Mercurial > repos > devteam > vcf_extract
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G A 99.0 PASS NS=299;DP=809;AC=271;AN=598;AF=0.45318;RA=473;AA=335;SR=453|20;SA=325|10;SB=0.97015;AB=0.53559;ABR=158;ABA=137;RUN=1;SNP;TS 20 80079 . G A 27.1 PASS NS=316;DP=898;AC=7;AN=632;AF=0.011076;RA=888;AA=8;SR=851|37;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.73333;ABR=22;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 80095 . A G 0.0807 PASS NS=324;DP=1080;AC=3;AN=648;AF=0.0046296;RA=1063;AA=7;SR=935|128;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS 20 80165 . G T 0.0494 PASS NS=365;DP=2212;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2191;AA=14;SR=1178|1013;SA=1|13;SB=0.071429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 80174 . A T 0.633 PASS NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=2;SR=1187|1166;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 80251 . T C 2.09 PASS NS=369;DP=2247;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2212;AA=25;SR=1205|1007;SA=5|20;SB=0.2;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS 20 80289 . C A 1.02 PASS NS=367;DP=2183;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=3;SR=1321|856;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 80359 . T C 0.834 PASS NS=367;DP=2201;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=7;SR=1148|1029;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 80448 . A G 0.782 PASS NS=367;DP=2320;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2310;AA=4;SR=1056|1254;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 80481 . G C 99.0 PASS NS=368;DP=2442;AC=48;AN=736;AF=0.065217;RA=2286;AA=149;SR=1092|1194;SA=62|87;SB=0.41611;AB=0.50794;ABR=128;ABA=122;RUN=1;SNP;TV 20 80497 . G T 0.851 PASS NS=366;DP=2581;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2572;AA=5;SR=1218|1354;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 80513 . C G 25.9 PASS NS=369;DP=2672;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2659;AA=6;SR=1308|1351;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TV 20 80525 . C A 0.0588 PASS NS=365;DP=2634;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2619;AA=5;SR=1324|1295;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 80655 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2328;AC=646;AN=732;AF=0.88251;RA=331;AA=1993;SR=147|184;SA=829|1164;SB=0.41596;AB=0.56156;ABR=260;ABA=203;RUN=1;SNP;TS 20 80725 . T A 8.94 PASS NS=366;DP=2067;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2061;AA=2;SR=1019|1042;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 80728 . C G 99.0 PASS NS=366;DP=2029;AC=17;AN=732;AF=0.023224;RA=1969;AA=56;SR=983|986;SA=27|29;SB=0.48214;AB=0.5045;ABR=56;ABA=55;RUN=1;SNP;TV 20 80838 . C T 76.1 PASS NS=365;DP=2253;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2239;AA=6;SR=953|1286;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 80856 . C G 0.0837 PASS NS=363;DP=2218;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2206;AA=4;SR=931|1275;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 80865 . A C 0.0761 PASS NS=363;DP=2195;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2187;AA=5;SR=937|1250;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 80887 . G A 58.7 PASS NS=361;DP=2159;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2148;AA=6;SR=901|1247;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 81001 . T C 39.3 PASS NS=364;DP=1961;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1955;AA=3;SR=979|976;SA=3|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 81017 . C T 0.602 PASS NS=358;DP=1953;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1946;AA=3;SR=966|980;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 81071 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1794;AC=6;AN=726;AF=0.0082645;RA=1756;AA=20;SR=873|883;SA=8|12;SB=0.4;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=1;SNP;TS 20 81282 . A T 3.99 PASS NS=361;DP=1909;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1900;AA=4;SR=1029|871;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81297 . T A 9.74 PASS NS=360;DP=1948;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1931;AA=6;SR=1062|869;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81298 . G A 99.0 PASS NS=360;DP=1942;AC=5;AN=720;AF=0.0069444;RA=1923;AA=17;SR=1058|865;SA=11|6;SB=0.64706;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TS 20 81481 . A G 0.751 PASS NS=354;DP=1746;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1737;AA=3;SR=786|951;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 81550 . G T 13.7 PASS NS=351;DP=1755;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1750;AA=3;SR=809|941;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81551 . A T 10.2 PASS NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1754;AA=2;SR=809|945;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81561 . A G 0.396 PASS NS=348;DP=1704;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1696;AA=3;SR=816|880;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 81602 . C G 1.28 PASS NS=348;DP=1658;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1645;AA=3;SR=860|785;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81679 . T G 4.28 PASS NS=350;DP=1612;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1602;AA=5;SR=664|938;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81692 . T C 4.66 PASS NS=347;DP=1557;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1550;AA=5;SR=624|926;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 81715 . C G 5.01 PASS NS=344;DP=1520;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1513;AA=2;SR=584|929;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 81966 . G A 15.2 PASS NS=187;DP=338;AC=1;AN=374;AF=0.0026738;RA=329;AA=4;SR=172|157;SA=4|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 82012 . T C 57.6 PASS NS=161;DP=273;AC=49;AN=322;AF=0.15217;RA=222;AA=41;SR=75|147;SA=16|25;SB=0.39024;AB=0.6;ABR=15;ABA=10;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 82119 . G A 1.23 PASS NS=223;DP=490;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=486;AA=2;SR=322|164;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 82168 . G A 0.0662 PASS NS=223;DP=456;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=447;AA=3;SR=316|131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 82204 . T C 60.6 PASS NS=275;DP=670;AC=17;AN=550;AF=0.030909;RA=633;AA=23;SR=366|267;SA=16|7;SB=0.69565;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 82215 . G A 99.0 PASS NS=313;DP=849;AC=97;AN=626;AF=0.15495;RA=715;AA=126;SR=411|304;SA=85|41;SB=0.6746;AB=0.49645;ABR=70;ABA=71;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 82217 . G A 99.0 PASS NS=314;DP=864;AC=493;AN=628;AF=0.78503;RA=182;AA=666;SR=108|74;SA=392|274;SB=0.58859;AB=0.46875;ABR=75;ABA=83;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 82223 . C T 99.0 PASS NS=325;DP=994;AC=20;AN=650;AF=0.030769;RA=956;AA=34;SR=548|408;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.53488;ABR=23;ABA=19;RUN=1;SNP;TS 20 82239 . A T 7.56 PASS NS=344;DP=1299;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1285;AA=2;SR=747|538;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 82258 . A G 14.1 PASS NS=355;DP=1549;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1536;AA=8;SR=883|653;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=3;SNP;TS 20 82309 . G A 0.136 PASS NS=356;DP=1542;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1528;AA=6;SR=935|593;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TS 20 82359 . T C 15.4 PASS NS=365;DP=1749;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1734;AA=8;SR=1094|640;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=3;SNP;TS 20 82415 . A C 23.9 PASS NS=369;DP=1845;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=1831;AA=10;SR=1068|763;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV 20 82416 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=1849;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=1813;AA=31;SR=1060|753;SA=14|17;SB=0.45161;AB=0.57627;ABR=34;ABA=25;RUN=1;SNP;TS 20 82446 . C G 59.2 PASS NS=359;DP=1707;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1700;AA=4;SR=909|791;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV 20 82460 . C T 9.05 PASS NS=363;DP=1665;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1657;AA=3;SR=856|801;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=2;SNP;TS 20 82571 . T C 12.6 PASS NS=351;DP=1817;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1807;AA=4;SR=940|867;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 82701 . T C 99.0 PASS NS=351;DP=1848;AC=103;AN=702;AF=0.14672;RA=1578;AA=267;SR=848|730;SA=159|108;SB=0.59551;AB=0.5063;ABR=241;ABA=235;RUN=1;SNP;TS 20 82729 . G C 7.54 PASS NS=348;DP=1793;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1782;AA=5;SR=948|834;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 82783 . C G 0.355 PASS NS=364;DP=1952;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1940;AA=3;SR=954|986;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 82898 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2131;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2111;AA=11;SR=1035|1076;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.68966;ABR=20;ABA=9;RUN=3;SNP;TS 20 82923 . T A 0.244 PASS NS=368;DP=2124;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2113;AA=2;SR=1084|1029;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 82991 . G C 11.7 PASS NS=367;DP=1988;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1974;AA=3;SR=1070|904;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 83034 . T C 1.7 PASS NS=367;DP=2054;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2021;AA=8;SR=1049|972;SA=6|2;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83129 . A G 0.056 PASS NS=367;DP=2217;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2204;AA=6;SR=1098|1106;SA=0|6;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS 20 83154 . C G 0.0482 PASS NS=368;DP=2149;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2137;AA=6;SR=1070|1067;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV 20 83196 . A T 99.0 PASS NS=368;DP=1931;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1884;AA=39;SR=936|948;SA=18|21;SB=0.46154;AB=0.47619;ABR=30;ABA=33;RUN=3;SNP;TV 20 83231 . G A 2.47 PASS NS=339;DP=1326;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1312;AA=5;SR=685|627;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83481 . G T 0.0764 PASS NS=363;DP=2028;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2017;AA=7;SR=858|1159;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 83485 . A C 2.92 PASS NS=363;DP=2053;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2047;AA=4;SR=881|1166;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 83492 . A T 2.75 PASS NS=361;DP=2031;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2016;AA=11;SR=866|1150;SA=9|2;SB=0.81818;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=6;SNP;TV 20 83501 . G A 0.105 PASS NS=362;DP=2022;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2015;AA=2;SR=889|1126;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 83570 . T G 99.0 PASS NS=366;DP=2101;AC=53;AN=732;AF=0.072404;RA=1942;AA=152;SR=1026|916;SA=88|64;SB=0.57895;AB=0.47685;ABR=103;ABA=113;RUN=3;SNP;TV 20 83611 . C A 99.0 PASS NS=367;DP=2005;AC=13;AN=734;AF=0.017711;RA=1959;AA=41;SR=1062|897;SA=20|21;SB=0.4878;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TV 20 83613 . T C 0.232 PASS NS=367;DP=2011;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=4;SR=1083|921;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83629 . C T 5.45 PASS NS=363;DP=1970;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1962;AA=3;SR=1038|924;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 83666 . G T 0.202 PASS NS=360;DP=1983;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1977;AA=3;SR=1132|845;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 83732 . A T 0.0538 PASS NS=369;DP=2058;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2035;AA=9;SR=1048|987;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 83765 . A G 1.78 PASS NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2018;AA=3;SR=1058|960;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83777 . T C 0.0484 PASS NS=368;DP=2022;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2013;AA=6;SR=1109|904;SA=6|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83819 . A T 1.79 PASS NS=366;DP=2143;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2133;AA=3;SR=1253|880;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 83929 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2235;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2216;AA=10;SR=999|1217;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.61538;ABR=16;ABA=10;RUN=1;SNP;TS 20 83934 . C T 0.265 PASS NS=365;DP=2214;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2192;AA=3;SR=983|1209;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 83966 . C T 0.338 PASS NS=370;DP=2246;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2222;AA=6;SR=1045|1177;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 83971 . C T 22.1 PASS NS=368;DP=2238;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2220;AA=11;SR=1057|1163;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.5;ABR=8;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 83996 . C G 99.0 PASS NS=366;DP=2129;AC=25;AN=732;AF=0.034153;RA=2061;AA=56;SR=1024|1037;SA=22|34;SB=0.39286;AB=0.5283;ABR=56;ABA=50;RUN=1;SNP;TV 20 84003 . A G 0.091 PASS NS=365;DP=2098;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2068;AA=12;SR=1047|1021;SA=1|11;SB=0.083333;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 84079 . G A 45.3 PASS NS=360;DP=1898;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1874;AA=10;SR=901|973;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=3;SNP;TS 20 84201 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1809;AC=4;AN=710;AF=0.0056338;RA=1784;AA=14;SR=830|954;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=2;SNP;TS 20 84351 . G A 1.43 PASS NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2138;AA=4;SR=1159|979;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 84358 . T C 0.98 PASS NS=360;DP=2134;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2108;AA=13;SR=1150|958;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 84488 . A G 0.241 PASS NS=365;DP=2176;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2139;AA=9;SR=1014|1125;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG 20 84499 . G A 27.9 PASS NS=364;DP=2141;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2118;AA=11;SR=1047|1071;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=2;SNP;TS 20 84504 . G A 35.0 PASS NS=366;DP=2125;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2098;AA=13;SR=1028|1070;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS 20 84666 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2163;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2140;AA=15;SR=1118|1022;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.28571;ABR=4;ABA=10;RUN=4;SNP;TS;CpG 20 84727 . G A 88.5 PASS NS=371;DP=2412;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2393;AA=10;SR=1261|1132;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.5625;ABR=9;ABA=7;RUN=1;SNP;TS 20 84892 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2536;AC=8;AN=736;AF=0.01087;RA=2499;AA=25;SR=1170|1329;SA=12|13;SB=0.48;AB=0.55102;ABR=27;ABA=21;RUN=1;SNP;TS 20 84906 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2485;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2422;AA=30;SR=1127|1295;SA=20|10;SB=0.66667;AB=0.58491;ABR=31;ABA=20;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 84934 . C T 0.156 PASS NS=369;DP=2365;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=4;SR=1081|1272;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 84937 . T A 0.102 PASS NS=369;DP=2325;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2299;AA=11;SR=1060|1239;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TV 20 84949 . G A 1.84 PASS NS=369;DP=2295;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2281;AA=5;SR=1075|1206;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 85116 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2259;AC=49;AN=734;AF=0.066757;RA=2119;AA=129;SR=989|1130;SA=54|75;SB=0.4186;AB=0.50679;ABR=112;ABA=106;RUN=1;SNP;TS 20 85180 . A G 2.49 PASS NS=366;DP=2123;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2111;AA=3;SR=882|1229;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 85182 . C T 6.7 PASS NS=365;DP=2111;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2100;AA=2;SR=874|1226;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 85195 . A G 0.062 PASS NS=354;DP=2020;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=2010;AA=5;SR=851|1159;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 85371 . A G 3.11 PASS NS=349;DP=2019;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=2008;AA=2;SR=1054|954;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 85388 . G A 2.07 PASS NS=364;DP=2082;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2071;AA=4;SR=1054|1017;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 85414 . G C 0.348 PASS NS=369;DP=2163;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2147;AA=5;SR=1106|1041;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 85492 . T C 2.17 PASS NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2323;AA=6;SR=1170|1153;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 85530 . G A 1.82 PASS NS=366;DP=1908;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1900;AA=3;SR=984|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 85875 . A G 38.7 PASS NS=357;DP=1986;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1979;AA=6;SR=1078|901;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS 20 85937 . G C 99.0 PASS NS=369;DP=2379;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2348;AA=15;SR=1362|986;SA=9|6;SB=0.6;AB=0.38095;ABR=8;ABA=13;RUN=1;SNP;TV 20 86055 . A C 0.233 PASS NS=369;DP=2109;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2095;AA=7;SR=1161|934;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 86103 . G T 10.5 PASS NS=355;DP=2067;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=2052;AA=6;SR=1129|923;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV 20 86115 . G A 99.0 PASS NS=356;DP=2026;AC=16;AN=712;AF=0.022472;RA=1969;AA=51;SR=1039|930;SA=28|23;SB=0.54902;AB=0.48837;ABR=42;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 86335 . T A 2.87 PASS NS=357;DP=2032;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=2003;AA=17;SR=925|1078;SA=0|17;SB=0;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=6;SNP;TV 20 86458 . C T 0.0675 PASS NS=362;DP=1974;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1959;AA=2;SR=1098|861;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 86620 . T A 4.96 PASS NS=368;DP=2381;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2365;AA=3;SR=1199|1166;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 86691 . C T 0.306 PASS NS=359;DP=2285;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2274;AA=4;SR=1261|1013;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 86719 . A G 0.0505 PASS NS=362;DP=2130;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2108;AA=9;SR=1090|1018;SA=0|9;SB=0;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS 20 86757 . A G 2.16 PASS NS=364;DP=2159;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2147;AA=4;SR=1029|1118;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 86823 . T G 1.16 PASS NS=360;DP=1894;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1867;AA=9;SR=870|997;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 87003 . A C 43.6 PASS NS=357;DP=2114;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2103;AA=10;SR=846|1257;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.28571;ABR=2;ABA=5;RUN=1;SNP;TV 20 87029 . C A 6.64 PASS NS=353;DP=2097;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2090;AA=5;SR=842|1248;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 87067 . A T 0.0727 PASS NS=349;DP=1846;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1839;AA=4;SR=850|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 87112 . G A 99.0 PASS NS=350;DP=1657;AC=181;AN=700;AF=0.25857;RA=1252;AA=400;SR=740|512;SA=233|167;SB=0.5825;AB=0.51139;ABR=247;ABA=236;RUN=4;SNP;TS;CpG 20 87230 . G A 0.205 PASS NS=347;DP=1809;AC=4;AN=694;AF=0.0057637;RA=1779;AA=26;SR=812|967;SA=1|25;SB=0.038462;AB=0.71429;ABR=15;ABA=6;RUN=8;SNP;TS 20 87254 . C T 99.0 PASS NS=333;DP=1705;AC=3;AN=666;AF=0.0045045;RA=1687;AA=11;SR=755|932;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS 20 87265 . A G 0.41 PASS NS=335;DP=1686;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1680;AA=3;SR=813|867;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 87313 . A G 1.57 PASS NS=354;DP=1886;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1880;AA=2;SR=941|939;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 87314 . A T 0.279 PASS NS=354;DP=1882;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1874;AA=3;SR=939|935;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 87362 . A G 99.0 PASS NS=345;DP=1823;AC=26;AN=690;AF=0.037681;RA=1732;AA=89;SR=879|853;SA=46|43;SB=0.51685;AB=0.46809;ABR=66;ABA=75;RUN=1;SNP;TS 20 87416 . A C 99.0 PASS NS=357;DP=1755;AC=511;AN=714;AF=0.71569;RA=537;AA=1217;SR=259|278;SA=650|567;SB=0.5341;AB=0.48414;ABR=290;ABA=309;RUN=3;SNP;TV 20 87471 . T C 0.608 PASS NS=349;DP=1783;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1768;AA=5;SR=935|833;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 87555 . T A 0.0485 PASS NS=355;DP=1728;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1715;AA=7;SR=840|875;SA=0|7;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=5;SNP;TV 20 87682 . G A 0.887 PASS NS=355;DP=1823;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1803;AA=4;SR=925|878;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 87790 . C T 99.0 PASS NS=345;DP=1766;AC=16;AN=690;AF=0.023188;RA=1705;AA=49;SR=867|838;SA=32|17;SB=0.65306;AB=0.5102;ABR=50;ABA=46;RUN=2;SNP;TS 20 88003 . A G 1.57 PASS NS=343;DP=1528;AC=1;AN=686;AF=0.0014577;RA=1524;AA=3;SR=698|826;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 88031 . T C 1.06 PASS NS=347;DP=1727;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1710;AA=4;SR=899|811;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 88058 . T C 0.444 PASS NS=367;DP=2138;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=7;SR=1196|926;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 88072 . C T 99.0 PASS NS=372;DP=2307;AC=6;AN=744;AF=0.0080645;RA=2286;AA=17;SR=1310|976;SA=6|11;SB=0.35294;AB=0.54545;ABR=18;ABA=15;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 88123 . C T 0.301 PASS NS=357;DP=2104;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2091;AA=5;SR=1202|889;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 88155 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2136;AC=17;AN=728;AF=0.023352;RA=2082;AA=41;SR=1144|938;SA=30|11;SB=0.73171;AB=0.60494;ABR=49;ABA=32;RUN=1;SNP;TS 20 88162 . G A 47.4 PASS NS=369;DP=2151;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2139;AA=7;SR=1175|964;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 88320 . A T 0.798 PASS NS=350;DP=1709;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1700;AA=3;SR=1029|671;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 88565 . A G 0.361 PASS NS=331;DP=1574;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1565;AA=3;SR=773|792;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 88647 . T G 0.076 PASS NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2140;AA=4;SR=1060|1080;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 88750 . T C 5.86 PASS NS=360;DP=1753;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1747;AA=2;SR=887|860;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 88814 . T C 0.327 PASS NS=335;DP=1461;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1447;AA=4;SR=749|698;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 88827 . C A 99.0 PASS NS=328;DP=1379;AC=133;AN=656;AF=0.20274;RA=1086;AA=290;SR=531|555;SA=135|155;SB=0.46552;AB=0.4788;ABR=192;ABA=209;RUN=6;SNP;TV 20 88874 . C T 3.41 PASS NS=346;DP=1464;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1450;AA=3;SR=694|756;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 88880 . T C 69.1 PASS NS=352;DP=1515;AC=9;AN=704;AF=0.012784;RA=1470;AA=16;SR=727|743;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.6;ABR=21;ABA=13;RUN=1;SNP;TS 20 88924 . A T 15.2 PASS NS=357;DP=1741;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1730;AA=6;SR=863|867;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=2;SNP;TV 20 89032 . C T 87.2 PASS NS=356;DP=1715;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1703;AA=6;SR=753|950;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.16667;ABR=1;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 89057 . T C 11.1 PASS NS=346;DP=1555;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1546;AA=2;SR=644|902;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 89061 . C T 3.13 PASS NS=338;DP=1513;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1503;AA=3;SR=618|885;SA=3|0;SB=1;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 89208 . T C 1.55 PASS NS=348;DP=1527;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1515;AA=2;SR=795|720;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 89322 . C G 0.0545 PASS NS=296;DP=1182;AC=1;AN=592;AF=0.0016892;RA=1176;AA=2;SR=694|482;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 89442 . G T 0.338 PASS NS=345;DP=1852;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1844;AA=6;SR=1099|745;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 89517 . A T 4.6 PASS NS=360;DP=2035;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2030;AA=2;SR=1134|896;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 89661 . G A 47.0 PASS NS=366;DP=2184;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2175;AA=5;SR=1085|1090;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 89739 . T A 0.145 PASS NS=359;DP=1950;AC=2;AN=718;AF=0.0027855;RA=1928;AA=8;SR=951|977;SA=8|0;SB=1;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV 20 89750 . G T 0.157 PASS NS=361;DP=1896;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1882;AA=10;SR=971|911;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 89784 . C T 4.3 PASS NS=350;DP=1854;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1848;AA=3;SR=1005|843;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 89860 . C A 2.95 PASS NS=371;DP=2493;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2480;AA=9;SR=1216|1264;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 89871 . T G 3.36 PASS NS=364;DP=2415;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2403;AA=9;SR=1148|1255;SA=0|9;SB=0;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TV 20 90008 . C A 99.0 PASS NS=346;DP=1902;AC=69;AN=692;AF=0.099711;RA=1671;AA=228;SR=919|752;SA=125|103;SB=0.54825;AB=0.48;ABR=168;ABA=182;RUN=4;SNP;TV 20 90187 . A C 0.0959 PASS NS=370;DP=2329;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2306;AA=14;SR=1020|1286;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 90407 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2398;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2378;AA=11;SR=1117|1261;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.35714;ABR=5;ABA=9;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 90509 . G A 0.677 PASS NS=370;DP=2346;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=2;SR=1216|1115;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 90541 . C T 99.0 PASS NS=371;DP=2334;AC=4;AN=742;AF=0.0053908;RA=2300;AA=23;SR=1229|1071;SA=11|12;SB=0.47826;AB=0.41667;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 90542 . G A 0.692 PASS NS=371;DP=2337;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2318;AA=16;SR=1245|1073;SA=2|14;SB=0.125;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG 20 90570 . G A 23.7 PASS NS=370;DP=2343;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=6;SR=1221|1110;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=3;SNP;TS 20 90628 . G T 6.52 PASS NS=371;DP=2396;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2379;AA=6;SR=1154|1225;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 90688 . T C 0.367 PASS NS=370;DP=2304;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2272;AA=15;SR=946|1326;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 90752 . A C 0.122 PASS NS=370;DP=2411;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2399;AA=6;SR=1210|1189;SA=6|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 90795 . C T 0.18 PASS NS=368;DP=2454;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2443;AA=4;SR=1318|1125;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 90814 . T C 43.3 PASS NS=368;DP=2403;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2388;AA=10;SR=1294|1094;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.6;ABR=12;ABA=8;RUN=1;SNP;TS 20 90826 . T A 0.0721 PASS NS=367;DP=2295;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2287;AA=5;SR=1231|1056;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=4;SNP;TV 20 90984 . A G 99.0 PASS NS=361;DP=2035;AC=150;AN=722;AF=0.20776;RA=1619;AA=410;SR=766|853;SA=181|229;SB=0.44146;AB=0.5;ABR=331;ABA=330;RUN=1;SNP;TS 20 91053 . G A 1.89 PASS NS=361;DP=2062;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2051;AA=4;SR=1080|971;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 91072 . G A 9.59 PASS NS=361;DP=2180;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2166;AA=8;SR=1078|1088;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 91088 . C T 99.0 PASS NS=363;DP=2177;AC=616;AN=726;AF=0.84848;RA=386;AA=1782;SR=187|199;SA=833|949;SB=0.46745;AB=0.49684;ABR=236;ABA=239;RUN=1;SNP;TS 20 91217 . T C 0.0587 PASS NS=369;DP=2369;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2361;AA=5;SR=1348|1013;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 91227 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2355;AC=25;AN=738;AF=0.033875;RA=2274;AA=74;SR=1302|972;SA=44|30;SB=0.59459;AB=0.46018;ABR=52;ABA=61;RUN=3;SNP;TS 20 91346 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2207;AC=150;AN=738;AF=0.20325;RA=1744;AA=456;SR=974|770;SA=250|206;SB=0.54825;AB=0.49656;ABR=361;ABA=363;RUN=2;SNP;TS 20 91474 . C A 0.361 PASS NS=369;DP=2458;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2449;AA=4;SR=1260|1189;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV 20 91497 . A G 0.291 PASS NS=370;DP=2513;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2504;AA=3;SR=1280|1224;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 91508 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2483;AC=621;AN=738;AF=0.84146;RA=424;AA=2039;SR=222|202;SA=1036|1003;SB=0.50809;AB=0.52604;ABR=303;ABA=270;RUN=1;SNP;TS 20 91707 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2273;AC=112;AN=738;AF=0.15176;RA=1930;AA=291;SR=948|982;SA=137|154;SB=0.47079;AB=0.53738;ABR=230;ABA=197;RUN=1;SNP;TS 20 91716 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2309;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2285;AA=18;SR=1117|1168;SA=7|11;SB=0.38889;AB=0.60465;ABR=26;ABA=17;RUN=2;SNP;TS 20 91718 . C T 61.6 PASS NS=368;DP=2338;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2322;AA=10;SR=1129|1193;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=2;SNP;TS 20 91778 . T A 2.05 PASS NS=366;DP=2459;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2444;AA=7;SR=1123|1321;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 91863 . A G 1.48 PASS NS=364;DP=2501;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2488;AA=4;SR=1261|1227;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TS 20 91920 . C A 1.42 PASS NS=368;DP=2547;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=6;SR=1225|1305;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 91937 . T A 15.2 PASS NS=368;DP=2523;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2492;AA=7;SR=1179|1313;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 91951 . G A 99.0 PASS NS=364;DP=2528;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2504;AA=12;SR=1185|1319;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.62069;ABR=18;ABA=11;RUN=1;SNP;TS 20 91971 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=2448;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2412;AA=26;SR=1136|1276;SA=9|17;SB=0.34615;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS 20 91987 . A C 2.61 PASS NS=366;DP=2461;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2447;AA=8;SR=1115|1332;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 91991 . G C 99.0 PASS NS=367;DP=2461;AC=12;AN=734;AF=0.016349;RA=2421;AA=30;SR=1104|1317;SA=12|18;SB=0.4;AB=0.525;ABR=21;ABA=19;RUN=2;SNP;TV 20 92037 . G T 18.0 PASS NS=369;DP=2484;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2465;AA=11;SR=1128|1337;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 92080 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2461;AC=10;AN=726;AF=0.013774;RA=2425;AA=32;SR=1182|1243;SA=15|17;SB=0.46875;AB=0.46341;ABR=19;ABA=22;RUN=1;SNP;TS 20 92091 . C A 3.93 PASS NS=363;DP=2512;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2502;AA=3;SR=1238|1264;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 92171 . T G 0.0778 PASS NS=361;DP=2344;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2332;AA=6;SR=1179|1153;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 92207 . T C 1.8 PASS NS=360;DP=2413;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2409;AA=2;SR=1146|1263;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 92366 . A G 99.0 PASS NS=359;DP=2411;AC=131;AN=718;AF=0.18245;RA=1937;AA=464;SR=930|1007;SA=219|245;SB=0.47198;AB=0.50995;ABR=282;ABA=269;RUN=1;SNP;TS 20 92383 . T C 0.775 PASS NS=364;DP=2395;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2377;AA=6;SR=1138|1239;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 92421 . A C 8.1 PASS NS=366;DP=2327;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2315;AA=6;SR=1224|1091;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 92441 . T C 2.12 PASS NS=364;DP=2420;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2406;AA=6;SR=1351|1055;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 92492 . G A 0.0468 PASS NS=366;DP=2377;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2366;AA=2;SR=1174|1192;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 92527 . A G 99.0 PASS NS=371;DP=2105;AC=644;AN=742;AF=0.86792;RA=317;AA=1752;SR=144|173;SA=822|930;SB=0.46918;AB=0.51415;ABR=218;ABA=198;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 92712 . T C 0.198 PASS NS=361;DP=2260;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2241;AA=10;SR=1190|1051;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 92774 . T C 0.403 PASS NS=364;DP=2560;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2548;AA=3;SR=1242|1306;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 92816 . T C 0.817 PASS NS=369;DP=2431;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=12;SR=1073|1334;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 92865 . T C 10.2 PASS NS=346;DP=2171;AC=2;AN=692;AF=0.0028902;RA=2155;AA=5;SR=1041|1114;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 92891 . A G 99.0 PASS NS=353;DP=2023;AC=99;AN=706;AF=0.14023;RA=1744;AA=258;SR=877|867;SA=137|121;SB=0.53101;AB=0.47804;ABR=185;ABA=200;RUN=1;SNP;TS 20 92972 . G A 9.84 PASS NS=362;DP=2148;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2140;AA=6;SR=1068|1072;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 93066 . C T 0.0559 PASS NS=356;DP=2150;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2137;AA=3;SR=1048|1089;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 93114 . C T 0.601 PASS NS=356;DP=2138;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2132;AA=2;SR=970|1162;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 93169 . C T 99.0 PASS NS=352;DP=2227;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=2133;AA=88;SR=999|1134;SA=36|52;SB=0.40909;AB=0.44681;ABR=63;ABA=77;RUN=1;SNP;TS 20 93175 . C A 0.159 PASS NS=359;DP=2283;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2272;AA=5;SR=1057|1215;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 93327 . T C 99.0 PASS NS=352;DP=1862;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=1797;AA=60;SR=792|1005;SA=20|40;SB=0.33333;AB=0.53535;ABR=53;ABA=46;RUN=3;SNP;TS 20 93343 . T C 1.43 PASS NS=351;DP=1897;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1886;AA=3;SR=804|1082;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 93356 . C T 0.0835 PASS NS=365;DP=1919;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1910;AA=2;SR=804|1106;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.78571;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 93389 . A G 10.9 PASS NS=361;DP=1775;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=1758;AA=5;SR=744|1014;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 93406 . T C 99.0 PASS NS=350;DP=1595;AC=7;AN=700;AF=0.01;RA=1573;AA=18;SR=651|922;SA=10|8;SB=0.55556;AB=0.55;ABR=22;ABA=18;RUN=1;SNP;TS 20 93428 . T C 3.27 PASS NS=334;DP=1422;AC=1;AN=668;AF=0.001497;RA=1415;AA=3;SR=565|850;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 93440 . A G 99.0 PASS NS=327;DP=1360;AC=157;AN=654;AF=0.24006;RA=1041;AA=315;SR=395|646;SA=136|179;SB=0.43175;AB=0.50992;ABR=180;ABA=172;RUN=2;SNP;TS 20 93499 . T C 99.0 PASS NS=365;DP=1887;AC=82;AN=730;AF=0.11233;RA=1681;AA=203;SR=679|1002;SA=79|124;SB=0.38916;AB=0.48855;ABR=128;ABA=134;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 93684 . A G 60.8 PASS NS=182;DP=336;AC=34;AN=364;AF=0.093407;RA=256;AA=30;SR=174|82;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.34783;ABR=8;ABA=14;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 93704 . G C 64.2 PASS NS=230;DP=445;AC=12;AN=460;AF=0.026087;RA=428;AA=12;SR=245|183;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 93718 . T C 99.0 PASS NS=260;DP=565;AC=55;AN=520;AF=0.10577;RA=498;AA=64;SR=267|231;SA=37|27;SB=0.57812;AB=0.5;ABR=30;ABA=30;RUN=2;SNP;TS 20 93739 . A G 99.0 PASS NS=278;DP=706;AC=75;AN=556;AF=0.13489;RA=582;AA=91;SR=316|266;SA=55|36;SB=0.6044;AB=0.48235;ABR=41;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 93931 . G A 99.0 PASS NS=325;DP=1064;AC=167;AN=650;AF=0.25692;RA=811;AA=248;SR=366|445;SA=126|122;SB=0.50806;AB=0.55128;ABR=129;ABA=105;RUN=1;SNP;TS 20 94019 . C T 0.498 PASS NS=360;DP=1907;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1900;AA=5;SR=1175|725;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 94036 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1929;AC=25;AN=710;AF=0.035211;RA=1850;AA=68;SR=1138|712;SA=44|24;SB=0.64706;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS 20 94087 . T C 25.9 PASS NS=364;DP=1913;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1901;AA=7;SR=1020|881;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 94091 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=1926;AC=93;AN=726;AF=0.1281;RA=1686;AA=228;SR=919|767;SA=116|112;SB=0.50877;AB=0.4822;ABR=149;ABA=156;RUN=1;SNP;TS 20 94179 . G A 9.12 PASS NS=356;DP=1627;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1617;AA=3;SR=942|675;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 94256 . A C 0.101 PASS NS=355;DP=1594;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1565;AA=4;SR=725|840;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 94307 . C A 8.46 PASS NS=339;DP=1691;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1675;AA=4;SR=703|972;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 94528 . T G 99.0 PASS NS=349;DP=1836;AC=84;AN=698;AF=0.12034;RA=1656;AA=177;SR=898|758;SA=96|81;SB=0.54237;AB=0.52747;ABR=144;ABA=129;RUN=1;SNP;TV 20 94588 . G A 0.244 PASS NS=364;DP=2022;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2006;AA=7;SR=1153|853;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.80952;ABR=17;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 94592 . T A 99.0 PASS NS=365;DP=2021;AC=89;AN=730;AF=0.12192;RA=1806;AA=212;SR=1024|782;SA=123|89;SB=0.58019;AB=0.5216;ABR=169;ABA=155;RUN=3;SNP;TV 20 94624 . G T 99.0 PASS NS=361;DP=1991;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=1949;AA=39;SR=1051|898;SA=25|14;SB=0.64103;AB=0.5;ABR=17;ABA=17;RUN=2;SNP;TV 20 94704 . G A 99.0 PASS NS=361;DP=2028;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=2015;AA=8;SR=958|1057;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 94717 . T C 57.7 PASS NS=365;DP=1994;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1985;AA=6;SR=926|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 94760 . A G 99.0 PASS NS=356;DP=2012;AC=22;AN=712;AF=0.030899;RA=1957;AA=50;SR=987|970;SA=19|31;SB=0.38;AB=0.55046;ABR=60;ABA=48;RUN=2;SNP;TS 20 94794 . T C 0.713 PASS NS=365;DP=2100;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=2;SR=1072|1019;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 94952 . G T 99.0 PASS NS=360;DP=2103;AC=157;AN=720;AF=0.21806;RA=1678;AA=422;SR=854|824;SA=209|213;SB=0.49526;AB=0.49323;ABR=255;ABA=262;RUN=3;SNP;TV 20 94973 . T A 0.162 PASS NS=363;DP=2064;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1059|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 95052 . T C 54.2 PASS NS=361;DP=1889;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1877;AA=5;SR=937|940;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 95093 . T G 99.0 PASS NS=364;DP=1944;AC=95;AN=728;AF=0.13049;RA=1730;AA=212;SR=840|890;SA=99|113;SB=0.46698;AB=0.46619;ABR=131;ABA=150;RUN=1;SNP;TV 20 95104 . A G 4.49 PASS NS=362;DP=1930;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1921;AA=3;SR=930|991;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 95186 . T C 6.33 PASS NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1986;AA=3;SR=977|1009;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS 20 95249 . C G 1.12 PASS NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=955|968;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 95360 . C G 0.0671 PASS NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2088;AA=3;SR=1177|911;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 95601 . A G 10.6 PASS NS=368;DP=2205;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2172;AA=14;SR=1077|1095;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 95603 . T C 0.0469 PASS NS=347;DP=1778;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1758;AA=5;SR=858|900;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 95619 . C T 33.4 PASS NS=368;DP=2234;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2205;AA=8;SR=1105|1100;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS 20 95627 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2216;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2175;AA=22;SR=1082|1093;SA=10|12;SB=0.45455;AB=0.40541;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 95781 . A T 0.36 PASS NS=363;DP=2225;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2185;AA=10;SR=1083|1102;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 95836 . T C 5.74 PASS NS=365;DP=2341;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2320;AA=11;SR=1153|1167;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 95989 . C T 0.0518 PASS NS=364;DP=2264;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2235;AA=5;SR=1159|1076;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 96026 . C T 83.3 PASS NS=362;DP=2328;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2304;AA=10;SR=1145|1159;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=2;SNP;TS 20 96038 . G C 0.823 PASS NS=362;DP=2311;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2279;AA=19;SR=1095|1184;SA=9|10;SB=0.47368;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TV 20 96141 . T C 0.0737 PASS NS=367;DP=2161;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2126;AA=13;SR=1101|1025;SA=13|0;SB=1;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 96166 . C T 1.2 PASS NS=367;DP=2187;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2169;AA=7;SR=1101|1068;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 96213 . C A 0.0772 PASS NS=359;DP=2247;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2231;AA=8;SR=994|1237;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 96325 . C T 0.047 PASS NS=364;DP=2278;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2256;AA=8;SR=1018|1238;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS 20 96369 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2148;AC=9;AN=732;AF=0.012295;RA=2087;AA=37;SR=1003|1084;SA=14|23;SB=0.37838;AB=0.5;ABR=21;ABA=20;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 96421 . G C 1.04 PASS NS=363;DP=2132;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2103;AA=12;SR=943|1160;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 96497 . C G 16.9 PASS NS=362;DP=1926;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=1908;AA=6;SR=907|1001;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV 20 96579 . G A 24.7 PASS NS=359;DP=1704;AC=5;AN=718;AF=0.0069638;RA=1670;AA=17;SR=848|822;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS 20 96646 . G A 0.141 PASS NS=364;DP=1850;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1823;AA=6;SR=961|862;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS 20 96670 . C T 2.72 PASS NS=366;DP=1963;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1953;AA=4;SR=1050|903;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 96695 . C T 13.0 PASS NS=364;DP=1927;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1894;AA=13;SR=1024|870;SA=12|1;SB=0.92308;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS 20 96815 . A G 0.711 PASS NS=371;DP=2127;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2098;AA=18;SR=1051|1047;SA=1|17;SB=0.055556;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 96857 . T A 0.885 PASS NS=366;DP=2378;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2341;AA=12;SR=1217|1124;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 96872 . G T 0.0924 PASS NS=368;DP=2394;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2385;AA=5;SR=1289|1096;SA=0|5;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV 20 96891 . C T 4.45 PASS NS=365;DP=2401;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2387;AA=4;SR=1293|1094;SA=1|3;SB=0.25;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 96923 . C A 99.0 PASS NS=363;DP=2448;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=2358;AA=85;SR=1286|1072;SA=56|29;SB=0.65882;AB=0.45385;ABR=59;ABA=71;RUN=2;SNP;TV 20 96931 . A G 99.0 PASS NS=365;DP=2424;AC=256;AN=730;AF=0.35068;RA=1586;AA=831;SR=882|704;SA=463|368;SB=0.55716;AB=0.50916;ABR=389;ABA=373;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 97048 . G T 0.0453 PASS NS=367;DP=2268;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2250;AA=9;SR=1094|1156;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=2;SNP;TV 20 97122 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2087;AC=168;AN=732;AF=0.22951;RA=1606;AA=470;SR=818|788;SA=230|240;SB=0.48936;AB=0.49234;ABR=257;ABA=261;RUN=1;SNP;TS 20 97227 . A C 87.6 PASS NS=358;DP=1952;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1912;AA=35;SR=1012|900;SA=33|2;SB=0.94286;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=2;SNP;TV 20 97271 . A T 10.8 PASS NS=367;DP=2260;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2241;AA=3;SR=1067|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 97285 . T C 0.442 PASS NS=363;DP=2215;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2169;AA=24;SR=1010|1159;SA=6|18;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 97371 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2386;AC=16;AN=730;AF=0.021918;RA=2319;AA=54;SR=1350|969;SA=26|28;SB=0.48148;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS 20 97394 . A G 99.0 PASS NS=346;DP=2074;AC=185;AN=692;AF=0.26734;RA=1552;AA=509;SR=904|648;SA=280|229;SB=0.5501;AB=0.46933;ABR=176;ABA=199;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 97458 . A G 68.2 PASS NS=365;DP=2315;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=7;SR=1121|1183;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TS 20 97465 . G C 2.86 PASS NS=365;DP=2309;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2285;AA=9;SR=1111|1174;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 97526 . C G 0.0531 PASS NS=370;DP=2381;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2370;AA=2;SR=1223|1147;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV 20 97564 . T G 0.0531 PASS NS=369;DP=2445;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2425;AA=8;SR=1233|1192;SA=0|8;SB=0;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TV 20 97804 . G C 12.2 PASS NS=367;DP=2119;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2109;AA=4;SR=1004|1105;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TV 20 97915 . A T 0.991 PASS NS=359;DP=1872;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1857;AA=5;SR=936|921;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 98008 . T C 99.0 PASS NS=335;DP=1359;AC=19;AN=670;AF=0.028358;RA=1305;AA=48;SR=640|665;SA=24|24;SB=0.5;AB=0.48571;ABR=34;ABA=36;RUN=3;SNP;TS 20 98061 . G T 0.0607 PASS NS=331;DP=1432;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1423;AA=5;SR=794|629;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.9;ABR=18;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 98439 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2319;AC=29;AN=738;AF=0.039295;RA=2221;AA=84;SR=1227|994;SA=55|29;SB=0.65476;AB=0.56627;ABR=94;ABA=71;RUN=1;SNP;TS 20 98447 . T G 99.0 PASS NS=371;DP=2416;AC=29;AN=742;AF=0.039084;RA=2311;AA=89;SR=1239|1072;SA=49|40;SB=0.55056;AB=0.52941;ABR=81;ABA=72;RUN=2;SNP;TV 20 98491 . C T 99.0 PASS NS=370;DP=2385;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2364;AA=8;SR=1167|1197;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.55556;ABR=10;ABA=8;RUN=1;SNP;TS 20 98688 . T C 99.0 PASS NS=362;DP=2160;AC=28;AN=724;AF=0.038674;RA=2090;AA=64;SR=1092|998;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.54839;ABR=68;ABA=55;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 98741 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2469;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=2377;AA=81;SR=1083|1294;SA=40|41;SB=0.49383;AB=0.51538;ABR=67;ABA=63;RUN=2;SNP;TS;CpG 20 98792 . G C 99.0 PASS NS=371;DP=2401;AC=32;AN=742;AF=0.043127;RA=2291;AA=92;SR=1124|1167;SA=41|51;SB=0.44565;AB=0.52632;ABR=80;ABA=70;RUN=1;SNP;TV 20 98796 . G T 0.637 PASS NS=369;DP=2424;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=13;SR=1185|1222;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TV 20 98905 . T C 0.0446 PASS NS=368;DP=2477;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2462;AA=9;SR=1319|1143;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS 20 98908 . A T 6.25 PASS NS=370;DP=2483;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2471;AA=7;SR=1328|1143;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 98930 . G A 99.0 PASS NS=370;DP=2431;AC=159;AN=740;AF=0.21486;RA=1920;AA=502;SR=1041|879;SA=269|233;SB=0.53586;AB=0.54773;ABR=350;ABA=287;RUN=1;SNP;TS 20 98957 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2423;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2404;AA=13;SR=1270|1134;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=1;SNP;TS 20 98991 . T C 4.43 PASS NS=370;DP=2386;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2377;AA=3;SR=1217|1160;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 99132 . G T 0.374 PASS NS=371;DP=2502;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2492;AA=6;SR=1292|1200;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 99200 . C G 47.2 PASS NS=368;DP=2476;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2464;AA=5;SR=1140|1324;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TV 20 99228 . C T 48.9 PASS NS=368;DP=2404;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2382;AA=12;SR=1087|1295;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=4;SNP;TS 20 99318 . G T 0.264 PASS NS=368;DP=2147;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2135;AA=8;SR=914|1221;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 99500 . C A 99.0 PASS NS=366;DP=2130;AC=35;AN=732;AF=0.047814;RA=2048;AA=75;SR=792|1256;SA=26|49;SB=0.34667;AB=0.512;ABR=64;ABA=60;RUN=1;SNP;TV 20 99554 . C A 5.17 PASS NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2095;AA=4;SR=846|1249;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV 20 99563 . T C 0.153 PASS NS=365;DP=2130;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2126;AA=3;SR=906|1220;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG 20 99612 . A G 1.43 PASS NS=370;DP=2190;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2185;AA=2;SR=1213|972;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS 20 99627 . G T 1.72 PASS NS=369;DP=2210;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2203;AA=6;SR=1239|964;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV 20 99632 . T C 2.53 PASS NS=369;DP=2206;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2197;AA=3;SR=1231|966;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 99653 . C A 0.0845 PASS NS=366;DP=2296;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2287;AA=5;SR=1195|1092;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=4;SNP;TV 20 99667 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2225;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2197;AA=21;SR=1101|1096;SA=9|12;SB=0.42857;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS 20 99704 . T C 0.0612 PASS NS=370;DP=2145;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2141;AA=2;SR=997|1144;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS 20 99734 . C T 0.0662 PASS NS=366;DP=2113;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2101;AA=6;SR=956|1145;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS 20 99801 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=1968;AC=88;AN=734;AF=0.11989;RA=1750;AA=214;SR=977|773;SA=103|111;SB=0.48131;AB=0.46021;ABR=133;ABA=154;RUN=1;SNP;TS 20 99919 . A T 4.0 PASS NS=359;DP=2099;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2092;AA=2;SR=1038|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV