACAATGTTTAAGCGTATAACAACACATTAATTGCCATA T 2453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-1.738;DP=150;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,68:150:99:2491,0,4725 -chr3 55972533 . AGGCAGAAACAAGACTATCAGAGACAGGCTTGAAGAAAACACAATGTTTAAGCGTATAACAACACATTAATTGCCATACCTG A 2935.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-2.028;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.965;QD=18.01;ReadPosRankSum=-1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,78:163:99:2973,0,4665 -chr3 55972629 . T A 5748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-1.881;DP=372;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=15.45;ReadPosRankSum=2.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,189:366:99:5777,0,6084 -chr3 55972715 . G T 3977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=2.542;DP=246;FS=6.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.992;QD=16.17;ReadPosRankSum=-2.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,124:240:99:4006,0,4355 -chr3 55974692 . T C 3176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=4.743;DP=386;FS=11.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,121:386:99:3205,0,10164 -chr3 55974704 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.612;ClippingRankSum=4.606;DP=356;FS=16.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:304,52:356:99:465,0,11262 -chr3 55974719 . A G 3030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=3.850;DP=372;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=8.15;ReadPosRankSum=-6.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,117:372:99:3059,0,9680 -chr3 55979333 . A G 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.587;DP=452;FS=6.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.466;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:321,130:451:99:2903,0,12511 -chr3 55979422 . TCTGCAGGAAACACAACAAACCAAATTAGTTTACAGCCACTACGAAAGTATCAAACTTGAGAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 13996.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=3.242;DP=320;FS=1.534;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=28.16;ReadPosRankSum=-2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,310:320:99:14034,1290,0 -chr3 55979711 . TCCTAGGCAGAAACAAGACTATCAGAGACAGGCTTGAAGAAAACACAATGTTTAAGCGTATAACAACACATTAATTGCCATA T 4763.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-1.338;DP=161;FS=3.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=29.59;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,124:160:99:4801,0,2386 -chr3 55979715 . AGGCAGAAACAAGACTATCAGAGACAGGCTTGAAGAAAACACAATGTTTAAGCGTATAACAACACATTAATTGCCATACCTG A 428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=-1.035;DP=164;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.567;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,29:163:99:466,0,6548 -chr3 55983317 . A G 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=-0.143;DP=158;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.053;QD=5.45;ReadPosRankSum=-5.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,40:157:99:890,0,4543 -chr3 55990301 . TCTGCAAACCAAACAAATCAAATTAGTTTACAGCCACTAAGAAAGTATCAAACTTGAAAACAACTGTTGATAGCGCTCAC T 15119.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-1.005;DP=402;FS=18.774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=35.86;ReadPosRankSum=-2.475 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,373:382:99:15157,1101,0 -chr3 55990587 . TCCTAGGCAGAAACAAGAATATCAGAGACAGGCTTGAAGAAAACACAATGTTTAAGCGTATAACAACACATTAATTGCCATA T 655.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=-2.870;DP=23;FS=21.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=28.51;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:693,0,971 -chr3 55990799 . C T 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=-1.257;DP=93;FS=23.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=22.47;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,60:93:99:2118,0,1153 -chr3 55998644 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:236,0,61 -chr3 56006961 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=1.197;DP=33;FS=3.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:719,0,464 -chr3 56007242 . TA T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=0.283;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:89:349,0,89 -chr3 56008640 . T A 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.022;DP=61;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:1080,0,986 -chr3 56008787 . G A 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.717;DP=32;FS=7.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=18.02;ReadPosRankSum=2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:605,0,529 -chr3 56008876 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=-0.386;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:286,0,789 -chr3 56009265 . TA T 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-1.508;DP=39;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:355,0,505 -chr3 56009527 . T A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.195;DP=29;FS=6.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=27.20;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:817,0,455 -chr3 56009718 . T A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=3.008;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=14.08;ReadPosRankSum=-1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:352,0,847 -chr3 56009810 . T C 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.781;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=33.20;ReadPosRankSum=-1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:1157,0,232 -chr3 56009946 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.308;DP=37;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:312,0,1225 -chr3 56010024 . C CT 924.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.504;DP=31;FS=2.447;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:36:962,36,0 -chr3 56010164 . C G 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=1.434;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:756,0,807 -chr3 56010422 . G A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.469;DP=27;FS=3.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:544,0,386 -chr3 56011029 . C T 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-0.091;DP=35;FS=8.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=24.71;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:893,0,296 -chr3 56012185 . C CA 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=-1.430;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:676,0,215 -chr3 56012251 . G A 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.410;DP=42;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=16.78;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,25:42:99:733,0,563 -chr3 56016059 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.994;DP=29;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.688;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:813,0,155 -chr3 56026308 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.993;DP=35;FS=7.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:742,0,447 -chr3 56026385 . G T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.766;DP=40;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=23.24;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:958,0,1313 -chr3 56026391 . G T 929.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.188;DP=43;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:958,0,1313 -chr3 56029411 . A T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=1.083;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:461,0,356 -chr3 56029561 . T A 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.505;DP=42;FS=2.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:860,0,503 -chr3 56029774 . C T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.203;DP=47;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=19.59;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:949,0,643 -chr3 56069708 . A G 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-0.405;DP=48;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=19.16;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:948,0,610 -chr3 56069766 . C T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.930;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=14.14;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:594,0,739 -chr3 56072158 . T A 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr3 56094275 . C CTGTTTTGACGATGATCTCCAGTGTGT 1203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=-1.165;DP=61;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,37:58:99:1241,0,804 -chr3 56103270 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.582;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:247,0,554 -chr3 56112693 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,299 -chr3 56214478 . C T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:256,18,0 -chr3 56288482 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.741;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,139 -chr3 56295831 . G C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-2.098;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=20.93;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:384,0,233 -chr3 56303800 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.231;DP=22;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:349,0,416 -chr3 56306704 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.533;DP=37;FS=1.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=17.62;ReadPosRankSum=1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:680,0,613 -chr3 56313998 . C A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.350;DP=19;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:545,0,108 -chr3 56349376 . C G 1323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-1.814;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1352,0,507 -chr3 56349529 . G C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-0.112;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=12.75;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:398,0,789 -chr3 56349731 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.528;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:334,0,684 -chr3 56349956 . A G 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.326;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=25.70;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:825,0,259 -chr3 56350582 . T G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=2.163;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=20.52;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:295,0,184 -chr3 56350829 . G T 987.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.530;DP=37;FS=5.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=26.70;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1016,0,280 -chr3 56352026 . TTA T 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.655;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:369,0,658 -chr3 56352258 . G A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.304;DP=43;FS=4.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:737,0,808 -chr3 56373043 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=1.286;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:317,0,372 -chr3 56373794 . G C 1223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.925;DP=59;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.74;ReadPosRankSum=0.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,36:59:99:1252,0,813 -chr3 56374099 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.742;DP=48;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=19.70;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:974,0,652 -chr3 56374246 . C T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.558;DP=51;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=15.60;ReadPosRankSum=1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:51:99:824,0,914 -chr3 56493739 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.365;DP=45;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.944;QD=15.06;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:706,0,736 -chr3 56623264 . G T 2927.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=-0.527;DP=176;FS=3.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=16.64;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,91:176:99:2956,0,3065 -chr3 56628990 . C T 2500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.461;DP=144;FS=0.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=17.37;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,79:143:99:2529,0,2151 -chr3 56772966 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.10;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:237,0,186 -chr3 56853572 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=-0.247;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:458,0,592 -chr3 56902800 . G T 4062.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.557;DP=89;FS=2.323;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.512;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:4091,297,0 -chr3 56903948 . A G 1349.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1378,105,0 -chr3 56905024 . A T 611.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:640,48,0 -chr3 56905097 . C CG 672.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:710,54,0 -chr3 56906408 . TA T 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=7.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=17.12;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:41:277,0,41 -chr3 56910211 . GT G 642.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=-1.980;DP=61;FS=6.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:680,0,340 -chr3 56910404 . A T 868.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-1.281;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=33.21;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:897,66,0 -chr3 56984915 . GA G 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=1.959;DP=55;FS=4.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=7.12;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:429,0,740 -chr3 57162710 . G A 3392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=1.852;DP=150;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=22.62;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,80:150:99:3421,0,5382 -chr3 57162718 . A G 3378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=2.305;DP=159;FS=5.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,85:159:99:3407,0,5382 -chr3 57162794 . A G 2829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=-0.072;DP=178;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=15.90;ReadPosRankSum=2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,79:177:99:2858,0,3379 -chr3 57162955 . C T 5132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=1.724;DP=161;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=31.88;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,66:161:99:5161,0,6518 -chr3 57162971 . T C 10147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.826;DP=164;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=26.89;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,85:164:99:10176,0,1695 -chr3 57163049 . G T 2308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=1.247;DP=183;FS=3.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,88:183:99:2337,0,10380 -chr3 57163116 . T A 3675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.270;DP=226;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,110:226:99:3704,0,6677 -chr3 57163542 . C T 3289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=-1.518;DP=186;FS=0.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=17.69;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,99:185:99:3318,0,3187 -chr3 57163920 . G A 3934.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.727;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.078;QD=24.59;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,104:159:99:3972,0,1614 -chr3 57163953 . C T 2497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.781;DP=136;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.366;QD=18.37;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:2526,0,2509 -chr3 57164312 . T C 5585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-2.243;DP=253;FS=5.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.554;QD=22.08;ReadPosRankSum=2.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,153:253:99:5614,0,3445 -chr3 57164396 . A G 3371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-1.300;DP=202;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,103:200:99:3400,0,3608 -chr3 57164472 . T C 2216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=-0.187;DP=130;FS=13.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=17.05;ReadPosRankSum=-1.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,52:128:99:2245,0,2615 -chr3 57164492 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.004;DP=104;FS=4.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.988;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,25:103:99:429,0,6325 -chr3 57164518 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.640;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=2.27;ReadPosRankSum=2.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:255,0,3174 -chr3 57164946 . G A 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.675;DP=128;FS=12.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=7.54;ReadPosRankSum=-2.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,38:128:99:993,0,3466 -chr3 57165292 . C T 2488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=-0.143;DP=142;FS=21.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.591;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,67:142:99:2517,0,2429 -chr3 57165396 . A T 1750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=3.683;DP=105;FS=2.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.401;QD=16.67;ReadPosRankSum=2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,54:105:99:1779,0,1894 -chr3 57165421 . T C 1444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=2.126;DP=98;FS=9.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=14.74;ReadPosRankSum=-3.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,43:98:99:1473,0,1917 -chr3 57165648 . T TA 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=-1.482;DP=84;FS=14.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:285,0,1434 -chr3 57166012 . G C 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=1.238;DP=50;FS=27.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.327;QD=13.20;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:688,0,1009 -chr3 57166157 . G C 2285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.343;DP=105;FS=13.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,63:105:99:2314,0,1434 -chr3 57166356 . CT C 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=2.958;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:516,0,4692 -chr3 57166368 . T C 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=2.295;DP=88;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=5.54;ReadPosRankSum=-4.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:516,0,4906 -chr3 57166525 . G A 3348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.245;DP=196;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.895;QD=17.09;ReadPosRankSum=3.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,100:194:99:3377,0,3393 -chr3 57166634 . T C 4746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=1.688;DP=231;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=20.55;ReadPosRankSum=-1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,142:231:99:4775,0,3117 -chr3 57166709 . C T 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-1.300;DP=141;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,66:140:99:2362,0,2378 -chr3 57166745 . C T 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-3.133;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,35:63:99:1206,0,1050 -chr3 57230908 . A G 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=-0.071;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:378,0,130 -chr3 57231927 . T C 209.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:238,0,23 -chr3 57234467 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=1.317;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:253,0,370 -chr3 57234518 . T C 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:41:500,0,41 -chr3 57234530 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-1.780;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,325 -chr3 57267189 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:238,0,56 -chr3 57267270 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=28.82;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:98:521,0,98 -chr3 57267278 . C A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=1.187;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:98:521,0,98 -chr3 57281459 . G A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:308,0,57 -chr3 57303712 . T A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=-0.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:330,0,335 -chr3 57303945 . C T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=20.52;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:336,0,215 -chr3 57303970 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.135;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=27.74;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:78:472,0,78 -chr3 57312685 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-1.943;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:333,0,329 -chr3 57318362 . A T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.673;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:99:488,0,146 -chr3 57320122 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=31.85;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:44:506,0,44 -chr3 57323349 . T C 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.668;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:48:534,0,48 -chr3 57323355 . T G 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=27.12;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:48:534,0,48 -chr3 57323574 . T C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=-1.359;DP=16;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=22.30;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:385,0,169 -chr3 57328455 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=-0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:278,0,178 -chr3 57328534 . G A 245.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:274,0,17 -chr3 57332748 . T C 250.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:279,0,18 -chr3 57332847 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-1.501;DP=15;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=25.38;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:409,0,137 -chr3 57333020 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:388,0,130 -chr3 57375682 . C T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=-0.128;DP=22;FS=2.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=26.44;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:69:610,0,69 -chr3 57396781 . C A 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr3 57456370 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:238,0,227 -chr3 57495141 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.567;DP=20;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.096;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:347,0,376 -chr3 57510250 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-1.198;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:447,0,491 -chr3 57517697 . C G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.663;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:264,0,260 -chr3 57566128 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.326;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:400,0,169 -chr3 57773292 . G A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.986;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:293,0,1842 -chr3 57773661 . A T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=-1.342;DP=71;FS=7.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:564,0,1879 -chr3 57993054 . C A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.236;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:332,0,401 -chr3 57994167 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:232,0,53 -chr3 58237637 . T A 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.433;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:395,0,1062 -chr3 58277048 . T C 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.771;DP=74;FS=3.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,23:74:99:610,0,1946 -chr3 58277334 . A T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=-2.079;DP=58;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:438,0,1565 -chr3 58279853 . G T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=1.061;DP=114;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:492,0,3253 -chr3 58286819 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=22.52;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:276,0,147 -chr3 58306040 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=-0.027;DP=95;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,16:88:99:258,0,2727 -chr3 58308305 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=2.471;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,32:121:99:755,0,3433 -chr3 58412815 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.682;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:320,0,2248 -chr3 58412993 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.594;DP=45;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.119;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:239,0,1292 -chr3 58413005 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-1.500;DP=49;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:283,0,1443 -chr3 58581467 . T C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.529;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:301,0,315 -chr3 58583263 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.467;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:253,0,1836 -chr3 58587209 . C T 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-0.918;DP=53;FS=4.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:371,0,1527 -chr3 58786848 . G T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.786;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=4.26;ReadPosRankSum=-2.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:390,0,2534 -chr3 59027641 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.249;DP=154;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=3.08;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,30:154:99:502,0,4691 -chr3 59027728 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=1.453;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,23:149:99:231,0,4751 -chr3 59251505 . C T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=1.808;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:506,0,543 -chr3 59374009 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.472;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:318,0,468 -chr3 59450285 . T G 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.921;DP=22;FS=15.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:294,0,991 -chr3 59450286 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.678;DP=23;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=11.56;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,945 -chr3 59671052 . C CGA 429.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=-1.457;DP=50;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:467,0,1008 -chr3 59675604 . A T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=1.357;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:340,0,657 -chr3 60210473 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.675;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=8.55;ReadPosRankSum=2.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:353,0,969 -chr3 60265868 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=18.42;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:323,0,256 -chr3 60286984 . C T 1919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=1.633;DP=391;FS=3.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,111:389:99:1948,0,10454 -chr3 60289929 . C A 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=-1.150;DP=175;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,37:173:99:584,0,5198 -chr3 60347982 . C T 2334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-1.683;DP=495;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=4.72;ReadPosRankSum=3.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:388,106:494:99:2363,0,28713 -chr3 60476528 . A G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.366;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:423,0,533 -chr3 60480206 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=-1.654;DP=51;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:447,0,1929 -chr3 60480332 . T A 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-1.998;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:619,0,1193 -chr3 60480617 . G A 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.852;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:509,0,570 -chr3 60484461 . T A 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.716;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1057 -chr3 60484462 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.518;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:417,0,1057 -chr3 60509256 . G A 209.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:238,0,24 -chr3 60511890 . T A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=15.67;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:373,0,402 -chr3 60512131 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.282;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=7.50;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:388,0,1324 -chr3 60512150 . T G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-1.021;DP=48;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:322,0,1343 -chr3 60520035 . T G 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=2.649;DP=26;FS=13.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.135;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:477,0,437 -chr3 60528975 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-0.652;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=16.24;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,253 -chr3 60633583 . A T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.581;DP=24;FS=5.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=30.07;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:51:750,0,51 -chr3 60633752 . T C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.276;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:514,0,237 -chr3 60633764 . A G 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:72:1047,72,0 -chr3 60634043 . A C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=-0.637;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:444,0,367 -chr3 60634199 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.949;DP=51;FS=4.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:519,0,3667 -chr3 60634200 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.929;DP=51;FS=4.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:519,0,3667 -chr3 60634205 . A T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=1.631;DP=48;FS=3.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:289,0,3164 -chr3 60634258 . T A 2299.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-0.758;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=30.95;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:99:2328,160,0 -chr3 60634337 . A T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-0.088;DP=33;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=16.33;ReadPosRankSum=0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:816,0,337 -chr3 60972138 . G A 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=-0.232;DP=101;FS=6.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:513,0,2879 -chr3 61187027 . G A 2173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=1.586;DP=369;FS=17.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,97:369:99:2202,0,10064 -chr3 61194638 . T C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=21.89;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,145 -chr3 61194997 . C A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.230;DP=28;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=29.17;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:845,0,817 -chr3 61201359 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-1.904;DP=29;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,623 -chr3 61211717 . T G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=4.179;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=7.51;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:524,0,1746 -chr3 61234919 . G A 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=-0.381;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.242;QD=15.76;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:580,0,678 -chr3 61236621 . G T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.386;DP=45;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:516,0,908 -chr3 61242836 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:320,0,513 -chr3 61243667 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.136;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:253,0,778 -chr3 61243687 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.024;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.966;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:257,0,781 -chr3 61264248 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=-1.148;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=1.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:326,0,308 -chr3 61314692 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.735;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:331,0,926 -chr3 61316403 . C T 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.752;DP=27;FS=7.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.480;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:479,0,428 -chr3 61377861 . G T 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-0.577;DP=34;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=18.93;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:672,0,486 -chr3 61384613 . G A 828.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.258;DP=43;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.012;QD=19.27;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:857,0,649 -chr3 61391848 . A G 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr3 61414017 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.600;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=21.48;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:286,0,124 -chr3 61431003 . AG A 303.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=2.539;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:341,0,381 -chr3 61440158 . GT G 304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.353;DP=32;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:342,0,415 -chr3 61541411 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=-0.647;DP=303;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=0.75;ReadPosRankSum=2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:258,42:300:99:254,0,9257 -chr3 61543998 . G T 3940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.480;DP=286;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,119:284:99:3969,0,5347 -chr3 61576279 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:329,0,226 -chr3 61617461 . G A 907.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.851;DP=56;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.070;QD=16.21;ReadPosRankSum=-1.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:936,0,905 -chr3 61617670 . CT C 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.903;DP=50;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:386,0,323 -chr3 61618438 . AT A 459.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-0.674;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:497,0,344 -chr3 61622222 . TCTGACACACAAAACAACACAGAAGACAACAAGATCTGTTCACCATCAGACTTTTCATTTTTGGGTGAACGATCCCTTAAACATGACATTTTTTCCTAACAAAATTAAAAGGAAGCCCGGGAGGAGGCGTACTGCGCTCCAAGTTCACCAATTAGGATGACTTTCAGCGTTCATTGTTATCAAGGACTAAGGAAAGAATCTATATACACACACAAAC T 6800.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=4.221;DP=154;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.873;QD=25.01;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,145:154:99:6838,563,0 -chr3 61625945 . C A 3097.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.315;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=20.93;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,95:147:99:3126,0,1682 -chr3 61658047 . C G 1597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.913;ClippingRankSum=-1.012;DP=116;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=13.77;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,47:116:99:1626,0,2226 -chr3 61658086 . C A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-2.651;DP=76;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=6.93;ReadPosRankSum=-1.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:555,0,2023 -chr3 61660694 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=-3.948;DP=79;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:242,0,2443 -chr3 61793496 . A C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:248,18,0 -chr3 61805098 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.164;DP=16;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:251,0,338 -chr3 61852902 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-1.441;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.927;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:395,0,714 -chr3 61887564 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=-0.461;DP=36;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:449,0,799 -chr3 61888942 . G A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=1.639;DP=56;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.499;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:424,0,1542 -chr3 61889004 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.656;DP=42;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:509,0,911 -chr3 61889268 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=-1.551;DP=49;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:305,0,1281 -chr3 61889938 . A G 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.397;DP=46;FS=1.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:750,0,917 -chr3 61894674 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=2.929;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.661;QD=7.55;ReadPosRankSum=-2.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:285,0,957 -chr3 61896378 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=2.275;DP=21;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:237,0,724 -chr3 61896973 . G A 1131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.246;DP=51;FS=6.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=22.19;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1160,0,598 -chr3 61901767 . A C 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.89;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:269,0,146 -chr3 61901850 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:266,0,54 -chr3 61958413 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:231,0,401 -chr3 61967667 . C CT 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.468;DP=42;FS=1.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:621,0,1593 -chr3 61973540 . T A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:318,0,541 -chr3 61974475 . C A 916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=1.498;DP=21;FS=2.730;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:31:945,31,0 -chr3 61975137 . G T 1122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.638;DP=57;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,33:57:99:1151,0,877 -chr3 61975177 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=-0.239;DP=24;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.835;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:307,0,528 -chr3 61981323 . G A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=-1.284;DP=55;FS=4.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:483,0,1439 -chr3 61981418 . T C 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:293,0,423 -chr3 61981785 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.182;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:278,0,1151 -chr3 62006631 . T A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.802;DP=85;FS=10.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.171;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,17:84:99:318,0,3167 -chr3 62007195 . A G 2177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=-2.384;DP=79;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.486;QD=27.57;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,9:79:99:2206,0,2371 -chr3 62633440 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:237,0,61 -chr3 62698876 . C T 283.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:312,0,18 -chr3 62699772 . A G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.933;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:334,0,172 -chr3 62716559 . T C 1100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.685;DP=67;FS=2.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.723;QD=16.43;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,36:67:99:1129,0,1056 -chr3 62717678 . T C 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.195;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:1174,0,1204 -chr3 62717924 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=1.223;DP=61;FS=3.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=7.26;ReadPosRankSum=2.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:471,0,1510 -chr3 62717948 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=1.413;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,14:52:99:333,0,1412 -chr3 62719829 . G A 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=-0.443;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=16.79;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:918,0,917 -chr3 62719853 . T C 905.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.580;DP=55;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:934,0,1007 -chr3 62720058 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=-0.582;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=12.18;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,507 -chr3 62720734 . A G 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=1.144;DP=65;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.059;QD=8.52;ReadPosRankSum=2.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:582,0,1641 -chr3 62721790 . CGT C 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-1.755;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.434;QD=3.34;ReadPosRankSum=2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:291,0,1868 -chr3 62732096 . G A 1179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-0.654;DP=69;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,34:69:99:1208,0,1299 -chr3 62741763 . G C 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.983;DP=63;FS=3.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=16.39;ReadPosRankSum=-1.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,31:63:99:1061,0,1169 -chr3 62741829 . G A 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.517;DP=44;FS=2.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:714,0,738 -chr3 62753291 . T A 809.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.415;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=27.92;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:838,0,215 -chr3 62753319 . T A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.588;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=29.19;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:933,0,242 -chr3 62754374 . A C 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=1.088;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:592,0,477 -chr3 62754408 . G C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:485,0,324 -chr3 62755526 . T A 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=-0.270;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=23.05;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:812,0,415 -chr3 62755577 . A C 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.769;DP=45;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,28:44:99:1006,0,542 -chr3 62756622 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.415;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=18.44;ReadPosRankSum=1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:526,0,421 -chr3 62756968 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.241;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:306,0,711 -chr3 62756975 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.212;DP=16;FS=7.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=17.36;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:306,0,711 -chr3 62757587 . TA T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-0.400;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:402,0,746 -chr3 62763254 . C T 216.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:245,0,23 -chr3 62779035 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=2.473;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=13.77;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:345,0,371 -chr3 62779068 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-1.975;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:315,0,334 -chr3 62801011 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=-2.079;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=29.05;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:78:522,0,78 -chr3 62810002 . G A 1201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=-1.748;DP=58;FS=9.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=20.72;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1230,0,792 -chr3 62813383 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=24.18;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:76:270,0,76 -chr3 62813432 . GT G 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-1.917;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.417;QD=7.30;ReadPosRankSum=1.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:322,0,484 -chr3 62827818 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=-0.109;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:240,0,420 -chr3 62828286 . T G 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.449;DP=36;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.348;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,21:36:99:747,0,1072 -chr3 62829313 . C G 1849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.105;DP=74;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=25.00;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,51:74:99:1878,0,609 -chr3 62838290 . A G 2458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=-1.034;DP=125;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=19.67;ReadPosRankSum=3.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,73:125:99:2487,0,1828 -chr3 62863765 . A T 253.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:282,0,20 -chr3 62916140 . G A 331.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=33.11;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:359,0,11 -chr3 62923667 . A G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=33.62;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:51:398,0,51 -chr3 62924901 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=26.34;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:96:318,0,96 -chr3 62925361 . T A 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.264;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:473,0,161 -chr3 62925461 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:303,0,100 -chr3 62925596 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.780;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.067;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:232,0,250 -chr3 62950663 . G C 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=-0.490;DP=33;FS=11.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=31.33;ReadPosRankSum=-0.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,27:33:99:1062,0,104 -chr3 62954835 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=1.200;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.646;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:403,0,404 -chr3 62955351 . T A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=-0.415;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:466,0,520 -chr3 62971193 . A G 863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.378;DP=36;FS=3.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:892,0,332 -chr3 62986721 . AT A 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.741;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=16.63;ReadPosRankSum=-2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:320,0,213 -chr3 62986945 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.887;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=11.78;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:252,0,464 -chr3 63008300 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=1.747;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.203;QD=16.09;ReadPosRankSum=-1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:350,0,336 -chr3 63008994 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.489;DP=26;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.877;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:399,0,475 -chr3 63009748 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.398;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:285,0,452 -chr3 63015339 . C A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr3 63026001 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.887;DP=19;FS=7.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,437 -chr3 63045051 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=2.055;DP=65;FS=7.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:487,0,1737 -chr3 63046688 . C G 1367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=1.588;DP=99;FS=5.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,41:99:99:1396,0,2206 -chr3 63184052 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=2.860;DP=51;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.179;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:310,0,1320 -chr3 63184374 . G A 664.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=2.119;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,21:58:99:693,0,1240 -chr4 27719 . AT A 2172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=-1.551;DP=333;FS=3.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,111:309:99:2210,0,6055 -chr4 375663 . TGGTGAGCATTTAAAGCATAATACATACTCATTTCCCTCCAGTGTCACTCAGTGTTTTCTCTTTGTTTTGTTCA T 9102.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=1.974;DP=217;FS=1.404;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=31.45;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,208:216:99:9140,710,0 -chr4 387818 . ACTATAGGAGACACACAAGGCTTAACGATCATACATGCAGCGGAACGAGTGTTTTTTTGTTTTTACTAGCTTCTGGTTGAAATGTGAAGTTTGTAAATGTAAAATTGTGGTTGAAATGTAAATGTTCAGCAGAAGATGTCGGGAAAGCATGATTTAAGAATCATTTTCGGATAGAGTGGGAATCTTTTGGGTGTTCACAATCCTCGTTAATGTAGTTTTTGCATGTTTTATTTTCCCATCATGCAC A 6961.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=7.016;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=27.65;ReadPosRankSum=-4.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,172:193:99:6999,0,7659 -chr4 389657 . GCCTGAACACACACACACACACACACACGCGGATATTTAATGATGAAATATCTCAGGATAACGAACAAGCACATTATTAGCACATA G 6390.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=1.679;DP=171;FS=1.646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=30.65;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,157:163:99:6428,540,0 -chr4 553932 . AGT A 1297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=-0.993;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.21;MQ0=0;MQRankSum=1.511;QD=33.28;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,33:38:61:1335,0,61 -chr4 558225 . A G 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=2.659;DP=26;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:730,0,177 -chr4 576666 . CCTACCTGGAGCACACACACACAGACAGAGAGACAGACACTCAAACGCTGCG C 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.541;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:689,0,1027 -chr4 576719 . TATCGACATCAGTGTGTTTATAAGCACTATAAACATTTCTGATCATACATAAACTG T 651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.298;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=29.62;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:689,0,1027 -chr4 577057 . A G 1244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.564;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=31.92;ReadPosRankSum=1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,33:39:94:1273,0,94 -chr4 581793 . G A 1407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.608;DP=48;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=29.33;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,39:48:99:1436,0,151 -chr4 581862 . A G 1434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=1.905;DP=43;FS=2.462;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,39:42:80:1463,80,0 -chr4 587684 . A AAC 222.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr4 588067 . C CTT 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=2.807;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=25.12;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:414,0,146 -chr4 588202 . T G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=23.13;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:352,0,353 -chr4 588203 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.271;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=24.91;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:352,0,353 -chr4 592064 . T C 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.231;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=25.83;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:519,0,154 -chr4 613181 . C A 3204.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.372;DP=111;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.336;QD=28.87;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,76:110:99:3236,0,2082 -chr4 613183 . T C 3204.83 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.544;DP=116;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,80:115:99:3236,0,2068 -chr4 613455 . G A 1709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.275;DP=69;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,50:69:99:1738,0,501 -chr4 630492 . T A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=-0.047;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:72:622,0,72 -chr4 630645 . A G 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.854;DP=40;FS=1.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=29.87;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,33:40:96:1223,0,96 -chr4 1237019 . G C 1508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-0.555;DP=106;FS=6.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,44:106:99:1537,0,2082 -chr4 1648009 . C G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.68;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:295,0,57 -chr4 2069888 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:263,0,144 -chr4 2380696 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.044;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=13.88;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:292,0,362 -chr4 2381145 . T A 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.988;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:620,0,670 -chr4 2403129 . A C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.124;DP=116;FS=2.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,26:115:99:510,0,3280 -chr4 2412597 . G GT 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=-1.327;DP=70;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,19:65:99:310,0,1246 -chr4 2538415 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.979;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=6.61;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:233,0,1406 -chr4 2559729 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,379 -chr4 2620270 . T C 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-1.021;DP=50;FS=4.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=11.58;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:607,0,1121 -chr4 2622506 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-0.778;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:367,0,493 -chr4 2623630 . A G 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.257;DP=43;FS=4.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:678,0,792 -chr4 2624024 . T A 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.466;DP=45;FS=8.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=15.17;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:711,0,799 -chr4 2630142 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=-0.090;DP=34;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=10.52;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:386,0,780 -chr4 2633073 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.775;QD=9.56;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:248,0,478 -chr4 2638532 . G A 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=1.644;DP=29;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:498,0,415 -chr4 2658904 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=-0.849;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.727;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:298,0,428 -chr4 3258207 . C CA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=1.255;DP=95;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.534;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,22:90:99:246,0,2321 -chr4 3317560 . A C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=-1.493;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:268,0,223 -chr4 4360950 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:277,0,271 -chr4 4388855 . TCCTGGTAGGAGCAGA T 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.547;DP=48;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:358,0,1990 -chr4 4388858 . TGGTAGGAGCAGATCTTGTGTTCATGAAATTACAGAACAGCGAATGATCTACCCGAGTTAGTGGCTCATCCATGTCTGATTCCATCCA T 1157.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=-1.038;DP=47;FS=2.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1195,0,1129 -chr4 4388873 . TTGTGTTCATGAAATTACAGAACAGCGAATGATCTACCCGAGTTAGTGGCTCATCCATGTCTGATTCCATCCA T 324.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.577;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:362,0,1990 -chr4 4586040 . T TA 583.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=-2.295;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:633,0,1048 -chr4 4595339 . A C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-1.616;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.028;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:377,0,1268 -chr4 4602335 . T C 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=1.957;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:450,0,1222 -chr4 4626529 . GACCTGTAAATGTAAGATTCTAGATTTAAAGCAGTATTTTTTAAAACCCTATTAAATGACTTTAAAAGCAAATAAAGAACAC G 7561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=-0.885;DP=192;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=32.71;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,179:188:99:7599,535,0 -chr4 4696242 . G A 2541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.208;DP=145;FS=2.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.848;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,71:145:99:2570,0,2681 -chr4 4761754 . G A 970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.027;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,30:76:99:999,0,1581 -chr4 4839549 . G A,GA 389.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.608;DP=23;FS=3.090;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=16.92;ReadPosRankSum=0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,12,7:23:99:608,146,775,355,0,1367 -chr4 4839550 . A AT 465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=20.25;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:503,0,640 -chr4 4898893 . AT A 616.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.393;DP=79;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,30:72:99:655,0,840 -chr4 4899277 . AT A 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=1.996;DP=38;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:340,0,376 -chr4 5198384 . G GT 1149.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.357;DP=92;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=12.50;ReadPosRankSum=-1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,50:77:99:1214,0,599 -chr4 5201288 . GCTGAAGGCAGCATATCATAGCAAGAGATTTACAATAATTTAATAAGAAGAAGCTACTCATCAGGGTCTGCTGTAAAAAAAAAAACAGATTTTTCTCAC G 1885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.015;DP=54;FS=14.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=34.92;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,43:49:99:1923,0,608 -chr4 5203166 . TCCTGTCAATCACATAATTATTAGTAACGCTTCACCATCAACATTTGTTATGTGGTAAATACACACTGTAGGTTCAAATACTTA T 3808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=3.384;DP=94;FS=9.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=26.92;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,87:94:99:3846,330,0 -chr4 5203628 . TCTGTAAATATCAAAATTAGCAGTAAATTCTTAAAATAACACAATCTTACAGAAACGGAGCTTGTATTTAGCTTCCTAAATGCTGAC T 2908.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=3.706;DP=83;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=34.10;ReadPosRankSum=-2.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,71:78:99:2946,0,1632 -chr4 5207337 . GGGTAAGAAAGATATGTCTGTGTATGATGAAATGCATGTGTATATTTACTGACTCGCTAACTTGTACATATGTAAATACGTCCATTATTAAAGCCAGGCGTGCGAGTCAGTGCTGCTTCATTGTTTCATTCATTCAGGCCGCACTTCTGGCTAACTCACACATTTGGCTAATTCATGCTCGCTCGTTATTCCA G 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=1.920;DP=298;FS=7.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,269:281:99:731,0,6065 -chr4 5230622 . C T 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=-1.266;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:633,0,460 -chr4 5296272 . T C 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr4 5324549 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.755;DP=48;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:466,0,1389 -chr4 5516929 . TGTAAGTGTTAACACTTCTGACGATTCTTAGTTTTAACAATGTTTCATATCTCAAAACTTCTCTCACTCTAAATGTGATGCAG T 6801.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=1.027;DP=184;FS=3.845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,168:174:99:6839,509,0 -chr4 5615452 . C T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.126;DP=38;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:622,0,696 -chr4 5615515 . A G 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=-0.911;DP=43;FS=4.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=16.37;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:732,0,757 -chr4 5615641 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.497;DP=52;FS=1.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=14.13;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:763,0,935 -chr4 5615707 . C T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=-2.426;DP=50;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=11.38;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:597,0,1039 -chr4 5615881 . C T 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.034;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:971,0,1028 -chr4 5638619 . T C 1883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.632;DP=71;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=26.53;ReadPosRankSum=-1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,40:71:99:1912,0,1077 -chr4 5641470 . TCTGCTCCACACCAGACAATCACACACACTTACAGGAGACCAACATCCAGAAAAAACAAACATTCACTTCTTTTACACCTTAAAGAGTCTTAC T 5236.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.263;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:5274,362,0 -chr4 5651347 . AAGGTATAAAAAACGTCATGCCTTTTACTGTTTTGGCTCTCTCTTTGTGGTATCTATTTTGAAGACCGGTGTTTTGTTGGTCC A 2004.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=2.434;DP=336;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.97;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,320:322:99:2042,759,0 -chr4 5659435 . G A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=-1.062;DP=40;FS=2.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:529,0,819 -chr4 5663675 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.451;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:974,0,1260 -chr4 5663706 . C T 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.980;DP=66;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=15.12;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:1026,0,1174 -chr4 5674258 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.029;DP=53;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.900;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:661,0,1175 -chr4 5677158 . C T 1137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-0.493;DP=54;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=21.07;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1166,0,624 -chr4 5677240 . AGTGAGTGACGTTTCTATATAATTCATTTCTAGTTCACAGTCAAATAAATCTTGAAGTGGTGTTAAAACTGTATATTCTTCCTAG A 1883.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=1.403;DP=52;FS=3.928;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=27.58;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:61:2125,61,0 -chr4 5677368 . T C 1217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.139;DP=73;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=16.68;ReadPosRankSum=-1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1246,0,2978 -chr4 5677371 . T C 1177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=-0.734;DP=75;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,32:75:99:1211,0,2985 -chr4 5680895 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.675;DP=26;FS=6.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:417,0,1101 -chr4 5681314 . A T 787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.577;DP=91;FS=4.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:816,0,2008 -chr4 5699411 . TCTGATAAAATAGTGAAACGTACATTGGTCATTTTACATTAGAAGGTTGAAACTCTGTTGGCTTTCTACACTAC T 4374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.669;DP=139;FS=4.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=31.47;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,112:133:99:4412,0,6152 -chr4 5699602 . A T 2316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-0.093;DP=159;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.197;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,66:159:99:2345,0,3178 -chr4 5701679 . A G 2221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.738;DP=135;FS=5.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,70:135:99:2250,0,2295 -chr4 5708132 . G A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.340;DP=38;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=14.78;ReadPosRankSum=-0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:590,0,1014 -chr4 5713680 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=-1.753;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.126;QD=10.51;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:249,0,490 -chr4 5722396 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=-0.653;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:235,0,1644 -chr4 5723797 . C A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.290;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:283,0,1003 -chr4 5723806 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=14.15;ReadPosRankSum=1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:283,0,1003 -chr4 5724109 . GCCTGTTAATGAATCATTATGTTATGTATCATTCAATGCATTTTGACTCAGTTAATTTTCACAACCCA G 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=1.344;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=25.25;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:416,0,1978 -chr4 5726823 . GCCTGTTGAAAAAAATACATACAATTGTTTTGTATTCTTTTGCATTCATGGTGTCACAAAATTGAGCAATAACTCA G 796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=1.964;DP=31;FS=3.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=25.70;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:834,0,2975 -chr4 6028470 . C A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.446;DP=154;FS=7.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,38:154:99:543,0,7877 -chr4 6028532 . G C 1136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=2.149;DP=118;FS=6.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=9.63;ReadPosRankSum=2.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,43:116:99:1165,0,3198 -chr4 6034487 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.022;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:263,0,361 -chr4 6190223 . G T 3370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=-1.655;DP=265;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,98:262:99:3399,0,5594 -chr4 6304908 . A C 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=-0.851;DP=29;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:511,0,489 -chr4 6304959 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.077;DP=26;FS=8.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:466,0,402 -chr4 6379422 . T G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-1.312;DP=27;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.66;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,673 -chr4 6380212 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.259;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,395 -chr4 6380697 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-1.268;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:240,0,636 -chr4 6380809 . C A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-0.913;DP=30;FS=8.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.373;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:542,0,536 -chr4 6381772 . A G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.134;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:337,0,846 -chr4 6549507 . C A 2098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.286;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,54:74:99:2127,0,505 -chr4 6568448 . G A 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr4 6573598 . GA G 885.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.719;DP=63;FS=6.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.084;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,38:57:99:923,0,357 -chr4 6573614 . G A 1715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.264;DP=61;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.879;QD=28.13;ReadPosRankSum=-1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,46:61:99:1744,0,325 -chr4 6573852 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=1.236;DP=23;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:294,0,1474 -chr4 6574016 . G T 1401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.960;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=31.86;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1430,0,155 -chr4 6574987 . T A 3527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.704;DP=130;FS=4.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,94:130:99:3556,0,888 -chr4 6589048 . A C 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:355,0,260 -chr4 6589057 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.106;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=29.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:355,0,260 -chr4 6605533 . G A 7645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.772;DP=274;FS=4.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,207:274:99:7674,0,1385 -chr4 6606013 . A G 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-5.095;DP=100;FS=3.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=12.34;ReadPosRankSum=-2.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:100:99:1262,0,4444 -chr4 6606022 . A T 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-5.290;DP=92;FS=1.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=13.41;ReadPosRankSum=-3.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:1262,0,4444 -chr4 6610617 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.255;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=31.92;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:99:507,0,173 -chr4 6611399 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.087;DP=20;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=27.74;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:583,0,106 -chr4 6611510 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.776;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:383,0,166 -chr4 6612551 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=-1.619;DP=26;FS=4.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=26.64;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:721,0,186 -chr4 6612728 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=31.06;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:48:432,0,48 -chr4 6614381 . T A 2101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.153;DP=124;FS=14.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,66:124:99:2130,0,2131 -chr4 6614464 . T A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-0.254;DP=36;FS=13.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=16.16;ReadPosRankSum=-1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:610,0,703 -chr4 6771668 . G A 1479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.644;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=25.96;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1508,0,419 -chr4 6778820 . C G 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.352;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,34:48:99:1190,0,376 -chr4 6783865 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=3.218;DP=26;FS=9.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:388,0,518 -chr4 6787066 . C T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:27:397,27,0 -chr4 6787074 . A G 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr4 6788665 . C T 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=-1.140;DP=40;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,30:40:99:1134,0,589 -chr4 6794069 . G A 2333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.488;DP=77;FS=4.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=30.31;ReadPosRankSum=-1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,66:77:99:2362,0,118 -chr4 6837691 . A G 1428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1457,111,0 -chr4 6837727 . G A 969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:77:998,77,0 -chr4 6846684 . G C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr4 6904973 . T C 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr4 6905285 . C G 1288.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1317,93,0 -chr4 6905620 . G T 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr4 6906218 . C T 455.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:484,33,0 -chr4 6906510 . T C 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.34;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:384,0,133 -chr4 6906538 . T C 699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:728,51,0 -chr4 7015375 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-1.562;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,305 -chr4 7015399 . T G 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=24.46;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:444,0,160 -chr4 7016073 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.435;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.735;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:670,0,144 -chr4 7040796 . C A 1338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-0.628;DP=55;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,38:55:99:1367,0,423 -chr4 7040850 . G A 1130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.592;DP=53;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:1159,0,552 -chr4 7048269 . C A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=1.997;DP=39;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:643,0,1631 -chr4 7048270 . G A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=2.082;DP=39;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:643,0,1598 -chr4 7050812 . T A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=2.778;DP=31;FS=3.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:593,0,1466 -chr4 7051104 . C T 1685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-1.365;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=21.61;ReadPosRankSum=-2.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,49:78:99:1714,0,970 -chr4 7055854 . A T 2619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.012;DP=82;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=31.95;ReadPosRankSum=1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,67:82:99:2648,0,248 -chr4 7059511 . GGGTGAGGAGATTCTATGGTTGCGTTTTTATCAACATGAATGTATAGTACTTATACTATCTGTTTTCCTGTCA G 2283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=1.650;DP=71;FS=4.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=32.17;ReadPosRankSum=1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,60:64:99:2321,0,409 -chr4 7063614 . A C 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=-1.843;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=17.74;ReadPosRankSum=2.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:525,0,919 -chr4 7063618 . G A 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-2.025;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.123;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:525,0,919 -chr4 7164498 . G T 250.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:279,0,22 -chr4 7164636 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:94:319,0,94 -chr4 7169262 . C T 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:447,33,0 -chr4 7181703 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=-0.324;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=32.41;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:79:644,0,79 -chr4 7194583 . A T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=1.096;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:272,0,290 -chr4 7203697 . G C 1732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-0.281;DP=103;FS=1.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,54:103:99:1761,0,1768 -chr4 7207293 . T G 1264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=1.000;DP=46;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=27.49;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1293,0,337 -chr4 7226151 . G C 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.905;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:984,0,531 -chr4 7228318 . T TA 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=1.057;DP=42;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.869;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:465,0,362 -chr4 7228669 . T G 1583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-0.128;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=25.54;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:1612,0,530 -chr4 7232685 . G A 2286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.450;DP=94;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=24.33;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,65:94:99:2315,0,745 -chr4 7246834 . G T 1792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=1.435;DP=81;FS=1.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:1821,0,990 -chr4 7247907 . T G 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.205;DP=52;FS=1.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,31:52:99:995,0,683 -chr4 7267730 . C T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:230,0,51 -chr4 7273756 . C A 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=2.062;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=12.99;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:431,0,639 -chr4 7274264 . G A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.962;DP=69;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,39:69:99:1301,0,1115 -chr4 7332533 . C T 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.092;DP=54;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:53:99:1057,0,751 -chr4 7333101 . C T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-0.505;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=21.90;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:751,0,404 -chr4 7335065 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=-1.133;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:334,0,524 -chr4 7454139 . A G 600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.297;DP=192;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,38:191:99:629,0,5300 -chr4 7549853 . T C 1233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.366;DP=82;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=15.05;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,35:82:99:1262,0,1642 -chr4 7550256 . GA G 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=-1.592;DP=85;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:433,0,1089 -chr4 7641490 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.572;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=25.41;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:638,0,304 -chr4 7642551 . A T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.934;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=28.34;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:83:425,0,83 -chr4 7978750 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.196;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.675;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:236,0,744 -chr4 7987552 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-1.453;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=6.67;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:275,0,1022 -chr4 8088840 . C CGCACACCATGGT 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=-0.942;DP=62;FS=2.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.301;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:656,0,946 -chr4 8091956 . AAGGTATTGCATACATATTTTTATAACATTTAATATTTCTTTATGATTATTTTGCTTCTAATTTGAAACCGGTCTCTGATC A 1349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.227;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=32.92;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:1387,0,1582 -chr4 8095289 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.557;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=10.71;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:296,0,549 -chr4 8107232 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.758;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:240,0,2307 -chr4 8109682 . GTATGTGTCCGTTTCTGTGACTTAAT G 481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=-0.784;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:519,0,3365 -chr4 8109709 . ATTTATAATAGATTTGTGTTGAGCAATTTATTTATTTTTGCATGCTTGTCTAGGCG A 484.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.005;DP=84;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.542;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:522,0,3365 -chr4 8440128 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.274;DP=55;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=6.38;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:379,0,1485 -chr4 8440652 . C A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.455;DP=65;FS=5.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.828;QD=4.86;ReadPosRankSum=-3.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:344,0,1737 -chr4 8532125 . T C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=-0.102;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:553,0,803 -chr4 8660752 . C A 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=-1.371;DP=140;FS=4.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,35:139:99:789,0,3945 -chr4 8661802 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=-0.867;DP=159;FS=3.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,34:159:99:639,0,9073 -chr4 8671510 . TCTGTTAAACAAGTAAACACACAGGTACATGTCATAAAAGAAGTGTACGCAAACCCTATTATCCTCTCACTCTGTCTGGGGAGTCCTCGAGTAATGTAATATCCAATATCACTTATAAATGCAC T 1016.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=3.142;DP=30;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=33.89;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:99:1054,0,1112 -chr4 8680999 . TGGTAAGTAAAAAAGCATTGATTATTTCAATCGTACCAAAATTAAAATCAATGCAAGTAAATGCAATCTCTCTCATTCTTTCA T 3606.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=1.695;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=27.95;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,90:94:99:3644,337,0 -chr4 8716152 . CT C 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.395;DP=32;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=12.74;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:476,0,1284 -chr4 8736442 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=1.704;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=12.14;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:514,0,916 -chr4 8745546 . G T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-0.427;DP=59;FS=5.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:471,0,1615 -chr4 8759240 . AAT A 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.564;DP=32;FS=4.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:447,0,773 -chr4 8759905 . C CA 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-1.426;DP=71;FS=3.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,25:69:99:481,0,974 -chr4 8787178 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.671;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:286,0,803 -chr4 8900277 . GAGGTGAGTGTTAGAAGTTTAAAGTTATAGTTCATGTCTTTGCAAATTTTGCATAAGGTGTCCTAATTTTTACTTTTCCATCCTAA G 13724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=1.324;DP=369;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=25.19;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,338:343:99:13762,989,0 -chr4 8910270 . ACTGTATAAAGCACAATAAGATTAACATAACAAGCTGACAACATCCATATACATGTGCATACATTAGTAC A 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.533;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:282,0,1193 -chr4 8922424 . T G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.785;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=4.31;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:235,0,1417 -chr4 8927739 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.552;DP=35;FS=11.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:270,0,954 -chr4 8968318 . A C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.727;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=10.02;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:339,0,453 -chr4 9031659 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=1.297;DP=87;FS=3.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,21:86:99:409,0,2358 -chr4 9041980 . T C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.975;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:510,0,2193 -chr4 9042606 . C A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.049;DP=66;FS=5.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:515,0,1675 -chr4 9056064 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.909;DP=68;FS=3.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:454,0,1758 -chr4 9129188 . AGC A 207.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:245,21,0 -chr4 9160394 . T C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.103;DP=67;FS=1.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:527,0,1800 -chr4 9176958 . C A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=-1.075;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:280,0,1750 -chr4 9675657 . AGTAAGACACACACACACAGGTGCCACAATAAAGAGCCACGTGACCATGCTCGATTTTAAACACTTCATTGCGTTTTTTTTTTCCTCCAG A 9747.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=2.273;DP=218;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=27.75;ReadPosRankSum=-2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,207:209:99:9785,825,0 -chr4 9797921 . G A 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.411;DP=38;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,21:38:99:715,0,628 -chr4 9813462 . A C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=1.903;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=11.87;ReadPosRankSum=-2.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,714 -chr4 9814954 . AGTACAGTAAAGAAAAACAAAAATAAACTTAATTCCCATTACTGCAACTAATTTTTTGTTTGTTTAG A 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-0.118;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=24.82;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:484,0,458 -chr4 9820653 . G A 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=1.010;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=16.00;ReadPosRankSum=-2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:51:99:844,0,917 -chr4 10414352 . TAA T,TA 297.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.158;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.576;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,11,10:22:99:547,187,261,222,0,236 -chr4 10511492 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=31.90;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:46:306,0,46 -chr4 10640051 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.790;DP=205;FS=10.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,41:205:99:659,0,6279 -chr4 10801549 . TCCTACAAAGAAAACAAAAGGTGTTTTTAATGCACAGACTTCTTTGGAAATTGCAAGCGCTACTGTTAAATCTGCTTA T 7107.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=1.713;DP=181;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=28.93;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,179:180:99:7145,602,0 -chr4 11071414 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=19.65;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:323,0,160 -chr4 11088697 . ACAGGTAAAGAGCTGCACATTTAACCAGAGAAAAGTGTAATGTCATACAGATGTTGCAGTTAGTGCTATAATCTTTAAATGTTATTTT A 1971.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=1.447;DP=58;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=34.00;ReadPosRankSum=-1.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,54:57:99:2009,0,225 -chr4 11096970 . A T 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=-0.849;DP=87;FS=0.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.660;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,48:87:99:1546,0,1374 -chr4 11097318 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=3.961;DP=94;FS=0.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=5.97;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:589,0,3694 -chr4 11098956 . G A 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-1.111;DP=55;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:722,0,1271 -chr4 11137887 . A T 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-1.901;DP=42;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:724,0,720 -chr4 11138589 . CA C 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.307;DP=34;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:435,0,376 -chr4 11151225 . C T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-0.218;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:461,0,444 -chr4 11151613 . CACCTGTCGAGTAACAAAAATAATGCTTTGGATGCTTCCAAAAGGCAAAATTTCATTCTTTTTGGTCATTTCATATTTAGTTTTGTGGTCCTTTTCAGCATACTT C 1636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=1.752;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=33.54;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,42:45:99:1674,0,182 -chr4 11170440 . A AAT 1336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=1.805;DP=104;FS=1.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=12.85;ReadPosRankSum=3.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,42:88:99:1374,0,1427 -chr4 11308447 . T TA 1005.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=-0.446;DP=28;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=2.154;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:42:1043,0,42 -chr4 11333923 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.127;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:537,0,630 -chr4 11333944 . G A 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=-0.466;DP=35;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:512,0,580 -chr4 11334663 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.868;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=16.95;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:486,0,487 -chr4 11336042 . C G 1394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.176;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.862;QD=25.36;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,39:55:99:1423,0,402 -chr4 11366545 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=-0.067;DP=77;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=17.04;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1340,0,1203 -chr4 11369208 . C T 1795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-0.742;DP=97;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.912;QD=18.51;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,54:96:99:1824,0,1463 -chr4 11371554 . T TA 374.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.915;DP=53;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:412,0,633 -chr4 11377837 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr4 11383390 . A G 291.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=29.12;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:10:319,0,10 -chr4 11384529 . TCTAAATTTGAATAAGCACTTATAAGTTCAAGAGCATTCATTAAACATATCATTACTCCATTAATGAGGTTAGTCAAACTCACATAC T 706.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=1.660;DP=22;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:744,0,478 -chr4 11478157 . A G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=1.186;DP=43;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=18.39;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,24:43:99:819,0,803 -chr4 11533919 . G A 1150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=-0.350;DP=44;FS=1.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.15;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,34:44:99:1179,0,198 -chr4 11778170 . G C 299.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.24;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:10:327,10,0 -chr4 11779321 . C T 1300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=-0.506;DP=52;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=25.01;ReadPosRankSum=1.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1329,0,442 -chr4 11779648 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=-0.621;DP=36;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=9.33;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:364,0,1028 -chr4 11779791 . A T 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=2.417;DP=32;FS=5.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:627,0,536 -chr4 11780516 . GAA G 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:554,0,407 -chr4 11780789 . A G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.293;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=16.77;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:766,0,678 -chr4 11784770 . A T 778.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=1.239;DP=21;FS=13.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=31.67;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:807,60,0 -chr4 11784915 . C A 7506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=-2.814;DP=245;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=30.64;ReadPosRankSum=3.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,194:245:99:7535,0,915 -chr4 11785268 . G A 11605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.491;DP=384;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.651;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,300:383:99:11634,0,1493 -chr4 11818304 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-1.439;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=8.74;ReadPosRankSum=2.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:238,0,714 -chr4 11819136 . A T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-1.654;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:514,0,1088 -chr4 11819324 . T C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.482;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:491,0,244 -chr4 11820568 . T A 857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=1.392;DP=48;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.787;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:886,0,737 -chr4 11830021 . G A 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.100;DP=39;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:784,0,1021 -chr4 11830797 . G A 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.140;DP=37;FS=5.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:664,0,680 -chr4 11834914 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.971;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:299,0,342 -chr4 11836105 . C T 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=-1.090;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=14.38;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:402,0,519 -chr4 11836558 . A T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.092;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:386,0,314 -chr4 11841817 . C G 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=-0.705;DP=16;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=22.17;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:383,0,214 -chr4 11843624 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-0.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:398,0,404 -chr4 11843784 . C A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.369;DP=29;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:455,0,389 -chr4 11858074 . T G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-0.257;DP=67;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:245,0,4616 -chr4 11858968 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.683;DP=229;FS=2.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,34:229:99:322,0,7525 -chr4 11858998 . A C 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.551;DP=254;FS=4.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,55:253:99:1052,0,7573 -chr4 11881189 . C T 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.560;DP=172;FS=6.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=6.16;ReadPosRankSum=2.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,47:172:99:1087,0,7094 -chr4 11881849 . GA G 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-1.221;DP=218;FS=6.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,48:208:99:473,0,5814 -chr4 11882168 . T TA 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=1.202;DP=217;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=1.81;ReadPosRankSum=-1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,44:191:99:430,0,3688 -chr4 11882429 . A T 1276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.015;DP=239;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.487;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,59:238:99:1305,0,6864 -chr4 11884306 . G GA 774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=-1.361;DP=267;FS=0.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=1.919;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,63:260:99:812,0,5442 -chr4 11981970 . T C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=-0.785;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=5.01;ReadPosRankSum=2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,32:134:99:704,0,3975 -chr4 11988798 . G A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=1.228;DP=124;FS=0.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,28:124:99:575,0,3820 -chr4 11989026 . TCCTGTAGATCCAATGCAAATACATATTTACAGACTATTCATCCATTTTTCAATGCAAGATTAAAACACAGGACAGATACTTA T 5319.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=1.978;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,118:120:99:5357,427,0 -chr4 11989118 . T C 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.524;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=4.39;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,29:131:99:603,0,4981 -chr4 11993790 . G C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.619;DP=92;FS=5.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:298,0,5447 -chr4 11994210 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-1.185;DP=70;FS=2.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:813,0,1426 -chr4 12016689 . G A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.028;DP=138;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,32:137:99:713,0,4145 -chr4 12017966 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=-0.068;DP=87;FS=8.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.912;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,23:86:99:526,0,2304 -chr4 12035854 . G C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=-0.674;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:400,0,1817 -chr4 12036428 . A T 4552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.855;DP=112;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=34.37;ReadPosRankSum=2.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:4581,0,3084 -chr4 12043286 . A G 1908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.271;DP=132;FS=3.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,55:131:99:1937,0,2599 -chr4 12098329 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=1.598;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:339,0,1054 -chr4 12098847 . G A 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=1.140;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=13.49;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:689,0,1138 -chr4 12120899 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-0.429;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.240;QD=13.39;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:671,0,1016 -chr4 12476744 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=-0.146;DP=211;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,34:211:99:409,0,6667 -chr4 12478905 . C A 1622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.062;DP=281;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,59:281:99:1651,0,17454 -chr4 12478915 . T C 1620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=1.543;DP=291;FS=3.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,70:291:99:1649,0,17454 -chr4 12489178 . C CA 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.007;DP=193;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,43:186:99:528,0,5131 -chr4 12489330 . AT A 401.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-3.297;DP=143;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,29:122:99:468,0,2078 -chr4 12489472 . C A 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-2.339;DP=220;FS=3.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-2.485;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,49:220:99:555,0,12013 -chr4 12495086 . T A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,711 -chr4 12495106 . A C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=-1.030;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.007;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:254,0,711 -chr4 12495485 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:286,0,257 -chr4 12620604 . T C 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-1.511;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:308,0,335 -chr4 12635040 . T G 3408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=-0.902;DP=192;FS=8.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,89:188:99:3437,0,6740 -chr4 12639740 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=1.029;DP=343;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:295,47:342:99:267,0,11624 -chr4 12657621 . T C 2006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.297;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,66:146:99:2035,0,2513 -chr4 12660311 . G A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.339;DP=134;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.196;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:594,0,3930 -chr4 12660401 . C T 772.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=1.092;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,36:145:99:801,0,4080 -chr4 12957889 . G A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=-0.155;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:543,0,1360 -chr4 12970287 . CA C 928.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=-1.295;DP=96;FS=11.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,40:85:99:966,0,1125 -chr4 12970377 . C CA 881.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=-0.341;DP=37;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:919,0,209 -chr4 12973895 . C T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=-0.052;DP=149;FS=2.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.121;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:1000,0,4046 -chr4 13008441 . C A 1970.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=-0.269;DP=187;FS=2.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,60:186:99:1999,0,6787 -chr4 13008653 . T A 1161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.057;DP=165;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.342;QD=7.04;ReadPosRankSum=-1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,54:165:99:1190,0,6636 -chr4 13015506 . C T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=1.584;DP=123;FS=5.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,35:123:99:877,0,3314 -chr4 13027503 . T G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.758;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,42:160:99:868,0,6381 -chr4 13027572 . T A 1940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-2.155;DP=155;FS=0.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=12.52;ReadPosRankSum=-0.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,56:155:99:1969,0,5821 -chr4 13027779 . T A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.539;DP=63;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:479,0,1654 -chr4 13029371 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.144;DP=83;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=3.15;ReadPosRankSum=3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:290,0,2546 -chr4 13030082 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.381;DP=90;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:429,0,2627 -chr4 13034594 . G T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-1.621;DP=100;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.631;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,25:90:99:595,0,2418 -chr4 13258252 . C A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-0.197;DP=58;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:859,0,1494 -chr4 13370689 . C T 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.959;DP=96;FS=5.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,35:96:99:1144,0,2427 -chr4 13426105 . G A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-0.563;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:278,0,1234 -chr4 13438700 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.813;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.228;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:278,0,893 -chr4 13439920 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.888;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:373,0,693 -chr4 13515257 . TA T,TAA 243.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.553;DP=28;FS=6.368;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,11,10:24:99:370,188,308,167,0,287 -chr4 13516263 . T A 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.379;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:538,0,2556 -chr4 13519525 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=-2.094;DP=103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.760;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,30:103:99:690,0,2755 -chr4 13541844 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.479;DP=85;FS=2.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.672;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:405,0,4995 -chr4 13541850 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.964;DP=80;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:397,0,4995 -chr4 13543144 . T A 1171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=1.179;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1200,0,1527 -chr4 13551144 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.514;DP=74;FS=5.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:392,0,2230 -chr4 13712188 . T G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.359;QD=23.90;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:315,0,128 -chr4 13730263 . T C 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:450,30,0 -chr4 13966835 . C A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.877;DP=338;FS=0.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,76:337:99:1566,0,10207 -chr4 13971014 . G A 1544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.266;DP=288;FS=3.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,71:288:99:1573,0,8639 -chr4 13982767 . A AT 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-1.623;DP=29;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:416,0,261 -chr4 13986155 . A G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.699;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=7.58;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:377,0,1165 -chr4 13994499 . T G 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=-0.225;DP=477;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:396,79:475:99:905,0,15053 -chr4 13994824 . GAGGTAGGTGCCTTTTCTCTTCTGCATGAAGCTGTAATTAAAAAAAAAAGTGATTTAAGTGCAAGACAAATATGAATAAACACCATGTTTTGTGACTAACCT G 11419.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-0.800;DP=330;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.538;QD=34.61;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,303:306:99:11457,888,0 -chr4 14001604 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=-2.039;DP=87;FS=4.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,15:87:99:234,0,2733 -chr4 14029420 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.779;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=2.59;ReadPosRankSum=2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,20:113:99:321,0,3642 -chr4 14031574 . ACAGGTCAGGGTTAATTATATAATTATATATGCTTATAGTGCATCATAAAGTTCTGTATGATTTTACTTTTTTTTTTTGGCTTATGTGAT A 2999.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=1.329;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=27.11;ReadPosRankSum=-3.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,71:78:99:3037,0,412 -chr4 14032968 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.415;DP=81;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:242,0,2411 -chr4 14041939 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.380;DP=148;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,26:148:99:375,0,4613 -chr4 14042037 . T C 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-2.521;DP=165;FS=1.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=5.33;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,41:165:99:908,0,4747 -chr4 14049650 . TGGTAAGTCAGGATTCATTTGTTTAATGGTCCAAATCTGTTACATTTTGACACTTTATTCTCACTGAAATCTGCCTTTTTGGTTTGTTTTA T 4113.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.389;DP=101;FS=2.213;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=30.61;ReadPosRankSum=1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,88:91:99:4151,355,0 -chr4 14072821 . C CT 407.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.377;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,28:119:99:445,0,2400 -chr4 14073397 . CCAGGTATTTTGATAGAATCGGCAGCCTTCCTGTGTCTGCTGATCAGAAATCAATTAACATTGTTTGTTTTTTG C 3611.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=2.922;DP=90;FS=2.583;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=31.44;ReadPosRankSum=-1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,87:90:99:3649,319,0 -chr4 14120517 . C T 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=1.388;DP=225;FS=2.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,36:224:99:357,0,7947 -chr4 14123821 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.082;DP=177;FS=1.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=2.18;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,32:177:99:414,0,6179 -chr4 14123903 . T A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=-0.274;DP=163;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,34:162:99:565,0,5410 -chr4 14124393 . T G 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=-0.111;DP=176;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,34:176:99:398,0,9898 -chr4 14162019 . A G 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=-1.417;DP=131;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,32:131:99:711,0,3597 -chr4 14200882 . A G 842.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-2.302;DP=17;FS=3.468;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,14:16:29:871,29,0 -chr4 14286171 . C CT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-1.465;DP=69;FS=16.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:287,0,1085 -chr4 14313291 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=3.002;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:276,0,2029 -chr4 14651290 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.098;DP=112;FS=6.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.151;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,20:112:99:303,0,3574 -chr4 14823013 . C T 1650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=-1.953;DP=179;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,22:156:99:1679,0,5177 -chr4 14823138 . T A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-1.158;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.913;QD=10.43;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:362,0,5560 -chr4 14823292 . G C 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.537;DP=90;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,26:89:99:665,0,2424 -chr4 14823435 . A T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.917;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:60:99:1120,0,1186 -chr4 14823476 . G T 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-1.999;DP=93;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=13.89;ReadPosRankSum=2.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,37:85:99:1320,0,2124 -chr4 14824364 . G T 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-1.126;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:764,0,801 -chr4 14860491 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=1.406;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,20:74:99:464,0,2125 -chr4 14996459 . GGGTAAAAGTGATCTCCCAGAAGGCCAGAATTTATTTAAGAGTATACTATTCCTAATATTTCCCCTAATTTTCCACA G 2453.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.334;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2491,185,0 -chr4 15001424 . A AG 1954.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=2.878;DP=63;FS=8.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=31.03;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,53:62:84:1992,0,84 -chr4 15005161 . AGTGAGTGTGGAACATTGATAGCATTTTGAACACAGTCAATGTAACCTTACACTTTTGAGGCATTTGGATGCAAAGACTTTTTAGTTACATGCACGCTTCTGTCTTTATAG A 2409.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=1.270;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=29.92;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,61:64:99:2447,226,0 -chr4 15028179 . AAGGTAGGAAAATTCAATCTGATGTTATTGATTTTACTTTTTTATATTCTCAATGACCTTCAAGTATTGCATTGCATGTCTTATTCTTCTGC A 1226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=2.297;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=34.08;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,30:32:99:1264,0,832 -chr4 15143561 . G GA 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-0.404;DP=90;FS=4.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:371,0,1555 -chr4 15419735 . C CA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=-1.418;DP=58;FS=4.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:248,0,847 -chr4 15448496 . GACCTGGGCATTTTGACACAGATTAATGCGCTGTATTGATGCATTGAGGTGAAAGGGATGTTCGTTAGTCTTCACTTTAGAGGTGATTCAGT G 13704.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=1.700;DP=365;FS=4.299;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=32.74;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,347:352:99:13742,1019,0 -chr4 15748846 . GGAGGAGGATGAT G 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=3.022;DP=24;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:318,0,851 -chr4 15962539 . CAAAACACGATTTAAAATTACACAAATCCAATTCGTAACTTT C 2213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=1.035;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=33.04;ReadPosRankSum=-2.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,45:67:99:2251,0,1407 -chr4 15962854 . TCCA T 821.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=3.045;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:859,0,4297 -chr4 15962858 . TTTCATAACTTCAAAACACGATTCAAAAATACACAAATC T 821.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=4.016;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=16.43;ReadPosRankSum=-2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:50:99:859,0,4141 -chr4 16422891 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=1.310;DP=106;FS=12.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:303,0,3346 -chr4 16721273 . GGCAGGTAATGATAAACCCAGCACACTAGTTCAAGCGCGTGTCCTGATATGCGTCTGCTTAATTGTCGACTCATGTTGCC G 3692.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=2.262;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=30.60;ReadPosRankSum=-2.943 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,86:89:99:3730,300,0 -chr4 16729455 . CT C 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=1.185;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:357,0,105 -chr4 16775575 . GT G 522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.239;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,41:165:99:560,0,3425 -chr4 16888526 . G T 261.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:289,0,11 -chr4 17373088 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.254;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=28.06;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:92:393,0,92 -chr4 17497845 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:65:291,0,65 -chr4 17497846 . C G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:65:291,0,65 -chr4 17499414 . G T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=18.73;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,174 -chr4 17500547 . G T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:301,0,57 -chr4 17661148 . GT G 1519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=1.423;DP=85;FS=5.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,58:80:99:1557,0,319 -chr4 17922491 . GA G 3533.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.630;DP=97;FS=4.004;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=29.96;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:3571,352,0 -chr4 18053590 . G T 515.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:544,39,0 -chr4 18470176 . TTG T 728.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:766,52,0 -chr4 18645675 . G GAT 244 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:281,0,12 -chr4 18700519 . C T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr4 18701746 . T C 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.953;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:28:644,0,28 -chr4 18728607 . C A 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr4 18884911 . A AT 429.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:467,45,0 -chr4 18983597 . CT C 2918.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.14;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:79:99:2956,239,0 -chr4 18985903 . A G 3384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:3413,235,0 -chr4 18985906 . A G 3384.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:3413,235,0 -chr4 19003919 . A T 911.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:940,66,0 -chr4 19004161 . C T 1473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1502,108,0 -chr4 19033355 . C T 976.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=-1.707;DP=52;FS=1.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=18.79;ReadPosRankSum=2.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,38:45:13:1005,0,13 -chr4 19033634 . AT A 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.687;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.97;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:85:764,0,85 -chr4 19033679 . C T 1822.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1851,129,0 -chr4 19034282 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:33:418,0,33 -chr4 19034628 . G GT,GTT 706.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.666;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,27,11:39:99:1078,293,181,677,0,637 -chr4 19036655 . CA C 2500.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.082;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=26.32;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:2538,251,0 -chr4 19037562 . TAAA T 237.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.54;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:22:275,22,0 -chr4 19065366 . GCCTGGTGACAATAAAATACATTCATAAAGATGCAAAAACATTCTATGATGCTTTGAATCAGTTAATATAGTAATGCTAA G 1827.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=2.854;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=29.87;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,45:48:99:1865,0,532 -chr4 19085666 . C G 8593.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:209:99:8622,628,0 -chr4 19085828 . G T 5166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:5195,370,0 -chr4 19201691 . G A 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:574,42,0 -chr4 19202761 . A AC 534.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:572,54,0 -chr4 19203617 . G A 636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:665,45,0 -chr4 19204238 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr4 19405724 . C T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr4 19408230 . A G 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:320,27,0 -chr4 19413838 . T G 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:441,30,0 -chr4 19441730 . TA T 685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.805;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:50:723,50,0 -chr4 19441732 . A T 693.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-1.898;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=23.92;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:49:722,49,0 -chr4 19442089 . TAA T 746.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:85:1123,85,0 -chr4 19442601 . G A 1423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.050;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=31.21;ReadPosRankSum=-0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:99:1452,102,0 -chr4 19444603 . A G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr4 19838480 . T C 434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:463,33,0 -chr4 19838546 . G A 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 -chr4 19838945 . C T 900.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:929,66,0 -chr4 19839028 . G A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr4 19923662 . G GA 530.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.651;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=17.70;ReadPosRankSum=-1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:52:696,52,0 -chr4 20142054 . G A 1158.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=-0.690;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=29.71;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:23:1187,0,23 -chr4 20248030 . T TA 535.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=1.203;DP=28;FS=9.556;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:30:648,30,0 -chr4 20248412 . G A 2836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-2.219;DP=83;FS=3.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=34.18;ReadPosRankSum=-0.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,74:83:99:2865,0,205 -chr4 20248603 . G GT 737.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-1.139;DP=65;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,47:55:37:1017,0,37 -chr4 20401908 . G A 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=2.490;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.925;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,48:82:99:1582,0,1174 -chr4 20402126 . C T 1658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.205;DP=59;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=28.11;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,45:59:99:1687,0,301 -chr4 20425071 . TAA T 384.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:23:613,23,0 -chr4 20447679 . TTTCTCC T 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=2.781;DP=19;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=11.30;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:252,0,755 -chr4 20480338 . G A 1169.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=1.581;DP=35;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=33.42;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:20:1198,0,20 -chr4 20588204 . TCTGAAACAAAGACAGAATAGATAACGTTTACTTTGAGATGAAATTAATCTTTAATTGACTGCACTATGGAGAAGGACTTGCAGACGCAC T 14668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=3.924;DP=483;FS=9.391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=30.37;ReadPosRankSum=-3.949 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,473:481:99:21675,2087,0 -chr4 20656703 . T C 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr4 20688462 . A G 371.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=33.74;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:399,0,11 -chr4 20804537 . C A 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.927;ClippingRankSum=-1.805;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=23.16;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:422,0,456 -chr4 20871609 . G A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.468;DP=27;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=28.55;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:91:799,0,91 -chr4 20893532 . T A 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr4 21236449 . AT A 738.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:61:776,61,0 -chr4 21236617 . C T 528.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-1.042;DP=15;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=29.01;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:10:556,10,0 -chr4 21249243 . C G 1605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=-1.512;DP=57;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,44:57:99:1634,0,358 -chr4 21249366 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:289,0,809 -chr4 21249452 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=-2.361;DP=28;FS=13.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=8.49;ReadPosRankSum=1.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,717 -chr4 21252627 . AACCTGAGAGAAATTGAGAGACACATTTACAAAGATACTTTGGATTAACTTTTGTCAGTGTTTTACTCAAAGCAAAGAATTCGGTACAACGTT A 2340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=2.843;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=22.73;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,60:64:99:2378,0,565 -chr4 21254937 . T A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.726;DP=47;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:570,0,2214 -chr4 21254938 . C T 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=-0.383;DP=49;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:492,0,2331 -chr4 21255745 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=-0.338;DP=42;FS=5.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:248,0,1182 -chr4 21256970 . T A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=-0.732;DP=49;FS=7.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:296,0,1439 -chr4 21263793 . C A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.952;DP=44;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:316,0,1216 -chr4 21264459 . T C 1860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.784;DP=54;FS=7.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=34.46;ReadPosRankSum=-1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:99:1889,0,194 -chr4 21289301 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=3.065;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=12.82;ReadPosRankSum=-3.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:259,0,364 -chr4 21292823 . ACTAATAGCAGAAAACCCAAAAACACAAACATTCAGTGCCTGATGACACACAAACTCAACCTCAAACACCATACATGAACTGCACAGAC A 1752.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.315;DP=67;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,47:65:99:1790,0,2509 -chr4 21296536 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=22.12;ReadPosRankSum=-2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,456 -chr4 21299000 . TCTGATCACAGCAAAACACATGCATTTAGTAAAGTGATAAAAACTACAGATGATAAAAAGCTCGGTTTAAAACCTTGAGCGCACACAGGTGTTTGAACAAACTTAAATGCAAAACCTAGATGTAGATTAGATATCGCATTATTAAAAATGATGCGTTCATTATTGAAGATTAATAACCATAACTGCTAGAACCTATAC T 496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=3.597;DP=66;FS=4.391;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=7.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,52:57:99:534,194,0 -chr4 21299845 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=20.62;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:255,0,141 -chr4 21360683 . C CG 2210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=-0.690;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,65:80:99:2248,0,178 -chr4 21361486 . T A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=2.070;DP=78;FS=3.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,17:78:99:348,0,2126 -chr4 21361701 . G T 1719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=-0.760;DP=60;FS=6.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.019;QD=28.66;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,46:60:99:1748,0,298 -chr4 21362475 . T C 3488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.805;DP=104;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.490;QD=33.55;ReadPosRankSum=0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,90:104:95:3517,0,95 -chr4 21364580 . G A 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=1.014;DP=49;FS=9.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=31.95;ReadPosRankSum=1.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1594,0,99 -chr4 21368755 . A G 2824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.550;DP=91;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,78:91:76:2853,0,76 -chr4 21381177 . G A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.229;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=20.69;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:36:56:773,0,56 -chr4 21413097 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr4 21414456 . T A 2174.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:2203,178,0 -chr4 21414743 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.182;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:55:398,0,55 -chr4 21415982 . G A 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=-2.022;DP=463;FS=0.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=2.76;ReadPosRankSum=2.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:372,89:461:99:1304,0,13563 -chr4 21418134 . TGTACATATAAATATATATTTACATCATTTACCTGGTGTAAATTCCTCACAGCATGACTGATGCTTCTTCTCTTCGCATTTGCAG T 9459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=1.927;DP=267;FS=6.231;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=29.91;ReadPosRankSum=-2.273 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,260:265:99:11515,564,0 -chr4 21418360 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:301,0,135 -chr4 21419017 . AT A 286.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.091;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:19:324,0,19 -chr4 21419913 . C CA 261.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:299,24,0 -chr4 21428122 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.556;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=30.36;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:39:514,0,39 -chr4 21430307 . G A 538.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:36:567,36,0 -chr4 21571830 . C T 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.417;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=25.76;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:698,0,214 -chr4 21571875 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.784;DP=21;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=26.66;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:588,0,109 -chr4 21589689 . C T 523.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:552,39,0 -chr4 21589757 . A C 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:496,36,0 -chr4 21590816 . T A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.538;DP=17;FS=2.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=27.05;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:84:488,0,84 -chr4 21591280 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.372;DP=21;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:616,0,119 -chr4 21644837 . C T 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-2.439;DP=214;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,48:213:99:1027,0,6484 -chr4 21670339 . C T 6190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.511;DP=243;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.999;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,166:243:99:6219,0,3006 -chr4 21684281 . C T 2469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=-1.169;DP=114;FS=0.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=21.66;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,73:114:99:2498,0,1333 -chr4 21767478 . T A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:343,0,175 -chr4 21873719 . G T 368.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:397,27,0 -chr4 21873751 . C T 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -chr4 22058003 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=-1.009;DP=38;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=16.18;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:643,0,670 -chr4 22058449 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=-0.684;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:845,0,1738 -chr4 22058655 . AT A,ATT 679.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,9,21:30:99:727,591,753,210,0,200 -chr4 22058870 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.372;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=21.25;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:687,0,470 -chr4 22059099 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.436;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:695,0,688 -chr4 22063044 . TGGTAATGTAGCCTCAAAATGACTTTGTATTTTAATATAGTTTTTGTGTCTTGATATGAATGAGTTATTTATGGTAACTTCCTTA T 12022.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=2.452;DP=324;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=30.91;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,282:290:99:12060,873,0 -chr4 22068490 . T G 4033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=-0.911;DP=308;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=13.10;ReadPosRankSum=1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:193,114:307:99:4062,0,6857 -chr4 22070701 . T C 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-2.270;DP=91;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:779,0,2370 -chr4 22071311 . C A 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:273,21,0 -chr4 22278102 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.35;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:231,0,66 -chr4 22710089 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:245,0,337 -chr4 22710522 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.129;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:257,0,681 -chr4 22736510 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-1.286;DP=27;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:467,0,498 -chr4 22817867 . T G 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.498;DP=44;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:327,0,341 -chr4 22820757 . A ATG 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-1.295;DP=228;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.459;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,28:164:99:258,0,4598 -chr4 22822203 . ATT A,AT 528.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.246;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:5,17,21:43:99:891,322,495,318,0,378 -chr4 22823910 . G T 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.655;DP=31;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=15.44;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:507,0,570 -chr4 22848925 . G A 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=1.026;DP=163;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,42:163:99:811,0,4311 -chr4 24177151 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=-0.376;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.181;QD=4.72;ReadPosRankSum=1.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:316,0,1583 -chr4 24193158 . G T 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.955;DP=78;FS=10.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=11.19;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,27:77:99:901,0,1752 -chr4 24268158 . C T 4831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=-0.539;DP=796;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=6.07;ReadPosRankSum=6.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:584,211:795:99:4860,0,21636 -chr4 24286711 . T G 3741.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-2.111;DP=262;FS=2.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=14.28;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,108:262:99:3770,0,5271 -chr4 24288282 . C T 2161.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=-1.668;DP=218;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,68:208:99:2199,0,4963 -chr4 24288309 . A G 1708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.072;DP=207;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.519;QD=8.25;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,63:192:99:1737,0,5000 -chr4 24291020 . C T 3152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=1.523;DP=262;FS=7.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,93:262:99:3181,0,5783 -chr4 24307853 . T A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=1.356;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:365,0,220 -chr4 24315957 . C A 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.325;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.043;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:325,0,799 -chr4 24336944 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.436;DP=29;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:347,0,679 -chr4 24337168 . TCA T 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-1.326;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:357,0,1023 -chr4 24337179 . T A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.644;DP=38;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=8.39;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:347,0,1412 -chr4 24566828 . G C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=-0.359;DP=34;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:278,0,1002 -chr4 24697353 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=-0.128;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.114;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:278,0,955 -chr4 24697486 . GAGGTAAATGCTTCTGCTTCAGTGCTGATCCTGCTTCCTTGGATCAGCTTTTGTAGTTTAATTTCATTATCAATGTATTTTGTGTGCGTTTCCCACTTAGCCAGGTCTTTTTTAACTTTGTAATTATGTGTATATGTGTGTTCCTGT G 3307.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=2.199;DP=97;FS=3.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=34.10;ReadPosRankSum=-1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,85:93:99:3345,0,2469 -chr4 24697752 . AAGGTTTACTTGCCCAAATATACATTTTATATGTACAGTATCTACATTCGTAGCTTTTCTTATTGTTGAATGTAATTTTACTTTTTTAAACATGTAGTTTTGCTTGT A 2411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=-0.067;DP=99;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,72:99:99:2449,0,7232 -chr4 24704580 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=1.555;DP=74;FS=7.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:369,0,2235 -chr4 24714418 . T A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:495,33,0 -chr4 24720323 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.419;DP=27;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:385,0,689 -chr4 24725099 . G A 1111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-0.901;DP=62;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=17.93;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,31:62:99:1140,0,1624 -chr4 24734513 . G A 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.422;DP=48;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=20.08;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:992,0,660 -chr4 24743552 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=2.777;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:258,0,207 -chr4 24777251 . A G 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=-0.525;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=15.25;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:974,0,1154 -chr4 24814906 . G T 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.801;DP=48;FS=6.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,19:48:99:664,0,1011 -chr4 24818341 . A G 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=1.085;DP=39;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:607,0,685 -chr4 24821632 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-1.361;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:884,0,455 -chr4 24829851 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-1.506;DP=39;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=15.33;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:626,0,648 -chr4 24841939 . G A 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=-1.692;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:800,0,1196 -chr4 24846601 . G A 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.844;DP=151;FS=15.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,26:150:99:362,0,4622 -chr4 24926766 . TG T 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=-1.674;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:254,0,222 -chr4 24926869 . C A 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=-1.898;DP=49;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:594,0,1093 -chr4 24926900 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.798;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:249,0,1308 -chr4 24930158 . A G 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.950;DP=89;FS=7.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.816;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,29:89:99:805,0,2215 -chr4 24934085 . T G 1047.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.743;DP=93;FS=4.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,33:93:99:1076,0,2056 -chr4 24938384 . C G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.538;DP=66;FS=3.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:468,0,1797 -chr4 24948932 . T A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=-1.077;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=17.25;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:425,0,405 -chr4 24949202 . T A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-0.182;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.764;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:405,0,614 -chr4 24994988 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:233,0,384 -chr4 24995684 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=2.271;DP=19;FS=11.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,637 -chr4 25026336 . T A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.051;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:460,0,454 -chr4 25033394 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.193;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:251,0,407 -chr4 25033416 . A C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.491;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=16.89;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:366,0,354 -chr4 25033521 . C G 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.842;DP=35;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.974;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:587,0,625 -chr4 25033942 . A G 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.071;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=28.39;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:738,0,105 -chr4 25033969 . G T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.121;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:475,0,479 -chr4 25037642 . C T 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=-0.789;DP=39;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=19.22;ReadPosRankSum=1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,22:37:99:778,0,490 -chr4 25113375 . G A 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=1.254;DP=92;FS=1.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:817,0,2285 -chr4 25115835 . T C 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-0.755;DP=73;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,26:73:99:879,0,1595 -chr4 25115970 . C T 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=-1.746;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.593;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1084,0,1104 -chr4 25128971 . T C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=1.139;DP=69;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:235,0,2154 -chr4 25136083 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=-0.501;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,515 -chr4 25137663 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=-0.927;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:234,0,1338 -chr4 25137901 . T A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=3.031;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=9.78;ReadPosRankSum=-2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:263,0,569 -chr4 25166064 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=-0.066;DP=29;FS=5.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:439,0,567 -chr4 25166165 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=1.240;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.460;QD=7.62;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:272,0,1015 -chr4 25167955 . A AG 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-2.154;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:328,0,420 -chr4 25170679 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:259,0,60 -chr4 25196047 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=27.31;ReadPosRankSum=0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:356,0,266 -chr4 25196048 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:356,0,266 -chr4 25289020 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr4 25456423 . T C 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.244;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:286,0,1540 -chr4 25457403 . CA C 969.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-1.080;DP=49;FS=6.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:50:1007,0,50 -chr4 25457987 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.822;DP=78;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:388,0,2185 -chr4 25458049 . T A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=1.033;DP=55;FS=7.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:280,0,1542 -chr4 25458372 . C T 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.989;DP=59;FS=5.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,25:58:99:880,0,1118 -chr4 25458680 . G A 2060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.634;DP=74;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=27.85;ReadPosRankSum=-1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,55:73:99:2089,0,377 -chr4 25475467 . G A 1202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=-1.416;DP=72;FS=6.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:1231,0,1243 -chr4 25476896 . A C 968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=-0.780;DP=41;FS=5.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.807;QD=23.63;ReadPosRankSum=-1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:997,0,195 -chr4 25476962 . T C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=-0.234;DP=48;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.640;QD=7.54;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:390,0,1461 -chr4 25517797 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=1.517;DP=35;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:507,0,665 -chr4 25545928 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.532;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:311,0,50 -chr4 25546683 . A C 238.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:267,0,22 -chr4 25551116 . C T 326.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=32.69;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:355,0,15 -chr4 25643602 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.818;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:259,0,98 -chr4 25643649 . A G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.251;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:399,0,193 -chr4 25775028 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.448;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:295,0,253 -chr4 26118401 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:37:233,0,37 -chr4 26120017 . T C 280.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:309,0,19 -chr4 26164515 . ATT A 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-1.126;DP=28;FS=3.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:371,0,584 -chr4 26227380 . A G 256.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:285,24,0 -chr4 26227448 . C T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr4 26388057 . G A 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=-0.191;DP=117;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:616,0,3630 -chr4 26400829 . C A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.769;DP=41;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=17.68;ReadPosRankSum=2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:753,0,712 -chr4 26405436 . GAGGTGTGTGAGCATCTAACTATCAAATATAATGCTTTTTATATTTTTTGAGTTGCTTGTTTTAATATTTCTTTTTAATTGCTTCAT G 1921.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=1.100;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=25.93;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,44:48:99:1959,188,0 -chr4 26410638 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.729;DP=66;FS=8.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:278,0,2052 -chr4 26410824 . A G 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=2.382;DP=63;FS=8.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=14.39;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,27:63:99:935,0,1230 -chr4 26444702 . T A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-1.084;DP=55;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:415,0,1534 -chr4 27010199 . A T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.656;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:324,0,520 -chr4 27235306 . CTCAGGTCACATAAAATGTCGTAAAAAATAAAATAGCTAATTTATTTCTTTCAATTGTCCTGAATTTTTTGTTATTGTCATTTA C 654.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=1.732;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:692,0,1862 -chr4 27250730 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.888;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,840 -chr4 27521639 . CCCTGTGGAAAAAAAAAAACACAAACTTTCTCAGCATGGCAACAGAGTGGCTGTGGAATGTCACCAAGACTAAATATTTGGACAGGCACTATACAGATGAACAAGCGCTCTGTA C 1614.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=1.022;DP=48;FS=2.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,45:48:8:1651,0,8 -chr4 27525676 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=2.944;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:641,0,482 -chr4 27577073 . G T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.036;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.558;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:394,0,1918 -chr4 27680636 . CGTCATCAACATTCTTAATCATGCTAACAGAAAGCTACATTTCATGATTTATTTTCAGGAAT C 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-2.868;DP=143;FS=0.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,23:140:99:277,0,5031 -chr4 27681180 . G C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.813;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.790;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:389,0,303 -chr4 27681247 . A AC 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:336,0,548 -chr4 27681270 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.296;DP=19;FS=5.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:249,0,504 -chr4 27681509 . T C 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-1.204;DP=55;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1039,0,1389 -chr4 27681544 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-0.151;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.024;QD=9.16;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:358,0,1414 -chr4 27691494 . GA G 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=-1.379;DP=27;FS=4.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:476,0,99 -chr4 27759779 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.037;DP=36;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=5.72;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:234,0,1062 -chr4 27762066 . C G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.465;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,460 -chr4 27941997 . G T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.419;DP=27;FS=9.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:360,0,551 -chr4 28026627 . G A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 -chr4 28034676 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr4 28035164 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,173 -chr4 28073924 . T C 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:526,39,0 -chr4 28073956 . G T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 -chr4 28141079 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.912;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=15.04;ReadPosRankSum=1.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:329,0,549 -chr4 28146265 . C T 368.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=33.46;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:396,0,11 -chr4 28146345 . T C 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:478,33,0 -chr4 28157246 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=2.927;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,184 -chr4 28200409 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=25.48;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:385,0,137 -chr4 28216746 . C T 363.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:392,27,0 -chr4 28216758 . T C 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 -chr4 28314296 . A G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:347,24,0 -chr4 28315172 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=-0.667;DP=16;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:474,0,221 -chr4 28347756 . CT C 387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:36:425,36,0 -chr4 28350209 . G T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=-1.202;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.202;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:335,0,131 -chr4 28451698 . T G 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:258,21,0 -chr4 28451876 . G A 1152.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:87:1181,87,0 -chr4 28453028 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr4 28485404 . C A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-0.536;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:303,0,127 -chr4 28487186 . G T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-2.318;DP=46;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.805;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:316,0,1548 -chr4 28488240 . ACT A 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.651;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:265,0,1202 -chr4 28588277 . G A 244.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.60;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:273,0,22 -chr4 28588532 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.380;DP=6;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=28.90;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:248,0,134 -chr4 28589233 . A G 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,13:13:76:376,0,76 -chr4 28589508 . C T 258.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:23:287,23,0 -chr4 28590034 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=2.848;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=18.05;ReadPosRankSum=0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:299,0,264 -chr4 28590050 . C G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:379,0,129 -chr4 28590205 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=2.496;DP=31;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=11.54;ReadPosRankSum=2.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:386,0,721 -chr4 28598950 . T C 576.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:605,42,0 -chr4 28687125 . A C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=18.80;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,244 -chr4 28944793 . C G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-1.920;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:239,0,191 -chr4 28965788 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr4 28967135 . T C 496.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:525,36,0 -chr4 29079731 . T A 444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:473,33,0 -chr4 29097738 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr4 29158455 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:250,18,0 -chr4 29196293 . T C 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.380;DP=19;FS=9.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=23.46;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:474,0,164 -chr4 29196310 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.184;DP=16;FS=9.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:393,0,173 -chr4 29197202 . T C 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.20;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 -chr4 29222925 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.850;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:584,0,118 -chr4 29223524 . C A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:234,0,65 -chr4 29223762 . A G 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:488,33,0 -chr4 29223771 . T C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:488,33,0 -chr4 29224170 . A G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=27.91;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:48:372,0,48 -chr4 29224354 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:2:99:234,0,176 -chr4 29265981 . A AT 229.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;QD=15.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41:357,41,0 -chr4 29282332 . T G 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=-0.933;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=30.82;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:46:737,0,46 -chr4 29282477 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.752;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=16.24;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:288,0,285 -chr4 29282959 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.18;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:54:310,0,54 -chr4 29283041 . A C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.795;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=15.04;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:299,0,310 -chr4 29283953 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.623;DP=14;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=26.55;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:76:400,0,76 -chr4 29283975 . TA T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=24.41;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:257,0,54 -chr4 29402262 . T G 207.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.69;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:236,0,19 -chr4 29529604 . C T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr4 29560195 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,245 -chr4 29637653 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:309,0,48 -chr4 29637692 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:242,0,53 -chr4 29638585 . TCAGGTGAGATGTCTAGTTGGAACAACAGCAGCATTATTAAGTGGATGCTAAAGTTTTACCATCACTAACGCTTTATTTCCCTTCTCTC T 13713.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.019;DP=320;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=30.40;ReadPosRankSum=-0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,318:320:99:13751,1141,0 -chr4 29661608 . G GT 1105.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-2.523;DP=121;FS=9.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,38:117:99:1143,0,5570 -chr4 29687702 . C G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.849;DP=15;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=27.18;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:436,0,125 -chr4 29848682 . TAA T 261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr4 29914033 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=11;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:99:343,0,102 -chr4 29996745 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.042;DP=50;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:420,0,1349 -chr4 29997725 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-0.479;DP=53;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=16.01;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,23:52:99:877,0,1951 -chr4 29997726 . A C 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=-0.656;DP=52;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:877,0,1943 -chr4 29997872 . G A 1666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1695,117,0 -chr4 29998083 . G C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.116;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:336,0,1447 -chr4 29998284 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=-1.087;DP=59;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=6.25;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:397,0,1548 -chr4 29998585 . A C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=1.727;DP=28;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:601,0,309 -chr4 29998614 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.936;DP=31;FS=5.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:256,0,832 -chr4 29998771 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=2.850;DP=35;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.774;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:251,0,1017 -chr4 29998827 . A T 1079.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.043;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=27.73;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:45:1108,45,0 -chr4 30134593 . A T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr4 30155221 . C G 281.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=6;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=24.49;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:7:309,0,7 -chr4 30212342 . A G 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr4 30303894 . A G 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.942;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=25.54;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:83:488,0,83 -chr4 30304373 . T C 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.070;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=32.77;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:32:618,0,32 -chr4 30304494 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=-0.363;DP=25;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:401,0,528 -chr4 30305339 . T C 1408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-2.489;DP=32;FS=2.614;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:44:1437,44,0 -chr4 30351435 . G A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=1.710;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.184;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:460,0,198 -chr4 30351608 . C G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=-0.760;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:408,0,740 -chr4 30493530 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=-1.082;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=10.32;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:245,0,486 -chr4 30494352 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=1.586;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=15.77;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:454,0,514 -chr4 30512510 . T C 519.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:548,39,0 -chr4 30771641 . G C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=1.036;DP=10;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=20.48;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,284 -chr4 31153641 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:235,0,110 -chr4 31224025 . T G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=22.53;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:231,0,53 -chr4 31224044 . T C 201.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:230,0,22 -chr4 31265446 . T G 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:688,48,0 -chr4 31273950 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.257;DP=33;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:240,0,845 -chr4 31273979 . A C 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.453;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:553,0,153 -chr4 31274227 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.579;DP=21;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=11.80;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:276,0,412 -chr4 31274492 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.487;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=11.27;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:400,0,858 -chr4 31323792 . A T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.120;DP=29;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=8.79;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:283,0,946 -chr4 31324135 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.512;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:272,0,539 -chr4 31324247 . A T 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.639;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=23.17;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:57:799,57,0 -chr4 31324257 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=-1.303;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=29.72;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:99:593,0,126 -chr4 31324407 . G A 1299.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-0.122;DP=39;FS=8.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=33.33;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,33:37:14:1328,0,14 -chr4 31324503 . G A 920.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.420;ClippingRankSum=0.622;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:3:947,0,3 -chr4 31337196 . T C 4669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.748;DP=86;FS=2.057;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=29.18;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,82:86:99:4698,328,0 -chr4 31337210 . C T 4669.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=1.378;DP=83;FS=5.948;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=31.08;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:83:99:4698,328,0 -chr4 31337574 . C T 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.210;DP=80;FS=1.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:986,0,1746 -chr4 31337775 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.289;DP=76;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.301;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,20:76:99:392,0,3439 -chr4 31337797 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-0.686;DP=67;FS=2.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.473;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,14:67:99:283,0,4626 -chr4 31337817 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-1.376;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:283,0,4626 -chr4 31338205 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=-1.739;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:283,0,221 -chr4 31338430 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.292;DP=38;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=16.84;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:668,0,739 -chr4 31359862 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr4 31360020 . T G 668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:697,51,0 -chr4 31360079 . T G 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:581,45,0 -chr4 31360721 . C T 266.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:295,24,0 -chr4 31360857 . G T 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr4 31391125 . A G 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.969;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:34:589,0,34 -chr4 31454162 . G A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr4 31497503 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.116;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=12.39;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:276,0,418 -chr4 31499811 . G T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=-0.177;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:334,0,536 -chr4 31499846 . A G 636.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-1.327;DP=18;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=26.28;ReadPosRankSum=1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:9:664,9,0 -chr4 31567482 . A G 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:417,30,0 -chr4 31567486 . A G 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:417,30,0 -chr4 31567609 . G A 561.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.217;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=31.09;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:589,6,0 -chr4 31567655 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:243,0,63 -chr4 31646799 . A AT 577.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.320;DP=25;FS=22.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.010;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:615,0,204 -chr4 31647553 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=-0.248;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,102 -chr4 31684045 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr4 31684052 . A T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:257,18,0 -chr4 31685315 . A C 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr4 31685492 . A G 776.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:805,54,0 -chr4 31685497 . C G 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=-1.118;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:47:581,0,47 -chr4 31744879 . G A 245.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:274,0,13 -chr4 31757452 . A T 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:358,27,0 -chr4 31805401 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.313;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.313;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:99:288,0,2030 -chr4 31805735 . T C 994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1023,75,0 -chr4 31805977 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.470;DP=29;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:375,0,580 -chr4 31806046 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.367;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:378,0,318 -chr4 31806970 . C T 468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:497,36,0 -chr4 31941950 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-1.083;DP=49;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:289,0,1528 -chr4 31942092 . G C 959.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.081;DP=61;FS=5.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=15.73;ReadPosRankSum=2.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,30:53:99:988,0,963 -chr4 31942158 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.011;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,1270 -chr4 31942209 . G T 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.334;DP=43;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.302;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:399,0,983 -chr4 31942278 . C T 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-1.500;DP=39;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:851,0,1398 -chr4 31942708 . T C 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=-0.283;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:600,0,547 -chr4 31961873 . A G 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.250;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:97:557,0,97 -chr4 31962713 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 32044372 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:244,0,107 -chr4 32094236 . T C 1289.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.263;DP=34;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.788;QD=31.89;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1318,96,0 -chr4 32094741 . C T 361.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:390,27,0 -chr4 32105553 . G T 723.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:752,54,0 -chr4 32118928 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=18.65;ReadPosRankSum=0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:364,0,252 -chr4 32233492 . T C 579.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:608,45,0 -chr4 32233870 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=-1.202;DP=25;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=8.03;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:229,0,1182 -chr4 32233891 . G A 768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.131;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=22.61;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:797,0,660 -chr4 32309799 . C T 828.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:857,60,0 -chr4 32494231 . G T 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 -chr4 32494299 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.053;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=22.83;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:462,0,163 -chr4 32536406 . C T 363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:392,30,0 -chr4 32577080 . C T 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 -chr4 32577104 . G T 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 -chr4 32625109 . C A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.619;DP=21;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=27.94;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:615,0,114 -chr4 32686532 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=-1.093;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:254,0,227 -chr4 32852591 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,445 -chr4 32852594 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.309;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.65;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:276,0,445 -chr4 32852640 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=1.775;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=29.52;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:99:412,0,565 -chr4 32852658 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-1.528;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.845;QD=23.40;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:426,0,565 -chr4 32852775 . A C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:95:352,0,95 -chr4 32852829 . A G 329.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.90;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:357,0,12 -chr4 32852878 . C T 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=-1.404;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=33.77;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,22:27:80:940,0,80 -chr4 32852940 . G C 594.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-1.008;DP=45;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:623,0,950 -chr4 32853090 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.936;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:320,0,1321 -chr4 32853278 . G C 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.180;DP=31;FS=3.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=21.15;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:684,0,945 -chr4 32853288 . C T 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=-1.232;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:680,0,945 -chr4 32853641 . T C 782.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:57:811,57,0 -chr4 32853654 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=33.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96:264,0,96 -chr4 32853810 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:241,0,59 -chr4 32854592 . A G 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr4 32894918 . C T 203.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:232,0,21 -chr4 32984813 . G C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.150;DP=18;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,531 -chr4 32984817 . A C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=1.000;DP=14;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.98;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:294,0,531 -chr4 33111993 . G A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=1.074;DP=30;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.601;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:445,0,776 -chr4 33112671 . T C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-1.123;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:263,0,838 -chr4 33113032 . A G 619.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:648,48,0 -chr4 33113064 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.780;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:249,0,271 -chr4 33148223 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=1.500;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=31.16;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:776,0,243 -chr4 33148332 . G A 353.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:382,30,0 -chr4 33148427 . T G 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=2.437;DP=47;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,36:46:99:1402,0,356 -chr4 33148641 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.998;DP=40;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:510,0,2045 -chr4 33148647 . C T 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.666;DP=41;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:510,0,2030 -chr4 33148734 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 33162582 . G C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.720;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:731,0,413 -chr4 33177408 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:355,0,356 -chr4 33395437 . G T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 33407358 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.031;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=9.67;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:270,0,584 -chr4 33407449 . A G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 -chr4 33543322 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr4 33543425 . A G 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:513,36,0 -chr4 33760466 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,253 -chr4 33789116 . C A 2324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=-1.079;DP=83;FS=7.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=28.01;ReadPosRankSum=1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,61:81:99:2353,0,1018 -chr4 33789119 . T G 2705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=-1.216;DP=83;FS=5.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.465;QD=32.60;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,65:81:99:2734,0,243 -chr4 33801332 . C T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr4 33801356 . G A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr4 33886265 . G T 353.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:382,27,0 -chr4 33886939 . A T 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr4 33887769 . A T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-2.415;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.485;QD=26.28;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:659,0,151 -chr4 33899564 . C T 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr4 33899571 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr4 33944985 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=-0.752;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=16.62;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:477,0,710 -chr4 33945018 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=1.911;DP=61;FS=7.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:248,0,3490 -chr4 33945019 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=1.246;DP=61;FS=7.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,11:54:99:248,0,3490 -chr4 34047973 . A G 283.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:312,0,19 -chr4 34066073 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr4 34142734 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=1.381;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.98;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:288,0,161 -chr4 34154328 . A G 1107.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1136,84,0 -chr4 34154358 . A T 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:895,63,0 -chr4 34156018 . G GAA 219.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:257,17,0 -chr4 34166940 . T G 469.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.935;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=32.18;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:497,0,6 -chr4 34184582 . G A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr4 34188865 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr4 34227955 . T C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr4 34248178 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=3.067;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.794;QD=14.45;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:245,0,284 -chr4 34248718 . T A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr4 34248860 . C G 1024.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=1.326;DP=34;FS=2.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=30.14;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:42:1053,0,42 -chr4 34248926 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=26.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:238,0,63 -chr4 34249154 . T C 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=21.26;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:815,0,162 -chr4 34368161 . TAA T 259.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.05;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr4 34397729 . G A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.520;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=28.80;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:70:633,0,70 -chr4 34419524 . T A 245.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.73;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:274,0,21 -chr4 34459595 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=-4.192;DP=27;FS=38.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:266,0,786 -chr4 34459611 . G C 774.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:60:803,60,0 -chr4 34459691 . A C 647.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=-0.863;DP=23;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=28.17;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:17:676,0,17 -chr4 34459722 . T G 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:415,30,0 -chr4 34459845 . C T 2185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=2.370;DP=78;FS=29.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=28.02;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,62:78:99:2214,0,306 -chr4 34459990 . G T 1867.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-2.902;DP=71;FS=4.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.31;ReadPosRankSum=-1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,49:55:14:1896,0,14 -chr4 34460416 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr4 34474151 . G A 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr4 34516556 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.48;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:262,0,176 -chr4 34621955 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-1.769;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.56;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,132 -chr4 34622463 . C T 2404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.321;DP=56;FS=1.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=30.79;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:2433,0,2838 -chr4 34622543 . T A 2385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.970;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.129;QD=30.20;ReadPosRankSum=-0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,3:32:99:2414,0,2838 -chr4 34622681 . A G 2388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-1.243;DP=95;FS=2.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,61:73:99:2417,0,2838 -chr4 34622812 . C CA 705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=-0.659;DP=41;FS=1.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.391;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:743,0,317 -chr4 34622845 . C T 550.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:39:579,39,0 -chr4 34622859 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=1.307;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=14.78;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:250,0,163 -chr4 34622957 . T A 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:335,24,0 -chr4 34633802 . C A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr4 34717369 . C T 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr4 34718413 . C T 253.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:282,0,22 -chr4 34745868 . A C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr4 34820186 . C T 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr4 34821678 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=-1.422;DP=11;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:96:236,0,96 -chr4 34822518 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.179;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:277,0,702 -chr4 34837842 . G T 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 -chr4 34837889 . T C 899.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:928,63,0 -chr4 34837912 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-1.268;DP=42;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,458 -chr4 34838122 . C T 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=-0.382;DP=29;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=27.61;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:829,0,256 -chr4 34838240 . A C 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:235,0,65 -chr4 34838879 . C A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.903;DP=18;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=22.02;ReadPosRankSum=-0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:765,0,242 -chr4 34838886 . T A 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.208;DP=25;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:765,0,242 -chr4 34839001 . G A 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=3.538;DP=62;FS=11.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=25.35;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,40:58:99:1600,0,1236 -chr4 34839003 . T A 1571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=3.345;DP=59;FS=12.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,37:55:99:1600,0,1240 -chr4 34839045 . T C 371.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:400,27,0 -chr4 34839082 . C T 896.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:925,66,0 -chr4 34839121 . C T 3304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=1.688;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.899;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:79:99:3333,232,0 -chr4 34840583 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=4.309;DP=50;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=4.64;ReadPosRankSum=-3.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:260,0,1453 -chr4 34841036 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=1.240;DP=21;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:42:507,0,42 -chr4 34841086 . T TA 413.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.873;DP=29;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:23:451,0,23 -chr4 34841139 . C T 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.714;DP=27;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:30:575,0,30 -chr4 34841795 . T C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=-1.411;DP=46;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:627,0,649 -chr4 34841955 . A G 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=-1.609;DP=48;FS=6.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:638,0,1409 -chr4 34842496 . T A 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 -chr4 34857156 . A T 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 -chr4 34857427 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.400;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=21.45;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:350,0,321 -chr4 34857573 . T G 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr4 34857857 . T G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr4 34890996 . C A,G 585.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,2,14:16:90:622,580,1194,90,0,131 -chr4 34899547 . T C 2640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=-1.026;DP=64;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=33.57;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,47:59:99:2669,0,152 -chr4 34899549 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.282;DP=62;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:392,0,3391 -chr4 34900501 . T G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr4 34900758 . T C 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 -chr4 34900775 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:272,0,54 -chr4 35088207 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=30.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=24.63;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:373,0,129 -chr4 35088404 . G A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.031;DP=22;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:500,0,150 -chr4 35088736 . A T 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-2.023;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.347;QD=14.65;ReadPosRankSum=2.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:506,0,177 -chr4 35088737 . A T 1003.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.179;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=31.37;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:1042,75,0 -chr4 35093885 . CCT C 238.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=1.875;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.691;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:18:276,0,18 -chr4 35094450 . C T 666.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:695,48,0 -chr4 35094801 . T G 622.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:651,45,0 -chr4 35097574 . T A 264.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=14;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:293,0,18 -chr4 35247675 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:65:245,0,65 -chr4 35558115 . C G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=1.090;DP=32;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=7.02;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:253,0,890 -chr4 35610086 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.696;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:305,0,174 -chr4 35644369 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.58;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:294,0,57 -chr4 35644734 . G A 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=1.171;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=22.71;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:437,0,274 -chr4 35653648 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.647;DP=26;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.57;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:303,0,700 -chr4 35752328 . T G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=1.905;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,428 -chr4 35848742 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.134;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=19.31;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,180 -chr4 35859398 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.717;DP=28;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=16.46;ReadPosRankSum=0.785 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:489,0,272 -chr4 35859669 . C T 335.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=33.60;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:13:364,0,13 -chr4 35932970 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=24.43;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:297,0,135 -chr4 36025950 . G T 338.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:367,27,0 -chr4 36026055 . T C 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=2.606;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.251;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:78:584,0,78 -chr4 36114277 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=1.393;DP=11;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=34.07;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:50:403,0,50 -chr4 36114290 . C A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:50:403,0,50 -chr4 36114949 . G A 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:467,33,0 -chr4 36115067 . C G 874.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:66:903,66,0 -chr4 36115094 . T A 808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:60:837,60,0 -chr4 36115111 . A G 808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:60:837,60,0 -chr4 36115113 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,0:5:99:467,0,689 -chr4 36115161 . A G 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.393;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=31.95;ReadPosRankSum=0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:1274,0,317 -chr4 36115163 . A G 1245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.454;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:1274,0,300 -chr4 36115209 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.366;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:311,0,2177 -chr4 36115312 . G T 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.502;DP=59;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=11.52;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:708,0,1370 -chr4 36115356 . A C 1963.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1992,138,0 -chr4 36115440 . G A 1253.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:90:1282,90,0 -chr4 36115475 . A G 1358.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:99:1387,99,0 -chr4 36115547 . T C 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr4 36119946 . T G 270.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:299,24,0 -chr4 36120084 . A G 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:54:761,54,0 -chr4 36120897 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:264,0,64 -chr4 36290967 . C T 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr4 36291173 . C A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=27.56;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:359,0,93 -chr4 36293956 . CT C 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.170;DP=20;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=19.59;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:96:429,0,96 -chr4 36409956 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=3.656;DP=60;FS=20.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=6.76;ReadPosRankSum=-2.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:434,0,1972 -chr4 36528669 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:357,0,281 -chr4 36528737 . A C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.059;DP=17;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:340,0,333 -chr4 36528833 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-0.825;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=22.11;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:382,0,218 -chr4 36570473 . G A 765.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:794,57,0 -chr4 36570529 . G A 885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=1.412;DP=30;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=29.53;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:48:914,0,48 -chr4 36570613 . A G 667.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:54:696,54,0 -chr4 36570680 . C T 1272.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1301,81,0 -chr4 36570698 . A T 1272.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:81:1301,81,0 -chr4 36570894 . T C 729.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=-0.137;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=29.19;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:67:758,0,67 -chr4 36570922 . A G 1360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:99:1389,106,0 -chr4 36571036 . A T 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.323;DP=36;FS=4.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=28.59;ReadPosRankSum=-0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:1332,0,127 -chr4 36571054 . G T 1797.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:99:1826,126,0 -chr4 36646651 . T G 2302.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=29.05;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:99:2331,168,0 -chr4 36646659 . G T 2300.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=32.02;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:99:2329,168,0 -chr4 36646729 . A G 2298.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:99:2327,168,0 -chr4 36646770 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.858;DP=32;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.770;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:302,0,807 -chr4 36646840 . C T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=1.986;DP=96;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,33:82:99:1143,0,1678 -chr4 36646882 . G C 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.237;DP=89;FS=4.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,27:82:99:712,0,2518 -chr4 36646994 . C T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=1.609;DP=45;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:419,0,2027 -chr4 36647010 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.582;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:238,0,1295 -chr4 36647018 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-2.326;DP=34;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:277,0,1293 -chr4 36647121 . A G 1206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=1.510;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=25.12;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:99:1235,0,121 -chr4 36647249 . G A 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=-1.738;DP=12;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=36.33;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:75:1080,75,0 -chr4 36647333 . T C 1490.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=-1.394;DP=40;FS=2.191;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=27.57;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,33:37:31:1519,31,0 -chr4 36647406 . G C,T 403.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.810;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,10,4:15:99:523,120,134,368,0,441 -chr4 36647666 . A AT 226.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-2.127;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=9.86;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:264,0,300 -chr4 36647718 . C A 675.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:704,51,0 -chr4 36647734 . A T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,103 -chr4 36647790 . G A 2219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=-0.332;DP=20;FS=2.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=27.79;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:99:2248,156,0 -chr4 36647863 . T C 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.948;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:559,0,1956 -chr4 36647884 . A T 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.291;DP=39;FS=5.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:751,0,1461 -chr4 36647935 . A G 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:95:320,0,95 -chr4 36648072 . T C 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:351,24,0 -chr4 36648102 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=26.34;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:318,0,189 -chr4 36648224 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.885;DP=29;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=24.61;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:742,0,272 -chr4 36648360 . T C 2221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.540;DP=14;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=29.97;ReadPosRankSum=-0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:2250,0,2293 -chr4 36648469 . C T 2191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.515;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.296;QD=29.62;ReadPosRankSum=-0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,8:69:99:2220,0,2294 -chr4 36648551 . T A 1199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=2.670;DP=146;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.503;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,52:135:99:1228,0,5662 -chr4 36648915 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=3.004;DP=29;FS=3.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=15.37;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:474,0,924 -chr4 36649097 . A AAG 227.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=-1.517;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.378;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:265,0,227 -chr4 36857898 . T G 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=-0.572;DP=31;FS=1.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:622,0,415 -chr4 36972810 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:301,0,177 -chr4 36983341 . C T 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=2.583;DP=22;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.953;QD=22.90;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:74:532,0,74 -chr4 37050595 . T G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr4 37134566 . T C 346.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:375,27,0 -chr4 37134592 . C A 747.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:776,54,0 -chr4 37134686 . G A 608.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:637,45,0 -chr4 37134817 . G T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:61:292,0,61 -chr4 37243326 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=14.20;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:298,0,378 -chr4 37243427 . A T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=26.29;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:370,0,119 -chr4 37338198 . A T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=-0.088;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=14.07;ReadPosRankSum=1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:366,0,478 -chr4 37338330 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.356;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.287;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:431,0,399 -chr4 37398289 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-1.202;DP=23;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:301,0,489 -chr4 37398553 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=1.268;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:231,0,181 -chr4 37409001 . C T 536.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.134;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=24.40;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:0:562,0,0 -chr4 37409238 . T C 858.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.544;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=27.68;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:10:886,0,10 -chr4 37409297 . T A 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=-0.765;DP=31;FS=29.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=18.28;ReadPosRankSum=3.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:595,0,448 -chr4 37409409 . T A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=-1.660;DP=21;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=21.85;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:90:487,0,90 -chr4 37409554 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.072;DP=16;FS=15.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=27.99;ReadPosRankSum=-1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:90:476,0,90 -chr4 37416669 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.772;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=19.12;ReadPosRankSum=2.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:315,0,261 -chr4 37416744 . C G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.244;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.788;QD=20.90;ReadPosRankSum=1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:279,0,302 -chr4 37416746 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=22.80;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,302 -chr4 37416895 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-1.418;DP=22;FS=1.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:360,0,388 -chr4 37416910 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.913;DP=23;FS=16.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:311,0,482 -chr4 37416966 . T G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=-0.328;DP=18;FS=4.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=23.82;ReadPosRankSum=2.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:457,0,202 -chr4 37417805 . C T 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.525;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:927,0,195 -chr4 37418142 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:392,0,174 -chr4 37448013 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:345,0,205 -chr4 37470996 . A G 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr4 37501013 . T A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=23.73;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:313,0,53 -chr4 37501073 . A G 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=-1.964;DP=60;FS=13.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.01;ReadPosRankSum=2.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:1049,0,526 -chr4 37501134 . A G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=1.590;DP=117;FS=9.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=6.76;ReadPosRankSum=-2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,7:92:99:819,0,10179 -chr4 37501157 . T G 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;ClippingRankSum=6.434;DP=126;FS=21.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=6.27;ReadPosRankSum=-5.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,22:94:99:818,0,10179 -chr4 37501172 . A C 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=5.493;DP=130;FS=11.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,26:97:99:820,0,10179 -chr4 37501263 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=2.976;DP=48;FS=18.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:352,0,2657 -chr4 37501264 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=2.179;DP=46;FS=25.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=6.89;ReadPosRankSum=-1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:345,0,2657 -chr4 37502806 . C T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-1.211;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=1.39;ReadPosRankSum=2.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,18:97:99:347,0,6835 -chr4 37503213 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=2.299;DP=23;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:304,0,485 -chr4 37503995 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.500;DP=26;FS=13.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,1184 -chr4 37503996 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.991;DP=26;FS=13.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:333,0,1185 -chr4 37504661 . A AT 436.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.246;DP=53;FS=39.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=1.800;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,34:50:99:816,0,427 -chr4 37649600 . G T 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.044;DP=40;FS=1.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=16.44;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:686,0,589 -chr4 37649627 . T A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.367;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:237,0,939 -chr4 37649970 . A C 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.101;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=20.51;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:99:664,0,400 -chr4 37650032 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-1.299;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:278,0,340 -chr4 37650065 . G T 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=1.843;DP=20;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=22.66;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:32:1045,0,32 -chr4 37650149 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=-1.194;DP=28;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:285,0,570 -chr4 37693469 . A C 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.771;DP=24;FS=9.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=30.97;ReadPosRankSum=2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:36:1045,0,36 -chr4 37890990 . C A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-1.313;DP=41;FS=4.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:952,0,1122 -chr4 37890991 . G A 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=-1.872;DP=40;FS=9.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=23.09;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:40:99:952,0,1122 -chr4 37905440 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=-0.365;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,234 -chr4 37932977 . T C 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:48:312,0,48 -chr4 37991794 . C G 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr4 38006817 . A G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr4 38079623 . A T 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr4 38079717 . A T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.233;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=26.30;ReadPosRankSum=1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:712,0,134 -chr4 38079760 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:29:268,0,29 -chr4 38079864 . A G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr4 38079936 . A G 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:613,42,0 -chr4 38080118 . A G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=-1.000;DP=12;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=17.90;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:243,0,206 -chr4 38249969 . T A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr4 38389404 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.97;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:262,0,51 -chr4 38389426 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=30.43;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:363,0,100 -chr4 38441812 . G T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr4 38471776 . C G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:377,27,0 -chr4 38475375 . A C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr4 38578678 . C T 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr4 38616927 . G T 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=-1.876;DP=20;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=12.84;ReadPosRankSum=-1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:311,0,408 -chr4 38635027 . T A 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr4 38680701 . A G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-0.934;DP=14;FS=6.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.70;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:430,0,84 -chr4 38711192 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=30.40;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:393,0,49 -chr4 38880708 . G T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=1.398;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=27.66;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:77:609,0,77 -chr4 38886863 . T A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.638;DP=28;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:341,0,571 -chr4 38887054 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-2.141;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.15;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:258,0,177 -chr4 38911508 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.637;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:245,0,291 -chr4 38946984 . G C 646.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:675,48,0 -chr4 38949069 . T C 527.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:556,42,0 -chr4 38952172 . T C 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,24:24:99:844,0,131 -chr4 38953011 . A T 605.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=1.504;DP=21;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=28.81;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:11:633,11,0 -chr4 38964717 . G A 388.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:417,30,0 -chr4 39096653 . C T 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.474;DP=22;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:468,0,170 -chr4 39096691 . C T 440.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:469,33,0 -chr4 39120913 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-0.342;DP=37;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=9.70;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:387,0,752 -chr4 39121156 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-1.077;DP=67;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:744,0,1544 -chr4 39121833 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.009;DP=129;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=3.39;ReadPosRankSum=2.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,26:128:99:466,0,4533 -chr4 39122459 . G C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-1.533;DP=90;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:270,0,3358 -chr4 39122492 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.643;DP=75;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:323,0,2638 -chr4 39122747 . T G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.390;DP=129;FS=21.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,22:118:99:374,0,3817 -chr4 39223820 . G T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-2.423;DP=26;FS=4.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:487,0,265 -chr4 39369342 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.731;DP=11;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,199 -chr4 39369343 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.895;DP=11;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.34;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,199 -chr4 39377369 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr4 39398330 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.43;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:264,0,124 -chr4 39574265 . A G 1423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1452,99,0 -chr4 39574654 . C T 615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.465;DP=44;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:644,0,888 -chr4 39575070 . A G 512.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:541,39,0 -chr4 39575084 . A T 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:447,33,0 -chr4 39575398 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.326;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:278,0,480 -chr4 39575457 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.141;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:453,0,249 -chr4 39575535 . T C 683.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.050;DP=21;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=32.57;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:13:712,0,13 -chr4 39575737 . T A 1041.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1070,75,0 -chr4 39576240 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.755;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.491;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:581,0,530 -chr4 39576861 . T C 2135.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2164,153,0 -chr4 39577140 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-1.565;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:279,0,827 -chr4 39577551 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=-3.050;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=13.94;ReadPosRankSum=2.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:544,0,762 -chr4 39577656 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-1.450;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.162;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:572,0,1055 -chr4 39577699 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-1.133;DP=36;FS=5.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:307,0,922 -chr4 39577941 . T G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.149;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:266,0,1179 -chr4 39578298 . A T 1606.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1635,117,0 -chr4 39603318 . A T 292.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:321,0,16 -chr4 39604046 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-0.501;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:344,0,533 -chr4 39669559 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=-1.900;DP=49;FS=2.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:579,0,1014 -chr4 39669798 . C G 889.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=1.722;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=15.89;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:918,0,1560 -chr4 39669812 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.164;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:312,0,2807 -chr4 39669871 . GA G 263.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.170;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.755;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:71:305,0,71 -chr4 39670129 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=1.604;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:239,0,1141 -chr4 39671101 . T C 578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=1.564;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:607,0,884 -chr4 39972442 . C T 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 -chr4 39998635 . T A 1860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:1889,132,0 -chr4 39998650 . G C 1281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=-0.474;DP=19;FS=3.542;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=34.03;ReadPosRankSum=-1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,15:18:27:1310,27,0 -chr4 39998714 . G A 1645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.894;DP=96;FS=8.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.021;QD=17.14;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,32:77:99:1674,0,1714 -chr4 39998716 . CA C 3929.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3967,302,0 -chr4 39998844 . A G 6676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=-5.092;DP=489;FS=25.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,189:444:99:6705,0,9859 -chr4 39998935 . C T 2773.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=3.273;DP=160;FS=6.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,82:152:99:2802,0,2485 -chr4 39998937 . A G 6644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,145:145:99:6673,467,0 -chr4 39998970 . A G 5923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:5952,421,0 -chr4 39999003 . C T 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.434;DP=155;FS=6.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,43:102:99:1463,0,2165 -chr4 40017432 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:54:375,0,54 -chr4 40017433 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=34.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:54:375,0,54 -chr4 40031933 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.031;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=23.06;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:305,0,191 -chr4 40031942 . A G,C 402.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=1.504;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=25.14;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,9,5:15:99:513,159,166,329,0,532 -chr4 40032409 . G T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.267;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:303,0,267 -chr4 40163487 . G C 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr4 40164605 . T A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr4 40215311 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr4 40216227 . A C 487.41 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-1.736;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=32.49;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:8:515,8,0 -chr4 40294810 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=-1.683;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:236,0,104 -chr4 40370656 . A C 211.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:240,0,24 -chr4 40371130 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.311;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.88;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:296,0,386 -chr4 40446077 . G A 324.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:353,24,0 -chr4 40499830 . A G 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=-0.986;DP=19;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=25.88;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:520,0,168 -chr4 40515303 . A T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.530;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.413;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,297 -chr4 40521880 . G A 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr4 40528841 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:353,0,237 -chr4 40528844 . T C 495.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:524,36,0 -chr4 40729308 . G C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr4 40770632 . G A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr4 40804556 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.637;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=15.98;ReadPosRankSum=2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:268,0,488 -chr4 40817222 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.185;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=21.65;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:353,0,178 -chr4 40852210 . C A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-1.927;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,248 -chr4 40910433 . C A 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr4 40967259 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.77;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:312,0,153 -chr4 40967264 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:312,0,153 -chr4 41175720 . A G 910.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:939,69,0 -chr4 41175780 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.197;DP=20;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:446,0,193 -chr4 41270700 . C G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr4 41270703 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr4 41274525 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=-1.221;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,13:31:99:418,0,591 -chr4 41275006 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=-2.148;DP=21;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:384,0,362 -chr4 41462327 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:262,0,262 -chr4 41480690 . C A 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=1.113;DP=26;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=27.26;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:737,0,136 -chr4 41480724 . A C 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.262;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:653,0,225 -chr4 41493430 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.175;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.875;QD=26.70;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:669,0,142 -chr4 41622704 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr4 41735850 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,130 -chr4 41735853 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,130 -chr4 41872683 . C A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.452;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.452;QD=23.93;ReadPosRankSum=-1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:459,0,197 -chr4 41888817 . T C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr4 41946391 . A G 660.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-0.727;DP=37;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=17.84;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:11:688,0,11 -chr4 41946406 . C G 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.453;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=13.67;ReadPosRankSum=2.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:493,0,344 -chr4 41971234 . A G 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr4 42182517 . A G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr4 42182547 . T G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr4 42341932 . G A 497.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:526,36,0 -chr4 42342050 . A G 313.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:342,24,0 -chr4 42343175 . G C 532.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:561,39,0 -chr4 42534423 . A C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 -chr4 42672297 . G A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr4 42706285 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=2.933;DP=14;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=20.20;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:311,0,301 -chr4 42792523 . A G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.28;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:231,0,153 -chr4 42793786 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=22.98;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:59:327,0,59 -chr4 42842518 . C G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-0.107;DP=12;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=29.31;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:380,0,48 -chr4 42842558 . A G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=-0.441;DP=21;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:76:564,0,76 -chr4 42842648 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.072;DP=17;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=26.69;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:81:482,0,81 -chr4 42862310 . T C 707.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:736,51,0 -chr4 42862405 . A G 836.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:63:865,63,0 -chr4 42862684 . C T 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr4 42971444 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.244;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,187 -chr4 43096207 . T C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 -chr4 43128646 . C T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr4 43137553 . A T 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr4 43138001 . G T 603.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:632,45,0 -chr4 43154786 . T G 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr4 43281064 . T C 238.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:267,18,0 -chr4 43288684 . G A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 -chr4 43335870 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-1.062;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=31.41;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:74:625,0,74 -chr4 43336529 . C T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr4 43337795 . CA C 444.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=-0.578;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.349;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:26:482,26,0 -chr4 43340110 . A G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr4 43347648 . A G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr4 43465623 . C CTG 287.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQ0=0;QD=16.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:2:328,0,2 -chr4 43678391 . T C 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr4 43844373 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=1.720;DP=53;FS=4.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=9.47;ReadPosRankSum=-0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:530,0,965 -chr4 43844388 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-1.145;DP=44;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.353;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:544,0,681 -chr4 43845226 . G A 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.929;DP=15;FS=6.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:341,0,337 -chr4 43845240 . C T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.550;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=33.03;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:341,0,337 -chr4 43846069 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=-0.476;DP=49;FS=4.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:302,0,1382 -chr4 43846239 . C G 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr4 43872376 . T A 226.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.36;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:255,0,16 -chr4 44112325 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=2.264;DP=34;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=6.43;ReadPosRankSum=-2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,941 -chr4 44112419 . G A 1451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=-0.306;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=32.93;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1480,105,0 -chr4 44112699 . A T 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=1.757;DP=26;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=31.76;ReadPosRankSum=-2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:97:854,0,97 -chr4 44113449 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:64:301,0,64 -chr4 44136581 . C T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.337;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=15.52;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:292,0,369 -chr4 44136898 . G A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.510;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:502,0,103 -chr4 44136971 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:47:249,0,47 -chr4 44137259 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=-1.468;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=17.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:289,0,233 -chr4 44137363 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-1.325;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.353;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:313,0,310 -chr4 44137384 . G T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.278;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=16.27;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:256,0,142 -chr4 44137641 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr4 44137645 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr4 44137778 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:271,0,130 -chr4 44139852 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=29.81;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:36:386,0,36 -chr4 44145323 . T C 526.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:39:555,39,0 -chr4 44233872 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.17;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:41:449,0,41 -chr4 44233901 . C G 692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:721,54,0 -chr4 44236846 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.878;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=11.23;ReadPosRankSum=2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:309,0,542 -chr4 44271804 . T G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=1.208;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=15.55;ReadPosRankSum=-2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:277,0,277 -chr4 44293294 . A G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.498;DP=25;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.640;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:709,0,103 -chr4 44293424 . A G 820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.991;DP=48;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.863;QD=17.10;ReadPosRankSum=-0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:849,0,1044 -chr4 44294131 . A G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.612;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:386,0,723 -chr4 44491489 . C A 299.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:328,24,0 -chr4 44495077 . GGT G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.608;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=13.63;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:378,0,655 -chr4 44540776 . TC T 216.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:254,24,0 -chr4 44544663 . A G 891.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:920,69,0 -chr4 44544886 . A T 432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:461,33,0 -chr4 44545684 . A C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.914;QD=14.28;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:271,0,335 -chr4 44545741 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=-0.230;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.198;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:457,0,480 -chr4 44545789 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.462;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:353,0,631 -chr4 44545790 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.178;DP=22;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:285,0,783 -chr4 44547573 . A G 514.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:543,39,0 -chr4 44578244 . A AT 254.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:291,0,6 -chr4 44578557 . T C 297.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:326,24,0 -chr4 44578783 . T C 2075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=-3.458;DP=66;FS=5.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=31.45;ReadPosRankSum=2.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,51:61:99:2104,0,105 -chr4 44684714 . T G 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr4 44753404 . A G 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr4 44755637 . CTG C 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:246,0,153 -chr4 44755703 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.847;DP=19;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=16.46;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:341,0,311 -chr4 44755773 . T C 2196.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.055;DP=26;FS=2.793;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.255 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:99:2225,154,0 -chr4 44755911 . A T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.208;DP=26;FS=3.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,619 -chr4 44755980 . C G 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=-0.962;DP=27;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.079;QD=30.47;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:1326,0,131 -chr4 44756297 . A G 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=-1.503;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=27.07;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:732,0,181 -chr4 44756513 . C T 1160.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1189,84,0 -chr4 44974770 . C G 257.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:19:286,0,19 -chr4 44985356 . C T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr4 44994326 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.962;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.814;QD=13.10;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:395,0,649 -chr4 44994450 . G A 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=1.691;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:732,0,1324 -chr4 44994519 . C A 2484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2513,184,0 -chr4 44994603 . G T 1858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=1.029;DP=46;FS=1.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=33.87;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,38:46:37:1887,0,37 -chr4 44994711 . G A 821.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.578;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:850,60,0 -chr4 44994750 . T C 204.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:233,0,18 -chr4 45056999 . T G 671.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:18:700,18,0 -chr4 45057002 . T C 671.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-1.369;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:18:700,18,0 -chr4 45057106 . T A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=24.62;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:99:299,0,110 -chr4 45057112 . G T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:99:299,0,110 -chr4 45058454 . C CTA 816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:854,57,0 -chr4 45218910 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.191;DP=30;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=12.19;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:394,0,651 -chr4 45222829 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-1.207;DP=33;FS=5.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:444,0,654 -chr4 45222874 . C T 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=-0.447;DP=54;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=14.25;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,22:51:99:798,0,1018 -chr4 45241041 . G T 299.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:328,0,16 -chr4 45418247 . C G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=-0.133;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=11.12;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:290,0,636 -chr4 45452305 . T C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr4 45452409 . T C 766.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:798,57,0 -chr4 45454232 . C A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,13:13:34:540,0,34 -chr4 45454241 . A T 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-2.293;DP=17;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=30.10;ReadPosRankSum=2.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:34:540,0,34 -chr4 45474579 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:66:233,0,66 -chr4 45529343 . C G 916.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=-0.091;DP=20;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=32.68;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:66:945,66,0 -chr4 45529662 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DP=48;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,17:48:99:598,0,1340 -chr4 45529951 . A G 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:515,36,0 -chr4 45627097 . C T 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-1.714;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=33.76;ReadPosRankSum=-1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,2:17:99:1239,0,1880 -chr4 45627126 . C A,G 2661.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=-0.828;DP=66;FS=11.579;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=28.54;ReadPosRankSum=-2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:6,18,29:53:99:3782,1085,957,1790,0,1796 -chr4 45627186 . A T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-0.014;DP=155;FS=14.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,30:126:99:460,0,7142 -chr4 45627265 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-1.228;DP=23;FS=2.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:317,0,621 -chr4 45628935 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=1.377;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.765;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:288,0,2519 -chr4 45631590 . A C 654.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.696;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:21:683,21,0 -chr4 45632485 . T G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=-0.725;DP=84;FS=9.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=2.39;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:229,0,2356 -chr4 45632518 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=-2.054;DP=115;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,27:96:99:705,0,2506 -chr4 45656256 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:232,0,62 -chr4 45741868 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.512;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=9.29;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:242,0,454 -chr4 45741869 . C G 896.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:67:925,67,0 -chr4 45741915 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=-0.273;DP=40;FS=1.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:272,0,1103 -chr4 45742009 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-0.498;DP=31;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:233,0,779 -chr4 45742119 . A T 960.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:989,72,0 -chr4 45742306 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.228;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:323,0,373 -chr4 45742539 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.210;DP=33;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:303,0,1931 -chr4 45742543 . T C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.936;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:522,0,1309 -chr4 45742620 . A G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.912;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:300,0,356 -chr4 45767852 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=-0.066;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=34.20;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:28:678,0,28 -chr4 45767881 . T G 436.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:465,33,0 -chr4 46046899 . A G 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr4 46082585 . A C 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr4 46082645 . G C 207.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:236,0,20 -chr4 46117585 . A G 220.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:249,0,25 -chr4 46273780 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.09;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:272,0,63 -chr4 46330793 . T C 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr4 46607843 . C G 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.568;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:600,0,490 -chr4 46650001 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.705;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=21.92;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:379,0,211 -chr4 46652740 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=-0.919;DP=35;FS=8.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:268,0,1512 -chr4 46652741 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.731;DP=35;FS=8.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:268,0,1512 -chr4 46732436 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=22.48;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:298,0,142 -chr4 46762563 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=-0.529;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.780;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:300,0,336 -chr4 46762915 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.85;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:243,0,135 -chr4 46762924 . C G 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-1.203;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=21.48;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,135 -chr4 46816969 . C T 1568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.962;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=31.87;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:99:1597,114,0 -chr4 46817063 . C T 1989.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.998;DP=83;FS=2.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=23.97;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,56:79:99:2018,0,504 -chr4 46817211 . G A 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.837;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.154;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,40:67:99:1322,0,960 -chr4 46817297 . T C 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr4 47206620 . T G 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=1.559;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=16.26;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:516,0,522 -chr4 47207640 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=-0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:289,0,335 -chr4 47270903 . A G 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=-1.344;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=29.41;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:440,0,154 -chr4 47270906 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:336,0,406 -chr4 47271018 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.226;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:235,0,852 -chr4 47420588 . TC T 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-1.768;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=26.89;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:36:360,0,36 -chr4 47420965 . T C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:297,21,0 -chr4 47421224 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:253,0,97 -chr4 47421636 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr4 47517748 . A G 477.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:506,36,0 -chr4 47517784 . G T 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr4 47517995 . G T 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.088;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:336,0,622 -chr4 47605826 . G A 240.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:269,0,21 -chr4 47625606 . A T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr4 47766944 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:33:444,33,0 -chr4 47768818 . T G 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-2.888;DP=24;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.41;ReadPosRankSum=2.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:374,0,388 -chr4 47769157 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:312,0,103 -chr4 47769188 . T A 426.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.401;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=32.83;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:6:454,0,6 -chr4 47769509 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 47796213 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=-0.527;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:358,0,815 -chr4 47863388 . G A 328.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.393;QD=32.89;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:15:357,0,15 -chr4 47918780 . C G 489.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:518,36,0 -chr4 47919208 . A C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 -chr4 47976918 . C T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr4 47977245 . T C 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr4 47998019 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.456;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=31.27;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:45:466,0,45 -chr4 47998088 . G A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr4 48045815 . C A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.241;DP=19;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=16.09;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:334,0,291 -chr4 48074409 . T C 281.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:18:310,0,18 -chr4 48074473 . T C 2282.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.577;DP=59;FS=3.757;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=31.90;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2311,166,0 -chr4 48074565 . A C 1142.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1171,84,0 -chr4 48074745 . C A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.386;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=7.68;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:343,0,138 -chr4 48075529 . T A 2987.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:99:3016,222,0 -chr4 48076773 . A T 5993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:6022,409,0 -chr4 48076779 . A G 5993.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:136:99:6022,409,0 -chr4 48076902 . A C 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=1.114;DP=66;FS=4.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=19.88;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:89:1340,0,89 -chr4 48076914 . GT G 345.87 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DP=22;FS=6.690;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:15:383,15,0 -chr4 48077049 . G T 1017.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1046,75,0 -chr4 48080124 . A T 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.950;DP=268;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.536;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,73:223:99:1965,0,7294 -chr4 48080251 . A G 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=6.786;DP=435;FS=134.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=3.97;ReadPosRankSum=-6.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:325,89:414:99:1756,0,13190 -chr4 48080347 . T G 1873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=4.773;DP=98;FS=20.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=19.12;ReadPosRankSum=0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,63:73:67:1902,0,67 -chr4 48080380 . A T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.909;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.255;QD=30.97;ReadPosRankSum=1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:89:957,0,89 -chr4 48080390 . G T 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-2.167;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=34.40;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:99:957,0,130 -chr4 48081445 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:99:390,0,686 -chr4 48081453 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,11:11:99:390,0,686 -chr4 48082414 . A G 893.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.393;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=28.71;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:64:922,64,0 -chr4 48082434 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-2.546;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:318,0,5677 -chr4 48082446 . C T 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=3.638;DP=120;FS=5.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=13.98;ReadPosRankSum=-3.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,39:109:99:1706,0,6250 -chr4 48082452 . C T 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=3.783;DP=138;FS=8.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=12.16;ReadPosRankSum=-2.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,47:122:99:1706,0,6199 -chr4 48082567 . C T 5143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=1.166;DP=425;FS=0.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.712;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,142:341:99:5172,0,6898 -chr4 48082602 . TCC T 1697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.468;DP=126;FS=11.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.704;QD=13.47;ReadPosRankSum=3.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,54:87:99:1735,0,1090 -chr4 48082605 . C T 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.074;DP=99;FS=11.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.72;ReadPosRankSum=-3.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1090,0,1818 -chr4 48082606 . C G 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=-0.547;DP=94;FS=11.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=11.30;ReadPosRankSum=-3.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,33:87:99:1090,0,1815 -chr4 48082954 . A T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=1.786;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=13.37;ReadPosRankSum=-1.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:349,0,1701 -chr4 48082964 . A T 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.289;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.856;QD=24.29;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:514,0,843 -chr4 48082969 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=9.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:349,0,1701 -chr4 48083029 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:48:277,0,48 -chr4 48083447 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=1.479;DP=13;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=32.39;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:548,0,115 -chr4 48083455 . G A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.158;DP=25;FS=2.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:447,0,399 -chr4 48083556 . T C 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.230;DP=80;FS=1.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.695;QD=4.85;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:416,0,1450 -chr4 48083660 . T C 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.176;DP=45;FS=9.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.199;QD=15.91;ReadPosRankSum=-2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:744,0,894 -chr4 48083685 . T C 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.739;DP=72;FS=4.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,38:72:99:1197,0,1261 -chr4 48083781 . C T 3700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-2.674;DP=111;FS=4.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=33.34;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,79:100:99:3729,0,282 -chr4 48083858 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=2.849;DP=236;FS=2.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=1.59;ReadPosRankSum=-2.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,29:165:99:403,0,5976 -chr4 48083933 . C T 1863.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.356;DP=132;FS=9.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,55:93:99:1892,0,1327 -chr4 48083961 . C G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.501;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.042;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,432 -chr4 48083971 . A C 484.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:36:513,36,0 -chr4 48084118 . T C 1397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1426,108,0 -chr4 48084617 . C G 1750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=-3.827;DP=55;FS=21.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,37:48:99:1779,0,648 -chr4 48084626 . T A 1750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-3.019;DP=67;FS=10.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=26.13;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1779,0,637 -chr4 48085059 . CA C 1669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.876;DP=77;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,47:68:99:1707,0,532 -chr4 48085166 . T C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.354;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=23.98;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:364,0,131 -chr4 48136122 . A T 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr4 48355341 . A C 319.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:348,24,0 -chr4 48477888 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=28.98;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:44:425,0,44 -chr4 48528898 . C T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr4 48529335 . A G 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 -chr4 48529477 . T A 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr4 48743440 . T G 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=-1.150;DP=37;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=14.37;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:560,0,794 -chr4 48743660 . A G 2660.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=-0.722;DP=26;FS=4.260;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=31.71;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:99:2689,190,0 -chr4 48743831 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.792;DP=55;FS=8.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,17:55:99:386,0,2086 -chr4 48743991 . C A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.429;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=31.58;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:502,0,513 -chr4 48744654 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:247,0,454 -chr4 48748983 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:271,0,148 -chr4 48758407 . T A 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr4 48986964 . A T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.75;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:92:233,0,92 -chr4 49284130 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-2.072;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:235,0,182 -chr4 49284176 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=3.153;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:296,0,269 -chr4 49465869 . C G 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:334,0,456 -chr4 49694700 . T C 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:471,33,0 -chr4 49694724 . T C 279.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:308,21,0 -chr4 49694870 . A T 2475.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=1.372;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=31.74;ReadPosRankSum=-1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,60:63:99:2504,181,0 -chr4 49695416 . G T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-4.848;DP=64;FS=24.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:312,0,1812 -chr4 49695655 . G A 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr4 49695656 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:21:300,21,0 -chr4 49695823 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=-0.633;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,144 -chr4 49695846 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=-0.466;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:229,0,186 -chr4 49705485 . G A 522.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-1.504;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=32.64;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:1:548,0,1 -chr4 49763136 . A C 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 -chr4 49763152 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr4 49789394 . C T 862.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.529;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=33.18;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:6:890,0,6 -chr4 49816616 . A C 208.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:17:256,17,0 -chr4 49816631 . G A 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr4 50071054 . A C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:37:273,0,37 -chr4 50138665 . C G 623.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:652,45,0 -chr4 50241975 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-1.380;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=23.36;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:42:548,0,42 -chr4 50242171 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=10;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=20.98;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:238,0,128 -chr4 50386443 . A T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.923;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=27.59;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:718,0,138 -chr4 50386941 . G C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.75;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:278,0,64 -chr4 50388390 . A G 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-0.404;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,20:52:99:679,0,1103 -chr4 50495143 . T G 850.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=-0.952;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=34.03;ReadPosRankSum=0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:27:879,27,0 -chr4 50501251 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr4 50598116 . T A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.255;DP=20;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=21.94;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:45:467,0,45 -chr4 50706127 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:46:234,0,46 -chr4 50801439 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=24.90;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:94:327,0,94 -chr4 50801509 . G A 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-1.559;DP=96;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:550,0,749 -chr4 50801534 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=-0.409;DP=86;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=3.39;ReadPosRankSum=-1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:320,0,545 -chr4 50802029 . A G 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=1.989;DP=92;FS=1.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=14.88;ReadPosRankSum=-2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:99:1397,0,226 -chr4 50802033 . C A 2013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:2042,138,0 -chr4 50844175 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:50:333,0,50 -chr4 50844176 . C A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:50:333,0,50 -chr4 50844331 . T C 743.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=1.052;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.32;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:9:771,0,9 -chr4 50844416 . A G 492.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=1.667;DP=18;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=27.38;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:521,0,26 -chr4 50865888 . C T 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr4 50886428 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:330,0,330 -chr4 50886632 . T C 277.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:306,0,19 -chr4 50886650 . C G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=27.71;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:333,0,56 -chr4 50886780 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=-0.386;DP=15;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:96:331,0,96 -chr4 50892922 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:261,0,57 -chr4 50918319 . G A 2392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=1.233;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=33.71;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,58:63:98:2421,98,0 -chr4 50918440 . G A 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=1.751;DP=28;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:377,0,1432 -chr4 50918465 . C G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.318;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:99:337,0,1523 -chr4 50918644 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-0.255;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:290,0,877 -chr4 50925098 . T C 402.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.290;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=33.53;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:8:430,0,8 -chr4 50929059 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=19.93;ReadPosRankSum=-2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:387,0,257 -chr4 50936952 . A C 1704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=-1.350;DP=98;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=17.40;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,49:98:99:1733,0,1848 -chr4 50937141 . G A 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.395;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,38:56:99:1433,0,517 -chr4 50937396 . A G 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.456;DP=46;FS=4.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=30.39;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,36:42:55:1426,0,55 -chr4 50937934 . G A 814.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=-1.222;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,21:24:16:843,0,16 -chr4 50937973 . C T 814.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:16:843,0,16 -chr4 50980514 . G A 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.286;DP=33;FS=7.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=34.81;ReadPosRankSum=0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:33:99:1177,0,264 -chr4 51030328 . A T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=-0.692;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=15.29;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:380,0,354 -chr4 51094934 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=2.281;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=17.91;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:261,0,562 -chr4 51094938 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:261,0,562 -chr4 51146424 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.531;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=21.71;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85:267,0,85 -chr4 51179083 . A G 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 -chr4 51179183 . G A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=2.339;DP=41;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=13.19;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:569,0,859 -chr4 51179219 . G C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=-1.423;DP=34;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:369,0,1830 -chr4 51179255 . C T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.358;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=14.16;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:368,0,1830 -chr4 51179648 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:260,0,250 -chr4 51179960 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,9:9:37:527,0,37 -chr4 51179998 . A G 963.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:32:992,32,0 -chr4 51180060 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=-1.003;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=32.22;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:556,0,117 -chr4 51180237 . A G 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr4 51180325 . G A 600.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:629,45,0 -chr4 51180559 . A G 991.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.133;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=29.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:75:1020,75,0 -chr4 51181001 . G A 659.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:688,48,0 -chr4 51222384 . T C 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 -chr4 51222504 . T A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr4 51222687 . G C 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr4 51295814 . A C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr4 51364412 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=1.153;DP=89;FS=0.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,19:80:99:391,0,2913 -chr4 51364671 . A G 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=-1.312;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:235,0,885 -chr4 51364675 . T G 1016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=-0.908;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=25.09;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:78:1045,78,0 -chr4 51364794 . A C 3763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=1.481;DP=73;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.232;QD=32.62;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,33:72:99:3792,0,2167 -chr4 51364797 . T C 3763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.572;DP=77;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=31.82;ReadPosRankSum=-1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:3792,0,2131 -chr4 51364862 . T C 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=-1.941;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=29.86;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1611,0,3003 -chr4 51364929 . A T 1242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=-0.945;DP=46;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=27.02;ReadPosRankSum=2.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:99:1271,0,2774 -chr4 51365081 . T C 3563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=-1.468;DP=59;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=34.10;ReadPosRankSum=1.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:3592,0,123 -chr4 51365147 . C G 1533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=1.666;DP=81;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,41:75:99:1562,0,1756 -chr4 51365262 . A C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=-0.205;DP=33;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:469,0,905 -chr4 51365416 . A G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.361;DP=9;FS=6.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=29.39;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:58:785,0,58 -chr4 51365468 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.151;DP=18;FS=5.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=29.82;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:565,0,690 -chr4 51365857 . T C 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.217;DP=43;FS=4.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:720,0,528 -chr4 51365947 . AC A 3715.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.276;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=34.99;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:99:3753,169,0 -chr4 51366086 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.398;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=11.77;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:299,0,1577 -chr4 51366119 . T C 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=2.417;DP=36;FS=3.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=13.44;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:512,0,2040 -chr4 51366140 . C G 3080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.685;DP=73;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,63:70:99:3109,0,135 -chr4 51366228 . G A 3486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=1.056;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=23.88;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,39:135:99:3515,0,3516 -chr4 51366414 . A C 1805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=-0.412;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=34.51;ReadPosRankSum=-2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,27:36:99:1843,0,3656 -chr4 51366544 . G T 1520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.812;DP=34;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=30.62;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:53:1549,0,53 -chr4 51366667 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=1.970;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.753;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:409,0,1081 -chr4 51366673 . TA T 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=1.693;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=15.49;ReadPosRankSum=-1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:409,0,1114 -chr4 51366761 . GT G 687.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-0.731;DP=66;FS=7.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:725,0,588 -chr4 51367192 . AC A 2178.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-1.182;DP=27;FS=2.881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:25:2216,25,0 -chr4 51367230 . T A 2201.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=-1.670;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,8:13:40:2230,40,0 -chr4 51367308 . C T 1393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.096;DP=82;FS=10.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:1422,0,608 -chr4 51367423 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=1.668;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:231,0,1563 -chr4 51367532 . A C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.524;DP=21;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:239,0,1563 -chr4 51367549 . T C 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=3.083;DP=54;FS=12.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=17.11;ReadPosRankSum=-2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:952,0,357 -chr4 51367692 . G A 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.056;DP=83;FS=1.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:687,0,701 -chr4 51367981 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=-1.022;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=13.70;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:398,0,363 -chr4 51367994 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=-0.177;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.766;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:343,0,406 -chr4 51368045 . A T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-2.106;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:554,0,198 -chr4 51368058 . A T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:553,0,274 -chr4 51387340 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=1.177;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:368,0,462 -chr4 51387434 . A G 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.386;DP=26;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=16.91;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:468,0,415 -chr4 51398338 . T C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr4 51448212 . T G 372.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:401,0,13 -chr4 51453727 . A C 274.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:303,0,19 -chr4 51594448 . T A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr4 51638847 . C A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=-0.505;DP=59;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,31:47:99:1477,0,370 -chr4 51639011 . A G 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:60:761,60,0 -chr4 51639721 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=3.244;DP=25;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=11.59;ReadPosRankSum=-2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:318,0,1114 -chr4 51639731 . A C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=2.749;DP=24;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=12.07;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:318,0,1070 -chr4 51685634 . G T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=23.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:261,0,52 -chr4 51685661 . A T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.394;DP=22;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.591;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:396,0,531 -chr4 51686164 . T C 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.330;DP=38;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.562;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1172,0,154 -chr4 51686209 . G A 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.446;DP=37;FS=5.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=24.45;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:933,0,329 -chr4 51686247 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DP=29;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:402,0,755 -chr4 51815102 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=30.65;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:396,0,48 -chr4 51855458 . C G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=1.615;DP=24;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.758;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:353,0,371 -chr4 51855588 . G A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.490;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,24:41:99:833,0,634 -chr4 51855732 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=1.226;DP=35;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:263,0,2067 -chr4 51855778 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=-1.704;DP=31;FS=6.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,3:31:99:263,0,2067 -chr4 51856490 . G C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.941;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=11.92;ReadPosRankSum=1.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:374,0,597 -chr4 51863642 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.555;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,213 -chr4 51953881 . C A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:895,63,0 -chr4 51953888 . T A 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:63:895,63,0 -chr4 51960658 . G A 207.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:236,0,23 -chr4 52109970 . T G 1431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.117;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=28.07;ReadPosRankSum=2.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,33:49:99:1460,0,599 -chr4 52110079 . G A 1067.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=-1.126;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=29.62;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:9:1095,0,9 -chr4 52110291 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.347;DP=23;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=29.56;ReadPosRankSum=-0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:96:708,0,96 -chr4 52110438 . A G 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.951;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:520,0,377 -chr4 52110652 . A G 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=-1.666;DP=36;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:460,0,834 -chr4 52139775 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=1.078;DP=25;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=8.07;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:230,0,664 -chr4 52279284 . C A 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr4 52439734 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:285,0,101 -chr4 52619129 . A T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr4 52729852 . C A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=11.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42:308,0,42 -chr4 52729930 . T TA 297.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:335,27,0 -chr4 52730071 . A C 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr4 52730118 . A T 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:468,33,0 -chr4 52741906 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.666;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:272,0,375 -chr4 52795601 . T A 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=-1.390;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=18.45;ReadPosRankSum=2.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,876 -chr4 52795602 . A G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-1.159;DP=24;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,876 -chr4 52932388 . G A 230.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9:258,0,9 -chr4 52932406 . G A 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -chr4 52975964 . G C 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.540;DP=26;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:419,0,597 -chr4 52975984 . T G 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.267;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:469,0,497 -chr4 53050241 . A G 1268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=1.213;DP=73;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=17.38;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,38:61:99:1297,0,789 -chr4 53050351 . C A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.750;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=25.36;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:713,0,480 -chr4 53050354 . T A 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.902;DP=24;FS=2.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=28.53;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:713,0,486 -chr4 53183865 . T C 1677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.152;DP=50;FS=3.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=33.56;ReadPosRankSum=-0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,41:50:99:1706,0,142 -chr4 53184146 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.903;DP=27;FS=1.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:310,0,578 -chr4 53188772 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=-1.705;DP=41;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:574,0,762 -chr4 53285565 . T C 2100.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=1.121;DP=67;FS=12.304;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.917 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:2129,147,0 -chr4 53285707 . G T 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 -chr4 53346979 . T A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=-1.632;DP=53;FS=7.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:323,0,1548 -chr4 53347047 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.68;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=19.73;ReadPosRankSum=-2.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:265,0,437 -chr4 53445766 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr4 53456869 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.830;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=20.10;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:370,0,345 -chr4 53456993 . TAG T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.042;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,482 -chr4 53458504 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,763 -chr4 53458506 . C A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-1.220;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:264,0,763 -chr4 53570258 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:264,0,127 -chr4 53570387 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-1.447;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:230,0,145 -chr4 53617524 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.540;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=24.67;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:349,0,132 -chr4 53732082 . G C 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.67;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:343,0,257 -chr4 53752164 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.905;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,470 -chr4 53770553 . G A 262.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=9;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.20;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:291,0,22 -chr4 53927464 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:281,0,252 -chr4 53927506 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=25.91;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:96:365,0,96 -chr4 53946160 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.694;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:248,0,334 -chr4 54005880 . A C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.054;DP=26;FS=13.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=22.30;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:608,0,306 -chr4 54061755 . C A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=-0.359;DP=61;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:331,0,1775 -chr4 54061767 . A T 1566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-1.317;DP=56;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.703;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1595,0,306 -chr4 54126642 . A G 435.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.474;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=29.17;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:8:463,0,8 -chr4 54274223 . T A 372.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.290;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=28.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:5:400,0,5 -chr4 54356190 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:39:268,0,39 -chr4 54378474 . A T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=-0.830;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:385,0,252 -chr4 54378580 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,122 -chr4 54475076 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:465,0,102 -chr4 54617578 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.64;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:268,0,62 -chr4 54617643 . T C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:52:366,0,52 -chr4 54617834 . A G 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=-2.359;DP=12;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:299,0,129 -chr4 54617861 . AG A 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.537;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:83:305,0,83 -chr4 54617980 . A G 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:346,0,95 -chr4 54693324 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.224;DP=37;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:288,0,880 -chr4 54829191 . T C 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr4 54839033 . G A 21166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=486;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,260:260:99:21195,1454,0 -chr4 54839087 . C A 21166.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.606;DP=733;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=28.88;ReadPosRankSum=-1.618 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,365:366:99:21195,1454,0 -chr4 54890474 . T TA 312.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:350,33,0 -chr4 54890503 . A T 316.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:345,24,0 -chr4 54890979 . A G 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:737,54,0 -chr4 54893745 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-2.369;DP=44;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.309;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:272,0,1181 -chr4 54907827 . T C 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=1.194;DP=25;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:284,0,455 -chr4 54968783 . T A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,187 -chr4 54968903 . G C 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.301;DP=30;FS=6.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:676,0,417 -chr4 54968940 . A T 1208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.273;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.636;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:40:99:1237,0,228 -chr4 54982220 . G A 2608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=1.160;DP=83;FS=5.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.037;QD=31.43;ReadPosRankSum=2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,66:76:86:2637,0,86 -chr4 54982266 . T G 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=2.072;DP=26;FS=9.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=28.38;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:766,0,103 -chr4 54983408 . C T 605.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.199;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.262;QD=27.54;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:31:634,0,31 -chr4 54986735 . T A 3636.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.565;DP=85;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=29.83;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,83:85:99:3665,250,0 -chr4 55122452 . C T 555.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=-2.095;DP=46;FS=9.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:584,0,978 -chr4 55153058 . G A 601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:630,48,0 -chr4 55204763 . G C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.135;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:256,0,266 -chr4 55235238 . C A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:302,0,249 -chr4 55235593 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-0.260;DP=33;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:242,0,2458 -chr4 55235604 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.151;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:242,0,2458 -chr4 55235899 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.217;DP=35;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:523,0,730 -chr4 55236123 . G A 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.024;DP=28;FS=9.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.558;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:365,0,488 -chr4 55236177 . G C 1756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.467;DP=62;FS=4.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,47:60:99:1785,0,258 -chr4 55236278 . G A 2458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=-1.773;DP=87;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=28.26;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,66:82:99:2487,0,225 -chr4 55236326 . A T 1629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-1.332;DP=78;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,46:74:99:1658,0,945 -chr4 55236412 . G T 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:418,30,0 -chr4 55302501 . T C 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.212;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:379,0,201 -chr4 55355532 . A G 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=28.15;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,15:16:76:620,0,76 -chr4 55566711 . T C 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=-1.374;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=17.08;ReadPosRankSum=1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,34:69:99:1275,0,1467 -chr4 55566795 . A C 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=-0.183;DP=35;FS=18.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:561,0,648 -chr4 55567278 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.088;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:358,0,283 -chr4 55567501 . A T 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=29.53;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:737,0,136 -chr4 55573803 . G A 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=4.336;DP=33;FS=1.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=14.42;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:504,0,720 -chr4 55582976 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.030;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:230,0,1244 -chr4 55583194 . C CA 513.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=-0.934;DP=30;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:551,0,817 -chr4 55583197 . T A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=-0.952;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:551,0,817 -chr4 55630057 . A T 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.561;DP=29;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.268;QD=14.23;ReadPosRankSum=-1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:441,0,517 -chr4 55639146 . T G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.689;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,161 -chr4 55639359 . A T 661.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:690,48,0 -chr4 55641289 . C T 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 -chr4 55641389 . C G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:263,0,107 -chr4 55641543 . T C 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.057;DP=18;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=30.76;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:582,0,144 -chr4 55641614 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-0.516;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:482,0,1847 -chr4 55641623 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=-0.224;DP=51;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,18:48:99:592,0,1767 -chr4 55641689 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=-0.236;DP=47;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=11.57;ReadPosRankSum=1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:572,0,1079 -chr4 55642554 . T C 275.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.66;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:304,0,13 -chr4 55657225 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.555;DP=17;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,223 -chr4 55781461 . AG A 498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.189;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:536,0,104 -chr4 55853714 . A C 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-1.147;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:451,0,360 -chr4 55853791 . G A 252.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:281,0,22 -chr4 56235254 . A T 259.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:288,0,17 -chr4 56437006 . G A 2128.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-3.060;DP=25;FS=2.114;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,20:24:83:2157,83,0 -chr4 56437106 . T G 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.075;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:837,0,1601 -chr4 56479897 . A T 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:262,18,0 -chr4 56479902 . A C 233.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:262,18,0 -chr4 56510862 . T TA 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.091;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:329,0,445 -chr4 56511118 . TA T 202.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:240,24,0 -chr4 56530626 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=28.08;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:88:309,0,88 -chr4 56707573 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-1.388;DP=125;FS=46.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,27:73:99:350,0,4994 -chr4 56707625 . T C 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=1.128;DP=212;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=1.33;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,18:115:99:311,0,4994 -chr4 56707717 . C T 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.723;DP=117;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.035;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,14:78:99:1922,0,3932 -chr4 56707736 . G T 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-2.118;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,10:47:99:1922,0,3977 -chr4 56707770 . C A 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-2.871;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=30.59;ReadPosRankSum=1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:1922,0,3913 -chr4 56707837 . A G 1893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.796;DP=39;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:1922,0,3916 -chr4 56707867 . A G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.778;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:1735,0,4327 -chr4 56707921 . T C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.226;DP=56;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:627,0,4681 -chr4 56707983 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.015;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:235,0,1260 -chr4 56708326 . G A 1219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-0.758;DP=130;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=9.38;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,10:59:99:1248,0,4629 -chr4 56708353 . G T 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=-0.047;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:1180,0,4631 -chr4 56708384 . C T 1186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.511;DP=79;FS=4.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=15.02;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:99:1215,0,4630 -chr4 56708436 . G T 1156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=1.399;DP=117;FS=1.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=9.89;ReadPosRankSum=-2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:1185,0,4631 -chr4 56708502 . A G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.446;DP=63;FS=9.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,30:37:99:1180,0,4631 -chr4 56733985 . A T 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-0.174;DP=54;FS=1.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=27.64;ReadPosRankSum=-0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:1521,0,1836 -chr4 56734136 . G C 1492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.556;DP=48;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=31.10;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:42:99:1521,0,1836 -chr4 56734230 . C A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,0:57:99:1150,0,2026 -chr4 56734407 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-1.169;DP=81;FS=3.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:397,0,4164 -chr4 56734521 . A C 898.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-1.783;DP=65;FS=4.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,6:53:99:927,0,1521 -chr4 56734620 . A C 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=1.512;DP=54;FS=6.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=7.88;ReadPosRankSum=1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:454,0,1730 -chr4 56734726 . A T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.355;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:616,0,2952 -chr4 56734819 . A T 2266.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=6.232;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=26.50;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:99:2295,165,0 -chr4 56734836 . A C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=-1.501;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=36.91;ReadPosRankSum=-1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:63:771,0,63 -chr4 56734864 . C G 492.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=28.41;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:4:519,0,4 -chr4 56734944 . A G 2007.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=-1.211;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.153;QD=33.31;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,13:16:67:2036,67,0 -chr4 56734965 . G A 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=-0.550;DP=39;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1731,0,280 -chr4 56735130 . C A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.846;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:1756,0,3669 -chr4 56735133 . C A 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-1.073;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:1756,0,3669 -chr4 56735324 . C T 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=1.963;DP=49;FS=8.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:761,0,1109 -chr4 56735331 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.561;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:363,0,1535 -chr4 56735547 . T C 754.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=1.185;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.659;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:12:782,0,12 -chr4 56735643 . G T 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=-2.294;DP=38;FS=13.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=15.63;ReadPosRankSum=-3.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:622,0,719 -chr4 56735694 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.165;DP=49;FS=3.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=6.77;ReadPosRankSum=-2.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:360,0,1407 -chr4 56735817 . T C 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.868;DP=44;FS=17.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:367,0,1146 -chr4 56735958 . C A 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.054;QD=29.30;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:1608,0,859 -chr4 56735967 . T C 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-1.877;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:1608,0,855 -chr4 56736086 . T C 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.970;DP=39;FS=3.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=23.30;ReadPosRankSum=1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:937,0,1395 -chr4 56736162 . T C 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.907;DP=63;FS=7.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:771,0,1102 -chr4 56736267 . G C 2836.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.344;DP=81;FS=10.687;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=32.14;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,64:73:11:2864,11,0 -chr4 56736426 . T C 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-1.109;DP=42;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=22.30;ReadPosRankSum=1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:965,0,599 -chr4 56736906 . A G 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.171;DP=35;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.500;QD=18.28;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:668,0,495 -chr4 56737119 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-1.528;DP=20;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:361,0,312 -chr4 56737209 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.423;DP=17;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,336 -chr4 56737322 . T C 1928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-1.772;DP=47;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=26.70;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:1957,0,2006 -chr4 56737448 . C T 1928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.112;DP=55;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=37.30;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,7:50:99:1957,0,2005 -chr4 56737657 . G A 1490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.255;DP=53;FS=3.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=28.13;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,40:50:99:1519,0,193 -chr4 57053142 . T A 3731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-1.081;DP=122;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,84:113:99:3760,0,583 -chr4 57053229 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.462;DP=38;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:509,0,1521 -chr4 57053524 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.380;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,231 -chr4 57054046 . A G 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.515;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=8.24;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:325,0,1251 -chr4 57054149 . G T 658.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:48:687,48,0 -chr4 57060297 . G A 409.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:438,30,0 -chr4 57060337 . C T 237.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr4 57061841 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=18.43;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:231,0,196 -chr4 57069283 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-0.239;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:249,0,814 -chr4 57069554 . T C 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.187;DP=23;FS=4.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=26.60;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:1032,0,291 -chr4 57069572 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.053;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.313;QD=21.10;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:408,0,834 -chr4 57080040 . A C 1691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1720,123,0 -chr4 57144250 . C T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr4 57144540 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=25.08;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:279,0,98 -chr4 57302492 . A C 873.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-1.041;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=27.31;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:63:902,63,0 -chr4 57302499 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=2.523;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:310,0,572 -chr4 57302535 . A G 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=1.506;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:416,0,233 -chr4 57302679 . A G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:333,0,93 -chr4 57321541 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=21.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:269,0,103 -chr4 57379015 . G C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr4 57616892 . A G 347.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:376,27,0 -chr4 57704268 . A G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=17.40;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:324,0,281 -chr4 57836298 . T C 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:340,24,0 -chr4 57836307 . G A 204.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.26;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:233,0,21 -chr4 57883035 . A AC 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-1.340;DP=21;FS=7.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:463,0,240 -chr4 57883037 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:340,0,612 -chr4 57883228 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=-1.543;DP=58;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=5.41;ReadPosRankSum=2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:342,0,1317 -chr4 57883783 . A G 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:283,0,59 -chr4 57883917 . A G 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-2.262;DP=13;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=34.21;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:42:473,0,42 -chr4 57978692 . A G 339.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.696;QD=33.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:368,0,16 -chr4 57979911 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=27.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:275,0,61 -chr4 58087928 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:58:357,0,58 -chr4 58088121 . G T 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=25.52;ReadPosRankSum=-0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:411,0,123 -chr4 58088299 . A C 1724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=-0.095;DP=47;FS=2.157;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=30.01;ReadPosRankSum=-1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,43:47:45:1753,45,0 -chr4 58088727 . A T 841.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.261;DP=24;FS=7.877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:26:870,26,0 -chr4 58088759 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=-1.763;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:421,0,119 -chr4 58089511 . C T 1448.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.966;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=32.93;ReadPosRankSum=1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,38:44:22:1477,0,22 -chr4 58089903 . T C 1377.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.020;DP=41;FS=4.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=33.61;ReadPosRankSum=-1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:14:1406,0,14 -chr4 58089975 . T A 2315.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-0.481;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,57:61:90:2344,90,0 -chr4 58090096 . C T 2284.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DP=58;FS=5.858;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=26.04;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:99:2313,123,0 -chr4 58090756 . A C 1598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=-1.454;DP=43;FS=2.578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=33.89;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,40:43:80:1627,80,0 -chr4 58090820 . A C 1819.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1848,132,0 -chr4 58091403 . A C 1855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.670;DP=54;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=34.37;ReadPosRankSum=2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,47:54:99:1884,0,228 -chr4 58091411 . C A 2121.22 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=-0.498;DP=58;FS=3.920;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=25.93;ReadPosRankSum=2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,52:58:4:2148,4,0 -chr4 58091831 . G C 2119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.752;DP=58;FS=2.008;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.949;QD=25.29;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,54:58:80:2148,80,0 -chr4 58091875 . C T 1877.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.600;DP=58;FS=2.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=32.38;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,51:55:74:1906,74,0 -chr4 58092432 . A C 1381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=-1.532;DP=66;FS=2.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=20.94;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,49:53:81:1481,0,81 -chr4 58092433 . A C 2248.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-1.626;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=34.07;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,64:66:99:2838,196,0 -chr4 58092760 . T C 1333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.472;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=31.02;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:94:1362,0,94 -chr4 58092916 . T C 1411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=-0.460;DP=45;FS=3.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=31.37;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,37:45:99:1440,0,134 -chr4 58093307 . T C 1434.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.659;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=25.53;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:58:1463,58,0 -chr4 58093604 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=2.758;DP=14;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=25.63;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:387,0,226 -chr4 58093832 . A G 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr4 58095988 . G A 1022.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=-0.179;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=31.03;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:11:1050,11,0 -chr4 58095994 . CA C 791.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.904;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:53:829,53,0 -chr4 58096080 . G A 1106.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.442;DP=31;FS=2.982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=29.88;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:53:1135,53,0 -chr4 58099254 . C G 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=3.737;DP=42;FS=11.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=16.23;ReadPosRankSum=-3.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:710,0,1374 -chr4 58099423 . TAGGTAACAGCACATCCTTTGTGAAAAATAATTTATTTTTGTGTCATCATCACAAGACAAAATACATTTCAACTGATTTC T 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=1.137;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=6.12;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,35:58:99:1218,0,2739 -chr4 58103108 . A C 682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:51:711,51,0 -chr4 58204100 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.370;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=24.73;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:325,0,97 -chr4 58342758 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-1.111;DP=18;FS=4.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:295,0,698 -chr4 58431581 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.185;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:345,0,182 -chr4 58431863 . A T 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:264,18,0 -chr4 58469842 . A G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=1.317;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,553 -chr4 58469845 . A G 767.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:54:796,54,0 -chr4 58570206 . A AT 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=-0.380;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=10.03;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:248,0,218 -chr4 58577184 . AC A 786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.921;DP=22;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:824,0,185 -chr4 58577186 . TCTCCTCTTTAATCCTCAGATCTTCAC T 786.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.268;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=27.13;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:824,0,187 -chr4 58581943 . T A 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.824;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=13.90;ReadPosRankSum=2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:334,0,633 -chr4 58623464 . C T 360.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.474;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.79;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6:388,0,6 -chr4 58809773 . A T 762.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.349;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=30.51;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:57:791,57,0 -chr4 58839516 . T C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:316,0,50 -chr4 58839709 . T C 256.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.10;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:285,0,22 -chr4 58939764 . C CAA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:272,0,145 -chr4 59089040 . G A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=2.283;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=16.84;ReadPosRankSum=2.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:466,0,162 -chr4 59286625 . G A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.834;DP=36;FS=2.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=13.99;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:532,0,740 -chr4 59292219 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.565;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:476,0,680 -chr4 59352652 . C A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.669;DP=60;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:433,0,1491 -chr4 59381456 . AG A 393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.168;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:73:776,0,73 -chr4 59381469 . G C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=-0.713;DP=25;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.208;QD=31.11;ReadPosRankSum=2.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:69:806,0,69 -chr4 59421056 . G A 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.490;DP=60;FS=5.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:963,0,1113 -chr4 59499636 . G T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=-0.495;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.802;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:378,0,407 -chr4 59529841 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.111;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:270,0,376 -chr4 60109187 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:236,0,171 -chr4 60130340 . GCTGAAAAAGAAAGAAACGAGAAAACGTTTACCAACGAACAGAGCCGTAAAATGAAGAGACTGTAGAAAGGAGCAAAC G 3163.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.685;DP=73;FS=3.318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=29.26;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:3201,242,0 -chr4 60246193 . A AGT 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=-1.284;DP=221;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.415;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,37:217:99:437,0,6622 -chr4 60260925 . AGTAAGCCTCTTGCCTTGTAAACACGTCGTTAGTCTCGCCGGTCTGCTATATTTACTTCACGTTTCCAG A 8724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=2.288;DP=291;FS=3.891;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=29.98;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,284:290:99:12929,1027,0 -chr4 60270125 . T C 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:473,0,488 -chr4 60270978 . C G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.358;DP=5;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=27.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:99:273,0,181 -chr4 60271391 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr4 60271392 . C T 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr4 60310085 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.07;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:337,0,107 -chr4 60314214 . T C 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.944;DP=35;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.036;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:580,0,632 -chr4 60359709 . T G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:365,0,343 -chr4 60612282 . G GT 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.948;DP=18;FS=2.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:58:507,0,58 -chr4 60613074 . G A 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 -chr4 60753442 . T C 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=-3.581;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:528,0,1494 -chr4 60827087 . C G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.515;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:306,0,907 -chr4 60931879 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.561;DP=52;FS=17.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=15.51;ReadPosRankSum=2.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:835,0,787 -chr4 60931899 . C A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=-0.985;DP=53;FS=19.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:310,0,1630 -chr4 60931952 . T G 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=2.184;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=31.49;ReadPosRankSum=1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,32:46:99:1571,0,353 -chr4 60932050 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=2.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=14.77;ReadPosRankSum=-1.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:368,0,331 -chr4 60934382 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=-2.363;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:233,0,750 -chr4 60999706 . G C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.050;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:401,0,199 -chr4 61111120 . C A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=-0.428;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:282,0,263 -chr4 61166762 . C T 281.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=31.31;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:19:310,0,19 -chr4 61241385 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=-1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:244,0,853 -chr4 61251157 . TC T 1161.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.311;DP=43;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.994;QD=27.02;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,32:39:64:1199,0,64 -chr4 61252031 . TCTGGAGGAAAGCAGGGCTTTAAAATCAGGTAAATCATTTACATTAGCTATGTATAGCCGCAGATGCTAGCTCAC T 1694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=1.296;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:99:1732,0,612 -chr4 61294895 . A C 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=-0.569;DP=235;FS=2.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,33:140:99:693,0,3449 -chr4 61297762 . T A 4549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-1.958;DP=218;FS=11.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.309;QD=20.87;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,142:193:99:5071,0,1076 -chr4 61298474 . T A 4897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.324;DP=361;FS=6.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,158:361:99:4926,0,6039 -chr4 61370818 . C T 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=-2.873;DP=46;FS=10.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:1000,0,757 -chr4 61442102 . A G 781.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:810,57,0 -chr4 61442591 . C G 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:479,36,0 -chr4 61479515 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=-0.041;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:341,0,369 -chr4 61479551 . A T 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -chr4 61830722 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-0.038;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:326,0,1130 -chr4 61840531 . G T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-1.258;DP=69;FS=2.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,16:69:99:348,0,1977 -chr4 61855303 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.546;DP=10;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:250,0,149 -chr4 61856265 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.619;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:291,0,411 -chr4 61856292 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.725;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:254,0,418 -chr4 61866693 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:54:249,0,54 -chr4 61866702 . C G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:54:249,0,54 -chr4 62004851 . G A 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=-0.403;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=29.51;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:58:648,0,58 -chr4 62015582 . TGTACGTCTCACACACACACACACACACACACACACACACTACAGACAGTGAGCGTGAGTGTGTGTGTTTCTGTCTGCAG T 2268.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-1.577;DP=51;FS=2.960;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2306,193,0 -chr4 62016416 . AAC A 1331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.159;DP=49;FS=2.981;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=27.18;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:79:1369,79,0 -chr4 62037551 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.553;DP=141;FS=6.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,27:141:99:430,0,4367 -chr4 62037867 . C T 2214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=1.306;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=27.01;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,71:82:43:2243,0,43 -chr4 62038675 . G T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr4 62043516 . T C 917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=-0.602;DP=27;FS=7.258;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=33.99;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:36:946,36,0 -chr4 62044009 . GCAGGTGAACAACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGCTGCAGTAATGTTGTGTTTGTCCTCTA G 1538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.874;DP=53;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=29.03;ReadPosRankSum=1.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,35:49:99:1576,0,2188 -chr4 62044521 . A C 263.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=29.23;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12:291,0,12 -chr4 62050300 . C A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.350;DP=59;FS=3.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:366,0,3740 -chr4 62050437 . G A 1949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=2.578;DP=76;FS=2.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=25.65;ReadPosRankSum=1.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,53:76:99:1978,0,589 -chr4 62050512 . A T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=3.335;DP=64;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=19.72;ReadPosRankSum=1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,40:64:99:1290,0,697 -chr4 62051712 . C A 780.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=2.192;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:17:809,17,0 -chr4 62051716 . C T 531.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=-1.692;DP=22;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.692;QD=24.17;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:560,0,231 -chr4 62052325 . G A 665.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=1.187;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=31.32;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:16:694,16,0 -chr4 62052462 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=-0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.73;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:253,0,175 -chr4 62055877 . C A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.617;DP=80;FS=10.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,23:80:99:521,0,2019 -chr4 62055932 . C T 2454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.509;DP=90;FS=6.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,67:89:99:2483,0,477 -chr4 62056877 . A C 1575.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-2.070;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=33.49;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,39:43:46:1604,46,0 -chr4 62056917 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=-0.076;DP=20;FS=10.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:363,0,394 -chr4 62057416 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:372,0,101 -chr4 62057594 . A G 2696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-2.567;DP=89;FS=1.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.409;QD=30.30;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,61:89:99:2725,0,1699 -chr4 62057619 . T A 2019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=-2.334;DP=88;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=22.95;ReadPosRankSum=3.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,61:88:99:2048,0,3065 -chr4 62057696 . TGAACATCTGGAGAACCACAGACAAAAA T 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=-2.922;DP=35;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=14.19;ReadPosRankSum=3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:534,0,453 -chr4 62058504 . A G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.917;DP=33;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=21.57;ReadPosRankSum=-0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:740,0,854 -chr4 62058623 . C T 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.854;DP=22;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:95:750,0,95 -chr4 62058624 . T G 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.854;DP=22;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=32.81;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:95:750,0,95 -chr4 62059654 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=5.748;DP=102;FS=19.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=8.92;ReadPosRankSum=-5.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:938,0,6066 -chr4 62059754 . G A 1716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=-1.156;DP=359;FS=11.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.78;ReadPosRankSum=2.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:277,82:359:99:1745,0,10851 -chr4 62060041 . C G 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.469;DP=85;FS=14.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=20.14;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,52:84:99:1740,0,1046 -chr4 62060228 . G A 9537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=-1.211;DP=328;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.123;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,257:327:99:9566,0,1641 -chr4 62060703 . C T 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-1.180;DP=242;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,54:241:99:733,0,21077 -chr4 62068644 . C A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=4.441;DP=41;FS=10.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=7.36;ReadPosRankSum=-4.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:330,0,1016 -chr4 62068833 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=-1.201;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:364,0,3460 -chr4 62077289 . A C 2250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.630;DP=111;FS=4.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.410;QD=20.28;ReadPosRankSum=2.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,71:111:99:2279,0,1284 -chr4 62079719 . CGCAGGTACACACACACACACACACACACGCGCTCATGATAGAGCAGACTGGCACTCACTGATCTCTGTGTCCT C 5287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.500;DP=135;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=30.47;ReadPosRankSum=1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,112:115:99:5325,474,0 -chr4 62080135 . G A 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.076;DP=114;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=7.91;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,36:114:99:930,0,2715 -chr4 62082821 . A G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 -chr4 62083040 . C CGT 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;QD=22.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,31:33:21:1034,0,21 -chr4 62086692 . TTG T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=-2.310;DP=37;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=5.51;ReadPosRankSum=2.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:241,0,385 -chr4 62093954 . GT G 1179.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=1.614;DP=48;FS=7.634;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=24.58;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:91:1217,91,0 -chr4 62093957 . C G 1188.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.42;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:91:1217,91,0 -chr5 247112 . CACCTGACCAAAACACACACACACACACGATGGTGATGCTGATGGTGCAGTGTTCTCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTTTCTGTGTGTTGTTTT C 5249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=1.154;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=29.20;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,128:138:61:5287,0,61 -chr5 250865 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-2.546;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:462,0,2767 -chr5 250895 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.312;DP=108;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:376,0,3144 -chr5 250939 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-0.657;DP=96;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,22:95:99:419,0,2703 -chr5 278301 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-0.121;DP=110;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,27:108:99:581,0,2700 -chr5 298612 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-1.535;DP=58;FS=4.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:320,0,1619 -chr5 483148 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.321;DP=36;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:244,0,980 -chr5 486405 . G C 1727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.879;DP=131;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,50:131:99:1756,0,2723 -chr5 544006 . GA G 3974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:107:99:4012,324,0 -chr5 610693 . A G 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.103;DP=36;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=22.72;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,25:36:99:846,0,303 -chr5 817676 . C T 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=1.588;DP=134;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,30:134:99:564,0,3876 -chr5 823983 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=1.324;DP=30;FS=6.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:862,0,118 -chr5 826166 . C T 7699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,166:166:99:7728,524,0 -chr5 826171 . G T 7699.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:7728,524,0 -chr5 861029 . TAGGTCAGTGTGGCTCTGTGGTGTCTGCAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGATGGGATCTGCTGTGTATGGC T 1024.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=2.854;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=32.02;ReadPosRankSum=-2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1062,0,1383 -chr5 1050998 . T A 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr5 1193619 . A T 2628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.738;DP=163;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,71:163:99:2657,0,3361 -chr5 1249828 . A AT 311.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:23:349,23,0 -chr5 1250475 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:273,0,511 -chr5 1284038 . CT C 3095.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=1.259;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=23.63;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,106:114:99:3133,244,0 -chr5 1421170 . C G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=-0.650;DP=142;FS=4.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.010;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,27:142:99:429,0,4246 -chr5 1429170 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=-1.713;DP=81;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.24;ReadPosRankSum=2.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:615,0,2072 -chr5 1507181 . C T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr5 1549451 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=31.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:279,0,145 -chr5 1549461 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:279,0,145 -chr5 1552126 . T A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=31.68;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:99:345,0,847 -chr5 1742221 . A G 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.150;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:306,0,258 -chr5 1971668 . G A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=-1.251;DP=77;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.086;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,33:77:99:1161,0,1429 -chr5 2064998 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.533;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,24:136:99:315,0,4434 -chr5 2065503 . G T 641.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=1.156;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=33.59;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:10:669,10,0 -chr5 2067411 . G A 2271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.609;DP=476;FS=5.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:359,115:474:99:2300,0,13510 -chr5 2099901 . A C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:270,0,119 -chr5 2107165 . T TAC 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-1.860;DP=64;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:314,0,2148 -chr5 2107340 . C G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.037;DP=159;FS=9.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,32:158:99:531,0,8944 -chr5 2156460 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=5.030;DP=53;FS=11.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.90;ReadPosRankSum=-5.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:288,0,1639 -chr5 2156463 . T TTG 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.382;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:300,0,852 -chr5 2156605 . C CT 556.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.475;DP=89;FS=6.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=6.26;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,44:81:99:769,0,485 -chr5 2156700 . G T 1519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-1.467;DP=69;FS=8.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=22.03;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,44:69:99:1548,0,862 -chr5 2157010 . CT C 320.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.895;DP=25;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:380,0,132 -chr5 2158578 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=25.10;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:62:229,0,62 -chr5 2174665 . C A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=-1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=27.78;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:50:306,0,50 -chr5 2176764 . G T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=2.667;DP=36;FS=5.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:239,0,1843 -chr5 2176766 . G A 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=1.389;DP=38;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:720,0,673 -chr5 2177060 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.331;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:280,0,1286 -chr5 2177837 . G GT 456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.627;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:494,0,528 -chr5 2177980 . C CTG 713.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-2.068;DP=56;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=12.75;ReadPosRankSum=2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,26:50:99:751,0,750 -chr5 2190826 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=-1.588;DP=46;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:237,0,1443 -chr5 2194960 . C G 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.383;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:430,0,2019 -chr5 2240358 . T TTG 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=2.046;DP=30;FS=6.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:262,0,693 -chr5 2240385 . A T 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:41:312,0,41 -chr5 2240387 . T A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.895;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=13.58;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:232,0,114 -chr5 2243460 . C A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-1.932;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=19.73;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:265,0,136 -chr5 2243518 . A G 206.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:235,0,23 -chr5 2260723 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.041;DP=40;FS=2.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,24:40:99:806,0,630 -chr5 2260776 . T C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.118;DP=48;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.867;QD=15.50;ReadPosRankSum=2.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:772,0,802 -chr5 2261380 . C A 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.008;DP=55;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=17.74;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,28:55:99:1004,0,949 -chr5 2261457 . A C 910.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=1.203;DP=68;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.542;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,27:68:99:939,0,1493 -chr5 2262336 . G A 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-2.088;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=23.75;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:1182,0,181 -chr5 2262625 . ATG A 326.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=2.287;DP=30;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:30:384,0,30 -chr5 2262814 . T C 362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:391,30,0 -chr5 2279322 . T C 228.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:257,0,14 -chr5 2371105 . AT A 335.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.488;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=18.65;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:30:373,0,30 -chr5 2493093 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-1.271;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:339,0,418 -chr5 2501232 . G T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=3.665;DP=26;FS=6.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=9.99;ReadPosRankSum=-2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:288,0,607 -chr5 2517125 . C T 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=0.175;DP=333;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,88:331:99:1961,0,8681 -chr5 2564923 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.969;DP=32;FS=11.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:497,0,621 -chr5 2707459 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.326;DP=41;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=14.46;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:621,0,712 -chr5 2813980 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:308,0,57 -chr5 3561616 . T A 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=-0.042;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:791,0,1008 -chr5 3562424 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=-0.050;DP=64;FS=1.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,13:64:99:238,0,2041 -chr5 3585135 . C T 4336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.824;DP=298;FS=8.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,126:298:99:4365,0,5689 -chr5 3842919 . TCTGCAAGATCATAGAGATGTGTAAGAGACTCAACTCAAACTGTGTGCTTATAAAATGTTTTAAGCAGAAACTTAC T 646.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=29.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:99:684,0,563 -chr5 3931937 . C T 1048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.551;DP=310;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.837;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,62:309:99:1077,0,9428 -chr5 3931970 . G A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.883;DP=356;FS=2.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:297,58:355:99:545,0,11341 -chr5 3944793 . G A 1774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=-2.308;DP=336;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,91:336:99:1803,0,11100 -chr5 4056105 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.313;DP=124;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,21:124:99:282,0,4036 -chr5 4127588 . G GA 458.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-2.907;DP=372;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:234,71:305:99:496,0,5579 -chr5 4128383 . C CA 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=-3.314;DP=155;FS=9.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,37:136:99:361,0,1931 -chr5 4264797 . G A 3958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.111;DP=343;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=11.54;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,120:339:99:3987,0,7550 -chr5 4270450 . G C 3043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=2.790;DP=343;FS=8.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.090;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,114:343:99:3072,0,8700 -chr5 4270537 . G T 1961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=-0.473;DP=270;FS=1.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=7.27;ReadPosRankSum=3.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,81:270:99:1990,0,6798 -chr5 4270593 . G T 3184.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.516;ClippingRankSum=0.543;DP=271;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,101:270:99:3213,0,5714 -chr5 4276523 . T A 4294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=1.006;DP=341;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,129:340:99:4323,0,6863 -chr5 4276547 . C T 3651.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-1.899;DP=323;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.019;QD=11.31;ReadPosRankSum=-1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,112:323:99:3689,0,7941 -chr5 4282704 . G T 4758.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=-0.986;DP=421;FS=4.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=11.30;ReadPosRankSum=3.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,142:420:99:4787,0,9411 -chr5 4294735 . C A 3723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.390;DP=307;FS=2.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,110:307:99:3752,0,6805 -chr5 4301217 . C T 1273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-2.473;DP=159;FS=2.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.049;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,50:158:99:1302,0,3889 -chr5 4301271 . T C 2021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=2.368;DP=128;FS=5.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,57:127:99:2050,0,4633 -chr5 4301274 . C A 2021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=3.020;DP=127;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,55:126:99:2050,0,4642 -chr5 4350875 . G A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.374;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:373,0,702 -chr5 4351103 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.584;DP=71;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=8.62;ReadPosRankSum=0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:640,0,1840 -chr5 4351140 . G A 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.273;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,26:75:99:842,0,1708 -chr5 4447429 . T TTA 1384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-3.110;DP=233;FS=19.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,44:227:99:1422,0,7825 -chr5 4456569 . T A 1304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.598;DP=261;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,62:261:99:1333,0,7971 -chr5 4471739 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.490;DP=68;FS=12.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:616,0,3782 -chr5 5150544 . A T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=-0.635;DP=16;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,245 -chr5 5151262 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:369,0,365 -chr5 5676585 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.362;DP=36;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:446,0,889 -chr5 5767646 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=-0.137;DP=60;FS=6.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:303,0,1725 -chr5 6242775 . A T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.568;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,149 -chr5 6290482 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.711;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:487,0,1605 -chr5 6290941 . A AG 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.883;DP=168;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,32:148:99:364,0,6579 -chr5 6291249 . C A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.175;DP=70;FS=5.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,16:70:99:353,0,2072 -chr5 6292649 . GT G 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=-0.828;DP=61;FS=32.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:591,0,3033 -chr5 6294380 . A T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=-1.752;DP=179;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.879;QD=3.50;ReadPosRankSum=-1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,41:179:99:655,0,6968 -chr5 6417337 . C A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.475;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:268,0,1225 -chr5 6446491 . T A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=-0.142;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=10.87;ReadPosRankSum=0.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:300,0,992 -chr5 6512503 . T C 1615.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.382;DP=100;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=16.16;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,47:99:99:1644,0,1741 -chr5 6695076 . CA C 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.154;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:674,0,127 -chr5 6802336 . G T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-1.037;DP=30;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:397,0,648 -chr5 6802598 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-2.198;DP=76;FS=0.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:588,0,1947 -chr5 6802949 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.299;DP=56;FS=1.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:414,0,1543 -chr5 6811578 . T C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.064;DP=72;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:267,0,2357 -chr5 6822548 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.088;DP=33;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=9.17;ReadPosRankSum=2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:331,0,824 -chr5 6930663 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.670;DP=54;FS=4.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:598,0,1295 -chr5 6961220 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.599;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.027;QD=16.21;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:482,0,557 -chr5 6963434 . A C 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=-2.243;DP=27;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=7.88;ReadPosRankSum=2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:241,0,673 -chr5 6964350 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-1.660;DP=25;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:232,0,658 -chr5 7013501 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.010;DP=48;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.115;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:678,0,920 -chr5 7013688 . G A 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.227;DP=58;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=14.60;ReadPosRankSum=2.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:875,0,1046 -chr5 7033149 . G A 5074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.753;DP=161;FS=0.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=31.52;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,125:161:99:5103,0,718 -chr5 7033156 . G A 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.498;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,54:166:99:1463,0,5809 -chr5 7033260 . G T 3688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=-1.544;DP=125;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=29.51;ReadPosRankSum=2.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,98:124:99:3717,0,464 -chr5 7033296 . T G 2267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-4.568;DP=88;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=25.77;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,62:88:99:2296,0,663 -chr5 7044762 . A C 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.152;DP=49;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:689,0,942 -chr5 7049666 . C G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=1.683;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.215;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:428,0,889 -chr5 7148833 . C A 2716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=-0.655;DP=87;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=31.23;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,69:87:99:2745,0,348 -chr5 7150061 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.249;DP=29;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:276,0,1543 -chr5 7150062 . T G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-2.381;DP=29;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:276,0,1543 -chr5 7150100 . C T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=-0.436;DP=70;FS=5.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.051;QD=7.80;ReadPosRankSum=-2.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,21:70:99:574,0,1991 -chr5 7150128 . G A 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.217;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=13.02;ReadPosRankSum=1.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,29:78:99:1044,0,1787 -chr5 7150233 . G T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.535;DP=93;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,25:92:99:445,0,3872 -chr5 7150320 . T G 2894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.687;DP=111;FS=3.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,78:111:99:2923,0,865 -chr5 7183724 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.283;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:494,0,455 -chr5 7183750 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.82;ReadPosRankSum=-1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,434 -chr5 7761024 . CGTAAGAACAGACTAAAAAGAGCTGCATGTGTGTTCGGCGTCTTTACTGTGCATAACATTCTGCTACCAACTGCAG C 951.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=1.837;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:99:989,0,652 -chr5 7885682 . C G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=-2.109;DP=30;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:384,0,686 -chr5 8050309 . C T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=-1.271;DP=28;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:337,0,613 -chr5 8051750 . G C 841.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.209;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=33.68;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:13:870,0,13 -chr5 8052095 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:236,0,392 -chr5 8052194 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=-1.550;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.094;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:436,0,418 -chr5 8052208 . C T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.817;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:308,0,409 -chr5 8052296 . C T 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=-1.196;DP=32;FS=5.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=19.21;ReadPosRankSum=-1.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:643,0,414 -chr5 8052584 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=-0.957;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.119;QD=8.48;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:342,0,955 -chr5 8052662 . A G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.318;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=18.89;ReadPosRankSum=-1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:595,0,414 -chr5 8139246 . A G 10090.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=244;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,243:243:99:10119,731,0 -chr5 8139284 . G A 3534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-1.701;DP=222;FS=5.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,105:221:99:3563,0,3538 -chr5 8164755 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.156;DP=54;FS=10.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:269,0,1552 -chr5 8178215 . A G 767.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=1.224;DP=47;FS=1.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:796,0,957 -chr5 8178227 . C T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=-1.046;DP=36;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=17.63;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:663,0,594 -chr5 8178257 . T G 356.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=32.44;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:23:385,23,0 -chr5 8183380 . G A 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.276;DP=119;FS=8.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.513;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,33:119:99:841,0,3204 -chr5 8319346 . A G 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.898;DP=56;FS=8.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:418,0,1498 -chr5 8670628 . GACCGGGTTGTGGTGTTGCTAACATGATGCCTCAAACAGAC G 898.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:72:936,72,0 -chr5 8675156 . G A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr5 8984949 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.401;DP=137;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,38:137:99:890,0,3790 -chr5 8992282 . C CA 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=1.269;DP=110;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,32:107:99:531,0,2030 -chr5 8998613 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.312;DP=96;FS=0.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,30:96:99:794,0,2413 -chr5 8998975 . GAGGTAAAATACAATCTCATATTGACTATGTTAATAATCTGCAAGCACTGAGGCTGATGTAATCTATTTATTGTATTGAGTGC G 4163.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.598;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.184;QD=30.30;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,103:105:99:4201,302,0 -chr5 9046139 . G C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.035;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:352,0,365 -chr5 9056776 . T A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.909;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:305,0,799 -chr5 9129034 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.538;DP=51;FS=1.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:239,0,1536 -chr5 9129061 . G A 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-0.541;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=15.62;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1184,0,3061 -chr5 9129064 . C G 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.686;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1184,0,3083 -chr5 9138013 . C G 2216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.527;DP=98;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=22.62;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,62:98:99:2245,0,1206 -chr5 9138015 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=-0.430;DP=106;FS=1.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=5.04;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:563,0,4490 -chr5 9157987 . G A 320.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:349,0,16 -chr5 9461830 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.800;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.48;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:357,0,391 -chr5 9537654 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.101;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:250,0,911 -chr5 9845507 . C T 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=1.827;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=22.12;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,463 -chr5 9845510 . T C 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.945;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:360,0,463 -chr5 10011764 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=1.243;DP=50;FS=1.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:489,0,1092 -chr5 10011851 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=-0.040;DP=44;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:290,0,1111 -chr5 10014462 . T C 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.398;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=15.50;ReadPosRankSum=-2.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,28:61:99:974,0,1010 -chr5 10014474 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.021;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,24:63:99:780,0,1311 -chr5 10018493 . C T 1255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.218;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,37:76:99:1284,0,1241 -chr5 10050385 . T G 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=1.839;DP=89;FS=6.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:595,0,2927 -chr5 10050440 . T C 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=-1.028;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=10.93;ReadPosRankSum=2.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:903,0,1791 -chr5 10052549 . C G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=-0.627;DP=60;FS=4.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=6.00;ReadPosRankSum=2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:388,0,3589 -chr5 10052555 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-1.007;DP=60;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.929;QD=6.00;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:388,0,3589 -chr5 10052612 . T C 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=3.221;DP=72;FS=7.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,21:72:99:660,0,4053 -chr5 10052615 . G A 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=3.046;DP=73;FS=8.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:660,0,4053 -chr5 10060693 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=-2.255;DP=118;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=1.85;ReadPosRankSum=3.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,19:118:99:247,0,3790 -chr5 10081255 . T C 940.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=-0.782;DP=68;FS=4.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.206;QD=13.83;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,28:67:99:969,0,1342 -chr5 10117269 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=-0.627;DP=28;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:474,0,480 -chr5 10225484 . T C 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 -chr5 10434529 . A G 1160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=-1.381;DP=59;FS=0.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.563;QD=19.67;ReadPosRankSum=0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,35:59:99:1189,0,821 -chr5 10606933 . C A 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr5 10606935 . C T 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:585,39,0 -chr5 10607028 . C G 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.615;DP=52;FS=10.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.486;QD=17.86;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,28:51:99:957,0,846 -chr5 10607128 . C G 2252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2281,168,0 -chr5 10607278 . G A 657.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.853;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=11.75;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:686,0,951 -chr5 10607349 . C T 2337.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2366,180,0 -chr5 10888412 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.884;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:319,0,198 -chr5 10953328 . G GA 537.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.562;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,31:92:99:575,0,2182 -chr5 10961626 . A G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=-1.536;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=18.17;ReadPosRankSum=1.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:428,0,322 -chr5 10987217 . G A 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=2.280;DP=44;FS=11.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.585;QD=13.18;ReadPosRankSum=-0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:608,0,852 -chr5 11124321 . A T 269.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:298,21,0 -chr5 11396406 . A T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.707;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:329,0,1179 -chr5 11396444 . A C 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.609;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:408,0,1178 -chr5 11396548 . C CAA 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=-0.471;DP=27;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:299,0,510 -chr5 11404787 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=-0.086;DP=44;FS=1.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:246,0,1558 -chr5 11404827 . A G 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-1.413;DP=48;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:262,0,1228 -chr5 11526118 . C T 202.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:231,0,17 -chr5 11526208 . T C 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr5 12076431 . T C 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:21:296,21,0 -chr5 12816210 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.819;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=29.10;ReadPosRankSum=0.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:75:523,0,75 -chr5 13232587 . T C 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=1.256;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:437,0,2024 -chr5 13717881 . A C 857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:886,63,0 -chr5 13732838 . C T 1647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.815;DP=328;FS=0.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:248,79:327:99:1676,0,9327 -chr5 13735587 . C CG 668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.937;ClippingRankSum=0.924;DP=185;FS=16.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=3.61;ReadPosRankSum=5.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,97:150:99:706,0,2277 -chr5 13830127 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr5 13874587 . T C 2362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2391,169,0 -chr5 13874637 . G T 3632.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3661,277,0 -chr5 13940391 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-0.708;DP=49;FS=4.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:613,0,1017 -chr5 13941230 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.996;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:240,0,1529 -chr5 13957561 . GAGGTAAGATTAAACAGTAAATATGTGAACAACTGGTAAAATGTTTTCACTTTAAAAAAAATTGTGCTTGCTTTC G 3790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=1.528;DP=89;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.243;QD=26.58;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:85:99:3828,300,0 -chr5 13969551 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=1.058;DP=111;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=2.83;ReadPosRankSum=3.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,21:111:99:342,0,7052 -chr5 13969554 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.146;DP=106;FS=0.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=2.98;ReadPosRankSum=4.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,17:106:99:344,0,7052 -chr5 13995283 . AGGTTTCAAATCCATTTAATATATTTTGTTCAAATTCTCATCTAGACTTCTGAAATCATTGGTATTAGATTATTCAGATACAATTTTTGTTTGCT A 816.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=1.703;DP=132;FS=3.083;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.530;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:120:99:854,289,0 -chr5 13998047 . G C 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=-0.329;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,31:96:99:868,0,2410 -chr5 14064164 . T C 1811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.002;DP=233;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,71:233:99:1840,0,6130 -chr5 14171542 . C T 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=1.075;DP=150;FS=5.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,43:149:99:1059,0,3974 -chr5 14236852 . C T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.875;DP=28;FS=3.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.737;QD=18.03;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:533,0,946 -chr5 14237539 . C G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=31.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:66:248,0,66 -chr5 14239549 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.261;DP=50;FS=3.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:250,0,2083 -chr5 14303642 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=2.258;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.838;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,246 -chr5 14305313 . C CT 223.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;QD=24.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:14:261,0,14 -chr5 14305317 . C A 232.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:14:261,0,14 -chr5 14306941 . T TA 1146.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=1.041;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=23.40;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:37:80:1184,80,0 -chr5 14313433 . G GCAGGAGCACTAGAGGAGAA 1610.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=-1.902;DP=56;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=28.76;ReadPosRankSum=0.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,37:50:99:1648,0,392 -chr5 14372818 . GT G 244.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:282,24,0 -chr5 14511332 . C CA 1483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.436;DP=87;FS=5.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,55:87:99:1521,0,803 -chr5 14540038 . CA C 1946.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.530;DP=128;FS=6.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=15.21;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,74:125:99:1984,0,1354 -chr5 14540441 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=-0.647;DP=135;FS=2.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=2.17;ReadPosRankSum=-4.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,24:135:99:321,0,4273 -chr5 14541070 . C CA 337.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.349;DP=127;FS=18.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,30:127:99:375,0,2805 -chr5 14877549 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.531;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:275,0,1162 -chr5 14890351 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.613;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:234,0,1393 -chr5 14890427 . C A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.478;DP=62;FS=5.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,26:62:99:829,0,1170 -chr5 14890454 . G A 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=-0.707;DP=52;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,24:52:99:795,0,912 -chr5 14950116 . T C 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.68;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:285,0,51 -chr5 14950200 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-2.381;DP=21;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=15.85;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:361,0,810 -chr5 14950205 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-2.898;DP=19;FS=14.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:361,0,803 -chr5 14988103 . G GA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.344;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:253,0,416 -chr5 15043378 . A G 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:540,39,0 -chr5 15271409 . A G 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.842;DP=41;FS=5.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:557,0,808 -chr5 15280168 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.628;DP=59;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:461,0,1562 -chr5 15295335 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=-0.747;DP=72;FS=4.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:252,0,2237 -chr5 16010997 . G GA 589.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=-1.171;DP=148;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,39:146:99:627,0,3290 -chr5 16011635 . C T 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=1.244;DP=168;FS=1.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:726,0,5015 -chr5 16016006 . G A 1283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.200;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,49:148:99:1312,0,3744 -chr5 16025403 . G A 1132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=-0.616;DP=165;FS=2.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,47:165:99:1161,0,4556 -chr5 16025937 . C T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=1.023;DP=130;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,39:129:99:945,0,3504 -chr5 16025952 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=-0.104;DP=138;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,37:137:99:865,0,3917 -chr5 16084547 . C T 1124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.842;DP=101;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=11.14;ReadPosRankSum=-1.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,37:101:99:1153,0,2102 -chr5 16097567 . G GT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.708;DP=65;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,21:52:99:336,0,629 -chr5 16117725 . A G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.634;DP=86;FS=3.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,26:85:99:655,0,1989 -chr5 16228718 . C A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.695;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:436,0,391 -chr5 16234426 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.800;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:619,0,830 -chr5 16919244 . C CT 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=-0.142;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:94:402,0,94 -chr5 17145517 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=-1.078;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=10.64;ReadPosRankSum=2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:305,0,600 -chr5 17269075 . C T 1703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-1.083;DP=138;FS=4.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=12.35;ReadPosRankSum=2.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,50:138:99:1732,0,3022 -chr5 17613362 . C G 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=-0.631;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:300,0,1420 -chr5 17696935 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.220;DP=22;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:356,0,222 -chr5 17719026 . C T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.256;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:239,42:281:99:333,0,8942 -chr5 17720367 . TCTGTGGAAAACAGCAAAATTATATTTTCATAAATTATCTAAACATTATTATTATTTTATTTCATCATTTATAATTACATTTGTCTTCTGAACTACAAAGATCCTTGTACATCAAATAGAAAAAAAGCAAAACAATGGTCAAAGTAC T 18427.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=1.447;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,391:397:99:18465,1596,0 -chr5 17720562 . C CT 1293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-1.381;DP=396;FS=29.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,95:368:99:1331,0,7707 -chr5 17722638 . G GA 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-1.729;DP=182;FS=3.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,32:162:99:242,0,3547 -chr5 17930906 . C T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:261,18,0 -chr5 18067274 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.588;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=17.87;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:332,0,250 -chr5 18112016 . T C 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:332,0,130 -chr5 18511133 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=1.528;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.306;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:429,0,513 -chr5 18578805 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:242,0,388 -chr5 19504949 . G A 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=1.394;DP=80;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:919,0,1912 -chr5 19505012 . C T 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=1.623;DP=123;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,41:123:99:1098,0,3063 -chr5 19531514 . G GT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=1.075;DP=41;FS=5.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=1.908;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:416,0,426 -chr5 19577145 . A T 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.879;DP=80;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,31:80:99:1035,0,2748 -chr5 19580385 . T C 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=1.167;DP=126;FS=12.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,38:126:99:986,0,3226 -chr5 19582322 . T A 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.357;DP=116;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,39:115:99:1258,0,2613 -chr5 19591600 . T G 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.835;ClippingRankSum=-1.841;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:1026,0,1665 -chr5 19592214 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=11.54;ReadPosRankSum=-2.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,813 -chr5 19599111 . C G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-1.126;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=10.44;ReadPosRankSum=2.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:258,0,497 -chr5 19635784 . GA G 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=-2.301;DP=55;FS=11.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:465,0,560 -chr5 19668089 . TGGTGAGAAATACAAATATTATCTTCCTTGTTTAACATTTACTCCATATAGTCAATATTCAGAAAAAAAAAAGTTTGAACTCAACTCTTATTCTATTTGATCCA T 743.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=2.205;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=30.04;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:99:781,0,625 -chr5 19668919 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.893;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=17.30;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:305,0,273 -chr5 19670694 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=18.56;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:251,0,168 -chr5 19673482 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=-1.082;DP=54;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:691,0,1163 -chr5 19680566 . G A 695.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-2.227;DP=44;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.837;QD=15.81;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:724,0,818 -chr5 19825807 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=-0.300;DP=51;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:279,0,1551 -chr5 19826116 . A T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=-1.646;DP=23;FS=8.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=10.21;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:263,0,541 -chr5 20609150 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=1.042;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=12.99;ReadPosRankSum=2.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,406 -chr5 20609621 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.978;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.616;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:268,0,441 -chr5 20611344 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.988;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,382 -chr5 20611432 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.074;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:315,0,1220 -chr5 20611554 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.457;DP=32;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:258,0,855 -chr5 20634634 . C T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.184;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=24.05;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:846,0,313 -chr5 20681078 . C A 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.540;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:430,0,437 -chr5 20681188 . G C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.950;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:387,0,250 -chr5 20686034 . G GA 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-1.482;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:381,0,2290 -chr5 20686599 . A AT 871.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-1.885;DP=85;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,40:81:99:909,0,1137 -chr5 20686677 . G A 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=-1.050;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1365,0,2060 -chr5 20686922 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=-0.962;DP=27;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:402,0,549 -chr5 20688272 . C A 1308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.817;DP=108;FS=0.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,38:107:99:1337,0,2456 -chr5 20689181 . C T 2606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=-0.685;DP=172;FS=4.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=15.16;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,79:172:99:2635,0,4050 -chr5 20689409 . A G 2264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-1.098;DP=178;FS=0.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.692;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,66:173:99:2293,0,3653 -chr5 20697062 . G C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.549;DP=40;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:340,0,1131 -chr5 20704306 . A T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=14.42;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:259,0,323 -chr5 20709292 . T C 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.292;DP=51;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.857;QD=17.00;ReadPosRankSum=-0.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,26:51:99:895,0,869 -chr5 20709414 . C T 1168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.368;DP=91;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,37:91:99:1197,0,1689 -chr5 20711132 . C T 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-0.981;DP=101;FS=3.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,34:101:99:856,0,4945 -chr5 20711152 . C G 1703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.093;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,51:122:99:1732,0,2374 -chr5 20711192 . C T 1817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=-0.246;DP=140;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.186;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,54:140:99:1846,0,2969 -chr5 20715367 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-0.237;DP=90;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,17:90:99:277,0,2745 -chr5 20719186 . G T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.347;DP=55;FS=3.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,30:55:99:1365,0,1777 -chr5 20719378 . A G 778.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=2.084;DP=49;FS=9.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:807,0,785 -chr5 20719426 . C T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.272;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=1.850;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:290,0,1431 -chr5 20724753 . T C 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-2.034;DP=12;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=27.73;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:361,0,93 -chr5 20726469 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-1.418;DP=16;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:255,0,330 -chr5 20727067 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-1.137;DP=34;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:612,0,606 -chr5 20727444 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-1.008;DP=46;FS=9.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:414,0,1228 -chr5 20730930 . G A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=-1.266;DP=39;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:427,0,937 -chr5 20749235 . C CT 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.553;DP=28;FS=3.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:391,0,237 -chr5 20769558 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=-1.032;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:332,0,657 -chr5 20772428 . C T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.116;DP=57;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,29:53:99:981,0,853 -chr5 20798299 . C T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.377;DP=279;FS=1.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=1.33;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,41:277:99:398,0,9276 -chr5 20819327 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=-0.708;DP=30;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.708;QD=12.16;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:393,0,1840 -chr5 20819341 . G T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=1.473;DP=34;FS=8.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:450,0,2703 -chr5 20819785 . A G 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=1.023;DP=67;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:873,0,1382 -chr5 21130442 . C A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.067;DP=92;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:251,0,2853 -chr5 21135371 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=-0.574;DP=59;FS=1.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:254,0,2542 -chr5 21137735 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.678;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.805;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:239,0,1798 -chr5 21138865 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.710;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:384,0,1671 -chr5 21150166 . AAGGTTAGATTTAATAACAAAACAACTGCAATTGCTCATGAGCTGTAGCGGTCAGAGGTTTTTTTCTACTAC A 2957.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=1.845;DP=88;FS=9.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=33.61;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,77:84:99:2995,0,1178 -chr5 21164191 . G T 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=1.221;DP=95;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=7.39;ReadPosRankSum=2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,30:95:99:730,0,2342 -chr5 21167378 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.234;DP=39;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.358;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:262,0,1195 -chr5 21169109 . A AT 1472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.084;DP=117;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,78:104:99:1647,0,498 -chr5 21174566 . TCTGAGAAGCATAGAAATCAACAAATTCTGTAAGTAACATTCATTAATTCTAATTTACCAGCATAGTTTTATTCAAATTCCTCAC T 8746.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=2.894;DP=211;FS=1.642;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=37.31;ReadPosRankSum=-2.438 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,204:210:99:8784,652,0 -chr5 21176455 . TCTACAAAAATGTCATATAAAAACTATATAAACACAGGCATATTTAGACTCCATAATTTGAGTTAGTTTGAATCCGAATCATCACTTAC T 6965.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=2.427;DP=161;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,157:161:99:7003,559,0 -chr5 21178612 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.260;DP=181;FS=0.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,25:162:99:241,0,5200 -chr5 21182977 . T C 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;ClippingRankSum=-0.228;DP=95;FS=3.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,35:95:99:1220,0,2046 -chr5 21219950 . G T 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.726;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:520,0,868 -chr5 21220475 . AT A 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=1.375;DP=37;FS=1.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:69:672,0,69 -chr5 21221594 . T C 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=2.095;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:494,0,108 -chr5 21222166 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=-0.343;DP=65;FS=4.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.460;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:277,0,1993 -chr5 21222446 . C T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=1.456;DP=53;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.882;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:269,0,1658 -chr5 21224089 . GCTTTAAAGAGAAAGAGCAAATTGATCAGGTAAAAGCTTTCTTCCTGAAACCAAGTAAGAAATTCCCTTTATTTTAC G 2175.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=2.527;DP=54;FS=5.055;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=30.73;ReadPosRankSum=-1.998 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,50:54:99:2213,183,0 -chr5 21226446 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.852;DP=77;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.333;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,16:77:99:329,0,2374 -chr5 21234776 . GGGTTCGTATCACATGTAATCGGAGATAGTGATTTACAGGTTAAAATGCATAGAGCCTACTTGAATTTCTTGTCTTTCTTTTCTGAA G 917.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=1.576;DP=26;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=29.90;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:80:955,80,0 -chr5 21534837 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-2.163;DP=72;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=3.51;ReadPosRankSum=0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:281,0,2113 -chr5 21537498 . TG T 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.588;DP=67;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.970;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:417,0,1499 -chr5 21579309 . T A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=-0.616;DP=22;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:289,0,441 -chr5 21632401 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.954;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:246,0,259 -chr5 21632462 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=-0.836;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.671;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:433,0,730 -chr5 21632464 . C T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.152;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=20.24;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:433,0,730 -chr5 21632594 . G T 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:385,27,0 -chr5 21633228 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.289;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.115;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:413,0,282 -chr5 21634668 . T A 205.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:243,24,0 -chr5 21634995 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.126;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=12.03;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:353,0,593 -chr5 21657523 . A T 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=2.147;DP=37;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:436,0,861 -chr5 21659278 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=1.558;DP=48;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=12.93;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:649,0,936 -chr5 21659341 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.951;DP=59;FS=4.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.497;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,12:59:99:246,0,1800 -chr5 21659447 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=2.480;DP=69;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,25:63:99:875,0,1285 -chr5 21662354 . GT G 431.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.066;DP=20;FS=2.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=21.59;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,17:19:27:469,27,0 -chr5 21667838 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:260,0,306 -chr5 21667850 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:368,0,328 -chr5 21668187 . T C 272.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:301,21,0 -chr5 21668847 . G C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.362;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.815;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:242,0,404 -chr5 21672437 . A C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=2.205;DP=28;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:376,0,555 -chr5 21675753 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.231;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=17.17;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:406,0,595 -chr5 21699684 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=-0.790;DP=38;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:237,0,1103 -chr5 21736334 . CT C 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=-1.268;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:277,0,356 -chr5 21736524 . CT C 664.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-1.183;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.038;QD=19.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:59:702,0,59 -chr5 21737780 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=30.58;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:487,0,194 -chr5 21886672 . A T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.200;DP=74;FS=1.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:237,0,2279 -chr5 21895685 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=13.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=28.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:369,0,217 -chr5 21903948 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=1.670;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.14;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:290,0,172 -chr5 21911040 . T A 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr5 21916127 . A T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=24.98;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:303,0,99 -chr5 21975261 . G A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=-0.500;DP=51;FS=3.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:912,0,852 -chr5 21977867 . T C 788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=-0.552;DP=44;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.608;QD=17.93;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:817,0,776 -chr5 21978185 . C T 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.855;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:783,0,779 -chr5 21978198 . A T 659.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=1.700;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.222;QD=16.92;ReadPosRankSum=-1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:688,0,706 -chr5 22100937 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=17.88;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:350,0,293 -chr5 22201435 . T TA 3002.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.874;ClippingRankSum=-1.345;DP=73;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=32.59;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,58:73:29:3040,0,29 -chr5 22202107 . T TA 929.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.303;DP=85;FS=0.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,45:84:99:972,0,954 -chr5 22202406 . C CT 571.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=-0.345;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:612,0,826 -chr5 22202891 . A C 3672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=1.012;DP=137;FS=2.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=26.81;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,96:131:99:3701,0,764 -chr5 22227480 . G GA 2518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=-0.489;DP=190;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,115:178:99:2622,0,1459 -chr5 22263048 . A AAT 1482.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=-1.687;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=17.24;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,48:77:99:1520,0,890 -chr5 22265463 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=29.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:319,0,130 -chr5 22265467 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:319,0,130 -chr5 22266401 . G A 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr5 22269574 . G GA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=-1.361;DP=25;FS=9.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:83:406,0,83 -chr5 22570485 . T C 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=-1.875;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=29.35;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:34:571,0,34 -chr5 22645522 . GT G 1042.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=1.051;DP=99;FS=0.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,51:91:99:1128,0,798 -chr5 22646443 . G GA 607.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-1.490;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,40:61:99:840,0,350 -chr5 22715542 . G GT 586.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=1.700;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:624,0,1090 -chr5 22955964 . ATT A 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.555;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=24.81;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:86:335,0,86 -chr5 22956479 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=19.06;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:276,0,490 -chr5 23032189 . C A 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr5 23636229 . TCA T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.106;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:259,0,362 -chr5 23796427 . A T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-1.252;DP=45;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:310,0,1342 -chr5 23865250 . C A 2874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.872;DP=336;FS=2.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=8.56;ReadPosRankSum=3.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,106:335:99:2903,0,8610 -chr5 23904801 . G A 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=-0.402;DP=149;FS=3.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.846;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,37:149:99:799,0,4022 -chr5 23941093 . T C 1923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.402;DP=383;FS=7.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,92:381:99:1952,0,11142 -chr5 23948314 . A G 2766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.109;DP=374;FS=9.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,114:373:99:2795,0,9576 -chr5 24201183 . G A 1177.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1206,84,0 -chr5 24201230 . A G 358.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:387,27,0 -chr5 24237617 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.498;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:347,0,474 -chr5 24238606 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:252,0,454 -chr5 24238712 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.674;DP=15;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.653;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:384,0,164 -chr5 24239661 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.039;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,395 -chr5 24246163 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:229,0,63 -chr5 24257677 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.644;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:298,0,373 -chr5 24265432 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.725;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,376 -chr5 24272697 . A G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.788;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:302,0,286 -chr5 24272718 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.604;QD=16.70;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:379,0,276 -chr5 24284905 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-1.273;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=18.14;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:391,0,277 -chr5 24334441 . T C 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=3.081;DP=134;FS=9.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,34:134:99:819,0,3545 -chr5 24339120 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=-2.263;DP=178;FS=4.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.913;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:147,31:178:99:469,0,5629 -chr5 24343774 . G A 2897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.860;DP=246;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,87:245:99:2926,0,5427 -chr5 24348157 . G A 3493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=-0.100;DP=267;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=13.09;ReadPosRankSum=-0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,103:267:99:3522,0,12249 -chr5 24348158 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.066;DP=267;FS=3.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.325;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,42:267:99:358,0,18085 -chr5 24377127 . AC A 1896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=1.542;DP=231;FS=7.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=8.21;ReadPosRankSum=2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,72:231:99:1934,0,11059 -chr5 24377129 . A G 1906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.825;DP=236;FS=6.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=8.08;ReadPosRankSum=2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,72:236:99:1935,0,11059 -chr5 24377258 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=3.003;DP=343;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,54:342:99:439,0,13081 -chr5 24382209 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=1.409;DP=334;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:281,52:333:99:464,0,10157 -chr5 24384114 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-2.311;DP=449;FS=1.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,66:448:99:478,0,14304 -chr5 24389429 . A T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.909;DP=62;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:384,0,1801 -chr5 24389740 . G C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=1.643;DP=110;FS=11.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,21:110:99:344,0,5150 -chr5 24393913 . G T 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.998;DP=103;FS=3.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:506,0,2967 -chr5 24402999 . T G 988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=4.319;DP=79;FS=0.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=12.52;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,32:79:99:1017,0,1651 -chr5 24467059 . G GT 880.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-2.858;DP=248;FS=3.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.253;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,67:223:99:918,0,8109 -chr5 24467277 . T C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=2.595;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=9.33;ReadPosRankSum=-3.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:588,0,3507 -chr5 24617468 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.53;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:276,0,60 -chr5 24620153 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:266,0,913 -chr5 24620286 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=2.293;DP=17;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=19.10;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:353,0,227 -chr5 24620297 . G A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=1.030;DP=21;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:375,0,287 -chr5 24620449 . G C 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.923;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.715;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:543,0,561 -chr5 24621824 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=1.607;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:285,0,1424 -chr5 24627105 . A G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.457;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=25.37;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,28:40:99:1043,0,317 -chr5 24633210 . T G 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.941;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:630,0,695 -chr5 24633641 . T C 684.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.045;DP=53;FS=3.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.92;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:713,0,1129 -chr5 24633927 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.233;DP=52;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:283,0,1473 -chr5 24633972 . A AT 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.320;DP=38;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:552,0,311 -chr5 24634157 . C CA 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-0.192;DP=57;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:514,0,624 -chr5 24634610 . A G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.404;DP=50;FS=17.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:343,0,2576 -chr5 24634940 . T C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.586;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:376,0,1592 -chr5 24635091 . C G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.012;DP=76;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.288;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:481,0,2279 -chr5 24635243 . T A 769.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-1.489;DP=71;FS=6.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:798,0,1691 -chr5 24635496 . GA G 714.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=-2.121;DP=111;FS=3.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=6.44;ReadPosRankSum=2.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,33:107:99:752,0,2457 -chr5 24644237 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=-0.550;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:587,0,1876 -chr5 24754869 . T C 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=3.100;DP=461;FS=3.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.373;QD=3.51;ReadPosRankSum=2.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:374,85:459:99:1645,0,28164 -chr5 24754878 . C T 1599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=2.918;DP=452;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=3.54;ReadPosRankSum=4.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:341,86:427:99:1628,0,28164 -chr5 24763578 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-2.708;DP=42;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:478,0,1004 -chr5 24767876 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=-1.344;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,725 -chr5 24777775 . A G 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.200;DP=44;FS=11.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,22:44:99:774,0,793 -chr5 24778014 . A T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.673;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:467,0,822 -chr5 24778222 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-1.783;DP=45;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:245,0,1290 -chr5 24785776 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=1.612;DP=50;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:509,0,2633 -chr5 24785782 . A C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=1.358;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:503,0,2633 -chr5 24785853 . T G 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-2.839;DP=66;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=7.18;ReadPosRankSum=1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:502,0,1648 -chr5 24785918 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.627;DP=33;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:242,0,920 -chr5 24794847 . C G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.041;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=16.67;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:345,0,291 -chr5 24795220 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.478;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:462,0,471 -chr5 24796237 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=1.151;DP=32;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=13.56;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:462,0,669 -chr5 24809483 . A G 3132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.857;DP=367;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.209;QD=8.54;ReadPosRankSum=1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,116:347:99:3161,0,9027 -chr5 24815715 . T A 3544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-1.520;DP=291;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,105:289:99:3573,0,6387 -chr5 24816062 . T C 2557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=-2.321;DP=302;FS=3.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,85:302:99:2586,0,8227 -chr5 24927416 . A G 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=-0.149;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=9.20;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:571,0,1483 -chr5 24931505 . G A 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=-0.791;DP=43;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=15.58;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:698,0,753 -chr5 25039759 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-1.890;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:261,0,342 -chr5 25145904 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=-0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.57;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:327,0,297 -chr5 25157713 . C CA 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.516;DP=35;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=6.14;ReadPosRankSum=-1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:99:252,0,488 -chr5 25167363 . G T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=2.214;DP=55;FS=8.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:431,0,1473 -chr5 25173327 . A G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.683;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,17:58:99:445,0,1626 -chr5 25178271 . T C 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-1.385;DP=49;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=12.00;ReadPosRankSum=1.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,19:49:99:616,0,1008 -chr5 25188265 . TA T 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.239;DP=48;FS=6.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:515,0,454 -chr5 25192229 . TCTGAGAGCAGAAGTGTATCATTGGCAGGTTCTGTTTGATGTAACCCAGCACCAGATGACTCTGACGTAAGATGATTCAGAGTCTACTCAC T 1034.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-1.583;DP=23;FS=4.586;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=24.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:99:1072,113,0 -chr5 25245338 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-1.634;DP=113;FS=10.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,26:113:99:379,0,5158 -chr5 25254702 . G GA 1940.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-3.413;DP=252;FS=3.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.432;QD=7.70;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,102:225:99:2058,0,2481 -chr5 25254945 . C T 1986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=1.043;DP=269;FS=6.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,77:259:99:2015,0,6784 -chr5 25256113 . C A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.951;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=21.29;ReadPosRankSum=-0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:454,0,237 -chr5 25264912 . C T 1983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=-1.279;DP=251;FS=3.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=7.90;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,78:250:99:2012,0,6229 -chr5 25269577 . C T 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=-0.444;DP=54;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.568;QD=12.94;ReadPosRankSum=1.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:727,0,1146 -chr5 25271037 . A G 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.813;DP=64;FS=5.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.126;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:883,0,1233 -chr5 25272810 . G A 994.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.280;DP=79;FS=7.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.59;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,29:79:99:1023,0,1798 -chr5 25283277 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=-0.205;DP=71;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=7.87;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:587,0,1895 -chr5 25303738 . C T 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=1.077;DP=73;FS=4.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=14.71;ReadPosRankSum=-1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,31:73:99:1102,0,1503 -chr5 25321744 . T C 757.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.906;DP=42;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=18.04;ReadPosRankSum=1.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:786,0,744 -chr5 25325975 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.210;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:326,0,995 -chr5 25346774 . C T 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=-0.177;DP=77;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:552,0,2028 -chr5 25346801 . A T 1040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.780;DP=90;FS=2.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=11.56;ReadPosRankSum=-1.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,32:90:99:1069,0,2127 -chr5 25517644 . TTG T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.950;DP=21;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:261,0,379 -chr5 25679730 . C CT 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.620;DP=112;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:308,0,1795 -chr5 25725333 . C G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=1.844;DP=32;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=6.81;ReadPosRankSum=-1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:246,0,792 -chr5 25728821 . G GA 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=-0.055;DP=311;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,56:276:99:507,0,6052 -chr5 25798057 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.549;DP=216;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.819;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,50:215:99:924,0,6476 -chr5 25799641 . T C 1625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.623;ClippingRankSum=-0.346;DP=191;FS=0.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=8.51;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,54:189:99:1654,0,4615 -chr5 25799650 . C T 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=-0.174;DP=204;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:1300,0,10586 -chr5 25800255 . A C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.434;DP=217;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.081;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,38:217:99:466,0,6680 -chr5 25801550 . T C 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.504;DP=114;FS=5.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:626,0,3396 -chr5 25803267 . AT A 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-0.285;DP=235;FS=4.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,33:228:99:279,0,8681 -chr5 25803270 . TCAGGTGACTGAATTCTTCAGTTGTAGATTTCAGGAGATTTGGAATTAGAGAGTGCTTGTATAAGTTGATGGCATGTCTTGTTTTATTTGATTATATGAATACTTTTGTATA T 6718.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=1.047;DP=238;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=28.23;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,193:228:99:6756,0,1573 -chr5 25803271 . CAGGTGACTGAATTCTTCAGTTGTAGATTTCAGGAGATTTGGAATTAGAGAGTGCTTGTATAAGTTGATGGCATGTCTTGTTTTATTTGATTATATGAATACTTTTGTATA C 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-0.636;DP=238;FS=4.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,33:228:99:270,0,8681 -chr5 25804221 . GT G 476.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=-0.990;DP=180;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.425;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,43:177:99:514,0,4023 -chr5 25804296 . G T 2017.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-2.627;DP=222;FS=10.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,73:221:99:2046,0,5720 -chr5 25822376 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=1.016;DP=196;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,30:196:99:341,0,6537 -chr5 25831126 . T G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=16.90;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:400,0,395 -chr5 25869527 . G A 1957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=1.345;DP=327;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,88:325:99:1986,0,9048 -chr5 25870123 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.743;DP=291;FS=4.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,39:291:99:247,0,21391 -chr5 25870129 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=-2.247;DP=287;FS=4.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,41:287:99:247,0,21391 -chr5 25907225 . A G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr5 25909426 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.443;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,18:104:99:241,0,3350 -chr5 25909903 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=-0.498;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,21:119:99:294,0,3862 -chr5 25928524 . AC A 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=-1.072;DP=259;FS=0.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=0.88;ReadPosRankSum=-1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,41:248:99:266,0,7224 -chr5 25999775 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.547;DP=132;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.649;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,21:132:99:255,0,4309 -chr5 25999867 . C A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=-1.217;DP=104;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:315,0,3271 -chr5 26000659 . G C 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=1.373;DP=154;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,27:154:99:373,0,4813 -chr5 26002070 . C T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.737;DP=127;FS=1.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.112;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,25:127:99:422,0,3861 -chr5 26180883 . G GA 1238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-1.411;DP=305;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,81:285:99:1276,0,5614 -chr5 26181141 . A G 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=-0.181;DP=307;FS=0.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,49:306:99:520,0,9462 -chr5 26181393 . G A 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.129;DP=470;FS=0.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:396,73:469:99:701,0,15608 -chr5 26182128 . G A 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.248;DP=550;FS=4.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:447,103:550:99:1588,0,17072 -chr5 26199598 . A T 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.637;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:486,0,2320 -chr5 26215301 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=-1.381;DP=59;FS=4.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:293,0,1755 -chr5 26235961 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-1.228;DP=56;FS=2.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:266,0,1745 -chr5 26265156 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.527;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.858;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:332,0,493 -chr5 26286461 . C T 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=-0.731;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.420;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,39:88:99:1307,0,1648 -chr5 26286489 . TG T 1833.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=-1.541;DP=108;FS=0.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.943;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,62:88:99:1871,0,484 -chr5 26287036 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=-0.922;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:445,0,278 -chr5 26287057 . A C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.182;DP=21;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=19.85;ReadPosRankSum=-1.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:445,0,278 -chr5 26287197 . GT G 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=2.663;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.060;QD=17.10;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:328,0,150 -chr5 26543315 . ACTAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATTTAGATTTATGCATATTTACCAGCCAAAACAATTCATCTAGTACGATGGATCTCTCAC A 14624.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=-1.053;DP=381;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=27.28;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,364:376:99:14662,737,0 -chr5 26543719 . TCCTTTTTTTTGAAATGTAAAGTACAGATGATAAATTCAAGTAGCAGAATAAAAAATCCAAAGTTATGGCAATATAATAAAAGCAGCAAACAAA T 16665.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=2.555;DP=397;FS=11.606;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.355;QD=27.34;ReadPosRankSum=-2.163 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,375:396:99:16703,1336,0 -chr5 26550951 . T G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-1.027;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:255,0,233 -chr5 26564463 . G A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:255,0,222 -chr5 26565772 . C T 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-0.253;DP=99;FS=0.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,26:98:99:645,0,2726 -chr5 26681391 . T A 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=-0.655;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:308,0,1485 -chr5 26681510 . T C 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.158;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,37:72:99:1134,0,1255 -chr5 26718507 . GCCTAAAATATGGAGACTAGATGTTAAAATTAGTCACAAAGAATAAGCGATGGGAAGATATTGAGATCTGAAGTAA G 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=3.329;DP=66;FS=2.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=24.91;ReadPosRankSum=-5.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,47:64:99:1681,0,4906 -chr5 26726783 . A T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.051;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:268,0,1030 -chr5 26727203 . G A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.650;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=17.19;ReadPosRankSum=2.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:716,0,638 -chr5 26727771 . T A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.168;DP=32;FS=3.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:249,0,895 -chr5 26728304 . T C 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.360;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:650,0,1384 -chr5 26745231 . G A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,289 -chr5 26746488 . T C 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.080;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:333,0,2095 -chr5 26750055 . GCTGGAAAACCACAACACTGAACATCACATACAGAGTCAGTGCAAAGAAAAATGATCAGTGACAGACTCATCATAC G 1805.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.681;DP=61;FS=2.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=29.60;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,43:55:99:1843,0,5644 -chr5 26752901 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=1.242;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:256,0,1131 -chr5 26753047 . C G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=32;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.012;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:242,0,969 -chr5 26753207 . TC T 223.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.171;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=10.17;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:261,0,458 -chr5 26754286 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.283;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:414,0,2059 -chr5 26784145 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=1.202;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=23.27;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:354,0,132 -chr5 27222891 . T C 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.375;DP=589;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:503,85:588:99:648,0,19685 -chr5 27251759 . A T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=-1.276;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=17.20;ReadPosRankSum=2.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,240 -chr5 27300984 . G T 368.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-1.448;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:396,0,7 -chr5 27331677 . T A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=1.222;DP=201;FS=13.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.303;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,38:201:99:612,0,6236 -chr5 27331869 . G C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-0.773;DP=227;FS=0.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,44:225:99:729,0,7017 -chr5 27338008 . T C 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-2.297;DP=153;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,32:151:99:472,0,5616 -chr5 27338424 . T A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.684;DP=191;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.539;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,33:191:99:354,0,11893 -chr5 27449408 . G T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=-0.791;DP=83;FS=2.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.006;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:276,0,2607 -chr5 27453210 . C T 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.078;DP=113;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=6.25;ReadPosRankSum=2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,31:112:99:734,0,3217 -chr5 27457186 . C CA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.895;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:441,0,3447 -chr5 27457197 . T A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=-0.837;DP=92;FS=3.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.18;MQ0=0;MQRankSum=1.162;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,30:92:99:908,0,4357 -chr5 27725545 . G C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=-1.488;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:283,0,1086 -chr5 27738354 . C CT 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=-1.334;DP=31;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:285,0,441 -chr5 27773350 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:279,0,209 -chr5 27823537 . TCCTTTATAGAAACAATTTTAAAAGAAATGAGACCATATTTATATATATATGTTTTTAAACAAAAGAATAAGATA T 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=1.369;DP=20;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=27.44;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:99:760,0,549 -chr5 27833751 . T TA 599.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.087;DP=36;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:637,0,311 -chr5 27844201 . A C 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=4.125;DP=55;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:330,0,2410 -chr5 27844223 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-0.472;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:480,0,917 -chr5 27847246 . T C 2582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.351;DP=130;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,77:130:99:2611,0,1851 -chr5 27855642 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=-0.323;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:292,0,591 -chr5 27858440 . CTG C 1266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=-0.995;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=16.89;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,34:75:99:1304,0,1507 -chr5 27865009 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.087;DP=25;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:251,0,698 -chr5 27865048 . G T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.554;DP=29;FS=3.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=20.27;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:616,0,454 -chr5 27868967 . CAGGTTGATGCATTTCTTTTATGTTTGCATATTTTGGAGATGTTATCAGTATAATCACACTGGTTTCCTCTCATA C 3285.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=2.270;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,80:82:99:3323,290,0 -chr5 27870833 . GAGGTTAGTAGTCCCACTTTTATGCAGGAACACAGTTTATCATTAGTGTTTTTTCTGACTGTGTTTGGCCCAAT G 3054.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.250;DP=78;FS=2.398;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=29.16;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:3092,260,0 -chr5 27907732 . ATT A 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:242,0,193 -chr5 27908073 . C T 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=-0.510;DP=49;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=17.61;ReadPosRankSum=0.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:49:99:891,0,905 -chr5 27909537 . CA C 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=-1.096;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:338,0,1322 -chr5 27909851 . GA G 404.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-0.522;DP=19;FS=8.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=21.30;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:6:441,0,6 -chr5 27933776 . G A 1731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.117;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=15.60;ReadPosRankSum=2.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,50:110:99:1760,0,1913 -chr5 28013898 . T G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.012;DP=104;FS=3.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,22:103:99:404,0,3084 -chr5 28110625 . CCT C 1064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=-0.625;DP=60;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.625;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,34:52:99:1102,0,542 -chr5 28331953 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=2.251;DP=45;FS=12.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.516;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,15:45:99:421,0,1118 -chr5 28341969 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-0.184;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:279,0,2553 -chr5 28365756 . A T 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.098;DP=50;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:657,0,948 -chr5 28365852 . G T 1070.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-1.533;DP=62;FS=5.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=17.27;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:1099,0,924 -chr5 28380766 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.055;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:706,0,420 -chr5 28380808 . T C 1214.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1243,87,0 -chr5 28394999 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=-0.088;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:485,0,404 -chr5 28396263 . A T 1246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=-0.339;DP=31;FS=10.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.603;QD=31.42;ReadPosRankSum=-1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:1275,0,150 -chr5 28397146 . T TA 332.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=-0.231;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:96:370,0,96 -chr5 28399482 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.118;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:240,0,793 -chr5 28400887 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-1.595;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:255,0,1349 -chr5 28409353 . G T 229.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:258,0,17 -chr5 28428386 . T A 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=-0.588;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=26.58;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:427,0,129 -chr5 28431759 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=1.693;DP=19;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:388,0,285 -chr5 28432147 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.011;QD=14.05;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:253,0,333 -chr5 28437987 . TCTATGTTTAAATGGACAGACAAATAAAATGAAAGGGATCATCTATAAGGTAATGGTGCTTAATTAGACTTCCTAATAGCACAAAACACTTAATGCTTAC T 931.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=1.876;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:99:969,0,153 -chr5 28440305 . A G 873.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.159;DP=77;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,26:76:99:902,0,1799 -chr5 28443381 . G GT 704.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.169;DP=122;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=5.78;ReadPosRankSum=5.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,58:108:99:742,0,1466 -chr5 28446774 . A G 1711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=-0.581;DP=131;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=13.07;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,50:130:99:1740,0,3319 -chr5 28447454 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:252,18,0 -chr5 28447497 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=1.253;DP=46;FS=3.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:384,0,1232 -chr5 28461283 . T A 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.310;DP=74;FS=0.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,34:72:99:1149,0,1208 -chr5 28461391 . G A 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.382;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,31:55:99:904,0,1655 -chr5 28472939 . C A 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=1.885;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,33:66:99:1182,0,1205 -chr5 28473517 . TA T 599.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:61:637,61,0 -chr5 28473868 . AG A 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.475;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:417,0,315 -chr5 28477009 . C G 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.658;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=24.51;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:494,0,186 -chr5 28510684 . TGGTAGCTCAAACCTGTTCTGGTTTGAGCTACCA T 781.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=2.812;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:819,0,4856 -chr5 28510721 . T G 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=3.408;DP=33;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:819,0,4856 -chr5 28511027 . A AT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=-1.092;DP=67;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:279,0,1280 -chr5 28534005 . C CT 280.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:318,30,0 -chr5 28571990 . T TTA 726.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:764,51,0 -chr5 29125605 . C T 4568.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4597,325,0 -chr5 29183443 . A AT 2287.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.26;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2325,227,0 -chr5 29511251 . GA G 571.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=1.569;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.40;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=27.23;ReadPosRankSum=-1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:63:609,63,0 -chr5 29511462 . A AT 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-0.693;DP=81;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:409,0,1509 -chr5 29569298 . G GT 403.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.602;DP=38;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:441,0,246 -chr5 29642932 . GT G,GTT 1059.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=1.893;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=17.65;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:3,26,22:51:99:1129,476,806,695,0,894 -chr5 29643500 . T C 1092.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-2.333;DP=70;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,36:70:99:1121,0,1255 -chr5 29643677 . G T 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=13.90;ReadPosRankSum=1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:612,0,897 -chr5 29645082 . G T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.202;DP=65;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:376,0,1744 -chr5 29681100 . G C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.250;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:327,0,519 -chr5 29778195 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.222;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.43;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,547 -chr5 29904242 . A C 1342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=1.968;DP=50;FS=2.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.686;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,37:50:99:1371,0,328 -chr5 29904796 . C A 4349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=-0.121;DP=222;FS=7.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.965;QD=19.59;ReadPosRankSum=-2.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,130:221:99:4378,0,3193 -chr5 29908599 . A T 6155.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.813;DP=200;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=30.78;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,156:173:99:6184,134,0 -chr5 29908667 . T A 2457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-2.249;DP=146;FS=9.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=16.83;ReadPosRankSum=3.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,89:144:99:2486,0,1827 -chr5 29908794 . A G 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.320;DP=118;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,42:114:99:1441,0,3055 -chr5 29922861 . G A 2118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.741;DP=120;FS=0.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.134;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,59:119:99:2147,0,2251 -chr5 29936659 . C A 439.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:38:468,38,0 -chr5 29951151 . AT A 1456.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=-2.163;DP=74;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.680;QD=19.69;ReadPosRankSum=2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,54:71:99:1494,0,228 -chr5 29951819 . G A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=2.557;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=4.09;ReadPosRankSum=-3.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:253,0,2176 -chr5 30135941 . T G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=24.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:90:275,0,90 -chr5 30151043 . T TC 322.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:360,24,0 -chr5 30199269 . C CT 973.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=-2.097;DP=230;FS=0.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,67:199:99:1011,0,3390 -chr5 30199414 . C T 1472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-0.240;DP=288;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,71:287:99:1501,0,8277 -chr5 30215703 . G A 237.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:266,0,20 -chr5 30393513 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=-1.121;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:265,0,1061 -chr5 30397373 . T C 509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:538,39,0 -chr5 30397508 . C T 633.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.745;DP=39;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.745;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:662,0,649 -chr5 30412250 . G C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=1.397;DP=38;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:365,0,1956 -chr5 30412255 . A G 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.977;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:354,0,1956 -chr5 30555604 . A ATT 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=24.64;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:41:333,0,41 -chr5 30556604 . G A 288.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:317,24,0 -chr5 30587172 . A G 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=-1.391;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:938,0,3075 -chr5 30587178 . C T 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=-0.087;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=14.00;ReadPosRankSum=-0.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,26:65:99:938,0,3095 -chr5 30589499 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.298;DP=58;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:514,0,1435 -chr5 30607409 . C T 1118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.224;DP=54;FS=2.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=20.72;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,33:54:99:1147,0,739 -chr5 30607584 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-2.096;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=13.89;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:320,0,403 -chr5 30607630 . T G 423.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:452,33,0 -chr5 30607648 . A C 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 -chr5 30798533 . AG A 473.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=-1.766;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=15.28;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:511,0,466 -chr5 30841946 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.694;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=17.20;ReadPosRankSum=2.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:355,0,315 -chr5 30847002 . C CCATATTGT 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=2.166;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:252,0,222 -chr5 30932513 . CT C 427.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.199;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=18.59;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:3:463,0,3 -chr5 30933264 . C CTT 252.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=25.29;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:5:289,0,5 -chr5 30935174 . G T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.594;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.783;QD=30.45;ReadPosRankSum=-1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:40:485,0,40 -chr5 30943795 . TCCTAATACACACACAAACACCATAAAGAGTTAAATACACAAGATCACACAAGAAAAACACTGAGAGTTTAATTACAGCA T 724.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=4.523;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:65:762,65,0 -chr5 30986813 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=24.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:248,0,60 -chr5 31141412 . T A 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.603;DP=44;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,27:44:99:907,0,598 -chr5 31149011 . GCTGCAGAGGGATACAGCACAAACAAAGGGACGGGCCCGTTTTTTCATCTAAACAATATCATTTAATTATGCTTAGCTTTTTAACTAAAAATCCCAC G 1108.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=1.617;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=33.12;ReadPosRankSum=-1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:99:1146,0,927 -chr5 31153132 . A C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-0.577;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:347,0,618 -chr5 31158093 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-1.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=29.34;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:93:439,0,93 -chr5 31202384 . AACCTGCAAACCAACACAATGTGTCGACGTTACTGACAGGATATGTCTTAAAACTGCATAGTGGTCTTTCTGAGTGTCTT A 695.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=3.297;DP=39;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.641;QD=17.84;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:733,0,5210 -chr5 31252709 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-1.154;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:231,0,239 -chr5 31256024 . A C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.35;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:67:240,0,67 -chr5 31306027 . A AT 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.594;DP=46;FS=14.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:401,0,343 -chr5 31383757 . CA C 283.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-2.277;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:321,0,1115 -chr5 31436848 . T C 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;ClippingRankSum=-0.137;DP=37;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=17.43;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:673,0,566 -chr5 31437215 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-0.635;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:609,0,178 -chr5 31437395 . T C 708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-0.993;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:737,0,285 -chr5 31437443 . G A 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.370;DP=31;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=25.48;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:818,0,248 -chr5 31461646 . G T 1212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=1.522;DP=98;FS=8.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,36:98:99:1241,0,2140 -chr5 31463796 . G A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.674;DP=106;FS=6.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,20:106:99:333,0,3488 -chr5 31486021 . G A 1748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.264;DP=282;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,76:281:99:1777,0,7878 -chr5 31487137 . A AT 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.723;DP=97;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:369,0,2195 -chr5 31839591 . T C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.116;DP=51;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:341,0,1373 -chr5 31842428 . C A 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=1.057;DP=44;FS=8.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=16.84;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:769,0,778 -chr5 31848201 . GA G 281.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.328;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:319,0,110 -chr5 31849764 . C T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=-1.026;DP=29;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:527,0,690 -chr5 32064441 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=1.285;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:321,0,2053 -chr5 32097964 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=-0.779;DP=45;FS=5.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:263,0,1243 -chr5 32147022 . G GT 911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=-0.617;DP=228;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,61:206:99:949,0,3959 -chr5 32254684 . C T 1434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-0.945;DP=682;FS=6.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:567,113:680:99:1463,0,22929 -chr5 32382966 . A T 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.461;DP=123;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,28:123:99:593,0,3671 -chr5 32568242 . A G 917.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:946,66,0 -chr5 32568263 . G A 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:581,48,0 -chr5 32568977 . A G 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=1.435;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=21.23;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:665,0,449 -chr5 32569180 . C G,A 3562.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.612;DP=239;FS=4.010;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=14.90;ReadPosRankSum=-0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:21,124,31:176:99:4179,1022,4299,2625,0,3133 -chr5 32569267 . G A 1602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.745;DP=106;FS=4.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.573;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,47:72:99:1631,0,822 -chr5 32630574 . G A 655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.346;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,32:136:99:684,0,4075 -chr5 32633052 . C A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=-1.311;DP=130;FS=0.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,34:130:99:717,0,3606 -chr5 32633748 . GT G 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.903;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,32:154:99:346,0,3029 -chr5 32633906 . ATG A 217.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.884;DP=109;FS=2.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:257,0,1073 -chr5 32660401 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.655;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,26:133:99:378,0,4053 -chr5 32742250 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.631;DP=31;FS=1.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,826 -chr5 32904635 . G T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-0.842;DP=34;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=12.23;ReadPosRankSum=1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:444,0,1395 -chr5 32905418 . T TG 434.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.784;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=22.88;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:472,0,676 -chr5 32906190 . AT A 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.251;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:310,0,472 -chr5 33282653 . G GA 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.415;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.318;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:274,0,245 -chr5 33358572 . G GTT 280.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=28.08;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:16:318,0,16 -chr5 33410172 . GT G 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.374;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=13.48;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:482,0,219 -chr5 33449576 . G A 670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=-0.592;DP=47;FS=2.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,20:47:99:699,0,922 -chr5 33468195 . G A 1421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=-0.813;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.340;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,40:51:99:1450,0,215 -chr5 33468454 . GCTGCCATTAACAGCGATAGAGAGTCAGACTGAATTTAATTTGCTTACTTCATTGAGAAGGATGAGCTGTTAC G 296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=3.025;DP=95;FS=1.808;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.304;QD=3.12;ReadPosRankSum=-3.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,79:84:99:334,143,0 -chr5 33479292 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.200;DP=33;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.532;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:99:657,0,562 -chr5 33521257 . G GT 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.136;DP=278;FS=11.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,52:247:99:438,0,5362 -chr5 33521882 . C CT 2769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-1.250;DP=185;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,114:175:99:2807,0,1558 -chr5 33525372 . A T 5992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-1.223;DP=249;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=24.07;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,172:247:99:6021,0,1756 -chr5 33632442 . CT C 669.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-0.690;DP=116;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,56:97:99:878,0,610 -chr5 33698813 . T A 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=-0.993;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=24.94;ReadPosRankSum=1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,52:73:99:1849,0,572 -chr5 33772848 . A G 273.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:302,24,0 -chr5 33772862 . G A 249.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=16;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=15.61;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:278,0,21 -chr5 33846779 . T C 26248.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=-0.289;DP=646;FS=11.723;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=30.31;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,625:641:99:26277,1831,0 -chr5 33847314 . T C 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.173;ClippingRankSum=8.844;DP=361;FS=62.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=2.57;ReadPosRankSum=-5.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,126:296:99:957,0,10358 -chr5 33849434 . AAGGTTCATATTTTAATCCACAGTTTTAAGAGATTCAGTGATCAGTGTAGTTTAGATTAGACATCAATTTATTTTCCTTTTCTCTATTTACATGAATTC A 14882.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.733;DP=457;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.040;QD=32.57;ReadPosRankSum=1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,401:403:99:14920,1188,0 -chr5 33849633 . C T 3595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.687;DP=139;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=25.87;ReadPosRankSum=-4.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,100:139:99:3624,0,1057 -chr5 33851330 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.945;DP=20;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:355,0,483 -chr5 33854767 . TGTGAGTTCCTCTTTTGAGAACTTAGACACCTGTGAACTTTCAAGATGTTCTTTTACTGATACAGTTGTATGTGACTTTGCAG T 17808.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=389;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,387:388:99:17846,1217,0 -chr5 33862089 . T C 2805.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=1.280;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.364;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2834,227,0 -chr5 33865515 . G T 2367.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:99:2396,178,0 -chr5 33865524 . T C 2372.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2401,178,0 -chr5 33865750 . C T 4677.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:110:99:4706,331,0 -chr5 33866805 . T C 354.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=32.27;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:383,0,13 -chr5 33869359 . C T 347.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=1.423;DP=11;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=31.63;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:13:376,0,13 -chr5 33869365 . A G 1124.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1153,87,0 -chr5 33870740 . G A 9176.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=7.126;DP=263;FS=17.101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=34.89;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,237:262:99:9205,271,0 -chr5 33870752 . A G 5763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=5.925;DP=186;FS=32.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=30.99;ReadPosRankSum=-5.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,160:186:99:5792,0,118 -chr5 33887112 . A T 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 -chr5 33903699 . C T 10723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=-11.458;DP=571;FS=30.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=18.78;ReadPosRankSum=6.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,316:570:99:10752,0,9427 -chr5 33907311 . A T 2448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=6.421;DP=318;FS=139.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.602;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,95:314:99:2477,0,8358 -chr5 33908283 . A T 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.262;ClippingRankSum=12.049;DP=649;FS=1.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.308;QD=0.72;ReadPosRankSum=-11.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:559,85:644:99:498,0,45197 -chr5 33908286 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.715;ClippingRankSum=12.158;DP=627;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=0.72;ReadPosRankSum=-12.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:545,77:622:99:481,0,45197 -chr5 33908966 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=1.335;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,28:184:99:299,0,6310 -chr5 33910022 . C T 4422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=2.086;DP=568;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:395,169:564:99:4451,0,15407 -chr5 33910386 . C A 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=-8.117;DP=241;FS=5.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=3.81;ReadPosRankSum=-3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,56:240:99:947,0,7093 -chr5 33920343 . A G 9923.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.331;DP=291;FS=6.554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=34.10;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,257:291:24:9952,24,0 -chr5 33920355 . C A 3956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=-3.542;DP=274;FS=49.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.474;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,111:273:99:3985,0,5449 -chr5 33921552 . TCTGTAGAAAGAAAAAATATTATCTGTATCATATCATAAAGACGGTTATTCATCAGGTTTTATTATTTTTTGATTCTTAC T 13665.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=1.707;DP=345;FS=1.552;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=30.44;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,331:339:99:13703,973,0 -chr5 33925185 . A T 3725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-5.447;DP=178;FS=199.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=20.93;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,110:178:99:3754,0,2426 -chr5 33937142 . G A 3668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=-4.182;DP=246;FS=20.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,107:246:99:3697,0,4797 -chr5 33937242 . GCCTTTTACATGAACACAAATCTCCATTAGACTCTTTTTTTTTAATACACTTTGAAACTGTTGTTCTGTTGCTCA G 6622.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=2.057;DP=172;FS=8.325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=29.89;ReadPosRankSum=-0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,162:170:99:6660,475,0 -chr5 33937640 . C T 2096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.419;ClippingRankSum=7.648;DP=136;FS=8.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=15.42;ReadPosRankSum=-7.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,61:136:99:2125,0,5058 -chr5 33937646 . C T 2058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.747;ClippingRankSum=6.404;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=23.13;ReadPosRankSum=-6.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:2087,0,5131 -chr5 33938882 . C T 4446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-3.192;DP=199;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=22.35;ReadPosRankSum=2.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,126:197:99:4475,0,2477 -chr5 33939807 . GCCTGTAAAAATGAAGTCATTTGATTGTTATAAATTTGAACCAAATTAAAAAAATACTTAATTTACAATTCTTCAACAATTCTCAAA G 14081.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=332;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,318:318:99:14119,1123,0 -chr5 33942309 . TCTGTGGAAAATTCGACAGTGGTTTATAACCTTTAATTAACAGACTCTTACAGTAAATTACATTTTTATGAAGTCACATTTAC T 15274.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=342;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,342:342:99:15312,1188,0 -chr5 34102608 . TCTGAAATAAGAATCATTGCCTGATTATAACCTGAACAAATGCATTAATTGTACTGATGGATAATATGCAGAAAACCACTTGC T 3075.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-0.066;DP=72;FS=4.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=31.80;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,67:72:99:3113,270,0 -chr5 34117674 . CT C 321.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.78;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:360,36,0 -chr5 34637358 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-1.654;DP=242;FS=5.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,38:242:99:382,0,8802 -chr5 34887410 . GCTGAAAAAAGGAAAGTTCTGCTCATTTAAAAGTCCACAAAACTGTCATTGGAGTTACTTGCAGAGTTCTGCTTTTAC G 2423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.141;DP=72;FS=2.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=33.66;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,58:71:99:2461,0,3094 -chr5 34904304 . G C 1041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=-0.423;DP=379;FS=23.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:310,69:379:99:1070,0,11721 -chr5 34904716 . C CA 585.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=3.567;DP=24;FS=14.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=3.567;QD=24.41;ReadPosRankSum=-3.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:623,0,612 -chr5 34915225 . TCCTGCGTGAAATGAGATGCATGATGGGAGAGGCTTTAAACATAGTGACAAAACCAGCAATGCAGAGAGTATGTGATGTAGAAGCATGCACTTA T 6498.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=1.755;DP=172;FS=2.121;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=35.77;ReadPosRankSum=0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,161:164:99:6536,475,0 -chr5 34966028 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.116;DP=28;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=15.06;ReadPosRankSum=2.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:450,0,604 -chr5 34966065 . A T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.383;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,11:31:99:383,0,678 -chr5 34999731 . GCTGAAAAGATGGTAGAAACACAAAGTCAGAGATATATCTTAAGCAAAAAACATCCCCTCTCATTTTCCTTTTGCCTCTTAC G 682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-0.199;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:99:720,0,958 -chr5 35152363 . GA G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.238;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=11.04;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:258,0,772 -chr5 36147384 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.412;DP=103;FS=0.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,19:103:99:258,0,3096 -chr5 36160379 . AG A 2022.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2060,203,0 -chr5 36167396 . C T 4696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.528;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.616;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,126:160:99:4725,0,621 -chr5 36191911 . GA G 1392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.023;DP=125;FS=8.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.946;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,82:102:99:1606,0,252 -chr5 36193216 . G GT 251.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-1.917;DP=89;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.483;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,23:84:99:289,0,1462 -chr5 36204790 . TGTGAGTACACCATCCTTTAAACTTCATAGTAAGATTGTGTTTTTTTTATTGCCATTTAAAAATGCATGTACATTTGTCTGCACAG T 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=2.261;DP=26;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=34.84;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:99:943,0,233 -chr5 36226939 . G A 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.954;DP=287;FS=2.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,45:287:99:515,0,9578 -chr5 36231973 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=-0.377;DP=209;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.328;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,36:209:99:450,0,6696 -chr5 36480279 . ACTTTACGAAACAAATACAGTTTAAAATTAGAACACACTCTGCTCCTCTCAATTTCTGTGCAACAACATGCATCATCACTACACAC A 1155.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=1.102;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:99:1193,0,483 -chr5 36485708 . TCTGCAGGAGCACAAAAGCACTGTCAGAAAATGATGAAGACCAGCTATGAACAGGATGCAATTGCACAGAATGTTTTTTAATAAGGAACACTGAC T 712.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.468;DP=22;FS=5.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=32.40;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:99:750,0,1220 -chr5 36600588 . AAGGTAAAGCAAATAAATGGAGCCAAATGACCAACTTTTACTGTCATGAGTGTCATTCATATGCCTCGTCTCTGCCTCTTTCTCTTTAC A 3243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=1.095;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.668;QD=34.51;ReadPosRankSum=-1.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,89:94:99:3281,0,144 -chr5 36605606 . C CA 562.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.166;DP=178;FS=13.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.679;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,50:111:99:600,0,1109 -chr5 36742647 . G T 2144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=-0.181;DP=71;FS=6.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,57:71:99:2173,0,256 -chr5 36742752 . C T 2957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=1.006;DP=93;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=31.80;ReadPosRankSum=-1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,75:92:99:2986,0,695 -chr5 36757231 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.371;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:72:429,0,72 -chr5 36822147 . C G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.446;DP=83;FS=7.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,17:83:99:316,0,2522 -chr5 36822823 . TG T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.437;DP=25;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=14.59;ReadPosRankSum=2.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:402,0,182 -chr5 36877655 . T C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.260;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=31.11;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:90:837,0,90 -chr5 36892096 . C G 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.398;DP=37;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=23.45;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:896,0,407 -chr5 36892125 . C T 983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-1.944;DP=37;FS=3.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=26.59;ReadPosRankSum=1.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1012,0,315 -chr5 36898362 . C CA 331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.163;DP=34;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:369,0,434 -chr5 37102955 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=1.045;DP=67;FS=2.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,17:67:99:398,0,1973 -chr5 37143174 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.609;DP=40;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:233,0,1157 -chr5 37144716 . GA G 1570.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.410;DP=55;FS=7.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=28.56;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,39:51:99:1608,0,565 -chr5 37144721 . A T 1579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.899;DP=51;FS=7.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=30.98;ReadPosRankSum=-1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,39:51:99:1608,0,564 -chr5 37157193 . G A 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.226;DP=47;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.844;QD=27.02;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1298,0,327 -chr5 37929362 . GT G 1452.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-0.289;DP=75;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,55:66:33:1490,0,33 -chr5 38085994 . T G 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr5 38136440 . AGTACAGTGCATTCGTGGTGTATCTGTGAGAGTCGGTGCTCTAGCATGGGCACGTTTGCATCAGATGTTTGTTTTCTGAATGTATTGCAG A 633.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=4.044;DP=137;FS=1.320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=4.63;ReadPosRankSum=-4.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,126:135:69:671,69,0 -chr5 38178441 . TCCTGTGAAAGAGAACAATGCACATCAGCTGTTGTGGGTCTCTATTAAAATCGTAGATATGAGGAAATCAAACATGCATGTGCTAA T 4019.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=1.694;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.463;QD=31.35;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:90:99:4057,318,0 -chr5 38205740 . G A 214.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:243,0,24 -chr5 38227315 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.124;DP=125;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,23:125:99:349,0,3870 -chr5 38227327 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.122;DP=111;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:379,0,3537 -chr5 38231055 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=1.030;DP=94;FS=8.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.591;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,20:94:99:362,0,2710 -chr5 38265438 . T G 10004.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=-2.031;DP=309;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=32.38;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,237:309:99:10033,0,1342 -chr5 38497880 . AAGGCAAGTCTTGTTACCGCTTGGCTGTGTTTCAAATGCTTTGCAGTTATGAATTTTATGTAATCTTATTTTTTTC A 6699.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=9.313;DP=304;FS=5.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.216;QD=22.04;ReadPosRankSum=-3.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,253:290:99:6737,0,8310 -chr5 38498966 . C CTT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.072;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,32:83:99:778,0,1597 -chr5 38500396 . C CA 3278.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=-0.450;DP=619;FS=10.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.238;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:416,203:619:99:3316,0,11184 -chr5 38524301 . ACTTTATTGCAAGAGAAGAGAAATATTATTTCGTTGCACAGCTAAAACAGAAGGTTTTGGACGCGCACGAACAGTCTGTCAC A 1466.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=1.494;DP=41;FS=4.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=35.76;ReadPosRankSum=-1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:99:1504,0,697 -chr5 38881566 . GA G 219.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=21.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:257,27,0 -chr5 38917117 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.539;DP=105;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=3.40;ReadPosRankSum=2.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:385,0,2960 -chr5 39254122 . CT C 658.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.859;DP=53;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:99:715,0,228 -chr5 39309451 . AT A 290.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.295;DP=24;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,679 -chr5 39309907 . T TA 704.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.439;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,57:83:99:1122,0,178 -chr5 39310318 . T TGA 4028.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.249;DP=183;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=22.01;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,114:165:99:4066,0,1263 -chr5 39311677 . A G 4178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=-1.386;DP=136;FS=0.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=30.73;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,99:135:99:4207,0,2325 -chr5 39358539 . GT G 754.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=-1.099;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,29:38:99:792,0,184 -chr5 39405500 . TGGTGAGGATAAAAAAAAAAATCAACAATTTATATGTTCATCCATAGTTGATTCTTCTGGTGCCATGACTTTTAATCTTTCTCCAATTTTTGTA T 648.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.351;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:99:686,0,740 -chr5 39405614 . T C 766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=1.312;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:795,0,144 -chr5 39466160 . GA G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=1.674;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:250,0,221 -chr5 39475642 . A T 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=1.613;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=20.67;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:793,0,476 -chr5 39475696 . T C 858.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-1.215;DP=32;FS=6.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=26.84;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:887,0,258 -chr5 39484806 . GCCTGTAAGAAAAGAAGATAACAGTTGGTTAACCAAGGAAGCTTCGATTTTTTATTATAATGTATGTAGAGGAGATGCTGTAGACTGCATGGATGGTAAACTTA G 2814.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=1.919;DP=110;FS=1.538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=25.59;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,94:101:99:2852,225,0 -chr5 39549239 . T TA 674.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-1.107;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.818;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:43:712,43,0 -chr5 39580344 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.303;DP=21;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=13.42;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:310,0,134 -chr5 39591881 . TCTGCAAAAGAAAAACAGAATGACGAAGTAAAGAATAAACAGTAACTCTTTCCCCCCATAATCCTCTAACATTAGGTTTTCACTCAC T 3039.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.234;DP=73;FS=1.484;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.583;QD=33.28;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,66:73:99:3077,279,0 -chr5 39671385 . G T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr5 39815146 . A C 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.112;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=30.99;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:741,0,323 -chr5 39815147 . T A 712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=-0.233;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=29.70;ReadPosRankSum=2.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:741,0,285 -chr5 39855623 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.452;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=19.34;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:357,0,192 -chr5 40025032 . TACCTACAAACAGGATAGTCACATCGTTAAGTATATCACAGCAACAGATTTTTAATGACATGTTCACAAACAC T 983.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.589;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=31.63;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:79:1021,79,0 -chr5 40086684 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=-0.978;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=18.38;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:304,0,129 -chr5 40089644 . C T 860.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:63:889,63,0 -chr5 40089787 . T C 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.218;DP=53;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=10.81;ReadPosRankSum=-1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:601,0,1246 -chr5 40089952 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=-1.604;DP=61;FS=1.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:278,0,2280 -chr5 40090003 . A G 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.198;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,22:34:99:789,0,916 -chr5 40090157 . A ATT 257.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:28:295,0,28 -chr5 40221891 . G T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=1.973;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:491,0,201 -chr5 40275343 . GA G 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=1.055;DP=23;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:272,0,133 -chr5 40297976 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.406;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=19.48;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:262,0,638 -chr5 40298004 . G A 4042.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.579;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:99:4071,295,0 -chr5 40298178 . A C 2640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.228;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.192;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,53:75:99:2669,0,656 -chr5 40298358 . A G 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.382;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:566,0,732 -chr5 40298409 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.645;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=13.77;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:455,0,605 -chr5 40298475 . AG A 896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=-1.752;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=26.37;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:32:934,32,0 -chr5 40298513 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-1.292;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=15.13;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:361,0,394 -chr5 40306103 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.637;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:238,0,313 -chr5 40306231 . C T 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:621,45,0 -chr5 40396608 . C G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.056;DP=57;FS=3.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=16.61;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:975,0,2154 -chr5 40577210 . C T 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.067;DP=65;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=16.30;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,33:64:99:1088,0,1090 -chr5 40602918 . G A 1977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.720;DP=74;FS=3.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,57:74:99:2006,0,834 -chr5 40660613 . A T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=1.871;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:337,0,533 -chr5 40743139 . C CAAAA 2936.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2974,211,0 -chr5 40743693 . T TTA 916.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.382;DP=42;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,27:38:99:954,0,280 -chr5 40744648 . C CT 863.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-1.300;DP=58;FS=15.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=14.89;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,44:51:3:1148,0,3 -chr5 40755594 . CG C 276.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=-0.170;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=9.88;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:314,0,750 -chr5 40992221 . C CT 201.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:239,27,0 -chr5 41114342 . AT A 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=-0.478;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:568,0,228 -chr5 41114347 . T G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.752;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:568,0,228 -chr5 41280756 . AT A 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.482;DP=21;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.886;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:94:313,0,94 -chr5 41313388 . C CAT 2102.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.146;DP=69;FS=2.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=30.47;ReadPosRankSum=-1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,52:69:99:2140,0,467 -chr5 41325574 . G A 1593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.220;DP=130;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,48:130:99:1622,0,2757 -chr5 41342259 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=-0.420;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:382,0,1326 -chr5 41631723 . GT G 415.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=-0.593;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:453,0,451 -chr5 41676514 . T TA 336.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.398;ClippingRankSum=-0.184;DP=27;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=1.502;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:374,0,1056 -chr5 41898273 . AT A 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.598;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:287,0,449 -chr5 42701700 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.943;DP=17;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.578;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,296 -chr5 42723975 . T TA 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=-2.306;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.643;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:339,0,321 -chr5 42725057 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.812;DP=40;FS=5.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:307,0,1074 -chr5 42748958 . TA T 670.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=-0.081;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=20.33;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:84:708,0,84 -chr5 42879290 . C CA 1331.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.705;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.594;QD=28.33;ReadPosRankSum=-1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,33:42:99:1369,0,412 -chr5 42943327 . C T 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=1.573;DP=145;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=13.12;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,57:145:99:1931,0,4115 -chr5 43065541 . A AC 831.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.451;DP=125;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=6.65;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,40:112:99:869,0,2530 -chr5 43066390 . CT C 1498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-1.129;DP=141;FS=1.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=10.63;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,51:138:99:1536,0,2626 -chr5 43067973 . TA T 956.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=2.169;DP=137;FS=2.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,45:132:99:994,0,2097 -chr5 43068800 . C G 691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-1.264;DP=53;FS=8.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=13.05;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:720,0,1163 -chr5 43070800 . G GA 970.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-1.058;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,54:129:99:1093,0,1678 -chr5 43102714 . AGTACGCACTTGTCCAGTCTGCCAAGTATGCTTTTAATCAGGCTTTAGCTTTAACATGAATACTAACTTTTGTCCTACTGTACACATCTTTCCCAAAG A 2485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.023;ClippingRankSum=3.470;DP=97;FS=5.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=25.63;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,68:88:99:2523,0,6942 -chr5 43102845 . CTCAGGTATGTTCTTTAAAAGCAATGCTGGGATTGCATGCGGTATGACTTCACAGCTGTTAACCACTTGTTTTCTTTATGGTCTCT C 1059.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.890;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=9.90;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1097,0,9579 -chr5 43102846 . TCAGGTATGTTCTTTAAAAGCAATGCTGGGATTGCATGCGGTATGACTTCACAGCTGTTAACCACTTGTTTTCTTTATGGTCTCTTCAG T 1255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=4.212;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=11.74;ReadPosRankSum=-3.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,37:92:99:1293,0,9926 -chr5 43113363 . T A 1417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.812;ClippingRankSum=-0.428;DP=108;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,49:107:99:1446,0,1852 -chr5 43122237 . AAGGTACAGTAGGATAATATGAGCTAGGTGTCTCACCGAGTGTTTTTCTAATGCTCTCTTGTTCTTTCCTTTC A 1193.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-0.153;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.766;QD=34.11;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1231,0,2066 -chr5 43133134 . C T 5000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.533;ClippingRankSum=0.221;DP=371;FS=3.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.288;QD=13.48;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,160:368:99:5029,0,6904 -chr5 43139130 . C CA 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=-0.057;DP=311;FS=8.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,57:290:99:417,0,6851 -chr5 43417629 . T TA 2555.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=-0.436;DP=132;FS=1.035;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,102:119:34:2780,34,0 -chr5 43448153 . ACTGCAGAACAAAGGAGAGACAAGAAACTGAACATCACCTGGTGGCTTGTGGGATAGTTTTTGTTGCAAGAGAAAAAATAGTTCTTAC A 4978.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=2.058;DP=126;FS=2.062;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=24.38;ReadPosRankSum=0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,120:124:99:5016,362,0 -chr5 43448781 . G A 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-1.574;DP=28;FS=7.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=25.63;ReadPosRankSum=-0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:746,0,270 -chr5 43449003 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=2.678;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=15.74;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:280,0,616 -chr5 43449011 . T G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,1:9:99:280,0,616 -chr5 43449044 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.945;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.077;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:363,0,409 -chr5 43450218 . C A 799.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.465;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.351;QD=17.77;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:828,0,796 -chr5 43450338 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:81:264,0,81 -chr5 43452181 . C T 1509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=2.137;DP=47;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=32.12;ReadPosRankSum=-0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,39:47:99:1538,0,121 -chr5 43453065 . A T 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=-0.049;DP=99;FS=3.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.616;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:98:99:968,0,2215 -chr5 43454458 . T C 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=1.995;DP=23;FS=1.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=25.25;ReadPosRankSum=-1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:609,0,146 -chr5 43455586 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=3.783;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=18.86;ReadPosRankSum=-3.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:613,0,457 -chr5 43456491 . G T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=2.960;DP=29;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:454,0,522 -chr5 43456671 . T C 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.283;DP=27;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:649,0,368 -chr5 43458462 . A C 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.415;DP=29;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=26.82;ReadPosRankSum=-1.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:806,0,212 -chr5 43460061 . G A 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.952;DP=29;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:571,0,430 -chr5 43460079 . A G 747.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.180;DP=21;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=28.25;ReadPosRankSum=1.498 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:21:18:776,18,0 -chr5 43496939 . CT C 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=1.349;DP=37;FS=3.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:400,0,302 -chr5 43496973 . G GA 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=-1.225;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:312,0,162 -chr5 43685726 . A C 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-2.906;DP=257;FS=52.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,61:257:99:1286,0,7366 -chr5 43685897 . A C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-2.078;DP=310;FS=22.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,29:295:99:307,0,11783 -chr5 43686195 . C T 7420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=-2.848;DP=361;FS=1.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=20.56;ReadPosRankSum=-3.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,140:361:99:7449,0,7028 -chr5 43686227 . A T 2766.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=9.158;DP=358;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,117:354:99:2795,0,17749 -chr5 43686356 . G A 950.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=4.369;DP=195;FS=0.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,20:195:99:979,0,11503 -chr5 43686683 . A T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=3.295;DP=125;FS=44.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=3.57;ReadPosRankSum=-1.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,24:119:99:474,0,3516 -chr5 43710826 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=23.62;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:88:288,0,88 -chr5 43713274 . C T 949.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.638;ClippingRankSum=-7.688;DP=280;FS=9.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=3.39;ReadPosRankSum=-7.857 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,58:278:99:978,0,8319 -chr5 43713454 . A G 1189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-0.325;DP=295;FS=10.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,64:294:99:1218,0,9153 -chr5 43714282 . T C 1271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=8.962;DP=219;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.137;QD=5.81;ReadPosRankSum=-5.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,67:219:99:1300,0,15656 -chr5 43714291 . A G 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=7.933;DP=213;FS=0.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=5.91;ReadPosRankSum=-5.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,48:212:99:1287,0,15656 -chr5 43714366 . A G 1924.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=11.416;DP=202;FS=0.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=9.53;ReadPosRankSum=-7.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,79:200:99:1953,0,9057 -chr5 43714468 . C T 3458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.358;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=30.28;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:99:3487,167,0 -chr5 43741960 . G A 2811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-1.694;DP=253;FS=6.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,93:252:99:2840,0,8647 -chr5 43742114 . GCTGAGAGACAAAAACAGAAGAGCATTGAAACATCGACCATCACATAAAGCCGTGAGTTCAGTTTAAATCTCCTCCGCTTAC G 9852.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=-1.932;DP=229;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.056;QD=25.89;ReadPosRankSum=-3.429 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,217:224:99:9890,741,0 -chr5 43782355 . A G 1072.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=1.655;DP=55;FS=2.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=19.50;ReadPosRankSum=-2.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:1101,0,2479 -chr5 43952234 . T C 642.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:48:671,48,0 -chr5 44151957 . T G 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=-0.152;DP=61;FS=3.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=15.65;ReadPosRankSum=1.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:983,0,1368 -chr5 44151971 . C A 1032.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.664;DP=60;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=17.21;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:1061,0,1322 -chr5 44453642 . TA T 1652.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.019;DP=296;FS=9.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,68:284:99:1690,0,15382 -chr5 44581043 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.365;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=6.34;ReadPosRankSum=-0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:504,0,2135 -chr5 45226951 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=-1.826;DP=92;FS=7.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:324,0,2875 -chr5 45473290 . G GCATT 347.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.326;DP=17;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:385,0,116 -chr5 45481827 . T G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.595;DP=39;FS=1.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:261,0,1113 -chr5 45490565 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=1.324;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.220;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:288,0,252 -chr5 45490649 . A T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.694;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:352,0,116 -chr5 45491159 . A G 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.978;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:286,0,464 -chr5 45973373 . C T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.490;DP=390;FS=7.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,56:390:99:379,0,16569 -chr5 46112979 . A T 996.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=1.110;DP=185;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.301;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,46:185:99:1025,0,5310 -chr5 46113254 . A G 3074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-1.177;DP=136;FS=6.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=22.61;ReadPosRankSum=3.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,88:136:99:3103,0,1718 -chr5 46113506 . G A 4694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.629;DP=226;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=20.77;ReadPosRankSum=1.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,131:226:99:4723,0,6568 -chr5 46113643 . A G 8613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=-1.648;DP=183;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.504;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,91:183:99:8642,0,2245 -chr5 46114208 . A C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.305;DP=104;FS=55.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:507,0,4261 -chr5 46114674 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.281;DP=211;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,42:211:99:705,0,6253 -chr5 46115532 . C T 3002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=1.784;DP=162;FS=4.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.949;QD=18.54;ReadPosRankSum=-1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,96:162:99:3031,0,2179 -chr5 46411640 . C T 727.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.470;DP=27;FS=3.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=26.95;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:756,0,181 -chr5 46423467 . AT A 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=-1.741;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:495,0,344 -chr5 46426295 . A T 616.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=-0.919;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.714;QD=28.16;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:11:644,11,0 -chr5 46428703 . C CA 481.14 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=-0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=30.07;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:10:518,10,0 -chr5 46429180 . C T 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-3.651;DP=296;FS=8.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,57:294:99:652,0,11468 -chr5 46452206 . T TA,TAA 1017.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=-0.577;DP=71;FS=4.771;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,39,17:57:99:2413,401,195,1024,0,934 -chr5 46558212 . G T 202.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:231,0,19 -chr5 46621624 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.906;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:358,0,225 -chr5 46628710 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=1.180;DP=63;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=16.81;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,37:63:99:1087,0,869 -chr5 46941469 . G GT 553.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.656;DP=30;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=1.884;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:591,0,753 -chr5 47158094 . GA G 213.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-0.158;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=15.23;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6:286,6,0 -chr5 47160321 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-1.973;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.876;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:289,0,343 -chr5 47358506 . AT A 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.553;DP=27;FS=6.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.080;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:383,0,257 -chr5 47513034 . CAGGTATGTTGTATCCTAGTCAAGCATTACTCATTAGTCATAATAACTCCTGTGTTTGTCTAATGTGTGAATCTGTCTTAA C 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=2.491;DP=14;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=26.05;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:99:402,0,1407 -chr5 47562293 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.606;DP=40;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:277,0,1931 -chr5 47722167 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.776;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:380,0,361 -chr5 47781290 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.504;DP=35;FS=3.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=11.02;ReadPosRankSum=1.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:414,0,818 -chr5 47789307 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.448;DP=38;FS=5.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:275,0,1026 -chr5 47889325 . G C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=-0.466;DP=55;FS=2.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:252,0,1618 -chr5 48066974 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:39:347,0,39 -chr5 48103371 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-0.703;DP=233;FS=4.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,35:233:99:354,0,8033 -chr5 48104141 . A AT 1180.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=3.024;DP=94;FS=2.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=12.56;ReadPosRankSum=-3.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:74:99:1218,0,1144 -chr5 49738697 . AAGGTGTTTAGATTTTCACGCTGAGTTCTAAAATGATCTGTGCTGAGAGAATGCTAATGTTGTGCTGATGTGTTTGTGTTGC A 4162.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=2.890;DP=110;FS=1.516;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.576;QD=32.86;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,103:110:99:4200,367,0 -chr5 49964877 . GA G 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=26.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:247,0,56 -chr5 49964879 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:247,0,56 -chr5 50456292 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.749;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:574,0,3630 -chr5 50585845 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=-0.407;DP=37;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:249,0,2417 -chr5 50585853 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.627;DP=33;FS=6.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:249,0,2417 -chr5 50594006 . C G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.485;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:297,0,546 -chr5 50605936 . A T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-1.623;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:355,0,586 -chr5 50606560 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.249;DP=38;FS=3.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:307,0,1107 -chr5 50608046 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.971;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:322,0,515 -chr5 50612464 . A G 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:681,0,210 -chr5 50615578 . A T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-1.723;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:334,0,1177 -chr5 50621181 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-0.152;DP=40;FS=4.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=12.84;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:542,0,884 -chr5 50621213 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=1.939;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=5.97;ReadPosRankSum=-1.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:255,0,1074 -chr5 50621399 . A G 1351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=-1.594;DP=53;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.644;QD=25.51;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,37:51:99:1380,0,337 -chr5 50621507 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.913;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:233,0,945 -chr5 50624339 . C T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=1.360;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:268,0,985 -chr5 50624720 . T C 1598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1627,120,0 -chr5 50629054 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=-0.881;DP=33;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.881;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:280,0,871 -chr5 50629138 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.177;DP=48;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:251,0,3166 -chr5 50629144 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.246;DP=52;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=4.28;ReadPosRankSum=2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:251,0,3166 -chr5 50682581 . G A 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.462;DP=59;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,22:59:99:742,0,1312 -chr5 50775258 . C T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=-1.767;DP=130;FS=0.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=8.42;ReadPosRankSum=2.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,42:129:99:1123,0,3245 -chr5 50777370 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=-0.461;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:458,0,1002 -chr5 50778048 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-0.136;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.843;QD=15.59;ReadPosRankSum=-1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:418,0,438 -chr5 50778675 . G A 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=0.773;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,19:73:99:462,0,2057 -chr5 50802363 . G T 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.903;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:422,0,565 -chr5 50802603 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.249;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=18.51;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:417,0,344 -chr5 50802656 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.67;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:364,0,387 -chr5 50804252 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.314;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,11:47:99:244,0,1421 -chr5 50811533 . T A 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.383;DP=47;FS=4.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:586,0,1215 -chr5 52582110 . GGGTTTGTGTGGCTTTCAATTCACTGTTTGCTCAGTGCTGTCACATTTTTTAGATACAAAATTCAATCCGATCAATCGTGTACCAATTATTAATTTCTATTTTTAA G 4544.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=1.645;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.361;QD=32.54;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,102:104:99:4582,371,0 -chr5 52859478 . GCCTGTATTCAGACAGAAAAGACAACCATCTGAAACTGTCAAAAGGCACAATGAAAGAAACAAAATCAACGCTATCAGGCTTA G 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.938;DP=16;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=26.23;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:457,0,674 -chr5 52898467 . A C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-0.724;DP=236;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=1.42;ReadPosRankSum=4.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,31:195:99:364,0,6569 -chr5 52902238 . G A 1837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=-0.097;DP=195;FS=21.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=9.42;ReadPosRankSum=3.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,58:156:99:1866,0,3320 -chr5 52902272 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=-3.693;DP=135;FS=55.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=1.69;ReadPosRankSum=-2.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:257,0,4467 -chr5 52902740 . C CT 1097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=3.071;DP=90;FS=19.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=12.20;ReadPosRankSum=-3.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,50:88:99:1199,0,954 -chr5 52902871 . T A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.173;DP=299;FS=111.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.902;QD=2.14;ReadPosRankSum=-7.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,39:189:99:668,0,5721 -chr5 52902919 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=-1.600;DP=247;FS=10.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:608,0,5472 -chr5 52926564 . T G 992.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=-1.441;DP=55;FS=5.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=18.05;ReadPosRankSum=1.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:1021,0,990 -chr5 52926625 . G C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-3.719;DP=43;FS=7.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:378,0,1133 -chr5 52926714 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=-1.234;DP=40;FS=11.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.547;QD=5.32;ReadPosRankSum=2.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:241,0,1155 -chr5 52926922 . C T 2022.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=-0.478;DP=77;FS=4.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=26.27;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,53:77:99:2051,0,683 -chr5 52927294 . T A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=1.369;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,50:68:99:1965,0,442 -chr5 52927377 . C T 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=-0.641;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.475;QD=24.17;ReadPosRankSum=3.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:971,0,424 -chr5 52927532 . A G 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-2.965;DP=43;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=28.92;ReadPosRankSum=2.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1272,0,732 -chr5 52927540 . G A 1243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-2.965;DP=43;FS=4.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=28.92;ReadPosRankSum=3.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,31:43:99:1272,0,734 -chr5 52927626 . G A 1143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=-1.208;DP=49;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=23.34;ReadPosRankSum=2.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,32:49:99:1172,0,604 -chr5 52927655 . T A 721.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=-1.556;DP=43;FS=2.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:759,0,780 -chr5 52928260 . A C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=4.407;DP=32;FS=5.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:510,0,540 -chr5 52929182 . G A 1899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.026;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=1.624;QD=27.14;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,51:70:99:1928,0,467 -chr5 52929225 . A AG 1603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=-1.027;DP=85;FS=3.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=18.87;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:85:99:1641,0,1124 -chr5 52929317 . A G 1988.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=-0.987;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.264;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,57:87:99:2017,0,1002 -chr5 52929426 . C T 1702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.445;DP=78;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,49:78:99:1731,0,1041 -chr5 52929517 . G T 1225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-0.463;DP=51;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=24.03;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1254,0,1276 -chr5 52929852 . TAA T 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=1.626;DP=39;FS=9.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:787,0,701 -chr5 52929917 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.195;DP=49;FS=8.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=20.89;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,30:49:99:1052,0,660 -chr5 52929949 . G T 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.985;DP=62;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=29.69;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,48:62:99:1869,0,294 -chr5 53099275 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-2.532;DP=34;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:481,0,1468 -chr5 53099284 . C T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=2.550;DP=32;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:709,0,989 -chr5 53100823 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=15.81;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:297,0,686 -chr5 53100824 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:297,0,686 -chr5 53118642 . C CT 542.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=27.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:580,57,0 -chr5 53118948 . G GA 386.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:424,42,0 -chr5 53119589 . A C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr5 53184810 . A G 375.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:404,30,0 -chr5 53295224 . T TG 216.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:254,24,0 -chr5 53295420 . T C 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=-0.087;DP=20;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.047;QD=28.09;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:590,0,121 -chr5 53454145 . T A 304.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.393;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=30.40;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:12:332,0,12 -chr5 53592799 . A C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.554;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=12.68;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:396,0,450 -chr5 53592871 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.953;DP=30;FS=12.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=13.46;ReadPosRankSum=2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:432,0,1354 -chr5 53592880 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=-1.606;DP=28;FS=9.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=14.42;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:432,0,1364 -chr5 53592999 . G T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.127;DP=29;FS=4.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,22:29:99:843,0,173 -chr5 53593182 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=-1.263;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=10.90;ReadPosRankSum=-3.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:268,0,504 -chr5 53593218 . C T 934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=2.521;DP=42;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=22.26;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,28:42:99:963,0,467 -chr5 53593569 . T C 876.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=1.299;DP=29;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:94:905,0,94 -chr5 53600629 . T G 2516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=-1.601;DP=82;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.224;QD=30.69;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,65:82:99:2545,0,306 -chr5 53600688 . C T 2801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.699;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=32.20;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,73:87:99:2830,0,172 -chr5 53626728 . A T 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr5 53626801 . T A 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:470,36,0 -chr5 53626895 . A C 290.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:319,24,0 -chr5 53626907 . G A 224.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:253,21,0 -chr5 53687429 . C G 565.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:594,45,0 -chr5 53709965 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.888;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=29.91;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:47:417,0,47 -chr5 53747175 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.536;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.672;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:269,0,458 -chr5 53853165 . A T 392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:421,30,0 -chr5 53853216 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=1.120;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=20.45;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:335,0,188 -chr5 53853265 . A G 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -chr5 53853410 . G A 405.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:434,30,0 -chr5 53853597 . T C 1398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1427,96,0 -chr5 53853599 . C G 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=1.155;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=29.41;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:83:940,0,83 -chr5 53920874 . T A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=26.73;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:93:349,0,93 -chr5 53931534 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 -chr5 53932016 . G A 522.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:551,39,0 -chr5 54043177 . T G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr5 54702518 . C T 256.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.01;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:11:284,0,11 -chr5 54728128 . G T 923.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=-1.505;DP=33;FS=8.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:61:952,0,61 -chr5 54728247 . C G 1203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1232,87,0 -chr5 54728674 . G A 1345.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1374,99,0 -chr5 54728730 . A C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=1.174;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=31.86;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1207,0,108 -chr5 54730799 . A G 1153.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1182,87,0 -chr5 54730863 . T C 1848.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=-0.851;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.193;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1877,138,0 -chr5 54732958 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.351;DP=34;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,983 -chr5 54734578 . C A 1822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=-1.052;DP=58;FS=8.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=31.43;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,49:58:99:1851,0,130 -chr5 54734719 . T G 636.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.731;DP=19;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.192;QD=33.51;ReadPosRankSum=1.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:27:665,0,27 -chr5 54737340 . G A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.936;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:681,0,919 -chr5 54737349 . T A 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.179;DP=24;FS=3.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=27.20;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:681,0,860 -chr5 54737369 . A C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-0.787;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.541;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:247,0,740 -chr5 54737421 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.609;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=23.99;ReadPosRankSum=2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:460,0,199 -chr5 54739374 . A G 1370.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.714;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=29.90;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1399,99,0 -chr5 54739607 . A G 1619.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.236;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=33.75;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,43:48:33:1648,33,0 -chr5 54766825 . G A 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.621;DP=86;FS=0.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,24:86:99:618,0,2434 -chr5 54767546 . T TA 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.139;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:299,0,1300 -chr5 54826123 . TCTGAAGAACACAACATCAAACATCATCAAGATCCAAGTATTAAAGAAAATGTATACAAATCTGAAACTTGTACAAAC T 3822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.957;DP=116;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.913;QD=32.95;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,113:116:99:3860,311,0 -chr5 55150612 . CACCTGCAATATAAATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACTTCAACAAAGCTTTAAAATGGCTTAAATGACTT C 19806.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.570;ClippingRankSum=1.744;DP=362;FS=2.557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.487;QD=31.53;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,339:350:99:19844,1404,0 -chr5 55150720 . GC G 692.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=-2.732;DP=349;FS=4.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,10:340:99:730,0,14277 -chr5 55205890 . G GA 1169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=-2.285;DP=167;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=1.249;QD=7.00;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,59:153:99:1207,0,2171 -chr5 55230624 . TA T 1007.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.884;DP=96;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=10.50;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:1045,0,986 -chr5 55231435 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=-0.818;DP=32;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=9.06;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:332,0,305 -chr5 55234331 . T C 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=2.338;DP=27;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:448,0,441 -chr5 56500528 . A T 557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.844;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.911;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:586,0,678 -chr5 56500541 . A C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-1.083;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=14.96;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:507,0,697 -chr5 56698392 . T C 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.805;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=24.54;ReadPosRankSum=-1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,22:31:99:789,0,244 -chr5 56698540 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-1.083;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.526;QD=28.92;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:84:462,0,84 -chr5 56733763 . C A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=1.670;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:319,0,489 -chr5 57215135 . C T 411.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=-1.737;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=29.42;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:2:438,2,0 -chr5 57636169 . C T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 -chr5 57731864 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.920;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:264,0,1289 -chr5 57735575 . TCTAAAGGAACGCAGCTCTGTTAGATTTGAAATCGGATTCTTTGGGTTTAATGAAACTTTCATGTTGTTTTCAGCATAC T 1095.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.038;DP=47;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=23.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:99:1133,144,0 -chr5 57792603 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.825;DP=48;FS=5.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,10:48:99:285,0,2920 -chr5 57916552 . T TAA 908.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.144;ClippingRankSum=0.705;DP=64;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=14.20;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:946,0,1021 -chr5 57919767 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.926;DP=78;FS=2.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:329,0,2284 -chr5 57922725 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=-0.602;DP=53;FS=2.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=6.96;ReadPosRankSum=1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:397,0,1466 -chr5 58411773 . C T 401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=-0.170;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=14.88;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:430,0,436 -chr5 58893199 . GGGTGAGTTAATGTAACCCCGTATGATTATTTACCAAAGCCGTTCACTGTTATAATGATCATAACCCTGCAATCATCATTATGCA G 2315.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=2.374;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.508;QD=31.72;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,64:73:99:2353,0,1133 -chr5 59146810 . C CT 720.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.627;DP=173;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.180;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,51:158:99:758,0,3015 -chr5 59516999 . T A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=1.767;DP=27;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=23.99;ReadPosRankSum=-1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:676,0,142 -chr5 59517005 . G GTGGTGGTCATTGT 701.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:50:739,50,0 -chr5 59596469 . T G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.047;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=23.09;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:467,0,206 -chr5 59597204 . C T 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:445,33,0 -chr5 59836832 . C T 426.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:455,33,0 -chr5 59836863 . A G 516.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:545,39,0 -chr5 59896202 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=-0.926;DP=38;FS=7.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.455;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:348,0,986 -chr5 60001634 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=1.511;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:318,0,346 -chr5 60160322 . ATT A 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.425;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:86:464,0,86 -chr5 60160487 . CCAGGTGATCAGTTTAACACTTTATACAGGCAACAGCTATTGAGTAGATTCATAAACAAAGATAAGCATCATTTTTGTTTGGTGTCTGTTTG C 1497.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=2.570;DP=55;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,36:49:99:1535,0,6190 -chr5 60228399 . G A 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.927;DP=47;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=14.40;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:705,0,776 -chr5 60228458 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.750;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=8.80;ReadPosRankSum=2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:257,0,1470 -chr5 60228462 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=1.035;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=8.47;ReadPosRankSum=2.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:257,0,1470 -chr5 60315429 . T A 834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.419;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=26.09;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:863,0,207 -chr5 60318041 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=1.035;DP=31;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=7.96;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:275,0,800 -chr5 60318329 . AT A 925.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=-1.350;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=18.89;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,35:42:99:963,0,106 -chr5 60318373 . C T 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-1.102;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=15.20;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:317,0,364 -chr5 60323812 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.144;DP=87;FS=2.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,21:87:99:483,0,2558 -chr5 60328144 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-2.728;DP=58;FS=7.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=18.25;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,31:58:99:1087,0,1204 -chr5 60332132 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=-0.357;DP=94;FS=7.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:311,0,2712 -chr5 60332452 . T C 2002.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.028;DP=70;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.413;QD=28.61;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,54:70:99:2031,0,328 -chr5 60334520 . A C 1147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.452;DP=38;FS=1.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=30.20;ReadPosRankSum=0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1176,0,138 -chr5 60344505 . G T 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=-0.858;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.043;QD=28.65;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,34:45:99:1346,0,244 -chr5 60548820 . A C 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr5 60549710 . TA T 262.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:300,30,0 -chr5 60550644 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-0.415;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:656,0,1352 -chr5 60551153 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr5 60551391 . G A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:30:415,30,0 -chr5 60551394 . A T 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:415,30,0 -chr5 60551695 . T G 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:356,27,0 -chr5 60559918 . C A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=-1.030;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,304 -chr5 60691773 . T A 2348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=1.918;DP=88;FS=1.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=26.69;ReadPosRankSum=1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,62:87:99:2377,0,625 -chr5 60758784 . C T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.301;DP=70;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,14:70:99:266,0,2117 -chr5 60769765 . T TA 208.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:246,24,0 -chr5 60775619 . C T 807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-0.640;DP=48;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=16.83;ReadPosRankSum=-0.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:836,0,769 -chr5 60777890 . C A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=1.392;DP=53;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:269,0,1639 -chr5 60779016 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.189;DP=32;FS=2.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:536,0,980 -chr5 60779331 . T G 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-1.408;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=24.58;ReadPosRankSum=0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:397,0,354 -chr5 60779354 . A T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-1.577;DP=18;FS=6.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=26.49;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:505,0,242 -chr5 60779805 . C T 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.711;DP=25;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:99:959,0,168 -chr5 60779806 . A C 930.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.424;DP=27;FS=2.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.430;QD=34.47;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:99:959,0,165 -chr5 60779966 . C A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=1.910;DP=36;FS=5.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:496,0,1735 -chr5 60781046 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=-1.695;DP=41;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=8.04;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:358,0,1067 -chr5 60787906 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-1.061;DP=14;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:401,0,345 -chr5 60790692 . C T 1901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=1.176;DP=121;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,61:114:99:1930,0,1841 -chr5 60809748 . G A 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=1.055;DP=103;FS=9.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=21.74;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,72:101:99:2267,0,674 -chr5 60809926 . C A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.795;DP=129;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,31:128:99:655,0,3651 -chr5 60896843 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=-1.258;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=5.05;ReadPosRankSum=1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:306,0,1602 -chr5 60897814 . T TA 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=-0.144;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.395;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:300,0,217 -chr5 60898496 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-2.025;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=15.47;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:353,0,291 -chr5 60899112 . AT A 435.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-1.129;DP=22;FS=2.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:3:471,0,3 -chr5 60899263 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.254;DP=13;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=27.29;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:383,0,87 -chr5 60899834 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=-0.775;DP=24;FS=3.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=9.16;ReadPosRankSum=-1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:248,0,654 -chr5 60900041 . A G 572.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=-0.868;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=33.28;ReadPosRankSum=1.519 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:6:600,6,0 -chr5 60962574 . A C 329.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.99;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:358,0,14 -chr5 61118194 . C T 3051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-1.689;DP=82;FS=3.120;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=30.71;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,79:80:99:3080,231,0 -chr5 61118521 . T A 1222.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:87:1251,87,0 -chr5 61118530 . T C 1222.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:87:1251,87,0 -chr5 61142789 . G A 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.782;DP=101;FS=5.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,29:100:99:716,0,2582 -chr5 61148009 . G A 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=-0.124;DP=58;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=26.79;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,43:58:99:1582,0,400 -chr5 61160759 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-2.047;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:302,0,1900 -chr5 61178150 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=1.542;DP=102;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:425,0,3314 -chr5 61178165 . C T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=-0.402;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=4.54;ReadPosRankSum=2.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:500,0,3281 -chr5 61178419 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.491;DP=24;FS=12.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:306,0,514 -chr5 61178505 . A G 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-0.972;DP=39;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=16.61;ReadPosRankSum=2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,18:39:99:676,0,716 -chr5 61179694 . GA G 454.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.050;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:1:489,0,1 -chr5 61179839 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=33.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:326,0,150 -chr5 61180144 . C G 771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-0.535;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.990;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:800,0,724 -chr5 61213673 . A G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.358;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.014;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:467,0,281 -chr5 61216128 . G A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.168;DP=37;FS=7.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=17.89;ReadPosRankSum=0.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:690,0,664 -chr5 61228359 . G A 1224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=-0.163;DP=44;FS=7.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,33:44:99:1253,0,270 -chr5 61232348 . TGAAGGTAAAACTCCATTTTAAAAGGTCACCGAGGTTTGCCTTCAGATATTATGGGCTGTCGGTGTGATTGTTCTCCCTTTTCCCCA T 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=1.630;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=19.03;ReadPosRankSum=-2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:437,0,1070 -chr5 61235035 . T A 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.461;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=10.59;ReadPosRankSum=-2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:420,0,851 -chr5 61242479 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-1.670;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=14.48;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:231,0,252 -chr5 61292108 . A G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:343,24,0 -chr5 61292492 . T C 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.769;DP=31;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=17.28;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:564,0,518 -chr5 61293035 . T G 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-0.253;DP=32;FS=8.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=21.71;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:723,0,967 -chr5 62036963 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.835;DP=35;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:313,0,897 -chr5 62343658 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-0.149;DP=51;FS=3.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:230,0,1480 -chr5 62375300 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=-1.145;DP=64;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:297,0,1895 -chr5 62377009 . C CT 490.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.203;DP=41;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:528,0,501 -chr5 62377417 . A T 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.885;DP=49;FS=2.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:466,0,2819 -chr5 62377423 . C A 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.616;DP=52;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=8.42;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:466,0,2819 -chr5 62377729 . C G 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=1.033;DP=60;FS=4.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:412,0,1671 -chr5 62378387 . A T 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.023;DP=45;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.172;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:683,0,1377 -chr5 62533915 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.398;DP=125;FS=4.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,25:125:99:429,0,3884 -chr5 62535174 . CAGGTTTGTAGTGTAGCTTCGAAGGTTTAATTTAGAAAAGAGGAGAGATATTTCACCTTTCTCTCATTGATCTTCAT C 8136.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=1.189;DP=197;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=38.49;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,184:185:99:8174,724,0 -chr5 62535414 . C T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=-1.674;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,24:150:99:299,0,4793 -chr5 62557540 . A G 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.597;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.973;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:439,0,710 -chr5 62762131 . C A 601.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.332;DP=22;FS=5.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:26:630,0,26 -chr5 62762143 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.182;DP=13;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.396;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:48:388,0,48 -chr5 62965102 . TCCTGCAAGAGAATATAATTAATGATTTGAAGTAAATAAAGGCACTATTTAAGGGAATATCTATGTAACACTTA T 1665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.763;DP=60;FS=3.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.763;QD=27.76;ReadPosRankSum=-0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,41:60:99:1703,0,4408 -chr5 62991809 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.927;DP=46;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:270,0,1371 -chr5 63109702 . GT G 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=1.250;DP=69;FS=1.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:462,0,799 -chr5 63412052 . A T 485.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:514,36,0 -chr5 63565911 . T C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.34;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:32:243,0,32 -chr5 63584007 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr5 63758432 . A G 329.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=-0.696;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=29.99;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:358,0,16 -chr5 63818481 . TA T 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=40;FS=8.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=7.82;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:350,0,429 -chr5 64392328 . G GA 218.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:256,27,0 -chr5 64401685 . T G 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr5 64401702 . A C 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr5 64562239 . CTGAAGAGGTCCGAGTTCTTCATCACTTCACATCTGATCATCGCTTCCTCTGCTGGTTAATTTTCAGATGTTGTTAA C 1376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.844;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:99:1414,152,0 -chr5 64562320 . GAAGCTTCTGCATTCAAATTCACAGTTTTGCTTTTTGTTGTTTTTC G 1376.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=1.076;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=28.10;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:99:1414,152,0 -chr5 64567108 . G T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=-1.498;DP=38;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.893;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:461,0,845 -chr5 64615343 . G T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.008;DP=135;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,29:135:99:488,0,8622 -chr5 64666086 . G C 251.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.50;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:280,0,13 -chr5 64727834 . G A 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-1.335;DP=170;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,30:170:99:376,0,5257 -chr5 64745340 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=-0.405;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.440;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,22:136:99:331,0,8546 -chr5 64785680 . G A 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.643;DP=211;FS=0.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,40:210:99:661,0,6542 -chr5 64786615 . CA C 519.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.44;MQ0=0;QD=23.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:55:557,55,0 -chr5 64864522 . AAGGTCAGTTCTGTGTGCTTGGGACTACTTTTTTGTGTTGCTCAATCTGACTGTTCCTTTGGTTGTTAT A 12859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=1.070;DP=324;FS=12.870;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,309:313:99:12897,914,0 -chr5 64871505 . C T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.297;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.08;ReadPosRankSum=-2.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:338,0,372 -chr5 64872321 . CT C 775.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=1.016;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.375;QD=22.82;ReadPosRankSum=-1.614 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:59:813,59,0 -chr5 64872809 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.718;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=27.32;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:438,0,452 -chr5 64872994 . TC T 1284.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1322,112,0 -chr5 64876646 . C A 1188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=-0.025;DP=314;FS=3.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,66:311:99:1217,0,18847 -chr5 64876649 . A C 1141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.024;DP=312;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,66:309:99:1170,0,18849 -chr5 64993897 . T C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=-0.033;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.484;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:340,0,458 -chr5 65001860 . GCTTAAGTTTAAAAAAAGCAACATTTGAGTTTTGAACATCGTAATATAATGATGCAAAAGTTGCAATTTGTCCTAC G 1708.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=1.164;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=26.68;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,41:44:99:1746,0,588 -chr5 65353091 . C CAT 444.92 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-1.470;DP=15;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=29.66;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:481,0,5 -chr5 65703116 . A G 1494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.360;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=30.47;ReadPosRankSum=-0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,34:40:99:1523,0,430 -chr5 65704100 . G A 929.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.583;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.980;QD=26.80;ReadPosRankSum=1.131 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:958,66,0 -chr5 65704609 . C T 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:346,24,0 -chr5 65712198 . G A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr5 65759989 . C T 784.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:813,60,0 -chr5 65760002 . T C 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1170,84,0 -chr5 65760107 . A C 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=2.073;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.678;QD=28.06;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:393,0,46 -chr5 65763695 . A G 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:467,33,0 -chr5 65763720 . A G 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:738,51,0 -chr5 65770865 . C T 1281.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1310,93,0 -chr5 65771932 . A G 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-1.187;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.187;QD=32.63;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:44:485,0,44 -chr5 65771949 . C A 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 -chr5 65950017 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-0.921;DP=23;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:277,0,474 -chr5 66051497 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=3.558;DP=93;FS=7.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.848;QD=2.20;ReadPosRankSum=1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:233,0,2928 -chr5 66059104 . A AT 443.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=-2.408;DP=37;FS=2.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=11.99;ReadPosRankSum=1.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:481,0,451 -chr5 66059467 . CA C 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.711;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:33:396,0,33 -chr5 66061150 . C CA 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.992;DP=46;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=4.41;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:240,0,735 -chr5 66062381 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.623;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:472,0,1748 -chr5 66069859 . CTGATGT C 219.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:20:257,20,0 -chr5 66418659 . C T 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 -chr5 66491093 . C CA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.767;DP=55;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:254,0,932 -chr5 66495973 . TCTGTGTAGAAATCATAATTTTTAAAAAAAAGTGTTCAATGAATATATGAAAACACTCCCCTGACAATGACTGCAGGCCCAC T 11459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.857;DP=302;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.565;QD=30.39;ReadPosRankSum=-1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,285:293:99:11497,858,0 -chr5 66508381 . C A 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-3.343;DP=113;FS=0.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=11.63;ReadPosRankSum=3.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,40:112:99:1342,0,2495 -chr5 66522179 . A T 242.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:21:271,0,21 -chr5 66529492 . G T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=2.575;DP=49;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:313,0,1401 -chr5 66538402 . G T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-1.379;DP=61;FS=2.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=6.06;ReadPosRankSum=1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:398,0,1677 -chr5 66567803 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=1.727;DP=25;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:294,0,731 -chr5 66567823 . A G 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=1.006;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.897;QD=15.87;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:425,0,430 -chr5 66578476 . C T 1743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=-3.081;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.294;QD=30.06;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,46:58:99:1772,0,240 -chr5 66578491 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=-0.938;DP=63;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:522,0,1596 -chr5 66581907 . G A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=-0.494;DP=49;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.334;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,32:49:99:1105,0,592 -chr5 66582066 . T C 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=-0.693;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=7.49;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:410,0,1404 -chr5 66582200 . C G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=-0.072;DP=53;FS=2.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:315,0,1591 -chr5 66582242 . G T 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=1.418;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=6.74;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:419,0,1616 -chr5 66582254 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.011;DP=52;FS=2.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:255,0,1542 -chr5 66582393 . A G 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=0.728;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=19.13;ReadPosRankSum=2.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:870,0,614 -chr5 66586360 . C G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-0.329;DP=38;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:535,0,804 -chr5 66586643 . G C 1018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=-0.808;DP=47;FS=6.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1047,0,573 -chr5 66586742 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=-0.718;DP=31;FS=6.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:241,0,794 -chr5 66586775 . A G 695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:724,51,0 -chr5 66594856 . T C 351.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:380,27,0 -chr5 66598892 . G C 935.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:964,69,0 -chr5 66599028 . C T 1921.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1950,141,0 -chr5 66600511 . G A 273.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:302,21,0 -chr5 66602465 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.163;DP=16;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=21.67;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:375,0,195 -chr5 66607189 . A T 770.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:799,60,0 -chr5 66607250 . A G 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=1.787;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.018;QD=12.14;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:429,0,691 -chr5 66610107 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=-1.423;DP=40;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=13.59;ReadPosRankSum=1.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:572,0,773 -chr5 66610859 . A G 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:531,39,0 -chr5 66612361 . G C 798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:827,60,0 -chr5 66612402 . T C 888.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:917,66,0 -chr5 66612585 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.359;DP=26;FS=22.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.128;QD=17.76;ReadPosRankSum=-0.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:490,0,465 -chr5 66616722 . T G 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=-0.055;DP=59;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=22.52;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,38:59:99:1357,0,732 -chr5 66616813 . G A 1799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1828,132,0 -chr5 66617806 . C T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.501;DP=48;FS=2.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=15.31;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:763,0,878 -chr5 66617893 . T C 2348.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2377,172,0 -chr5 66619057 . T A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-0.094;DP=44;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=17.04;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:778,0,775 -chr5 66620130 . C T 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.897;DP=35;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=30.91;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1110,0,114 -chr5 66676777 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.667;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.183;QD=7.04;ReadPosRankSum=2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:556,0,2005 -chr5 67007178 . A G 284.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:313,21,0 -chr5 67008106 . A G 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.831;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=19.90;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,183 -chr5 67473653 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.811;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,396 -chr5 67474467 . T C 1039.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-1.273;DP=27;FS=6.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=24.87;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:84:1068,0,84 -chr5 67475958 . C CA 1042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1080,101,0 -chr5 67505794 . ACTGTGGATTTTCAATAACACTGTTAACTCCTCAGTAAACATTAGCTGGGCTTCACCGCTATATCACACTGAAAGTCAAATATCCTAC A 8266.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.194;DP=184;FS=6.140;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.36;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,182:184:99:8304,687,0 -chr5 67591107 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.650;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:382,0,1177 -chr5 67620931 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:262,0,63 -chr5 67822329 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=2.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.591;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:352,0,205 -chr5 67822376 . G C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.156;DP=39;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.770;QD=18.53;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,22:39:99:751,0,600 -chr5 67989594 . TA T 919.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.423;DP=63;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:957,0,232 -chr5 67990107 . AT A 1339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=-1.187;DP=92;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,53:81:99:1377,0,431 -chr5 67990789 . C CA 1536.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=-0.180;DP=70;FS=1.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=21.95;ReadPosRankSum=-1.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,48:66:99:1574,0,848 -chr5 67991169 . G GC 305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-2.132;DP=78;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=3.92;ReadPosRankSum=2.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:343,0,5605 -chr5 68048240 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.827;QD=20.92;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:342,0,216 -chr5 68659346 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=30.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:99:240,0,202 -chr5 68659354 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=9;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.53;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:240,0,202 -chr5 68659952 . G C 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.938;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=23.21;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:83:446,0,83 -chr5 68660177 . T TG 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=-0.608;DP=29;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:44:476,0,44 -chr5 68660189 . C T 820.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=-0.161;DP=30;FS=2.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=27.36;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:16:849,0,16 -chr5 68665942 . GA G 568.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.436;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,28:83:99:606,0,1187 -chr5 68668810 . A G 835.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=-2.823;DP=71;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=11.77;ReadPosRankSum=2.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,26:71:99:864,0,1484 -chr5 68668954 . A G 1510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.516;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.528;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,30:70:99:1539,0,1487 -chr5 68674450 . T C 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.756;DP=90;FS=5.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,31:90:99:941,0,4472 -chr5 68674456 . C T 912.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=1.382;DP=89;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.202;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:941,0,4472 -chr5 68684954 . A G 984.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.021;DP=90;FS=2.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,30:90:99:1013,0,2132 -chr5 68691622 . G A 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=-1.033;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.265;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,35:100:99:957,0,2041 -chr5 69011941 . G T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=4.646;DP=62;FS=4.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:1123,0,4649 -chr5 69011977 . A T 1094.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=-3.607;DP=52;FS=7.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=21.05;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:1123,0,4638 -chr5 69012722 . A G 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=5.126;DP=94;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=5.87;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:580,0,2617 -chr5 69012932 . T A 473.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=3.830;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.350;QD=7.07;ReadPosRankSum=-2.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:502,0,1941 -chr5 69012962 . A T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.927;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:252,0,4338 -chr5 69014531 . GT G 1612.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=1.486;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=1.370;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,72:135:99:1650,0,3399 -chr5 69050745 . C G 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.424;DP=33;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.166;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:637,0,430 -chr5 69105635 . C T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.153;DP=53;FS=10.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,22:53:99:775,0,1078 -chr5 69162900 . A G 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-1.507;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.012;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:336,0,2186 -chr5 69162963 . C T 1266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.585;DP=74;FS=7.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=17.12;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:1295,0,1297 -chr5 69166798 . GCTCAGGTACAGCAGAAACACACCTGATAGAACAAACACTGAACTTACCAAGGCTGAACGCAACTGCAATGTGTTGAAT G 4233.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=1.700;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.441;QD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:107:99:4271,299,0 -chr5 69187951 . AAGGTTGGATTTTTTATTATTTTTATTTTTTTTTTGTATTCTGAATTGTTGATGTAGTATTGCAGCTCATTTCTGAGTATGTTTGCATTTGC A 4181.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-1.191;DP=117;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=35.06;ReadPosRankSum=2.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,106:117:99:4219,0,439 -chr5 69197874 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-1.494;DP=60;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.655;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:262,0,1710 -chr5 69200968 . C G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-0.106;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,14:64:99:278,0,2760 -chr5 69254957 . A G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-0.462;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.94;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,390 -chr5 69328964 . G A 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.160;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.257 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:1088,0,1847 -chr5 69329032 . A G 1059.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=-1.363;DP=87;FS=13.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=12.18;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:1088,0,1842 -chr5 69353568 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=-0.795;DP=30;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:449,0,647 -chr5 69372373 . ACTAAAGCAACAAGAACAAGAGTTCGTGAACAAGTGAAATCAGTCTTTGAGGGCTGGTGTCAGTTCAGATGAATGAGGACACACTTTAC A 2251.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.364;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=31.42;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:51:99:2289,189,0 -chr5 69372483 . G A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.232;DP=55;FS=2.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:408,0,1472 -chr5 69434779 . C CT 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=-0.547;DP=95;FS=5.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.340;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,26:88:99:350,0,1678 -chr5 69436777 . C A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.713;DP=103;FS=6.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=2.83;ReadPosRankSum=3.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:320,0,3196 -chr5 69462505 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=-1.945;DP=150;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,31:150:99:473,0,6550 -chr5 69476983 . C T 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=-0.122;DP=137;FS=5.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,29:136:99:537,0,3991 -chr5 69697595 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=-2.140;DP=99;FS=13.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=3.68;ReadPosRankSum=3.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,20:99:99:393,0,2982 -chr5 69698048 . C T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.244;DP=81;FS=1.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:369,0,2271 -chr5 69801775 . C CA 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=-2.231;DP=195;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,37:160:99:270,0,2666 -chr5 69803668 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:95:231,0,95 -chr5 69805938 . G A 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=2.684;DP=383;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:313,69:382:99:1001,0,12082 -chr5 70183196 . CA C 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=1.212;DP=18;FS=20.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:384,0,117 -chr5 70189873 . TCTGCACGCGACCCACACCAGAAGAACTGAGCAAAAAACAGTAACGTGCACTCGCACACTCAAAAAACCCAAAGCGACTGTTAC T 1073.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=2.491;DP=32;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=33.55;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1111,0,1808 -chr5 70223929 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.636;DP=43;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:261,0,1158 -chr5 70266571 . G T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.201;DP=15;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,248 -chr5 70282360 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.446;DP=59;FS=12.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:314,0,1680 -chr5 70282416 . T A 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.516;DP=71;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:776,0,1518 -chr5 70282606 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=-1.450;DP=80;FS=2.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:99:232,0,2149 -chr5 70282627 . A T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.228;DP=86;FS=6.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,19:81:99:394,0,2506 -chr5 70283298 . A T 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-1.821;DP=84;FS=5.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=12.82;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,34:82:99:1105,0,1727 -chr5 70283502 . T TA 983.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.959;DP=108;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.631;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,55:95:99:1162,0,912 -chr5 70283559 . C A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=1.133;DP=44;FS=6.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:276,0,1247 -chr5 70284885 . AT A 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=-0.950;DP=36;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:244,0,1492 -chr5 70315193 . G T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.215;DP=38;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.149;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:280,0,1075 -chr5 70325065 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-1.524;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:277,0,2316 -chr5 70325278 . T C 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.735;DP=64;FS=1.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:468,0,1630 -chr5 70325290 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.999;DP=64;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=6.64;ReadPosRankSum=-1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:453,0,1619 -chr5 70336809 . TCTTCAGGAAAGAAAGGCATTACCAACAGAAACAAACAAACTAAATGTGTTGTATCATATCTGAATATTTCTGCAGGCTCTTAC T 2815.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=-0.891;DP=65;FS=2.124;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=28.72;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,62:65:99:2853,232,0 -chr5 70347866 . T A 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=-2.002;DP=104;FS=1.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,24:104:99:483,0,3390 -chr5 70347987 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.131;DP=150;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=1.41;ReadPosRankSum=-1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,24:150:99:240,0,4902 -chr5 70348039 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.504;DP=142;FS=10.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,26:142:99:384,0,4544 -chr5 70361401 . T G 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.359;DP=156;FS=3.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,35:155:99:740,0,4543 -chr5 70387468 . GT G 1057.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.010;DP=160;FS=0.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=6.61;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,53:153:99:1095,0,3792 -chr5 70422762 . C A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.907;DP=150;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,41:149:99:1010,0,4031 -chr5 70456127 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.129;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.721;QD=22.29;ReadPosRankSum=-0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:697,0,450 -chr5 70457691 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.951;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:326,0,1407 -chr5 70459386 . A G 9839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=-1.346;DP=242;FS=0.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=29.53;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,62:230:99:9868,0,5805 -chr5 70459432 . T C 8164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-2.248;DP=278;FS=37.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=29.37;ReadPosRankSum=-1.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,56:260:99:8193,0,11890 -chr5 70459539 . T C 3792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=-3.161;DP=313;FS=2.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.007;QD=12.12;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,160:311:99:3821,0,19322 -chr5 70481355 . G T 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=1.063;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,16:93:99:306,0,2786 -chr5 70490310 . T G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=-0.104;DP=93;FS=1.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:250,0,3043 -chr5 70660625 . G C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.952;DP=26;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=17.18;ReadPosRankSum=1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:475,0,474 -chr5 70666627 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-1.333;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:393,0,492 -chr5 70668622 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=-1.772;DP=50;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:622,0,1026 -chr5 70678122 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.334;DP=26;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=14.88;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:415,0,466 -chr5 70681441 . C T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.298;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.49;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:280,0,495 -chr5 70697266 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-1.271;DP=23;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:373,0,457 -chr5 70729642 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.329;DP=72;FS=13.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,24:72:99:630,0,1725 -chr5 70730141 . A G 686.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.237;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:715,0,1199 -chr5 70730154 . C T 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.746;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,25:62:99:837,0,1242 -chr5 70731496 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-3.166;DP=51;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.107;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:309,0,1423 -chr5 70733384 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=-0.063;DP=76;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,31:76:99:1015,0,1448 -chr5 70747597 . A G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=-0.465;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:854,0,630 -chr5 70855746 . CT C 409.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.330;DP=83;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,33:76:99:683,0,722 -chr5 70856214 . CAT C 1308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=1.221;DP=87;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=1.753;QD=15.04;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,37:86:99:1346,0,1802 -chr5 70877381 . C A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.363;DP=33;FS=11.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.36;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:238,0,2420 -chr5 70877760 . T C 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-0.837;DP=30;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:475,0,581 -chr5 70878292 . T C 759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=1.192;DP=45;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:788,0,826 -chr5 70919491 . A G 3709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=-2.324;DP=262;FS=2.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=14.16;ReadPosRankSum=3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,104:261:99:3738,0,5615 -chr5 71057960 . TAGGTAAGTGTGTCATTTGTGCATTGAAAAAGTTTTGCAATTAAACTTTTTATGTATATCAGCAACTTAACTTTTTGTTTATTGTTCAAC T 2650.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=2.942;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=30.78;ReadPosRankSum=-1.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,67:73:99:2688,0,288 -chr5 71075982 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.603;DP=44;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:641,0,833 -chr5 71077624 . C T 533.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.307;DP=41;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=13.02;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:562,0,864 -chr5 71081730 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=-1.929;DP=27;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=9.58;ReadPosRankSum=-1.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:287,0,626 -chr5 71084239 . TC T 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.296;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=30.39;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:402,0,102 -chr5 71110746 . G T 1875.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.339;ClippingRankSum=-0.802;DP=150;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=12.50;ReadPosRankSum=1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,64:145:99:1913,0,2784 -chr5 71116263 . G A 2826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.823;DP=175;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,79:175:99:2855,0,5821 -chr5 71304678 . TA T 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:248,0,217 -chr5 71672129 . A AC 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.015;DP=46;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,29:46:99:809,0,562 -chr5 71720018 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.529;DP=12;FS=18.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=18.65;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:252,0,171 -chr5 71802483 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=-0.533;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:315,0,399 -chr5 71808770 . TAA T 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=14.78;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,450 -chr5 71810111 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=1.000;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=18.90;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:255,0,179 -chr5 71885348 . G GC 351.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.21;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:389,27,0 -chr5 72000434 . AT A 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=-0.475;DP=56;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.823;QD=4.25;ReadPosRankSum=1.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,16:56:99:275,0,1021 -chr5 72057314 . GA G 2285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=-2.066;DP=132;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,84:127:99:2323,0,1071 -chr5 72059584 . G A 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=-0.610;DP=116;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:415,0,5494 -chr5 72065281 . G A 956.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-2.534;DP=124;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,38:124:99:985,0,3226 -chr5 72147260 . G T 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=-0.534;DP=251;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,75:250:99:1852,0,6538 -chr5 72147279 . G A 1936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=-0.902;DP=287;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,84:285:99:1965,0,7527 -chr5 72151377 . T C 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:359,0,318 -chr5 72165146 . G T 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=1.693;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:269,0,1299 -chr5 72176231 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.936;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:257,0,840 -chr5 72211355 . C G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=1.342;DP=30;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=8.36;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:279,0,712 -chr5 72217033 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=-2.370;DP=33;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:247,0,1060 -chr5 72228789 . T G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-1.184;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=16.45;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:423,0,400 -chr5 72228818 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=-1.214;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:591,0,533 -chr5 72291326 . CT C 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.635;DP=78;FS=0.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,33:73:99:753,0,1470 -chr5 72301430 . TA T 308.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-1.034;DP=30;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:346,0,344 -chr5 72301643 . C CT 323.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=2.619;DP=21;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.04;MQ0=0;MQRankSum=0.524;QD=15.42;ReadPosRankSum=-2.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:82:361,0,82 -chr5 72301874 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-0.391;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.542;QD=7.81;ReadPosRankSum=2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:372,0,1597 -chr5 72331102 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.159;DP=77;FS=1.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:343,0,2356 -chr5 72331173 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=-0.486;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:345,0,3438 -chr5 72331355 . A T 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=-0.811;DP=53;FS=5.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=16.03;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:878,0,859 -chr5 72352374 . AT A 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=2.020;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:296,0,568 -chr5 72352390 . T C 957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=3.188;DP=57;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=16.80;ReadPosRankSum=-2.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,27:57:99:986,0,1464 -chr5 72361517 . G A 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=1.417;DP=313;FS=15.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:245,68:313:99:1120,0,11164 -chr5 72361550 . A G 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=4.751;DP=316;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-6.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,60:316:99:928,0,10154 -chr5 72375930 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=-0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:464,0,156 -chr5 72426425 . C T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-0.915;DP=50;FS=10.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=17.44;ReadPosRankSum=1.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,27:50:99:900,0,784 -chr5 72442187 . G T 798.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-1.404;DP=21;FS=3.680;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=34.09;ReadPosRankSum=1.569 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:60:827,60,0 -chr5 72452740 . A G 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=2.216;DP=109;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.79;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,25:109:99:550,0,3254 -chr5 72452833 . T C 1345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=2.518;DP=117;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.438;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,44:116:99:1374,0,2353 -chr5 72454773 . A G 7613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:170:99:7642,530,0 -chr5 72454782 . C A 2710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.176;DP=181;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=14.98;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,78:179:99:2739,0,3374 -chr5 72461485 . G T 6038.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-5.058;DP=242;FS=2.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=24.95;ReadPosRankSum=-0.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,153:240:99:6067,0,7261 -chr5 72461492 . C A 6029.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=-6.134;DP=256;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=23.55;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,158:253:99:6058,0,7261 -chr5 72463432 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.929;DP=23;FS=2.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:295,0,132 -chr5 72463538 . G T 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 -chr5 72465914 . G T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.992;ClippingRankSum=0.903;DP=181;FS=68.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=1.55;ReadPosRankSum=2.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,53:174:99:308,0,5508 -chr5 72465970 . G T 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-5.946;DP=203;FS=26.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=3.24;ReadPosRankSum=2.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,54:197:99:685,0,5202 -chr5 72466045 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=-3.171;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:344,0,974 -chr5 72470764 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr5 72472083 . C T 7067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=-1.447;DP=245;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=28.85;ReadPosRankSum=1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,183:244:99:7096,0,1372 -chr5 72473479 . G A 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=2.248;DP=75;FS=11.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=6.57;ReadPosRankSum=-2.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:521,0,1950 -chr5 72474396 . T C 2141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2170,165,0 -chr5 72474437 . ACTGCACATAAAGGAGGACAGAAGGACATTGCATTAGTTGTAAAATTACTGCAATACAATGTTATAAAAATATTGCAAATTTGCATTCAAAAAGCATAGACTTAC A 6331.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=-1.281;DP=141;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,139:141:99:6369,515,0 -chr5 72474554 . C T 3789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.216;DP=145;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=26.14;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,100:145:99:3818,0,1252 -chr5 72486725 . G A 1448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=3.932;DP=61;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=23.75;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,42:61:99:1477,0,500 -chr5 72508431 . G A 2187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=2.247;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=28.05;ReadPosRankSum=0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,59:78:99:2216,0,442 -chr5 72514546 . A C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=2.898;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=19.45;ReadPosRankSum=-1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:495,0,372 -chr5 72514560 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=-3.307;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=12.82;ReadPosRankSum=3.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:323,0,529 -chr5 72514580 . C T 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=3.811;DP=23;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=20.29;ReadPosRankSum=-2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:495,0,334 -chr5 72532248 . C A 285.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=31.76;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:314,0,17 -chr5 72532331 . G A 380.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-1.739;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=34.61;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6:408,0,6 -chr5 72532334 . GT G 371.70 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-1.741;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=30.87;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:6:408,0,6 -chr5 72535619 . A C 639.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:668,48,0 -chr5 72535703 . C T 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:972,69,0 -chr5 72535766 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=1.962;DP=57;FS=14.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:242,0,1466 -chr5 72535779 . G T 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=1.269;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,40:58:99:1551,0,532 -chr5 72535827 . C T 2282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=2.355;DP=92;FS=1.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=24.81;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,61:79:99:2311,0,409 -chr5 72547043 . G A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.641;DP=368;FS=1.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.416;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,65:366:99:856,0,14772 -chr5 72547047 . G A 1485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=5.870;DP=358;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:276,80:356:99:1514,0,12847 -chr5 72551472 . G A 1368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1397,99,0 -chr5 72561373 . G A 7790.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=3.330;DP=221;FS=2.983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.673;QD=34.47;ReadPosRankSum=-3.609 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,198:221:99:7819,120,0 -chr5 72584636 . G A 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=-0.453;DP=59;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.947;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:489,0,1554 -chr5 72585138 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=3.239;DP=100;FS=0.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,19:99:99:343,0,2997 -chr5 72589493 . C T 621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-1.546;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=5.06;ReadPosRankSum=2.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,29:123:99:650,0,3795 -chr5 72592510 . A G 2233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.086;ClippingRankSum=-1.282;DP=119;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,67:118:99:2262,0,1635 -chr5 72594825 . C T 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-1.741;DP=112;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.773 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,52:112:99:1774,0,1887 -chr5 72601119 . C T 1311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-2.006;DP=105;FS=9.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,39:105:99:1340,0,2265 -chr5 72601361 . T C 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=1.692;DP=55;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:777,0,1131 -chr5 72649516 . T TA 427.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.771;DP=93;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:465,0,1663 -chr5 72657454 . G A 970.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:999,72,0 -chr5 72664938 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=-0.107;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:402,0,303 -chr5 72664950 . A C 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.603;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:527,0,456 -chr5 72666329 . C T 1435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.702;DP=50;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=28.72;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,40:47:82:1464,0,82 -chr5 72673200 . A G 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr5 72673300 . A T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.833;DP=19;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=25.78;ReadPosRankSum=1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:518,0,623 -chr5 72673305 . C A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=27.21;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:518,0,623 -chr5 72718718 . A C 1410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.845;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,44:75:99:1439,0,1052 -chr5 72721160 . G A 2994.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:3023,229,0 -chr5 72754674 . C A 2465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.400;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.424;QD=19.26;ReadPosRankSum=-1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,76:128:99:2494,0,1816 -chr5 72754808 . C T 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-1.815;DP=87;FS=3.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:81:99:605,0,2018 -chr5 72761429 . T C 1502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=-0.430;DP=80;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,47:80:99:1531,0,1099 -chr5 72762527 . A T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.918;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:313,0,1869 -chr5 72762998 . C T 548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-0.151;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.813;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,17:32:99:577,0,526 -chr5 72775919 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=-0.999;DP=51;FS=14.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,7:51:99:273,0,2344 -chr5 72775980 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=-1.184;DP=56;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:243,0,2111 -chr5 72776046 . A G 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.321;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:323,0,904 -chr5 72801461 . G A 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:49:444,0,49 -chr5 72816972 . A T 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=1.229;DP=230;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=4.34;ReadPosRankSum=4.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,51:230:99:1026,0,7040 -chr5 72817913 . C T 2694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.337;DP=126;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=21.39;ReadPosRankSum=-0.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,63:126:99:2723,0,5087 -chr5 72817919 . G A 2694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;ClippingRankSum=0.553;DP=136;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=19.81;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,69:136:99:2723,0,5087 -chr5 72823135 . G T 652.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=-0.763;DP=279;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:229,50:279:99:681,0,10036 -chr5 72823185 . C T 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.556;DP=233;FS=12.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:186,47:233:99:764,0,9164 -chr5 72823303 . C T 3428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-1.285;DP=181;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.489;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,43:180:99:3457,0,4744 -chr5 72825468 . T C 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.031;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=15.16;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:377,0,432 -chr5 72831784 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.365;DP=63;FS=4.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.979;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:236,0,1945 -chr5 72834078 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-1.553;DP=72;FS=6.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,15:72:99:296,0,2188 -chr5 72883875 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.376;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:256,0,352 -chr5 72884107 . G T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=-0.053;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:270,0,1008 -chr5 72886767 . G C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.675;DP=26;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=13.61;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:382,0,508 -chr5 72895149 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.775;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:306,0,647 -chr5 72904658 . A G 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.815;DP=18;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:230,0,421 -chr5 72923159 . T C 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=1.418;DP=158;FS=4.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,44:158:99:1081,0,4165 -chr5 72924085 . C A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.085;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:468,0,2333 -chr5 72924520 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=-1.636;DP=40;FS=1.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:274,0,1107 -chr5 72925413 . A T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=16.34;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,16:35:99:600,0,665 -chr5 72926270 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.281;DP=53;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:364,0,2013 -chr5 72926851 . A G 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=1.236;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:385,0,974 -chr5 72928782 . GACAGGTTGGTTGTCTTTTACTTAAAAATGGGGCTTGTGTCATAACTTTATTACGTACATTATTACTTTATTAAGTTATATTAACATTGTCTCCCT G 7756.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=1.611;DP=204;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,200:202:99:7794,615,0 -chr5 72932687 . A C 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=-1.269;DP=198;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,58:198:99:1328,0,5066 -chr5 72933118 . TG T 1685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-1.083;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=33.71;ReadPosRankSum=-1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,1:48:99:1723,0,1603 -chr5 72938075 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.559;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:239,0,3356 -chr5 72941796 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=-0.431;DP=76;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.553;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:300,0,2334 -chr5 72957189 . A C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=-0.263;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=14.81;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:354,0,402 -chr5 72990389 . A G 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=2.359;DP=25;FS=6.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:237,0,666 -chr5 73132393 . TAA T 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.112;DP=28;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:455,0,364 -chr5 73353616 . A C 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=-0.487;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=5.85;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:274,0,1091 -chr5 73378726 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.518;DP=40;FS=1.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.198;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,9:40:99:302,0,2439 -chr5 73378735 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=1.193;DP=45;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:302,0,2439 -chr5 73378903 . C A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=-1.047;DP=61;FS=2.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:340,0,1781 -chr5 74755792 . G GCA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=-0.600;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=12.51;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:250,0,113 -chr5 74826308 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:435,33,0 -chr5 74826312 . C T 406.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:33:435,33,0 -chr5 74854518 . C T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=-1.713;DP=27;FS=3.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:523,0,371 -chr5 75060666 . C T 1023.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=-1.192;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=21.33;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1052,0,533 -chr5 75084612 . ACT A 697.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=3.347;DP=51;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:735,0,1611 -chr5 75090479 . T TGC 234.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:272,19,0 -chr5 75123911 . T A 1343.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.818;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=33.60;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,35:40:15:1372,0,15 -chr5 75130998 . C CAT 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.678;DP=27;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:306,0,541 -chr5 75138109 . C T 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=1.528;DP=142;FS=19.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,59:138:99:1809,0,2149 -chr5 75141605 . G A 2788.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.215;DP=152;FS=2.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,88:152:99:2817,0,2249 -chr5 75148436 . A AT 6862.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6900,505,0 -chr5 75153579 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=-0.213;DP=108;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,33:108:99:771,0,2759 -chr5 75179380 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.32;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:258,0,301 -chr5 75180231 . GT G 204.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:22:242,22,0 -chr5 75181195 . G A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.720;DP=47;FS=4.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=20.68;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1000,0,549 -chr5 75182206 . TCTGAGACACACACATCATGGTTTGACATGAAGAAGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGGTGTGTGTGTGTGTCTCATCACTCAC T 2154.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=-0.903;DP=48;FS=3.104;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=28.14;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2192,164,0 -chr5 75239872 . C T 798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-1.260;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:827,0,121 -chr5 75250696 . G A 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.219;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:454,0,710 -chr5 75267129 . G A 1054.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.261;DP=55;FS=7.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:1083,0,1958 -chr5 75281555 . A G 1456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.006;ClippingRankSum=0.496;DP=76;FS=0.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.562;QD=19.17;ReadPosRankSum=2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,42:76:99:1485,0,1009 -chr5 75283194 . GT G 311.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-1.549;DP=70;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.385;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,11:69:99:349,0,1847 -chr5 75474532 . A C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-1.991;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:266,0,178 -chr5 75476429 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.400;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:306,0,159 -chr5 75542373 . G C 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr5 75556242 . A C 261.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=3.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:20:290,20,0 -chr5 75577415 . G A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=1.035;DP=68;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:295,0,1927 -chr5 75577661 . A T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=1.704;DP=33;FS=9.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.547;QD=7.81;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:286,0,801 -chr5 75579258 . TCTGACACACACACACACACACACAGAACATGAGCTTGAGGCTGACATCATGATTCACTTATACACCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAC T 2964.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=-0.015;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.574;QD=31.29;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,66:69:99:3002,245,0 -chr5 75586980 . C G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=2.100;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=16.82;ReadPosRankSum=-2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:785,0,826 -chr5 75587165 . T A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=8.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=28.56;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:51:371,0,51 -chr6 18072 . AAGGTAAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTAAGTAACACATCTCCTGCTGGACTCTGC A 2002.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=1.412;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=33.41;ReadPosRankSum=-1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,54:57:99:2040,0,306 -chr6 20804 . A AGT 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=-1.819;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:381,0,464 -chr6 39357 . A C 1975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-1.377;DP=69;FS=3.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=28.63;ReadPosRankSum=1.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,58:68:81:2017,0,81 -chr6 39763 . G A 2193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=1.050;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.472;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,60:80:99:2222,0,425 -chr6 39829 . A G 2743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=-0.558;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.456;QD=33.06;ReadPosRankSum=1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,71:82:57:2772,0,57 -chr6 40052 . G A 1723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-0.621;DP=93;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=18.54;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,55:92:99:1752,0,1248 -chr6 40599 . C A 1158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-1.564;DP=64;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:1393,0,416 -chr6 41294 . T C 2287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=1.260;DP=72;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=31.77;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,63:72:31:2316,0,31 -chr6 44174 . T C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.898;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:463,0,521 -chr6 44560 . T C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=18.62;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:382,0,441 -chr6 67376 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.968;DP=46;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=15.73;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:46:99:752,0,762 -chr6 69160 . C T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=1.597;DP=45;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=17.42;ReadPosRankSum=0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,26:45:99:812,0,661 -chr6 69190 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=3.019;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=23.21;ReadPosRankSum=-1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:794,0,892 -chr6 130175 . GGGTGAACACACACCACACAGCACAACACAACACACACAGAGTCAACACAACACAACTCATTCATTCATTAGTCTGCAAGTAACAGCGCGGGCAGAAATATGACGAGTGTGTGTGTGTGCGATCTCAGTGATGTTTGTGTGTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTGCGCA G 2694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.245;DP=82;FS=5.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=32.86;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,73:81:99:2732,0,971 -chr6 133683 . C A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=1.763;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:414,0,137 -chr6 133684 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.466;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=29.67;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:414,0,137 -chr6 153851 . A G 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=-1.250;DP=26;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=24.68;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:670,0,295 -chr6 156870 . T TA 703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.433;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.567;QD=29.32;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:741,0,293 -chr6 156947 . CGCTCTAGGCCAGTTTTATAACAGCAGATGTTGCTCTAGGCTAGATTTGTAACAGCAGATGGT C 292.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,15:15:1:327,0,1 -chr6 158108 . G A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.800;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:626,0,449 -chr6 160155 . T C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.14;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:99:572,0,270 -chr6 215951 . C T 2467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.342;DP=80;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=30.85;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,62:80:99:2496,0,383 -chr6 220030 . C A 1529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=-1.736;DP=305;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=5.02;ReadPosRankSum=2.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,75:305:99:1558,0,17666 -chr6 220278 . C T 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-1.243;DP=331;FS=6.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,77:330:99:1576,0,9756 -chr6 220718 . CTCATCATCA C,CTCATCATCATCA 365.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.173;DP=98;FS=4.150;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=3.73;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,7,12:20:99:486,349,3867,128,0,155 -chr6 220872 . T C 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=-2.270;DP=151;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.33;MQ0=0;MQRankSum=-7.255;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,46:151:99:1174,0,5522 -chr6 223434 . A G 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=-0.069;DP=34;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:475,0,1338 -chr6 223631 . G T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=-0.919;DP=34;FS=8.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.631;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:381,0,790 -chr6 224787 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=-3.532;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.54;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:236,0,387 -chr6 276512 . A G 270.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=30.09;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:17:299,0,17 -chr6 282036 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=1.395;DP=16;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=28.24;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:480,0,123 -chr6 282270 . TA T 268.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:306,30,0 -chr6 283146 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.678;DP=11;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=22.80;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,162 -chr6 286185 . CT C 437.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.168;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:475,0,242 -chr6 1087550 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=1.401;DP=48;FS=2.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:390,0,1218 -chr6 1124104 . A T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 -chr6 1167317 . C A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.322;DP=32;FS=5.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=14.96;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:507,0,559 -chr6 1233098 . C G 669.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.239;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=19.14;ReadPosRankSum=-0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,20:33:99:698,0,410 -chr6 1266747 . C A 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=15.05;ReadPosRankSum=0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:284,0,313 -chr6 1272997 . T G 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=20.67;ReadPosRankSum=2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:545,0,339 -chr6 1274517 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.826;DP=24;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:652,0,194 -chr6 1274554 . C A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=27.15;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:544,0,149 -chr6 1274642 . T A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=-1.479;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=25.88;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:520,0,156 -chr6 1275222 . T G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.044;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=22.46;ReadPosRankSum=-0.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:455,0,200 -chr6 1275556 . T TA 360.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:398,39,0 -chr6 1367700 . G A 5025.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=-0.437;DP=285;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=17.63;ReadPosRankSum=2.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,156:285:99:5054,0,4599 -chr6 1367733 . A G 4673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=-4.382;DP=293;FS=0.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=15.95;ReadPosRankSum=5.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,131:293:99:4702,0,5266 -chr6 1370382 . G A 4018.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=-2.571;DP=335;FS=0.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=12.00;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,130:312:99:4047,0,5513 -chr6 1384271 . C T 8110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-1.660;DP=388;FS=13.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=20.90;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,240:388:99:8139,0,9572 -chr6 1388614 . G A 7622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=1.673;DP=390;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,229:390:99:7651,0,5455 -chr6 1392899 . G A 3219.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=-2.184;DP=244;FS=7.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,96:244:99:3248,0,5090 -chr6 1422875 . G A 656.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.979;DP=38;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=17.28;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:685,0,655 -chr6 1428161 . G A 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=1.866;DP=106;FS=12.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:493,0,6511 -chr6 1429781 . T C 1754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=-3.879;DP=119;FS=7.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,50:119:99:1783,0,2347 -chr6 1432730 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=32.98;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:358,0,173 -chr6 1440019 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=-1.079;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:259,0,2937 -chr6 1449781 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.813;DP=34;FS=3.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:277,0,897 -chr6 1616180 . TGAAACATCAAGAACACACACAGTCAATCTTCAGCTTTAATGCTGGATCATGGAAGAGGAGCAGAAGCGCTTCATACCC T 7859.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=158;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:7897,665,0 -chr6 1617553 . GA G 1112.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=-0.358;DP=56;FS=16.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=0.627;QD=19.87;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1150,0,135 -chr6 1710812 . C A 649.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:678,48,0 -chr6 1711078 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:45:387,0,45 -chr6 1711085 . T C 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.752;DP=12;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:45:387,0,45 -chr6 1711177 . G T 1006.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.899;DP=30;FS=2.319;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=33.55;ReadPosRankSum=1.590 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:3:1033,3,0 -chr6 1711184 . T C 1203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:84:1232,84,0 -chr6 1711462 . T A 1969.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1998,141,0 -chr6 1711548 . C T 1857.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1886,132,0 -chr6 1712010 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-1.039;DP=212;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,31:212:99:268,0,7202 -chr6 1712094 . C T 1989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2018,144,0 -chr6 1712104 . A G 1989.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:99:2018,144,0 -chr6 1712141 . A T 361.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:13:390,0,13 -chr6 1904340 . G T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=1.778;DP=44;FS=8.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=19.74;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:897,0,641 -chr6 1904367 . T C 875.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.248;DP=48;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.681;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:48:99:904,0,1406 -chr6 1925244 . C T 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.527;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.636;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:458,0,331 -chr6 1927232 . A G 1224.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90:1253,90,0 -chr6 1937822 . C T 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 -chr6 1939317 . C T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-2.373;DP=96;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.553;QD=5.11;ReadPosRankSum=2.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:519,0,4572 -chr6 1946020 . G C 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.163;DP=91;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,48:91:99:1589,0,1462 -chr6 1948990 . A T 1315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=-3.441;DP=37;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=25.43;ReadPosRankSum=3.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1344,0,290 -chr6 1951036 . C A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.390;DP=109;FS=1.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,27:109:99:659,0,6189 -chr6 1951685 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.644;DP=135;FS=5.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.124;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,26:135:99:450,0,4239 -chr6 1953656 . G A 1963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.764;DP=115;FS=4.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=17.08;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,56:115:99:1992,0,1921 -chr6 1953707 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-0.454;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,20:98:99:386,0,5983 -chr6 1959330 . A G 1014.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=-0.277;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=33.81;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:1:1040,0,1 -chr6 1959333 . C CGTGACGAAT 1004.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-0.069;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=31.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,27:30:2:1040,0,2 -chr6 1959548 . T C 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=1.517;DP=40;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=20.67;ReadPosRankSum=-1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:855,0,703 -chr6 1966894 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=-1.042;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=20.86;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:967,0,339 -chr6 1967478 . G A 763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.393;DP=25;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=30.55;ReadPosRankSum=-0.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:792,0,240 -chr6 1967997 . T G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:240,0,239 -chr6 1968003 . C A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=26.47;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:240,0,239 -chr6 1968200 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=1.087;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,875 -chr6 1968201 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.272;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:258,0,875 -chr6 1968482 . A G 535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.352;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:564,0,281 -chr6 1968492 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=-0.718;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=17.14;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:371,0,365 -chr6 1968855 . G A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=-0.348;DP=24;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:426,0,952 -chr6 1968860 . C A 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=-0.465;DP=24;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:381,0,1043 -chr6 1970418 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-2.262;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=25.98;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:88:314,0,88 -chr6 1970640 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.650;DP=52;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.218;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:231,0,1537 -chr6 1971239 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:262,0,60 -chr6 1973487 . C CTT 1172.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=-1.253;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.534;QD=23.93;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1210,0,299 -chr6 1975321 . G C 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=33.58;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:50:364,0,50 -chr6 1975352 . A G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=-1.630;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=29.05;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1045,0,340 -chr6 1975584 . A T 2849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-0.676;DP=109;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=26.14;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,76:109:99:2878,0,1142 -chr6 1975744 . T A 3016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=1.734;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.468;QD=31.96;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,73:78:99:3045,137,0 -chr6 1975807 . GA G 1238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.315;DP=64;FS=1.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=19.36;ReadPosRankSum=1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,42:60:99:1276,0,331 -chr6 1975993 . G T 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.590;DP=43;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=22.18;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:982,0,597 -chr6 1976822 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=1.591;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:337,0,228 -chr6 1976964 . G A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.469;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.855;QD=33.24;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:39:1125,0,39 -chr6 1977486 . G GT 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=-0.277;DP=166;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=2.05;ReadPosRankSum=-2.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,35:161:99:378,0,3464 -chr6 1980706 . G A 260.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=32.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:289,0,22 -chr6 1982605 . A G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr6 2168178 . A T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=1.785;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.435;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,17:23:99:482,0,163 -chr6 2191614 . A C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.296;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=32.37;ReadPosRankSum=1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:449,0,183 -chr6 2193067 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.865;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:280,0,302 -chr6 2193485 . A G 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.545;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:338,0,357 -chr6 2193490 . A G 659.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=1.714;DP=18;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.671;QD=31.74;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:24:688,0,24 -chr6 2193868 . C G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=2.680;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=21.60;ReadPosRankSum=-1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:309,0,409 -chr6 2193968 . T TA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.542;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.95;MQ0=0;MQRankSum=3.418;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:272,0,1332 -chr6 2194334 . C T 321.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:24:350,24,0 -chr6 2195220 . C T 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=1.194;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:653,0,688 -chr6 2195477 . G A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.722;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:277,0,1738 -chr6 2195692 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.289;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.52;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:246,0,295 -chr6 2195891 . T A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=2.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=20.56;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:275,0,191 -chr6 2197460 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=1.898;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=19.61;ReadPosRankSum=-2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:342,0,797 -chr6 2197469 . C G 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.981;DP=18;FS=2.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=25.60;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:489,0,116 -chr6 2198195 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=2.949;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.173;QD=12.08;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:282,0,369 -chr6 2198315 . C T 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-2.266;DP=31;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:587,0,1016 -chr6 2198316 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-2.598;DP=31;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.062;QD=18.02;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:587,0,1016 -chr6 2221612 . A G 1943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.386;DP=64;FS=3.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=30.37;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,55:64:64:1972,0,64 -chr6 2230225 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.683;DP=16;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=19.74;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:344,0,565 -chr6 2263237 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.467;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=27.63;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:83:415,0,83 -chr6 2275496 . G A 242.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:271,0,22 -chr6 2300118 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-2.693;DP=20;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=26.99;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:62:568,0,62 -chr6 2300780 . A T 427.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:456,33,0 -chr6 2322410 . C G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.715;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.708;QD=22.71;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:84:278,0,84 -chr6 2328527 . T A 537.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:566,42,0 -chr6 2418563 . TGTGAGTTTTAATCTGTTGTTCACCACAAAGCTAGCAATGTGAGCTAACCAAATCATATGGTTAGTTTTGACTTCATGCACAAGGTCTCATCTCTTTCCTCCAG T 525.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=1.953;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:563,0,1670 -chr6 2842491 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:236,0,59 -chr6 2845338 . G A 816.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.800;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=30.60;ReadPosRankSum=2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,21:23:26:845,26,0 -chr6 2845424 . T C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.798;DP=41;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.995;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:334,0,1020 -chr6 3000762 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.811;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=15.12;ReadPosRankSum=0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:391,0,422 -chr6 3062856 . G A 1170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=-1.257;DP=38;FS=4.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.204;QD=30.81;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,31:37:99:1199,0,106 -chr6 3080639 . A T 952.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.861;DP=33;FS=6.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,25:33:99:981,0,204 -chr6 3081301 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.346;DP=45;FS=5.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=27.88;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,33:45:99:1283,0,299 -chr6 3101466 . CCCAATCAGATCCCAGCGACATCTCCATCGGCTCTAAACAGGAGTACAGCATTAACTCCGCCCAAATTGATAATGT C 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.103;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:419,0,1029 -chr6 3101968 . TAACTCCGCCCAAATGTATGATGTCCAATCAGAACCCAGTGACATCTCCATCAGCTCTACACAGGAGACCAGCATC T 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=3.203;DP=39;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.253;QD=6.38;ReadPosRankSum=-2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:286,0,7468 -chr6 3102042 . T A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-1.905;DP=24;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:526,0,1256 -chr6 3102315 . C T 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=1.205;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.96;ReadPosRankSum=-1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:895,0,166 -chr6 3102659 . T A 1006.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.363;DP=32;FS=4.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=31.46;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1035,0,200 -chr6 3128263 . C A 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.872;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.506;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:445,0,251 -chr6 3128679 . C A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr6 3284108 . C T 801.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-3.875;DP=61;FS=0.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=13.14;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:830,0,1235 -chr6 3284343 . C T 1191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=1.970;DP=52;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=22.92;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,35:52:99:1220,0,2016 -chr6 3348183 . T C 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=-1.177;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=18.38;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,30:51:99:1315,0,674 -chr6 3348276 . A G 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=1.674;DP=92;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:309,0,1474 -chr6 3348611 . A C 1230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:90:1259,90,0 -chr6 3349660 . T G 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:263,18,0 -chr6 3349704 . C T 291.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:320,0,15 -chr6 3349774 . A T 1703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:99:1732,123,0 -chr6 3349912 . A G 1082.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:78:1111,78,0 -chr6 3351003 . T C 624.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:45:653,45,0 -chr6 3351782 . A G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.849;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:615,0,118 -chr6 3351876 . A G 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=1.398;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:612,0,664 -chr6 3351889 . C A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=1.359;DP=67;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:610,0,664 -chr6 3351921 . T G 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=-1.733;DP=53;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:610,0,664 -chr6 3352105 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=1.231;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=26.21;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:99:369,0,6068 -chr6 3352115 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,0:0:99:400,0,6066 -chr6 3352193 . C A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.276;ClippingRankSum=-0.786;DP=188;FS=15.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,25:88:99:400,0,6066 -chr6 3352201 . C G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-2.537;DP=254;FS=27.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=1.46;ReadPosRankSum=2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,26:115:99:400,0,6066 -chr6 3367888 . TCC T 214.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:19:252,19,0 -chr6 3529356 . GAGGTGAGATGATGATAATCATGTAAAATATGCTGATTTCCCATCGCCAATTCAGATGAATGATATGATTGTCCATATTTCTGTGTGTTC G 12896.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=-0.683;DP=344;FS=6.110;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=31.30;ReadPosRankSum=-0.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,341:343:99:12934,1205,0 -chr6 3673731 . CAGGTTTGTATCTGGAACATACACATTTATTGATTCGAAGAAGTGCTTAGCTAATACTGCTGCTAATGGGTTTTTTATTGCTTTCCTCTGCTCTCCAT C 1020.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=1.297;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.980;QD=31.52;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1058,0,1150 -chr6 3679833 . C CT 947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.112;DP=283;FS=4.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,72:261:99:985,0,5104 -chr6 3717098 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr6 3761118 . C A 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.665;DP=38;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,22:38:99:760,0,548 -chr6 3761793 . G A 1415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1444,111,0 -chr6 3764242 . C T 1350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,44:44:99:1379,0,1359 -chr6 3764269 . T C 1609.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1638,123,0 -chr6 3764354 . G A 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,38:38:99:1334,0,1383 -chr6 3767025 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.382;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=18.40;ReadPosRankSum=-0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,19:34:99:654,0,527 -chr6 3775057 . G T 364.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:393,27,0 -chr6 3831533 . A T 871.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.530;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.790;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:900,0,887 -chr6 3831696 . A C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=2.776;DP=68;FS=10.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=4.66;ReadPosRankSum=-4.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,17:68:99:345,0,2024 -chr6 3831776 . C CA 371.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=-2.424;DP=152;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,34:135:99:409,0,2497 -chr6 4088074 . A T 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr6 4113146 . T C 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 -chr6 4113988 . ACAGGTGAGGACACGGTGGCTGGTTTACAGAGCCGTGAATCTGAATCCAGGTTCAGACCGTTTCCTGTTTGTCCTG A 1442.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.168;DP=32;FS=3.452;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1480,132,0 -chr6 4196566 . C G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.986;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=13.18;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:371,0,511 -chr6 4200876 . G A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.675;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=17.75;ReadPosRankSum=1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:401,0,298 -chr6 4232335 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.915;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:352,0,502 -chr6 4240879 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.722;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.646;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:323,0,359 -chr6 4243947 . A G 874.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=-0.085;DP=73;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:903,0,1445 -chr6 4257049 . A G 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.917;DP=66;FS=3.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,20:65:99:453,0,1685 -chr6 4427678 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:238,0,128 -chr6 6148540 . C T 1998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=-0.414;DP=373;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.124;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,92:370:99:2027,0,12792 -chr6 6189996 . AAGGTTTGTTACCTGTTAGTCTCAATTGTCTTTAGCAGCTCCAGGTTTTCAGGAGTTGATCTTTAAGTTGTTTCTCTTGATCTTT A 15496.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-1.201;DP=359;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,358:359:99:15534,1245,0 -chr6 6192800 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-0.704;DP=46;FS=4.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:353,0,1206 -chr6 6198024 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=-0.198;DP=55;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:386,0,1606 -chr6 6415575 . C T 803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.881;DP=114;FS=1.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.550;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,33:113:99:832,0,3020 -chr6 6456796 . C G 1559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=1.491;DP=211;FS=3.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.323;QD=7.39;ReadPosRankSum=-1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,62:211:99:1588,0,5580 -chr6 6456953 . C T 3051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.468;DP=267;FS=8.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,93:267:99:3080,0,6029 -chr6 6458730 . G A 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.400;DP=167;FS=5.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,50:167:99:1304,0,4549 -chr6 6704066 . T C 1352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.679;DP=212;FS=6.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,57:210:99:1381,0,5949 -chr6 6705573 . T A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,0:4:99:412,0,2304 -chr6 6712507 . CT C 1183.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.008;DP=165;FS=9.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,54:150:99:1221,0,3203 -chr6 6719798 . C A 1347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=1.175;DP=114;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=11.82;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,41:114:99:1376,0,2455 -chr6 6722155 . TGGTATCCAGCATTTATTTGACTATATCGATGCCTTTCCATCATCTTCGAGAGCATTATGAAATTTCTTGATTGTTCTTAATACAGCATAAATTGTTTTGGGACATAGAACAGTTTGGCTGTTGTTCTTTCTTCATTTCTCA T 4918.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=2.837;DP=150;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=32.79;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,118:150:99:4956,0,9646 -chr6 6750137 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:285,0,325 -chr6 6852938 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.088;DP=33;FS=5.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=10.33;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:369,0,822 -chr6 6883936 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.600;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.835;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:277,0,129 -chr6 6890135 . G A 1895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-1.926;DP=30;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.561;QD=33.25;ReadPosRankSum=1.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:1924,0,2305 -chr6 6890153 . G A 13130.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=-0.550;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,20:35:99:13159,923,0 -chr6 6890898 . GCCTGCAAACAAAAGATGTCGTATCAAATGCATATCTGAATTATTGTGATCAAATTCTACATATTTTATTACCTAGTGACTACTAATGTTCTGCGAACTATAAGGTGGTGACAAAACTGGAAACCTA G 9685.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-1.157;DP=213;FS=4.322;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.404;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:211:99:9723,850,0 -chr6 6906156 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.921;DP=39;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:291,0,1024 -chr6 6906698 . G A 2429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=-1.948;DP=184;FS=5.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=13.21;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,70:183:99:2458,0,4147 -chr6 6907114 . T C 14891.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=-0.358;DP=333;FS=3.923;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=27.44;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,328:333:99:14920,1011,0 -chr6 6907118 . A G 14897.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=-0.331;DP=334;FS=4.011;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=31.56;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,329:334:99:14926,1011,0 -chr6 6907248 . GCCTGCAGGATTCAACACTGTGATTATTCAATGATCCTAAAGATAAAGCAAATATTTGAACCCAAGATTGTCTTA G 14966.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.402;DP=393;FS=2.974;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=33.18;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,369:371:99:15004,1125,0 -chr6 6912668 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.537;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:588,0,861 -chr6 6913481 . T G 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=-2.012;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.224;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:61:563,0,61 -chr6 6913561 . T G 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=-3.730;DP=44;FS=2.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,25:43:99:809,0,671 -chr6 6915742 . C G 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-2.887;DP=27;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=29.32;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:820,0,545 -chr6 6916268 . C CA 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.179;DP=53;FS=1.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,11:52:99:241,0,3028 -chr6 6916276 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=-0.419;DP=47;FS=3.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=4.57;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:99:243,0,3028 -chr6 6916632 . CT C 680.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=-0.291;DP=54;FS=13.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,30:41:58:719,0,58 -chr6 7300724 . C T 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.617;DP=58;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.48;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,22:58:99:694,0,1213 -chr6 7307996 . G T 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=1.185;DP=71;FS=3.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=11.48;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:843,0,1728 -chr6 7331262 . AG A 1178.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=1.270;DP=80;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,39:79:99:1216,0,1263 -chr6 7331680 . C T 868.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=-0.298;DP=81;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.73;ReadPosRankSum=1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:897,0,1501 -chr6 7355229 . T C 1553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.885;ClippingRankSum=-2.143;DP=185;FS=3.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.928;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,60:185:99:1582,0,4471 -chr6 7376918 . A G 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.303;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=28.17;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:479,0,133 -chr6 7416144 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=1.216;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=14.94;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:327,0,365 -chr6 7546724 . G A 5511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.039;DP=343;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,159:342:99:5540,0,5918 -chr6 7547051 . AAGGTGAGGACAGGGTTGATTTTGTTTTGTTCTATTGGATATAAAACAATAAGTTTTACGTATTTGTGTTTGAACATC A 13491.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=2.978;DP=324;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.477;QD=27.29;ReadPosRankSum=-1.717 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,321:324:99:13529,1048,0 -chr6 7565039 . A G 4638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=1.269;DP=280;FS=3.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=16.57;ReadPosRankSum=-1.641 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,135:280:99:4667,0,4491 -chr6 7634222 . A T 4999.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-0.235;DP=421;FS=0.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.765;QD=11.88;ReadPosRankSum=3.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:272,149:421:99:5028,0,9346 -chr6 7675524 . GCTACAGAGAGAGAGAAAAAGATTCAAAAATCAAACTTGCCCATTAGAATGGAGATACTCAATGTATTTCTTCCGCAC G 14076.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.698;DP=326;FS=1.920;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=28.79;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,315:319:99:14114,1012,0 -chr6 7784227 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=-0.872;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=17.72;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:294,0,255 -chr6 7789663 . T C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-1.545;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=23.88;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:458,0,197 -chr6 7800206 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=2.141;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.635;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:263,0,178 -chr6 7932701 . A G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.556;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:351,0,599 -chr6 7966034 . GGGTAAACAAACACGCAGAGTCACACAAAAAAAATGTAAATCTGACAAAATATGCAAGGTTTTCCACAGTCACTCTGTTGTTTCTTCA G 649.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=-0.306;DP=17;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=31.53;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:53:687,53,0 -chr6 8022269 . T C 2043.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.468;DP=135;FS=4.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.121 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,57:134:99:2072,0,2563 -chr6 8057971 . G A 4601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.026;DP=345;FS=1.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,139:345:99:4630,0,6787 -chr6 8241931 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=1.580;DP=11;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:261,0,105 -chr6 8452346 . C T 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=1.713;DP=25;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=15.87;ReadPosRankSum=-1.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:425,0,438 -chr6 8542273 . T C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.464;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.903;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:414,0,520 -chr6 8542321 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.812;DP=29;FS=1.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:409,0,538 -chr6 8542567 . A C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.836;DP=28;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:256,0,710 -chr6 8550536 . T G 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr6 8550614 . C G 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 -chr6 8566359 . T C 1391.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1420,107,0 -chr6 9133860 . T A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=-1.080;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:503,0,810 -chr6 9140277 . C T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.184;DP=57;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,26:57:99:906,0,1020 -chr6 9187106 . G GT 678.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.944;DP=97;FS=8.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,32:96:99:716,0,1640 -chr6 9197141 . G A 2132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.099;DP=135;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.776;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,67:135:99:2161,0,2255 -chr6 9198819 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=-0.346;DP=23;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.661;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:296,0,458 -chr6 9342179 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-1.249;DP=51;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.749;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:477,0,1285 -chr6 9415956 . G GA 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.387;DP=41;FS=8.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.055;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:299,0,427 -chr6 9416263 . AG A 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.022;DP=31;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.73;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:339,0,324 -chr6 9528782 . GA G 665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=-0.365;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:99:703,0,365 -chr6 9582156 . A C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.625;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:353,0,543 -chr6 9618148 . C T 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.823;DP=92;FS=8.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=14.42;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,40:92:99:1355,0,1655 -chr6 9618523 . G A 1184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.579;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,46:140:99:1213,0,3576 -chr6 9656032 . GA G 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-1.317;DP=18;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:281,0,171 -chr6 9656557 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:265,0,581 -chr6 9918983 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.488;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:579,0,2537 -chr6 9921544 . AT A 1234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.461;DP=133;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=2.224;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,54:128:99:1272,0,1571 -chr6 9926277 . AT A 1367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=-2.269;DP=178;FS=0.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,65:168:99:1405,0,2366 -chr6 9939831 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.242;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.298;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:285,0,743 -chr6 10502055 . G T 4015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.586;DP=107;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=29.07;ReadPosRankSum=2.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,37:67:99:4044,0,774 -chr6 10502069 . TA T 4006.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-0.539;DP=124;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.803;QD=32.31;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,56:83:99:4044,0,812 -chr6 10502127 . C T 2169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=-1.417;DP=164;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,62:100:99:2198,0,2941 -chr6 10502190 . T C 2727.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2756,193,0 -chr6 10502231 . C T 565.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.735;DP=28;FS=6.284;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.327;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:6:593,6,0 -chr6 10502304 . T A 409.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.731;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=34.13;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:2:436,2,0 -chr6 10652871 . A G 1547.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=1.611;DP=226;FS=7.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,63:224:99:1585,0,7750 -chr6 10652983 . C T 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.076;DP=340;FS=6.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.115;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:280,60:340:99:824,0,11413 -chr6 10655912 . A G 1722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.079;DP=448;FS=0.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:355,93:448:99:1751,0,14330 -chr6 10662154 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.810;DP=344;FS=3.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,56:343:99:599,0,11058 -chr6 10698631 . GACCTGTGGATGCAAACACAAATACAGATGACCAAAAAGACGATTTTGGGATCATCCTGTAAAAACCTGCACCTCCTTCAAT G 2090.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.554;DP=58;FS=2.526;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.089;QD=27.98;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:57:99:2128,126,0 -chr6 10724069 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.094;ClippingRankSum=1.087;DP=67;FS=7.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,12:67:99:276,0,3545 -chr6 10743980 . G A 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=1.445;DP=376;FS=5.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=1.73;ReadPosRankSum=2.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:316,60:376:99:679,0,11289 -chr6 10764906 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-2.976;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,24:95:99:536,0,2536 -chr6 10769180 . T C 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr6 10855321 . T C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-1.195;DP=33;FS=3.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:292,0,920 -chr6 10864693 . C T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=1.127;DP=51;FS=11.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.248;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:431,0,1313 -chr6 10990868 . TCTGTGAAAAGACACATCATTTCCAGGATTTAGACCTAGCCTTCCTTAAATGATCTTGAGGTGTCTTTACCGCTTTTAGAGATTTGGGAAGAAGCTATTCAC T 612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=1.694;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:91:99:650,209,0 -chr6 11049202 . G C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=15.25;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:257,0,285 -chr6 11196530 . C T 537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=-0.966;DP=67;FS=5.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.696;QD=8.03;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:566,0,1713 -chr6 11260766 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.927;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:264,0,2631 -chr6 11325550 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=1.220;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,13:69:99:237,0,4526 -chr6 11325552 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=1.036;DP=70;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,12:70:99:237,0,4526 -chr6 11395490 . A AGCAGGAGCT 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.082;ClippingRankSum=-1.304;DP=28;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:513,0,324 -chr6 11408242 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:235,0,58 -chr6 11698734 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.759;DP=198;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,33:198:99:421,0,6158 -chr6 11702925 . T G 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-1.358;DP=141;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,25:141:99:337,0,4624 -chr6 11912372 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=-1.067;DP=192;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,37:192:99:350,0,7398 -chr6 12211556 . G T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=4.476;DP=131;FS=7.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:869,0,3744 -chr6 12288322 . G A 980.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=-0.487;DP=38;FS=5.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=25.81;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,26:38:99:1009,0,342 -chr6 12289110 . G A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.752;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:380,0,54 -chr6 12289162 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=1.296;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=29.89;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:357,0,54 -chr6 12289312 . CAA C 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=-0.299;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.201;QD=15.72;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:273,0,269 -chr6 12377703 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:92:231,0,92 -chr6 12416029 . A T 740.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.507;DP=130;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,36:130:99:769,0,3417 -chr6 12416250 . C T 1632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-1.652;DP=111;FS=10.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,48:111:99:1661,0,2108 -chr6 12450999 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.343;ClippingRankSum=-0.521;DP=183;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,33:183:99:321,0,5543 -chr6 12463104 . G A 1816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-1.002;DP=107;FS=2.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.901;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,57:107:99:1845,0,1749 -chr6 12507260 . C G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.921;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:99:508,0,282 -chr6 12507469 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.082;DP=25;FS=18.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.638;QD=12.67;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:345,0,476 -chr6 12590854 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.788;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=15.49;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:276,0,287 -chr6 12594567 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.437;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,176 -chr6 12704964 . CAT C 889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=-0.361;DP=45;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.39;MQ0=0;MQRankSum=0.628;QD=19.77;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:927,0,229 -chr6 12705090 . T A 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.987;DP=50;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=31.32;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:99:1594,0,120 -chr6 12705316 . G A 1537.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=-0.235;DP=48;FS=6.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=32.04;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,40:48:99:1566,0,198 -chr6 12705571 . G A 1730.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=-1.206;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.934;QD=35.09;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:91:1759,91,0 -chr6 12705734 . G A 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-0.072;DP=15;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=30.25;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:75:482,0,75 -chr6 12707134 . T C 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=-0.627;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:255,0,950 -chr6 12707144 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-0.546;DP=35;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:251,0,892 -chr6 12707572 . T C 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=-0.064;DP=24;FS=1.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.826;QD=24.62;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:619,0,194 -chr6 12708325 . T C 277.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=34.73;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:306,0,17 -chr6 12709009 . G A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.707;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=26.36;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:898,0,249 -chr6 12709788 . C G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=2.016;DP=23;FS=6.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:328,0,387 -chr6 12710044 . T C 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=-1.599;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.746;QD=31.84;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:55:856,0,55 -chr6 12710402 . T A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.732;DP=31;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.488;QD=26.38;ReadPosRankSum=1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:846,0,146 -chr6 12719546 . G T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:231,0,67 -chr6 12770291 . C A 1618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.131;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=27.44;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,44:59:99:1647,0,388 -chr6 12777514 . G A 817.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=1.386;DP=26;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=31.45;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:25:846,0,25 -chr6 12777606 . G A 1193.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=1.063;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.441;QD=34.11;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:21:1222,0,21 -chr6 12777686 . T G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-2.353;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:413,0,279 -chr6 12778357 . G A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=2.637;DP=12;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=24.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:324,0,284 -chr6 12781265 . G T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr6 12782862 . A T 505.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=1.221;DP=18;FS=2.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=28.10;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:534,0,103 -chr6 12789237 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.942;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:99:813,0,115 -chr6 12809743 . A G 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-1.826;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=29.58;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,31:39:99:1182,0,183 -chr6 12834853 . C T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=-1.626;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:539,0,1096 -chr6 12835246 . C A 1413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.156;DP=49;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=28.85;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1442,0,218 -chr6 12905829 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:429,0,801 -chr6 12906476 . AT A 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.311;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:510,0,160 -chr6 12906704 . C T 1033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.980;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.282;QD=27.94;ReadPosRankSum=0.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1062,0,724 -chr6 12914564 . T C 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.793;DP=61;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=32.96;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:2039,0,249 -chr6 12914565 . G T 2010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=-0.747;DP=61;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.321;QD=32.96;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,49:57:99:2039,0,249 -chr6 13021778 . G A 1413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=-1.199;DP=50;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=28.28;ReadPosRankSum=0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,36:50:99:1442,0,971 -chr6 13021786 . A T 1413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=-2.273;DP=46;FS=2.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:1442,0,916 -chr6 13217611 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:329,0,100 -chr6 13218061 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:58:265,0,58 -chr6 13257109 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.181;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:287,0,561 -chr6 13315905 . AACCTGTGGGAAATGAAAGAAACTGGTGATATCGCTACTCAATAAGCCAACCCCAAAACCAAACCAAAACCTGAAGCTATTTGCTTGTAAAGGCTAATGGGGAACTC A 3549.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=1.209;DP=97;FS=2.238;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:3587,266,0 -chr6 13654720 . C CT 379.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=-1.673;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:417,0,512 -chr6 13944175 . AACCTATTTAAAACATGTGTTAATAGTGCTTGCTGGCTCAAAAAAGGGAATATAAAGAGTTTTGCTTCTATAACATACTG A 6491.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.576;DP=154;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=33.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,141:143:99:6529,559,0 -chr6 13998955 . G GT 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.498;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,25:82:99:416,0,1568 -chr6 14539526 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-1.419;DP=37;FS=1.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.51;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:269,0,953 -chr6 14852527 . A AT 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=-2.143;DP=197;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,48:172:99:554,0,2941 -chr6 15157231 . A C 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.980;DP=437;FS=4.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,80:426:99:1139,0,12874 -chr6 15200883 . C T 895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.042;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,2:30:99:924,0,956 -chr6 15200987 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=-1.779;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=22.59;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:751,0,1213 -chr6 15204197 . T G 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=-0.457;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=19.64;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:421,0,134 -chr6 15204467 . C T 1292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-1.659;DP=69;FS=3.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=18.74;ReadPosRankSum=2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1321,0,341 -chr6 15204556 . A G 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-2.062;DP=32;FS=10.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.769;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:406,0,418 -chr6 15506275 . GCCTGAAAGTAAATGTTCACAAATATATAGTGAGTTGCAAATCTGGAAGAAAGCAGATTTAAATGTAATTTTTTTAACTAATTATTTGAACGGTTCA G 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=1.776;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=26.45;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:434,0,2311 -chr6 15552190 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-1.498;DP=114;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,21:114:99:347,0,3673 -chr6 15572862 . T A 241.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:270,0,22 -chr6 15573922 . C G 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:774,54,0 -chr6 15927865 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=-0.467;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=16.73;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:229,0,235 -chr6 15963714 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-1.214;DP=37;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.393;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:260,0,1100 -chr6 16393560 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.603;DP=92;FS=5.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,16:92:99:241,0,2997 -chr6 16396001 . GT G 9005.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.716;DP=427;FS=2.394;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=21.09;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,348:394:99:9043,350,0 -chr6 16865530 . A T 1657.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1686,123,0 -chr6 16865932 . C T 1692.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1721,120,0 -chr6 16865957 . C T 1533.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1562,108,0 -chr6 16867268 . G A 561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:590,42,0 -chr6 16868341 . G A 1184.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1213,87,0 -chr6 16869471 . A T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=29.86;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:46:297,0,46 -chr6 16985718 . C A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 -chr6 17335173 . C T 723.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.446;DP=53;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:752,0,1102 -chr6 17569537 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.380;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,407 -chr6 17651875 . A C 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:27:360,27,0 -chr6 17651879 . A G 331.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:360,27,0 -chr6 17652028 . G T 502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:531,36,0 -chr6 17653972 . C T 708.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:737,51,0 -chr6 17654116 . A C 448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:477,36,0 -chr6 17654479 . T C 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-1.479;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=31.23;ReadPosRankSum=2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:78:531,0,78 -chr6 17654503 . A T 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=-1.059;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:351,0,386 -chr6 17654579 . T A 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-0.762;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:68:279,0,68 -chr6 17655729 . C G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=-0.985;DP=24;FS=12.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=18.45;ReadPosRankSum=-2.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:471,0,677 -chr6 17656243 . CTA C 338.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.07;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:376,28,0 -chr6 17656335 . A T 2167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:2196,154,0 -chr6 17656450 . G T 2878.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.086;DP=109;FS=7.382;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=26.41;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,69:74:99:2907,128,0 -chr6 17656463 . C T 3949.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:3978,284,0 -chr6 17718732 . A G 206.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.54;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:235,0,25 -chr6 17729978 . G A 250.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.88;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:279,0,14 -chr6 17734170 . C T 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-1.308;DP=34;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:755,0,131 -chr6 17734207 . A G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.436;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=11.73;ReadPosRankSum=1.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:697,0,693 -chr6 17756669 . A G 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.003;QD=25.89;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:313,0,55 -chr6 17758691 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.967;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:44:342,0,44 -chr6 17775300 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.362;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:241,0,650 -chr6 17851223 . C G 235.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:264,18,0 -chr6 17855859 . A AG 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=-2.444;DP=32;FS=6.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=26.40;ReadPosRankSum=2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,26:31:20:882,0,20 -chr6 17855871 . G C 1813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.801;DP=56;FS=7.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=32.39;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,46:53:56:1842,0,56 -chr6 18117593 . A G 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.086;DP=30;FS=3.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.291;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:382,0,637 -chr6 18117948 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.613;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:320,0,534 -chr6 18118280 . C CA 258.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.369;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=4.79;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:296,0,1023 -chr6 18119051 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.827;DP=24;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=8.82;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:240,0,682 -chr6 18119066 . T A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.882;DP=32;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.266;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:457,0,658 -chr6 18120093 . T A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=1.460;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.054;QD=10.64;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:390,0,794 -chr6 18120345 . A C 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.851;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:605,0,721 -chr6 18120710 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=-0.794;DP=57;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=7.87;ReadPosRankSum=1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:477,0,1481 -chr6 18121064 . A G 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.548;DP=52;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:478,0,2115 -chr6 18121100 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-1.878;DP=44;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:265,0,2167 -chr6 18540192 . T G 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=-0.337;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=8.41;ReadPosRankSum=0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:390,0,759 -chr6 18655548 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.106;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:306,0,831 -chr6 18684087 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=2.603;DP=42;FS=17.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:272,0,1207 -chr6 18684700 . TA T 2286.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:2324,163,0 -chr6 18733502 . C G 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=1.644;DP=18;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:290,0,385 -chr6 18733636 . T A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=8.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:242,0,324 -chr6 18733649 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=1.369;DP=13;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=17.75;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:259,0,211 -chr6 18735926 . TG T 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.364;QD=17.81;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:429,0,702 -chr6 18735928 . C A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=20.04;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:429,0,702 -chr6 19063416 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=-0.554;DP=76;FS=3.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=2.90;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,19:75:99:249,0,4092 -chr6 19171209 . A T 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-0.850;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:261,0,2691 -chr6 19171217 . G C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.806;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.330;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:261,0,2691 -chr6 19171459 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.687;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.894;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:398,0,1163 -chr6 19172004 . T A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=-1.507;DP=70;FS=7.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:360,0,2093 -chr6 19172131 . G A 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=-0.765;DP=72;FS=3.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.144;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,37:71:99:1148,0,1111 -chr6 19172344 . T A 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.243;DP=59;FS=4.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=31.01;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,48:59:99:1858,0,177 -chr6 19172567 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.031;DP=51;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:387,0,2722 -chr6 19172576 . C A 1067.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-0.389;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=19.07;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1096,0,1557 -chr6 19172601 . A G 1016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-1.245;DP=54;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.784;QD=18.83;ReadPosRankSum=2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,30:54:99:1045,0,837 -chr6 19172966 . T C 1305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-1.229;DP=69;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,39:69:99:1334,0,1056 -chr6 19173948 . T C 1487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.269;DP=52;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=28.61;ReadPosRankSum=-0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1516,0,214 -chr6 19173995 . T G 770.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-1.697;DP=56;FS=1.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=13.76;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:799,0,1065 -chr6 19176953 . G T 2509.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2538,186,0 -chr6 19179019 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=1.567;DP=44;FS=4.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,24:44:99:728,0,700 -chr6 19179080 . C G 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.476;DP=56;FS=9.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.181;QD=15.59;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,29:56:99:901,0,1086 -chr6 19179092 . A T 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=-0.589;DP=57;FS=6.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.785;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:373,0,1500 -chr6 19181642 . T C 2226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-1.057;DP=71;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=31.36;ReadPosRankSum=-0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,60:71:99:2255,0,124 -chr6 19183877 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=-0.738;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.214;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,19:68:99:413,0,1826 -chr6 19183904 . A C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.608;DP=69;FS=3.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:402,0,1876 -chr6 19184527 . A T 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=1.262;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=21.34;ReadPosRankSum=-0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1287,0,788 -chr6 19185176 . T C 2361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=1.561;DP=80;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=29.52;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,62:80:99:2390,0,348 -chr6 19185212 . G A 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.265;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,27:81:99:908,0,1837 -chr6 19185993 . A T 1348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.787;DP=71;FS=0.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=19.00;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,41:71:99:1377,0,1040 -chr6 19189309 . A G 1997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-0.627;DP=72;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,54:71:99:2027,0,348 -chr6 19189348 . A C 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=1.336;DP=61;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,32:61:99:1007,0,903 -chr6 19189387 . T C 1398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=2.508;DP=65;FS=5.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=21.52;ReadPosRankSum=0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,41:65:99:1427,0,822 -chr6 19191444 . T C 1318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=2.203;DP=60;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=21.98;ReadPosRankSum=-2.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,40:60:99:1347,0,650 -chr6 19191562 . T A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-1.430;DP=49;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=17.55;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,25:49:99:888,0,837 -chr6 19191970 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.079;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:323,0,558 -chr6 19192011 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.020;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=15.09;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:496,0,608 -chr6 19192176 . G T 2525.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=-0.112;DP=63;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.279;QD=31.23;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:99:2554,181,0 -chr6 19192474 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.461;DP=37;FS=5.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=22.94;ReadPosRankSum=-0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,24:37:99:877,0,455 -chr6 19192522 . A G 1555.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1584,117,0 -chr6 19192725 . G GT 325.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=-2.812;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,37:68:99:676,0,651 -chr6 19192772 . G A 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.551;DP=67;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:519,0,1719 -chr6 19192955 . T G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=-0.310;DP=77;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,25:77:99:687,0,1895 -chr6 19193257 . T C 1840.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1869,135,0 -chr6 19193598 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=-2.576;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.302;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,17:85:99:232,0,2997 -chr6 19193797 . A G 1768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=-0.472;DP=80;FS=0.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.11;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,46:80:99:1797,0,1099 -chr6 19193869 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=1.232;DP=83;FS=8.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:478,0,2408 -chr6 19194166 . C T 1228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.949;DP=112;FS=0.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,38:112:99:1257,0,2551 -chr6 19194214 . C A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.101;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=5.22;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,21:78:99:674,0,2150 -chr6 19194323 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.934;DP=62;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=3.29;ReadPosRankSum=-2.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:232,0,1827 -chr6 19194431 . T G 1724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1753,123,0 -chr6 19194440 . T A 1724.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:99:1753,123,0 -chr6 19194542 . T C 3093.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:3122,223,0 -chr6 19194568 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-0.759;DP=85;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:265,0,2663 -chr6 19194696 . T C 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-1.921;DP=90;FS=4.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.169;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:575,0,2518 -chr6 19194868 . T C 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.231;DP=40;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:759,0,676 -chr6 19195049 . A T 1710.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1739,125,0 -chr6 19195099 . A G 1313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.016;DP=43;FS=3.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=30.55;ReadPosRankSum=0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,35:43:99:1342,0,107 -chr6 19195318 . T C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.069;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,33:59:99:1119,0,1470 -chr6 19195438 . TA T 2790.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.98;MQ0=0;QD=30.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2828,260,0 -chr6 19195518 . A T 1549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=-0.678;DP=79;FS=1.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=19.62;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,45:79:99:1578,0,1225 -chr6 19195563 . T G 1252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.859;DP=73;FS=3.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,40:73:99:1281,0,1173 -chr6 19195690 . T C 1881.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1910,135,0 -chr6 19195816 . A C 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=2.355;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.079;QD=17.40;ReadPosRankSum=-1.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:99:672,0,661 -chr6 19196044 . A T 1386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1415,96,0 -chr6 19196050 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=-1.617;DP=35;FS=10.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=19.96;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:35:99:727,0,527 -chr6 19212499 . GA G 499.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=-0.108;DP=64;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:537,0,1052 -chr6 19212518 . A T 1967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.663;DP=60;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=32.80;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,52:60:37:1996,0,37 -chr6 19212612 . A G 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.195;DP=55;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=7.49;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:440,0,1549 -chr6 19212666 . A G 2050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2079,144,0 -chr6 19251094 . C T 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=-0.332;DP=72;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:484,0,1953 -chr6 19251124 . T C 3211.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:3240,232,0 -chr6 19251259 . G T 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=-0.459;DP=104;FS=2.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=8.85;ReadPosRankSum=1.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,34:103:99:949,0,2596 -chr6 19256078 . A T 1705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.986;DP=105;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=16.25;ReadPosRankSum=-1.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,50:104:99:1734,0,1773 -chr6 19286230 . A T 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.784;DP=41;FS=2.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:488,0,955 -chr6 19292332 . TC T 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=1.401;DP=47;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.47;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:334,0,3804 -chr6 19292341 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.832;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.412;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:346,0,3804 -chr6 19303241 . C T 2014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=-0.233;DP=244;FS=0.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.206;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,81:244:99:2043,0,6056 -chr6 19304162 . C A 2351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=-0.269;DP=301;FS=2.691;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,96:299:99:2380,0,7701 -chr6 19336775 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=1.161;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:448,0,826 -chr6 19355556 . A C 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=2.015;DP=29;FS=6.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.908;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:409,0,616 -chr6 19355812 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.455;DP=38;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:349,0,1040 -chr6 19356184 . C T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=1.162;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.161;QD=6.25;ReadPosRankSum=-1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:372,0,1569 -chr6 19357221 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.849;DP=27;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,683 -chr6 19357313 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.126;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1925 -chr6 19357314 . A G 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.335;DP=32;FS=3.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:266,0,1925 -chr6 19360282 . GCTGAGTTAAAAAAATATAGAATTACTTCATCAGAATGTGATATGCTTAGATTACTGTTCAAATGCATGTTCTCAC G 911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=2.648;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=30.39;ReadPosRankSum=-2.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:949,0,1447 -chr6 19366091 . A T 1562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.440;DP=108;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,45:108:99:1591,0,2185 -chr6 19366597 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=-0.432;DP=155;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.054;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,25:153:99:301,0,5224 -chr6 19367139 . C T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=1.076;DP=101;FS=7.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,26:101:99:572,0,2887 -chr6 19367151 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-0.322;DP=92;FS=3.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,17:92:99:271,0,2957 -chr6 19369481 . A G 1882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-2.270;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.039;QD=14.82;ReadPosRankSum=2.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,55:127:99:1911,0,2319 -chr6 19381244 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.755;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:530,0,2878 -chr6 19383638 . C A 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.218;DP=81;FS=13.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.653;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:505,0,2281 -chr6 19526306 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=-0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=29.16;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:91:349,0,91 -chr6 19527395 . G A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.880;DP=21;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:363,0,365 -chr6 19542634 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.211;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.902;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:235,0,437 -chr6 19545569 . TGTAAGCTGAACGATTAACAAATAAGTCAGTTTATGCTTGTTTTAAATAAAAAAAAATTCTTAATGTCAGTATTCATTTTAGAGTTCGTTGTGTGTTTCAG T 2491.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.761;DP=13;FS=2.522;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=21.07;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:99:2529,887,0 -chr6 19545849 . T A 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.141;DP=272;FS=5.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:233,39:272:99:333,0,9115 -chr6 19546225 . CA C 419.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.963;DP=36;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:457,0,643 -chr6 19548663 . C G 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=1.528;DP=31;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=17.73;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:578,0,513 -chr6 19548948 . G C 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=1.444;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=14.89;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:341,0,357 -chr6 19639583 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=19.52;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:321,0,222 -chr6 19654796 . A C 308.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.696;DP=15;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=20.59;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:337,0,16 -chr6 19665405 . G A 332.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=33.29;ReadPosRankSum=1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:361,0,14 -chr6 19705972 . T C 2712.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=1.117;DP=243;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,82:243:99:2741,0,5566 -chr6 19706013 . C CT 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-1.676;DP=213;FS=1.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,40:174:99:274,0,3351 -chr6 19706338 . C CT 384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=-1.291;DP=106;FS=8.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,25:97:99:422,0,2243 -chr6 19706418 . T TA 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-2.395;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=4.376;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:414,0,449 -chr6 19706610 . G T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=1.770;DP=363;FS=8.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=0.726;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,56:362:99:529,0,12121 -chr6 19781669 . G T 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=1.856;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=16.36;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:44:99:748,0,773 -chr6 19953817 . T C 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=-0.400;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=18.26;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:357,0,288 -chr6 20031724 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=2.370;DP=65;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=3.50;ReadPosRankSum=-1.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,14:65:99:256,0,2003 -chr6 20031962 . G C 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=-0.254;DP=73;FS=3.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1156,0,3296 -chr6 20031972 . C G 1127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=-0.620;DP=74;FS=1.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:1156,0,3243 -chr6 20198932 . C T 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-1.077;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,28:81:99:975,0,1890 -chr6 20198975 . A T 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-1.759;DP=154;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.882;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,37:154:99:846,0,4565 -chr6 20199302 . T TA 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.279;DP=103;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=3.78;ReadPosRankSum=-2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,30:85:99:427,0,1055 -chr6 20238062 . C T 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=-1.319;DP=59;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:850,0,1233 -chr6 20261731 . T C 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-1.474;DP=52;FS=1.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:395,0,1433 -chr6 20292506 . G A 654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=-0.239;DP=98;FS=1.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,27:98:99:683,0,2808 -chr6 20296129 . A T 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=-3.152;DP=93;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=10.97;ReadPosRankSum=3.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:93:99:1048,0,1767 -chr6 20298499 . T G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.238;DP=61;FS=5.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=6.00;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:394,0,1785 -chr6 20366268 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=14.65;ReadPosRankSum=-1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:248,0,301 -chr6 20367199 . A T 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:333,0,251 -chr6 20370711 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=-0.910;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:268,0,242 -chr6 20375842 . TCTGAAACAGTACACATCTAACTGTCACAGCAGAAATGACATCTTATATCTTGTCTAAAGCTCATCGATTGGTCGTAC T 925.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=-0.248;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.569;QD=31.98;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:89:963,89,0 -chr6 20452134 . G A 852.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:881,60,0 -chr6 20583016 . TCCTTAAATACACAAGAACAGGAGAATGCTGAAGACTGAGCTCACATTTCATACGATTTACTCGTATAAAATATCTGTA T 1686.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.878;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=30.05;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:99:1724,160,0 -chr6 20593477 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=-0.686;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:279,0,913 -chr6 20604663 . CTT C 627.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.095;DP=36;FS=4.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:665,0,549 -chr6 20893344 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:253,0,391 -chr6 20904771 . A G 7167.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=0.401;DP=182;FS=4.402;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=33.64;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,170:173:99:7196,509,0 -chr6 20904877 . T A 10364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,239:239:99:10393,725,0 -chr6 20905505 . G GT 505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:543,52,0 -chr6 20905546 . T C 4031.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.11;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4060,292,0 -chr6 20905606 . C T 6936.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=-0.231;DP=179;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=29.13;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,171:174:99:6965,503,0 -chr6 20905681 . A G 6934.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,158:158:99:6963,490,0 -chr6 20905815 . A G 323.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:352,30,0 -chr6 20905930 . A G 8863.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,210:210:99:8892,632,0 -chr6 20905970 . T C 6313.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.748;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=25.59;ReadPosRankSum=0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,153:156:99:6342,451,0 -chr6 20906329 . C T 3966.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-0.442;DP=197;FS=3.949;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.284;QD=20.14;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,93:96:99:3995,280,0 -chr6 20906336 . T TA 3991.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.297;DP=245;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.026;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:4029,360,0 -chr6 20906441 . A G 3218.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:3247,226,0 -chr6 20906450 . C G 1928.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.645;DP=78;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=24.73;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:1957,138,0 -chr6 20906612 . T A 6561.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=-1.559;DP=215;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.730;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,158:160:99:6590,475,0 -chr6 20906632 . T A 5468.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,129:129:99:5497,388,0 -chr6 20906695 . C T 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 -chr6 20906702 . G A 691.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:720,48,0 -chr6 20908298 . C G 3697.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.930;DP=124;FS=18.445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=29.82;ReadPosRankSum=-1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,86:90:99:3726,259,0 -chr6 20908543 . T C 2368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2397,166,0 -chr6 20908549 . C G 1752.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=2.231;DP=57;FS=4.393;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=30.75;ReadPosRankSum=-2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:99:1781,129,0 -chr6 20908724 . G T 7382.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.420;DP=271;FS=1.872;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=27.24;ReadPosRankSum=1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,185:189:99:7411,545,0 -chr6 20908755 . G A 4000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:4029,292,0 -chr6 20908834 . T A 530.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:559,42,0 -chr6 20908956 . T C 11057.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=358;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,268:268:99:11086,806,0 -chr6 20909027 . C T 3768.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=1.622;DP=118;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:3797,274,0 -chr6 20909059 . A C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr6 20909165 . G C 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=-0.520;DP=24;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=34.62;ReadPosRankSum=-2.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:99:859,0,135 -chr6 20909218 . T G 7638.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.074;DP=170;FS=3.162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=30.81;ReadPosRankSum=-0.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:118:99:7667,526,0 -chr6 20909280 . T C 4845.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.953;DP=196;FS=4.314;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.720;QD=24.72;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,117:129:83:4874,83,0 -chr6 20909569 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr6 20909592 . C T 2925.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=1.383;DP=132;FS=6.384;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.117;QD=22.16;ReadPosRankSum=-1.050 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,72:74:99:2954,217,0 -chr6 20909616 . A C 5418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=186;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5447,379,0 -chr6 20909739 . T G 17364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=389;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,339:339:99:17393,1207,0 -chr6 20909775 . T C 9083.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.783;DP=288;FS=2.803;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=31.54;ReadPosRankSum=0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,219:221:99:9112,644,0 -chr6 21030537 . C A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.055;DP=35;FS=1.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:286,0,1020 -chr6 21373954 . TCCTGTAAAAAAATTTAAAAACTGTAGTATCACAGGACTAATTCAATGAGGCATACTGACTGTAAATTCTTA T 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=2.143;DP=18;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=30.99;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:595,0,816 -chr6 21476316 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-3.548;DP=102;FS=32.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,30:82:99:1055,0,1766 -chr6 21476721 . G A 1424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.488;DP=103;FS=2.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=13.83;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,41:103:99:1453,0,2142 -chr6 21477680 . A G 3192.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-1.233;DP=149;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.397;QD=21.43;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,89:149:99:3221,0,1973 -chr6 21477766 . G A 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.627;DP=181;FS=0.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,55:179:99:1456,0,4627 -chr6 21477939 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.429;DP=168;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,35:164:99:675,0,5670 -chr6 21478442 . A T 1353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=-0.335;DP=62;FS=6.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,39:62:99:1382,0,830 -chr6 21566558 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.151;DP=91;FS=4.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:513,0,3131 -chr6 21639978 . A G 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.489;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.111;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:366,0,311 -chr6 21645091 . C T 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.592;DP=44;FS=6.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:655,0,852 -chr6 21663480 . T A 1069.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.546;DP=65;FS=3.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:65:99:1098,0,1184 -chr6 21667213 . A G 944.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-2.607;DP=56;FS=3.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:56:99:973,0,2028 -chr6 21724163 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.964;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:252,0,878 -chr6 22451746 . G GA 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=-0.311;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:244,0,839 -chr6 23075297 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.209;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:259,0,1427 -chr6 23077318 . T A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=-0.879;DP=43;FS=7.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:490,0,850 -chr6 23156400 . CT C 617.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=-0.308;DP=41;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:655,0,325 -chr6 23156402 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.877;DP=41;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:264,0,1013 -chr6 23210952 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.324;DP=323;FS=3.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=1.71;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,53:323:99:581,0,10319 -chr6 23211115 . G A 5857.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=2.306;DP=479;FS=5.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=12.23;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,176:478:99:5886,0,10257 -chr6 23216759 . T C 5313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.581;DP=447;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,157:447:99:5342,0,9604 -chr6 23256589 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=-1.034;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,244 -chr6 23256590 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=-1.398;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:282,0,244 -chr6 23267485 . C A 3347.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.927;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=32.20;ReadPosRankSum=-2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,55:64:89:3376,89,0 -chr6 23267603 . G A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=1.663;DP=59;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=10.39;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:641,0,3788 -chr6 23267612 . G C 607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.736;DP=61;FS=3.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,21:59:99:636,0,3788 -chr6 23267776 . T G 1709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1738,123,0 -chr6 23268262 . T A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=2.371;DP=38;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=8.81;ReadPosRankSum=-1.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:363,0,1020 -chr6 23268645 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-0.561;DP=59;FS=6.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.686;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:296,0,1914 -chr6 23269076 . G T 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.684;DP=44;FS=6.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:519,0,1060 -chr6 23269220 . A T 1238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.016;DP=41;FS=3.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.339;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,32:41:99:1267,0,177 -chr6 23273612 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-1.369;DP=31;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.40;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=15.44;ReadPosRankSum=1.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:507,0,594 -chr6 23280829 . ACTAAGATAACATATACCATAAATAACAAGAGTGTGAACCAGTTCACGTTATTAATGATTAGTATCTTAATGTTTAATGTGTATTAAAAACAAAAAC A 2327.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=3.293;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.334;QD=31.00;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,52:56:99:2365,194,0 -chr6 23286861 . T A 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.032;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:310,0,1517 -chr6 23377921 . G T 7347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.021;DP=399;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=18.42;ReadPosRankSum=2.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,219:398:99:7376,0,6367 -chr6 23378956 . C A 3677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=-3.210;DP=180;FS=2.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.399;QD=20.43;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,87:148:99:3706,0,1636 -chr6 23400527 . T C 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.245;DP=47;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.695;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:805,0,803 -chr6 23491772 . C T 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-1.356;DP=49;FS=1.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:394,0,1248 -chr6 23540997 . CAA C 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.400;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.489;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:300,0,407 -chr6 23541426 . GT G 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=1.531;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:20:468,20,0 -chr6 23545858 . T G 1543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=-0.969;DP=178;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,57:177:99:1572,0,8106 -chr6 23546231 . T A 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=1.100;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=10.50;ReadPosRankSum=2.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,36:93:99:1005,0,2835 -chr6 23546620 . G A 1481.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=-0.977;DP=182;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,57:182:99:1519,0,4786 -chr6 23546792 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=4.171;DP=201;FS=11.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,35:201:99:505,0,6550 -chr6 23559801 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=-1.439;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:326,0,887 -chr6 23560073 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.564;DP=75;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,14:75:99:237,0,2329 -chr6 23561243 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.622;DP=47;FS=1.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:270,0,1341 -chr6 23562506 . TA T 301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.902;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:339,0,568 -chr6 23614547 . C T 935.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.533;DP=48;FS=4.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=19.50;ReadPosRankSum=-0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,28:48:99:964,0,723 -chr6 23680790 . G A 1303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.165;DP=75;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,35:75:99:1332,0,2857 -chr6 23702542 . A G 227.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:256,0,21 -chr6 23702722 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=-0.250;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:589,0,122 -chr6 23702723 . C A 815.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:844,57,0 -chr6 23702830 . C T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.896;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.685;QD=17.07;ReadPosRankSum=1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:438,0,140 -chr6 23702894 . A T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr6 23703332 . G A 687.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:716,51,0 -chr6 23706581 . C T 352.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:381,27,0 -chr6 23719317 . A C 879.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=-1.220;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:69:99:908,0,1482 -chr6 23727028 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.320;DP=43;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:307,0,1123 -chr6 23727042 . T A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.076;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:490,0,883 -chr6 23727339 . A AT 1385.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.49;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1423,120,0 -chr6 23727385 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.541;DP=29;FS=4.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:267,0,730 -chr6 23778015 . T G 1204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=1.788;DP=69;FS=8.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=17.46;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,40:68:99:1233,0,2204 -chr6 23786293 . T TA 815.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.548;DP=55;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=14.83;ReadPosRankSum=-2.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,35:53:99:853,0,398 -chr6 23789468 . AT A 828.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.270;DP=64;FS=3.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,35:62:99:866,0,640 -chr6 23789532 . CTT C 1054.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=-1.847;DP=85;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=1.021;QD=12.41;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,42:79:99:1349,0,1160 -chr6 23793983 . A G 1253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=-0.081;DP=238;FS=3.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,59:238:99:1282,0,6777 -chr6 23797936 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=-0.473;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,20:101:99:347,0,2908 -chr6 23803784 . CT C 270.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:308,28,0 -chr6 23804406 . C T 1062.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=1.371;DP=93;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.120;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,32:93:99:1091,0,2228 -chr6 23805209 . A G 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.813;DP=49;FS=2.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:392,0,1392 -chr6 23868786 . A G 2528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:99:2557,184,0 -chr6 23868803 . A G 2528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:99:2557,184,0 -chr6 23869030 . A G 3768.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=1.530;DP=148;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.780;QD=25.46;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,98:140:99:3797,0,1084 -chr6 23869050 . T G 3473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:83:99:3502,250,0 -chr6 23988220 . T A 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr6 23988542 . T A 863.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-1.191;DP=67;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=12.89;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:901,93,0 -chr6 23988614 . G A 711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:51:740,51,0 -chr6 23989082 . G A 1020.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=-2.736;DP=49;FS=11.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.821;QD=20.83;ReadPosRankSum=3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,29:49:99:1049,0,733 -chr6 23989125 . G C 1710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=-0.794;DP=82;FS=14.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=20.86;ReadPosRankSum=-1.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:99:1739,0,1153 -chr6 23989198 . C T 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=-5.161;DP=54;FS=27.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.270;QD=23.18;ReadPosRankSum=5.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,33:50:99:1280,0,1617 -chr6 23989438 . G T 511.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:540,36,0 -chr6 23989439 . C T 493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:522,36,0 -chr6 23989588 . A T 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr6 23989714 . A G 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 -chr6 23989732 . G A 242.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=22.04;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:8:270,0,8 -chr6 23989842 . G T 703.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:732,51,0 -chr6 23990297 . G T 1820.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:99:1849,144,0 -chr6 23990308 . T TA 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=1.648;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:461,0,753 -chr6 23990490 . G T 4228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=-1.246;DP=148;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.423;QD=28.57;ReadPosRankSum=2.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,102:124:99:4257,0,1027 -chr6 23990493 . G A 4228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.200;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=30.21;ReadPosRankSum=1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,99:117:99:4257,0,969 -chr6 23990847 . C T 3084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.913;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.543;QD=21.88;ReadPosRankSum=0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,84:119:99:3113,0,921 -chr6 23990932 . G T 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 -chr6 23991077 . A G 951.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=6.094;DP=126;FS=18.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:55:99:980,0,1005 -chr6 23991375 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr6 23991498 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=15.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:285,0,53 -chr6 23993586 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-5.034;DP=133;FS=15.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.792;QD=2.71;ReadPosRankSum=3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:388,0,1500 -chr6 23993624 . G T 1011.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:75:1040,75,0 -chr6 23993636 . T C 733.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:77:762,0,77 -chr6 23994011 . A G 8751.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=249;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,194:194:99:8780,624,0 -chr6 23994130 . A G 3685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.905;ClippingRankSum=3.388;DP=126;FS=110.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.305;QD=29.25;ReadPosRankSum=-2.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,95:124:99:3714,0,520 -chr6 23994161 . A G 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=4.249;DP=33;FS=3.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=13.02;ReadPosRankSum=-4.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:458,0,521 -chr6 23994164 . T A 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=-3.050;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=25.89;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:90:572,0,90 -chr6 23994315 . A G 239.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:268,18,0 -chr6 24014732 . A T 1746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=2.531;DP=265;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=6.59;ReadPosRankSum=3.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:191,74:265:99:1775,0,7057 -chr6 24033882 . GAGGTAAATGTTCTGTCATTACAACTTTAGGATGGGTGAATACCTGAGGTTAAATACATTTTTAAGAATCCCCTGTTGTTTAATTGCTTTTTGCT G 16313.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.579;DP=407;FS=2.053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.784;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,403:407:99:16351,1425,0 -chr6 24039377 . ACTGTAAAGTACGACAACCAAAAATGTAAGAAAAAGAACCCATTACAAGAATGAGAATAAACAACATCAACAAAAAAACATAC A 2415.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.908;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.797;QD=28.09;ReadPosRankSum=1.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2453,214,0 -chr6 24153870 . T C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr6 24158587 . T C 329.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:358,24,0 -chr6 24158689 . C G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr6 24159598 . T C 862.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:891,63,0 -chr6 24159702 . G C 373.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:402,27,0 -chr6 24162282 . G T 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr6 24169740 . T A 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.501;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=33.65;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:45:1105,0,45 -chr6 24169797 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=1.611;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=20.91;ReadPosRankSum=-2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:36:300,0,36 -chr6 24169945 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:48:324,0,48 -chr6 24169948 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:48:324,0,48 -chr6 24170069 . A T 1502.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1556,110,0 -chr6 24170168 . G T 837.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=1.576;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.946;QD=31.45;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:866,63,0 -chr6 24171280 . T C 808.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=-1.419;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=33.70;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:837,63,0 -chr6 24171288 . T A 1402.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1431,99,0 -chr6 24171403 . T A 743.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:772,54,0 -chr6 24171424 . A T 1086.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1115,78,0 -chr6 24171509 . C T 932.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:961,66,0 -chr6 24171586 . T A 220.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.60;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:249,0,25 -chr6 24171850 . C T 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.264;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:718,0,984 -chr6 24173714 . C A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=-1.513;DP=20;FS=4.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.439;QD=18.04;ReadPosRankSum=0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:389,0,346 -chr6 24173781 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=-1.022;DP=21;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:293,0,554 -chr6 24173831 . T A 940.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=1.898;DP=27;FS=3.961;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=34.85;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:5:968,5,0 -chr6 24173957 . T A 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=-1.475;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:926,0,476 -chr6 24175056 . C T 447.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:476,33,0 -chr6 24175588 . T C 230.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:259,18,0 -chr6 24176128 . TCA T 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=27.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:73:288,0,73 -chr6 24222236 . G A 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:539,39,0 -chr6 24222331 . G A 592.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:621,48,0 -chr6 24224524 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,215 -chr6 24304406 . G A 625.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:654,45,0 -chr6 25117086 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr6 25117171 . G A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:746,51,0 -chr6 25313066 . C T 210.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:15:239,0,15 -chr6 25313074 . C T 210.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:239,0,15 -chr6 25473324 . T A 362.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:391,27,0 -chr6 25668804 . A AT 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.052;DP=84;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,25:72:99:482,0,938 -chr6 25687385 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-0.257;DP=87;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.263;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,18:87:99:301,0,2706 -chr6 25798433 . G T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.297;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=5.12;ReadPosRankSum=2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:233,0,1177 -chr6 25798504 . A ATT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.758;DP=31;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:374,0,415 -chr6 26583228 . A G 732.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=-0.391;DP=328;FS=5.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:269,58:327:99:761,0,10285 -chr6 26583768 . CA C 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-1.672;DP=335;FS=3.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:259,60:319:99:434,0,7753 -chr6 26584108 . CA C 4393.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=-0.268;DP=284;FS=21.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=15.47;ReadPosRankSum=-5.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,57:269:99:4431,0,5776 -chr6 26586228 . G A 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.057;DP=413;FS=3.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=3.08;ReadPosRankSum=3.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:332,81:413:99:1301,0,12483 -chr6 26600405 . C T 1077.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=1.378;DP=347;FS=5.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,67:346:99:1106,0,10760 -chr6 26600532 . GCTAATGAAGAGATATTCGTCATTTATTTTGCCAGATAATTGTTACTTCCAAATCTAAACAGTCACAACCACCACTCAC G 1408.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=355;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=3.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,324:324:99:1446,527,0 -chr6 26716746 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.158;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=15.92;ReadPosRankSum=-2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,307 -chr6 26796644 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.272;DP=18;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.04;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,407 -chr6 26800466 . ACAGGTTATCAAGTGTGAAACATTGAATGTTTTGTGATGTTGTGTTTGGGTTTTGCTCCTAACATGGTTTTCATTTTGGGTTG A 2819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.186;DP=91;FS=4.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=30.99;ReadPosRankSum=0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,73:84:46:2857,0,46 -chr6 26812340 . AAGGTGCTCATATCATATTTTTTATTTAAATAGCCTCCACTTGTGGATCTTTTATTCACTTTGGTTTTTCTCTTCAAC A 2453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=6.087;DP=105;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=23.37;ReadPosRankSum=-1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,70:105:99:2491,0,13071 -chr6 26812747 . C T 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-1.609;DP=74;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.821;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:328,0,2179 -chr6 26821593 . TCTGTAAGACAATATTTTTTTCAGTGCTTATTTGATATGTATCTTATATAAGGCCTGTTATGATGTGCCAAC T 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:257,0,506 -chr6 26860245 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.217;DP=23;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.279;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:325,0,434 -chr6 26875880 . G T 241.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:20:270,0,20 -chr6 26919670 . T C 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:774,54,0 -chr6 26919712 . A G 866.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:895,69,0 -chr6 26928749 . C T 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=-1.790;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=10.36;ReadPosRankSum=-2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,12:35:99:391,0,834 -chr6 26980125 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.868;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=14.18;ReadPosRankSum=1.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:241,0,332 -chr6 26980176 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.417;DP=24;FS=6.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=11.78;ReadPosRankSum=-0.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:311,0,633 -chr6 26992962 . TGTAAGTCTGGTTTCTGCCTTATTTTAGCAAACATTTCAGCTGACAATAATTTAGCCTAGCTAGTTGTAATAATTTTTTTTTTAATTTTCCATTTTCAACTTCTAG T 1137.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=1.740;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:96:1175,96,0 -chr6 26997306 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=-1.202;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:262,0,770 -chr6 27223033 . G A 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.315;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:280,0,1439 -chr6 27307054 . C T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.683;DP=108;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,21:108:99:385,0,4065 -chr6 27321888 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=-1.230;DP=113;FS=3.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.351;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,23:113:99:415,0,3336 -chr6 27322784 . A T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=-2.164;DP=80;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.200;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:315,0,2434 -chr6 27323309 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-1.879;DP=52;FS=5.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:283,0,1582 -chr6 27706557 . C A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.404;DP=229;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.944;QD=3.64;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,47:225:99:862,0,6675 -chr6 27709105 . G T 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=-1.887;DP=99;FS=10.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.758;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,21:98:99:438,0,3014 -chr6 27745365 . G A 611.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-1.213;DP=42;FS=2.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=14.57;ReadPosRankSum=2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:640,0,844 -chr6 27914670 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=-0.066;DP=400;FS=0.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:343,57:400:99:423,0,13454 -chr6 27915568 . C T 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.011;DP=353;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.275;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,50:353:99:376,0,11935 -chr6 28811180 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-0.775;DP=23;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:370,0,461 -chr6 28811185 . G A 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:344,0,460 -chr6 28866294 . TCTGTGAAGAATAAAAGTTAGACAGTGAACTAATAATGTATAGCATAGGGTCAGATTAAAGTTGTTACATTTATTCAGCCCAAGGGTACGTAC T 3048.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=2.443;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=29.97;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,76:81:38:3086,38,0 -chr6 29049774 . GCTGAAGAAGAAAAAAATTATTAAACAATAACTAAGACAACAACTTATCCAAGAAAATTAATGCAGAAAGGTGGCGTAC G 4527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=1.558;DP=103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.084;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,98:103:99:4565,368,0 -chr6 29105410 . TGTAAGTTATCAAAGCTATCATTAATGGAGATATGTGAAGAAAATCTTAAATGTTGCAATTTGTGATTTCAG T 13081.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=-0.458;DP=296;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=32.77;ReadPosRankSum=1.527 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,286:293:99:13119,1106,0 -chr6 29109333 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.321;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:386,0,517 -chr6 29109375 . ATTTTATTTTTTTT A,ATTTTTATTTTTTTT 247.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.91;MQ0=0;QD=20.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,7,4:11:99:353,128,646,239,0,232 -chr6 29831290 . TG T 1496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=-1.743;DP=48;FS=5.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=31.18;ReadPosRankSum=0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,39:48:99:1534,0,561 -chr6 29831292 . AAGGTAAAAAGCTGTAGAACTAGTTATAGTTGTCATGTATAGAAAAAGTCTAACACCAAGTTGTTGATGTATATG A 1496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=-1.593;DP=50;FS=5.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=29.93;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,38:49:99:1534,0,617 -chr6 30120069 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=-0.225;DP=134;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,21:133:99:233,0,4419 -chr6 30121528 . T A 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=-1.912;DP=110;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,24:109:99:475,0,3340 -chr6 30268829 . TGTAAGTATACTTATCTTAATATCAAATATTTCACTCATGTTCTTTTAATATTGCAGGTACTTTACACTTTACGCACATTTGTCATTATCTCCATGTTGCTCTCTCTCAG T 1255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=1.842;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=29.90;ReadPosRankSum=-0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1293,0,1018 -chr6 30367221 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.718;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.023;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:244,0,832 -chr6 30547615 . TCCTGTTACAGAAAGAAGCATCATTAGTACATTTCGCTACAACGTTTGTTGAAATTTGTGGAAAGTCACCATAGGCAACTGAACAGAACTGA T 4548.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=2.312;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.863;QD=30.65;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,105:107:99:4586,409,0 -chr6 30877279 . C A 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=1.550;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:371,0,572 -chr6 31102616 . G A 855.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-0.970;DP=143;FS=0.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.786 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,38:142:99:884,0,3836 -chr6 31118991 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.789;DP=115;FS=10.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=1.79;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,21:114:99:234,0,6203 -chr6 31119886 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:331,0,360 -chr6 31120290 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.758;DP=22;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:353,0,522 -chr6 31120313 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=-0.630;DP=25;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=13.79;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:373,0,788 -chr6 31120552 . T C 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.282;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,17:61:99:399,0,1939 -chr6 31120940 . G A 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=-1.266;DP=39;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:300,0,922 -chr6 31316277 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-0.384;DP=78;FS=4.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,23:78:99:608,0,2069 -chr6 31464384 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=-0.344;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.851;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:386,0,677 -chr6 31466598 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.354;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:309,0,472 -chr6 31473292 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=1.151;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:247,0,1531 -chr6 32088959 . GAGGTATTTGATTTGGTTTACATTTTCCATTTATTTTTTTTACACGTTTAACCTTCGCTGTTGTAACAATTCTGTTTAAATTTC G 5779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.872;DP=141;FS=3.297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.585;QD=27.82;ReadPosRankSum=0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,140:141:99:5817,470,0 -chr6 32095766 . C T 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-1.226;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.614;QD=19.13;ReadPosRankSum=-2.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:296,0,667 -chr6 32095776 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.530;DP=15;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:296,0,667 -chr6 32175484 . A T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.320;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:316,0,1171 -chr6 32398709 . CA C 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-0.849;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:71:286,0,71 -chr6 32792874 . C A 546.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.554;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=10.32;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:575,0,1394 -chr6 33361121 . T C 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.811;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=13.78;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:244,0,303 -chr6 33365677 . ACTGAAGTGGATAAATTAGATACAAACCATTACTGGAACAGCAAACATATTTAAAGGAACTGAAATGGAAAACATTTGTGTGGAATATAGGTGTAATTTAAATTATGCTATATGTTAAACTTCAC A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-1.909;DP=43;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:295,0,1965 -chr6 33365679 . TG T 1009.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=-2.890;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=23.48;ReadPosRankSum=0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:43:99:1047,0,1343 -chr6 33365681 . AAGTGGATAAATTAGATACAAACCATTACTGGAACAGCAAACATATTTAAAGGAACTGAAATGGAAAACATTTGTGTGGAATATAGGTGTAATTTAAATTATGCTATATGTTAAACTTCACCTG A 1006.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-0.288;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=21.89;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,30:46:99:1044,0,1343 -chr6 33540618 . T G 486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=16.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:515,39,0 -chr6 33579257 . G GA 441.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.20;MQ0=0;QD=3.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30:479,30,0 -chr6 33579260 . G T 450.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:479,30,0 -chr6 33594411 . AG A 672.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=-2.002;DP=72;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.701;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,35:67:99:710,0,1262 -chr6 33609908 . TCTAGGGGAGAAAGAAGAGAGATTTAATACGGAAAAGCACACTTTGGCAGGGGTCACTTTAATAAAGCATTAACACAC T 1603.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=2.103;DP=427;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=3.76;ReadPosRankSum=-2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,382:390:99:1641,682,0 -chr6 33743513 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=1.314;DP=36;FS=5.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=12.47;ReadPosRankSum=-0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:477,0,792 -chr6 33771745 . A G 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=-1.377;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=21.98;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:99:270,0,304 -chr6 33771810 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.588;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=14.17;ReadPosRankSum=-1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,390 -chr6 34380617 . G A 1396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=-0.131;DP=120;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,41:119:99:1425,0,3109 -chr6 34437159 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=1.395;DP=19;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=11.36;ReadPosRankSum=-2.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:244,0,316 -chr6 34641025 . C CT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=-0.617;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=8.14;ReadPosRankSum=-1.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:257,0,515 -chr6 34641224 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=-1.528;DP=19;FS=17.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=13.72;ReadPosRankSum=1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:289,0,382 -chr6 34683527 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=1.073;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:234,0,414 -chr6 34684351 . T C 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=-0.263;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:433,0,888 -chr6 34820394 . G A 482.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=34.44;ReadPosRankSum=-0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:509,0,4 -chr6 34823724 . T A 2390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2419,175,0 -chr6 34824744 . A G 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:69:1004,69,0 -chr6 34824745 . A G 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69:1004,69,0 -chr6 34825010 . T C 4068.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:101:99:4097,304,0 -chr6 34881197 . C T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.721;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:271,0,1195 -chr6 34890041 . G A 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=-0.656;DP=456;FS=0.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:374,82:456:99:1059,0,13601 -chr6 36330920 . ACTAAAATGCAAAATAAAAACAAAATGAGTCAATCTGTCTAATCACTTCTTGAAGCACTATAGTTCGTAGCTTAATATCAATACCAAC A 12366.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=3.633;DP=324;FS=0.939;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.223;QD=27.36;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,295:312:99:12404,924,0 -chr6 36499872 . G A 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=1.422;DP=63;FS=3.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.145;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,21:63:99:535,0,1988 -chr6 36502947 . G A 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.940;DP=33;FS=1.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:423,0,706 -chr6 36667364 . T A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.103;DP=82;FS=1.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:312,0,2584 -chr6 36667609 . C T 1141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1170,87,0 -chr6 36726994 . G A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-1.157;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:453,0,141 -chr6 36731689 . T C 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=-0.227;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,28:35:99:1299,0,365 -chr6 36731698 . T A 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=-0.226;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.017;QD=33.44;ReadPosRankSum=-0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,31:38:99:1299,0,354 -chr6 36737583 . A G 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=1.345;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:82:492,0,82 -chr6 36743504 . A G 208.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:237,0,23 -chr6 36743527 . T A 239.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:268,0,16 -chr6 37249942 . G T 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.572;ClippingRankSum=-0.868;DP=309;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=1.53;ReadPosRankSum=2.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:255,53:308:99:501,0,9716 -chr6 37255094 . TA T 2225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.156;DP=200;FS=5.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,96:181:99:2263,0,1984 -chr6 37255329 . GA G 985.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.554;DP=154;FS=7.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,51:140:99:1023,0,1623 -chr6 37255446 . A G 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=2.517;DP=111;FS=13.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,25:111:99:497,0,3462 -chr6 37398745 . T C 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=-1.189;DP=32;FS=8.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.535;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.998 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:434,0,788 -chr6 37399314 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=13.86;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,385 -chr6 37399380 . T A 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:36:454,36,0 -chr6 37400254 . CT C 2339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2377,213,0 -chr6 37400256 . GCGCAATAGAAATATGCTGATTAGAGATCTGATAGGTTTTTTCAATAACGGTCAACTAAAAGCTTCTCTCACCA G 2339.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2377,213,0 -chr6 37428142 . G C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=-1.790;DP=82;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=2.86;ReadPosRankSum=2.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,13:82:99:263,0,5275 -chr6 37446852 . T C 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.690;DP=125;FS=3.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,31:123:99:647,0,3542 -chr6 37465855 . T G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-1.080;DP=38;FS=10.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:305,0,926 -chr6 37633053 . G A 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.827;DP=145;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,26:145:99:346,0,4504 -chr6 37651303 . C T 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=1.506;DP=155;FS=9.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.360;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,25:155:99:315,0,4974 -chr6 37674075 . AAGGTAAGCTCACTTTTGTGTGTTTGCCAAGGATATTCAGTATTTTGAGCATGCTTTGTGTTCCTCATACATGTGTAATAATCCCTCCACAATTCACTTATGC A 6976.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.229;DP=188;FS=3.514;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=28.94;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,176:183:99:7014,603,0 -chr6 37678285 . C T 897.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=-0.692;DP=253;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,52:253:99:926,0,9212 -chr6 37678306 . G T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=1.469;DP=234;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,37:234:99:342,0,9645 -chr6 37679022 . C G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.252;DP=150;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,29:150:99:505,0,5275 -chr6 37679105 . G T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.983;DP=101;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,21:101:99:367,0,2988 -chr6 37682802 . G A 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-1.330;DP=52;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:52:99:614,0,1093 -chr6 37756966 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=1.568;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=13.90;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:459,0,1042 -chr6 37769618 . T C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.716;DP=37;FS=1.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.557;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:447,0,861 -chr6 37781370 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.875;DP=75;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:358,0,2102 -chr6 37785202 . T C 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-0.893;DP=69;FS=5.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:465,0,1842 -chr6 37790444 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.697;DP=64;FS=4.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,15:64:99:300,0,1823 -chr6 37979055 . AC A 483.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=1.273;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=30.23;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:32:521,0,32 -chr6 38436545 . G T 326.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:355,24,0 -chr6 38776643 . T A 597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.923;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:626,0,824 -chr6 38776969 . G T 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.293;DP=49;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,21:49:99:701,0,918 -chr6 38789542 . G GT 392.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=1.192;DP=55;FS=2.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=0;MQRankSum=4.585;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,15:52:99:430,0,2648 -chr6 38832779 . T C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=-0.436;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:508,0,2493 -chr6 38833178 . A G 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.785;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.791;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:254,0,1432 -chr6 38877914 . A T 877.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.551;DP=39;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.164;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,26:39:99:906,0,515 -chr6 38878181 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=-0.466;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:335,0,1712 -chr6 38880939 . T C 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.667;DP=45;FS=2.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:589,0,992 -chr6 38881214 . G GA 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.197;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.904 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:297,0,256 -chr6 38881345 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.256;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:258,0,1790 -chr6 38882249 . A T 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.525;DP=25;FS=3.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=10.83;ReadPosRankSum=1.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:299,0,959 -chr6 38882457 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.109;DP=21;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:283,0,771 -chr6 38882781 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=-0.926;DP=41;FS=1.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:734,0,1117 -chr6 38883015 . G A 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=-0.033;DP=36;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:442,0,834 -chr6 38885319 . G A 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.487;DP=28;FS=11.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=17.78;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:526,0,417 -chr6 38885424 . A AT 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=-1.943;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:273,0,411 -chr6 38885775 . G T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.437;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:262,0,706 -chr6 38903643 . C A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=-0.341;DP=51;FS=4.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,15:51:99:400,0,1305 -chr6 38951884 . TCTGAAAGACAAACACAGCCAGATAGCTATCTTACTATCATTAAACGTGGAAGCACTGCCGTGTGTTTAAGTGTCTGTAAGAC T 901.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=-0.915;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.477;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:939,0,2161 -chr6 38957072 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=-0.773;DP=32;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:558,0,527 -chr6 38957636 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.077;DP=39;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:260,0,1024 -chr6 38959984 . CACCTCAGAACACACAAACACAACATTAAAACACCGTCAATTTATGCAGTGACAGTGAAAGAGTGCAGTTGGTAAATGTCT C 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=2.715;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=30.95;ReadPosRankSum=-2.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:904,0,1430 -chr6 38968339 . G A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=-0.575;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=18.07;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:480,0,407 -chr6 38998272 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=22.98;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:258,0,99 -chr6 39067385 . C A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.283;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:416,0,446 -chr6 39093663 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=1.237;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:407,0,642 -chr6 39093922 . T A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=-0.277;DP=45;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:248,0,1297 -chr6 39119654 . A G 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=-1.470;DP=80;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:673,0,1909 -chr6 39119825 . C T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=1.082;DP=46;FS=5.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:247,0,1362 -chr6 39120002 . A C 813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.874;DP=50;FS=8.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,22:49:99:842,0,1948 -chr6 39120157 . A T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=1.291;DP=30;FS=3.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.086;QD=16.76;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:531,0,1449 -chr6 39120165 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.650;DP=35;FS=5.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:531,0,1507 -chr6 39120275 . C A 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-0.735;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.753;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,40:56:99:1571,0,450 -chr6 39120374 . A G 1376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=1.760;DP=65;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,40:65:99:1405,0,865 -chr6 39120414 . G A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.196;DP=66;FS=4.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=3.74;ReadPosRankSum=-2.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:275,0,1987 -chr6 39120605 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.329;DP=62;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:284,0,1838 -chr6 39121029 . C G 717.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-1.302;DP=80;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:746,0,5923 -chr6 39121036 . T C 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=-1.460;DP=90;FS=3.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,28:90:99:760,0,5923 -chr6 39121535 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=-0.602;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:364,0,1173 -chr6 39121785 . G C 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-2.115;DP=96;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=12.73;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,37:96:99:1250,0,2001 -chr6 39129573 . G A 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=1.544;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=8.98;ReadPosRankSum=2.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:621,0,2648 -chr6 39129644 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=1.106;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=4.86;ReadPosRankSum=2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:305,0,2418 -chr6 39132691 . G A 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=1.747;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.216;QD=16.34;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:355,0,406 -chr6 39133776 . A G 846.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=-1.099;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,31:95:99:875,0,2494 -chr6 39136276 . T C 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.386;DP=48;FS=4.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,17:44:99:559,0,845 -chr6 39139549 . G C 694.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.486;DP=105;FS=4.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,29:104:99:723,0,2932 -chr6 39139748 . T C 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=-1.709;DP=103;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,28:103:99:663,0,2964 -chr6 39139766 . C T 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=-1.637;DP=105;FS=0.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,26:105:99:591,0,3062 -chr6 39160541 . T C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.566;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:94:307,0,94 -chr6 39193141 . TCTGTGATAAGGACACAAAAAGAGGACAGAACAATAATTCAATACGCCACCTGATAATGAGTTTACACTCTTTTATATGCCAGTACAAGCTGTAC T 2370.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=2.168;DP=55;FS=2.236;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:99:2408,227,0 -chr6 39195733 . G A 1220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=1.110;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.643;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,35:79:99:1249,0,1518 -chr6 39195940 . G A 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.932;DP=93;FS=10.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,35:93:99:1194,0,2108 -chr6 39197832 . CCCTGGAGGAGGCAAAATCAGAGAATGAGGGTTAAACGAAATACTTTGTAAGATCTACTGTGAGTGAAAATATTAATGTGTAA C 4242.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=1.585;DP=101;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=29.71;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,92:95:99:4280,384,0 -chr6 39198113 . G C 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.217;DP=91;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,34:91:99:1168,0,2527 -chr6 39295759 . AGTAAAGAGGAAAAGTTTAATTCTTGTATTTCATAGGGCATTAAATACAGTCACTGATTCTAATTCCTCTATATTTAG A 8824.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=0.735;DP=233;FS=3.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=4.358;QD=26.55;ReadPosRankSum=2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,205:222:99:8862,0,2112 -chr6 39295870 . G C 2521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-4.717;DP=191;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=13.20;ReadPosRankSum=3.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,112:191:99:4004,0,6290 -chr6 39296294 . GA G 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.897;DP=74;FS=7.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=3.12;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,18:65:99:268,0,1100 -chr6 39307962 . C A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.500;DP=47;FS=4.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:382,0,1279 -chr6 39348995 . A G 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.787;DP=28;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:436,0,538 -chr6 39354890 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=1.276;DP=14;FS=8.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:253,0,357 -chr6 39369462 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=-0.212;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:229,0,329 -chr6 39440857 . C A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-0.345;DP=84;FS=4.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:706,0,3297 -chr6 39448930 . G A 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=-0.049;DP=150;FS=6.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,54:150:99:1871,0,3181 -chr6 39456641 . G T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=-0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:275,0,401 -chr6 39464338 . A T 303.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=-1.741;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=25.29;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:3:330,0,3 -chr6 39465426 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=-0.337;DP=24;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=11.16;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:296,0,327 -chr6 39476512 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.010;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:279,0,328 -chr6 39552619 . AACATCCTGCAAGAGCGAGTAACATGATAATGCTGCAATGCCAAAACTACTGTAATCCAACTTGTGGC A 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.545;DP=76;FS=3.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:304,0,3251 -chr6 39552623 . TCCTGCAAGAGCGAGTAACATGATAATGCTGCAATGCCAAAACTACTGTAATCCAACTTGTGGCATATTCAAATTTA T 1927.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.159;DP=73;FS=5.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.239;QD=26.41;ReadPosRankSum=1.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,55:72:99:1965,0,1383 -chr6 39552690 . TTCAAATTTA T 265.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.502;DP=70;FS=4.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=3.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,15:69:99:303,0,3251 -chr6 39566695 . A G 658.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.223;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.205;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,19:46:99:687,0,921 -chr6 39596115 . TACCTGAGAGAAAAAGTAAAAAAAAATTAGCAAACGTCAGATTTAGCTAAAAACGTCATAAAAGAGTTTTAAAAGTC T,TTGAGAGAAAAAGTAAAAAAAAATTAGCAAACGTCAGATTTAGCTAAAAACGTCATAAAAGAGTTTTAAAAGTC 12587.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=1.777;DP=408;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:2,93,277:372:99:14320,10458,10503,2415,0,2241 -chr6 39596119 . TGAGAGAAAAAGTAAAAAAAAATTAGCAAACGTCAGATTTAGCTAAAAACGTCATAAAAGAGTTTTAAAAGTCA T 10352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=-0.686;DP=363;FS=5.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,258:354:99:10390,0,2868 -chr6 39597353 . C T 5600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=-0.711;DP=408;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.958;QD=13.73;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,155:408:99:5629,0,17655 -chr6 39597356 . G T 5597.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=-0.898;DP=364;FS=2.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.104;QD=15.38;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,138:364:99:5626,0,17693 -chr6 39613280 . A G 3540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.008;DP=125;FS=0.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,93:125:99:3569,0,770 -chr6 39670642 . CA C 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=-0.334;DP=43;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:252,0,758 -chr6 39670717 . C CA 575.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=-1.627;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=16.93;ReadPosRankSum=2.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:613,0,1159 -chr6 39684575 . GCTGGACAATGGAGAGAATAATTATATCAGACAGATCATAATGTTGATTATGGTGATAAATAAGGTTGATGTAATGTGTGTAGATGTTAC G 6250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.723;ClippingRankSum=1.283;DP=170;FS=6.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=32.07;ReadPosRankSum=-2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,147:166:99:6288,0,2943 -chr6 39792795 . T G 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=2.129;DP=31;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=12.41;ReadPosRankSum=-2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:413,0,659 -chr6 39814380 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.437;DP=14;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:380,0,87 -chr6 39890132 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=1.135;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:419,0,725 -chr6 39895085 . G A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=-0.416;DP=25;FS=3.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:337,0,557 -chr6 39926796 . A C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:245,0,67 -chr6 39930942 . GCTGCTCTCCGACACACAAACAAAAGACCGTTTCATAAATAACAACTAATGTATTCGAGAAAAATTGAGGAAGCACTACTCAATATTTCAATCACTGTCTTAC G 5923.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.494;DP=162;FS=3.280;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.611 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,148:156:99:5961,199,0 -chr6 39937574 . G A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=-1.671;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.413;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,22:117:99:370,0,3714 -chr6 40116405 . A T 947.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-1.781;DP=80;FS=0.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,29:80:99:976,0,1808 -chr6 40135701 . G C 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.528;DP=116;FS=10.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,32:116:99:772,0,3116 -chr6 40140574 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=1.580;DP=84;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,27:84:99:530,0,2081 -chr6 40147266 . G A 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=-1.139;DP=91;FS=2.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:551,0,2610 -chr6 40147270 . GC G 940.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.075;DP=89;FS=5.166;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=10.57;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:31:978,31,0 -chr6 40181818 . G A 1028.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.481;DP=92;FS=1.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,34:92:99:1057,0,1893 -chr6 40184581 . G A 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.882;DP=104;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,25:104:99:541,0,3130 -chr6 40360825 . T C 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.364;DP=57;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,19:57:99:485,0,2942 -chr6 40361208 . G A 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.167;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,14:76:99:233,0,2379 -chr6 40363324 . CCCTGCAATTGAGAGAGCACAGAAAATCCACAGTTCAGAGTCCAAAAAATATTTTAAATCTCATAAGACGTTGTACCGTAATACACATCGTA C 646.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=3.746;DP=102;FS=4.187;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=6.34;ReadPosRankSum=-2.948 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,93:98:99:684,223,0 -chr6 40392890 . G A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=-1.080;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:353,0,1055 -chr6 40474500 . GA G 630.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=-1.047;DP=49;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.33;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:668,0,492 -chr6 40485569 . G A 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=-1.000;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=8.01;ReadPosRankSum=2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,41:131:99:1078,0,3404 -chr6 40493045 . T C 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-1.060;DP=172;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=4.75;ReadPosRankSum=0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,40:172:99:845,0,6195 -chr6 40493629 . T C 1275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-2.108;DP=159;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=8.02;ReadPosRankSum=-0.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,48:158:99:1304,0,4292 -chr6 40493817 . G C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=-0.861;DP=170;FS=3.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,37:169:99:731,0,5110 -chr6 40494236 . G C 1216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=-1.440;DP=135;FS=6.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.021;QD=9.01;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,45:135:99:1245,0,3441 -chr6 40494853 . C G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-1.182;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=20.55;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:31:409,0,31 -chr6 40502188 . AAGGTATTACAAGTCATAAAATAAAATAGATTGAGTTCATCTGCTGTTAGGATTCATAATTCAATTTCTGATTGT A 3897.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.338;ClippingRankSum=1.330;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.490;QD=30.50;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,86:88:99:3935,295,0 -chr6 40502355 . AAGGTACAAAATATCTTGAGTTCTTTTTTATGCCTCTGTCAAATTTGTAGACATATTTTTCTTTTTTTCAAT A 2176.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=1.468;DP=72;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=30.23;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,52:65:99:2214,0,4135 -chr6 40502702 . C A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.625;DP=67;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:352,0,1947 -chr6 40503783 . TCCTGTAACAACAGCAGACACTTAAAACAGCACATGTAAATCAGATTTTGAGTAACGTTGGTACGTTACATTCGTCGTTTCGAGCCTTCGTAAATTTATAAACCGTGACTAA T 15026.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=-0.552;DP=345;FS=2.814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,333:343:99:15064,1387,0 -chr6 40509120 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-1.546;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:325,0,904 -chr6 40509287 . T C 2046.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.250;DP=245;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.497;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,79:245:99:2075,0,10098 -chr6 40509345 . T G 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-4.013;DP=319;FS=5.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,72:318:99:1234,0,13881 -chr6 40509451 . A G 1458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=-0.547;DP=290;FS=7.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,67:290:99:1487,0,20522 -chr6 40509527 . T A 1547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=2.984;DP=262;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=5.91;ReadPosRankSum=3.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,70:262:99:1576,0,7198 -chr6 40512142 . C T 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.108;DP=397;FS=8.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:330,66:396:99:764,0,12553 -chr6 40565515 . AAGGTTACACTTCTAACATACAGCAATACAATCATTTTAATTTATTTTTCATTTTGTTGCAGATAACAAAAATGTAAACATGCAATACACTAACACTTAAAAGTCACATCATCACTGAAATATTTGTATACTTAC A 3435.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.778;DP=84;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=32.66;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:84:99:3473,311,0 -chr6 40576389 . CCA C 1636.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.072;DP=100;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=16.37;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,44:94:99:1674,0,3397 -chr6 40582689 . T A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.682;ClippingRankSum=0.152;DP=232;FS=4.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,65:231:99:1010,0,5708 -chr6 40584317 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=-0.312;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=17.52;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:256,0,213 -chr6 40588381 . C A 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.052;DP=93;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,20:93:99:405,0,2783 -chr6 40607506 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.352;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:402,0,197 -chr6 40621218 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.817;DP=41;FS=7.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=6.90;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:311,0,1126 -chr6 40624796 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.154;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:392,0,537 -chr6 40624811 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.429;DP=22;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:372,0,522 -chr6 40638401 . G GA 954.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=-0.675;DP=37;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:70:992,70,0 -chr6 40647804 . A T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.258;DP=30;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:370,0,695 -chr6 40692930 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-3.318;DP=28;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.180;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:265,0,722 -chr6 40756870 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.155;DP=73;FS=3.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.045;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,20:73:99:496,0,1908 -chr6 40763596 . G T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=1.310;DP=129;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,24:129:99:367,0,5943 -chr6 40764493 . AAGGTAAGGGT A 2894.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.087;DP=266;FS=7.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=10.88;ReadPosRankSum=-2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,90:232:99:2932,0,6201 -chr6 40768479 . ACAGGTATGAGCCCACAAACATTATGCTATTTCTAATGAATCTCCGTAAATCTAATCATTTGGTGTCTTT A 10980.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.343;DP=331;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=33.17;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,231:234:99:11018,1051,0 -chr6 40771526 . G A 3852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-1.054;DP=223;FS=6.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=17.28;ReadPosRankSum=2.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,108:223:99:3881,0,3705 -chr6 40781906 . T A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.179;DP=31;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.734;QD=16.09;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:527,0,570 -chr6 40835748 . CCCTAGATCACCACGTATAGTAAGTTATAATATGTATGTTTACAGTTGGTATGTGCACAACTGGAGAAACAAAGTATTGGAATTTGACATAAGTTTTGTGAGTGTACCAGA C 1765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=2.489;DP=53;FS=8.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=33.32;ReadPosRankSum=1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,43:53:99:1803,0,2052 -chr6 40835897 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.634;DP=58;FS=6.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,13:58:99:295,0,1741 -chr6 40838776 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=-1.107;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:313,0,966 -chr6 40838884 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=-0.586;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=7.02;ReadPosRankSum=1.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:274,0,870 -chr6 40842531 . T A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=-1.063;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:476,0,857 -chr6 40844576 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.788;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.473;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:298,0,1277 -chr6 40883071 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.528;DP=33;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.147;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:465,0,610 -chr6 40884070 . CAGGTGAGGTTCAGTCAACAATGGAAACCATGGTCAAAATCTTATCATTCATTTATGTTTTTGGTGTTATAGCTGATGGTTTTCGTTGTTTTTGT C 1506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.959;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,33:35:99:1544,124,0 -chr6 41011086 . T TA 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=-0.625;DP=52;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:646,0,594 -chr6 41011105 . CAA C 608.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=-0.692;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:646,0,594 -chr6 41015689 . T A 5319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=-0.368;DP=331;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,172:330:99:5348,0,5601 -chr6 41050317 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.147;DP=46;FS=2.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:341,0,1270 -chr6 41062746 . G C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=1.557;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.826;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:257,0,1137 -chr6 41381252 . TGGTGAGCAGTCATTTACATTTCCTTTTAACTACATCTTCTGTGTCACTGTTAATGTATAATGTTGTCAACCTTTTCTCTTCA T 1220.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.121;DP=31;FS=7.084;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=33.74;ReadPosRankSum=1.086 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:99:1258,100,0 -chr6 41389752 . C A 1696.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=-0.407;DP=292;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,73:292:99:1725,0,8437 -chr6 41391371 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.619;DP=137;FS=2.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,23:137:99:326,0,4406 -chr6 41391428 . T TA 384.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=-0.598;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:8:421,0,8 -chr6 41391628 . TA T 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=1.585;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=9.87;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:284,0,156 -chr6 41431811 . C G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-1.333;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:447,0,358 -chr6 41441348 . A AAC 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.516;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:523,0,717 -chr6 41687608 . CT C 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-1.713;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=9.41;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:282,0,442 -chr6 41784312 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.015;DP=70;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=2.90;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,13:70:99:231,0,2339 -chr6 41969894 . C T 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.989;DP=38;FS=8.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:367,0,1005 -chr6 42077928 . G A 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.330;DP=71;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,22:71:99:583,0,1803 -chr6 42222920 . T C 1954.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:99:1983,141,0 -chr6 42223068 . T C 802.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-1.202;DP=21;FS=6.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=31.24;ReadPosRankSum=1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:12:830,0,12 -chr6 42223099 . T C 1498.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:99:1527,111,0 -chr6 42230468 . ACTAAAGATCAAAAACAACACAAAAATACTGTTAAATTACAACATCAATACAAACATACTTTTATGAGTGCAAATACTTCTCAC A 4277.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=1.696;DP=97;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:4315,331,0 -chr6 42242389 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.529;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=30.08;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:33:660,0,33 -chr6 42245346 . G T 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 -chr6 42247975 . G T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.161;DP=100;FS=0.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.049;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,21:100:99:375,0,3081 -chr6 42254156 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=-2.632;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,25:119:99:512,0,3553 -chr6 42255990 . G A 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=-0.757;DP=63;FS=3.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:739,0,1344 -chr6 42267921 . T C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.059;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:320,0,1636 -chr6 42267943 . G T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=-0.209;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:324,0,1772 -chr6 42272317 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.373;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.745;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:343,0,1530 -chr6 42277115 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-0.753;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:310,0,2504 -chr6 42279236 . C T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.291;DP=167;FS=1.552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.983;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,33:167:99:546,0,7781 -chr6 42284531 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.630;DP=175;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,29:174:99:378,0,5393 -chr6 42286798 . G A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.949;DP=146;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.711;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,26:146:99:305,0,5597 -chr6 42286846 . T A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=-0.642;DP=125;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,28:125:99:547,0,3683 -chr6 42287287 . G A 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.660;DP=119;FS=0.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:850,0,3010 -chr6 42301962 . G C 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.165;DP=202;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,37:202:99:447,0,9161 -chr6 42302132 . T C 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.817;DP=243;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,47:243:99:456,0,11464 -chr6 42302992 . C T 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=-1.002;DP=269;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,63:268:99:1389,0,8017 -chr6 42305154 . A AT 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr6 42306046 . C G 1014.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.115;DP=282;FS=5.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,59:282:99:1043,0,8303 -chr6 42306171 . G A 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=-0.375;DP=251;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,56:251:99:1115,0,7630 -chr6 42348637 . T G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.094;DP=38;FS=5.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:319,0,1046 -chr6 42529782 . T C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.954;DP=27;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.281;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:244,0,221 -chr6 42604586 . G A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-1.239;DP=151;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,25:151:99:309,0,4696 -chr6 42605241 . C T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-1.005;DP=122;FS=2.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,27:122:99:485,0,3635 -chr6 42611473 . C T 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=-0.012;DP=140;FS=1.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,32:140:99:668,0,4217 -chr6 42614497 . A C 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-1.474;DP=134;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,32:134:99:710,0,4029 -chr6 42617446 . A T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.987;DP=146;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=4.13;ReadPosRankSum=3.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,31:144:99:631,0,4320 -chr6 42621953 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=-2.529;DP=67;FS=2.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=3.31;ReadPosRankSum=2.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:67:99:250,0,2089 -chr6 42750784 . C G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=-1.831;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=3.79;ReadPosRankSum=2.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:229,0,1516 -chr6 42846965 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.263;DP=58;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.918;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:337,0,1693 -chr6 42865014 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=-1.117;DP=111;FS=1.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,23:111:99:472,0,3401 -chr6 42876532 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=-1.759;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:281,0,2638 -chr6 42950379 . T C 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=1.095;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,30:121:99:690,0,3563 -chr6 43193596 . C T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.108;DP=89;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.886;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:541,0,2488 -chr6 43545367 . TA T 203.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:241,24,0 -chr6 43945857 . G T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.062;DP=93;FS=5.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,19:93:99:327,0,2844 -chr6 44135065 . GAGGTAAGGAAAGTATATGAAGCCTAAGATAGTCATTTTAAAAAATATATGCTCTATATATTGCACTGTATATTTC G 4650.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.566;DP=124;FS=2.498;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.140;QD=32.01;ReadPosRankSum=-0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,120:123:99:4688,425,0 -chr6 44180583 . AGCTAGT A 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-1.212;DP=86;FS=13.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:476,0,6440 -chr6 44180591 . CAACAAGGACAGGACAAAAGCTATCAGCTGCCCTTCAGAGTTGGTAAAGAGCATGTA C 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=-1.914;DP=85;FS=13.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:476,0,6440 -chr6 44180650 . ATGTGTTTCTGGCATCTCACCTGT A 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=-2.153;DP=88;FS=10.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=4.99;ReadPosRankSum=-1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,22:86:99:476,0,6440 -chr6 44914548 . CA C 662.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=-0.459;DP=67;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=2.148;QD=9.89;ReadPosRankSum=-1.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,29:65:99:703,0,697 -chr6 45133352 . G C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 -chr6 45133377 . A T 604.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:633,45,0 -chr6 45791064 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=1.164;DP=52;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.664;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,18:52:99:622,0,1191 -chr6 45791350 . G A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.387;DP=61;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:666,0,1375 -chr6 45795446 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.329;DP=29;FS=1.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=14.68;ReadPosRankSum=0.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:454,0,541 -chr6 45798401 . G A 697.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.270;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=14.54;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,21:48:99:726,0,917 -chr6 45803656 . C G 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.031;DP=68;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:984,0,2115 -chr6 45803718 . G A 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=-0.853;DP=56;FS=5.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=13.84;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:803,0,1051 -chr6 45803842 . T A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.076;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=13.87;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,15:32:99:472,0,999 -chr6 45804196 . G GT 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=1.747;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=9.21;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:249,0,269 -chr6 45804810 . C T 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=-0.488;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=16.53;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,22:45:99:772,0,820 -chr6 45812311 . TA T 1518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=-0.842;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,65:139:99:1556,0,2863 -chr6 45812460 . CCCTTTAGAAAAAGAAGTTGATAGAAAAACGTTATATGATGGCATATGGAATTTTTGGTAATACACATTTGGTTACATTTGTGTTTGGTTTTTGAATGCAGAGGATACTTA C 9573.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=-0.675;DP=208;FS=2.117;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=28.52;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,204:207:99:9611,834,0 -chr6 45816136 . G T 2885.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.105;DP=231;FS=1.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,85:231:99:2914,0,5028 -chr6 45819153 . G A 2780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.636;DP=175;FS=0.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=15.89;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,80:175:99:2809,0,3133 -chr6 45819270 . C T 2076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.637;DP=151;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,62:151:99:2105,0,2915 -chr6 45821992 . G T 1052.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=-3.247;DP=143;FS=15.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,43:143:99:1081,0,3680 -chr6 45824977 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.215;DP=147;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=3.64;ReadPosRankSum=2.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,32:146:99:563,0,4251 -chr6 45837733 . C T 2005.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-0.697;DP=130;FS=6.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=15.43;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,59:130:99:2034,0,2329 -chr6 45837745 . A G 2040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.866;DP=127;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=16.07;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,62:127:99:2069,0,2149 -chr6 45860071 . C T 460.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.356;DP=57;FS=6.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,17:56:99:489,0,1515 -chr6 45862870 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.813;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.013 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:276,0,1312 -chr6 45863894 . A C 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=-1.112;DP=37;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=18.26;ReadPosRankSum=-1.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:704,0,589 -chr6 45864248 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-2.145;DP=39;FS=8.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=8.33;ReadPosRankSum=1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:353,0,1125 -chr6 45864768 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=-1.773;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,379 -chr6 45865440 . A C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=2.024;DP=31;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=7.48;ReadPosRankSum=-2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:260,0,1281 -chr6 45874526 . CTT C 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=-1.480;DP=50;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.702;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:390,0,1405 -chr6 45874729 . A T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-0.114;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.073;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:50:99:447,0,1376 -chr6 45907909 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.531;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.88;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:349,0,323 -chr6 46181824 . C G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.485;DP=23;FS=1.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.109;QD=9.21;ReadPosRankSum=3.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:240,0,1304 -chr6 46181828 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=-0.444;DP=24;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=8.82;ReadPosRankSum=3.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:240,0,1304 -chr6 46181934 . C A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=-1.288;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:247,0,1734 -chr6 46182034 . A G 963.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=-1.140;DP=54;FS=8.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=17.85;ReadPosRankSum=-2.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:47:99:992,0,1042 -chr6 46182052 . T C 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.287;DP=63;FS=9.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=6.39;ReadPosRankSum=-2.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:431,0,2666 -chr6 46182106 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.415;DP=93;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:325,0,2150 -chr6 46182469 . A T 402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=-1.981;DP=20;FS=28.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=20.14;ReadPosRankSum=-2.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:431,0,385 -chr6 46182497 . C A 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.737;DP=34;FS=20.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=30.73;ReadPosRankSum=0.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:42:1073,0,42 -chr6 46183093 . C T 2415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=1.574;DP=71;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=34.02;ReadPosRankSum=-1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,60:62:99:2444,185,0 -chr6 46183194 . A AT 516.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=-1.586;DP=494;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.706;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:257,79:336:99:554,0,7120 -chr6 46183444 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=3.169;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=10.61;ReadPosRankSum=-2.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:251,0,515 -chr6 46183900 . GT G 1911.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.591;DP=104;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQ0=0;MQRankSum=1.565;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,74:88:50:1949,0,50 -chr6 46184059 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=1.855;DP=14;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:318,0,184 -chr6 46184646 . T C 1000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1029,78,0 -chr6 46273243 . G A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.182;DP=31;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=20.90;ReadPosRankSum=-0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:676,0,434 -chr6 46274509 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=1.444;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=16.80;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:381,0,411 -chr6 46274568 . A G 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.683;DP=17;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.22;ReadPosRankSum=-1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:287,0,389 -chr6 46351296 . G GA 333.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.154;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=1.91;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:371,0,3482 -chr6 46353199 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.105;DP=185;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.994 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,34:185:99:408,0,5569 -chr6 46353790 . G C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-0.437;DP=231;FS=0.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,41:231:99:517,0,7650 -chr6 46357739 . C T 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=-1.159;DP=235;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,52:235:99:1059,0,6995 -chr6 46364559 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=4.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:250,0,769 -chr6 46364563 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=1.733;DP=18;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:250,0,807 -chr6 46512138 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.927;DP=17;FS=4.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=19.34;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:357,0,228 -chr6 46519252 . T C 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=1.299;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:326,0,280 -chr6 46662986 . CA C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.021;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:391,0,357 -chr6 46673507 . G GA 496.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.156;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:534,0,854 -chr6 46674876 . A G 2405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=1.329;DP=190;FS=14.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=12.66;ReadPosRankSum=-0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,72:189:99:2434,0,3866 -chr6 46677052 . G T 891.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.064;DP=139;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,38:139:99:920,0,3949 -chr6 46677079 . A T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-1.561;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,32:138:99:710,0,3987 -chr6 46679353 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=1.760;DP=111;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,28:110:99:600,0,2961 -chr6 46786505 . GCCTGTAATCGGGAGTTCATATTGTAATAAATTCAGACTTCTATTAATAAGAATATGTTGTAAATATAAATATTTTAGGTTA G 1027.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=3.131;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.676;QD=24.47;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1065,0,621 -chr6 46791228 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=-0.651;DP=23;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:319,0,385 -chr6 46822559 . G A 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=-1.149;DP=159;FS=3.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.318;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,34:158:99:589,0,4725 -chr6 46831162 . T A 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.482;DP=143;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,33:143:99:673,0,4198 -chr6 46831189 . A G 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=2.051;DP=117;FS=1.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:739,0,3316 -chr6 46831549 . C T 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.038;DP=154;FS=5.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,47:153:99:1236,0,4096 -chr6 46840032 . CCTCCAG C 371.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:38:409,38,0 -chr6 46840343 . C A 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-1.246;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.494;QD=19.56;ReadPosRankSum=0.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,37:59:99:1182,0,699 -chr6 46843773 . C T 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-2.288;DP=155;FS=2.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,37:154:99:740,0,4165 -chr6 46920851 . A G 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=-0.553;DP=17;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=22.05;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:403,0,208 -chr6 47389227 . AAGGTATACAACTTCAGACACTGACCTCAATGTACAGTTTATAAGAAAGCATACTTCATATTTTAGGTTGAGAACTCTTTCTGTCTTATTCTGTCATTTATTTTGC A 3413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=-3.320;DP=221;FS=12.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,96:214:99:3451,0,9082 -chr6 47389230 . GTATACAACTTCAGACACTGACCTCAATGTACAGTTTATAAGAAAGCATACTTCATATTTTAGGTTGAGAACTCTTTCTGTCTTATTCTGTCATTTATTTTGCAGA G 3816.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.281;DP=219;FS=21.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,105:216:99:3854,0,8266 -chr6 47394596 . C T 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=-1.190;DP=213;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=2.13;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,35:213:99:481,0,6944 -chr6 47399603 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=-3.389;DP=44;FS=16.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:372,0,1132 -chr6 47400701 . G A 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=-3.787;DP=105;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.382;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,29:103:99:735,0,4156 -chr6 47400942 . T A 2016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=-0.014;DP=86;FS=1.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.266;QD=23.45;ReadPosRankSum=1.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,30:84:99:2045,0,3693 -chr6 47401766 . T G 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=1.415;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=16.95;ReadPosRankSum=-1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:435,0,445 -chr6 47750721 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.319;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:409,0,2547 -chr6 47751791 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=-3.103;DP=51;FS=5.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=4.33;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:249,0,1575 -chr6 47752999 . C G 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=-0.507;DP=68;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.596;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:367,0,2019 -chr6 47773686 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=1.942;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,17:75:99:378,0,4816 -chr6 47773688 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=1.701;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.406;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:378,0,4816 -chr6 47776188 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=-0.174;DP=75;FS=1.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:413,0,1997 -chr6 47806193 . C CA 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.673;ClippingRankSum=-3.122;DP=180;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-2.300;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,31:170:99:288,0,5036 -chr6 47808970 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:270,0,61 -chr6 47986344 . G A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-1.098;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=17.99;ReadPosRankSum=1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,15:27:99:514,0,425 -chr6 47999016 . C T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=1.001;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=23.86;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,210 -chr6 47999018 . TC T 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.86;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:243,0,210 -chr6 48005788 . T TA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-1.637;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.753;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:273,0,1024 -chr6 48006252 . G A 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.536;DP=62;FS=1.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:390,0,1703 -chr6 48009331 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.125;DP=96;FS=3.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:246,0,2964 -chr6 48012761 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=-0.580;DP=94;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:277,0,2991 -chr6 48139785 . GT G 325.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.248;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:14:363,14,0 -chr6 48178966 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.048;DP=44;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.338;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:261,0,1082 -chr6 48184468 . C CA 211.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:249,24,0 -chr6 48230897 . T C 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.946;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=8.36;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:279,0,705 -chr6 48253171 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.549;DP=32;FS=5.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=8.27;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,830 -chr6 48264007 . G A 1540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.907;DP=388;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.363;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,82:387:99:1569,0,11886 -chr6 48301120 . GCAGGTATATGGATTCAAGAGCACTGTTTTATTGCAGTCTTAAACTGCCATGTTATGACTTTTGTGTATGT G 2833.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=-0.868;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=30.18;ReadPosRankSum=-1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:2871,230,0 -chr6 48301337 . T A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=-0.622;DP=41;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.172;QD=14.24;ReadPosRankSum=1.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:612,0,735 -chr6 48319704 . A T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.895;DP=24;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.46;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=15.16;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:392,0,731 -chr6 48320032 . C T 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=1.109;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:314,0,211 -chr6 48324771 . C G 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.373;DP=132;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,21:132:99:269,0,4415 -chr6 48325179 . G T 1423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=1.302;DP=100;FS=6.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=14.24;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,42:100:99:1452,0,1939 -chr6 48342022 . G A 3922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=-0.223;DP=288;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.100;QD=13.62;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,121:285:99:3951,0,5279 -chr6 48358377 . T G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=-0.914;DP=239;FS=3.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,44:236:99:677,0,11001 -chr6 48925784 . G A 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 -chr6 48927828 . A G 369.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:398,27,0 -chr6 49001640 . TA T 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.280;DP=42;FS=12.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:42:99:322,0,1185 -chr6 49002301 . GCTAAAAAAGTAAAAGCGGGAATAATTAGGGAGGGTAAACACCTTTATTTGCTTTACATTTTTATTGCTGATTTATGTTTAAACCAAC G 823.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=-1.075;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.373;QD=16.81;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,23:47:99:861,0,1175 -chr6 49002302 . CTAAAAAAGTAAAAG C 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.747;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=8.73;ReadPosRankSum=-1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:610,0,1631 -chr6 49002317 . CGGGAATAATTAGGGAGGGTAAACACCTTTATTTGCTTTACATTTTTATTGCTGATTTATGTTTAAACCAACCT C 384.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.119;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:422,0,1918 -chr6 49039081 . CGTAGGAAGAGCTTATGACAGTGAGTTGTAAGTTATTTTTTTCCGGTTTTAAAGCTGTCTGTTAACAGCCCCTGTGTTTTTCCGTCAG C 297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=28.65;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:99:335,0,8426 -chr6 49042636 . T A 11578.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=2.911;DP=102;FS=5.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=29.40;ReadPosRankSum=1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,51:101:99:11607,0,659 -chr6 49043716 . GGGTACGTTTGCTTCTACTGCGTTTGGTGAAGCATTAAAAGGGCTGCAGAACATCTAAATCTTCATTTTGCTGTTTTACA G 14254.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=-1.378;DP=369;FS=7.594;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=29.71;ReadPosRankSum=3.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,341:350:99:14292,1045,0 -chr6 49046145 . G A 4253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=-1.185;DP=297;FS=1.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.272;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,122:297:99:4282,0,7002 -chr6 49048088 . T TC 264.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.039;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.196;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:302,0,740 -chr6 49049581 . A C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-1.209;DP=28;FS=9.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=12.24;ReadPosRankSum=-1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:371,0,514 -chr6 49200523 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,224 -chr6 49202026 . G T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=-0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:283,0,103 -chr6 49263039 . G C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=1.740;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:273,0,526 -chr6 49456137 . C T 779.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=1.940;DP=388;FS=1.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:322,66:388:99:808,0,11884 -chr6 49456204 . GCCTGGAAAAAAATAAACACGAAATGTCAGCATCCATCACACATATGACTGTAATAATGCATACATCAATCAGCAGTCTTA G 16592.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.266;DP=441;FS=10.162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.525;QD=32.58;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,419:422:99:16630,1234,0 -chr6 49474228 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=19.32;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:318,0,424 -chr6 49474276 . T C 229.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:20:258,20,0 -chr6 49474484 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-0.406;DP=24;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.290;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:397,0,471 -chr6 49474598 . T C 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=-0.324;DP=57;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.806;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:363,0,2036 -chr6 49475389 . T A 1356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=-0.223;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.687;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,43:82:99:1385,0,1439 -chr6 49482995 . G A 1116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=-1.843;DP=51;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1145,0,601 -chr6 49486899 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.705;DP=97;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,16:97:99:232,0,3043 -chr6 49487208 . G A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.927;DP=34;FS=7.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:476,0,671 -chr6 49527866 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=-0.523;DP=23;FS=1.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.154;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:426,0,814 -chr6 49527874 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-1.162;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=18.94;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:426,0,814 -chr6 49528988 . T A 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.202;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.247;QD=11.65;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:366,0,646 -chr6 49530138 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=1.266;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:294,0,353 -chr6 49556914 . G C 4403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=-0.217;DP=226;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=19.49;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,137:226:99:4432,0,2908 -chr6 49587405 . C CA 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.152;DP=83;FS=9.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:249,0,1813 -chr6 49587656 . C T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.532;DP=228;FS=4.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=2.35;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,40:227:99:565,0,7472 -chr6 49589177 . G A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.397;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=6.46;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:248,0,1237 -chr6 49589203 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=-0.578;DP=40;FS=3.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=5.07;ReadPosRankSum=3.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:231,0,1186 -chr6 49589777 . T C 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.312;DP=110;FS=6.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.936;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,29:110:99:729,0,3120 -chr6 49602754 . A C 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.386;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.590;QD=26.56;ReadPosRankSum=0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:878,0,300 -chr6 49607077 . T G 1250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.012;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1279,0,333 -chr6 49690312 . A G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:99:292,0,279 -chr6 49690411 . GT G 494.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=-0.884;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.945;QD=32.98;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:96:532,0,96 -chr6 49692037 . C T 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.303;DP=39;FS=3.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,15:39:99:549,0,884 -chr6 49696025 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=2.065;DP=219;FS=5.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=1.52;ReadPosRankSum=-4.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,35:219:99:362,0,6809 -chr6 49704627 . T C 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=-1.722;DP=364;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.525;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:268,87:355:99:1880,0,10385 -chr6 49712135 . C A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.580;DP=203;FS=6.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,31:203:99:289,0,7058 -chr6 49732807 . CT C 353.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=-0.355;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:391,0,2855 -chr6 49736537 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.290;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:331,0,3235 -chr6 49743670 . TCTAGAAATGAAAGACATTTTACAAAGAATTAAGTGCTTTGAGAGCTGTTTCATTAAGCAGTACATGCAGTAGAGTGTATTTAAAACATAC T 4368.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.455;DP=110;FS=4.554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=34.77;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,106:110:99:4406,380,0 -chr6 49743874 . C G 1257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=1.235;DP=100;FS=9.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,37:100:99:1286,0,2200 -chr6 49840421 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.664;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.91;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:335,0,134 -chr6 49853428 . C T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.358;DP=116;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.394;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:460,0,3550 -chr6 49871466 . G A 1221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-1.013;DP=85;FS=5.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.621;QD=14.37;ReadPosRankSum=0.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,35:85:99:1250,0,1873 -chr6 49871560 . GA G 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.331;ClippingRankSum=0.934;DP=94;FS=7.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,26:92:99:419,0,1819 -chr6 49898599 . C T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=-1.509;DP=346;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.293;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:274,71:345:99:1258,0,10265 -chr6 49917929 . A G 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.137;DP=84;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.160 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:256,0,2613 -chr6 49963387 . C A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.582;ClippingRankSum=1.631;DP=408;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,68:408:99:624,0,12465 -chr6 49963541 . G GA 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=-0.011;DP=112;FS=6.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,27:88:99:393,0,1574 -chr6 50186388 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=25.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:259,0,55 -chr6 50186418 . C T 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.815;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:415,0,288 -chr6 50334302 . C T 1145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.244;DP=342;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,70:335:99:1174,0,10078 -chr6 50337912 . CCAGGTCATTAATATAAAGTCATCTTTTACGTTAATCAGACTTAGTAGCTTTAAGTTTTTTATTGTATTTAGCATTTTCTAATGATCTGCATCTTCATCT C 3932.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=1.459;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,354:355:99:3970,813,0 -chr6 50346938 . A T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.478;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=19.25;ReadPosRankSum=1.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,2:39:99:779,0,1200 -chr6 50353597 . G A 8525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.218;ClippingRankSum=0.608;DP=360;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=23.68;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,257:359:99:8554,0,2425 -chr6 50405445 . A G 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.657;DP=185;FS=2.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,30:185:99:319,0,5590 -chr6 50545372 . G T 1214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.540;DP=76;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,39:76:99:1243,0,1326 -chr6 50646510 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=-0.944;DP=98;FS=2.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=2.99;ReadPosRankSum=3.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:321,0,3090 -chr6 50665367 . G T 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=1.850;DP=35;FS=1.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:336,0,2093 -chr6 50683292 . T C 234.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:263,18,0 -chr6 51480803 . A T 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=-0.504;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.074;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:565,0,728 -chr6 51480936 . AT A 488.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=-1.734;DP=21;FS=3.245;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=23.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:33:526,33,0 -chr6 51481687 . CT C 860.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=-0.313;DP=35;FS=2.013;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.62;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=24.59;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,28:32:3:896,3,0 -chr6 51482203 . A G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=-0.530;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=11.12;ReadPosRankSum=-1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:462,0,897 -chr6 51485827 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-1.756;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,18:69:99:432,0,1931 -chr6 51500023 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-1.455;DP=43;FS=7.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.211;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:695,0,1262 -chr6 51500068 . T A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=1.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=30.70;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:79:458,0,79 -chr6 51502892 . T C 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.303;DP=77;FS=1.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=6.50;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:529,0,3367 -chr6 51528218 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.226;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=10.86;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:278,0,537 -chr6 51531975 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=-0.999;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=7.66;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:281,0,845 -chr6 51534624 . T C 523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=2.241;DP=39;FS=7.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=13.43;ReadPosRankSum=1.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:552,0,800 -chr6 51546068 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=2.022;DP=36;FS=2.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=17.97;ReadPosRankSum=-2.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:675,0,943 -chr6 51546261 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.385;DP=43;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=13.58;ReadPosRankSum=1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,17:43:99:612,0,890 -chr6 51551156 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=-0.937;DP=45;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=11.88;ReadPosRankSum=1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:563,0,988 -chr6 51581878 . C T 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.699;DP=34;FS=5.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=7.49;ReadPosRankSum=-1.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:283,0,863 -chr6 51720792 . C T 2565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.705;ClippingRankSum=-3.858;DP=156;FS=54.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.609;QD=16.45;ReadPosRankSum=7.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,73:133:99:2603,0,3806 -chr6 51720907 . C T 1691.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=2.224;DP=270;FS=27.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.125;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,70:270:99:1720,0,10324 -chr6 51720925 . A T 1322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=1.057;DP=278;FS=19.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,67:278:99:1351,0,12240 -chr6 51721026 . T TG 1849.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=-3.369;DP=286;FS=0.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,113:250:99:1960,0,4421 -chr6 51721036 . A G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=-0.195;DP=281;FS=5.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,56:279:99:771,0,11242 -chr6 51721159 . C T 1427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=-0.026;DP=291;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,69:290:99:1456,0,8253 -chr6 51721285 . C G 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.183;DP=281;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.786;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,75:279:99:1700,0,7388 -chr6 51722404 . G A 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=-1.592;DP=151;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.057;QD=8.35;ReadPosRankSum=2.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,47:150:99:1289,0,3991 -chr6 52022330 . T A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.183;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,1235 -chr6 52167156 . C T 4417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-1.064;DP=381;FS=3.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:246,134:380:99:4446,0,8313 -chr6 52174639 . A C 5146.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,121:121:99:5175,364,0 -chr6 52174825 . CA C 4322.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.077;DP=150;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=28.82;ReadPosRankSum=-0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,142:144:99:4360,420,0 -chr6 52174966 . A G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.497;DP=136;FS=0.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,33:136:99:755,0,4029 -chr6 52175272 . A G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=-0.274;DP=170;FS=1.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,31:169:99:456,0,6553 -chr6 52175334 . T A 993.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-2.903;DP=110;FS=4.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.581;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:1022,0,6852 -chr6 52175963 . CA C 559.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.580;DP=229;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.340;QD=2.44;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,45:185:99:647,0,2927 -chr6 52178698 . GCTTGAAATGAAATGGCTGACAATCAGGTTCTGAAGGCAAGTGTGAGGCATTTGCTTGGTACAGCAAAAGTAAATAC G 700.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=1.196;DP=175;FS=4.329;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,150:161:99:738,301,0 -chr6 52289120 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.263;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=16.05;ReadPosRankSum=-0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:285,0,324 -chr6 52293026 . T G 3899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=-0.500;DP=319;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.230;QD=12.22;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,115:319:99:3928,0,7105 -chr6 52348145 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=-0.289;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.115;QD=27.23;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:77:600,0,77 -chr6 52348181 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=14.60;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:364,0,358 -chr6 52472173 . ATG A 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=-1.506;DP=66;FS=2.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=4.81;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:355,0,757 -chr6 52484039 . G C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.536;DP=150;FS=2.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,26:143:99:388,0,4437 -chr6 52510779 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=-0.283;DP=151;FS=1.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,26:151:99:370,0,4811 -chr6 52515573 . A C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=1.606;DP=106;FS=3.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.461;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,19:106:99:252,0,3270 -chr6 52616120 . A T 1071.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.111;DP=153;FS=3.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.337;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,41:151:99:1100,0,5616 -chr6 52616256 . G GA 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=3.988;DP=218;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.283;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,44:207:99:350,0,4262 -chr6 52620062 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.439;DP=359;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.469;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,57:359:99:491,0,12126 -chr6 52621070 . C T 1744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-2.338;DP=438;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:343,94:437:99:1773,0,13352 -chr6 52668785 . T G 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.464;DP=68;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=14.06;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:984,0,1360 -chr6 52742651 . T A 5125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-2.444;DP=437;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.213;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:285,150:435:99:5154,0,10135 -chr6 52771612 . A G 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=-0.423;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=20.71;ReadPosRankSum=1.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:608,0,2419 -chr6 52772853 . G A 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=0.307;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=16.08;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:559,0,462 -chr6 52776750 . AC A 224.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.108;DP=26;FS=6.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=8.64;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:262,0,520 -chr6 52776830 . C T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.966;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.615;QD=13.62;ReadPosRankSum=0.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:355,0,523 -chr6 52777304 . A G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-1.702;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.267;QD=20.13;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:451,0,405 -chr6 52780575 . T C 1670.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.449;ClippingRankSum=2.781;DP=472;FS=0.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.328;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:377,94:471:99:1699,0,14559 -chr6 52780636 . A T 4525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=-1.290;DP=352;FS=5.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.005;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,136:345:99:4554,0,6017 -chr6 52798188 . A G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=-0.305;DP=298;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=1.41;ReadPosRankSum=2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,75:288:99:448,0,20078 -chr6 52989729 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:319,0,139 -chr6 52990521 . T C 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr6 52994166 . A G 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=-1.286;DP=63;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,18:63:99:408,0,2464 -chr6 53000768 . CCCTGAAAATAAAGATACGTCCGCCATTAATATTTTTTTCAAATAATGCAAAATTGAGTCTATCACGACCTAAGAGCGTTCGAGACACTTA C 2262.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.785;DP=58;FS=3.554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=27.76;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2300,173,0 -chr6 53005359 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=-0.365;DP=37;FS=5.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:245,0,1026 -chr6 53103255 . A G 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-1.681;DP=26;FS=11.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=20.22;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:554,0,384 -chr6 53103527 . C T 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=-1.000;DP=27;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:462,0,1239 -chr6 53105575 . T A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=-1.017;DP=41;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.393;QD=6.17;ReadPosRankSum=1.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:281,0,1097 -chr6 53177730 . A C 2477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-4.625;DP=173;FS=3.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=14.32;ReadPosRankSum=4.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,74:172:99:2506,0,3318 -chr6 53204865 . AT A 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.180;ClippingRankSum=-1.055;DP=112;FS=0.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=7.31;ReadPosRankSum=2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,39:91:99:856,0,1116 -chr6 53205314 . CT C 1725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-2.398;DP=202;FS=1.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,76:186:99:1763,0,2403 -chr6 53205642 . A C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=-0.518;DP=169;FS=2.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:134,35:169:99:486,0,5524 -chr6 53205902 . G GA 3506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=-2.331;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=18.46;ReadPosRankSum=-2.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,114:186:99:4845,0,1427 -chr6 53206178 . G A 6203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.039;DP=247;FS=6.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=25.12;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,50:247:99:6232,0,10265 -chr6 53206227 . G T 6206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.360;DP=236;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:157,77:234:99:6235,0,10322 -chr6 53206367 . GA G 1793.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=-2.353;DP=245;FS=2.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.32;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,118:232:99:1831,0,15206 -chr6 53229254 . GAC G 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=-2.257;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=2.79;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,13:73:99:241,0,2529 -chr6 53236002 . A G 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-1.343;DP=51;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.210 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:252,0,1435 -chr6 53302427 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.555;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:251,0,211 -chr6 53303588 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=1.064;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=13.44;ReadPosRankSum=-0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:297,0,366 -chr6 53306997 . C T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.226;DP=28;FS=6.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:325,0,602 -chr6 53308225 . T C 213.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=30.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:242,0,25 -chr6 53316888 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.492;DP=61;FS=3.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=7.03;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:457,0,1583 -chr6 53333705 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.087;DP=72;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.748;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,20:72:99:505,0,1990 -chr6 53343479 . CT C 1146.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.27;MQ0=0;QD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1184,115,0 -chr6 53358982 . T G 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.62;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:343,0,46 -chr6 53359663 . G A 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-1.296;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=28.52;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:342,0,54 -chr6 53359712 . A G 415.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:444,30,0 -chr6 53360002 . T TG 333.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:371,30,0 -chr6 53360025 . G C 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.807;DP=16;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=30.11;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:80:510,0,80 -chr6 53360139 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-0.532;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:342,0,369 -chr6 53360203 . C A 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=1.273;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=26.55;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:453,0,109 -chr6 53360588 . A G 570.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:599,42,0 -chr6 53361464 . T C 598.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:627,45,0 -chr6 53366507 . T C 437.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:466,33,0 -chr6 53409529 . C G 1000.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=1.682;DP=151;FS=6.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1029,0,3884 -chr6 53435632 . CTT C 944.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=3.192;DP=85;FS=8.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=11.11;ReadPosRankSum=-1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:982,0,985 -chr6 53435987 . A C 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.503;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=21.03;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:63:554,0,63 -chr6 53435992 . T A 1098.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:76:1127,76,0 -chr6 53436625 . AT A 947.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:66:985,66,0 -chr6 53436630 . T A 956.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:985,66,0 -chr6 53436842 . CTT C 551.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=-0.980;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:41:856,41,0 -chr6 53942560 . G T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.740;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=12.28;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:90:323,0,90 -chr6 53942979 . T A 1506.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.306;DP=56;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=26.91;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:99:1535,105,0 -chr6 53943117 . A T 2395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-1.029;DP=97;FS=7.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.130;QD=24.70;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,39:74:99:2424,0,1201 -chr6 53943153 . T C 2401.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=-1.308;DP=74;FS=5.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=32.46;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,34:53:99:2430,0,1201 -chr6 53943745 . A T 1394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=1.656;DP=40;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.884;QD=34.87;ReadPosRankSum=-1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:99:1423,109,0 -chr6 53943783 . T G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=-2.716;DP=78;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=5.83;ReadPosRankSum=-1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:483,0,484 -chr6 53944272 . A T 250.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=25.08;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:279,0,22 -chr6 54045462 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=-0.939;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:380,0,488 -chr6 54048002 . C G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=28.42;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:45:284,0,45 -chr6 54048362 . T C 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 -chr6 54048630 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.474;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:459,0,306 -chr6 54072537 . G A 864.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=-0.122;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=21.09;ReadPosRankSum=1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:99:893,0,513 -chr6 54107309 . T A 295.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.721;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:419,0,905 -chr6 54107363 . G A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.115;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:492,0,1400 -chr6 54107370 . G C 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.384;DP=32;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.806;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:492,0,1419 -chr6 54121308 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=1.936;DP=15;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:269,0,302 -chr6 54127404 . C T 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=-0.917;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:487,0,718 -chr6 54132636 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=1.023;DP=438;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=1.70;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:367,70:437:99:773,0,14255 -chr6 54211912 . C CA 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-3.073;DP=73;FS=15.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,19:66:99:307,0,1255 -chr6 54217456 . C T 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=1.296;DP=148;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.864;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,27:148:99:418,0,4576 -chr6 54226165 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=-0.065;DP=95;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.035;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,16:95:99:246,0,3270 -chr6 54279752 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-1.505;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:466,0,588 -chr6 54280006 . T C 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.492;DP=39;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.009;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:622,0,698 -chr6 54385784 . A G 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.564;DP=284;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:227,54:281:99:841,0,9036 -chr6 54388379 . C T 1066.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-0.295;DP=474;FS=8.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:392,82:474:99:1095,0,15534 -chr6 54393811 . G C 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-1.947;DP=71;FS=5.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.723;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,16:71:99:321,0,2099 -chr6 54628012 . GT G 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.170;DP=17;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:48:380,0,48 -chr6 54628521 . A G 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:284,0,108 -chr6 54629062 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.732;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:244,0,530 -chr6 54630992 . A C 1498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.540;DP=59;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=25.40;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,40:55:99:1527,0,440 -chr6 54636208 . A AC 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:287,0,123 -chr6 54780832 . TCCTGTGAAAAGATAAGAAATTCCTTGTTTTGTTCTGCATCTACAACCAAATTTCACATGAAGAAACCTTAGTAAATAAAGTTTTGAGCATATGCTAGTATTCATTTGCATA T 1120.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=2.289;DP=33;FS=2.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.848;QD=33.96;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:99:1158,0,654 -chr6 55180238 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=21.13;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:324,0,182 -chr6 55268217 . TCTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAAATTTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTAC T 2519.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=-0.185;DP=420;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=6.00;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,109:402:99:2557,0,12615 -chr6 55268218 . CTGCATAACCACACAAAGCAATGGAATGAACTACAGTCAGAA C 10897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.255;DP=419;FS=2.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=26.01;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,289:401:99:10935,0,3544 -chr6 55268262 . TTCCACCAAATAGAAAAGGATGTATATAAAGGCCTTACCATC T 10897.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.304;DP=430;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.838;QD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,301:412:99:10935,0,3775 -chr6 55273501 . CCCTAAAAGTAAATTACGAGATGCTCATTCACTGTGAACTTCATTTATCAAAGTTTTAAGACTAAGAAAATGTTTGTTTA C 3399.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=1.264;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.140;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,77:79:99:3437,273,0 -chr6 55309681 . AT A 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=1.030;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.746;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:32:461,0,32 -chr6 55605040 . ACTGCAAAACATCAACTTTTAGAGACGACACGATTATAAACGTGCTGAATATTGGACGTTTTGTTCAAGTTCTTAC A 1090.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-0.602;DP=33;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=33.05;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:99:1128,0,589 -chr6 56149167 . A C 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.890;DP=94;FS=7.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:356,0,2980 -chr6 56149234 . C T 1475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.619;DP=128;FS=10.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.058;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.838 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,44:124:99:1504,0,2723 -chr6 56149283 . G A 1690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.918;DP=149;FS=5.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,52:147:99:1719,0,3324 -chr6 56150944 . GAA G 965.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.569;DP=84;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.430;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,35:81:99:1161,0,1379 -chr6 56252998 . A G 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.830;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=14.10;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:282,0,346 -chr6 57583460 . T C 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.139;DP=57;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,22:57:99:751,0,1226 -chr6 57583513 . T C 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.657;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:743,0,1449 -chr6 57739650 . TA T 618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.457;DP=46;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,28:45:99:656,0,435 -chr6 57740774 . A T 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=3.596;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.229;QD=16.57;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:774,0,918 -chr6 57795157 . T A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.198;DP=34;FS=5.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:438,0,1694 -chr6 57796880 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=-0.704;DP=24;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=21.57;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:546,0,277 -chr6 57805105 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=-0.088;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.088;QD=8.37;ReadPosRankSum=0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:229,0,489 -chr6 58427061 . AGTGAGTCAAGCTGCAGCACAAATGGAGAAGCTTTTATTGGTGGAAAGACTGGTTTTGACTGGTTTCTGCTGTGTGTTTCAG A 7985.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=1.924;DP=179;FS=1.531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=27.87;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,172:179:99:8023,648,0 -chr6 59116333 . T G 1971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=2.205;DP=73;FS=4.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.510;QD=27.01;ReadPosRankSum=-2.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,57:72:99:2000,0,275 -chr6 59148718 . A G 3096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=2.265;DP=92;FS=2.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=33.66;ReadPosRankSum=-2.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,60:91:99:3125,0,378 -chr6 59150040 . T TA 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.718;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=21.78;ReadPosRankSum=2.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:364,0,105 -chr6 59354581 . CTG C 1620.27 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.093;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=33.76;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,44:48:1:1655,1,0 -chr6 59356812 . TCCTGACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGCAGACTGTTAACCAGTAGGCACACTTTACCAGCACACACTTAACCGGCAACACACATAGTTAATCAGTTTA T 316.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=2.819;DP=57;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.531;QD=5.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,47:50:99:354,133,0 -chr6 59376498 . G A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:364,0,54 -chr6 59382557 . T C 463.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:492,36,0 -chr6 59412577 . C T 1307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=1.028;DP=39;FS=6.368;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=33.53;ReadPosRankSum=-0.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:39:27:1336,27,0 -chr6 59413080 . G A 1706.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1735,129,0 -chr6 59413302 . C A 1001.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.769;DP=32;FS=2.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=31.31;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:22:1030,0,22 -chr6 59445642 . G A 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr6 59539065 . T G 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr6 59563774 . GTAAAA G 6694.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=-0.547;DP=252;FS=5.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.681;QD=26.57;ReadPosRankSum=-3.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,178:249:99:6732,0,34466 -chr6 59563780 . GCACTGCGTCCTACAACCCCATCCAGCCCATGCAGAGCGCAGGCAGGTGTCGCCGCACACACCTGAGAGCCTGCTCTGTTTCGCCCTCTGCCAGTGATGCTTTACTGATGGGTATCTCTGTCTCTTAGGA G 6705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=1.703;DP=293;FS=4.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=22.89;ReadPosRankSum=-2.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,178:285:99:6743,0,34466 -chr6 59563822 . GCA G 1442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=-7.903;DP=249;FS=5.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=5.79;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,64:243:99:1480,0,43957 -chr6 59563825 . GGTGTCGCCGCACACACCTGAGAGCCTGCTCTGTTTCGCCCTCTGCCAGTGATGCTTTACTGATGGGTATCTCTGTCTCTTAGGA G 1471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=-8.204;DP=254;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.999;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,64:244:99:1509,0,43957 -chr6 59564039 . CGGTGAGTCTCTCTTCACACAATTTGGGGAACATCTGGTGCATGTCTGTGTGTGAGACTGAAGCGCTGTTGTGTTCCTCA C 1459.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=1.947;DP=398;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.142 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,373:376:99:1497,578,0 -chr6 59574057 . GAGGTACGCAGACGTGCTGCTGTCCTTCCCTTCAGCTCCAGCTCTCTCGACTTGAGTGTGAAGAGTCCGAGTTAGAGCTCGGTTAGCTGCTCGCGCTCCTGGTGTTAGCAGCGCTGTGGAGGATTGAGCGGGTCGTCTGTGATTGGACGGTGGCGCTGACTCTGCTGTGCTCCTC G 12720.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=1.908;DP=344;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.824 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,333:337:99:12758,966,0 -chr6 59574312 . A G 19524.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-2.639;DP=302;FS=3.367;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=32.11;ReadPosRankSum=0.982 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,294:301:99:19553,1583,0 -chr6 59574354 . TGGTAAGGGTCGGTTTCGCTCCCAGTGCCCTCATTGGGGAGCGCACGCTGCTTTATTCCTGTGGTGATCATCAGTGTGTGCATGCTAACGCTAACGCTGTGTGTTTCTGCCCGCA T 6565.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.311;DP=318;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=20.65;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,182:307:99:6603,0,13103 -chr6 59574360 . GGGTCGGTTTCGCTCCCAGTGCCCTCATTGGGGAGCGCACGCTGCTTTATTCCTGTGGTGATCATCAGTGTGTGCATGCTAACGCTAACGCTGTGTGTTTCTGCCCGCA G 3746.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.936;DP=313;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=11.97;ReadPosRankSum=-2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,118:307:99:3784,0,16150 -chr6 59574588 . C CAT 6891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=-1.936;DP=181;FS=6.701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.26;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=30.34;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,163:174:99:6929,411,0 -chr6 59575393 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.714;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.191;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:99:365,0,186 -chr6 59575401 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:365,0,186 -chr6 59600346 . G A 867.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-1.453;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.142;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:68:896,0,68 -chr6 59619434 . GAGGTGCGTGCGTGCGTGTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGCTGCAGTAACGCTCTGCTCCTCCAC G 1772.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.477;DP=58;FS=4.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=30.56;ReadPosRankSum=0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,49:54:99:1810,0,114 -chr6 59641817 . GAGGTGTGTGTGTGTGTTACTGCTTTGTGTGCGTTACTGCTCTATGTGTGTGTATTTTACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGC G 4879.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=2.092;DP=162;FS=11.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,134:145:99:4917,0,836 -chr6 59708141 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=1.133;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:239,0,319 -chr6 59723225 . C G 7534.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-0.850;DP=193;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,185:193:99:7563,555,0 -chr6 59725684 . A T 1466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1495,102,0 -chr6 59739173 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=-1.537;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:509,0,111 -chr6 59740577 . T C 1486.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.219;DP=45;FS=2.027;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=33.04;ReadPosRankSum=-2.014 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,41:45:51:1515,51,0 -chr6 59793804 . G GT 685.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=4.863;DP=145;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,106:136:99:723,0,1180 -chr6 59803665 . CTT C 7374.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=1.456;DP=174;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=28.42;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,165:173:99:7412,503,0 -chr6 59809177 . G A 406.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.203;DP=13;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=31.29;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:0:432,0,0 -chr6 59809390 . C A 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=2.037;DP=22;FS=5.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:94:604,0,94 -chr6 59827109 . C T 665.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:694,48,0 -chr7 484826 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.377;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.660;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:242,0,217 -chr7 490571 . A G 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.585;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.246;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:391,0,392 -chr7 644640 . C CT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:257,0,850 -chr7 700429 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=1.408;DP=66;FS=2.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:318,0,1875 -chr7 720544 . G A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.287;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.297;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:339,0,1615 -chr7 729370 . A G 2295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=1.494;DP=222;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.869;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,76:221:99:2324,0,5403 -chr7 730936 . CCTGTACGACTACACAACACCACACAACACACTACACACACCTGTATGACCACAATACACTACACTACACACCTGAACCACTACTCTATACAACACTACACACCTCACGACAACACTACACACCACAT C 1750.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=6.104;DP=400;FS=3.911;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=4.38;ReadPosRankSum=-3.135 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,364:377:99:1788,718,0 -chr7 747411 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=4.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:278,0,579 -chr7 1524730 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=1.368;DP=20;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.292;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,355 -chr7 1615029 . AGTGAGCATATAGACTGTTTTATTTATGGTTTATTTTTCACCTTAATAACTGGATTGTGTCCTGCAG A 1920.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=-1.041;DP=49;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,45:49:99:1958,0,1007 -chr7 1624971 . T C 625.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.822;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=32.90;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:653,11,0 -chr7 1625072 . G A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:96:303,0,96 -chr7 1625082 . A C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,3:3:96:303,0,96 -chr7 1648585 . G A 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.114;DP=115;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=13.92;ReadPosRankSum=1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1629,0,1706 -chr7 1654725 . T A 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=-0.142;DP=43;FS=3.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:426,0,671 -chr7 1654777 . C T 544.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.683;DP=49;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.114;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,17:46:99:573,0,920 -chr7 1661959 . A G 508.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.043;DP=30;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.516;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:537,0,298 -chr7 1670202 . A G 689.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=1.216;DP=41;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,22:41:99:718,0,701 -chr7 1671514 . A T 752.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.027;DP=40;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.997;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:781,0,570 -chr7 1696431 . A G 482.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.238;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=30.17;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:511,0,35 -chr7 1726465 . A C 2922.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=-0.205;DP=367;FS=13.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,118:365:99:2951,0,9246 -chr7 1746706 . G A 2426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=-1.427;DP=395;FS=1.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.554;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:244,117:361:99:2455,0,7150 -chr7 1746713 . G A 2448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,4:4:99:2477,0,7150 -chr7 1753342 . C T 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=2.409;DP=384;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:305,78:383:99:1158,0,12681 -chr7 2642863 . C G 1447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.012;DP=170;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.797;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,56:170:99:1476,0,4393 -chr7 2654280 . G A 2884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.313;DP=127;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.112;QD=22.71;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,48:120:99:2913,0,3387 -chr7 2705657 . T C 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=-0.159;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:362,0,760 -chr7 2706183 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=-0.423;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:80:314,0,80 -chr7 3287475 . T A 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr7 3423610 . T A 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 -chr7 3596882 . T A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=1.067;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:234,0,59 -chr7 3597776 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=1.531;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:300,0,100 -chr7 3637110 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=-0.322;DP=13;FS=6.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=26.91;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:378,0,49 -chr7 4046282 . C G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=-1.812;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:327,0,401 -chr7 4104429 . A AT 541.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=-0.185;DP=65;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,24:64:99:579,0,1088 -chr7 4106190 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=-0.635;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:270,0,1811 -chr7 4262342 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=-3.363;DP=182;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=1.55;ReadPosRankSum=2.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,27:181:99:311,0,12574 -chr7 4262345 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-3.134;DP=189;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=1.44;ReadPosRankSum=2.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,28:188:99:300,0,12574 -chr7 4274592 . C T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=3.657;DP=160;FS=6.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,30:160:99:477,0,4921 -chr7 4472960 . G GA 366.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:404,30,0 -chr7 4568044 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr7 4773649 . G A 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:503,36,0 -chr7 5570470 . A T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=2.266;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:393,0,163 -chr7 5571311 . C T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-1.120;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.766;QD=20.18;ReadPosRankSum=1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:331,0,326 -chr7 6219015 . C CT 558.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=-1.554;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.418;QD=6.50;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,27:78:99:596,0,1266 -chr7 6223157 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr7 6225604 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=-1.656;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,13:63:99:244,0,2029 -chr7 6226089 . A T 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=-0.709;DP=34;FS=1.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:448,0,810 -chr7 6358967 . T C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.584;DP=38;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:238,0,1634 -chr7 6364176 . A G 236.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:20:265,20,0 -chr7 6546804 . G A 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.983;DP=26;FS=8.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=27.72;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:749,0,185 -chr7 6661716 . T G 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 -chr7 6661846 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=32.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:317,0,57 -chr7 6661865 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=25.71;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:311,0,238 -chr7 6664558 . C T 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=-2.010;DP=36;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=23.74;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:99:883,0,170 -chr7 6750459 . A C 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.124;ClippingRankSum=8.116;DP=164;FS=67.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=4.67;ReadPosRankSum=-2.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,28:152:99:794,0,4991 -chr7 6750471 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=8.177;DP=161;FS=73.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.281;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,28:161:99:405,0,5842 -chr7 6753678 . T G 668.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=6.201;DP=172;FS=33.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=3.89;ReadPosRankSum=-4.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,36:172:99:697,0,5162 -chr7 6799589 . G A 3836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=-0.883;DP=308;FS=47.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=12.46;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,120:307:99:3865,0,7929 -chr7 6801495 . A T 1209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;ClippingRankSum=1.542;DP=213;FS=26.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.341;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,53:213:99:1238,0,6184 -chr7 6801508 . G A 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.117;DP=205;FS=33.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,43:205:99:771,0,6409 -chr7 6803298 . T A 2300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=2.603;DP=187;FS=4.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=12.30;ReadPosRankSum=-2.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,68:186:99:2329,0,4861 -chr7 6817320 . C CTA 276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:314,21,0 -chr7 6820922 . A T 1745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=-1.048;DP=85;FS=7.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.166;QD=20.54;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,53:85:99:1774,0,1034 -chr7 6908956 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=-0.178;DP=77;FS=2.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=3.59;ReadPosRankSum=-2.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,17:77:99:305,0,2497 -chr7 6919512 . T C 905.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=1.514;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=31.24;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,22:24:27:934,27,0 -chr7 6919518 . G T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.804;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:361,0,784 -chr7 7075005 . G T 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DP=26;FS=6.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=9.95;ReadPosRankSum=-0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:287,0,610 -chr7 7075075 . A G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=-1.553;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.019;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:415,0,714 -chr7 7075232 . T C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:280,0,413 -chr7 7075290 . G A 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=-0.656;DP=20;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=13.54;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:299,0,411 -chr7 7075361 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=-1.682;DP=44;FS=4.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:679,0,1031 -chr7 7179763 . G A 3547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-1.792;DP=127;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=27.94;ReadPosRankSum=2.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,104:120:99:4831,0,791 -chr7 7179856 . A G 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.198;DP=129;FS=26.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.079;QD=12.18;ReadPosRankSum=-5.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,47:128:99:1599,0,9315 -chr7 7179862 . A C 2264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=-0.560;DP=122;FS=15.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.846;QD=18.56;ReadPosRankSum=4.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,55:121:99:2293,0,4171 -chr7 7179871 . A C 1570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=-1.228;DP=90;FS=4.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=17.45;ReadPosRankSum=-2.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,12:90:99:1599,0,9209 -chr7 7179872 . T C 1737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.658;DP=88;FS=0.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.429;QD=19.75;ReadPosRankSum=-2.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,52:88:99:1766,0,5569 -chr7 7181982 . A T 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-1.692;DP=122;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,31:115:99:773,0,4014 -chr7 7182907 . A T 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=-0.258;DP=49;FS=12.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:541,0,1080 -chr7 7183116 . T C 702.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-0.245;DP=59;FS=3.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=11.91;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:731,0,963 -chr7 7228746 . T C 1296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=4.131;DP=246;FS=19.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.274;QD=5.27;ReadPosRankSum=-4.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,62:245:99:1325,0,6837 -chr7 7228787 . T G 8105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=14.287;DP=432;FS=5.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,250:431:99:8134,0,6106 -chr7 7230677 . T G 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.211;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.551;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:569,0,180 -chr7 7234556 . T C 1859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=9.098;DP=351;FS=7.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=5.30;ReadPosRankSum=-7.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:262,88:350:99:1888,0,18093 -chr7 7235051 . C T 7563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=-3.188;DP=237;FS=20.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=31.91;ReadPosRankSum=2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:198,39:237:99:7592,0,7116 -chr7 7235839 . C T 2044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=-2.079;DP=308;FS=2.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.932;QD=6.64;ReadPosRankSum=4.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,81:299:99:2073,0,8407 -chr7 7241500 . A T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=-0.881;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:1001,0,2988 -chr7 7241509 . C T 972.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=-0.544;DP=76;FS=5.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=12.80;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,28:76:99:1001,0,2959 -chr7 7241716 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-3.348;DP=162;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.150;QD=3.26;ReadPosRankSum=-5.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,33:162:99:556,0,5062 -chr7 7245132 . C T 3621.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=-0.384;DP=289;FS=5.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,108:288:99:3650,0,11212 -chr7 7246767 . TA T 774.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=-7.955;DP=178;FS=4.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,61:175:99:812,0,5758 -chr7 7247015 . G A 2449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.546;DP=251;FS=6.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,77:229:99:2478,0,15885 -chr7 7247068 . AAC A 2549.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;ClippingRankSum=0.199;DP=166;FS=11.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=15.36;ReadPosRankSum=-4.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,12:149:99:2587,0,15879 -chr7 7247191 . G A 1406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=-0.502;DP=189;FS=12.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,56:189:99:1435,0,5281 -chr7 7247311 . T C 2326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.476;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=15.94;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,65:143:99:2355,0,2637 -chr7 7247392 . T C 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.673;DP=44;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.235;QD=14.81;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:680,0,2589 -chr7 7247401 . G A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=1.453;DP=34;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:680,0,2502 -chr7 7250240 . G C 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.834;DP=53;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.799;QD=15.26;ReadPosRankSum=-3.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:837,0,1885 -chr7 7250243 . C A 971.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=-0.739;DP=53;FS=9.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=18.34;ReadPosRankSum=-1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,28:53:99:1000,0,872 -chr7 7250428 . C T 1514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=1.300;DP=76;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,29:70:99:1543,0,2694 -chr7 7250495 . C T 2371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-1.638;DP=201;FS=16.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=11.80;ReadPosRankSum=2.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,74:200:99:2400,0,5105 -chr7 7250558 . G A 3708.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-1.409;DP=330;FS=6.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.338 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,117:319:99:3737,0,7519 -chr7 7256015 . T A 2435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.546;DP=180;FS=5.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=13.53;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,71:177:99:2464,0,3613 -chr7 7265051 . C T 5878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-1.898;DP=153;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=26.46;ReadPosRankSum=4.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,121:152:99:5907,0,1173 -chr7 7266593 . A G 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=1.375;DP=69;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.279;QD=17.11;ReadPosRankSum=1.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,33:69:99:1209,0,1192 -chr7 7267201 . G A 1486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=3.913;DP=68;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.930;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,46:68:99:1515,0,1007 -chr7 7267223 . T C 1742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.210;DP=81;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.864;QD=21.52;ReadPosRankSum=-2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,56:81:99:1771,0,1114 -chr7 7268257 . G A 604.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=-0.909;DP=158;FS=6.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.403;QD=3.83;ReadPosRankSum=2.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,35:158:99:633,0,5675 -chr7 7269454 . T A 1237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.303;DP=75;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,40:75:99:1266,0,1252 -chr7 7271101 . G T 2209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.203;DP=164;FS=2.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,69:163:99:2238,0,8703 -chr7 7271104 . T C 3399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=3.989;DP=175;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=19.43;ReadPosRankSum=-3.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,62:168:99:3428,0,5599 -chr7 7271113 . C T 2976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=4.489;DP=227;FS=1.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=13.11;ReadPosRankSum=-3.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,91:226:99:3005,0,10564 -chr7 7271278 . G A 1990.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=-0.125;DP=220;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=9.05;ReadPosRankSum=0.984 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,92:193:99:2019,0,9655 -chr7 7271416 . T C 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=-2.052;DP=181;FS=8.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:133,48:181:99:570,0,11141 -chr7 7278938 . T G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:288,0,378 -chr7 7279948 . G A 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-1.034;DP=29;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:496,0,509 -chr7 7281318 . GAT G 623.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=-1.054;DP=94;FS=5.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=2.597;QD=6.64;ReadPosRankSum=1.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:661,0,3284 -chr7 7281667 . A G 764.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=1.264;DP=371;FS=7.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.909;QD=2.06;ReadPosRankSum=2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,64:371:99:793,0,11538 -chr7 7282475 . GA G 2312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.691;ClippingRankSum=-0.228;DP=212;FS=9.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.376;QD=10.91;ReadPosRankSum=-4.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,24:212:99:2350,0,15980 -chr7 7282477 . G C 2332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.344;DP=203;FS=1.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=11.49;ReadPosRankSum=-1.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,16:203:99:2361,0,15980 -chr7 7290605 . T A 2771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.775;DP=237;FS=3.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=11.70;ReadPosRankSum=1.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,85:236:99:2800,0,5111 -chr7 7290692 . G A 2163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.275;DP=293;FS=1.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=7.38;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,90:291:99:2192,0,7478 -chr7 7290791 . G A 3003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=-1.593;DP=271;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.310;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,92:271:99:3032,0,6561 -chr7 7291640 . T A 4365.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.458;DP=106;FS=8.065;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.759;QD=30.17;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,100:106:99:4394,214,0 -chr7 7291756 . G A 14275.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=-1.976;DP=356;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=30.77;ReadPosRankSum=1.926 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,346:350:99:14304,1040,0 -chr7 7292699 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.543;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=20.61;ReadPosRankSum=1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:461,0,280 -chr7 7292823 . CAT C 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.061;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:405,0,275 -chr7 7463153 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-4.121;DP=295;FS=14.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=0.78;ReadPosRankSum=-2.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,41:295:99:257,0,9878 -chr7 7516219 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.718;DP=60;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:246,0,1676 -chr7 7562049 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=-0.099;DP=205;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,30:204:99:264,0,6920 -chr7 7564759 . ATGCAGAG A 927.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:94:965,94,0 -chr7 7712132 . A AT 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.750;DP=95;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.359;QD=3.45;ReadPosRankSum=-2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,17:88:99:365,0,1960 -chr7 7757878 . T C 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.077;DP=13;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:342,0,141 -chr7 7846212 . C T 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=1.865;DP=32;FS=5.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.357;QD=20.06;ReadPosRankSum=-2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:670,0,370 -chr7 7854501 . CT C 491.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.994;DP=40;FS=1.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:99:529,0,246 -chr7 7856223 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.344;DP=33;FS=5.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=6.57;ReadPosRankSum=1.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:245,0,930 -chr7 7897764 . A T 231.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:260,18,0 -chr7 7925327 . T A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.677;DP=388;FS=1.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.710;QD=1.61;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:327,61:388:99:654,0,12283 -chr7 7936377 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.603;DP=23;FS=12.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=19.08;ReadPosRankSum=-2.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:467,0,329 -chr7 7936454 . A C 1128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=-1.042;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=32.25;ReadPosRankSum=0.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:33:1157,0,33 -chr7 7939228 . G A 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=3.479;DP=31;FS=9.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.222;QD=10.73;ReadPosRankSum=-3.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:361,0,560 -chr7 7939345 . T A 1404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=2.890;DP=108;FS=27.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=13.01;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,41:84:99:1433,0,1549 -chr7 7939367 . G T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=-0.013;DP=85;FS=28.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,23:66:99:789,0,1474 -chr7 7940295 . T G 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=-0.410;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.517;QD=4.22;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,23:73:99:657,0,2069 -chr7 7940300 . GT G 1774.50 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=-3.009;DP=155;FS=17.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=11.45;ReadPosRankSum=4.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,68:79:3:1810,0,3 -chr7 7940506 . A C 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=1.147;DP=32;FS=19.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.767;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:458,0,386 -chr7 7940625 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:279,0,53 -chr7 7942064 . C T 1481.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.144;DP=44;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.240;QD=33.68;ReadPosRankSum=0.087 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,41:43:99:1510,123,0 -chr7 7965600 . T TA 335.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:373,36,0 -chr7 8206071 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=1.242;DP=45;FS=3.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:289,0,1165 -chr7 8305506 . A AC 506.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=-2.892;DP=57;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.688;QD=8.89;ReadPosRankSum=-0.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,25:51:99:544,0,814 -chr7 8335243 . A G 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.762;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=30.52;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:869,0,167 -chr7 8425107 . A G 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.302;DP=90;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.095;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,29:90:99:719,0,2235 -chr7 8491501 . A T 973.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.747;DP=75;FS=3.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,25:75:99:1002,0,3764 -chr7 8493029 . C CA 234.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=1.072;DP=44;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:272,0,2350 -chr7 8686589 . A G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=2.153;DP=127;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=2.59;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,24:126:99:357,0,7672 -chr7 8686596 . A C 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=2.564;DP=121;FS=7.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=8.09;ReadPosRankSum=-2.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,33:121:99:1007,0,3364 -chr7 8687521 . G A 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.175;DP=106;FS=6.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.292;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:397,0,3291 -chr7 8689329 . A AT 480.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.318;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=12.33;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:546,0,266 -chr7 8841695 . T A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr7 9116056 . C T 878.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.670;DP=58;FS=7.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.109;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:907,0,1018 -chr7 9162921 . T A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 -chr7 9179912 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=1.411;DP=96;FS=6.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.461 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,25:96:99:548,0,5706 -chr7 9179917 . T G 847.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=1.101;DP=109;FS=7.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,32:109:99:876,0,2780 -chr7 9180769 . G A 1693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=-1.793;DP=214;FS=1.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,64:214:99:1722,0,6878 -chr7 9186929 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=-1.457;DP=21;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:329,0,413 -chr7 9187237 . T C 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=2.958;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:658,0,604 -chr7 9264130 . C T 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1080,72,0 -chr7 9264131 . T G 1051.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72:1080,72,0 -chr7 9296444 . A G 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 -chr7 9350515 . T G 225.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:254,18,0 -chr7 9350564 . G A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 -chr7 9501751 . C CT 413.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.993;DP=127;FS=7.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,30:116:99:451,0,1860 -chr7 9651384 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=-0.689;DP=28;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=7.78;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:246,0,700 -chr7 9697360 . T C 696.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.118;DP=11;FS=12.632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=38.62;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:22:725,22,0 -chr7 9698587 . T C 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:252,0,271 -chr7 9698903 . TA T 974.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=-1.669;DP=25;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=29.37;ReadPosRankSum=1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:1012,0,301 -chr7 9699462 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=-2.413;DP=25;FS=9.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=12.87;ReadPosRankSum=1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:350,0,593 -chr7 10028151 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=1.493;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:249,0,211 -chr7 10093614 . G A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.836;DP=122;FS=6.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.622;QD=6.87;ReadPosRankSum=-0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,33:122:99:866,0,7341 -chr7 10100530 . A G 554.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.990;DP=38;FS=4.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.163;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:583,0,809 -chr7 10101622 . A G 2111.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=-0.573;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=30.98;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:50:2140,50,0 -chr7 10101633 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,1:4:99:454,0,1135 -chr7 10291103 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.373;DP=35;FS=8.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.226;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:327,0,977 -chr7 10514048 . A G 240.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:269,18,0 -chr7 10573994 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.248;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=22.31;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:229,0,100 -chr7 10680637 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=1.803;DP=25;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=11.67;ReadPosRankSum=-2.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:320,0,511 -chr7 10783334 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DP=12;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:294,0,186 -chr7 11417025 . T G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.463;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:331,0,1200 -chr7 11453158 . G A 1058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.275;DP=150;FS=2.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.002;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,44:150:99:1087,0,5887 -chr7 11500130 . A G 1932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.790;DP=66;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=29.28;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:1961,0,222 -chr7 11517850 . C T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=1.132;DP=56;FS=5.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.482;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,18:56:99:518,0,1438 -chr7 11688016 . G A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=1.099;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.436;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:350,0,2593 -chr7 11692170 . C CT 417.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=-0.192;DP=32;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.381;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:455,0,305 -chr7 11693441 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-1.099;DP=51;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,12:51:99:276,0,1643 -chr7 11729572 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.205;DP=82;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:265,0,2436 -chr7 11729618 . C A 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.343;DP=85;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,19:85:99:375,0,2522 -chr7 11729864 . C G 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=1.284;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.885;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,22:91:99:450,0,2391 -chr7 11729897 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=-0.616;DP=80;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:264,0,2250 -chr7 11729942 . C G 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-0.584;DP=55;FS=1.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:404,0,1330 -chr7 11822893 . T C 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.647;DP=92;FS=4.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.235;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,29:92:99:767,0,2437 -chr7 12208571 . G T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.153;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=5.92;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:277,0,1209 -chr7 12407699 . T C 203.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:232,0,25 -chr7 12408207 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.998;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:275,0,291 -chr7 12410101 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=24.62;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:93:299,0,93 -chr7 12882714 . G A 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.707;DP=79;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,23:79:99:579,0,2160 -chr7 13666525 . A AT 285.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 -chr7 13667655 . A AG 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.494;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:740,0,420 -chr7 13743131 . A T 271.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:300,21,0 -chr7 14180913 . T C 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=-0.412;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=19.92;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:327,0,218 -chr7 14181072 . T C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.110;DP=34;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:324,0,871 -chr7 14453586 . A G 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.024;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.289;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:663,0,1373 -chr7 14453623 . A C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-1.117;DP=64;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=7.17;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:487,0,1712 -chr7 14499055 . T C 333.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=33.39;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:362,0,14 -chr7 14506494 . T A 337.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:366,27,0 -chr7 14509415 . G C 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.694;DP=26;FS=4.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=25.95;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:99:703,0,372 -chr7 14509417 . G A 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.030;DP=26;FS=7.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=30.49;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:821,0,134 -chr7 14542327 . T C 2077.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.876;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.593;QD=33.88;ReadPosRankSum=-1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,46:50:70:2106,70,0 -chr7 14556466 . CCCTGGTTTAAAAAACAACAACAACAACACAACAGGTGTCATATTATCACTATAATGATACTTCCAATAACAATCAGATTTGTAGGCTCAGTATTGTTTGTATA C 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=105;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,1:5:99:313,0,2536 -chr7 14771691 . A C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.209;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=20.18;ReadPosRankSum=-2.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:331,0,497 -chr7 15251801 . C CT 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-3.141;DP=300;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,49:271:99:246,0,6468 -chr7 15692337 . C G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=2.153;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=28.30;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:79:481,0,79 -chr7 15716239 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=1.517;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.871;QD=10.77;ReadPosRankSum=-0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,528 -chr7 15885808 . C T 350.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:379,27,0 -chr7 16588621 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=-2.397;DP=164;FS=5.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,28:164:99:398,0,5220 -chr7 16595569 . C T 831.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=-0.884;DP=290;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,54:290:99:860,0,11921 -chr7 16595671 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.184;DP=309;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.526;QD=2.65;ReadPosRankSum=1.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,56:309:99:848,0,9739 -chr7 16663808 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.506;DP=62;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.204;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:379,0,3975 -chr7 16663831 . C T 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-0.568;DP=59;FS=2.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.764;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:370,0,3975 -chr7 16664848 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=-0.949;DP=67;FS=6.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:263,0,2945 -chr7 16940392 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=15.52;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:230,0,271 -chr7 16955059 . TCTACAACAGGAGGAGAGGAGAAATTCCTCAGCAGGAGTGCGAGTGTTGTCCTGTGATGTAAGCAGATAGAAATACACTGAC T 3516.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=1.765;DP=86;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.648;QD=36.13;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,83:86:99:3554,269,0 -chr7 16975839 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-2.436;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=14.41;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:302,0,393 -chr7 17225422 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.763;DP=52;FS=4.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=6.67;ReadPosRankSum=1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:375,0,1318 -chr7 17288913 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.789;DP=64;FS=5.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.970;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:322,0,2472 -chr7 17354266 . G T 2866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=-0.123;DP=251;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=11.42;ReadPosRankSum=3.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,88:251:99:2895,0,5516 -chr7 17357326 . A G 2213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=-0.690;DP=197;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.669;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,67:197:99:2242,0,4477 -chr7 17361176 . A G 1948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.232;DP=161;FS=2.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.865;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,60:161:99:1977,0,3538 -chr7 17364815 . A T 2244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=-0.194;DP=197;FS=3.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:130,67:197:99:2273,0,4609 -chr7 17373367 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=1.350;DP=73;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=5.48;ReadPosRankSum=-1.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,18:73:99:428,0,2343 -chr7 17738439 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-1.299;DP=32;FS=9.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:233,0,1453 -chr7 17781803 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=2.141;DP=51;FS=14.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.500;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:234,0,1953 -chr7 17787790 . CT C 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.560;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=11.16;ReadPosRankSum=-2.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:312,0,242 -chr7 17803054 . G A 745.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-0.744;DP=227;FS=23.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,45:227:99:774,0,7108 -chr7 18022955 . T A 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=1.557;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:81:424,0,81 -chr7 18024017 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr7 18024359 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=21.25;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:262,0,131 -chr7 18316705 . A G 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 18316708 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 18526616 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:64:270,0,64 -chr7 18550418 . C T 365.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:394,27,0 -chr7 18682039 . A T 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 -chr7 18732910 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.177;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.237;QD=19.58;ReadPosRankSum=0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:322,0,209 -chr7 18732967 . A G 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=-1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:240,0,58 -chr7 18735739 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:47:307,0,47 -chr7 18735757 . T C 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=-1.157;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=22.06;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:315,0,115 -chr7 18735847 . G C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=-0.533;DP=13;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.545;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:244,0,163 -chr7 18741406 . A G 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.887;QD=25.71;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:491,0,154 -chr7 18750914 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=-1.453;DP=55;FS=2.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.993 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:466,0,1304 -chr7 18751059 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.836;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:248,0,804 -chr7 18752020 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-2.034;DP=13;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=23.91;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:95:339,0,95 -chr7 18817426 . A T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:229,0,139 -chr7 18940869 . A T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 -chr7 18941481 . T C 609.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=-0.191;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=25.41;ReadPosRankSum=-1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:638,0,185 -chr7 18951421 . A G 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.764;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:505,0,502 -chr7 19001748 . G A 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.068;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.269;QD=19.08;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:448,0,317 -chr7 19002591 . G A 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:534,39,0 -chr7 19003232 . T G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.313;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.103;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:291,0,277 -chr7 19004566 . G A 542.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:571,42,0 -chr7 19048116 . A AT 203.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 -chr7 19052350 . C G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=-3.047;DP=100;FS=5.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=2.10;ReadPosRankSum=3.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,17:100:99:238,0,3493 -chr7 19057268 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=1.918;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:265,0,2390 -chr7 19060647 . A T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=-1.944;DP=97;FS=3.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=2.80;ReadPosRankSum=2.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,18:97:99:300,0,3010 -chr7 19060715 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.110;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.218;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:257,0,3031 -chr7 19151515 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=1.415;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.025;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:233,0,447 -chr7 19188411 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=1.180;DP=310;FS=4.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:256,53:309:99:506,0,8451 -chr7 19189479 . C A 2183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=-1.573;DP=179;FS=12.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=12.20;ReadPosRankSum=1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,64:179:99:2212,0,5009 -chr7 19189787 . C CT 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.497;DP=197;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.240;QD=1.23;ReadPosRankSum=-1.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,37:177:99:279,0,3681 -chr7 19190384 . G GA 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-1.227;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:273,0,1385 -chr7 19206408 . C T 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-1.247;DP=48;FS=4.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,27:48:99:919,0,767 -chr7 19210444 . C G 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=-1.091;DP=45;FS=7.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=7.44;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:363,0,1200 -chr7 19210459 . C T 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=-0.949;DP=51;FS=10.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=8.70;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:472,0,1263 -chr7 19216945 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=19.89;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:446,0,270 -chr7 19317149 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.660;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.493;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:262,0,213 -chr7 19317342 . CA C 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:49:287,0,49 -chr7 19319406 . C A 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:364,0,579 -chr7 19360715 . T C 1031.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.152;DP=213;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,51:212:99:1060,0,6017 -chr7 19360727 . A G 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-0.008;DP=216;FS=5.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,43:216:99:671,0,6509 -chr7 19360821 . G A 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=1.689;DP=160;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,39:160:99:754,0,4397 -chr7 19361029 . G T 9181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-2.409;DP=122;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:9210,0,993 -chr7 19361152 . A T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.005;ClippingRankSum=-0.756;DP=177;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,36:177:99:304,0,10360 -chr7 19361790 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=-0.262;DP=189;FS=2.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,43:188:99:413,0,14700 -chr7 19361807 . G A 1164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.577;DP=183;FS=7.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=6.36;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,47:178:99:1193,0,10824 -chr7 19361914 . G A 1966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=4.068;DP=121;FS=5.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=16.25;ReadPosRankSum=2.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,59:121:99:1995,0,6896 -chr7 19362187 . C T 1148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.316;DP=241;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:182,58:240:99:1177,0,9281 -chr7 19362226 . G A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=-0.458;DP=273;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:230,43:273:99:406,0,11835 -chr7 19362367 . C A 704.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=1.000;DP=222;FS=5.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,44:222:99:733,0,8295 -chr7 19362557 . G T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=-1.458;DP=84;FS=7.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=4.24;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,25:84:99:384,0,4226 -chr7 19362709 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=-1.146;DP=179;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.447;QD=4.38;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:136,43:179:99:813,0,6502 -chr7 19397670 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=1.914;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:306,0,498 -chr7 19679704 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=1.545;DP=31;FS=5.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:245,0,795 -chr7 19696867 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=-0.781;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:600,0,1777 -chr7 19774669 . T G 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.249;ClippingRankSum=0.184;DP=50;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.860;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:615,0,2079 -chr7 19920369 . G A 569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.220;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=8.50;ReadPosRankSum=-0.314 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,22:67:99:598,0,1784 -chr7 20123163 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.774;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:237,0,958 -chr7 20134611 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=1.362;DP=61;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:396,0,1629 -chr7 20134650 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=-0.122;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=5.91;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:318,0,1301 -chr7 20173077 . T C 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.507;DP=36;FS=6.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:593,0,637 -chr7 20281811 . G A 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.351;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.870;QD=6.17;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:540,0,2872 -chr7 20282370 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.636;DP=57;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:255,0,1686 -chr7 20282936 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=2.379;DP=29;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:513,0,447 -chr7 20282997 . T C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:264,0,212 -chr7 20283700 . T C 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.101;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:231,0,212 -chr7 20286115 . A G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=1.761;DP=49;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.443;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:234,0,1475 -chr7 20288242 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.488;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:240,0,1220 -chr7 20391766 . A T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.736;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=29.37;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:45:295,0,45 -chr7 20392017 . C T 610.96 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.714;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=32.39;ReadPosRankSum=-0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:5:638,5,0 -chr7 20393206 . C CT 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=-1.560;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=8.39;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:247,0,319 -chr7 20393820 . ATC A 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.37;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:60:311,0,60 -chr7 20393927 . T C 202.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:231,0,25 -chr7 20394109 . A G 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=-1.488;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.496;QD=30.63;ReadPosRankSum=-1.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:48:457,0,48 -chr7 20394126 . C T 527.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.579;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=29.11;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:0:553,0,0 -chr7 20483420 . C G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=3.873;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.072;QD=11.99;ReadPosRankSum=-3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:292,0,468 -chr7 20483501 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=3.523;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:439,0,430 -chr7 20550103 . GTGAGTTA G 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=-0.249;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:382,0,1100 -chr7 20550111 . CATCTACTATTCTAAAAAAACAAGAGGATTGACCATTTCTGTTCCAAATCTGTAATACTGTTTTTTTTTCTCAGGT C 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=-1.599;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:379,0,1100 -chr7 20653778 . G C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=1.088;DP=49;FS=8.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.885;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,20:49:99:721,0,948 -chr7 20657615 . G C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.309;DP=84;FS=1.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,32:84:99:925,0,2772 -chr7 20663243 . T G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:234,0,67 -chr7 20674335 . G A 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=-0.700;DP=22;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.258;QD=26.40;ReadPosRankSum=1.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:22:99:609,0,143 -chr7 20674460 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=-1.111;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:375,0,599 -chr7 20676140 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=-0.702;DP=19;FS=4.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=20.15;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:411,0,277 -chr7 20683952 . A G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.643;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=16.72;ReadPosRankSum=1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:463,0,409 -chr7 20715694 . CT C 1322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=-1.612;DP=173;FS=9.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,63:152:99:1360,0,1635 -chr7 20786796 . TCTGAAAAGAAAAACCATAAACCAAACCAAATCAAAGTAACCAATGGTATTTTGGACACCATTTCAGTAGTGGCAATCAAAAAAAAAAACGTACTGAC T 11077.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=4.182;DP=261;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=32.75;ReadPosRankSum=-4.187 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,251:257:99:11115,895,0 -chr7 20787750 . TCCTGAAAAGAAAAAACATTATCATTGCCTGTCTTTAGTTATTAAACTGAAACATGTTAAACCTTAACATTTA T 5235.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.266;DP=194;FS=1.648;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,164:170:99:5273,490,0 -chr7 20789597 . G C 2933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.656;DP=175;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=16.76;ReadPosRankSum=-0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,92:175:99:2962,0,2910 -chr7 20790921 . CCTTT C 1448.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=210;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=6.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:99:1486,119,0 -chr7 20794722 . G A 986.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.612;DP=207;FS=4.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.299;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,48:207:99:1015,0,6045 -chr7 20795407 . C CT 348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-1.104;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.477;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,38:155:99:386,0,3188 -chr7 20842139 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=1.513;DP=30;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.285;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:546,0,477 -chr7 21005140 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.869;DP=24;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:371,0,451 -chr7 21012441 . TTGGCTCCATCCTGTCATTGGAACAACA T 222.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=-1.763;DP=35;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=6.36;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:260,0,5206 -chr7 21067466 . TA T 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.313;DP=40;FS=1.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:427,0,466 -chr7 21068344 . G A 1790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=1.130;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=15.05;ReadPosRankSum=-2.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,52:118:99:1819,0,2245 -chr7 21136510 . CTT C 400.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.340;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:438,0,187 -chr7 21143604 . G T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=-0.732;DP=55;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=7.54;ReadPosRankSum=0.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,16:55:99:443,0,1536 -chr7 21222117 . G T 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-0.339;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:385,0,462 -chr7 21237601 . C T 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.927;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.970;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:390,0,431 -chr7 21436283 . G A 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=1.115;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.774;QD=7.35;ReadPosRankSum=2.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,21:73:99:565,0,2051 -chr7 21950356 . TA T 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=1.529;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=4.66;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,1:51:99:284,0,1451 -chr7 21951060 . A AT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=-0.022;DP=52;FS=4.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.150;QD=4.82;ReadPosRankSum=-2.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:288,0,1373 -chr7 21960066 . GCCTGAAAACATATGCATACTATAAATGTGTATATACTGTTTGCCACATAGAACTCAATTTTGTATTACAACAACAAAAATGAACTCA G 2522.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.579;DP=79;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=31.93;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,67:76:99:2560,0,1011 -chr7 22258034 . A G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=-0.235;DP=122;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,24:122:99:369,0,3760 -chr7 22258705 . G GT 343.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=-0.409;DP=41;FS=5.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,25:37:99:455,0,304 -chr7 22259522 . G A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.021;DP=137;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,22:137:99:281,0,4641 -chr7 22260264 . C T 650.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.809;DP=79;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:679,0,2087 -chr7 22260382 . A G 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=-0.609;DP=131;FS=5.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,28:131:99:544,0,6515 -chr7 22260624 . A C 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-0.970;DP=107;FS=1.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:588,0,3346 -chr7 22260719 . C A 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=-0.325;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:373,0,2673 -chr7 22261003 . A G 1251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.814;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.356;QD=20.52;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,36:61:99:1280,0,908 -chr7 22261659 . C T 693.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=1.579;DP=160;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,36:160:99:722,0,4859 -chr7 22700183 . G T 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=26.48;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:55:346,0,55 -chr7 22701076 . C T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.731;DP=10;FS=2.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:273,0,98 -chr7 22937617 . A G 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-1.132;DP=252;FS=8.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.090;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,55:252:99:983,0,7325 -chr7 22938069 . A T 551.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-2.619;DP=248;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.626;QD=2.22;ReadPosRankSum=2.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:201,45:246:99:580,0,7577 -chr7 22939623 . C T 391.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.451;DP=188;FS=1.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.692;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,32:188:99:420,0,8392 -chr7 22939716 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-1.371;DP=228;FS=3.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,34:228:99:295,0,7451 -chr7 22940292 . G A 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.154;DP=243;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.138;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,35:242:99:290,0,7887 -chr7 22942019 . C T 760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=-3.377;DP=284;FS=1.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.356;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,52:284:99:789,0,8870 -chr7 22942103 . C T 685.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.010;DP=249;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.232;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,46:249:99:714,0,7900 -chr7 22942429 . AGTATGTATGCAGCCTCCTCCTTACTCAGTTACATCACAGTTAGTGTAAAGGTTTCATCTATTTTCCTTTCCTCCTTTTCAG A 11992.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-0.187;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=32.86;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,343:355:99:12044,1025,0 -chr7 22943195 . C T 560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=-1.471;DP=179;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.205;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,34:178:99:589,0,5738 -chr7 22946501 . AT A 367.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.262;DP=109;FS=18.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,39:106:99:405,0,4463 -chr7 23045242 . TCCTGAAACACACAAAACAAGAAATATAACATACGACTGAATGAACAATTGGTAAATGAAGTGAATGTCTGACTCA T 3587.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=2.063;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=34.50;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,100:104:99:4347,317,0 -chr7 23475831 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=1.753;DP=21;FS=4.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=9.66;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:231,0,685 -chr7 23746475 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=-0.935;DP=55;FS=4.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=6.30;ReadPosRankSum=1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,15:55:99:375,0,1523 -chr7 23793134 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=1.200;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,752 -chr7 23793140 . C A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.821;QD=15.43;ReadPosRankSum=-1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,752 -chr7 23797351 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.170;DP=76;FS=2.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:272,0,2284 -chr7 23830714 . AAGGTTTGAGGGAAAACAAGATTTAAAAGCCTTTTCTATGAAGCATTTATCTAGAGAACTTACCATGTTTACTTATCTCTCACTCTTT A 2194.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.652;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.652;QD=31.35;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,52:56:99:2232,0,343 -chr7 23842839 . TGTGAGTACTTTTCATGCCTTCACGTAACATTAGTGAGGCTCAATAGTGTGTATGTAATTGTTTTTTGTGAATGTGTGGTGACTGATTTACGTGATCTTGTGCGGCAG T 5229.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=-0.693;DP=142;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=25.45;ReadPosRankSum=1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,130:142:99:5267,576,0 -chr7 23850822 . CA C 438.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.90;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:46:476,46,0 -chr7 23862447 . A T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=-0.812;DP=28;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.137;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:414,0,524 -chr7 23885617 . C T 1015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=-0.237;DP=165;FS=4.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,44:163:99:1044,0,4322 -chr7 23885699 . A G 890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=-1.636;DP=174;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,43:174:99:919,0,4516 -chr7 23915101 . C A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-3.212;DP=140;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=3.06;ReadPosRankSum=2.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,30:140:99:456,0,3997 -chr7 23926792 . CA C 1552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=2.007;DP=127;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=12.23;ReadPosRankSum=-2.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,74:108:99:1599,0,634 -chr7 23926963 . A AT 2348.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=-1.811;DP=153;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,93:139:99:2386,0,1218 -chr7 23926975 . T C 3487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.342;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=26.62;ReadPosRankSum=-1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,95:127:99:3516,0,1072 -chr7 23926983 . A AT 898.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.971;DP=126;FS=1.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=7.13;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,32:117:99:936,0,2047 -chr7 23927163 . A G 5605.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.18;MQ0=0;QD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:112:99:5634,427,0 -chr7 23927243 . G GA 255.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;QD=8.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:56:462,56,0 -chr7 23927401 . C T 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.628;DP=128;FS=0.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.695;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,57:109:99:1648,0,1807 -chr7 23927561 . C T 5469.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:126:99:5498,391,0 -chr7 23927705 . C A 1619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-3.630;DP=64;FS=7.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=25.31;ReadPosRankSum=3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1648,0,197 -chr7 23927715 . A T 2203.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2232,162,0 -chr7 23928088 . G GT,GTT 733.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-1.077;DP=45;FS=5.082;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.140;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,8,28:37:99:1184,777,731,197,0,114 -chr7 23956089 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.706;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.559;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,26:179:99:248,0,6116 -chr7 23956704 . G A 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-2.819;DP=203;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,33:202:99:354,0,8277 -chr7 23961704 . A AT 940.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=-0.817;DP=292;FS=2.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.637;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:200,80:280:99:978,0,5268 -chr7 23973353 . A AT 275.92 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;QD=13.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:36:373,36,0 -chr7 23980260 . C T 1616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=1.077;DP=491;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.176;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:393,97:490:99:1645,0,15315 -chr7 23981621 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.014;DP=41;FS=4.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=7.14;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:321,0,1869 -chr7 23982024 . C A 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-1.940;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.485;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:277,0,589 -chr7 23987066 . A T 2199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=1.321;DP=310;FS=4.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,97:308:99:2228,0,8903 -chr7 23987795 . C G 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=-0.188;DP=121;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,33:120:99:785,0,3641 -chr7 23991246 . G C 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=-1.876;DP=64;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=7.50;ReadPosRankSum=1.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,20:64:99:508,0,1616 -chr7 24017718 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=-0.018;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:474,0,720 -chr7 24018306 . A T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-1.005;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.708;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:359,0,3370 -chr7 24018307 . T G 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=-1.499;DP=61;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.276;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,15:61:99:359,0,3370 -chr7 24018489 . TTG T,TTGTG 203.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.543;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:7,13,11:31:99:440,119,536,196,0,622 -chr7 24079123 . A T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.321;DP=35;FS=1.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.208;QD=6.02;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:239,0,1070 -chr7 24149150 . C T 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=-3.663;DP=86;FS=4.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=22.03;ReadPosRankSum=2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,57:86:99:1923,0,935 -chr7 24149480 . A T 2015.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;ClippingRankSum=-0.079;DP=181;FS=14.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.371;QD=11.14;ReadPosRankSum=1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,63:181:99:2044,0,8027 -chr7 24151579 . A AAATCTAT 294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=3.621;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:332,0,3508 -chr7 24171440 . A C 1078.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.533;DP=96;FS=6.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,39:95:99:1107,0,2015 -chr7 24171564 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=-1.477;DP=79;FS=18.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.068;QD=3.05;ReadPosRankSum=-1.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,10:77:99:269,0,2642 -chr7 24171576 . TA T 1294.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=1.425;DP=84;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,56:74:99:1332,0,139 -chr7 24192358 . G T 268.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:297,21,0 -chr7 24433337 . A G 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr7 24433381 . A T 394.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:423,30,0 -chr7 24892330 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=-0.420;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=10.77;ReadPosRankSum=1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:276,0,515 -chr7 24892514 . G GT 531.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:39:569,39,0 -chr7 24895059 . G T 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=1.013;DP=38;FS=1.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:325,0,1039 -chr7 24895282 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.142;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:455,0,1763 -chr7 24895567 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=-2.256;DP=62;FS=8.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=5.80;ReadPosRankSum=3.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:388,0,1628 -chr7 24917981 . G A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=-0.142;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:301,0,565 -chr7 24920901 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=-0.853;DP=71;FS=2.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,20:69:99:485,0,1824 -chr7 24921577 . T A 925.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=-0.193;DP=68;FS=6.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.991;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:954,0,2405 -chr7 24921689 . A T 1350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=2.069;DP=113;FS=3.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,41:113:99:1379,0,3394 -chr7 24921805 . A G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-1.280;DP=83;FS=6.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:755,0,4522 -chr7 24921806 . T C 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=-0.693;DP=83;FS=6.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.280;QD=8.76;ReadPosRankSum=2.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,26:82:99:755,0,4522 -chr7 24923729 . TA T 1414.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=-0.716;DP=63;FS=4.845;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.798;QD=22.46;ReadPosRankSum=1.288 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,52:57:99:1452,99,0 -chr7 24923731 . A T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=-0.986;DP=62;FS=3.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,20:62:99:331,0,1631 -chr7 25183136 . CCCTGATGGACAACAGAAGGGTAAAGTACAGTTCAAAGTCTTTATAATGGTTATTTCATCTCCATCTGTAATCTAGAAGGGCAACCCAGCTTA C 1891.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=2.145;DP=48;FS=2.147;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.548;QD=25.57;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,44:48:99:1929,186,0 -chr7 25234216 . T TAA 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.787;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=19.36;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:502,0,348 -chr7 25234662 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=-0.489;DP=78;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:395,0,2162 -chr7 25235169 . T G 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.882;DP=72;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,19:72:99:467,0,2100 -chr7 25251874 . C T 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-1.404;DP=236;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.174;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,41:236:99:544,0,7485 -chr7 25252689 . C CT 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=-1.345;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:17:372,0,17 -chr7 25254157 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.363;DP=72;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=3.41;ReadPosRankSum=1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,14:72:99:274,0,2212 -chr7 25267862 . TCCTGGAGCAGAAGAGAGCACGTGTTATCTCCAGAACAAGCAAATGGTGAACCAAACCGCTTTCTAGGACACTCA T 4612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=2.581;DP=111;FS=1.751;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.585;QD=32.63;ReadPosRankSum=-2.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,106:111:99:4650,380,0 -chr7 25277134 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=-0.081;DP=96;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.382;QD=3.02;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:318,0,2872 -chr7 25277369 . G A 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=1.083;DP=110;FS=12.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=6.82;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,31:110:99:778,0,3012 -chr7 25277993 . G T 1167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-1.371;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.232;QD=11.45;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1196,0,2096 -chr7 25278083 . G A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.372;DP=71;FS=2.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.523;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:548,0,1905 -chr7 25279208 . A G 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.864;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,28:91:99:705,0,2311 -chr7 25279271 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=-0.485;DP=75;FS=8.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:334,0,3177 -chr7 25296130 . T C 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=-1.624;DP=128;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,37:128:99:917,0,3201 -chr7 25299900 . TACCTGAAAGAGACCCACACACGTTCTCAATACAAAAAATAGGAAAGAATTTACATTTAAAACCCTAGACACAATTCTAGATCATCTTCCTC T 4283.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.334;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=24.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,105:107:99:4321,391,0 -chr7 25300274 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=-1.518;DP=72;FS=1.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=6.01;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,21:71:99:461,0,1888 -chr7 25316448 . C CA 382.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.990;ClippingRankSum=-1.190;DP=94;FS=10.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,26:91:99:420,0,1782 -chr7 25320976 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.283;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:234,0,1122 -chr7 25324163 . G C 852.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=-1.139;DP=67;FS=0.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:881,0,1421 -chr7 25326009 . G A 1299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=-0.946;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1328,0,1640 -chr7 25378004 . T C 998.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.024;DP=83;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,30:81:99:1027,0,1843 -chr7 25524317 . C T 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.297;DP=22;FS=2.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=15.35;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:366,0,402 -chr7 25524595 . C T 1655.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-0.642;DP=352;FS=3.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,81:351:99:1684,0,10359 -chr7 25543268 . C A 854.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=-1.014;DP=289;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.378;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,54:289:99:883,0,9301 -chr7 25549780 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=1.068;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=17.31;ReadPosRankSum=1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:461,0,406 -chr7 25562816 . A T 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.222;DP=117;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.086;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,21:116:99:338,0,3744 -chr7 25624621 . GC G 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=-1.041;DP=203;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.969;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,34:190:99:258,0,4378 -chr7 25639995 . G GA 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.771;DP=180;FS=0.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,33:160:99:268,0,3232 -chr7 25653535 . C T 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=1.436;DP=84;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:452,0,2407 -chr7 25656979 . A G 322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.766;DP=139;FS=1.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,24:139:99:351,0,4421 -chr7 25829326 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.463;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=3.82;ReadPosRankSum=2.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:269,0,1700 -chr7 25997529 . A AG 241.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-2.355;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.595;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:279,0,315 -chr7 26017637 . GCTGTTTAATCAAGAAAGAAATTCAATAGAATTACTTTTTTATAATCAAATACTGTATCTAACTGTATGAGTCTTAC G 1968.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.531;DP=53;FS=10.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.511;QD=24.38;ReadPosRankSum=-0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,47:50:99:2006,0,635 -chr7 26127248 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DP=10;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:272,0,317 -chr7 26170533 . G GA 2561.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=-4.186;DP=316;FS=16.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=8.11;ReadPosRankSum=2.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,112:288:99:2599,0,4168 -chr7 26171506 . C T 1771.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=-1.550;DP=103;FS=1.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.084;QD=17.20;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,50:102:99:1800,0,1804 -chr7 26178207 . G A 1798.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=-2.959;DP=329;FS=7.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=5.47;ReadPosRankSum=2.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:247,80:327:99:1827,0,9677 -chr7 26188968 . T C 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.350;DP=76;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,15:74:99:283,0,2170 -chr7 26194155 . C A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=-0.608;DP=63;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.140;QD=5.66;ReadPosRankSum=1.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:385,0,1736 -chr7 26212733 . C T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-1.872;DP=49;FS=4.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.314;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:291,0,1799 -chr7 26266001 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=-0.448;DP=29;FS=3.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.966 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:251,0,740 -chr7 26460220 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=-1.276;DP=41;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.394;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:41:99:237,0,3435 -chr7 26725704 . A AT 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-3.273;DP=42;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:480,0,639 -chr7 26727205 . C A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.842;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.964;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:558,0,905 -chr7 26999403 . C T 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.190;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=16.59;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:443,0,446 -chr7 26999708 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-1.595;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=16.39;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:356,0,307 -chr7 27005655 . C G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-1.096;DP=176;FS=0.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.223;QD=1.57;ReadPosRankSum=2.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,27:176:99:305,0,5895 -chr7 27006638 . T TG 813.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-0.230;DP=214;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,54:186:99:851,0,3505 -chr7 27007171 . C T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.247;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.941;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,29:175:99:400,0,5921 -chr7 27007804 . G A 2662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=2.126;DP=154;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:150:99:2691,0,2705 -chr7 27009686 . TCTGTTATGAGATGAAGCACATTATAATGAGTGGCGGGAAAAGGGAAAGCAATGTGGTGCCATTAAGAAGGAAATGTGTTTATCTTTAC T 7511.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=2.755;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=30.60;ReadPosRankSum=1.711 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,166:171:99:7549,585,0 -chr7 27018440 . G A 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=2.543;DP=207;FS=0.589;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,51:206:99:1094,0,5904 -chr7 27042942 . AAGGCATGTCTCCATACTTCCATCCTCCATGCAGCATATTAAAAATGGCAGCAAATTTTAACAATATTTGCATTTTCATGC A 10074.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=1.490;DP=332;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.853;QD=30.35;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,310:312:99:10112,910,0 -chr7 27043953 . T TA 2785.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.105;DP=296;FS=2.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,124:291:99:2823,0,3849 -chr7 27129310 . C T 1464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.488;DP=183;FS=0.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.596;QD=8.00;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,58:182:99:1493,0,4893 -chr7 27129423 . C CT 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=1.432;DP=134;FS=2.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,26:126:99:258,0,2754 -chr7 27139749 . A C 1227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=1.427;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,37:102:99:1256,0,2193 -chr7 27152317 . CT C 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-1.227;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:41:315,0,41 -chr7 27155703 . CA C 912.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.594;DP=95;FS=5.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.584;QD=9.61;ReadPosRankSum=-1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,38:83:99:950,0,1018 -chr7 27172511 . C CA 975.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=1.047;DP=77;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=12.67;ReadPosRankSum=-1.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,40:74:99:1013,0,933 -chr7 27178563 . G A 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.538;DP=84;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.783;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:435,0,2427 -chr7 27187475 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=-0.580;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.512;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:288,0,498 -chr7 27188024 . A G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=1.265;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=21.37;ReadPosRankSum=-0.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,20:32:99:712,0,554 -chr7 27268960 . C CT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.050;DP=20;FS=7.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=12.79;ReadPosRankSum=-1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:293,0,141 -chr7 27492612 . C T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=-0.419;DP=36;FS=2.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:342,0,902 -chr7 27523498 . G T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=1.247;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.191;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,2246 -chr7 27523499 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=1.023;DP=41;FS=1.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=8.53;ReadPosRankSum=-1.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:378,0,2246 -chr7 27557856 . C CA 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-1.409;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:243,0,793 -chr7 27558272 . G A 2774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-2.205;DP=221;FS=0.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.556;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,84:221:99:2803,0,4571 -chr7 27558412 . G T 1916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=-1.164;DP=148;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.604;QD=12.95;ReadPosRankSum=1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,53:148:99:1945,0,6584 -chr7 27558586 . A T 2050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=1.258;DP=142;FS=9.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,59:142:99:2079,0,2778 -chr7 27588505 . G T 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=-1.880;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:594,0,454 -chr7 27594184 . TTAGGTAAGGAAATGTCTCCCATATCTTTACATTACTCACGCAAACAATGAATATCCTCTAACATTGATGTTTTTGTGCTCGTTTCTTTA T 5176.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=2.270;DP=178;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=29.08;ReadPosRankSum=-2.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,165:174:99:5214,0,217 -chr7 27598787 . A T 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.889;DP=81;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=14.58;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,33:81:99:1209,0,1621 -chr7 27621266 . T G 1983.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-1.191;DP=120;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=16.53;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,56:120:99:2012,0,2132 -chr7 27621573 . AT A 390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.777;DP=44;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,15:43:99:428,0,900 -chr7 27621685 . G A 1675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=-0.319;DP=99;FS=5.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.040;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,51:99:99:1704,0,1655 -chr7 27647919 . T TA 209.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.089;DP=92;FS=5.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,20:87:99:247,0,1830 -chr7 27829249 . A T 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=1.033;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=9.95;ReadPosRankSum=-1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,20:59:99:615,0,1310 -chr7 27829286 . T C 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.010;DP=53;FS=6.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.293;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:388,0,1434 -chr7 27829507 . G T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DP=52;FS=1.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:309,0,1494 -chr7 27830522 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.437;DP=25;FS=10.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:231,0,798 -chr7 27831308 . AT A 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.264;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.634;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:97:295,0,97 -chr7 27832454 . C G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.133;DP=48;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=8.20;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:422,0,1272 -chr7 27855759 . T C 3841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.438;DP=497;FS=7.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,151:497:99:3870,0,13472 -chr7 27862710 . C A 961.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=-2.374;DP=335;FS=4.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:270,63:333:99:990,0,10376 -chr7 27862794 . C T 6607.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=-7.602;DP=320;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=20.65;ReadPosRankSum=0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,68:319:99:6636,0,15503 -chr7 27863376 . A T 1298.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:91:1327,91,0 -chr7 27863421 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.246;DP=74;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:288,0,1084 -chr7 27863851 . T G 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.540;DP=121;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,21:119:99:357,0,3952 -chr7 27958323 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.761;DP=62;FS=9.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:233,0,1902 -chr7 27970137 . A G 202.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:17:231,17,0 -chr7 27973015 . C T 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.154;DP=147;FS=3.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,31:147:99:599,0,4412 -chr7 28017689 . A AT 2735.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=2.077;DP=142;FS=6.780;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,116:134:22:2989,22,0 -chr7 28018091 . G C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.851;DP=93;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.075;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.783 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,18:93:99:292,0,3208 -chr7 28020189 . CA C 668.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:49:706,49,0 -chr7 28020990 . C T 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.680;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=17.02;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:641,0,652 -chr7 28032802 . T C 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.438;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=6.36;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:461,0,1823 -chr7 28050601 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:61:268,0,61 -chr7 28130541 . G T 687.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.189;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.809;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,40:199:99:716,0,6156 -chr7 28130583 . G A 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.828;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.982;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.860 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,42:219:99:695,0,6672 -chr7 28130590 . C A 920.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.865;DP=213;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,47:213:99:949,0,6259 -chr7 28133643 . G A 850.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.712;DP=192;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.383;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,44:192:99:879,0,5313 -chr7 28136493 . CATGCAGGTAAACTGGAGAATTTGTTCATTCATCAGACTTCAGTTGTATCAGTGAAGTTTTCCAACTCATGTTTAATGCA C 7060.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=2.011;DP=200;FS=4.788;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=26.91;ReadPosRankSum=1.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,196:200:99:7098,621,0 -chr7 28138864 . CAGGTAACGTGGTAGATCGTAGTGGTTTTGCAGATGCTGTGTGTTCACTATGGCTTAGACATGTGAGTGATGTAGGATATACACCCT C 9570.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=1.403;DP=267;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=27.14;ReadPosRankSum=-2.049 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,247:254:99:9608,745,0 -chr7 28143883 . GT G 784.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.351;DP=34;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=23.08;ReadPosRankSum=0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:918,0,370 -chr7 28143888 . T G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=-1.760;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.557;QD=22.71;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:755,0,493 -chr7 28146623 . C T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=2.831;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.071;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:232,0,435 -chr7 28149220 . GA G 201.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.05;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:239,21,0 -chr7 28151429 . C T 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.038;DP=333;FS=8.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=1.37;ReadPosRankSum=-1.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,54:332:99:483,0,11349 -chr7 28154862 . C T 791.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=1.129;DP=371;FS=1.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.651;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:307,63:370:99:820,0,11833 -chr7 28156387 . T C 6760.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.481;DP=561;FS=0.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=12.05;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:362,197:559:99:6789,0,12942 -chr7 28169339 . AAGGTATCAAATCAACCATTCATAATAGATTGTGTTTTATTTTAGGAGATTTCTGGGAAAATGAGATCAGTACACTGCAGC A 487.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=446;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=1.09;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,1:8:99:525,0,683 -chr7 28821300 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=-1.585;DP=31;FS=5.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:293,0,950 -chr7 28821614 . AAGGTTGGTGCCCATGGAGCATGCGCTTATTGTTCATTTATGATCAATGTTTTAATGTCGTTGCGCTAATCACGTCATGTTTTTTTTTCCCTTCCATTC A 574.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=-1.711;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:612,0,3335 -chr7 28928403 . C T 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=-2.054;DP=203;FS=2.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.011;QD=1.65;ReadPosRankSum=2.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,32:203:99:364,0,10151 -chr7 28933451 . C T 2393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-0.115;DP=354;FS=8.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:254,100:354:99:2422,0,9554 -chr7 28940152 . G T 2859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=1.838;DP=335;FS=17.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=8.54;ReadPosRankSum=-1.781 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,108:334:99:2888,0,8618 -chr7 28942527 . A C 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=-0.528;DP=404;FS=3.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:334,69:403:99:911,0,18423 -chr7 28946205 . G C 347.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-1.334;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=11.59;ReadPosRankSum=1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:376,0,660 -chr7 29011462 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=-1.994;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:246,0,1947 -chr7 29012023 . C T 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=-1.616;DP=70;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=5.04;ReadPosRankSum=-1.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:381,0,1937 -chr7 29342733 . G A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=-0.935;DP=137;FS=3.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.097;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,22:137:99:247,0,4488 -chr7 29344203 . T C 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=4.234;DP=46;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:497,0,977 -chr7 29484120 . A T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.434;DP=39;FS=5.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:244,0,1087 -chr7 29742902 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.817;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:232,0,440 -chr7 29743262 . ATT A,AT 366.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=17.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,11,8:19:99:640,222,192,339,0,286 -chr7 29852256 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.717;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.161;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:513,0,2342 -chr7 29907341 . TCTAAAAGAATCATATTATATATCCAATAAATCCTCAGACTACTTACCATACAATAAAAACACACAAGCAATCAATTTCTCAC T 3135.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=1.419;DP=82;FS=1.869;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.258;QD=26.43;ReadPosRankSum=1.509 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,74:79:99:3173,125,0 -chr7 29949174 . G A 730.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=-0.911;DP=134;FS=2.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:759,0,3441 -chr7 29953852 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=1.384;DP=245;FS=18.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.189;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,39:243:99:405,0,7959 -chr7 29959542 . TA T,TAA 280.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=12.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,8,5:13:99:359,157,176,235,0,272 -chr7 30011809 . G A 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr7 30011826 . AACCTGAAAATGGAAAGAAAAACAAATCTGTTAATTATCGTGTCTCAATTTAGTTCATTTGAATAAGCTTACCAAAACTTGCCACTT A 764.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=1.357;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:99:802,0,963 -chr7 30015356 . A G 1392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1421,99,0 -chr7 30050977 . T A 439.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=-2.643;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.788;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:468,0,287 -chr7 30052922 . T C 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:445,30,0 -chr7 30052928 . A G 416.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:445,30,0 -chr7 30333294 . C CTA 438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=-1.269;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=19.94;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:476,0,328 -chr7 30372739 . G GA 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=1.643;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:286,0,2064 -chr7 30372745 . G A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=2.339;DP=61;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.418;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,25:61:99:286,0,2063 -chr7 30374979 . T C 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.649;DP=55;FS=3.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:948,0,997 -chr7 30378453 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=1.766;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.503;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,30:56:99:944,0,921 -chr7 30379075 . G A 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=-0.386;DP=57;FS=4.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=24.07;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1400,0,497 -chr7 30387934 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=-0.663;DP=14;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=16.70;ReadPosRankSum=1.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:262,0,246 -chr7 30387997 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.416;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.992;QD=14.19;ReadPosRankSum=3.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:610,0,813 -chr7 30422746 . ACCAGGTGAGATGTTGCAGAAGAAAGCCAGAGGTGTTCCAGGTAGATGATGTGTCACTAAACCTTATCTCTCTTCGTCTC A 2310.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.928;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.024;QD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:99:2348,204,0 -chr7 30440512 . T C 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-1.426;DP=55;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:678,0,1154 -chr7 30443014 . G A 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-0.956;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:264,0,1112 -chr7 30500406 . G T 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.378;ClippingRankSum=-2.446;DP=57;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.489;QD=8.57;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:517,0,1448 -chr7 30501225 . T A 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=-0.275;DP=124;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,24:124:99:380,0,3710 -chr7 30518850 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=1.053;DP=219;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,38:205:99:513,0,6485 -chr7 30518853 . G GTGTCCGGTCTGGGC 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=1.160;DP=215;FS=2.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.812;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,37:199:99:512,0,6485 -chr7 30519048 . GTCAGGTAAAGAGACGTCAGCTTGTGTTTAGGCATGAGGATGGTCTCCAGTGTGACTGAGGTGTGTGTTTTCTCTCC G 8211.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=-0.307;DP=250;FS=5.297;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.923;QD=32.85;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,241:249:99:8249,789,0 -chr7 30523198 . C T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=-0.324;DP=82;FS=1.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,15:82:99:241,0,2627 -chr7 30526184 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.561;DP=46;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,10:43:99:276,0,1224 -chr7 30533869 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.514;DP=90;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.948;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,19:90:99:354,0,2719 -chr7 30551556 . C T 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.575;DP=51;FS=2.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:99:305,0,1263 -chr7 30552076 . T C 591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=-1.705;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:620,0,1033 -chr7 30643902 . GAGGTGAGAAACAGACATAATGCTGATGTAGATAAGCAAGTTTTCACTTCATTCAGCGAGTCAGATGAGTTGACTTCTCTTCTGTTTTATC G 3698.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=2.307;DP=90;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.782;QD=29.43;ReadPosRankSum=0.765 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,85:89:99:3736,297,0 -chr7 30688177 . C T 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-0.152;DP=72;FS=2.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.647;QD=11.15;ReadPosRankSum=1.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,24:71:99:831,0,1661 -chr7 30798680 . T A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.832;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.832;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:235,0,953 -chr7 30855177 . TCCTGAACACAAAAACACAGAGAGAATGAAGTGCAGAAAGAAAAGAAAAGATGAGAAAGACAGACAACTGGACACTTA T 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-0.480;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:340,0,1431 -chr7 30875892 . TA T 819.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-1.859;DP=59;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:857,0,801 -chr7 30889787 . T A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-1.172;DP=64;FS=2.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:391,0,1706 -chr7 30907990 . A G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=1.331;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:293,0,498 -chr7 30961861 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=-0.270;DP=20;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=11.39;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:256,0,388 -chr7 31020648 . T A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=20;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=10.64;ReadPosRankSum=0.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:241,0,455 -chr7 31032374 . A G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.032;DP=38;FS=3.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:312,0,1021 -chr7 31034908 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=1.291;DP=24;FS=3.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:308,0,458 -chr7 31261930 . T C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=-0.110;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=11.88;ReadPosRankSum=3.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:551,0,959 -chr7 31288845 . C T 475.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-0.977;DP=196;FS=3.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,34:194:99:504,0,6230 -chr7 31293487 . AAGGTGTGAACGGTCATCTGCGTGTGTTGGTTGTGTGTTTGTGGACAGCTTTTTAATCCTGTCTTCTGTCTTTCACGCACAC A 11992.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.231;DP=304;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=26.36;ReadPosRankSum=1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,299:300:99:12030,881,0 -chr7 31294333 . A T 340.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=31.55;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:20:369,20,0 -chr7 31296633 . C CT 558.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:44:596,44,0 -chr7 31297213 . C T 737.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:64:766,64,0 -chr7 31297218 . C T 496.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,13:13:72:525,0,72 -chr7 31512767 . T C 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=-0.806;DP=213;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:159,54:213:99:1320,0,12309 -chr7 31513367 . C T 1045.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=-0.629;DP=298;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,63:298:99:1074,0,8913 -chr7 31540791 . C A 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=2.441;DP=96;FS=1.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=5.73;ReadPosRankSum=2.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:578,0,2834 -chr7 31546572 . T C 911.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=1.437;DP=80;FS=3.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.40;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,28:80:99:940,0,1875 -chr7 31546780 . ATT A 275.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=-1.069;DP=52;FS=2.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:313,0,1687 -chr7 31595691 . TGGTAAGACAACACACTCCCACATTTACACTCTACCTGTTCTGTACAAGTGGAGAGTCTCTTAGTGTTTTTTTTTCTTTTGTA T 769.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=2.227;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=34.99;ReadPosRankSum=-2.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:807,0,457 -chr7 31622980 . G A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.157;DP=23;FS=3.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.976;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:314,0,495 -chr7 31663708 . C CT 272.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.006;DP=91;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:310,0,1432 -chr7 31746675 . T C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=-1.082;DP=186;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,54:186:99:1078,0,8228 -chr7 31828520 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=-0.902;DP=30;FS=9.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.374;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.946 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:282,0,731 -chr7 31869660 . A T 936.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.458;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.434;QD=31.23;ReadPosRankSum=-1.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:27:965,0,27 -chr7 31869807 . G T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.757;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.449;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:298,0,1222 -chr7 31875294 . C CA 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-1.751;DP=260;FS=3.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,44:247:99:336,0,5958 -chr7 31878803 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=-0.596;DP=211;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.554 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,30:211:99:244,0,6838 -chr7 31880033 . TCCTTCACATACACAATTTCAGCACATCAAACAAACACACAAGACATGCCAACTCTGAATTTCCATGAGCAGGGATATATCGTAGTCGCA T 14125.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=2.434;DP=317;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=30.30;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,315:317:99:14163,1138,0 -chr7 31889500 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.405;DP=76;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:243,0,2491 -chr7 31889864 . C T 476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=2.430;DP=223;FS=6.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,39:223:99:505,0,7191 -chr7 31898327 . C T 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=-0.385;DP=84;FS=5.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=2.51;ReadPosRankSum=1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,15:84:99:239,0,2867 -chr7 31907808 . C T 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=-1.079;DP=96;FS=5.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=8.17;ReadPosRankSum=1.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,29:95:99:813,0,2401 -chr7 31915326 . C T 1287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.853;DP=85;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.781;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.075 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,38:85:99:1316,0,1540 -chr7 31963365 . AAGGTTCGTGTCTTTTATTTGGCACCAAGCAGCTTATGAACGTAAACAACAACGTGCTGCCACACACTCCTTTGTTTCCTTTTTAC A 3966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.848;DP=112;FS=2.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.649;QD=29.47;ReadPosRankSum=-0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,93:106:99:4004,0,2665 -chr7 31966319 . TGTAAGTGCTGATTTTTGTGATCCCTGATGGAATTTGTGTGATCTTCAGAAGATAACGCTTGCCTTTTTTCCATCTGATTTCTAG T 3654.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.627;DP=96;FS=4.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=29.98;ReadPosRankSum=0.973 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,91:96:99:3692,315,0 -chr7 31988877 . T C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=-0.300;DP=54;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:299,0,1464 -chr7 31991324 . C T 699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.273;DP=57;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,21:57:99:728,0,1230 -chr7 31996797 . G C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-0.995;DP=55;FS=1.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:290,0,1571 -chr7 32062069 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=-2.179;DP=29;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=10.65;ReadPosRankSum=1.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:337,0,632 -chr7 32104845 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.341;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:343,0,959 -chr7 32109640 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.372;DP=53;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,12:53:99:276,0,1601 -chr7 32109989 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-1.693;DP=126;FS=1.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.034;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,24:126:99:401,0,3853 -chr7 32258148 . C T 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-3.960;DP=103;FS=1.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.366;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.552 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,25:102:99:529,0,2917 -chr7 32258374 . C T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.792;DP=110;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,26:110:99:558,0,3167 -chr7 32258674 . TCTACAAATAGAAACATAAAGATCATATGCTGTATAGATGTGCAGTCAATCTCAATATAGTTCCCTTTTATATGTCCTGAATATAAACATTAC T 5002.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=1.180;DP=117;FS=1.670;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.985;QD=32.68;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,105:111:99:5040,439,0 -chr7 32258831 . TCCTGTGTTGATGAAAACAAACACCCTTTTTGTTTCCACAGACTGCTTAAACATTTTATGTGTCATGTTCCAGAGACAGTATTTGATAATAACGACACATGCTTTCAGTGATACAAGATTAGTATCAAGCATAGGTCAGTGGACAAGAAGTCAGAGGTCAATACACTGATTAACAAGTTAATGTGTAACGGTTGCATAAATATGTGCAATGATTAGAGCTGGCTGA T 4862.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=4.449;DP=133;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=32.47;ReadPosRankSum=-1.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,118:133:99:4900,0,2494 -chr7 32259175 . GCCTGCGTGCACATAGCTTTAGAATTATTACACATACGATTCAAAACTAAGCTGTATCATTTATCCAGCTATGGTGATCTGA G 4972.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=-1.606;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=36.61;ReadPosRankSum=-0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,115:131:99:5010,0,3124 -chr7 32457705 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-1.422;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:69:231,0,69 -chr7 32457892 . C T 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=-0.558;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,24:68:99:760,0,1415 -chr7 32460537 . C G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=-0.804;DP=231;FS=3.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.294;QD=1.69;ReadPosRankSum=2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,37:231:99:419,0,9587 -chr7 32460694 . G T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.549;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,20:111:99:229,0,4315 -chr7 32462966 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=-0.993;DP=175;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.820;QD=3.10;ReadPosRankSum=2.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,34:174:99:571,0,5337 -chr7 32465146 . C A 2438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=-1.185;DP=181;FS=2.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.254;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,75:181:99:2467,0,3438 -chr7 32475192 . G T 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=-1.233;DP=170;FS=2.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,34:169:99:572,0,5319 -chr7 32475549 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.303;DP=105;FS=10.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=3.77;ReadPosRankSum=2.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:424,0,4438 -chr7 32475975 . A AT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=-1.163;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.815 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:288,0,1019 -chr7 32476079 . C T 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.131;DP=128;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,27:126:99:491,0,3863 -chr7 32670268 . A C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.097;DP=23;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.098;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:262,0,526 -chr7 32701165 . G T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.877;DP=98;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=3.71;ReadPosRankSum=1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:392,0,6348 -chr7 32701167 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.777;DP=97;FS=0.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:392,0,6380 -chr7 32701350 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=-0.926;DP=88;FS=2.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,18:88:99:326,0,2767 -chr7 32701367 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=-2.119;DP=74;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.656;QD=3.12;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:259,0,2336 -chr7 32702287 . C G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=1.280;DP=79;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.637;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,18:79:99:388,0,2343 -chr7 32721303 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.476;DP=107;FS=5.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.803 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,26:107:99:631,0,6415 -chr7 32721306 . A T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=-0.557;DP=108;FS=5.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=5.58;ReadPosRankSum=-0.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,26:108:99:631,0,6415 -chr7 32726111 . G T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.972;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,19:95:99:359,0,2998 -chr7 32726711 . T A 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-1.098;DP=40;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.805;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:324,0,1657 -chr7 32727321 . C A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=-1.315;DP=38;FS=8.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:522,0,757 -chr7 32763071 . A C 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=-0.626;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,24:146:99:280,0,4640 -chr7 32763091 . T A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.492;DP=141;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.332;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,22:135:99:250,0,4213 -chr7 32765843 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=-0.116;DP=171;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.573;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,28:170:99:373,0,5622 -chr7 32766017 . T C 355.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-1.577;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,22:66:99:393,0,3217 -chr7 32767455 . C T 1829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=1.013;DP=121;FS=3.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=15.12;ReadPosRankSum=-0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,52:121:99:1858,0,2320 -chr7 32768015 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.574;DP=115;FS=7.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.981;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,23:113:99:444,0,3457 -chr7 32769021 . C T 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-1.450;DP=106;FS=3.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.738;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,26:106:99:600,0,3066 -chr7 32770191 . T A 1560.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.954;ClippingRankSum=1.163;DP=147;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=10.62;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,50:147:99:1589,0,3432 -chr7 32774100 . GCCTAATGAGGAAATGAAAGCAGCTCAAGTTTTTTCAAGTTTGAAAAATATGTTCATTTACTTCAATGATGGGTGTAACTTGCTTTTGATGTGGTAATGAAAATAAAGTATATTGCGCGTTAATCAAGGCTAATTATCATGAGCCCTGCTAATGACTAATGCTTTCATGTGATTTCTCCCTCTCCAGATTATTGCTTAACACTTGATTCTTA G 686.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.289;ClippingRankSum=6.954;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=4.61;ReadPosRankSum=-4.130 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,120:145:99:724,0,12885 -chr7 32830512 . A C 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=2.152;DP=41;FS=2.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:522,0,919 -chr7 32830820 . ATG A 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=-1.870;DP=30;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.02;ReadPosRankSum=-0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:308,0,874 -chr7 32831744 . T C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=-0.852;DP=39;FS=5.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:268,0,1123 -chr7 32833125 . CTT C 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.919;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.251;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:678,0,1000 -chr7 32833645 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.889;DP=68;FS=2.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:229,0,2140 -chr7 32834035 . T C 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=-0.056;DP=41;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=9.38;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:413,0,1126 -chr7 32835146 . G C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-0.103;DP=47;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.309;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:250,0,1342 -chr7 32962665 . G A 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=1.540;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:245,0,414 -chr7 32966655 . A G 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.899;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:342,0,445 -chr7 33111097 . CA C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.044;DP=48;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,15:48:99:285,0,1540 -chr7 33112209 . T C 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.208;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:426,0,2077 -chr7 33112299 . G GT 514.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.851;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.654;QD=7.05;ReadPosRankSum=-1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,26:63:99:569,0,886 -chr7 33131105 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=-0.450;DP=123;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,22:122:99:322,0,4773 -chr7 33137931 . C T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.856;DP=135;FS=4.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,35:134:99:767,0,3772 -chr7 33352218 . G T 567.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.395;DP=100;FS=1.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,28:100:99:596,0,2640 -chr7 33354543 . C T 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=-0.358;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=13.82;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,19:47:99:678,0,971 -chr7 33790094 . G A 739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=-0.594;DP=59;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.489;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,24:59:99:768,0,1139 -chr7 33790274 . C T 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.653;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:669,0,1131 -chr7 33979054 . GAGGTAAACACATTCTACTTTAATTTAACATACTGTAACTTAAAGCCTATGATAGTGTTTGATGATTTATATCTCCCTTTTTACCTGC G 1004.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=-1.280;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=32.41;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1042,0,1660 -chr7 33979159 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.194;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=12.47;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:340,0,535 -chr7 33980300 . GT G 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=1.111;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:252,0,190 -chr7 34045866 . A T 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=-0.802;DP=107;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:703,0,2981 -chr7 34048864 . T A 997.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.457;DP=73;FS=4.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,29:73:99:1026,0,1559 -chr7 34049377 . A T 1527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=-0.713;DP=77;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=19.84;ReadPosRankSum=-1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,43:77:99:1556,0,3331 -chr7 34050454 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=-0.041;DP=20;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:377,0,348 -chr7 34078175 . A T 204.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:25:233,0,25 -chr7 34082619 . G C 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-1.292;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.760;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:320,0,363 -chr7 34083743 . C T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.180;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=16.03;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:445,0,504 -chr7 34146827 . G A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-1.975;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.051;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:246,0,485 -chr7 34147977 . C CT 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-0.457;DP=20;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:68:278,0,68 -chr7 34149716 . C A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=-0.739;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:396,0,582 -chr7 34155477 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=1.216;DP=20;FS=17.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=17.14;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:371,0,334 -chr7 34160430 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=-1.029;DP=41;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:568,0,861 -chr7 34170296 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=1.658;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:464,0,442 -chr7 34178264 . G A 797.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.476;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,25:71:99:826,0,1574 -chr7 34185741 . G A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.817;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.139;QD=16.41;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:652,0,686 -chr7 34187207 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=1.003;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.386;QD=22.91;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:326,0,273 -chr7 34189473 . G A 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.755;DP=42;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,21:42:99:615,0,823 -chr7 34192378 . GCTAAGAAAAAAAAGGGATCAGAAATTAGGAAACTGTATACGATTAATAAATAGTTATTTACAATTTAAACAGTGCTTGTTTTCAC G 2038.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.630;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.237;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,51:55:99:2076,0,439 -chr7 34197766 . G A 558.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.905;DP=38;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.963 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:587,0,683 -chr7 34197832 . G A 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.373;DP=29;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:507,0,482 -chr7 34215029 . A C 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.381;DP=24;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:453,0,351 -chr7 34233383 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=1.621;DP=85;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,20:85:99:312,0,3369 -chr7 34243346 . G A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=-0.398;DP=37;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.448;QD=11.21;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:443,0,833 -chr7 34243504 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=-0.083;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:272,0,847 -chr7 34243555 . C A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.246;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=17.37;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:393,0,508 -chr7 34257722 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=2.938;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:309,0,513 -chr7 34258051 . A T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.499;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.576;QD=13.49;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:460,0,636 -chr7 34281195 . A G 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.444;DP=57;FS=2.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.985 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:355,0,1423 -chr7 34299150 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=1.604;DP=34;FS=3.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:409,0,794 -chr7 34318214 . C A 2194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.243;ClippingRankSum=-1.504;DP=285;FS=61.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=7.70;ReadPosRankSum=3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,106:280:99:2223,0,22417 -chr7 34319234 . G A 5737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-1.010;DP=349;FS=7.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=16.44;ReadPosRankSum=-1.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,162:349:99:5766,0,6074 -chr7 34319959 . G A 10150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.331;DP=143;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.605;QD=28.25;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,48:143:99:10179,0,14567 -chr7 34319969 . G GA 10136.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-1.370;DP=168;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=27.57;ReadPosRankSum=-1.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,73:168:99:10174,0,14567 -chr7 34320482 . CA C 2705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.680;DP=260;FS=5.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.809;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,101:245:99:2743,0,3156 -chr7 34427234 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr7 34464711 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.922;DP=32;FS=5.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.551;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:242,0,851 -chr7 34678540 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.675;DP=21;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:322,0,403 -chr7 34680708 . T TG 296.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=-0.247;DP=286;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.845;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,45:286:99:334,0,10445 -chr7 34777775 . GT G 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=-0.400;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.407;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:584,0,270 -chr7 35007142 . C CA 485.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=-1.785;DP=154;FS=8.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.877;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,39:150:99:523,0,3035 -chr7 35164382 . C T 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=-0.724;DP=36;FS=8.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:233,0,990 -chr7 35447911 . T TA 321.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:359,24,0 -chr7 35450025 . GT G 733.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.229;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.40;MQ0=0;MQRankSum=1.889;QD=13.34;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:32:860,32,0 -chr7 35450561 . TA T 318.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.966;DP=39;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.652;QD=8.17;ReadPosRankSum=0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:396,0,240 -chr7 35526802 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=2.690;DP=74;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,18:74:99:402,0,2032 -chr7 35582394 . C CA 244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=1.320;DP=89;FS=8.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:282,0,1751 -chr7 35584372 . AT A 277.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=25.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:315,33,0 -chr7 35649089 . C T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.299;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:358,0,439 -chr7 35660594 . T TCA 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.062;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQ0=0;MQRankSum=1.177;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:567,0,1154 -chr7 35684486 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=-0.764;DP=25;FS=3.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:263,0,507 -chr7 35756777 . G A 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-0.498;DP=30;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=26.03;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:809,0,240 -chr7 35756856 . C T 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.632;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.118;QD=32.40;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:34:64:1130,0,64 -chr7 35756980 . TCA T 792.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:68:830,68,0 -chr7 35811204 . C CA 533.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=-0.428;DP=138;FS=2.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,37:135:99:571,0,2645 -chr7 35812009 . C T 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=-2.781;DP=97;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,27:97:99:706,0,2671 -chr7 35812694 . G A 939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-0.196;DP=292;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,57:292:99:968,0,8707 -chr7 36185717 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=-0.795;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=4.05;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,16:75:99:332,0,2248 -chr7 36228759 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=-2.569;DP=158;FS=2.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,29:158:99:359,0,5669 -chr7 36271707 . TA T 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:295,0,158 -chr7 36276345 . T C 254.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-2.154;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:292,0,2130 -chr7 36434484 . A G 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:245,0,258 -chr7 36541184 . C T 1642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.907;DP=226;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,66:226:99:1671,0,6336 -chr7 36549423 . CAT C 755.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.752;DP=118;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,30:117:99:793,0,3764 -chr7 36566992 . G C 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.869;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.101;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.695 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:411,0,442 -chr7 36567790 . G GTT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.317;DP=56;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=8.05;ReadPosRankSum=-2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:570,0,950 -chr7 36580724 . C T 332.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.233;DP=70;FS=2.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,17:70:99:361,0,1934 -chr7 36652328 . A T 738.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=-1.704;DP=28;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.432;QD=26.38;ReadPosRankSum=-0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:767,0,225 -chr7 36696637 . A T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.903;DP=37;FS=3.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.088;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:246,0,1104 -chr7 36737748 . A C 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-0.286;DP=63;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.596;QD=6.12;ReadPosRankSum=-1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:414,0,1915 -chr7 36742721 . T C 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.085;DP=64;FS=1.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:397,0,1758 -chr7 36745265 . GCTGTGTATAACAACATTTGACAGAATGAAATTATAATGGCATATACATTTTGGGATGGGCTGGGATATGTGAAATATTTGTAGTTGTTTATAC G 3207.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=1.686;DP=83;FS=3.565;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=32.55;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:75:99:3245,258,0 -chr7 36747415 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=2.918;DP=77;FS=6.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,13:75:99:229,0,2280 -chr7 36752142 . TCTACAGTACAAGACCCAAGACATAAACAAGAACACATTAGACATAATGTGTTTGTTTCCATCCAATGAAATGTTTTATTTTTTATTTTTTTATACTCTGTAGAGACAGATGACTGAC T 2397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=1.502;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=35.29;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,59:68:99:2435,0,967 -chr7 36754305 . C T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=-1.228;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.294;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:237,0,1766 -chr7 36758383 . A G 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=1.001;DP=74;FS=2.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.669;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:247,0,2227 -chr7 36846531 . G A 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.036;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=14.37;ReadPosRankSum=1.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:330,0,407 -chr7 36846604 . C T 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=-1.445;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:282,0,411 -chr7 36855209 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=-0.910;DP=53;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,11:53:99:229,0,1608 -chr7 36864858 . TA T 766.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=-0.162;DP=136;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,41:124:99:804,0,2269 -chr7 37162334 . G C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.536;DP=157;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,31:157:99:506,0,4584 -chr7 37802573 . C T 780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-2.514;DP=166;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=4.70;ReadPosRankSum=2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,38:165:99:809,0,4881 -chr7 37803848 . T C 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=-0.215;DP=170;FS=5.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,42:170:99:975,0,4824 -chr7 37909965 . G C 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.873;DP=127;FS=3.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,21:127:99:268,0,4014 -chr7 37933942 . ATGGTAAGTTT A 4255.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:95:99:4293,350,0 -chr7 37933953 . CATCAGCTCTCAGGTGATCTCAGATGTTCACACTCTTATTTAATGACCTAATGATGTCTGTGTGTTGTTGCA C 4213.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.878;DP=94;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.135;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,92:94:99:4251,348,0 -chr7 37937816 . G A 429.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=-0.942;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.783;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,21:89:99:458,0,3167 -chr7 37937858 . A T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=1.040;DP=81;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,21:81:99:453,0,2244 -chr7 37945553 . C A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.010;DP=90;FS=8.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,21:90:99:438,0,2609 -chr7 37946462 . C T 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=-4.279;DP=40;FS=6.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=16.54;ReadPosRankSum=3.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:690,0,748 -chr7 37947514 . C CA 667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=-0.866;DP=133;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:705,0,3414 -chr7 37947642 . T TG 396.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.706;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:434,0,2682 -chr7 37947643 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-1.611;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:289,0,3343 -chr7 38291333 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.506;DP=80;FS=3.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,17:80:99:255,0,2279 -chr7 38353950 . A G 509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-0.815;DP=91;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=5.60;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,24:91:99:538,0,2376 -chr7 38359073 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=-0.968;DP=62;FS=8.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.817;QD=4.19;ReadPosRankSum=0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:288,0,1721 -chr7 38778559 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.512;DP=143;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:121,22:143:99:266,0,8265 -chr7 38778561 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.684;DP=140;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.234;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:140:99:266,0,8265 -chr7 38975232 . GT G 264.87 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.369;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.639;QD=14.71;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:15:302,0,15 -chr7 38977119 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.025;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:279,0,4425 -chr7 38977128 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=1.256;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=4.18;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,13:60:99:279,0,4425 -chr7 39155422 . T A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=1.000;DP=15;FS=10.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:260,0,185 -chr7 39156288 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.254;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:97:401,0,97 -chr7 39156495 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.382;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=24.07;ReadPosRankSum=-1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:93:293,0,93 -chr7 39156663 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=1.200;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=16.85;ReadPosRankSum=-1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:382,0,275 -chr7 39157616 . A T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=23.09;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:236,0,158 -chr7 39157624 . A C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=1.380;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=29.68;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:99:236,0,158 -chr7 39299774 . C T 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=-1.736;DP=79;FS=7.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=4.19;ReadPosRankSum=2.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:359,0,2382 -chr7 39478381 . A T 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=1.199;DP=108;FS=0.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,22:107:99:379,0,3210 -chr7 39655558 . TGTATCCTTTTCAGTGTAGCAGTGTGCATTATTCAGTCAATCTATTTTCAAAGCTGCAGATTGTAAGTAACTTCCAGATTCTCCTTAACCACTTGCAG T 1465.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=1.239;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.392;QD=24.84;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,45:54:99:1879,0,4731 -chr7 39668717 . T A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.730;DP=88;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:378,0,2993 -chr7 39701974 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.708;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:402,0,418 -chr7 39708711 . G A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=0.315;DP=42;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:285,0,1204 -chr7 39709175 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-1.279;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:395,0,1631 -chr7 39709250 . C T 838.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=1.260;DP=60;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.98;ReadPosRankSum=2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:867,0,1187 -chr7 39712858 . G A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=1.786;DP=54;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:356,0,3078 -chr7 39714895 . G A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.835;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.154;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:391,0,1676 -chr7 39765731 . T C 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.214;DP=63;FS=4.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,28:63:99:945,0,1051 -chr7 39765806 . C T 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=-0.540;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.960;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,19:76:99:447,0,2183 -chr7 39784133 . C T 750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=1.103;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.697;QD=11.21;ReadPosRankSum=-1.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,23:67:99:779,0,1664 -chr7 39892346 . T A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=4.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=16.63;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:261,0,255 -chr7 39910069 . C A 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr7 39910078 . C T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:352,24,0 -chr7 39928343 . T TA 471.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=-0.399;DP=115;FS=3.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,35:111:99:509,0,2757 -chr7 39929447 . C T 1414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.504;DP=168;FS=2.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,54:168:99:1443,0,4338 -chr7 39929759 . C T 1339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=1.780;DP=210;FS=6.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.644;QD=6.38;ReadPosRankSum=-2.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,57:210:99:1368,0,5847 -chr7 39930524 . C T 908.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=1.683;DP=93;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,31:93:99:937,0,5040 -chr7 39931382 . T A 500.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.372;DP=75;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,21:75:99:529,0,2767 -chr7 39931390 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.481;DP=73;FS=2.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=3.74;ReadPosRankSum=-1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,15:73:99:301,0,3105 -chr7 39932094 . G A 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=-1.575;DP=104;FS=1.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,26:103:99:603,0,2961 -chr7 39933093 . T A 651.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.404;DP=219;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.857;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,41:218:99:680,0,7158 -chr7 39936755 . T C 579.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.236;DP=214;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,41:214:99:608,0,6546 -chr7 39944396 . T C 2514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=2.773;DP=235;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.828;QD=10.70;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,79:233:99:2543,0,5290 -chr7 39980992 . T G 1820.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=-3.436;DP=74;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.241;QD=24.60;ReadPosRankSum=3.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,52:74:99:1849,0,476 -chr7 40045863 . G A 795.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=-1.957;DP=61;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=13.05;ReadPosRankSum=1.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,23:61:99:824,0,1337 -chr7 40066291 . T C 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.145;DP=241;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:181,59:240:99:1283,0,7073 -chr7 40069454 . A T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=1.106;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:131,37:168:99:609,0,5794 -chr7 40069672 . TAA T 1886.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-1.680;DP=145;FS=0.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.53;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=13.01;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,53:139:99:1924,0,3025 -chr7 40072168 . G T 707.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.196;DP=118;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,31:118:99:736,0,3258 -chr7 40075476 . G A 1542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=1.293;DP=359;FS=0.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=4.30;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,81:359:99:1571,0,12529 -chr7 40075605 . C A 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.108;DP=334;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,92:309:99:2309,0,8271 -chr7 40079437 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-1.693;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=12.57;ReadPosRankSum=2.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:267,0,383 -chr7 40148808 . C T 3513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.655;DP=326;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.464;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,113:322:99:3542,0,6496 -chr7 40175844 . G A 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=-0.605;DP=101;FS=0.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=3.78;ReadPosRankSum=-2.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,22:101:99:410,0,3042 -chr7 40176074 . T C 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=1.298;DP=63;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:273,0,1945 -chr7 40176517 . A G 751.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.167;DP=24;FS=4.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=31.32;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:780,0,129 -chr7 40176541 . A G 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=2.417;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.736;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:305,0,1101 -chr7 40176670 . A G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.414;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=13.66;ReadPosRankSum=-0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:561,0,758 -chr7 40176920 . G A 674.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.800;DP=83;FS=0.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.015;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:703,0,2261 -chr7 40177087 . T G 964.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=-1.362;DP=87;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,30:87:99:993,0,2163 -chr7 40177201 . TA T 440.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.953;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,22:64:99:478,0,951 -chr7 40186061 . T TA 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=-1.568;DP=103;FS=6.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,25:100:99:323,0,2004 -chr7 40186337 . C T 703.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=-2.492;DP=107;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.277;QD=6.58;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,29:107:99:732,0,5948 -chr7 40190735 . T C 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.379;DP=173;FS=2.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=3.74;ReadPosRankSum=3.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,38:173:99:675,0,5148 -chr7 40190762 . A G 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.412;DP=146;FS=6.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,31:146:99:574,0,4509 -chr7 40191742 . A C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=1.008;DP=72;FS=16.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,17:72:99:385,0,2003 -chr7 40201967 . G T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-1.180;DP=52;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.01;ReadPosRankSum=0.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:445,0,1393 -chr7 40212368 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=23.78;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89:266,0,89 -chr7 40214927 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.348;DP=48;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:298,0,1336 -chr7 40216489 . C G 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.948;DP=101;FS=9.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,27:101:99:599,0,2730 -chr7 40234604 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=-1.326;DP=83;FS=4.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,22:83:99:496,0,2369 -chr7 40316478 . A T 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.069;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.142;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:368,0,1402 -chr7 40569041 . G GA 665.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-1.704;DP=338;FS=6.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.165 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:243,58:301:99:703,0,5650 -chr7 40753674 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.976;DP=130;FS=0.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.305;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,23:130:99:335,0,3996 -chr7 40803124 . C A 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=-0.114;DP=126;FS=2.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,35:126:99:854,0,3612 -chr7 40809138 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.290;DP=128;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,30:128:99:655,0,3686 -chr7 40811454 . T G 304.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.292;DP=129;FS=7.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.178;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,23:129:99:333,0,4203 -chr7 40822221 . A T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:258,0,820 -chr7 40822224 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.163;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=14.36;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:258,0,820 -chr7 40841472 . C A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=-1.653;DP=106;FS=11.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,18:106:99:260,0,3521 -chr7 40846938 . G A 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=-2.139;DP=257;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.227;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,42:248:99:585,0,8226 -chr7 40847528 . AC A 271.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.091;DP=30;FS=3.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=9.06;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:309,0,1462 -chr7 40847531 . T A 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=-0.655;DP=31;FS=3.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=9.06;ReadPosRankSum=1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:309,0,1462 -chr7 40847665 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.285;DP=36;FS=3.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:99:241,0,2349 -chr7 40851290 . TA T 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-1.025;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=13.54;ReadPosRankSum=-0.439 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:308,0,919 -chr7 40930709 . C G 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.279;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.093;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:372,0,447 -chr7 41070157 . A T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=1.011;DP=127;FS=1.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=3.82;ReadPosRankSum=-1.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,27:127:99:513,0,3975 -chr7 41137538 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-0.590;DP=85;FS=1.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:276,0,2749 -chr7 41137817 . T C 1780.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=-0.576;DP=228;FS=1.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,70:228:99:1809,0,6002 -chr7 41435999 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=1.418;DP=16;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=14.17;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:255,0,441 -chr7 41436005 . T C 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=-0.057;DP=17;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=28.10;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:506,0,103 -chr7 41452399 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=-1.177;DP=30;FS=1.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:259,0,778 -chr7 41474539 . C T 2036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=-0.083;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.165;QD=28.29;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,57:72:99:2065,0,256 -chr7 41476750 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=3.318;DP=120;FS=10.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=5.17;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,30:120:99:649,0,3475 -chr7 41483324 . T TC 6941.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.869;DP=162;FS=2.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.498;QD=22.42;ReadPosRankSum=-1.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,70:159:99:6979,0,6443 -chr7 41486950 . G C 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.831;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=14.34;ReadPosRankSum=0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:358,0,380 -chr7 41519690 . CACCTGAGAGGGCCAGACAAACAAGCAGAATTTTTGTATTGATCCTTATGGTGAATTTTAATGACATCAGTATGTTCGTTTTCAT C 1210.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=1.166;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:99:1248,102,0 -chr7 41532945 . TCTGAGAAAACACAATAAAGCACTGATTTAGCTCTTCTTTTCTGTAGTCTGCAGCAGAATGAACACAAACCTTTGTTTAACTAC T 1536.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1574,124,0 -chr7 41540985 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=1.203;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=22.31;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:89:229,0,89 -chr7 41541508 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=2.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=24.52;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:396,0,127 -chr7 41551331 . A G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=1.837;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=16.27;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,339 -chr7 41555860 . A G 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=-1.634;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:463,0,165 -chr7 41555884 . A C 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=-0.822;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:47:452,0,47 -chr7 41876628 . A G 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.104;DP=104;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:314,0,3197 -chr7 41953115 . T C 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=-0.707;DP=62;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:329,0,1774 -chr7 41954039 . G A 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=1.800;DP=131;FS=4.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.040;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,23:120:99:378,0,3803 -chr7 41977316 . CT C 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=-0.034;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=0.258;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,16:47:99:437,0,897 -chr7 41978321 . GT G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=-1.588;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:250,0,1861 -chr7 41978326 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-1.352;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.082;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:250,0,1861 -chr7 41987622 . C T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.046;DP=54;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:471,0,1355 -chr7 42009644 . GCTGCACCCACAGAGAGAGGAGAGAAAAAAACAGAGGTATTAATATTGTACGCAGGATATTAGAAATAAACATGTAGAAAACTTAC G 2243.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=1.735;DP=58;FS=1.738;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=23.64;ReadPosRankSum=0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,52:57:99:2281,145,0 -chr7 42048715 . AT A 314.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=2.150;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.312;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:352,0,662 -chr7 42105940 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=-1.063;DP=77;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,23:77:99:631,0,1972 -chr7 42390381 . G A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=1.524;DP=14;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=16.27;ReadPosRankSum=1.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:256,0,254 -chr7 43030019 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.671;DP=32;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:253,0,816 -chr7 43192078 . TCCTAACAACAGAATATGAGTTACTTAAGGCAGCAAATATTGAACACACAATCATTTACAGACATGATCGTTAAGCTCA T 2133.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=1.541;DP=49;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.834;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2171,184,0 -chr7 43196752 . CCCTAGAAACCAAAATATCATTGTTCTCTTAAATCACTGTAAACAAAACCAAGCTCTGGCTGATGAAAGAGACTTTTA C 3696.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=2.393;DP=87;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=33.82;ReadPosRankSum=-2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,85:87:99:3734,284,0 -chr7 43239242 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.854;DP=105;FS=3.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.463;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,18:105:99:230,0,3278 -chr7 43239265 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.551;DP=120;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,20:119:99:260,0,3874 -chr7 43591234 . G A 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:39:557,39,0 -chr7 43591256 . T G 528.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:39:557,39,0 -chr7 43619746 . T C 1183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=2.002;DP=89;FS=0.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.400;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,36:89:99:1212,0,1730 -chr7 43620014 . A AAG 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=-1.532;DP=83;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:414,0,1811 -chr7 43620084 . T TA 545.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=-1.498;DP=62;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.893;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:583,0,900 -chr7 43636106 . T G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.466;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,13:55:99:311,0,1598 -chr7 43657080 . G A 805.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=-0.583;DP=105;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:834,0,2601 -chr7 43661350 . C A 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=-1.186;DP=39;FS=2.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=10.53;ReadPosRankSum=1.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:39:99:439,0,880 -chr7 43664893 . G T 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.906;DP=111;FS=3.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,22:111:99:400,0,3447 -chr7 43669812 . A C 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=1.283;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.897 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:637,0,1033 -chr7 43680992 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=-1.154;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,14:58:99:287,0,1936 -chr7 43738844 . C T 936.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=1.215;DP=68;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.305;QD=13.78;ReadPosRankSum=-1.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,28:68:99:965,0,1364 -chr7 43742979 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.160;DP=78;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.192;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,18:78:99:369,0,2217 -chr7 43880081 . C CA 364.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.250;DP=35;FS=5.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:402,0,549 -chr7 43887221 . C T 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=-2.816;DP=346;FS=1.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:278,67:345:99:989,0,11312 -chr7 43887432 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-1.940;DP=304;FS=4.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:261,43:304:99:314,0,10400 -chr7 43888939 . C A 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.861;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.319;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,20:88:99:372,0,2468 -chr7 43953188 . C T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.007;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,27:149:99:406,0,4569 -chr7 43990970 . C A 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.075;DP=196;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,30:180:99:281,0,4555 -chr7 44077297 . T A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.872;DP=31;FS=5.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.454;QD=11.93;ReadPosRankSum=-1.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:398,0,673 -chr7 44098650 . C A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=-0.633;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=6.24;ReadPosRankSum=2.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:259,0,1030 -chr7 44143090 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.951;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:246,0,445 -chr7 44166806 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.933;DP=68;FS=1.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:269,0,2060 -chr7 44166854 . G A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-1.017;DP=94;FS=3.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,19:94:99:360,0,2930 -chr7 44167079 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=-0.271;DP=116;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,22:116:99:349,0,3537 -chr7 44167811 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.295;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.114;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,16:80:99:302,0,5077 -chr7 44167812 . T G 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=-0.495;DP=77;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,15:77:99:302,0,5077 -chr7 44168111 . A G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.237;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.073;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,20:100:99:332,0,3838 -chr7 44168303 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=-1.377;DP=108;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=3.95;ReadPosRankSum=1.995 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,22:108:99:455,0,6170 -chr7 44168304 . T C 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-1.023;DP=104;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.211;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,22:104:99:455,0,6170 -chr7 44226225 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-1.851;DP=91;FS=7.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.225;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,16:91:99:240,0,3113 -chr7 44230165 . A G 479.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.478;DP=69;FS=0.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,20:68:99:508,0,1770 -chr7 44236304 . A G 469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.458;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,22:80:99:498,0,2140 -chr7 44241431 . T C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.445;DP=81;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,16:81:99:276,0,2515 -chr7 44242460 . T A 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.852;DP=60;FS=5.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=11.33;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:708,0,1319 -chr7 44444783 . A T 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-0.671;DP=78;FS=4.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,14:78:99:247,0,2497 -chr7 44447885 . G A 643.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.028;DP=181;FS=5.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,37:180:99:672,0,5598 -chr7 44456162 . G T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-2.176;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.598;QD=3.77;ReadPosRankSum=0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,22:102:99:413,0,3058 -chr7 44487614 . T TA 613.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=-1.568;DP=139;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,36:134:99:664,0,3396 -chr7 44488058 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=-0.702;DP=212;FS=9.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,37:212:99:496,0,6507 -chr7 44488130 . C T 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.203;DP=215;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=1.50;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,33:205:99:350,0,6511 -chr7 44510552 . A T 3033.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.982;ClippingRankSum=0.004;DP=278;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.450;QD=10.91;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,102:277:99:3062,0,5903 -chr7 44510579 . T G 1720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=1.558;DP=268;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,75:267:99:1749,0,7229 -chr7 44517838 . G A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=-2.035;DP=246;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=1.86;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:204,39:243:99:487,0,7880 -chr7 44521484 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.408;DP=243;FS=6.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:206,37:243:99:284,0,7916 -chr7 44543461 . G C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:247,0,381 -chr7 44546247 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=-0.453;DP=105;FS=13.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,20:105:99:327,0,3555 -chr7 44555496 . A G 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=25.71;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:98:311,0,98 -chr7 44605619 . G T 1587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-1.291;DP=231;FS=3.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=6.87;ReadPosRankSum=3.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,66:231:99:1616,0,6272 -chr7 44617489 . A G 490.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=-1.804;DP=91;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:519,0,2619 -chr7 44623257 . C T 549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.571;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.399;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,26:108:99:578,0,3140 -chr7 44628924 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=-0.895;DP=40;FS=10.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:331,0,1223 -chr7 44630512 . A G 1715.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.042;DP=30;FS=3.163;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=32.03;ReadPosRankSum=-0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:99:1744,122,0 -chr7 44630741 . T G 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=-0.597;DP=33;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:531,0,546 -chr7 44734792 . G GA 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=-2.535;DP=118;FS=7.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,33:112:99:416,0,1920 -chr7 44738596 . G A 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=-0.351;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.275;QD=2.01;ReadPosRankSum=-1.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,36:200:99:432,0,6310 -chr7 45590904 . GTCTGT G 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.593;DP=42;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=14.23;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:635,0,3994 -chr7 45590910 . AATCATAATGAAAACAACAAGAAGTTATTGAAGTCATTTATTTTTTTCCAATCACCAAGAAGGAAGGGATACTGATTGTACAGCAGAATAAAAACAGATGCATGTGAAGCAAGTGAAAATACAACTGATGTCAAAGAGTATTTGTACATGC A 597.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=1.333;DP=48;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,19:43:99:635,0,4010 -chr7 45592316 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.714;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:57:99:290,0,2216 -chr7 45612115 . GA G 468.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=1.241;DP=26;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=18.03;ReadPosRankSum=-1.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:80:506,0,80 -chr7 45614149 . TTA T 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.278;DP=13;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:258,0,149 -chr7 45664568 . A AAT 299.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=-0.694;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.612;QD=12.49;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:337,0,304 -chr7 45703988 . A G 1917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.006;DP=237;FS=2.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.108;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.665 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,83:236:99:1946,0,9516 -chr7 45762015 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.830;DP=65;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=4.92;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,16:65:99:348,0,1894 -chr7 45775647 . A T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.319;DP=79;FS=4.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,15:79:99:277,0,2459 -chr7 45779784 . C A 520.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=1.757;DP=88;FS=8.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.532;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:549,0,2500 -chr7 45779927 . GCTGCAGAAAATATTAAAGAATGCAATCAGGCATAATTATCAATTTATCATATTATATTTCCAAAAAAGATATACATCATCACGCCAACACATTTAC G 1219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=1.008;DP=77;FS=9.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.188 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,50:70:99:1257,0,3061 -chr7 45954463 . C T 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=-0.842;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.942 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,16:43:99:556,0,987 -chr7 45954997 . C T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=-0.167;DP=61;FS=2.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,13:61:99:242,0,2244 -chr7 45958453 . C T 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.317;DP=120;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,40:120:99:1103,0,3038 -chr7 46455716 . G C 2111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=-0.617;DP=388;FS=0.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.274;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:288,100:388:99:2140,0,11017 -chr7 46457278 . G T 592.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-0.569;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.984;QD=17.43;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,18:34:99:621,0,454 -chr7 46457901 . A G 1151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.838;DP=245;FS=0.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.721;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,56:245:99:1180,0,7400 -chr7 46458088 . G C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-4.882;DP=85;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,20:83:99:316,0,3199 -chr7 46581998 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=-0.258;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:618,0,738 -chr7 46582433 . C A 451.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:480,33,0 -chr7 46582553 . T C 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.937;DP=103;FS=19.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=3.50;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,21:103:99:389,0,3170 -chr7 46583067 . G A 808.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.579;DP=37;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:837,0,512 -chr7 46584322 . T A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr7 47178872 . G T 631.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:660,48,0 -chr7 47178945 . G GA 261.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:20:299,20,0 -chr7 47178946 . G A 270.81 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=35.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:20:299,20,0 -chr7 47983217 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.878;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:266,0,1052 -chr7 48031311 . G A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=-0.237;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.155;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:237,0,1193 -chr7 48041220 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.232;DP=54;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=5.59;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,14:53:99:330,0,1432 -chr7 48338854 . C CT 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-0.623;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:449,0,419 -chr7 48605442 . T C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=-1.657;DP=38;FS=1.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.699;QD=7.23;ReadPosRankSum=-1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:303,0,1227 -chr7 48605499 . G A 981.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.884;DP=36;FS=3.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=27.27;ReadPosRankSum=-0.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,27:35:99:1010,0,228 -chr7 48605577 . C T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.289;DP=20;FS=1.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.610;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:409,0,291 -chr7 48870884 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.906;DP=36;FS=7.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:291,0,912 -chr7 48871973 . G T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=28.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:62:286,0,62 -chr7 48872366 . A G 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:399,27,0 -chr7 48872369 . A C 370.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:399,27,0 -chr7 49492205 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.142;DP=25;FS=3.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.161;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:306,0,715 -chr7 49496043 . TA T 279.06 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.401;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:11:316,11,0 -chr7 49760262 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=-1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=11.65;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:238,0,643 -chr7 49760589 . G GT 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.290;DP=33;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:445,0,215 -chr7 49791820 . G A 765.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.264;DP=251;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:202,49:251:99:794,0,7654 -chr7 49810137 . G GA 445.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.112;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:56:483,0,56 -chr7 49826987 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=-1.255;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.726 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,16:76:99:304,0,2252 -chr7 49848520 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-1.740;DP=43;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.102;QD=4.92;ReadPosRankSum=1.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:240,0,1147 -chr7 50179418 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=-0.060;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:302,0,604 -chr7 50179689 . G GAC 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=-0.291;DP=38;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:290,0,1079 -chr7 50245898 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=-1.109;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.426;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:231,0,458 -chr7 50268425 . C T 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.659;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.122;QD=27.28;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,33:46:99:1283,0,336 -chr7 50485146 . C A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.212;DP=29;FS=1.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:258,0,781 -chr7 50511699 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=-1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=23.38;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:97:262,0,97 -chr7 50782021 . TA T 358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=1.274;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.991;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:396,0,207 -chr7 50785337 . GT G 217.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:255,24,0 -chr7 50805310 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=-0.368;DP=41;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:251,0,1079 -chr7 51076958 . A T 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.849;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=30.12;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:480,0,270 -chr7 51076959 . C A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.152;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=28.24;ReadPosRankSum=0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:480,0,270 -chr7 51172875 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=-0.333;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.920;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:280,0,3344 -chr7 51257358 . G T 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.169;QD=13.39;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:363,0,425 -chr7 51771573 . C G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=-0.302;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.764;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:292,0,909 -chr7 51810731 . C G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.541;DP=151;FS=0.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.027;QD=2.46;ReadPosRankSum=2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,27:151:99:400,0,4809 -chr7 51814534 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=-1.367;DP=116;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:99:452,0,3461 -chr7 51814842 . A G 821.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-2.304;DP=178;FS=2.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.422;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,41:178:99:850,0,5056 -chr7 51821403 . A T 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.699;DP=114;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:523,0,3462 -chr7 51821433 . A G 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=-2.342;DP=114;FS=1.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.808;QD=4.22;ReadPosRankSum=-1.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,25:114:99:509,0,3372 -chr7 51822307 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:230,0,53 -chr7 51824505 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.292;DP=75;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:421,0,2151 -chr7 51864761 . G C 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=2.030;DP=267;FS=7.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,42:267:99:400,0,8574 -chr7 51864862 . C CG 715.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=-0.351;DP=246;FS=3.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.462;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,57:234:99:753,0,5699 -chr7 51865011 . TCTGAGAGAAACACGTTAACATGTTTATCCTCGTCAAATCATCTAAATCAGTGAATGCACTGCTCTATACTTAC T 14552.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=4.821;DP=373;FS=6.527;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=26.42;ReadPosRankSum=1.114 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,355:372:99:14590,1212,0 -chr7 51867451 . A G 862.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.598;DP=109;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,34:109:99:891,0,2913 -chr7 52001522 . G A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=-0.386;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=23.29;ReadPosRankSum=1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:331,0,139 -chr7 52147722 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.403;DP=95;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,17:95:99:238,0,2995 -chr7 52228518 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-1.394;DP=43;FS=5.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.772;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:309,0,1323 -chr7 52366630 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.471;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=10.80;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:255,0,442 -chr7 52366675 . C T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.285;DP=36;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:378,0,913 -chr7 52369412 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.809;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.986 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,19:42:99:678,0,761 -chr7 52375505 . G A 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=-2.149;DP=25;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.299;QD=16.71;ReadPosRankSum=0.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:446,0,438 -chr7 52375817 . T C 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.223;DP=206;FS=1.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:160,46:206:99:436,0,15522 -chr7 52376615 . A T 5084.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=1.200;DP=170;FS=0.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,107:170:99:5113,0,3883 -chr7 52378660 . A G 2360.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=1.675;DP=60;FS=4.771;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=31.40;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,59:60:99:2389,175,0 -chr7 52381298 . C A 1842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=-0.083;DP=414;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.738;QD=4.45;ReadPosRankSum=1.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:318,94:412:99:1871,0,12254 -chr7 52386972 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=-0.105;DP=302;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.252;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:226,36:262:99:239,0,8583 -chr7 52387191 . T C 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=-0.988;DP=343;FS=5.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=2.17;ReadPosRankSum=-0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,59:343:99:773,0,10755 -chr7 52409935 . AACCTAGAAACAAGTGAATTAAATGATCACTGAAATCTACACCTGAAAAATAACTTAAGTTAGTGCATCTTAGATTGAACAAAAATCACAAAAAAGCAACATTGGAGCCTGACATATCAGCAATTGCTTAT A 12798.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=2.156;DP=317;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,311:316:99:12836,1131,0 -chr7 52428524 . A G 9613.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.323;DP=237;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.116;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,235:236:99:9642,692,0 -chr7 52603343 . C G 24243.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=584;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,553:553:99:24272,1625,0 -chr7 52603345 . A G 24243.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=584;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,553:553:99:24272,1625,0 -chr7 52649141 . T A 1699.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.540;DP=61;FS=11.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=27.87;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,47:61:99:1728,0,247 -chr7 52809436 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.428;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:277,0,263 -chr7 52809783 . G GC 789.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:827,63,0 -chr7 52819788 . C CA 252.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.36;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:27:290,27,0 -chr7 52923412 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=-1.582;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.119;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,413 -chr7 53089498 . GCCTATTCACAAACAGAAAAAGTGATGTGCAACTCAAATACAGGAACAACAGTTTCCACTCAATTTTAAAACCATGAGCTGACCAA G 15730.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.625;DP=365;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.009;QD=32.00;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,349:354:99:15768,1252,0 -chr7 53098589 . C A 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.172;DP=65;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,17:65:99:374,0,1876 -chr7 53183260 . TCTACAGACGTCGAGAAAAAACACATTAAGATTTTTTTACCATCTCGGGTTTTGTTTTACCAAAAGTGTTCACCAAATGTGTATATTTACACAC T 909.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=2.246;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:99:947,0,842 -chr7 53241655 . C T 526.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=-0.323;DP=322;FS=6.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=1.64;ReadPosRankSum=2.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,49:309:99:555,0,10100 -chr7 53251085 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-0.481;DP=56;FS=6.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.130;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:384,0,1567 -chr7 53266193 . GAGGTAACATGCTTATTGTGGTCTATAATATGTGAAGTAAACATACGGTCAGGTCTGAAAGGGAATATGCATGTTTGTTTGTGCTTC G 3934.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.079;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.089;QD=32.03;ReadPosRankSum=-0.570 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,99:102:99:3972,296,0 -chr7 53609661 . C CA 787.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=-1.948;DP=85;FS=7.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=9.27;ReadPosRankSum=1.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,35:84:99:825,0,1198 -chr7 53740129 . AAC A 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-3.101;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:238,0,539 -chr7 53915988 . G A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=-0.073;DP=118;FS=3.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,19:118:99:241,0,3797 -chr7 53948573 . G A 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=1.778;DP=79;FS=1.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:235,0,2388 -chr7 53972284 . GTT G 1279.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=-1.888;DP=63;FS=5.935;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=1.057;QD=20.31;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,51:54:99:1891,125,0 -chr7 53973731 . AAT A 822.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-1.115;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=18.28;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,26:31:11:855,11,0 -chr7 53974257 . C T 748.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=-2.246;DP=263;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,49:261:99:777,0,8348 -chr7 54205856 . G T 603.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.504;DP=147;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.931;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,33:147:99:632,0,4350 -chr7 54206310 . GT G 1421.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.345;DP=93;FS=3.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQ0=0;MQRankSum=2.399;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,50:81:99:1459,0,437 -chr7 54285543 . GA G 414.76 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.327;DP=18;FS=3.274;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=23.04;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:22:452,22,0 -chr7 54292109 . A G 495.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=1.076;DP=42;FS=4.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:524,0,916 -chr7 54292451 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.069;DP=41;FS=1.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:403,0,963 -chr7 54294865 . T C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.741;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=11.60;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:469,0,874 -chr7 54295989 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.262;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=8.03;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:229,0,657 -chr7 54353236 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.951;DP=113;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,23:112:99:428,0,3386 -chr7 54356016 . A T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.197;DP=118;FS=0.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,24:118:99:388,0,4674 -chr7 54391946 . C G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-1.396;DP=157;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,28:157:99:415,0,4834 -chr7 54582542 . GAA G 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=-0.293;DP=205;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,2:180:99:351,0,6238 -chr7 54583170 . G GA 1428.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=-1.310;DP=330;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,91:312:99:1466,0,6044 -chr7 54583470 . CA C 1784.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=-0.378;DP=227;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,90:210:99:1822,0,2295 -chr7 54583749 . A AT 1618.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=-1.318;DP=205;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,56:163:99:2368,0,1013 -chr7 54584277 . C CT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-1.828;DP=348;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,57:324:99:299,0,7279 -chr7 54630554 . CT C 237.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.543;DP=18;FS=1.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=13.21;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:275,0,149 -chr7 54756277 . C A 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-1.080;DP=92;FS=5.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,27:92:99:647,0,2816 -chr7 54756389 . TCA T 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=-1.748;DP=80;FS=3.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.457;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:80:99:672,0,2993 -chr7 55222099 . TC T 1019.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-0.957;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=1.017;QD=17.00;ReadPosRankSum=0.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,40:54:99:1057,0,208 -chr7 55222323 . G GT 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=-1.990;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.374;QD=9.49;ReadPosRankSum=2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,22:47:99:547,0,563 -chr7 55225578 . CT C 652.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.630;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=28.38;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:67:690,67,0 -chr7 55235290 . CT C 418.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=3.091;DP=71;FS=6.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,21:60:99:458,0,774 -chr7 55235308 . CT C 344.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=1.128;DP=63;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=5.47;ReadPosRankSum=-2.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:440,0,459 -chr7 55235883 . GA G 823.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=0.674;DP=68;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=12.11;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,37:62:99:861,0,579 -chr7 56207281 . C G 1269.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1298,96,0 -chr7 56220954 . AGTAAGCTGATAAGATTATTGTTGTAATTATAGTTATATACGAGTATAAAAATAGCAATAAACATCTCGGGTATGTCCTGTCATCCCCCTATTATGTTTTTAG A 8080.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=1.913;DP=196;FS=2.684;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.719;QD=32.91;ReadPosRankSum=-2.216 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,183:194:99:8118,735,0 -chr7 56222252 . GAGGTGAGAAATGTTTTTTTGATTAATCTCAGAGCAGTTGCTGAATTTATTCTAGCAAGTTCATTCATCTTCCTCTTTC G 1267.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.911;DP=260;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.225;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,240:244:99:1305,508,0 -chr7 56227698 . C CT,CTT 831.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.52;MQ0=0;QD=19.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,24,18:42:99:1439,527,401,618,0,542 -chr7 56277838 . C G 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 -chr7 56278306 . C T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:347,24,0 -chr7 56279696 . G T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=10;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.88;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:267,0,55 -chr7 56281181 . A T 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=-0.634;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:378,0,256 -chr7 56539584 . T C 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr7 56590189 . CA C 257.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=16.11;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:87:295,0,87 -chr7 56590799 . A AT 634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=-2.164;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=22.67;ReadPosRankSum=-0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:672,0,801 -chr7 56782029 . C T 1860.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.287;DP=117;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.308;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,55:117:99:1889,0,2008 -chr7 56793696 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.926;DP=65;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:318,0,1957 -chr7 56795964 . A T 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-1.437;DP=106;FS=6.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,22:105:99:433,0,3178 -chr7 56807997 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=-0.020;DP=107;FS=4.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.252;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,20:107:99:287,0,3443 -chr7 56892888 . G A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=-0.720;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:274,0,1305 -chr7 56920814 . GAT G 1536.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=1.521;DP=42;FS=2.162;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.30;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=27.21;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,38:42:27:1574,27,0 -chr7 57382481 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr7 57383048 . A C 638.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=1.043;DP=37;FS=8.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.281;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:35:99:667,0,598 -chr7 57415618 . C CA 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=1.733;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=15.70;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:257,0,106 -chr7 57440451 . T G 1326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.894;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.451;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,38:84:99:1355,0,1473 -chr7 57659374 . A G 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=-0.540;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,18:81:99:277,0,2884 -chr7 57659940 . C CA 274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.155;DP=97;FS=6.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,24:88:99:312,0,1680 -chr7 57669794 . G GA 474.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=-2.164;DP=52;FS=8.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=9.13;ReadPosRankSum=2.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,27:41:99:630,0,220 -chr7 57672417 . G T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.773;DP=47;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.131;QD=6.34;ReadPosRankSum=2.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:326,0,3004 -chr7 57731139 . A G 477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.703;DP=32;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:506,0,705 -chr7 57731208 . A G 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=1.794;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.819;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:99:579,0,1056 -chr7 57731356 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.461;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.843;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:261,0,1310 -chr7 57731367 . A G 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=-2.313;DP=36;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.618;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:263,0,956 -chr7 57791828 . GAGGTCAGGCTACCATATAATTGATATAACTATGACTGGGTCATTTAGAATACTGCCATGTTAATGTTTTAGCTAATGCTTATTTTTTCCT G 2777.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.176;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=32.30;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,74:81:99:2815,0,1365 -chr7 57847468 . C T 421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=-1.632;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=18.34;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:450,0,202 -chr7 58007142 . A G 335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.922;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=20.99;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:364,0,204 -chr7 58485226 . G GT 206.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:244,24,0 -chr7 59145701 . G A 3186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=-1.002;DP=133;FS=3.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=23.96;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,83:121:99:3215,0,1008 -chr7 59411384 . TCTGAAATCATTAGTCAGTAAACAAATGTGTATGATGTGTTTTCTCAAACAGTGTGATGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGAC T 1498.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=2.874;DP=42;FS=4.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=28.70;ReadPosRankSum=-2.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:99:1536,0,1369 -chr7 59429935 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-1.217;DP=36;FS=1.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=13.19;ReadPosRankSum=1.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:503,0,813 -chr7 59432439 . T C 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.975;DP=27;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.975;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:305,0,588 -chr7 59438188 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=-0.766;DP=56;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:353,0,1610 -chr7 59459860 . AT A 362.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.744;DP=89;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,28:77:99:587,0,758 -chr7 59459862 . T A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.947;DP=88;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:388,0,3483 -chr7 60023301 . T A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:449,0,219 -chr7 60030577 . T C 713.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=0.256;DP=195;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,40:195:99:742,0,5865 -chr7 60062685 . C T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.315;DP=172;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,30:165:99:464,0,5291 -chr7 60125782 . A T 587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=1.797;DP=508;FS=4.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=1.16;ReadPosRankSum=1.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:432,74:506:99:616,0,16544 -chr7 60140545 . T C 672.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=-0.679;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.515;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:701,0,1366 -chr7 60621598 . T C 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.555;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=23.52;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:428,0,135 -chr7 60624485 . G GA 477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.884;ClippingRankSum=-1.394;DP=301;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:212,63:275:99:515,0,5439 -chr7 60627070 . T A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.714;DP=430;FS=1.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:364,61:425:99:400,0,14331 -chr7 60835342 . T C 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-0.984;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,25:125:99:445,0,4357 -chr7 60872055 . CT C 478.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.063;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=23.94;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:31:516,31,0 -chr7 61753638 . T C 1178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=-1.109;DP=74;FS=5.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.457;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1207,0,1417 -chr7 61753668 . C A 1663.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=-1.445;DP=108;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,46:108:99:1692,0,2164 -chr7 61910337 . T C 628.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.087;DP=25;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:657,0,322 -chr7 61970418 . A C 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=-1.033;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=27.82;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:696,0,129 -chr7 62028784 . A G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.662;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.662;QD=24.66;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:546,0,171 -chr7 62035888 . G A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-1.877;DP=37;FS=1.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.346;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:311,0,909 -chr7 62042693 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=-1.093;DP=14;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:236,0,225 -chr7 62043065 . C G 548.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:577,42,0 -chr7 62057276 . T C 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.493;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.26;ReadPosRankSum=-0.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:540,0,179 -chr7 62059463 . A G 2058.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.058;DP=53;FS=2.243;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.021;QD=36.79;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,50:53:99:2087,108,0 -chr7 62070672 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=-0.539;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.725;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:317,0,597 -chr7 62077981 . G T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=-0.555;DP=34;FS=1.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:530,0,609 -chr7 62361864 . C A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.380;DP=12;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=20.31;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:272,0,183 -chr7 62624576 . CACCTGGAGAAGATTGACAGGTATGCTAGTTTACATGGCTAATACGTTGCGTGTGATGCTACCCATTTGCATAGTTTGAAGTATTTT C 2200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=-0.478;DP=123;FS=10.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,79:109:99:2238,0,1565 -chr7 62854382 . T A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 63468497 . A AAG 1376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=-3.104;DP=65;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=21.18;ReadPosRankSum=2.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,44:55:99:1414,0,170 -chr7 63470763 . A C 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr7 64015046 . A G 1398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1427,102,0 -chr7 64100775 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.226;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=7.83;ReadPosRankSum=1.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:263,0,795 -chr7 64601453 . T C 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr7 64602753 . A C 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr7 64603529 . C T 1149.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87:1178,87,0 -chr7 65357283 . ACTAAAAGAATAAAACATTGAAAAGTTGCACAAAAGGGAGCTGATAATAACAAAATTATATAAACATATACGTCAATACGGTAATAAGAC A 9270.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=-0.543;DP=208;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.710;QD=31.29;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,193:201:99:9308,897,0 -chr7 65688433 . C T 3353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.681;DP=568;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=5.90;ReadPosRankSum=2.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:419,147:566:99:3382,0,15902 -chr7 65691940 . G GT 705.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;ClippingRankSum=0.566;DP=310;FS=4.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.353 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,69:280:99:743,0,5303 -chr7 65725906 . TCCTGCGATAAAAAGACAGAGAAAAGAGTTACTATGGAAATTAGCCTCTGAAACGTACTTTGAGTTGTAAATACAACACAATA T 2042.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.181;DP=48;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.264;QD=28.71;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,46:48:99:2080,163,0 -chr7 66010513 . T C 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.660;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=18.21;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:265,0,225 -chr7 66020342 . T C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=1.190;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.119;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:444,0,750 -chr7 66020610 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=-0.990;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:275,0,581 -chr7 66080309 . AT A 236.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=-0.888;DP=25;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=9.47;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:274,0,282 -chr7 66359920 . TGTGAGTGTGTACGGAGTTCACAATCATTAAACTGGCTTTAAAAAAATGAATCTCTCAGTGATTTGGATGTTTTGCTCTCATCTTGACAG T 1092.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=2.333;DP=35;FS=5.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=31.22;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:35:99:1130,0,1557 -chr7 66377344 . C A 570.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=2.850;DP=19;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=30.04;ReadPosRankSum=-2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:599,0,149 -chr7 66377352 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=3.802;DP=21;FS=10.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.670;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:413,0,557 -chr7 66648972 . C T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 -chr7 66648978 . C T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:230,18,0 -chr7 66652391 . AT A 284.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.938;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:45:322,0,45 -chr7 66653784 . T TA 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.664;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:300,0,299 -chr7 66673595 . C T 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=16.95;ReadPosRankSum=0.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,27:46:99:825,0,634 -chr7 66821232 . A AT 2675.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-2.646;DP=239;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,158:211:99:3374,0,925 -chr7 66821918 . C CT 406.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-1.052;DP=269;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,48:245:99:444,0,4656 -chr7 66822142 . CT C 16477.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.925;DP=146;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=32.71;ReadPosRankSum=0.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,2:129:99:16515,0,1196 -chr7 66829409 . G C 270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=2.680;DP=13;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:299,0,166 -chr7 66834632 . TA T 207.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-0.740;DP=13;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=15.98;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:57:245,0,57 -chr7 66837071 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.398;DP=21;FS=16.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.412;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:464,0,261 -chr7 66837080 . C T 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=1.491;DP=17;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=15.16;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:286,0,662 -chr7 66837391 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.575;DP=26;FS=1.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=17.18;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:99:475,0,379 -chr7 66838541 . A C 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=-2.709;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=21.38;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:627,0,343 -chr7 66898728 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=1.592;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:319,0,361 -chr7 66959675 . TA T 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-1.061;DP=26;FS=3.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.224;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.789 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:323,0,389 -chr7 66961458 . T C 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:433,30,0 -chr7 66972013 . TCTGTAAAGCATCAAAAAAAGACATCAAAAGTTATCATAAAACATTTTGAAACTTGAAAACTTCAGTCGGGAGTGGATGCAGACTTAC T 2298.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=2.359;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=31.01;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:54:99:2336,168,0 -chr7 66982970 . C T 6040.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-1.357;DP=351;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=17.21;ReadPosRankSum=1.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,177:351:99:6069,0,6014 -chr7 67018477 . TGGTAAGAGCCTCTTCTATGATTCACCGCTCATCTTGAAATCGAAGCAGCTTGAAATAAACATTTCCTTCCTCTTTCTCA T 11689.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.526;DP=340;FS=1.647;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.459;QD=34.38;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,296:301:99:11727,870,0 -chr7 67033902 . CA C,CAA 3256.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=2.104;DP=187;FS=2.722;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.625;QD=17.41;ReadPosRankSum=-1.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:17,111,42:170:99:3490,579,952,2789,0,3838 -chr7 67034267 . TA T 5246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=-0.399;DP=289;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,210:255:99:5284,0,164 -chr7 67034478 . A AT 1176.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.160;DP=78;FS=8.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.28;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=15.09;ReadPosRankSum=-3.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,47:76:99:1214,0,1001 -chr7 67034898 . TTC T 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.231;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.758;QD=15.81;ReadPosRankSum=1.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:401,0,684 -chr7 67288444 . A T 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=-1.969;DP=50;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.339;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:518,0,3009 -chr7 67288449 . C A 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-1.159;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:99:530,0,3009 -chr7 67327737 . GT G 896.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=-0.741;DP=111;FS=5.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.396;QD=8.08;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,43:103:99:934,0,2197 -chr7 67328321 . A AT 326.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.175;DP=41;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:364,0,757 -chr7 67328564 . GA G 2751.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.767;DP=180;FS=0.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=15.29;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,119:160:99:2864,0,914 -chr7 67328610 . TA T 1260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=-0.423;DP=160;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,59:129:99:1298,0,2142 -chr7 67329002 . AAG A 2115.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.894;DP=279;FS=5.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=7.58;ReadPosRankSum=2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,80:275:99:2153,0,7954 -chr7 67332553 . GCTGGGAGAATTGAGAGGTTAAACCAACTGTACACCAACTAAACTTTAACAAACGCCTTCAATAGAAACAGTCAGCCATAC G 11914.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=1.379;DP=341;FS=4.210;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=34.94;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,313:325:99:11952,1005,0 -chr7 67410910 . C A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=1.480;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=31.75;ReadPosRankSum=-0.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:46:441,0,46 -chr7 67478515 . A G 458.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:487,36,0 -chr7 67938300 . C CA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=-1.531;DP=123;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.649;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,30:105:99:308,0,1704 -chr7 68129020 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-0.076;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:368,0,323 -chr7 68129603 . A AT 238.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.558;DP=54;FS=2.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=4.42;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,17:49:99:276,0,801 -chr7 68773905 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.692;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=14.90;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:356,0,409 -chr7 69497596 . CGGTATAGAAATGTTTGAAAACATATGTTTGCCATCACAAAAGGTGTGGGAAGGTGTTTTTTTTCTGTTGCTAAAATAGTTTTGTGTGTGTTTTTGACA C 15902.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.308;DP=367;FS=3.441;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=32.06;ReadPosRankSum=-0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,345:352:99:15940,1149,0 -chr7 69498715 . TGGTATGTGCTTTTTAGTTTGTTTTTCATTTGTATGGTTAAACCACACATTATCCACAACATTCATCTGATCCGTCTTCCATCTTTCACCCTCA T 15886.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=-0.997;DP=337;FS=2.111;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=34.83;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,333:336:99:15924,1353,0 -chr7 69516628 . CTT C 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.375;DP=164;FS=0.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,36:124:99:1060,0,2454 -chr7 69797626 . C CT 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=1.088;DP=124;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.004;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,28:107:99:284,0,2068 -chr7 69799029 . A G 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=1.038;DP=81;FS=5.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.725;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:298,0,2500 -chr7 69799658 . A G 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.720;DP=6;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=32.90;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:99:735,0,139 -chr7 69801575 . C CT 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=-3.067;DP=78;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:330,0,992 -chr7 69819751 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.017;DP=37;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:236,0,1025 -chr7 69849690 . GT G 405.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=-0.010;DP=50;FS=1.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:443,0,834 -chr7 70371093 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=-1.815;DP=189;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:158,31:189:99:386,0,5779 -chr7 70378541 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=2.536;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=19.89;ReadPosRankSum=2.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:446,0,165 -chr7 70378559 . A G 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=1.212;DP=17;FS=9.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.107;QD=23.81;ReadPosRankSum=0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:433,0,270 -chr7 70379001 . A G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.964;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=12.29;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:274,0,445 -chr7 70379144 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=-0.495;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:419,0,438 -chr7 70379145 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=-0.157;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:301,0,911 -chr7 70379413 . A G 1127.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:24:10:1155,10,0 -chr7 70380015 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=1.444;DP=21;FS=4.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:278,0,1346 -chr7 70380049 . T A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=-0.421;DP=14;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.663;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:326,0,251 -chr7 70380131 . A G 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.597;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:259,0,135 -chr7 70380545 . A G 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.988;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.692;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:452,0,908 -chr7 70391446 . A G 521.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:550,39,0 -chr7 70400010 . G A 960.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.713;DP=60;FS=5.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=16.01;ReadPosRankSum=-0.892 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,27:60:99:989,0,1137 -chr7 70648257 . GT G 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.233;DP=72;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.055;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,20:61:99:384,0,692 -chr7 70648380 . CT C 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-1.836;DP=70;FS=6.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.374;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:493,0,751 -chr7 70649707 . G C 1452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.836;DP=103;FS=8.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.862;QD=14.10;ReadPosRankSum=1.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,42:103:99:1481,0,2107 -chr7 71196855 . A G 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.249;DP=22;FS=4.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:289,0,389 -chr7 71381161 . C A 232.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:261,18,0 -chr7 71418828 . A G 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:97:315,0,97 -chr7 71419320 . G T 546.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:575,42,0 -chr7 71456711 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.263;DP=33;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=7.78;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:285,0,434 -chr7 71505007 . A T 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.274;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=30.91;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:39:461,0,39 -chr7 71944083 . C T 483.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.764;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.594;QD=30.24;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:39:512,0,39 -chr7 72101620 . T A 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.537;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=13.34;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:255,0,373 -chr7 72101906 . G GA 253.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=-0.174;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=16.92;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:291,0,582 -chr7 72101915 . A G 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.521;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=17.52;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:291,0,582 -chr7 72102079 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.168;DP=28;FS=5.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:348,0,654 -chr7 72105127 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.433;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:278,0,327 -chr7 72106483 . A G 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-2.736;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:327,0,422 -chr7 72106548 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-0.556;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=15.45;ReadPosRankSum=0.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:260,0,240 -chr7 72107549 . G A 671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.342;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.460;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:700,0,1043 -chr7 72108780 . A G 494.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=-0.323;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.083;QD=15.46;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:523,0,608 -chr7 72108957 . T C 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=1.314;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:513,0,1556 -chr7 72109071 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.748;DP=36;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:591,0,730 -chr7 72126141 . C A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.181;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.083;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,764 -chr7 72126142 . A G 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=-1.156;DP=17;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:250,0,764 -chr7 72263081 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-1.110;DP=31;FS=8.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.153;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:238,0,797 -chr7 72307181 . A G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=20.98;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:322,0,176 -chr7 72307612 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=0.289;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=26.65;ReadPosRankSum=-1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:348,0,126 -chr7 72307787 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.231;DP=5;FS=10.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=32.10;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:97:258,0,97 -chr7 72307788 . A G 438.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:33:467,33,0 -chr7 72315924 . GA G 235.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=-1.001;DP=52;FS=2.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:273,0,931 -chr7 72317459 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=-0.960;DP=51;FS=4.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.792 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:369,0,1400 -chr7 72399638 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=-1.461;DP=36;FS=3.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:229,0,1697 -chr7 72430590 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=-2.044;DP=39;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:323,0,1052 -chr7 72439000 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=-0.050;DP=36;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:404,0,835 -chr7 72441814 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.506;DP=54;FS=9.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.538;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:290,0,1355 -chr7 72546578 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.707;DP=71;FS=3.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.905;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,18:71:99:395,0,2081 -chr7 72552173 . A C 718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=-0.629;DP=56;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=12.84;ReadPosRankSum=1.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:99:747,0,1191 -chr7 72561530 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.765;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=13.70;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:398,0,749 -chr7 72580795 . G A 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.630;DP=26;FS=10.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:386,0,533 -chr7 72581901 . T A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=1.800;DP=49;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:298,0,1535 -chr7 72582209 . C T 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.429;DP=45;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,14:45:99:380,0,1196 -chr7 72582485 . T C 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=2.516;DP=41;FS=8.917;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:277,0,1138 -chr7 72582783 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-1.762;DP=52;FS=1.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.045;QD=6.23;ReadPosRankSum=1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,14:51:99:352,0,1375 -chr7 72582955 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=-0.390;DP=58;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:313,0,1820 -chr7 72583093 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=-0.378;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:253,0,1406 -chr7 72583348 . C T 886.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=-2.089;DP=75;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,27:74:99:915,0,1641 -chr7 72585181 . A G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=-0.444;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:307,0,2238 -chr7 72585571 . T C 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-1.357;DP=63;FS=1.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,18:62:99:441,0,2365 -chr7 72624252 . C A 1241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=-0.896;DP=114;FS=3.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.108;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,39:114:99:1270,0,2655 -chr7 72645962 . C CA 479.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=-1.255;DP=155;FS=0.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.806 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,38:146:99:517,0,2936 -chr7 72649615 . C T 1904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=-0.053;DP=136;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.795;QD=14.01;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,57:136:99:1933,0,2675 -chr7 72657398 . G C 666.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.221;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,26:95:99:695,0,2799 -chr7 72818596 . C CCT 201.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=1.866;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=20.17;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:239,0,154 -chr7 72820016 . C T 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=-0.604;DP=50;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=13.78;ReadPosRankSum=1.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,20:50:99:717,0,1101 -chr7 72820041 . C T 995.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=-0.781;DP=59;FS=0.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=16.88;ReadPosRankSum=-1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1024,0,1056 -chr7 72884945 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-1.236;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:262,0,1416 -chr7 72885041 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.973;DP=42;FS=5.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,11:42:99:263,0,1128 -chr7 73835616 . CA C 4075.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.247;DP=337;FS=0.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,173:295:99:4113,0,2883 -chr7 73885276 . G A 2438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=1.720;DP=213;FS=13.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=11.45;ReadPosRankSum=2.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,74:213:99:2467,0,4874 -chr7 73965861 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 73965863 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr7 73968066 . C T 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=1.148;DP=72;FS=1.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=13.57;ReadPosRankSum=-0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:99:1005,0,2110 -chr7 73970899 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.021;DP=66;FS=1.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,20:66:99:509,0,1735 -chr7 73982861 . T C 775.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=-0.942;DP=55;FS=2.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,24:55:99:804,0,1039 -chr7 73983327 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=-0.915;DP=47;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:291,0,1299 -chr7 73992857 . G A 404.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.142;DP=54;FS=6.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=7.50;ReadPosRankSum=2.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,16:54:99:433,0,1431 -chr7 73995033 . T A 516.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=-0.977;DP=30;FS=5.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.226;QD=17.23;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:545,0,462 -chr7 74357162 . T C 1565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.026;DP=106;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,45:106:99:1594,0,2372 -chr7 74357187 . T C 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.412;DP=89;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.916;QD=10.97;ReadPosRankSum=2.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,30:89:99:1005,0,2100 -chr7 74357274 . AAT A 674.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=-4.386;DP=100;FS=16.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.213 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,19:97:99:712,0,3307 -chr7 74359974 . A C 3124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.612;DP=182;FS=9.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.751;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,86:181:99:3153,0,3174 -chr7 74366242 . G A 3220.76 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=2.177;DP=202;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,91:202:99:3249,0,3631 -chr7 74366260 . G A 3073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.701;DP=196;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,89:196:99:3102,0,3527 -chr7 74435386 . G GT 3165.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=-2.447;DP=386;FS=10.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.198;QD=8.20;ReadPosRankSum=-1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,166:356:99:3583,0,4282 -chr7 74594680 . A G 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=-1.694;DP=48;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.64;ReadPosRankSum=2.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1307,0,316 -chr7 74597235 . T C 1019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=1.583;DP=41;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.87;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,28:41:99:1048,0,333 -chr7 74628326 . C T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.306;DP=15;FS=9.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:319,0,162 -chr7 74668842 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 -chr7 74677053 . G A 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:352,0,201 -chr7 74741566 . T A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=1.365;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:297,0,207 -chr7 74852175 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=-0.825;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,24:113:99:263,0,2436 -chr7 75111942 . T C 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.456;DP=35;FS=8.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:262,0,920 -chr7 75111966 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=1.926;DP=31;FS=5.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=11.86;ReadPosRankSum=0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:396,0,669 -chr7 75112230 . A G 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.678;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.065;QD=10.86;ReadPosRankSum=-0.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:278,0,528 -chr7 75150153 . AT A 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=-0.065;DP=37;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=7.29;ReadPosRankSum=2.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:307,0,382 -chr7 75150218 . A AT 615.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=1.118;DP=45;FS=7.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=13.68;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,27:43:99:653,0,362 -chr7 75158711 . G A 629.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.694;DP=43;FS=19.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=14.65;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:658,0,712 -chr7 75199241 . G T 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=-1.051;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.657 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:409,0,398 -chr7 75202229 . A T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-1.176;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=13.10;ReadPosRankSum=-2.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:395,0,631 -chr7 75223291 . C T 5302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.032;DP=366;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,152:365:99:5331,0,7167 -chr7 75227537 . G A 6469.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.827;ClippingRankSum=0.313;DP=442;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=14.64;ReadPosRankSum=2.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,228:442:99:6498,0,7543 -chr7 75231124 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=12;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:265,0,55 -chr7 75312242 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DP=34;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=11.61;ReadPosRankSum=-2.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:423,0,732 -chr7 75317094 . C T 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.163;DP=38;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.517;QD=12.81;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:515,0,744 -chr7 75364108 . G C 755.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-2.351;DP=44;FS=1.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,26:44:99:784,0,574 -chr7 75415009 . T A 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DP=42;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=19.30;ReadPosRankSum=0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,27:42:99:839,0,491 -chr7 75426827 . G T 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr7 75435228 . C T 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.044;DP=38;FS=4.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.434;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:470,0,745 -chr7 75451580 . A G 966.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.186;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.471;QD=20.57;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,29:47:99:995,0,620 -chr7 75457114 . A G 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.434;DP=49;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,28:49:99:944,0,742 -chr7 75488378 . C CA 726.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=-1.331;DP=272;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.205;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,62:256:99:764,0,5482 -chr7 75716669 . T C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-1.098;DP=23;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:233,0,192 -chr7 75723667 . G A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-0.171;DP=172;FS=0.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.483 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,35:172:99:612,0,5137 -chr7 76575445 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.895;DP=10;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:264,0,101 -chr7 76619784 . A G 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=-0.408;DP=48;FS=1.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:755,0,1005 -chr7 76632947 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=-2.384;DP=149;FS=1.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,22:149:99:269,0,9574 -chr7 76654975 . T TA 546.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.149;DP=102;FS=14.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,35:95:99:584,0,1571 -chr7 76683526 . C T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-1.354;DP=33;FS=5.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=6.14;ReadPosRankSum=2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:231,0,880 -chr7 76683700 . C T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.926;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.926;QD=6.88;ReadPosRankSum=1.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:262,0,884 -chr7 76820937 . G GT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.929;DP=240;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.395;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,49:224:99:290,0,3858 -chr7 76829181 . T C 710.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=-2.464;DP=118;FS=10.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=6.02;ReadPosRankSum=3.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,31:118:99:739,0,2874 -chr7 76829237 . A C 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=-3.346;DP=142;FS=12.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.522;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,30:142:99:521,0,4283 -chr7 76858823 . G T 2041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=2.419;DP=362;FS=13.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.229;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:267,94:361:99:2070,0,9945 -chr7 77022854 . TGTGAGCAGAGCGCGCCACCATGCTGTGTAGCGGAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTAGTGAATCTGTGGTGTGTTTATGCGTCTCCTCAG T 15527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.065;DP=346;FS=3.550;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=1.092;QD=32.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,339:346:99:15565,1315,0 -chr7 77047809 . GCAGGTCAGAGTGTGTTTCTGTCTGCCTGTGTGTTATCATTCAGCGTGTGTGTTATTATAGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGCA G 313.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=2.376;DP=69;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:351,131,0 -chr8 250727 . C G 842.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.175;DP=67;FS=5.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=12.58;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,25:67:99:871,0,1466 -chr8 271325 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.548;DP=34;FS=3.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:275,0,909 -chr8 460587 . C A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=-1.317;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:414,0,755 -chr8 473037 . G A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=2.353;DP=74;FS=4.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:231,0,2249 -chr8 485361 . C T 248.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=-0.265;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=6.91;ReadPosRankSum=0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:277,0,909 -chr8 497912 . A ACG 467.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.617;DP=45;FS=2.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.424;QD=10.39;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,14:44:99:505,0,2963 -chr8 497928 . A ACT 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.673;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:516,0,2963 -chr8 498044 . G A 1735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.655;DP=127;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.674;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.655 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,52:127:99:1764,0,2317 -chr8 498290 . G A 975.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=2.000;DP=85;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=11.48;ReadPosRankSum=1.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,31:83:99:1004,0,1645 -chr8 505599 . T G 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=-3.409;DP=124;FS=3.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.388;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,35:124:99:813,0,3060 -chr8 505842 . C T 906.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=-1.275;DP=129;FS=1.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,38:125:99:935,0,3123 -chr8 580226 . T C 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-1.721;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=9.51;ReadPosRankSum=1.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:304,0,769 -chr8 581127 . C T 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-1.422;DP=44;FS=3.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:561,0,701 -chr8 581804 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-1.092;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:243,0,294 -chr8 582024 . C T 1634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-1.468;DP=76;FS=2.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.574;QD=21.51;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,42:62:99:1663,0,509 -chr8 582140 . T C 1007.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=1.555;DP=61;FS=1.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,30:50:99:1036,0,1370 -chr8 582216 . T C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.687;DP=66;FS=3.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=3.51;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:260,0,2375 -chr8 582243 . C T 2320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=-1.282;DP=51;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=32.82;ReadPosRankSum=-1.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:2349,0,432 -chr8 582341 . A AC 256.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.313;DP=42;FS=5.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.087 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:294,0,1650 -chr8 582492 . TTA T 1369.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=1.750;DP=26;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=30.83;ReadPosRankSum=-1.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:1407,0,411 -chr8 582580 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=1.080;DP=42;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.334;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,12:30:99:279,0,1862 -chr8 582620 . G A 1074.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.427;DP=50;FS=11.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.317;QD=21.50;ReadPosRankSum=1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,27:37:99:1103,0,865 -chr8 583040 . A C 1155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-1.708;DP=48;FS=12.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:1184,0,2820 -chr8 583107 . C T 1731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.980;DP=115;FS=6.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.789;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,18:50:99:1760,0,1093 -chr8 583166 . C T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-0.584;DP=129;FS=3.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=8.94;ReadPosRankSum=2.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,30:58:99:1182,0,2844 -chr8 583560 . T C 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.142;DP=36;FS=3.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=12.47;ReadPosRankSum=3.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:477,0,764 -chr8 585950 . C A 647.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=-1.707;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=12.70;ReadPosRankSum=2.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:676,0,1000 -chr8 662715 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=-0.578;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:298,0,279 -chr8 718036 . G C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-1.504;DP=20;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.196;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:246,0,399 -chr8 732765 . G A 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.921;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=13.37;ReadPosRankSum=-0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:456,0,663 -chr8 734474 . AT A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=-0.521;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=15.32;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,602 -chr8 734477 . T A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.984;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=15.92;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:267,0,602 -chr8 773989 . T C 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:324,27,0 -chr8 774927 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.872;DP=15;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.220;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:322,0,260 -chr8 775005 . T G 560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:42:589,42,0 -chr8 908045 . C T 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=1.750;DP=106;FS=12.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.022;QD=17.31;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,49:105:99:1863,0,3761 -chr8 908047 . T C 1834.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=1.334;DP=96;FS=11.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=19.11;ReadPosRankSum=-1.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,43:96:99:1863,0,3743 -chr8 910382 . TCTGGAACACAGCATCAGCAGCACACATCAGTTTATTTATACACAAACACAATAAATACATGAAGATAAATGCTGGCGTTAGACTGAC T 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=1.733;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=29.27;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:330,0,1361 -chr8 918434 . C T 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.735;ClippingRankSum=4.781;DP=338;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=1.58;ReadPosRankSum=-5.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,35:337:99:563,0,27224 -chr8 978930 . A T 1229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=2.868;DP=65;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.305;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,37:65:99:1258,0,1661 -chr8 980996 . T C 953.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.672;DP=85;FS=4.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,29:85:99:982,0,1974 -chr8 993509 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 1138987 . A G 694.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.274;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=34.70;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:722,11,0 -chr8 1139433 . A G 556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.385;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.481;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:585,0,817 -chr8 1198853 . T C 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=-1.907;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.802;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:481,0,721 -chr8 1198888 . C T 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=-0.294;DP=38;FS=1.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.28;ReadPosRankSum=0.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,17:38:99:609,0,751 -chr8 1199350 . G A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=1.082;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=17.56;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,17:28:99:520,0,384 -chr8 1199412 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=-0.836;DP=21;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.216 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:301,0,337 -chr8 1275815 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr8 1288154 . A G 1263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=2.772;DP=79;FS=1.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.996;QD=16.00;ReadPosRankSum=-2.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,41:77:99:1292,0,1256 -chr8 1296324 . G T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=-0.614;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:610,0,410 -chr8 1298230 . A G 328.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=18.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:357,27,0 -chr8 1298850 . TA T 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.537;DP=19;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=11.25;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:254,0,173 -chr8 1322302 . T C 6803.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.937;DP=428;FS=4.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.002;QD=15.90;ReadPosRankSum=0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:235,193:428:99:6832,0,9797 -chr8 1323063 . C T 4424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-2.764;DP=318;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,129:318:99:4453,0,6553 -chr8 1323132 . G C 3807.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.085;DP=304;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=12.53;ReadPosRankSum=2.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,112:302:99:3836,0,6566 -chr8 1335743 . T A 1880.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.858;ClippingRankSum=0.749;DP=114;FS=0.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=16.50;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,66:114:99:1909,0,1657 -chr8 1335822 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=-0.821;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.806;QD=20.02;ReadPosRankSum=1.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,23:40:99:829,0,1226 -chr8 1335826 . G A 800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=-0.014;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.300;QD=20.53;ReadPosRankSum=2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:829,0,1226 -chr8 1482650 . C A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-0.817;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=21.37;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:306,0,248 -chr8 1626153 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=-0.131;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.298;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:350,0,593 -chr8 1627931 . A T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,363 -chr8 1629345 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.365;DP=10;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=20.48;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:233,0,235 -chr8 1964883 . T C 1074.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:78:1103,78,0 -chr8 1964887 . C T 1018.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:75:1047,75,0 -chr8 1964981 . T A 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-1.767;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.527;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:337,0,704 -chr8 1965000 . C G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.510;DP=46;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=9.06;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:445,0,338 -chr8 1965037 . C CA 795.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:60:833,60,0 -chr8 1965337 . T G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:99:295,0,377 -chr8 1965341 . A C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=-0.572;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:99:295,0,377 -chr8 1965460 . G C 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=1.571;DP=64;FS=4.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.36;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,19:40:99:691,0,823 -chr8 1965477 . C T 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.210;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:348,0,1379 -chr8 2034359 . GA G 529.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=1.496;DP=30;FS=4.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,21:26:46:567,0,46 -chr8 2034468 . A G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=-0.226;DP=30;FS=9.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:233,0,855 -chr8 2036400 . C T 270.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:299,21,0 -chr8 2038469 . C A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 -chr8 2504107 . A G 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.445;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.064;QD=26.12;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,17:24:99:655,0,176 -chr8 2583507 . G A 389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.553;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=22.93;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:418,0,210 -chr8 2587842 . C CA 309.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.746;DP=151;FS=5.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.960 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,31:114:99:370,0,1644 -chr8 2655997 . C T 766.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=20.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:795,57,0 -chr8 2656094 . TA T 512.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.21;MQ0=0;QD=13.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:550,54,0 -chr8 2662383 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.594;ClippingRankSum=-1.868;DP=410;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:391,11:402:99:447,0,8358 -chr8 2681390 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=2.648;DP=22;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.187;QD=16.53;ReadPosRankSum=-3.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:392,0,214 -chr8 2763708 . ACTGAAACACAAGAGAGATGGGGAGTTATTGAAATGCTAAGATTCTGACTTGCATAAATGAAATGAAAACTTCTACCACTTAC A 10802.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=-0.119;DP=289;FS=2.101;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=23.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,258:261:99:10840,901,0 -chr8 2915024 . T C 1354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1383,96,0 -chr8 2915070 . G A 4472.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.481;DP=145;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.706 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,107:108:99:4501,325,0 -chr8 2915114 . T A 6304.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=-2.151;DP=194;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=32.50;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,146:148:99:6333,442,0 -chr8 2915542 . G C 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:24:346,24,0 -chr8 2915549 . T G 317.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:24:346,24,0 -chr8 2915626 . A AG 1274.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=-1.949;DP=83;FS=1.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=15.36;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:44:99:1312,0,337 -chr8 2915860 . G T 719.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:748,18,0 -chr8 2915869 . G T 719.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:748,18,0 -chr8 2915903 . C T 715.94 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.752;DP=25;FS=2.881;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=28.64;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:14:744,14,0 -chr8 2968253 . A G 639.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.556;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=19.39;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:26:668,0,26 -chr8 2968374 . A G 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=-1.468;DP=26;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:417,0,118 -chr8 2968483 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-1.531;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=9.84;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:343,0,178 -chr8 2968578 . C G 320.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.727;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=29.09;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:12:348,0,12 -chr8 2969346 . CT C 216.27 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.696;DP=10;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=21.63;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:1:251,0,1 -chr8 3072360 . C T 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 -chr8 3268772 . A T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-1.890;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.124;QD=6.80;ReadPosRankSum=2.561 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:273,0,928 -chr8 3268918 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.880;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.299;QD=8.31;ReadPosRankSum=1.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:294,0,1746 -chr8 3513605 . A G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.323;DP=39;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=16.64;ReadPosRankSum=-1.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:677,0,703 -chr8 3631724 . A C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=-0.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=3.091;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:323,0,326 -chr8 3632402 . A T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.380;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.216;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:318,0,371 -chr8 3698938 . A T 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=-0.133;DP=18;FS=7.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=19.38;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:377,0,278 -chr8 3716004 . G A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-1.517;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.145;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,14:30:99:536,0,574 -chr8 3716142 . A G 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=-0.245;DP=27;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:432,0,448 -chr8 3717660 . C T 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=-0.853;DP=31;FS=8.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=16.06;ReadPosRankSum=1.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:526,0,624 -chr8 3720493 . G A 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:496,39,0 -chr8 3720559 . G A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr8 3720748 . G A 826.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:855,57,0 -chr8 3721876 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=-0.146;DP=19;FS=1.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:259,0,585 -chr8 3722080 . G GA 495.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.237;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=4.207;QD=15.02;ReadPosRankSum=-2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:533,0,1273 -chr8 3722081 . T C 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.273;DP=33;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=4.426;QD=15.30;ReadPosRankSum=-2.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:533,0,1281 -chr8 3766383 . G GC 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.571;DP=127;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,31:117:99:740,0,3318 -chr8 3786048 . G A 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=-0.113;DP=113;FS=4.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.096;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,56:112:99:1923,0,1856 -chr8 3808698 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-5.915;DP=108;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,25:108:99:503,0,3007 -chr8 3826047 . A T 521.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=2.236;DP=191;FS=3.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,36:188:99:550,0,11637 -chr8 3826979 . C T 2750.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.540;DP=160;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=17.19;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,77:160:99:2779,0,2670 -chr8 3844334 . G A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=-0.237;DP=33;FS=5.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.366;QD=13.11;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:461,0,655 -chr8 3869860 . CT C 411.25 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.510;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=22.85;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:13:448,13,0 -chr8 3876361 . C CAT 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=26.09;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:71:246,0,71 -chr8 4130671 . T G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=2.024;DP=15;FS=6.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.196;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:345,0,99 -chr8 4132929 . CA C 440.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=-1.883;DP=16;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.55;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:20:478,0,20 -chr8 4568903 . T A 515.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=-0.522;DP=33;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:544,0,600 -chr8 4600383 . G A 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=1.660;DP=28;FS=11.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.659;QD=18.92;ReadPosRankSum=-1.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:558,0,354 -chr8 4600524 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=-0.489;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:386,0,297 -chr8 4601075 . A G 344.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.085;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.113;QD=26.52;ReadPosRankSum=0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:85:373,0,85 -chr8 4644464 . A G 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.666;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=10.71;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:371,0,750 -chr8 4656118 . A G 573.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=-1.319;DP=217;FS=12.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:178,39:217:99:602,0,6721 -chr8 4672524 . G C 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.109;DP=207;FS=8.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:169,38:207:99:532,0,6113 -chr8 4693386 . G C 1841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=-0.621;DP=142;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.710;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,56:141:99:1870,0,3895 -chr8 4719379 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=-1.772;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.226;QD=6.46;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:332,0,1347 -chr8 4725335 . G A 833.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=1.005;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=14.63;ReadPosRankSum=-0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,25:57:99:862,0,1366 -chr8 4741505 . C G 576.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.046;DP=37;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:605,0,702 -chr8 4767056 . C A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=-1.063;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:387,0,771 -chr8 4907059 . G A 2058.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=-0.146;DP=175;FS=4.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=11.76;ReadPosRankSum=2.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,66:175:99:2087,0,3395 -chr8 4908413 . C CT 1262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=-2.313;DP=123;FS=4.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.645;QD=10.27;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,55:118:99:1300,0,1482 -chr8 4952795 . C G 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr8 4952876 . A T 315.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:344,24,0 -chr8 4958121 . C T 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.183;DP=192;FS=2.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=3.13;ReadPosRankSum=2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,37:189:99:630,0,5812 -chr8 5008588 . C T 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.197;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.049 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:646,0,243 -chr8 5023960 . G C 1426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-0.721;DP=53;FS=1.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.444;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,38:53:99:1455,0,400 -chr8 5024174 . A G 1008.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=1.385;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=32.54;ReadPosRankSum=-1.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:27:1037,0,27 -chr8 5062862 . C T 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=2.910;DP=60;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,14:60:99:298,0,4011 -chr8 5063689 . G A 701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=-0.764;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=15.26;ReadPosRankSum=2.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:730,0,855 -chr8 5063961 . G T 1144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=-0.172;DP=73;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,32:73:99:1173,0,1535 -chr8 5066546 . T A 827.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=2.756;DP=47;FS=2.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.415;QD=17.61;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,24:47:99:856,0,810 -chr8 5066574 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.670;ClippingRankSum=3.482;DP=51;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=15.82;ReadPosRankSum=-3.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:51:99:835,0,924 -chr8 5067181 . C T 689.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.041;DP=42;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.446;QD=16.42;ReadPosRankSum=0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:727,0,763 -chr8 5067945 . C G 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=-0.381;DP=55;FS=5.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=11.41;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:656,0,1277 -chr8 5069189 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=-0.936;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.199;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:273,0,1259 -chr8 5069435 . G A 784.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.821;DP=47;FS=1.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=16.70;ReadPosRankSum=0.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:813,0,784 -chr8 5072616 . G A 861.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.431;DP=39;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.677;QD=22.10;ReadPosRankSum=0.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:38:99:890,0,447 -chr8 5077247 . G C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=2.176;DP=39;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.613;QD=10.66;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:444,0,871 -chr8 5175638 . C G 381.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=2.546;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.774;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:410,0,586 -chr8 5175657 . A T 504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=1.087;DP=31;FS=1.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:533,0,556 -chr8 5188411 . T A 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-2.053;DP=32;FS=4.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=8.27;ReadPosRankSum=2.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:293,0,854 -chr8 5331691 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-1.445;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:417,0,391 -chr8 5358386 . G A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.277;ClippingRankSum=0.859;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:398,0,540 -chr8 5418712 . A G 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=2.965;DP=85;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.219;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,22:85:99:510,0,2362 -chr8 5419182 . C T 1968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=-2.944;DP=140;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=14.06;ReadPosRankSum=1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,56:139:99:1997,0,2858 -chr8 5419761 . A C 1517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=-1.578;DP=109;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.096;QD=13.92;ReadPosRankSum=2.375 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,44:109:99:1546,0,2346 -chr8 5429860 . C A 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=5.971;DP=121;FS=6.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=1.80;ReadPosRankSum=-4.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,21:121:99:246,0,3813 -chr8 5444919 . C T 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=-1.355;DP=68;FS=3.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:456,0,1897 -chr8 5448845 . T C 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.677;DP=43;FS=1.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:643,0,873 -chr8 5463275 . G A 642.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.049;DP=89;FS=1.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.343;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,27:89:99:671,0,2294 -chr8 5472069 . A G 946.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=-0.078;DP=70;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,28:70:99:975,0,1450 -chr8 6616052 . C T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-1.902;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:238,0,408 -chr8 6741374 . C T 239.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,6:6:21:268,0,21 -chr8 6741459 . A G 1992.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:2021,144,0 -chr8 6742105 . C T 1600.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-0.660;DP=57;FS=6.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=28.08;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,43:56:99:1629,0,308 -chr8 6743588 . C A 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=1.009;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=24.83;ReadPosRankSum=-1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:500,0,197 -chr8 6743603 . T G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 -chr8 7436058 . T G 2390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=-0.695;DP=92;FS=4.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,65:92:99:2419,0,690 -chr8 7445746 . G A 2759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-2.454;DP=97;FS=0.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.109;QD=28.45;ReadPosRankSum=0.544 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,71:95:99:2788,0,555 -chr8 7464193 . T A 3380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:3409,240,0 -chr8 7471504 . G A 982.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=-1.497;DP=52;FS=2.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.882;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,36:52:99:1011,0,581 -chr8 7487793 . G A 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.124;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=24.69;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:522,0,158 -chr8 7558173 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=1.274;DP=134;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,30:127:99:622,0,4299 -chr8 7558387 . T A 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=1.145;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.632;QD=21.12;ReadPosRankSum=0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,66:101:99:2267,0,1241 -chr8 7592088 . G A 721.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-2.126;DP=64;FS=15.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=11.28;ReadPosRankSum=1.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:750,0,710 -chr8 7592345 . A T 1577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.190;DP=83;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=19.01;ReadPosRankSum=-1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,29:59:99:1606,0,1019 -chr8 7592898 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.512;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.399 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:440,0,407 -chr8 7592917 . C T 484.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-1.528;DP=44;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.655;QD=11.02;ReadPosRankSum=-0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:513,0,500 -chr8 7593009 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.720;DP=31;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=12.80;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:425,0,552 -chr8 7593022 . T A 789.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:63:818,63,0 -chr8 7593092 . A AGT 245.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.33;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:283,0,13 -chr8 7593620 . G A 257.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.24;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:286,0,15 -chr8 7594505 . C T 613.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.090;DP=33;FS=1.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=18.60;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,18:33:99:642,0,600 -chr8 7594517 . G T 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.727;DP=30;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:546,0,558 -chr8 7617974 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=-2.377;DP=94;FS=9.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.356;QD=2.50;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:263,0,2970 -chr8 7659825 . TCCTACAGGTGAAGACAAATCCATCTCAGATCATCTCAAACATCTGTGTGTTTCTGTTGCGCGTCTGGATTTGCATTTTA T 7323.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.946;DP=168;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,165:168:99:7361,571,0 -chr8 7688232 . A C 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.261;DP=21;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:316,0,1043 -chr8 7852935 . A T 343.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=-1.444;DP=22;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.796;QD=15.63;ReadPosRankSum=-0.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:372,0,391 -chr8 7853012 . T TA 415.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:43:453,43,0 -chr8 7872531 . TGTAAGTAGGTTTAGGCTGACACAGACTGAACTATCTGCATGCTGGACATTTCATTATCCTCAATGTTATTTCCCCCAGAGGAAAATACGACACTTGTAAAGTATCTTTTTGTGAGATGCCAAGAGAAGACTGTTTTGTGTTTGTCCTCTGTTGTTGTCCATGTGCAG T 14844.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.331;DP=424;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=26.35;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,381:397:99:14882,0,7521 -chr8 7885198 . CT C 2390.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.776;DP=52;FS=2.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.251;QD=26.05;ReadPosRankSum=-2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,46:51:0:2425,0,0 -chr8 7885648 . CT C 239.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:277,30,0 -chr8 7944096 . G C 2185.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.492;DP=59;FS=2.269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.107;QD=33.94;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,55:58:99:2214,125,0 -chr8 7960475 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=-1.356;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.705;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:460,0,461 -chr8 7960482 . A T 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-2.098;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:460,0,461 -chr8 8044207 . TA T 424.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-2.028;DP=41;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=10.36;ReadPosRankSum=1.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:462,0,218 -chr8 8044281 . AG A,AGG 376.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-1.552;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.552;QD=19.80;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:1,5,13:19:99:465,361,474,127,0,154 -chr8 8044340 . GTT G,GT 432.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,8,12:20:99:712,398,589,203,0,146 -chr8 8072910 . G A 829.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=-0.980;DP=23;FS=8.846;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:858,66,0 -chr8 8073992 . G A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.442;DP=31;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=29.06;ReadPosRankSum=-1.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,27:31:99:929,0,1252 -chr8 8150278 . G A 398.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:427,30,0 -chr8 8153431 . T C 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr8 8154155 . T C 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=-1.435;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.250;QD=24.15;ReadPosRankSum=1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:487,0,156 -chr8 8158933 . T C 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 -chr8 8255535 . C T 948.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.036;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=32.72;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:90:977,0,90 -chr8 8255999 . A C 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr8 8256041 . T A 408.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:437,30,0 -chr8 8310830 . T A 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=-0.241;DP=35;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.204;QD=31.34;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,29:35:99:1125,0,103 -chr8 8312726 . G C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.093;DP=29;FS=3.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=13.34;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:415,0,418 -chr8 8312932 . G C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=-0.234;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=22.15;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:449,0,278 -chr8 8312953 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.386;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=22.20;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:339,0,189 -chr8 8313769 . C T 784.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=1.884;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=29.16;ReadPosRankSum=-1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:22:21:813,21,0 -chr8 8314214 . T C 709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.810;DP=15;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=31.21;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:67:738,0,67 -chr8 8314752 . T A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=-0.370;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=27.06;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:80:353,0,80 -chr8 8315079 . G C 418.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:447,30,0 -chr8 8315708 . T C 1218.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=1.082;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=33.86;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:20:1247,0,20 -chr8 8316203 . T A 475.53 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-1.240;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=33.97;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:3:502,3,0 -chr8 8334796 . G A 636.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.352;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.256;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:25:665,0,25 -chr8 8334807 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=26.44;ReadPosRankSum=1.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:51:610,0,51 -chr8 8356158 . T TA 552.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.700;DP=32;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.596;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.364 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:590,0,202 -chr8 8371715 . G A 1276.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.108;DP=32;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.975;QD=30.85;ReadPosRankSum=0.975 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:93:1305,93,0 -chr8 8386313 . G A 978.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=-0.311;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:70:1007,0,70 -chr8 8581499 . A C 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.28;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:57:301,0,57 -chr8 8741498 . A C 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-1.769;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,23:37:99:811,0,478 -chr8 8829334 . C CA 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.448;DP=43;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,16:39:99:360,0,576 -chr8 8829458 . G T 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.694;DP=19;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=28.36;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:567,0,285 -chr8 8830087 . T A 463.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=-1.415;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=27.28;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:492,0,124 -chr8 8830850 . A T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=1.799;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.588;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.799 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:243,0,706 -chr8 8831389 . T A 614.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.460;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.220;QD=19.83;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,18:31:99:643,0,440 -chr8 8831698 . C T 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.689;DP=48;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=32.97;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,38:47:99:1611,0,409 -chr8 8831699 . C T 1582.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.030;DP=49;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=32.30;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,39:48:99:1611,0,409 -chr8 8832824 . A T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=-0.787;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,19:28:99:663,0,379 -chr8 8833102 . TC T 203.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=-0.495;DP=19;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.202;QD=10.72;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:241,0,240 -chr8 8881348 . C T 976.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.217;DP=32;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.748;QD=30.52;ReadPosRankSum=0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:1005,0,111 -chr8 8883877 . T TTA 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.306;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:379,0,152 -chr8 8898433 . G GA 221.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:259,27,0 -chr8 8971250 . T G 1819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=0.252;DP=67;FS=1.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=27.16;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1848,0,389 -chr8 9044476 . A G 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr8 9044485 . C A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:18:257,18,0 -chr8 9238528 . CCCTGTAAGAGGAACAGAGTTTATTCTGGGTTTTCAGCATCTGGAAACAAATCAAAAACTTCACATGTCAGTATCGTA C 2296.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=1.668;DP=54;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:2334,183,0 -chr8 9238642 . C T 1153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=1.350;DP=60;FS=0.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=19.23;ReadPosRankSum=-1.848 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,36:60:99:1182,0,837 -chr8 9291879 . T G 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.070;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.524;QD=26.19;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,22:30:99:814,0,210 -chr8 9292496 . T G 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=1.867;DP=30;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.166;QD=17.26;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:546,0,528 -chr8 9294244 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.053;DP=18;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:99:528,0,122 -chr8 9390986 . C T 367.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=33.37;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:12:395,0,12 -chr8 9472769 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=3.954;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:400,0,650 -chr8 9472824 . C T 942.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=-2.494;DP=58;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=16.25;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,27:58:99:971,0,1020 -chr8 9478380 . G T 2364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=-0.352;DP=86;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=27.50;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,61:86:99:2393,0,681 -chr8 9478486 . A C 2688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.688;DP=104;FS=4.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.472;QD=25.85;ReadPosRankSum=0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,71:103:99:2717,0,863 -chr8 9480732 . A G 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=33.99;ReadPosRankSum=0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:68:572,0,68 -chr8 9482121 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=25.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:63:230,0,63 -chr8 9484815 . G A 276.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:305,21,0 -chr8 9504061 . T A 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=2.197;DP=31;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=30.83;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,24:31:99:984,0,468 -chr8 9504065 . A T 955.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=1.112;DP=33;FS=3.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=28.96;ReadPosRankSum=1.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,24:33:99:984,0,473 -chr8 9508090 . AT A 755.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.828;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=22.23;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,28:33:25:793,0,25 -chr8 9510409 . A G 664.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=-0.578;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=31.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:692,9,0 -chr8 9511815 . G T 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.050;DP=17;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.558;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:412,0,195 -chr8 9573872 . T A 6322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=-2.276;DP=254;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.577;QD=24.89;ReadPosRankSum=2.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,170:254:99:6351,0,7544 -chr8 9573873 . G C 6322.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=-2.815;DP=252;FS=3.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=25.09;ReadPosRankSum=2.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,168:252:99:6351,0,7544 -chr8 9574754 . C T 1371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-1.677;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,37:47:99:1400,0,208 -chr8 9576160 . G A 584.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-1.691;DP=159;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:124,33:157:99:613,0,4598 -chr8 9589857 . T G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.784;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=13.51;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:285,0,414 -chr8 9591785 . A AAC 327.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.589;DP=11;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=29.79;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:365,0,56 -chr8 9592104 . G T 1415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=-1.434;DP=52;FS=4.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.856;QD=27.23;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,38:52:99:1444,0,354 -chr8 9592317 . A T 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=-1.660;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=33.25;ReadPosRankSum=1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:527,0,206 -chr8 9592951 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,207 -chr8 9592952 . C A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:285,0,207 -chr8 9595369 . T A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.111;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=29.79;ReadPosRankSum=1.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:83:922,0,83 -chr8 9595891 . A T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=-0.934;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.368;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,16:25:99:631,0,620 -chr8 9595892 . G A 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=-0.647;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,17:26:99:631,0,620 -chr8 9604043 . C A 1259.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-1.593;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.213;QD=33.14;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,34:38:10:1287,0,10 -chr8 9619207 . G C 200.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:229,0,23 -chr8 9623410 . G A 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=1.805;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=31.74;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:43:917,0,43 -chr8 9631685 . C A 772.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=-1.213;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=30.88;ReadPosRankSum=1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:12:800,0,12 -chr8 9765057 . TA T 411.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=25.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:449,42,0 -chr8 9767502 . CA C 736.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.043;DP=38;FS=3.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=1.248;QD=19.37;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:6:745,0,6 -chr8 10912349 . TCTGTAAAAGAACAGGATGTTTGATTAGCTCTGCTGTAAAGCCATAAAACTGCTTAAAGGTGGCGCCGTGTGATTGAGTGTGTCTCAC T 7815.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=3.119;DP=268;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=29.16;ReadPosRankSum=2.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,230:246:99:7853,0,1303 -chr8 10914692 . A T 786.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.965;ClippingRankSum=0.291;DP=104;FS=6.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,31:104:99:815,0,2891 -chr8 11368321 . TA T 474.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.55;MQ0=0;QD=23.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:52:512,52,0 -chr8 11378925 . ACTATAAAATATTGAAACATCAGATCATTTACAATTATATATTTTAGACTCAATTTTGTAACTTAAAAAAGAAACAAAGTGATCTGTGCTCATTAC A 2064.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=1.344;DP=48;FS=7.116;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:99:2102,169,0 -chr8 11478955 . A T 529.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=-1.193;DP=244;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.587;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,45:244:99:558,0,7541 -chr8 11479070 . G A 711.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=-1.400;DP=128;FS=3.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,34:128:99:740,0,3659 -chr8 11479216 . A G 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=1.719;DP=138;FS=5.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.183;QD=2.44;ReadPosRankSum=2.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,25:138:99:365,0,8842 -chr8 11479225 . T C 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=1.906;DP=122;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,19:121:99:383,0,8842 -chr8 11497291 . C T 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=4.640;DP=165;FS=14.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=1.63;ReadPosRankSum=-1.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,27:165:99:297,0,5349 -chr8 11501937 . GT G 807.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.080;DP=80;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.352;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,38:75:99:845,0,737 -chr8 11502086 . GT G 2186.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.235;ClippingRankSum=0.506;DP=83;FS=4.392;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=26.35;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,72:77:99:2224,172,0 -chr8 11502296 . T C 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.014;DP=124;FS=0.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,32:124:99:709,0,3468 -chr8 11515615 . AAGGTAAGAAGTGCAAAATTCATTGGAAAACTTTACAGATTCAAAAAAAGCTTGCTTTACAAACCTCAACTTCACCTTTCGTTTTGCC A 1123.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=1.235;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=26.76;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,27:34:99:1161,0,2343 -chr8 11520723 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=1.165;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=5.38;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:265,0,1382 -chr8 11521762 . A G 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=-0.171;DP=27;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=13.95;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:405,0,525 -chr8 11522937 . A T 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=-1.086;DP=41;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=9.02;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,14:41:99:398,0,1060 -chr8 11539456 . AAAGGTTTGGTGCTGGCGTGTAACAATGACTATATACTGCATTTTTATTACTTATTTTTGCTGATTCAAATTTCCACTTGGCTG A 375.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=2.041;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=31.31;ReadPosRankSum=-0.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:413,0,1256 -chr8 11590698 . AT A 213.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.72;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:99:251,0,354 -chr8 11591226 . AT A 2199.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.61;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:2237,199,0 -chr8 11606240 . G A 977.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.387;DP=243;FS=10.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,55:243:99:1006,0,11966 -chr8 11626045 . C T 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=-2.532;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.583;QD=13.01;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:835,0,1213 -chr8 11663256 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-0.867;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:249,0,370 -chr8 11697473 . AGTCAGTACTGCATTATGTTCAACTCGTTCCAGAAAATGTCGTAGTCAGTTCGTTGACTCACATATTTCTGCTCGTGTTTTCACAG A 13839.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=2.434;DP=312;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=31.37;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,309:311:99:13877,1104,0 -chr8 11768841 . TA T 455.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.024;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.412;QD=16.88;ReadPosRankSum=1.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:493,0,890 -chr8 11810639 . T C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=1.589;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=32.47;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:54:288,0,54 -chr8 11810781 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.181;DP=18;FS=2.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.536;QD=11.43;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:234,0,512 -chr8 11811530 . T C 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.217;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:335,0,473 -chr8 12000406 . G A 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=2.240;DP=89;FS=8.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,22:89:99:467,0,2530 -chr8 12000881 . G T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.159;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:255,0,3070 -chr8 12085294 . A T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.144;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=17.75;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:330,0,293 -chr8 12086587 . T A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=29.80;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:99:356,0,150 -chr8 12086602 . G T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=-0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=28.85;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:356,0,150 -chr8 12200749 . A G 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.267;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:344,0,172 -chr8 12204899 . G T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=-1.642;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:414,0,648 -chr8 12234725 . T C 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.676;DP=52;FS=7.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:289,0,1422 -chr8 12262914 . AT A 322.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.348;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:365,0,334 -chr8 12264291 . G A 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.446;DP=36;FS=8.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=8.02;ReadPosRankSum=0.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:317,0,1416 -chr8 12897388 . C A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-2.381;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,406 -chr8 13447256 . AAGGTTTGTACGAGTTCAGAGTGAAGTTGTGAACTTGCACGCTTTCTTTTTAACCTTTTTTGTATTCTTTTGTTTGTGTGC A 4006.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=3.107;DP=153;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.799;QD=26.19;ReadPosRankSum=-0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,120:143:99:4044,0,7173 -chr8 13452645 . TGTAAGAAGCACTTCTTTTATATTCTTTACTAGTTTCTGTATTAAAAATGGCCTTAACATTTTTAGTTTTATTACTAACAGTATTGTTTTTTTTATATATGTAACATAAAAAATTATTTTTGTCTTAG T 5301.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.782;DP=149;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=31.26;ReadPosRankSum=-0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,137:142:99:5339,0,584 -chr8 13464788 . CT C 277.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=1.549;DP=36;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:326,0,434 -chr8 13610994 . A G 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.734;DP=140;FS=4.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.048;QD=3.05;ReadPosRankSum=2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,27:140:99:455,0,4511 -chr8 13614486 . C T 1800.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=0.898;DP=137;FS=0.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=13.14;ReadPosRankSum=0.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,55:137:99:1829,0,4180 -chr8 13631455 . G A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=1.139;DP=50;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.007;QD=11.44;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:600,0,2656 -chr8 13631457 . G A 481.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.810;DP=53;FS=2.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=9.09;ReadPosRankSum=1.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,17:53:99:510,0,2800 -chr8 13644223 . A T 608.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=-0.528;DP=79;FS=3.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:637,0,2080 -chr8 13652382 . C T 969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=2.002;DP=89;FS=9.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,31:89:99:998,0,3589 -chr8 13654143 . G A 869.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.563;DP=71;FS=3.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:898,0,1528 -chr8 13663156 . T A 883.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=-1.243;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,26:58:99:912,0,1014 -chr8 13668408 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=3.627;DP=65;FS=1.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,12:65:99:275,0,4186 -chr8 13668414 . G C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=3.009;DP=65;FS=1.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.877;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.943 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,13:65:99:288,0,4186 -chr8 13674421 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.137;DP=60;FS=1.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.508;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:417,0,1887 -chr8 13676147 . TA T 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=-0.281;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=9.75;ReadPosRankSum=3.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,20:37:99:437,0,359 -chr8 13676224 . GT G 1056.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.192;DP=61;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=1.814;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,37:57:99:1094,0,438 -chr8 13703376 . T C 204.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:233,21,0 -chr8 13868681 . ATT A 391.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.593;DP=36;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,1372 -chr8 13868979 . TA T 2085.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=-2.582;DP=197;FS=4.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=0.451;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,86:176:99:2123,0,2196 -chr8 13869276 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=-1.406;DP=132;FS=17.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.305 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,21:132:99:270,0,4976 -chr8 13869463 . T C 1036.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.620;DP=222;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=4.67;ReadPosRankSum=0.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,53:221:99:1065,0,6723 -chr8 13872930 . C T 1091.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=-1.197;DP=256;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.954;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,57:256:99:1120,0,7743 -chr8 13881819 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=1.024;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=9.49;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:275,0,654 -chr8 14052067 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.834;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.049;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:251,0,2402 -chr8 14232293 . A G 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=-1.256;DP=15;FS=5.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:310,0,167 -chr8 14232332 . G A 330.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=-0.146;DP=26;FS=6.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=12.72;ReadPosRankSum=1.376 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:359,0,491 -chr8 14232392 . A G 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.211;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=14.81;ReadPosRankSum=1.728 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,20:39:99:665,0,675 -chr8 14232423 . A G 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-1.471;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.534;QD=15.59;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:652,0,662 -chr8 14232488 . A G 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=-0.027;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=13.32;ReadPosRankSum=1.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:388,0,483 -chr8 14405829 . C A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.184;DP=21;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:391,0,165 -chr8 14484251 . G C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=-0.093;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=17.56;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:432,0,329 -chr8 14602098 . C T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=-1.030;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.872 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:253,0,478 -chr8 14688016 . C CTA 475.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=-0.487;DP=221;FS=10.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.368;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,42:210:99:513,0,7969 -chr8 14688633 . AT A 2937.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=1.123;DP=311;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.330;QD=9.45;ReadPosRankSum=-1.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,125:289:99:2975,0,3745 -chr8 14697305 . T A 2436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-0.197;DP=366;FS=3.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=6.66;ReadPosRankSum=-0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:265,100:365:99:2465,0,10452 -chr8 14759022 . CT C 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.439;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=6.42;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:249,0,642 -chr8 14898292 . CA C 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.199;DP=48;FS=2.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,20:48:99:499,0,715 -chr8 14956754 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.450;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.255;QD=8.42;ReadPosRankSum=1.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:306,0,892 -chr8 14958475 . A G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=-0.766;DP=68;FS=1.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:253,0,2146 -chr8 15020567 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.162;DP=51;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.178;QD=6.72;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:371,0,1523 -chr8 15103264 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.695;DP=47;FS=9.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.159;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,12:47:99:287,0,1348 -chr8 15426649 . TTGAGGAGGTAAACAAAAACTAGTGGAGCCTGATGTGTTTAA T 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:298,0,1490 -chr8 15426695 . GATCATTGTTGGTTTATTCATGTGTTTGAGTGTATTTTTGTTTCCTC G 260.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:298,0,1490 -chr8 15597835 . AC A 335.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.168;DP=89;FS=6.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.206;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:373,0,1655 -chr8 16523887 . CT C 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=-1.922;DP=58;FS=4.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.048;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:416,0,899 -chr8 16573633 . C T 1013.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=2.894;DP=146;FS=1.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.527;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,44:146:99:1042,0,3738 -chr8 16631803 . C CA 444.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=-1.583;DP=90;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=4.94;ReadPosRankSum=1.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,32:81:99:482,0,1138 -chr8 16633621 . C CA 220.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=-1.729;DP=133;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.892;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,28:126:99:258,0,2620 -chr8 16634408 . GA G 1061.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=-1.260;DP=140;FS=3.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,54:122:99:1099,0,1671 -chr8 16901609 . C T 646.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-1.960;DP=94;FS=1.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.599;QD=6.88;ReadPosRankSum=2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,25:94:99:675,0,2508 -chr8 16944877 . T TTG 230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.605;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:268,0,1024 -chr8 16952851 . C T 799.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.173;DP=20;FS=3.979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.387;QD=27.10;ReadPosRankSum=-0.694 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:57:828,57,0 -chr8 16952871 . G T 902.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.630;DP=22;FS=3.424;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.261;QD=28.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:931,63,0 -chr8 16953514 . C G 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr8 17001518 . G A 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.813;DP=53;FS=7.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:855,0,923 -chr8 17085384 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.391;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:354,0,325 -chr8 17103251 . C T 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-3.027;DP=289;FS=18.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:231,58:289:99:948,0,8590 -chr8 17107576 . GGACCTGAAAGAGATAAGATGGCATTATGGGTGCCCAAATAAATTGATGCATGTTTCAGATGTAAGATGTCTATAGACGGATTAAGTACT G 11957.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=-0.130;DP=323;FS=3.704;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=31.04;ReadPosRankSum=1.211 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,295:301:99:11995,882,0 -chr8 17117289 . G A 360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.445;DP=46;FS=1.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,15:46:99:389,0,1657 -chr8 17129359 . A G 1739.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=6.682;DP=110;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=15.82;ReadPosRankSum=-4.631 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,49:110:99:1768,0,2009 -chr8 17130651 . T A 9968.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=2.627;DP=445;FS=10.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=22.40;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,288:444:99:9997,0,5493 -chr8 17199981 . AGTAAGCCTGACTCTCATACATTTAGATTTACACTATATATGTTTTTAAATCAGAAAACCGGTCTTTCATCAG A 1921.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=1.277;DP=52;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.658;QD=34.12;ReadPosRankSum=-0.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1959,0,4642 -chr8 17205157 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.537;DP=65;FS=8.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,15:65:99:321,0,1884 -chr8 17206912 . C G 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.312;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,31:57:99:1084,0,980 -chr8 17207207 . T A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.799;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=19.24;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:336,0,605 -chr8 17207369 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=-0.789;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=8.24;ReadPosRankSum=0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:325,0,1252 -chr8 17211368 . T A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=4.531;DP=50;FS=8.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:622,0,1146 -chr8 17213116 . A T 1335.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=-1.012;DP=155;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=8.62;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,50:155:99:1364,0,4084 -chr8 17213166 . CACCTACAGAAGAAACAGAAACAATAAATGATTTCAGTTTGATTCATGCCCTCAAATATCAGCAAAAGCTT C 4989.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=-0.055;DP=185;FS=5.554;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.086;QD=26.97;ReadPosRankSum=1.789 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,162:171:99:5027,480,0 -chr8 17221616 . A G 1612.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=1.979;DP=45;FS=2.387;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.297;QD=31.36;ReadPosRankSum=0.660 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:43:1641,43,0 -chr8 17221832 . A G 837.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-1.525;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=32.21;ReadPosRankSum=1.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:26:7:865,0,7 -chr8 17223216 . C A 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-2.239;DP=11;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=25.07;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:304,0,54 -chr8 17223457 . T A 1125.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=-0.707;DP=30;FS=5.971;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=29.59;ReadPosRankSum=-0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:46:1154,46,0 -chr8 17223758 . T A 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.849;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=28.79;ReadPosRankSum=-1.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:748,0,99 -chr8 17232834 . G GA 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.490;DP=73;FS=8.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,23:57:99:401,0,754 -chr8 17234450 . A G 512.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=1.975;DP=92;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:541,0,2626 -chr8 17238760 . A T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:254,0,289 -chr8 17241325 . A G 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.394;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.459;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:419,0,2745 -chr8 17274841 . T A 829.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.020;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.621;QD=12.38;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,24:67:99:858,0,1489 -chr8 17564677 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-1.610;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=13.67;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:288,0,413 -chr8 17575117 . C A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.117;DP=35;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:413,0,818 -chr8 17599302 . C T 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.013;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.395;QD=13.64;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:601,0,826 -chr8 17671397 . A G 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.455;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.429;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:340,0,1384 -chr8 17671457 . C A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=-0.612;DP=38;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:312,0,991 -chr8 17683256 . T G 1461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=-0.984;DP=308;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.476;QD=4.75;ReadPosRankSum=2.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,71:308:99:1490,0,12505 -chr8 17687669 . T A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.431;DP=99;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,18:99:99:307,0,3150 -chr8 17687706 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.192;DP=97;FS=1.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.038;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:275,0,3084 -chr8 17693661 . C T 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-1.910;DP=18;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=19.76;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:384,0,274 -chr8 17694709 . GCTGAAATAATAATCCATTTAAAGGTTAATTCAATTGTCAGGAATAGCAATACAGACAACCAACATAACATTTCTCTGGGGAGGTTATATTTTAAGATGCATATTTGACAAAC G 11709.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=3.580;DP=281;FS=2.969;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.497;QD=29.39;ReadPosRankSum=0.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,260:281:99:11747,982,0 -chr8 17694878 . ACTGCAAAAAACAGAAAAGCCACCTGAATGCTTGTGTTCACTCATTTTTTTTAAAGTCATTTTTTTTTTCAAATTAGAAAATAACCAGAAACCACAATAAAAAAAAAAAAAACCAAGTCATTCCTAAATAAACTACAGCGCATACTGTATGTACATTTGCTGTGAGTAGCATTAC A 732.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.058;ClippingRankSum=6.317;DP=243;FS=1.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=3.02;ReadPosRankSum=-4.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,211:235:99:770,0,4767 -chr8 17695159 . GCTAAGGGTGGAAAGACAATATTAGACAACATGAGCAATTGGAACATCCTCTAGTTTAAGATAATGACATGTTGAATAAAAGCATTTCTTTCTAATTACGCTTGGCCTGAATCACACAAATAGATCAAATATTAATCACCACCATTCAAGGAAAGAGGACGGCCAGTTACATTGAGATGAACAAGGTTTAGCTAATCATCTCAC G 8673.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.192;ClippingRankSum=6.757;DP=265;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=32.73;ReadPosRankSum=-1.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,227:265:99:8711,0,16702 -chr8 17695466 . GTACTA G 1151.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=-0.344;DP=257;FS=6.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,59:247:99:1189,0,13161 -chr8 17695473 . GATAATTTAAAAAGAAAAAGAGTGTACATTGAAAAAGAGTTGTAATCGCTAGTAGTGCTTTATAGTTGATGTAGAGAAAAAGATCTACACAC G 1169.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-0.184;DP=255;FS=6.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.744;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:195,59:254:99:1207,0,13161 -chr8 17697409 . CCCTGGTGGACAAACACATTTCTAAATAAATATCATCATTTAACAAAGTGTAAACTAAACCAAACAGACTGAGGTACCTTA C 578.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=1.077;DP=164;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.435 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,141:144:99:616,233,0 -chr8 17698194 . A G 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.046;DP=204;FS=3.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.316;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,30:202:99:244,0,6873 -chr8 17711342 . G T 619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.163;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.745;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,25:79:99:648,0,2042 -chr8 17712030 . A AT 267.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.342;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:305,0,199 -chr8 17916123 . CT C 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=-1.451;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.30;MQ0=0;MQRankSum=1.110;QD=16.05;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:631,0,295 -chr8 17917207 . C A 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=1.354;DP=55;FS=2.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.780;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:514,0,1457 -chr8 17917629 . A T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=-1.099;DP=36;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.687;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:326,0,945 -chr8 17918986 . T A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=-1.238;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=4.00;ReadPosRankSum=0.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:244,0,1655 -chr8 17921708 . C T 785.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.299;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:814,0,1011 -chr8 17924005 . C A 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.303;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:314,0,1537 -chr8 17926658 . T C 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-1.320;DP=56;FS=7.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.795;QD=11.46;ReadPosRankSum=1.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:670,0,1193 -chr8 18035704 . C T 566.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=-0.743;DP=52;FS=1.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=10.90;ReadPosRankSum=-0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,20:51:99:595,0,1007 -chr8 18294814 . C CT 544.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.664;DP=68;FS=3.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=8.01;ReadPosRankSum=-1.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,29:61:99:611,0,699 -chr8 18300538 . T A 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=-0.363;DP=45;FS=1.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=6.11;ReadPosRankSum=1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:303,0,1723 -chr8 18302003 . TGTAAGTAACTACATAATATTTGAAAAAATGTATTAATTTGTCTCTTCTTTTACTGGCAATTGTTATGTTTACATTACAG T 2209.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=1.764;DP=58;FS=4.825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=31.48;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,54:58:99:2247,147,0 -chr8 18303826 . T G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=-0.601;DP=59;FS=2.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:501,0,1579 -chr8 18307101 . C T 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=-0.114;DP=55;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:689,0,1258 -chr8 18307185 . A C 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.062;ClippingRankSum=-0.185;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.514;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.870 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,20:67:99:517,0,2486 -chr8 18307442 . G A 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=-1.231;DP=63;FS=3.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=5.90;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,17:63:99:400,0,2012 -chr8 18307719 . GCTGAATGAATGTACATTTAACATTAGTAAGATTAGCAACAGGTTTGAAACTAGTTTTATTGAATGCTGTAACCGTTTATACTCAC G 1725.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=3.537;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=25.74;ReadPosRankSum=-2.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,42:47:99:1763,0,1790 -chr8 18307975 . T C 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=-0.091;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.439;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:457,0,672 -chr8 18309723 . C T 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=1.015;DP=38;FS=1.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=10.49;ReadPosRankSum=-1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:427,0,930 -chr8 18309756 . AC A 376.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-2.094;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.734;QD=15.07;ReadPosRankSum=-2.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:414,0,412 -chr8 18340173 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.026;DP=27;FS=1.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.209;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:232,0,693 -chr8 18425564 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.078;DP=39;FS=5.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.234;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:293,0,990 -chr8 18438538 . T C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=-1.448;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.993;QD=18.25;ReadPosRankSum=1.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:302,0,247 -chr8 18526330 . A G 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 -chr8 18550257 . C T 2848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.462;DP=184;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=15.48;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,81:183:99:2877,0,3302 -chr8 18713105 . G C 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-1.369;DP=13;FS=5.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.83;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:260,0,194 -chr8 18720398 . C T 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=1.266;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,10:34:99:281,0,1205 -chr8 18721752 . ACTGTGGAAAGAAACGATACTTTGTTGGTAAAAGGTCATGATGAGGACACGCATCTTCAATATTCTCAGACTGAATGACTTGATTATTGAAAGCAAGACCTTGATGGTAGGATAACCAACCTGAACTAATGGAGTAATGTATAAAATGCATTATTTAC A 2097.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.495;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=32.28;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,49:56:99:2135,0,854 -chr8 18723740 . C T 553.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.018;DP=33;FS=1.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=16.78;ReadPosRankSum=-1.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:582,0,617 -chr8 18726653 . TCTACAGTATATAATAAGAACATTGTTATAAAATAGGCAAGGTTCCTCATGAAGTGTGTGGTGAGAGTTGCTGGATAGTAC T 2387.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=-0.425;DP=55;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:53:99:2425,220,0 -chr8 18726865 . C T 1169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.036;DP=63;FS=0.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.264;QD=18.57;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,36:62:99:1198,0,923 -chr8 18733592 . C T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:251,0,147 -chr8 18878241 . A G 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.721;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=4.28;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:482,0,3141 -chr8 19025782 . TCTGTAAAACATATTTGAGCCATTAATAACACCACATGTCTGCATTTCTAAATTACACACACACTCTGATAAACATTACTGATATGCAACTCCGATAAAATAAAACGTAC T 703.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=1.567;DP=21;FS=2.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.567;QD=33.51;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:99:741,0,1333 -chr8 19037436 . GT G 1889.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=-1.829;DP=131;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,76:120:99:1927,0,835 -chr8 19042658 . G A 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=-0.817;DP=147;FS=0.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,25:147:99:313,0,4799 -chr8 19051441 . G A 1021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=-1.041;DP=140;FS=3.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,43:139:99:1050,0,3532 -chr8 19074225 . T C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.538;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.338;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:295,0,1912 -chr8 19086742 . G A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.298;DP=44;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=13.22;ReadPosRankSum=-1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:44:99:610,0,814 -chr8 19087571 . G GA 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=-1.035;DP=31;FS=3.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:304,0,588 -chr8 19088212 . C G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=-0.529;DP=17;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.914;QD=18.81;ReadPosRankSum=3.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:348,0,412 -chr8 19088357 . T C 254.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:283,0,21 -chr8 19088776 . A G 705.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.822;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=30.04;ReadPosRankSum=1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:19:734,19,0 -chr8 19088777 . T C 816.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:845,57,0 -chr8 19089005 . A T 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.297;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.165;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:413,0,482 -chr8 19109179 . C T 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=-1.488;DP=50;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:276,0,1404 -chr8 19115217 . G C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.736;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:237,0,1013 -chr8 19121180 . T C 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;ClippingRankSum=0.924;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=12.99;ReadPosRankSum=-0.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:509,0,2437 -chr8 19121187 . C T 480.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.670;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.577;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:509,0,2437 -chr8 19121288 . T C 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.151;DP=105;FS=3.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,23:105:99:486,0,3238 -chr8 19187493 . G T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=-0.197;DP=28;FS=3.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:266,0,665 -chr8 19362350 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-0.585;DP=46;FS=5.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=6.04;ReadPosRankSum=2.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:306,0,1171 -chr8 19362439 . C A 491.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-2.021;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.520;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,21:67:99:520,0,1747 -chr8 19366480 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=-0.464;DP=110;FS=4.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.076;QD=7.21;ReadPosRankSum=-0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,32:110:99:821,0,3005 -chr8 19366673 . G A 690.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=-0.305;DP=127;FS=2.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,33:127:99:719,0,4129 -chr8 19367222 . CT C 1438.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-1.832;DP=90;FS=5.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,61:84:99:1476,0,315 -chr8 19367744 . G A 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.823;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,31:122:99:659,0,3406 -chr8 19378191 . G A 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.136;DP=151;FS=7.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,24:150:99:296,0,4911 -chr8 19413693 . G A 498.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.289;DP=42;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:99:527,0,2128 -chr8 19458281 . G A 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=-0.416;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,15:34:99:547,0,662 -chr8 19740611 . G A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=-2.353;DP=50;FS=10.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.074;QD=5.58;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:307,0,1155 -chr8 19753493 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.607;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:298,0,2100 -chr8 19753544 . G T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.969;DP=40;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:279,0,1489 -chr8 19776404 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.621;DP=93;FS=7.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.104;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,17:93:99:270,0,2891 -chr8 19777701 . C CT 252.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.126;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.596 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,22:81:99:290,0,1748 -chr8 19796057 . C G 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.684;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.068;QD=14.83;ReadPosRankSum=-0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:399,0,547 -chr8 19796194 . G A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.221;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:302,0,848 -chr8 19796903 . G A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.254;DP=82;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,20:82:99:425,0,2319 -chr8 19808969 . A T 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=4.092;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=26.92;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,22:40:99:1105,0,6546 -chr8 19808985 . ACAAACACATATACACACACACACACACACACG A 1067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=2.130;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=19.07;ReadPosRankSum=-3.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,27:55:99:1105,0,6546 -chr8 19825595 . C T 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.360;DP=76;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=6.84;ReadPosRankSum=1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,21:76:99:548,0,2071 -chr8 19833222 . G A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.503;DP=84;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,19:84:99:358,0,2465 -chr8 19888657 . G A 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.106;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=17.51;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:396,0,550 -chr8 19927107 . G A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-1.579;DP=63;FS=6.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.008;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:270,0,1801 -chr8 19940606 . G A 822.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=2.596;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.677;QD=19.13;ReadPosRankSum=-3.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:851,0,594 -chr8 19943297 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.766;DP=102;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.834;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,27:102:99:617,0,2743 -chr8 19948598 . G A 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.687;DP=72;FS=3.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.189;QD=13.08;ReadPosRankSum=0.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,28:72:99:970,0,1528 -chr8 20035646 . C A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=1.041;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,21:82:99:472,0,2306 -chr8 20037416 . G T 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=-0.170;DP=54;FS=3.856;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.833;QD=21.01;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,34:54:99:1163,0,700 -chr8 20037465 . T G 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.959;DP=21;FS=4.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=13.94;ReadPosRankSum=-2.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:321,0,431 -chr8 20037560 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=2.397;DP=22;FS=12.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=14.72;ReadPosRankSum=-2.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:352,0,1259 -chr8 20037566 . A G 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=2.182;DP=28;FS=7.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:352,0,1252 -chr8 20037659 . T A 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.923;DP=64;FS=2.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,23:64:99:833,0,1508 -chr8 20037687 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=3.804;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.210;QD=4.10;ReadPosRankSum=-3.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,12:56:99:258,0,1761 -chr8 20037747 . G A 1061.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=1.982;DP=47;FS=1.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=22.59;ReadPosRankSum=0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,30:47:99:1090,0,601 -chr8 20044811 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.998;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=16.61;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:294,0,261 -chr8 20049498 . G A 317.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=31.79;ReadPosRankSum=-1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:346,0,16 -chr8 20130362 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-3.029;DP=71;FS=0.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:639,0,1796 -chr8 20137020 . G T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=-0.848;DP=118;FS=3.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=7.63;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,35:118:99:928,0,4268 -chr8 20140961 . C A 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=-2.574;DP=60;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=8.16;ReadPosRankSum=2.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:518,0,1537 -chr8 20147692 . A G 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=1.756;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.127;QD=9.12;ReadPosRankSum=1.342 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,19:58:99:557,0,1439 -chr8 20154522 . T C 1389.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.561;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=14.04;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,43:99:99:1418,0,2100 -chr8 20155559 . C A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.452;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,16:95:99:244,0,3074 -chr8 20155626 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-1.631;DP=83;FS=3.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=4.65;ReadPosRankSum=2.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:414,0,2651 -chr8 20157327 . G A 653.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=1.018;DP=79;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,24:79:99:682,0,2154 -chr8 20436286 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=1.676;DP=34;FS=5.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=11.08;ReadPosRankSum=1.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:405,0,756 -chr8 20442065 . A T 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=-0.406;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=6.49;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:262,0,1852 -chr8 20523947 . T C 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 -chr8 20524822 . T C 1057.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-1.636;DP=66;FS=6.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.955;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,32:59:99:1086,0,2054 -chr8 20524824 . C G 812.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=1.366;DP=65;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.081;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,24:58:99:841,0,2579 -chr8 20526349 . C T 482.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.496;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.496;QD=34.49;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:509,0,2 -chr8 20528674 . ATAGGTATTCACTTTATTCATATACAATGATACATGAAAAGACTGAAAAATACAGCTAAATACTTTTCTC A 416.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=2.492;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.227;QD=26.05;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:454,0,1517 -chr8 20597581 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.299;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:398,0,521 -chr8 20611275 . C T 1065.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=-1.484;DP=91;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,32:91:99:1094,0,1953 -chr8 20618057 . A G 722.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.769;DP=101;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=7.16;ReadPosRankSum=2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,30:101:99:751,0,2689 -chr8 20678927 . C A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.707;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:253,0,921 -chr8 20723847 . G T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=-0.154;DP=103;FS=8.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,20:103:99:257,0,3513 -chr8 20742497 . C T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.508;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,14:68:99:272,0,2067 -chr8 20835018 . A AT 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=-0.363;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.297;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:307,0,282 -chr8 20986728 . C T 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=3.111;DP=222;FS=3.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,45:222:99:803,0,8600 -chr8 20988652 . AT A 905.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=-0.556;DP=147;FS=0.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,50:139:99:943,0,1912 -chr8 20989344 . C CT 446.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.697;DP=218;FS=10.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,49:200:99:484,0,4231 -chr8 20990043 . TA T 363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=-2.004;DP=144;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,29:141:99:401,0,3047 -chr8 21009230 . T TC 206.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=-0.259;DP=36;FS=9.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.108;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:247,0,727 -chr8 21009498 . C T 453.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=-1.644;DP=37;FS=3.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.235 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:482,0,838 -chr8 21026619 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.346;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.661;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,19:56:99:655,0,1414 -chr8 21026760 . G A 541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=-2.120;DP=66;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,21:66:99:570,0,1701 -chr8 21028741 . C T 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=1.407;DP=100;FS=2.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=8.33;ReadPosRankSum=-1.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,33:100:99:861,0,2602 -chr8 21391332 . A G 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=1.903;DP=140;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,40:140:99:922,0,3818 -chr8 21391918 . G A 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=1.242;DP=129;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.815;QD=3.32;ReadPosRankSum=2.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,26:129:99:457,0,3801 -chr8 21391969 . G C 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=1.657;DP=113;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.192;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,22:113:99:307,0,3355 -chr8 21394383 . T G 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=-0.501;DP=131;FS=11.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.143;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,33:131:99:754,0,3815 -chr8 21395126 . G A 205.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.29;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:12:233,0,12 -chr8 21403563 . A C 1269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.675;ClippingRankSum=-0.940;DP=245;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=5.18;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,62:245:99:1298,0,6611 -chr8 21411134 . T C 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.930;DP=137;FS=7.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=2.97;ReadPosRankSum=3.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,26:137:99:435,0,4641 -chr8 21414454 . T TTG 1377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=-1.295;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.899;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,28:86:99:1415,0,2209 -chr8 21447562 . A C 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=4.216;DP=51;FS=5.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=4.27;ReadPosRankSum=-4.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:246,0,1744 -chr8 21521191 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 21521200 . T C 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 21588695 . A G 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=-1.800;DP=79;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.850;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:712,0,2012 -chr8 21590791 . T G 774.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.109;DP=43;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.377;QD=18.02;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:803,0,741 -chr8 21628618 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=4.031;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=15.38;ReadPosRankSum=-3.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:382,0,378 -chr8 21629054 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.318;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.92;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:331,0,245 -chr8 21710798 . C A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:232,0,102 -chr8 21744219 . A G 1654.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.086;DP=484;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.202;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,99:481:99:1683,0,15143 -chr8 21781820 . CATTTTGATCTTCATTGTATATTGATTTGTTGATTATTTAAGTTAGTGTAGAAATTCTACAAATAAATGATGAATGTTATTATGTCTTATTGGCGGAAGTGATTACAATATCTAGGTTGCA C 771.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=4;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,1:4:99:809,343,0 -chr8 21783794 . T C 4701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=-2.122;DP=123;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.003;QD=26.66;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,41:123:99:4730,0,2981 -chr8 21783890 . A G 4682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.047;DP=20;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=29.39;ReadPosRankSum=2.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:4711,0,2981 -chr8 21783900 . A G 4744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.611;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=28.07;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:4773,0,2981 -chr8 21783916 . A G 1894.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=1.684;DP=25;FS=6.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:1923,0,3801 -chr8 21783993 . A G 2763.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=-0.280;DP=79;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.475;QD=34.98;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,64:78:99:2792,0,3247 -chr8 21784125 . A G 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=-0.966;DP=24;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.732;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:594,0,356 -chr8 21784169 . A G 3473.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=-0.259;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.362;QD=27.95;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,56:59:99:3502,252,0 -chr8 21784393 . A G 1076.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=-0.175;DP=20;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=29.87;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:1105,0,119 -chr8 21784438 . A G 1051.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.280;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.093;QD=31.53;ReadPosRankSum=-0.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:1080,0,188 -chr8 21784992 . A AT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=1.391;DP=85;FS=2.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,21:85:99:317,0,6685 -chr8 21788554 . G GT 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.020;DP=141;FS=4.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,39:131:99:470,0,1793 -chr8 21789461 . GT G 1074.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=-1.563;DP=121;FS=3.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,54:110:99:1112,0,1373 -chr8 21789788 . G C 1649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=-0.179;DP=201;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=8.21;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,63:201:99:1678,0,8090 -chr8 21853567 . C T 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=-0.144;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.383;QD=7.22;ReadPosRankSum=0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:382,0,1363 -chr8 21855271 . C T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-1.161;DP=37;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.893;QD=11.43;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:451,0,1430 -chr8 21862382 . AGTGAGTCGCTTTTGTGTCACTTTTGACTTTTCTCATTTTGCTTTCGGCACACATGTCTTAGTCAAAAAAAAGCAAAGCGATTATGTGTGACTTCATGTTTTTCTCCTTTTGCTCTGAGCAG A 1078.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.387;ClippingRankSum=3.457;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=32.69;ReadPosRankSum=-2.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,26:33:99:1116,0,3555 -chr8 21870409 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=-1.217;DP=26;FS=6.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=10.68;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:306,0,529 -chr8 21894112 . G T 1671.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.475;DP=388;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.201;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:302,86:388:99:1700,0,11360 -chr8 21906493 . A T 1030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=1.187;DP=195;FS=2.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=0.319;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,48:194:99:1059,0,10856 -chr8 22675464 . T C 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr8 22891519 . T C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=-0.097;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.130;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:294,0,985 -chr8 22891930 . C T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.634;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.347;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:250,0,460 -chr8 22901955 . G GCC 300.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=2.572;DP=19;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.449;QD=15.83;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:338,0,415 -chr8 22904447 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.278;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:261,0,221 -chr8 22914523 . T A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.345;DP=48;FS=1.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.964;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:288,0,1366 -chr8 22914549 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.292;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:232,0,1023 -chr8 22925168 . C A 431.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=-0.203;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:99:460,0,1566 -chr8 22926742 . T C 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-1.416;DP=37;FS=3.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.288;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,13:37:99:392,0,964 -chr8 22926754 . A G 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=-0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.062;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:481,0,811 -chr8 22934992 . T C 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.972;DP=133;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.003;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.716 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,33:133:99:749,0,3811 -chr8 22935127 . C A 849.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=1.336;DP=105;FS=0.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.846 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,33:105:99:878,0,2820 -chr8 22937461 . A C 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.722;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.395;QD=15.63;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:294,0,340 -chr8 22945160 . A G 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.016;DP=39;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.113;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:275,0,1125 -chr8 22945171 . A C 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.048;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:276,0,1178 -chr8 22945622 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=18.52;ReadPosRankSum=-0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:306,0,263 -chr8 22947333 . G A 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=2.471;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.267;QD=13.40;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:323,0,453 -chr8 22947358 . T C 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.608;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=13.37;ReadPosRankSum=-3.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:309,0,362 -chr8 22948247 . T A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.473;DP=16;FS=8.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.208;QD=16.49;ReadPosRankSum=1.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:292,0,292 -chr8 22949259 . C T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.439;DP=17;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.830;QD=13.63;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:260,0,837 -chr8 22949268 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=1.139;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:260,0,837 -chr8 22949425 . T A 519.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=-1.691;DP=20;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.278;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:548,0,142 -chr8 22949546 . T C 716.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=1.445;DP=45;FS=6.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.058;QD=15.93;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:745,0,783 -chr8 22949596 . A C 731.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=-0.124;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.958;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,21:54:99:760,0,1139 -chr8 22949866 . G A 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.510;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:393,0,1883 -chr8 22949872 . A G 1249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.252;DP=48;FS=2.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.842;QD=26.04;ReadPosRankSum=-0.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1278,0,447 -chr8 22952995 . C CT 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.022;DP=31;FS=1.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:257,0,436 -chr8 22954076 . T C 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.132;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.026;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:354,0,544 -chr8 22954087 . C T 899.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=-0.026;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=29.99;ReadPosRankSum=-0.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:928,0,117 -chr8 22965624 . T G 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=-1.788;DP=69;FS=4.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.445 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,23:69:99:677,0,1831 -chr8 22967489 . A G 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=1.713;DP=107;FS=14.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=7.71;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,31:107:99:853,0,2865 -chr8 22970012 . A C 1306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=-0.848;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.961;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,39:72:99:1335,0,1239 -chr8 22970108 . G A 802.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=-0.211;DP=46;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.504;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:831,0,703 -chr8 22970414 . T A 257.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=2.235;DP=39;FS=8.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=6.61;ReadPosRankSum=-1.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:286,0,2233 -chr8 22970419 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=2.693;DP=34;FS=12.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=7.35;ReadPosRankSum=-2.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:278,0,2233 -chr8 22982135 . GTA G 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.717;DP=25;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:249,0,441 -chr8 23083863 . A G 237.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.72;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:266,0,22 -chr8 23084907 . C G 483.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=-0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2:510,0,2 -chr8 23093602 . T G 348.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.231;DP=22;FS=6.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.033;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:377,0,386 -chr8 23093646 . C G 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-1.021;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:370,0,324 -chr8 23093690 . C G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=-0.193;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=18.84;ReadPosRankSum=-0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:292,0,224 -chr8 23094088 . T G 248.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:277,0,16 -chr8 23096753 . G T 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=-1.560;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.016;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:271,0,1147 -chr8 23102591 . A G 580.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.448;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=17.08;ReadPosRankSum=-0.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,17:34:99:609,0,594 -chr8 23103045 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.814;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.506;QD=8.79;ReadPosRankSum=-1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:292,0,807 -chr8 23103428 . AGTAAGTCCTTTTATTCTTCAAACTGAAATAACACGATTCTGCACATCTCACTTATTTGAAATTTTTTTTGCTTAGTTTTGACATCTTGAAAAAATGGTGTGATTTACTTGGATGTTGACTGATGTTTTTGCTTTACTCTCAACAG A 762.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=3.050;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.617;QD=23.11;ReadPosRankSum=1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:800,0,5073 -chr8 23103892 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DP=46;FS=2.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,21:46:99:753,0,821 -chr8 23107293 . G T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.642;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:542,0,766 -chr8 23107696 . T C 851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.701;DP=55;FS=1.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.141;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,25:55:99:880,0,1000 -chr8 23107776 . C G 624.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=-0.306;DP=54;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=11.57;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:653,0,1204 -chr8 23108086 . C T 932.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.164;DP=54;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.043;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,26:54:99:961,0,928 -chr8 23111244 . G A 606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=1.417;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:635,0,502 -chr8 23111624 . A T 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.781;DP=41;FS=15.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:554,0,798 -chr8 23112036 . A G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.074;DP=41;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:99:246,0,1155 -chr8 23119520 . G C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=1.445;DP=22;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=15.90;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:378,0,398 -chr8 23129498 . G GTT 2668.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=2.363;DP=342;FS=0.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.737;QD=7.80;ReadPosRankSum=2.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,114:328:99:2706,0,12344 -chr8 23129564 . CA C 796.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.030;DP=369;FS=15.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.220;QD=2.16;ReadPosRankSum=4.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:260,91:351:99:834,0,12157 -chr8 23129916 . C CA 753.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=-1.887;DP=352;FS=3.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:263,77:340:99:791,0,7085 -chr8 23130565 . C G 472.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=-2.873;DP=341;FS=21.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.490 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:284,56:340:99:501,0,15106 -chr8 23130620 . G A 1749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=-0.609;DP=371;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,87:370:99:1778,0,12748 -chr8 23130723 . A T 1134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.745;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.282;QD=13.67;ReadPosRankSum=-1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,34:83:99:1163,0,1673 -chr8 23133206 . C A 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.150;DP=257;FS=7.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:216,40:256:99:406,0,9688 -chr8 23133214 . ACTGACAAACACAGGGCTGTTACACTCACATGAAGCAAATAAATATTCAAATCTAATAAACAGCCTTAACATAC A 12505.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.690;DP=320;FS=2.250;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=29.85;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,305:309:99:12543,895,0 -chr8 23133635 . T C 309.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=-4.060;DP=235;FS=11.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.965 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,38:234:99:338,0,7486 -chr8 23141955 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=-0.111;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=3.49;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,14:61:99:241,0,1674 -chr8 23146163 . G GA 818.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.147;DP=274;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.358;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,76:252:99:856,0,8093 -chr8 23146225 . A G 8593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.503;DP=261;FS=7.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=32.93;ReadPosRankSum=-1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,175:260:99:8622,0,1971 -chr8 23146232 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=1.721;DP=267;FS=2.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:225,42:267:99:403,0,12500 -chr8 23146284 . A T 1336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=-2.194;DP=307;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.679;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:236,70:306:99:1365,0,8687 -chr8 23161987 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.766;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:321,0,212 -chr8 23215577 . C T 529.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:558,39,0 -chr8 23217086 . G C 274.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:303,21,0 -chr8 23244971 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=-2.356;DP=34;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.957;QD=8.67;ReadPosRankSum=0.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:323,0,868 -chr8 23245189 . G A 1029.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1058,75,0 -chr8 23248830 . T A 407.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=-0.099;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=31.37;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:45:436,0,45 -chr8 23347883 . A G 397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:426,30,0 -chr8 23348231 . AAGGTACTGTTTAACAAAACTTCAGTTAATTGTATCATTGTGATTCATTGTTTAAGAGGTAGTTTAGGCAAAATAGGGGAGAAAATGCTTAACAAAGGTACTGCTTAC A 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.465;DP=20;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:271,0,6745 -chr8 23349360 . A T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 23350574 . CGTAAGAAGCTTTCCTTTTTGTCTATGTATGCAGGGGACATGAAGTTATAATACATGACTAATACATGTAATTGTTTGTTTGCAG C 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=2.267;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.533;QD=23.05;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:406,0,2095 -chr8 23356447 . C G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=2.078;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=14.12;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:353,0,445 -chr8 23356781 . C G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=-0.092;DP=33;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,13:33:99:454,0,690 -chr8 23357238 . C T 397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-1.458;DP=32;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:426,0,706 -chr8 23357405 . A T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=-0.122;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=13.67;ReadPosRankSum=0.939 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:288,0,364 -chr8 23366527 . G A 228.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:257,18,0 -chr8 23374099 . G GT 262.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=-0.494;DP=104;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=2.53;ReadPosRankSum=5.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,24:102:99:300,0,2136 -chr8 23374159 . CA C 2008.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=-1.477;DP=71;FS=3.701;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=28.29;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:68:99:2046,199,0 -chr8 23374289 . T G 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.810;DP=50;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:332,0,1489 -chr8 23374333 . A AT 557.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.543;DP=71;FS=7.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,27:71:99:595,0,1261 -chr8 23374936 . A C 2283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=2.596;DP=83;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.555;QD=27.52;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,64:83:99:2312,0,1227 -chr8 23378181 . T C 648.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=1.319;DP=187;FS=47.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.351;QD=3.47;ReadPosRankSum=-4.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,39:187:99:677,0,5700 -chr8 23384135 . A G 2363.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2392,180,0 -chr8 23390747 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=-0.178;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.315;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,9:21:99:318,0,427 -chr8 23466977 . C CG 256.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-1.044;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=21.40;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:0:291,0,0 -chr8 23800074 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=1.315;DP=138;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.53;ReadPosRankSum=-1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,32:137:99:654,0,4843 -chr8 23803526 . G T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=-0.995;DP=79;FS=4.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:79:99:259,0,2537 -chr8 23859490 . A C 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.431;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:272,0,498 -chr8 23956057 . A AT 282.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=-0.165;DP=62;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.588;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,20:60:99:320,0,1396 -chr8 23962218 . G A 286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.261;DP=112;FS=4.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.56;ReadPosRankSum=-0.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,21:112:99:315,0,3375 -chr8 23962422 . G A 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=1.561;DP=100;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.464;QD=13.74;ReadPosRankSum=-1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,42:99:99:1402,0,1883 -chr8 23962833 . T C 1291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=-1.240;DP=71;FS=3.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.490;QD=18.19;ReadPosRankSum=1.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,41:70:99:1320,0,913 -chr8 23962989 . G A 441.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.114;DP=110;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,25:110:99:470,0,3261 -chr8 23972795 . T TA 286.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=-0.401;DP=79;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,20:77:99:324,0,1523 -chr8 24004729 . C T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=-1.392;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:332,0,1340 -chr8 24027113 . G A 743.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.289;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.011;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,21:47:99:772,0,868 -chr8 24032536 . C A 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.523;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=7.87;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:398,0,2684 -chr8 24032546 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.514;DP=44;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=8.29;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,12:44:99:393,0,2684 -chr8 24033127 . G A 641.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=-0.363;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,24:76:99:670,0,1997 -chr8 24036270 . T A 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.676;DP=52;FS=7.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.824;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:302,0,1530 -chr8 24047252 . TC T 866.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=-1.375;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.44;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.732 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,37:73:99:904,0,950 -chr8 24048337 . C T 1974.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.431;ClippingRankSum=-2.511;DP=147;FS=13.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=13.43;ReadPosRankSum=-0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,57:147:99:2003,0,3026 -chr8 24057317 . G T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=-2.164;DP=28;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:251,0,835 -chr8 24063682 . T C 1096.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=-0.777;DP=132;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,43:132:99:1125,0,3401 -chr8 24064206 . CT C 606.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.408;DP=132;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.25;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,39:121:99:644,0,2608 -chr8 24066359 . A T 2541.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-1.849;DP=453;FS=4.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:331,120:451:99:2570,0,11985 -chr8 24068810 . C CT 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=-0.473;DP=128;FS=6.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.257;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,24:119:99:285,0,2154 -chr8 24078076 . C T 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 24078084 . C A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr8 24096246 . G A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.362;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=11.93;ReadPosRankSum=1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:243,0,417 -chr8 24096712 . A C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=12.61;ReadPosRankSum=-1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:230,0,341 -chr8 24214761 . G T 1272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.405;DP=194;FS=3.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.121;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.183 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:152,41:193:99:1301,0,12097 -chr8 24215508 . G A 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-1.555;DP=204;FS=7.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.523;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:168,35:203:99:491,0,6483 -chr8 24216071 . C T 844.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.833;DP=202;FS=7.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,45:201:99:873,0,6106 -chr8 24216147 . A C 361.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=-0.108;DP=257;FS=6.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:217,40:257:99:390,0,11350 -chr8 24216159 . A T 1261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.885;DP=279;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,64:278:99:1290,0,10348 -chr8 24228053 . G A 2358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=-4.201;DP=374;FS=1.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.889;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:273,101:374:99:2387,0,10619 -chr8 24230250 . CGGTATAAATGCACATACAAACATACACACATACCCATAGACATTAAACACATTTTAAAGCATGGAAATGTTCGTGTTCAGAAATAGATTAATGTGACTTTTATTTTGTGTTTTTA C 12857.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=1.473;DP=294;FS=3.508;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=29.85;ReadPosRankSum=-0.221 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,288:294:99:12895,1154,0 -chr8 24232662 . AT A 2390.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=-1.134;DP=90;FS=8.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQ0=0;MQRankSum=0.476;QD=26.56;ReadPosRankSum=-0.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,32:80:99:2428,0,784 -chr8 24233104 . AT A 701.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=-1.241;DP=207;FS=1.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:146,57:203:99:1177,0,2896 -chr8 24233221 . T C 909.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=-1.661;DP=189;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,48:186:99:938,0,6931 -chr8 24233674 . TTA T 366.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.202;DP=265;FS=12.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.161;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:224,39:263:99:404,0,12721 -chr8 24233761 . TA T 4966.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-3.866;DP=200;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.314;QD=24.83;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,43:199:99:5004,0,14895 -chr8 24235549 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=-2.444;DP=177;FS=7.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:140,36:176:99:647,0,5193 -chr8 24236835 . T C 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=-0.509;DP=178;FS=2.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.185;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,28:178:99:348,0,5991 -chr8 24242755 . C A 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.102;DP=49;FS=5.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.351 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:49:99:311,0,1326 -chr8 24242778 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.601;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:269,0,1623 -chr8 24395246 . ACAGGTACACTTTTACAGTCTATTTTTGTTCTTTTTGACAGGTTCCTTGCTAAAATGCCATGTGTTTTT A 5011.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=2.406;DP=132;FS=3.032;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.014;QD=24.67;ReadPosRankSum=-2.428 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,111:113:99:5049,412,0 -chr8 24407420 . T TA 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.442;DP=67;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,25:66:99:508,0,1120 -chr8 24407543 . T C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=3.317;DP=71;FS=2.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=3.24;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:71:99:258,0,2212 -chr8 24407854 . A T 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=-0.072;DP=96;FS=3.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,24:96:99:542,0,2882 -chr8 24408496 . CT C 248.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.031;DP=52;FS=2.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.277 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:286,0,669 -chr8 24433098 . T C 1934.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.501;DP=162;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.556;QD=11.94;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,58:162:99:1963,0,4310 -chr8 24433239 . T A 1174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-0.089;DP=146;FS=5.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.127;QD=8.05;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,45:146:99:1203,0,3964 -chr8 24433409 . G A 449.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-2.357;DP=115;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,24:115:99:478,0,3902 -chr8 24434285 . G A 1166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=1.535;DP=164;FS=2.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,47:164:99:1195,0,4537 -chr8 24444949 . G A 1003.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.754;DP=151;FS=6.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.779;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,42:151:99:1032,0,4193 -chr8 24452046 . T A 2557.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.625;ClippingRankSum=-0.068;DP=175;FS=1.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=14.62;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,78:174:99:2586,0,3183 -chr8 24478766 . T G 590.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.690;DP=104;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,27:104:99:619,0,2933 -chr8 24478826 . C T 467.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=-1.576;DP=101;FS=1.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,24:101:99:496,0,2966 -chr8 24480407 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.274;DP=86;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,18:85:99:344,0,2596 -chr8 24484594 . T G 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.488;DP=100;FS=5.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=4.34;ReadPosRankSum=0.827 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,24:100:99:462,0,2852 -chr8 24485366 . T C 901.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=-0.509;DP=109;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,35:109:99:930,0,2891 -chr8 24493045 . T C 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=2.278;DP=203;FS=16.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.508;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,28:203:99:230,0,13365 -chr8 24500332 . T A 2048.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.001;DP=230;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,76:230:99:2077,0,5791 -chr8 24504262 . G A 2016.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=-0.752;DP=270;FS=1.610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.291;QD=7.47;ReadPosRankSum=2.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:189,80:269:99:2045,0,8644 -chr8 24508631 . G A 3556.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.285;DP=325;FS=0.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:210,115:325:99:3585,0,6814 -chr8 24508779 . A G 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.390;DP=247;FS=3.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.990;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:208,39:247:99:407,0,7999 -chr8 24511819 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.868;DP=15;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.85;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:236,0,304 -chr8 24523269 . A AG 302.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.844;DP=18;FS=1.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:340,0,260 -chr8 24525548 . T TA 408.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=-0.372;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.362;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:84:516,0,84 -chr8 24527785 . A C 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=-1.464;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=18.34;ReadPosRankSum=0.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:340,0,217 -chr8 24528696 . A C 541.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:570,39,0 -chr8 24536595 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-1.990;DP=28;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:343,0,624 -chr8 24536865 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=2.549;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.36;ReadPosRankSum=-1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:354,0,217 -chr8 24536920 . G T 377.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=2.188;DP=19;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=19.88;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:406,0,251 -chr8 24544765 . G T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.527;DP=27;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.728;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:337,0,618 -chr8 24576588 . C T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-4.356;DP=59;FS=6.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,14:59:99:293,0,1881 -chr8 24580620 . G T 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.962;ClippingRankSum=1.847;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.277;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,34:110:99:709,0,2741 -chr8 24583078 . CAGGTAAGGGTTCACATTTCAGGTTTTCTATGATTTTTGTTTCTTTTGACCTTCTGAATTGTTTTGTGGTTTTCCGTTTGTCTCT C 2129.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=2.308;DP=88;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=24.20;ReadPosRankSum=-1.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,67:80:99:2167,0,2751 -chr8 24609461 . A G 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.268;DP=130;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.481;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,29:130:99:536,0,3713 -chr8 24609623 . T A 571.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-2.378;DP=91;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=6.28;ReadPosRankSum=2.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,25:91:99:600,0,2447 -chr8 24611267 . G T 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=2.088;DP=108;FS=3.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,21:108:99:331,0,3345 -chr8 24613120 . G T 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=-2.648;DP=101;FS=4.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.445;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:101:99:471,0,2816 -chr8 24721541 . T C 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=1.496;DP=80;FS=1.967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,27:80:99:865,0,1838 -chr8 24726157 . A G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=22.80;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:279,0,146 -chr8 24731846 . A AT 397.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=-1.518;DP=49;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=8.12;ReadPosRankSum=-1.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:435,0,643 -chr8 24770757 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=-1.271;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=26.08;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:289,0,144 -chr8 24770796 . C G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-2.003;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.768;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:339,0,49 -chr8 24961520 . T A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=1.443;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.009;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:649,0,1337 -chr8 25134571 . C G 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=-0.116;DP=53;FS=1.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.098 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,24:53:99:833,0,1028 -chr8 25148600 . T C 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.530;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,30:63:99:1078,0,1091 -chr8 25148789 . T A 572.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.753;DP=30;FS=1.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=19.09;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:601,0,473 -chr8 25152411 . G A 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=-0.123;DP=27;FS=6.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=10.88;ReadPosRankSum=2.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:322,0,554 -chr8 25175432 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=1.030;DP=20;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=11.04;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:249,0,437 -chr8 25178271 . T C 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.016;DP=38;FS=2.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.44;ReadPosRankSum=2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,12:38:99:349,0,1039 -chr8 25593099 . C T 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.536;DP=78;FS=2.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=8.18;ReadPosRankSum=1.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,24:78:99:666,0,2061 -chr8 25640712 . A T 448.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=1.396;DP=76;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,20:75:99:477,0,2048 -chr8 25641556 . C T 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=-0.224;DP=89;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:288,0,2577 -chr8 25643056 . A G 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=-0.918;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,14:73:99:258,0,2252 -chr8 25649730 . C T 497.22 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.248;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.736;QD=30.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:4:524,0,4 -chr8 25825287 . A C 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.290;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.190;QD=9.39;ReadPosRankSum=-0.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:507,0,1353 -chr8 25825382 . G A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=-0.497;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.262;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:239,0,2938 -chr8 25880686 . G A 1409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.218;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.064;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,42:89:99:1438,0,1497 -chr8 25895492 . G GA 270.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-1.637;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.502 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:308,0,311 -chr8 25895719 . C A 583.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.430;DP=50;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.475;QD=11.68;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:612,0,2402 -chr8 25943116 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.570;DP=55;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.068;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,14:55:99:348,0,1538 -chr8 25969095 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.572;DP=8;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=26.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:94:239,0,94 -chr8 26074616 . A T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=-0.415;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.390;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.014 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:301,0,1506 -chr8 26074802 . T A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.291;DP=49;FS=7.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.221;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:259,0,1397 -chr8 26076284 . T C 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.211;DP=36;FS=1.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=13.19;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:503,0,806 -chr8 26149913 . TGTAATGTGTACTACAATGTTGGTGGATTTTTTCATAATGTGATACAAGTCATTAATAATAAGTTCAATTAATTTACCTGCAG T 14566.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=2.315;DP=347;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.392;QD=29.41;ReadPosRankSum=-3.441 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,328:333:99:14604,1079,0 -chr8 26150807 . A G 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.205;DP=67;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=6.35;ReadPosRankSum=1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,18:67:99:454,0,1931 -chr8 26153454 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=-0.176;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:301,0,1506 -chr8 26154128 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=-1.970;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.461;QD=6.37;ReadPosRankSum=1.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:232,0,878 -chr8 26443050 . T G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=1.278;DP=57;FS=8.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:356,0,1684 -chr8 26443152 . G GT 261.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.461;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:299,0,604 -chr8 26443493 . GA G 211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=-0.525;DP=34;FS=3.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.148;QD=6.23;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:249,0,475 -chr8 26477243 . T A 639.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=-0.301;DP=101;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=6.33;ReadPosRankSum=2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:668,0,2712 -chr8 26477632 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-1.431;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,11:51:99:251,0,1564 -chr8 26478416 . T A 661.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=-0.199;DP=56;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.069;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:690,0,3257 -chr8 26478432 . T TG 638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=-0.941;DP=58;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=11.01;ReadPosRankSum=3.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:676,0,3257 -chr8 26478527 . G A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.681;DP=66;FS=4.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:347,0,2324 -chr8 26502748 . A G 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.589;DP=36;FS=3.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,14:35:99:490,0,701 -chr8 26502820 . G A 383.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.739;DP=34;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.595;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:412,0,801 -chr8 26599068 . C T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.238;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:329,0,1199 -chr8 26599156 . A G 536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.534;DP=45;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.146;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,16:45:99:565,0,1181 -chr8 26618583 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=-1.929;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:271,0,562 -chr8 26745679 . A C 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.332;DP=116;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,28:116:99:551,0,4993 -chr8 26746318 . T C 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=1.158;DP=67;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,17:66:99:396,0,1897 -chr8 26747165 . G A 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.390;DP=67;FS=6.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,16:67:99:332,0,1890 -chr8 26758474 . G GT 1643.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-0.543;DP=307;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=1.570;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,73:291:99:1681,0,5880 -chr8 26822405 . A AC 313.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=-1.380;DP=36;FS=7.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=8.71;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:351,0,740 -chr8 26891252 . G A 1254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.614;DP=226;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,59:225:99:1283,0,6124 -chr8 26899111 . G C 1101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.878;DP=188;FS=3.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.996;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:138,50:188:99:1130,0,5156 -chr8 26919177 . C T 2041.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.168;DP=177;FS=3.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.548 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,61:176:99:2070,0,4097 -chr8 26928461 . C T 2219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.422;DP=271;FS=1.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.011;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,86:271:99:2248,0,7053 -chr8 26944804 . GGGTACGTGCTTTAACTTTTCAGGCCTTGACTGCACATTATAGACATAGTACTGAACCCTTTCTTTATTCA G 1144.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.049;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=22.89;ReadPosRankSum=-0.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,33:41:99:1182,0,369 -chr8 26946603 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.423;DP=71;FS=1.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,18:70:99:416,0,1947 -chr8 26950387 . C CT 279.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=1.221;DP=68;FS=5.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:317,0,1208 -chr8 26950687 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-3.325;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.986;QD=6.13;ReadPosRankSum=2.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:249,0,1479 -chr8 26976900 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.501;DP=20;FS=7.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:288,0,403 -chr8 27065799 . G GT 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.879;DP=34;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.730 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,12:33:99:277,0,527 -chr8 27066351 . T C 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.018;DP=36;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.430;QD=6.41;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:259,0,1674 -chr8 27068382 . C T 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=-1.583;DP=35;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.417;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:444,0,703 -chr8 27176331 . G A 726.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=1.405;DP=62;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:755,0,1354 -chr8 27176410 . A T 435.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.535;DP=68;FS=12.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.243;QD=6.41;ReadPosRankSum=2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,18:68:99:464,0,2151 -chr8 27176526 . C CT 673.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=-0.620;DP=73;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,31:71:99:711,0,946 -chr8 27176651 . T G 954.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.126;DP=65;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.404;QD=14.69;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,28:65:99:983,0,1291 -chr8 27176894 . A T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=1.298;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=19.64;ReadPosRankSum=1.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,36:61:99:1226,0,896 -chr8 27177544 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=1.351;DP=38;FS=3.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.564;QD=7.44;ReadPosRankSum=-4.497 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:311,0,2348 -chr8 27182482 . GA G 854.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=-0.945;DP=229;FS=3.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.48;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=3.73;ReadPosRankSum=-0.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,61:223:99:892,0,4654 -chr8 27183272 . A G 1103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=-2.773;DP=241;FS=0.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.179;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,54:238:99:1132,0,7149 -chr8 27183454 . C T 1945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-1.303;DP=252;FS=14.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.552;QD=7.72;ReadPosRankSum=2.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:175,76:251:99:1974,0,6628 -chr8 27220669 . C T 1586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=1.253;DP=332;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:253,79:332:99:1615,0,9540 -chr8 27221334 . GA G 960.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.296;DP=139;FS=6.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.622;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,47:123:99:998,0,2372 -chr8 27221923 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.337;DP=117;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,21:117:99:337,0,3672 -chr8 27279496 . T G 635.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=1.816;DP=186;FS=6.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.180;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,38:186:99:664,0,5817 -chr8 27279768 . G GT 548.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=-0.956;DP=177;FS=12.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,44:159:99:586,0,3087 -chr8 27437012 . C T 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=1.772;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.273;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,25:83:99:656,0,2250 -chr8 27559966 . T C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=-1.178;DP=34;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,11:34:99:317,0,862 -chr8 27579944 . G A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=-0.797;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.534;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,22:65:99:727,0,1472 -chr8 27580390 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=2.351;DP=75;FS=4.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.013;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,15:75:99:294,0,2342 -chr8 27580973 . C T 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.030;DP=88;FS=3.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.842;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:322,0,2521 -chr8 27645480 . G A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.117;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.642;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:230,0,2154 -chr8 27691433 . C G 680.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-0.064;DP=223;FS=1.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,43:223:99:709,0,10873 -chr8 27737727 . GAC G 1641.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-1.349;DP=251;FS=3.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:172,65:237:99:1679,0,6798 -chr8 27737830 . T C 1119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=1.789;DP=203;FS=9.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,52:203:99:1148,0,5876 -chr8 27738097 . G C 2358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=-0.180;DP=253;FS=3.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:167,73:240:99:2396,0,6121 -chr8 27738389 . A G 1548.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=-1.540;DP=266;FS=4.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.180;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,79:266:99:1577,0,9780 -chr8 27738927 . A C 3019.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.421;DP=252;FS=2.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.193;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,89:252:99:3048,0,5749 -chr8 27739153 . C T 836.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-1.933;DP=142;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.892;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.525 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,37:142:99:865,0,4158 -chr8 27739583 . A G 2318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=-1.787;DP=186;FS=1.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=12.47;ReadPosRankSum=1.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,69:185:99:2347,0,3811 -chr8 27739705 . C T 1331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=-0.215;DP=256;FS=10.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.038;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:192,64:256:99:1360,0,12785 -chr8 27775318 . T G 702.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-1.274;DP=136;FS=8.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,36:132:99:740,0,4040 -chr8 27775820 . T G 1210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.776;DP=211;FS=2.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,54:208:99:1239,0,5970 -chr8 27776235 . T A 1055.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.728;DP=183;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.094;QD=5.77;ReadPosRankSum=-0.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,48:183:99:1084,0,5483 -chr8 27777024 . A T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=-0.534;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,38:175:99:763,0,5404 -chr8 27777287 . T C 1176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=-0.075;DP=281;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.064;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,63:281:99:1205,0,8257 -chr8 27780791 . C T 596.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.872;DP=232;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.906 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,41:231:99:625,0,7279 -chr8 28058320 . C T 8392.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,196:196:99:8421,596,0 -chr8 28058487 . C T 9141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=-1.286;DP=109;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.497;QD=33.84;ReadPosRankSum=-0.120 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:101:99:9170,620,0 -chr8 28058488 . C A 9366.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=-1.362;DP=111;FS=3.053;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.127;QD=35.01;ReadPosRankSum=1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:9395,635,0 -chr8 28058559 . C T 9141.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=-0.053;DP=144;FS=4.684;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.397;QD=31.25;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,111:115:99:9170,620,0 -chr8 28058659 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.073;ClippingRankSum=1.480;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:369,0,110 -chr8 28058660 . A C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.358;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:99:369,0,110 -chr8 28058783 . A AT 2561.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=-0.609;DP=108;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.773;QD=23.72;ReadPosRankSum=0.095 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,89:92:99:2599,262,0 -chr8 28058820 . G A 5618.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=2.247;DP=106;FS=1.942;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=28.02;ReadPosRankSum=0.970 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,102:106:99:5647,406,0 -chr8 28058900 . A G 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-2.457;DP=17;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=26.22;ReadPosRankSum=-2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:99:474,0,207 -chr8 28425790 . C A 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=-0.471;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:301,0,285 -chr8 28673267 . T C 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=1.606;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.662;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:515,0,1384 -chr8 28674291 . C T 428.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=1.515;DP=59;FS=1.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,17:59:99:457,0,1642 -chr8 28677107 . C T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-2.498;DP=96;FS=0.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:516,0,2771 -chr8 28677262 . C T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-1.587;DP=92;FS=3.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.885;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,23:92:99:536,0,2678 -chr8 28680691 . C T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.377;DP=99;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,23:98:99:335,0,2885 -chr8 29258354 . CAGA C 2469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=1.434;DP=94;FS=3.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.801;QD=26.27;ReadPosRankSum=-1.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,1:93:99:2507,0,4268 -chr8 29318280 . G GT 521.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.063;DP=57;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.332;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,23:53:99:559,0,720 -chr8 29416879 . C T 424.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.456;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:453,0,42 -chr8 29561205 . A C 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.735;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.584;QD=10.64;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:656,0,1472 -chr8 29561274 . G T 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=-1.187;DP=59;FS=14.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,15:57:99:440,0,1637 -chr8 30488201 . G A 937.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.767;DP=183;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.707;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,46:183:99:966,0,5269 -chr8 30488702 . C G 464.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.609;ClippingRankSum=-0.191;DP=210;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,36:209:99:502,0,6768 -chr8 30490869 . C G 673.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.753;DP=174;FS=1.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,36:173:99:702,0,5225 -chr8 30492193 . A G 719.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=1.723;DP=191;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,41:191:99:748,0,10139 -chr8 30492491 . A G 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=-0.324;DP=217;FS=2.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,46:217:99:943,0,16611 -chr8 30492495 . C T 914.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=-0.454;DP=219;FS=2.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.643;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:173,46:219:99:943,0,16611 -chr8 30495764 . C T 468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.693;DP=185;FS=0.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.058;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,33:184:99:497,0,5814 -chr8 30558707 . T G 393.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=-0.426;DP=31;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=12.70;ReadPosRankSum=0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:422,0,689 -chr8 30622164 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=-0.244;DP=46;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=6.26;ReadPosRankSum=1.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:316,0,1813 -chr8 30622667 . A AAT 628.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=-0.507;DP=47;FS=2.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:44:99:666,0,745 -chr8 30661413 . G A 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.386;DP=55;FS=17.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,18:55:99:490,0,1414 -chr8 30667560 . G A 452.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=-0.557;DP=60;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,18:60:99:481,0,1607 -chr8 30911493 . G T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-0.620;DP=99;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,19:98:99:335,0,2926 -chr8 30916739 . A T 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.132;DP=61;FS=1.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.646;QD=8.32;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,19:61:99:536,0,2943 -chr8 30916740 . T A 507.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=-0.558;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.793;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,19:64:99:536,0,2943 -chr8 31007561 . G C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=-1.955;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,16:62:99:350,0,1806 -chr8 31090562 . ACTGAACAAGAGGAAGAGAGCAGCAGAATGTTGAGTGGAAAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAATCACTTGTTCCTTGATGGCAACTGAC A 205.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=3.685;DP=28;FS=1.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=7.35;ReadPosRankSum=-2.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:243,0,8014 -chr8 31169744 . A C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.740;DP=12;FS=2.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=26.31;ReadPosRankSum=-0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:88:344,0,88 -chr8 31169876 . T C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.225;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=19.41;ReadPosRankSum=-1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:300,0,214 -chr8 31169947 . GT G 887.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=-0.675;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.498;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,35:50:99:925,0,252 -chr8 31172591 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.693;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=15.64;ReadPosRankSum=2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:388,0,411 -chr8 31207936 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=-1.511;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:311,0,906 -chr8 31301640 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=-0.572;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:67:234,0,67 -chr8 31492358 . G A 312.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=-1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=31.29;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:341,0,14 -chr8 31670608 . G A 338.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-1.032;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.009;QD=7.06;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,14:48:99:367,0,1852 -chr8 31675106 . G GA 339.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=-1.143;DP=29;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.588;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,19:26:98:431,0,98 -chr8 31785796 . G A 625.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=1.492;DP=200;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.389;QD=3.13;ReadPosRankSum=3.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,38:199:99:654,0,6208 -chr8 31801803 . C A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-0.172;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.947;QD=11.69;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:379,0,663 -chr8 31811999 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=-0.529;DP=16;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:245,0,338 -chr8 31879356 . AT A 383.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-0.423;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,18:53:99:421,0,1263 -chr8 31881867 . C T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-1.240;DP=321;FS=4.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.912;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,54:320:99:618,0,9449 -chr8 31884108 . G A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.836;DP=209;FS=0.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.218;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,45:209:99:845,0,6415 -chr8 31885373 . G A 1198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=-2.481;DP=256;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:197,59:256:99:1227,0,7590 -chr8 31885439 . T C 1044.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=-1.434;DP=229;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.623;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,52:229:99:1073,0,9425 -chr8 31886940 . G GTCCGTTGA 3435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.192;DP=198;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=17.35;ReadPosRankSum=-0.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,100:174:99:3473,0,2943 -chr8 31892502 . G A 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=-1.372;DP=201;FS=6.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=4.01;ReadPosRankSum=2.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,45:201:99:835,0,5952 -chr8 31894135 . G A 677.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=-0.534;DP=226;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=3.00;ReadPosRankSum=-0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:183,43:226:99:706,0,6860 -chr8 31899459 . G T 804.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=1.007;DP=260;FS=5.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.416;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,51:260:99:833,0,7744 -chr8 31947915 . T G 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.667;DP=66;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:274,0,2033 -chr8 31995322 . A T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=-2.239;DP=29;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=7.61;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:99:249,0,721 -chr8 32006539 . G A 369.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:398,30,0 -chr8 32215990 . ATC A 381.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=1.687;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:419,0,1832 -chr8 32216052 . G A 387.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=-0.168;DP=53;FS=8.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.346;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:416,0,1410 -chr8 32216395 . GCTTTGGGAAGAAAAGAAGAAGCAATATTAATACCCCGTGCAAATGTAGGTGTTGATAAGAGTGTGGTGAAGAGGAGGTGATCTACTCAC G 2363.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=4.319;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=31.52;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,58:69:99:2401,0,3801 -chr8 32216566 . C T 916.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=1.007;DP=50;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.319;QD=18.34;ReadPosRankSum=-0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,28:50:99:945,0,771 -chr8 32217113 . G C 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=-0.959;DP=61;FS=7.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.320;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,16:61:99:334,0,1647 -chr8 32223442 . C T 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=-0.573;DP=86;FS=0.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,19:86:99:423,0,5500 -chr8 32224357 . G T 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=1.604;DP=106;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,24:106:99:445,0,3047 -chr8 32285715 . ACAGGTTTGGCTTATCCAGTTGAATTCACTTAACATGAATGTATAACTTTATCAATATGTCACTAAATATCTTTGTCAAC A 19506.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.911;DP=346;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.948;QD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,328:330:99:19544,1489,0 -chr8 32291033 . CT C 1188.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=-2.449;DP=302;FS=6.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:203,80:283:99:1249,0,4833 -chr8 32305931 . C T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.088;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.966;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:99:310,0,567 -chr8 32311793 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=-0.133;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.933;QD=21.63;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:331,0,175 -chr8 32313458 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.893;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=15.36;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:274,0,520 -chr8 32332683 . T C 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=1.671;DP=26;FS=1.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:298,0,603 -chr8 32333616 . C T 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-1.986;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,894 -chr8 32333619 . G A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-1.902;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=12.09;ReadPosRankSum=2.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:258,0,894 -chr8 32491580 . GT G 204.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.286;DP=20;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=10.24;ReadPosRankSum=-1.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:242,0,203 -chr8 32493493 . G T 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=-0.323;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:319,0,597 -chr8 32540375 . A G 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.450;DP=34;FS=1.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:409,0,755 -chr8 32553309 . G A 1317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=-0.392;DP=98;FS=0.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=13.45;ReadPosRankSum=0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,39:98:99:1346,0,2075 -chr8 32612900 . G A 1397.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.439;DP=125;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,43:125:99:1426,0,2810 -chr8 32747817 . T A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:49:270,0,49 -chr8 32773455 . A G 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=24.48;ReadPosRankSum=1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:273,0,98 -chr8 32878133 . A C 455.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=-1.387;DP=58;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.059;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:58:99:484,0,1664 -chr8 32878219 . T C 679.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.057;DP=45;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,19:45:99:708,0,1024 -chr8 32878948 . G T 634.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.088;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:663,0,1119 -chr8 33229097 . TCTGTGGTGACAAAACACATTAAGTACGTTGGTAAAGATGAAAAGTGCCAAAGCAACAAAAAAGTTGAAGCACTTAC T 3038.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=-1.126;DP=70;FS=5.310;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.013;QD=34.44;ReadPosRankSum=1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,66:70:99:3076,240,0 -chr8 33229590 . C T 715.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=-2.047;DP=102;FS=4.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.016;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:744,0,2781 -chr8 33234025 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=1.728;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=7.46;ReadPosRankSum=-1.687 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,10:32:99:267,0,853 -chr8 33331553 . T A 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.052;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=4.05;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:247,0,1607 -chr8 33492765 . C T 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-1.085;DP=66;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.621;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,16:66:99:343,0,1879 -chr8 33496828 . G A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=-1.400;DP=58;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=6.77;ReadPosRankSum=1.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:421,0,2707 -chr8 33505574 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=-1.888;DP=45;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.941;QD=4.57;ReadPosRankSum=2.232 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:234,0,1228 -chr8 33507167 . A C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=1.025;DP=46;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:350,0,2692 -chr8 33507173 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=-0.013;DP=47;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.346;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:350,0,2692 -chr8 33514206 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.616;DP=51;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.270;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.292 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:317,0,1322 -chr8 33533452 . C T 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.322;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:375,0,1691 -chr8 33539127 . A C 369.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.428;DP=43;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=8.60;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:398,0,1130 -chr8 33543264 . A G 365.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=-0.811;DP=57;FS=4.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.42;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:394,0,1503 -chr8 33554363 . C T 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.025;DP=84;FS=6.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:530,0,2257 -chr8 33562166 . GGGTCAGTGGCTCTTATACAGACATGAGCTTCTGTTTTTACTGCTTTGTTTTTATTTTAATATTTATCTTTTCCATGACCTCTTCCACTACCTCCTCA G 2710.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.133;DP=74;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=33.83;ReadPosRankSum=-0.866 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:65:99:2748,198,0 -chr8 33587649 . G A 595.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=-0.661;DP=75;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,23:75:99:624,0,1997 -chr8 33600058 . C A 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.566;DP=79;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,20:78:99:451,0,2219 -chr8 33883914 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=-0.639;DP=76;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.044;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:297,0,2368 -chr8 33884156 . G A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=-1.463;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.488;QD=2.76;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,16:87:99:268,0,2659 -chr8 33896678 . T C 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=-1.241;DP=84;FS=2.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=4.19;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,19:83:99:380,0,2445 -chr8 33898696 . C A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.136;DP=44;FS=1.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,11:44:99:262,0,1331 -chr8 34109187 . C CT 345.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-1.618;DP=53;FS=4.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.840;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:383,0,821 -chr8 34764808 . G A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.782;DP=100;FS=0.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,19:100:99:297,0,3726 -chr8 35168841 . A G 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.887;DP=35;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:241,0,1016 -chr8 35183366 . G A 380.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=-0.614;DP=75;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=5.08;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,18:75:99:409,0,2189 -chr8 35183377 . C T 446.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=-0.486;DP=84;FS=3.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.940;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.486 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,21:84:99:475,0,2469 -chr8 35206061 . G A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-1.462;DP=48;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,13:48:99:336,0,1319 -chr8 35220379 . G A 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DP=68;FS=1.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.228;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,15:68:99:289,0,1959 -chr8 35223846 . G A 881.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=-0.163;DP=47;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,28:47:99:910,0,658 -chr8 35226192 . T A 1129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.633;DP=47;FS=6.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=24.04;ReadPosRankSum=1.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,31:46:99:1158,0,352 -chr8 35226235 . A G 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=1.379;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.291;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,33:48:99:1236,0,412 -chr8 35226379 . C T 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=-0.995;DP=61;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.878;QD=5.31;ReadPosRankSum=1.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:352,0,1647 -chr8 35232024 . G A 610.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=-1.192;DP=62;FS=3.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.827;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,21:61:99:639,0,1271 -chr8 37638817 . T C 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.573;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=23.20;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:237,0,102 -chr8 38076279 . G C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.421;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.027;QD=15.84;ReadPosRankSum=-0.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:250,0,500 -chr8 38106356 . T C 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=-0.791;DP=224;FS=2.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,46:223:99:811,0,6808 -chr8 38112480 . A G 1085.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.552;DP=213;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,50:213:99:1114,0,6327 -chr8 38125978 . T C 2226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.705;DP=305;FS=4.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.763;QD=7.30;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,91:305:99:2255,0,8143 -chr8 38151141 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.118;DP=44;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,19:44:99:665,0,838 -chr8 38154105 . C T 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=-1.044;DP=50;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.963;QD=11.06;ReadPosRankSum=2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,17:50:99:581,0,1200 -chr8 38172585 . C A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=-2.258;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.964;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.175 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,11:45:99:257,0,1285 -chr8 38187900 . G A 514.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.372;DP=54;FS=8.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=9.53;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,17:54:99:543,0,3060 -chr8 38194759 . T G 749.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=-0.268;DP=67;FS=9.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.461;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,23:65:99:778,0,1466 -chr8 38295918 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.168;DP=32;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:234,0,1703 -chr8 38332450 . G A 688.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.812;DP=37;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.207;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:36:99:717,0,568 -chr8 38332475 . A G 547.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.603;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=17.67;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:30:99:576,0,551 -chr8 38483642 . A T 1096.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78:1125,78,0 -chr8 38569231 . G A 601.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.735;DP=92;FS=1.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,25:89:99:630,0,2469 -chr8 38572714 . A T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=-0.021;DP=82;FS=0.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=6.58;ReadPosRankSum=2.436 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,23:82:99:568,0,2275 -chr8 38850417 . C G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.342;DP=17;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=20.75;ReadPosRankSum=0.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:381,0,239 -chr8 38850489 . C T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=1.615;DP=22;FS=3.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=17.85;ReadPosRankSum=-1.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:421,0,403 -chr8 38910523 . C G 215.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:244,0,23 -chr8 38913868 . G A 2759.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.514;DP=87;FS=1.420;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.245;QD=31.72;ReadPosRankSum=-0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,73:81:59:2788,59,0 -chr8 38932179 . C A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.898;DP=28;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:55:329,0,55 -chr8 38934079 . T A 2187.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2216,160,0 -chr8 38934235 . T A 413.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:442,33,0 -chr8 38939754 . G A 776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=-0.411;DP=61;FS=1.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:99:805,0,849 -chr8 39408474 . A C 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=-1.758;DP=45;FS=1.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.77;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:99:288,0,1222 -chr8 39925353 . C T 2580.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.907;DP=66;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.138;QD=33.63;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:64:99:2609,187,0 -chr8 39927766 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr8 39928202 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.785;DP=65;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.233;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,34:42:99:1357,0,148 -chr8 39928795 . A T 4501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:4530,307,0 -chr8 39928799 . T G 4501.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:102:99:4530,307,0 -chr8 39929543 . A T 277.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:306,21,0 -chr8 40113994 . G A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-1.096;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.555;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:298,0,253 -chr8 40114323 . A C 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:422,30,0 -chr8 40141206 . A G 1569.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=2.837;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.168;QD=21.50;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,40:43:99:1598,0,277 -chr8 40141215 . T C 1522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=3.595;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=33.23;ReadPosRankSum=-1.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:99:1551,0,380 -chr8 40141306 . C A 15291.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=3.162;DP=443;FS=1.616;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.397;QD=34.52;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,325:331:99:15320,1099,0 -chr8 40141426 . C T 3222.65 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=1.273;DP=130;FS=5.929;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.683;QD=24.79;ReadPosRankSum=-1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,81:86:99:3251,168,0 -chr8 40141431 . A G 3811.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=1.826;DP=114;FS=7.141;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.477;QD=33.44;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,72:76:99:3840,268,0 -chr8 40141455 . T A 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=3.772;DP=70;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.016;QD=14.67;ReadPosRankSum=-2.959 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,28:34:99:1055,0,102 -chr8 40148703 . G GTC 518.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=8.109;DP=386;FS=10.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=1.34;ReadPosRankSum=-5.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:266,48:314:99:556,0,11541 -chr8 40454900 . A C 413.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=-0.731;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=29.47;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89:442,0,89 -chr8 40454920 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.449;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=14.23;ReadPosRankSum=-0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:327,0,718 -chr8 40455061 . C A 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.176;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:350,0,430 -chr8 40465521 . C A 470.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:499,36,0 -chr8 40466909 . G T 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 -chr8 40466924 . G T 330.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:359,27,0 -chr8 40582835 . T C 226.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:255,18,0 -chr8 41156835 . A G 367.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:396,27,0 -chr8 41200882 . G A 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.636;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.485;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:395,0,130 -chr8 41200902 . G C 346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.778;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.344;QD=24.77;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:375,0,125 -chr8 41211873 . C T 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.762;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:274,0,51 -chr8 41522628 . G A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.050;DP=35;FS=3.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:617,0,617 -chr8 41821862 . AC A 461.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=-1.403;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,26:100:99:499,0,2536 -chr8 41822948 . T C 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=-0.951;DP=21;FS=1.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:347,0,380 -chr8 41836940 . C CT 508.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=1.323;DP=111;FS=2.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,32:102:99:546,0,1896 -chr8 42063634 . G A 1682.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1711,123,0 -chr8 42063700 . C A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 -chr8 42063876 . C G 3131.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=-1.399;DP=143;FS=1.770;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=21.90;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,78:85:87:3160,87,0 -chr8 42134101 . C A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.540;DP=26;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:414,0,759 -chr8 42191347 . C G 2080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=-0.287;DP=120;FS=5.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,66:120:99:2109,0,1890 -chr8 42191711 . GT G 212.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.674;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=10.64;ReadPosRankSum=-2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:250,0,113 -chr8 42192423 . G T 1476.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=1.022;DP=69;FS=2.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.257;QD=21.40;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,43:69:99:1505,0,1550 -chr8 42525785 . T A 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.921;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=18.76;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:591,0,460 -chr8 42525826 . T C 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=-1.403;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=17.14;ReadPosRankSum=2.063 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,18:35:99:628,0,615 -chr8 42526925 . G A 2838.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=-2.959;DP=79;FS=9.483;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=25.85;ReadPosRankSum=1.941 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,72:79:99:2867,101,0 -chr8 42620237 . GA G 528.19 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=-1.415;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,20:23:4:564,4,0 -chr8 42620436 . A G 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.247;DP=32;FS=3.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.728;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,14:32:99:466,0,624 -chr8 42620506 . A G 489.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=-0.771;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:41:99:518,0,860 -chr8 42620758 . T A 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.896;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:268,0,145 -chr8 42621065 . G C 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-1.193;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.954;QD=9.57;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:258,0,767 -chr8 42621111 . A T 524.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.494;DP=31;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.771;QD=16.93;ReadPosRankSum=-0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:553,0,523 -chr8 42621150 . A C 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.215;DP=30;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.473;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:297,0,967 -chr8 42621283 . A G 1215.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=-1.129;DP=32;FS=7.364;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.506;QD=34.18;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:48:1244,48,0 -chr8 42621386 . G T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.953;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=1.164;QD=18.80;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:329,0,331 -chr8 42621425 . C CT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.555;DP=12;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=19.06;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:67:266,0,67 -chr8 42621464 . A G 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-2.003;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:353,0,50 -chr8 42621514 . AT A 229.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.158;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=20.88;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:60:267,0,60 -chr8 42621660 . A C 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=1.056;DP=19;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.211;QD=11.04;ReadPosRankSum=-2.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:238,0,473 -chr8 42621710 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=1.023;DP=23;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=14.82;ReadPosRankSum=2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:369,0,433 -chr8 42621859 . A C 1339.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=1.462;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=29.66;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:28:1368,28,0 -chr8 42622342 . T C 1354.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-1.782;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=34.72;ReadPosRankSum=1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,35:39:11:1382,0,11 -chr8 42622527 . A C 543.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.270;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=16.48;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,17:33:99:572,0,759 -chr8 42622588 . A G 720.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.468;DP=33;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:99:749,0,426 -chr8 42622688 . G A 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=-1.109;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.294;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:81:329,0,81 -chr8 42622784 . T C 770.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.320;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=33.51;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:21:799,0,21 -chr8 42623222 . A G 1086.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.573;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.813;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,34:62:99:1115,0,964 -chr8 42623594 . A G 518.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.968;DP=76;FS=3.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,22:76:99:547,0,2046 -chr8 42623698 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=-0.769;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,17:51:99:487,0,1306 -chr8 42623975 . A T 1468.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.137;DP=63;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=23.31;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,43:62:99:1497,0,500 -chr8 42624278 . T A 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=-1.045;DP=60;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.242;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:331,0,1578 -chr8 42624310 . A G 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=-1.321;DP=48;FS=1.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=5.00;ReadPosRankSum=2.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,12:48:99:268,0,1315 -chr8 42627246 . T C 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=-1.106;DP=50;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.703;QD=27.38;ReadPosRankSum=-0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,37:50:99:1397,0,298 -chr8 42627321 . A C 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.471;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.398;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,35:54:99:1236,0,582 -chr8 42627480 . T C 1075.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.292;DP=42;FS=1.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=25.61;ReadPosRankSum=-0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:42:99:1104,0,275 -chr8 42785231 . C T 411.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:440,33,0 -chr8 42785269 . A G 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr8 43282170 . TGGTAAGCAAGTTTGTGTGAATATATTGACCAGCTGTGGTGACTGTTGCTAAACTTTTTGTGTAACTCTTGGTCA T 14005.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-1.633;DP=353;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=29.27;ReadPosRankSum=1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,350:353:99:14793,378,0 -chr8 43492651 . G A 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=-0.501;DP=100;FS=4.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.728;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,22:96:99:382,0,3606 -chr8 43500645 . AAGGTCAGTCTTGGAAGAGGTCTGATTCTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCATTTAAAACATTTATCTCTCTTTTTGTCTTCATATTCTCACTC A 5180.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=1.588;DP=110;FS=2.535;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=29.58;ReadPosRankSum=-0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,95:98:99:5218,438,0 -chr8 43501255 . A G 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:51:707,51,0 -chr8 43501256 . A G 678.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:51:707,51,0 -chr8 43501292 . A G 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-1.061;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=29.25;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:350,0,50 -chr8 43527436 . C G 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.583;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.971;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:260,0,964 -chr8 44027953 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:89:288,0,89 -chr8 44027956 . G A 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=12.37;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:89:288,0,89 -chr8 44126203 . C G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.408;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.743;QD=11.85;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:360,0,717 -chr8 44129990 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=1.910;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.868;QD=14.42;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:259,0,350 -chr8 44130048 . T C 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.491;ClippingRankSum=-1.299;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:331,0,302 -chr8 44131470 . G A 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=-3.443;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.984;QD=7.28;ReadPosRankSum=-1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:254,0,953 -chr8 44131478 . T C 709.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:54:738,54,0 -chr8 44664567 . A G 640.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-2.475;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=16.02;ReadPosRankSum=2.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:669,0,695 -chr8 45194740 . G A 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=-1.139;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=22.49;ReadPosRankSum=1.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:388,0,215 -chr8 45491995 . G GT 249.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=-0.470;DP=126;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,25:116:99:287,0,2502 -chr8 45795167 . T C 1053.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.756;DP=141;FS=5.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.095;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.802 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,41:129:99:1082,0,3444 -chr8 45795288 . T C 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=-3.222;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=17.61;ReadPosRankSum=3.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,15:31:99:574,0,543 -chr8 45795896 . G A 2535.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=-1.686;DP=230;FS=2.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=11.03;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,80:164:99:2564,0,2845 -chr8 45796010 . A G 2506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=-0.040;DP=245;FS=5.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.345;QD=10.23;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,81:208:99:2535,0,5111 -chr8 45796313 . G A 1536.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.535;DP=125;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,46:113:99:1565,0,2299 -chr8 45796410 . G C 1939.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=-0.830;DP=119;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.032;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,54:112:99:1968,0,1903 -chr8 45913260 . C G 1668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1697,114,0 -chr8 45913261 . A C 1668.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1697,114,0 -chr8 45926656 . CT C 298.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.589;DP=30;FS=6.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:336,0,321 -chr8 46321407 . A C 353.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.537;DP=18;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.041;QD=19.65;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:52:382,0,52 -chr8 46321999 . C A 322.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:351,24,0 -chr8 46490950 . C G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 -chr8 46504228 . G A 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.337;DP=24;FS=1.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.888;QD=22.74;ReadPosRankSum=1.378 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,16:24:99:574,0,226 -chr8 46529582 . A T 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=-1.444;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.243;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:840,0,974 -chr8 46529585 . T A 811.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=-1.144;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=23.19;ReadPosRankSum=1.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:35:99:840,0,974 -chr8 46529693 . T A 1493.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1522,111,0 -chr8 46530213 . G A 1173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-2.045;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=24.45;ReadPosRankSum=1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,32:48:99:1202,0,432 -chr8 46531565 . G A 1336.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=-0.744;DP=36;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=35.55;ReadPosRankSum=-0.916 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:16:1365,16,0 -chr8 46533171 . A G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.211;DP=44;FS=4.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.907;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,26:43:99:868,0,554 -chr8 46533216 . A G 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=-0.528;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.341;QD=15.40;ReadPosRankSum=-2.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:783,0,1120 -chr8 46534060 . T G 1379.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.777;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.414;QD=33.65;ReadPosRankSum=1.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,36:41:23:1408,0,23 -chr8 46534090 . A T 568.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.807;DP=41;FS=1.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.569;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:41:99:597,0,823 -chr8 46535036 . C T 714.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-0.213;DP=24;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=29.78;ReadPosRankSum=0.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:743,0,109 -chr8 46535045 . T A 1101.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:78:1130,78,0 -chr8 46845753 . G A 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=-1.373;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:369,0,757 -chr8 47480620 . TCCTGTAAAACACAGGGGTTGTCACTCTTGCAAATAAAAACATTTATATAACATTACCACAATAAAAATGGGAATTA T 10412.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=2.702;DP=239;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.097;QD=24.54;ReadPosRankSum=-2.979 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:239:99:10450,873,0 -chr8 47883872 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:253,18,0 -chr8 47883879 . A G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 -chr8 47909836 . C G 1465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=-0.363;DP=237;FS=1.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,62:236:99:1494,0,6535 -chr8 47918094 . G GT 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.054;DP=141;FS=1.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,35:121:99:387,0,3048 -chr8 47918216 . T C 3376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=1.528;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=29.35;ReadPosRankSum=-0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,16:21:99:3405,184,0 -chr8 47918341 . T C 1185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=-0.696;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=31.90;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:94:1214,0,94 -chr8 47918404 . T C 577.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.642;DP=63;FS=3.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.959;QD=9.17;ReadPosRankSum=-1.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,22:63:99:606,0,1966 -chr8 47921660 . T C 540.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:569,42,0 -chr8 47921729 . C T 406.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.296;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.803;QD=21.41;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:435,0,241 -chr8 47921781 . C A 334.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=-0.449;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:363,0,276 -chr8 47951168 . G A 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.127;DP=257;FS=1.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.105;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,58:257:99:1149,0,7403 -chr8 48440273 . T C 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.196;DP=70;FS=5.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,15:70:99:281,0,2097 -chr8 48653614 . TCCTGGAAAAGACCATTTTTTTTCTCCCAACTACATTTATGACTGTATTTATAACTGATTTCACAGTTAAATGCTACTTTATGAACTTA T 814.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=6.624;DP=251;FS=3.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.065;QD=3.25;ReadPosRankSum=-5.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,197:213:99:852,0,1742 -chr8 48653751 . G GT 312.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=-1.341;DP=215;FS=5.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=0.504;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:143,39:182:99:350,0,3771 -chr8 49081929 . GCCTACGAATTAAAGTGATTTCAAAGATTAGCATATTGTTCAGACACTGACATAAACTTGGATTTATTAGTATTGTATGTATTGCCAAAGAAACAAAGTTAAGATACTTA G 1244.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=1.944;DP=35;FS=5.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.218;QD=35.86;ReadPosRankSum=-1.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,31:35:99:1282,0,984 -chr8 49305447 . TCTAGACAGAAAACAAAGGCAATCAGAAAAAAATACATCTACCCCAACACAAATATAAAAAGAAAACTGGAGAAAATAATCAC T 3638.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=-0.120;DP=463;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:303,148:451:99:3676,0,13441 -chr8 49305449 . TAGACAGAAAACAAA T 12848.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.904;DP=461;FS=0.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=27.87;ReadPosRankSum=3.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:148,303:451:99:13150,0,4817 -chr8 49305465 . GCAATCAGAAAAAAATACATCTACCCCAACACAAATATAAAAAGAAAACTGGAGAAAATAATCACCTGA G 10358.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=1.391;DP=547;FS=4.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.945;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:176,312:488:99:10396,0,5956 -chr8 49476509 . G A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=-2.799;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.466;QD=13.76;ReadPosRankSum=1.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:276,0,344 -chr8 49485594 . G A 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.996;DP=18;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.181;QD=11.76;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:240,0,410 -chr8 49779361 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=-0.342;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.342;QD=12.99;ReadPosRankSum=1.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:249,0,370 -chr8 49779623 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.276;ClippingRankSum=0.733;DP=20;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.582;QD=11.39;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:256,0,423 -chr8 49780148 . G A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=-0.887;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:402,0,269 -chr8 49813463 . C T 782.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=1.789;DP=361;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:296,64:360:99:811,0,11774 -chr8 49824007 . CT C 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=1.169;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.190;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:99:311,0,405 -chr8 49842471 . AAGGTATGGGAATGTTTTCCTGATGCTATCAATTGTGTTATAAATCAATGTGTTTTCGACTAACGGCTGACTCCTGCGCTC A 7253.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=1.039;DP=219;FS=5.286;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=33.12;ReadPosRankSum=-0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,186:195:99:7291,475,0 -chr8 49858445 . C T 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=4.364;DP=141;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.320;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,25:141:99:327,0,7378 -chr8 49864558 . C CA 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=1.367;DP=140;FS=8.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=0.330;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.492 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,36:125:99:531,0,2421 -chr8 49866217 . C T 2979.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=-0.851;DP=186;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=16.02;ReadPosRankSum=1.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,84:185:99:3008,0,3290 -chr8 49880549 . T TC 1858.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-2.968;DP=164;FS=7.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=11.33;ReadPosRankSum=1.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,74:150:99:1896,0,2008 -chr8 49880724 . C T 1776.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-1.645;DP=145;FS=3.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.191;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,53:144:99:1805,0,3946 -chr8 49880901 . TC T 1033.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.199;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=11.88;ReadPosRankSum=0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,27:76:99:1116,0,2839 -chr8 49909066 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=1.196;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:274,0,401 -chr8 49914835 . T TA 216.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.722;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:254,0,209 -chr8 49915541 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=-0.310;DP=33;FS=3.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.164;QD=14.72;ReadPosRankSum=1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:514,0,628 -chr8 49917021 . C A 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.954;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:425,0,718 -chr8 49918068 . G T 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.080;DP=27;FS=1.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,10:27:99:337,0,1179 -chr8 49933390 . C T 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-1.169;DP=73;FS=0.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,40:73:99:1357,0,1193 -chr8 49934396 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.961;DP=53;FS=2.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.093;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:308,0,1500 -chr8 49992421 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-0.417;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:551,0,156 -chr8 49993220 . C G 532.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.569;DP=34;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.776;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:34:99:561,0,626 -chr8 50023823 . G A 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.235;DP=79;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=9.17;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,26:79:99:753,0,1977 -chr8 50034306 . C T 644.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=-0.731;DP=83;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.468;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,26:83:99:673,0,2192 -chr8 50036381 . G T 1298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=1.031;DP=87;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.013;QD=14.93;ReadPosRankSum=-0.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,38:87:99:1327,0,1646 -chr8 50037387 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.576;DP=120;FS=5.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:91,29:120:99:617,0,3500 -chr8 50086845 . C T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=1.213;DP=46;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.888;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,12:46:99:278,0,1204 -chr8 50091440 . C T 794.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=-1.262;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=13.03;ReadPosRankSum=2.192 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:823,0,1505 -chr8 50107027 . T G 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=-0.335;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.210;QD=6.56;ReadPosRankSum=1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:238,0,864 -chr8 50701835 . CT C 377.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=-0.181;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=19.88;ReadPosRankSum=-1.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:415,0,494 -chr8 50775847 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=-0.728;DP=52;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.357;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:256,0,2754 -chr8 50821111 . A T 734.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.578;DP=26;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.152;QD=28.26;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,20:26:99:763,0,138 -chr8 50822263 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.318;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:414,0,403 -chr8 50822287 . C T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=-1.310;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.549;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:417,0,242 -chr8 50833692 . A G 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:341,24,0 -chr8 51210181 . CCAGGTAGGGCTGAGATCAAAACCGATCTGCATCGTTGAGGGGATTTATTCTTAATCAGTGTTTCTCTTGGT C 12612.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=1.102;DP=340;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.274;QD=28.86;ReadPosRankSum=1.042 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,323:326:99:12650,943,0 -chr8 51218641 . CT C 2317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=-2.625;DP=55;FS=10.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.390;QD=31.46;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,21:55:99:2355,0,859 -chr8 51219192 . C CT 317.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.479;DP=85;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.730;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,31:72:99:630,0,593 -chr8 51219398 . T TG 6994.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=-3.890;DP=302;FS=2.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,202:301:99:7032,0,2334 -chr8 51219564 . A AT 603.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=-0.204;DP=114;FS=5.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.378;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,37:107:99:641,0,1797 -chr8 51226441 . C A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.799;ClippingRankSum=-1.022;DP=18;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=13.21;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:266,0,307 -chr8 51325984 . A AT 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.456;DP=20;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=11.09;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:259,0,230 -chr8 51352988 . T A 200.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:17:229,17,0 -chr8 51480668 . A G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.198;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:42:317,0,42 -chr8 51480787 . T C 682.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=2.141;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.518;QD=29.69;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:711,0,147 -chr8 51480917 . A T 1170.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.289;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=27.65;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:17:1199,0,17 -chr8 51480998 . GA G 215.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=1.022;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=10.27;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:253,0,327 -chr8 51481104 . A T 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=2.822;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=8.45;ReadPosRankSum=-1.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:341,0,651 -chr8 51481355 . T C 437.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=-2.123;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.444;QD=20.85;ReadPosRankSum=1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:38:492,0,38 -chr8 51481371 . T A 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=-0.849;DP=23;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:516,0,119 -chr8 51481443 . A C 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-1.580;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=14.32;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:65:243,0,65 -chr8 51485091 . C G 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-1.684;DP=17;FS=4.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:272,0,287 -chr8 51570096 . T A 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-0.191;DP=166;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,29:166:99:447,0,5515 -chr8 51570887 . T C 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.322;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.182;QD=29.81;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:49:386,0,49 -chr8 51570962 . T C 403.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.370;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:432,0,548 -chr8 51571338 . A AT 389.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=-0.973;DP=164;FS=11.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.662;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,33:159:99:427,0,3577 -chr8 51571513 . C T 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=1.447;DP=42;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.148;QD=12.64;ReadPosRankSum=-0.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,2:42:99:559,0,2489 -chr8 51571535 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=-0.085;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.31;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:236,0,1324 -chr8 51571965 . A G 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-1.664;DP=264;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,41:263:99:440,0,8714 -chr8 51582324 . C T 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-2.040;DP=294;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=1.25;ReadPosRankSum=2.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:251,43:294:99:396,0,9836 -chr8 51669623 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.253;DP=85;FS=2.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,16:85:99:232,0,2450 -chr8 51674273 . G A 1286.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.663;DP=105;FS=2.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.175;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,40:105:99:1315,0,2125 -chr8 52006702 . TA T 202.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=1.464;DP=293;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=0.69;ReadPosRankSum=-1.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:249,40:289:99:295,0,6917 -chr8 52007196 . AAAAG A 1297.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=-2.411;DP=342;FS=1.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=3.79;ReadPosRankSum=-1.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:301,4:305:99:1335,0,15110 -chr8 52016814 . GCCTGGAAAGAGAAAGAACTAATTAGAAACATGTTCAACAAGCAAACCAGGAGTCAAATGATTTCAATCTGA G 17025.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=341;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,332:332:99:17063,1396,0 -chr8 52020297 . A G 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=-0.117;DP=533;FS=5.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:459,72:531:99:356,0,17845 -chr8 52126036 . C T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=-0.535;DP=23;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.913;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:302,0,505 -chr8 52129002 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=-0.340;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:291,0,507 -chr8 52129093 . C G 393.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:30:422,30,0 -chr8 52143213 . G T 326.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=-0.123;DP=27;FS=21.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.469;QD=12.10;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:355,0,663 -chr8 52197695 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.057;DP=33;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.936;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:312,0,797 -chr8 52222362 . T G 530.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=-2.049;DP=138;FS=2.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.507;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,29:138:99:559,0,4112 -chr8 52227205 . A G 492.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.008;ClippingRankSum=0.899;DP=53;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.610;QD=9.30;ReadPosRankSum=-4.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:521,0,1454 -chr8 52227211 . T G 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=4.848;DP=53;FS=1.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=4.73;ReadPosRankSum=-3.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:279,0,3093 -chr8 52227850 . C T 926.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=1.535;DP=132;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:94,38:132:99:955,0,3491 -chr8 52293526 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.058;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.984;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:251,0,302 -chr8 52584748 . A G 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=-0.589;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=28.25;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:56:339,0,56 -chr8 52612914 . C A 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.811;DP=13;FS=5.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.811;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:275,0,215 -chr8 52614842 . T TC 306.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.204;DP=19;FS=8.512;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=0.122;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:344,0,295 -chr8 52644269 . G A 328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.223;DP=102;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,21:102:99:357,0,3010 -chr8 52647703 . C G 10060.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.003;DP=433;FS=5.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.310;QD=23.24;ReadPosRankSum=-0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,288:433:99:10089,0,5139 -chr8 52647722 . C T 11549.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=-0.525;DP=500;FS=7.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.329;QD=23.10;ReadPosRankSum=3.460 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,330:500:99:11578,0,5731 -chr8 52651959 . G GA 964.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=-0.176;DP=290;FS=12.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:184,82:266:99:1064,0,4541 -chr8 52757569 . G A 1297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=-5.225;DP=51;FS=11.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.430;QD=25.45;ReadPosRankSum=5.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,34:51:99:1326,0,461 -chr8 52768791 . C G 839.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=-0.806;DP=152;FS=4.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,38:152:99:868,0,4355 -chr8 53112019 . GCTGGACAGACACCAGACATAAAGATTTAAGAAATGACCGATTCATTTGGAGAGTCGGGAGCTCATGTGTGTGTCACTCAC G 4108.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=1.236;DP=115;FS=2.091;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.613;QD=25.77;ReadPosRankSum=-2.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,104:107:99:4146,344,0 -chr8 53178377 . C T 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.480;DP=10;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=27.28;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:47:301,0,47 -chr8 53216272 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.970;DP=26;FS=3.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.755;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:306,0,617 -chr8 53216427 . T C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=-0.027;DP=25;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.789;QD=15.87;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:425,0,434 -chr8 53216614 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.244;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:257,0,350 -chr8 53218673 . C T 550.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=-2.335;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=18.99;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:579,0,1082 -chr8 53231260 . T A 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=-1.462;DP=76;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.261;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:285,0,2414 -chr8 53235573 . A G 872.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=2.191;DP=109;FS=0.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.072;QD=8.01;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,25:65:99:901,0,2121 -chr8 53235624 . T C 706.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.037;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.147;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,23:34:99:735,0,1215 -chr8 53235833 . A AC 530.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=1.415;DP=30;FS=12.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.433;QD=17.69;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:568,0,1248 -chr8 53235857 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.651;DP=34;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=15.88;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:568,0,1254 -chr8 53235898 . G A 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=-0.578;DP=69;FS=3.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:335,0,1830 -chr8 53431404 . T G 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.235;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.470;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:379,0,555 -chr8 53521509 . T C 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.540;DP=130;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:107,21:128:99:229,0,3862 -chr8 53586829 . T A 627.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=-1.637;DP=97;FS=14.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.47;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,26:96:99:656,0,2733 -chr8 53710129 . T C 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=-0.512;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.921;QD=9.64;ReadPosRankSum=0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:250,0,1300 -chr8 53711858 . T C 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-1.036;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=20.58;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:234,0,131 -chr8 54001432 . A G 398.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.691;DP=37;FS=3.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.691;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:99:427,0,139 -chr8 54001605 . G T 1013.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=31.97;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:74:1042,74,0 -chr8 54001654 . A G 618.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.634;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:62:647,0,62 -chr8 54001723 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-1.221;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:93:252,0,93 -chr8 54104773 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.533;DP=14;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:336,0,164 -chr8 54203914 . C T 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.094;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.724;QD=12.34;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:312,0,460 -chr8 54290849 . T A 1081.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=-0.786;DP=56;FS=7.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,32:56:99:1110,0,855 -chr8 54293824 . G T 1194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.362;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.584;QD=18.10;ReadPosRankSum=-0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,37:66:99:1223,0,1027 -chr8 54294213 . T C 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.298;DP=58;FS=4.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.010;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,12:58:99:256,0,1720 -chr8 54321231 . T A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.783;DP=62;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.008 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,14:62:99:276,0,1793 -chr8 54323697 . C T 364.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=-1.772;DP=71;FS=1.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.004;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,17:71:99:393,0,2103 -chr8 54386620 . A T 283.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:312,21,0 -chr8 54387082 . G A 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-0.012;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.151;QD=9.17;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,14:47:99:459,0,2945 -chr8 54387092 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.116;DP=54;FS=2.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:454,0,2945 -chr8 54424839 . T G 281.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:310,21,0 -chr8 54579846 . GAAAA G 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,0:1:99:278,0,213 -chr8 54579856 . TAAATCAACTATAACAACAACATGAATATTAGAAAGAAAAAA T 240.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.107;DP=22;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:278,0,213 -chr8 54584215 . G A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=-1.093;DP=13;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:263,0,200 -chr8 54584372 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=3.264;DP=22;FS=4.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=14.63;ReadPosRankSum=-2.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:350,0,359 -chr8 54587187 . G GT 228.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.741;DP=17;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQ0=0;MQRankSum=2.752;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:266,0,614 -chr8 54587191 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.106;DP=16;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=3.281;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:266,0,614 -chr8 54600888 . C G 2921.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=-1.157;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.148;QD=32.46;ReadPosRankSum=0.564 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,78:90:81:2950,0,81 -chr8 54626021 . A G 632.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=-0.044;DP=38;FS=4.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=16.65;ReadPosRankSum=-0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,20:38:99:661,0,656 -chr8 54626036 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=-0.510;DP=37;FS=3.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=13.56;ReadPosRankSum=-0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,15:37:99:530,0,940 -chr8 54626836 . A G 367.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=-1.573;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.097;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:396,0,1434 -chr8 54626969 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=-1.111;DP=38;FS=1.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.215;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:308,0,1339 -chr8 54686705 . T A 278.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:307,21,0 -chr8 54698639 . TGGTATGAGTCTGTCTGCAGTGTTTCTCAGTCTGATTAAACTTTGCGTGACGGATGTTAGCCTGTAGACGAGTCAGATTGACCGTTTCAGTATCGATCATGACTTGTGGTGTGATTTA T 5098.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=2.144;DP=139;FS=1.758;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.916;QD=38.62;ReadPosRankSum=-1.289 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,126:131:99:5136,378,0 -chr8 54721387 . AGTAAGCGTTTTGATTTAATCATTGTGTATTGGAGGTTTGGGTGAAGGTGGTTGATGTTAAATGACTAACTTGAGTTTAATGTGTGTTTTTCTACAG A 219.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=8;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.47;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:99:257,0,789 -chr8 54861165 . A C 396.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.805;DP=27;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=14.70;ReadPosRankSum=1.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:425,0,1168 -chr8 54861388 . T G 379.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:30:408,30,0 -chr8 54864134 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=-0.028;DP=25;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.083;QD=13.47;ReadPosRankSum=1.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:365,0,1081 -chr8 54866954 . T C 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=1.110;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.939;QD=11.74;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:439,0,653 -chr8 54886747 . A G 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-0.454;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:522,0,158 -chr8 54897223 . C T 395.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.843;DP=25;FS=6.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=15.83;ReadPosRankSum=-1.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:424,0,408 -chr8 54897463 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=1.733;DP=16;FS=1.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.313;QD=15.24;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:272,0,290 -chr8 54976904 . GTGCAACAGCTTGACATTTTATGATGTTTCACAAATGATATTATAATTTTCTTTTATTGTTTGCTA G 10737.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.432;ClippingRankSum=2.970;DP=236;FS=2.233;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.756;QD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,232:235:99:10775,1061,0 -chr8 54976973 . CAAACCATTTTAACCCTGTATTTGTAATCTTTTAGGAGGT C 10779.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=2.542;DP=259;FS=2.059;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.544;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,254:258:99:10817,1063,0 -chr8 55062945 . T C 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=-0.154;DP=26;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.462;QD=26.87;ReadPosRankSum=1.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:1141,0,1066 -chr8 55063077 . T A 1112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.612;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=16.86;ReadPosRankSum=0.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:1141,0,1066 -chr8 55176238 . C CTG 292.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.818;DP=134;FS=2.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=2.18;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:330,0,1600 -chr8 55236398 . C T 3201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.144;DP=282;FS=5.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,101:280:99:3231,0,6041 -chr8 55236482 . T A 1121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=-1.829;DP=295;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:228,66:294:99:1150,0,9165 -chr8 55315497 . G A 879.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=2.739;DP=39;FS=16.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=22.56;ReadPosRankSum=-2.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:0:905,0,0 -chr8 55321647 . GC G 221.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=19;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,1:8:99:259,0,2383 -chr8 55321713 . T C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.449;DP=123;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.048;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,14:74:99:251,0,2383 -chr8 55321775 . C T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=1.247;DP=113;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.110;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,17:62:99:386,0,2435 -chr8 55321797 . T A 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.587;DP=88;FS=11.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.307;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,15:40:99:401,0,1857 -chr8 55321816 . G C 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=1.504;DP=47;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=4.74;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:251,0,514 -chr8 55348877 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=2.266;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:306,0,782 -chr8 55348963 . C T 563.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.702;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.167;QD=24.51;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:592,0,154 -chr8 55354597 . G A 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=1.747;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.286;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:22:99:404,0,338 -chr8 55357293 . A G 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=-0.688;DP=21;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:280,0,422 -chr8 55359913 . C T 2619.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=-0.598;DP=186;FS=2.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=14.08;ReadPosRankSum=0.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,68:186:99:2648,0,12767 -chr8 55361276 . G A 3128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=-2.467;DP=244;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.054;QD=12.82;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:153,90:243:99:3157,0,5277 -chr8 55375356 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.895;DP=25;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:407,0,468 -chr8 55408267 . A T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=-2.199;DP=20;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=22.24;ReadPosRankSum=-1.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:473,0,596 -chr8 55408268 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-1.629;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=21.18;ReadPosRankSum=-1.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:473,0,596 -chr8 55408338 . C T 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=2.193;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,22:99:99:428,0,3621 -chr8 55510496 . C T 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=-0.511;DP=73;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,24:73:99:604,0,1799 -chr8 55545621 . G A 450.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.680;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.074;QD=15.54;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,16:29:99:479,0,434 -chr8 55550189 . G A 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.174;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,18:45:99:588,0,893 -chr8 55555847 . G A 2280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=2.138;DP=190;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=12.00;ReadPosRankSum=-2.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,11:89:99:2309,0,8063 -chr8 55555902 . C T 2281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=4.532;DP=458;FS=6.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=4.98;ReadPosRankSum=3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:144,72:216:99:2310,0,8017 -chr8 55556012 . T C 538.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=1.055;DP=81;FS=11.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.024;QD=6.65;ReadPosRankSum=0.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,5:52:99:567,0,4315 -chr8 55556080 . T TGG 542.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.474;DP=40;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:580,0,4315 -chr8 55556212 . T A 525.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=-1.020;DP=32;FS=1.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:554,0,4315 -chr8 55556222 . T C 528.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=2.646;DP=44;FS=1.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=12.02;ReadPosRankSum=-2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:557,0,4315 -chr8 55558398 . T C 692.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.082;DP=53;FS=1.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.518;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:53:99:721,0,1111 -chr8 55558691 . A G 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=1.010;DP=52;FS=1.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,12:52:99:248,0,2361 -chr8 55558696 . C A 612.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-1.302;DP=47;FS=6.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.514;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,18:47:99:641,0,1452 -chr8 55558835 . T C 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=1.077;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:236,0,1004 -chr8 55559010 . A G 511.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.633;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.560;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,15:33:99:540,0,633 -chr8 55559084 . T G 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=-0.713;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:257,0,876 -chr8 55593288 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=-0.026;DP=26;FS=3.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=11.99;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:340,0,554 -chr8 55599123 . C G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.592;DP=52;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.310 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:307,0,1413 -chr8 55724361 . T G 343.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:27:372,27,0 -chr8 55724531 . G T 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.831;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:273,0,151 -chr8 55724595 . G C 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:24:335,24,0 -chr8 55764021 . C A 932.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=1.595;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.763;QD=25.42;ReadPosRankSum=0.763 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72:961,72,0 -chr8 55769209 . T C 617.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.717;DP=55;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.027;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:646,0,1326 -chr8 55769221 . T C 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.703;DP=63;FS=1.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.521;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:287,0,1980 -chr8 55769595 . C G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=-0.523;DP=101;FS=3.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,17:100:99:231,0,3210 -chr8 55770769 . TTCACCTGATCAAACAAAACACGAGCACCATAAGCCCAGCAGATATACTGTAAATCTGTGAATAATGCTGACTAATGC T 577.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=3.215;DP=122;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.072;QD=4.74;ReadPosRankSum=-2.427 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,105:109:99:615,233,0 -chr8 55856476 . A G 943.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=1.257;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.645;QD=30.99;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,20:25:99:972,0,291 -chr8 56085674 . A G 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=2.261;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=18.05;ReadPosRankSum=-2.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:335,0,596 -chr8 56085679 . A T 306.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=1.794;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.174;QD=20.45;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:335,0,596 -chr8 56085933 . A G 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.184;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=30.32;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:483,0,852 -chr9 29285 . T C 321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.118;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=29.25;ReadPosRankSum=-2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:55:350,0,55 -chr9 50485 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=5.804;DP=258;FS=23.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.04;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=0.89;ReadPosRankSum=-4.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,35:258:99:259,0,18127 -chr9 51838 . G A 373.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=-1.368;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.823;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:411,0,435 -chr9 54872 . A G 1368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=-0.425;DP=494;FS=7.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.408;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.012 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:400,93:493:99:1397,0,22037 -chr9 151343 . A C 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=-0.664;DP=24;FS=6.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:449,0,845 -chr9 151345 . A G 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=-0.945;DP=20;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.247;QD=21.04;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:449,0,845 -chr9 152554 . A T 471.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.396;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.697;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,16:32:99:500,0,579 -chr9 181244 . C T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.463;DP=66;FS=2.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.078;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,14:66:99:264,0,1902 -chr9 184612 . TGGTAATCACACACTCGACTCTTCTAACATGTATTTGCTGGATCTTAATATAACTTTAATCTGACTTTGTGATCCACTCA T 3527.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.484;DP=82;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=26.72;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,78:82:99:3565,290,0 -chr9 230895 . T A 1181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=-2.030;DP=252;FS=1.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.697;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:190,60:250:99:1210,0,9010 -chr9 231464 . T TA 246.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=-0.078;DP=183;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.403;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:142,36:178:99:284,0,8254 -chr9 236418 . T C 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=-0.683;DP=88;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=5.28;ReadPosRankSum=1.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,19:60:99:493,0,1570 -chr9 242902 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=-0.271;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:303,0,170 -chr9 272098 . A G 272.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=-0.716;DP=24;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.119 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:301,0,613 -chr9 272310 . A G 352.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=1.595;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.228;QD=17.64;ReadPosRankSum=1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:381,0,538 -chr9 272353 . A G 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.543;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.398;QD=11.80;ReadPosRankSum=-2.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:276,0,511 -chr9 289511 . C CGTG 421.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:30:459,30,0 -chr9 295220 . TCCTGAAACACACACACACAGGTTATGGAGAGCAGAGATTATGAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTA T 4655.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=1.819;DP=121;FS=8.850;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.182;QD=33.87;ReadPosRankSum=-2.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,117:121:99:4693,426,0 -chr9 326494 . C A 269.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-0.338;DP=52;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.486;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:298,0,1460 -chr9 330791 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=-1.312;DP=102;FS=5.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.593;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,18:102:99:230,0,4123 -chr9 332604 . C T 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=-0.037;DP=100;FS=3.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.126;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,22:100:99:345,0,2593 -chr9 337839 . T A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=-0.946;DP=49;FS=1.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.683;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,11:49:99:262,0,1483 -chr9 381661 . G T 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=-0.155;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=17.08;ReadPosRankSum=-1.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:23:99:421,0,342 -chr9 381732 . ACAGGTCATCATCCCTGCAGTCATACACCGACACACACACGCTCGTGCGCAGAACATCTTCACTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG A 1299.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=1.621;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=27.85;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:99:1337,100,0 -chr9 413202 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=-0.399;DP=114;FS=3.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.628 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,22:114:99:305,0,5474 -chr9 418830 . C A 817.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.385;DP=149;FS=3.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,38:148:99:846,0,4028 -chr9 422863 . C T 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=-0.208;DP=151;FS=2.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.414;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:126,25:151:99:356,0,5032 -chr9 429814 . GCCTGAACCATGGAGAACGTGCAGCTTCACTGAGTCTCCGGGAGAACTGAGCTCACGCCGCGCTGATGAACACTGAAGAGAAATAAGAGACTCA G 232.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,1:12:99:270,0,1789 -chr9 444024 . G T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.192;DP=107;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.388;QD=3.04;ReadPosRankSum=1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,21:107:99:353,0,3117 -chr9 453791 . GGGTAGGGCGCGCTCGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGACCTGAATGTGTGTGTGTGTTCTCTCCACA G 13190.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.504;DP=310;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=33.66;ReadPosRankSum=0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,305:309:99:13228,1137,0 -chr9 454300 . G GAGTCATCT 2426.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=10.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:2464,140,0 -chr9 457676 . G A 459.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-1.478;DP=261;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,43:261:99:488,0,8210 -chr9 458857 . A G 574.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=-2.661;DP=28;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=20.53;ReadPosRankSum=1.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:603,0,308 -chr9 458958 . A G 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-1.743;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.411;QD=25.72;ReadPosRankSum=1.704 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:877,0,375 -chr9 459840 . C T 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=-0.440;DP=224;FS=0.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:177,46:223:99:617,0,7050 -chr9 459935 . AGCCGCAGGTAGGCC A 4211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=-0.526;DP=185;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=22.77;ReadPosRankSum=0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,120:175:99:4249,0,1860 -chr9 459938 . CGCAGGTAGGCCACCGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 986.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=1.228;DP=190;FS=1.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,49:171:99:1024,0,5188 -chr9 459952 . CGCACGGCATGCTGGGAGTCAGCTGTACGTACCAAAGAGTGTTAAACTCTGCTTCACTGTCTGCCCCG C 4211.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=-0.750;DP=179;FS=2.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=23.53;ReadPosRankSum=-0.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,112:163:99:4249,0,1291 -chr9 461593 . TA T 411.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=-2.277;DP=31;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.462;QD=13.28;ReadPosRankSum=1.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:449,0,229 -chr9 495709 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=-1.092;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.186;QD=14.52;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,18:36:99:551,0,965 -chr9 499061 . T A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=-2.155;DP=91;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,17:89:99:360,0,2775 -chr9 514060 . GA G 426.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=-1.161;DP=73;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.238;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,23:70:99:464,0,1008 -chr9 568744 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=-0.618;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,17:82:99:318,0,2611 -chr9 568998 . G A 593.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=-1.173;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.332;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.022 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:622,0,1212 -chr9 569244 . T C 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.593;DP=106;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.509;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,18:106:99:240,0,3597 -chr9 575141 . T C 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.959;DP=53;FS=4.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.630;QD=7.30;ReadPosRankSum=-1.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,16:53:99:415,0,1208 -chr9 586209 . C G 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-0.306;DP=66;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.064;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,13:66:99:234,0,1944 -chr9 588682 . C T 333.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.455;ClippingRankSum=0.731;DP=69;FS=4.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,17:69:99:362,0,1956 -chr9 693714 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=-0.776;DP=363;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=1.59;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,65:363:99:604,0,13537 -chr9 697597 . C T 1871.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.809;DP=69;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=27.13;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,57:65:15:1900,0,15 -chr9 697619 . C A 2021.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.652;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=28.48;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,59:68:35:2050,0,35 -chr9 697709 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=1.219;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,16:90:99:236,0,2790 -chr9 698522 . C T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.668;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,16:89:99:235,0,2790 -chr9 698537 . T C 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.969;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.010 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,17:96:99:254,0,2929 -chr9 701088 . T C 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=-1.529;DP=62;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.35;MQ0=0;MQRankSum=0.177;QD=3.83;ReadPosRankSum=3.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,12:54:99:266,0,1530 -chr9 701138 . A AG 543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=-0.378;DP=54;FS=1.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=10.07;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:581,0,588 -chr9 705464 . A G 810.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.491;DP=96;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.633;QD=8.45;ReadPosRankSum=-0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,31:94:99:839,0,2401 -chr9 707461 . T A 414.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=-0.175;DP=78;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.117;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,19:78:99:443,0,4170 -chr9 707468 . A G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=-0.397;DP=72;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.657;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:72:99:446,0,4170 -chr9 710255 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=2.132;DP=60;FS=1.232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.924;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,15:59:99:292,0,1735 -chr9 717866 . C T 522.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.017;DP=78;FS=8.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,22:78:99:551,0,3226 -chr9 731679 . A G 1462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=-1.437;DP=119;FS=8.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,46:118:99:1491,0,2305 -chr9 742068 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.299;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.154;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,424 -chr9 742655 . A C 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.534;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:302,0,422 -chr9 743307 . A G 312.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-1.849;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=26.06;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:81:341,0,81 -chr9 743606 . C CA 210.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.939;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:248,0,485 -chr9 743841 . A AT 740.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.289;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.371;QD=33.67;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:42:778,0,42 -chr9 743920 . TA T 316.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=-0.358;DP=38;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,15:38:99:354,0,715 -chr9 744428 . A G 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.752;DP=15;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.405;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:249,0,296 -chr9 744672 . G A 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=-3.009;DP=27;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=11.03;ReadPosRankSum=2.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:326,0,1226 -chr9 744673 . A AG 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=-3.575;DP=27;FS=8.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=9.03;ReadPosRankSum=2.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:281,0,1305 -chr9 889095 . C G 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.523;ClippingRankSum=-0.788;DP=33;FS=4.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=8.96;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,1:33:99:324,0,1143 -chr9 893803 . A G 3753.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.789;DP=632;FS=3.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.833;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:470,162:632:99:3782,0,18526 -chr9 900199 . A AT 804.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=2.826;DP=311;FS=19.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.11;MQ0=0;MQRankSum=-2.751;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,78:297:99:842,0,21138 -chr9 900544 . A T 2318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.984;DP=99;FS=2.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.108;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,66:99:99:2347,0,1084 -chr9 950070 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=1.122;DP=25;FS=1.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.137;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,11:25:99:388,0,453 -chr9 1011400 . T A 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.193;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:487,0,1372 -chr9 1167469 . C T 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.148;DP=57;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=6.77;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,17:57:99:414,0,1405 -chr9 1197770 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=-1.628;DP=16;FS=2.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.103;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:279,0,287 -chr9 1229614 . C T 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-1.904;DP=22;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.591;QD=16.94;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:401,0,380 -chr9 1247720 . C T 681.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.239;DP=45;FS=1.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:99:710,0,716 -chr9 1252306 . C T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-0.289;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:365,0,999 -chr9 1263753 . C T 904.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=-0.513;DP=64;FS=2.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=14.14;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:933,0,1213 -chr9 1266873 . C T 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=1.000;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=6.34;ReadPosRankSum=0.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,13:46:99:320,0,1230 -chr9 1360783 . C CT 291.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=-0.149;DP=45;FS=1.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=6.48;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,19:38:99:384,0,739 -chr9 1363761 . T TA 1820.52 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=-0.762;DP=12;FS=3.802;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=26.90;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:7:1857,7,0 -chr9 1363853 . C T 1373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=-1.401;DP=77;FS=3.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=17.84;ReadPosRankSum=-0.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,41:66:99:1402,0,1083 -chr9 1363985 . A G 1115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.024;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=30.16;ReadPosRankSum=0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,21:29:99:1144,0,175 -chr9 1364012 . C A 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=-0.262;DP=24;FS=4.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.571;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:99:727,0,382 -chr9 1364421 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.898;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:99:303,0,186 -chr9 1364509 . A G 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.791;QD=18.72;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:99:384,0,102 -chr9 1474008 . T C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=-0.652;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:337,0,239 -chr9 1566633 . G C 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-2.570;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:385,0,847 -chr9 1566685 . C A 356.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=-1.642;DP=17;FS=2.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:385,0,887 -chr9 1575150 . T A 392.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.659;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.713;QD=10.91;ReadPosRankSum=-1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:421,0,914 -chr9 1576331 . T C 482.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:37:511,37,0 -chr9 1578496 . C T 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-1.202;DP=59;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.952;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,16:59:99:405,0,1483 -chr9 1587797 . C T 915.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.136;DP=66;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=13.88;ReadPosRankSum=1.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:944,0,1272 -chr9 1598922 . G A 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.007;DP=72;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,16:72:99:312,0,2123 -chr9 1618697 . A G 1099.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.770;DP=53;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=20.75;ReadPosRankSum=-1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,34:53:99:1128,0,673 -chr9 1658272 . C T 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=-1.012;DP=110;FS=0.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=7.64;ReadPosRankSum=0.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,33:109:99:869,0,2756 -chr9 1668014 . A G 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:352,24,0 -chr9 1669007 . G C 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=-1.212;DP=153;FS=0.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.854;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,36:151:99:766,0,4339 -chr9 1669023 . C T 1063.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.440;DP=145;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,44:143:99:1092,0,3623 -chr9 1669343 . T C 586.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.757;DP=112;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.757;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,28:111:99:615,0,3130 -chr9 1669725 . G A 796.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=-1.838;DP=98;FS=7.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=8.13;ReadPosRankSum=2.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,30:97:99:825,0,2529 -chr9 1670703 . T C 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=-0.497;DP=82;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.831;QD=2.96;ReadPosRankSum=1.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,16:82:99:271,0,2816 -chr9 1670874 . A G 1205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=-0.294;DP=74;FS=1.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.011;QD=16.29;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,33:74:99:1234,0,1437 -chr9 1671344 . T G 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.754;DP=81;FS=6.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=11.33;ReadPosRankSum=3.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,29:81:99:946,0,1810 -chr9 1672082 . C T 848.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=-1.618;DP=95;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.146;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,32:95:99:877,0,4440 -chr9 1672205 . A G 660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=1.503;DP=41;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.373;QD=16.12;ReadPosRankSum=-1.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,19:41:99:689,0,1539 -chr9 1927783 . C A 540.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=-0.403;DP=44;FS=1.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:569,0,979 -chr9 1928198 . C T 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=-0.987;DP=83;FS=3.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.172;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,16:83:99:263,0,2565 -chr9 1943420 . T C 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.678;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=22.43;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:275,0,142 -chr9 1968235 . G T 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.546;DP=40;FS=5.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.812;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:291,0,1050 -chr9 1972925 . G A 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=1.177;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=12.32;ReadPosRankSum=-0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:250,0,406 -chr9 2018218 . C T 1588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.790;DP=80;FS=4.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=19.86;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,49:80:99:1617,0,1021 -chr9 2378850 . C G 497.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=-1.529;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.189;QD=29.28;ReadPosRankSum=1.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:526,0,241 -chr9 2379962 . T C 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=-1.816;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=14.57;ReadPosRankSum=1.816 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:407,0,883 -chr9 2381824 . T A 488.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.549;DP=23;FS=3.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=21.25;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:23:99:517,0,281 -chr9 2381970 . T G 559.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.350;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:36:588,0,36 -chr9 2383974 . C T 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=1.611;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=33.14;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:73:459,0,73 -chr9 2386068 . C T 203.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=29.12;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:232,0,20 -chr9 2389822 . G A 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.033;DP=36;FS=3.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.428;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,13:36:99:429,0,2228 -chr9 2389856 . G T 545.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=-1.110;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.902;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,18:49:99:574,0,1910 -chr9 2400983 . A C 434.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.808;DP=43;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:463,0,851 -chr9 2418748 . C T 410.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=-1.826;DP=48;FS=2.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.186;QD=8.56;ReadPosRankSum=0.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,16:48:99:439,0,1177 -chr9 2418820 . C T 255.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.454;DP=19;FS=4.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:284,0,392 -chr9 2454387 . G A 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=-1.151;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=10.87;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:99:387,0,600 -chr9 2469491 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=-0.972;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=11.15;ReadPosRankSum=0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:240,0,413 -chr9 2472269 . T G 320.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.348;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.09;ReadPosRankSum=-1.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:14:349,0,14 -chr9 2477692 . T A 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.328;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.702;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:474,0,207 -chr9 2479850 . CA C 341.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.046;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:98:379,0,98 -chr9 2480704 . T A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=-1.323;DP=23;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.769;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:414,0,400 -chr9 2480862 . G A 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=-0.397;DP=32;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:764,0,384 -chr9 2493650 . G A 705.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=-0.109;DP=43;FS=2.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.324;QD=16.41;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,21:43:99:734,0,1007 -chr9 2510051 . G A 254.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.683;DP=16;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=15.92;ReadPosRankSum=-0.473 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:283,0,293 -chr9 2552628 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.445;DP=38;FS=3.106;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.364;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.199 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:563,0,937 -chr9 2586614 . AG A 349.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-3.048;DP=44;FS=9.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.893 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:387,0,791 -chr9 2590637 . G A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.459;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:348,0,2675 -chr9 2590642 . C A 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=-0.107;DP=47;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.749;QD=6.80;ReadPosRankSum=-1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,13:47:99:348,0,2675 -chr9 2590747 . G A 350.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=-1.432;DP=53;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=6.62;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,15:53:99:379,0,2689 -chr9 2590987 . G T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=-0.230;DP=74;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,16:74:99:244,0,2139 -chr9 2591165 . G C 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=-1.121;DP=67;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.347;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,15:67:99:310,0,1885 -chr9 2591468 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.461;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=14.49;ReadPosRankSum=-1.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:434,0,1280 -chr9 2591492 . C A 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=-0.424;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.326;QD=13.99;ReadPosRankSum=2.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:434,0,1234 -chr9 2766227 . G T 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.317;DP=36;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:610,0,596 -chr9 2766272 . C T 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=-1.555;DP=41;FS=1.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,13:41:99:323,0,952 -chr9 2766356 . G C 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=-1.261;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:50:99:267,0,2708 -chr9 2766669 . G A 649.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=-0.360;DP=62;FS=5.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,22:62:99:678,0,1697 -chr9 2775569 . C CA 208.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.076;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQ0=0;MQRankSum=0.532;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:246,0,218 -chr9 2887316 . C T 2587.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.654;DP=340;FS=2.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:237,102:339:99:2616,0,8916 -chr9 2890718 . C T 444.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.921;DP=77;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.852;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,21:77:99:473,0,2021 -chr9 3054582 . C A 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.636;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.427 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:336,0,4034 -chr9 3055344 . G A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.674;DP=32;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:320,0,996 -chr9 3055437 . T A 561.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.417;DP=24;FS=6.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:590,0,320 -chr9 3055611 . T C 552.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-1.131;DP=31;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.131;QD=17.83;ReadPosRankSum=-0.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,14:31:99:581,0,610 -chr9 3055842 . T A 816.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=-0.639;DP=71;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.985;QD=11.50;ReadPosRankSum=-0.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,26:71:99:845,0,1570 -chr9 3117148 . T C 211.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=-0.742;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=30.26;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:240,0,21 -chr9 3123949 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.498;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.615;QD=17.31;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:24:99:461,0,390 -chr9 3124117 . A G 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.065;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.581;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:255,0,973 -chr9 3124299 . A G 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.854;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:401,0,438 -chr9 3124682 . G A 390.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.066;DP=60;FS=1.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=6.51;ReadPosRankSum=0.509 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:419,0,1662 -chr9 3125143 . C G 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=-1.768;DP=43;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.014;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:231,0,1484 -chr9 3131934 . G C 789.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.743;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.424;QD=28.21;ReadPosRankSum=-1.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:818,0,177 -chr9 3132687 . G A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.945;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.550;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:384,0,388 -chr9 3132954 . G A 831.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=-1.213;DP=25;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=33.27;ReadPosRankSum=-0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:18:860,0,18 -chr9 3133303 . A C 307.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=-2.119;DP=18;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=17.10;ReadPosRankSum=2.649 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:336,0,341 -chr9 3207538 . A T 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=-4.149;DP=137;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.744 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,21:92:99:340,0,4480 -chr9 3242659 . T A 3701.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=1.682;DP=124;FS=11.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.126;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.974 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,63:123:99:3730,0,5284 -chr9 3243215 . A T 3813.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.248;DP=169;FS=2.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.606;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,109:169:99:3842,0,2104 -chr9 3243563 . T A 665.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=-1.439;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.568;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,24:61:99:694,0,2076 -chr9 3288384 . G T 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 -chr9 3396811 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.401;DP=57;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:238,0,1709 -chr9 3426188 . C A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.338;DP=54;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=6.72;ReadPosRankSum=-0.697 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:391,0,1556 -chr9 3449083 . G A 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=1.147;DP=39;FS=4.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:428,0,927 -chr9 3467526 . C T 675.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=-0.244;DP=51;FS=1.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.205;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,19:51:99:704,0,2313 -chr9 3469811 . T A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.417;DP=49;FS=10.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:236,0,1251 -chr9 3476526 . C T 465.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.657;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.787;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.316 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,19:59:99:494,0,2798 -chr9 3486726 . A G 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.967;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.826;QD=31.15;ReadPosRankSum=1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:99:402,0,118 -chr9 3486930 . G C 462.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.359;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.80;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,13:26:99:491,0,493 -chr9 3487577 . TCCTGAAACACATGACGGACAACACATTTGTGGTCAGGAAGTGTATTTGTGTGTGTGTTTTTAATCTGAAGCAGCACTTA T 1853.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=2.659;DP=59;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=31.42;ReadPosRankSum=-2.560 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,50:54:99:1891,0,553 -chr9 3605161 . C A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=-0.017;DP=96;FS=4.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.897;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,23:96:99:532,0,2820 -chr9 3911372 . T C 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.935;DP=13;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:257,0,433 -chr9 3915470 . G A 233.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.803;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=7.08;ReadPosRankSum=-2.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:99:262,0,870 -chr9 3915489 . C G 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=-0.274;DP=35;FS=8.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:271,0,919 -chr9 4388192 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-1.077;DP=38;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:279,0,1091 -chr9 4388379 . C T 662.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=-1.154;DP=45;FS=6.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.702;QD=14.73;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:691,0,1583 -chr9 4393144 . C T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=-0.598;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.682;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:99:248,0,1217 -chr9 4394783 . G A 298.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=-0.066;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.770 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:327,0,663 -chr9 4394886 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=-0.127;DP=19;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=10.83;ReadPosRankSum=2.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:234,0,431 -chr9 4397366 . T G 427.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.158;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.792;QD=21.39;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:456,0,238 -chr9 4397497 . T G 442.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=-0.112;DP=21;FS=1.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.082;QD=21.08;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:471,0,238 -chr9 4710076 . C T 1870.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.035;DP=273;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,77:273:99:1899,0,7325 -chr9 4711074 . G A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=3.365;DP=246;FS=5.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.488;QD=1.08;ReadPosRankSum=-2.504 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:209,36:245:99:294,0,8326 -chr9 4730018 . C T 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.865;DP=14;FS=2.027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,773 -chr9 4734223 . T A 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=2.262;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:295,0,126 -chr9 4737292 . G A 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=-0.062;DP=82;FS=5.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:1119,0,1584 -chr9 4737366 . T C 1090.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=-1.512;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=21.39;ReadPosRankSum=2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,26:37:99:1119,0,1555 -chr9 4737463 . T G 825.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.528;DP=66;FS=1.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.420;QD=12.51;ReadPosRankSum=-1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:42:99:952,0,871 -chr9 4737539 . T G 449.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.727;DP=5;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.86;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:3:476,0,3 -chr9 4737579 . A G 995.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:72:1024,72,0 -chr9 4737651 . C T 284.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=-0.922;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:313,0,125 -chr9 4738254 . T G 464.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=28.75;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85:493,0,85 -chr9 4738271 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=2.054;DP=10;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=35.82;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:74:440,0,74 -chr9 4738846 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=-0.237;DP=26;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.501;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:321,0,947 -chr9 5274894 . A G 458.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.438;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.282;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,14:36:99:487,0,749 -chr9 5280143 . T C 832.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.555;DP=57;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:99:861,0,1169 -chr9 5318990 . C T 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=25.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:234,0,61 -chr9 5350303 . A G 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:330,0,297 -chr9 5584221 . T C 227.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:256,18,0 -chr9 5584338 . G A 241.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:270,18,0 -chr9 6120267 . A G 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.780;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,18:54:99:514,0,1348 -chr9 6124044 . C T 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.227;DP=41;FS=1.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.029;QD=12.26;ReadPosRankSum=-1.911 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,16:41:99:531,0,881 -chr9 6166105 . GA G 395.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=-0.331;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.614;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,16:20:34:433,0,34 -chr9 6166667 . G A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.127;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:236,0,607 -chr9 6166952 . C A 598.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DP=28;FS=3.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:627,0,880 -chr9 6167619 . C T 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.074;DP=40;FS=10.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,13:39:99:408,0,1006 -chr9 6167794 . G A 1098.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.773;DP=69;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.157;QD=15.92;ReadPosRankSum=1.390 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1127,0,1238 -chr9 6296772 . C T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.251;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.044;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:279,0,2674 -chr9 6296816 . C T 724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=-1.753;DP=53;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,19:53:99:753,0,1182 -chr9 6324160 . A T 683.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.744;DP=94;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.476 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,27:94:99:712,0,2552 -chr9 6336926 . G C 565.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=-0.041;DP=58;FS=5.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.074;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,20:58:99:594,0,1290 -chr9 6418405 . G C 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=-1.768;DP=25;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,12:25:99:402,0,438 -chr9 6456250 . G A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.331;DP=47;FS=4.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.513;QD=7.74;ReadPosRankSum=0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:47:99:392,0,1201 -chr9 6556681 . A T 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.354;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.25;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:54:339,0,54 -chr9 6572646 . C A 262.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,7:7:15:291,0,15 -chr9 6572655 . T C 262.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.86;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:291,0,15 -chr9 6579256 . C G 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-2.107;DP=20;FS=2.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=20.89;ReadPosRankSum=-1.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:446,0,232 -chr9 6579921 . A G 2227.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.893;DP=68;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=32.76;ReadPosRankSum=-0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,56:62:57:2256,57,0 -chr9 6581019 . C T 967.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=-0.641;DP=38;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=25.47;ReadPosRankSum=0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:46:996,0,46 -chr9 6700263 . CT C 943.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=-0.818;DP=120;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.963;QD=7.86;ReadPosRankSum=-0.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,56:108:99:981,0,2919 -chr9 6700968 . C T 824.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.018;DP=157;FS=1.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,39:157:99:853,0,4281 -chr9 6956439 . T G 351.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=-1.142;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:380,0,506 -chr9 6957129 . G T 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=-0.488;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=22.36;ReadPosRankSum=-2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:386,0,489 -chr9 7122294 . G A 527.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.741;DP=94;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,24:94:99:556,0,2664 -chr9 7122306 . A G 506.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=-0.114;DP=88;FS=10.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.608;QD=5.76;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,23:88:99:535,0,2460 -chr9 7130699 . C A 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=1.070;DP=166;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.021 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:166:99:773,0,4821 -chr9 7254704 . G A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=-0.689;DP=12;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=20.23;ReadPosRankSum=-1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:271,0,166 -chr9 7257509 . T A 536.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:565,39,0 -chr9 7263063 . A AAG 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=27.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:66:288,0,66 -chr9 7263659 . C T 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:24:329,24,0 -chr9 7443952 . AG A 245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=-0.382;DP=11;FS=6.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=22.34;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85:283,0,85 -chr9 7444050 . C T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:258,18,0 -chr9 7446897 . G GA 492.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.052;DP=23;FS=2.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=21.42;ReadPosRankSum=-1.339 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:0:527,0,0 -chr9 7446998 . CCA C 247.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-2.166;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=17.70;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:98:285,0,98 -chr9 7447286 . G A 895.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=1.103;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=34.96;ReadPosRankSum=-1.103 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:63:924,63,0 -chr9 7447310 . AT A 251.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.493;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=11.99;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:27:289,0,27 -chr9 7449738 . G GA 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.079;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.75;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,19:23:2:393,0,2 -chr9 7497946 . GA G 453.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=-0.858;DP=58;FS=1.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.310;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:491,0,1714 -chr9 7540811 . C T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=-0.610;DP=87;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.415;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,22:87:99:446,0,2387 -chr9 7541039 . G A 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.486;DP=52;FS=8.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,16:52:99:455,0,1373 -chr9 7541189 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=-2.463;DP=79;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.042;QD=4.06;ReadPosRankSum=2.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,17:79:99:349,0,2321 -chr9 7542965 . C T 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=-0.372;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=31.81;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:925,0,151 -chr9 7543722 . T C 411.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.850;DP=23;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:440,0,400 -chr9 7544606 . A G 468.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.992;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=33.48;ReadPosRankSum=0.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:0:494,0,0 -chr9 7544842 . G T 631.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=-1.379;DP=42;FS=19.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.066;QD=15.04;ReadPosRankSum=2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,18:41:99:660,0,745 -chr9 7545720 . T A 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-1.672;DP=69;FS=7.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:465,0,2518 -chr9 7571307 . G A 826.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=-6.143;DP=515;FS=9.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.006 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:437,78:515:99:855,0,16804 -chr9 7646040 . G A 1082.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=3.000;DP=63;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.969;QD=17.19;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,10:63:99:1111,0,3941 -chr9 7654227 . G A 1239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=1.009;DP=154;FS=1.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=8.05;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,48:153:99:1268,0,3876 -chr9 7654247 . GCAGGTGTGTGTTTCGTGCGTTCTTTTATTACCACTTTGAGTTCAAATGAAGGCCTTAAAATGCATTTTCCTGCTTCAAA G 6811.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=2.834;DP=171;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=27.02;ReadPosRankSum=0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,147:153:99:6849,570,0 -chr9 7654342 . C T 1412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.539;DP=170;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,55:169:99:1441,0,4259 -chr9 7660422 . T C 698.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-1.465;DP=208;FS=0.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.078;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:166,42:208:99:727,0,10807 -chr9 7661068 . T TA 255.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=-0.393;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=6.39;ReadPosRankSum=-0.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,13:35:99:293,0,540 -chr9 7662961 . T A 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.370;DP=32;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=7.12;ReadPosRankSum=-2.154 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:99:256,0,863 -chr9 7672463 . C T 225.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=-1.164;DP=16;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.799;QD=14.11;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:254,0,338 -chr9 7704467 . G A 2238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.938;DP=134;FS=5.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.376;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,64:134:99:2267,0,2337 -chr9 7704989 . T C 3050.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=5.712;DP=175;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=17.43;ReadPosRankSum=-0.513 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,88:174:99:3079,0,3031 -chr9 7705006 . A G 3175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=5.781;DP=186;FS=12.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=17.07;ReadPosRankSum=-5.735 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,99:186:99:3204,0,3118 -chr9 7719968 . A G 403.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:432,30,0 -chr9 7720070 . T C 6518.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=1.673;DP=163;FS=2.362;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=31.58;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,160:163:99:6547,470,0 -chr9 7720280 . C T 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=-0.641;DP=62;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,15:62:99:353,0,2240 -chr9 7720283 . A G 2444.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=-1.032;DP=64;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.989;QD=35.45;ReadPosRankSum=-0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,57:64:28:2473,28,0 -chr9 7789446 . T A 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.146;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.40;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,10:17:99:358,0,247 -chr9 7794260 . C T 318.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:347,27,0 -chr9 7796845 . G A 637.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.128;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=28.99;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:59:666,0,59 -chr9 7799331 . A C 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=-0.898;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=28.88;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:52:317,0,52 -chr9 8164501 . G T 487.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=-0.954;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.539;QD=16.26;ReadPosRankSum=1.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,15:30:99:516,0,526 -chr9 8164516 . C T 436.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=-0.059;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:465,0,513 -chr9 8204920 . T TA 289.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.837;DP=28;FS=3.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.341;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:327,0,237 -chr9 8471605 . A AT 319.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.025;DP=27;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.025;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:357,0,333 -chr9 8473041 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=-0.892;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:387,0,404 -chr9 8473599 . C T 354.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=-0.776;DP=19;FS=11.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.367;QD=18.67;ReadPosRankSum=1.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:383,0,310 -chr9 8475032 . G A 517.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=3.021;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=24.66;ReadPosRankSum=0.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:21:99:546,0,195 -chr9 8493213 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-1.456;DP=37;FS=7.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:449,0,840 -chr9 8494454 . G A 474.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.227;DP=34;FS=18.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=13.96;ReadPosRankSum=1.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,14:34:99:503,0,690 -chr9 8674464 . T C 433.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.826;DP=56;FS=4.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.402;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,15:50:99:462,0,1495 -chr9 8674958 . TA T 273.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.702;DP=21;FS=8.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=13.03;ReadPosRankSum=0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:311,0,180 -chr9 8675378 . C T 358.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=1.140;DP=51;FS=9.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=7.03;ReadPosRankSum=2.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:387,0,1361 -chr9 8675623 . T C 466.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=-2.881;DP=69;FS=17.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=6.76;ReadPosRankSum=0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,19:69:99:495,0,2016 -chr9 8679087 . G A 893.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=1.278;DP=107;FS=3.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.528;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,35:107:99:922,0,2678 -chr9 8687208 . G A 900.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=-1.875;DP=70;FS=4.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.658;QD=12.87;ReadPosRankSum=0.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,27:69:99:929,0,1469 -chr9 8896119 . T C 372.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.879;DP=49;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.529;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,15:49:99:401,0,1249 -chr9 8923386 . G A 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=-0.069;DP=57;FS=4.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.362;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,12:57:99:260,0,1693 -chr9 8928484 . T G 357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-0.577;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.563;QD=5.34;ReadPosRankSum=1.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:386,0,2521 -chr9 8934018 . C A 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.827;DP=61;FS=1.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,16:60:99:347,0,1703 -chr9 8938914 . C T 700.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.972;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.718;QD=17.97;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,21:39:99:729,0,653 -chr9 8939100 . G A 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=2.110;DP=37;FS=8.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:316,0,1012 -chr9 8986077 . G A 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-0.609;DP=39;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=6.76;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,11:39:99:292,0,948 -chr9 9007222 . G C 337.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.933;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.044;QD=18.76;ReadPosRankSum=1.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:366,0,352 -chr9 9007380 . C G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.533;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=20.27;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:312,0,515 -chr9 9009130 . C T 301.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=1.945;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.473;QD=20.12;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:330,0,220 -chr9 9025215 . T A 1049.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=-0.704;DP=145;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.843;QD=7.24;ReadPosRankSum=1.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,42:145:99:1078,0,3986 -chr9 9028626 . TA T 1191.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=-1.284;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,23:38:69:1229,0,69 -chr9 9028773 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.761;DP=153;FS=0.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=3.69;ReadPosRankSum=-0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,33:153:99:593,0,5671 -chr9 9030324 . G A 443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=-2.126;DP=70;FS=7.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.726;QD=6.34;ReadPosRankSum=1.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,19:70:99:472,0,1876 -chr9 9030510 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=1.620;DP=55;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,12:55:99:252,0,1511 -chr9 9030681 . G A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=-0.237;DP=56;FS=1.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=5.62;ReadPosRankSum=0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:343,0,1592 -chr9 9035053 . T A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=-0.071;DP=57;FS=13.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,11:57:99:229,0,1772 -chr9 9172648 . G A 667.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=-0.141;DP=102;FS=4.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.556;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,29:102:99:696,0,2724 -chr9 9175589 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.197;DP=131;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.104;QD=2.21;ReadPosRankSum=-1.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,23:131:99:318,0,4182 -chr9 9176357 . A G 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=-0.233;DP=108;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,20:108:99:349,0,3502 -chr9 9177986 . AGT A 214.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=-1.289;DP=122;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-1.259;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:97,18:115:99:252,0,4094 -chr9 9178079 . A AT 804.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=-0.123;DP=59;FS=3.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=13.64;ReadPosRankSum=0.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,28:56:99:842,0,637 -chr9 9178089 . A T 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=-0.166;DP=68;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.860;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,16:68:99:329,0,2706 -chr9 9325050 . C A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.762;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:287,0,63 -chr9 9325056 . T C 376.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:405,27,0 -chr9 9325665 . T A 1374.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=-0.725;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=29.89;ReadPosRankSum=-1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,37:41:33:1403,33,0 -chr9 9404669 . G A 409.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.644;DP=89;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,20:89:99:438,0,2709 -chr9 9404998 . T A 1718.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.676;DP=92;FS=5.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=18.68;ReadPosRankSum=-0.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,51:92:99:1747,0,1483 -chr9 9405435 . A G 2969.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=-0.320;DP=165;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.882;QD=18.00;ReadPosRankSum=0.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,88:158:99:2998,0,2498 -chr9 9417417 . G A 3709.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=-0.909;DP=230;FS=0.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=16.13;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:125,105:230:99:3738,0,3998 -chr9 9426501 . G A 620.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=1.079;DP=216;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.280;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:174,41:215:99:649,0,6545 -chr9 9426590 . CACCTTCACAGAGAAAATAGTTTAGGAAAACACTTAATTTCACTTCATTTCAGAGATGCACTGTGATTGACAT C 7186.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.740;DP=194;FS=6.810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=33.04;ReadPosRankSum=-0.594 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,177:182:99:7224,533,0 -chr9 9431549 . G A 1814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.726;DP=209;FS=2.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:141,68:209:99:1843,0,5394 -chr9 9447343 . G A 626.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.605;DP=262;FS=3.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.687;QD=2.39;ReadPosRankSum=2.220 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,47:261:99:655,0,8154 -chr9 9457237 . G C 1890.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=-0.569;DP=427;FS=0.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.086 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:329,96:425:99:1919,0,12330 -chr9 9542029 . C T 470.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=-1.209;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=18.11;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:499,0,471 -chr9 9542543 . T C 252.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.762;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=28.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:63:281,0,63 -chr9 9542957 . A G 299.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.529;DP=16;FS=8.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=18.74;ReadPosRankSum=-0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:328,0,259 -chr9 9543089 . G A 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.583;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.750;QD=24.84;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:26:99:674,0,214 -chr9 9543233 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=1.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.239;QD=10.99;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,612 -chr9 9543880 . A G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=-0.340;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=17.12;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:285,0,271 -chr9 9544194 . C G 742.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.581;DP=27;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=27.51;ReadPosRankSum=0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:771,0,183 -chr9 9544207 . A G 728.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.581;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.802;QD=26.99;ReadPosRankSum=0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,20:27:99:757,0,176 -chr9 9544889 . T C 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.241;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.241;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:291,0,349 -chr9 9669006 . C T 329.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=1.044;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=32.99;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:16:358,0,16 -chr9 9703403 . G C 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 -chr9 9799288 . G GA 330.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.520;DP=85;FS=0.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.738;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.025 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,24:84:99:368,0,1592 -chr9 9800362 . TCA T 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=-1.205;DP=91;FS=2.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=5.43;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,26:71:99:765,0,1146 -chr9 9800683 . C CA 659.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=-1.574;DP=78;FS=2.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.438;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,30:75:99:697,0,1067 -chr9 9820858 . G A 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.236;DP=94;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,17:94:99:265,0,3769 -chr9 9892373 . A G 744.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.128;DP=97;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.801;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,31:97:99:773,0,2475 -chr9 9938808 . A AT 947.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-1.428;DP=106;FS=1.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.384;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,41:101:99:985,0,1462 -chr9 9957080 . A G 3417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=-2.054;DP=174;FS=0.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.005;QD=19.64;ReadPosRankSum=1.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,102:173:99:3446,0,3289 -chr9 9957905 . T C 1895.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=-1.000;DP=215;FS=8.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:137,75:212:99:1924,0,6105 -chr9 9958171 . GA G 441.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=1.459;DP=244;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.007;QD=1.81;ReadPosRankSum=-1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:240,1:241:99:479,0,9688 -chr9 9958282 . T G 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.590;DP=292;FS=5.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=0.99;ReadPosRankSum=2.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:214,78:292:99:316,0,26379 -chr9 9958330 . G C 882.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=-0.833;DP=303;FS=18.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.389;QD=2.91;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:220,83:303:99:911,0,15977 -chr9 9958771 . AT A 1511.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-1.458;DP=282;FS=1.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.599;QD=5.36;ReadPosRankSum=3.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,64:277:99:1549,0,16432 -chr9 9958934 . A G 1360.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.736;DP=231;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:162,67:229:99:1389,0,14916 -chr9 9960001 . C G 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=-0.746;DP=282;FS=29.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=0.91;ReadPosRankSum=2.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:242,40:282:99:285,0,9238 -chr9 9960409 . A C 2660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.607;DP=229;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.412;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,79:229:99:2689,0,5419 -chr9 9964198 . C T 6291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.415;DP=469;FS=4.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=13.42;ReadPosRankSum=-1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:279,190:469:99:6320,0,8905 -chr9 10363118 . G A 919.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.518;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=16.42;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,26:56:99:948,0,1018 -chr9 10367578 . C T 756.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=-0.352;DP=43;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:785,0,737 -chr9 10919091 . C T 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=-0.367;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:324,0,2041 -chr9 10919206 . GA G 245.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:28:283,28,0 -chr9 10924175 . A G 3218.75 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.557;DP=459;FS=0.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.195;QD=7.01;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:324,133:457:99:3247,0,12250 -chr9 10952115 . C T 3503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=1.139;DP=483;FS=11.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.972;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:340,142:482:99:3532,0,12729 -chr9 10978397 . C T 2830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.184;DP=411;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:291,118:409:99:2859,0,14139 -chr9 10984650 . AT A 890.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=-0.179;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=26.99;ReadPosRankSum=-1.375 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:91:928,91,0 -chr9 10984837 . T G 1321.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-1.144;DP=84;FS=9.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=15.74;ReadPosRankSum=1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,37:84:99:1350,0,3278 -chr9 10984907 . A T 3095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=-0.317;DP=166;FS=1.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=18.65;ReadPosRankSum=2.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,74:166:99:3124,0,8287 -chr9 10984931 . T A 3095.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-1.787;DP=133;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=23.28;ReadPosRankSum=-1.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,59:133:99:3124,0,8141 -chr9 10998165 . C T 3030.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=-1.768;DP=97;FS=2.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.218;QD=31.25;ReadPosRankSum=1.471 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,79:97:99:3059,0,272 -chr9 10999019 . G A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.117;DP=76;FS=1.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.514;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.005 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,15:76:99:291,0,2319 -chr9 11003232 . A C 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=-0.128;DP=74;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,17:74:99:353,0,2206 -chr9 11003550 . TAGGTAATTGTGTGGGAGGTCATCATGAATGTATTATGTATTCGAAAGCGATTCATCTAATGTGATTTTCTCTCTC T 3974.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=-1.168;DP=121;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.823;QD=32.85;ReadPosRankSum=0.620 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,108:112:99:4012,310,0 -chr9 11874098 . TTTTAC T 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,8:8:32:277,0,32 -chr9 11882814 . C G 6957.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=1.030;DP=317;FS=12.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=21.95;ReadPosRankSum=-0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:112,205:317:99:6986,0,3722 -chr9 11946990 . AACCTTGAATAAAAGATCGTTTGTTAATATCAATTATTGAAATCAACTGGAATGGTGTAAAAACTTGCAACTTTAATCATGATAAATTCTGTAAACTCATGTCAGAACCT A 13657.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=2.721;DP=334;FS=4.302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.415;QD=32.74;ReadPosRankSum=-2.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,321:326:99:13695,1007,0 -chr9 12544345 . CACCTGATGGAAAAAAAAGAACATTAAATCTGTAAGAAAGCAACTTTGCTTATAAGTATAAAAATAACCATAATTAAGGTATCAACAAAGCACTGTGACCAATAACAAGCATTGTTATATGCATTT C 5033.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=2.065;DP=115;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.610;QD=29.32;ReadPosRankSum=-0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,113:115:99:5071,475,0 -chr9 12742014 . G T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 -chr9 12860823 . T A 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.094;DP=214;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.942;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:180,33:213:99:360,0,6713 -chr9 12867625 . T TG 539.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:577,39,0 -chr9 12867832 . C T 227.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=-0.718;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=11.99;ReadPosRankSum=2.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:256,0,450 -chr9 12956998 . G C 806.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.610;DP=48;FS=2.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=16.81;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,26:48:99:835,0,806 -chr9 13126143 . TGTACGTGAAACAAACACTACATACTGAACACAGTCACGTTACACACCTTGCTAAAATCTTTGGTTTGTTTACTTGCAG T 3046.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.394;DP=86;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=33.48;ReadPosRankSum=-0.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,78:86:99:3084,0,1006 -chr9 13133974 . G A 1180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=1.072;DP=67;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=17.62;ReadPosRankSum=-0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,33:67:99:1209,0,1204 -chr9 13141036 . T A 830.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=1.683;DP=75;FS=3.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,26:70:99:859,0,1553 -chr9 13150311 . G T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=-0.207;DP=54;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.089;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,14:54:99:304,0,1541 -chr9 13197361 . G A 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.237;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=29.99;ReadPosRankSum=0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:67:568,0,67 -chr9 13223632 . A T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.035;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.810;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:365,0,344 -chr9 13224408 . A T 318.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-1.147;DP=28;FS=1.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:347,0,544 -chr9 13353133 . A G 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.377;DP=26;FS=1.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.808;QD=10.34;ReadPosRankSum=0.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:297,0,579 -chr9 13381450 . G A 423.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=-0.855;DP=29;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.820;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,13:29:99:452,0,451 -chr9 13388020 . G GT 321.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=-1.444;DP=16;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.594;QD=20.11;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:17:359,0,17 -chr9 13388729 . G GA 269.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=-0.650;DP=23;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.850;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,17:22:92:374,0,92 -chr9 13388805 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=-0.825;DP=12;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:231,0,46 -chr9 13390494 . G C 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=-2.122;DP=20;FS=7.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:295,0,650 -chr9 13391815 . C CT 450.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=-0.217;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=30.05;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:99:488,0,205 -chr9 13393077 . T G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=-0.454;DP=19;FS=1.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.445;QD=12.41;ReadPosRankSum=-2.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:264,0,395 -chr9 13394380 . G T 445.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.535;DP=23;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.669;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,14:23:99:474,0,314 -chr9 13394622 . GA G 368.37 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=-1.714;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.224;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:8:405,0,8 -chr9 13420396 . C T 630.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=-0.365;DP=40;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.771;QD=15.77;ReadPosRankSum=0.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:659,0,726 -chr9 13484960 . A C 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=-1.166;DP=40;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.103;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:303,0,1033 -chr9 13489330 . A G 319.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.977;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=9.14;ReadPosRankSum=1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,11:35:99:348,0,1874 -chr9 13489818 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=1.313;DP=46;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.026;QD=5.17;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,11:46:99:266,0,1366 -chr9 13506227 . C G 419.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=1.395;DP=16;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=26.24;ReadPosRankSum=1.152 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:448,0,113 -chr9 13510048 . G T 408.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.518;DP=51;FS=2.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.350;QD=8.02;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,16:51:99:437,0,1301 -chr9 13510069 . G A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.249;DP=51;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.551;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,13:51:99:321,0,1384 -chr9 13628952 . C A 1509.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-3.336;DP=216;FS=0.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.488;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:150,63:213:99:1538,0,5708 -chr9 13629062 . T A 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.125;DP=298;FS=0.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.926;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.325 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:218,79:297:99:1753,0,7865 -chr9 13629899 . G A 1260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.174;DP=299;FS=2.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.153;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:232,66:298:99:1289,0,8306 -chr9 13951467 . T C 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.412;DP=15;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.591;QD=20.72;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:339,0,208 -chr9 13953569 . G T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=-0.929;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.468;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:321,0,389 -chr9 14073881 . A G 815.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=-0.148;DP=67;FS=10.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.225;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,26:67:99:844,0,1345 -chr9 14096393 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.667;DP=33;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.233;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,9:33:99:236,0,889 -chr9 14275951 . AGTAAGTTTGAACACATACTTCCTGTGTTTTCTTACTCCAG A 287.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=3.366;DP=15;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.209;QD=19.18;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:325,0,2709 -chr9 14299855 . C T 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=-0.715;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.357;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:64:99:568,0,1575 -chr9 14318896 . A T 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=-0.201;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:248,0,269 -chr9 14367682 . C T 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-1.238;DP=39;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.595;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,10:39:99:252,0,1034 -chr9 14369434 . C T 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.512;DP=22;FS=9.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:270,0,489 -chr9 14394477 . T C 562.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=2.349;DP=107;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,27:107:99:591,0,3000 -chr9 14406250 . A T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=1.323;DP=71;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.371;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,20:71:99:490,0,1955 -chr9 14687735 . A G 1207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=-0.891;DP=100;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=12.08;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,36:99:99:1236,0,2203 -chr9 14687969 . C T 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=-1.207;DP=89;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,19:88:99:344,0,2554 -chr9 14688008 . T A 502.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.342;DP=89;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,23:89:99:531,0,2469 -chr9 15172922 . T C 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=-0.637;DP=15;FS=13.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:242,0,298 -chr9 15804286 . C G 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-1.221;DP=56;FS=4.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.048;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,14:50:99:369,0,1486 -chr9 15804387 . T C 323.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=2.667;DP=17;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:352,0,177 -chr9 15805499 . A T 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.117;ClippingRankSum=-0.198;DP=42;FS=1.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.964;QD=6.66;ReadPosRankSum=0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:308,0,1013 -chr9 15846838 . G A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 -chr9 15846952 . C T 938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.583;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=16.19;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:967,0,305 -chr9 15846986 . C T 1078.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:81:1107,81,0 -chr9 15921139 . G A 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=1.109;DP=12;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=26.73;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:97:349,0,97 -chr9 15921957 . T A 807.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:836,57,0 -chr9 15922392 . G A 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=-1.000;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=6.45;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:267,0,318 -chr9 15922459 . C T 366.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.107;DP=37;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=9.91;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:54:395,0,54 -chr9 15923731 . T A 1601.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DP=16;FS=12.041;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.302;QD=31.92;ReadPosRankSum=0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:99:1630,120,0 -chr9 15923738 . G T 888.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=-0.241;DP=62;FS=24.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=14.33;ReadPosRankSum=-1.760 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,27:62:99:917,0,1207 -chr9 15923906 . CT C 472.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.886;DP=92;FS=75.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,32:54:99:510,0,3474 -chr9 15926411 . G T 2606.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.551;DP=108;FS=1.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.171;QD=24.14;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,66:80:99:2635,0,299 -chr9 15931381 . C A 602.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:631,45,0 -chr9 15962074 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:265,18,0 -chr9 15962083 . T C 236.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:265,18,0 -chr9 15962209 . C T 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr9 16001993 . T A 1206.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:90:1235,90,0 -chr9 16002002 . A C 1119.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:87:1190,87,0 -chr9 16452744 . A G 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=-0.580;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.528;QD=25.46;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:461,0,166 -chr9 16688471 . G A 535.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:39:564,39,0 -chr9 16688569 . C G 1250.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=-0.113;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.622;QD=31.27;ReadPosRankSum=1.773 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:61:1279,61,0 -chr9 16688686 . T C 1035.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=-1.073;DP=26;FS=3.222;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.569;QD=27.05;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:75:1064,75,0 -chr9 16690028 . A T 1996.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=-1.390;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.884;QD=35.17;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:99:2025,141,0 -chr9 16690107 . A C 412.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:441,33,0 -chr9 16801868 . A G 258.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=9;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.78;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:287,0,13 -chr9 17115752 . C T 622.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=-0.199;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.129;QD=32.78;ReadPosRankSum=0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:28:651,0,28 -chr9 17116217 . A C 260.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=32.60;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:22:289,0,22 -chr9 17128040 . C A 341.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=1.164;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=22.78;ReadPosRankSum=-1.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:370,0,169 -chr9 17129115 . G T 1114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.483;DP=52;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.173;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,33:51:99:1143,0,607 -chr9 17156695 . C A 1902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.371;ClippingRankSum=-0.995;DP=70;FS=1.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.657;QD=27.18;ReadPosRankSum=0.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,50:70:99:1931,0,524 -chr9 17156769 . G A 1192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=-0.850;DP=68;FS=6.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=17.54;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,37:68:99:1221,0,1150 -chr9 17156803 . A G 933.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.379;DP=55;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.003;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:55:99:962,0,1007 -chr9 17156878 . C T 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=-0.063;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.331;QD=27.90;ReadPosRankSum=1.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,21:31:99:921,0,653 -chr9 17156879 . G A 892.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.630;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=27.05;ReadPosRankSum=1.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,22:32:99:921,0,645 -chr9 17157031 . G T 762.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=-0.477;DP=36;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=21.19;ReadPosRankSum=1.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:791,0,234 -chr9 17157226 . T A 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=-1.016;DP=23;FS=6.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.092;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,12:23:99:392,0,391 -chr9 17157238 . T C 534.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=-0.913;DP=27;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.160;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,16:27:99:563,0,332 -chr9 17157549 . C T 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=-1.963;DP=39;FS=5.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.476;QD=26.33;ReadPosRankSum=2.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,27:39:99:1055,0,354 -chr9 17158060 . A G 1258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.155;DP=47;FS=7.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.059;QD=26.78;ReadPosRankSum=-0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,34:47:99:1287,0,375 -chr9 17158300 . T A 866.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.248;DP=31;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=27.96;ReadPosRankSum=-0.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:99:895,0,206 -chr9 17158367 . G A 616.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.402;DP=30;FS=8.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=20.56;ReadPosRankSum=-1.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:645,0,425 -chr9 17158419 . C T 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=-2.425;DP=23;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=11.56;ReadPosRankSum=-2.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:294,0,482 -chr9 17158799 . C G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=2.069;DP=34;FS=3.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:236,0,1059 -chr9 17158988 . G A 918.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.370;DP=33;FS=1.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=27.84;ReadPosRankSum=1.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:947,0,243 -chr9 17159430 . GT G 593.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=-0.379;DP=26;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=22.84;ReadPosRankSum=-1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:25:99:631,0,561 -chr9 17159440 . C T 602.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=-1.239;DP=27;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=22.32;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,16:26:99:631,0,561 -chr9 17159732 . A C 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.825;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=18.62;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:233,0,189 -chr9 17159842 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=1.479;DP=19;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=23.09;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:467,0,248 -chr9 17160586 . A G 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=-0.610;DP=40;FS=2.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.241;QD=21.04;ReadPosRankSum=1.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,26:40:99:870,0,449 -chr9 17285797 . A G 259.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.566;DP=35;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.822 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:288,0,944 -chr9 17304371 . G T 229.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:18:258,18,0 -chr9 18438238 . ACAGGTAAAAACAACCCATAAATGACATAATTTTGTTTTGTATGCAAATGCTGGTAAAGGAGTTTATATTGTAATTTGATTTAACCCTTC A 435.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=-0.579;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=30.61;ReadPosRankSum=0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:99:473,0,268 -chr9 19909517 . C A 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.504;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.713;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,13:57:99:307,0,1716 -chr9 19909721 . T A 355.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.718;DP=63;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,16:63:99:384,0,1845 -chr9 19909763 . A C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=2.241;DP=58;FS=5.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.745 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,11:58:99:249,0,3595 -chr9 19909772 . G A 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=3.727;DP=52;FS=8.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.197;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,10:52:99:249,0,3595 -chr9 20196496 . G T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.027;DP=62;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:278,0,1838 -chr9 20196855 . C T 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.689;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,15:66:99:321,0,2064 -chr9 20197057 . C A 1328.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=-1.308;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.538;QD=30.20;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,33:43:99:1357,0,214 -chr9 20197212 . A G 430.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=1.828;DP=83;FS=8.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.131;QD=5.19;ReadPosRankSum=-0.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,21:83:99:459,0,2459 -chr9 20197526 . C T 958.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.059;DP=50;FS=6.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,29:50:99:987,0,740 -chr9 20197558 . G T 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=-0.455;DP=64;FS=6.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:293,0,1885 -chr9 20198005 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=-0.889;DP=70;FS=1.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,13:68:99:232,0,2124 -chr9 20237381 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.480;DP=10;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=27.78;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:45:306,0,45 -chr9 20239631 . C A 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=27.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:278,0,56 -chr9 20338516 . C G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-1.977;DP=12;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:261,0,170 -chr9 20342354 . A T 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.133;DP=14;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.133;QD=18.84;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:292,0,170 -chr9 20342887 . T A 859.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=-0.678;DP=23;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=29.23;ReadPosRankSum=0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:66:888,66,0 -chr9 20359884 . A G 1923.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=2.062;DP=51;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=30.18;ReadPosRankSum=-0.460 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:99:1952,102,0 -chr9 20359905 . A G 3695.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.451;DP=100;FS=1.627;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=30.35;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,92:100:99:3724,173,0 -chr9 20364226 . C T 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=-1.050;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=26.51;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:92:532,0,92 -chr9 20377221 . C A 1270.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=-1.313;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.578;QD=28.53;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:96:1299,96,0 -chr9 20377233 . C T 1787.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=-2.715;DP=56;FS=1.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=31.92;ReadPosRankSum=2.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,48:55:45:1816,0,45 -chr9 20391286 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=2.007;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=15.63;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:247,0,211 -chr9 20391630 . GCAACAGGGGAAATGGCTT G 352.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=-0.521;DP=29;FS=1.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=12.16;ReadPosRankSum=2.136 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:24:99:390,0,1422 -chr9 20396271 . A G 449.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:478,33,0 -chr9 20396374 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr9 20396547 . T C 356.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=35.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:385,27,0 -chr9 20396619 . G A 695.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=-0.639;DP=19;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.091;QD=31.80;ReadPosRankSum=-1.004 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:11:723,11,0 -chr9 20398315 . G T 369.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=-1.107;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=33.55;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:11:397,0,11 -chr9 20398322 . G A 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.067;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=27.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:272,0,104 -chr9 20479431 . GA G 584.50 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.191;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,19:22:3:620,3,0 -chr9 20483026 . G T 469.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=-0.810;DP=15;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.504;QD=31.32;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:0:495,0,0 -chr9 20514553 . G C 349.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=-0.106;DP=22;FS=4.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=15.90;ReadPosRankSum=-0.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:378,0,370 -chr9 20515846 . T C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=1.379;DP=22;FS=4.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.328;QD=17.13;ReadPosRankSum=1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:405,0,404 -chr9 20530834 . T C 236.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:265,0,15 -chr9 20532690 . G T 281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.715;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:310,0,217 -chr9 20533087 . TCTGCGCCAGTTGAAGCTGATGCCCCTGTAGTTGAAGCTG T 1385.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=-0.660;DP=115;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.015;QD=12.05;ReadPosRankSum=0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,38:103:99:1423,0,6170 -chr9 20538041 . C CA 200.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.533;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:238,0,114 -chr9 20546616 . C T 368.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.567;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=13.17;ReadPosRankSum=-0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:397,0,623 -chr9 20560070 . C T 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.197;DP=52;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.608;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:99:1226,0,1451 -chr9 20560072 . C A 1197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.380;DP=52;FS=4.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=23.03;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,33:52:99:1226,0,1451 -chr9 20560358 . T C 985.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.295;DP=48;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.253;QD=20.54;ReadPosRankSum=1.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,29:48:99:1014,0,678 -chr9 20560396 . T A 1477.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=-0.135;DP=54;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.008;QD=27.37;ReadPosRankSum=0.058 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:54:99:1506,0,398 -chr9 20560445 . A G 1591.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.208;DP=55;FS=4.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.129;QD=28.94;ReadPosRankSum=0.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,42:55:99:1620,0,303 -chr9 20560545 . G A 945.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.792;DP=44;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.149;QD=21.49;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:44:99:974,0,521 -chr9 20560762 . C A 1009.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=-0.377;DP=48;FS=4.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=21.04;ReadPosRankSum=2.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,27:47:99:1038,0,1237 -chr9 20560832 . C A 588.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.578;DP=35;FS=7.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=16.82;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,17:35:99:617,0,587 -chr9 20560847 . C T 777.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=-0.783;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.967;QD=27.78;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:806,0,506 -chr9 20560885 . A C 736.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.506;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.230;QD=19.91;ReadPosRankSum=0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:37:99:765,0,584 -chr9 20560992 . G A 1357.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=-0.792;DP=63;FS=1.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.079;QD=21.55;ReadPosRankSum=0.907 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,40:63:99:1386,0,787 -chr9 20580518 . G A 564.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-1.859;DP=43;FS=2.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.628;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.169 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,18:43:99:593,0,804 -chr9 20585248 . A G 478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.620;DP=38;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.076;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,14:38:99:507,0,897 -chr9 20750157 . A C 217.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=14.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:266,18,0 -chr9 20787904 . T C 200.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=10;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:24:229,0,24 -chr9 20805306 . C T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=-1.910;DP=20;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.666;QD=12.84;ReadPosRankSum=-1.910 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:285,0,453 -chr9 20805347 . C T 226.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=-1.482;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:255,0,406 -chr9 20805430 . T C 415.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=-0.722;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.087;QD=14.85;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:444,0,436 -chr9 20806214 . A G 806.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:835,63,0 -chr9 20806712 . C A 304.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:333,24,0 -chr9 20829417 . C G 264.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=-2.379;DP=64;FS=2.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.232;QD=4.14;ReadPosRankSum=2.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,14:49:99:293,0,1742 -chr9 20870805 . C G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=13.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 -chr9 20874015 . T A 231.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:260,0,13 -chr9 20874092 . G C 823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=-0.746;DP=27;FS=2.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.599;QD=30.51;ReadPosRankSum=0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:99:852,0,188 -chr9 22300507 . CCCTGCAATAAAGCCAGTGGAGTTATAAAAAATCCATAACAAATCTTAACACAGTATTAAGAACTGTGTATTCATTA C 20067.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=1.112;DP=384;FS=12.067;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.884;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,370:377:99:20105,1608,0 -chr9 22587162 . TCAGGTACGTGTCAGTTATAAAACAGATAAACAGTCTTTACATTTGATCCTTTTATTAAATCTCTCCATTTCCTAAAACTCTCCACA T 722.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-1.200;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.455;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,31:100:99:760,0,2678 -chr9 22587163 . CAGG C 1869.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=-0.632;DP=102;FS=0.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,60:92:99:1991,0,1097 -chr9 22587167 . TACGTGTCAGTTATAAAACAGATAAACAGTCTTTACATTTGATCCTTTTATTAAATCTCTCCATTTCCTAAAACTCTCCACACA T 1634.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=-0.423;DP=97;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,50:81:99:1672,0,1188 -chr9 22847673 . AGTAAGCCTGATCTGAAACATTCTTCTTCATATCCAGTGCTTCAGCCACATCATATTTAATGCACATCTGTATTCATCTGAGCTGTTTTTCACTGTGCAG A 2230.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=64;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,61:64:99:2267,0,657 -chr9 23004795 . AT A 2191.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=-0.910;DP=124;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=17.68;ReadPosRankSum=-0.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,84:115:99:2229,0,420 -chr9 23150193 . A G 1660.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=7.521;DP=386;FS=0.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=4.30;ReadPosRankSum=-7.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:298,87:385:99:1689,0,11662 -chr9 23155292 . T C 3230.05 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=3.823;DP=311;FS=10.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.126;QD=10.39;ReadPosRankSum=-3.961 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:207,102:309:99:3267,0,7189 -chr9 23155651 . A G 9523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=-0.157;DP=363;FS=3.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.207;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,253:363:99:9552,0,2666 -chr9 23191043 . T G 539.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=2.145;DP=117;FS=11.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.023;QD=4.61;ReadPosRankSum=-2.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,27:117:99:568,0,3534 -chr9 23238425 . GCTGTAGTGGAAGAAAAGCCAGTACTGTGATTTAGCATTACAGATTCAAATAAAGTATATATTTTTAGTTTTGTATGTTGTATTGAGCTCAC G 17159.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=-0.019;DP=373;FS=2.318;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.669;QD=29.08;ReadPosRankSum=1.124 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,358:361:99:17197,1517,0 -chr9 23265853 . G A 18281.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=1.390;DP=691;FS=0.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.815;QD=26.46;ReadPosRankSum=-1.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:196,493:689:99:18310,0,4783 -chr9 23272769 . ACTGAAGTGCAACATGAGTCTGTTACTTTCAAGTTTATCAGACAACAACATTTTAACAGTCAAAAAAAAGTATTATCTTATAAATCCTCAAAATTTAAATTAC A 12523.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=3.431;DP=286;FS=1.938;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.880;QD=25.73;ReadPosRankSum=0.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,282:286:99:12561,943,0 -chr9 23825068 . CGTAAGTATCTTTTGTCATTTTATCTCCATTTAAATTCATGCTCGTATTTTGAATGTACAAATAAATCCCACATCCTTTCCAG C 4630.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=1.702;DP=125;FS=3.531;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=33.54;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,114:115:99:4668,388,0 -chr9 23826019 . CAGGTCAGAGAGTGTCCTTATTTTCTCATAATTGGTTCTTTCTTCACTTATTTAAATTAATGCTTCTCTTTTT C 5879.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=1.708;DP=148;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.393;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.732 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,142:143:99:5917,486,0 -chr9 23829899 . CGGTAAGTTTGCTTTAGTCAAATTGCAATTATTTTCATGACACAGCAGCCATTTACAAAGTCAGAATTTTGTTTGCATTTCTGGATTTTATTTTTGGTTTCCTTAA C 4504.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=1.008;DP=131;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.325;QD=34.39;ReadPosRankSum=-1.814 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,118:121:99:4542,344,0 -chr9 23894781 . T TAGTC 3305.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.449;DP=106;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.703;QD=31.19;ReadPosRankSum=0.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,81:99:99:3343,0,239 -chr9 24174847 . T G 394.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.408;DP=26;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=15.18;ReadPosRankSum=0.571 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:423,0,444 -chr9 24215615 . T C 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.067;DP=9;FS=7.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:59:270,0,59 -chr9 24228023 . GCGCTCTAGGGGACAATAACAAAACTAAACACATGCATCCTTCATACATACAAGCTTTCCTCATATTTATATTCCCTGCATC G 1176.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=-2.029;DP=46;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=25.58;ReadPosRankSum=-0.563 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:99:1214,0,174 -chr9 24228108 . TTAC T 1176.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=-1.717;DP=44;FS=1.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.522;QD=26.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,34:43:99:1214,0,173 -chr9 24417291 . GT G 203.75 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:241,24,0 -chr9 25139866 . GGGTATGATCCCTCAGGTCCCAACTCTAAAAAATAGTCTACATATATTTTTTGAGAAAAATATAATTTCACCTTTCAACATATACCTGTAGTTGTAGATTAGTCGTTTTCTGCTATTTCTGTCTGTTCTTTGTCAAACTGTTCTCATCATCTGCAGACTTGTTTTTTCATTGCTTTCACCTTCTTTTTCACCTCCTTGCTGTATCTTGGCCAAATCTTTCTGCTGCCGTTCA G 1682.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=3.920;DP=57;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.440 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,39:56:99:1720,0,8401 -chr9 25149857 . T C 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=-1.082;DP=28;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.935;QD=7.74;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:245,0,712 -chr9 25235141 . AAC A 622.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=-2.061;DP=45;FS=1.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.84;ReadPosRankSum=2.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:660,0,679 -chr9 25235498 . GT G 679.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.010;DP=66;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=10.30;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,31:54:99:717,0,455 -chr9 25248137 . C T 359.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=2.108;DP=34;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.090;QD=10.58;ReadPosRankSum=-2.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,12:34:99:388,0,833 -chr9 25420798 . T C 2181.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=1.190;DP=53;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.070;QD=34.68;ReadPosRankSum=-1.424 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:99:2210,154,0 -chr9 25420836 . T C 328.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.791;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=29.84;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:356,0,9 -chr9 25742658 . T C 1105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=-0.384;DP=67;FS=0.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.458;QD=16.50;ReadPosRankSum=0.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,31:67:99:1134,0,1237 -chr9 26100811 . A T 342.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:371,27,0 -chr9 26200871 . GT G 221.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-1.826;DP=13;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.107;QD=17.06;ReadPosRankSum=1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:28:262,0,28 -chr9 26205562 . T C 902.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=2.579;DP=171;FS=2.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.077;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,43:171:99:931,0,5051 -chr9 26379472 . T C 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.377;DP=131;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.575;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,35:131:99:866,0,3692 -chr9 26379492 . G A 457.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=-0.367;DP=179;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.838;QD=2.56;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:145,33:178:99:486,0,6624 -chr9 26415867 . C T 211.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.887;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.472;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:240,0,978 -chr9 26420633 . C T 585.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=-2.779;DP=56;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=10.46;ReadPosRankSum=1.069 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:614,0,1227 -chr9 26859160 . T A 2504.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.255;ClippingRankSum=0.239;DP=224;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=11.18;ReadPosRankSum=-1.603 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:139,74:213:99:2533,0,4611 -chr9 26861408 . A C 1523.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=2.136;DP=215;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:151,63:214:99:1552,0,5672 -chr9 26864302 . T C 1010.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=-0.136;DP=206;FS=4.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:155,50:205:99:1039,0,5705 -chr9 26864645 . C CA 425.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-1.510;DP=249;FS=4.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.624;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:187,48:235:99:463,0,5225 -chr9 27157440 . C CT 285.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.558;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.160;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,20:90:99:323,0,1742 -chr9 28334343 . C T 305.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=-1.212;DP=60;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,15:60:99:334,0,1917 -chr9 28772963 . A G 292.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.751;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=32.55;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:13:321,0,13 -chr9 28795489 . T C 575.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=-1.489;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:604,0,473 -chr9 28795936 . C A 1823.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.583;DP=83;FS=11.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.223;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,53:83:99:1852,0,1035 -chr9 28796000 . G A 2203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-1.066;DP=99;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.986;QD=22.26;ReadPosRankSum=0.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,63:99:99:2232,0,1243 -chr9 28796242 . G T 1165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-2.483;DP=81;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.607;QD=14.39;ReadPosRankSum=0.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,37:77:99:1194,0,1855 -chr9 28796424 . G A 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DP=96;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.616;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,19:96:99:282,0,3741 -chr9 28796564 . G A 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.266;DP=92;FS=4.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.419;QD=32.13;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,78:92:99:3263,0,447 -chr9 28796565 . A G 3233.06 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.285;DP=93;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.263;QD=34.76;ReadPosRankSum=0.671 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,79:93:99:3263,0,447 -chr9 28796664 . T A 1840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=-0.935;DP=63;FS=2.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=29.22;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,50:62:99:1869,0,192 -chr9 28796745 . A T 1402.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=-0.837;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.582;QD=31.17;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,36:45:99:1431,0,173 -chr9 28803214 . G A 859.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.362;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.279;QD=23.24;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:99:888,0,102 -chr9 28838729 . T G 460.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:489,36,0 -chr9 29374900 . AT A,ATT 500.19 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=-1.462;DP=39;FS=2.632;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.414;QD=12.83;ReadPosRankSum=0.359 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:4,21,9:34:99:626,120,219,492,0,725 -chr9 29378876 . C CA 462.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=-0.466;DP=51;FS=2.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.921 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,22:48:99:500,0,584 -chr9 29900591 . GT G 1538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=-1.187;DP=103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.362;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,60:83:99:1576,0,319 -chr9 30514898 . CACAGGTAACTCTAATCAATACACAACAATACTTCAGTAATCCTTGTGATTGAAGCAAAGTTCATGAACATCTGTATTTTA C 5001.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=1.375;DP=123;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=29.77;ReadPosRankSum=-0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,109:113:99:5039,425,0 -chr9 30533849 . A C 454.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=1.723;DP=29;FS=13.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=15.68;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:483,0,513 -chr9 31040464 . A G 350.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=19.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,10:10:11:378,0,11 -chr9 31040492 . G A 385.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=-0.836;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:414,0,388 -chr9 31044090 . GA G 399.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=1.255;DP=83;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.837 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,23:71:99:437,0,1061 -chr9 31143343 . GAGGTAACTATATCATCAAACTATCCCTGCAATCTAACATGACCAATAACATTACCAATCTATCATCATCACCAATCCTGTCTTTC G 2304.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=1.833;DP=65;FS=5.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=29.61;ReadPosRankSum=-0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,56:65:99:2342,0,1139 -chr9 32024039 . T C 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=1.815;DP=55;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=6.18;ReadPosRankSum=-2.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,15:54:99:368,0,1334 -chr9 32319041 . C CT 342.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-1.477;DP=174;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.088;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.949 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:122,39:161:99:380,0,3334 -chr9 32620066 . T C 250.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.736;DP=22;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:279,0,22 -chr9 32730120 . A G 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=9.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:448,30,0 -chr9 32730157 . A T 444.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=1.107;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=15.88;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:7:472,0,7 -chr9 32730242 . A T 417.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=-0.091;DP=32;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.822;QD=13.06;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:84:446,0,84 -chr9 33129639 . C CA 346.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.621;DP=116;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.222;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:80,29:109:99:384,0,2220 -chr9 33142280 . T C 267.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=1.531;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=24.34;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:99:296,0,102 -chr9 33142291 . T C 223.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.99;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15:252,0,15 -chr9 33205097 . C CT 797.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.640;DP=349;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.165;QD=2.29;ReadPosRankSum=0.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:252,74:326:99:835,0,7052 -chr9 33305825 . T G 399.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.113;DP=16;FS=2.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=24.99;ReadPosRankSum=-0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:428,0,172 -chr9 33349690 . TCCTAAAACACAAACCCATTAGCGACATCATCAAAATGAGTTTAACACCATGCTAGATAATGACAGCTTCCACACATTCAATCACA T 1996.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=1.268;DP=65;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.411;QD=30.72;ReadPosRankSum=-0.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,49:64:99:2034,0,6844 -chr9 33681350 . TCCTGAAAACAAACAGGAATTCAGAAGTACGTTGAACCACACACCAATCCATTCATTAATTTAAGGATACTGATGAATAGAAACAGCCGTGGATACTGGTGTCTAATCATTTAACATCATGACCAAAAAAAGCAATACAATCAACAACACGAAGCTTCAGATATTCCTGGAATAAATATGACAGTTA T 1625.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=4.529;DP=322;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.860;QD=5.05;ReadPosRankSum=-2.705 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,294:303:99:1663,562,0 -chr9 33682884 . GTATAATGTCAATTAAAAGTGATTCATTTCAA G 1543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=-1.277;DP=54;FS=13.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=28.59;ReadPosRankSum=0.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,41:52:99:1581,0,1019 -chr9 33682920 . CAAAGCTATGGAAAATGACAAAGTGAGTCTTGATTCTTTGGACAGGTTCAT C 1543.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-1.013;DP=63;FS=14.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.013;QD=24.50;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,46:61:99:1581,0,1158 -chr9 33684973 . T C 296.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.200;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.402;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:325,0,715 -chr9 33786324 . C G 386.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.519;DP=59;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,18:59:99:415,0,1703 -chr9 33926115 . C A 314.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=-1.286;DP=45;FS=2.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.904;QD=6.99;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,13:44:99:343,0,1221 -chr9 33926530 . A T 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=1.876;DP=33;FS=1.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.439;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:485,0,664 -chr9 33936708 . GCTTTAGAGAGAGAAAGAGAGAAAAATACAACTTCCCATCACTCTGCATTTCATGAACCCTTGCAACGTTAGCCAAAAGTATTGACAAAACTGTTTATTTTATCTTTCTACATACTAAACTGAC G 1048.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=2.748;DP=28;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=27.13;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:99:1086,0,862 -chr9 34013993 . AT A 1245.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=-0.912;DP=170;FS=2.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.19;MQ0=0;MQRankSum=1.087;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.074 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,56:149:99:1283,0,2163 -chr9 34014681 . G GA 993.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.344;DP=111;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,37:107:99:1031,0,1953 -chr9 34152518 . A G 302.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=-2.833;DP=67;FS=30.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,13:54:99:331,0,1561 -chr9 34180173 . TGTGAGTTTCCCTGTCAATATTTATTTTAAATCTTTTTCCAGTTCTCATACTCAATACTCCTCAATACTCATTTCTTCACTTTCTAG T 16535.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=-1.380;DP=368;FS=3.082;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,363:364:99:16573,1293,0 -chr9 34208441 . C T 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=-0.265;DP=42;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.821 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,12:42:99:244,0,1151 -chr9 34280712 . A G 943.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:972,66,0 -chr9 34280750 . A G 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:534,36,0 -chr9 34283174 . G A 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=7.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:340,24,0 -chr9 34329167 . G A 814.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.132;DP=147;FS=5.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.212;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:110,37:147:99:843,0,4056 -chr9 34353430 . AT A 457.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=-0.788;DP=144;FS=0.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:100,35:135:99:495,0,2781 -chr9 34356604 . GCTGCAGGAGGACCAGATTTTTAAAATCAGCATATACGGCTTTAAATCAGAAACTAACTTGACCTGTAATAATACATGAAATGTGCTTAC G 13518.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=-0.637;DP=380;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.547;QD=33.91;ReadPosRankSum=-0.528 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,356:357:99:14778,1064,0 -chr9 34357380 . GAA G 363.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:401,30,0 -chr9 34385679 . TA T 551.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=-0.065;DP=177;FS=11.234;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.491;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.040 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:157:99:589,0,2480 -chr9 34415044 . C T 725.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.503;DP=157;FS=7.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.453;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,37:157:99:754,0,4672 -chr9 34692380 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.405;DP=15;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=14.05;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:239,0,308 -chr9 35073750 . C CA 378.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.977;DP=41;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=9.24;ReadPosRankSum=-0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:99:416,0,548 -chr9 35236930 . TCTGGGAGGAAGAGGAGAGTGTGGGTGACCTCAACAGCATTAAAAAGGTGTTTTGTGCTAAAAGCCAGTCTTCAGTTGGCTGATACGTAC T 821.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.057;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.286;QD=32.67;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:99:859,0,627 -chr9 35255076 . G A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.471;ClippingRankSum=1.287;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.413;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,18:95:99:269,0,4569 -chr9 35321934 . CA C 388.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=-0.868;DP=77;FS=3.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,24:75:99:510,0,991 -chr9 35323546 . CA C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=-0.816;DP=71;FS=2.297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,33:61:99:759,0,569 -chr9 35326171 . G A 372.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=1.049;DP=110;FS=0.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.802;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,23:109:99:410,0,3440 -chr9 35326367 . TA T 478.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=-0.619;DP=70;FS=2.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,24:60:99:516,0,757 -chr9 35326585 . T C 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-1.511;DP=94;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,18:92:99:365,0,5058 -chr9 35326586 . G T 336.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=-1.360;DP=93;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,18:91:99:365,0,5058 -chr9 35344180 . T C 819.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=-1.359;DP=50;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,25:45:99:848,0,792 -chr9 35344237 . A C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-1.448;DP=43;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.674;QD=7.37;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:345,0,1108 -chr9 35344817 . C T 297.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=-1.629;DP=107;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,20:104:99:326,0,3638 -chr9 35345480 . C G 486.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.641;DP=109;FS=3.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.419;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,22:88:99:515,0,2624 -chr9 35345586 . T C 285.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.940;ClippingRankSum=2.590;DP=161;FS=12.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.425;QD=1.77;ReadPosRankSum=-4.698 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,26:145:99:314,0,5055 -chr9 35346925 . A C 485.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=1.575;DP=18;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,14:17:71:514,0,71 -chr9 35755697 . C T 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=36.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:424,30,0 -chr9 35903301 . G A 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=-0.262;DP=63;FS=1.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:63:99:403,0,1678 -chr9 35974563 . TGGTGGGAATGCAAATCTTTTTAATTATTCAATTATTCAATAGCTTACACATGTGCGGTTGCACCACTGATATTCATAACCTTTCTCTGAATGAGCAGTATGATCATGTGACTGTAACTGTGTTTCACATTGACA T 2456.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=1.764;DP=59;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.317;QD=30.87;ReadPosRankSum=-0.247 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,55:59:99:2494,217,0 -chr9 35997990 . G T 1106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=-0.039;DP=151;FS=2.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=7.33;ReadPosRankSum=-0.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:106,45:151:99:1135,0,5271 -chr9 35999011 . AT A 903.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.42;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:83:941,83,0 -chr9 37797971 . TTA T 765.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=-0.047;DP=23;FS=9.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=33.29;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:803,0,755 -chr9 37797985 . A AT 250.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.578;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,1:21:99:288,0,3117 -chr9 37797995 . T C 1278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-1.180;DP=91;FS=3.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,40:83:99:1307,0,2214 -chr9 37798106 . G A 3111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=-0.774;DP=473;FS=4.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.055;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:336,126:462:99:3140,0,13554 -chr9 37798163 . T C 3890.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3919,285,0 -chr9 37798217 . T A 8513.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=3.905;DP=239;FS=5.443;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=32.61;ReadPosRankSum=2.649 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,213:237:99:8542,180,0 -chr9 37798945 . T C 17678.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=1.406;DP=509;FS=2.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.102;QD=34.73;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,432:502:99:17707,0,421 -chr9 37799117 . T C 1478.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=2.012;DP=74;FS=7.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.964;QD=19.98;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,46:74:99:1507,0,943 -chr9 37946386 . GA G 340.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=-0.123;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.518;QD=10.99;ReadPosRankSum=3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:31:99:378,0,353 -chr9 38013047 . A G 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,0:4:99:542,0,164 -chr9 38013063 . G A 513.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.731;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=34.66;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:99:542,0,164 -chr9 38013170 . C T 275.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=-0.340;DP=30;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:304,0,259 -chr9 38419502 . C T 374.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.289;DP=64;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=5.86;ReadPosRankSum=-1.079 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:403,0,1785 -chr9 38891911 . C CA 225.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.583;DP=95;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,18:83:99:263,0,1570 -chr9 38913594 . C T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.278;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:265,0,133 -chr9 38929624 . T C 553.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=-1.335;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=29.15;ReadPosRankSum=0.913 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:25:582,0,25 -chr9 39113637 . ACAGGTTTGTTGAAATCAAAACTTCCCCCAAAACGTCCAGTCTCTGCATTTGTGAAGAAAAAAAACATCTTCTGTAACTCCTG A 4362.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.665;ClippingRankSum=1.598;DP=103;FS=3.694;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,102:103:99:4400,373,0 -chr9 39213070 . TGTGAGATGAGAGCATACAAGATTATTAATCATTATTTTTTTTGTCTGTGTGTGATGTTTTTTTATGAGTAATGCTGTGTATTGTACTTTTCAG T 9639.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=3.136;DP=212;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=31.85;ReadPosRankSum=-1.552 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,206:212:99:9677,879,0 -chr9 39213375 . TGTAAGTACTACAGTCAGAGTATGTTTTAGTTGGGACTTTTAAGATGTTATCATTAATTTGATCATGTTTTTTTGTTTGCAG T 7636.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.003;DP=207;FS=3.451;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=32.35;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,200:207:99:7674,659,0 -chr9 40016006 . A C 317.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.099;DP=22;FS=1.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.297;QD=14.44;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:346,0,421 -chr9 40063791 . G T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=-0.474;DP=11;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=33.63;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:57:417,0,57 -chr9 40063801 . A T 388.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=-0.474;DP=12;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.423;QD=32.40;ReadPosRankSum=-0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:57:417,0,57 -chr9 40064260 . A G 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.685;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=24.87;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:451,0,152 -chr9 41037838 . T A 599.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=-0.465;DP=19;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.793;QD=31.57;ReadPosRankSum=0.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:33:628,0,33 -chr9 41038427 . T C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.453;QD=11.32;ReadPosRankSum=0.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:232,0,502 -chr9 41706621 . A AT 442.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=1.108;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.579;QD=12.30;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,21:30:99:495,0,143 -chr9 41707508 . TA T 470.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.077;DP=28;FS=6.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=2.289;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:508,0,222 -chr9 41852605 . G A 1884.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=-0.339;DP=67;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.730;QD=28.13;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,50:67:99:1913,0,679 -chr9 41852626 . G A 1938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.541;DP=66;FS=1.126;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.620;QD=29.38;ReadPosRankSum=-1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,52:66:99:1967,0,331 -chr9 41862839 . A C 941.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-2.031;DP=36;FS=3.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.971;QD=26.16;ReadPosRankSum=2.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,26:36:99:970,0,260 -chr9 41898155 . A C 1293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.274;ClippingRankSum=-0.657;DP=69;FS=3.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.116;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,39:68:99:1322,0,1093 -chr9 41898192 . T C 2759.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=-0.442;DP=108;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.849;QD=25.55;ReadPosRankSum=1.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,72:107:99:2788,0,959 -chr9 41898394 . G C 6421.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=3.427;DP=426;FS=18.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:241,178:419:99:6450,0,8128 -chr9 41898656 . A G 17633.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=-1.651;DP=455;FS=9.621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.943;QD=30.98;ReadPosRankSum=1.006 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,434:444:99:17662,1273,0 -chr9 41898822 . T C 1346.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=1.185;DP=91;FS=13.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=14.80;ReadPosRankSum=-4.840 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,42:90:99:1375,0,1907 -chr9 41898892 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=1.507;DP=41;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:238,0,377 -chr9 42155308 . GGGTATGACTGTCACAACACTCCAGGACATAGTTTGAAATGGCTTTAAAAGAAAAATATTTTGTTCATTTTGCA G 2667.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=1.496;DP=77;FS=6.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=34.65;ReadPosRankSum=0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,63:75:99:2705,0,4476 -chr9 42155679 . TGTGCGTTTTCTTTTGCTTGTATGATAAAGGCATTTCAGTACTGTTTGGCTTTCCTAGGGTTCATATCCTCGATGTGTTTTTCTTGTTTCAG T 2504.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=-0.131;DP=61;FS=4.510;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.267;QD=28.19;ReadPosRankSum=-1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,57:61:83:2542,83,0 -chr9 42155971 . AAGGTTACCGAAAGGCAAATCATAAACAATAAGCCATTGTGTATGCTCACAGGCAATAACATTAATCACACCTGGTTTTATTTTT A 1067.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.835;DP=33;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=32.36;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:99:1105,0,1538 -chr9 42176396 . GAA G 469.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.080;DP=76;FS=4.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.471;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:894,0,598 -chr9 42185443 . G GT 239.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=-1.807;DP=134;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.08;MQ0=0;MQRankSum=0.659;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,28:114:99:277,0,2012 -chr9 42185739 . T TG 1105.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=-3.987;DP=145;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.523;QD=7.63;ReadPosRankSum=2.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,49:124:99:1143,0,2007 -chr9 42186616 . A AT 2507.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=-1.046;DP=182;FS=9.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.317;QD=13.78;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,106:175:99:2545,0,1610 -chr9 42359387 . C G 416.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.440;DP=64;FS=2.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.023;QD=6.51;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,18:64:99:445,0,1804 -chr9 42383439 . A G 371.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.344;DP=60;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.902 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:60:99:400,0,1661 -chr9 42547527 . TCAGGCAAGCTTCTTTTATCCGCTACAAATTGGCTATGCTTTTTGCATTGTTCCATGTATGTATGCTTGCGTGCAATGTGAATGATAATACCAAACTTGACCTTTAAAATGATTTAGAGACTTTGCTCTTTCTTTG T 243.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=1.489;DP=22;FS=4.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:281,0,6349 -chr9 42731821 . T A 240.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=-0.383;DP=35;FS=1.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,10:35:99:269,0,981 -chr9 43034075 . T C 896.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=-0.604;DP=389;FS=1.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.809;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:319,68:387:99:925,0,12212 -chr9 43731284 . CCCTAAGCATGAGAACAGGGTGAACGTGAAAAAAAAAATGAGTGGGCAAAGTTTTAATGTTATTTGAGCTATTTGGAAACAAGTAACTTG C 11876.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=2.733;DP=302;FS=9.194;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.281;QD=30.83;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,278:285:99:11914,930,0 -chr9 43806349 . C A 623.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.176;DP=222;FS=0.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:179,42:221:99:652,0,6971 -chr9 43816885 . C T 747.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=-1.151;DP=196;FS=0.658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:156,40:196:99:776,0,6051 -chr9 43822758 . A T 746.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=-1.547;DP=129;FS=1.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.516;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,33:129:99:775,0,3582 -chr9 43968732 . C T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-0.801;DP=227;FS=1.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.859;QD=0.96;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,32:226:99:246,0,7680 -chr9 46648903 . T A 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 -chr9 46653824 . C A 456.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=-0.124;DP=45;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.074;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:485,0,992 -chr9 46658138 . T C 1026.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.651;DP=60;FS=6.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.932;QD=17.11;ReadPosRankSum=-0.710 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,29:60:99:1055,0,1103 -chr9 46658652 . A G 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.816;DP=55;FS=1.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.005;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,22:55:99:866,0,2614 -chr9 46658660 . C A 837.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=-0.728;DP=61;FS=5.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,22:61:99:866,0,2557 -chr9 46695718 . C T 246.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=1.259;DP=23;FS=7.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=10.73;ReadPosRankSum=-0.226 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:275,0,573 -chr9 46734722 . C T 363.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.066;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.263;QD=16.53;ReadPosRankSum=-1.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:392,0,397 -chr9 47606386 . TA T 293.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=-0.872;DP=61;FS=2.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.734;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,18:61:99:331,0,846 -chr9 47855835 . A G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 -chr9 48849100 . G A 2089.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=1.193;DP=66;FS=3.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=31.66;ReadPosRankSum=-1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,53:66:99:2118,0,251 -chr9 49011792 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=1.214;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,104 -chr9 49297492 . C A 432.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=-1.733;DP=113;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:84,22:106:99:461,0,5791 -chr9 49526663 . C A 503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=-2.546;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=26.51;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:532,0,155 -chr9 49616866 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-1.187;DP=14;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:34:441,0,34 -chr9 49627394 . C T 542.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=-1.129;DP=19;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.129;QD=28.57;ReadPosRankSum=-0.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:28:571,0,28 -chr9 49627460 . G A 382.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=-1.369;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.552;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:42:411,0,42 -chr9 49627583 . C T 636.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.087;DP=27;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=23.58;ReadPosRankSum=-0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,21:27:99:665,0,112 -chr9 49627601 . A T 737.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.081;DP=29;FS=4.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=25.44;ReadPosRankSum=0.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:29:87:766,0,87 -chr9 49627739 . C T 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=1.102;DP=19;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=14.30;ReadPosRankSum=-0.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:300,0,308 -chr9 49627922 . G A 412.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.639;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:41:441,0,41 -chr9 49630211 . C T 425.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.053;DP=17;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.580;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:454,0,156 -chr9 49630760 . G A 339.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=-0.988;DP=20;FS=3.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:368,0,308 -chr9 50510680 . T C 255.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.742;DP=7;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=33.08;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:22:284,0,22 -chr9 50819478 . A C 622.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.847;DP=20;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=31.14;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:22:651,0,22 -chr9 50830501 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.543;QD=21.04;ReadPosRankSum=1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:407,0,237 -chr9 51509296 . A G 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.633;DP=11;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:232,0,119 -chr9 52564189 . C CAT 436.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.09;MQ0=0;QD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:33:474,33,0 -chr9 52566775 . G T 552.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.651;DP=16;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=34.56;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:2:579,2,0 -chr9 52566890 . G GT 280.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.421;DP=18;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=0.234;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:99:318,0,133 -chr9 52567265 . A T 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=-0.296;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=24.98;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:278,0,171 -chr9 52597206 . TATGGTTAGTGA T 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.265;DP=31;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.114;QD=22.54;ReadPosRankSum=-0.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,21:28:99:736,0,3171 -chr9 52597219 . CATGCTTTTACGCCTGTGAGATTCATTCAGAGCAAACAACCGAATGATACCCGCTGGTGATCTGAGCTGACTGAGACATTCAAGGCTAATAAACGCTGCTTTTACA C 698.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=1.547;DP=32;FS=1.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=21.84;ReadPosRankSum=0.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:736,0,3171 -chr9 52598724 . CGGTATGTTTAGTATTTTTAAGTACTCTAGAAACATAAGATTTAGCATTAGATTCAAATCTGTTTATATGATACAATTCTCCA C 640.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=1.398;DP=20;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:99:678,0,1289 -chr9 52824929 . C T 320.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-1.967;DP=21;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.656;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:349,0,296 -chr9 52831364 . C T 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-1.279;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=8.78;ReadPosRankSum=1.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:318,0,825 -chr9 53132957 . A T 318.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=30.45;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:347,0,14 -chr9 53132960 . T A 229.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=1.179;DP=9;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=25.53;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:99:258,0,108 -chr9 53133722 . GA G 266.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=1.552;DP=19;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=14.04;ReadPosRankSum=-1.917 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:31:313,0,31 -chr9 53163803 . A G 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=-0.365;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=20.78;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:236,0,114 -chr9 53482582 . G A 320.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:349,24,0 -chr9 53530585 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-1.472;DP=113;FS=2.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.862;QD=1.97;ReadPosRankSum=1.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,21:56:99:251,0,6670 -chr9 53532100 . C G 928.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;ClippingRankSum=0.013;DP=76;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,13:45:99:957,0,1043 -chr9 53532162 . C G 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=1.369;DP=29;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.004;QD=9.61;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:99:307,0,1132 -chr9 53532261 . G C 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=-2.017;DP=10;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=35.85;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:1299,0,2248 -chr9 53532266 . T C 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=-2.219;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=29.61;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:1299,0,2270 -chr9 53532421 . C G 1270.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=-1.987;DP=168;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.216;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,34:94:99:1299,0,2276 -chr9 53532547 . T C 1851.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=-0.281;DP=98;FS=9.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.314;QD=18.90;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,50:54:99:1880,0,157 -chr9 53532717 . A G 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=15.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:18:230,18,0 -chr9 53573832 . C T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.048;DP=17;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.684;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.337 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:249,0,319 -chr9 53636341 . C T 282.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=1.059;DP=16;FS=2.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=17.67;ReadPosRankSum=-0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:311,0,250 -chr9 53840811 . G A 384.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.643;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:413,0,487 -chr9 53850273 . A G 501.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.665;DP=38;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.345;QD=13.20;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,16:38:99:530,0,769 -chr9 53850384 . A T 1120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.013;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.335;QD=26.06;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,30:43:99:1149,0,364 -chr9 53861623 . C T 873.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:902,66,0 -chr9 53946715 . A G 1064.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.634;DP=33;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.469;QD=32.27;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:33:1093,0,33 -chr9 53946753 . G A 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=-0.225;DP=14;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:306,0,213 -chr9 53949571 . T C 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.711;DP=38;FS=1.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=20.86;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,24:38:99:821,0,445 -chr9 54003617 . C T 438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=-1.220;DP=33;FS=1.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.273;QD=13.30;ReadPosRankSum=0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,14:33:99:467,0,682 -chr9 54010204 . A G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 -chr9 54032656 . T C 1120.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=-0.619;DP=28;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.24;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:81:1149,81,0 -chr9 54032665 . T C 991.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.322;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=30.04;ReadPosRankSum=1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,26:29:1:1017,1,0 -chr9 54036707 . G A 754.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.770;DP=54;FS=10.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,23:54:99:783,0,1096 -chr9 54130083 . A G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=5.532;DP=56;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.14;ReadPosRankSum=-4.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,20:56:99:764,0,2719 -chr9 54130084 . A G 735.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=5.555;DP=55;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.744;QD=13.38;ReadPosRankSum=-4.593 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,20:55:99:764,0,2716 -chr9 54130278 . G A 4080.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.238;DP=132;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.243;QD=30.91;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,107:132:99:4109,0,427 -chr9 54171619 . AT A 1064.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=-0.917;DP=29;FS=5.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=27.33;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,25:29:99:1102,0,203 -chr9 54171624 . T C 1073.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=-1.349;DP=32;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=33.56;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,27:32:99:1102,0,171 -chr9 54171762 . CA C 924.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=-1.527;DP=81;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.431;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,41:78:99:962,0,1171 -chr9 54192644 . A C 1438.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=3.284;DP=57;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.554;QD=25.24;ReadPosRankSum=-3.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,36:57:99:1467,0,1633 -chr9 54192652 . G A 1443.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=3.641;DP=62;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.831;QD=23.29;ReadPosRankSum=-1.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,40:62:99:1472,0,1633 -chr9 54200098 . C A 2025.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:2054,150,0 -chr9 54211872 . G A 499.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=2.143;DP=16;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.556;QD=31.24;ReadPosRankSum=1.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:35:528,0,35 -chr9 54211951 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=-0.956;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.903;QD=8.80;ReadPosRankSum=1.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:345,0,831 -chr9 54252769 . G A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=-0.159;DP=36;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,10:36:99:266,0,958 -chr9 54390401 . C A 241.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=-0.471;DP=15;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=16.12;ReadPosRankSum=0.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:270,0,183 -chr9 54390521 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.546;DP=11;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=20.98;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:99:259,0,106 -chr9 54392699 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 -chr9 54569444 . A G 263.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.747;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=33.00;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:13:292,0,13 -chr9 54835051 . G C 294.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;ClippingRankSum=-0.566;DP=11;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:83:323,0,83 -chr9 55102973 . A T 493.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=-0.066;DP=63;FS=5.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,20:63:99:522,0,1620 -chr9 55550497 . T G 611.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:640,45,0 -chr9 55550531 . T C 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 -chr9 55931758 . T G 248.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=-0.747;DP=8;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:277,0,16 -chr9 55931806 . A C 345.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.495;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=24.70;ReadPosRankSum=-1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:374,0,138 -chr9 56145820 . G A 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 -chr9 56317411 . T C 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=3.125;DP=67;FS=13.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=5.09;ReadPosRankSum=-2.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,15:58:99:369,0,1607 -chr9 56320679 . T C 1724.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-1.094;DP=119;FS=7.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,54:93:99:1753,0,1367 -chr9 56360000 . G T 400.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.694;DP=26;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.157;QD=15.41;ReadPosRankSum=0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:429,0,441 -chr9 56367935 . A G 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=-1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=24.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:251,0,54 -chr9 56367936 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=1.666;DP=9;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:60:261,0,60 -chr9 56368366 . A G 440.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-1.737;DP=13;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.935;QD=33.92;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:5:468,0,5 -chr9 56369344 . A G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.067;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.870;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:303,0,605 -chr9 56438090 . T C 253.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.073;DP=36;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=7.05;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:282,0,2070 -chr9 56710395 . T A 574.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:42:603,42,0 -chr9 56710711 . C G 1108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=35;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,24:24:99:1137,0,852 -chr9 56710820 . T A 841.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.817;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:99:870,0,1069 -chr9 56710869 . G A 1110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.198;DP=22;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:99:1139,0,850 -chr9 56710886 . A C 840.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.741;DP=21;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=28.27;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:869,0,1103 -chr9 56710964 . A AC 538.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.906;DP=68;FS=2.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.014;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,20:40:99:576,0,508 -chr9 56711068 . A C 628.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:48:657,48,0 -chr9 56712857 . T G 293.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=8;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=28.32;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55:322,0,55 -chr9 56714036 . T A 292.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=-0.267;DP=22;FS=1.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=13.31;ReadPosRankSum=-1.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:321,0,725 -chr9 56715221 . T A 242.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=-1.848;DP=24;FS=8.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=10.12;ReadPosRankSum=1.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:271,0,1606 -chr9 56718887 . A T 273.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=-0.430;DP=60;FS=13.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.832;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,13:59:99:302,0,1823 -chr9 56725996 . G A 311.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=-1.883;DP=56;FS=4.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:56:99:340,0,1661 -chr9 56746468 . ACAGGTGATGAATCATTCATGAGTCATGTAAATGAGCTTCATTAATATGCACTTTTTAAATAACAATTGATTACAATCTGTCTTG A 963.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=1.805;DP=29;FS=5.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:99:1001,0,1460 -chr9 56747302 . T C 375.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=-0.044;DP=18;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=20.88;ReadPosRankSum=-0.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:404,0,323 -chr9 56749042 . T C 342.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=-1.200;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.910;QD=19.04;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:371,0,322 -chr9 56750664 . AT A 953.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=-2.377;DP=113;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.10;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,42:94:99:991,0,1121 -chr9 56751142 . G A 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=3.207;DP=81;FS=2.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.618;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,17:81:99:345,0,5183 -chr9 56751583 . T TA 423.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=-0.624;DP=116;FS=12.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.465;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.494 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,32:102:99:461,0,1754 -chr9 56753618 . A T 783.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.768;DP=98;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.288;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,29:97:99:812,0,2790 -chr9 56754341 . CA C 493.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.074;DP=142;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=1.427;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,25:141:99:531,0,9045 -chr9 56754355 . C A 581.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.136;DP=145;FS=9.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=4.01;ReadPosRankSum=0.489 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:113,32:145:99:610,0,6134 -chr9 56763236 . T TA 233.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=-0.496;DP=37;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.035;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,13:34:99:271,0,450 -chr9 56766342 . C T 461.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.078;DP=37;FS=3.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.329;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,14:37:99:490,0,863 -chr9 56766603 . A T 422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=1.055;DP=58;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,15:56:99:451,0,1621 -chr9 57113130 . G A 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=-0.370;DP=80;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.441;QD=2.55;ReadPosRankSum=2.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,15:80:99:232,0,2500 -chr9 57198546 . G A 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.143;DP=43;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.531;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:407,0,2323 -chr9 57198552 . C T 378.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=-0.776;DP=46;FS=1.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.731;QD=8.23;ReadPosRankSum=1.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,14:46:99:407,0,2323 -chr9 57240993 . A G 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.492;DP=29;FS=1.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=1.131;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:265,0,678 -chr9 57517769 . C T 1139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=-3.096;DP=36;FS=9.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.881;QD=31.66;ReadPosRankSum=2.844 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,32:36:99:1168,0,108 -chr9 57520552 . T C 1354.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1383,99,0 -chr9 57520612 . G A 1560.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=-1.733;DP=40;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.173;QD=31.83;ReadPosRankSum=1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:99:1589,117,0 -chr9 57649292 . C T 216.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=1.378;DP=39;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.585;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:245,0,1038 -chr9 57774365 . G GA 272.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:25:310,25,0 -chr9 57774385 . C G 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=22.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:25:310,25,0 -chr9 57816294 . G GCA 936.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=-0.474;DP=190;FS=5.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:115,46:161:99:974,0,3966 -chr9 57816889 . CA C 1135.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=1.683;DP=100;FS=24.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=11.36;ReadPosRankSum=1.242 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,52:97:99:1173,0,991 -chr9 57860834 . C CT 1000.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=-1.549;DP=283;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.068;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:205,69:274:99:1038,0,5982 -chr9 57915052 . T C 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=-1.813;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:318,0,287 -chr9 57915053 . G A 289.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=-1.813;DP=14;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:318,0,287 -chr9 57930736 . A G 331.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.373;DP=37;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,12:37:99:360,0,921 -chr9 57953771 . T C 245.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:274,21,0 -chr9 57971241 . G T 790.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=-0.468;DP=129;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.719;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,34:129:99:819,0,3488 -chr9 57971434 . T C 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.147;DP=84;FS=3.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.957;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:345,0,2468 -chr9 57971471 . T C 3861.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:93:99:3890,279,0 -chr9 57971654 . T A 1448.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=1.627;DP=41;FS=2.719;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=34.92;ReadPosRankSum=-1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,38:41:71:1477,71,0 -chr9 57977778 . T A 379.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.091;DP=18;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=21.10;ReadPosRankSum=-0.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:408,0,242 -chr9 57977881 . ACT A 1881.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.24;MQ0=0;QD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1919,134,0 -chr9 57981942 . A G 1046.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1075,81,0 -chr9 57982148 . C T 1802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=1.480;DP=50;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=26.62;ReadPosRankSum=-1.022 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,46:49:95:1831,95,0 -chr9 57982673 . T TC 2162.73 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.19;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2200,177,0 -chr9 57984903 . C T 1503.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=-2.406;DP=61;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.158;QD=24.65;ReadPosRankSum=1.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,41:57:99:1532,0,419 -chr9 57985290 . A G 792.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.796;DP=36;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=22.02;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,23:32:99:821,0,254 -chr9 58038006 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-1.205;DP=52;FS=4.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.416;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,13:52:99:289,0,1430 -chr9 58045869 . A T 250.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-1.215;DP=63;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.918;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:99:279,0,1860 -chr9 58109906 . T G 645.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.423;DP=90;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=7.18;ReadPosRankSum=-0.475 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,27:90:99:674,0,2521 -chr9 58158238 . GCA G 268.73 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=-0.448;DP=31;FS=1.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.70;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=8.67;ReadPosRankSum=1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:306,0,523 -chrM 339 . A G 5938.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=-1.040;DP=324;FS=2.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=18.33;ReadPosRankSum=0.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:161,163:324:99:5967,0,5892 -chrM 582 . C T 5140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.307;DP=333;FS=0.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=15.44;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:188,144:332:99:5169,0,6464 -chrM 635 . C T 4818.77 . 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cloudmap_zf_hom_mapping.Rscript27.8 KB
cloudmap_zf_hom_mapping_error.log340 B
cloudmap_zf_hom_mapping_runner.log781 B

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- diff -r f6ea3e1cdfb9 -r c3956b7cb71f cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/test1_out.log --- a/cloudmap_zf_hom_mapping/test-data/test1_out.log Fri Oct 10 12:36:10 2014 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,53 +0,0 @@ -## Toolfactory generated command line = Rscript - /Volumes/ngs/database/files/012/dataset_12035.dat None -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1 -null device - 1