|
[up]
|
|
drwxr-xr-x |
 hg19.HouseKeepingGenes_30.bed
|
6099 |
-rw-r--r-- |
|
hg19.chrom.sizes
|
1971 |
-rw-r--r-- |
|
hg19_RefSeq_chr1_1-100000.bed
|
527 |
-rw-r--r-- |
|
output.DupRate_plot.pdf
|
4675 |
-rw-r--r-- |
|
output.DupRate_plot.r
|
860 |
-rw-r--r-- |
|
output.FPKM.xls
|
429 |
-rw-r--r-- |
|
output.GC.xls
|
159 |
-rw-r--r-- |
|
output.GC_plot.pdf
|
4949 |
-rw-r--r-- |
|
output.GC_plot.r
|
302 |
-rw-r--r-- |
|
output.NVC.xls
|
924 |
-rw-r--r-- |
|
output.NVC_plot.pdf
|
6869 |
-rw-r--r-- |
|
output.NVC_plot.r
|
1583 |
-rw-r--r-- |
|
output.bamstats.txt
|
777 |
-rw-r--r-- |
|
output.clipping_profile.pdf
|
5181 |
-rw-r--r-- |
|
output.clipping_profile.r
|
534 |
-rw-r--r-- |
|
output.clipping_profile.xls
|
572 |
-rw-r--r-- |
|
output.deletion_profile.pdf
|
5007 |
-rw-r--r-- |
|
output.deletion_profile.r
|
647 |
-rw-r--r-- |
|
output.deletion_profile.txt
|
525 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage.curves.pdf
|
4849 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage.r
|
758 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage.txt
|
755 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage2.curves.pdf
|
4949 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage2.r
|
541 |
-rw-r--r-- |
|
output.geneBodyCoverage2.txt
|
707 |
-rw-r--r-- |
|
output.infer_experiment.txt
|
183 |
-rw-r--r-- |
|
output.inner_distance.txt
|
1120 |
-rw-r--r-- |
|
output.inner_distance_freq.txt
|
1015 |
-rw-r--r-- |
|
output.inner_distance_plot.pdf
|
8520 |
-rw-r--r-- |
|
output.inner_distance_plot.r
|
1126 |
-rw-r--r-- |
|
output.insertion_profile.pdf
|
4968 |
-rw-r--r-- |
|
output.insertion_profile.r
|
506 |
-rw-r--r-- |
|
output.insertion_profile.xls
|
533 |
-rw-r--r-- |
|
output.junction.xls
|
163 |
-rw-r--r-- |
|
output.junctionSaturation_plot.pdf
|
5083 |
-rw-r--r-- |
|
output.junctionSaturation_plot.r
|
589 |
-rw-r--r-- |
|
output.junction_plot.r
|
500 |
-rw-r--r-- |
|
output.mismatch_profile.pdf
|
0 |
-rw-r--r-- |
|
output.mismatch_profile.r
|
0 |
-rw-r--r-- |
|
output.mismatch_profile.xls
|
20 |
-rw-r--r-- |
|
output.pos.DupRate.xls
|
31 |
-rw-r--r-- |
|
output.qual.boxplot.pdf
|
6049 |
-rw-r--r-- |
|
output.qual.heatmap.pdf
|
18869 |
-rw-r--r-- |
|
output.qual.r
|
18869 |
-rw-r--r-- |
|
output.read_distribution.txt
|
1110 |
-rw-r--r-- |
|
output.saturation.pdf
|
9055 |
-rw-r--r-- |
|
output.seq.DupRate.xls
|
31 |
-rw-r--r-- |
|
output.splice_events.pdf
|
12367 |
-rw-r--r-- |
|
output.splice_junction.pdf
|
12378 |
-rw-r--r-- |
|
output.tin.xls
|
263 |
-rw-r--r-- |
|
output2.geneBodyCoverage.curves.pdf
|
5067 |
-rw-r--r-- |
|
output2.geneBodyCoverage.heatMap.pdf
|
6380 |
-rw-r--r-- |
|
output2.geneBodyCoverage.r
|
2887 |
-rw-r--r-- |
|
output2.geneBodyCoverage.txt
|
1663 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.R1.fastq
|
2437 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.R1.fastq.gz
|
1183 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.R2.fastq
|
2437 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.bam
|
3449 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_chr1_1-100000.bigwig
|
61290 |
-rw-r--r-- |
|
pairend_strandspecific_51mer_hg19_random.bam
|
280402 |
-rw-r--r-- |
|
testwig.Forward.wig
|
1735 |
-rw-r--r-- |
|
testwig.Reverse.wig
|
20545 |
-rw-r--r-- |
|
testwig.wig
|
20006 |
-rw-r--r-- |
|
testwig_wigsum100.wig
|
20006 |
-rw-r--r-- |
