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file AddOrReplaceReadGroups.xml 12458 -rw-r--r--
file all_fasta.loc.sample 828 -rw-r--r--
file cleansamwrapper.sh 84 -rw-r--r--
file fastq2sam_wrapper.sh 281 -rw-r--r--
file generic_outformat_wrapper.sh 88 -rw-r--r--
file igvtools.jar 10497673 -rw-r--r--
file mergebamalignment_wrapper.sh 234 -rw-r--r--
file mergesam_wrapper.sh 94 -rw-r--r--
file mergevcf_wrapper.sh 315 -rw-r--r--
file normalizefasta_wrapper.sh 97 -rw-r--r--
file picard_CleanSam.xml 1242 -rw-r--r--
file picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml 11538 -rw-r--r--
file picard_CollectRnaSeqMetrics.xml 5727 -rw-r--r--
file picard_DownsampleSam.xml 2947 -rw-r--r--
file picard_EstimLibComplexity.xml 7668 -rw-r--r--
file picard_FastqToSam.xml 7041 -rw-r--r--
file picard_FilterSamReads.xml 5323 -rw-r--r--
file picard_FixMateInformation.xml 4267 -rw-r--r--
file picard_GCBiasMetrics.xml 9256 -rw-r--r--
file picard_InsertSizeMetrics.xml 4702 -rw-r--r--
file picard_MarkDuplicates.xml 7017 -rw-r--r--
file picard_MeanQualityByCycle.xml 3171 -rw-r--r--
file picard_MergeBamAlignment.xml 11853 -rw-r--r--
file picard_MergeSam.xml 2829 -rw-r--r--
file picard_MergeVcfs.xml 2089 -rw-r--r--
file picard_NormalizeFasta.xml 2606 -rw-r--r--
file picard_ReorderSam.xml 8301 -rw-r--r--
file picard_ReplaceSamHeader.xml 4580 -rw-r--r--
file picard_SamToFastq.xml 12247 -rw-r--r--
file picard_SamToFastq_wrapper.py 4642 -rw-r--r--
file picard_SortSam.xml 1887 -rw-r--r--
file picard_index.loc.sample 1050 -rw-r--r--
file picard_wrapper.py 40022 -rw-r--r--
file simple_wrapper.sh 52 -rw-r--r--
file tool_data_table_conf.xml.sample 4785 -rw-r--r--
file tool_dependencies.xml 830 -rw-r--r--