# HG changeset patch
# User iuc
# Date 1749197467 0
# Node ID 665420a511515466d9754c61a4c1605ce17e6824
# Parent  e16d8d40fe1c18993e18c11ced60324afa1a8cbb
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/cutadapt commit 0c93f97b7bd74293324b0a220359741a94be865d

diff -r e16d8d40fe1c -r 665420a51151 cutadapt.xml
--- a/cutadapt.xml	Sat Feb 08 20:30:11 2025 +0000
+++ b/cutadapt.xml	Fri Jun 06 08:11:07 2025 +0000
@@ -211,6 +211,9 @@
 #end if
 #if 'info_file' in $output_selector:
     --info-file='$info_file'
+    #if 'info_file_paired' in $output_selector:
+        --info-file-paired='$info_file_paired'
+    #end if
 #end if
 #if 'rest_file' in $output_selector:
     -r='${rest_output}'
@@ -397,6 +400,7 @@
         <param name="output_selector" type="select" multiple="true" display="checkboxes" label="Additional outputs to generate">
             <option value="report">Report: Cutadapt's per-adapter statistics. You can use this file with MultiQC.</option>
             <option value="info_file">Info file: write information about each read and its adapter matches.</option>
+            <option value="info_file_paired">Paired Info file: write information about each read and its adapter matches for Paired end reads.</option>
             <option value="rest_file">Rest of read: when the adapter matches in the middle of a read, write the rest (after the adapter).</option>
             <option value="wildcard_file">Wildcard file: when the adapter has wildcard bases (Ns) write adapter bases matching wildcard positions.</option>
             <option value="too_short_file">Too short reads: write reads that are too short according to minimum length specified (default: discard reads).</option>
@@ -429,6 +433,9 @@
         <data name="info_file" format="txt" metadata_source="library|input_1" label="${tool.name} on ${on_string}: Info File" >
             <filter>output_selector and 'info_file' in output_selector</filter>
         </data>
+        <data name="info_file_paired" format="txt" metadata_source="library|input_1" label="${tool.name} on ${on_string}: Paired Info File" >
+            <filter>output_selector and 'info_file_paired' in output_selector</filter>
+        </data>
         <data name="rest_output" format="fastqsanger" metadata_source="library|input_1" from_work_dir="rest_output*" label="${tool.name} on ${on_string}: Rest of Reads (R1 only)" >
             <filter>output_selector and 'rest_file' in output_selector</filter>
             <expand macro="inherit_format_1" />
@@ -682,6 +689,38 @@
             </output>
             <output name="info_file" value="cutadapt_info_out.txt" ftype="txt"/>
         </test>
+        <!-- Ensure Report and Paired Info file output work -->
+        <test expect_num_outputs="5">
+            <param name="type" value="paired" />
+            <param name="input_1" ftype="fastq.gz" value="bwa-mem-fastq1.fq.gz" />
+            <param name="input_2" ftype="fastq.gz" value="bwa-mem-fastq2.fq.gz" />
+            <section name="r1">
+                <repeat name="adapters">
+                    <conditional name="adapter_source">
+                        <param name="adapter_source_list" value="user"/>
+                        <param name="adapter" value="AGATCGGAAGAGC"/>
+                    </conditional>
+                </repeat>
+            </section>
+            <section name="r2">
+                <repeat name="adapters">
+                    <conditional name="adapter_source">
+                        <param name="adapter_source_list" value="user"/>
+                        <param name="adapter" value="AGATCGGAAGAGC"/>
+                    </conditional>
+                </repeat>
+            </section>
+            <param name="output_selector" value="report,info_file,info_file_paired"/>
+            <output name="out1" decompress="true" file="cutadapt_out1_r1.fq.gz" ftype="fastq.gz"/>
+            <output name="out2" decompress="true" file="cutadapt_out2_r2.fq.gz" ftype="fastq.gz"/>
+            <output name="report">
+                <assert_contents>
+                    <has_text text="Summary"/>
+                </assert_contents>
+            </output>
+            <output name="info_file" value="cutadapt_info_paired_out_2.txt" ftype="txt"/>
+            <output name="info_file_paired" value="cutadapt_info_paired_out.txt" ftype="txt"/>
+        </test>
         <test expect_num_outputs="1">
             <conditional name="library">
                 <param name="type" value="single" />
diff -r e16d8d40fe1c -r 665420a51151 macros.xml
--- a/macros.xml	Sat Feb 08 20:30:11 2025 +0000
+++ b/macros.xml	Fri Jun 06 08:11:07 2025 +0000
@@ -1,5 +1,5 @@
 <macros>
-    <token name="@TOOL_VERSION@">5.0</token>
+    <token name="@TOOL_VERSION@">5.1</token>
     <token name="@VERSION_SUFFIX@">0</token>
     <token name="@FASTQ_TYPES@">fastq.bz2,fastq.gz,fastq,fasta.bz2,fasta.gz,fasta</token>
     <xml name="edam_ontology">
diff -r e16d8d40fe1c -r 665420a51151 test-data/cutadapt_info_paired_out.txt
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/cutadapt_info_paired_out.txt	Fri Jun 06 08:11:07 2025 +0000
@@ -0,0 +1,99 @@
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:6911:8255/2	-1	TCGCCTTACCGCTACTCACCCACGGCGGCCATCAGCCGATACTAAGTTTGGGGTATGGTGGGGGGGATAATGAATTAGGTTGTGGGGGAGGGTTTGTGGTTGAGAGAAACACAAAAAACAATCTTATATATGGGTAGTCGTTTTGTATTGGTTTTTTGTTTTGTTTGTGTTTTGAGTGTCGGTTTAGTTCGGTGTACTAGGGGGGGTGGATGGGGTCGGCTGGTGAGGGGGTCTTAGTGTATTGAGTGTGG	1>11111@11111A111A100000000////011110//>>/12@1@22B/////1@>21/>>/-----9/;////9////--;-;-;-----;--------9/-/-///9-;-------9//////9/////-//-/9-;-;9--/////99-;--9-:-;----/---/-----////---9-/////--;A-//////---------9/-----;-----/-/-----;--;//////////9;///-
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:14518:9998/2	-1	CATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATTCCTGCCTCATCCTATTATTTATCGCACCTACGTTCAATATTACAGGCGAACATACTTACTAAAGTGTGTTAATTAATTAATGCTTGTAGGACATAATAATAA	CCCCCFCCCCCFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGFHHHHGGGGGHGFHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHGGEHGGGGCGGGHHGGCGGGGGHHGHHHGGGGGGGG.BFFFGAGADFGAFDGFGGCFFF;DDFFFFFFFFFFFFFFFFFFEFFFFFFFFFFFBFFFFFFFFFFFFFFFFFFF09FFFE00;BE@;DABBFFFFFBBFB00;F:9;FFBFFF9BFFFFFFFFFFFFF90/::BFFFBF0
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:18422:19051/2	-1	CTACAAGCATTAATTAATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGGGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGG	BCCCCFFCFFFFGGGGGGGGGGHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHEHHHHHHHGGHHGGHGGHHHHHHHGHGGHHHGGGGGHGHHHHGGGHFHFHHHHHGGGGGHBFFCGDHHHGGGGGGHGGGGGGHHGCGGGFGHHBGGGGGFFFHEGGGGGCDCCE@EFGHHHHFHEGHGFFHHGB;ECBFGGGEFEFFGF0AFGFGFFG.;;DFFFFFFFFFF090BFFFE?FEFBBFBFFFB990BF
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:25545:21098/2	-1	GCCCATAACACTTGGGGGTAGCTAAAGTGAACTGTATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTTCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCAACCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGAT	3AAA34BFFFFFGCGGCGGGCGHHHGHHHHCGHFGHFHGFGGCDGGBD5FGFFFHFHGGGHAEBFGHHHEHGGFHBGGFHHHGGGEEFHHHFHFFHDHGHGHHHHFFHHGGFAEGFFFFFBGHHHFFHHHHHHHFHFHHFHGFHGHGA/<@EFHEHH1GGHFFFHG1>=FGHFHGF.GE//-<BB?9.9BFFFB==AA/FFFFFA-@BA.;;D?F9FAB;---./99BFFFBBAE-.9B/BFB9F/9BFBB
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:5446:12248/2	-1	ATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATTCCTGCCTCATCCTATTATTTATCGCACCTACGTT	CCDDDCCCCFFFGGGGGGGGGGHHHHHGHHHHHHHHGHHHHHHGHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHHHGFGHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHGHGHGHHGGGGGGGGGGGFFFFFFFFFFFFFFAFFFFFFFFFFFFFBFC?.EAFFFFFFFFAFFFFFFFFFFFFFFFEFFFF0FFFFFFF0BFFFFFFFFF?.BDCFFEDA/
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1101:5861:6452/2	-1	TTATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATTCCTGCCTCATCCTATTATTTATCGCACCTACG	BCCCCFBBCCCFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHGGHGGHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGHHHHGGGGGGEHGHHHHHHHHHHHGHHHHHHGHGHGHGGGGCGGGGGFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF?FFEAF:DAEF9DEFFFFFFF-A.BFFFFFEFFFFEFFFFFFFF0FFEB0FFFFBFFFFFFADEFCF0/.
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:10403:6021/2	-1	GGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGGGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGGGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGAGGTTAATAGGGGGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGTTTTATGACGCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGATACAGTTGACTTTAGGTAACCCA	AA?A34BF>AADEBGGGGFFCGGHHA5DFGAE?AAEDFHG2AEE1FBE00A1BGE0?E1FFGEEEGB4F43?EE/>///F??//@BCBAC<<BAGHB?11F/FGFGGBFBGBD.11><.<<<C0<A</<<=0GFHC@-.;FF09BFFGB00B0;FE.C/:CCF0;0C0;BBBFF@.9AF.:9EFF.;.BFF/FF/;/./BFB/..;;ABF/9FF//.;AAF9BBBA;-A.B/9///9/BF////;///:9.
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:10677:23253/2	-1	AATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGCTGTCTCTTATACACA	CDDDDFFFFCCFGGGGGGGGGGHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGHHGGHGGHHHHHHGHGHGHHHGGGGGGGGHHHHHFHHHFHHHHGGGGGGHHGHHGGHHHGGGCGGHFFFGGGHHGGGFHHGHHHGGGCGGHFHHGGGGGGFHGC<@GGHGHHCHE00:CFHHHFGACGFFEG:D.E;FG;EFBBFGGGFEE0CBBBFFGBFFGFGFFFFFFFF0:B0:BFFFFFFF/0.;:0F0B:BFFF00
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:13809:1733/2	-1	NATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATTCCTGCCTCATCCTATTATTTATCGCACCTACGTTCAATATCTGTCTCTTATACACATCTGAC	#>AABBFFCFFFGGGFGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHGGEGGFFHHHHHHGHGHGHHHHHEHFHGHHHHEFHHGHGGGGGHHHHGHHHHHHHHHGFGHHHHHGHGHGHHGGGCCGGGGFGGGGGGDGGGGFGDGGGFFFFFFEFFFFFFFBAF:9AF//;BEF-DD/FFFFBFFFFFFFFFEBFF?FB;/;//BFFEFFE/::..9;-:B9:FBFFFFFFBFB/9/FFF/B///99/:B///
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:17584:10050/2	-1	GTCATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGCGATCTAGTGGAGATCTTGGGGGGTGG	ABCCCFFFFFCFGGGGGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHFHGGHGGHHHHHHHHHHHHHHGHHHGGHHHHHHHGGHHHHGGGGGHHHHHHHHHHHHHHGGHHHHHHGHGHGGHGGFGGGGGGGGGGFGGFGGGGGGGGGFFFFFFFFFFEFFCFAAFEFEFFFFFFFCFDFFFFFFEFFFFFFFFFFBFFFFFFF/:BFFFFFFFFFFFFFFFFAFC=@-.;A///B././//////.-9----
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:18842:24844/2	-1	CTACAAGCATTAATTAATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGG	CCCCBFFBFFFFGGGGGGGGGGHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHFHHHHHGHGHHHGGHGGHHHHGHHHHHHGHHGGGGGHFHHHFGHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGFECGGHGGGGGGHHHGGGGHHGGGGHHHHHEFDCADGHHHHGGGGFC?AE-@DDFHFFHHHCFHGGFFGFFFGGGEFEGFGED9C?CEGF90FEF/A./BBF9FFFFFFFFBFFF.9AF////;FFBFFB/:BF
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:21788:11027/2	-1	AATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGGGAACGTGTGGGCCTG	CDDDDFFFFDDFGGGGGGGGGGHHHHHGGGGHHHHHHHHGHHHHHHHGGHHGEHGGHHHHHHHHHHHHHHGGGGEHHHHHHHHHHFFFFFHHHGGGGGHFHGBFEHHHGGGGGGGHHGGGGHGGGGGHHFHHHGGG@CGHHHGGGGGGGGGGGEGDGFFDHHGEHHBCFHGBGFAGGHFGGCEEF0BE<?FFFGFGG<EFFGFFFFGGGGGF:0BFFB9FFFFFFFFFFFFF0B0ABADEF.A/..D.BA.
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:5728:8777/2	-1	CACTTGGGAGTAGCTAAAGTGAACTGTATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAACCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATTTGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGTCTTTGATTCCTGCCC	BBBBBFFBBBBFGGGGGGGDGGHHHHHFHHHGGGGGHHGFHFHHFHHHGGHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHFGHHHGGGGHHHHHHHHHGHHHGHHHHFHHHGGHGGHFFHHHHGFHHHHHHHHHHFHFHHHFHFHHHHHGGGGGHGHHHHHGHHHHHHH/FHHHHHGHGGGHHGGFBFFFFFFFFFF;DDFFFFFFF;;BA.=DDBFFFFF;-DFF.EDFFFFFFEF-AFFFFFB;FBFFFBFFFFB9B..
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:5983:21093/2	-1	ATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGTTTTATGACCCTGAAGTAGGAACCAGATGTG	ABCCCFFFBFFCGGGGGGGGGGHHHHHHGHHGHHGGGGGHHHHHHGHHHHHGGHHHHGGGGFHHHHGFFHGHGGGFEGGHFFFE?GFFGGGHGHFGHGGGEEFHHHHGGGGGCDGGBGGGGHHHGGHGHHHDGHHHHEFHHHHGF<A.ADGG0EHFFHHHHCEFHHEGHGHHGGHHHFGGGGEF//FFFFGGGFGGGGGGG.ACDE?B?DD9F.BBBBFFFFFEF0090:BF/;:0;0009:A?...0:;0
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1102:7765:18353/2	-1	ATTATGTCCTACAAGCATTAATTAATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAAAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTT	BBBBBFFFFFFFGBEGBGGGGGFHFHHHCFFFGFHHHHF5FEDABFAGGBEE22FFGGEEHF5EDCA11FE5FFE?FEG5EG555F@35B3FFA1FEF2@3GGD3?23?3@F4BF3E>///FDFACF?FHFGC//??1B0<<?/@GFGD/@1FG10<?ACC.<<G0DGGG--.<CCCCGC;CGCGFE9;0FBFA000.;0BF.9....0;909B00999A/9./;BBFB/.:B/////9/999//B//;/;
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1103:10405:17879/2	-1	CTACAAGCATTAATTAATTAACACACTTTAGTAAGTATGTTCGCCTGTAATATTGAACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGG	CCCCCFFCFFFFGGGGGGGGGGHHFEHHHHHHHHHHHHGHHHGGGGHHHHHHHHEHHHHHFHGGHHGGHGGHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHFHHHFFGHHFGHHHGGGGFHHHHGGGHHGGGGGGGHGHGGGDHGGCGFHHGHHHGGGDGGHHHHGGGGGGGHGG-ADGGHHHBHHHFFFHHHGGGGEGBFGGAEEDBFF0C;CFFGFGFEEFFBBFFEFFFFFFFFFFDEFBFFFF///BFF/BF/A
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1103:13493:8205/2	-1	AACGTAGGTGCGATAAATAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGTTTTATGACCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGAT	BBBBAFFBFFFBEGGGGGGGGGHHHHHFHHGGGGGHHHHHHHHGHHHHHHHHHGGGGGHFHHGGGHHHGGGGGGHHHGGGDHHGGGGHHHHHHGGFEEEFFHGGGGGGCDHFGCCDGHGHHHHFFFEGHHHFCFEHGHHGG.C.EGGGFGFGEHGHH/:CGHHHGGGB::CGHHHHHGFGBBF0BFGFGGGGBFGGGBG.9.;BEG?AF.FFFFFFFFFFFFBBBFFFFF/BFFEFBBFFEFFFBBB;D9.
+M01368:8:000000000-A3GHV:1:1103:14060:21273/2	-1	TAATAGGATGAGGCAGGAATCAAAGACAGATACTGCGACATAGGGTGCTCCGGCTCCAGCGTCTCGCAATGCTATCGCGTGCACACCCCCCAGACGAAAATACCAAATGCATGGAGAGCTCCCGTGAGTGGTTAATAGGGTGATAGACCTGTGATCCATCGTGATGTCTTATTTAAGGGGAACGTGTGGGCTATTTAGGTTTTATGACCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGATACCTGTCTCTTATACAC	CCCCCFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHEFGGHHGGGGGGGHGGGGDHHGGGGHHHHHHGGGEGFEHHHGGGGGGGAFGGGGBHHHHHHHHHGHHHHHHHGHEHHGGGGAFHFEGGHHFHHHF>FF<F1GGHHHHHHGHHGFFDEHHHHGF0GGHHHGFHGHFAGEGCEBEGF.FFFGGGGGFFGG0CBFBFGGGFFFFFBFFF.E.E?FFFFEFADAF/BFBFFFFFFFFF//
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