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comparison test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack @ 14:27c43fb015f0 draft

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author iuc
date Fri, 22 Jun 2018 03:24:29 -0400
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2 1
3 V R C L K Y L L L S L H R P Q F S * W L F1 2 V R C L K Y L L L S L H R P Q F S * W L F1
4 F D A * N T F F C P Y T D H S F P N G F F2 3 F D A * N T F F C P Y T D H S F P N G F F2
5 S M P K I P S F V P T Q T T V F L M A L F3 4 S M P K I P S F V P T Q T T V F L M A L F3
6 gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt 5 gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt
7 10 20 30 40 50 60 6 10 20 30 40 50 60
8 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 7 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
9 caagctacggattttatggaagaaaacagggatgtgtctggtgtcaaaaggattaccgaa
10 T R H R F Y R R K D R C L G C N E * H S F6
11 X E I G L I G E K T G V C V V T K R I A F5
12 N S A * F V K K Q G * V S W L K G L P K F4
13
14 8
15 Y T D * K F L C K H * L K A V G L E C Y F1 9 Y T D * K F L C K H * L K A V G L E C Y F1
16 T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2 10 T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2
17 H R L E I L V Q A L I E S G W P R V L P F3 11 H R L E I L V Q A L I E S G W P R V L P F3
18 tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac 12 tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac
19 70 80 90 100 110 120 13 70 80 90 100 110 120
20 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 14 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
21 atgtggctgatctttaagaacacgttcgtgattaactttcgccaaccggatctcacaatg
22 * V S * F N K H L C * N F A T P R S H * F6
23 K C R S S I R T C A S I S L P Q G L T N F5
24 V G V L F E Q A L V L Q F R N A * L T V F4
25
26 15
27 R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1 16 R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1
28 G L Y S * A R L L P * S K V H F L Y F G F2 17 G L Y S * A R L L P * S K V H F L Y F G F2
29 V C I A E R V S C P D Q R F I F S T L E F3 18 V C I A E R V S C P D Q R F I F S T L E F3
30 cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg 19 cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg
31 130 140 150 160 170 180 20 130 140 150 160 170 180
32 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 21 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
33 gccaaacatatcgactcgcgcagagaacgggactagtttccaagtaaaagagatgaaacc
34 R N T Y S L A D R A R I L P E N E R S Q F6
35 G T Q I A S R T E Q G S * L N M K E V K F5
36 P K Y L Q A R R K G Q D F T * K R * K P F4
37
38 22
39 K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1 23 K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1
40 R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2 24 R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2
41 D V V E E Y N K Y E S L P P G L L I T G F3 25 D V V E E Y N K Y E S L P P G L L I T G F3
42 aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg 26 aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg
43 190 200 210 220 230 240 27 190 200 210 220 230 240
44 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 28 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
45 ttctgcaacaccttcttatgttgttcatgctcagagaggggggaccaaacgactaatgac
46 F V N H F F V V L V L R E G R T Q Q N S F6
47 S S T T S S Y L L Y S D R G G P K S I V F5
48 L R Q P L I C C T R T E G G Q N A S * Q F4
49
50 29
51 D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1 30 D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1
52 I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2 31 I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2
53 Y S C N T L R N T A * L S I * I I F P L F3 32 Y S C N T L R N T A * L S I * I I F P L F3
54 gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt 33 gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt
55 250 260 270 280 290 300 34 250 260 270 280 290 300
56 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 35 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
57 ctatgtcaacattatgggaagcgttgtggcgcattgatagatatacttaataaaagggaa
58 S V T T I G K A V G R L * R Y S N N E R F6
59 P Y L Q L V R R L V A Y S D I H I I K G F5
60 I C N Y Y G E C C R T V I * I F * K G K F4
61
62 36
63 Y Y M * * V R L * S S F S K S F T V F D F1 37 Y Y M * * V R L * S S F S K S F T V F D F1
64 I I C S R F V F N L P L A S L L L F S T F2 38 I I C S R F V F N L P L A S L L L F S T F2
65 L Y V V G S S L I F L * Q V F Y C F R P F3 39 L Y V V G S S L I F L * Q V F Y C F R P F3
66 tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac 40 tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac
67 310 320 330 340 350 360 41 310 320 330 340 350 360
68 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 42 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
69 ataatatacatcatccaagcagaaattagaaggaaatcgttcagaaaatgacaaaagctg
70 * * I Y Y T R R * D E K L L D K V T K S F6
71 K N Y T T P E D K I K R * C T K * Q K R F5
72 I I H L L N T K L R G K A L R K S N E V F4
73
74 43
75 L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1 44 L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1
76 S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2 45 S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2
77 Q C S C S * V V L D N M R S V * S S L F F3 46 Q C S C S * V V L D N M R S V * S S L F F3
78 ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt 47 ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt
79 370 380 390 400 410 420 48 370 380 390 400 410 420
80 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| 49 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
81 gagttacaagtacaagaatccaacaaaacctattatacgccagtcaaattagaagcaaca
82 R L T * T R L N N Q I I H P * N L R R Q F6
83 G * H E H E * T T K S L I R D T * D E N F5
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85
86 50
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89 L L K I F I H G L I F G L Y L F R G Q F F3 53 L L K I F I H G L I F G L Y L F R G Q F F3
90 ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt 54 ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt
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94 K K K F Y K N M T * N K T Q V Q E P A L F6
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96 E E * F I * E H N L K Q N T S T * P G T F4
97
98 57
99 S L F T L F V Y S S S F I F S M I L I * F1 58 S L F T L F V Y S S S F I F S M I L I * F1
100 H Y L L C L Y T A V L L F L V * F * F K F2 59 H Y L L C L Y T A V L L F L V * F * F K F2
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102 tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa 61 tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa
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105 agtaataaatgagacaaacatatgtcgtcaagaaaataaaaatcatactaaaattaaatt
106 E N N V R N T Y L L E K I K L I I K I * F6
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109
110 64
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114 aacaattctaatggtcaaaaa 68 aacaattctaatggtcaaaaa
115 550 560 69 550 560
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117 ttgttaagattaccagttttt
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122 ############################## 72 ##############################
123 Minimum size of ORFs : 1 73 Minimum size of ORFs : 1
124 74
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134 81