Mercurial > repos > devteam > ncbi_blast_plus

diff test-data/blastn_chimera_vs_three_human_max1.txt @ 0:432ea9614cc9 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded v0.1.02 preview 1, using tool_data_table_conf.xml for loc files, etc
author peterjc
date Fri, 30 Jan 2015 08:27:28 -0500
parents
children 0e86300e49c0
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/blastn_chimera_vs_three_human_max1.txt	Fri Jan 30 08:27:28 2015 -0500
@@ -0,0 +1,356 @@
+BLASTN 2.2.30+
+
+
+Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb
+Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J
+Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14.
+
+
+
+Database: Just 3 human mRNA sequences
+           3 sequences; 10,732 total letters
+
+
+
+Query= chimera chunks of AB011145 plus M10051 plus BC112106
+
+Length=9973
+                                                                      Score     E
+Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value
+
+  ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein,...   8421   0.0  
+
+
+> ENA|AB011145|AB011145.1 Homo sapiens mRNA for KIAA0573 protein, 
+partial cds.
+Length=4796
+
+ Score =  8421 bits (4560),  Expect = 0.0
+ Identities = 4560/4560 (100%), Gaps = 0/4560 (0%)
+ Strand=Plus/Plus
+
+Query  1     GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC  60
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  121   GGACCCCAGCGTTACCATGCATCCTGCCGTCTTCCTATCCTTACCCGACCTCAGATGCTC  180
+
+Query  61    CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA  120
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  181   CCTTCTGCTCCTGGTAACTTGGGTTTTTACTCCTGTAACAACTGAAATAACAAGTCTTGA  240
+
+Query  121   TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC  180
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  241   TACAGAGAATATAGATGAAATTTTAAACAATGCTGATGTTGCTTTAGTAAATTTTTATGC  300
+
+Query  181   TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT  240
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  301   TGACTGGTGTCGTTTCAGTCAGATGTTGCATCCAATTTTTGAGGAAGCTTCCGATGTCAT  360
+
+Query  241   TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA  300
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  361   TAAGGAAGAATTTCCAAATGAAAATCAAGTAGTGTTTGCCAGAGTTGATTGTGATCAGCA  420
+
+Query  301   CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA  360
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  421   CTCTGACATAGCCCAGAGATACAGGATAAGCAAATACCCAACCCTCAAATTGTTTCGTAA  480
+
+Query  361   TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA  420
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  481   TGGGATGATGATGAAGAGAGAATACAGGGGTCAGCGATCAGTGAAAGCATTGGCAGATTA  540
+
+Query  421   CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC  480
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  541   CATCAGGCAACAAAAAAGTGACCCCATTCAAGAAATTCGGGACTTAGCAGAAATCACCAC  600
+
+Query  481   TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA  540
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  601   TCTTGATCGCAGCAAAAGAAATATCATTGGATATTTTGAGCAAAAGGACTCGGACAACTA  660
+
+Query  541   TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT  600
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  661   TAGAGTTTTTGAACGAGTAGCGAATATTTTGCATGATGACTGTGCCTTTCTTTCTGCATT  720
+
+Query  601   TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG  660
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  721   TGGGGATGTTTCAAAACCGGAAAGATATAGTGGCGACAACATAATCTACAAACCACCAGG  780
+
+Query  661   GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA  720
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  781   GCATTCTGCTCCGGATATGGTGTACTTGGGAGCTATGACAAATTTTGATGTGACTTACAA  840
+
+Query  721   TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA  780
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  841   TTGGATTCAAGATAAATGTGTTCCTCTTGTCCGAGAAATAACATTTGAAAATGGAGAGGA  900
+
+Query  781   ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG  840
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  901   ATTGACAGAAGAAGGACTGCCTTTTCTCATACTCTTTCACATGAAAGAAGATACAGAAAG  960
+
+Query  841   TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA  900
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  961   TTTAGAAATATTCCAGAATGAAGTAGCTCGGCAATTAATAAGTGAAAAAGGTACAATAAA  1020
+
+Query  901   CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC  960
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1021  CTTTTTACATGCCGATTGTGACAAATTTAGACATCCTCTTCTGCACATACAGAAAACTCC  1080
+
+Query  961   AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT  1020
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1081  AGCAGATTGTCCTGTAATCGCTATTGACAGCTTTAGGCATATGTATGTGTTTGGAGACTT  1140
+
+Query  1021  CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA  1080
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1141  CAAAGATGTATTAATTCCTGGAAAACTCAAGCAATTCGTATTTGACTTACATTCTGGAAA  1200
+
+Query  1081  ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC  1140
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1201  ACTGCACAGAGAATTCCATCATGGACCTGACCCAACTGATACAGCCCCAGGAGAGCAAGC  1260
+
+Query  1141  CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA  1200
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1261  CCAAGATGTAGCAAGCAGTCCACCTGAGAGCTCCTTCCAGAAACTAGCACCCAGTGAATA  1320
+
+Query  1201  TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG  1260
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1321  TAGGTATACTCTATTGAGGGATCGAGATGAGCTTTAAAAACTTGAAAAACAGTTTGTAAG  1380
+
+Query  1261  CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC  1320
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1381  CCTTTCAACAGCAGCATCAACCTACGTGGTGGAAATAGTAAACCTATATTTTCATAATTC  1440
+
+Query  1321  TATGTGTatttttattttgaataaacagaaagaaattttgggtttttaatttttttCTCC  1380
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1441  TATGTGTATTTTTATTTTGAATAAACAGAAAGAAATTTTGGGTTTTTAATTTTTTTCTCC  1500
+
+Query  1381  CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTaaaaaaaaaaaaaCCTGCTA  1440
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1501  CCGACTCAAAATGCATTGTCATTTAATATAGTAGCCTCTTAAAAAAAAAAAAACCTGCTA  1560
+
+Query  1441  GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT  1500
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1561  GGATTTAAAAATAAAAATCAGAGGCCTATCTCCACTTTAAATCTGTCCTGTAAAAGTTTT  1620
+
+Query  1501  ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA  1560
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1621  ATAAATCAAATGAAAGGTGACATTGCCAGAAACTTACCATTAACTTGCACTACTAGGGTA  1680
+
+Query  1561  GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT  1620
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1681  GGGAGGACTTAGGATGTTTCCTGTGTCGTATGTGCTTTTCTTTCTTTCATATGATCAATT  1740
+
+Query  1621  CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT  1680
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1741  CTGTTGGTATTTTCAGTATCTCATTTCTCAAAGCTAAAGAGATATACATTCTGGATACTT  1800
+
+Query  1681  GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA  1740
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1801  GGGAGGGGAATAAATTAAAGTTTTCACACTGTGTACTGTGTTTTACTGATTGGTTGGATA  1860
+
+Query  1741  TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTAtttttttGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA  1800
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1861  TTGCTTATGAAAATTCCATAGTGGTATTTTTTTGGATTCTTAATGTGTAACTTAAACATA  1920
+
+Query  1801  CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA  1860
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1921  CTTTGAAGTGGAGGAGAGTCATAAGACAGAACATTTGGCAGGAATTGTCCTTATGAAACA  1980
+
+Query  1861  AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG  1920
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  1981  AGAAAAAGAAAATGAAAAGTATTATTAAGCTTCTGTGTTTGTCTAAAAATGTGGCATATG  2040
+
+Query  1921  GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG  1980
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2041  GATGGCATTTAAAACTTTGAATGAATTATACCTAAATCTGGGACAGGGAGGTGACAGTGG  2100
+
+Query  1981  AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT  2040
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2101  AACAGGCTACCAATCAGAACTAGATGACTTTTAAGGCTCCTCCTATTATGAGACTTCAAT  2160
+
+Query  2041  TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT  2100
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2161  TTCCAAAGAGAAGAACTAGCAGAGAAATTGTATTTCAGTAATTTTAAGCTCCTTCTGTCT  2220
+
+Query  2101  TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACtt  2160
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2221  TGTAGAGTCTTGTTATAGTTGTATAAATCAAAAACACAGAATAAGGAACATATTTAACTT  2280
+
+Query  2161  tttttCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG  2220
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2281  TTTTTCATTATAAAATGGTTAGAGGACCCTACCCCCTCTAGATTCCCTGATTTCCCCAGG  2340
+
+Query  2221  CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA  2280
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2341  CCTGCAGCATACAGTAAGATGGGTCCCTGTGCCAGGCCTCAATACTGCCAGGGAATAAAA  2400
+
+Query  2281  CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT  2340
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2401  CCAGAGGGAGAGGACCCTCAGTGTCATATCAGGAAGCCCAGTGCCAGAGGACAGACAGGT  2460
+
+Query  2341  TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC  2400
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2461  TCAAAACTGGCTTTTCCTCTGGGCCTGGGTTGGTGCTATAGGCCAAGGGTCATTTTATAC  2520
+
+Query  2401  TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT  2460
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2521  TTGGGTATAAATCAATCCCAGTTTGGGAAAAGATTATTTTTAAGCTTAAAAGGCTGACAT  2580
+
+Query  2461  GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT  2520
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2581  GTGCCATTATATGTAGTATGTAATATATGTAACATCTTCCAATTCTTTTAAAATAAAATT  2640
+
+Query  2521  AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT  2580
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2641  AATATTTATAATGGATATTTAATGATTGTTATTTTTAAAAACCAGCTTATAATTCCTCGT  2700
+
+Query  2581  TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT  2640
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2701  TATGCATGATTTATCCAAAGTTTCCATAGTTTTATTCAAAATAATAAATGTTAATAAGGT  2760
+
+Query  2641  GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT  2700
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2761  GATAAGGGGTATATTTAATGTATTGTATCAAATTGTGAATAAGAAAGTAGGATGGAGCTT  2820
+
+Query  2701  TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA  2760
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2821  TCTAGAGGTTGGGCCTTAGTTCTGTTATCCTCATTGCTTTTAACCAATAAGTTAAATGAA  2880
+
+Query  2761  GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA  2820
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2881  GTTAGAGTTATGGTCTTCAGGTTAGATTATGGACCAGATCTGTGAGGGTCAGCATGGAAA  2940
+
+Query  2821  TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA  2880
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  2941  TTCACATTCAACAAGGTAGCACACAGGACCAAGAGCAGCACATGCAATCAACTGGAATAA  3000
+
+Query  2881  TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT  2940
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3001  TATAGTAATCCTGTAACTGGGTTTGAAAAAATAATCAACAAAAGATACAATTCAAGGGTT  3060
+
+Query  2941  AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT  3000
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3061  AGGTTGCAGAGAGCTGGCTTGAGAGTAGTTATTATGAAAAAGGCCTCAAGGAGTACGTGT  3120
+
+Query  3001  TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT  3060
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3121  TCAGTATGCTCTAAGATGATAAAGTGGCTGTTAAAAAGGGAGTTGATTTGAGGAAGTATT  3180
+
+Query  3061  ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT  3120
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3181  ACTTAGCATTCATGCATATTGGGCTTAGGCTCTAGCCCTGCCACTATCATTGTCTTCTCT  3240
+
+Query  3121  GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA  3180
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3241  GGACTGTGAAGTCACTGAGGACAAGGAAACTAAATTTAATGTCTGTATCACTAGTGCCTA  3300
+
+Query  3181  GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT  3240
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3301  GAATTTCTGGACACTTAGTAGTCACCATCAGGCGTTTATTTAATGAATGAGAAGCAAAGT  3360
+
+Query  3241  GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT  3300
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3361  GACCTTGGTTACTTTTTTACCCTGAGGGGCTCAGCACTCATTAGGACTTGGTGCCTAATT  3420
+
+Query  3301  TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT  3360
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3421  TTATAAAAAGTCACTAAGCTCAAGTGCTTGGATGAAAGGACAGCGTGGATAAAAAGGTTT  3480
+
+Query  3361  TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT  3420
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3481  TTAAAACATGGATGTTAAGGCTGTTTTGCTTGGAGAAGACTTGGGACTGGGACAGTCTTT  3540
+
+Query  3421  AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG  3480
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3541  AGATATTATTTGAAATGCTGGCACTGTCTATCTGGATCCCAGGGCTTGAACTAGGATTTG  3600
+
+Query  3481  AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC  3540
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3601  AGGAAGTCACAGGGAAGCAGATTTCAGTCTGACATTTATTCAGTGCAAGTTTTTTGGTGC  3660
+
+Query  3541  TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT  3600
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3661  TGTAGTATATGATGAAAGATGTAAAGCTGAATAAAGCATTATTTCTGCCCTAGAGTTGTT  3720
+
+Query  3601  CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA  3660
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3721  CACAGCCTAGTCAGGCATATGGATATGTAAACAATGACTGTAACGTGTTATAGATGTAAA  3780
+
+Query  3661  GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT  3720
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3781  GACAAAATAAAGGTTAAAGAGGGCATAAAGGAGCACTCAATTGCAGAGATTTGAGGACAT  3840
+
+Query  3721  TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT  3780
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3841  TATTTTTATTTTGAGCTTTAAAAAGATGAATAGGTGTTCTCAGGAGGTAGGGATCTGGCT  3900
+
+Query  3781  GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT  3840
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3901  GAGAGGGAATAATCTGAGCAAAGGTATGAAACAGCCTAATGCATTAGAGAAAAAAGTTCT  3960
+
+Query  3841  TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG  3900
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  3961  TTTAGTAAGGCATTTGGGGTTGGGGAAGCTAGAAAAAGAAATGGGAGCTGGTCACACAGG  4020
+
+Query  3901  GCCTTGTGTGCCAGACTAAGGGGTTTGTAGTATATATTGTAGGCAGAAGAGATCCATCAA  3960
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4021  GCCTTGTGTGCCAGACTAAGGGGTTTGTAGTATATATTGTAGGCAGAAGAGATCCATCAA  4080
+
+Query  3961  CAGATTGCAAGCAAGGAAGTATGTTCACTTTAAAGTTTGAGAAAGAATAGTGTGGAAGCA  4020
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4081  CAGATTGCAAGCAAGGAAGTATGTTCACTTTAAAGTTTGAGAAAGAATAGTGTGGAAGCA  4140
+
+Query  4021  CGTCTCAAATTTAGACTTACTTGTTCCCCCTCTGAACCGTGAATCAGACCATTTCAGGTA  4080
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4141  CGTCTCAAATTTAGACTTACTTGTTCCCCCTCTGAACCGTGAATCAGACCATTTCAGGTA  4200
+
+Query  4081  GAAGTCTTCCCCGGTTTATCTGATCTACTCGGGGCCTCAGGCTTCTCAGCTGGGAAGAGA  4140
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4201  GAAGTCTTCCCCGGTTTATCTGATCTACTCGGGGCCTCAGGCTTCTCAGCTGGGAAGAGA  4260
+
+Query  4141  GGATGCAAGACCAGACTGAAGAACACGGTTGAGTCCCCAGAACCAAAAGGGGGCCTTTCT  4200
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4261  GGATGCAAGACCAGACTGAAGAACACGGTTGAGTCCCCAGAACCAAAAGGGGGCCTTTCT  4320
+
+Query  4201  GCTTCTTAGCCAGCTACCTCTTCGAGTTTTTCAAATTGTGAGGGGGACCATAAAAGGATG  4260
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4321  GCTTCTTAGCCAGCTACCTCTTCGAGTTTTTCAAATTGTGAGGGGGACCATAAAAGGATG  4380
+
+Query  4261  GAAACTTTTAGATGACATTCTACAAATTAtttttttCTTTAAATTAAAAGAACCTAGCCA  4320
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4381  GAAACTTTTAGATGACATTCTACAAATTATTTTTTTCTTTAAATTAAAAGAACCTAGCCA  4440
+
+Query  4321  ATAAGATAGAGAATGGGCATCTAAGGCATCTCAGAGCTCTCTGATGAAGCCAGGTTGTCA  4380
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4441  ATAAGATAGAGAATGGGCATCTAAGGCATCTCAGAGCTCTCTGATGAAGCCAGGTTGTCA  4500
+
+Query  4381  AAGATCATTTGCAAAAGAAGGGAAAACTGGCATGACAAAAGCTACAGAGAGGAGAGTGAA  4440
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4501  AAGATCATTTGCAAAAGAAGGGAAAACTGGCATGACAAAAGCTACAGAGAGGAGAGTGAA  4560
+
+Query  4441  ATATAGAAGTGTTTGAAATGTTCAAGCTCACAATAAGCTTAAATTTATAGAAAATGCTAA  4500
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4561  ATATAGAAGTGTTTGAAATGTTCAAGCTCACAATAAGCTTAAATTTATAGAAAATGCTAA  4620
+
+Query  4501  GGTTGTCAAGAAGGCttttttttttttcttttttAAACCTGAGGGCAAAAAGGAATGGAT  4560
+             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+Sbjct  4621  GGTTGTCAAGAAGGCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAAACCTGAGGGCAAAAAGGAATGGAT  4680
+
+
+
+Lambda      K        H
+    1.33    0.621     1.12 
+
+Gapped
+Lambda      K        H
+    1.28    0.460    0.850 
+
+Effective search space used: 106299490
+
+
+  Database: Just 3 human mRNA sequences
+    Posted date:  Dec 26, 2014  5:54 AM
+  Number of letters in database: 10,732
+  Number of sequences in database:  3
+
+
+
+Matrix: blastn matrix 1 -2
+Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5