view test-data/resfinder.90/cluster-219.msa @ 0:fbe36cf83eb7 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/groot commit 85ca2a9a7b2871674dbb9e53e398e459debca529
author iuc
date Fri, 18 Oct 2024 08:19:14 +0000
parents
children
line wrap: on
line source

>*blaB-10_1_AY348325
---ATGAAAGGATTAAAAGGGCTATTGGTTCTGGCTTTAGGCTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGGCAACAGAACCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTCAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACCGATAAAGGAGTAGTGGTTATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTTATCATGAACATTGCAACCCACTCTCATGATGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAAGACTGAGTTTCAGGTTTATTATCCGGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTTGTGTGGTTTCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGTGGTGATTC
GAAAGACCTTGGGTTTATTGGGGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAACATTCAGCAGAAATTTCCCT
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCATGACGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>blaB-5_1_AF189303
ATGTTGAAAAGATTAAAAGGATTATTGGTTCTGGCTTTAGGTTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGACAGCAAAATCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTTAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACGGATAAAGGAGTAGTGGTGATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTCATCATGAACATTGCTACCCATTCTCATGACGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAACACTGAGTTCCAGGTCTATTATCCGGGAAAAGGG
CATACGGCAGATAATGTGGTGGTATGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGTGGTGATTC
GAAAGACCTTGGATATATTGGAGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCTATACACAATATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGCCACGATGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAT
TACCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>blaB-6_1_AF189302
---ATGAAAAGATTAAAAGGATTATTGGTTCTGGCTTTAGGTTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGACAGCAAAATCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTTAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACGGATAAAGGAGTAGTGGTGATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTCATCATGAACATTGCTACCCATTCTCATGACGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAACACTGAGTTCCAGGTCTATTATCCGGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTTGTGTGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGCGGTGATTC
GAAAGACCTTGGGTTTATTGGAGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAACATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCACGATGACTGGAAGGATCAAACATCAATACAGCATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>blaB-7_1_AF189304
---ATGAAAGGATTAAAAGGGCTATTGGTTCTGGCTTTAGGTTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGGCAACAGAACCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTCAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACCGATAAAGGAATAGTGGTTATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGTAAGAAAGTTATCATGAACATTGCGACCCACTCTCATGATGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAAGACTGAGTTTCAGGTCTATTATCCGGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTTGTGTGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGTGGTGATTC
GAAAGACCTTGGGTTTATTGGAGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAATATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCATGACGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>blaB-8_1_AF189305
---ATGAAAGGATTAAAAGGACTATTGGTTCTGGCTTTAGGTTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGGCAACAGAACCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACATATAATACCTTCAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACCGATAAAGGAGTAGTGGTTATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTTATCATGAACATTGCGACCCACTCTCATGATGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAAGACTGAGTTTCAGGTCTATTATCCAGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTTGTATGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGCGGTGATTC
GAAAGATCTTGGGTTTATTGGAGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAACATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCATGACGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>blaB-9_1_AY348324
---ATGAAAGGATTAAAAGGGCTATTGGTTCTGGCTTTAGGCTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGGCAACAGAACCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTCAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACCGATAAAGGAGTAGTGGTGATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTCATCATGAACATTGCTACACATTCTCATGACGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAACACTGAGTTCCAGGTCTATTATCCGGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTGGTATGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGCGGTGATTC
GAAAGACCTTGGGTTTATTGGGGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAACATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCATGACGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA
>consensus
+++ATGAAAGGATTAAAAGGACTATTGGTTCTGGCTTTAGGTTTTACAGGACTACAGGTTTTTGGGCAACAGAACCCTGA
TATTAAAATTGAAAAATTAAAAGATAATTTATACGTCTATACAACCTATAATACCTTCAAAGGAACTAAATATGCGGCTA
ATGCGGTATATATGGTAACCGATAAAGGAGTAGTGGTGATAGACTCTCCATGGGGAGAAGATAAATTTAAAAGTTTTACA
GACGAGATTTATAAAAAGCACGGAAAGAAAGTCATCATGAACATTGCTACCCACTCTCATGACGATAGAGCCGGAGGTCT
TGAATATTTTGGTAAACTAGGTGCAAAAACTTATTCTACTAAAATGACAGATTCTATTTTAGCAAAAGAGAATAAGCCAA
GAGCAAAGTACACTTTTGATAATAATAAATCTTTTAAAGTAGGAAACACTGAGTTCCAGGTCTATTATCCGGGAAAAGGT
CATACAGCAGATAATGTGGTTGTATGGTTCCCTAAAGACAAAGTATTAGTAGGAGGCTGCATTGTAAAAAGCGGTGATTC
GAAAGACCTTGGGTTTATTGGAGAAGCTTATGTAAACGACTGGACACAGTCCATACACAACATTCAGCAGAAATTTCCCG
ATGTTCAGTATGTCGTTGCAGGTCATGACGACTGGAAAGATCAAACATCAATACAACATACACTGGATTTAATCAGTGAA
TATCAACAAAAACAAAAGGCTTCAAATTAA