Mercurial > repos > devteam > cuffdiff
view test-data/genes.exp @ 8:a10919766c11 draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/cufflinks/cuffdiff commit 80b06e80066b32ad53ed418628992f056444256f
| author | iuc |
|---|---|
| date | Sat, 05 Oct 2024 11:14:49 +0000 |
| parents | 9ba750f285e3 |
| children |
line wrap: on
line source
test_id gene_id gene locus sample_1 sample_2 status value_1 value_2 log2(fold_change) test_stat p_value q_value significant XLOC_000001 XLOC_000001 Xkr4 chr1:3204754-3204833 q1 q2 OK 0 9.45986e+06 inf -nan 0.01975 0.09875 no XLOC_000002 XLOC_000002 - chr1:3111449-3111490 q1 q2 OK 0 2.43637e+08 inf -nan 0.12465 0.181781 no XLOC_000003 XLOC_000003 - chr1:3111545-3111576 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000004 XLOC_000004 - chr1:3174765-3174792 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000005 XLOC_000005 - chr1:3187401-3187428 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000006 XLOC_000006 - chr1:3188521-3188548 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000007 XLOC_000007 - chr1:3189810-3190789 q1 q2 OK 358326 522345 0.543731 1.1445 0.1952 0.27328 no XLOC_000008 XLOC_000008 - chr1:3190858-3191434 q1 q2 OK 408511 420354 0.0412311 0.0469899 0.96715 0.96715 no XLOC_000009 XLOC_000009 - chr1:3191512-3192077 q1 q2 OK 433286 842157 0.958769 1.27887 0.20385 0.274413 no XLOC_000010 XLOC_000010 - chr1:3192250-3192336 q1 q2 OK 3.44151e+06 3.34455e+06 -0.0412311 -0.014084 0.67715 0.718189 no XLOC_000011 XLOC_000011 - chr1:3192441-3192494 q1 q2 OK 0 9.7002e+07 inf -nan 0.07975 0.181781 no XLOC_000012 XLOC_000012 - chr1:3192550-3192629 q1 q2 OK 0 4.72993e+06 inf -nan 0.12465 0.181781 no XLOC_000013 XLOC_000013 - chr1:3192649-3192676 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000014 XLOC_000014 - chr1:3192731-3192811 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000015 XLOC_000015 - chr1:3192940-3193042 q1 q2 OK 0 6.86386e+06 inf -nan 0.0612 0.181781 no XLOC_000016 XLOC_000016 - chr1:3194185-3194226 q1 q2 OK 0 2.43637e+08 inf -nan 0.12465 0.181781 no XLOC_000017 XLOC_000017 - chr1:3194302-3194329 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000018 XLOC_000018 - chr1:3194706-3194733 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000019 XLOC_000019 - chr1:3195083-3195110 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000020 XLOC_000020 - chr1:3195450-3195477 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000021 XLOC_000021 - chr1:3197089-3197116 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000022 XLOC_000022 - chr1:3197246-3197273 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000023 XLOC_000023 - chr1:3197346-3197373 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000024 XLOC_000024 - chr1:3197425-3197452 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000025 XLOC_000025 - chr1:3200022-3200191 q1 q2 OK 826392 803108 -0.0412311 -0.0180163 0.8625 0.887868 no XLOC_000026 XLOC_000026 - chr1:3200325-3200352 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000027 XLOC_000027 - chr1:3200430-3200457 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000028 XLOC_000028 - chr1:3201007-3201039 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000029 XLOC_000029 - chr1:3201077-3201481 q1 q2 OK 66791.3 324548 2.2807 1.1905 0.3026 0.383188 no XLOC_000030 XLOC_000030 - chr1:3201596-3201666 q1 q2 OK 1.6359e+07 0 -inf -nan 0.0148 0.09875 no XLOC_000031 XLOC_000031 - chr1:3201672-3201699 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000032 XLOC_000032 - chr1:3201725-3201809 q1 q2 OK 1.5136e+07 0 -inf -nan 0.06005 0.181781 no XLOC_000033 XLOC_000033 Xkr4 chr1:3211521-3211561 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000034 XLOC_000034 Xkr4 chr1:3212213-3212292 q1 q2 OK 0 9.45986e+06 inf -nan 0.01975 0.09875 no XLOC_000035 XLOC_000035 Xkr4 chr1:3212367-3212439 q1 q2 OK 0 2.80837e+07 inf -nan 0.0612 0.181781 no XLOC_000036 XLOC_000036 Xkr4 chr1:3212717-3212801 q1 q2 OK 3.784e+06 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000037 XLOC_000037 Xkr4 chr1:3213095-3213242 q1 q2 OK 5.10781e+06 2.08209e+06 -1.29467 -0.482193 0.5916 0.647062 no XLOC_000038 XLOC_000038 Xkr4 chr1:3240606-3240633 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000039 XLOC_000039 Xkr4 chr1:3242479-3242512 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000040 XLOC_000040 Xkr4 chr1:3242633-3242923 q1 q2 OK 48522.7 424400 3.12869 1.23747 0.38685 0.450823 no XLOC_000041 XLOC_000041 Xkr4 chr1:3242924-3243005 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000042 XLOC_000042 Xkr4 chr1:3243018-3243079 q1 q2 OK 0 3.03053e+07 inf -nan 0.01975 0.09875 no XLOC_000043 XLOC_000043 Xkr4 chr1:3243108-3243154 q1 q2 OK 8.616e+07 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000044 XLOC_000044 Xkr4 chr1:3243347-3243401 q1 q2 OK 0 5.79991e+07 inf -nan 0.01975 0.09875 no XLOC_000045 XLOC_000045 Xkr4 chr1:3254079-3254106 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000046 XLOC_000046 Xkr4 chr1:3256974-3257011 q1 q2 OK 0 2.35423e+09 inf -nan 0.01975 0.09875 no XLOC_000047 XLOC_000047 Xkr4 chr1:3277155-3277182 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000048 XLOC_000048 Xkr4 chr1:3277190-3277218 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000049 XLOC_000049 Xkr4 chr1:3277913-3278390 q1 q2 OK 228872 47662.2 -2.26362 -1.16262 0.30655 0.383188 no XLOC_000050 XLOC_000050 Xkr4 chr1:3280117-3280144 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000051 XLOC_000051 Xkr4 chr1:3280498-3280525 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000052 XLOC_000052 Xkr4 chr1:3280686-3280741 q1 q2 OK 0 2.61334e+07 inf -nan 0.12465 0.181781 no XLOC_000053 XLOC_000053 Xkr4 chr1:3282504-3282531 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000054 XLOC_000054 Xkr4 chr1:3282650-3282677 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000055 XLOC_000055 Xkr4 chr1:3282760-3282832 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000056 XLOC_000056 Xkr4 chr1:3284966-3284993 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000057 XLOC_000057 Xkr4 chr1:3290488-3290553 q1 q2 OK 0 1.11503e+07 inf -nan 0.12465 0.181781 no XLOC_000058 XLOC_000058 Xkr4 chr1:3290798-3290859 q1 q2 OK 1.55919e+07 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000059 XLOC_000059 Xkr4 chr1:3290919-3291273 q1 q2 OK 294879 85971.3 -1.7782 -0.902752 0.36915 0.445526 no XLOC_000060 XLOC_000060 Xkr4 chr1:3299443-3299664 q1 q2 OK 807732 156995 -2.36316 -0.89463 0.3993 0.450823 no XLOC_000061 XLOC_000061 Xkr4 chr1:3299691-3299733 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000062 XLOC_000062 Xkr4 chr1:3300051-3300078 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000063 XLOC_000063 Xkr4 chr1:3307748-3307775 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000064 XLOC_000064 Xkr4 chr1:3318620-3318647 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000065 XLOC_000065 Xkr4 chr1:3318999-3319051 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000066 XLOC_000066 Xkr4 chr1:3330527-3330554 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000067 XLOC_000067 Xkr4 chr1:3351240-3351311 q1 q2 OK 7.68169e+06 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000068 XLOC_000068 Xkr4 chr1:3355887-3356119 q1 q2 OK 504790 0 -inf -nan 0.04565 0.181781 no XLOC_000069 XLOC_000069 Xkr4 chr1:3356180-3356225 q1 q2 OK 1.02717e+08 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000070 XLOC_000070 Xkr4 chr1:3363076-3363176 q1 q2 OK 3.81001e+06 0 -inf -nan 0.0148 0.09875 no XLOC_000071 XLOC_000071 Xkr4 chr1:3363214-3363278 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000072 XLOC_000072 Xkr4 chr1:3363387-3363446 q1 q2 OK 5.53654e+07 0 -inf -nan 0.0773 0.181781 no XLOC_000073 XLOC_000073 Xkr4 chr1:3363753-3363849 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000074 XLOC_000074 Xkr4 chr1:3364871-3364919 q1 q2 OK 6.28966e+07 0 -inf -nan 0.12165 0.181781 no XLOC_000075 XLOC_000075 Xkr4 chr1:3367135-3367162 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000076 XLOC_000076 Xkr4 chr1:3367210-3367237 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000077 XLOC_000077 Xkr4 chr1:3367333-3367382 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000078 XLOC_000078 Xkr4 chr1:3369580-3369607 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000079 XLOC_000079 Xkr4 chr1:3375001-3375028 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000080 XLOC_000080 Xkr4 chr1:3377211-3377262 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000081 XLOC_000081 Xkr4 chr1:3379888-3379915 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000082 XLOC_000082 Xkr4 chr1:3386739-3386836 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000083 XLOC_000083 Xkr4 chr1:3391325-3391352 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000084 XLOC_000084 Xkr4 chr1:3435841-3435880 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000085 XLOC_000085 Xkr4 chr1:3447761-3447788 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000086 XLOC_000086 Xkr4 chr1:3450906-3450965 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no XLOC_000087 XLOC_000087 Xkr4 chr1:3451051-3451109 q1 q2 NOTEST 0 0 0 0 1 1 no