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picard1106
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767bcb0a06df
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test-data/
drwxr-xr-x
AddOrReplaceReadGroups.xml
12458
-rw-r--r--
all_fasta.loc.sample
828
-rw-r--r--
cleansamwrapper.sh
84
-rw-r--r--
fastq2sam_wrapper.sh
281
-rw-r--r--
generic_outformat_wrapper.sh
88
-rw-r--r--
igvtools.jar
10497673
-rw-r--r--
mergebamalignment_wrapper.sh
234
-rw-r--r--
mergesam_wrapper.sh
94
-rw-r--r--
mergevcf_wrapper.sh
315
-rw-r--r--
normalizefasta_wrapper.sh
97
-rw-r--r--
picard_CleanSam.xml
1242
-rw-r--r--
picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
11538
-rw-r--r--
picard_CollectRnaSeqMetrics.xml
5727
-rw-r--r--
picard_DownsampleSam.xml
2947
-rw-r--r--
picard_EstimLibComplexity.xml
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-rw-r--r--
picard_FastqToSam.xml
7041
-rw-r--r--
picard_FilterSamReads.xml
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-rw-r--r--
picard_FixMateInformation.xml
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-rw-r--r--
picard_GCBiasMetrics.xml
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-rw-r--r--
picard_InsertSizeMetrics.xml
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picard_SamToFastq.xml
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picard_SamToFastq_wrapper.py
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picard_SortSam.xml
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picard_index.loc.sample
1050
-rw-r--r--
picard_wrapper.py
40022
-rw-r--r--
simple_wrapper.sh
52
-rw-r--r--
tool_data_table_conf.xml.sample
4785
-rw-r--r--
tool_dependencies.xml
830
-rw-r--r--