Mercurial > repos > devteam > ncbi_blast_plus
view test-data/blastn_chimera_vs_three_human_max1.txt @ 5:188d2aca045b draft
Uploaded v0.1.04, fix regression with BLAST database from history
| author | peterjc |
|---|---|
| date | Wed, 22 Jul 2015 04:58:58 -0400 |
| parents | 432ea9614cc9 |
| children | 0e86300e49c0 |
line wrap: on
line source
BLASTN 2.2.30+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Just 3 human mRNA sequences 3 sequences; 10,732 total letters Query= chimera chunks of AB011145 plus M10051 plus BC112106 Length=9973 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein,... 8421 0.0 > ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein, partial cds. Length=4796 Score = 8421 bits (4560), Expect = 0.0 Identities = 4560/4560 (100%), Gaps = 0/4560 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC 180 Query 61 CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA 240 Query 121 TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC 300 Query 181 TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT 360 Query 241 TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA 420 Query 301 CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA 480 Query 361 TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA 540 Query 421 CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC 600 Query 481 TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA 660 Query 541 TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT 720 Query 601 TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG 780 Query 661 GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA 840 Query 721 TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA 900 Query 781 ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG 960 Query 841 TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA 1020 Query 901 CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC 1080 Query 961 AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT 1140 Query 1021 CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA 1200 Query 1081 ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC 1260 Query 1141 CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA 1320 Query 1201 TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG 1380 Query 1261 CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC 1440 Query 1321 TATGTGTatttttattttgaataaacagaaagaaattttgggtttttaatttttttCTCC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 TATGTGTATTTTTATTTTGAATAAACAGAAAGAAATTTTGGGTTTTTAATTTTTTTCTCC 1500 Query 1381 CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTaaaaaaaaaaaaaCCTGCTA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTAAAAAAAAAAAAACCTGCTA 1560 Query 1441 GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT 1620 Query 1501 ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA 1680 Query 1561 GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT 1740 Query 1621 CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT 1800 Query 1681 GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA 1860 Query 1741 TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTAtttttttGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTATTTTTTTGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA 1920 Query 1801 CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA 1980 Query 1861 AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG 2040 Query 1921 GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG 2100 Query 1981 AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT 2160 Query 2041 TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT 2220 Query 2101 TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACtt 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACTT 2280 Query 2161 tttttCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 TTTTTCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG 2340 Query 2221 CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2341 CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA 2400 Query 2281 CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT 2460 Query 2341 TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2461 TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC 2520 Query 2401 TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2521 TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT 2580 Query 2461 GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2581 GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT 2640 Query 2521 AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT 2580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2641 AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT 2700 Query 2581 TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT 2640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2701 TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT 2760 Query 2641 GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2761 GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT 2820 Query 2701 TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA 2760 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2821 TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA 2880 Query 2761 GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA 2820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2881 GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA 2940 Query 2821 TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA 2880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2941 TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA 3000 Query 2881 TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT 2940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3001 TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT 3060 Query 2941 AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT 3000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3061 AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT 3120 Query 3001 TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT 3060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3121 TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT 3180 Query 3061 ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT 3120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3181 ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT 3240 Query 3121 GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA 3180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3241 GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA 3300 Query 3181 GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT 3240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3301 GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT 3360 Query 3241 GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT 3300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3361 GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT 3420 Query 3301 TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT 3360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3421 TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT 3480 Query 3361 TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT 3420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3481 TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT 3540 Query 3421 AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG 3480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3541 AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG 3600 Query 3481 AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC 3540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3601 AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC 3660 Query 3541 TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT 3600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3661 TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT 3720 Query 3601 CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA 3660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3721 CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA 3780 Query 3661 GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT 3720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3781 GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT 3840 Query 3721 TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT 3780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3841 TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT 3900 Query 3781 GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT 3840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3901 GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT 3960 Query 3841 TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG 3900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3961 TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG 4020 Query 3901 GCCTTGTGTGCCAGACTAAGGGGTTTGTAGTATATATTGTAGGCAGAAGAGATCCATCAA 3960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4021 GCCTTGTGTGCCAGACTAAGGGGTTTGTAGTATATATTGTAGGCAGAAGAGATCCATCAA 4080 Query 3961 CAGATTGCAAGCAAGGAAGTATGTTCACTTTAAAGTTTGAGAAAGAATAGTGTGGAAGCA 4020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4081 CAGATTGCAAGCAAGGAAGTATGTTCACTTTAAAGTTTGAGAAAGAATAGTGTGGAAGCA 4140 Query 4021 CGTCTCAAATTTAGACTTACTTGTTCCCCCTCTGAACCGTGAATCAGACCATTTCAGGTA 4080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4141 CGTCTCAAATTTAGACTTACTTGTTCCCCCTCTGAACCGTGAATCAGACCATTTCAGGTA 4200 Query 4081 GAAGTCTTCCCCGGTTTATCTGATCTACTCGGGGCCTCAGGCTTCTCAGCTGGGAAGAGA 4140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4201 GAAGTCTTCCCCGGTTTATCTGATCTACTCGGGGCCTCAGGCTTCTCAGCTGGGAAGAGA 4260 Query 4141 GGATGCAAGACCAGACTGAAGAACACGGTTGAGTCCCCAGAACCAAAAGGGGGCCTTTCT 4200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4261 GGATGCAAGACCAGACTGAAGAACACGGTTGAGTCCCCAGAACCAAAAGGGGGCCTTTCT 4320 Query 4201 GCTTCTTAGCCAGCTACCTCTTCGAGTTTTTCAAATTGTGAGGGGGACCATAAAAGGATG 4260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4321 GCTTCTTAGCCAGCTACCTCTTCGAGTTTTTCAAATTGTGAGGGGGACCATAAAAGGATG 4380 Query 4261 GAAACTTTTAGATGACATTCTACAAATTAtttttttCTTTAAATTAAAAGAACCTAGCCA 4320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4381 GAAACTTTTAGATGACATTCTACAAATTATTTTTTTCTTTAAATTAAAAGAACCTAGCCA 4440 Query 4321 ATAAGATAGAGAATGGGCATCTAAGGCATCTCAGAGCTCTCTGATGAAGCCAGGTTGTCA 4380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4441 ATAAGATAGAGAATGGGCATCTAAGGCATCTCAGAGCTCTCTGATGAAGCCAGGTTGTCA 4500 Query 4381 AAGATCATTTGCAAAAGAAGGGAAAACTGGCATGACAAAAGCTACAGAGAGGAGAGTGAA 4440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4501 AAGATCATTTGCAAAAGAAGGGAAAACTGGCATGACAAAAGCTACAGAGAGGAGAGTGAA 4560 Query 4441 ATATAGAAGTGTTTGAAATGTTCAAGCTCACAATAAGCTTAAATTTATAGAAAATGCTAA 4500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4561 ATATAGAAGTGTTTGAAATGTTCAAGCTCACAATAAGCTTAAATTTATAGAAAATGCTAA 4620 Query 4501 GGTTGTCAAGAAGGCttttttttttttcttttttAAACCTGAGGGCAAAAAGGAATGGAT 4560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4621 GGTTGTCAAGAAGGCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAAACCTGAGGGCAAAAAGGAATGGAT 4680 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 106299490 Database: Just 3 human mRNA sequences Posted date: Dec 26, 2014 5:54 AM Number of letters in database: 10,732 Number of sequences in database: 3 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5