# HG changeset patch
# User matthias
# Date 1545156126 18000
# Node ID ead5013ec8e406f68dbe8030d88dffd36924fe82
# Parent  c9fffbd29afcc55d2d3d7dd1bce48fbf2e6125da
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/stacks2 commit 9c41b2599125298b1a4d9ffb2511cdc87ff79a73

diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 macros.xml
--- a/macros.xml	Fri Nov 30 07:40:25 2018 -0500
+++ b/macros.xml	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -8,7 +8,7 @@
     </xml>
 
     <token name="@STACKS_VERSION@">2.2</token>
-    <token name="@WRAPPER_VERSION@">1</token>
+    <token name="@WRAPPER_VERSION@">2</token>
 
     <xml name="stdio">
         <stdio>
@@ -128,6 +128,7 @@
         </data>
     </xml>
 
+
     <!-- fastq input -->
     <xml name="fastq_input_macro" token_fastq_optional="false">
         <conditional name="input_type">
@@ -139,7 +140,7 @@
                 <param name="samples" argument="-f" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" type="data" label="Reads" multiple="true" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/>
             </when>
             <when value="list">
-                <param name="samples" argument="-f" type="data_collection" collection_type="list,list:paired" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" label="List for forward reads or read pairs" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/>
+                <param name="samples" argument="-f" type="data_collection" collection_type="list:paired" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" label="List for forward reads or read pairs" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/>
             </when>
         </conditional>
     </xml>
@@ -147,30 +148,33 @@
          appends noting/.1/.2 to the link name for accessing the fastq data
          sets variables $name and $data_path-->
     <token name="@FASTQ_INPUT@"><![CDATA[
+    ## TODO should use sample.identidfier if possible (see corresp. preproc macro)
     #set $name = $clean_ext($sample.name)
     #set $data_path = "stacks_inputs/" + $name
     #if $sample.is_collection:
-        #set $sample=$sample[$read_direction]
+        #set $cur_sample=$sample[$read_direction]
+    #else:
+        #set $cur_sample=$sample
     #end if
     #if $read_direction == "forward":
         #set $data_path =  $data_path + ".1"
     #elif $read_direction == "reverse":
         #set $data_path =  $data_path + ".2"
     #end if
-    #if $sample.is_of_type('fastqsanger')
+    #if $cur_sample.is_of_type('fastqsanger')
         #set $data_path =  $data_path + ".fq"
         #set inputype = "fastq"
-    #else if $sample.is_of_type('fastqsanger.gz')
+    #else if $cur_sample.is_of_type('fastqsanger.gz')
         #set $data_path = $data_path + ".fq.gz"
         #set inputype = "gzfastq"
-    #else if $sample.is_of_type('fasta')
+    #else if $cur_sample.is_of_type('fasta')
         #set $data_path = $data_path + ".fa"
         #set inputype = "fasta"
     #else
         #set $data_path = $data_path + ".fa.gz"
         #set inputype = "gzfasta"
     #end if
-    ln -s '$sample' '${data_path}' &&
+    ln -s '$cur_sample' '${data_path}' &&
     ]]></token>
 
     <!-- macro and token for BAM input-->
@@ -188,15 +192,6 @@
     #end for
     ]]></token>
 
-    <xml name="discover_faqgz_output_macro" token_pattern="" token_dir="">
-        <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="@PATTERN@" dir="@DIR@"/>
-        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fq\.gz$" ext="fastqsanger.gz" directory="@DIR@/" />
-        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fa\.gz$" ext="fasta.gz" directory="@DIR@/" />
-    </xml>
-    <xml name="discover_faq_output_macro" token_pattern="" token_dir="">
-        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fq$" ext="fastqsanger" directory="@DIR@/" />
-        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fa$" ext="fasta" directory="@DIR@/" />
-    </xml>
     <token name="@CLEAN_EXT@">
         <![CDATA[
         #from os.path import splitext
@@ -412,19 +407,19 @@
         <param argument="--gt-alpha" name="gt_alpha" type="float" value="0.05" min="0" label="alpha threshold for calling genotypes" />
     </xml>
 
-    <xml name="barcode_encoding_single">
-        <option value="--inline_null" selected="True">Barcode is inline with sequence, occurs only on single-end read</option>
-        <option value="--index_null">Barcode is provded in FASTQ header (Illumina i5 or i7 read)</option>
+    <xml name="barcode_encoding_single" token_type="">
+        <option value="--inline_null" selected="True">@TYPE@ is inline with sequence, occurs only on single-end read (--inline_null)</option>
+        <option value="--index_null">@TYPE@ is provded in FASTQ header (Illumina i5 or i7 read) (--index_null)</option>
         <yield/>
     </xml>
 
-    <xml name="barcode_encoding_pair">
-        <expand macro="barcode_encoding_single">    
-            <option value="--null_index">barcode is provded in FASTQ header (Illumina i7 read if both i5 and i7 read are provided)</option>
-            <option value="--inline_inline">barcode is inline with sequence, occurs on single and paired-end read</option>
-            <option value="--index_index">barcode is provded in FASTQ header (Illumina i5 and i7 reads).</option>
-            <option value="--inline_index">barcode is inline with sequence on single-end read and occurs in FASTQ header (from either i5 or i7 read)</option>
-            <option value="--index_inline"></option>
+    <xml name="barcode_encoding_pair" token_type="">
+        <expand macro="barcode_encoding_single" type="@TYPE@">    
+            <option value="--null_index">@TYPE@ is provded in FASTQ header (Illumina i7 read if both i5 and i7 read are provided) (--null_index)</option>
+            <option value="--inline_inline">@TYPE@ is inline with sequence, occurs on single and paired-end read (--inline_inline)</option>
+            <option value="--index_index">@TYPE@ is provded in FASTQ header (Illumina i5 and i7 reads) (--index_index)</option>
+            <option value="--inline_index">@TYPE@ is inline with sequence on single-end read and occurs in FASTQ header (from either i5 or i7 read) (--inline_index)</option>
+            <option value="--index_inline">@TYPE@ occurs in FASTQ header (Illumina i5 or i7 read) and is inline with sequence on single-end read (if single read data) or paired-end read (if paired data) (--index_inline)</option>
         </expand>    
     </xml>
 </macros>
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 macros_process.xml
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/macros_process.xml	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -0,0 +1,235 @@
+<?xml version="1.0"?>
+
+<!-- macros and tokens for process_radtags and process_short_reads -->
+
+<macros>
+    <!-- fastq input for process_radtags/shortreads-->
+    <xml name="process_inputs">
+        <conditional name="input_type">
+            <param name="options_type_selector" type="select" label="Single-end or paired-end reads files">
+                <option value="single" selected="True">Single-end files</option>
+                <option value="paired">Paired-end files</option>
+            </param>
+            <when value="single">
+                <param name="fqinputs" argument="-f" format="fastqsanger,fastqsanger.gz" multiple="true" type="data" label="singles-end reads infile(s)" help="input files" />
+                <param name="barcode_encoding" type="select" label="Barcode location">
+                    <expand macro="barcode_encoding_single" type="Barcode" />
+                </param>
+            </when>
+            <when value="paired">
+                <param name="fqinputs" type="data_collection" collection_type="list:paired" label="paired-end reads infile(s)" format="fastqsanger,fastqsanger.gz"/>
+                <param name="barcode_encoding" type="select" label="Barcode location">
+                    <expand macro="barcode_encoding_pair" type="Barcode" />
+                </param>
+            </when>
+        </conditional>
+        <param name="barcode" argument="-b" type="data"  format="tabular,txt" label="Barcode file" />
+    </xml>
+    <token name="@FASTQ_INPUT_PREPROC@"><![CDATA[
+    #for $input in $input_type.fqinputs:
+        #if $input_type.options_type_selector == "single"
+            #set $isfq=$input.is_of_type('fastqsanger')
+            #set $name=$clean_ext($input.element_identifier)
+        #else:
+            #set $isfq=$input.forward.is_of_type('fastqsanger')
+            ## TODO if https://github.com/galaxyproject/galaxy/pull/7031 is
+            ## backported use element_identifier consistently and fix release in <tool>?
+            #set $name=$clean_ext($input.name)
+        #end if
+    
+        #if $isfq:
+            #set $ext = "fastq"
+            #set inputype = "fastq"
+        #else
+            #set $ext = "fastq.gz"
+            #set inputype = "gzfastq"
+        #end if
+    
+        #if $input_type.options_type_selector == "single"
+            ln -s '$input' 'stacks_inputs/${name}.${ext}' &&
+        #else:
+            ## procrad needs _R[12]_ in the file name, so we add an add 0
+            ln -s '$input.forward' 'stacks_inputs/${name}_R1_0.${ext}' &&
+            ln -s '$input.reverse' 'stacks_inputs/${name}_R2_0.${ext}' &&
+        #end if
+    #end for
+    ]]></token>
+    <token name="@PROCESS_IOOPTIONS@"><![CDATA[
+    -p stacks_inputs/
+    #if $input_type.options_type_selector == "paired"
+        --paired
+    #end if
+    -i $inputype
+    -b '$barcode'
+    $input_type.barcode_encoding
+    #if str( $outype ) != "auto"
+        -y $outype
+    #end if
+    -o stacks_outputs
+    ]]></token>
+    <xml name="process_output_types">
+        <param name="outype" argument="-y" type="select" label="Output format" >
+            <option value="auto" selected="True">Same as input</option>
+            <option value="fastq">fastq</option>
+            <option value="fasta">fasta</option>
+            <option value="gzfastq">gzipped fastq</option>
+            <option value="gzfasta">gzipped fasta</option>
+        </param>
+    </xml>
+
+    <xml name="discover_faqgz_output_macro" token_pattern="" token_dir="">
+        <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="@PATTERN@" dir="@DIR@"/>
+        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fq\.gz$" ext="fastqsanger.gz" directory="@DIR@/" />
+        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fa\.gz$" ext="fasta.gz" directory="@DIR@/" />
+    </xml>
+    <xml name="discover_faq_output_macro" token_pattern="" token_dir="">
+        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fq$" ext="fastqsanger" directory="@DIR@/" />
+        <discover_datasets pattern="@PATTERN@\.fa$" ext="fasta" directory="@DIR@/" />
+    </xml>
+
+    <xml name="process_outputs">
+        <collection name="demultiplexed" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads">
+            <filter>input_type['options_type_selector'] == "single"</filter>
+            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;name&gt;.+)" dir="stacks_outputs"/>
+        </collection>
+        <collection name="demultiplexed_paired" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads">
+            <filter>input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
+            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs"/>
+        </collection>
+
+        <collection name="remaining" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Remaining orphan reads">
+            <filter>input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
+            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.rem\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs/remaining"/>
+        </collection>
+
+        <!-- note irrespective of -y output is always named fastq and are never zipped -->
+        <collection name="discarded" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Discarded reads">
+            <filter>capture is True and input_type['options_type_selector'] == "single"</filter>
+            <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="(?P&lt;name&gt;.*)" dir="stacks_outputs/discarded"/>
+        </collection>
+        <collection name="discarded_paired" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Discarded reads">
+            <filter>capture is True and input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
+            <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs/discarded"/>
+        </collection>
+    </xml>
+
+    <!-- FASTQ filtering options -->
+    <xml name="process_filter">
+        <conditional name="filter_cond" >
+            <param name="filter_select" type="select" label="do quality filtering">
+                <option value="yes">Yes</option>
+                <option value="no" selected="true">No</option>
+            </param>
+            <when value="yes">
+                <param name="sliding" type="float" value="0.15" min="0" max="1" argument="-w" label="Set the size of the sliding window as a fraction of the read length, between 0 and 1" />
+                <param name="score" type="integer" value="10" min="0" max="40" argument="-s" label="Set the score limit. If the average score within the sliding window drops below this value, the read is discarded" />
+                <param name="remove" type="boolean" checked="false" truevalue="-c" falsevalue="" argument="-c" label="Clean data, remove any read with an uncalled base" />
+                <param name="discard" type="boolean" checked="false" truevalue="-q" falsevalue="" argument="-q" label="Discard reads with low quality scores"/>
+                <param argument="--filter_illumina" type="boolean" checked="false" truevalue="--filter_illumina" falsevalue="" label="discard reads that have been marked by Illumina's chastity/purity filter as failing" />
+            </when>
+            <when value="no">
+                <param argument="--len_limit" type="integer" value="" optional="true" label="minimum sequence length" help="useful if your data has already been trimmed"/>
+            </when>
+        </conditional>
+        <param name="capture" type="boolean" checked="false" truevalue="-D" falsevalue="" argument="-D" label="Capture discarded reads to a file" />
+    </xml>
+    <token name="@PROCESS_FILTER@"><![CDATA[
+    #if $filter_cond.filter_select == 'yes':
+        -w $filter_cond.sliding
+        -s $filter_cond.score
+        $filter_cond.remove
+        $filter_cond.discard
+        $filter_cond.filter_illumina
+    #else
+        #if str($filter_cond.len_limit) != "":
+            --len_limit $filter_cond.len_limit
+        #end if
+    #end if
+    $capture
+    ]]></token>
+    <token name="@PROCESS_FASTQ_POSTPROC@"><![CDATA[
+    #if $capture:
+        && mkdir stacks_outputs/discarded/
+        && mv stacks_outputs/*discards stacks_outputs/discarded/
+
+        ## fix the _R[12]_0 that was added for preparing the input
+        #if $input_type.options_type_selector == 'paired':
+            && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/_R1_0/.1/; s/_R2_0/.2/;')"; done
+        #end if
+        ## also remove the gz which is added by procrad (but its uncompressed)
+        && find stacks_outputs/discarded/ -type f -iname "*.gz.discards" | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/.gz.discards$/.discards/;')"; done
+
+        ## the discard files are named fastq even if the output is fasta
+        #if str($outype).endswith("fasta"):
+            && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.fastq.discards/.fa/;')"; done
+        #else
+            && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.fastq.discards/.fq/;')"; done
+        #end if
+    #end if
+    ## prepare paired read output for processing in galaxy
+    #if $input_type.options_type_selector == 'paired':
+        && mkdir stacks_outputs/remaining
+        && find stacks_outputs -iregex ".*\.rem\.[12]\.f[aq]\(\.gz\)?" | while read file; do mv "\$file" stacks_outputs/remaining/; done
+        && find stacks_outputs/ -iregex ".*.f[aq]\(\.gz\)?" | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.1\./.forward./; s/\.2\./.reverse./')"; done
+    #end if
+    ]]></token>
+
+
+
+    <!-- adapter trimming options -->
+    <xml name="process_adapter">
+            <param argument="--adapter_1" type="text" value="" optional="true" label="adaptor sequence that may occur on the first read" />
+            <param argument="--adapter_2" type="text" value="" optional="true" label="adaptor sequence that may occur on the paired-read" />
+            <param argument="--adapter_mm" type="integer" value="" optional="true" label="number of mismatches allowed in the adapter sequence"/>
+    </xml>
+    <token name="@PROCESS_ADAPTER@"><![CDATA[
+    ## Adapter options
+    #if str($options_advanced.adapter_1) != "":
+        --adapter_1 $options_advanced.adapter_1
+    #end if
+    #if str($options_advanced.adapter_2) != "":
+        --adapter_2 $options_advanced.adapter_2
+    #end if
+    #if str($options_advanced.adapter_mm) != "":
+        --adapter_mm $options_advanced.adapter_mm
+    #end if
+    ]]></token>
+
+    <!-- barcode rescue options -->
+    <xml name="rescue_barcode">
+        <conditional name="rescue_cond">
+            <param name="rescue" type="select" argument="-r" label="Rescue mutated barcodes and RAD-Tags?">
+                <option value="-r">yes</option>
+                <option value="" selected="true">no</option>
+            </param>
+	    <when value="-r">
+                <param argument="--barcode_dist_1" type="integer" value="" optional="true" label="number of allowed mismatches when rescuing first read barcodes" help="(default 1)"/>
+    	        <param argument="--barcode_dist_2" type="integer" value="" optional="true" label="number of allowed mismatches when rescuing paired read barcodes" help="(default value for single end barcodes)"/>
+            </when>
+            <when value=""/>
+        </conditional>
+    </xml>
+    <token name="@RESCUE_BARCODE@"><![CDATA[
+    #if str($options_advanced.rescue_cond.rescue) != ""
+        $options_advanced.rescue_cond.rescue
+        #if str($options_advanced.rescue_cond.barcode_dist_1) != "":
+            --barcode_dist_1 $options_advanced.rescue_cond.barcode_dist_1
+        #end if
+        #if str($options_advanced.rescue_cond.barcode_dist_2) != "":
+            --barcode_dist_2 $options_advanced.rescue_cond.barcode_dist_2
+        #end if
+    #end if
+    ]]></token>
+
+    <!-- advanced options that are shared --> 
+    <xml name="common_advanced">
+        <param name="truncate" type="integer" value="" optional="True" argument="-t" label="Truncate final read length to this value" />
+        <param argument="--retain_header" type="boolean" checked="false" truevalue="--retain_header" falsevalue="" label="Retain unmodified FASTQ headers in the output" />
+    </xml>
+    <token name="@COMMON_ADVANCED@"><![CDATA[
+    #if str($options_advanced.truncate)
+        -t $options_advanced.truncate
+    #end if
+    $options_advanced.retain_header
+    ]]></token>
+</macros>
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 stacks_procrad.xml
--- a/stacks_procrad.xml	Fri Nov 30 07:40:25 2018 -0500
+++ b/stacks_procrad.xml	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -2,76 +2,25 @@
 <description>the Stacks demultiplexing script</description>
     <macros>
         <import>macros.xml</import>
+        <import>macros_process.xml</import>
     </macros>
     <expand macro="requirements"/>
     <expand macro="stdio"/>
     <expand macro="version_cmd"/>
     <command><![CDATA[
 @CLEAN_EXT@
-
 mkdir stacks_inputs stacks_outputs &&
-
-#for $input in $input_type.fqinputs:
-    #if $input_type.options_type_selector == "single"
-        #set $isfq=$input.is_of_type('fastqsanger')
-        #set $name=$clean_ext($input.element_identifier)
-    #else:
-        #set $isfq=$input.forward.is_of_type('fastqsanger')
-        ## TODO if https://github.com/galaxyproject/galaxy/pull/7031 is backoported use element_identifier consistently and fix release in <tool>
-        #set $name=$clean_ext($input.name)
-    #end if
-
-    #if $isfq:
-        #set $ext = "fastq"
-        #set inputype = "fastq"
-    #else
-        #set $ext = "fastq.gz"
-        #set inputype = "gzfastq"
-    #end if
-
-    #if $input_type.options_type_selector == "single"
-        ln -s '$input' 'stacks_inputs/${name}.${ext}' &&
-    #else:
-        ## procrad needs _R[12]_ in the file name, so we add an add 0
-        ln -s '$input.forward' 'stacks_inputs/${name}_R1_0.${ext}' &&
-        ln -s '$input.reverse' 'stacks_inputs/${name}_R2_0.${ext}' &&
-    #end if
-
-#end for
+@FASTQ_INPUT_PREPROC@
 
 process_radtags
 
--p stacks_inputs/
-#if $input_type.options_type_selector == "paired"
-    --paired
-#end if
--i $inputype
--b '$barcode'
+@PROCESS_IOOPTIONS@
+@PROCESS_FILTER@
+@COMMON_ADVANCED@
+@RESCUE_BARCODE@
+@PROCESS_ADAPTER@
 
-#if $filter_cond.filter_select == 'yes':
-    -w $filter_cond.sliding
-    -s $filter_cond.score
-    $filter_cond.remove
-    $filter_cond.discard
-    $filter_cond.filter_illumina
-#else
-    #if str($filter_cond.len_limit) != "":
-        --len_limit $filter_cond.len_limit
-    #end if
-#end if
-
-#if str($options_advanced.truncate)
-    -t $options_advanced.truncate
-#end if
-$options_advanced.rescue
-$capture
 ## -E not implemented in Galaxy defaults to phred33
-#if str( $outype ) != "auto"
-    -y $outype
-#end if
-
-## Barcode options
-$input_type.barcode_encoding
 
 ## Restriction enzyme options
 #if str($options_enzyme.enzyme) != '':
@@ -81,87 +30,20 @@
     --renz_2 $options_enzyme.enzyme2
 #end if
 
-## Protocol-specific options
+## advanced options not shared between shortreads and radtags
 $options_advanced.bestrad
-
-## Adapter options
-#if str($options_advanced.adapter_1) != "":
-    --adapter_1 $options_advanced.adapter_1
-#end if
-#if str($options_advanced.adapter_2) != "":
-    --adapter_2 $options_advanced.adapter_2
-#end if
-#if str($options_advanced.adapter_mm) != "":
-    --adapter_mm $options_advanced.adapter_mm
-#end if
+$options_advanced.disable_rad_check
 
 ## Output options
-$options_advanced.retain_header
 ## --merge not implemented in Galaxy
 
-## Advanced options
-$options_advanced.disable_rad_check
-#if str($options_advanced.barcode_dist_1) != "":
-    --barcode_dist_1 $options_advanced.barcode_dist_1
-#end if
-#if str($options_advanced.barcode_dist_2) != "":
-    --barcode_dist_2 $options_advanced.barcode_dist_2
-#end if
-
--o stacks_outputs
-
 && mv stacks_outputs/process_radtags.stacks_inputs.log $output_log
 
-#if $capture:
-    && mkdir stacks_outputs/discarded/
-    && mv stacks_outputs/*discards stacks_outputs/discarded/
-
-    ## fix the _R[12]_0 that was added for preparing the input
-    #if $input_type.options_type_selector == 'paired':
-    && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/_R1_0/.1/; s/_R2_0/.2/;')"; done
-    #end if
-    ## also remove the gz which is added by procrad (but its uncompressed)
-    && find stacks_outputs/discarded/ -type f -iname "*.gz.discards" | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/.gz.discards$/.discards/;')"; done
-
-    ## the discard files are named fastq even if the output is fasta
-    #if str($outype).endswith("fasta"):
-        && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.fastq.discards/.fa/;')"; done
-    #else
-        && find stacks_outputs/discarded/ -type f | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.fastq.discards/.fq/;')"; done
-    #end if
-#end if
-## prepare paired read output for processing in galaxy
-#if $input_type.options_type_selector == 'paired':
-    && mkdir stacks_outputs/remaining
-    && mv stacks_outputs/*.rem.[12].* stacks_outputs/remaining/
-    && find stacks_outputs/ -iregex ".*.f[aq]\(\.gz\)?" | while read file; do mv "\$file" "\$(echo \$file | sed 's/\.1\./.forward./; s/\.2\./.reverse./')"; done
-#end if
+@PROCESS_FASTQ_POSTPROC@
     ]]></command>
 
     <inputs>
-        <conditional name="input_type">
-            <param name="options_type_selector" type="select" label="Single-end or paired-end reads files">
-                <option value="single" selected="True">Single-end files</option>
-                <option value="paired">Paired-end files</option>
-            </param>
-            <when value="single">
-                <param name="fqinputs" argument="-f" format="fastqsanger,fastqsanger.gz" multiple="true" type="data" label="singles-end reads infile(s)" help="input files" />
-
-                <param name="barcode_encoding" type="select" label="Barcode location">
-                    <expand macro="barcode_encoding_single" />
-                </param>
-            </when>
-            <when value="paired">
-                <param name="fqinputs" type="data_collection" collection_type="list:paired" label="paired-end reads infile(s)" format="fastqsanger,fastqsanger.gz"/>
-<!--                <param name="inputs_paired1" argument="-1" format="fastqsanger,fastqsanger.gz" type="data" label="paired-end reads infile(s) 1" help="Files must have this syntax : name_R1_001.fastq" />-->
-<!--                <param name="inputs_paired2" argument="-2" format="fastqsanger,fastqsanger.gz" type="data" label="paired-end reads infile(s) 2" help="Files must have this syntax : name_R2_001.fastq" />-->
-                <param name="barcode_encoding" type="select" label="Barcode location">
-                    <expand macro="barcode_encoding_pair" />
-                </param>
-            </when>
-        </conditional>
-
-        <param name="barcode" argument="-b" type="data"  format="tabular,txt" label="Barcode file" />
+        <expand macro="process_inputs"/>
 
         <conditional name="options_enzyme">
             <param name="options_enzyme_selector" type="select" label="Number of enzymes">
@@ -184,71 +66,21 @@
         </conditional>
 
         <section name="options_advanced" title="advanced options" expanded="False">
-            <param name="truncate" type="integer" value="" optional="True" argument="-t" label="Truncate final read length to this value" />
-            <param name="rescue" type="boolean" checked="false" truevalue="-r" falsevalue="" argument="-r" label="Rescue barcodes and RAD-Tags?"/>
+	    <expand macro="common_advanced"/>
             <param argument="--bestrad" type="boolean" checked="false" truevalue="--bestrad" falsevalue="" label="library was generated using BestRAD, check for restriction enzyme on either read and potentially tranpose reads" />
-            <param argument="--retain_header" type="boolean" checked="false" truevalue="--retain_header" falsevalue="" label="Retain unmodified FASTQ headers in the output" />
             <param argument="--disable_rad_check" type="boolean" checked="false" truevalue="--disable_rad_check" falsevalue="" label="disable checking if the RAD site is intact" />
-            <param argument="--barcode_dist_1" type="integer" value="" optional="true" label="number of allowed mismatches when rescuing first read barcodes" help="(default 1)"/>
-            <param argument="--barcode_dist_2" type="integer" value="" optional="true" label="number of allowed mismatches when rescuing paired read barcodes" help="(default value for single end barcodes)"/>
-            <param argument="--adapter_1" type="text" value="" optional="true" label="adaptor sequence that may occur on the first read" />
-            <param argument="--adapter_2" type="text" value="" optional="true" label="adaptor sequence that may occur on the paired-read" />
-            <param argument="--adapter_mm" type="integer" value="" optional="true" label="number of mismatches allowed in the adapter sequence"/>
+	    <expand macro="rescue_barcode"/>
+	    <expand macro="process_adapter"/>
         </section>
 
-        <conditional name="filter_cond" >
-            <param name="filter_select" type="select" label="do quality filtering">
-                <option value="yes">Yes</option>
-                <option value="no" selected="true">No</option>
-            </param>
-            <when value="yes">
-                <param name="sliding" type="float" value="0.15" min="0" max="1" argument="-w" label="Set the size of the sliding window as a fraction of the read length, between 0 and 1" />
-                <param name="score" type="integer" value="10" min="0" max="40" argument="-s" label="Set the score limit. If the average score within the sliding window drops below this value, the read is discarded" />
-                <param name="remove" type="boolean" checked="false" truevalue="-c" falsevalue="" argument="-c" label="Clean data, remove any read with an uncalled base" />
-                <param name="discard" type="boolean" checked="false" truevalue="-q" falsevalue="" argument="-q" label="Discard reads with low quality scores"/>
-                <param argument="--filter_illumina" type="boolean" checked="false" truevalue="--filter_illumina" falsevalue="" label="discard reads that have been marked by Illumina's chastity/purity filter as failing" />
-            </when>
-            <when value="no">
-                <param argument="--len_limit" type="integer" value="" optional="true" label="minimum sequence length" help="useful if your data has already been trimmed"/>
-            </when>
-        </conditional>
-        <param name="capture" type="boolean" checked="false" truevalue="-D" falsevalue="" argument="-D" label="Capture discarded reads to a file" />
-
-        <param name="outype" argument="-y" type="select" label="Output format" >
-            <option value="auto" selected="True">Same as input</option>
-            <option value="fastq">fastq</option>
-            <option value="fasta">fasta</option>
-            <option value="gzfastq">gzipped fastq</option>
-            <option value="gzfasta">gzipped fasta</option>
-        </param>
+	<expand macro="process_filter"/>
+	<expand macro="process_output_types"/>
         <expand macro="in_log"/>
     </inputs>
 
     <outputs>
         <expand macro="out_log"/>
-        <collection name="demultiplexed" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads">
-            <filter>input_type['options_type_selector'] == "single"</filter>
-            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;name&gt;.+)" dir="stacks_outputs"/>
-        </collection>
-        <collection name="demultiplexed_paired" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads">
-            <filter>input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
-            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs"/>
-        </collection>
-
-        <collection name="remaining" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Remaining orphan reads">
-            <filter>input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
-            <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.rem\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs/remaining"/>
-        </collection>
-
-        <!-- note irrespective of -y output is always named fastq and are never zipped -->
-        <collection name="discarded" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Discarded reads">
-            <filter>capture is True and input_type['options_type_selector'] == "single"</filter>
-            <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="(?P&lt;name&gt;.*)" dir="stacks_outputs/discarded"/>
-        </collection>
-        <collection name="discarded_paired" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Discarded reads">
-            <filter>capture is True and input_type['options_type_selector'] == "paired"</filter>
-            <expand macro="discover_faq_output_macro" pattern="(?P&lt;identifier_0&gt;.+)\.(?P&lt;identifier_1&gt;[^.]+)" dir="stacks_outputs/discarded"/>
-        </collection>
+	<expand macro="process_outputs"/>
     </outputs>
     <tests>
         <!-- single single ended input, no filtering (hence no capturing) + log -->
@@ -359,12 +191,12 @@
             <param name="options_enzyme|enzyme" value="ecoRI"/>
             <param name="options_enzyme|enzyme2" value="ecoRI"/>
             <param name="options_advanced|truncate" value="70" />
-            <param name="options_advanced|rescue" value="-r"/>
+            <param name="options_advanced|rescue_cond|rescue" value="-r"/>
+            <param name="options_advanced|rescue_cond|barcode_dist_1" value="2" />
+            <param name="options_advanced|rescue_cond|barcode_dist_2" value="2" />
             <param name="options_advanced|bestrad" value="--bestrad" />
             <param name="options_advanced|retain_header" value="true"/>
             <param name="options_advanced|disable_rad_check" value="--disable_rad_check" />
-            <param name="options_advanced|barcode_dist_1" value="2" />
-            <param name="options_advanced|barcode_dist_2" value="2" />
             <param name="options_advanced|adapter_1" value="" />
             <param name="options_advanced|adapter_2" value="" />
             <param name="options_advanced|adapter_mm" value="" />
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/kmerfilter/kfreq.tsv
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/PopA_01.forward.fq.gz
Binary file test-data/shortreads/PopA_01.forward.fq.gz has changed
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/PopA_01.fq
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/shortreads/PopA_01.fq	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -0,0 +1,640 @@
+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_17 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_18 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_19 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_20 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_21 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_22 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_23 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_24 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_25 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_26 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata0_27 1:N:0:/1
+ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTAAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_8 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_10 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_11 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_12 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_13 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_14 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_15 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_16 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_17 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCCAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_18 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata2_19 1:N:0:/1
+ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_0 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_1 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_2 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_3 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_4 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata3_5 1:N:0:/1
+ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_0 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCGACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_1 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_2 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_3 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_4 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_5 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_6 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_7 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_8 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_9 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_10 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_11 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_12 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_13 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_14 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_15 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_16 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_17 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_18 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_19 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_20 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCGACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_21 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_22 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_23 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_24 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_25 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_26 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTGTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_27 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_28 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_29 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_30 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTCCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_31 1:N:0:/1
+ATTATTGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGGGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_32 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata4_33 1:N:0:/1
+ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_0 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_1 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_2 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_3 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_4 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_5 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_6 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_7 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_8 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_9 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_10 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_11 1:N:0:/1
+ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_12 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_13 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTTGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_14 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_15 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_16 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_17 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_18 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_19 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_20 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_21 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_22 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata6_23 1:N:0:/1
+ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_0 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:/1
+ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_0 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_1 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_2 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATCGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCACTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGTTAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata8_9 1:N:0:/1
+ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_4 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_5 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_6 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_7 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_8 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_9 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_10 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCGATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:/1
+ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
++
+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/PopA_01.rem.forward.fq.gz
Binary file test-data/shortreads/PopA_01.rem.forward.fq.gz has changed
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/PopA_01.rem.reverse.fq.gz
Binary file test-data/shortreads/PopA_01.rem.reverse.fq.gz has changed
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/PopA_01.reverse.fq.gz
Binary file test-data/shortreads/PopA_01.reverse.fq.gz has changed
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/Pop_01.1.fq
--- a/test-data/shortreads/Pop_01.1.fq	Fri Nov 30 07:40:25 2018 -0500
+++ /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
@@ -1,640 +0,0 @@
-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_17 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_18 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_19 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_20 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_21 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_22 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_23 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_24 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_25 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_26 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata0_27 1:N:0:/1
-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_0 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_1 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_2 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_3 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_4 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_5 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTAAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_6 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_7 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_8 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_9 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_10 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_11 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_12 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_13 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_14 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_15 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_16 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_17 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCCAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_18 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata2_19 1:N:0:/1
-ATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_0 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_1 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_2 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACAGACGGTTCATACGGTAAACTATCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_3 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_4 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata3_5 1:N:0:/1
-ATTACTATTAGGCGAAGCTGACGACGGCTCATACGGTAAACTTCAAAAACTCTTGGCTTCCCTCCTAAACCTGAGTGCTCAAACGTCGTAATG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_0 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCGACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_1 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_2 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_3 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_4 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_5 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_6 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_7 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_8 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_9 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_10 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_11 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_12 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_13 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_14 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_15 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_16 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_17 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_18 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_19 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_20 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCGACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_21 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_22 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_23 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_24 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_25 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_26 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTGTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_27 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_28 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_29 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_30 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTCCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_31 1:N:0:/1
-ATTATTGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGGGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_32 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata4_33 1:N:0:/1
-ATTATCGTCTTGCACAAATCGTCTACGCAGATTGGAGTCTTCCTAGCTACTGAAGTAGCTTGGACGGATTCTTTAGTGTCAATCAACTCGTGT
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_0 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_1 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_2 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_3 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_4 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_5 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_6 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_7 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_8 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_9 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_10 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_11 1:N:0:/1
-ATTGACCGCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTCTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_12 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_13 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTTGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_14 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_15 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_16 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_17 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_18 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_19 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_20 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_21 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_22 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata6_23 1:N:0:/1
-ATTGACCCCAGCAACCGCTCGTGGCGTTACTTGTCTTGGTCCTTAGGTAAAGCTTATATGACTGAGAAACCGGTTCGGACATATAGGCCGGAG
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_0 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_1 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_2 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_3 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_4 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_5 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_6 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_7 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_8 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_9 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_10 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_11 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_12 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_13 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_14 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_15 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_16 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata7_17 1:N:0:/1
-ATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_0 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_1 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_2 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_3 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATCGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_4 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_5 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCACTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_6 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_7 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGTTAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_8 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata8_9 1:N:0:/1
-ATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_0 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_1 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_2 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_4 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_5 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_6 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_7 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_8 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_9 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_10 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCGATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:/1
-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC
-+
-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/lane1_fakedata0_11
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/process_shortreads.out
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/shortreads/process_shortreads.out	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -0,0 +1,56 @@
+process_shortreads v2.2, executed 2018-12-03 21:27:19
+process_shortreads -p stacks_inputs/ -i fastq -b /tmp/tmpiZT6X4/files/000/dataset_2.dat --inline_null -o stacks_outputs
+File	Retained Reads	Low Quality	Ambiguous Barcodes	Trimmed Reads	Orphaned paired-end reads	Total
+R1.fastq	7000	0	0	0	0	7000
+
+Total Sequences	7000
+Ambiguous Barcodes	0
+Low Quality	0
+Trimmed Reads	0
+Orphaned Paired-ends	0
+Retained Reads	7000
+
+Barcode	Filename	Total	Retained
+ATGGGG	PopA_01	160	160
+GGGTAA	PopA_02	146	146
+AGGAAA	PopA_03	224	224
+TTTAAG	PopA_04	168	168
+GGTGTG	PopA_05	220	220
+TGATGT	PopA_06	214	214
+GGTTGT	PopA_07	182	182
+ATAAGT	PopA_08	232	232
+AAGATA	PopA_09	182	182
+TGTGAG	PopA_10	168	168
+ATAGTT	PopA_11	200	200
+GGAAGG	PopA_12	178	178
+TTTGTG	PopA_13	190	190
+TTAAAT	PopA_14	166	166
+AATAAG	PopA_15	152	152
+AAGAGG	PopA_16	174	174
+TAGTGT	PopA_17	242	242
+TGGAAG	PopA_18	148	148
+GGGTTG	PopA_19	110	110
+CATCAT	PopA_20	178	178
+GGAGAG	PopB_20	210	210
+GTTTTA	PopB_01	136	136
+TGATAA	PopB_02	166	166
+GTTGAT	PopB_03	148	148
+AGATTA	PopB_04	180	180
+GTATAG	PopB_05	136	136
+TTGGGA	PopB_06	166	166
+ATATAT	PopB_07	242	242
+GATGAG	PopB_08	208	208
+GGGAAT	PopB_09	198	198
+AGTAAT	PopB_10	164	164
+GGGATA	PopB_11	146	146
+GAGAAG	PopB_12	162	162
+AGTAGA	PopB_13	204	204
+AAGGAT	PopB_14	180	180
+AGGGTA	PopB_15	134	134
+TGTTTT	PopB_16	138	138
+ATGATG	PopB_17	142	142
+GAGTTA	PopB_18	160	160
+ATGTAG	PopB_19	146	146
+
+Sequences not recorded
+Barcode	Total
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/reads.forward.fq
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 test-data/shortreads/reads.reverse.fq
diff -r c9fffbd29afc -r ead5013ec8e4 todo.txt
--- a/todo.txt	Fri Nov 30 07:40:25 2018 -0500
+++ b/todo.txt	Tue Dec 18 13:02:06 2018 -0500
@@ -5,9 +5,6 @@
 the single letter options (-x,...), would be nice to put them in the correct
 section / conditional as well.
 
-
-
-
 Raw Reads
     process_radtags planemo test-data-generated-wdefaults sufficient-test
     process_shortreads