diff test-data/297_reference.fa @ 0:cffab3a42aa7 draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/sr_bowtie commit 1b3431dcb7e220ab736de4598d0f769cb6c60015"

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/297_reference.fa	Fri Oct 29 19:03:36 2021 +0000
@@ -0,0 +1,118 @@
+>FBgn0000005_297
+AGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG
+CACTCTAGTAATTTTCCATAACTGTATCCCAGCTGCGCAGACTCGTTTATCTTTTGCAGC
+GCAGCGTTCTTTGTAAACATCCTAAAGACCTGCCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCA
+ACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAA
+ATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCA
+AAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCC
+TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCA
+GTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAATGGAAAATAAGTTAAAT
+TTTATAGTCCTGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTCA
+ATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGAAGTGAAATACGAAACAAAAATAT
+TAAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAAAATTAAAACAATA
+TAGAATTTTAATAATACAACACAAAAATTTACAAAACAAAAAAACAAACAAGTGAAACTA
+GAAAGCTTAAAAATAATAATAACATTGAATCCGAAACAAAACAAAAAAATAAAACACAAA
+AGTTAAAAATTTTACAATAAAAATGTCACAACCAATTATTGCGCTGAGCGACATAAACCT
+TGCCGAAGCCCGTCGGCAGCTTAAAGACATTATGCCATTCAAGGGTGATCCAGAAACCCT
+TCACACCTTTATCAGCAGAGTGGATTACGTAATTTCGCTCTACCAAACAAATGATGTCCG
+ACAACAGAGGATTCTACTGGGAGCCATCGAAAGGAACTTGGACGGACAAATTACACGATC
+TTTGGGACTTCCGAACGTCGAAGATTGGCCTACCCTTAAAGCAAGACTCATCGCGGAATT
+TAAAATTCAAACACCAAACTACAAACTTCTGGAGAACTTCAGGGAGACACCATACAGAGG
+AAGCCTAAGAGCATTCTGCGAAGAAGCGGAGAGACGACGTCAATTACTAATTTCGAAACT
+ACACCTGGAAGGTAACCAATCGGATTTTCTTATTTATATTCAGGGTATTAAAGAATCTAT
+TAAGATACTGATAAGGAAACTACCAATACAATTATTCACTATTTTAGCCCATCACGATAT
+TACAGACTTAAGATCCTTAATTACCATTGCACAAAATGAGGGAATTTATGAAGAACACAT
+TAATTTTGAATTTTATGAAAAACCAGAATATCGTAATAAAAATTCAAATTCTAACCAGAA
+TTCGAAAACACAAAAATTCAATACAAATGTTCAAACTCAAAATCGACCAAGTTACTCACA
+ATATTCCCAACCCTTCCAACCTAATTTTAATCAATACATTCAACCATTTAGACCTAGCTA
+TACACAGCAGATAACTAACAACCCACCCATGTGGCACGCACCTAATTATTTCAGACCCAA
+CCAATACATAAACCCACAACCCATTATTCAAAAAAATCATTTCCAACAATATCCCAACAA
+AGCCCAATTTCCCCAAACAACGCATTTTAGAGGAAATACATACCCTCGACTACAACAACC
+CTCTACATATAAAAATACTAACTTCCCGATTACTAAACGACTAAGACCATCGGACAGTGA
+ACAAACTAAAATGTCTATTGACGAAATTAGATTCCAAGACGCGCATGAATTCGAACAAGT
+CCAACCTAATTATTACGAGCAACAGTATTTTAACCAAAATCAATACAATCCGTATCAAAA
+TCATAGCTTCATTAATGAAGGGCAACAACAAGTTCAATTTGTACAAATTAATAACAAACA
+AAACCAAAATAATTCTGAACTAAACGAAAATTTTCGGTTAACAGTTCCGGAAAATACGAA
+TACATAAAAATAGTATACAAAGGGCGTTCATACAAATGCCTTCTAGACACAGGATCAACA
+ATTAATATGATCAATGAAAATATATTTTGTCTTCCCATTCAAAATAGTAGATGTGAAGTT
+TTAACATCAAATGGCCCTATTACCTTGAACGACTTGATTATGTTACCCAGAAATAGTATT
+TTCAAAAAAACCGAACCATTTTATGTGCACAGATTTTCTAATAATTACGATATGCTAATT
+GGCAGAAAATTGTTGAAAAATGCTCAATCAGTTATTAATTACAAAAATGATACAGTTACC
+CTTTTTGATCAAACATACAAATTAATTACTTCAGAATCCGAAAGAAACCAAAATTTGTAT
+ATCCAAAGGACACCAGAATCAATTGCAAGCTCAGATCAGGAATCAATAAAAAAATTAGAT
+TTTTCACAGTTTCGATTAGATCACCTAAATCAGGAGGAAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTG
+TTAAATAAATTTAGAAATCTTGAATATAAGGAGGGAGAGAAATTAACATTTACAAATACA
+ATTAAACACGTACTAAATACAACACATAACTCCCCAATTTATTCGAAACAATACCCACTT
+GCGCAAACACACGAAATCGAAGTAGAAAACCAAGTACAGGAAATGCTGAATCAGGGATTA
+ATTAGGGAAAGTAATTCTCCATACAATAGTCCTACTTGGGTCGTACCAAAGAAACCGGAT
+GCTTCTGGTGCAAATAAGTACAGGGTAGTAATTGATTATAGAAAGCTAAATGAAATAACC
+ATACCTGACAGATATCCAATTCCAAATATGGACGAAATTCTTGGCAAACTGGGTAAATGC
+CAATATTTTACAACGATCGATCTGGCAAAGGGATTTCATCAAATAGAAATGGACGAAGAA
+TCAATTTCTAAAACTGCATTCTCCACAAAAAGCGGTCATTACGAATACCTTCGAATGCCA
+TTTGGCCTTAGGAATGCACCCGCTACTTTTCAAAGGTGCATGAATAATATCCTTCGACCG
+TTGCTTAACAAACACTGTTTGGTGTATCTGGATGATATTATAATTTTTTCAACATCCCTT
+ACAGAACATTTAAATTCAATACAATTAGTTTTTACAAAGCTTGCAGATGCAAATTTAAAA
+TTGCAACTAGACAAATGTGAGTTCTTAAAAAAGGAAGCTAACTTTCTTGGTCACATAGTT
+ACCCCTGATGGTATTAAACCAAATCCTATTAAAGTTAAAGCCATAGTTTCATACCCAATT
+CCGACAAAAGATAAAGAGATAAGAGCTTTCCTTGGATTAACAGGTTATTATCGCAAATTT
+ATTCCAAATTACGCAGACATAGCAAAACCCATGACCAGCTGCTTAAAAAAAAGGACAAAG
+ATAGATACACAAAAACTTGAGTACATAGAGGCATTCGAAAAACTTAAGGCTTTGATAATT
+CGTGACCCAATTTTACAATTACCTGATTTTGAAAAGAAATTTGTTTTAACCACAGATGCA
+AGTAACTTGGCCCTCGGGGCTGTCCTTTCTCAAAACGGTCATCCTATATCTTTTATTAGT
+AGAACACTTAACGATCACGAATTAAATTACAGTGCTATCGAAAAAGAATTACTTGCCATA
+GTTTGGGCCACAAAAACTTTTCGACATTATTTACTAGGACGACAATTTCTCATTGCCAGT
+GACCATCAACCTCTTAGATGGCTTCATAACTTAAAGGAACCAGGTGCTAAGTTAGAAAGA
+TGGAGAGTTAGATTAAGCGAATACCAATTTAAAATAGATTATATTAAAGGGAAAGAAAAT
+TCAGTTGCCGATGCATTATCAAGAATTAAAATTGAAGAAAATCATCATAGTGAAGCTACT
+CAACATAGTGCAGAAGAGGACAATAGCAACCTTATTCATTTAACAGAAAAACCAATAAAT
+TATTTCAAAAAACAAATAATCTTTATTAAATCCGATAAAAATAAAGTAGAGCATTCAAAA
+ATATTCGGTAACTCCATTACCACAATTCAATATGACGTAATGACACTTGAAAAGGCCAAA
+CAAATTTTACTCGATCACTTTATCCATAGAAACATTACCATTTATATTGAGAGCGATGTA
+GATTTTGAAATCGTTCAAAGAGCACACATAGAAATTGTTAATACCACCTACACAAAAGTA
+ATTCGCAGTCTTTTCCTATTAAAGAACGTTGGTTCATACGCCGAATTCAAAGAAATCATA
+CTTCAATCACATGAAAAACTTTTACACCCTGGTATACAGAAAATGACAAAATTATTTAAA
+GAAAATCACTTCTTTCCAAATAGCCAACTATTAATTCAGAATATAATAAACGAATGCAAC
+ATATGCAATTTGGCCAAAACAGAACATAGAAACACCAAAATGCCTTTAAAAATCACACCC
+AACCCGGAACATTGCCGAGAAAAATTTGTAGTAGATATTTATTCATCTGAGGGAAAACAT
+TACATCAGTTGCATTGATATTTATTCTAAATTCGCTACACTTGAGCAAATTAAAACTAAG
+GATTGGATAGAATGCAGAAACGCATTAATGCGCATTTTTAATCAACTAGGAAAACCCAAA
+TTATTAAAGGCAGACAGAGACGGAGCTTTCTCCAGTTTAGCTTTAAAGCGATGGCTTGAA
+GAAGAAGAAGTCGAATTACAGCTCAATACAGCAAAAAACGGAGTAGCAGACGTCGAAAGA
+TTACACAAAACAATAAATGAAAAAATTCGTATAATCAATTCATCTGATGATGAAGAAGTA
+AAATTAAGCAAGATAGAAACAATCCTCTACACATACAACCAAAAAATTAAACATGACACT
+ACTGGACAGAGACCTGCTCAAATTTTCTTATACGCTGGGCATCCCATATTAGACACTCAA
+AAAATTAAAGAGAAGAAAATAGAGAAAATAAATGAAGACAGACGGGAATTTAATATTGAC
+ACTAATTACAGAAAAGGTCCACTACAGAAAGGCAAATTAGAAAACCCATTTAAACCAACC
+AAAAATGTAGAACAGACAGACCCTGACCATTACAAAATCACTAATAGAAATAGAGTTACG
+CACTACTACAAAACACAATTCAAAAAACAAAAGAAAAATAATAAACTCTCAATTTCACAG
+GCACCTGGTACCCGATAACACTATTGTTTATACTGATCACAGCTGTTCATGGACAACAAA
+TTCAAATTAATAATATTGACACCAACCACGGATATCTCCTTTTTTCTGATAAGCCAGTAC
+AGATACCATCCTCCTTTGAACATCACTCCTTAAAAATCAATTTAACTGAAATAGACATCG
+TGGTTGACTATTTTGAGCAAAGACTACGAACCGATTACCATGCACCCCAGATCAATTTTT
+TATACAATAAAATAAAAAGAGAACTAGCCAGAATAACCCTGAAACATAGAAACAAACGGG
+GTTTTATTAACATTGTGGGTTCAGGTTTTAAATACCTATTTGGAACACTAGATGAAAATG
+ATCGAGTCGAAATACAGAAAAAACTTGAAATCAACGTCCATAACTCAGTAAAATTACATG
+AACTCAACGACGCCATACGATTGATAAATGACGGAATGCAAAAAATACAGAATTATGAAA
+ATAACCACACCATCATTGACAGTCTTTTGTTCGAACTAATGCAGTTTACGGAATACATAG
+AAGATTTGGAAATGGCTATGCAGCTTTCCAGACTTGGACTGTTTAACCCCAAATTACTAA
+ACTACGACAAACTTGAAAATGTGAACAGCCAAAACATTTTGAACATTAAAACATCCACTT
+GGATTAACTACAATGATAACCAAGTATTAATCATATCCCACATACCCATTTACCTTTCAC
+TAATAAGCACAATTAAAATAATTCCTTACCCAGACTCCAACGGCTATCAGCTAGATTACA
+CAGACACACAATCATATTTTGAAAAAGAAAATAAAGTTTATAATACCGAAAATAAAGAAG
+TAAAAAATGAATGTGTCACCAATATTATTAAACACTTAAATCCAATTTGTAATTTTAAGC
+CAGTACACACGAACGAAATAATAAAATACATAGAACCAAACACAATTGTAACTTGGAACT
+TAACCCAAACAATTCTTAACCAAAATTGCCAAAATTCAATTAATAAAATAAAAATAGAAG
+GAAACAAAATGATAAGAGTAACGCAATGCAAAATAGAAATCAATAATATAAATTTTAGTG
+AAACTCTGTTAGAACCAGAAATAGATTTGACACCACTATACACACCACTTAATATAACAA
+AAATAAAAATTGTAAAACACAACGACATTATTGAGATGATTTCAGAGAACAATATTACAC
+TTTACATACAAATGATCATTGTAATAATCGCACTAATTTTGTTGTACTCATATTTAAGAT
+ATGTATCATTTAAACCATTTATGATGTTGTATGCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAA
+ATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAATTCCATTTCCCACACTATATCCAT
+CAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGT
+CCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT
+AACTGTATCCCAGCTGCGCAGACTCGTTTATCTTTTGCAGCGCAGCGTTCTTTGTAAACA
+TCCTAAAGACCTGCCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGA
+ACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCA
+ATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAAC
+TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACA
+TTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACT