Mercurial > repos > devteam > emboss_5
annotate test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack @ 18:c2228166c035 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 4812c313fd8762b11f7fd002436e3a93b4c67f00"
author | iuc |
---|---|
date | Fri, 20 Nov 2020 16:49:40 +0000 |
parents | 27c43fb015f0 |
children |
rev | line source |
---|---|
1 | 1 |
2 V R C L K Y L L L S L H R P Q F S * W L F1 | |
3 F D A * N T F F C P Y T D H S F P N G F F2 | |
4 S M P K I P S F V P T Q T T V F L M A L F3 | |
5 gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt | |
6 10 20 30 40 50 60 | |
7 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
8 | |
9 Y T D * K F L C K H * L K A V G L E C Y F1 | |
10 T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2 | |
11 H R L E I L V Q A L I E S G W P R V L P F3 | |
12 tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac | |
13 70 80 90 100 110 120 | |
14 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
15 | |
16 R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1 | |
17 G L Y S * A R L L P * S K V H F L Y F G F2 | |
18 V C I A E R V S C P D Q R F I F S T L E F3 | |
19 cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg | |
20 130 140 150 160 170 180 | |
21 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
22 | |
23 K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1 | |
24 R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2 | |
25 D V V E E Y N K Y E S L P P G L L I T G F3 | |
26 aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg | |
27 190 200 210 220 230 240 | |
28 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
29 | |
30 D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1 | |
31 I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2 | |
32 Y S C N T L R N T A * L S I * I I F P L F3 | |
33 gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt | |
34 250 260 270 280 290 300 | |
35 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
36 | |
37 Y Y M * * V R L * S S F S K S F T V F D F1 | |
38 I I C S R F V F N L P L A S L L L F S T F2 | |
39 L Y V V G S S L I F L * Q V F Y C F R P F3 | |
40 tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac | |
41 310 320 330 340 350 360 | |
42 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
43 | |
44 L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1 | |
45 S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2 | |
46 Q C S C S * V V L D N M R S V * S S L F F3 | |
47 ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt | |
48 370 380 390 400 410 420 | |
49 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
50 | |
51 F F L K Y L F M V * F L V C T C S G A S F1 | |
52 S S * N I Y S W F N F W F V L V Q G P V F2 | |
53 L L K I F I H G L I F G L Y L F R G Q F F3 | |
54 ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt | |
55 430 440 450 460 470 480 | |
56 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
57 | |
58 S L F T L F V Y S S S F I F S M I L I * F1 | |
59 H Y L L C L Y T A V L L F L V * F * F K F2 | |
60 I I Y S V C I Q Q F F Y F * Y D F N L K F3 | |
61 tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa | |
62 490 500 510 520 530 540 | |
63 ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| | |
64 | |
65 N N S N G Q K F1 | |
66 T I L M V K X F2 | |
67 Q F * W S K X F3 | |
68 aacaattctaatggtcaaaaa | |
69 550 560 | |
70 ----:----|----:----|- | |
71 | |
72 ############################## | |
73 Minimum size of ORFs : 1 | |
74 | |
14
27c43fb015f0
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 9844cae766e7471d9fa6b2e8356e5194e77f6753
iuc
parents:
1
diff
changeset
|
75 Total ORFs in frame 1 : 9 |
27c43fb015f0
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 9844cae766e7471d9fa6b2e8356e5194e77f6753
iuc
parents:
1
diff
changeset
|
76 Total ORFs in frame 2 : 10 |
27c43fb015f0
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 9844cae766e7471d9fa6b2e8356e5194e77f6753
iuc
parents:
1
diff
changeset
|
77 Total ORFs in frame 3 : 7 |
1 | 78 |
14
27c43fb015f0
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/emboss_5 commit 9844cae766e7471d9fa6b2e8356e5194e77f6753
iuc
parents:
1
diff
changeset
|
79 Total ORFs : 26 |
1 | 80 ############################## |
81 |