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comparison test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack @ 1:a74a91f0ca4a

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Uploaded emboss_testdata.tar
author devteam
date Tue, 05 Jun 2012 14:00:15 -0400
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5 S M P K I P S F V P T Q T T V F L M A L F3
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9 caagctacggattttatggaagaaaacagggatgtgtctggtgtcaaaaggattaccgaa
10 T R H R F Y R R K D R C L G C N E * H S F6
11 X E I G L I G E K T G V C V V T K R I A F5
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16 T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2
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22 * V S * F N K H L C * N F A T P R S H * F6
23 K C R S S I R T C A S I S L P Q G L T N F5
24 V G V L F E Q A L V L Q F R N A * L T V F4
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27 R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1
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30 cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg
31 130 140 150 160 170 180
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34 R N T Y S L A D R A R I L P E N E R S Q F6
35 G T Q I A S R T E Q G S * L N M K E V K F5
36 P K Y L Q A R R K G Q D F T * K R * K P F4
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39 K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1
40 R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2
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46 F V N H F F V V L V L R E G R T Q Q N S F6
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51 D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1
52 I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2
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58 S V T T I G K A V G R L * R Y S N N E R F6
59 P Y L Q L V R R L V A Y S D I H I I K G F5
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70 * * I Y Y T R R * D E K L L D K V T K S F6
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75 L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1
76 S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2
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79 370 380 390 400 410 420
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82 R L T * T R L N N Q I I H P * N L R R Q F6
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118 F L E L P * F F6
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120 V I R I T L F F4
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123 Minimum size of ORFs : 1
124
125 Total ORFs in frame 1 : 10
126 Total ORFs in frame 2 : 11
127 Total ORFs in frame 3 : 8
128 Total ORFs in frame 4 : 14
129 Total ORFs in frame 5 : 12
130 Total ORFs in frame 6 : 14
131
132 Total ORFs : 69
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