# HG changeset patch # User ggricourt # Date 1645632327 0 # Node ID 5068c648460654c98557514178ba2299c069e7ba # Parent 262b8d79bc08947aaa5d36a14b0c90b287e575b5 "planemo upload for repository https://github.com/brsynth/synbiocad-galaxy-wrappers commit 8353ca81a49f5c8c7efb00cdf08710f916422a44-dirty" diff -r 262b8d79bc08 -r 5068c6484606 data_manager/bigg_model_sbml_fetcher.py --- a/data_manager/bigg_model_sbml_fetcher.py Wed Feb 23 14:33:49 2022 +0000 +++ b/data_manager/bigg_model_sbml_fetcher.py Wed Feb 23 16:05:27 2022 +0000 @@ -9,6 +9,56 @@ # Fall back to Python 2 imports from urllib2 import Request, urlopen +BASE_URL = 'http://bigg.ucsd.edu/static/models' +ID2ORG = { + "iCN718": "Acinetobacter baumannii AYE", + "iYO844": "Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168", + "iRC1080": "Chlamydomonas reinhardtii", + "iCN900": "Clostridioides difficile 630", + "iHN637": "Clostridium ljungdahlii DSM 13528", + "iCHOv1_DG44": "Cricetulus griseus", + "iCHOv1": "Cricetulus griseus", + "iAF1260b": "Escherichia coli str. 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