Mercurial > repos > boris > example2
comparison test-data/adjusted_200_mouse_reference_mtDNA.fasta @ 0:47e1dc8b27f8 draft
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2 GTTAATGTAGCTTAATAACAAAGCAAAGCACTGAAAATGCTTAGATGGATAATTGTATCCCATAAACACAAAGGTTTGGTCCTGGCCTTATAATTAATTAGAGGTAAAATTACACATGCAAACCTCCATAGACCGGTGTAAAATCCCTTAAACATTTACTTAAAATTTAAGGAGAGGGTATCAAGCACATTAAAATAGCT | |
3 TAAGACACCTTGCCTAGCCACACCCCCACGGGACTCAGCAGTGATAAATATTAAGCAATAAACGAAAGTTTGACTAAGTTATACCTCTTAGGGTTGGTAAATTTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCAAACTAATTATCTTCGGCGTAAAACGTGTCAACTATAAATAAATAAATAGAATTAAAATCCAAC | |
4 TTATATGTGAAAATTCATTGTTAGGACCTAAACTCAATAACGAAAGTAATTCTAGTCATTTATAATACACGACAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCATAAACCTAAATAATTAAATTTAACAAAACTATTTGCCAGAGAACTACTAGCCATAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTA | |
5 CTTTATATCCATCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAAACCCCGCTCTACCTCACCATCTCTTGCTAATTCAGCCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTAAAAAGGTATTAAAGTAAGCAAAAGAATCAAACATAAAAACGTTAGGTCAAGGTGTAGCCAATGAAATGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTTATA | |
6 AAAGAACATTACTATACCCTTTATGAAACTAAAGGACTAAGGAGGATTTAGTAGTAAATTAAGAATAGAGAGCTTAATTGAATTGAGCAATGAAGTACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAATTAAATTAAACTTAACATAATTAATTTCTAGACATCCGTTTATGAGAGGAGATAAGTCGTAACAAGGTAAGCAT | |
7 ACTGGAAAGTGTGCTTGGAATAATCATAGTGTAGCTTAATATTAAAGCATCTGGCCTACACCCAGAAGATTTCATGACCAATGAACACTCTGAACTAATCCTAGCCCTAGCCCTACACAAATATAATTATACTATTATATAAATCAAAACATTTATCCTACTAAAAGTATTGGAGAAAGAAATTCGTACATCTAGGAGCT | |
8 ATAGAACTAGTACCGCAAGGGAAAGATGAAAGACTAATTAAAAGTAAGAACAAGCAAAGATTAAACCTTGTACCTTTTGCATAATGAACTAACTAGAAAACTTCTAACTAAAAGAATTACAGCTAGAAACCCCGAAACCAAACGAGCTACCTAAAAACAATTTTATGAATCAACTCGTCTATGTGGCAAAATAGTGAGAA | |
9 GATTTTTAGGTAGAGGTGAAAAGCCTAACGAGCTTGGTGATAGCTGGTTACCCAAAAAATGAATTTAAGTTCAATTTTAAACTTGCTAAAAAAACAACAAAATCAAAAAGTAAGTTTAGATTATAGCCAAAAGAGGGACAGCTCTTCTGGAACGGAAAAAACCTTTAATAGTGAATAATTAACAAAACAGCTTTTAACCA | |
10 TTGTAGGCCTAAAAGCAGCCACCAATAAAGAAAGCGTTCAAGCTCAACATAAAATTTCAATTAATTCCATAATTTACACCAACTTCCTAAACTTAAAATTGGGTTAATCTATAACTTTATAGATGCAACACTGTTAGTATGAGTAACAAGAATTCCAATTCTCCAGGCATACGCGTATAACAACTCGGATAACCATTGTT | |
11 AGTTAATCAGACTATAGGCAATAATCACACTATAAATAATCCACCTATAACTTCTCTGTTAACCCAACACCGGAATGCCTAAAGGAAAGATCCAAAAAGATAAAAGGAACTCGGCAAACAAGAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCTAGCATTACAAGTATTAGAGGCACTGCCTGCCCAGTGACTAAAGTTT | |
12 AACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAATTAGGGACTAGCATGAACGGCTAAACGAGGGTCCAACTGTCTCTTATCTTTAATCAGTGAAATTGACCTTTCAGTGAAGAGGCTGAAATATAATAATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTAAATTATATAACTTATCTATTTAAT | |
13 TTATTAAACCTAATGGCCCAAAAACTATAGTATAAGTTTGAAATTTCGGTTGGGGTGACCTCGGAGAATAAAAAATCCTCCGAATGATTATAACCTAGACTTACAAGTCAAAGTAAAATCAACATATCTTATTGACCCAGATATATTTTGATCAACGGACCAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTTAAGAG | |
14 TTCATATCGACAATTAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCCAATGGTGTAGAAGCTATTAATGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATTTACGATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATAGAGCCACCTTACAAA | |
15 TAAGCGCTCTCAACTTAATTTATGAATAAAATCTAAATAAAATATATACGTACACCCTCTAACCTAGAGAAGGTTATTAGGGTGGCAGAGCCAGGAAATTGCGTAAGACTTAAAACCTTGTTCCCAGAGGTTCAAATCCTCTCCCTAATAGTGTTCTTTATTAATATCCTAACACTCCTCGTCCCCATTCTAATCGCCAT | |
16 AGCCTTCCTAACATTAGTAGAACGCAAAATCTTAGGGTACATACAACTACGAAAAGGCCCTAACATTGTTGGTCCATACGGCATTTTACAACCATTTGCAGACGCCATAAAATTATTTATAAAAGAACCAATACGCCCTTTAACAACCTCTATATCCTTATTTATTATTGCACCTACCCTATCACTCACACTAGCATTAA | |
17 GTCTATGAGTTCCCCTACCAATACCACACCCATTAATTAATTTAAACCTAGGGATTTTATTTATTTTAGCAACATCTAGCCTATCAGTTTACTCCATTCTATGATCAGGATGAGCCTCAAACTCCAAATACTCACTATTCGGAGCTTTACGAGCCGTAGCCCAAACAATTTCATATGAAGTAACCATAGCTATTATCCTT | |
18 TTATCAGTTCTATTAATAAATGGATCCTACTCTCTACAAACACTTATTACAACCCAAGAACACATATGATTACTTCTGCCAGCCTGACCCATAGCCATAATATGATTTATCTCAACCCTAGCAGAAACAAACCGGGCCCCCTTCGACCTGACAGAAGGAGAATCAGAATTAGTATCAGGGTTTAACGTAGAATACGCAGC | |
19 CGGCCCATTCGCGTTATTCTTTATAGCAGAGTACACTAACATTATTCTAATAAACGCCCTAACAACTATTATCTTCCTAGGACCCCTATACTATATCAATTTACCAGAACTCTACTCAACTAACTTCATAATAGAAGCTCTACTACTATCATCAACATTCCTATGGATCCGAGCATCTTATCCACGCTTCCGTTACGATC | |
20 AACTTATACATCTTCTATGAAAAAACTTTCTACCCCTAACACTAGCATTATGTATGTGACATATTTCTTTACCAATTTTTACAGCGGGAGTACCACCATACATATAGAAATATGTCTGATAAAAGAATTACTTTGATAGAGTAAATTATAGAGGTTCAAGCCCTCTTATTTCTAGGACAATAGGAATTGAACCTACACTT | |
21 AAGAATTCAAAATTCTCCGTGCTACCTAAACACCTTATCCTAATAGTAAGGTCAGCTAATTAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAACGTTGGTTTAAATCCTTCCCGTACTAATAAATCCTATCACCCTTGCCATCATCTACTTCACAATCTTCTTAGGTCCTGTAATCACAATATCCAGCACCAACCTAATACTAATA | |
22 TGAGTAGGCCTGGAATTCAGCCTACTAGCAATTATCCCCATACTAATCAACAAAAAAAACCCACGATCAACTGAAGCAGCAACAAAATACTTCGTCACACAAGCAACAGCCTCAATAATTATCCTCCTGGCCATCGTACTCAACTATAAACAACTAGGAACATGAATATTTCAACAACAAACAAACGGTCTTATCCTTAA | |
23 CATAACATTAATAGCCCTATCCATAAAACTAGGCCTCGCCCCATTCCACTTCTGATTACCAGAAGTAACTCAAGGGATCCCACTGCACATAGGACTTATTCTTCTTACATGACAAAAAATTGCTCCCCTATCAATTTTAATTCAAATTTACCCGCTACTCAACTCTACTATCATTTTAATACTAGCAATTACTTCTATTT | |
24 TCATAGGGGCATGAGGAGGACTTAACCAAACACAAATACGAAAAATTATAGCCTATTCATCAATTGCCCACATAGGATGAATATTAGCAATTCTTCCTTACAACCCATCCCTCACTCTACTCAACCTCATAATCTATATTATTCTTACAGCCCCTATATTCATAGCACTTATACTAAATAACTCTATAACCATCAACTCA | |
25 ATCTCACTTCTATGAAATAAAACTCCAGCAATACTAACTATAATCTCACTGATATTACTATCCCTAGGAGGCCTTCCACCACTAACAGGATTCTTACCAAAATGAATTATCATCACAGAACTTATAAAAAACAACTGTCTAATTATAGCAACACTCATAGCAATAATAGCTCTACTAAACCTATTCTTTTATACTCGCCT | |
26 AATTTATTCCACTTCACTAACAATATTTCCAACCAACAATAACTCAAAAATAATAACTCACCAAACAAAAACTAAACCCAACCTAATATTTTCCACCCTAGCTATCATAAGCACAATAACCCTACCCCTAGCCCCCCAACTAATTACCTAGAAGTTTAGGATATACTAGTCCGCGAGCCTTCAAAGCCCTAAGAAAACAC | |
27 ACAAGTTTAACTTCTGATAAGGACTGTAAGACTTCATCCTACATCTATTGAATGCAAATCAATTGCTTTAATTAAGCTAAGACCTCAACTAGATTGGCAGGAATTAAACCTACGAAAATTTAGTTAACAGCTAAATACCCTATTACTGGCTTCAATCTACTTCTACCGCCGAAAAAAAAAAATGGCGGTAGAAGTCTTAG | |
28 TAGAGATTTCTCTACACCTTCGAATTTGCAATTCGACATGAATATCACCTTAAGACCTCTGGTAAAAAGAGGATTTAAACCTCTGTGTTTAGATTTACAGTCTAATGCTTACTCAGCCATTTTACCTATGTTCATTAATCGTTGATTATTCTCAACCAATCACAAAGATATCGGAACCCTCTATCTACTATTCGGAGCCT | |
29 GAGCGGGAATAGTGGGTACTGCACTAAGTATTTTAATTCGAGCAGAATTAGGTCAACCAGGTGCACTTTTAGGAGATGACCAAATTTACAATGTTATCGTAACTGCCCATGCTTTTGTTATAATTTTCTTCATAGTAATACCAATAATAATTGGAGGCTTTGGAAACTGACTTGTCCCACTAATAATCGGAGCCCCAGAT | |
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31 TTTAGGTGCAATTAATTTTATTACCACTATTATCAACATGAAACCCCCAGCCATAACACAGTATCAAACTCCACTATTTGTCTGATCCGTACTTATTACAGCCGTACTGCTCCTATTATCACTACCAGTGCTAGCCGCAGGCATTACTATACTACTAACAGACCGCAACCTAAACACAACTTTCTTTGATCCCGCTGGAG | |
32 GAGGGGACCCAATTCTCTACCAGCATCTGTTCTGATTCTTTGGGCACCCAGAAGTTTATATTCTTATCCTCCCAGGATTTGGAATTATTTCACATGTAGTTACTTACTACTCCGGAAAAAAAGAACCTTTCGGCTATATAGGAATAGTATGAGCAATAATGTCTATTGGCTTTCTAGGCTTTATTGTATGAGCCCACCAC | |
33 ATATTCACAGTAGGATTAGATGTAGACACACGAGCTTACTTTACATCAGCCACTATAATTATCGCAATTCCTACCGGTGTCAAAGTATTTAGCTGACTTGCAACCCTACACGGAGGTAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGAGCCTTAGGCTTTATTTTCTTATTTACAGTTGGTGGTCTAACCGGAATTGTTTT | |
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35 TCTTCCCTCAACATTTCCTGGGCCTTTCAGGAATACCACGACGCTACTCAGACTACCCAGATGCTTACACCACATGAAACACTGTCTCTTCTATAGGATCATTTATTTCACTAACAGCTGTTCTCATCATGATCTTTATAATTTGAGAGGCCTTTGCTTCAAAACGAGAAGTAATATCAGTATCGTATGCTTCAACAAAT | |
36 TTAGAATGACTTCATGGCTGCCCTCCACCATATCACACATTCGAGGAACCAACCTATGTAAAAGTAAAATAAGAAAGGAAGGAATCGAACCCCCTAAAATTGGTTTCAAGCCAATCTCATATCCTATATGTCTTTCTCAATAAGATATTAGTAAAATCAATTACATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGATCAATAATC | |
37 TATATATCTTATATGGCCTACCCATTCCAACTTGGTCTACAAGACGCCACATCCCCTATTATAGAAGAGCTAATAAATTTCCATGATCACACACTAATAATTGTTTTCCTAATTAGCTCCTTAGTCCTCTATATCATCTCGCTAATATTAACAACAAAACTAACACATACAAGCACAATAGATGCACAAGAAGTTGAAAC | |
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46 AACCTACCAAGGCCACCACACTCCTATTGTACAAAAAGGACTACGATATGGTATAATTCTATTCATCGTCTCGGAAGTATTTTTCTTTGCAGGATTCTTCTGAGCGTTCTATCATTCTAGCCTCGTACCAACACATGATCTAGGAGGCTGCTGACCTCCAACAGGAATTTCACCACTTAACCCTCTAGAAGTCCCACTAC | |
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48 ATGGCTACTGGATTCCATGGACTCCATGTAATTATTGGATCAACATTCCTTATTGTTTGCCTACTACGACAACTAAAATTTCACTTCACATCAAAACATCACTTCGGATTTGAAGCCGCAGCATGATACTGACATTTTGTAGACGTAGTCTGACTTTTCCTATACGTCTCCATTTATTGATGAGGATCTTACTCCCTTAG | |
49 TATAATTAATATAACTGACTTCCAATTAGTAGATTCTGAATAAACCCAGAAGAGAGTAATTAACCTGTACACTGTTATCTTCATTAATATTTTATTATCCCTAACGCTAATTCTAGTTGCATTCTGACTCCCCCAAATAAATCTGTACTCAGAAAAAGCAAATCCATATGAATGCGGATTCGACCCTACAAGCTCTGCAC | |
50 GTCTACCATTCTCAATAAAATTTTTCTTGGTAGCAATTACATTTCTATTATTTGACCTAGAAATTGCTCTTCTACTTCCACTACCATGAGCAATTCAAACAATTAAAACCTCTACTATAATAATTATAGCCTTTATTCTAGTCACAATTCTATCTCTAGGCCTAGCATATGAATGAACACAAAAAGGATTAGAATGAACA | |
51 GAGTAAATGGTAATTAGTTTAAAAAAAATTAATGATTTCGACTCATTAGATTATGATGATGTTCATAATTACCAATATGCCATCTACCTTCTTCAACCTCACCATAGCCTTCTCACTATCACTTCTAGGGACACTTATATTTCGCTCTCACCTAATATCCACATTACTATGCCTGGAAGGCATAGTATTATCCTTATTTA | |
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