Mercurial > repos > nick > duplex
directory /mafft/core/ @ 18:e4d75f9efb90 draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 DNA.h
|
8094 | -rw-r--r-- |
|
Falign.c
|
62726 | -rw-r--r-- |
|
Falign_localhom.c
|
21994 | -rw-r--r-- |
|
Galign11.c
|
20716 | -rw-r--r-- |
|
JTT.c
|
8491 | -rw-r--r-- |
|
Lalign11.c
|
25111 | -rw-r--r-- |
|
Lalignmm.c
|
55067 | -rw-r--r-- |
|
MSalign11.c
|
13343 | -rw-r--r-- |
|
MSalignmm.c
|
86078 | -rw-r--r-- |
|
Makefile
|
19379 | -rw-r--r-- |
|
Makefile.sos
|
18908 | -rw-r--r-- |
|
SAalignmm.c
|
8362 | -rw-r--r-- |
|
Salignmm.c
|
61483 | -rw-r--r-- |
|
addfunctions.c
|
13339 | -rw-r--r-- |
|
addsingle.c
|
81086 | -rw-r--r-- |
|
blosum.c
|
14027 | -rw-r--r-- |
|
blosum.h
|
256 | -rw-r--r-- |
|
constants.c
|
42787 | -rw-r--r-- |
|
contrafoldwrap.c
|
7784 | -rw-r--r-- |
|
countlen.c
|
1061 | -rw-r--r-- |
|
defs.c
|
2793 | -rw-r--r-- |
|
disttbfast.c
|
74058 | -rw-r--r-- |
|
dndblast.c
|
8950 | -rw-r--r-- |
|
dndfast4.c
|
5232 | -rw-r--r-- |
|
dndfast7.c
|
7406 | -rw-r--r-- |
|
dndpre.c
|
8415 | -rw-r--r-- |
|
dndpre_score.c
|
944 | -rw-r--r-- |
|
dp.h
|
185 | -rw-r--r-- |
|
dvtditr.c
|
27219 | -rw-r--r-- |
|
f2cl.c
|
5906 | -rw-r--r-- |
|
fft.c
|
3841 | -rw-r--r-- |
|
fft.h
|
287 | -rw-r--r-- |
|
fftFunctions.c
|
16761 | -rw-r--r-- |
|
functions.h
|
33527 | -rw-r--r-- |
|
genalign11.c
|
12757 | -rw-r--r-- |
|
getlag.c
|
11132 | -rw-r--r-- |
|
interface.c
|
9177 | -rw-r--r-- |
|
io.c
|
120751 | -rw-r--r-- |
|
iteration.c
|
9324 | -rw-r--r-- |
|
mafft-distance.c
|
8653 | -rw-r--r-- |
|
mafft-homologs.1
|
4550 | -rw-r--r-- |
|
mafft-homologs.tmpl
|
8409 | -rw-r--r-- |
|
mafft-profile.c
|
11621 | -rw-r--r-- |
|
mafft.1
|
14771 | -rw-r--r-- |
|
mafft.bat
|
299 | -rwxr-xr-x |
|
mafft.h
|
198 | -rw-r--r-- |
|
mafft.tmpl
|
84405 | -rw-r--r-- |
|
mafftash_premafft.tmpl
|
10475 | -rw-r--r-- |
|
makedirectionlist.c
|
17987 | -rw-r--r-- |
|
makemergetable.rb
|
476 | -rwxr-xr-x |
|
mccaskillwrap.c
|
10732 | -rw-r--r-- |
|
mingw64mingw32
|
1087 | -rwxr-xr-x |
|
mingw64mingw32dll
|
473 | -rwxr-xr-x |
|
miyata.h
|
711 | -rw-r--r-- |
|
miyata5.h
|
4635 | -rw-r--r-- |
|
mltaln.h
|
7169 | -rw-r--r-- |
|
mltaln9.c
|
220664 | -rw-r--r-- |
|
mtxutl.c
|
9371 | -rw-r--r-- |
|
mtxutl.h
|
1218 | -rw-r--r-- |
|
multi2hat3s.c
|
8737 | -rw-r--r-- |
|
newick2mafft.rb
|
2486 | -rwxr-xr-x |
|
nj.c
|
4969 | -rw-r--r-- |
|
pair2hat3s.c
|
10478 | -rw-r--r-- |
|
pairash.c
|
30600 | -rw-r--r-- |
|
pairlocalalign.c
|
79643 | -rw-r--r-- |
|
partSalignmm.c
|
54338 | -rw-r--r-- |
|
regionalrealignment.rb
|
8976 | -rwxr-xr-x |
|
regtable2seq.c
|
4569 | -rw-r--r-- |
|
replaceu.c
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|
restoreu.c
|
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|
rna.c
|
14440 | -rw-r--r-- |
|
rnatest.c
|
10076 | -rw-r--r-- |
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score.c
|
2342 | -rw-r--r-- |
|
seekquencer_premafft.tmpl
|
15541 | -rwxr-xr-x |
|
seq2regtable.c
|
1553 | -rw-r--r-- |
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setcore.c
|
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setdirection.c
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sextet5.c
|
6088 | -rw-r--r-- |
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share.h
|
323 | -rw-r--r-- |
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splittbfast.c
|
82996 | -rw-r--r-- |
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suboptalign11.c
|
14116 | -rw-r--r-- |
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tbfast.c
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tddis.c
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18667 | -rw-r--r-- |
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tditeration.c
|
67690 | -rw-r--r-- |
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treeOperation.c
|
16530 | -rw-r--r-- |
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univscript.tmpl
|
1345 | -rw-r--r-- |
|
version.c
|
83 | -rw-r--r-- |