Mercurial > repos > devteam > vcf_annotate
comparison test-data/test.small.vcf @ 0:3eca7b2537aa draft default tip
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| 9 ##INFO=<ID=AB,Number=1,Type=Float,Description="Allele balance at heterozygous sites: a number between 0 and 1 representing the ratio of reads showing the reference allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous"> | |
| 10 ##INFO=<ID=DEL,Number=1,Type=Integer,Description="Length of deletion allele, if present"> | |
| 11 ##INFO=<ID=CpG,Number=0,Type=Flag,Description="CpG site (either CpG, TpG or CpA)"> | |
| 12 ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total read depth at the locus"> | |
| 13 ##INFO=<ID=TV,Number=0,Type=Flag,Description="transversion SNP"> | |
| 14 ##INFO=<ID=TS,Number=0,Type=Flag,Description="transition SNP"> | |
| 15 ##INFO=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations"> | |
| 16 ##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data"> | |
| 17 ##INFO=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations"> | |
| 18 ##INFO=<ID=ABA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the alternate allele"> | |
| 19 ##INFO=<ID=AC,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alternate alleles in called genotypes"> | |
| 20 ##INFO=<ID=REPEAT,Number=1,Type=String,Description="Description of the local repeat structures flanking the current position"> | |
| 21 ##INFO=<ID=AF,Number=1,Type=Float,Description="Estimated allele frequency in the range (0,1]"> | |
| 22 ##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes"> | |
| 23 ##INFO=<ID=ABR,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele balance count: the number of sequence reads from apparent heterozygotes supporting the reference allele"> | |
| 24 ##INFO=<ID=RUN,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length: the number of consecutive nucleotides in the reference genome matching the alternate allele prior to the current position"> | |
| 25 ##INFO=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]"> | |
| 26 ##INFO=<ID=INS,Number=1,Type=Integer,Description="Length of insertion allele, if present"> | |
| 27 ##INFO=<ID=MNP,Number=0,Type=Integer,Description="Length of MNP allele, if present"> | |
| 28 ##INFO=<ID=SNP,Number=0,Type=Flag,Description="SNP allele"> | |
| 29 ##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand bias for the alternate allele: a number between 0 and 1 representing the ratio of forward strand sequence reads showing the alternate allele to all reads, considering only reads from individuals called as heterozygous"> | |
| 30 ##INFO=<ID=SA,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alternate observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]"> | |
| 31 ##FORMAT=<ID=AA,Number=1,Type=Integer,Description="Alternate allele observations"> | |
| 32 ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> | |
| 33 ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality"> | |
| 34 ##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations by strand, delimited by |: [forward]|[reverse]"> | |
| 35 ##FORMAT=<ID=RA,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations"> | |
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| 40 20 60479 . C T 75.2 PASS NS=368;DP=2111;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2096;AA=9;SR=1153|943;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=2;SNP;TS | |
| 41 20 60571 . C A 99.0 PASS NS=366;DP=2338;AC=6;AN=732;AF=0.0081967;RA=2293;AA=30;SR=1123|1170;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.51515;ABR=17;ABA=16;RUN=1;SNP;TV | |
| 42 20 60828 . T G 8.94 PASS NS=361;DP=2341;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2267;AA=30;SR=1101|1166;SA=15|15;SB=0.5;AB=0.16667;ABR=1;ABA=4;RUN=3;SNP;TV | |
| 43 20 61098 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=1780;AC=140;AN=732;AF=0.19126;RA=1457;AA=317;SR=600|857;SA=132|185;SB=0.4164;AB=0.56587;ABR=262;ABA=198;RUN=2;SNP;TS | |
| 44 20 61270 . A C 1.01 PASS NS=220;DP=449;AC=18;AN=440;AF=0.040909;RA=423;AA=23;SR=165|258;SA=6|17;SB=0.26087;AB=0.61111;ABR=11;ABA=7;RUN=1;SNP;TV | |
| 45 20 61388 . T C 46.6 PASS NS=314;DP=1036;AC=2;AN=628;AF=0.0031847;RA=1025;AA=6;SR=709|316;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 46 20 61409 . A G 36.0 PASS NS=340;DP=1212;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1207;AA=4;SR=876|331;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 47 20 61517 . C T 13.8 PASS NS=363;DP=2032;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2019;AA=7;SR=1200|819;SA=7|0;SB=1;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TS | |
| 48 20 61535 . A G 0.0666 PASS NS=362;DP=2048;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2037;AA=4;SR=1150|887;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 49 20 61586 . C A 0.0941 PASS NS=362;DP=1953;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1941;AA=6;SR=1062|879;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 50 20 61651 . C A 99.0 PASS NS=369;DP=2217;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2190;AA=22;SR=1230|960;SA=12|10;SB=0.54545;AB=0.41176;ABR=14;ABA=20;RUN=4;SNP;TV | |
| 51 20 61724 . A C 99.0 PASS NS=369;DP=2442;AC=6;AN=738;AF=0.0081301;RA=2409;AA=29;SR=1205|1204;SA=16|13;SB=0.55172;AB=0.48889;ABR=22;ABA=23;RUN=2;SNP;TV | |
| 52 20 61795 . G T 99.0 PASS NS=368;DP=2464;AC=324;AN=736;AF=0.44022;RA=1426;AA=1032;SR=740|686;SA=519|513;SB=0.50291;AB=0.49956;ABR=568;ABA=565;RUN=1;SNP;TV | |
| 53 20 61807 . G T 16.2 PASS NS=369;DP=2523;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2506;AA=7;SR=1311|1195;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 54 20 61848 . A G 0.0723 PASS NS=370;DP=2478;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2458;AA=9;SR=1313|1145;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 55 20 61909 . C G 0.224 PASS NS=366;DP=2253;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2240;AA=4;SR=1131|1109;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 56 20 61986 . G A 0.054 PASS NS=364;DP=2106;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2072;AA=26;SR=906|1166;SA=0|26;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 57 20 62100 . T C 82.3 PASS NS=363;DP=2082;AC=3;AN=726;AF=0.0041322;RA=2069;AA=8;SR=1052|1017;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TS | |
| 58 20 62255 . T C 99.0 PASS NS=361;DP=2204;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2195;AA=6;SR=1247|948;SA=6|0;SB=1;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 59 20 62348 . A G 99.0 PASS NS=350;DP=1861;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1845;AA=10;SR=949|896;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.23077;ABR=3;ABA=10;RUN=1;SNP;TS | |
| 60 20 62420 . A G 46.8 PASS NS=364;DP=1821;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1812;AA=3;SR=933|879;SA=0|3;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 61 20 62471 . G A 43.6 PASS NS=350;DP=1782;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1772;AA=7;SR=891|881;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69231;ABR=9;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 62 20 62530 . A G 1.17 PASS NS=364;DP=2137;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2129;AA=4;SR=1034|1095;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 63 20 62545 . C G 99.0 PASS NS=348;DP=2043;AC=5;AN=696;AF=0.0071839;RA=2018;AA=17;SR=907|1111;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.44828;ABR=13;ABA=16;RUN=1;SNP;TV | |
| 64 20 62553 . T C 0.193 PASS NS=345;DP=2009;AC=2;AN=690;AF=0.0028986;RA=1986;AA=5;SR=869|1117;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 65 20 62673 . G T 0.556 PASS NS=359;DP=2225;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2218;AA=5;SR=1217|1001;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 66 20 62727 . C T 8.51 PASS NS=347;DP=1801;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1794;AA=2;SR=906|888;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 67 20 62731 . C A 99.0 PASS NS=345;DP=1727;AC=22;AN=690;AF=0.031884;RA=1666;AA=55;SR=840|826;SA=26|29;SB=0.47273;AB=0.53061;ABR=52;ABA=46;RUN=2;SNP;TV | |
| 68 20 62739 . T C 7.0 PASS NS=342;DP=1646;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1623;AA=7;SR=812|811;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 69 20 62770 . G C 3.33 PASS NS=324;DP=1429;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1422;AA=3;SR=655|767;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 70 20 62783 . A G 17.3 PASS NS=328;DP=1471;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1455;AA=8;SR=665|790;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 71 20 62881 . G T 0.253 PASS NS=345;DP=1772;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1761;AA=7;SR=910|851;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 72 20 62946 . T A 83.9 PASS NS=349;DP=1880;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1868;AA=5;SR=787|1081;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=2;SNP;TV | |
| 73 20 62997 . A T 5.74 PASS NS=364;DP=2195;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2190;AA=2;SR=1042|1148;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 74 20 63054 . A G 48.5 PASS NS=364;DP=2097;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2082;AA=8;SR=1090|992;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=2;SNP;TS | |
| 75 20 63055 . A G 0.234 PASS NS=362;DP=2088;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2078;AA=4;SR=1096|982;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 76 20 63063 . T C 0.0841 PASS NS=363;DP=2065;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1083|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 77 20 63141 . T C 2.61 PASS NS=360;DP=1900;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1891;AA=2;SR=1041|850;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 78 20 63197 . T A 0.305 PASS NS=364;DP=2047;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2037;AA=5;SR=1067|970;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 79 20 63231 . T G 99.0 PASS NS=360;DP=2025;AC=76;AN=720;AF=0.10556;RA=1828;AA=186;SR=914|914;SA=102|84;SB=0.54839;AB=0.52581;ABR=163;ABA=145;RUN=1;SNP;TV | |
| 80 20 63244 . A C 99.0 PASS NS=364;DP=1991;AC=84;AN=728;AF=0.11538;RA=1701;AA=284;SR=871|830;SA=132|152;SB=0.46479;AB=0.46951;ABR=154;ABA=174;RUN=2;SNP;TV | |
| 81 20 63245 . C A 4.67 PASS NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1990;AA=6;SR=1010|980;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 82 20 63351 . A G 30.7 PASS NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2354;AA=5;SR=1414|940;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 83 20 63360 . C T 38.4 PASS NS=367;DP=2348;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2334;AA=4;SR=1363|971;SA=0|4;SB=0;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 84 20 63426 . G T 99.0 PASS NS=369;DP=2178;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2146;AA=17;SR=1263|883;SA=8|9;SB=0.47059;AB=0.69231;ABR=27;ABA=12;RUN=1;SNP;TV | |
| 85 20 63452 . C G 99.0 PASS NS=369;DP=2242;AC=22;AN=738;AF=0.02981;RA=2169;AA=68;SR=1220|949;SA=40|28;SB=0.58824;AB=0.47321;ABR=53;ABA=59;RUN=1;SNP;TV | |
| 86 20 63466 . A G 0.305 PASS NS=369;DP=2343;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2334;AA=3;SR=1290|1044;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 87 20 63521 . G A 33.5 PASS NS=370;DP=2387;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2376;AA=3;SR=1217|1159;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 88 20 63680 . A G 0.841 PASS NS=371;DP=2758;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2741;AA=5;SR=1422|1319;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 89 20 63733 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2571;AC=58;AN=732;AF=0.079235;RA=2363;AA=200;SR=1311|1052;SA=101|99;SB=0.505;AB=0.50291;ABR=173;ABA=171;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 90 20 63746 . C T 0.0651 PASS NS=369;DP=2564;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2552;AA=3;SR=1391|1161;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 91 20 63799 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2322;AC=331;AN=734;AF=0.45095;RA=1274;AA=1026;SR=610|664;SA=489|537;SB=0.47661;AB=0.53157;ABR=564;ABA=494;RUN=3;SNP;TS | |
| 92 20 63808 . G C 99.0 PASS NS=368;DP=2352;AC=61;AN=736;AF=0.08288;RA=2168;AA=171;SR=1043|1125;SA=80|91;SB=0.46784;AB=0.56869;ABR=178;ABA=134;RUN=1;SNP;TV | |
| 93 20 63967 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2363;AC=21;AN=740;AF=0.028378;RA=2276;AA=68;SR=911|1365;SA=26|42;SB=0.38235;AB=0.48837;ABR=63;ABA=66;RUN=1;SNP;TS | |
| 94 20 63983 . C T 0.569 PASS NS=371;DP=2349;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2334;AA=3;SR=892|1442;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 95 20 64016 . G A 32.3 PASS NS=370;DP=2259;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2231;AA=15;SR=854|1377;SA=1|14;SB=0.066667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 96 20 64062 . G A 62.0 PASS NS=370;DP=2274;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2264;AA=6;SR=953|1311;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=3;SNP;TS | |
| 97 20 64150 . C A 99.0 PASS NS=368;DP=2268;AC=38;AN=736;AF=0.05163;RA=2160;AA=103;SR=881|1279;SA=41|62;SB=0.39806;AB=0.545;ABR=109;ABA=90;RUN=1;SNP;TV | |
| 98 20 64175 . A G 97.6 PASS NS=369;DP=2213;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2192;AA=10;SR=838|1354;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS | |
| 99 20 64186 . C G 99.0 PASS NS=369;DP=2166;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2111;AA=20;SR=858|1253;SA=9|11;SB=0.45;AB=0.5;ABR=12;ABA=12;RUN=1;SNP;TV | |
| 100 20 64539 . A T 0.0711 PASS NS=352;DP=1674;AC=1;AN=704;AF=0.0014205;RA=1667;AA=4;SR=856|811;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV | |
| 101 20 64560 . A G 0.0799 PASS NS=358;DP=1831;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1824;AA=4;SR=1057|767;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 102 20 64568 . A C 1.98 PASS NS=355;DP=1856;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1842;AA=7;SR=1124|718;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 103 20 64587 . A G 1.36 PASS NS=357;DP=1971;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1963;AA=3;SR=1234|729;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 104 20 64597 . T C 0.152 PASS NS=359;DP=1981;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1974;AA=3;SR=1238|736;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 105 20 64618 . G A 0.794 PASS NS=361;DP=2018;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2011;AA=3;SR=1263|748;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS | |
| 106 20 64624 . T C 5.08 PASS NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1994;AA=3;SR=1238|756;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 107 20 64625 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1995;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1980;AA=7;SR=1229|751;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 108 20 64647 . T C 0.188 PASS NS=362;DP=1911;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1899;AA=5;SR=1157|742;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 109 20 64656 . C T 2.15 PASS NS=368;DP=1875;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1866;AA=3;SR=1113|753;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 110 20 64672 . T C 48.3 PASS NS=365;DP=1877;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1869;AA=5;SR=1097|772;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 111 20 64771 . A G 0.563 PASS NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2017;AA=2;SR=1315|702;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 112 20 64898 . G A 49.7 PASS NS=371;DP=2342;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2329;AA=7;SR=1249|1080;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 113 20 64913 . G T 0.846 PASS NS=370;DP=2344;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2333;AA=5;SR=1234|1099;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 114 20 65122 . T C 1.23 PASS NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2265;AA=3;SR=976|1289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 115 20 65173 . C G 12.2 PASS NS=370;DP=2118;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2104;AA=4;SR=947|1157;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 116 20 65240 . G A 89.4 PASS NS=364;DP=2106;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2087;AA=8;SR=941|1146;SA=0|8;SB=0;AB=0.25;ABR=2;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 117 20 65241 . T C 0.371 PASS NS=364;DP=2101;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2087;AA=8;SR=934|1153;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 118 20 65288 . G T 99.0 PASS NS=364;DP=2003;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1924;AA=76;SR=915|1009;SA=29|47;SB=0.38158;AB=0.4963;ABR=67;ABA=68;RUN=1;SNP;TV | |
| 119 20 65317 . A C 0.0806 PASS NS=365;DP=1967;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1957;AA=4;SR=954|1003;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 120 20 65335 . T G 99.0 PASS NS=363;DP=1773;AC=12;AN=726;AF=0.016529;RA=1744;AA=22;SR=831|913;SA=11|11;SB=0.5;AB=0.46875;ABR=15;ABA=17;RUN=1;SNP;TV | |
| 121 20 65338 . A T 0.813 PASS NS=362;DP=1726;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1715;AA=3;SR=799|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 122 20 65562 . A G 6.8 PASS NS=325;DP=1375;AC=2;AN=650;AF=0.0030769;RA=1343;AA=4;SR=759|584;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 123 20 65578 . T C 3.24 PASS NS=327;DP=1379;AC=1;AN=654;AF=0.0015291;RA=1375;AA=3;SR=790|585;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 124 20 65632 . C T 40.9 PASS NS=366;DP=1714;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1703;AA=5;SR=918|785;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 125 20 65850 . G A 0.111 PASS NS=307;DP=1146;AC=1;AN=614;AF=0.0016287;RA=1128;AA=3;SR=696|432;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 126 20 65900 . G A 99.0 PASS NS=325;DP=1412;AC=530;AN=650;AF=0.81538;RA=271;AA=1129;SR=145|126;SA=639|490;SB=0.56599;AB=0.47594;ABR=178;ABA=193;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 127 20 65986 . G A 8.36 PASS NS=370;DP=2269;AC=3;AN=740;AF=0.0040541;RA=2255;AA=6;SR=1197|1058;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 128 20 66029 . T C 0.101 PASS NS=339;DP=1544;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1526;AA=7;SR=748|778;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 129 20 66060 . C T 6.42 PASS NS=324;DP=1304;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1297;AA=3;SR=613|684;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 130 20 66248 . C T 12.0 PASS NS=288;DP=1080;AC=1;AN=576;AF=0.0017361;RA=1074;AA=2;SR=440|634;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 131 20 66370 . G A 99.0 PASS NS=262;DP=824;AC=404;AN=524;AF=0.77099;RA=185;AA=629;SR=79|106;SA=267|362;SB=0.42448;AB=0.55801;ABR=101;ABA=79;RUN=1;SNP;TS | |
| 132 20 66388 . C T 0.809 PASS NS=269;DP=809;AC=1;AN=538;AF=0.0018587;RA=798;AA=3;SR=351|447;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 133 20 66620 . C T 2.19 PASS NS=338;DP=1326;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1319;AA=3;SR=634|685;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=4;SNP;TS | |
| 134 20 66705 . C T 4.94 PASS NS=292;DP=835;AC=8;AN=584;AF=0.013699;RA=819;AA=10;SR=483|336;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.5;ABR=6;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 135 20 66890 . G T 6.54 PASS NS=313;DP=1102;AC=1;AN=626;AF=0.0015974;RA=1097;AA=4;SR=670|427;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 136 20 67080 . A G 0.371 PASS NS=355;DP=1745;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1732;AA=4;SR=907|825;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 137 20 67421 . A C 0.0555 PASS NS=363;DP=1999;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1990;AA=6;SR=945|1045;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 138 20 67461 . A G 99.0 PASS NS=357;DP=1894;AC=4;AN=714;AF=0.0056022;RA=1872;AA=14;SR=841|1031;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 139 20 67563 . A G 3.64 PASS NS=360;DP=1912;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1904;AA=4;SR=1033|871;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 140 20 67572 . A T 0.0602 PASS NS=363;DP=1887;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1871;AA=6;SR=1028|843;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=2;SNP;TV | |
| 141 20 67573 . C T 4.67 PASS NS=364;DP=1888;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1878;AA=6;SR=1028|850;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 142 20 67641 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=1910;AC=23;AN=728;AF=0.031593;RA=1837;AA=67;SR=897|940;SA=35|32;SB=0.52239;AB=0.52679;ABR=59;ABA=53;RUN=1;SNP;TS | |
| 143 20 67644 . T C 40.4 PASS NS=365;DP=1899;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=1887;AA=9;SR=933|954;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 144 20 67646 . G A 3.98 PASS NS=365;DP=1897;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1877;AA=6;SR=923|954;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 145 20 67752 . T A 0.292 PASS NS=367;DP=2181;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2163;AA=6;SR=1201|962;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.82353;ABR=14;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 146 20 67760 . C T 67.6 PASS NS=367;DP=2169;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2152;AA=5;SR=1181|971;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 147 20 67765 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2200;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2178;AA=11;SR=1201|977;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 148 20 67831 . C T 0.781 PASS NS=371;DP=2294;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2281;AA=5;SR=1237|1044;SA=2|3;SB=0.4;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=4;SNP;TS | |
| 149 20 67949 . G T 10.4 PASS NS=366;DP=2315;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2282;AA=12;SR=1321|961;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 150 20 67976 . T A 0.679 PASS NS=369;DP=2408;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2397;AA=6;SR=1299|1098;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 151 20 68015 . C T 0.113 PASS NS=369;DP=2466;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2453;AA=5;SR=1313|1140;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 152 20 68055 . A G 0.102 PASS NS=370;DP=2540;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2522;AA=5;SR=1296|1226;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 153 20 68075 . T C 0.0657 PASS NS=370;DP=2582;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2562;AA=8;SR=1291|1271;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 154 20 68123 . C A 0.0592 PASS NS=369;DP=2705;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2685;AA=13;SR=1300|1385;SA=11|2;SB=0.84615;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 155 20 68182 . A T 99.0 PASS NS=368;DP=2675;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2653;AA=10;SR=1458|1195;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.2;ABR=2;ABA=8;RUN=2;SNP;TV | |
| 156 20 68190 . T C 0.109 PASS NS=368;DP=2678;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2661;AA=5;SR=1481|1180;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 157 20 68205 . A G 31.9 PASS NS=369;DP=2686;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2672;AA=6;SR=1492|1180;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 158 20 68264 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2558;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=2173;AA=376;SR=1055|1118;SA=202|174;SB=0.53723;AB=0.48951;ABR=280;ABA=292;RUN=1;SNP;TS | |
| 159 20 68474 . A G 31.0 PASS NS=370;DP=2532;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2507;AA=14;SR=1171|1336;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 160 20 68505 . A G 0.483 PASS NS=369;DP=2490;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2477;AA=3;SR=1140|1337;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 161 20 68535 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2573;AC=12;AN=738;AF=0.01626;RA=2503;AA=58;SR=1186|1317;SA=32|26;SB=0.55172;AB=0.50893;ABR=57;ABA=55;RUN=1;SNP;TS | |
| 162 20 68618 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2561;AC=21;AN=736;AF=0.028533;RA=2451;AA=93;SR=1224|1227;SA=48|45;SB=0.51613;AB=0.45517;ABR=66;ABA=78;RUN=1;SNP;TS | |
| 163 20 68657 . C A 3.85 PASS NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2585;AA=9;SR=1214|1371;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 164 20 68660 . C A 99.0 PASS NS=370;DP=2608;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2591;AA=14;SR=1221|1370;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.44;ABR=11;ABA=14;RUN=2;SNP;TV | |
| 165 20 68664 . A C 0.0666 PASS NS=370;DP=2602;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2571;AA=12;SR=1212|1359;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 166 20 68667 . T G 99.0 PASS NS=370;DP=2607;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2584;AA=15;SR=1201|1383;SA=5|10;SB=0.33333;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=2;SNP;TV | |
| 167 20 68749 . T C 99.0 PASS NS=368;DP=2323;AC=426;AN=736;AF=0.5788;RA=983;AA=1334;SR=457|526;SA=640|694;SB=0.47976;AB=0.47215;ABR=568;ABA=632;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 168 20 68799 . T C 1.55 PASS NS=367;DP=2269;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2213;AA=15;SR=1064|1149;SA=14|1;SB=0.93333;AB=0.66667;ABR=8;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 169 20 68815 . C T 0.275 PASS NS=367;DP=2245;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2226;AA=3;SR=1051|1175;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 170 20 68826 . A T 2.17 PASS NS=370;DP=2244;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2223;AA=5;SR=1043|1180;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 171 20 68926 . T C 0.43 PASS NS=369;DP=2139;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2120;AA=4;SR=904|1216;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.61538;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 172 20 68975 . C G 1.62 PASS NS=367;DP=2121;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2105;AA=4;SR=767|1338;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 173 20 68987 . G T 2.55 PASS NS=369;DP=2074;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2059;AA=8;SR=732|1327;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 174 20 69049 . T A 0.201 PASS NS=361;DP=2045;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2038;AA=5;SR=936|1102;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 175 20 69066 . C G 14.2 PASS NS=360;DP=2078;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2069;AA=8;SR=1074|995;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TV | |
| 176 20 69094 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=2092;AC=318;AN=724;AF=0.43923;RA=1227;AA=857;SR=691|536;SA=451|406;SB=0.52625;AB=0.49681;ABR=389;ABA=392;RUN=1;SNP;TS | |
| 177 20 69130 . C A 11.5 PASS NS=365;DP=2014;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2007;AA=3;SR=1082|925;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 178 20 69145 . A G 0.195 PASS NS=367;DP=1999;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1991;AA=5;SR=1033|958;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 179 20 69262 . A T 1.7 PASS NS=365;DP=2053;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2047;AA=3;SR=1145|902;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 180 20 69305 . T C 0.123 PASS NS=367;DP=1964;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1956;AA=3;SR=1101|855;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 181 20 69355 . C T 4.52 PASS NS=367;DP=2009;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2000;AA=3;SR=970|1030;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 182 20 69376 . G A 0.665 PASS NS=367;DP=2085;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2077;AA=3;SR=1003|1074;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 183 20 69408 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2154;AC=38;AN=732;AF=0.051913;RA=2013;AA=133;SR=894|1119;SA=60|73;SB=0.45113;AB=0.51685;ABR=138;ABA=128;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 184 20 69486 . C G 0.0652 PASS NS=362;DP=1836;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1820;AA=2;SR=1092|728;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 185 20 69641 . C A 0.0576 PASS NS=367;DP=2135;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2121;AA=8;SR=1038|1083;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.8125;ABR=13;ABA=3;RUN=3;SNP;TV | |
| 186 20 69656 . T C 0.253 PASS NS=366;DP=2096;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2090;AA=2;SR=1030|1060;SA=0|2;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 187 20 69668 . T C 40.6 PASS NS=365;DP=2114;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2104;AA=6;SR=1026|1078;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 188 20 69707 . T A 0.375 PASS NS=366;DP=2148;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2143;AA=2;SR=1011|1132;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 189 20 69723 . T A 0.883 PASS NS=363;DP=2037;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2026;AA=2;SR=945|1081;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 190 20 69752 . A C 1.31 PASS NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1977;AA=2;SR=932|1045;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 191 20 69821 . A T 0.479 PASS NS=364;DP=1967;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1960;AA=3;SR=958|1002;SA=3|0;SB=1;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=4;SNP;TV | |
| 192 20 69835 . A G 0.671 PASS NS=363;DP=1953;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1943;AA=5;SR=936|1007;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 193 20 69903 . T A 0.0459 PASS NS=362;DP=1913;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1904;AA=5;SR=821|1083;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 194 20 69951 . A T 0.159 PASS NS=354;DP=1819;AC=2;AN=708;AF=0.0028249;RA=1810;AA=8;SR=774|1036;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=4;SNP;TV | |
| 195 20 69966 . T C 0.661 PASS NS=351;DP=1768;AC=2;AN=702;AF=0.002849;RA=1762;AA=4;SR=773|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 196 20 70470 . A G 4.57 PASS NS=359;DP=1690;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1681;AA=2;SR=1065|616;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 197 20 70490 . C T 0.934 PASS NS=358;DP=1682;AC=5;AN=716;AF=0.0069832;RA=1665;AA=12;SR=962|703;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=5;SNP;TS | |
| 198 20 70604 . A T 0.698 PASS NS=360;DP=1795;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=1776;AA=10;SR=1075|701;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=4;SNP;TV | |
| 199 20 70611 . G A 0.143 PASS NS=362;DP=1806;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1788;AA=5;SR=1077|711;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 200 20 70696 . T C 1.72 PASS NS=365;DP=1849;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1839;AA=4;SR=983|856;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 201 20 70785 . A G 99.0 PASS NS=368;DP=1990;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1938;AA=40;SR=1005|933;SA=20|20;SB=0.5;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TS | |
| 202 20 70804 . C T 4.03 PASS NS=369;DP=2057;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2042;AA=5;SR=1069|973;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 203 20 70917 . T C 1.54 PASS NS=369;DP=2193;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2182;AA=2;SR=1110|1072;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 204 20 70920 . A G 99.0 PASS NS=368;DP=2172;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2121;AA=45;SR=1084|1037;SA=24|21;SB=0.53333;AB=0.38462;ABR=25;ABA=40;RUN=2;SNP;TS | |
| 205 20 70980 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2339;AC=39;AN=736;AF=0.052989;RA=2221;AA=106;SR=1223|998;SA=71|35;SB=0.66981;AB=0.57416;ABR=120;ABA=89;RUN=1;SNP;TS | |
| 206 20 71013 . A C 0.0504 PASS NS=371;DP=2390;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2371;AA=12;SR=1359|1012;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 207 20 71015 . T C 0.569 PASS NS=371;DP=2398;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2390;AA=5;SR=1364|1026;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 208 20 71037 . T C 0.223 PASS NS=369;DP=2289;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2279;AA=4;SR=1353|926;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 209 20 71079 . C T 99.0 PASS NS=370;DP=2338;AC=60;AN=740;AF=0.081081;RA=2168;AA=166;SR=1421|747;SA=102|64;SB=0.61446;AB=0.53086;ABR=129;ABA=113;RUN=1;SNP;TS | |
| 210 20 71093 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2393;AC=93;AN=730;AF=0.1274;RA=2085;AA=299;SR=1382|703;SA=194|105;SB=0.64883;AB=0.5317;ABR=260;ABA=225;RUN=1;SNP;TS | |
| 211 20 71281 . G A 66.6 PASS NS=369;DP=2496;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2481;AA=11;SR=1273|1208;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.66667;ABR=12;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 212 20 71290 . A G 0.526 PASS NS=368;DP=2466;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2448;AA=4;SR=1262|1186;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 213 20 71454 . T C 0.691 PASS NS=370;DP=2518;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2498;AA=5;SR=1203|1295;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 214 20 71543 . A G 1.37 PASS NS=369;DP=2378;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2369;AA=6;SR=1023|1346;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 215 20 71549 . G T 99.0 PASS NS=370;DP=2354;AC=49;AN=740;AF=0.066216;RA=2139;AA=210;SR=769|1370;SA=208|2;SB=0.99048;AB=0.68065;ABR=211;ABA=99;RUN=4;SNP;TV | |
| 216 20 71726 . C A 5.19 PASS NS=363;DP=2309;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2301;AA=3;SR=1162|1139;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 217 20 71809 . G A 27.3 PASS NS=354;DP=1947;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1937;AA=3;SR=923|1014;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 218 20 71850 . T C 0.131 PASS NS=358;DP=2062;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2055;AA=2;SR=1053|1002;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 219 20 71859 . G A 14.4 PASS NS=355;DP=2030;AC=3;AN=710;AF=0.0042254;RA=2010;AA=7;SR=1055|955;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 220 20 71926 . T A 4.2 PASS NS=336;DP=1791;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1787;AA=2;SR=879|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 221 20 71929 . T A 0.237 PASS NS=336;DP=1782;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1773;AA=3;SR=875|898;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 222 20 72002 . A C 0.101 PASS NS=340;DP=1976;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1960;AA=10;SR=1100|860;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 223 20 72036 . G A 99.0 PASS NS=349;DP=2037;AC=6;AN=698;AF=0.008596;RA=2022;AA=11;SR=1106|916;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.60714;ABR=17;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 224 20 72206 . T G 1.43 PASS NS=370;DP=2151;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2144;AA=4;SR=1129|1015;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 225 20 72287 . A G 0.0526 PASS NS=369;DP=2216;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2210;AA=2;SR=1016|1194;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 226 20 72331 . T A 0.125 PASS NS=367;DP=2265;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2246;AA=7;SR=1089|1157;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 227 20 72406 . C T 0.0949 PASS NS=366;DP=2205;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2191;AA=2;SR=1075|1116;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 228 20 72570 . C A 2.37 PASS NS=365;DP=1829;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1810;AA=13;SR=969|841;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 229 20 72604 . A G 2.22 PASS NS=363;DP=2084;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2079;AA=3;SR=1043|1036;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 230 20 72632 . G T 99.0 PASS NS=367;DP=2170;AC=21;AN=734;AF=0.02861;RA=2099;AA=67;SR=1017|1082;SA=36|31;SB=0.53731;AB=0.54167;ABR=65;ABA=55;RUN=2;SNP;TV | |
| 231 20 72665 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2216;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2198;AA=11;SR=1006|1192;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.5;ABR=10;ABA=10;RUN=2;SNP;TS | |
| 232 20 72719 . C T 99.0 PASS NS=360;DP=2045;AC=12;AN=720;AF=0.016667;RA=2005;AA=33;SR=968|1037;SA=19|14;SB=0.57576;AB=0.52174;ABR=36;ABA=32;RUN=3;SNP;TS | |
| 233 20 72747 . T A 0.163 PASS NS=368;DP=2073;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2062;AA=4;SR=1092|970;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 234 20 72771 . A T 1.48 PASS NS=371;DP=2071;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2062;AA=3;SR=1149|913;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 235 20 72772 . A G 0.311 PASS NS=371;DP=2065;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2051;AA=5;SR=1145|906;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 236 20 72815 . T C 25.8 PASS NS=367;DP=2079;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2062;AA=8;SR=1133|929;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 237 20 72820 . C A 3.07 PASS NS=366;DP=2061;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2048;AA=5;SR=1097|951;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 238 20 72882 . T C 4.28 PASS NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2013;AA=5;SR=914|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 239 20 72887 . A G 2.42 PASS NS=367;DP=2020;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=6;SR=906|1098;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 240 20 72890 . A G 1.25 PASS NS=366;DP=2018;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2006;AA=3;SR=910|1096;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 241 20 72892 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2011;AC=36;AN=730;AF=0.049315;RA=1913;AA=88;SR=863|1050;SA=43|45;SB=0.48864;AB=0.56647;ABR=98;ABA=73;RUN=5;SNP;TS | |
| 242 20 72894 . T C 77.5 PASS NS=365;DP=2035;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2010;AA=11;SR=921|1089;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 243 20 73014 . C G 12.4 PASS NS=368;DP=2017;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1989;AA=3;SR=858|1131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 244 20 73136 . T A 5.76 PASS NS=282;DP=784;AC=3;AN=564;AF=0.0053191;RA=758;AA=7;SR=402|356;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 245 20 73268 . G T 0.0695 PASS NS=346;DP=1716;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1710;AA=4;SR=1061|649;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 246 20 73369 . C T 5.68 PASS NS=365;DP=1955;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1943;AA=6;SR=800|1143;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=4;SNP;TS | |
| 247 20 73416 . C T 0.0527 PASS NS=362;DP=1908;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1894;AA=3;SR=937|957;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 248 20 73431 . C G 1.76 PASS NS=363;DP=1863;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1856;AA=3;SR=950|906;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 249 20 73719 . C A 99.0 PASS NS=277;DP=997;AC=18;AN=554;AF=0.032491;RA=964;AA=30;SR=443|521;SA=18|12;SB=0.6;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TV | |
| 250 20 73767 . A G 3.17 PASS NS=284;DP=893;AC=1;AN=568;AF=0.0017606;RA=883;AA=3;SR=402|481;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 251 20 73852 . T G 99.0 PASS NS=335;DP=1416;AC=7;AN=670;AF=0.010448;RA=1377;AA=28;SR=855|522;SA=8|20;SB=0.28571;AB=0.375;ABR=9;ABA=15;RUN=2;SNP;TV | |
| 252 20 73858 . C T 96.7 PASS NS=341;DP=1497;AC=9;AN=682;AF=0.013196;RA=1483;AA=13;SR=916|567;SA=8|5;SB=0.61538;AB=0.64516;ABR=20;ABA=11;RUN=1;SNP;TS | |
| 253 20 73888 . G A 0.0568 PASS NS=351;DP=1692;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1679;AA=4;SR=945|734;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 254 20 73957 . G A 13.1 PASS NS=368;DP=2167;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1176|982;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 255 20 74009 . C T 3.44 PASS NS=369;DP=2230;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2224;AA=2;SR=1283|941;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 256 20 74053 . A T 6.52 PASS NS=366;DP=2231;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2219;AA=4;SR=1326|893;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 257 20 74073 . T A 0.0672 PASS NS=365;DP=2246;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2237;AA=2;SR=1302|935;SA=2|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 258 20 74142 . A G 0.849 PASS NS=370;DP=2293;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2273;AA=7;SR=1239|1034;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 259 20 74232 . T C 0.106 PASS NS=366;DP=2368;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2348;AA=6;SR=1206|1142;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 260 20 74247 . T C 99.0 PASS NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2353;AA=9;SR=1194|1159;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.3;ABR=3;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 261 20 74281 . C T 3.59 PASS NS=366;DP=2430;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2418;AA=5;SR=1176|1242;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 262 20 74297 . A T 0.214 PASS NS=367;DP=2402;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2379;AA=5;SR=1148|1231;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 263 20 74347 . G A 99.0 PASS NS=371;DP=2504;AC=76;AN=742;AF=0.10243;RA=2237;AA=253;SR=1152|1085;SA=127|126;SB=0.50198;AB=0.52459;ABR=224;ABA=203;RUN=1;SNP;TS | |
| 264 20 74355 . G T 0.613 PASS NS=368;DP=2548;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=9;SR=1322|1208;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.8125;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 265 20 74545 . T A 1.96 PASS NS=361;DP=2030;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2012;AA=12;SR=933|1079;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.55;ABR=11;ABA=9;RUN=1;SNP;TV | |
| 266 20 74595 . G C 0.696 PASS NS=364;DP=2054;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2046;AA=4;SR=1037|1009;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 267 20 74617 . A G 4.15 PASS NS=365;DP=2159;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2139;AA=6;SR=1030|1109;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 268 20 74651 . T G 55.6 PASS NS=367;DP=2262;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2241;AA=12;SR=985|1256;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.46154;ABR=6;ABA=7;RUN=1;SNP;TV | |
| 269 20 74747 . C T 0.125 PASS NS=355;DP=2085;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=2069;AA=10;SR=1059|1010;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 270 20 74776 . T C 0.0648 PASS NS=357;DP=2083;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2066;AA=5;SR=1096|970;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 271 20 74801 . T C 0.234 PASS NS=361;DP=1925;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1921;AA=2;SR=960|961;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 272 20 74873 . T A 0.0536 PASS NS=337;DP=1479;AC=2;AN=674;AF=0.0029674;RA=1470;AA=4;SR=610|860;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 273 20 74885 . C A 0.412 PASS NS=342;DP=1549;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1540;AA=4;SR=692|848;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TV | |
| 274 20 74995 . T A 0.177 PASS NS=365;DP=2238;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2203;AA=16;SR=1233|970;SA=14|2;SB=0.875;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 275 20 75003 . T A 0.703 PASS NS=365;DP=2252;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2235;AA=3;SR=1241|994;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 276 20 75026 . G A 6.27 PASS NS=361;DP=2078;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2063;AA=9;SR=1109|954;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 277 20 75040 . T C 2.13 PASS NS=367;DP=2087;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2076;AA=3;SR=1074|1002;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 278 20 75245 . T A 3.0 PASS NS=363;DP=2162;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2150;AA=3;SR=1018|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 279 20 75254 . C A 99.0 PASS NS=362;DP=2018;AC=255;AN=724;AF=0.35221;RA=1339;AA=657;SR=615|724;SA=345|312;SB=0.52511;AB=0.52083;ABR=450;ABA=401;RUN=2;SNP;TV | |
| 280 20 75280 . A G 0.0778 PASS NS=350;DP=1862;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1823;AA=17;SR=786|1037;SA=0|17;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 281 20 75389 . C T 2.19 PASS NS=361;DP=2144;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2136;AA=4;SR=1054|1082;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 282 20 75514 . C T 0.116 PASS NS=369;DP=2263;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2248;AA=7;SR=1190|1058;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 283 20 75516 . A G 99.0 PASS NS=369;DP=2296;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2273;AA=14;SR=1217|1056;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.42105;ABR=8;ABA=11;RUN=1;SNP;TS | |
| 284 20 75691 . C G 1.39 PASS NS=370;DP=2164;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2149;AA=6;SR=933|1216;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 285 20 75729 . C G 99.0 PASS NS=368;DP=2200;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2156;AA=37;SR=1063|1093;SA=19|18;SB=0.51351;AB=0.50667;ABR=38;ABA=36;RUN=1;SNP;TV | |
| 286 20 75790 . G T 0.37 PASS NS=366;DP=2147;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2139;AA=5;SR=1124|1015;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TV | |
| 287 20 75813 . G T 45.2 PASS NS=367;DP=2170;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2155;AA=11;SR=1100|1055;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=2;SNP;TV | |
| 288 20 75880 . G A 4.19 PASS NS=369;DP=2153;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2139;AA=7;SR=1037|1102;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=3;SNP;TS | |
| 289 20 75999 . T C 99.0 PASS NS=371;DP=2394;AC=21;AN=742;AF=0.028302;RA=2315;AA=63;SR=1290|1025;SA=41|22;SB=0.65079;AB=0.50794;ABR=64;ABA=61;RUN=1;SNP;TS | |
| 290 20 76282 . G A 2.2 PASS NS=370;DP=2122;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2113;AA=2;SR=1137|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 291 20 76316 . T G 0.0522 PASS NS=353;DP=2029;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2019;AA=6;SR=1099|920;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 292 20 76317 . A T 0.0577 PASS NS=353;DP=2039;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2028;AA=4;SR=1106|922;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 293 20 76388 . G A 99.0 PASS NS=371;DP=2615;AC=3;AN=742;AF=0.0040431;RA=2588;AA=14;SR=1183|1405;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.54167;ABR=13;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 294 20 76407 . C T 0.047 PASS NS=369;DP=2638;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2620;AA=7;SR=1141|1479;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=3;SNP;TS | |
| 295 20 76477 . G T 0.0468 PASS NS=369;DP=2510;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2495;AA=8;SR=1108|1387;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.83333;ABR=5;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 296 20 76519 . T C 55.2 PASS NS=367;DP=2405;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2395;AA=6;SR=1135|1260;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 297 20 76526 . G A 97.7 PASS NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2355;AA=6;SR=1100|1255;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 298 20 76559 . G A 0.0519 PASS NS=366;DP=2361;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2351;AA=3;SR=1069|1282;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 299 20 76614 . T C 0.355 PASS NS=364;DP=2186;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2180;AA=2;SR=1061|1119;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 300 20 76631 . T A 0.135 PASS NS=362;DP=2146;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2138;AA=4;SR=1088|1050;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 301 20 76668 . T C 0.299 PASS NS=370;DP=2308;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2288;AA=7;SR=1196|1092;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 302 20 76669 . T A 3.27 PASS NS=370;DP=2325;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2319;AA=3;SR=1215|1104;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 303 20 76689 . T C 14.1 PASS NS=369;DP=2386;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2371;AA=7;SR=1247|1124;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 304 20 76796 . T C 18.7 PASS NS=368;DP=2408;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2393;AA=9;SR=1269|1124;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.76667;ABR=23;ABA=7;RUN=1;SNP;TS | |
| 305 20 76801 . G A 1.02 PASS NS=364;DP=2385;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2372;AA=4;SR=1252|1120;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 306 20 76915 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2285;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2256;AA=11;SR=1262|994;SA=8|3;SB=0.72727;AB=0.5;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS | |
| 307 20 76920 . G A 65.7 PASS NS=367;DP=2288;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2276;AA=7;SR=1297|979;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=2;SNP;TS | |
| 308 20 76934 . A G 40.7 PASS NS=368;DP=2253;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2238;AA=6;SR=1276|962;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 309 20 76962 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2127;AC=599;AN=738;AF=0.81165;RA=436;AA=1670;SR=226|210;SA=898|772;SB=0.53772;AB=0.51024;ABR=299;ABA=281;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 310 20 77013 . C T 47.1 PASS NS=370;DP=2371;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2361;AA=5;SR=1049|1312;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.57143;ABR=8;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 311 20 77025 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2398;AC=4;AN=740;AF=0.0054054;RA=2351;AA=24;SR=1035|1316;SA=5|19;SB=0.20833;AB=0.57143;ABR=24;ABA=18;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 312 20 77115 . A G 0.997 PASS NS=371;DP=2355;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2344;AA=4;SR=1291|1053;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 313 20 77225 . T C 0.928 PASS NS=366;DP=2199;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2192;AA=3;SR=986|1206;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 314 20 77264 . C T 0.0587 PASS NS=369;DP=2275;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2261;AA=5;SR=1054|1207;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 315 20 77327 . G T 24.8 PASS NS=367;DP=2294;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2282;AA=10;SR=1172|1110;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6875;ABR=11;ABA=5;RUN=2;SNP;TV | |
| 316 20 77393 . G A 32.7 PASS NS=367;DP=2297;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2277;AA=11;SR=1261|1016;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 317 20 77484 . A T 0.241 PASS NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2283;AA=5;SR=1203|1080;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 318 20 77499 . G T 0.058 PASS NS=369;DP=2269;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2260;AA=4;SR=1216|1044;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 319 20 77655 . T C 0.0462 PASS NS=371;DP=2542;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2533;AA=3;SR=1188|1345;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 320 20 77816 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2224;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=2161;AA=45;SR=1004|1157;SA=21|24;SB=0.46667;AB=0.53571;ABR=45;ABA=37;RUN=1;SNP;TS | |
| 321 20 77870 . A G 0.0585 PASS NS=368;DP=2214;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2176;AA=15;SR=836|1340;SA=3|12;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 322 20 77871 . C T 28.8 PASS NS=368;DP=2215;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2200;AA=11;SR=831|1369;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.75;ABR=9;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 323 20 77884 . T C 2.39 PASS NS=369;DP=2325;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2308;AA=4;SR=832|1476;SA=3|1;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 324 20 77890 . T C 13.2 PASS NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2324;AA=5;SR=842|1482;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 325 20 78254 . C T 99.0 PASS NS=345;DP=1534;AC=11;AN=690;AF=0.015942;RA=1494;AA=34;SR=751|743;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.58824;ABR=50;ABA=34;RUN=1;SNP;TS | |
| 326 20 78255 . C A 0.0735 PASS NS=347;DP=1551;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1538;AA=6;SR=774|764;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 327 20 78266 . T A 0.136 PASS NS=354;DP=1640;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1632;AA=4;SR=840|792;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 328 20 78455 . G A 99.0 PASS NS=342;DP=1209;AC=3;AN=684;AF=0.004386;RA=1190;AA=12;SR=657|533;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.45;ABR=9;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 329 20 78515 . G A 15.5 PASS NS=201;DP=435;AC=1;AN=402;AF=0.0024876;RA=429;AA=2;SR=37|392;SA=0|2;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 330 20 78691 . T G 0.408 PASS NS=164;DP=352;AC=1;AN=328;AF=0.0030488;RA=346;AA=3;SR=10|336;SA=0|3;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 331 20 79234 . T C 99.0 PASS NS=185;DP=299;AC=221;AN=370;AF=0.5973;RA=126;AA=171;SR=83|43;SA=113|58;SB=0.66082;AB=0.57447;ABR=27;ABA=20;RUN=1;SNP;TS | |
| 332 20 79509 . A G 6.23 PASS NS=341;DP=1250;AC=1;AN=682;AF=0.0014663;RA=1242;AA=3;SR=618|624;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 333 20 79697 . A G 6.18 PASS NS=129;DP=195;AC=1;AN=258;AF=0.003876;RA=191;AA=2;SR=53|138;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 334 20 79749 . A T 0.0964 PASS NS=158;DP=301;AC=2;AN=316;AF=0.0063291;RA=290;AA=3;SR=117|173;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 335 20 79969 . T G 6.07 PASS NS=214;DP=647;AC=1;AN=428;AF=0.0023364;RA=643;AA=2;SR=615|28;SA=2|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 336 20 80071 . G A 99.0 PASS NS=299;DP=809;AC=271;AN=598;AF=0.45318;RA=473;AA=335;SR=453|20;SA=325|10;SB=0.97015;AB=0.53559;ABR=158;ABA=137;RUN=1;SNP;TS | |
| 337 20 80079 . G A 27.1 PASS NS=316;DP=898;AC=7;AN=632;AF=0.011076;RA=888;AA=8;SR=851|37;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.73333;ABR=22;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 338 20 80095 . A G 0.0807 PASS NS=324;DP=1080;AC=3;AN=648;AF=0.0046296;RA=1063;AA=7;SR=935|128;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS | |
| 339 20 80165 . G T 0.0494 PASS NS=365;DP=2212;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2191;AA=14;SR=1178|1013;SA=1|13;SB=0.071429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 340 20 80174 . A T 0.633 PASS NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=2;SR=1187|1166;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 341 20 80251 . T C 2.09 PASS NS=369;DP=2247;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2212;AA=25;SR=1205|1007;SA=5|20;SB=0.2;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS | |
| 342 20 80289 . C A 1.02 PASS NS=367;DP=2183;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=3;SR=1321|856;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 343 20 80359 . T C 0.834 PASS NS=367;DP=2201;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=7;SR=1148|1029;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 344 20 80448 . A G 0.782 PASS NS=367;DP=2320;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2310;AA=4;SR=1056|1254;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 345 20 80481 . G C 99.0 PASS NS=368;DP=2442;AC=48;AN=736;AF=0.065217;RA=2286;AA=149;SR=1092|1194;SA=62|87;SB=0.41611;AB=0.50794;ABR=128;ABA=122;RUN=1;SNP;TV | |
| 346 20 80497 . G T 0.851 PASS NS=366;DP=2581;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2572;AA=5;SR=1218|1354;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 347 20 80513 . C G 25.9 PASS NS=369;DP=2672;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2659;AA=6;SR=1308|1351;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TV | |
| 348 20 80525 . C A 0.0588 PASS NS=365;DP=2634;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2619;AA=5;SR=1324|1295;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 349 20 80655 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2328;AC=646;AN=732;AF=0.88251;RA=331;AA=1993;SR=147|184;SA=829|1164;SB=0.41596;AB=0.56156;ABR=260;ABA=203;RUN=1;SNP;TS | |
| 350 20 80725 . T A 8.94 PASS NS=366;DP=2067;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2061;AA=2;SR=1019|1042;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 351 20 80728 . C G 99.0 PASS NS=366;DP=2029;AC=17;AN=732;AF=0.023224;RA=1969;AA=56;SR=983|986;SA=27|29;SB=0.48214;AB=0.5045;ABR=56;ABA=55;RUN=1;SNP;TV | |
| 352 20 80838 . C T 76.1 PASS NS=365;DP=2253;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2239;AA=6;SR=953|1286;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 353 20 80856 . C G 0.0837 PASS NS=363;DP=2218;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2206;AA=4;SR=931|1275;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 354 20 80865 . A C 0.0761 PASS NS=363;DP=2195;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2187;AA=5;SR=937|1250;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 355 20 80887 . G A 58.7 PASS NS=361;DP=2159;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2148;AA=6;SR=901|1247;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 356 20 81001 . T C 39.3 PASS NS=364;DP=1961;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1955;AA=3;SR=979|976;SA=3|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 357 20 81017 . C T 0.602 PASS NS=358;DP=1953;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1946;AA=3;SR=966|980;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 358 20 81071 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1794;AC=6;AN=726;AF=0.0082645;RA=1756;AA=20;SR=873|883;SA=8|12;SB=0.4;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=1;SNP;TS | |
| 359 20 81282 . A T 3.99 PASS NS=361;DP=1909;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1900;AA=4;SR=1029|871;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 360 20 81297 . T A 9.74 PASS NS=360;DP=1948;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1931;AA=6;SR=1062|869;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 361 20 81298 . G A 99.0 PASS NS=360;DP=1942;AC=5;AN=720;AF=0.0069444;RA=1923;AA=17;SR=1058|865;SA=11|6;SB=0.64706;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TS | |
| 362 20 81481 . A G 0.751 PASS NS=354;DP=1746;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1737;AA=3;SR=786|951;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 363 20 81550 . G T 13.7 PASS NS=351;DP=1755;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1750;AA=3;SR=809|941;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 364 20 81551 . A T 10.2 PASS NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1754;AA=2;SR=809|945;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 365 20 81561 . A G 0.396 PASS NS=348;DP=1704;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1696;AA=3;SR=816|880;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 366 20 81602 . C G 1.28 PASS NS=348;DP=1658;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1645;AA=3;SR=860|785;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 367 20 81679 . T G 4.28 PASS NS=350;DP=1612;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1602;AA=5;SR=664|938;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 368 20 81692 . T C 4.66 PASS NS=347;DP=1557;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1550;AA=5;SR=624|926;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 369 20 81715 . C G 5.01 PASS NS=344;DP=1520;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1513;AA=2;SR=584|929;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 370 20 81966 . G A 15.2 PASS NS=187;DP=338;AC=1;AN=374;AF=0.0026738;RA=329;AA=4;SR=172|157;SA=4|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 371 20 82012 . T C 57.6 PASS NS=161;DP=273;AC=49;AN=322;AF=0.15217;RA=222;AA=41;SR=75|147;SA=16|25;SB=0.39024;AB=0.6;ABR=15;ABA=10;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 372 20 82119 . G A 1.23 PASS NS=223;DP=490;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=486;AA=2;SR=322|164;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 373 20 82168 . G A 0.0662 PASS NS=223;DP=456;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=447;AA=3;SR=316|131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 374 20 82204 . T C 60.6 PASS NS=275;DP=670;AC=17;AN=550;AF=0.030909;RA=633;AA=23;SR=366|267;SA=16|7;SB=0.69565;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 375 20 82215 . G A 99.0 PASS NS=313;DP=849;AC=97;AN=626;AF=0.15495;RA=715;AA=126;SR=411|304;SA=85|41;SB=0.6746;AB=0.49645;ABR=70;ABA=71;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 376 20 82217 . G A 99.0 PASS NS=314;DP=864;AC=493;AN=628;AF=0.78503;RA=182;AA=666;SR=108|74;SA=392|274;SB=0.58859;AB=0.46875;ABR=75;ABA=83;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 377 20 82223 . C T 99.0 PASS NS=325;DP=994;AC=20;AN=650;AF=0.030769;RA=956;AA=34;SR=548|408;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.53488;ABR=23;ABA=19;RUN=1;SNP;TS | |
| 378 20 82239 . A T 7.56 PASS NS=344;DP=1299;AC=1;AN=688;AF=0.0014535;RA=1285;AA=2;SR=747|538;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 379 20 82258 . A G 14.1 PASS NS=355;DP=1549;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1536;AA=8;SR=883|653;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=3;SNP;TS | |
| 380 20 82309 . G A 0.136 PASS NS=356;DP=1542;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1528;AA=6;SR=935|593;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TS | |
| 381 20 82359 . T C 15.4 PASS NS=365;DP=1749;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1734;AA=8;SR=1094|640;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=3;SNP;TS | |
| 382 20 82415 . A C 23.9 PASS NS=369;DP=1845;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=1831;AA=10;SR=1068|763;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 383 20 82416 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=1849;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=1813;AA=31;SR=1060|753;SA=14|17;SB=0.45161;AB=0.57627;ABR=34;ABA=25;RUN=1;SNP;TS | |
| 384 20 82446 . C G 59.2 PASS NS=359;DP=1707;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1700;AA=4;SR=909|791;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 385 20 82460 . C T 9.05 PASS NS=363;DP=1665;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1657;AA=3;SR=856|801;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 386 20 82571 . T C 12.6 PASS NS=351;DP=1817;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1807;AA=4;SR=940|867;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 387 20 82701 . T C 99.0 PASS NS=351;DP=1848;AC=103;AN=702;AF=0.14672;RA=1578;AA=267;SR=848|730;SA=159|108;SB=0.59551;AB=0.5063;ABR=241;ABA=235;RUN=1;SNP;TS | |
| 388 20 82729 . G C 7.54 PASS NS=348;DP=1793;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1782;AA=5;SR=948|834;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 389 20 82783 . C G 0.355 PASS NS=364;DP=1952;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1940;AA=3;SR=954|986;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 390 20 82898 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2131;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2111;AA=11;SR=1035|1076;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.68966;ABR=20;ABA=9;RUN=3;SNP;TS | |
| 391 20 82923 . T A 0.244 PASS NS=368;DP=2124;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2113;AA=2;SR=1084|1029;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 392 20 82991 . G C 11.7 PASS NS=367;DP=1988;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1974;AA=3;SR=1070|904;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 393 20 83034 . T C 1.7 PASS NS=367;DP=2054;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2021;AA=8;SR=1049|972;SA=6|2;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 394 20 83129 . A G 0.056 PASS NS=367;DP=2217;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2204;AA=6;SR=1098|1106;SA=0|6;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 395 20 83154 . C G 0.0482 PASS NS=368;DP=2149;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2137;AA=6;SR=1070|1067;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 396 20 83196 . A T 99.0 PASS NS=368;DP=1931;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1884;AA=39;SR=936|948;SA=18|21;SB=0.46154;AB=0.47619;ABR=30;ABA=33;RUN=3;SNP;TV | |
| 397 20 83231 . G A 2.47 PASS NS=339;DP=1326;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1312;AA=5;SR=685|627;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 398 20 83481 . G T 0.0764 PASS NS=363;DP=2028;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2017;AA=7;SR=858|1159;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 399 20 83485 . A C 2.92 PASS NS=363;DP=2053;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2047;AA=4;SR=881|1166;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 400 20 83492 . A T 2.75 PASS NS=361;DP=2031;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2016;AA=11;SR=866|1150;SA=9|2;SB=0.81818;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=6;SNP;TV | |
| 401 20 83501 . G A 0.105 PASS NS=362;DP=2022;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2015;AA=2;SR=889|1126;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 402 20 83570 . T G 99.0 PASS NS=366;DP=2101;AC=53;AN=732;AF=0.072404;RA=1942;AA=152;SR=1026|916;SA=88|64;SB=0.57895;AB=0.47685;ABR=103;ABA=113;RUN=3;SNP;TV | |
| 403 20 83611 . C A 99.0 PASS NS=367;DP=2005;AC=13;AN=734;AF=0.017711;RA=1959;AA=41;SR=1062|897;SA=20|21;SB=0.4878;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TV | |
| 404 20 83613 . T C 0.232 PASS NS=367;DP=2011;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=4;SR=1083|921;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 405 20 83629 . C T 5.45 PASS NS=363;DP=1970;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1962;AA=3;SR=1038|924;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 406 20 83666 . G T 0.202 PASS NS=360;DP=1983;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1977;AA=3;SR=1132|845;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 407 20 83732 . A T 0.0538 PASS NS=369;DP=2058;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2035;AA=9;SR=1048|987;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 408 20 83765 . A G 1.78 PASS NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2018;AA=3;SR=1058|960;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 409 20 83777 . T C 0.0484 PASS NS=368;DP=2022;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2013;AA=6;SR=1109|904;SA=6|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 410 20 83819 . A T 1.79 PASS NS=366;DP=2143;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2133;AA=3;SR=1253|880;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 411 20 83929 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2235;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2216;AA=10;SR=999|1217;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.61538;ABR=16;ABA=10;RUN=1;SNP;TS | |
| 412 20 83934 . C T 0.265 PASS NS=365;DP=2214;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2192;AA=3;SR=983|1209;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 413 20 83966 . C T 0.338 PASS NS=370;DP=2246;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2222;AA=6;SR=1045|1177;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 414 20 83971 . C T 22.1 PASS NS=368;DP=2238;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2220;AA=11;SR=1057|1163;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.5;ABR=8;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 415 20 83996 . C G 99.0 PASS NS=366;DP=2129;AC=25;AN=732;AF=0.034153;RA=2061;AA=56;SR=1024|1037;SA=22|34;SB=0.39286;AB=0.5283;ABR=56;ABA=50;RUN=1;SNP;TV | |
| 416 20 84003 . A G 0.091 PASS NS=365;DP=2098;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2068;AA=12;SR=1047|1021;SA=1|11;SB=0.083333;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 417 20 84079 . G A 45.3 PASS NS=360;DP=1898;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1874;AA=10;SR=901|973;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=3;SNP;TS | |
| 418 20 84201 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1809;AC=4;AN=710;AF=0.0056338;RA=1784;AA=14;SR=830|954;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=2;SNP;TS | |
| 419 20 84351 . G A 1.43 PASS NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2138;AA=4;SR=1159|979;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 420 20 84358 . T C 0.98 PASS NS=360;DP=2134;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2108;AA=13;SR=1150|958;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 421 20 84488 . A G 0.241 PASS NS=365;DP=2176;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2139;AA=9;SR=1014|1125;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 422 20 84499 . G A 27.9 PASS NS=364;DP=2141;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2118;AA=11;SR=1047|1071;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 423 20 84504 . G A 35.0 PASS NS=366;DP=2125;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2098;AA=13;SR=1028|1070;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS | |
| 424 20 84666 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2163;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2140;AA=15;SR=1118|1022;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.28571;ABR=4;ABA=10;RUN=4;SNP;TS;CpG | |
| 425 20 84727 . G A 88.5 PASS NS=371;DP=2412;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2393;AA=10;SR=1261|1132;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.5625;ABR=9;ABA=7;RUN=1;SNP;TS | |
| 426 20 84892 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2536;AC=8;AN=736;AF=0.01087;RA=2499;AA=25;SR=1170|1329;SA=12|13;SB=0.48;AB=0.55102;ABR=27;ABA=21;RUN=1;SNP;TS | |
| 427 20 84906 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2485;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2422;AA=30;SR=1127|1295;SA=20|10;SB=0.66667;AB=0.58491;ABR=31;ABA=20;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 428 20 84934 . C T 0.156 PASS NS=369;DP=2365;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=4;SR=1081|1272;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 429 20 84937 . T A 0.102 PASS NS=369;DP=2325;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2299;AA=11;SR=1060|1239;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 430 20 84949 . G A 1.84 PASS NS=369;DP=2295;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2281;AA=5;SR=1075|1206;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 431 20 85116 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2259;AC=49;AN=734;AF=0.066757;RA=2119;AA=129;SR=989|1130;SA=54|75;SB=0.4186;AB=0.50679;ABR=112;ABA=106;RUN=1;SNP;TS | |
| 432 20 85180 . A G 2.49 PASS NS=366;DP=2123;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2111;AA=3;SR=882|1229;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 433 20 85182 . C T 6.7 PASS NS=365;DP=2111;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2100;AA=2;SR=874|1226;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 434 20 85195 . A G 0.062 PASS NS=354;DP=2020;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=2010;AA=5;SR=851|1159;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 435 20 85371 . A G 3.11 PASS NS=349;DP=2019;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=2008;AA=2;SR=1054|954;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 436 20 85388 . G A 2.07 PASS NS=364;DP=2082;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2071;AA=4;SR=1054|1017;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 437 20 85414 . G C 0.348 PASS NS=369;DP=2163;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2147;AA=5;SR=1106|1041;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 438 20 85492 . T C 2.17 PASS NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2323;AA=6;SR=1170|1153;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 439 20 85530 . G A 1.82 PASS NS=366;DP=1908;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1900;AA=3;SR=984|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 440 20 85875 . A G 38.7 PASS NS=357;DP=1986;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1979;AA=6;SR=1078|901;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 441 20 85937 . G C 99.0 PASS NS=369;DP=2379;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2348;AA=15;SR=1362|986;SA=9|6;SB=0.6;AB=0.38095;ABR=8;ABA=13;RUN=1;SNP;TV | |
| 442 20 86055 . A C 0.233 PASS NS=369;DP=2109;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2095;AA=7;SR=1161|934;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 443 20 86103 . G T 10.5 PASS NS=355;DP=2067;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=2052;AA=6;SR=1129|923;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 444 20 86115 . G A 99.0 PASS NS=356;DP=2026;AC=16;AN=712;AF=0.022472;RA=1969;AA=51;SR=1039|930;SA=28|23;SB=0.54902;AB=0.48837;ABR=42;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 445 20 86335 . T A 2.87 PASS NS=357;DP=2032;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=2003;AA=17;SR=925|1078;SA=0|17;SB=0;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=6;SNP;TV | |
| 446 20 86458 . C T 0.0675 PASS NS=362;DP=1974;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1959;AA=2;SR=1098|861;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 447 20 86620 . T A 4.96 PASS NS=368;DP=2381;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2365;AA=3;SR=1199|1166;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 448 20 86691 . C T 0.306 PASS NS=359;DP=2285;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2274;AA=4;SR=1261|1013;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 449 20 86719 . A G 0.0505 PASS NS=362;DP=2130;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2108;AA=9;SR=1090|1018;SA=0|9;SB=0;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 450 20 86757 . A G 2.16 PASS NS=364;DP=2159;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2147;AA=4;SR=1029|1118;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 451 20 86823 . T G 1.16 PASS NS=360;DP=1894;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1867;AA=9;SR=870|997;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 452 20 87003 . A C 43.6 PASS NS=357;DP=2114;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2103;AA=10;SR=846|1257;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.28571;ABR=2;ABA=5;RUN=1;SNP;TV | |
| 453 20 87029 . C A 6.64 PASS NS=353;DP=2097;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2090;AA=5;SR=842|1248;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 454 20 87067 . A T 0.0727 PASS NS=349;DP=1846;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1839;AA=4;SR=850|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 455 20 87112 . G A 99.0 PASS NS=350;DP=1657;AC=181;AN=700;AF=0.25857;RA=1252;AA=400;SR=740|512;SA=233|167;SB=0.5825;AB=0.51139;ABR=247;ABA=236;RUN=4;SNP;TS;CpG | |
| 456 20 87230 . G A 0.205 PASS NS=347;DP=1809;AC=4;AN=694;AF=0.0057637;RA=1779;AA=26;SR=812|967;SA=1|25;SB=0.038462;AB=0.71429;ABR=15;ABA=6;RUN=8;SNP;TS | |
| 457 20 87254 . C T 99.0 PASS NS=333;DP=1705;AC=3;AN=666;AF=0.0045045;RA=1687;AA=11;SR=755|932;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 458 20 87265 . A G 0.41 PASS NS=335;DP=1686;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1680;AA=3;SR=813|867;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 459 20 87313 . A G 1.57 PASS NS=354;DP=1886;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1880;AA=2;SR=941|939;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 460 20 87314 . A T 0.279 PASS NS=354;DP=1882;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1874;AA=3;SR=939|935;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 461 20 87362 . A G 99.0 PASS NS=345;DP=1823;AC=26;AN=690;AF=0.037681;RA=1732;AA=89;SR=879|853;SA=46|43;SB=0.51685;AB=0.46809;ABR=66;ABA=75;RUN=1;SNP;TS | |
| 462 20 87416 . A C 99.0 PASS NS=357;DP=1755;AC=511;AN=714;AF=0.71569;RA=537;AA=1217;SR=259|278;SA=650|567;SB=0.5341;AB=0.48414;ABR=290;ABA=309;RUN=3;SNP;TV | |
| 463 20 87471 . T C 0.608 PASS NS=349;DP=1783;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1768;AA=5;SR=935|833;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 464 20 87555 . T A 0.0485 PASS NS=355;DP=1728;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1715;AA=7;SR=840|875;SA=0|7;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=5;SNP;TV | |
| 465 20 87682 . G A 0.887 PASS NS=355;DP=1823;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1803;AA=4;SR=925|878;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 466 20 87790 . C T 99.0 PASS NS=345;DP=1766;AC=16;AN=690;AF=0.023188;RA=1705;AA=49;SR=867|838;SA=32|17;SB=0.65306;AB=0.5102;ABR=50;ABA=46;RUN=2;SNP;TS | |
| 467 20 88003 . A G 1.57 PASS NS=343;DP=1528;AC=1;AN=686;AF=0.0014577;RA=1524;AA=3;SR=698|826;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 468 20 88031 . T C 1.06 PASS NS=347;DP=1727;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1710;AA=4;SR=899|811;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 469 20 88058 . T C 0.444 PASS NS=367;DP=2138;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=7;SR=1196|926;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 470 20 88072 . C T 99.0 PASS NS=372;DP=2307;AC=6;AN=744;AF=0.0080645;RA=2286;AA=17;SR=1310|976;SA=6|11;SB=0.35294;AB=0.54545;ABR=18;ABA=15;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 471 20 88123 . C T 0.301 PASS NS=357;DP=2104;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2091;AA=5;SR=1202|889;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 472 20 88155 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2136;AC=17;AN=728;AF=0.023352;RA=2082;AA=41;SR=1144|938;SA=30|11;SB=0.73171;AB=0.60494;ABR=49;ABA=32;RUN=1;SNP;TS | |
| 473 20 88162 . G A 47.4 PASS NS=369;DP=2151;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2139;AA=7;SR=1175|964;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 474 20 88320 . A T 0.798 PASS NS=350;DP=1709;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1700;AA=3;SR=1029|671;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 475 20 88565 . A G 0.361 PASS NS=331;DP=1574;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1565;AA=3;SR=773|792;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 476 20 88647 . T G 0.076 PASS NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2140;AA=4;SR=1060|1080;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 477 20 88750 . T C 5.86 PASS NS=360;DP=1753;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1747;AA=2;SR=887|860;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 478 20 88814 . T C 0.327 PASS NS=335;DP=1461;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1447;AA=4;SR=749|698;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 479 20 88827 . C A 99.0 PASS NS=328;DP=1379;AC=133;AN=656;AF=0.20274;RA=1086;AA=290;SR=531|555;SA=135|155;SB=0.46552;AB=0.4788;ABR=192;ABA=209;RUN=6;SNP;TV | |
| 480 20 88874 . C T 3.41 PASS NS=346;DP=1464;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1450;AA=3;SR=694|756;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 481 20 88880 . T C 69.1 PASS NS=352;DP=1515;AC=9;AN=704;AF=0.012784;RA=1470;AA=16;SR=727|743;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.6;ABR=21;ABA=13;RUN=1;SNP;TS | |
| 482 20 88924 . A T 15.2 PASS NS=357;DP=1741;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1730;AA=6;SR=863|867;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=2;SNP;TV | |
| 483 20 89032 . C T 87.2 PASS NS=356;DP=1715;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1703;AA=6;SR=753|950;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.16667;ABR=1;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 484 20 89057 . T C 11.1 PASS NS=346;DP=1555;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1546;AA=2;SR=644|902;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 485 20 89061 . C T 3.13 PASS NS=338;DP=1513;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1503;AA=3;SR=618|885;SA=3|0;SB=1;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 486 20 89208 . T C 1.55 PASS NS=348;DP=1527;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1515;AA=2;SR=795|720;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 487 20 89322 . C G 0.0545 PASS NS=296;DP=1182;AC=1;AN=592;AF=0.0016892;RA=1176;AA=2;SR=694|482;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 488 20 89442 . G T 0.338 PASS NS=345;DP=1852;AC=1;AN=690;AF=0.0014493;RA=1844;AA=6;SR=1099|745;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 489 20 89517 . A T 4.6 PASS NS=360;DP=2035;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2030;AA=2;SR=1134|896;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 490 20 89661 . G A 47.0 PASS NS=366;DP=2184;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2175;AA=5;SR=1085|1090;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 491 20 89739 . T A 0.145 PASS NS=359;DP=1950;AC=2;AN=718;AF=0.0027855;RA=1928;AA=8;SR=951|977;SA=8|0;SB=1;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 492 20 89750 . G T 0.157 PASS NS=361;DP=1896;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1882;AA=10;SR=971|911;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 493 20 89784 . C T 4.3 PASS NS=350;DP=1854;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1848;AA=3;SR=1005|843;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 494 20 89860 . C A 2.95 PASS NS=371;DP=2493;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2480;AA=9;SR=1216|1264;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 495 20 89871 . T G 3.36 PASS NS=364;DP=2415;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2403;AA=9;SR=1148|1255;SA=0|9;SB=0;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TV | |
| 496 20 90008 . C A 99.0 PASS NS=346;DP=1902;AC=69;AN=692;AF=0.099711;RA=1671;AA=228;SR=919|752;SA=125|103;SB=0.54825;AB=0.48;ABR=168;ABA=182;RUN=4;SNP;TV | |
| 497 20 90187 . A C 0.0959 PASS NS=370;DP=2329;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2306;AA=14;SR=1020|1286;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 498 20 90407 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2398;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2378;AA=11;SR=1117|1261;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.35714;ABR=5;ABA=9;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 499 20 90509 . G A 0.677 PASS NS=370;DP=2346;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=2;SR=1216|1115;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 500 20 90541 . C T 99.0 PASS NS=371;DP=2334;AC=4;AN=742;AF=0.0053908;RA=2300;AA=23;SR=1229|1071;SA=11|12;SB=0.47826;AB=0.41667;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 501 20 90542 . G A 0.692 PASS NS=371;DP=2337;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2318;AA=16;SR=1245|1073;SA=2|14;SB=0.125;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 502 20 90570 . G A 23.7 PASS NS=370;DP=2343;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=6;SR=1221|1110;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=3;SNP;TS | |
| 503 20 90628 . G T 6.52 PASS NS=371;DP=2396;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2379;AA=6;SR=1154|1225;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 504 20 90688 . T C 0.367 PASS NS=370;DP=2304;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2272;AA=15;SR=946|1326;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 505 20 90752 . A C 0.122 PASS NS=370;DP=2411;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2399;AA=6;SR=1210|1189;SA=6|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 506 20 90795 . C T 0.18 PASS NS=368;DP=2454;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2443;AA=4;SR=1318|1125;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 507 20 90814 . T C 43.3 PASS NS=368;DP=2403;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2388;AA=10;SR=1294|1094;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.6;ABR=12;ABA=8;RUN=1;SNP;TS | |
| 508 20 90826 . T A 0.0721 PASS NS=367;DP=2295;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2287;AA=5;SR=1231|1056;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=4;SNP;TV | |
| 509 20 90984 . A G 99.0 PASS NS=361;DP=2035;AC=150;AN=722;AF=0.20776;RA=1619;AA=410;SR=766|853;SA=181|229;SB=0.44146;AB=0.5;ABR=331;ABA=330;RUN=1;SNP;TS | |
| 510 20 91053 . G A 1.89 PASS NS=361;DP=2062;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2051;AA=4;SR=1080|971;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 511 20 91072 . G A 9.59 PASS NS=361;DP=2180;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2166;AA=8;SR=1078|1088;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 512 20 91088 . C T 99.0 PASS NS=363;DP=2177;AC=616;AN=726;AF=0.84848;RA=386;AA=1782;SR=187|199;SA=833|949;SB=0.46745;AB=0.49684;ABR=236;ABA=239;RUN=1;SNP;TS | |
| 513 20 91217 . T C 0.0587 PASS NS=369;DP=2369;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2361;AA=5;SR=1348|1013;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 514 20 91227 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2355;AC=25;AN=738;AF=0.033875;RA=2274;AA=74;SR=1302|972;SA=44|30;SB=0.59459;AB=0.46018;ABR=52;ABA=61;RUN=3;SNP;TS | |
| 515 20 91346 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2207;AC=150;AN=738;AF=0.20325;RA=1744;AA=456;SR=974|770;SA=250|206;SB=0.54825;AB=0.49656;ABR=361;ABA=363;RUN=2;SNP;TS | |
| 516 20 91474 . C A 0.361 PASS NS=369;DP=2458;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2449;AA=4;SR=1260|1189;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=5;SNP;TV | |
| 517 20 91497 . A G 0.291 PASS NS=370;DP=2513;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2504;AA=3;SR=1280|1224;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 518 20 91508 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2483;AC=621;AN=738;AF=0.84146;RA=424;AA=2039;SR=222|202;SA=1036|1003;SB=0.50809;AB=0.52604;ABR=303;ABA=270;RUN=1;SNP;TS | |
| 519 20 91707 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2273;AC=112;AN=738;AF=0.15176;RA=1930;AA=291;SR=948|982;SA=137|154;SB=0.47079;AB=0.53738;ABR=230;ABA=197;RUN=1;SNP;TS | |
| 520 20 91716 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2309;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2285;AA=18;SR=1117|1168;SA=7|11;SB=0.38889;AB=0.60465;ABR=26;ABA=17;RUN=2;SNP;TS | |
| 521 20 91718 . C T 61.6 PASS NS=368;DP=2338;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2322;AA=10;SR=1129|1193;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=2;SNP;TS | |
| 522 20 91778 . T A 2.05 PASS NS=366;DP=2459;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2444;AA=7;SR=1123|1321;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 523 20 91863 . A G 1.48 PASS NS=364;DP=2501;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2488;AA=4;SR=1261|1227;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TS | |
| 524 20 91920 . C A 1.42 PASS NS=368;DP=2547;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2530;AA=6;SR=1225|1305;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 525 20 91937 . T A 15.2 PASS NS=368;DP=2523;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2492;AA=7;SR=1179|1313;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 526 20 91951 . G A 99.0 PASS NS=364;DP=2528;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2504;AA=12;SR=1185|1319;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.62069;ABR=18;ABA=11;RUN=1;SNP;TS | |
| 527 20 91971 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=2448;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2412;AA=26;SR=1136|1276;SA=9|17;SB=0.34615;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS | |
| 528 20 91987 . A C 2.61 PASS NS=366;DP=2461;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2447;AA=8;SR=1115|1332;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 529 20 91991 . G C 99.0 PASS NS=367;DP=2461;AC=12;AN=734;AF=0.016349;RA=2421;AA=30;SR=1104|1317;SA=12|18;SB=0.4;AB=0.525;ABR=21;ABA=19;RUN=2;SNP;TV | |
| 530 20 92037 . G T 18.0 PASS NS=369;DP=2484;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2465;AA=11;SR=1128|1337;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 531 20 92080 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2461;AC=10;AN=726;AF=0.013774;RA=2425;AA=32;SR=1182|1243;SA=15|17;SB=0.46875;AB=0.46341;ABR=19;ABA=22;RUN=1;SNP;TS | |
| 532 20 92091 . C A 3.93 PASS NS=363;DP=2512;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2502;AA=3;SR=1238|1264;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 533 20 92171 . T G 0.0778 PASS NS=361;DP=2344;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2332;AA=6;SR=1179|1153;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 534 20 92207 . T C 1.8 PASS NS=360;DP=2413;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2409;AA=2;SR=1146|1263;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 535 20 92366 . A G 99.0 PASS NS=359;DP=2411;AC=131;AN=718;AF=0.18245;RA=1937;AA=464;SR=930|1007;SA=219|245;SB=0.47198;AB=0.50995;ABR=282;ABA=269;RUN=1;SNP;TS | |
| 536 20 92383 . T C 0.775 PASS NS=364;DP=2395;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2377;AA=6;SR=1138|1239;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 537 20 92421 . A C 8.1 PASS NS=366;DP=2327;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2315;AA=6;SR=1224|1091;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 538 20 92441 . T C 2.12 PASS NS=364;DP=2420;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2406;AA=6;SR=1351|1055;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 539 20 92492 . G A 0.0468 PASS NS=366;DP=2377;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2366;AA=2;SR=1174|1192;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 540 20 92527 . A G 99.0 PASS NS=371;DP=2105;AC=644;AN=742;AF=0.86792;RA=317;AA=1752;SR=144|173;SA=822|930;SB=0.46918;AB=0.51415;ABR=218;ABA=198;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 541 20 92712 . T C 0.198 PASS NS=361;DP=2260;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2241;AA=10;SR=1190|1051;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 542 20 92774 . T C 0.403 PASS NS=364;DP=2560;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2548;AA=3;SR=1242|1306;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 543 20 92816 . T C 0.817 PASS NS=369;DP=2431;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=12;SR=1073|1334;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 544 20 92865 . T C 10.2 PASS NS=346;DP=2171;AC=2;AN=692;AF=0.0028902;RA=2155;AA=5;SR=1041|1114;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 545 20 92891 . A G 99.0 PASS NS=353;DP=2023;AC=99;AN=706;AF=0.14023;RA=1744;AA=258;SR=877|867;SA=137|121;SB=0.53101;AB=0.47804;ABR=185;ABA=200;RUN=1;SNP;TS | |
| 546 20 92972 . G A 9.84 PASS NS=362;DP=2148;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2140;AA=6;SR=1068|1072;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 547 20 93066 . C T 0.0559 PASS NS=356;DP=2150;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2137;AA=3;SR=1048|1089;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 548 20 93114 . C T 0.601 PASS NS=356;DP=2138;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2132;AA=2;SR=970|1162;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 549 20 93169 . C T 99.0 PASS NS=352;DP=2227;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=2133;AA=88;SR=999|1134;SA=36|52;SB=0.40909;AB=0.44681;ABR=63;ABA=77;RUN=1;SNP;TS | |
| 550 20 93175 . C A 0.159 PASS NS=359;DP=2283;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2272;AA=5;SR=1057|1215;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 551 20 93327 . T C 99.0 PASS NS=352;DP=1862;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=1797;AA=60;SR=792|1005;SA=20|40;SB=0.33333;AB=0.53535;ABR=53;ABA=46;RUN=3;SNP;TS | |
| 552 20 93343 . T C 1.43 PASS NS=351;DP=1897;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1886;AA=3;SR=804|1082;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 553 20 93356 . C T 0.0835 PASS NS=365;DP=1919;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1910;AA=2;SR=804|1106;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.78571;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 554 20 93389 . A G 10.9 PASS NS=361;DP=1775;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=1758;AA=5;SR=744|1014;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 555 20 93406 . T C 99.0 PASS NS=350;DP=1595;AC=7;AN=700;AF=0.01;RA=1573;AA=18;SR=651|922;SA=10|8;SB=0.55556;AB=0.55;ABR=22;ABA=18;RUN=1;SNP;TS | |
| 556 20 93428 . T C 3.27 PASS NS=334;DP=1422;AC=1;AN=668;AF=0.001497;RA=1415;AA=3;SR=565|850;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 557 20 93440 . A G 99.0 PASS NS=327;DP=1360;AC=157;AN=654;AF=0.24006;RA=1041;AA=315;SR=395|646;SA=136|179;SB=0.43175;AB=0.50992;ABR=180;ABA=172;RUN=2;SNP;TS | |
| 558 20 93499 . T C 99.0 PASS NS=365;DP=1887;AC=82;AN=730;AF=0.11233;RA=1681;AA=203;SR=679|1002;SA=79|124;SB=0.38916;AB=0.48855;ABR=128;ABA=134;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 559 20 93684 . A G 60.8 PASS NS=182;DP=336;AC=34;AN=364;AF=0.093407;RA=256;AA=30;SR=174|82;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.34783;ABR=8;ABA=14;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 560 20 93704 . G C 64.2 PASS NS=230;DP=445;AC=12;AN=460;AF=0.026087;RA=428;AA=12;SR=245|183;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 561 20 93718 . T C 99.0 PASS NS=260;DP=565;AC=55;AN=520;AF=0.10577;RA=498;AA=64;SR=267|231;SA=37|27;SB=0.57812;AB=0.5;ABR=30;ABA=30;RUN=2;SNP;TS | |
| 562 20 93739 . A G 99.0 PASS NS=278;DP=706;AC=75;AN=556;AF=0.13489;RA=582;AA=91;SR=316|266;SA=55|36;SB=0.6044;AB=0.48235;ABR=41;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 563 20 93931 . G A 99.0 PASS NS=325;DP=1064;AC=167;AN=650;AF=0.25692;RA=811;AA=248;SR=366|445;SA=126|122;SB=0.50806;AB=0.55128;ABR=129;ABA=105;RUN=1;SNP;TS | |
| 564 20 94019 . C T 0.498 PASS NS=360;DP=1907;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1900;AA=5;SR=1175|725;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 565 20 94036 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1929;AC=25;AN=710;AF=0.035211;RA=1850;AA=68;SR=1138|712;SA=44|24;SB=0.64706;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS | |
| 566 20 94087 . T C 25.9 PASS NS=364;DP=1913;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1901;AA=7;SR=1020|881;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 567 20 94091 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=1926;AC=93;AN=726;AF=0.1281;RA=1686;AA=228;SR=919|767;SA=116|112;SB=0.50877;AB=0.4822;ABR=149;ABA=156;RUN=1;SNP;TS | |
| 568 20 94179 . G A 9.12 PASS NS=356;DP=1627;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1617;AA=3;SR=942|675;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 569 20 94256 . A C 0.101 PASS NS=355;DP=1594;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1565;AA=4;SR=725|840;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 570 20 94307 . C A 8.46 PASS NS=339;DP=1691;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1675;AA=4;SR=703|972;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 571 20 94528 . T G 99.0 PASS NS=349;DP=1836;AC=84;AN=698;AF=0.12034;RA=1656;AA=177;SR=898|758;SA=96|81;SB=0.54237;AB=0.52747;ABR=144;ABA=129;RUN=1;SNP;TV | |
| 572 20 94588 . G A 0.244 PASS NS=364;DP=2022;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2006;AA=7;SR=1153|853;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.80952;ABR=17;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 573 20 94592 . T A 99.0 PASS NS=365;DP=2021;AC=89;AN=730;AF=0.12192;RA=1806;AA=212;SR=1024|782;SA=123|89;SB=0.58019;AB=0.5216;ABR=169;ABA=155;RUN=3;SNP;TV | |
| 574 20 94624 . G T 99.0 PASS NS=361;DP=1991;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=1949;AA=39;SR=1051|898;SA=25|14;SB=0.64103;AB=0.5;ABR=17;ABA=17;RUN=2;SNP;TV | |
| 575 20 94704 . G A 99.0 PASS NS=361;DP=2028;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=2015;AA=8;SR=958|1057;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 576 20 94717 . T C 57.7 PASS NS=365;DP=1994;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1985;AA=6;SR=926|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 577 20 94760 . A G 99.0 PASS NS=356;DP=2012;AC=22;AN=712;AF=0.030899;RA=1957;AA=50;SR=987|970;SA=19|31;SB=0.38;AB=0.55046;ABR=60;ABA=48;RUN=2;SNP;TS | |
| 578 20 94794 . T C 0.713 PASS NS=365;DP=2100;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=2;SR=1072|1019;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 579 20 94952 . G T 99.0 PASS NS=360;DP=2103;AC=157;AN=720;AF=0.21806;RA=1678;AA=422;SR=854|824;SA=209|213;SB=0.49526;AB=0.49323;ABR=255;ABA=262;RUN=3;SNP;TV | |
| 580 20 94973 . T A 0.162 PASS NS=363;DP=2064;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1059|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 581 20 95052 . T C 54.2 PASS NS=361;DP=1889;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1877;AA=5;SR=937|940;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 582 20 95093 . T G 99.0 PASS NS=364;DP=1944;AC=95;AN=728;AF=0.13049;RA=1730;AA=212;SR=840|890;SA=99|113;SB=0.46698;AB=0.46619;ABR=131;ABA=150;RUN=1;SNP;TV | |
| 583 20 95104 . A G 4.49 PASS NS=362;DP=1930;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1921;AA=3;SR=930|991;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 584 20 95186 . T C 6.33 PASS NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1986;AA=3;SR=977|1009;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 585 20 95249 . C G 1.12 PASS NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=955|968;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 586 20 95360 . C G 0.0671 PASS NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2088;AA=3;SR=1177|911;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 587 20 95601 . A G 10.6 PASS NS=368;DP=2205;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2172;AA=14;SR=1077|1095;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 588 20 95603 . T C 0.0469 PASS NS=347;DP=1778;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1758;AA=5;SR=858|900;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 589 20 95619 . C T 33.4 PASS NS=368;DP=2234;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2205;AA=8;SR=1105|1100;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 590 20 95627 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2216;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2175;AA=22;SR=1082|1093;SA=10|12;SB=0.45455;AB=0.40541;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 591 20 95781 . A T 0.36 PASS NS=363;DP=2225;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2185;AA=10;SR=1083|1102;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 592 20 95836 . T C 5.74 PASS NS=365;DP=2341;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2320;AA=11;SR=1153|1167;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 593 20 95989 . C T 0.0518 PASS NS=364;DP=2264;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2235;AA=5;SR=1159|1076;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 594 20 96026 . C T 83.3 PASS NS=362;DP=2328;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2304;AA=10;SR=1145|1159;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=2;SNP;TS | |
| 595 20 96038 . G C 0.823 PASS NS=362;DP=2311;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2279;AA=19;SR=1095|1184;SA=9|10;SB=0.47368;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TV | |
| 596 20 96141 . T C 0.0737 PASS NS=367;DP=2161;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2126;AA=13;SR=1101|1025;SA=13|0;SB=1;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 597 20 96166 . C T 1.2 PASS NS=367;DP=2187;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2169;AA=7;SR=1101|1068;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 598 20 96213 . C A 0.0772 PASS NS=359;DP=2247;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2231;AA=8;SR=994|1237;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 599 20 96325 . C T 0.047 PASS NS=364;DP=2278;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2256;AA=8;SR=1018|1238;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 600 20 96369 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2148;AC=9;AN=732;AF=0.012295;RA=2087;AA=37;SR=1003|1084;SA=14|23;SB=0.37838;AB=0.5;ABR=21;ABA=20;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 601 20 96421 . G C 1.04 PASS NS=363;DP=2132;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2103;AA=12;SR=943|1160;SA=6|6;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 602 20 96497 . C G 16.9 PASS NS=362;DP=1926;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=1908;AA=6;SR=907|1001;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 603 20 96579 . G A 24.7 PASS NS=359;DP=1704;AC=5;AN=718;AF=0.0069638;RA=1670;AA=17;SR=848|822;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS | |
| 604 20 96646 . G A 0.141 PASS NS=364;DP=1850;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1823;AA=6;SR=961|862;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 605 20 96670 . C T 2.72 PASS NS=366;DP=1963;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1953;AA=4;SR=1050|903;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 606 20 96695 . C T 13.0 PASS NS=364;DP=1927;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1894;AA=13;SR=1024|870;SA=12|1;SB=0.92308;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 607 20 96815 . A G 0.711 PASS NS=371;DP=2127;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2098;AA=18;SR=1051|1047;SA=1|17;SB=0.055556;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 608 20 96857 . T A 0.885 PASS NS=366;DP=2378;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2341;AA=12;SR=1217|1124;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 609 20 96872 . G T 0.0924 PASS NS=368;DP=2394;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2385;AA=5;SR=1289|1096;SA=0|5;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 610 20 96891 . C T 4.45 PASS NS=365;DP=2401;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2387;AA=4;SR=1293|1094;SA=1|3;SB=0.25;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 611 20 96923 . C A 99.0 PASS NS=363;DP=2448;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=2358;AA=85;SR=1286|1072;SA=56|29;SB=0.65882;AB=0.45385;ABR=59;ABA=71;RUN=2;SNP;TV | |
| 612 20 96931 . A G 99.0 PASS NS=365;DP=2424;AC=256;AN=730;AF=0.35068;RA=1586;AA=831;SR=882|704;SA=463|368;SB=0.55716;AB=0.50916;ABR=389;ABA=373;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 613 20 97048 . G T 0.0453 PASS NS=367;DP=2268;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2250;AA=9;SR=1094|1156;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=2;SNP;TV | |
| 614 20 97122 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2087;AC=168;AN=732;AF=0.22951;RA=1606;AA=470;SR=818|788;SA=230|240;SB=0.48936;AB=0.49234;ABR=257;ABA=261;RUN=1;SNP;TS | |
| 615 20 97227 . A C 87.6 PASS NS=358;DP=1952;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1912;AA=35;SR=1012|900;SA=33|2;SB=0.94286;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=2;SNP;TV | |
| 616 20 97271 . A T 10.8 PASS NS=367;DP=2260;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2241;AA=3;SR=1067|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 617 20 97285 . T C 0.442 PASS NS=363;DP=2215;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2169;AA=24;SR=1010|1159;SA=6|18;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 618 20 97371 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2386;AC=16;AN=730;AF=0.021918;RA=2319;AA=54;SR=1350|969;SA=26|28;SB=0.48148;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS | |
| 619 20 97394 . A G 99.0 PASS NS=346;DP=2074;AC=185;AN=692;AF=0.26734;RA=1552;AA=509;SR=904|648;SA=280|229;SB=0.5501;AB=0.46933;ABR=176;ABA=199;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 620 20 97458 . A G 68.2 PASS NS=365;DP=2315;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=7;SR=1121|1183;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TS | |
| 621 20 97465 . G C 2.86 PASS NS=365;DP=2309;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2285;AA=9;SR=1111|1174;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 622 20 97526 . C G 0.0531 PASS NS=370;DP=2381;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2370;AA=2;SR=1223|1147;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 623 20 97564 . T G 0.0531 PASS NS=369;DP=2445;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2425;AA=8;SR=1233|1192;SA=0|8;SB=0;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 624 20 97804 . G C 12.2 PASS NS=367;DP=2119;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2109;AA=4;SR=1004|1105;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 625 20 97915 . A T 0.991 PASS NS=359;DP=1872;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1857;AA=5;SR=936|921;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 626 20 98008 . T C 99.0 PASS NS=335;DP=1359;AC=19;AN=670;AF=0.028358;RA=1305;AA=48;SR=640|665;SA=24|24;SB=0.5;AB=0.48571;ABR=34;ABA=36;RUN=3;SNP;TS | |
| 627 20 98061 . G T 0.0607 PASS NS=331;DP=1432;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1423;AA=5;SR=794|629;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.9;ABR=18;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 628 20 98439 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2319;AC=29;AN=738;AF=0.039295;RA=2221;AA=84;SR=1227|994;SA=55|29;SB=0.65476;AB=0.56627;ABR=94;ABA=71;RUN=1;SNP;TS | |
| 629 20 98447 . T G 99.0 PASS NS=371;DP=2416;AC=29;AN=742;AF=0.039084;RA=2311;AA=89;SR=1239|1072;SA=49|40;SB=0.55056;AB=0.52941;ABR=81;ABA=72;RUN=2;SNP;TV | |
| 630 20 98491 . C T 99.0 PASS NS=370;DP=2385;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2364;AA=8;SR=1167|1197;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.55556;ABR=10;ABA=8;RUN=1;SNP;TS | |
| 631 20 98688 . T C 99.0 PASS NS=362;DP=2160;AC=28;AN=724;AF=0.038674;RA=2090;AA=64;SR=1092|998;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.54839;ABR=68;ABA=55;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 632 20 98741 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2469;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=2377;AA=81;SR=1083|1294;SA=40|41;SB=0.49383;AB=0.51538;ABR=67;ABA=63;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 633 20 98792 . G C 99.0 PASS NS=371;DP=2401;AC=32;AN=742;AF=0.043127;RA=2291;AA=92;SR=1124|1167;SA=41|51;SB=0.44565;AB=0.52632;ABR=80;ABA=70;RUN=1;SNP;TV | |
| 634 20 98796 . G T 0.637 PASS NS=369;DP=2424;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=13;SR=1185|1222;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TV | |
| 635 20 98905 . T C 0.0446 PASS NS=368;DP=2477;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2462;AA=9;SR=1319|1143;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 636 20 98908 . A T 6.25 PASS NS=370;DP=2483;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2471;AA=7;SR=1328|1143;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 637 20 98930 . G A 99.0 PASS NS=370;DP=2431;AC=159;AN=740;AF=0.21486;RA=1920;AA=502;SR=1041|879;SA=269|233;SB=0.53586;AB=0.54773;ABR=350;ABA=287;RUN=1;SNP;TS | |
| 638 20 98957 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2423;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2404;AA=13;SR=1270|1134;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=1;SNP;TS | |
| 639 20 98991 . T C 4.43 PASS NS=370;DP=2386;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2377;AA=3;SR=1217|1160;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 640 20 99132 . G T 0.374 PASS NS=371;DP=2502;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2492;AA=6;SR=1292|1200;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 641 20 99200 . C G 47.2 PASS NS=368;DP=2476;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2464;AA=5;SR=1140|1324;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 642 20 99228 . C T 48.9 PASS NS=368;DP=2404;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2382;AA=12;SR=1087|1295;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=4;SNP;TS | |
| 643 20 99318 . G T 0.264 PASS NS=368;DP=2147;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2135;AA=8;SR=914|1221;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 644 20 99500 . C A 99.0 PASS NS=366;DP=2130;AC=35;AN=732;AF=0.047814;RA=2048;AA=75;SR=792|1256;SA=26|49;SB=0.34667;AB=0.512;ABR=64;ABA=60;RUN=1;SNP;TV | |
| 645 20 99554 . C A 5.17 PASS NS=365;DP=2104;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2095;AA=4;SR=846|1249;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 646 20 99563 . T C 0.153 PASS NS=365;DP=2130;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2126;AA=3;SR=906|1220;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 647 20 99612 . A G 1.43 PASS NS=370;DP=2190;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2185;AA=2;SR=1213|972;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 648 20 99627 . G T 1.72 PASS NS=369;DP=2210;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2203;AA=6;SR=1239|964;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 649 20 99632 . T C 2.53 PASS NS=369;DP=2206;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2197;AA=3;SR=1231|966;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 650 20 99653 . C A 0.0845 PASS NS=366;DP=2296;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2287;AA=5;SR=1195|1092;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=4;SNP;TV | |
| 651 20 99667 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2225;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2197;AA=21;SR=1101|1096;SA=9|12;SB=0.42857;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS | |
| 652 20 99704 . T C 0.0612 PASS NS=370;DP=2145;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2141;AA=2;SR=997|1144;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 653 20 99734 . C T 0.0662 PASS NS=366;DP=2113;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2101;AA=6;SR=956|1145;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 654 20 99801 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=1968;AC=88;AN=734;AF=0.11989;RA=1750;AA=214;SR=977|773;SA=103|111;SB=0.48131;AB=0.46021;ABR=133;ABA=154;RUN=1;SNP;TS | |
| 655 20 99919 . A T 4.0 PASS NS=359;DP=2099;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2092;AA=2;SR=1038|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 656 20 100030 . G T 2.4 PASS NS=361;DP=1980;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1969;AA=9;SR=986|983;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 657 20 100133 . T C 2.2 PASS NS=359;DP=2041;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2033;AA=3;SR=936|1097;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 658 20 100134 . A G 72.1 PASS NS=360;DP=2052;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2042;AA=5;SR=942|1100;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 659 20 100172 . G C 16.2 PASS NS=356;DP=2127;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2120;AA=2;SR=996|1124;SA=2|0;SB=1;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 660 20 100184 . A G 68.0 PASS NS=360;DP=2141;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2125;AA=12;SR=1021|1104;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 661 20 100190 . A T 99.0 PASS NS=360;DP=2144;AC=20;AN=720;AF=0.027778;RA=2093;AA=43;SR=1027|1066;SA=23|20;SB=0.53488;AB=0.56044;ABR=51;ABA=40;RUN=1;SNP;TV | |
| 662 20 100272 . C T 99.0 PASS NS=352;DP=1860;AC=85;AN=704;AF=0.12074;RA=1684;AA=174;SR=855|829;SA=90|84;SB=0.51724;AB=0.48826;ABR=104;ABA=109;RUN=6;SNP;TS | |
| 663 20 100275 . C G 27.0 PASS NS=354;DP=1879;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1870;AA=5;SR=954|916;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 664 20 100277 . A G 0.355 PASS NS=351;DP=1863;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1857;AA=3;SR=938|919;SA=0|3;SB=0;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 665 20 100279 . T C 99.0 PASS NS=349;DP=1846;AC=9;AN=698;AF=0.012894;RA=1829;AA=13;SR=926|903;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.52381;ABR=11;ABA=10;RUN=2;SNP;TS | |
| 666 20 100308 . A G 5.47 PASS NS=354;DP=1794;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1781;AA=3;SR=814|967;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 667 20 100339 . C A 99.0 PASS NS=356;DP=1834;AC=18;AN=712;AF=0.025281;RA=1785;AA=45;SR=760|1025;SA=16|29;SB=0.35556;AB=0.50667;ABR=38;ABA=37;RUN=2;SNP;TV | |
| 668 20 100495 . G A 99.0 PASS NS=359;DP=2056;AC=85;AN=718;AF=0.11838;RA=1866;AA=181;SR=948|918;SA=93|88;SB=0.51381;AB=0.548;ABR=137;ABA=113;RUN=1;SNP;TS | |
| 669 20 100505 . T C 99.0 PASS NS=357;DP=2026;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1853;AA=167;SR=909|944;SA=83|84;SB=0.49701;AB=0.57025;ABR=138;ABA=104;RUN=1;SNP;TS | |
| 670 20 100515 . T A 1.58 PASS NS=357;DP=1978;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1971;AA=3;SR=933|1038;SA=0|3;SB=0;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=4;SNP;TV | |
| 671 20 100537 . C A 8.5 PASS NS=360;DP=1925;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1910;AA=6;SR=851|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 672 20 100554 . T C 5.56 PASS NS=361;DP=1910;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1902;AA=3;SR=827|1075;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 673 20 100564 . T C 0.454 PASS NS=359;DP=1868;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1865;AA=2;SR=825|1040;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 674 20 100569 . A G 0.0539 PASS NS=353;DP=1836;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1825;AA=3;SR=832|993;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 675 20 100592 . T C 6.17 PASS NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1756;AA=3;SR=892|864;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 676 20 100645 . C T 99.0 PASS NS=355;DP=1769;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1753;AA=12;SR=929|824;SA=8|4;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=9;ABA=12;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 677 20 100678 . C T 99.0 PASS NS=351;DP=1593;AC=77;AN=702;AF=0.10969;RA=1411;AA=177;SR=563|848;SA=177|0;SB=1;AB=0.69182;ABR=220;ABA=97;RUN=4;SNP;TS | |
| 678 20 100699 . C T 99.0 PASS NS=348;DP=1572;AC=178;AN=696;AF=0.25575;RA=1157;AA=387;SR=473|684;SA=178|209;SB=0.45995;AB=0.49265;ABR=201;ABA=204;RUN=2;SNP;TS | |
| 679 20 100700 . A C 0.0548 PASS NS=350;DP=1624;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1609;AA=7;SR=721|888;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=4;SNP;TV | |
| 680 20 100764 . C T 20.8 PASS NS=353;DP=1810;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1805;AA=3;SR=774|1031;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 681 20 100767 . T G 99.0 PASS NS=355;DP=1827;AC=8;AN=710;AF=0.011268;RA=1795;AA=25;SR=765|1030;SA=6|19;SB=0.24;AB=0.45714;ABR=16;ABA=19;RUN=1;SNP;TV | |
| 682 20 100816 . A G 1.13 PASS NS=346;DP=1873;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1867;AA=2;SR=836|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 683 20 100854 . T A 93.6 PASS NS=346;DP=1891;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1877;AA=10;SR=914|963;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=4;ABA=8;RUN=2;SNP;TV | |
| 684 20 100862 . C A 6.72 PASS NS=347;DP=1913;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1902;AA=4;SR=956|946;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 685 20 100881 . T C 0.499 PASS NS=353;DP=1949;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1943;AA=2;SR=1035|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 686 20 100904 . T C 4.63 PASS NS=358;DP=1912;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1906;AA=2;SR=1075|831;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 687 20 101020 . T C 1.07 PASS NS=357;DP=1819;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1807;AA=4;SR=962|845;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 688 20 101235 . T G 39.9 PASS NS=365;DP=2094;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2082;AA=8;SR=1042|1040;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=2;SNP;TV | |
| 689 20 101355 . T C 99.0 PASS NS=362;DP=2122;AC=25;AN=724;AF=0.03453;RA=2066;AA=51;SR=947|1119;SA=17|34;SB=0.33333;AB=0.58036;ABR=65;ABA=47;RUN=1;SNP;TS | |
| 690 20 101362 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=2073;AC=86;AN=724;AF=0.11878;RA=1825;AA=242;SR=817|1008;SA=107|135;SB=0.44215;AB=0.54505;ABR=242;ABA=202;RUN=3;SNP;TS | |
| 691 20 101437 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=1982;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1917;AA=58;SR=1001|916;SA=24|34;SB=0.41379;AB=0.46667;ABR=42;ABA=48;RUN=1;SNP;TS | |
| 692 20 101449 . A G 99.0 PASS NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1971;AA=10;SR=1065|906;SA=5|5;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=10;RUN=1;SNP;TS | |
| 693 20 101513 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2010;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=1985;AA=11;SR=952|1033;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=1;SNP;TS | |
| 694 20 101515 . G A 25.8 PASS NS=364;DP=1991;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1979;AA=5;SR=946|1033;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 695 20 101521 . A T 3.47 PASS NS=365;DP=1956;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1949;AA=3;SR=905|1044;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 696 20 101567 . A G 31.0 PASS NS=359;DP=1818;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1808;AA=5;SR=875|933;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 697 20 101590 . C A 0.0543 PASS NS=355;DP=1773;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1756;AA=9;SR=848|908;SA=1|8;SB=0.11111;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 698 20 101905 . G C 99.0 PASS NS=370;DP=2159;AC=13;AN=740;AF=0.017568;RA=2107;AA=46;SR=1075|1032;SA=30|16;SB=0.65217;AB=0.46988;ABR=39;ABA=44;RUN=1;SNP;TV | |
| 699 20 101918 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2159;AC=29;AN=736;AF=0.039402;RA=2069;AA=83;SR=1068|1001;SA=46|37;SB=0.55422;AB=0.59296;ABR=118;ABA=80;RUN=3;SNP;TS | |
| 700 20 102181 . T C 99.0 PASS NS=370;DP=2299;AC=310;AN=740;AF=0.41892;RA=1354;AA=940;SR=740|614;SA=508|432;SB=0.54043;AB=0.51446;ABR=427;ABA=401;RUN=2;SNP;TS | |
| 701 20 102203 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2327;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2305;AA=15;SR=1223|1082;SA=11|4;SB=0.73333;AB=0.72727;ABR=24;ABA=9;RUN=2;SNP;TS | |
| 702 20 102205 . A G 7.9 PASS NS=368;DP=2331;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2314;AA=5;SR=1222|1092;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 703 20 102278 . C A 0.0803 PASS NS=370;DP=2369;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2353;AA=11;SR=1241|1112;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 704 20 102312 . A G 39.1 PASS NS=369;DP=2482;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2466;AA=6;SR=1292|1174;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 705 20 102387 . C A 0.0651 PASS NS=372;DP=2764;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2750;AA=8;SR=1316|1434;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 706 20 102441 . T C 99.0 PASS NS=370;DP=2720;AC=18;AN=740;AF=0.024324;RA=2616;AA=92;SR=1328|1288;SA=36|56;SB=0.3913;AB=0.51075;ABR=95;ABA=91;RUN=1;SNP;TS | |
| 707 20 102464 . G C 99.0 PASS NS=368;DP=2753;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2720;AA=13;SR=1339|1381;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.56667;ABR=17;ABA=13;RUN=1;SNP;TV | |
| 708 20 102485 . A G 0.539 PASS NS=372;DP=2911;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2902;AA=4;SR=1393|1509;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 709 20 102510 . C T 0.0965 PASS NS=368;DP=2818;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2807;AA=3;SR=1294|1513;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 710 20 102511 . G A 0.0598 PASS NS=369;DP=2815;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2803;AA=6;SR=1297|1506;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 711 20 102519 . G A 9.8 PASS NS=369;DP=2741;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2734;AA=4;SR=1271|1463;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 712 20 102524 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2710;AC=31;AN=740;AF=0.041892;RA=2605;AA=99;SR=1195|1410;SA=45|54;SB=0.45455;AB=0.54082;ABR=106;ABA=90;RUN=1;SNP;TS | |
| 713 20 102631 . G A 2.6 PASS NS=367;DP=2311;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2298;AA=4;SR=1160|1138;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 714 20 102760 . A G 0.319 PASS NS=371;DP=2530;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2521;AA=5;SR=1100|1421;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 715 20 102799 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=2411;AC=188;AN=734;AF=0.25613;RA=1818;AA=585;SR=812|1006;SA=250|335;SB=0.42735;AB=0.49346;ABR=377;ABA=383;RUN=1;SNP;TS | |
| 716 20 103002 . G A 59.3 PASS NS=365;DP=2072;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2051;AA=6;SR=1068|983;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 717 20 103003 . C G 0.107 PASS NS=365;DP=2089;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2079;AA=2;SR=1075|1004;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 718 20 103119 . T C 5.14 PASS NS=362;DP=2079;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2070;AA=2;SR=950|1120;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 719 20 103308 . A T 99.0 PASS NS=367;DP=1956;AC=21;AN=734;AF=0.02861;RA=1908;AA=46;SR=920|988;SA=23|23;SB=0.5;AB=0.56061;ABR=37;ABA=29;RUN=1;SNP;TV | |
| 720 20 103351 . C A 99.0 PASS NS=362;DP=2013;AC=23;AN=724;AF=0.031768;RA=1954;AA=58;SR=1062|892;SA=37|21;SB=0.63793;AB=0.49438;ABR=44;ABA=45;RUN=4;SNP;TV | |
| 721 20 103487 . A G 99.0 PASS NS=367;DP=2018;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=1949;AA=62;SR=873|1076;SA=26|36;SB=0.41935;AB=0.52577;ABR=51;ABA=46;RUN=1;SNP;TS | |
| 722 20 103517 . A T 99.0 PASS NS=362;DP=1991;AC=307;AN=724;AF=0.42403;RA=1246;AA=741;SR=604|642;SA=340|401;SB=0.45884;AB=0.49821;ABR=278;ABA=279;RUN=1;SNP;TV | |
| 723 20 103565 . A G 31.2 PASS NS=360;DP=2009;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2002;AA=5;SR=1066|936;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 724 20 103642 . C G 99.0 PASS NS=361;DP=1999;AC=90;AN=722;AF=0.12465;RA=1791;AA=200;SR=906|885;SA=106|94;SB=0.53;AB=0.50545;ABR=139;ABA=134;RUN=1;SNP;TV | |
| 725 20 103645 . T C 3.37 PASS NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1980;AA=3;SR=1009|971;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 726 20 103659 . T G 0.587 PASS NS=355;DP=1968;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1961;AA=6;SR=994|967;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 727 20 103694 . C T 9.34 PASS NS=360;DP=2012;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2005;AA=2;SR=1039|966;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 728 20 103722 . T C 3.92 PASS NS=365;DP=2168;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2161;AA=4;SR=1157|1004;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 729 20 103762 . G A 5.05 PASS NS=367;DP=2133;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=2;SR=1144|978;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 730 20 103813 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=1974;AC=23;AN=724;AF=0.031768;RA=1909;AA=59;SR=1009|900;SA=35|24;SB=0.59322;AB=0.58779;ABR=77;ABA=54;RUN=1;SNP;TS | |
| 731 20 103826 . T C 1.89 PASS NS=360;DP=1939;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1930;AA=2;SR=993|937;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 732 20 104114 . G C 99.0 PASS NS=361;DP=2017;AC=4;AN=722;AF=0.0055402;RA=2002;AA=12;SR=921|1081;SA=3|9;SB=0.25;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TV | |
| 733 20 104292 . A G 0.304 PASS NS=360;DP=2180;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2177;AA=2;SR=1102|1075;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 734 20 104330 . A T 0.0694 PASS NS=366;DP=2128;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2121;AA=3;SR=1033|1088;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 735 20 104367 . T G 0.273 PASS NS=366;DP=2220;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2206;AA=8;SR=1142|1064;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 736 20 104402 . T G 0.435 PASS NS=362;DP=2078;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2064;AA=10;SR=1163|901;SA=1|9;SB=0.1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 737 20 104520 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2249;AC=90;AN=732;AF=0.12295;RA=1999;AA=247;SR=942|1057;SA=126|121;SB=0.51012;AB=0.52493;ABR=200;ABA=181;RUN=2;SNP;TS | |
| 738 20 104532 . C T 9.69 PASS NS=370;DP=2249;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2239;AA=3;SR=1069|1170;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 739 20 104534 . T C 99.0 PASS NS=371;DP=2257;AC=27;AN=742;AF=0.036388;RA=2156;AA=93;SR=1027|1129;SA=49|44;SB=0.52688;AB=0.51852;ABR=84;ABA=78;RUN=1;SNP;TS | |
| 740 20 104604 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2148;AC=30;AN=728;AF=0.041209;RA=2078;AA=61;SR=1065|1013;SA=29|32;SB=0.47541;AB=0.52632;ABR=50;ABA=42;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 741 20 104610 . C A 0.102 PASS NS=365;DP=2131;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2113;AA=14;SR=1080|1033;SA=4|10;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 742 20 104716 . C A 0.52 PASS NS=368;DP=2299;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2289;AA=7;SR=1070|1219;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 743 20 104808 . G T 13.4 PASS NS=361;DP=2053;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2046;AA=3;SR=998|1048;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 744 20 104899 . C T 99.0 PASS NS=358;DP=1718;AC=155;AN=716;AF=0.21648;RA=1331;AA=378;SR=675|656;SA=191|187;SB=0.50529;AB=0.49703;ABR=251;ABA=251;RUN=2;SNP;TS | |
| 745 20 104902 . T A 0.0554 PASS NS=358;DP=1715;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1704;AA=4;SR=864|840;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 746 20 104959 . G C 4.15 PASS NS=355;DP=1738;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1728;AA=3;SR=833|895;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 747 20 105111 . T A 0.299 PASS NS=353;DP=2057;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2048;AA=2;SR=1090|958;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 748 20 105131 . T C 0.314 PASS NS=354;DP=1957;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1953;AA=2;SR=1047|906;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 749 20 105239 . A C 7.74 PASS NS=353;DP=1694;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1682;AA=6;SR=893|789;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 750 20 105359 . G T 85.9 PASS NS=343;DP=1740;AC=3;AN=686;AF=0.0043732;RA=1730;AA=7;SR=780|950;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TV | |
| 751 20 105407 . T C 6.06 PASS NS=347;DP=1867;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1860;AA=2;SR=843|1017;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 752 20 105450 . A G 1.12 PASS NS=353;DP=1846;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1842;AA=2;SR=803|1039;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 753 20 105477 . A G 0.259 PASS NS=350;DP=1929;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1925;AA=2;SR=871|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 754 20 105540 . A G 2.1 PASS NS=348;DP=1862;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1855;AA=4;SR=957|898;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 755 20 105930 . G T 11.5 PASS NS=362;DP=2051;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2038;AA=2;SR=1081|957;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 756 20 106063 . T C 0.044 PASS NS=362;DP=2061;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2041;AA=5;SR=905|1136;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 757 20 106098 . A G 99.0 PASS NS=362;DP=1933;AC=14;AN=724;AF=0.019337;RA=1875;AA=55;SR=915|960;SA=20|35;SB=0.36364;AB=0.43023;ABR=37;ABA=49;RUN=1;SNP;TS | |
| 758 20 106169 . A C 5.1 PASS NS=363;DP=1990;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1985;AA=4;SR=1081|904;SA=4|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 759 20 106204 . A G 14.8 PASS NS=367;DP=1984;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1967;AA=6;SR=965|1002;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 760 20 106371 . C A 27.8 PASS NS=357;DP=1931;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1919;AA=9;SR=1070|849;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=5;SNP;TV | |
| 761 20 106411 . C A 99.0 PASS NS=353;DP=1798;AC=6;AN=706;AF=0.0084986;RA=1782;AA=15;SR=908|874;SA=8|7;SB=0.53333;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=3;SNP;TV | |
| 762 20 106550 . T C 0.176 PASS NS=348;DP=1664;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1657;AA=3;SR=738|919;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 763 20 106604 . T C 0.162 PASS NS=359;DP=1894;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1887;AA=3;SR=817|1070;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 764 20 106609 . A G 22.0 PASS NS=360;DP=1886;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1872;AA=5;SR=801|1071;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 765 20 106613 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1933;AC=17;AN=726;AF=0.023416;RA=1878;AA=52;SR=795|1083;SA=23|29;SB=0.44231;AB=0.45833;ABR=44;ABA=52;RUN=1;SNP;TS | |
| 766 20 106635 . G A 99.0 PASS NS=364;DP=1892;AC=261;AN=728;AF=0.35852;RA=1263;AA=626;SR=506|757;SA=246|380;SB=0.39297;AB=0.48309;ABR=300;ABA=321;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 767 20 107011 . A G 33.8 PASS NS=303;DP=833;AC=1;AN=606;AF=0.0016502;RA=827;AA=4;SR=348|479;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 768 20 107071 . G A 0.0548 PASS NS=297;DP=963;AC=1;AN=594;AF=0.0016835;RA=954;AA=4;SR=622|332;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 769 20 107118 . C T 0.0477 PASS NS=310;DP=1008;AC=3;AN=620;AF=0.0048387;RA=1002;AA=3;SR=698|304;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 770 20 107120 . T G 11.1 PASS NS=306;DP=986;AC=1;AN=612;AF=0.001634;RA=974;AA=7;SR=677|297;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 771 20 107152 . A G 38.9 PASS NS=307;DP=943;AC=5;AN=614;AF=0.0081433;RA=930;AA=9;SR=548|382;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 772 20 107160 . C G 99.0 PASS NS=312;DP=969;AC=4;AN=624;AF=0.0064103;RA=951;AA=12;SR=546|405;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.4;ABR=6;ABA=9;RUN=2;SNP;TV | |
| 773 20 107201 . G A 99.0 PASS NS=317;DP=936;AC=24;AN=634;AF=0.037855;RA=883;AA=51;SR=486|397;SA=36|15;SB=0.70588;AB=0.40278;ABR=29;ABA=43;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 774 20 107273 . C A 0.855 PASS NS=298;DP=985;AC=1;AN=596;AF=0.0016779;RA=978;AA=3;SR=689|289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 775 20 107457 . T C 99.0 PASS NS=350;DP=1623;AC=91;AN=700;AF=0.13;RA=1430;AA=185;SR=730|700;SA=101|84;SB=0.54595;AB=0.52964;ABR=134;ABA=117;RUN=1;SNP;TS | |
| 776 20 107563 . T G 1.01 PASS NS=353;DP=1642;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1604;AA=29;SR=596|1008;SA=25|4;SB=0.86207;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 777 20 107613 . T G 99.0 PASS NS=350;DP=1383;AC=68;AN=700;AF=0.097143;RA=1287;AA=95;SR=532|755;SA=36|59;SB=0.37895;AB=0.58621;ABR=68;ABA=48;RUN=1;SNP;TV | |
| 778 20 107682 . T C 1.66 PASS NS=328;DP=1188;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1174;AA=7;SR=513|661;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 779 20 107739 . C T 19.1 PASS NS=309;DP=939;AC=1;AN=618;AF=0.0016181;RA=931;AA=4;SR=333|598;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 780 20 107955 . C T 0.385 PASS NS=353;DP=1950;AC=2;AN=706;AF=0.0028329;RA=1935;AA=7;SR=1127|808;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS | |
| 781 20 107972 . T C 8.26 PASS NS=356;DP=1989;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1981;AA=3;SR=1113|868;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 782 20 107980 . T C 3.5 PASS NS=353;DP=2021;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2005;AA=6;SR=1111|894;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 783 20 107995 . A G 0.878 PASS NS=353;DP=2018;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2007;AA=2;SR=1100|907;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 784 20 108012 . A C 0.159 PASS NS=352;DP=1969;AC=1;AN=704;AF=0.0014205;RA=1957;AA=8;SR=1101|856;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 785 20 108015 . T C 6.58 PASS NS=353;DP=1948;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1941;AA=3;SR=1097|844;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 786 20 108017 . C T 0.235 PASS NS=355;DP=1935;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1924;AA=4;SR=1088|836;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=5;SNP;TS | |
| 787 20 108135 . G A 0.105 PASS NS=359;DP=1667;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1654;AA=4;SR=1019|635;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 788 20 108187 . A G 99.0 PASS NS=357;DP=1712;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1508;AA=195;SR=874|634;SA=103|92;SB=0.52821;AB=0.54895;ABR=157;ABA=128;RUN=1;SNP;TS | |
| 789 20 108192 . G A 99.0 PASS NS=359;DP=1741;AC=3;AN=718;AF=0.0041783;RA=1721;AA=14;SR=975|746;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=6;ABA=12;RUN=4;SNP;TS | |
| 790 20 108286 . T G 99.0 PASS NS=360;DP=1849;AC=159;AN=720;AF=0.22083;RA=1402;AA=404;SR=743|659;SA=205|199;SB=0.50743;AB=0.46593;ABR=253;ABA=274;RUN=1;SNP;TV | |
| 791 20 108328 . A C 99.0 PASS NS=362;DP=2007;AC=628;AN=724;AF=0.8674;RA=315;AA=1690;SR=139|176;SA=829|861;SB=0.49053;AB=0.52174;ABR=204;ABA=187;RUN=1;SNP;TV | |
| 792 20 108333 . G A 3.94 PASS NS=360;DP=2056;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2044;AA=5;SR=980|1064;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 793 20 108642 . T C 0.532 PASS NS=216;DP=749;AC=1;AN=432;AF=0.0023148;RA=741;AA=3;SR=201|540;SA=0|3;SB=0;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 794 20 108711 . A C 99.0 PASS NS=227;DP=741;AC=10;AN=454;AF=0.022026;RA=723;AA=15;SR=265|458;SA=7|8;SB=0.46667;AB=0.51724;ABR=15;ABA=14;RUN=1;SNP;TV | |
| 795 20 108793 . C G 68.9 PASS NS=193;DP=364;AC=8;AN=386;AF=0.020725;RA=352;AA=10;SR=228|124;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=1;SNP;TV | |
| 796 20 108889 . G C 99.0 PASS NS=353;DP=1305;AC=22;AN=706;AF=0.031161;RA=1259;AA=38;SR=644|615;SA=22|16;SB=0.57895;AB=0.5;ABR=21;ABA=21;RUN=2;SNP;TV | |
| 797 20 108949 . T G 99.0 PASS NS=329;DP=1082;AC=61;AN=658;AF=0.092705;RA=988;AA=92;SR=653|335;SA=70|22;SB=0.76087;AB=0.53;ABR=53;ABA=47;RUN=1;SNP;TV | |
| 798 20 108958 . A C 99.0 PASS NS=324;DP=1013;AC=125;AN=648;AF=0.1929;RA=809;AA=201;SR=551|258;SA=141|60;SB=0.70149;AB=0.5503;ABR=93;ABA=75;RUN=2;SNP;TV | |
| 799 20 109043 . G T 13.5 PASS NS=342;DP=1318;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1299;AA=4;SR=862|437;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 800 20 109213 . A C 37.3 PASS NS=366;DP=1810;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1803;AA=4;SR=998|805;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 801 20 109258 . T C 3.83 PASS NS=370;DP=2046;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2039;AA=3;SR=1134|905;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 802 20 109272 . C G 99.0 PASS NS=367;DP=2020;AC=90;AN=734;AF=0.12262;RA=1774;AA=241;SR=983|791;SA=127|114;SB=0.52697;AB=0.50142;ABR=177;ABA=175;RUN=2;SNP;TV | |
| 803 20 109273 . T A 7.99 PASS NS=367;DP=2018;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2012;AA=2;SR=1110|902;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 804 20 109288 . G C 99.0 PASS NS=364;DP=1921;AC=90;AN=728;AF=0.12363;RA=1686;AA=221;SR=898|788;SA=120|101;SB=0.54299;AB=0.51133;ABR=158;ABA=148;RUN=1;SNP;TV | |
| 805 20 109358 . T C 0.707 PASS NS=358;DP=2101;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2093;AA=5;SR=1099|994;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 806 20 109377 . A C 99.0 PASS NS=361;DP=2239;AC=21;AN=722;AF=0.029086;RA=2161;AA=75;SR=1073|1088;SA=46|29;SB=0.61333;AB=0.49635;ABR=68;ABA=68;RUN=2;SNP;TV | |
| 807 20 109385 . A G 1.51 PASS NS=363;DP=2269;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2254;AA=8;SR=1091|1163;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 808 20 109422 . T A 99.0 PASS NS=366;DP=2242;AC=24;AN=732;AF=0.032787;RA=2159;AA=76;SR=1039|1120;SA=30|46;SB=0.39474;AB=0.48387;ABR=60;ABA=64;RUN=1;SNP;TV | |
| 809 20 109440 . T C 0.386 PASS NS=362;DP=2222;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2218;AA=3;SR=1057|1161;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 810 20 109575 . A G 0.588 PASS NS=364;DP=2020;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2008;AA=4;SR=931|1077;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 811 20 109582 . T G 23.2 PASS NS=362;DP=1967;AC=3;AN=724;AF=0.0041436;RA=1957;AA=6;SR=907|1050;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TV | |
| 812 20 109707 . G A 0.971 PASS NS=323;DP=1467;AC=1;AN=646;AF=0.001548;RA=1455;AA=3;SR=669|786;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 813 20 109725 . T C 0.908 PASS NS=336;DP=1492;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1479;AA=7;SR=670|809;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 814 20 109736 . T C 0.074 PASS NS=342;DP=1489;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1478;AA=5;SR=680|798;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 815 20 109783 . T C 99.0 PASS NS=342;DP=1544;AC=26;AN=684;AF=0.038012;RA=1472;AA=66;SR=641|831;SA=28|38;SB=0.42424;AB=0.46364;ABR=51;ABA=57;RUN=2;SNP;TS | |
| 816 20 109889 . T C 0.545 PASS NS=365;DP=2083;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2077;AA=4;SR=1096|981;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 817 20 109901 . A G 99.0 PASS NS=364;DP=2112;AC=28;AN=728;AF=0.038462;RA=2028;AA=78;SR=1064|964;SA=39|39;SB=0.5;AB=0.46479;ABR=66;ABA=74;RUN=1;SNP;TS | |
| 818 20 109933 . G A 0.166 PASS NS=357;DP=1915;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1908;AA=3;SR=1017|891;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 819 20 109947 . T A 4.68 PASS NS=352;DP=1833;AC=2;AN=704;AF=0.0028409;RA=1822;AA=4;SR=950|872;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 820 20 109997 . C T 0.0475 PASS NS=346;DP=1655;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1639;AA=11;SR=790|849;SA=10|1;SB=0.90909;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=8;SNP;TS | |
| 821 20 110058 . G C 99.0 PASS NS=338;DP=1651;AC=146;AN=676;AF=0.21598;RA=1306;AA=340;SR=717|589;SA=189|151;SB=0.55588;AB=0.4978;ABR=226;ABA=226;RUN=1;SNP;TV | |
| 822 20 110082 . A G 99.0 PASS NS=337;DP=1696;AC=5;AN=674;AF=0.0074184;RA=1677;AA=14;SR=1008|669;SA=5|9;SB=0.35714;AB=0.47826;ABR=11;ABA=12;RUN=1;SNP;TS | |
| 823 20 110098 . A G 99.0 PASS NS=347;DP=1831;AC=242;AN=694;AF=0.3487;RA=1250;AA=577;SR=767|483;SA=353|224;SB=0.61179;AB=0.51826;ABR=298;ABA=277;RUN=3;SNP;TS | |
| 824 20 110124 . T C 0.105 PASS NS=365;DP=2096;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=3;SR=1273|818;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 825 20 110234 . G A 0.759 PASS NS=350;DP=1744;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1727;AA=4;SR=739|988;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 826 20 110315 . T C 0.0966 PASS NS=337;DP=1589;AC=1;AN=674;AF=0.0014837;RA=1583;AA=3;SR=729|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 827 20 110366 . C A 99.0 PASS NS=340;DP=1634;AC=7;AN=680;AF=0.010294;RA=1602;AA=28;SR=724|878;SA=18|10;SB=0.64286;AB=0.39474;ABR=15;ABA=23;RUN=3;SNP;TV | |
| 828 20 110404 . G A 26.7 PASS NS=351;DP=1839;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1826;AA=5;SR=727|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 829 20 110417 . G A 7.25 PASS NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=782|1141;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 830 20 110427 . A G 0.108 PASS NS=364;DP=2009;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2000;AA=3;SR=826|1174;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 831 20 110442 . C A 9.88 PASS NS=367;DP=2074;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2060;AA=5;SR=845|1215;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 832 20 110520 . A G 8.32 PASS NS=351;DP=1771;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1759;AA=3;SR=809|950;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 833 20 110536 . T C 55.6 PASS NS=359;DP=1709;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1697;AA=6;SR=784|913;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 834 20 110564 . T C 1.51 PASS NS=360;DP=1650;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1637;AA=5;SR=750|887;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 835 20 110702 . C T 99.0 PASS NS=244;DP=491;AC=104;AN=488;AF=0.21311;RA=368;AA=102;SR=39|329;SA=6|96;SB=0.058824;AB=0.50617;ABR=41;ABA=38;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 836 20 110773 . G A 0.095 PASS NS=223;DP=443;AC=18;AN=446;AF=0.040359;RA=425;AA=14;SR=61|364;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.57895;ABR=11;ABA=7;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 837 20 110875 . C T 99.0 PASS NS=165;DP=461;AC=14;AN=330;AF=0.042424;RA=439;AA=21;SR=7|432;SA=0|21;SB=0;AB=0.52941;ABR=18;ABA=16;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 838 20 110970 . G A 99.0 PASS NS=88;DP=160;AC=37;AN=176;AF=0.21023;RA=125;AA=32;SR=6|119;SA=0|32;SB=0;AB=0.54545;ABR=12;ABA=9;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 839 20 110976 . G A 67.8 PASS NS=80;DP=137;AC=6;AN=160;AF=0.0375;RA=127;AA=8;SR=4|123;SA=0|8;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 840 20 110979 . A G 99.0 PASS NS=41;DP=61;AC=39;AN=82;AF=0.47561;RA=29;AA=30;SR=4|25;SA=0|30;SB=0;AB=0.375;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 841 20 111531 . G A 0.0614 PASS NS=6;DP=8;AC=4;AN=12;AF=0.33333;RA=3;AA=4;SR=0|3;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=7;SNP;TS | |
| 842 20 116405 . G A 49.6 PASS NS=55;DP=69;AC=26;AN=110;AF=0.23636;RA=52;AA=16;SR=49|3;SA=16|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=2;SNP;TS | |
| 843 20 116545 . G A 95.2 PASS NS=65;DP=84;AC=19;AN=130;AF=0.14615;RA=70;AA=13;SR=67|3;SA=13|0;SB=1;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 844 20 116652 . A T 0.615 PASS NS=305;DP=848;AC=1;AN=610;AF=0.0016393;RA=842;AA=3;SR=602|240;SA=3|0;SB=1;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 845 20 116787 . A G 99.0 PASS NS=293;DP=885;AC=195;AN=586;AF=0.33276;RA=619;AA=263;SR=450|169;SA=196|67;SB=0.74525;AB=0.52709;ABR=107;ABA=95;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 846 20 116986 . G T 0.068 PASS NS=200;DP=396;AC=1;AN=400;AF=0.0025;RA=385;AA=4;SR=239|146;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TV | |
| 847 20 117254 . T C 99.0 PASS NS=360;DP=1886;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=1869;AA=10;SR=1183|686;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6087;ABR=14;ABA=9;RUN=1;SNP;TS | |
| 848 20 117290 . T G 99.0 PASS NS=358;DP=1981;AC=49;AN=716;AF=0.068436;RA=1888;AA=79;SR=1178|710;SA=41|38;SB=0.51899;AB=0.7807;ABR=267;ABA=74;RUN=2;SNP;TV | |
| 849 20 117305 . T C 3.02 PASS NS=359;DP=2077;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2064;AA=3;SR=1224|840;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 850 20 117312 . G A 0.499 PASS NS=364;DP=2121;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2108;AA=8;SR=1235|873;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.7619;ABR=16;ABA=5;RUN=2;SNP;TS | |
| 851 20 117329 . T C 6.59 PASS NS=361;DP=2185;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2178;AA=2;SR=1178|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 852 20 117475 . T C 1.49 PASS NS=367;DP=2292;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2284;AA=4;SR=1049|1235;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 853 20 117575 . A G 0.598 PASS NS=358;DP=2097;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2089;AA=3;SR=957|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 854 20 117618 . T G 0.0451 PASS NS=366;DP=2178;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2162;AA=10;SR=1020|1142;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 855 20 117683 . G C 0.218 PASS NS=359;DP=2011;AC=2;AN=718;AF=0.0027855;RA=1997;AA=5;SR=926|1071;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 856 20 117685 . T A 0.339 PASS NS=360;DP=2018;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2009;AA=2;SR=939|1070;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 857 20 117719 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2041;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2030;AA=8;SR=948|1082;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS | |
| 858 20 117742 . T A 0.194 PASS NS=361;DP=1998;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1990;AA=4;SR=956|1034;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TV | |
| 859 20 117749 . C G 8.36 PASS NS=360;DP=1983;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1974;AA=4;SR=956|1018;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 860 20 117769 . A G 3.93 PASS NS=358;DP=1977;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1968;AA=4;SR=942|1026;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 861 20 117770 . C T 1.74 PASS NS=359;DP=1977;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1969;AA=2;SR=938|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 862 20 117892 . C T 99.0 PASS NS=363;DP=2099;AC=4;AN=726;AF=0.0055096;RA=2082;AA=14;SR=1169|913;SA=6|8;SB=0.42857;AB=0.56667;ABR=17;ABA=13;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 863 20 117925 . G C 3.85 PASS NS=367;DP=2130;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2121;AA=2;SR=1246|875;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 864 20 117968 . G A 69.7 PASS NS=362;DP=2113;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=9;SR=1143|951;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=3;ABA=6;RUN=2;SNP;TS | |
| 865 20 117971 . T C 0.191 PASS NS=361;DP=2106;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2096;AA=4;SR=1139|957;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 866 20 118008 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2249;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=1978;AA=264;SR=1025|953;SA=161|103;SB=0.60985;AB=0.51459;ABR=194;ABA=183;RUN=1;SNP;TS | |
| 867 20 118034 . A G 43.1 PASS NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2262;AA=8;SR=1177|1085;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 868 20 118087 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2284;AC=95;AN=732;AF=0.12978;RA=1966;AA=308;SR=1170|796;SA=194|114;SB=0.62987;AB=0.51454;ABR=230;ABA=214;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 869 20 118150 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2270;AC=96;AN=732;AF=0.13115;RA=1946;AA=312;SR=1208|738;SA=191|121;SB=0.61218;AB=0.50302;ABR=250;ABA=246;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 870 20 118166 . C T 75.1 PASS NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2268;AA=8;SR=1313|955;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 871 20 118169 . T C 0.287 PASS NS=369;DP=2281;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2254;AA=14;SR=1275|979;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 872 20 118222 . A G 99.0 PASS NS=367;DP=2462;AC=20;AN=734;AF=0.027248;RA=2368;AA=84;SR=1080|1288;SA=41|43;SB=0.4881;AB=0.47134;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 873 20 118249 . C A 2.99 PASS NS=369;DP=2568;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2555;AA=6;SR=1170|1385;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 874 20 118252 . T C 41.3 PASS NS=369;DP=2588;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2562;AA=10;SR=1173|1389;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 875 20 118410 . T C 99.0 PASS NS=366;DP=2417;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2365;AA=26;SR=1156|1209;SA=17|9;SB=0.65385;AB=0.52174;ABR=12;ABA=11;RUN=1;SNP;TS | |
| 876 20 118477 . G C 40.1 PASS NS=368;DP=2524;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2501;AA=9;SR=1136|1365;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 877 20 118525 . T A 0.143 PASS NS=369;DP=2559;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2528;AA=5;SR=1373|1155;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 878 20 118535 . G A 99.0 PASS NS=370;DP=2547;AC=25;AN=740;AF=0.033784;RA=2432;AA=98;SR=1401|1031;SA=47|51;SB=0.47959;AB=0.51872;ABR=97;ABA=89;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 879 20 118618 . C T 1.78 PASS NS=367;DP=2563;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2546;AA=3;SR=1375|1171;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 880 20 118657 . C T 0.168 PASS NS=368;DP=2612;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2602;AA=3;SR=1428|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 881 20 118780 . T C 0.605 PASS NS=368;DP=2715;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2696;AA=6;SR=1421|1275;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 882 20 118803 . C T 2.66 PASS NS=370;DP=2742;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2728;AA=4;SR=1422|1306;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 883 20 118878 . C A 4.89 PASS NS=371;DP=2432;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2419;AA=6;SR=1178|1241;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 884 20 118954 . G A 0.29 PASS NS=357;DP=2361;AC=3;AN=714;AF=0.0042017;RA=2337;AA=8;SR=1048|1289;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS | |
| 885 20 118963 . C T 0.62 PASS NS=359;DP=2420;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2411;AA=4;SR=1067|1344;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 886 20 118973 . G C 1.48 PASS NS=365;DP=2459;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2422;AA=13;SR=1098|1324;SA=7|6;SB=0.53846;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TV | |
| 887 20 119005 . A C 0.0651 PASS NS=368;DP=2535;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2503;AA=21;SR=1147|1356;SA=19|2;SB=0.90476;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 888 20 119035 . G C 1.82 PASS NS=366;DP=2461;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2443;AA=8;SR=1160|1283;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 889 20 119056 . A C 99.0 PASS NS=368;DP=2408;AC=22;AN=736;AF=0.029891;RA=2343;AA=61;SR=1089|1254;SA=30|31;SB=0.4918;AB=0.57895;ABR=77;ABA=55;RUN=4;SNP;TV | |
| 890 20 119085 . G T 11.6 PASS NS=369;DP=2362;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=3;SR=1098|1255;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 891 20 119295 . C T 5.3 PASS NS=370;DP=2159;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2150;AA=7;SR=909|1241;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 892 20 119420 . A G 2.58 PASS NS=365;DP=2001;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1996;AA=3;SR=955|1041;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 893 20 119421 . A G 72.7 PASS NS=366;DP=2005;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=1990;AA=10;SR=951|1039;SA=5|5;SB=0.5;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS | |
| 894 20 119496 . C A 0.46 PASS NS=355;DP=1848;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1840;AA=5;SR=837|1003;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=5;SNP;TV | |
| 895 20 119518 . C T 0.149 PASS NS=356;DP=1941;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1932;AA=2;SR=900|1032;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 896 20 119534 . A G 99.0 PASS NS=360;DP=2109;AC=39;AN=720;AF=0.054167;RA=1989;AA=114;SR=879|1110;SA=47|67;SB=0.41228;AB=0.47396;ABR=91;ABA=101;RUN=3;SNP;TS | |
| 897 20 119596 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2103;AC=39;AN=732;AF=0.053279;RA=2004;AA=97;SR=874|1130;SA=41|56;SB=0.42268;AB=0.54706;ABR=93;ABA=76;RUN=1;SNP;TS | |
| 898 20 119599 . A T 4.27 PASS NS=365;DP=2081;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2067;AA=5;SR=906|1161;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 899 20 119714 . G A 0.547 PASS NS=314;DP=1079;AC=1;AN=628;AF=0.0015924;RA=1068;AA=6;SR=496|572;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 900 20 119730 . A G 99.0 PASS NS=308;DP=1035;AC=49;AN=616;AF=0.079545;RA=956;AA=69;SR=376|580;SA=24|45;SB=0.34783;AB=0.52427;ABR=54;ABA=48;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 901 20 119734 . T C 4.93 PASS NS=310;DP=1053;AC=1;AN=620;AF=0.0016129;RA=1034;AA=10;SR=379|655;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS | |
| 902 20 119897 . T C 0.0526 PASS NS=263;DP=770;AC=1;AN=526;AF=0.0019011;RA=760;AA=7;SR=349|411;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 903 20 119918 . A G 44.3 PASS NS=294;DP=924;AC=3;AN=588;AF=0.005102;RA=911;AA=11;SR=340|571;SA=2|9;SB=0.18182;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS | |
| 904 20 119945 . T C 0.0906 PASS NS=335;DP=1320;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1312;AA=3;SR=458|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 905 20 119983 . T C 18.0 PASS NS=351;DP=1675;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1664;AA=4;SR=800|864;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 906 20 119986 . T A 99.0 PASS NS=348;DP=1647;AC=34;AN=696;AF=0.048851;RA=1580;AA=64;SR=781|799;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.55046;ABR=60;ABA=49;RUN=3;SNP;TV | |
| 907 20 119992 . A T 0.112 PASS NS=348;DP=1643;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1632;AA=3;SR=839|793;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 908 20 120093 . T C 99.0 PASS NS=336;DP=1402;AC=35;AN=672;AF=0.052083;RA=1335;AA=61;SR=744|591;SA=39|22;SB=0.63934;AB=0.53153;ABR=59;ABA=52;RUN=1;SNP;TS | |
| 909 20 120127 . T C 99.0 PASS NS=345;DP=1541;AC=39;AN=690;AF=0.056522;RA=1447;AA=87;SR=872|575;SA=51|36;SB=0.58621;AB=0.47436;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS | |
| 910 20 120210 . G C 99.0 PASS NS=366;DP=2009;AC=16;AN=732;AF=0.021858;RA=1951;AA=51;SR=1192|759;SA=31|20;SB=0.60784;AB=0.44595;ABR=33;ABA=40;RUN=1;SNP;TV | |
| 911 20 120234 . C A 99.0 PASS NS=363;DP=1980;AC=21;AN=726;AF=0.028926;RA=1914;AA=62;SR=1162|752;SA=31|31;SB=0.5;AB=0.53982;ABR=61;ABA=52;RUN=6;SNP;TV | |
| 912 20 120289 . T C 1.51 PASS NS=359;DP=2131;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2120;AA=4;SR=1226|894;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 913 20 120327 . A G 99.0 PASS NS=365;DP=2183;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2172;AA=9;SR=1158|1014;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 914 20 120353 . T C 99.0 PASS NS=361;DP=2069;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=2029;AA=35;SR=1056|973;SA=16|19;SB=0.45714;AB=0.34043;ABR=16;ABA=31;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 915 20 120463 . T C 0.168 PASS NS=357;DP=2200;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2187;AA=4;SR=1102|1085;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 916 20 120464 . T C 0.96 PASS NS=357;DP=2188;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2158;AA=17;SR=1089|1069;SA=3|14;SB=0.17647;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 917 20 120471 . A G 99.0 PASS NS=355;DP=2155;AC=292;AN=710;AF=0.41127;RA=1332;AA=818;SR=667|665;SA=419|399;SB=0.51222;AB=0.50122;ABR=411;ABA=408;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 918 20 120487 . A G 0.161 PASS NS=361;DP=2223;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2217;AA=2;SR=1044|1173;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 919 20 120491 . G A 2.04 PASS NS=361;DP=2213;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2201;AA=3;SR=1022|1179;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS | |
| 920 20 120534 . T A 2.45 PASS NS=366;DP=2334;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2317;AA=6;SR=1093|1224;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 921 20 120535 . G A 3.2 PASS NS=366;DP=2332;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2321;AA=5;SR=1104|1217;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 922 20 120553 . G A 99.0 PASS NS=363;DP=2295;AC=38;AN=726;AF=0.052342;RA=2196;AA=93;SR=1087|1109;SA=46|47;SB=0.49462;AB=0.5509;ABR=92;ABA=75;RUN=1;SNP;TS | |
| 923 20 120746 . A G 0.107 PASS NS=356;DP=2078;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2073;AA=3;SR=1040|1033;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 924 20 120761 . A G 4.72 PASS NS=360;DP=2025;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=2013;AA=7;SR=1011|1002;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 925 20 120863 . T C 7.31 PASS NS=356;DP=2117;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2108;AA=2;SR=1114|994;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 926 20 120911 . T C 4.66 PASS NS=364;DP=2171;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2152;AA=3;SR=1110|1042;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 927 20 121040 . C T 0.0497 PASS NS=351;DP=2064;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=2047;AA=3;SR=1039|1008;SA=3|0;SB=1;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS | |
| 928 20 121125 . A G 2.32 PASS NS=362;DP=2128;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2124;AA=3;SR=1089|1035;SA=3|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 929 20 121188 . G A 99.0 PASS NS=363;DP=1947;AC=35;AN=726;AF=0.048209;RA=1842;AA=103;SR=897|945;SA=51|52;SB=0.49515;AB=0.4069;ABR=59;ABA=86;RUN=2;SNP;TS | |
| 930 20 121235 . C T 0.234 PASS NS=360;DP=1946;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1935;AA=3;SR=820|1115;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 931 20 121288 . G A 43.3 PASS NS=364;DP=2030;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2021;AA=5;SR=756|1265;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 932 20 121310 . A C 99.0 PASS NS=358;DP=1910;AC=195;AN=716;AF=0.27235;RA=1431;AA=477;SR=602|829;SA=212|265;SB=0.44444;AB=0.52581;ABR=326;ABA=294;RUN=1;SNP;TV | |
| 933 20 121478 . C A 99.0 PASS NS=332;DP=1073;AC=248;AN=664;AF=0.37349;RA=685;AA=338;SR=373|312;SA=200|138;SB=0.59172;AB=0.49371;ABR=157;ABA=143;RUN=1;SNP;TV | |
| 934 20 121493 . C T 99.0 PASS NS=304;DP=848;AC=120;AN=608;AF=0.19737;RA=641;AA=202;SR=285|356;SA=94|108;SB=0.46535;AB=0.59302;ABR=204;ABA=137;RUN=18;SNP;TS | |
| 935 20 121543 . C T 73.2 PASS NS=355;DP=1309;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1270;AA=6;SR=571|699;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS | |
| 936 20 121609 . G C 99.0 PASS NS=362;DP=1963;AC=22;AN=724;AF=0.030387;RA=1886;AA=71;SR=987|899;SA=41|30;SB=0.57746;AB=0.496;ABR=62;ABA=63;RUN=1;SNP;TV | |
| 937 20 121682 . C A 2.49 PASS NS=361;DP=1952;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1941;AA=6;SR=1070|871;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 938 20 121727 . T C 0.137 PASS NS=365;DP=2073;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2064;AA=4;SR=1229|835;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 939 20 121761 . G A 0.814 PASS NS=363;DP=1992;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1983;AA=4;SR=1067|916;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 940 20 121787 . A G 5.77 PASS NS=368;DP=1959;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1946;AA=6;SR=952|994;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 941 20 121824 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=1902;AC=299;AN=732;AF=0.40847;RA=1098;AA=764;SR=470|628;SA=353|411;SB=0.46204;AB=0.48175;ABR=330;ABA=346;RUN=1;SNP;TS | |
| 942 20 121975 . C T 0.0658 PASS NS=368;DP=2209;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2200;AA=2;SR=1147|1053;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 943 20 121976 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2174;AC=320;AN=736;AF=0.43478;RA=1282;AA=888;SR=680|602;SA=467|421;SB=0.5259;AB=0.50249;ABR=404;ABA=399;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 944 20 121986 . A G 29.8 PASS NS=366;DP=2153;AC=4;AN=732;AF=0.0054645;RA=2143;AA=7;SR=1159|984;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69565;ABR=16;ABA=7;RUN=1;SNP;TS | |
| 945 20 122072 . T C 0.195 PASS NS=369;DP=2181;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2151;AA=13;SR=1122|1029;SA=13|0;SB=1;AB=0.76;ABR=19;ABA=6;RUN=1;SNP;TS | |
| 946 20 122202 . C T 2.54 PASS NS=365;DP=2275;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2262;AA=3;SR=1021|1241;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 947 20 122214 . A T 0.559 PASS NS=368;DP=2327;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2321;AA=5;SR=1038|1283;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 948 20 122337 . A G 13.1 PASS NS=370;DP=2216;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2208;AA=4;SR=1130|1078;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 949 20 122411 . C T 1.75 PASS NS=366;DP=2162;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2155;AA=3;SR=1002|1153;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 950 20 122505 . T G 99.0 PASS NS=358;DP=2049;AC=24;AN=716;AF=0.03352;RA=1985;AA=61;SR=948|1037;SA=23|38;SB=0.37705;AB=0.48936;ABR=46;ABA=48;RUN=1;SNP;TV | |
| 951 20 122508 . G A 99.0 PASS NS=358;DP=2024;AC=118;AN=716;AF=0.1648;RA=1718;AA=301;SR=831|887;SA=133|168;SB=0.44186;AB=0.51299;ABR=237;ABA=224;RUN=4;SNP;TS | |
| 952 20 122511 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2032;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=1967;AA=59;SR=932|1035;SA=27|32;SB=0.45763;AB=0.39706;ABR=27;ABA=41;RUN=2;SNP;TS | |
| 953 20 122548 . C T 99.0 PASS NS=356;DP=1990;AC=37;AN=712;AF=0.051966;RA=1899;AA=86;SR=950|949;SA=49|37;SB=0.56977;AB=0.51471;ABR=70;ABA=66;RUN=6;SNP;TS | |
| 954 20 122637 . G T 0.0819 PASS NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2003;AA=14;SR=955|1048;SA=6|8;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=2;SNP;TV | |
| 955 20 122706 . G A 13.0 PASS NS=362;DP=2089;AC=3;AN=724;AF=0.0041436;RA=2063;AA=10;SR=944|1119;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.4375;ABR=7;ABA=9;RUN=5;SNP;TS | |
| 956 20 122770 . T C 0.0898 PASS NS=359;DP=2007;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2001;AA=3;SR=951|1050;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 957 20 122897 . C G 63.7 PASS NS=367;DP=2167;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2145;AA=11;SR=1277|868;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TV | |
| 958 20 122913 . G C 33.5 PASS NS=368;DP=2131;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2115;AA=7;SR=1201|914;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TV | |
| 959 20 122977 . T A 0.153 PASS NS=368;DP=2071;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2056;AA=6;SR=1062|994;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=10;ABA=4;RUN=4;SNP;TV | |
| 960 20 122995 . C G 0.222 PASS NS=368;DP=2170;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1124|1034;SA=3|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 961 20 123021 . C T 0.0437 PASS NS=368;DP=2290;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2281;AA=4;SR=1221|1060;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=3;SNP;TS | |
| 962 20 123037 . T C 99.0 PASS NS=367;DP=2305;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2285;AA=13;SR=1267|1018;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.63333;ABR=19;ABA=11;RUN=2;SNP;TS | |
| 963 20 123073 . C T 0.404 PASS NS=371;DP=2357;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2341;AA=7;SR=1293|1048;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 964 20 123251 . T C 71.0 PASS NS=363;DP=2413;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2393;AA=10;SR=1226|1167;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS | |
| 965 20 123318 . T C 99.0 PASS NS=367;DP=2371;AC=24;AN=734;AF=0.032698;RA=2289;AA=73;SR=1174|1115;SA=41|32;SB=0.56164;AB=0.5;ABR=56;ABA=56;RUN=1;SNP;TS | |
| 966 20 123404 . T A 6.08 PASS NS=365;DP=2328;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=6;SR=1114|1190;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 967 20 123499 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2330;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2298;AA=18;SR=1062|1236;SA=6|12;SB=0.33333;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=2;SNP;TS | |
| 968 20 123500 . A G 0.191 PASS NS=367;DP=2342;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2317;AA=13;SR=1062|1255;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG | |
| 969 20 123513 . A G 1.47 PASS NS=368;DP=2373;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2358;AA=5;SR=1071|1287;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS | |
| 970 20 123556 . C G 7.19 PASS NS=371;DP=2383;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2370;AA=6;SR=1058|1312;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 971 20 123564 . T C 0.229 PASS NS=372;DP=2373;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2348;AA=10;SR=1045|1303;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.72727;ABR=8;ABA=2;RUN=5;SNP;TS | |
| 972 20 123809 . A T 0.953 PASS NS=356;DP=1910;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1896;AA=7;SR=843|1053;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=2;SNP;TV | |
| 973 20 123979 . C A 0.314 PASS NS=363;DP=2152;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2141;AA=3;SR=1118|1023;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 974 20 124059 . C T 37.8 PASS NS=358;DP=1984;AC=3;AN=716;AF=0.0041899;RA=1971;AA=7;SR=971|1000;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 975 20 124060 . G A 34.6 PASS NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1983;AA=3;SR=995|988;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG | |
| 976 20 124137 . C A 0.0701 PASS NS=357;DP=1933;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1922;AA=4;SR=990|932;SA=0|4;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=2;SNP;TV | |
| 977 20 124148 . A G 0.344 PASS NS=358;DP=1957;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1947;AA=6;SR=989|958;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 978 20 124229 . T C 0.672 PASS NS=356;DP=1979;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1972;AA=4;SR=1025|947;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 979 20 124230 . A G 0.0816 PASS NS=356;DP=1970;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1959;AA=4;SR=1026|933;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 980 20 124249 . A G 99.0 PASS NS=359;DP=1969;AC=41;AN=718;AF=0.057103;RA=1864;AA=101;SR=974|890;SA=55|46;SB=0.54455;AB=0.51977;ABR=92;ABA=85;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 981 20 124302 . A C 99.0 PASS NS=358;DP=2007;AC=319;AN=716;AF=0.44553;RA=1185;AA=819;SR=577|608;SA=392|427;SB=0.47863;AB=0.51934;ABR=376;ABA=348;RUN=2;SNP;TV | |
| 982 20 124335 . C T 99.0 PASS NS=361;DP=2035;AC=4;AN=722;AF=0.0055402;RA=2013;AA=15;SR=929|1084;SA=10|5;SB=0.66667;AB=0.3913;ABR=9;ABA=14;RUN=1;SNP;TS | |
| 983 20 124412 . C T 99.0 PASS NS=357;DP=2005;AC=307;AN=714;AF=0.42997;RA=1207;AA=795;SR=602|605;SA=400|395;SB=0.50314;AB=0.51286;ABR=379;ABA=360;RUN=1;SNP;TS | |
| 984 20 124511 . T A 0.647 PASS NS=365;DP=2141;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2133;AA=4;SR=1077|1056;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TV | |
| 985 20 124607 . A G 2.28 PASS NS=357;DP=1872;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1865;AA=2;SR=930|935;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 986 20 124737 . A C 99.0 PASS NS=367;DP=2024;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2003;AA=16;SR=1046|957;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.26316;ABR=5;ABA=14;RUN=1;SNP;TV | |
| 987 20 124827 . T C 1.7 PASS NS=367;DP=2059;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2048;AA=4;SR=987|1061;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 988 20 124848 . A G 36.5 PASS NS=364;DP=2077;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2060;AA=6;SR=966|1094;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS | |
| 989 20 124878 . G A 0.22 PASS NS=361;DP=2060;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2049;AA=4;SR=974|1075;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 990 20 124920 . A G 76.0 PASS NS=361;DP=1956;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1949;AA=6;SR=984|965;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG | |
| 991 20 124942 . A T 1.44 PASS NS=362;DP=2015;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2007;AA=4;SR=1107|900;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 992 20 124998 . T C 99.0 PASS NS=366;DP=2204;AC=29;AN=732;AF=0.039617;RA=2131;AA=66;SR=1132|999;SA=36|30;SB=0.54545;AB=0.54902;ABR=56;ABA=46;RUN=1;SNP;TS | |
| 993 20 125096 . C G 4.18 PASS NS=363;DP=2095;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2082;AA=2;SR=1071|1011;SA=2|0;SB=1;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 994 20 125109 . A T 0.0858 PASS NS=365;DP=2091;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2080;AA=7;SR=1103|977;SA=7|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=8;SNP;TV | |
| 995 20 125121 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=2075;AC=208;AN=728;AF=0.28571;RA=1472;AA=599;SR=826|646;SA=335|264;SB=0.55927;AB=0.49868;ABR=377;ABA=378;RUN=1;SNP;TS | |
| 996 20 125179 . C A 99.0 PASS NS=368;DP=2155;AC=7;AN=736;AF=0.0095109;RA=2127;AA=26;SR=1123|1004;SA=16|10;SB=0.61538;AB=0.36842;ABR=14;ABA=24;RUN=2;SNP;TV | |
| 997 20 125266 . T A 3.47 PASS NS=364;DP=2138;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2123;AA=5;SR=907|1216;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TV | |
| 998 20 125381 . A G 4.69 PASS NS=362;DP=2102;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=3;SR=919|1175;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS | |
| 999 20 125450 . G A 0.364 PASS NS=359;DP=1881;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1868;AA=5;SR=862|1006;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS | |
| 1000 20 125470 . A G 0.602 PASS NS=360;DP=1870;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1855;AA=5;SR=909|946;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS |