Mercurial > repos > nilesh > rseqc
changeset 5:09a89ed6f8fd draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/rseqc commit 734a31ae8ba22f0d75bda696c4856ee3e274e1ba
| author | iuc |
|---|---|
| date | Tue, 20 Mar 2018 05:37:00 -0400 |
| parents | caaa120457bc |
| children | 017eaaf58e5e |
| files | bam2wig.xml test-data/output.RNA_fragment_size.txt test-data/output.tin.summary.txt test-data/testwig_wigsum100.wig |
| diffstat | 4 files changed, 1800 insertions(+), 5 deletions(-) [+] |
line wrap: on
line diff
--- a/bam2wig.xml Tue Nov 21 14:55:14 2017 -0500 +++ b/bam2wig.xml Tue Mar 20 05:37:00 2018 -0400 @@ -37,7 +37,7 @@ #end if #if str($wigsum_type.wigsum_type_selector) == "normalize": - -t ${wigsum.totalwig} + -t ${wigsum_type.totalwig} #end if @MULTIHITS@ @@ -81,8 +81,8 @@ <test> <param name="input" value="pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.bam"/> <param name="chromsize" value="hg19.chrom.sizes"/> - <param name="multihits_type.multihits_type_selector" value="skipmultihits"/> - <param name="multihits_type.mapq" value="20"/> + <param name="multihits_type_selector" value="skip_multihits"/> + <param name="mapq" value="20"/> <output name="output" file="testwig.wig"/> </test> <test> @@ -93,6 +93,13 @@ <output name="outputfwd" file="testwig.Forward.wig"/> <output name="outputrv" file="testwig.Reverse.wig"/> </test> + <test> + <param name="input" value="pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.bam"/> + <param name="chromsize" value="hg19.chrom.sizes"/> + <param name="wigsum_type_selector" value="normalize"/> + <param name="totalwig" value="100"/> + <output name="output" file="testwig_wigsum100.wig"/> + </test> </tests> <help><![CDATA[
--- a/test-data/output.RNA_fragment_size.txt Tue Nov 21 14:55:14 2017 -0500 +++ b/test-data/output.RNA_fragment_size.txt Tue Mar 20 05:37:00 2018 -0400 @@ -1,6 +1,6 @@ chrom tx_start tx_end symbol frag_count frag_mean frag_median frag_std chr1 11873 14409 NR_046018 1 0 0 0 -chr1 14361 29370 NR_024540 14 66.5 51.0 41.1195990809 +chr1 14361 29370 NR_024540 14 66.5 51.0 41.119599080869314 chr1 17368 17436 NR_106918 0 0 0 0 chr1 17368 17436 NR_107062 0 0 0 0 chr1 34610 36081 NR_026818 0 0 0 0
--- a/test-data/output.tin.summary.txt Tue Nov 21 14:55:14 2017 -0500 +++ b/test-data/output.tin.summary.txt Tue Mar 20 05:37:00 2018 -0400 @@ -1,2 +1,2 @@ Bam_file TIN(mean) TIN(median) TIN(stdev) -input.bam 8.87096774194 8.87096774194 0.0 +input.bam 8.870967741935486 8.870967741935486 0.0
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/testwig_wigsum100.wig Tue Mar 20 05:37:00 2018 -0400 @@ -0,0 +1,1788 @@ +variableStep chrom=chr13 +variableStep chrom=chr12 +variableStep chrom=chr11 +variableStep chrom=chr10 +variableStep chrom=chr17 +variableStep chrom=chr16 +variableStep chrom=chr15 +variableStep chrom=chr14 +variableStep chrom=chr19 +variableStep chrom=chr18 +variableStep chrom=chr8 +variableStep chrom=chr3 +variableStep chrom=chr1 +12674 0.05 +12675 0.05 +12676 0.05 +12677 0.05 +12678 0.05 +12679 0.05 +12680 0.05 +12681 0.05 +12682 0.05 +12683 0.05 +12684 0.05 +12685 0.05 +12686 0.05 +12687 0.05 +12688 0.05 +12689 0.05 +12690 0.05 +12691 0.05 +12692 0.05 +12693 0.05 +12694 0.05 +12695 0.05 +12696 0.05 +12697 0.05 +13221 0.05 +13222 0.05 +13223 0.05 +13224 0.05 +13225 0.05 +13226 0.05 +13227 0.05 +13228 0.05 +13229 0.05 +13230 0.05 +13231 0.05 +13232 0.05 +13233 0.05 +13234 0.05 +13235 0.05 +13236 0.05 +13237 0.05 +13238 0.05 +13239 0.05 +13240 0.05 +13241 0.05 +13242 0.05 +13243 0.05 +13244 0.05 +13245 0.05 +13246 0.05 +13247 0.05 +13483 0.05 +13484 0.05 +13485 0.05 +13486 0.05 +13487 0.05 +13488 0.05 +13489 0.05 +13490 0.05 +13491 0.05 +13492 0.05 +13493 0.05 +13494 0.05 +13495 0.05 +13496 0.05 +13497 0.05 +13498 0.05 +13499 0.05 +13500 0.05 +13501 0.05 +13502 0.05 +13503 0.05 +13504 0.05 +13505 0.05 +13506 0.05 +13507 0.05 +13508 0.05 +13509 0.05 +13510 0.05 +13511 0.05 +13512 0.05 +13513 0.05 +13514 0.05 +13515 0.05 +13516 0.05 +13517 0.05 +13518 0.05 +13519 0.05 +13520 0.05 +13521 0.05 +13522 0.05 +13523 0.05 +13524 0.05 +13525 0.05 +13526 0.05 +13527 0.05 +13528 0.05 +13529 0.05 +13530 0.05 +13531 0.05 +13532 0.05 +13533 0.05 +14596 0.05 +14597 0.05 +14598 0.05 +14599 0.05 +14600 0.05 +14601 0.05 +14602 0.05 +14603 0.05 +14604 0.05 +14605 0.05 +14606 0.05 +14607 0.05 +14608 0.05 +14609 0.05 +14610 0.05 +14611 0.05 +14612 0.05 +14613 0.05 +14614 0.05 +14615 0.05 +14616 0.05 +14617 0.05 +14618 0.05 +14619 0.05 +14620 0.05 +14621 0.05 +14622 0.05 +14623 0.05 +14624 0.05 +14625 0.05 +14626 0.05 +14627 0.05 +14628 0.05 +14629 0.05 +14630 0.05 +14631 0.05 +14632 0.05 +14633 0.05 +14634 0.05 +14635 0.05 +14636 0.05 +14637 0.05 +14638 0.05 +14639 0.05 +14640 0.05 +14641 0.05 +14642 0.05 +14643 0.05 +14644 0.05 +14645 0.05 +14676 0.05 +14677 0.05 +14678 0.05 +14679 0.05 +14680 0.05 +14681 0.05 +14682 0.05 +14683 0.05 +14684 0.05 +14685 0.05 +14686 0.05 +14687 0.05 +14688 0.05 +14689 0.05 +14690 0.05 +14691 0.05 +14692 0.05 +14693 0.05 +14694 0.05 +14695 0.05 +14696 0.05 +14697 0.05 +14698 0.05 +14699 0.05 +14700 0.05 +14701 0.05 +14702 0.05 +14703 0.05 +14704 0.05 +14705 0.05 +14706 0.05 +14707 0.05 +14708 0.05 +14709 0.05 +14710 0.05 +14711 0.05 +14712 0.05 +14713 0.05 +14714 0.05 +14715 0.05 +14716 0.05 +14717 0.05 +14718 0.05 +14719 0.05 +14720 0.05 +14721 0.05 +14722 0.05 +14723 0.05 +14724 0.05 +14725 0.05 +14726 0.05 +16455 0.05 +16456 0.05 +16457 0.05 +16458 0.05 +16459 0.05 +16460 0.05 +16461 0.05 +16462 0.05 +16463 0.05 +16464 0.05 +16465 0.05 +16466 0.05 +16467 0.05 +16468 0.05 +16469 0.05 +16470 0.05 +16471 0.05 +16472 0.05 +16473 0.05 +16474 0.05 +16475 0.05 +16476 0.05 +16477 0.05 +16478 0.05 +16479 0.05 +16480 0.05 +16481 0.05 +16482 0.05 +16483 0.05 +16484 0.05 +16485 0.05 +16486 0.05 +16487 0.05 +16488 0.05 +16489 0.05 +16490 0.05 +16491 0.05 +16492 0.05 +16493 0.05 +16494 0.05 +16495 0.05 +16496 0.05 +16497 0.05 +16498 0.05 +16499 0.05 +16500 0.05 +16501 0.05 +16502 0.05 +16503 0.05 +16504 0.05 +16506 0.05 +16507 0.05 +16508 0.05 +16509 0.05 +16510 0.05 +16511 0.05 +16512 0.05 +16513 0.05 +16514 0.05 +16515 0.05 +16516 0.05 +16517 0.05 +16518 0.05 +16519 0.05 +16520 0.05 +16521 0.05 +16522 0.05 +16523 0.05 +16524 0.05 +16525 0.05 +16526 0.05 +16527 0.05 +16528 0.05 +16529 0.05 +16530 0.05 +16531 0.05 +16532 0.05 +16533 0.05 +16534 0.05 +16535 0.05 +16536 0.05 +16537 0.05 +16538 0.05 +16539 0.05 +16540 0.05 +16541 0.05 +16542 0.05 +16543 0.05 +16544 0.05 +16545 0.05 +16546 0.05 +16547 0.05 +16548 0.05 +16549 0.05 +16550 0.05 +16551 0.05 +16552 0.05 +16553 0.05 +16554 0.05 +16555 0.05 +16556 0.05 +17051 0.05 +17052 0.05 +17053 0.05 +17054 0.05 +17055 0.05 +17233 0.05 +17234 0.05 +17235 0.05 +17236 0.05 +17237 0.05 +17238 0.05 +17239 0.05 +17240 0.05 +17241 0.05 +17242 0.05 +17243 0.05 +17244 0.05 +17245 0.05 +17246 0.05 +17247 0.05 +17248 0.05 +17249 0.05 +17250 0.05 +17251 0.05 +17252 0.05 +17253 0.05 +17254 0.05 +17255 0.05 +17256 0.05 +17257 0.05 +17258 0.05 +17259 0.05 +17260 0.05 +17261 0.05 +17262 0.05 +17263 0.05 +17264 0.05 +17265 0.05 +17266 0.05 +17267 0.05 +17268 0.05 +17269 0.05 +17270 0.05 +17271 0.05 +17272 0.05 +17273 0.05 +17274 0.05 +17275 0.05 +17276 0.05 +17277 0.05 +17278 0.05 +17555 0.05 +17556 0.05 +17557 0.05 +17558 0.05 +17559 0.05 +17560 0.05 +17561 0.05 +17562 0.05 +17563 0.05 +17564 0.05 +17565 0.05 +17566 0.05 +17567 0.05 +17568 0.05 +17569 0.05 +17570 0.05 +17571 0.05 +17572 0.05 +17573 0.05 +17574 0.05 +17575 0.05 +17576 0.05 +17577 0.05 +17578 0.05 +17579 0.05 +17580 0.05 +17581 0.05 +17582 0.05 +17583 0.05 +17584 0.05 +17585 0.05 +17586 0.05 +17587 0.05 +17588 0.05 +17589 0.05 +17590 0.05 +17591 0.05 +17592 0.05 +17593 0.05 +17594 0.05 +17595 0.05 +17596 0.05 +17597 0.05 +17598 0.05 +17599 0.05 +17600 0.05 +17601 0.05 +17602 0.05 +17603 0.05 +17604 0.05 +17605 0.05 +20203 0.05 +20204 0.05 +20205 0.05 +20206 0.05 +20207 0.05 +20208 0.05 +20209 0.05 +20210 0.05 +20211 0.05 +20212 0.05 +20213 0.05 +20214 0.05 +20215 0.05 +20216 0.05 +20217 0.05 +20218 0.05 +20219 0.05 +20220 0.05 +20221 0.05 +20222 0.05 +20223 0.05 +20224 0.05 +20225 0.05 +20226 0.05 +20227 0.05 +20228 0.05 +20229 0.05 +20230 0.05 +20231 0.05 +20232 0.05 +20233 0.05 +20234 0.05 +20235 0.05 +20236 0.05 +20237 0.05 +20238 0.05 +20239 0.05 +20240 0.05 +20241 0.05 +20242 0.05 +20243 0.05 +20244 0.05 +20245 0.05 +20246 0.05 +20247 0.05 +20248 0.05 +20249 0.05 +20250 0.05 +20251 0.05 +20252 0.05 +20253 0.05 +20400 0.05 +20401 0.05 +20402 0.05 +20403 0.05 +20404 0.05 +20405 0.05 +20406 0.05 +20407 0.05 +20408 0.05 +20409 0.05 +20410 0.05 +20411 0.05 +20412 0.05 +20413 0.05 +20414 0.05 +20415 0.05 +20416 0.05 +20417 0.05 +20418 0.05 +20419 0.05 +20420 0.05 +20421 0.05 +20422 0.05 +20423 0.05 +20424 0.05 +20425 0.05 +20426 0.05 +20427 0.05 +20428 0.05 +20429 0.05 +20430 0.05 +20431 0.05 +20432 0.05 +20433 0.05 +20434 0.05 +20435 0.05 +20436 0.05 +20437 0.05 +20438 0.05 +20439 0.05 +20440 0.05 +20441 0.05 +20442 0.05 +20443 0.05 +20444 0.05 +20445 0.05 +20446 0.05 +20447 0.05 +20448 0.05 +20449 0.05 +20450 0.05 +20773 0.05 +20774 0.05 +20775 0.05 +20776 0.05 +20777 0.05 +20778 0.05 +20779 0.05 +20780 0.05 +20781 0.05 +20782 0.05 +20783 0.05 +20784 0.05 +20785 0.05 +20786 0.05 +20787 0.05 +20788 0.05 +20789 0.05 +20790 0.05 +20791 0.05 +20792 0.05 +20793 0.05 +20794 0.05 +20795 0.05 +20796 0.05 +20797 0.05 +20798 0.05 +20799 0.05 +20800 0.05 +20801 0.05 +20802 0.05 +20803 0.05 +20804 0.05 +20805 0.05 +20806 0.05 +20807 0.05 +20808 0.05 +20809 0.05 +20810 0.05 +20811 0.05 +20812 0.05 +20813 0.05 +20814 0.05 +20815 0.05 +20816 0.05 +20817 0.05 +20818 0.05 +20819 0.05 +20849 0.05 +20850 0.05 +20851 0.05 +20852 0.05 +20853 0.05 +20854 0.05 +20855 0.05 +20856 0.05 +20857 0.05 +20858 0.05 +20859 0.05 +20860 0.05 +20861 0.05 +20862 0.05 +20863 0.05 +20864 0.05 +20865 0.05 +20866 0.05 +20867 0.05 +20868 0.05 +20869 0.05 +20870 0.05 +20871 0.05 +20872 0.05 +20873 0.05 +20874 0.05 +20875 0.05 +20876 0.05 +20877 0.05 +20878 0.05 +20879 0.05 +20880 0.05 +20881 0.05 +20882 0.05 +20883 0.05 +20884 0.05 +20885 0.05 +20886 0.05 +20887 0.05 +20888 0.05 +20889 0.05 +20890 0.05 +20891 0.05 +20892 0.05 +20893 0.05 +20894 0.05 +20895 0.05 +20896 0.05 +20897 0.05 +20898 0.05 +20899 0.05 +21469 0.05 +21470 0.05 +21471 0.05 +21472 0.05 +21473 0.10 +21474 0.10 +21475 0.10 +21476 0.10 +21477 0.10 +21478 0.10 +21479 0.10 +21480 0.10 +21481 0.10 +21482 0.10 +21483 0.10 +21484 0.10 +21485 0.10 +21486 0.10 +21487 0.10 +21488 0.10 +21489 0.10 +21490 0.10 +21491 0.10 +21492 0.10 +21493 0.10 +21494 0.10 +21495 0.10 +21496 0.10 +21497 0.10 +21498 0.10 +21499 0.10 +21500 0.10 +21501 0.10 +21502 0.10 +21503 0.10 +21504 0.10 +21505 0.10 +21506 0.10 +21507 0.10 +21508 0.05 +21509 0.05 +21510 0.05 +21511 0.05 +21512 0.05 +21513 0.05 +21514 0.05 +21515 0.05 +21516 0.05 +21517 0.05 +21526 0.05 +21527 0.05 +21528 0.05 +21529 0.05 +21530 0.05 +21531 0.05 +21543 0.05 +21544 0.05 +21545 0.05 +21546 0.05 +21547 0.05 +21548 0.05 +21549 0.05 +21550 0.05 +21551 0.05 +21552 0.05 +21553 0.05 +21554 0.05 +21555 0.05 +21556 0.05 +21557 0.05 +21558 0.05 +21559 0.05 +21560 0.05 +21561 0.05 +21562 0.05 +21563 0.05 +21564 0.05 +21565 0.05 +21566 0.05 +21567 0.05 +21568 0.05 +21569 0.05 +21570 0.05 +21571 0.05 +21572 0.05 +21573 0.05 +21574 0.05 +21575 0.05 +21576 0.05 +21577 0.05 +21578 0.05 +21579 0.05 +21580 0.05 +21581 0.05 +21582 0.05 +21583 0.05 +21584 0.05 +21585 0.05 +21586 0.05 +21587 0.05 +21588 0.05 +21589 0.05 +21590 0.05 +21591 0.05 +21592 0.05 +21593 0.05 +21723 0.05 +21724 0.05 +21725 0.05 +21726 0.05 +21727 0.05 +21728 0.05 +21729 0.05 +21730 0.05 +21731 0.05 +21732 0.05 +21733 0.05 +21734 0.05 +21735 0.05 +21736 0.05 +21737 0.05 +21738 0.05 +21739 0.05 +21740 0.05 +21741 0.05 +21742 0.05 +21743 0.05 +21744 0.05 +21745 0.05 +21746 0.05 +21747 0.05 +21748 0.05 +21749 0.05 +21750 0.05 +21751 0.05 +21752 0.05 +21753 0.05 +21754 0.05 +21755 0.05 +21756 0.05 +21757 0.05 +21758 0.05 +21759 0.05 +21760 0.05 +21761 0.05 +21762 0.05 +21763 0.05 +21764 0.05 +21765 0.05 +21766 0.05 +21767 0.05 +21768 0.05 +21963 0.05 +21964 0.05 +21965 0.05 +21966 0.05 +21967 0.05 +21968 0.05 +21969 0.05 +21970 0.05 +21971 0.05 +21972 0.05 +21973 0.05 +21974 0.05 +21975 0.05 +21976 0.05 +21977 0.05 +21978 0.05 +21979 0.05 +21980 0.05 +21981 0.05 +21982 0.05 +21983 0.05 +21984 0.05 +21985 0.05 +21986 0.05 +21987 0.05 +21988 0.05 +21989 0.05 +21990 0.05 +21991 0.05 +21992 0.05 +21993 0.05 +21994 0.05 +21995 0.05 +21996 0.05 +21997 0.05 +21998 0.05 +21999 0.05 +22000 0.05 +22001 0.10 +22002 0.10 +22003 0.10 +22004 0.10 +22005 0.10 +22006 0.05 +22062 0.05 +22063 0.05 +22064 0.05 +22065 0.05 +22066 0.05 +22067 0.05 +22068 0.05 +22069 0.05 +22070 0.05 +22071 0.05 +22072 0.05 +22073 0.05 +22074 0.05 +22075 0.05 +22076 0.05 +22077 0.05 +22078 0.05 +22079 0.05 +22080 0.05 +22081 0.05 +22082 0.05 +22083 0.05 +22084 0.05 +22085 0.05 +22086 0.05 +22087 0.05 +22088 0.05 +22089 0.05 +22090 0.05 +22091 0.05 +22092 0.05 +22093 0.05 +22094 0.05 +22095 0.05 +22096 0.05 +22097 0.05 +22098 0.05 +22099 0.05 +22100 0.05 +22101 0.05 +22102 0.05 +22103 0.05 +22104 0.05 +22105 0.05 +22106 0.05 +22107 0.05 +22108 0.05 +22109 0.05 +22110 0.05 +22111 0.05 +22112 0.05 +22343 0.05 +22344 0.05 +22345 0.05 +22346 0.05 +22347 0.05 +22348 0.05 +22349 0.05 +22350 0.05 +22351 0.05 +22352 0.05 +22353 0.05 +22354 0.05 +22355 0.05 +22356 0.05 +22357 0.05 +22358 0.05 +22359 0.05 +22360 0.05 +22361 0.05 +22362 0.05 +22363 0.05 +22364 0.05 +22365 0.05 +22366 0.05 +22367 0.05 +22368 0.05 +22369 0.05 +22370 0.05 +22371 0.05 +22372 0.05 +22373 0.05 +22374 0.05 +22375 0.05 +22376 0.05 +22377 0.05 +22378 0.05 +22379 0.05 +22380 0.05 +22381 0.05 +22382 0.05 +22383 0.05 +22384 0.05 +22385 0.05 +22386 0.05 +22387 0.05 +22388 0.05 +22389 0.05 +22390 0.05 +22434 0.05 +22435 0.05 +22436 0.05 +22437 0.05 +22438 0.05 +22439 0.05 +22440 0.05 +22441 0.05 +22442 0.05 +22443 0.05 +22444 0.05 +22445 0.05 +22446 0.10 +22447 0.10 +22448 0.10 +22449 0.15 +22450 0.15 +22451 0.15 +22452 0.15 +22453 0.15 +22454 0.15 +22455 0.15 +22456 0.15 +22457 0.15 +22458 0.15 +22459 0.15 +22460 0.15 +22461 0.15 +22462 0.15 +22463 0.15 +22464 0.15 +22465 0.15 +22466 0.15 +22467 0.15 +22468 0.15 +22469 0.15 +22470 0.15 +22471 0.15 +22472 0.15 +22473 0.15 +22474 0.15 +22475 0.15 +22476 0.15 +22477 0.15 +22478 0.15 +22479 0.15 +22480 0.10 +22481 0.10 +22482 0.10 +22483 0.10 +22484 0.10 +22485 0.10 +22486 0.10 +22487 0.10 +22488 0.10 +22489 0.10 +22490 0.10 +22491 0.05 +22492 0.05 +22493 0.05 +22494 0.05 +22495 0.05 +22496 0.05 +22497 0.05 +22498 0.05 +22499 0.05 +22544 0.05 +22545 0.05 +22546 0.05 +22547 0.05 +22548 0.05 +22549 0.05 +22550 0.05 +22551 0.05 +22552 0.05 +22553 0.05 +22554 0.05 +22555 0.05 +22556 0.05 +22557 0.05 +22558 0.05 +22559 0.05 +22560 0.05 +22561 0.05 +22562 0.05 +22563 0.05 +22564 0.05 +22565 0.05 +22566 0.05 +22567 0.05 +22568 0.05 +22569 0.05 +22570 0.05 +22571 0.05 +22572 0.05 +22573 0.05 +22574 0.05 +22575 0.05 +22576 0.05 +22577 0.05 +22578 0.05 +22579 0.05 +22580 0.05 +22581 0.05 +22582 0.05 +22583 0.05 +22584 0.05 +22585 0.05 +22586 0.05 +22587 0.05 +22588 0.05 +22589 0.05 +22590 0.05 +22591 0.05 +22710 0.05 +22711 0.05 +22712 0.05 +22713 0.05 +22714 0.05 +22715 0.05 +22716 0.05 +22717 0.05 +22718 0.05 +22719 0.05 +22720 0.05 +22721 0.05 +22722 0.05 +22723 0.05 +22724 0.05 +22725 0.05 +22726 0.05 +22727 0.05 +22728 0.05 +22729 0.05 +22730 0.05 +22731 0.05 +22732 0.05 +22733 0.05 +22734 0.05 +22735 0.05 +22736 0.05 +22737 0.05 +22738 0.05 +22739 0.05 +22740 0.05 +22741 0.05 +22742 0.05 +22743 0.05 +22744 0.05 +22745 0.05 +22746 0.05 +22747 0.05 +22748 0.05 +22749 0.05 +22750 0.05 +22751 0.05 +22752 0.05 +22753 0.05 +22754 0.05 +22755 0.05 +22756 0.05 +22757 0.05 +22758 0.05 +22759 0.05 +22760 0.05 +23105 0.05 +23106 0.05 +23107 0.05 +23108 0.05 +23109 0.05 +23110 0.05 +23111 0.05 +23112 0.05 +23113 0.05 +23114 0.05 +23115 0.05 +23116 0.05 +23117 0.05 +23118 0.05 +23119 0.05 +23120 0.05 +23121 0.05 +23122 0.05 +23123 0.05 +23124 0.05 +23125 0.05 +23126 0.05 +23127 0.05 +23128 0.05 +23129 0.05 +23130 0.05 +23131 0.05 +23132 0.05 +23133 0.05 +23134 0.05 +23135 0.05 +23136 0.05 +23137 0.05 +23138 0.05 +23139 0.05 +23140 0.05 +23141 0.05 +23142 0.05 +23143 0.05 +23144 0.05 +23145 0.05 +23146 0.05 +23147 0.05 +23148 0.05 +23149 0.05 +23150 0.05 +23151 0.05 +23152 0.05 +23153 0.05 +23154 0.05 +23354 0.05 +23355 0.05 +23356 0.05 +23357 0.05 +23358 0.05 +23359 0.05 +23360 0.05 +23361 0.05 +23362 0.05 +23363 0.05 +23364 0.05 +23365 0.05 +23366 0.05 +23367 0.05 +23368 0.05 +23369 0.05 +23370 0.05 +23371 0.05 +23372 0.05 +23373 0.05 +23374 0.05 +23375 0.05 +23376 0.05 +23377 0.05 +23378 0.05 +23379 0.05 +23380 0.05 +23381 0.05 +23382 0.05 +23383 0.05 +23384 0.05 +23385 0.05 +23386 0.05 +23387 0.05 +23388 0.05 +23389 0.05 +23390 0.05 +23391 0.05 +23392 0.05 +23393 0.05 +23394 0.05 +23395 0.05 +23396 0.05 +23397 0.05 +23398 0.05 +23399 0.05 +23400 0.05 +23401 0.05 +23402 0.05 +23403 0.05 +23404 0.05 +24395 0.05 +24396 0.05 +24397 0.05 +24398 0.05 +24399 0.05 +24400 0.05 +24401 0.05 +24402 0.05 +24403 0.05 +24404 0.05 +24405 0.05 +24406 0.05 +24407 0.05 +24408 0.05 +24409 0.05 +24410 0.05 +24411 0.05 +24412 0.05 +24413 0.05 +24414 0.05 +24415 0.05 +24416 0.05 +24417 0.05 +24418 0.05 +24419 0.05 +24420 0.05 +24421 0.05 +24422 0.05 +24423 0.05 +24424 0.05 +24425 0.05 +24426 0.05 +24427 0.05 +24428 0.05 +24429 0.05 +24430 0.05 +24431 0.05 +24432 0.05 +24433 0.05 +24434 0.05 +24435 0.05 +24558 0.05 +24559 0.05 +24560 0.05 +24561 0.05 +24562 0.05 +24563 0.05 +24564 0.05 +24565 0.05 +24566 0.05 +24567 0.05 +24568 0.05 +24569 0.05 +24570 0.05 +24571 0.05 +24572 0.05 +24573 0.05 +24574 0.05 +24575 0.05 +24576 0.05 +24577 0.05 +24578 0.05 +24579 0.05 +24580 0.05 +24581 0.05 +24582 0.05 +24583 0.05 +24584 0.05 +24585 0.05 +24586 0.05 +24587 0.05 +24588 0.05 +24589 0.05 +24590 0.05 +24591 0.05 +24592 0.05 +24593 0.05 +24594 0.05 +24595 0.05 +24596 0.05 +24597 0.05 +24598 0.05 +24599 0.05 +24600 0.05 +24601 0.05 +24602 0.05 +24603 0.05 +24604 0.05 +24605 0.05 +24606 0.05 +24607 0.05 +24608 0.05 +28411 0.05 +28412 0.05 +28413 0.05 +28414 0.05 +28415 0.05 +28416 0.05 +28417 0.05 +28418 0.05 +28419 0.05 +28420 0.05 +28421 0.05 +28422 0.05 +28423 0.05 +28424 0.05 +28425 0.05 +28426 0.05 +28427 0.05 +28428 0.05 +28429 0.05 +28430 0.05 +28431 0.10 +28432 0.10 +28433 0.10 +28434 0.10 +28435 0.10 +28436 0.10 +28437 0.10 +28438 0.10 +28439 0.10 +28440 0.10 +28441 0.10 +28442 0.10 +28443 0.10 +28444 0.10 +28445 0.10 +28446 0.10 +28447 0.10 +28448 0.10 +28449 0.10 +28450 0.10 +28451 0.10 +28452 0.10 +28453 0.10 +28454 0.10 +28455 0.10 +28456 0.10 +28457 0.10 +28458 0.10 +28459 0.10 +28460 0.05 +28461 0.05 +28462 0.05 +28463 0.05 +28464 0.05 +28465 0.05 +28466 0.05 +28467 0.05 +28468 0.05 +28469 0.05 +28470 0.05 +28471 0.05 +28472 0.05 +28473 0.05 +28474 0.05 +28475 0.05 +28476 0.05 +28477 0.05 +40638 0.05 +40639 0.05 +40640 0.05 +40641 0.05 +40642 0.05 +40643 0.05 +40644 0.05 +40645 0.05 +40646 0.05 +40647 0.05 +40648 0.10 +40649 0.10 +40650 0.10 +40651 0.10 +40652 0.10 +40653 0.10 +40654 0.10 +40655 0.10 +40656 0.10 +40657 0.10 +40658 0.10 +40659 0.10 +40660 0.10 +40661 0.10 +40662 0.10 +40663 0.10 +40664 0.10 +40665 0.10 +40666 0.10 +40667 0.10 +40668 0.10 +40669 0.10 +40670 0.10 +40671 0.10 +40672 0.10 +40673 0.10 +40674 0.10 +40675 0.10 +40676 0.10 +40677 0.10 +40678 0.10 +40679 0.10 +40680 0.15 +40681 0.15 +40682 0.15 +40683 0.15 +40684 0.15 +40685 0.15 +40686 0.15 +40687 0.10 +40688 0.10 +40689 0.10 +40690 0.10 +40691 0.10 +40692 0.10 +40693 0.05 +40694 0.05 +40695 0.05 +40696 0.05 +40697 0.05 +40698 0.05 +40699 0.05 +40700 0.05 +40701 0.05 +40702 0.05 +40703 0.05 +40704 0.05 +40705 0.05 +40706 0.05 +40707 0.05 +40708 0.05 +40709 0.05 +40710 0.05 +40711 0.05 +40712 0.05 +40713 0.05 +40714 0.05 +40715 0.05 +40716 0.05 +40717 0.05 +40718 0.05 +40719 0.05 +40720 0.05 +40721 0.05 +40722 0.05 +40723 0.05 +40724 0.05 +40725 0.05 +40726 0.05 +40727 0.05 +40728 0.05 +40729 0.05 +40730 0.05 +40895 0.05 +40896 0.05 +40897 0.05 +40898 0.05 +40899 0.05 +40900 0.05 +40901 0.05 +40902 0.05 +40903 0.05 +40904 0.05 +40905 0.05 +40906 0.05 +40907 0.05 +40908 0.05 +40909 0.05 +40910 0.05 +40911 0.05 +40912 0.05 +40913 0.05 +40914 0.05 +40915 0.05 +40916 0.05 +40917 0.05 +40918 0.05 +40919 0.05 +40920 0.05 +40921 0.05 +40922 0.05 +40923 0.05 +40924 0.05 +40925 0.05 +40926 0.05 +40927 0.05 +40928 0.05 +40929 0.05 +40930 0.05 +40931 0.05 +40932 0.05 +40933 0.05 +40934 0.05 +40935 0.05 +40936 0.05 +40937 0.05 +40938 0.05 +40939 0.05 +40940 0.05 +40941 0.05 +40942 0.05 +40943 0.05 +40944 0.05 +40945 0.05 +57998 0.05 +57999 0.05 +58000 0.05 +58001 0.05 +58002 0.05 +58003 0.05 +58004 0.05 +58005 0.05 +58006 0.05 +58007 0.05 +58008 0.05 +58009 0.05 +58010 0.05 +58011 0.05 +58012 0.05 +58013 0.05 +58014 0.05 +58015 0.05 +58016 0.05 +58017 0.05 +58018 0.05 +58019 0.05 +58020 0.05 +58021 0.05 +58022 0.05 +58023 0.05 +58024 0.05 +58025 0.05 +58026 0.05 +58027 0.05 +58028 0.05 +58029 0.05 +58030 0.05 +58031 0.05 +58032 0.05 +58033 0.05 +58034 0.05 +58035 0.05 +58036 0.05 +58037 0.05 +58038 0.05 +58039 0.05 +58040 0.05 +58041 0.05 +58042 0.05 +58043 0.05 +58044 0.05 +58045 0.05 +58046 0.05 +58047 0.05 +58135 0.05 +58136 0.05 +58137 0.05 +58138 0.05 +58139 0.05 +58140 0.05 +58141 0.05 +58142 0.05 +58143 0.05 +58144 0.05 +58145 0.05 +58146 0.05 +58147 0.05 +58148 0.05 +58149 0.05 +58150 0.05 +58151 0.05 +58152 0.05 +58153 0.05 +58154 0.05 +58155 0.05 +58156 0.05 +58157 0.05 +58158 0.05 +58159 0.05 +58160 0.05 +58161 0.05 +58162 0.05 +58163 0.05 +58164 0.05 +58165 0.05 +58166 0.05 +58167 0.05 +58168 0.05 +58169 0.05 +58170 0.05 +58171 0.05 +58172 0.05 +58173 0.05 +58174 0.05 +58175 0.05 +58176 0.05 +58177 0.05 +58178 0.05 +58179 0.05 +58180 0.05 +58181 0.05 +58182 0.05 +58183 0.05 +58184 0.05 +58185 0.05 +80866 0.05 +80867 0.05 +80868 0.05 +80869 0.05 +80870 0.05 +80871 0.05 +80872 0.05 +80873 0.05 +80874 0.05 +80875 0.05 +80876 0.05 +80877 0.05 +80878 0.05 +80879 0.05 +80880 0.05 +80881 0.05 +80882 0.05 +80883 0.05 +80884 0.05 +80885 0.05 +80886 0.05 +80887 0.05 +80888 0.05 +80889 0.05 +80890 0.05 +80891 0.05 +80892 0.05 +80893 0.05 +80894 0.05 +80895 0.05 +80896 0.05 +80897 0.05 +80898 0.05 +80899 0.05 +80900 0.05 +80901 0.05 +80902 0.05 +80903 0.05 +80904 0.05 +80905 0.05 +80906 0.05 +80907 0.05 +80908 0.05 +80909 0.05 +80910 0.05 +80911 0.05 +80912 0.05 +80913 0.05 +80914 0.05 +80915 0.05 +80916 0.05 +87735 0.05 +87736 0.05 +87737 0.05 +87738 0.05 +87739 0.05 +87740 0.05 +87741 0.05 +87742 0.05 +87743 0.05 +87744 0.05 +87745 0.05 +87746 0.05 +87747 0.05 +87748 0.05 +87749 0.05 +87750 0.05 +87751 0.05 +87752 0.05 +87753 0.05 +87754 0.05 +87755 0.05 +87756 0.05 +87757 0.05 +87758 0.05 +87759 0.05 +87760 0.05 +87761 0.05 +87762 0.05 +87763 0.05 +87764 0.05 +87765 0.05 +87766 0.05 +87767 0.05 +87768 0.05 +87769 0.05 +87770 0.05 +87771 0.05 +87772 0.05 +87773 0.05 +87774 0.05 +87775 0.05 +87776 0.05 +87777 0.05 +87778 0.05 +87779 0.05 +87780 0.05 +87781 0.05 +87782 0.05 +87800 0.05 +87801 0.05 +87802 0.05 +87803 0.05 +87804 0.05 +87805 0.05 +87806 0.05 +87807 0.05 +87808 0.05 +87809 0.05 +87810 0.05 +87811 0.05 +87812 0.05 +87813 0.05 +87814 0.05 +87815 0.05 +87816 0.05 +87817 0.05 +87818 0.05 +87819 0.05 +87820 0.05 +87821 0.05 +87822 0.05 +87823 0.05 +87824 0.05 +87825 0.05 +87826 0.05 +87827 0.05 +87828 0.05 +87829 0.05 +87830 0.05 +87831 0.05 +87832 0.05 +87833 0.05 +87834 0.05 +87835 0.05 +87836 0.05 +87837 0.05 +87838 0.05 +87839 0.05 +87840 0.05 +87841 0.05 +94827 0.05 +94828 0.05 +94829 0.05 +94830 0.05 +94831 0.05 +94832 0.05 +94833 0.05 +94834 0.05 +94835 0.05 +94836 0.05 +94837 0.05 +94838 0.05 +94839 0.05 +94840 0.05 +94841 0.05 +94842 0.05 +94843 0.05 +94844 0.05 +94845 0.05 +94846 0.05 +94847 0.05 +94848 0.05 +94849 0.05 +94850 0.05 +94851 0.05 +94852 0.05 +94853 0.05 +94854 0.05 +94855 0.05 +94856 0.05 +94857 0.05 +94858 0.05 +94859 0.05 +94860 0.05 +94861 0.05 +94862 0.05 +94863 0.05 +94864 0.05 +94865 0.05 +94866 0.05 +94867 0.05 +94868 0.05 +94869 0.05 +94870 0.05 +94871 0.05 +94872 0.05 +94873 0.05 +94874 0.05 +94875 0.05 +94876 0.05 +94877 0.05 +variableStep chrom=chrY +variableStep chrom=chrX +variableStep chrom=chr9 +variableStep chrom=chrM +variableStep chrom=chr22 +variableStep chrom=chr20 +variableStep chrom=chr21 +variableStep chrom=chr7 +variableStep chrom=chr6 +variableStep chrom=chr5 +variableStep chrom=chr4 +variableStep chrom=chr2