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picard1106
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67f1ec3ab183
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test-data/
drwxr-xr-x
AddOrReplaceReadGroups.xml
12458
-rw-r--r--
all_fasta.loc.sample
828
-rw-r--r--
cleansamwrapper.sh
84
-rw-r--r--
fastq2sam_wrapper.sh
281
-rw-r--r--
generic_outformat_wrapper.sh
88
-rw-r--r--
mergebamalignment_wrapper.sh
234
-rw-r--r--
mergesam_wrapper.sh
94
-rw-r--r--
mergevcf_wrapper.sh
315
-rw-r--r--
normalizefasta_wrapper.sh
97
-rw-r--r--
picard_CleanSam.xml
1242
-rw-r--r--
picard_CollectAlignmentSummaryMetrics.xml
11514
-rw-r--r--
picard_DownsampleSam.xml
2524
-rw-r--r--
picard_EstimLibComplexity.xml
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-rw-r--r--
picard_FastqToSam.xml
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-rw-r--r--
picard_FilterSamReads.xml
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-rw-r--r--
picard_FixMateInformation.xml
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-rw-r--r--
picard_GCBiasMetrics.xml
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-rw-r--r--
picard_InsertSizeMetrics.xml
4702
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picard_MeanQualityByCylce.xml
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picard_ReplaceSamHeader.xml
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picard_SortSam.xml
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picard_index.loc.sample
1050
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picard_wrapper.py
37122
-rw-r--r--
simple_wrapper.sh
52
-rw-r--r--
tool_data_table_conf.xml.sample
4785
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tool_dependencies.xml
830
-rw-r--r--