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diff test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack @ 14:27c43fb015f0 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 9844cae766e7471d9fa6b2e8356e5194e77f6753
| author | iuc |
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| date | Fri, 22 Jun 2018 03:24:29 -0400 |
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--- a/test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack Mon Apr 23 13:04:47 2018 -0400 +++ b/test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack Fri Jun 22 03:24:29 2018 -0400 @@ -1,4 +1,3 @@ - V R C L K Y L L L S L H R P Q F S * W L F1 F D A * N T F F C P Y T D H S F P N G F F2 @@ -6,11 +5,6 @@ gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt 10 20 30 40 50 60 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - caagctacggattttatggaagaaaacagggatgtgtctggtgtcaaaaggattaccgaa - T R H R F Y R R K D R C L G C N E * H S F6 - X E I G L I G E K T G V C V V T K R I A F5 - N S A * F V K K Q G * V S W L K G L P K F4 - Y T D * K F L C K H * L K A V G L E C Y F1 T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2 @@ -18,11 +12,6 @@ tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac 70 80 90 100 110 120 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - atgtggctgatctttaagaacacgttcgtgattaactttcgccaaccggatctcacaatg - * V S * F N K H L C * N F A T P R S H * F6 - K C R S S I R T C A S I S L P Q G L T N F5 - V G V L F E Q A L V L Q F R N A * L T V F4 - R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1 G L Y S * A R L L P * S K V H F L Y F G F2 @@ -30,11 +19,6 @@ cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg 130 140 150 160 170 180 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - gccaaacatatcgactcgcgcagagaacgggactagtttccaagtaaaagagatgaaacc - R N T Y S L A D R A R I L P E N E R S Q F6 - G T Q I A S R T E Q G S * L N M K E V K F5 - P K Y L Q A R R K G Q D F T * K R * K P F4 - K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1 R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2 @@ -42,11 +26,6 @@ aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg 190 200 210 220 230 240 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - ttctgcaacaccttcttatgttgttcatgctcagagaggggggaccaaacgactaatgac - F V N H F F V V L V L R E G R T Q Q N S F6 - S S T T S S Y L L Y S D R G G P K S I V F5 - L R Q P L I C C T R T E G G Q N A S * Q F4 - D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1 I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2 @@ -54,11 +33,6 @@ gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt 250 260 270 280 290 300 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - ctatgtcaacattatgggaagcgttgtggcgcattgatagatatacttaataaaagggaa - S V T T I G K A V G R L * R Y S N N E R F6 - P Y L Q L V R R L V A Y S D I H I I K G F5 - I C N Y Y G E C C R T V I * I F * K G K F4 - Y Y M * * V R L * S S F S K S F T V F D F1 I I C S R F V F N L P L A S L L L F S T F2 @@ -66,11 +40,6 @@ tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac 310 320 330 340 350 360 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - ataatatacatcatccaagcagaaattagaaggaaatcgttcagaaaatgacaaaagctg - * * I Y Y T R R * D E K L L D K V T K S F6 - K N Y T T P E D K I K R * C T K * Q K R F5 - I I H L L N T K L R G K A L R K S N E V F4 - L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1 S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2 @@ -78,11 +47,6 @@ ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt 370 380 390 400 410 420 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - gagttacaagtacaagaatccaacaaaacctattatacgccagtcaaattagaagcaaca - R L T * T R L N N Q I I H P * N L R R Q F6 - G * H E H E * T T K S L I R D T * D E N F5 - E I N M N K P Q K P Y Y A T L K I K T T F4 - F F L K Y L F M V * F L V C T C S G A S F1 S S * N I Y S W F N F W F V L V Q G P V F2 @@ -90,11 +54,6 @@ ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt 430 440 450 460 470 480 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - aagaagaattttataaataagtaccaaattaaaaaccaaacatgaacaagtccccggtca - K K K F Y K N M T * N K T Q V Q E P A L F6 - N R R L I N I * P K I K P K Y K N L P W F5 - E E * F I * E H N L K Q N T S T * P G T F4 - S L F T L F V Y S S S F I F S M I L I * F1 H Y L L C L Y T A V L L F L V * F * F K F2 @@ -102,11 +61,6 @@ tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa 490 500 510 520 530 540 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| - agtaataaatgagacaaacatatgtcgtcaagaaaataaaaatcatactaaaattaaatt - E N N V R N T Y L L E K I K L I I K I * F6 - N M I * E T Q I C C N K * K * Y S K L K F5 - * * K S Q K Y V A T R K N K T H N * N L F4 - N N S N G Q K F1 T I L M V K X F2 @@ -114,21 +68,14 @@ aacaattctaatggtcaaaaa 550 560 ----:----|----:----|- - ttgttaagattaccagttttt - F L E L P * F F6 - F C N * H D F F5 - V I R I T L F F4 ############################## Minimum size of ORFs : 1 -Total ORFs in frame 1 : 10 -Total ORFs in frame 2 : 11 -Total ORFs in frame 3 : 8 -Total ORFs in frame 4 : 14 -Total ORFs in frame 5 : 12 -Total ORFs in frame 6 : 14 +Total ORFs in frame 1 : 9 +Total ORFs in frame 2 : 10 +Total ORFs in frame 3 : 7 -Total ORFs : 69 +Total ORFs : 26 ##############################