Mercurial > repos > jjohnson > gmap
view test-data/ss.her2.chr17.txt @ 6:4f358603ee12 draft default tip
Uploaded v3.0.1c with table fix
| author | peterjc |
|---|---|
| date | Fri, 21 Oct 2016 11:15:09 -0400 |
| parents | 14561eb803a5 |
| children |
line wrap: on
line source
>NM_004448 Homo sapiens v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) (ERBB2), transcript variant 1, mRNA. 4624 bp, mRNA, linear, PRI 20-DEC-2004 Paths (1): Path 1: query 1..4624 (4624 bp) => genome 109,781..138,442 (28662 bp) cDNA direction: sense Genomic pos: 109,781..138,442 (+ strand) Number of exons: 27 Coverage: 100.0 (query length: 4624 bp) Trimmed coverage: 100.0 (trimmed length: 4624 bp, trimmed region: 1..4624) Percent identity: 100.0 (4624 matches, 0 mismatches, 0 indels, 0 unknowns) Translation: 2..4006 (1334 aa) Amino acid changes: Alignments: Alignment for path 1: 109781-110091 (1-311) 100% -> ...6678... 116770-116921 (312-463) 100% -> ...1179... 118101-118314 (464-677) 100% -> ...783... 119098-119232 (678-812) 100% -> ...360... 119593-119661 (813-881) 100% -> ...204... 119866-119981 (882-997) 100% -> ...138... 120120-120261 (998-1139) 100% -> ...1446... 121708-121827 (1140-1259) 100% -> ...274... 122102-122228 (1260-1386) 100% -> ...2837... 125066-125139 (1387-1460) 100% -> ...86... 125226-125316 (1461-1551) 100% -> ...203... 125520-125719 (1552-1751) 100% -> ...361... 126081-126213 (1752-1884) 100% -> ...81... 126295-126385 (1885-1975) 100% -> ...714... 127100-127260 (1976-2136) 100% -> ...2306... 129567-129614 (2137-2184) 100% -> ...3484... 133099-133237 (2185-2323) 100% -> ...80... 133318-133440 (2324-2446) 100% -> ...251... 133692-133790 (2447-2545) 100% -> ...715... 134506-134691 (2546-2731) 100% -> ...137... 134829-134984 (2732-2887) 100% -> ...122... 135107-135182 (2888-2963) 100% -> ...304... 135487-135633 (2964-3110) 100% -> ...708... 136342-136439 (3111-3208) 100% -> ...155... 136595-136783 (3209-3397) 100% -> ...291... 137075-137327 (3398-3650) 100% -> ...141... 137469-138442 (3651-4624) 100% 0 . : . : . : . : . : aa.g 1 E E V E E E G C L R K Y K N E V V 109781 GGAGGAGGTGGAGGAGGAGGGCTGCTTGAGGAAGTATAAGAATGAAGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 GGAGGAGGTGGAGGAGGAGGGCTGCTTGAGGAAGTATAAGAATGAAGTTG aa.c 1 E E V E E E G C L R K Y K N E V V 50 . : . : . : . : . : aa.g 18 K L R F P S I G T G E T R G A P 109831 TGAAGCTGAGATTCCCCTCCATTGGGACCGGAGAAACCAGGGGAGCCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 TGAAGCTGAGATTCCCCTCCATTGGGACCGGAGAAACCAGGGGAGCCCCC aa.c 18 K L R F P S I G T G E T R G A P 100 . : . : . : . : . : aa.g 34 R A A A R P F P R G P L L R R A P 109881 CGGGCAGCCGCGCGCCCCTTCCCACGGGGCCCTTTACTGCGCCGCGCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 CGGGCAGCCGCGCGCCCCTTCCCACGGGGCCCTTTACTGCGCCGCGCGCC aa.c 34 R A A A R P F P R G P L L R R A P 150 . : . : . : . : . : aa.g 51 G P H P S Q H P A P R A L P A G S 109931 CGGCCCCCACCCCTCGCAGCACCCCGCGCCCCGCGCCCTCCCAGCCGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 CGGCCCCCACCCCTCGCAGCACCCCGCGCCCCGCGCCCTCCCAGCCGGGT aa.c 51 G P H P S Q H P A P R A L P A G S 200 . : . : . : . : . : aa.g 68 S R S H G A G A A V S T M E L A 109981 CCAGCCGGAGCCATGGGGCCGGAGCCGCAGTGAGCACCATGGAGCTGGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201 CCAGCCGGAGCCATGGGGCCGGAGCCGCAGTGAGCACCATGGAGCTGGCG aa.c 68 S R S H G A G A A V S T M E L A 250 . : . : . : . : . : aa.g 84 A L C R W G L L L A L L P P G A A 110031 GCCTTGTGCCGCTGGGGGCTCCTCCTCGCCCTCTTGCCCCCCGGAGCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 GCCTTGTGCCGCTGGGGGCTCCTCCTCGCCCTCTTGCCCCCCGGAGCCGC aa.c 84 A L C R W G L L L A L L P P G A A 300 . : . : . : . : . : aa.g 101 S T Q V C T G T D M K L R L 110081 GAGCACCCAAGGTG...CAGTGTGCACCGGCACAGACATGAAGCTGCGGC |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 301 GAGCACCCAAG 6678 TGTGCACCGGCACAGACATGAAGCTGCGGC aa.c 101 S T Q V C T G T D M K L R L 350 . : . : . : . : . : aa.g 115 P A S P E T H L D M L R H L Y Q 116800 TCCCTGCCAGTCCCGAGACCCACCTGGACATGCTCCGCCACCTCTACCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 342 TCCCTGCCAGTCCCGAGACCCACCTGGACATGCTCCGCCACCTCTACCAG aa.c 115 P A S P E T H L D M L R H L Y Q 400 . : . : . : . : . : aa.g 131 G C Q V V Q G N L E L T Y L P T N 116850 GGCTGCCAGGTGGTGCAGGGAAACCTGGAACTCACCTACCTGCCCACCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 392 GGCTGCCAGGTGGTGCAGGGAAACCTGGAACTCACCTACCTGCCCACCAA aa.c 131 G C Q V V Q G N L E L T Y L P T N 450 . : . : . : . : . : aa.g 148 A S L S F L Q D I Q E V Q G 116900 TGCCAGCCTGTCCTTCCTGCAGGTG...CAGGATATCCAGGAGGTGCAGG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 442 TGCCAGCCTGTCCTTCCTGCAG 1179 GATATCCAGGAGGTGCAGG aa.c 148 A S L S F L Q D I Q E V Q G 500 . : . : . : . : . : aa.g 162 Y V L I A H N Q V R Q V P L Q R 118120 GCTACGTGCTCATCGCTCACAACCAAGTGAGGCAGGTCCCACTGCAGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 483 GCTACGTGCTCATCGCTCACAACCAAGTGAGGCAGGTCCCACTGCAGAGG aa.c 162 Y V L I A H N Q V R Q V P L Q R 550 . : . : . : . : . : aa.g 178 L R I V R G T Q L F E D N Y A L A 118170 CTGCGGATTGTGCGAGGCACCCAGCTCTTTGAGGACAACTATGCCCTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 533 CTGCGGATTGTGCGAGGCACCCAGCTCTTTGAGGACAACTATGCCCTGGC aa.c 178 L R I V R G T Q L F E D N Y A L A 600 . : . : . : . : . : aa.g 195 V L D N G D P L N N T T P V T G A 118220 CGTGCTAGACAATGGAGACCCGCTGAACAATACCACCCCTGTCACAGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 583 CGTGCTAGACAATGGAGACCCGCTGAACAATACCACCCCTGTCACAGGGG aa.c 195 V L D N G D P L N N T T P V T G A 650 . : . : . : . : . : aa.g 212 S P G G L R E L Q L R S L T E 118270 CCTCCCCAGGAGGCCTGCGGGAGCTGCAGCTTCGAAGCCTCACAGGTG.. |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 633 CCTCCCCAGGAGGCCTGCGGGAGCTGCAGCTTCGAAGCCTCACAG 78 aa.c 212 S P G G L R E L Q L R S L T E 700 . : . : . : . : . : aa.g 227 I L K G G V L I Q R N P Q L C 119095 .CAGAGATCTTGAAAGGAGGGGTCTTGATCCAGCGGAACCCCCAGCTCTG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 678 3 AGATCTTGAAAGGAGGGGTCTTGATCCAGCGGAACCCCCAGCTCTG aa.c 227 I L K G G V L I Q R N P Q L C 750 . : . : . : . : . : aa.g 242 Y Q D T I L W K D I F H K N N Q L 119144 CTACCAGGACACGATTTTGTGGAAGGACATCTTCCACAAGAACAACCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 724 CTACCAGGACACGATTTTGTGGAAGGACATCTTCCACAAGAACAACCAGC aa.c 242 Y Q D T I L W K D I F H K N N Q L 800 . : . : . : . : . : aa.g 259 A L T L I D T N R S R A C 119194 TGGCTCTCACACTGATAGACACCAACCGCTCTCGGGCCTGTA...CAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 774 TGGCTCTCACACTGATAGACACCAACCGCTCTCGGGCCT 360 GC aa.c 259 A L T L I D T N R S R A C 850 . : . : . : . : . : aa.g 272 H P C S P M C K G S R C W G E S S 119595 CACCCCTGTTCTCCGATGTGTAAGGGCTCCCGCTGCTGGGGAGAGAGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 815 CACCCCTGTTCTCCGATGTGTAAGGGCTCCCGCTGCTGGGGAGAGAGTTC aa.c 272 H P C S P M C K G S R C W G E S S 900 . : . : . : . : . : aa.g 289 E D C Q S L T R T V C A G G 119645 TGAGGATTGTCAGAGCCGTG...CAGTGACGCGCACTGTCTGTGCCGGTG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 865 TGAGGATTGTCAGAGCC 204 TGACGCGCACTGTCTGTGCCGGTG aa.c 289 E D C Q S L T R T V C A G G 950 . : . : . : . : . : aa.g 303 C A R C K G P L P T D C C H E Q 119890 GCTGTGCCCGCTGCAAGGGGCCACTGCCCACTGACTGCTGCCATGAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 906 GCTGTGCCCGCTGCAAGGGGCCACTGCCCACTGACTGCTGCCATGAGCAG aa.c 303 C A R C K G P L P T D C C H E Q 1000 . : . : . : . : . : aa.g 319 C A A G C T G P K H S D C L 119940 TGTGCTGCCGGCTGCACGGGCCCCAAGCACTCTGACTGCCTGGTA...CA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 956 TGTGCTGCCGGCTGCACGGGCCCCAAGCACTCTGACTGCCTG 138 aa.c 319 C A A G C T G P K H S D C L 1050 . : . : . : . : . : aa.g 333 A C L H F N H S G I C E L H C P A 120119 GGCCTGCCTCCACTTCAACCACAGTGGCATCTGTGAGCTGCACTGCCCAG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 998 GCCTGCCTCCACTTCAACCACAGTGGCATCTGTGAGCTGCACTGCCCAG aa.c 333 A C L H F N H S G I C E L H C P A 1100 . : . : . : . : . : aa.g 350 L V T Y N T D T F E S M P N P E 120169 CCCTGGTCACCTACAACACAGACACGTTTGAGTCCATGCCCAATCCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1047 CCCTGGTCACCTACAACACAGACACGTTTGAGTCCATGCCCAATCCCGAG aa.c 350 L V T Y N T D T F E S M P N P E 1150 . : . : . : . : . : aa.g 366 G R Y T F G A S C V T A C P Y 120219 GGCCGGTATACATTCGGCGCCAGCTGTGTGACTGCCTGTCCCTGTG...T |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 1097 GGCCGGTATACATTCGGCGCCAGCTGTGTGACTGCCTGTCCCT 1446 aa.c 366 G R Y T F G A S C V T A C P Y 1200 . : . : . : . : . : aa.g 381 N Y L S T D V G S C T L V C P L 121706 AGACAACTACCTTTCTACGGACGTGGGATCCTGCACCCTCGTCTGCCCCC >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1140 ACAACTACCTTTCTACGGACGTGGGATCCTGCACCCTCGTCTGCCCCC aa.c 381 N Y L S T D V G S C T L V C P L 1250 . : . : . : . : . : aa.g 397 H N Q E V T A E D G T Q R C E K 121756 TGCACAACCAAGAGGTGACAGCAGAGGATGGAACACAGCGGTGTGAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1188 TGCACAACCAAGAGGTGACAGCAGAGGATGGAACACAGCGGTGTGAGAAG aa.c 397 H N Q E V T A E D G T Q R C E K 1300 . : . : . : . : . : aa.g 413 C S K P C A R V C Y G L G M 121806 TGCAGCAAGCCCTGTGCCCGAGGTA...CAGTGTGCTATGGTCTGGGCAT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 1238 TGCAGCAAGCCCTGTGCCCGAG 274 TGTGCTATGGTCTGGGCAT aa.c 413 C S K P C A R V C Y G L G M 1350 . : . : . : . : . : aa.g 427 E H L R E V R A V T S A N I Q E F 122121 GGAGCACTTGCGAGAGGTGAGGGCAGTTACCAGTGCCAATATCCAGGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1279 GGAGCACTTGCGAGAGGTGAGGGCAGTTACCAGTGCCAATATCCAGGAGT aa.c 427 E H L R E V R A V T S A N I Q E F 1400 . : . : . : . : . : aa.g 444 A G C K K I F G S L A F L P E S 122171 TTGCTGGCTGCAAGAAGATCTTTGGGAGCCTGGCATTTCTGCCGGAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1329 TTGCTGGCTGCAAGAAGATCTTTGGGAGCCTGGCATTTCTGCCGGAGAGC aa.c 444 A G C K K I F G S L A F L P E S 1450 . : . : . : . : . : aa.g 460 F D G D P A S N T A P L Q P 122221 TTTGATGGGTA...CAGGGACCCAGCCTCCAACACTGCCCCGCTCCAGCC ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 1379 TTTGATGG 2837 GGACCCAGCCTCCAACACTGCCCCGCTCCAGCC aa.c 460 F D G D P A S N T A P L Q P 1500 . : . : . : . : . : aa.g 474 E Q L Q V F E T L E E I T G 125099 AGAGCAGCTCCAAGTGTTTGAGACTCTGGAAGAGATCACAGGTG...CAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 1420 AGAGCAGCTCCAAGTGTTTGAGACTCTGGAAGAGATCACAG 86 aa.c 474 E Q L Q V F E T L E E I T G 1550 . : . : . : . : . : aa.g 488 Y L Y I S A W P D S L P D L S V 125226 GTTACCTATACATCTCAGCATGGCCGGACAGCCTGCCTGACCTCAGCGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1461 GTTACCTATACATCTCAGCATGGCCGGACAGCCTGCCTGACCTCAGCGTC aa.c 488 Y L Y I S A W P D S L P D L S V 1600 . : . : . : . : . : aa.g 504 F Q N L Q V I R G R I L H N 125276 TTCCAGAACCTGCAAGTAATCCGGGGACGAATTCTGCACAAGTG...TAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 1511 TTCCAGAACCTGCAAGTAATCCGGGGACGAATTCTGCACAA 203 aa.c 504 F Q N L Q V I R G R I L H N 1650 . : . : . : . : . : aa.g 518 G A Y S L T L Q G L G I S W L G L 125520 TGGCGCCTACTCGCTGACCCTGCAAGGGCTGGGCATCAGCTGGCTGGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1552 TGGCGCCTACTCGCTGACCCTGCAAGGGCTGGGCATCAGCTGGCTGGGGC aa.c 518 G A Y S L T L Q G L G I S W L G L 1700 . : . : . : . : . : aa.g 535 R S L R E L G S G L A L I H H N 125570 TGCGCTCACTGAGGGAACTGGGCAGTGGACTGGCCCTCATCCACCATAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1602 TGCGCTCACTGAGGGAACTGGGCAGTGGACTGGCCCTCATCCACCATAAC aa.c 535 R S L R E L G S G L A L I H H N 1750 . : . : . : . : . : aa.g 551 T H L C F V H T V P W D Q L F R N 125620 ACCCACCTCTGCTTCGTGCACACGGTGCCCTGGGACCAGCTCTTTCGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1652 ACCCACCTCTGCTTCGTGCACACGGTGCCCTGGGACCAGCTCTTTCGGAA aa.c 551 T H L C F V H T V P W D Q L F R N 1800 . : . : . : . : . : aa.g 568 P H Q A L L H T A N R P E D E C V 125670 CCCGCACCAAGCTCTGCTCCACACTGCCAACCGGCCAGAGGACGAGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1702 CCCGCACCAAGCTCTGCTCCACACTGCCAACCGGCCAGAGGACGAGTGTG aa.c 568 P H Q A L L H T A N R P E D E C V 1850 . : . : . : . : . : aa.g 585 G E G L A C H Q L C A R G 125720 GTA...CAGTGGGCGAGGGCCTGGCCTGCCACCAGCTGTGCGCCCGAGGG >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1752 361 TGGGCGAGGGCCTGGCCTGCCACCAGCTGTGCGCCCGAGGG aa.c 585 G E G L A C H Q L C A R G 1900 . : . : . : . : . : aa.g 598 H C W G P G P T Q C V N C S Q F L 126122 CACTGCTGGGGTCCAGGGCCCACCCAGTGTGTCAACTGCAGCCAGTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1793 CACTGCTGGGGTCCAGGGCCCACCCAGTGTGTCAACTGCAGCCAGTTCCT aa.c 598 H C W G P G P T Q C V N C S Q F L 1950 . : . : . : . : . : aa.g 615 R G Q E C V E E C R V L Q G 126172 TCGGGGCCAGGAGTGCGTGGAGGAATGCCGAGTACTGCAGGGGTA...CA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 1843 TCGGGGCCAGGAGTGCGTGGAGGAATGCCGAGTACTGCAGGG 81 aa.c 615 R G Q E C V E E C R V L Q G 2000 . : . : . : . : . : aa.g 629 L P R E Y V N A R H C L P C H P 126294 GGCTCCCCAGGGAGTATGTGAATGCCAGGCACTGTTTGCCGTGCCACCCT >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1885 GCTCCCCAGGGAGTATGTGAATGCCAGGCACTGTTTGCCGTGCCACCCT aa.c 629 L P R E Y V N A R H C L P C H P 2050 . : . : . : . : . : aa.g 645 E C Q P Q N G S V T C F G P 126344 GAGTGTCAGCCCCAGAATGGCTCAGTGACCTGTTTTGGACCGGTG...CA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 1934 GAGTGTCAGCCCCAGAATGGCTCAGTGACCTGTTTTGGACCG 714 aa.c 645 E C Q P Q N G S V T C F G P 2100 . : . : . : . : . : aa.g 659 E A D Q C V A C A H Y K D P P F C 127099 GGAGGCTGACCAGTGTGTGGCCTGTGCCCACTATAAGGACCCTCCCTTCT >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1976 GAGGCTGACCAGTGTGTGGCCTGTGCCCACTATAAGGACCCTCCCTTCT aa.c 659 E A D Q C V A C A H Y K D P P F C 2150 . : . : . : . : . : aa.g 676 V A R C P S G V K P D L S Y M P 127149 GCGTGGCCCGCTGCCCCAGCGGTGTGAAACCTGACCTCTCCTACATGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2025 GCGTGGCCCGCTGCCCCAGCGGTGTGAAACCTGACCTCTCCTACATGCCC aa.c 676 V A R C P S G V K P D L S Y M P 2200 . : . : . : . : . : aa.g 692 I W K F P D E E G A C Q P C P I N 127199 ATCTGGAAGTTTCCAGATGAGGAGGGCGCATGCCAGCCTTGCCCCATCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2075 ATCTGGAAGTTTCCAGATGAGGAGGGCGCATGCCAGCCTTGCCCCATCAA aa.c 692 I W K F P D E E G A C Q P C P I N 2250 . : . : . : . : . : aa.g 709 C T H S C V D L D D K G C P 127249 CTGCACCCACTCGTG...CAGCTGTGTGGACCTGGATGACAAGGGCTGCC ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 2125 CTGCACCCACTC 2306 CTGTGTGGACCTGGATGACAAGGGCTGCC aa.c 709 C T H S C V D L D D K G C P 2300 . : . : . : . : . : aa.g 723 A E Q R A S P L T S I I S 129596 CCGCCGAGCAGAGAGCCAGGTT...CAGCCCTCTGACGTCCATCATCTCT |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 2166 CCGCCGAGCAGAGAGCCAG 3484 CCCTCTGACGTCCATCATCTCT aa.c 723 A E Q R A S P L T S I I S 2350 . : . : . : . : . : aa.g 736 A V V G I L L V V V L G V V F G I 133121 GCGGTGGTTGGCATTCTGCTGGTCGTGGTCTTGGGGGTGGTCTTTGGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2207 GCGGTGGTTGGCATTCTGCTGGTCGTGGTCTTGGGGGTGGTCTTTGGGAT aa.c 736 A V V G I L L V V V L G V V F G I 2400 . : . : . : . : . : aa.g 753 L I K R R Q Q K I R K Y T M R R L 133171 CCTCATCAAGCGACGGCAGCAGAAGATCCGGAAGTACACGATGCGGAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2257 CCTCATCAAGCGACGGCAGCAGAAGATCCGGAAGTACACGATGCGGAGAC aa.c 753 L I K R R Q Q K I R K Y T M R R L 2450 . : . : . : . : . : aa.g 770 L Q E T E L V E P L T P S 133221 TGCTGCAGGAAACGGAGGTG...CAGCTGGTGGAGCCGCTGACACCTAGC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 2307 TGCTGCAGGAAACGGAG 80 CTGGTGGAGCCGCTGACACCTAGC aa.c 770 L Q E T E L V E P L T P S 2500 . : . : . : . : . : aa.g 783 G A M P N Q A Q M R I L K E T E L 133342 GGAGCGATGCCCAACCAGGCGCAGATGCGGATCCTGAAAGAGACGGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2348 GGAGCGATGCCCAACCAGGCGCAGATGCGGATCCTGAAAGAGACGGAGCT aa.c 783 G A M P N Q A Q M R I L K E T E L 2550 . : . : . : . : . : aa.g 800 R K V K V L G S G A F G T V Y K 133392 GAGGAAGGTGAAGGTGCTTGGATCTGGCGCTTTTGGCACAGTCTACAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 2398 GAGGAAGGTGAAGGTGCTTGGATCTGGCGCTTTTGGCACAGTCTACAAG aa.c 800 R K V K V L G S G A F G T V Y K 2600 . : . : . : . : . : aa.g 816 G I W I P D G E N V K I P V 133442 TC...CAGGGCATCTGGATCCCTGATGGGGAGAATGTGAAAATTCCAGTG >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2447 251 GGCATCTGGATCCCTGATGGGGAGAATGTGAAAATTCCAGTG aa.c 816 G I W I P D G E N V K I P V 2650 . : . : . : . : . : aa.g 830 A I K V L R E N T S P K A N K E I 133734 GCCATCAAAGTGTTGAGGGAAAACACATCCCCCAAAGCCAACAAAGAAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2489 GCCATCAAAGTGTTGAGGGAAAACACATCCCCCAAAGCCAACAAAGAAAT aa.c 830 A I K V L R E N T S P K A N K E I 2700 . : . : . : . : . : aa.g 847 L D E A Y V M A G V G S P Y 133784 CTTAGACGTA...CAGGAAGCATACGTGATGGCTGGTGTGGGCTCCCCAT |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2539 CTTAGAC 715 GAAGCATACGTGATGGCTGGTGTGGGCTCCCCAT aa.c 847 L D E A Y V M A G V G S P Y 2750 . : . : . : . : . : aa.g 861 V S R L L G I C L T S T V Q L V 134540 ATGTCTCCCGCCTTCTGGGCATCTGCCTGACATCCACGGTGCAGCTGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2580 ATGTCTCCCGCCTTCTGGGCATCTGCCTGACATCCACGGTGCAGCTGGTG aa.c 861 V S R L L G I C L T S T V Q L V 2800 . : . : . : . : . : aa.g 877 T Q L M P Y G C L L D H V R E N R 134590 ACACAGCTTATGCCCTATGGCTGCCTCTTAGACCATGTCCGGGAAAACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2630 ACACAGCTTATGCCCTATGGCTGCCTCTTAGACCATGTCCGGGAAAACCG aa.c 877 T Q L M P Y G C L L D H V R E N R 2850 . : . : . : . : . : aa.g 894 G R L G S Q D L L N W C M Q I A K 134640 CGGACGCCTGGGCTCCCAGGACCTGCTGAACTGGTGTATGCAGATTGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2680 CGGACGCCTGGGCTCCCAGGACCTGCTGAACTGGTGTATGCAGATTGCCA aa.c 894 G R L G S Q D L L N W C M Q I A K 2900 . : . : . : . : . : aa.g 911 G M S Y L E D V R L V H R 134690 AGGTA...CAGGGGATGAGCTACCTGGAGGATGTGCGGCTCGTACACAGG ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2730 AG 137 GGGATGAGCTACCTGGAGGATGTGCGGCTCGTACACAGG aa.c 911 G M S Y L E D V R L V H R 2950 . : . : . : . : . : aa.g 924 D L A A R N V L V K S P N H V K I 134868 GACTTGGCCGCTCGGAACGTGCTGGTCAAGAGTCCCAACCATGTCAAAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2771 GACTTGGCCGCTCGGAACGTGCTGGTCAAGAGTCCCAACCATGTCAAAAT aa.c 924 D L A A R N V L V K S P N H V K I 3000 . : . : . : . : . : aa.g 941 T D F G L A R L L D I D E T E Y H 134918 TACAGACTTCGGGCTGGCTCGGCTGCTGGACATTGACGAGACAGAGTACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2821 TACAGACTTCGGGCTGGCTCGGCTGCTGGACATTGACGAGACAGAGTACC aa.c 941 T D F G L A R L L D I D E T E Y H 3050 . : . : . : . : . : aa.g 958 A D G G K V P I K W M A L 134968 ATGCAGATGGGGGCAAGGTT...CAGGTGCCCATCAAGTGGATGGCGCTG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 2871 ATGCAGATGGGGGCAAG 122 GTGCCCATCAAGTGGATGGCGCTG aa.c 958 A D G G K V P I K W M A L 3100 . : . : . : . : . : aa.g 971 E S I L R R R F T H Q S D V W S Y 135131 GAGTCCATTCTCCGCCGGCGGTTCACCCACCAGAGTGATGTGTGGAGTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2912 GAGTCCATTCTCCGCCGGCGGTTCACCCACCAGAGTGATGTGTGGAGTTA aa.c 971 E S I L R R R F T H Q S D V W S Y 3150 . : . : . : . : . : aa.g 988 G V T V W E L M T F G A K P 135181 TGGTG...TAGGTGTGACTGTGTGGGAGCTGATGACTTTTGGGGCCAAAC ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2962 TG 304 GTGTGACTGTGTGGGAGCTGATGACTTTTGGGGCCAAAC aa.c 988 G V T V W E L M T F G A K P 3200 . : . : . : . : . : aa.g 1002 Y D G I P A R E I P D L L E K G 135526 CTTACGATGGGATCCCAGCCCGGGAGATCCCTGACCTGCTGGAAAAGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3003 CTTACGATGGGATCCCAGCCCGGGAGATCCCTGACCTGCTGGAAAAGGGG aa.c 1002 Y D G I P A R E I P D L L E K G 3250 . : . : . : . : . : aa.g 1018 E R L P Q P P I C T I D V Y M I M 135576 GAGCGGCTGCCCCAGCCCCCCATCTGCACCATTGATGTCTACATGATCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3053 GAGCGGCTGCCCCAGCCCCCCATCTGCACCATTGATGTCTACATGATCAT aa.c 1018 E R L P Q P P I C T I D V Y M I M 3300 . : . : . : . : . : aa.g 1035 V K C W M I D S E C R P R F 135626 GGTCAAATGTG...CAGGTTGGATGATTGACTCTGAATGTCGGCCAAGAT ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 3103 GGTCAAAT 708 GTTGGATGATTGACTCTGAATGTCGGCCAAGAT aa.c 1035 V K C W M I D S E C R P R F 3350 . : . : . : . : . : aa.g 1049 R E L V S E F S R M A R D P Q R 136375 TCCGGGAGTTGGTGTCTGAATTCTCCCGCATGGCCAGGGACCCCCAGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3144 TCCGGGAGTTGGTGTCTGAATTCTCCCGCATGGCCAGGGACCCCCAGCGC aa.c 1049 R E L V S E F S R M A R D P Q R 3400 . : . : . : . : . : aa.g 1065 F V V I Q N E D L G P A S P 136425 TTTGTGGTCATCCAGGTA...CAGAATGAGGACTTGGGCCCAGCCAGTCC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 3194 TTTGTGGTCATCCAG 155 AATGAGGACTTGGGCCCAGCCAGTCC aa.c 1065 F V V I Q N E D L G P A S P 3450 . : . : . : . : . : aa.g 1079 L D S T F Y R S L L E D D D M G D 136621 CTTGGACAGCACCTTCTACCGCTCACTGCTGGAGGACGATGACATGGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3235 CTTGGACAGCACCTTCTACCGCTCACTGCTGGAGGACGATGACATGGGGG aa.c 1079 L D S T F Y R S L L E D D D M G D 3500 . : . : . : . : . : aa.g 1096 L V D A E E Y L V P Q Q G F F C 136671 ACCTGGTGGATGCTGAGGAGTATCTGGTACCCCAGCAGGGCTTCTTCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3285 ACCTGGTGGATGCTGAGGAGTATCTGGTACCCCAGCAGGGCTTCTTCTGT aa.c 1096 L V D A E E Y L V P Q Q G F F C 3550 . : . : . : . : . : aa.g 1112 P D P A P G A G G M V H H R H R S 136721 CCAGACCCTGCCCCGGGCGCTGGGGGCATGGTCCACCACAGGCACCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3335 CCAGACCCTGCCCCGGGCGCTGGGGGCATGGTCCACCACAGGCACCGCAG aa.c 1112 P D P A P G A G G M V H H R H R S 3600 . : . : . : . : . : aa.g 1129 S S T R S G G G D L T L G L 136771 CTCATCTACCAGGGTC...CAGAGTGGCGGTGGGGACCTGACACTAGGGC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 3385 CTCATCTACCAGG 291 AGTGGCGGTGGGGACCTGACACTAGGGC aa.c 1129 S S T R S G G G D L T L G L 3650 . : . : . : . : . : aa.g 1143 E P S E E E A P R S P L A P S E 137103 TGGAGCCCTCTGAAGAGGAGGCCCCCAGGTCTCCACTGGCACCCTCCGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3426 TGGAGCCCTCTGAAGAGGAGGCCCCCAGGTCTCCACTGGCACCCTCCGAA aa.c 1143 E P S E E E A P R S P L A P S E 3700 . : . : . : . : . : aa.g 1159 G A G S D V F D G D L G M G A A K 137153 GGGGCTGGCTCCGATGTATTTGATGGTGACCTGGGAATGGGGGCAGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3476 GGGGCTGGCTCCGATGTATTTGATGGTGACCTGGGAATGGGGGCAGCCAA aa.c 1159 G A G S D V F D G D L G M G A A K 3750 . : . : . : . : . : aa.g 1176 G L Q S L P T H D P S P L Q R Y S 137203 GGGGCTGCAAAGCCTCCCCACACATGACCCCAGCCCTCTACAGCGGTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3526 GGGGCTGCAAAGCCTCCCCACACATGACCCCAGCCCTCTACAGCGGTACA aa.c 1176 G L Q S L P T H D P S P L Q R Y S 3800 . : . : . : . : . : aa.g 1193 E D P T V P L P S E T D G Y V A 137253 GTGAGGACCCCACAGTACCCCTGCCCTCTGAGACTGATGGCTACGTTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3576 GTGAGGACCCCACAGTACCCCTGCCCTCTGAGACTGATGGCTACGTTGCC aa.c 1193 E D P T V P L P S E T D G Y V A 3850 . : . : . : . : . : aa.g 1209 P L T C S P Q P E Y V N Q P 137303 CCCCTGACCTGCAGCCCCCAGCCTGGTA...CAGAATATGTGAACCAGCC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 3626 CCCCTGACCTGCAGCCCCCAGCCTG 141 AATATGTGAACCAGCC aa.c 1209 P L T C S P Q P E Y V N Q P 3900 . : . : . : . : . : aa.g 1223 D V R P Q P P S P R E G P L P A A 137485 AGATGTTCGGCCCCAGCCCCCTTCGCCCCGAGAGGGCCCTCTGCCTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3667 AGATGTTCGGCCCCAGCCCCCTTCGCCCCGAGAGGGCCCTCTGCCTGCTG aa.c 1223 D V R P Q P P S P R E G P L P A A 3950 . : . : . : . : . : aa.g 1240 R P A G A T L E R P K T L S P G 137535 CCCGACCTGCTGGTGCCACTCTGGAAAGGCCCAAGACTCTCTCCCCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3717 CCCGACCTGCTGGTGCCACTCTGGAAAGGCCCAAGACTCTCTCCCCAGGG aa.c 1240 R P A G A T L E R P K T L S P G 4000 . : . : . : . : . : aa.g 1256 K N G V V K D V F A F G G A V E N 137585 AAGAATGGGGTCGTCAAAGACGTTTTTGCCTTTGGGGGTGCCGTGGAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3767 AAGAATGGGGTCGTCAAAGACGTTTTTGCCTTTGGGGGTGCCGTGGAGAA aa.c 1256 K N G V V K D V F A F G G A V E N 4050 . : . : . : . : . : aa.g 1273 P E Y L T P Q G G A A P Q P H P P 137635 CCCCGAGTACTTGACACCCCAGGGAGGAGCTGCCCCTCAGCCCCACCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3817 CCCCGAGTACTTGACACCCCAGGGAGGAGCTGCCCCTCAGCCCCACCCTC aa.c 1273 P E Y L T P Q G G A A P Q P H P P 4100 . : . : . : . : . : aa.g 1290 P A F S P A F D N L Y Y W D Q D 137685 CTCCTGCCTTCAGCCCAGCCTTCGACAACCTCTATTACTGGGACCAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3867 CTCCTGCCTTCAGCCCAGCCTTCGACAACCTCTATTACTGGGACCAGGAC aa.c 1290 P A F S P A F D N L Y Y W D Q D 4150 . : . : . : . : . : aa.g 1306 P P E R G A P P S T F K G T P T A 137735 CCACCAGAGCGGGGGGCTCCACCCAGCACCTTCAAAGGGACACCTACGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3917 CCACCAGAGCGGGGGGCTCCACCCAGCACCTTCAAAGGGACACCTACGGC aa.c 1306 P P E R G A P P S T F K G T P T A 4200 . : . : . : . : . : aa.g 1323 E N P E Y L G L D V P V * 137785 AGAGAACCCAGAGTACCTGGGTCTGGACGTGCCAGTGTGAACCAGAAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3967 AGAGAACCCAGAGTACCTGGGTCTGGACGTGCCAGTGTGAACCAGAAGGC aa.c 1323 E N P E Y L G L D V P V * 4250 . : . : . : . : . : 137835 CAAGTCCGCAGAAGCCCTGATGTGTCCTCAGGGAGCAGGGAAGGCCTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4017 CAAGTCCGCAGAAGCCCTGATGTGTCCTCAGGGAGCAGGGAAGGCCTGAC 4300 . : . : . : . : . : 137885 TTCTGCTGGCATCAAGAGGTGGGAGGGCCCTCCGACCACTTCCAGGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4067 TTCTGCTGGCATCAAGAGGTGGGAGGGCCCTCCGACCACTTCCAGGGGAA 4350 . : . : . : . : . : 137935 CCTGCCATGCCAGGAACCTGTCCTAAGGAACCTTCCTTCCTGCTTGAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4117 CCTGCCATGCCAGGAACCTGTCCTAAGGAACCTTCCTTCCTGCTTGAGTT 4400 . : . : . : . : . : 137985 CCCAGATGGCTGGAAGGGGTCCAGCCTCGTTGGAAGAGGAACAGCACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4167 CCCAGATGGCTGGAAGGGGTCCAGCCTCGTTGGAAGAGGAACAGCACTGG 4450 . : . : . : . : . : 138035 GGAGTCTTTGTGGATTCTGAGGCCCTGCCCAATGAGACTCTAGGGTCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4217 GGAGTCTTTGTGGATTCTGAGGCCCTGCCCAATGAGACTCTAGGGTCCAG 4500 . : . : . : . : . : 138085 TGGATGCCACAGCCCAGCTTGGCCCTTTCCTTCCAGATCCTGGGTACTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4267 TGGATGCCACAGCCCAGCTTGGCCCTTTCCTTCCAGATCCTGGGTACTGA 4550 . : . : . : . : . : 138135 AAGCCTTAGGGAAGCTGGCCTGAGAGGGGAAGCGGCCCTAAGGGAGTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4317 AAGCCTTAGGGAAGCTGGCCTGAGAGGGGAAGCGGCCCTAAGGGAGTGTC 4600 . : . : . : . : . : 138185 TAAGAACAAAAGCGACCCATTCAGAGACTGTCCCTGAAACCTAGTACTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4367 TAAGAACAAAAGCGACCCATTCAGAGACTGTCCCTGAAACCTAGTACTGC 4650 . : . : . : . : . : 138235 CCCCCATGAGGAAGGAACAGCAATGGTGTCAGTATCCAGGCTTTGTACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4417 CCCCCATGAGGAAGGAACAGCAATGGTGTCAGTATCCAGGCTTTGTACAG 4700 . : . : . : . : . : 138285 AGTGCTTTTCTGTTTAGTTTTTACTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTAAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4467 AGTGCTTTTCTGTTTAGTTTTTACTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTAAAGAT 4750 . : . : . : . : . : 138335 GAAATAAAGACCCAGGGGGAGAATGGGTGTTGTATGGGGAGGCAAGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4517 GAAATAAAGACCCAGGGGGAGAATGGGTGTTGTATGGGGAGGCAAGTGTG 4800 . : . : . : . : . : 138385 GGGGGTCCTTCTCCACACCCACTTTGTCCATTTGCAAATATATTTTGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 4567 GGGGGTCCTTCTCCACACCCACTTTGTCCATTTGCAAATATATTTTGGAA 4850 . 138435 AACAGCTA |||||||| 4617 AACAGCTA